View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7270_high_1 (Length: 789)

Name: NF7270_high_1
Description: NF7270
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7270_high_1
NF7270_high_1
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (490-773)||(5253053-5253336)
chr2 (490-773)||(33907950-33908233)
chr2 (489-747)||(26822342-26822599)
chr2 (490-773)||(26828218-26828501)
chr2 (489-773)||(11707333-11707616)
chr2 (490-773)||(19167150-19167431)
chr2 (490-747)||(16723662-16723919)
chr2 (545-773)||(45399506-45399739)
chr2 (501-747)||(21098411-21098656)
chr2 (552-771)||(30569902-30570119)
chr2 (490-747)||(19126000-19126254)
chr2 (551-756)||(33663117-33663321)
chr2 (548-773)||(36632393-36632623)
chr2 (545-773)||(42886093-42886327)
chr2 (489-773)||(4812233-4812533)
chr2 (490-773)||(35285584-35285864)
chr2 (545-773)||(1514326-1514558)
chr2 (545-757)||(11448466-11448682)
chr2 (490-735)||(45204295-45204544)
chr2 (545-747)||(18092075-18092270)
chr2 (545-685)||(10048371-10048511)
chr2 (490-757)||(27364142-27364392)
chr2 (545-681)||(9543994-9544130)
chr2 (545-677)||(4291028-4291160)
chr2 (488-605)||(18137828-18137944)
chr2 (549-605)||(6342785-6342841)
chr2 (545-605)||(28608457-28608517)
chr2 (551-605)||(14323271-14323325)
chr2 (551-605)||(1993012-1993066)
chr2 (551-605)||(28502445-28502499)
chr2 (364-416)||(638723-638775)
chr2 (490-531)||(32725991-32726032)
chr2 (490-529)||(1992950-1992989)
chr2 (490-532)||(4289028-4289070)
chr2 (490-531)||(7364780-7364821)
chr2 (488-529)||(28502523-28502564)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (490-773)||(17997218-17997501)
chr5 (490-773)||(20350585-20350866)
chr5 (492-773)||(20758595-20758876)
chr5 (492-773)||(21030759-21031039)
chr5 (490-757)||(34373669-34373937)
chr5 (492-736)||(2195825-2196068)
chr5 (545-773)||(3029404-3029632)
chr5 (490-747)||(7286330-7286586)
chr5 (488-773)||(20995177-20995466)
chr5 (546-773)||(27066522-27066749)
chr5 (490-773)||(35539210-35539493)
chr5 (551-773)||(3149951-3150173)
chr5 (517-747)||(33610476-33610706)
chr5 (518-773)||(19448645-19448900)
chr5 (490-745)||(26320388-26320641)
chr5 (545-735)||(30689995-30690185)
chr5 (549-773)||(1851314-1851529)
chr5 (551-773)||(287074-287299)
chr5 (545-773)||(33706111-33706343)
chr5 (551-773)||(38935112-38935322)
chr5 (490-773)||(10511665-10511934)
chr5 (545-709)||(41781631-41781795)
chr5 (551-735)||(12419925-12420113)
chr5 (545-725)||(34726735-34726919)
chr5 (545-681)||(25696895-25697031)
chr5 (545-677)||(41691051-41691183)
chr5 (490-645)||(4882958-4883112)
chr5 (551-685)||(30142270-30142404)
chr5 (552-677)||(34717365-34717490)
chr5 (490-687)||(33930966-33931155)
chr5 (488-605)||(19395581-19395697)
chr5 (551-779)||(3396496-3396711)
chr5 (709-773)||(41781492-41781556)
chr5 (551-605)||(31295614-31295668)
chr5 (709-773)||(33930464-33930529)
chr5 (490-533)||(38935346-38935389)
chr5 (486-531)||(42819326-42819371)
chr5 (488-532)||(3086431-3086475)
chr5 (489-529)||(31295551-31295591)
chr5 (492-531)||(19365945-19365984)
chr5 (489-532)||(25695538-25695581)
chr5 (735-773)||(4882922-4882960)
chr5 (490-532)||(34719457-34719499)
chr5 (490-531)||(7863529-7863570)
chr5 (490-531)||(8350250-8350291)
chr5 (490-531)||(22602635-22602676)
chr5 (490-531)||(36366125-36366166)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (490-773)||(2776981-2777263)
chr4 (490-773)||(22115354-22115637)
chr4 (488-773)||(53343114-53343397)
chr4 (516-773)||(36514669-36514926)
chr4 (490-773)||(21353723-21354005)
chr4 (490-773)||(19830700-19830983)
chr4 (551-779)||(33502365-33502593)
chr4 (545-773)||(39742353-39742581)
chr4 (547-773)||(19109117-19109343)
chr4 (546-773)||(55998071-55998298)
chr4 (546-779)||(17699874-17700107)
chr4 (490-779)||(41983532-41983825)
chr4 (490-747)||(5271602-5271858)
chr4 (490-773)||(38008965-38009249)
chr4 (490-747)||(34055891-34056146)
chr4 (490-747)||(23479607-23479865)
chr4 (554-747)||(14828901-14829094)
chr4 (490-757)||(28973782-28974051)
chr4 (561-773)||(35494978-35495187)
chr4 (490-773)||(37700901-37701183)
chr4 (545-756)||(17740762-17740977)
chr4 (545-771)||(13628761-13628984)
chr4 (490-691)||(54331070-54331270)
chr4 (545-773)||(47556780-47557012)
chr4 (551-773)||(7643169-7643378)
chr4 (490-773)||(36857772-36858043)
chr4 (490-677)||(15642363-15642549)
chr4 (545-773)||(40622855-40623082)
chr4 (545-725)||(2116579-2116764)
chr4 (545-725)||(12682157-12682340)
chr4 (545-677)||(39714899-39715031)
chr4 (545-725)||(46104653-46104837)
chr4 (545-677)||(52800800-52800932)
chr4 (490-615)||(28134708-28134830)
chr4 (551-605)||(740367-740421)
chr4 (551-605)||(15520994-15521048)
chr4 (489-536)||(14828802-14828849)
chr4 (713-757)||(7847744-7847789)
chr4 (490-532)||(30527588-30527630)
chr4 (488-532)||(574175-574219)
chr4 (487-531)||(3839092-3839136)
chr4 (489-532)||(3759279-3759322)
chr4 (490-529)||(15521071-15521110)
chr4 (489-536)||(33502304-33502351)
chr4 (489-532)||(39713495-39713538)
chr4 (490-532)||(2118190-2118232)
chr4 (490-532)||(5759341-5759383)
chr4 (490-532)||(12680630-12680672)
chr4 (490-536)||(35494909-35494955)
chr4 (490-532)||(35707658-35707700)
chr4 (490-531)||(15650486-15650527)
chr4 (490-531)||(19591081-19591122)
chr4 (490-531)||(43014591-43014632)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (490-773)||(17470419-17470702)
chr7 (490-773)||(17582512-17582795)
chr7 (490-747)||(8925226-8925482)
chr7 (545-773)||(33031546-33031773)
chr7 (545-773)||(42688242-42688470)
chr7 (565-773)||(5963372-5963581)
chr7 (546-773)||(11500547-11500767)
chr7 (489-748)||(47175173-47175436)
chr7 (551-773)||(23299072-23299298)
chr7 (545-773)||(42918551-42918784)
chr7 (545-773)||(33638017-33638249)
chr7 (490-773)||(42826647-42826932)
chr7 (545-773)||(27734394-27734624)
chr7 (489-739)||(14309553-14309816)
chr7 (551-757)||(19521852-19522046)
chr7 (545-773)||(9150012-9150245)
chr7 (621-773)||(17483036-17483188)
chr7 (621-773)||(17570026-17570178)
chr7 (583-747)||(23765847-23766011)
chr7 (621-773)||(17478601-17478753)
chr7 (621-773)||(17574461-17574613)
chr7 (545-725)||(49145635-49145819)
chr7 (545-681)||(48528137-48528273)
chr7 (546-685)||(39649328-39649467)
chr7 (546-725)||(4848834-4849017)
chr7 (545-677)||(17170801-17170933)
chr7 (545-681)||(31898168-31898304)
chr7 (551-605)||(6911421-6911475)
chr7 (490-581)||(23762347-23762437)
chr7 (551-605)||(47573399-47573453)
chr7 (490-529)||(6911359-6911398)
chr7 (490-529)||(47573333-47573372)
chr7 (490-532)||(691288-691330)
chr7 (490-532)||(21669232-21669274)
chr7 (490-532)||(31896814-31896856)
chr7 (490-532)||(39278237-39278279)
chr7 (490-532)||(39647982-39648024)
chr7 (490-531)||(12960607-12960648)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (490-773)||(44407052-44407335)
chr1 (489-747)||(31620384-31620641)
chr1 (490-747)||(34692810-34693060)
chr1 (490-747)||(34688282-34688532)
chr1 (490-739)||(41829350-41829598)
chr1 (490-735)||(38844474-38844718)
chr1 (490-757)||(45005478-45005747)
chr1 (546-747)||(52520972-52521173)
chr1 (546-747)||(18814914-18815115)
chr1 (551-757)||(17672159-17672370)
chr1 (551-757)||(47135982-47136192)
chr1 (490-757)||(36682746-36683016)
chr1 (545-773)||(52310526-52310758)
chr1 (549-747)||(41962294-41962483)
chr1 (490-757)||(12245172-12245436)
chr1 (551-735)||(16030946-16031134)
chr1 (550-773)||(48341007-48341235)
chr1 (545-773)||(50561741-50561971)
chr1 (551-734)||(10694138-10694325)
chr1 (551-725)||(5426715-5426893)
chr1 (545-773)||(51965187-51965410)
chr1 (545-725)||(16300781-16300966)
chr1 (545-677)||(4891875-4892007)
chr1 (545-677)||(29186480-29186612)
chr1 (545-677)||(33361478-33361610)
chr1 (551-770)||(17707244-17707455)
chr1 (490-605)||(24294796-24294910)
chr1 (490-605)||(50394967-50395082)
chr1 (545-605)||(39760073-39760133)
chr1 (551-605)||(43254614-43254668)
chr1 (489-529)||(43254554-43254594)
chr1 (490-532)||(4893967-4894009)
chr1 (490-532)||(10763587-10763629)
chr1 (490-532)||(29840690-29840732)
chr1 (490-532)||(38896814-38896856)
chr1 (490-532)||(42682591-42682633)
chr1 (490-531)||(3929748-3929789)
chr1 (490-531)||(28565430-28565471)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (490-773)||(35041756-35042038)
chr6 (490-773)||(18312458-18312741)
chr6 (490-747)||(18598305-18598561)
chr6 (490-773)||(22373140-22373422)
chr6 (490-747)||(1072583-1072839)
chr6 (490-747)||(21800212-21800468)
chr6 (546-773)||(17940188-17940415)
chr6 (488-747)||(33814662-33814920)
chr6 (545-747)||(34856623-34856825)
chr6 (490-757)||(15276320-15276584)
chr6 (490-747)||(11932802-11933058)
chr6 (546-739)||(14887313-14887506)
chr6 (545-773)||(4425153-4425373)
chr6 (490-773)||(7222979-7223249)
chr6 (552-773)||(33320807-33321032)
chr6 (545-773)||(14832150-14832383)
chr6 (545-773)||(34321763-34321984)
chr6 (545-725)||(4108441-4108625)
chr6 (490-735)||(25540645-25540890)
chr6 (545-702)||(35158714-35158870)
chr6 (545-677)||(1220293-1220425)
chr6 (545-677)||(24445702-24445834)
chr6 (490-628)||(2521928-2522065)
chr6 (545-677)||(9979441-9979573)
chr6 (653-735)||(2521850-2521932)
chr6 (702-773)||(30044876-30044946)
chr6 (551-605)||(13456795-13456849)
chr6 (488-532)||(4110060-4110104)
chr6 (490-595)||(22323724-22323828)
chr6 (490-529)||(13456735-13456774)
chr6 (651-725)||(28573340-28573418)
chr6 (490-532)||(1222384-1222426)
chr6 (490-532)||(6966237-6966279)
chr6 (490-532)||(24447794-24447836)
chr6 (490-531)||(18389168-18389209)
chr6 (490-531)||(33319049-33319090)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (548-773)||(23521994-23522219)
chr8 (490-779)||(19394839-19395127)
chr8 (490-773)||(22332005-22332286)
chr8 (490-747)||(14078130-14078386)
chr8 (490-773)||(36597312-36597594)
chr8 (490-773)||(44600129-44600416)
chr8 (490-747)||(27273663-27273919)
chr8 (545-747)||(33423613-33423815)
chr8 (490-773)||(38994112-38994400)
chr8 (545-773)||(7015580-7015806)
chr8 (490-747)||(42785600-42785856)
chr8 (545-747)||(9761699-9761901)
chr8 (490-747)||(5836027-5836281)
chr8 (490-732)||(30826837-30827077)
chr8 (516-779)||(38962591-38962866)
chr8 (545-773)||(44382127-44382359)
chr8 (551-773)||(41629317-41629527)
chr8 (595-773)||(6476874-6477052)
chr8 (514-770)||(19248547-19248814)
chr8 (514-770)||(19321731-19321998)
chr8 (545-779)||(41533186-41533424)
chr8 (560-773)||(3751542-3751749)
chr8 (552-773)||(22946140-22946359)
chr8 (545-756)||(45291817-45292032)
chr8 (545-725)||(4465823-4466007)
chr8 (545-748)||(41977955-41978161)
chr8 (545-725)||(7389704-7389887)
chr8 (633-773)||(42810359-42810493)
chr8 (545-698)||(25615859-25616011)
chr8 (545-677)||(12760752-12760884)
chr8 (621-748)||(41157051-41157183)
chr8 (551-725)||(25345015-25345193)
chr8 (545-725)||(25620133-25620317)
chr8 (699-779)||(38992935-38993016)
chr8 (490-605)||(6300489-6300601)
chr8 (489-605)||(44940445-44940560)
chr8 (551-605)||(42060725-42060779)
chr8 (490-605)||(37029841-37029956)
chr8 (545-594)||(41157180-41157229)
chr8 (551-605)||(23966450-23966504)
chr8 (490-531)||(12660958-12660999)
chr8 (490-529)||(23966383-23966422)
chr8 (490-529)||(42060662-42060701)
chr8 (490-532)||(18375558-18375600)
chr8 (370-416)||(35094566-35094612)
chr8 (490-532)||(36778479-36778521)
chr8 (490-532)||(40586443-40586485)
chr8 (490-532)||(41158643-41158685)
chr8 (490-531)||(2961009-2961050)
chr8 (490-531)||(27272686-27272727)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (488-773)||(18741515-18741799)
chr3 (489-747)||(50770558-50770815)
chr3 (546-773)||(21698931-21699158)
chr3 (490-773)||(50742056-50742337)
chr3 (489-773)||(51248987-51249270)
chr3 (485-747)||(31368322-31368584)
chr3 (545-773)||(19406680-19406908)
chr3 (509-773)||(54648199-54648462)
chr3 (490-773)||(52852744-52853026)
chr3 (490-773)||(16342339-16342619)
chr3 (490-735)||(6103433-6103677)
chr3 (490-773)||(52462215-52462502)
chr3 (490-773)||(54934489-54934775)
chr3 (551-773)||(49113748-49113958)
chr3 (490-747)||(35087163-35087408)
chr3 (488-773)||(32756197-32756479)
chr3 (546-773)||(54513468-54513701)
chr3 (546-735)||(8243224-8243418)
chr3 (545-757)||(39093025-39093241)
chr3 (545-773)||(55294120-55294352)
chr3 (545-773)||(23194872-23195109)
chr3 (545-773)||(52842263-52842498)
chr3 (545-773)||(48520379-48520611)
chr3 (545-773)||(40824009-40824241)
chr3 (545-747)||(2839569-2839777)
chr3 (559-725)||(4138140-4138310)
chr3 (545-725)||(26777272-26777456)
chr3 (490-629)||(19353698-19353836)
chr3 (614-766)||(48977607-48977749)
chr3 (492-604)||(48988911-48989022)
chr3 (549-635)||(11597366-11597452)
chr3 (709-773)||(11597467-11597531)
chr3 (487-605)||(5252251-5252370)
chr3 (490-605)||(39796355-39796469)
chr3 (659-725)||(53800998-53801068)
chr3 (490-532)||(4137400-4137442)
chr3 (490-532)||(8396765-8396807)
chr3 (490-532)||(18688673-18688715)
chr3 (490-532)||(22477905-22477947)
chr3 (490-532)||(35861001-35861043)
chr3 (490-536)||(49113972-49114018)
chr3 (490-532)||(55290397-55290439)
chr3 (490-531)||(188736-188777)
chr3 (489-530)||(44186858-44186899)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (490-773)||(2709-2991)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (490-773)||(14619-14909)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (546-773)||(377-604)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (492-773)||(101394-101680)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (554-773)||(25712-25931)
scaffold0047 (489-536)||(25613-25660)
[»] scaffold1891 (1 HSPs)
scaffold1891 (545-747)||(115-317)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (545-747)||(5185-5387)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (490-773)||(12214-12500)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (490-773)||(29639-29917)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (554-747)||(10615-10808)
scaffold0005 (489-536)||(10860-10907)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (489-770)||(48525-48804)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (551-773)||(10081-10307)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (552-773)||(120589-120814)
scaffold0010 (679-773)||(177143-177237)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (546-747)||(4308-4513)
scaffold0032 (546-747)||(10757-10962)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (545-748)||(3123-3329)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (545-677)||(18760-18892)
scaffold0057 (490-532)||(17401-17443)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (545-677)||(13508-13640)
scaffold0069 (490-532)||(14647-14689)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (490-629)||(16982-17124)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (545-605)||(231820-231880)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (490-531)||(24919-24960)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (490-531)||(13023-13064)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 5253336 - 5253053
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253336 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaactctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 5253237  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5253236 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 5253137  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253136 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagagttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 5253053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 33908233 - 33907950
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33908233 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattca 33908134  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33908133 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagtatataatcagtttatgagaatacaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 33908034  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  33908033 aaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 33907950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 489 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 26822599 - 26822342
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822599 tactagttaaaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 26822501  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26822500 atcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaa 26822401  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822400 ggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 26822342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 26828501 - 26828218
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26828501 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattca 26828402  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26828401 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgagaatacaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 26828302  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  26828301 aaactaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 26828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 489 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 11707616 - 11707333
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11707616 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattc 11707518  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11707517 atcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaattggcataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaa 11707418  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  11707417 gaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 11707333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 19167150 - 19167431
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||        | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19167150 actagttacaaacccgtgct-cgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 19167247  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19167248 ttataaaatatgtatgggctgattaagagaacatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 19167347  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  19167348 gaaccattgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagaatgttgttgttatagaattatcaaaaaatgattgat 19167431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 16723662 - 16723919
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16723662 actagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaataacgtattcgataaaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 16723761  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||     
T  16723762 tcataaaatatgtatggcctgatttagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttagaatgaaaactatttgaaccaataaaa 16723861  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16723862 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatcgaaaattataaaaaagagttttgttgt 16723919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 45399739 - 45399506
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45399739 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataattagtttatgagattag 45399640  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45399639 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagaga 45399540  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     |||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  45399539 attgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 45399506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 501 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21098656 - 21098411
Alignment:
Q  501 acccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatat 600  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21098656 acccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattc-attaaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatat 21098558  T
Q  601 gtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataat 700  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21098557 gtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaattattggaaccaataaaggaatcaatgat 21098458  T
Q  701 gtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21098457 gtgtggatttacatattacccaaaattataaaaaagagttttgttgt 21098411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 552 - 771
Target Start/End: Original strand, 30569902 - 30570119
Alignment:
Q  552 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattga 651  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  30569902 aaagaagagctgttaaaatgaaggaacattgtgattcatcataaaaaatgtagg--ctgattaagagagcatataatcagtttataagattaggaattga 30569999  T
Q  652 cataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttata 751  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570000 cataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttata 30570099  T
Q  752 gagttaataaaaaatgattg 771  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  30570100 gagttaccaaaaaatgattg 30570119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 19126000 - 19126254
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19126000 actagttacaaacccgtgcgaagcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattca 19126098  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19126099 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaag 19126198  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19126199 gaaccaatgatatgtgaatttacatattatccaaaattat--aaaagagtgttgttgt 19126254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 551 - 756
Target Start/End: Original strand, 33663117 - 33663321
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33663117 gaaagaagatatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagtaattg 33663216  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33663217 acataatattta-gatgaaaacaattgaaaccaataaatgaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtgttgttgttat 33663315  T
Q  751 agagtt 756  Q
    ||||||    
T  33663316 agagtt 33663321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 548 - 773
Target Start/End: Original strand, 36632393 - 36632623
Alignment:
Q  548 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaa 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  36632393 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaa 36632492  T
Q  648 ttgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgtt 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36632493 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaaccaatgatgtttgaattatgattacatattatcccaaattataaaatagagtgtt 36632592  T
Q  743 gttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36632593 attgttatagagttaccaaaaaatgattgat 36632623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 42886327 - 42886093
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42886327 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagcgcatataatcagtttatgagattag 42886228  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattat-------aaaaaaga 737  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||       |||||| |    
T  42886227 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatg-accaatgatgtatgaatttaaatattatccagaattataaaaaaaaaaaaaaa 42886129  T
Q  738 gtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42886128 atgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 42886093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 489 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 4812533 - 4812233
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||        ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4812533 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaaaaatgtattcgattaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattc 4812435  T
Q  589 atcataaaatat---gtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
    ||||||||||||   ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4812434 atcataaaatatcatgtatgggatgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 4812335  T
Q  686 aaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattata---------aaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattg 771  Q
    ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  4812334 aaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatcgaaaattataaaataaaataaaaagagtgttgttgttatagagtgacaaaaaaaggattg 4812235  T
Q  772 at 773  Q
    ||    
T  4812234 at 4812233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 35285584 - 35285864
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35285584 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataatatattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 35285682  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||       |  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35285683 tcataaaatatgtatgagctgattaagagag-------ttagtttatgtgattggaatttgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaag 35285775  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatt-----tacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||| |||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  35285776 gaaacaatgatgtgggaattatgattacatattattcaaaattataaaaaagagtgttgttgttataaagttaccaaaaaatgattgat 35285864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 1514326 - 1514558
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  1514326 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcatgaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattaa 1514425  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1514426 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaagaaccaatgatgtgtgaattacgattacatgttatccaaaattataaaaaagagt 1514524  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  1514525 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 1514558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 545 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 11448682 - 11448466
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  11448682 ttcttcgaaaaaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagaaagcaaataatcagtttataagattag 11448583  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448582 gaattgacataatatttaagatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 11448483  T
Q  740 gttgttgttatagagtta 757  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  11448482 gtt-ttgttatggagtta 11448466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 490 - 735
Target Start/End: Original strand, 45204295 - 45204544
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45204295 actagttacaaactcgtgcttcgcacgggttcaataacatatttgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattca 45204393  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||    
T  45204394 tcataaaatatgtatgggctgattaagaaagcatctaatcagtttctgagattacgaattgacataatatttaaaatgaaaacaattggaactaataaag 45204493  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45204494 gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattacaaaaaa 45204544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Original strand, 18092075 - 18092270
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  18092075 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaatttagagatcatataatcagtttatgaaattag 18092174  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |  | ||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18092175 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat-gatgtgtgaattatg------attacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 18092267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 545 - 685
Target Start/End: Original strand, 10048371 - 10048511
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10048371 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 10048470  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10048471 gaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaat 10048511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Original strand, 27364142 - 27364392
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364142 actaattacaaacttgtgcttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 27364240  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||                     ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27364241 tcataaaatatgtatgagatgattaagag---------------------attaggaattgacatcatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 27364319  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
    ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27364320 gaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagcgttgttgttatagagtta 27364392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 681
Target Start/End: Original strand, 9543994 - 9544130
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9543994 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 9544093  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaac 681  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9544094 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaac 9544130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Original strand, 4291028 - 4291160
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4291028 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 4291127  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4291128 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 4291160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 488 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 18137944 - 18137828
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18137944 atactagttacaaacctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 18137846  T
Q  588 catcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18137845 catcataaaatatgtatg 18137828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 549 - 605
Target Start/End: Original strand, 6342785 - 6342841
Alignment:
Q  549 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6342785 ttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 6342841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 545 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 28608517 - 28608457
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28608517 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 28608457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 14323271 - 14323325
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14323271 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 14323325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 1993012 - 1993066
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1993012 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatg 1993066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 28502499 - 28502445
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28502499 gaaagaagatatgttaaaacgacggaatattatgattcatcataaaatatgtatg 28502445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 638775 - 638723
Alignment:
Q  364 tagagtgaatgaatgcttattagacattacctttgaaaattaatagaataagt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  638775 tagagtgaatgaatgcttattaggcataatctttgaaaattaattgaataagt 638723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 32725991 - 32726032
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32725991 actagttataaacccgtgcttcgcatgggttcaataacgtat 32726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 1992950 - 1992989
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1992950 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 1992989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 4289028 - 4289070
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4289028 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 4289070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 7364821 - 7364780
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  7364821 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 7364780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 488 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 28502564 - 28502523
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  28502564 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaataacgt 28502523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17997501 - 17997218
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997501 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 17997402  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17997401 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataattagtttatgagattcgaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 17997302  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17997301 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattacccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 17997218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 20350866 - 20350585
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||         |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20350866 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtatttga--aaaataattctttgaaagaagtgatgctaaaacgacggaacattgtgattca 20350769  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20350768 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataagcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 20350669  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20350668 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 20350585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 492 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 20758876 - 20758595
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 591  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758876 tagttataaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaaaaattgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 20758777  T
Q  592 ataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaagga 691  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20758776 ataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataattagtttatgagattagaaattaacataatatttatgatgaaaacagttggaaccaataaagga 20758677  T
Q  692 atcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20758676 accaatgatgtgtgaatttacatataatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttactaaaaaatgattgat 20758595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 492 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21031039 - 21030759
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 591  Q
    |||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||        | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21031039 tagttataaacctgtgcttcacataggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttagaaagaagagatgttaaaacaacagaacattgtgattcatc 21030941  T
Q  592 ataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaagga 691  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21030940 ataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaagga 21030841  T
Q  692 atcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  21030840 accaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 21030759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Original strand, 34373669 - 34373937
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34373669 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggtttaataacgtattcgataaaaaaaattcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattca 34373768  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34373769 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 34373868  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattat-aaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34373869 aaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaaagagtgtccttgttatagagtta 34373937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 492 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 2196068 - 2195825
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 591  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2196068 tagttataaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatc 2195970  T
Q  592 ataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaagga 691  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2195969 ataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaagga 2195870  T
Q  692 atcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaag 736  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195869 atcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaag 2195825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 3029632 - 3029404
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  3029632 ttcttcgaaagaagaaatgttaaaacgaaggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgaaattag 3029533  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3029532 aaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagaatgttgt 3029433  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3029432 tgttatagagttaccaaaaaatgattgat 3029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 7286586 - 7286330
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7286586 actagttacaaacccgtgcttcgcgcgagttcaataacatattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattca 7286488  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7286487 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttgtgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 7286388  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7286387 gaaccaatgatgtgtaaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 7286330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 488 - 773
Target Start/End: Original strand, 20995177 - 20995466
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    |||||||||||||||||||||   | | | |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995177 atactagttacaaacccgtgcgaagcacgagttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 20995275  T
Q  588 catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20995276 catcataaaatatgtatggactgattaaaagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataa 20995375  T
Q  688 aggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||| |||| |||| |||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20995376 aggaaccaatgatgtttgaattatgattacatattatccaaaattataaaatagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 20995466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 27066749 - 27066522
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27066749 tcttcgaaagaagagatggtaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatagactgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 27066650  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066649 aattaatataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 27066550  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  27066549 gttatagagttaccaaaaaatgattgat 27066522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 35539210 - 35539493
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||   | | |||||||||||| ||||||||         |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35539210 actagttacaaacccgtgcgaagcacgggttcaataacatattcgataaaaaaaaatctttgaaagaaaagatattaaaacgacggaacattgtgactca 35539309  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35539310 tcataaaatatgtatgagctaattaagagagcatataatcaatttatgagaatacaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 35539409  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  35539410 aaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaaaagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 35539493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Original strand, 3149951 - 3150173
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  3149951 gaaagaagagatgttaaaacgaattaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagataaggaattg 3150050  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150051 acataatatttagaatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttatatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 3150150  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  3150151 agagttaccaaaaaatgattgat 3150173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 517 - 747
Target Start/End: Original strand, 33610476 - 33610706
Alignment:
Q  517 ggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaag 616  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  33610476 ggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattgtgattcgtcataaaatacgtatgagctgattaag 33610575  T
Q  617 agagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatat 716  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33610576 agagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatat 33610675  T
Q  717 tatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33610676 tatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 33610706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 518 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 19448900 - 19448645
Alignment:
Q  518 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaaga 617  Q
    |||||||||||||||||||        |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  19448900 gttcaataacgtattcgataaaaaaaattcttcaaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatggattgattaaga 19448801  T
Q  618 gagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatatt 717  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||    
T  19448800 gagcatataatcagtttataagattatgaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaactaatgatatgtgaatttacatatt 19448701  T
Q  718 atccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19448700 atccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 19448645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 490 - 745
Target Start/End: Original strand, 26320388 - 26320641
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||        |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320388 actagttacaaattcgtgcttcaca-gggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttaaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattca 26320485  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26320486 tcataaaatatgtatggcctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 26320585  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26320586 aaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgtt 26320641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 545 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 30690185 - 30689995
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30690185 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgaaggaacatcgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 30690086  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30690085 gaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 30689995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 549 - 773
Target Start/End: Original strand, 1851314 - 1851529
Alignment:
Q  549 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaat 648  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1851314 ttgaaagaagatatgttaaaatgacggaacatt---------cataaaatatgtataggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 1851404  T
Q  649 tgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtt 748  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851405 tgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtt 1851504  T
Q  749 atagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  1851505 atagagttaccaaaaaatgattgat 1851529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Original strand, 287074 - 287299
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  287074 gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 287173  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287174 acataatatttaggatgaaaacaattggaacca--aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 287271  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  287272 gttgtagagttaccaaaaaaggattgat 287299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 33706111 - 33706343
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33706111 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 33706210  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33706211 gaattgagataatatttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 33706309  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  33706310 gttgttgttgcagagttaccaaaaaatgattgat 33706343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 38935322 - 38935112
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  38935322 gaaagaagggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattg 38935223  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38935222 acataatatttaggatgaaaacgattggaac------------caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 38935135  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  38935134 agagttaccaaaaaatgattgat 38935112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 10511665 - 10511934
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10511665 actagttacaaactcgtgcttcacacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattca 10511763  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            
T  10511764 tcataaaatatgtatgggctgattaagagaacatataatcagtttatgagattagtaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaac-------- 10511855  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| |||||||    
T  10511856 ----caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattat-aaaaagagtgatgttgttgtagggttaccaaaaaaggattgat 10511934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 545 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 41781795 - 41781631
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41781795 ttcttcgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 41781696  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatt 709  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41781695 gaattgacataatatttaggaagaaaataattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaatt 41781631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 551 - 735
Target Start/End: Original strand, 12419925 - 12420113
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12419925 gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattttgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 12420024  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12420025 acataatatttaggatgaaaataattggaaccaa-aaaggaaccaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaattattaaaaa 12420113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 34726735 - 34726919
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  34726735 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataaacagtttatgagattag 34726834  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  34726835 aaattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 34726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 681
Target Start/End: Original strand, 25696895 - 25697031
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25696895 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcctaaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 25696994  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaac 681  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25696995 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaac 25697031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 41691183 - 41691051
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  41691183 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 41691084  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  41691083 aaattgacataatttttagaatgaaaacaattg 41691051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 490 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4883112 - 4882958
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4883112 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgatgaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgcttca 4883014  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    || |||||||||||   |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4883013 tcgtaaaatatgtaaaggctggttaagagagcatataatcagtttatgagattaga 4882958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 551 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 30142404 - 30142270
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30142404 gaaagaaaagatgttaaaacaacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 30142305  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  30142304 acataatatttaggatgaaaataattgaaaccaat 30142270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 552 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34717490 - 34717365
Alignment:
Q  552 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattga 651  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34717490 aaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattga 34717391  T
Q  652 cataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||    
T  34717390 cataatttttagaatgaaaacaattg 34717365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 490 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 33931155 - 33930966
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||        ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33931155 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataatatattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattctgattca 33931057  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||       |  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33931056 tcataaaatatgtatgggctgattaagagag-------ttagtttatgagattataatttgacataatatttatgatgaaaacaattgaaaccaataa 33930966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 488 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 19395697 - 19395581
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||        | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395697 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaaaaaat-cttcaaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 19395599  T
Q  588 catcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19395598 catcataaaatatgtatg 19395581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 551 - 779
Target Start/End: Original strand, 3396496 - 3396711
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt--catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaat 648  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||                
T  3396496 gaaagaagagatgttaaaactacagaacattgtgattttcatcataaaatatggatgggtttattaagagagcatataatcagtttat------------ 3396583  T
Q  649 tgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatcca----aaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
          |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||||||||||    || | |||||||||||||||||    
T  3396584 ------aatatt-aggatgaaaacaaatggaaccaatatagaaaccaatgatgtgtgaatttccatattatccatccaaactaataaaaaagagtgttgt 3396676  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3396677 tgtaatagagttaccaaaaaatgattgatatccat 3396711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 709 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 41781556 - 41781492
Alignment:
Q  709 ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  41781556 ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 41781492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 31295614 - 31295668
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31295614 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 31295668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 33930529 - 33930464
Alignment:
Q  709 ttacatattatccaaaattataaaaaa-gagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  33930529 ttacatattattcaaaattataaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 33930464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38935389 - 38935346
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattc 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38935389 actagttacaaacccgtgcttcgtacgggttcaataacgtattc 38935346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 531
Target Start/End: Original strand, 42819326 - 42819371
Alignment:
Q  486 agatactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  42819326 agatactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 42819371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 532
Target Start/End: Original strand, 3086431 - 3086475
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  3086431 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 3086475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 529
Target Start/End: Original strand, 31295551 - 31295591
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31295551 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 31295591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19365984 - 19365945
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19365984 tagttacaaacccgtgcttcgcatgggttgaataacgtat 19365945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 532
Target Start/End: Original strand, 25695538 - 25695581
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  25695538 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 25695581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 735 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 4882960 - 4882922
Alignment:
Q  735 agagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4882960 agagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 4882922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 34719499 - 34719457
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  34719499 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 34719457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 7863529 - 7863570
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  7863529 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 7863570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8350291 - 8350250
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8350291 actagttataaacccgtgcttcgtacgggttgaataacgtat 8350250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 22602635 - 22602676
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22602635 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 22602676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 36366125 - 36366166
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  36366125 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 36366166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 2777263 - 2776981
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777263 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 2777165  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2777164 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataattagtttatgagattagaaattaacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 2777065  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2777064 gaaccaatgatatgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttactaaaaaatgattgat 2776981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 22115354 - 22115637
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22115354 actagttacaaacccgtgcttcccacggattcaataacgtattcgataaaaaaaattctctgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattca 22115453  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22115454 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 22115553  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22115554 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttggtgttatagagttactaaaaaatgattgat 22115637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 488 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 53343397 - 53343114
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    |||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53343397 atactagttataaacctgtgctttgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 53343299  T
Q  588 catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53343298 catcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataa 53343199  T
Q  688 aggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  53343198 aggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattata-aaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 53343114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 516 - 773
Target Start/End: Original strand, 36514669 - 36514926
Alignment:
Q  516 gggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36514669 gggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaa 36514768  T
Q  616 gagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacata 715  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  36514769 gagaacatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtctgaatttacata 36514868  T
Q  716 ttatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36514869 taatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttactaaaaaatgattgat 36514926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 21354005 - 21353723
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21354005 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaaaatt-gaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattca 21353907  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  21353906 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaa 21353807  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353806 gaaccaatgatgtgttaatttacatattatccaaaattataaaaaaaagtgttgttgttatagagttactaaaaaatgattgat 21353723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 19830700 - 19830983
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19830700 actagttacatacccgtgcttcgcatgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattcttcgaaagatgagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 19830799  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19830800 tcataaaatatgtatgggctgattaatagagcatataatcagtttatgagattaggtattaacataatgtataggatgaaaacaattggaaccaataaag 19830899  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19830900 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagaatgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 19830983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 551 - 779
Target Start/End: Original strand, 33502365 - 33502593
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33502365 gaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 33502464  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33502465 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaaaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 33502564  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  33502565 agagttatcaaaaaatgattgatatccat 33502593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 39742353 - 39742581
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39742353 ttctttgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 39742452  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39742453 gaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaatcaataaatgaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 39742552  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39742553 tgttatagagttaccaaaaaatgattgat 39742581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 547 - 773
Target Start/End: Original strand, 19109117 - 19109343
Alignment:
Q  547 ctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaa 646  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  19109117 ctttgaaagaagtgatgctaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataaacaatttatgaaattagga 19109216  T
Q  647 attgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttg 746  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19109217 attgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtgttgttg 19109316  T
Q  747 ttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19109317 ttatagagttaacaaaaaatgattgat 19109343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Original strand, 55998071 - 55998298
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  55998071 tctttgaaagaagagatattaaaacgaaggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgtttaagagagcatataatcagtttatgatattagg 55998170  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998171 aattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 55998270  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  55998271 gttatagagttaccaaaaaatgtttgat 55998298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 546 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 17700107 - 17699874
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  17700107 tcttcgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataataagtttatgagattagg 17700008  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17700007 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccagtaaaggaaccaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgacgtt 17699908  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  17699907 gttatagagttaccaaaaaatgattgatgcccat 17699874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 490 - 779
Target Start/End: Original strand, 41983532 - 41983825
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41983532 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaat-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgcttca 41983630  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41983631 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagaatataatcagtttatgagattatgaattgaaataatatttaggatggaaacaattggaaccaataaag 41983730  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||    
T  41983731 gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaagaattgatatccat 41983825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 5271602 - 5271858
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5271602 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgaaattca 5271700  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  5271701 tcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaat 5271800  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  5271801 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattatattaaagagttttgttgt 5271858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 38009249 - 38008965
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||        | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38009249 actagttacaaacacgtgcttcacacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 38009151  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38009150 tcataaaatatgtatgggctgattaagggagcatataatcaatttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 38009051  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaat--tataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38009050 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatgcaaaataataaaaaaaaaagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 38008965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 34055891 - 34056146
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34055891 actagttacaaacccgtg-ttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaaa-tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 34055988  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34055989 tcataaaatatgtatgagctgattaagagaacatataatcagtttatgagattaggaattgatataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 34056088  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34056089 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 34056146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 23479865 - 23479607
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23479865 actagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaataacgtattcgataaaaaaaaaaaattgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 23479766  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23479765 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttataagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 23479666  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataa-aaaagagtgttgttgt 747  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23479665 aaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaaagagttttgttgt 23479607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 554 - 747
Target Start/End: Original strand, 14828901 - 14829094
Alignment:
Q  554 agaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgaca 653  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14828901 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 14829000  T
Q  654 taatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14829001 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattctaaaaaagagttttgttgt 14829094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28974051 - 28973782
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnt-tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||          |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  28974051 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacatatttgataaaaaaaaaatcttcgaaagaagagatattaaaatgacagaacattgtgattc 28973952  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28973951 atcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgataatacaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaa 28973852  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataa-aaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
    | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28973851 gaaaccaatgatgtgtgagtttacatattatccaaaattataaaaaaagagtgttgttgttatagagtta 28973782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 561 - 773
Target Start/End: Original strand, 35494978 - 35495187
Alignment:
Q  561 atgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatt 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35494978 atgttaaaacgacggaacattgtgattcatcagaaaatat--atgggctgattaagagagcatataattagtttatgagattaggaattgacataatatt 35495075  T
Q  661 taggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaata 760  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  35495076 -aggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttacca 35495174  T
Q  761 aaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||    
T  35495175 aaaaatgattgat 35495187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 37700901 - 37701183
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||| ||||||   | | |||||||||||||||||||||        || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37700901 actagttacaaatccgtgcgaagcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattattcgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtaattca 37701000  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||     
T  37701001 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaggtattgacataatatataggatgaaaacaattgaaaccaataaa- 37701099  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37701100 gaaccaatgatgtgtgaatttatatattatccaaaattatagaaaatagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 37701183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 545 - 756
Target Start/End: Complemental strand, 17740977 - 17740762
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17740977 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 17740878  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740877 aaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 17740779  T
Q  740 gttgttgttatagagtt 756  Q
    ||||||||| |||||||    
T  17740778 gttgttgttgtagagtt 17740762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 545 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 13628984 - 13628761
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  13628984 ttctttgaaagaagagctgttaaaacgacggatcattgtgattcatcataaaaaatgtagg--ctgattaagatagcatataatcaatttatgagattag 13628887  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13628886 gaattgacataatatttaggataaaa-caattagaaccaataaaggaaccaatgatgtttgaatttacatattatccaaaattataaaaaagattgttgt 13628788  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattg 771  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||    
T  13628787 tgatatagagttaccaaaaaatgattg 13628761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 490 - 691
Target Start/End: Original strand, 54331070 - 54331270
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331070 actagttaaaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 54331168  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  54331169 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaatgaag 54331268  T
Q  690 ga 691  Q
    ||    
T  54331269 ga 54331270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 47556780 - 47557012
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47556780 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgaactgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 47556879  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47556880 gaattgagataatatttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 47556978  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||  |||||||  |||||| |||||||    
T  47556979 gttgttgttgcagagttaccaaaaaaggattgat 47557012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Original strand, 7643169 - 7643378
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7643169 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtaattcatcataaaatatgtatgagcttatta-gagagcatataatcagtttatgagattagaaattg 7643267  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||            |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7643268 acataatatttaggatgaaaacaatcggaac------------caatgatgtgtaaatttacatattaaccaaaattgtaaaaaagagtgttgttgttat 7643355  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  7643356 agagttaccaaaaaatgattgat 7643378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 36858043 - 36857772
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |    
T  36858043 actagttacaaatccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagaaacgttaaaacaacggaacattgtgattta 36857945  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagc-atataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  36857944 tcataaaatatgtataggctgattaagagagccatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaac------- 36857852  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||||||    
T  36857851 -----caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtaattgagttgccgaaaaatgattgat 36857772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 490 - 677
Target Start/End: Original strand, 15642363 - 15642549
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||| ||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15642363 actagtcacaaatccgtgctttgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattatgattca 15642461  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15642462 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattg 15642549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 40623082 - 40622855
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| |  ||| |||| |||||||||||||     
T  40623082 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaatctagata--atacaatcagtttatgagattaa 40622985  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||||||   | ||||||||||    
T  40622984 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaactaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaa---aaaaaaaagagt 40622889  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  40622888 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 40622855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 2116764 - 2116579
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  2116764 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattat 2116665  T
Q  645 aaattgacat-aatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  2116664 gaattgacataaatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 2116579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 12682157 - 12682340
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12682157 ttcttcgaaagaaaagatgtttaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgatttagagatcatttaatcagtttatgagattag 12682256  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  12682257 gaattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaagg-atcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 12682340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Original strand, 39714899 - 39715031
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39714899 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 39714998  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  39714999 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 39715031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 46104837 - 46104653
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  46104837 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcattataaaatatgtatgggctgatttagagataatataatcagtttatgagattag 46104738  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  46104737 gaattgacataatgtttaggatgaaaataatt-gaaacaaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 46104653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 52800932 - 52800800
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52800932 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 52800833  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  52800832 gaattgacataatttttagaatgaaaacaattg 52800800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 490 - 615
Target Start/End: Original strand, 28134708 - 28134830
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||         ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28134708 actagttacaaacttgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatc---gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 28134804  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaa 615  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    
T  28134805 tcataaaatatgtatgggctgattaa 28134830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 740367 - 740421
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  740367 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 740421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 15521048 - 15520994
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15521048 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatatatg 15520994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 536
Target Start/End: Original strand, 14828802 - 14828849
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14828802 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgat 14828849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 713 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 7847789 - 7847744
Alignment:
Q  713 atattatccaaaattataaaaaa-gagtgttgttgttatagagtta 757  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7847789 atattatccaaaattataaaaaaagagtgttgttgttatagagtta 7847744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 30527588 - 30527630
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30527588 actagttacaaacccgtgcttcgtacgggttgaataacgtatt 30527630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 532
Target Start/End: Original strand, 574175 - 574219
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  574175 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 574219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 487 - 531
Target Start/End: Original strand, 3839092 - 3839136
Alignment:
Q  487 gatactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  3839092 gatactagttacaaacccgtgcttcgcaagggttgaataacgtat 3839136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 3759322 - 3759279
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  3759322 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 3759279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 15521110 - 15521071
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15521110 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 15521071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 536
Target Start/End: Original strand, 33502304 - 33502351
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  33502304 tactggttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacatattcgat 33502351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 532
Target Start/End: Original strand, 39713495 - 39713538
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  39713495 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 39713538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2118232 - 2118190
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  2118232 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 2118190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5759383 - 5759341
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  5759383 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 5759341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 12680630 - 12680672
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  12680630 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 12680672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 536
Target Start/End: Original strand, 35494909 - 35494955
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  35494909 actagttacaaacccgtgcttcacacggattcaataacgtattcgat 35494955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 35707658 - 35707700
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  35707658 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 35707700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 15650486 - 15650527
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  15650486 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 15650527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 19591122 - 19591081
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  19591122 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggtttaataacgtat 19591081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 43014591 - 43014632
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  43014591 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 43014632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17470702 - 17470419
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17470702 actagctacaaacccgtgcttcgcaggggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatatttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattca 17470603  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17470602 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 17470503  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17470502 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttattgagttattaaaaaatgattgat 17470419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 17582512 - 17582795
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17582512 actagctacaaacccgtgcttcgcaggggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatatttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattca 17582611  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17582612 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 17582711  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17582712 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttattgagttattaaaaaatgattgat 17582795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 8925226 - 8925482
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8925226 actagttacaaacccgtgctccgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 8925324  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8925325 tcataaaatatgtatgggctgatcaagagagcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 8925424  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8925425 gaatcaatgatgtatgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 8925482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 33031773 - 33031546
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  33031773 ttctttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattca 33031674  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  33031673 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa-agtgttat 33031575  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33031574 tgttatagagttaccaaaaaatgattgat 33031546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 42688470 - 42688242
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  42688470 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcgtaaaatatgtatgggctgtttaagagaacatataatcagtttatgagattag 42688371  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42688370 gaattgacataatatttatgatgaaaacaatttgaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattattcaaaattataaaaaagggtgttgt 42688271  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42688270 tgttatagagttaccaaaaaatgattgat 42688242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 565 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 5963581 - 5963372
Alignment:
Q  565 taaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttagg 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5963581 taaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttagg 5963482  T
Q  665 ataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta-ataaaa 763  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  5963481 atgaaaacaattagaaccaataaaggaaccaatgaagtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaa 5963382  T
Q  764 aatgattgat 773  Q
    ||||||||||    
T  5963381 aatgattgat 5963372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 11500767 - 11500547
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11500767 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataa--tatttatg-----attaacagagcatataatcagtttatgagattagg 11500675  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500674 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaactaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 11500575  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11500574 gttatagagttaccaaaaaatgattgat 11500547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 489 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 47175436 - 47175173
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47175436 tactagttataaactcgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattc 47175338  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47175337 atcataaaatatgtatgggttgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaa 47175238  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtt 748  Q
    | || |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47175237 gaaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgtt 47175173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Original strand, 23299072 - 23299298
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23299072 gaaagaaaagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 23299171  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23299172 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaatcaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttctt 23299270  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  23299271 gttgtagagttaccaaaaaaggattgat 23299298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 42918784 - 42918551
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42918784 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtaccggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 42918685  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat-aaaaaagag 738  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||     ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42918684 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattatgattacacattatccaaaattataaaaaaagag 42918586  T
Q  739 tgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42918585 tgttgttgttatagagttaccaaaaaaagattgat 42918551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 33638017 - 33638249
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||    
T  33638017 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcttataatcagtttattagattag 33638116  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638117 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 33638215  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    || |||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  33638216 gtcgttgttgtagagttagcaaaaaaggattgat 33638249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 42826647 - 42826932
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||            | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42826647 actagttacaaacccgtgcttcgcaagggttcaataatgtattcgataaaaaaaaaa--tcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 42826744  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42826745 tcataaaatatgtataggctgattaagagagcgtgtaaaa--tttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaataattggaaccaataaag 42826842  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat-aaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||     ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  42826843 gaaacaatgatgtgtgaattatgattacacattattcaaaattataaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaagattgat 42826932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 27734394 - 27734624
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27734394 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattg--attcattataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 27734491  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27734492 gaattgacataataattaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 27734590  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  27734591 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 27734624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 489 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 14309816 - 14309553
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||        |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14309816 tactagttacgaatccgtgcttcgcacgggttcaatgacgtattcgataaaaaaaata-tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacatcgtgattc 14309718  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaa---- 684  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        
T  14309717 atcatagaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaa 14309618  T
Q  685 ----------taaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
              ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309617 ttggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagt 14309553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 551 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 19522046 - 19521852
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  19522046 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataaccagtttatgagattatgaattg 19521947  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||            |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19521946 acataatatttaggttgaaaacaattggaac------------caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttattgttat 19521859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 9150245 - 9150012
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9150245 ttcttcgaaagaaaagatgtataaacgaaggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 9150146  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaac-aattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagag 738  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150145 gaattgacataatatttaggatgaaaacaaaaaggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagag 9150047  T
Q  739 tgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  9150046 tgttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 9150012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 621 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17483188 - 17483036
Alignment:
Q  621 catataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatc 720  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17483188 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaatttacatattatc 17483089  T
Q  721 caaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17483088 caaaattataaaaaagaatgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 17483036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 621 - 773
Target Start/End: Original strand, 17570026 - 17570178
Alignment:
Q  621 catataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatc 720  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17570026 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaatttacatattatc 17570125  T
Q  721 caaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17570126 caaaattataaaaaagaatgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 17570178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 583 - 747
Target Start/End: Original strand, 23765847 - 23766011
Alignment:
Q  583 tgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaacc 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23765847 tgattcatcataaaatatgtatgacctgatttagaaagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaacc 23765946  T
Q  683 aataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23765947 aataaatgaatcaatgatgtgtgaatttacatattatcgaaaattataaaaaagagttttgttgt 23766011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 621 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17478753 - 17478601
Alignment:
Q  621 catataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatc 720  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17478753 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaatttacatattatc 17478654  T
Q  721 caaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17478653 caaaattgtaaaaaagaatgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 17478601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 621 - 773
Target Start/End: Original strand, 17574461 - 17574613
Alignment:
Q  621 catataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatc 720  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17574461 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaatttacatattatc 17574560  T
Q  721 caaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17574561 caaaattgtaaaaaagaatgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 17574613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 49145635 - 49145819
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  49145635 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgatttagagatcatataatcagtttatttgattag 49145734  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||     |||||||||||||||||    
T  49145735 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaa 49145819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 681
Target Start/End: Original strand, 48528137 - 48528273
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48528137 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 48528236  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaac 681  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  48528237 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaac 48528273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 546 - 685
Target Start/End: Original strand, 39649328 - 39649467
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  39649328 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 39649427  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  39649428 aattgacataatatttaggatgaaaataattgaaaccaat 39649467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 546 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 4849017 - 4848834
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  4849017 tcttcgaaagaaaagatcttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4848918  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  4848917 aattgacataatgtttaagttgaaaacaattggaaccaa-aaaagaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4848834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17170933 - 17170801
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17170933 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 17170834  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17170833 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 17170801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 681
Target Start/End: Original strand, 31898168 - 31898304
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31898168 ttcttcgaaagaaaggatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 31898267  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaac 681  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31898268 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaac 31898304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 6911421 - 6911475
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6911421 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatg 6911475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 581
Target Start/End: Original strand, 23762347 - 23762437
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacatt 581  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762347 actagttacaaacttgtgcttcgcacgagttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacatt 23762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 47573399 - 47573453
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47573399 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatg 47573453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 6911359 - 6911398
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6911359 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 6911398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 47573333 - 47573372
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47573333 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 47573372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 691330 - 691288
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  691330 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 691288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 21669232 - 21669274
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  21669232 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 21669274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 31896814 - 31896856
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  31896814 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 31896856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 39278279 - 39278237
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  39278279 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 39278237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 39647982 - 39648024
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  39647982 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 39648024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 12960648 - 12960607
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  12960648 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 12960607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 44407335 - 44407052
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44407335 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 44407236  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44407235 tcataaaatatgtatgggctgattaaaagagcatataatcagtttataagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaag 44407136  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44407135 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 44407052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 489 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31620641 - 31620384
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31620641 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattc 31620543  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31620542 atcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatttttaggatgaaaactattggaaccaataaa 31620443  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31620442 ggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 31620384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 34693060 - 34692810
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34693060 actagttacaaacccgtgct-------ggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaatagatattaaaacgacggaacattgtgattca 34692968  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34692967 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 34692868  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34692867 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 34692810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 34688532 - 34688282
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34688532 actagttacaaacccgtgct-------ggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaatagatattaaaacgacggaacattgtgattca 34688440  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34688439 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 34688340  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34688339 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 34688282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 490 - 739
Target Start/End: Original strand, 41829350 - 41829598
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||        ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41829350 actagttacaaacccgtgctttgcacgg-ttcaataacgtatttgataaaaaaaattctttgaaagaatagttgttaaaacgacggaacattatgattca 41829448  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41829449 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 41829548  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41829549 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagt 41829598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 490 - 735
Target Start/End: Original strand, 38844474 - 38844718
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38844474 actagttacaaacccgtgtttcgtacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattca 38844572  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38844573 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 38844672  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38844673 gaaccaatgatctgtgaatttacgtattatccaaaattataaaaaa 38844718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 45005747 - 45005478
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45005747 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataatatattcgataaaaaa--ttctttgaaagaagagatgttaaaacgatggagcattgtgattca 45005650  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45005649 tcataaaatatgtataggctgattaagaaagcatataattagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 45005550  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
     ||| ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45005549 aaat-aatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 45005478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 546 - 747
Target Start/End: Original strand, 52520972 - 52521173
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  52520972 tctttgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatacgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatg 52521071  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52521072 aattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaaggaaccaatgatatgtgaatttacatattattcaaaattataaaaaagagtgttgtt 52521171  T
Q  746 gt 747  Q
    ||    
T  52521172 gt 52521173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 546 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18815115 - 18814914
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  18815115 tctttgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggtctgttttagagatcatataatcagtttatgagattagg 18815016  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18815015 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattatagaaaagagttttgtt 18814916  T
Q  746 gt 747  Q
    ||    
T  18814915 gt 18814914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 551 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 17672370 - 17672159
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||    
T  17672370 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcataaaattaatttatgagattaggaattg 17672271  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17672270 acataatatttaggacgaaaaccattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagcgttgtt 17672171  T
Q  746 gttatagagtta 757  Q
    ||||||||||||    
T  17672170 gttatagagtta 17672159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 551 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 47136192 - 47135982
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47136192 gaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 47136093  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47136092 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 47135994  T
Q  746 gttatagagtta 757  Q
    ||| ||||||||    
T  47135993 gttgtagagtta 47135982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 36683016 - 36682746
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36683016 actagttataaacccatgcttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaa--ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggagcattgtgattca 36682919  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36682918 tcataaaatatgtatgggctgattaagaaaacatataattagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggatccaataaag 36682819  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat-aaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
     ||| ||  ||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36682818 aaat-aaggatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaaagagtgttgttgttatagagtta 36682746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 52310758 - 52310526
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52310758 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagatgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 52310659  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52310658 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtatgaattatgattacatattatctaaaattataaaaaagagt 52310560  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  52310559 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 52310526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 549 - 747
Target Start/End: Original strand, 41962294 - 41962483
Alignment:
Q  549 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaat 648  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||         ||| |||||||||||||| |||    
T  41962294 ttgaaagaagagatgctaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaaga---------atcagtttatgagattaggaat 41962384  T
Q  649 tgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41962385 tgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 41962483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Original strand, 12245172 - 12245436
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12245172 actagttacaaacccgtgctttgcacgggttcaataatatattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattca 12245270  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||       |  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12245271 tcataaaatatgtatgagctgattaagagag-------ttagtttatgagattataatttgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaag 12245363  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
    ||| |||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245364 gaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattattcaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 12245436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 551 - 735
Target Start/End: Original strand, 16030946 - 16031134
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  16030946 gaaataagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagaatataattagtttatgagattaggaattg 16031045  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat----ttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16031046 acataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaaggaaacaatgatgtgtgattatgattacatattatccaaaattataaaaaa 16031134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 550 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 48341235 - 48341007
Alignment:
Q  550 tgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaatt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  48341235 tgaaagaagagatgttaaaacgataaaatattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaaagcatctaatcagtttttgagattaggaatt 48341136  T
Q  650 gacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  48341135 gacataatatttagaatgaaaacaattggaactaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattacaaaaaaaaatgtttt 48341036  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  48341035 tgttatagagttaccaaaaaaggattgat 48341007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 50561971 - 50561741
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  50561971 ttcttcgaaataaaagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgatttagagatcatataatcagtttat--gattag 50561874  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50561873 gaattgacataatatttagaatgaaaacaattgaaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 50561775  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  50561774 gttgttgttttagagttatcaaaaaaggattgat 50561741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 551 - 734
Target Start/End: Original strand, 10694138 - 10694325
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  10694138 gaaagaaaagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatacgtatgggctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaagaattg 10694237  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaa 734  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  10694238 acataatatttaggatgaaaacaattggaaacaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaa 10694325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 551 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 5426893 - 5426715
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5426893 gaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattatgaattg 5426794  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  5426793 acataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 5426715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 51965187 - 51965410
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaa-tatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagatta 643  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51965187 ttctttgaaaggaaagatgttaaaacgagagaacattgtgattcatcataaaaatatgtatgtgctgatttagagatcatataatcagtttatgagatta 51965286  T
Q  644 gaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattat-aaaaaagagtgtt 742  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |  | ||| |||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51965287 ggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat-gatgtgtgaattatg------attacatattatccaaaagtataaaaaaagagtgtt 51965379  T
Q  743 gttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  51965380 gttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 51965410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 16300966 - 16300781
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16300966 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 16300867  T
Q  645 aaattgacataat-atttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  16300866 gaattgacataatgttttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 16300781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4892007 - 4891875
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4892007 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 4891908  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4891907 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 4891875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Original strand, 29186480 - 29186612
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29186480 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 29186579  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29186580 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 29186612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33361610 - 33361478
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33361610 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatttatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 33361511  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  33361510 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 33361478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 551 - 770
Target Start/End: Original strand, 17707244 - 17707455
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||  |||||    
T  17707244 gaaagaatagatgttaaaat-acggaacatcgtgattcattataaaatatatatgggctgattaagagtgcacataatcaatttatgagattatgaattg 17707342  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||            |||| || |||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17707343 acataatatttaggatgaaaataatttgaac------------caatgatatgtgaattattattatatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 17707430  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgatt 770  Q
     |||||||||||  |||||||||||    
T  17707431 attatagagttaccaaaaaatgatt 17707455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 24294910 - 24294796
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||        ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294910 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaataa-ttcttcgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattca 24294812  T
Q  590 tcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  24294811 tcataaaatatgtatg 24294796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Original strand, 50394967 - 50395082
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||           || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50394967 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtttttgataaaaaaaaaaattcgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattca 50395066  T
Q  590 tcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  50395067 tcataaaatatgtatg 50395082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 545 - 605
Target Start/End: Original strand, 39760073 - 39760133
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39760073 ttcttcgaaagaagatatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatg 39760133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 43254614 - 43254668
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43254614 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 43254668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 529
Target Start/End: Original strand, 43254554 - 43254594
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43254554 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 43254594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4894009 - 4893967
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4894009 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 4893967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 10763629 - 10763587
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  10763629 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 10763587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 29840690 - 29840732
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  29840690 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 29840732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 38896856 - 38896814
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  38896856 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 38896814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 42682633 - 42682591
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  42682633 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 42682591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 3929748 - 3929789
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  3929748 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 3929789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 28565430 - 28565471
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  28565430 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 28565471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 35042038 - 35041756
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35042038 actagttacaaacccgtgtttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaagattgtgattca 35041939  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35041938 tcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggat-gaaacaattggaaccaataaag 35041840  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35041839 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttattatagagttactaaaaaataattgat 35041756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 18312741 - 18312458
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgctt-cgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||        | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18312741 actagttacaaacccgtgctttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttgaaacgacagaacattgtgattc 18312643  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18312642 atcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaa 18312543  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18312542 ggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 18312458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 18598305 - 18598561
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598305 actagttccaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttatttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 18598403  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18598404 tcataaaatatgtatgggctgcttaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 18598503  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18598504 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 18598561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 22373140 - 22373422
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22373140 actagttacaaacatgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagatatgttaaaactacggaatattgtgattca 22373238  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  22373239 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcacataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattagacccaataaag 22373338  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22373339 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttcttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 22373422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 1072583 - 1072839
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1072583 actagttacaaattcgtgtttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgaaattca 1072681  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1072682 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 1072781  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1072782 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 1072839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 21800468 - 21800212
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21800468 actagttataaacccgtgcttcgcattggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgtaaaaacgacggaacattgtgatgca 21800370  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21800369 tcataaaatatgtatgacctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 21800270  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21800269 aaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 21800212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17940415 - 17940188
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  17940415 tcttcgaaagaagagatgctaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagagaacatataatcagtttatgagattagg 17940316  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17940315 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtgttgtt 17940216  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17940215 gttatagagttaccaaaaaatgattgat 17940188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 488 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 33814920 - 33814662
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||        | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33814920 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcagtaacgtatttgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgataaaacgacgaaacattgtgatt 33814822  T
Q  588 catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33814821 catcataaaatatgtatgggatgattaagagagcatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataa 33814722  T
Q  688 aggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33814721 aggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaatagtgttgttgt 33814662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 34856825 - 34856623
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34856825 ttctttgaaagaagagatgttaaaactacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 34856726  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34856725 gaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgt 34856626  T
Q  745 tgt 747  Q
    |||    
T  34856625 tgt 34856623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 490 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 15276584 - 15276320
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaa-gagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||        ||    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15276584 actagttacaaactcgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcaataaaaaaaatt----gaaagaaagagatgttaaaatgacggaatattgtgattc 15276489  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15276488 atcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagattgggaattaacataatatttatgataaaaacaattggaaccaataaa 15276389  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagtta 757  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15276388 ggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgatgttgttatagagtta 15276320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 11932802 - 11933058
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||        | |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11932802 actagttacaaactcgtgcttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaaaat-ctttaaaagaagataagttaaaacgacggaacattgtgattca 11932900  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11932901 tcataaaatatgtatgacctgattaagagagtatataatcagtttaagagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaag 11933000  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11933001 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaaaagtgttgttgt 11933058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 546 - 739
Target Start/End: Original strand, 14887313 - 14887506
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  14887313 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaag 14887412  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14887413 aattgacataatatttaggatgaaaactattgaaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatcaaaaattataaaaaagagt 14887506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 4425373 - 4425153
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||         ||    
T  4425373 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagagagcatataatcagtt---------ag 4425283  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425282 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 4425183  T
Q  745 tgttatagagtta-ataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4425182 tgttatagagttaccaaaaaaatgattgat 4425153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 7223249 - 7222979
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||| |||        || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7223249 actagttacaaacctgtgtttcgcacgggttcaatgacgtatttgataaaaaaaatt-tttgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattca 7223151  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||            
T  7223150 tcataaaatatgtatctgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacatttgaaac-------- 7223059  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
        |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  7223058 ----caatgatgtatgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtaatagagttaccaaaaaatgattgat 7222979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 552 - 773
Target Start/End: Original strand, 33320807 - 33321032
Alignment:
Q  552 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattga 651  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33320807 aaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattga 33320906  T
Q  652 cataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttg 746  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33320907 cataatatttaggatgaaaacaattagaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgttaattatgattacatgttatccaaaattataaaaaagagtgttgttg 33321005  T
Q  747 ttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    || ||||||||  |||||| |||||||    
T  33321006 ttgtagagttaccaaaaaaggattgat 33321032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 14832383 - 14832150
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14832383 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 14832284  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaa-gag 738  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14832283 gagttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaacgaaccaatgatgtttgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaacgag 14832185  T
Q  739 tgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  14832184 tgttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 14832150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 34321984 - 34321763
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34321984 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcatgaaatatgtacgggcagattaagagagcatataatcagtttatgagattag 34321885  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  |  ||| |||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321884 aaattggcataatatttaggatgaaaacaattggaaccaatgatgtga-gaattatg------attacacattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 34321792  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  34321791 tgttatagagttaccaaaaaaggattgat 34321763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 4108625 - 4108441
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  4108625 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcattataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaa 4108526  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  4108525 gaattgacataatatttaggatgaaaacaataggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4108441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 490 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 25540890 - 25540645
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||        |     ||||||| |||| ||||||||||  || ||| |||||||    
T  25540890 actagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaataacgtattcgataaaaaaaatc----gaaagaaaagatattaaaacgacaaaaaattatgattca 25540795  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25540794 tcataaaatatgtatggcctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaag 25540696  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  25540695 gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaa 25540645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 35158870 - 35158714
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35158870 ttcttcgaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatctgtatggactgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 35158771  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgt 702  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  35158770 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgt 35158714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1220425 - 1220293
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1220425 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 1220326  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1220325 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 1220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24445834 - 24445702
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24445834 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 24445735  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24445734 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 24445702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 490 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 2522065 - 2521928
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2522065 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattca 2521967  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataat 628  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  2521966 tcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataat 2521928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Original strand, 9979441 - 9979573
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9979441 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 9979540  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  9979541 gaattgacataatttttagaatgaaaacaattg 9979573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 653 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 2521932 - 2521850
Alignment:
Q  653 ataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2521932 ataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 2521850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 702 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 30044946 - 30044876
Alignment:
Q  702 tgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  30044946 tgtgagtttacatattatccaaaattataaaaaagagtgtt-ttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 30044876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 13456795 - 13456849
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13456795 gaaagaagatatgttaaaacgatggaacattataattcatcataaaatatgtatg 13456849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 488 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4110104 - 4110060
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4110104 atactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 4110060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 490 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22323828 - 22323724
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||        | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22323828 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcagtaacatattcgat-aaaatattacattgaaaggatagatgttaaaacgacggaacatcatgattca 22323730  T
Q  590 tcataa 595  Q
    | ||||    
T  22323729 ttataa 22323724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 13456735 - 13456774
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13456735 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 13456774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 651 - 725
Target Start/End: Original strand, 28573340 - 28573418
Alignment:
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  28573340 acataatgtttaggatgaaaacgattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 28573418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 1222426 - 1222384
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  1222426 actagttacaaacccgtgcttcgcatggattgaataacgtatt 1222384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 6966237 - 6966279
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6966237 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 6966279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 24447836 - 24447794
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  24447836 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 24447794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 18389168 - 18389209
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  18389168 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 18389209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33319090 - 33319049
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  33319090 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 33319049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 548 - 773
Target Start/End: Original strand, 23521994 - 23522219
Alignment:
Q  548 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaa 647  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23521994 tttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaa 23522093  T
Q  648 ttgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23522094 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtttgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 23522193  T
Q  748 tatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  23522194 tatagagttactaaaaaatgattgat 23522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 490 - 779
Target Start/End: Original strand, 19394839 - 19395127
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19394839 actagttacaaacccgtgcttcgcaggggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttctaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 19394937  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19394938 tcataaaatatgtatgggcagattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgatataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 19395037  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  19395038 gaaccaatgatgtgtgaatttacattttatccaaaattataaaaaagagtgttattgttatagagttaccaaaaaatgattgatgcccat 19395127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 22332005 - 22332286
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||         |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332005 actagttacagacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcaataaataaaaat--ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 22332102  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22332103 tcataaaatatgtacgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaatttgaaccaataaag 22332202  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22332203 gaaccaatgatgtatgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 22332286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 14078130 - 14078386
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078130 actagttacaaacccgtgcttcgctgaggttcaataacgtattcgataattattttt-tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 14078228  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14078229 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataaccagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 14078328  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14078329 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 14078386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 36597312 - 36597594
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36597312 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaatgacatatttgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatgca 36597410  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  36597411 tcataaaatatgtatgggttgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattggaactaataaag 36597510  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  36597511 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtaatagagttaccaaaaaatgattgat 36597594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 44600416 - 44600129
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgc----ttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtga 585  Q
    ||||||||||||||||| |    |||| | |||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44600416 actagttacaaacccgtacgaacttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtga 44600317  T
Q  586 ttcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44600316 ttcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaattgacataatatgtaggatgaaaacaattggaaccaat 44600217  T
Q  686 aaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44600216 aaagaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 44600129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27273919 - 27273663
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273919 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 27273821  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  27273820 tcaaaaaatatatatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaat 27273721  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27273720 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 27273663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Original strand, 33423613 - 33423815
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33423613 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 33423712  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33423713 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgt 33423812  T
Q  745 tgt 747  Q
    |||    
T  33423813 tgt 33423815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 38994400 - 38994112
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgc----ttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtga 585  Q
    ||||||||||||||||| |    |||| | |||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38994400 actagttacaaacccgtacgaacttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtga 38994301  T
Q  586 ttcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaat 685  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38994300 ttcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaattgacataatatgtaggatgaaaacaattggaaccaat 38994201  T
Q  686 aaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaatt-ataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38994200 aaagaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattaataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 38994112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 7015806 - 7015580
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||||  ||||    
T  7015806 ttcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagtgagcatataatcagtctatga--ttag 7015709  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7015708 gaattgacataatatttaagatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 7015609  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7015608 tgttatagagttatcaaaaaatgattgat 7015580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 42785856 - 42785600
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||        || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42785856 actagttacaaacccgtgtttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaaa-ttatttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattca 42785758  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42785757 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaagaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaag 42785658  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42785657 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaatagtgttgttgt 42785600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 9761901 - 9761699
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9761901 ttctttgaaagaagagatgttagaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 9761802  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9761801 gaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaatagtgttgt 9761702  T
Q  745 tgt 747  Q
    |||    
T  9761701 tgt 9761699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5836281 - 5836027
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5836281 actagttacaaacctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattca 5836183  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  5836182 tcataaaatatgtatgggctgattaagag--catataatcagttaatgagattaggaattgacataatatttatgaaaaaaacaattggaaccaataaaa 5836085  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836084 gaactaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 5836027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 490 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30827077 - 30826837
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30827077 actagttacaaacccgtgcttcgtacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaaa--ttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattca 30826980  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  30826979 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatacgattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaacaaag 30826880  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaa 732  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826879 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaa 30826837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 516 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 38962866 - 38962591
Alignment:
Q  516 gggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaa 615  Q
    ||||| |||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  38962866 gggtttaataacgtattcgataaaaaaaattctttgaaagaagtgatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatacatgggctgattaa 38962767  T
Q  616 gagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaa------------taaaggaatcaataatgtg 703  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||            |||||||| |||| |||||    
T  38962766 gagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaaccaataaaggaaccaatgatgtg 38962667  T
Q  704 tgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  38962666 tgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatatccat 38962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 44382127 - 44382359
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44382127 ttcttcgaaagaaaagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 44382226  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382227 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 44382325  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  44382326 gttgttgttgtagagttaccaaaaaatgattgat 44382359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 41629527 - 41629317
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  41629527 gaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagactaggaattg 41629428  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41629427 acaaaatatttaggatgaaaacaattggaac------------caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 41629340  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  41629339 agagttaccaaaaaatgattgat 41629317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 595 - 773
Target Start/End: Original strand, 6476874 - 6477052
Alignment:
Q  595 aaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatc 694  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6476874 aaatatgtatgggatgattaatagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatataggataaaaacaattggaaccaataaaggaacc 6476973  T
Q  695 aataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6476974 aataatgtgtgaatatacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 6477052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 514 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 19248814 - 19248547
Alignment:
Q  514 atgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttatt 613  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  19248814 atgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaggaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgagctgatg 19248716  T
Q  614 aagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat----- 708  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||         
T  19248715 aagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattataa 19248617  T
Q  709 ttacatattatcc--------aaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgatt 770  Q
    ||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19248616 ttacacattatccaaaattataaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgatt 19248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 514 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 19321998 - 19321731
Alignment:
Q  514 atgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttatt 613  Q
    |||||||||||||||||||||||        ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||     
T  19321998 atgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaggaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgagctgatg 19321900  T
Q  614 aagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat----- 708  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||         
T  19321899 aagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattataa 19321801  T
Q  709 ttacatattatcc--------aaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgatt 770  Q
    ||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19321800 ttacacattatccaaaattataaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgatt 19321731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 545 - 779
Target Start/End: Original strand, 41533186 - 41533424
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  41533186 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacaggacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcaatttatgagattag 41533285  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41533286 gaattgacataatatttaggaagaaagcaattggaacgaa-aaaggaaccaataatgtgtgaattatgattgcatattatccaaaattataaaaaagagt 41533384  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  41533385 gttgttgttgtagagttaccaaaaaacgattgatatccat 41533424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 560 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 3751749 - 3751542
Alignment:
Q  560 gatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatat 659  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3751749 gatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcaaaaaatatgtataggctgatttagagattatataatcagtttatgagattaggaattgacataatat 3751650  T
Q  660 ttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaat 759  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||      
T  3751649 ttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaat-----tattatccaaaattataaaaaagagttttgttgttgtagagttacc 3751556  T
Q  760 aaaaaatgattgat 773  Q
    |||||| |||||||    
T  3751555 aaaaaaggattgat 3751542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 552 - 773
Target Start/End: Original strand, 22946140 - 22946359
Alignment:
Q  552 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattga 651  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||       |  |||||||||||||||| ||||    
T  22946140 aaagtagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatgagctgattaagagag-------ttagtttatgagattagaatttga 22946232  T
Q  652 cataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttg 746  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22946233 cataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattattcaaaattataaaaaagaacgttgttg 22946332  T
Q  747 ttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||    
T  22946333 ttatagagttaccaaaaaaggattgat 22946359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 545 - 756
Target Start/End: Original strand, 45291817 - 45292032
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45291817 ttcttcgaaagaagatacgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgggctgattaagagagcatataataagtttatgagattag 45291916  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| ||||| ||||     ||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  45291917 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattatcaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattatgattacacattatccaaaattattaaaaagatt 45292015  T
Q  740 gttgttgttatagagtt 756  Q
    |||||||||||||||||    
T  45292016 gttgttgttatagagtt 45292032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 4465823 - 4466007
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||     
T  4465823 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcaatttatgagattat 4465922  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  4465923 gaattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4466007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 545 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 41978161 - 41977955
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  41978161 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacgttgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgaaattag 41978062  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaa-----tttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||      ||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  41978061 gaatggacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaagaaaccaatgatgtgtgaagtatgattacatattattc-aaattataaaaaatagt 41977964  T
Q  740 gttgttgtt 748  Q
    |||||||||    
T  41977963 gttgttgtt 41977955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 7389887 - 7389704
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  7389887 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatttaatcagtttatgagattag 7389788  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  7389787 gaattgacataatgtttaggaggaaaacaattggaaccaa-aaagg-atcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 7389704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 633 - 773
Target Start/End: Original strand, 42810359 - 42810493
Alignment:
Q  633 ttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaa 732  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      ||||||||||||||    
T  42810359 ttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttac------tccaaaattataaa 42810452  T
Q  733 aaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42810453 aaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 42810493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 545 - 698
Target Start/End: Original strand, 25615859 - 25616011
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25615859 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaatgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 25615958  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaata 698  Q
     |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25615959 gaattgacataatgtttaggatgataacaattggaaccaa-aaaggaatcaata 25616011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12760884 - 12760752
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12760884 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgatttagagatcatataatctgtttatgagattag 12760785  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12760784 gaattgacataatatataggatgaaaacaattg 12760752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 621 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 41157183 - 41157051
Alignment:
Q  621 catataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacata 715  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||    
T  41157183 catataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacata 41157084  T
Q  716 ttatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtt 748  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157083 ttatccaaaattataaaaaagagtgttgttgtt 41157051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 551 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 25345193 - 25345015
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  25345193 gaaagaaaagatgttaaaaaaacggaacattgtggttcatcataaaatatgtatgggctgattgaaagatcatataatctgtttatgagattaggaatta 25345094  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  25345093 acataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 25345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 25620133 - 25620317
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  25620133 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcttaaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattgg 25620232  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  25620233 gaattggaataatgtttaggatgaaaacaattggaa-taaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 25620317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 699 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 38993016 - 38992935
Alignment:
Q  699 atgtgtgaatttacatattatccaaaatta-taaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgatgtccat 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  38993016 atgtgtgaatttacatattatccaaaattaataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatatccat 38992935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Original strand, 6300489 - 6300601
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||         ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6300489 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtttttgataaaaaaaaatc---gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattca 6300585  T
Q  590 tcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  6300586 tcataaaatatgtatg 6300601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 44940560 - 44940445
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||           || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44940560 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtttttgataaaaaaaaaa-ttcgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattc 44940462  T
Q  589 atcataaaatatgtatg 605  Q
    |||||||||||||||||    
T  44940461 atcataaaatatgtatg 44940445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 42060725 - 42060779
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42060725 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatg 42060779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 37029956 - 37029841
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||            | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37029956 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtttttgataaacaaaaaaaatcgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattca 37029857  T
Q  590 tcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||| ||||    
T  37029856 tcataaaatatatatg 37029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 41157229 - 41157180
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcata 594  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157229 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcata 41157180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 551 - 605
Target Start/End: Original strand, 23966450 - 23966504
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  23966450 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcttcataaaatatgtatg 23966504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 12660958 - 12660999
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12660958 actagttacaaacccgtgcttcgcatgggttaaataacgtat 12660999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 23966383 - 23966422
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23966383 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 23966422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 529
Target Start/End: Original strand, 42060662 - 42060701
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42060662 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgt 42060701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 18375558 - 18375600
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18375558 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 18375600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 370 - 416
Target Start/End: Original strand, 35094566 - 35094612
Alignment:
Q  370 gaatgaatgcttattagacattacctttgaaaattaatagaataagt 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||    
T  35094566 gaatgaatgcttattaggcattacctttgaaaactgattgaataagt 35094612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36778521 - 36778479
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  36778521 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 36778479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 40586443 - 40586485
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  40586443 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 40586485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 41158685 - 41158643
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  41158685 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 41158643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 2961009 - 2961050
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  2961009 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 2961050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27272727 - 27272686
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27272727 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 27272686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 488 - 773
Target Start/End: Original strand, 18741515 - 18741799
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    |||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18741515 atactagttacaaatctgtacttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaattt-tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 18741613  T
Q  588 catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18741614 catcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttataagattaggaattgacataatatttagaatgaaaacaattggaaccaataa 18741713  T
Q  688 aggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18741714 aggaaccaatgatgtgtgaatttaaatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 18741799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 489 - 747
Target Start/End: Original strand, 50770558 - 50770815
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50770558 tactagttaaaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 50770656  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50770657 atcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaa 50770756  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50770757 ggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 50770815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Original strand, 21698931 - 21699158
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21698931 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 21699030  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21699031 aattgacataatatttaggatgaaaacaatttgaaccaataaaggaactaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagaatgttgtt 21699130  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  21699131 gttataaagttacgaaaaaatgattgat 21699158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 50742337 - 50742056
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50742337 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtatttga--aaaaaaattctttaaaagaagtgatgctaaaatgacggaacattgtgattca 50742240  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50742239 tcataaaatatgtatgggataattaagagagcatataaacagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaacaaataaag 50742140  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50742139 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 50742056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 489 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 51249270 - 51248987
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51249270 tactagttacaaatccgtgctatgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatgctaaaacgatggaacattgtgattc 51249172  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51249171 atcataaaatatgtatgggctgattaagagagcacataatcaatttatgagattatgaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaa 51249072  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51249071 ggaaccaatgatgtgtgaatttatatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 51248987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 485 - 747
Target Start/End: Original strand, 31368322 - 31368584
Alignment:
Q  485 aagatactagttacaaacccgtgcttcgtatggg-ttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgt 583  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368322 aagaaactagttacaaacccgtgcttcgcacggggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgt 31368420  T
Q  584 gattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaacca 683  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  31368421 gattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaggaattgacataatatttagaatgaaaactattggaacca 31368520  T
Q  684 ataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31368521 ataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttgt 31368584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 19406680 - 19406908
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19406680 ttctttaaaaaaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 19406779  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19406780 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 19406879  T
Q  745 tgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  19406880 tgtaatagagttaccaaaaaatgattgat 19406908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 509 - 773
Target Start/End: Original strand, 54648199 - 54648462
Alignment:
Q  509 ttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgc 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  54648199 ttcgcatgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-ctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggt 54648297  T
Q  609 ttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat 708  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  54648298 tgattaagagagcatgtaatcagtttatgagattagtaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat 54648397  T
Q  709 ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  54648398 ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttattatagagttaccaaaaaatgattgat 54648462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 52852744 - 52853026
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  52852744 actagttacaaactcgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagatatgttaaaacaatggaatattatgattca 52852842  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  52852843 ttataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaggaattaacataatatttaggatgaaaacaattagaaccaataaag 52852942  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52852943 gaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttataaagttactaaaaaatgattgat 52853026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 16342619 - 16342339
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||         |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  16342619 actagttacaaacccgtgtttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaaatctttgaaagaagagtaattaaaacgacggaacattatgattca 16342520  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  16342519 tcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagaataaaaattgacataatatttaggatgaaaacaa---gaaccaataaag 16342423  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  16342422 aaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 16342339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 490 - 735
Target Start/End: Original strand, 6103433 - 6103677
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6103433 actagttacaaacctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattatgattca 6103531  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6103532 tcataaaatatgtatgagctgattaagatagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaag 6103631  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6103632 gaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaa 6103677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 52462215 - 52462502
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52462215 actagttacaaatccgtgcttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaaaat-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattatgattca 52462313  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52462314 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagaatataatcagtttatgagattaagaattgaaataatatttaggatggaaacaattggaaccaataaag 52462413  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||    
T  52462414 gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgctgttatagagttaccaaaaaaggattgat 52462502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 54934775 - 54934489
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54934775 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaaa--tctttaaaagaagagatgttaaaacgaaggaacattgtgattca 54934678  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  54934677 tcataaaatatgtatggactgattaagaaagcatatcattagtttatgagattaagaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaag 54934578  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  54934577 gaaacaatgatgtgtgaatcatgattatatattatccaaaattataaaaaatagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 54934489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 49113958 - 49113748
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  49113958 gaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatgagattaggaattg 49113859  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49113858 acataatatttaggataaaaacaatt------------ggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttat 49113771  T
Q  751 agagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  49113770 agagttaccaaaaaatgattgat 49113748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 490 - 747
Target Start/End: Original strand, 35087163 - 35087408
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087163 actagttaaaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaattctttaaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 35087262  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            
T  35087263 tcgtaaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaac-------- 35087354  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35087355 ----caatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagaatgttgttgt 35087408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 488 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 32756479 - 32756197
Alignment:
Q  488 atactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatt 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||        |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32756479 atactagttacaaacccgtgcttcacatgggttcaataatatattcgataaaaaaa-ttcttcaaaagaagagatggtaaaacgacggaacattgtgatt 32756381  T
Q  588 catcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataa 687  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||       |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32756380 catcataaaatatgtatgggctgattaagagag-------ttagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataa 32756288  T
Q  688 aggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  32756287 aggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 32756197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 54513701 - 54513468
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagag--catataatcggtttatgagatta 643  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  54513701 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatat-tatgggctgattaagagagagcatataatcaatttatgagatta 54513603  T
Q  644 gaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagag 738  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54513602 ggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgcgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagag 54513503  T
Q  739 tgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  54513502 tgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 54513468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 546 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 8243418 - 8243224
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8243418 tcttcgaaagaatagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 8243319  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaa 735  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  8243318 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaa 8243224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 545 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 39093241 - 39093025
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39093241 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 39093142  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39093141 gaattgacataatatttaggatgcaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 39093043  T
Q  740 gttgttgttatagagtta 757  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  39093042 gttgttgttgtagagtta 39093025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 55294120 - 55294352
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  55294120 ttcttcgaaagaaaagattttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgcatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 55294219  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55294220 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 55294318  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  55294319 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 55294352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 23195109 - 23194872
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23195109 ttcttcgaaagaagagattttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 23195010  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt----ataaaaaa 735  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    ||||||||    
T  23195009 aaattgacataatatttaggatgaaaacaattggagctaataaagaaatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattacaaataaaaaa 23194910  T
Q  736 gagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  23194909 aagtgtttttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 23194872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 52842498 - 52842263
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52842498 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 52842399  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagag- 738  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52842398 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgacgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagc 52842300  T
Q  739 --tgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
      |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  52842299 gttgttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 52842263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 48520379 - 48520611
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48520379 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattgatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 48520478  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520479 gaattgacataatatttagaatgaaaacaattggaaccaa-aaagtaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 48520577  T
Q  740 gttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  48520578 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgat 48520611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 545 - 773
Target Start/End: Original strand, 40824009 - 40824241
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  40824009 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagaaaatataaacagtttatgagattag 40824108  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40824109 gaattgacataatattt-ggatgaaaacaatttgaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 40824206  T
Q  740 gttgttgttatagagtta-ataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  40824207 gttgttgttgtagagttaccaaaaaaatgattgat 40824241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Original strand, 2839569 - 2839777
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  2839569 ttctttgagagaagagatgttaaaacgacggaacattgtaattcattataaaatatatatgagttgattaagagaacatataatcagtttatgagattaa 2839668  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatt-----tacatattatccaaaattat-aaaaaagag 738  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||     || ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2839669 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaatcaatgatgtgttaattatgattatatattattcaaaattataaaaaaagag 2839768  T
Q  739 tgttgttgt 747  Q
    |||||||||    
T  2839769 tgttgttgt 2839777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 559 - 725
Target Start/End: Original strand, 4138140 - 4138310
Alignment:
Q  559 agatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataata 658  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  4138140 agatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatg 4138239  T
Q  659 tttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  4138240 tttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaagaaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4138310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 545 - 725
Target Start/End: Original strand, 26777272 - 26777456
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26777272 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttcgagatcatataatcagtttatgagattag 26777371  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
     ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  26777372 gaattggcataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaactaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 26777456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 490 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 19353836 - 19353698
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19353836 actagttacaaatctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattca 19353738  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatc 629  Q
    ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  19353737 tcataaaatatgtatggattgattaagagagcatataatc 19353698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 614 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 48977749 - 48977607
Alignment:
Q  614 aagagagcatataatcggttt--atgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaattta 711  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |            | ||||||||||    
T  48977749 aagagagcatataatcagtttttatgagattttgaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaaccaatga------------tttgtgaattta 48977662  T
Q  712 catattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaat 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48977661 catattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaat 48977607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 492 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 48989022 - 48988911
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 591  Q
    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||        | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48989022 tagttacaaaccagtgtttcgcacgggttcaataacgtatttgataaaaaaaat-cttcgaaagaagtgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 48988924  T
Q  592 ataaaatatgtat 604  Q
    |||||||||||||    
T  48988923 ataaaatatgtat 48988911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 549 - 635
Target Start/End: Original strand, 11597366 - 11597452
Alignment:
Q  549 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggttta 635  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  11597366 ttgaaagaaaagatattaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgatttagagatcatataatcagttta 11597452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 709 - 773
Target Start/End: Original strand, 11597467 - 11597531
Alignment:
Q  709 ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  11597467 ttacatattatccaaagttataaaaaagagtgttgttcttatagagttaccaaaaaaagattgat 11597531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 605
Target Start/End: Original strand, 5252251 - 5252370
Alignment:
Q  487 gatactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttcttt-gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtga 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||         |   | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  5252251 gatactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtttttgataaacaaaaataaatcgaaggaagatatgttaaaacgacggaacattatga 5252350  T
Q  586 ttcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5252351 ttcatcataaaatatgtatg 5252370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 605
Target Start/End: Original strand, 39796355 - 39796469
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||           |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39796355 actagttacaaacccgtgcttcgcatgggttcaataacgtttttgatataaaaaaaaatc-gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattatgattca 39796453  T
Q  590 tcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  39796454 tcataaaatatgtatg 39796469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 659 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 53801068 - 53800998
Alignment:
Q  659 tttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaa 725  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||    
T  53801068 tttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 53800998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 4137400 - 4137442
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4137400 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 4137442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 8396807 - 8396765
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8396807 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 8396765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18688715 - 18688673
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18688715 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 18688673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22477947 - 22477905
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22477947 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 22477905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 35861043 - 35861001
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  35861043 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 35861001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 49114018 - 49113972
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  49114018 actagttacaaactcgtgcttcgcacaggttcaataacgtattcgat 49113972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 55290397 - 55290439
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  55290397 actagttacaaacctgtgcttcgtacgggttgaataacgtatt 55290439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 188777 - 188736
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  188777 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 188736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 530
Target Start/End: Original strand, 44186858 - 44186899
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgta 530  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  44186858 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgagttcaataacgta 44186899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 2709 - 2991
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2709 actagttacaaacccgtgcttcacacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaagagatattaaaatgacggaacattgtgattca 2807  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2808 tcaaaaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaatgcaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 2907  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2908 aaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 2991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 14619 - 14909
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14619 actagttacaaacccgtgcttcgtacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttaaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattca 14717  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14718 tcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 14817  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattat--------aaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14818 gaaccaatgatctgtgaatttacgtattatccaaaattataaaaaaaaaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgat 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 546 - 773
Target Start/End: Original strand, 377 - 604
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  377 tcttcgaaagaagagatgttaacacgatggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 476  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  477 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatttacatattatgtaaaattataaaaaagagtgttgtt 576  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  577 gttatagagttaccaaaaaatgattgat 604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 492 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 101680 - 101394
Alignment:
Q  492 tagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatc 591  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||         |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  101680 tagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataatgtattcgataaaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatc 101581  T
Q  592 ataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaagga 691  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  101580 ataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaagga 101481  T
Q  692 atcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    | |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  101480 aacaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagcgtttttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 101394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 554 - 773
Target Start/End: Original strand, 25712 - 25931
Alignment:
Q  554 agaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgaca 653  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  25712 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 25811  T
Q  654 taatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttataga 753  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  25812 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattctaaaaaagagttttgttgtaataga 25911  T
Q  754 gttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||  |||||| |||||||    
T  25912 gttaccaaaaaaggattgat 25931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 536
Target Start/End: Original strand, 25613 - 25660
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25613 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgat 25660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1891 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 317 - 115
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  317 ttctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaactttgtgattcatcataaaatatatatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 218  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  217 gaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgt 118  T
Q  745 tgt 747  Q
    |||    
T  117 tgt 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5387 - 5185
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5387 ttctttgaaagaagagatgttaaaacaacggaacattgtaattcattataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 5288  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgt 744  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5287 gaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagttttgt 5188  T
Q  745 tgt 747  Q
    |||    
T  5187 tgt 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 152; Significance: 4e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 12214 - 12500
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12214 actagttacaaacctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 12312  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  12313 tcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttaggataaaaacaattagaaccaa-aagg 12411  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  12412 gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttgtagagttagcaaaaaaggattgat 12500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 490 - 773
Target Start/End: Original strand, 29639 - 29917
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattca 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29639 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaaat-cttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcc 29737  T
Q  590 tcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaag 689  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29738 tcataaaatatgtacgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaa-aaag 29836  T
Q  690 gaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  29837 gaaacaatgatgtatgaatttacacattatccaaaattataaaagaaag---tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 29917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 554 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10808 - 10615
Alignment:
Q  554 agaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgaca 653  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  10808 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 10709  T
Q  654 taatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgt 747  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10708 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattctaaaaaagagttttgttgt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 10907 - 10860
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgat 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10907 tactagttacaaacccgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgat 10860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 489 - 770
Target Start/End: Original strand, 48525 - 48804
Alignment:
Q  489 tactagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattc 588  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||        || || |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  48525 tactagttacaaacctgtgcttcgcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttattcgaaagaagagatattaaaatgacataacattgtgattc 48623  T
Q  589 atcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaa 688  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48624 atcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaactaacataatatttaggattaaaacaattggaaccaataaa 48723  T
Q  689 ggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgatt 770  Q
    | || |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  48724 gaaaccaatgatatgtgagtttacatattatccaaaattataaaaaagagtgtt-ttgttatagagttaccaaaaaaagatt 48804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 551 - 773
Target Start/End: Original strand, 10081 - 10307
Alignment:
Q  551 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattg 650  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  10081 gaaagaaaggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatctagaggtcatataatcattttatgagattaggaattg 10180  T
Q  651 acataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 745  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgtt 10279  T
Q  746 gttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  10280 gttgtagagttaccaaaaaaggattgat 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 552 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 120814 - 120589
Alignment:
Q  552 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattagaaattga 651  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  120814 aaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttaattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattga 120715  T
Q  652 cataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttg 746  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  120714 tataatatttaagat-gaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgagaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagttttgttg 120616  T
Q  747 ttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  120615 ttagagagttaccaaaaaaggattgat 120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 679 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 177237 - 177143
Alignment:
Q  679 aaccaataaaggaatcaataatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaataaaaaatgattgat 773  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  177237 aaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaatttacatattatccaaaattataaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaaggattgat 177143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 546 - 747
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4513
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  4308 tcttcgaaagaaccgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataacatttgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4407  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 740  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtg 4506  T
Q  741 ttgttgt 747  Q
    |||||||    
T  4507 ttgttgt 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 546 - 747
Target Start/End: Original strand, 10757 - 10962
Alignment:
Q  546 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattaga 645  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  10757 tcttcgaaagaaccgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataacatttgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 10856  T
Q  646 aattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 740  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10857 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagtg 10955  T
Q  741 ttgttgt 747  Q
    |||||||    
T  10956 ttgttgt 10962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 545 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 3329 - 3123
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  3329 ttcttcgaaagaaaggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggggtaatttagagatcatataatcagtttatga-attag 3231  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaatcaataatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagt 739  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3230 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaacgaatgttgtgtgaattatgattacatattatccaaaattataaaaaagagt 3132  T
Q  740 gttgttgtt 748  Q
    |||||||||    
T  3131 gttgttgtt 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Original strand, 18760 - 18892
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18760 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 18859  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18860 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 18892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Original strand, 17401 - 17443
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  17401 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 17443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13640 - 13508
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatcggtttatgagattag 644  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13640 ttcttcgaaggaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 13541  T
Q  645 aaattgacataatatttaggataaaaacaattg 677  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13540 gaattgacataatttttaggatgaaaacaattg 13508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 490 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14689 - 14647
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtatt 532  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14689 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtatt 14647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 490 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 17124 - 16982
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatg----ggttcaataacgtattcgatnnnnnnnnttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtga 585  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17124 actagttacaaacccgtgcttcgcaagcacgggttcaataacgtattcgataaaaaaa-ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtga 17026  T
Q  586 ttcatcataaaatatgtatgtgcttattaagagagcatataatc 629  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17025 ttcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatc 16982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 545 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 231880 - 231820
Alignment:
Q  545 ttctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 605  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  231880 ttcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 231820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Original strand, 24919 - 24960
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24919 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 24960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 490 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 13064 - 13023
Alignment:
Q  490 actagttacaaacccgtgcttcgtatgggttcaataacgtat 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13064 actagttacaaacccgtgcttcgcacgggttgaataacgtat 13023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University