View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7283_low_1 (Length: 420)

Name: NF7283_low_1
Description: NF7283
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7283_low_1
NF7283_low_1
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (14-420)||(44725837-44726243)
chr7 (14-420)||(24749505-24749910)
chr7 (14-367)||(28486483-28486835)
chr7 (17-420)||(21678980-21679382)
chr7 (22-420)||(9679584-9679979)
chr7 (30-420)||(24815993-24816381)
chr7 (14-299)||(4293803-4294087)
chr7 (185-420)||(38395374-38395608)
chr7 (99-420)||(44011476-44011797)
chr7 (159-367)||(1048006-1048213)
chr7 (159-367)||(22136168-22136374)
chr7 (159-367)||(40551195-40551401)
chr7 (185-367)||(7093178-7093359)
chr7 (159-365)||(20298343-20298548)
chr7 (189-365)||(43633-43808)
chr7 (14-161)||(7093348-7093495)
chr7 (159-367)||(7350370-7350575)
chr7 (159-367)||(7471034-7471241)
chr7 (14-161)||(1048176-1048323)
chr7 (14-161)||(7350538-7350685)
chr7 (14-161)||(7471204-7471351)
chr7 (14-161)||(31157172-31157319)
chr7 (159-367)||(31157003-31157209)
chr7 (14-161)||(22136057-22136205)
chr7 (14-161)||(40551084-40551232)
chr7 (14-161)||(20298233-20298380)
chr7 (14-161)||(38395238-38395385)
chr7 (32-398)||(47674742-47675104)
chr7 (52-374)||(48490626-48490945)
chr7 (94-288)||(18390883-18391074)
chr7 (52-396)||(6047770-6048110)
chr7 (94-288)||(6593245-6593436)
chr7 (77-161)||(43556-43640)
chr7 (239-420)||(26214193-26214373)
chr7 (14-82)||(36704-36772)
chr7 (94-201)||(1560762-1560869)
chr7 (383-420)||(20298547-20298584)
chr7 (386-420)||(7471000-7471034)
chr7 (383-420)||(43807-43844)
chr7 (335-420)||(6067995-6068080)
chr7 (386-419)||(7093145-7093178)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (14-420)||(34803-35209)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (14-420)||(27911341-27911746)
chr5 (14-420)||(18510379-18510784)
chr5 (14-420)||(658927-659332)
chr5 (14-420)||(20504832-20505237)
chr5 (14-365)||(18467932-18468282)
chr5 (14-420)||(20043881-20044285)
chr5 (25-262)||(25806350-25806587)
chr5 (159-367)||(31544088-31544295)
chr5 (14-237)||(31467036-31467263)
chr5 (185-362)||(6746452-6746628)
chr5 (159-367)||(34478137-34478343)
chr5 (159-367)||(23666402-23666608)
chr5 (159-367)||(15355566-15355773)
chr5 (185-367)||(10756275-10756455)
chr5 (14-161)||(34478306-34478453)
chr5 (14-161)||(15355736-15355883)
chr5 (14-161)||(31543978-31544125)
chr5 (14-161)||(23666291-23666439)
chr5 (14-161)||(6746316-6746463)
chr5 (14-148)||(10750943-10751077)
chr5 (263-420)||(31466875-31467031)
chr5 (94-398)||(29721636-29721939)
chr5 (94-397)||(16545705-16546005)
chr5 (61-398)||(26174010-26174344)
chr5 (341-419)||(41586973-41587051)
chr5 (75-398)||(13487269-13487588)
chr5 (61-162)||(16408565-16408666)
chr5 (94-398)||(40381381-40381682)
chr5 (225-398)||(13295033-13295204)
chr5 (52-157)||(42427276-42427381)
chr5 (52-398)||(534956-535299)
chr5 (382-420)||(6746629-6746667)
chr5 (383-420)||(18468281-18468318)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (14-418)||(21519325-21519728)
chr2 (14-420)||(31733844-31734249)
chr2 (14-420)||(6263120-6263524)
chr2 (159-367)||(35216687-35216894)
chr2 (63-267)||(22402266-22402470)
chr2 (168-367)||(36559862-36560059)
chr2 (185-367)||(19503053-19503234)
chr2 (14-161)||(19503223-19503370)
chr2 (14-161)||(35216857-35217004)
chr2 (14-161)||(36560031-36560178)
chr2 (262-420)||(22404969-22405127)
chr2 (46-398)||(28569073-28569425)
chr2 (31-374)||(14634627-14634966)
chr2 (43-156)||(41304109-41304222)
chr2 (96-156)||(42018734-42018794)
chr2 (248-398)||(41303933-41304082)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-420)||(50927-51332)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (14-420)||(14788398-14788803)
chr4 (14-420)||(5099782-5100185)
chr4 (14-365)||(22133301-22133651)
chr4 (14-420)||(47563718-47564124)
chr4 (14-420)||(12401722-12402127)
chr4 (14-420)||(16454266-16454673)
chr4 (18-420)||(36379193-36379594)
chr4 (159-420)||(22801737-22801997)
chr4 (99-420)||(36770499-36770820)
chr4 (161-420)||(24879622-24879880)
chr4 (14-288)||(12399578-12399852)
chr4 (159-420)||(36920498-36920758)
chr4 (65-417)||(10113857-10114207)
chr4 (159-367)||(22045431-22045638)
chr4 (159-367)||(22781455-22781661)
chr4 (168-367)||(11007286-11007483)
chr4 (159-367)||(9175190-9175397)
chr4 (168-367)||(16932866-16933063)
chr4 (14-161)||(22781624-22781771)
chr4 (14-161)||(16933035-16933182)
chr4 (17-161)||(9175360-9175504)
chr4 (14-161)||(22045601-22045749)
chr4 (124-420)||(47565681-47565976)
chr4 (14-161)||(11007455-11007602)
chr4 (159-420)||(18535806-18536066)
chr4 (14-161)||(22801960-22802107)
chr4 (14-161)||(36920721-36920868)
chr4 (311-420)||(12396780-12396888)
chr4 (61-374)||(34571229-34571536)
chr4 (52-398)||(12740336-12740679)
chr4 (52-398)||(12748542-12748885)
chr4 (94-319)||(8394683-8394905)
chr4 (94-288)||(5137357-5137548)
chr4 (94-288)||(7123973-7124164)
chr4 (99-161)||(18536029-18536091)
chr4 (98-176)||(47565620-47565698)
chr4 (46-158)||(3577934-3578046)
chr4 (33-162)||(26558905-26559034)
chr4 (239-362)||(54881989-54882111)
chr4 (30-82)||(18536807-18536859)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (14-420)||(18097797-18098202)
chr3 (14-418)||(53916641-53917044)
chr3 (14-420)||(3315570-3315975)
chr3 (14-420)||(890871-891277)
chr3 (17-420)||(28100973-28101375)
chr3 (14-363)||(42991187-42991535)
chr3 (14-420)||(43422436-43422840)
chr3 (30-420)||(23634667-23635057)
chr3 (185-420)||(28138206-28138440)
chr3 (159-365)||(5898746-5898951)
chr3 (159-365)||(4309226-4309431)
chr3 (30-354)||(25634738-25635058)
chr3 (159-367)||(457241-457447)
chr3 (159-365)||(6064513-6064717)
chr3 (159-365)||(43227414-43227619)
chr3 (14-161)||(457131-457278)
chr3 (14-161)||(10957210-10957357)
chr3 (14-161)||(43227304-43227451)
chr3 (14-155)||(6064686-6064827)
chr3 (159-367)||(11169435-11169642)
chr3 (14-161)||(5898636-5898783)
chr3 (16-161)||(11169327-11169472)
chr3 (14-161)||(4309394-4309541)
chr3 (61-398)||(23198742-23199076)
chr3 (159-316)||(10957090-10957247)
chr3 (65-398)||(5258926-5259256)
chr3 (61-398)||(7763500-7763833)
chr3 (52-374)||(29812091-29812409)
chr3 (31-398)||(32892289-32892652)
chr3 (94-398)||(4599321-4599622)
chr3 (94-288)||(6717774-6717965)
chr3 (94-288)||(10210463-10210654)
chr3 (94-288)||(10057510-10057701)
chr3 (94-288)||(10059732-10059923)
chr3 (94-288)||(10061954-10062145)
chr3 (94-288)||(10064176-10064367)
chr3 (94-288)||(10066398-10066589)
chr3 (46-286)||(1619605-1619844)
chr3 (46-264)||(7769766-7769982)
chr3 (344-419)||(35918864-35918939)
chr3 (46-182)||(27421892-27422028)
chr3 (306-419)||(1619491-1619603)
chr3 (46-156)||(15824698-15824808)
chr3 (91-156)||(27900211-27900276)
chr3 (383-420)||(43227618-43227655)
chr3 (383-419)||(4309191-4309227)
chr3 (93-156)||(27882632-27882695)
chr3 (384-419)||(42991537-42991572)
chr3 (99-127)||(31116511-31116539)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (15-420)||(3630908-3631312)
chr6 (53-420)||(3395260-3395626)
chr6 (159-420)||(15533601-15533862)
chr6 (159-367)||(33310244-33310450)
chr6 (159-367)||(26067115-26067319)
chr6 (14-161)||(26067282-26067429)
chr6 (14-161)||(33310134-33310281)
chr6 (14-161)||(15533825-15533972)
chr6 (46-373)||(11137349-11137673)
chr6 (94-398)||(16652203-16652504)
chr6 (61-349)||(16568196-16568480)
chr6 (66-420)||(30444585-30444936)
chr6 (94-398)||(16553941-16554242)
chr6 (94-398)||(16630497-16630798)
chr6 (61-176)||(5407899-5408014)
chr6 (61-176)||(5412224-5412339)
chr6 (46-143)||(26944465-26944562)
chr6 (301-398)||(26944599-26944696)
chr6 (94-288)||(34166149-34166340)
chr6 (327-420)||(28038631-28038724)
chr6 (91-156)||(10456494-10456559)
chr6 (91-162)||(11722602-11722673)
chr6 (224-259)||(17012969-17013004)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (15-420)||(41383618-41384021)
chr8 (111-420)||(15071820-15072126)
chr8 (32-372)||(21481478-21481818)
chr8 (185-367)||(18812144-18812324)
chr8 (159-367)||(43081012-43081218)
chr8 (185-367)||(27828421-27828602)
chr8 (14-161)||(43080902-43081049)
chr8 (14-161)||(18812008-18812155)
chr8 (14-161)||(27828285-27828432)
chr8 (61-398)||(34255109-34255443)
chr8 (53-179)||(31577171-31577297)
chr8 (236-420)||(31574531-31574714)
chr8 (46-398)||(41365619-41365965)
chr8 (53-215)||(17848865-17849026)
chr8 (14-115)||(15069870-15069971)
chr8 (52-319)||(4732851-4733116)
chr8 (243-398)||(17849079-17849233)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (14-394)||(6996493-6996872)
chr1 (14-420)||(28202326-28202731)
chr1 (14-420)||(50077759-50078164)
chr1 (14-420)||(31424000-31424404)
chr1 (14-420)||(16429856-16430261)
chr1 (120-420)||(14098890-14099189)
chr1 (101-420)||(25249616-25249935)
chr1 (13-216)||(28997423-28997626)
chr1 (14-216)||(29003139-29003341)
chr1 (159-367)||(51751392-51751599)
chr1 (168-367)||(47178726-47178924)
chr1 (159-367)||(27337847-27338054)
chr1 (185-365)||(31736531-31736710)
chr1 (30-419)||(13126369-13126755)
chr1 (159-367)||(16227523-16227729)
chr1 (159-367)||(20301486-20301693)
chr1 (14-161)||(20301376-20301523)
chr1 (14-161)||(51751282-51751429)
chr1 (14-161)||(16227413-16227560)
chr1 (14-161)||(27338017-27338164)
chr1 (14-161)||(47178607-47178754)
chr1 (14-161)||(31736699-31736846)
chr1 (207-365)||(28841760-28841917)
chr1 (14-144)||(28841634-28841764)
chr1 (47-370)||(50167982-50168302)
chr1 (52-157)||(31658362-31658467)
chr1 (52-374)||(776294-776613)
chr1 (125-398)||(13548287-13548556)
chr1 (14-99)||(25250566-25250651)
chr1 (52-319)||(28222106-28222371)
chr1 (301-397)||(31928880-31928975)
chr1 (30-79)||(8348039-8348088)
chr1 (306-398)||(19753440-19753532)
chr1 (383-419)||(31736496-31736532)
chr1 (381-420)||(25127081-25127120)
chr1 (386-420)||(27337813-27337847)
chr1 (239-420)||(28242990-28243170)
chr1 (254-319)||(31658561-31658626)
chr1 (383-419)||(28841916-28841952)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (159-367)||(979-1186)
scaffold1899 (14-161)||(869-1016)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (159-367)||(23482-23689)
scaffold0140 (14-161)||(23371-23519)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (159-361)||(511-712)
scaffold1674 (14-161)||(675-822)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (185-365)||(70247-70426)
scaffold0025 (13-94)||(72468-72549)
scaffold0025 (99-161)||(70415-70477)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (18-190)||(80779-80951)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (290-420)||(3969-4099)
scaffold0133 (224-259)||(26228-26263)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (52-196)||(584-728)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (61-151)||(115830-115920)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 44725837 - 44726243
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44725837 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgtta 44725936  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44725937 aacactcaacatcagcctggagaagcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaatgatactcatgatctacctgttgaggtggag 44726036  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44726037 tttcaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 44726136  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726137 tggaggaccttgggtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagatggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 44726236  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  44726237 gattacc 44726243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 24749505 - 24749910
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  24749505 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctggagagacatta 24749604  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24749605 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggatgcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 24749704  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  24749705 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttaaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgtcta 24749804  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24749805 tggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttcataaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgcgg 24749903  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  24749904 gattacc 24749910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 367
Target Start/End: Original strand, 28486483 - 28486835
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28486483 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 28486582  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28486583 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggag 28486682  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28486683 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 28486782  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28486783 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 28486835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 420
Target Start/End: Original strand, 21678980 - 21679382
Alignment:
Q  17 ctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaac 116  Q
    ||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21678980 ctctgatggcgtagtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctggagagacgctaaac 21679079  T
Q  117 actcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagttt 216  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  21679080 actcaacatcatccaggagacgcggtggtaagaatactcatgatcagttcggagaggcggaggaaccaatactcatgatctacttgttaagatggagttt 21679179  T
Q  217 gaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatgg 316  Q
     || |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  21679180 caaggttgaagacataatgggatatacacattttctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatgg 21679279  T
Q  317 aggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggat 416  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21679280 aggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagatattccgaaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggat 21679378  T
Q  417 tacc 420  Q
    ||||    
T  21679379 tacc 21679382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 9679584 - 9679979
Alignment:
Q  22 atggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactca 121  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  9679584 atggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaaaactca 9679683  T
Q  122 acatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaag 221  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| || |    
T  9679684 acatcatcctgaagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaacaatactcatgatcaacttgttgaggtggagtttcaagg 9679783  T
Q  222 ttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggac 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  9679784 ttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttga--acaccggtaatggtactgctatggaggac 9679881  T
Q  322 cttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||    
T  9679882 cttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagagattttttcatgaagacggaatgcatttcggaggttgaagaatgtataacactacttgcaggattacc 9679979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 24816381 - 24815993
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 129  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816381 gtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagc 24816282  T
Q  130 ctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagac 229  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||| || || ||||||    
T  24816281 ctgaagagacggtggtaagaatactcatggtcactttggagaggcggaggtaacaatacccatgatctacat-ttgaggtggagtttcaaggtggaagac 24816183  T
Q  230 atagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| || |||||| | |||    
T  24816182 atagtgggatgtatgcatttgctagttgaagtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgagaatggtacgactacggtggacctcgggtg 24816083  T
Q  330 ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  24816082 ctatgctctagtggtgagcaaggga-ttcttcatgaagaaggaaggtatttcggaggttgaagaatgtatagcatagcttgcgggattacc 24815993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4294087 - 4293803
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  4294087 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacatta 4293988  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4293987 aacactcaacatcagcctggagaggtggtgacaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagctggag 4293888  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccgg 299  Q
    ||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4293887 tttcaaggttgaagacatagtacgat-tacgcatttgctagtttaggtagagtacgctaagcttgaggtggagttgaacacaccgg 4293803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 185 - 420
Target Start/End: Original strand, 38395374 - 38395608
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38395374 atactcatgatctacctgttgaggtggggtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagggtacgctcagcgtgaggtgg 38395473  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcgga 384  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  38395474 agttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagcgatttcttcatgaagacggaaggcattccgga 38395572  T
Q  385 ggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38395573 ggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattacc 38395608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 99 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 44011797 - 44011476
Alignment:
Q  99 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatcta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  44011797 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggaggtaacagtactcatgatcta 44011698  T
Q  199 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagtt--gaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacac 296  Q
    ||| |||| ||| ||||| || || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | |||| || |||||||||||  |||||||    
T  44011697 cctattgaagtggagtttcaaggtggaagatatagtgtgatgtacgtatttgctagttaagaggtaga--aagctctgcttgaggtggagtcgaacacac 44011600  T
Q  297 cggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatg 396  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44011599 cggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctgtagttgtgagcaagggaattcttcatgaagatggaaggtattccggaggttgaagaatg 44011500  T
Q  397 tacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    || | || |||||| |||||||||    
T  44011499 tataacatggcttgtgggattacc 44011476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1048213 - 1048006
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048213 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 1048114  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1048113 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 1048015  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  1048014 ttcatgaag 1048006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 22136168 - 22136374
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136168 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 22136267  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22136268 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 22136365  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  22136366 ttcatgaag 22136374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 40551195 - 40551401
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551195 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 40551294  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40551295 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 40551392  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  40551393 ttcatgaag 40551401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7093359 - 7093178
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7093359 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtgg 7093260  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7093259 agttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 7093178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Original strand, 20298343 - 20298548
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20298343 atcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatgatctacctgttgatgtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttga 20298442  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20298443 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 20298541  T
Q  359 ttcatga 365  Q
    |||||||    
T  20298542 ttcatga 20298548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 365
Target Start/End: Original strand, 43633 - 43808
Alignment:
Q  189 tcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43633 tcatgatctacctgttgaggttgagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagatggagtt 43732  T
Q  289 aaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43733 gaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 43808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7093495 - 7093348
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7093495 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 7093396  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093395 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 7093348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7350575 - 7350370
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350575 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 7350476  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7350475 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaac-cactggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 7350379  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  7350378 ttcatgaag 7350370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7471241 - 7471034
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7471241 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgtggtggagtttcaaggttgaagacaaagtgggatgtacgcatttgctagttga 7471142  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  7471141 ggcagagtacgctcagcgtgaggtggggttgaacacaccggtaatgatacgattatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggggagcaagggatttc 7471043  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  7471042 ttcatgaag 7471034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1048323 - 1048176
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1048323 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 1048224  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1048223 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1048176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7350685 - 7350538
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7350685 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 7350586  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7350585 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7350538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7471351 - 7471204
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7471351 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtta 7471252  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7471251 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 7471204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31157319 - 31157172
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  31157319 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagatgtta 31157220  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31157219 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31157172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 31157209 - 31157003
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31157209 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttga 31157110  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  31157109 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggacttgaacacacctgtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttc 31157012  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  31157011 ttcatgaag 31157003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 22136057 - 22136205
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggt-gttcatctggagagacgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  22136057 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgtt 22136156  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22136157 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22136205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 40551084 - 40551232
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggt-gttcatctggagagacgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  40551084 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgtt 40551183  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40551184 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 40551232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 20298233 - 20298380
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20298233 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctggagagacgtta 20298332  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20298333 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatgatc 20298380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 38395238 - 38395385
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||    
T  38395238 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagaagtta 38395337  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38395338 aacactcaacatcagcctggagagacggtggtaagaatactcatgatc 38395385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 47675104 - 47674742
Alignment:
Q  32 gttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 131  Q
    |||||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47675104 gttgttgggaggatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcat 47675005  T
Q  132 ggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacat 231  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | || || || |||||| |  ||   ||||| ||||| |||| || ||||| || ||| ||| ||||| |||    
T  47675004 ggagaggcggtgggaagaatactcatggttagcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttaaggtggag-ttgcaaggtgaaggcat 47674907  T
Q  232 agtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgct 331  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||| | |||| ||| ||||||| || ||||||||| |    
T  47674906 agtgtg-tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacacctggaatggtacaactatggtgg-ccttgagtgat 47674809  T
Q  332 attctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    || ||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||| | | | ||||||||||||    
T  47674808 atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaagacattccagggtttgaagaatgta 47674742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 48490626 - 48490945
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||| | | |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  48490626 ggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggtgggaagaat 48490725  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || |||||||   |  ||  |||||  ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||     
T  48490726 actcatggttagcctggagaggcactgtgaataatacttgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaggcatagtgtg-tgtacgcatttgg 48490822  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaa 350  Q
     ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||  |  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||||     
T  48490823 aagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtagatgacaccgggaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcat 48490921  T
Q  351 gggatttcttcatgaagacggaag 374  Q
    |  | |||||||||| ||||||||    
T  48490922 gtaaattcttcatgaggacggaag 48490945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18391074 - 18390883
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||||||    
T  18391074 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcatg 18390975  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  18390974 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 18390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 396
Target Start/End: Original strand, 6047770 - 6048110
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| || || ||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6047770 ggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggaaagaat 6047869  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||| | |||||||  ||||||||||| ||  |||||  | ||| |||| |||||||| ||||  || ||  ||||||||||| |  ||||  |||||     
T  6047870 actcaaggtcagtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtaatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtgtg-cgtacttatttgg 6047967  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaag 351  Q
     ||||||||||||| |   ||||| |||||||||||| |  ||| ||  |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  6047968 aagttgaggtagagaaatgtcagcttgaggtggagttgatgacatcgagaatggtacaactatg--ggaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaag 6048065  T
Q  352 ggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatg 396  Q
    | | ||||||| || |||| |||  ||||||| | ||||||||||    
T  6048066 gaaattcttcaagaggacgaaaggcatttcggggtttgaagaatg 6048110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6593436 - 6593245
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  6593436 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtg 6593337  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  6593336 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 6593245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Original strand, 43556 - 43640
Alignment:
Q  77 atgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43556 atgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctgcagaggcggtggtaagaataatcatgatc 43640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Original strand, 26214193 - 26214373
Alignment:
Q  239 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 338  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    ||||  | || ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26214193 tgtacgcatttggaagttgaggtagataaagctcagcttgaggtggagttggtgacactaggaacgatacgactatggag-accttgggtgctagactct 26214291  T
Q  339 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  26214292 agttgtgagcaagggaattcttcaagaagacggaagacattccgtagtttgaagaatgtatggcttggcttgtgggattacc 26214373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 36704 - 36772
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36704 gtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 36772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1560869 - 1560762
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  1560869 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtgataacaatactcgtg 1560770  T
Q  194 atctacct 201  Q
    ||| ||||    
T  1560769 atcaacct 1560762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 420
Target Start/End: Original strand, 20298547 - 20298584
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298547 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 20298584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7471034 - 7471000
Alignment:
Q  386 gttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7471034 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 7471000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 420
Target Start/End: Original strand, 43807 - 43844
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43807 gaggttgaagaatgtatatcacggcttgcgggattacc 43844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6068080 - 6067995
Alignment:
Q  335 ctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||  ||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||| |||||||||    
T  6068080 ctctagttgtgagcaagggaattcttcaattagacggaaggcattccggagtttgaagaatgcatggcatggcttgtgggattacc 6067995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 7093178 - 7093145
Alignment:
Q  386 gttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7093178 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattac 7093145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 34803 - 35209
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  34803 gtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggaaagacgtta 34902  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34903 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 35002  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  35003 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgacta 35102  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35103 tggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 35202  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  35203 gattacc 35209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 27911341 - 27911746
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27911341 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgacgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 27911440  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27911441 aacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 27911540  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27911541 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 27911640  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911641 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 27911739  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  27911740 gattacc 27911746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18510784 - 18510379
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18510784 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggacgatgaataagatgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctgaagagacgtta 18510685  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18510684 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaacactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcataatctacctgttgaggtggag 18510585  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18510584 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 18510485  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18510484 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgtatagcacggcttgcgg 18510386  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  18510385 gattacc 18510379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 658927 - 659332
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  658927 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 659026  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  659027 aacactcaccatcagcctagagaggcggtcgtaagaataatcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagatggag 659126  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  659127 tttcaagattgaagacatagtgggatgtacgcattttctagtttaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgacta 659226  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    || ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  659227 tgaaggaccttgggtgctttgctcta-tgatgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 659325  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  659326 gattacc 659332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 20505237 - 20504832
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  20505237 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtctagagagacgtta 20505138  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20505137 aacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctcgagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 20505038  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  20505037 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagttagagtacactcagcgtgaggtggagtggaacacaccggtaatggtacggcta 20504938  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20504937 tggaggaccttggatgttatgctcta-tggtgagcaagggatttgttcatgaagacggaaggcattacggaggttgaagaatgtatagcacggcttacgg 20504839  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  20504838 gattacc 20504832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 365
Target Start/End: Original strand, 18467932 - 18468282
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18467932 gtgctatgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 18468031  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||    
T  18468032 aaaactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatacccatgatcagtctggagaggcggaggcaacaacaatcatgatctacctgttgaggtggag 18468131  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  18468132 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggcacggcta 18468231  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18468232 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaatggatttcttcatga 18468282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 20043881 - 20044285
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20043881 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 20043980  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20043981 aacactcaacatcatcttggagaggtggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcgaagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 20044080  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     | | ||||||| |||||||||||| |  | ||| |||||| | ||||||    
T  20044081 tttcaaggttgaagacatagcgggatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttga--agaccagtaatgttgcgacta 20044178  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20044179 tggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagagatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 20044278  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  20044279 gattacc 20044285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 262
Target Start/End: Original strand, 25806350 - 25806587
Alignment:
Q  25 gtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25806350 gtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaaca 25806449  T
Q  125 tcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  25806450 tcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttg 25806549  T
Q  225 aagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggta 262  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25806550 aagacatagtgggaagtacgcatttgctagttgaggta 25806587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 31544088 - 31544295
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544088 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 31544187  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31544188 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 31544286  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  31544287 ttcatgaag 31544295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31467263 - 31467036
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  31467263 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgtta 31467164  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgt----tgaggt 209  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||    
T  31467163 aacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgataagtctggacaggcggaggcaacaatactcataatctacctgttgcatgaggt 31467064  T
Q  210 gaagtttgaaagttgaagacatagtggg 237  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||    
T  31467063 ggagtttcaaggttgaagacatagtggg 31467036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 362
Target Start/End: Original strand, 6746452 - 6746628
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6746452 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcaccgtgaggtgg 6746551  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttca 362  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6746552 agttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca 6746628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 34478343 - 34478137
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478343 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 34478244  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34478243 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 34478146  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  34478145 ttcatgaag 34478137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 23666402 - 23666608
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666402 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 23666501  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23666502 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 23666599  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  23666600 ttcatgaag 23666608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15355773 - 15355566
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355773 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 15355674  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaa-gggattt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  15355673 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggggattt 15355576  T
Q  358 cttcatgaag 367  Q
    ||||||||||    
T  15355575 cttcatgaag 15355566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Original strand, 10756275 - 10756455
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10756275 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtgaggtgg 10756374  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10756375 agttgaactcaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 10756455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34478453 - 34478306
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34478453 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtta 34478354  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34478353 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 34478306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15355883 - 15355736
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15355883 gtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 15355784  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15355783 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 15355736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 31543978 - 31544125
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  31543978 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctatagagacgtta 31544077  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31544078 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 31544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 23666291 - 23666439
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggt-gttcatctggagagacgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23666291 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgtt 23666390  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23666391 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23666439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 6746316 - 6746463
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6746316 gtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtcttgagagacgtta 6746415  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6746416 aacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 6746463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 10750943 - 10751077
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10750943 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 10751042  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10751043 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaag 10751077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 263 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31467031 - 31466875
Alignment:
Q  263 gagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttca 362  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31467031 gagtacgcttagcttgaggtggagttaaacacaccgataatggtacgactatggaggaccttggttgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttca 31466933  T
Q  363 tgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466932 tgaagacggaagacatttcagaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 31466875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Original strand, 29721636 - 29721939
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  29721636 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgataacaatactcgtg 29721735  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| |||   ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |    
T  29721736 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatga 29721832  T
Q  294 caccgg-taatgatacgactatggaggacctt--gagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttga 390  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||| | ||  ||||  ||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||    
T  29721833 caccggaaaatggtatgactatggagg-ctttgggagttttatgctctagttgtgagcatgcgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttga 29721931  T
Q  391 agaatgta 398  Q
    ||||||||    
T  29721932 agaatgta 29721939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 397
Target Start/End: Original strand, 16545705 - 16546005
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  16545705 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 16545804  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| | | ||||| | |||||||||||| |  |    
T  16545805 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagcgaaagctcaacttgaggtggagttgatga 16545901  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    |||||| |||| |||| |||||| || | ||| | |  ||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  16545902 caccgggaatggtacggctatgg-gggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaag 16546000  T
Q  393 aatgt 397  Q
    |||||    
T  16546001 aatgt 16546005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 398
Target Start/End: Original strand, 26174010 - 26174344
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||| ||| || ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  26174010 tctcaccttggtattgattccttgtagagtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcgatggtgagaatactcatggt 26174109  T
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
     ||||| |||||| || |  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| |||   || || |||| |||||| | | |||| ||||||  ||||||||    
T  26174110 tagtctggagaggaggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtggcaaggtggaag-catagt-gcaagtactcatttggaagttgagg 26174206  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttct 359  Q
    ||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||| | ||| | |  ||| ||||||| ||||||| | || ||||    
T  26174207 tagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagg-ctttgggagtttatgctctagttgtgagcatgtgaattct 26174305  T
Q  360 tcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  26174306 tcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 26174344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 341 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41587051 - 41586973
Alignment:
Q  341 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41587051 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgtgggattac 41586973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 398
Target Start/End: Original strand, 13487269 - 13487588
Alignment:
Q  75 tgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggc 174  Q
    |||||||| || ||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  13487269 tgatgccttgtagagtggtgttcgtatagagagacgttaaacacttaatatcagcttgcagaagcggtgggaagaatactcatggttagtctggagaggc 13487368  T
Q  175 ggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcag 274  Q
    || |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| || | | ||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | |||     
T  13487369 ggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-tagcaaggtgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaa 13487465  T
Q  275 cgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 374  Q
    | | |||||||||| |  ||||||  |||| ||  |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  13487466 cttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaag 13487564  T
Q  375 aaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
      ||| ||| | ||||||||||||    
T  13487565 gcattccggggtttgaagaatgta 13487588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 162
Target Start/End: Original strand, 16408565 - 16408666
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||| ||| || ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16408565 tctcaccttggtattgattccttgtagagtgtggttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgat 16408664  T
Q  161 ca 162  Q
    ||    
T  16408665 ca 16408666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Original strand, 40381381 - 40381682
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  40381381 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtttggagaggcggtgataacaatactcgtg 40381480  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||    |    
T  40381481 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtacgcatttggaagttgaggcagagaaagctcaacttgaggtggagttggtaa 40381577  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    | |||| |||| |||| ||||||||| | ||| | |  ||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  40381578 ctccgggaatgttacggctatggagg-ctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaag 40381676  T
Q  393 aatgta 398  Q
    ||||||    
T  40381677 aatgta 40381682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 398
Target Start/End: Original strand, 13295033 - 13295204
Alignment:
Q  225 aagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggacctt 324  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |  |||||   |||| ||||||||||||| |||||    
T  13295033 aagacatagtggaa-gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttgaggtggagatgatgacaccaaaaatggtacgactatggag-acctt 13295130  T
Q  325 gagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| | || |||| | || ||||||||| ||||| ||||||    
T  13295131 gggtgctatgctctagttgtgagcaagggagctctttaagaggacgaacgacatttcggagtttgaaaaatgta 13295204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42427381 - 42427276
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  42427381 ggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggagaggcgatgggaagaat 42427282  T
Q  152 actcat 157  Q
    | ||||    
T  42427281 attcat 42427276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 398
Target Start/End: Original strand, 534956 - 535299
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||| ||||||| | |||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||    
T  534956 ggtgaggtttcttaccttggtaatgatgccttgtagagtggtgatcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctcgagaggcgctgggaataat 535055  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || || |||||| |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| ||  || ||| ||||| ||||||  | ||||||||||||     
T  535056 actcatggttagcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-gtgcaaggtgaaggcatagtatg-tgtacgcatttgg 535152  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaa 350  Q
     ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| |  | | ||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||||||  ||||||     
T  535153 aagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgaggatatcgggaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttatgagcat 535251  T
Q  351 gggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    | || |||||||||  ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  535252 gtgaattcttcatggggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 535299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 420
Target Start/End: Original strand, 6746629 - 6746667
Alignment:
Q  382 ggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6746629 ggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 6746667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 420
Target Start/End: Original strand, 18468281 - 18468318
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18468281 gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcaggattacc 18468318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21519728 - 21519325
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21519728 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgtta 21519629  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21519628 aacactcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcattctggagagccggaggcaaaaatactcatgatctacttgttgaggtgaag 21519529  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21519528 cttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 21519429  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21519428 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatatatagcacggcttgcgg 21519330  T
Q  414 gatta 418  Q
    |||||    
T  21519329 gatta 21519325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31734249 - 31733844
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31734249 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggataaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 31734150  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31734149 aacactcaacatcaacctggagatgtggtgataagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 31734050  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  31734049 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgacta 31733950  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||      
T  31733949 tggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagtgatttcttcatgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcta 31733851  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  31733850 gattacc 31733844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 6263524 - 6263120
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||| |||| ||| |||||| |||| || |||||||| ||||||    
T  6263524 gtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtccctcaccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctggagaaacgtta 6263425  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6263424 aacactcaacatcaacctgaagagacgatggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctgcctgttgaggtggag 6263325  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6263324 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 6263225  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6263224 tggaggaccttgggtgctatgctcta--ggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 6263127  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  6263126 gattacc 6263120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35216894 - 35216687
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216894 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 35216795  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35216794 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 35216696  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  35216695 ttcatgaag 35216687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402470
Alignment:
Q  63 tcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatca 162  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatattcatgatca 22402365  T
Q  163 gtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggta 262  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22402366 gtctggagaggtggaggcaataatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggaatgtacgcattttctagttgaggta 22402465  T
Q  263 gagta 267  Q
    |||||    
T  22402466 gagta 22402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36560059 - 36559862
Alignment:
Q  168 gagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 267  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560059 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 36559960  T
Q  268 cgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36559959 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 36559862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19503234 - 19503053
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503234 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgcacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 19503135  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||| || |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19503134 agttgaatacaccggtaatggtacggctattaaggaccttgggtgctatgcgcta-tggtgaccaagggatttcttcatgaag 19503053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19503370 - 19503223
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19503370 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctggagagacgtta 19503271  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19503270 aacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatgatc 19503223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35217004 - 35216857
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  35217004 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgtta 35216905  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35216904 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 35216857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36560178 - 36560031
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36560178 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 36560079  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36560078 aacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 36560031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 420
Target Start/End: Original strand, 22404969 - 22405127
Alignment:
Q  262 agagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttc 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22404969 agagtacgctcagcttgaggtggaattgaacacaccggtaatggtatggctatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttc 22405068  T
Q  362 atgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22405069 atgaagacgaaaggcattccggaggttgaagaatgtataacacggcttgcgggattacc 22405127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28569425 - 28569073
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||| || || ||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  28569425 gaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaacatcagtctggagaggcggtggg 28569326  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttg-aagacatagtgggatgtacg 244  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  |||||| ||||| |||| |||||||| | |||| ||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  28569325 aaaaatactcatgatcagtctgaagaggtggaggtaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtgga-tttgcaaggtgaaagccatagtggg-tgtacg 28569229  T
Q  245 catttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccgg---taatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagt 341  Q
    ||||||  ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |  ||||| |   || || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  28569228 catttggaagttgaggtagagaaagctcagcttaaggtggagttgatgacacctggaatattggtacgactatgga-gacctagggtgctattctctagt 28569130  T
Q  342 ggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
     |||||||||| | ||||||| || || |||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  28569129 tgtgagcaaggtaattcttcaagaggatggaaggcattccggggtttgaagaatgta 28569073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14634966 - 14634627
Alignment:
Q  31 tgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 130  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634966 tgttgttgggaggatgaagagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 14634867  T
Q  131 tggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagaca 230  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| | | || || ||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||| || ||||| ||||  || ||| ||  ||    
T  14634866 tagagaggcggtgggaagaatactcacggttagcctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttaaggtggagttacaaggttaaaagca 14634768  T
Q  231 tagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgc 330  Q
    |||||   |||||||| |||  ||||| ||||||| |  |||| | |||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||     
T  14634767 tagtg---tgtacgcaattggaagttggggtagagaaatctcaacttgaggtggagttagtgacaccggaaatggtacgactatggagggccttgggtgt 14634671  T
Q  331 tattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 374  Q
    ||| ||||||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  14634670 tatgctctagttgtgagcatgagaattcttcaagaggacggaag 14634627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41304222 - 41304109
Alignment:
Q  43 gacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggt 142  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41304222 gacgaagaaggtgatgcctttcaccttgtgactgatgccttatagagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaaaatcagcttggagatgcggt 41304123  T
Q  143 ggtaagaatactca 156  Q
    || |||||||||||    
T  41304122 gggaagaatactca 41304109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42018794 - 42018734
Alignment:
Q  96 tcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactca 156  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42018794 tcatcttgaaagacattaaacactcaacatcatcctggagaggcggtgggaagaatactca 42018734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41304082 - 41303933
Alignment:
Q  248 ttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgag 347  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| || |  ||| ||| |||| ||| ||||||||| | |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  41304082 ttgctagttgaggtagagatagcatagcttgaggtggaattgatgacatcgggaatggtacaactatggag-atcttgggtgctaggctctagttgtgag 41303984  T
Q  348 caagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  41303983 caagggaattcttcaagaggacaaaagaaattccggggtttgaataatgta 41303933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 50927 - 51332
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  50927 gtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 51026  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51027 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 51126  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  51127 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggcta 51226  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51227 tggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 51325  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  51326 gattacc 51332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14788803 - 14788398
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14788803 gtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 14788704  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14788703 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 14788604  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  14788603 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggcta 14788504  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14788503 tggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 14788405  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  14788404 gattacc 14788398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 5099782 - 5100185
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  5099782 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacatta 5099881  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5099882 aacactcaacattagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggtggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggag 5099981  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  5099982 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaa--acaccggtaatagtacgacta 5100079  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5100080 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattccggaggttgaagaatgtataacacagcttgcgg 5100178  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  5100179 gattacc 5100185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22133651 - 22133301
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22133651 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtta 22133552  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22133551 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 22133452  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22133451 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 22133352  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22133351 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 22133301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 47563718 - 47564124
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  47563718 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggagagacgtta 47563817  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  47563818 aacactcaacatcagtctagagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctaccggttgaggtggag 47563917  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  47563918 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgacta 47564017  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  47564018 tggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttcttcatgaagacggaaggcattatggaggttgaagaatgtatagcacgaattgcgg 47564117  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  47564118 gattacc 47564124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12402127 - 12401722
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||   || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  12402127 gtgcactgatggtgtagtgttttttgctggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctagagagacgtta 12402028  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12402027 aacactcaacatcagcctggaaaagcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacttgttgaggtggag 12401928  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||    
T  12401927 tttcaaggttgaagacataatgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggtaatggtacagcta 12401828  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12401827 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgg 12401729  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  12401728 gattacc 12401722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 16454266 - 16454673
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |  ||| |||||||||||    
T  16454266 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtctagagagacgtta 16454365  T
Q  114 aacactcaaca--tcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtga 211  Q
     ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16454366 gacactcaacagatcagcctggagaggcggtggcaagaatactcatgatcagactggagaggtggaagcaacaatactcatgatctacctgttgaggtgg 16454465  T
Q  212 agtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgac 311  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16454466 tgtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgac 16454565  T
Q  312 tatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgc 411  Q
    ||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16454566 tatggagtaccttgggtgctatacgcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgc 16454664  T
Q  412 gggattacc 420  Q
    |||||||||    
T  16454665 gggattacc 16454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 420
Target Start/End: Original strand, 36379193 - 36379594
Alignment:
Q  18 tctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaaca 117  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| || ||||| |  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36379193 tctgacggtgtaatgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 36379292  T
Q  118 ctcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttg 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  36379293 ctcaacatcagcctggagaggcggtggtaataatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttc 36379392  T
Q  218 aaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatgga 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36379393 aaggttgaagacatagtgggatgtac-catttgctagttgaggtagagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatgga 36379491  T
Q  318 ggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggatt 417  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36379492 ggaccttggatgctatgctctagtggtgagcaatgaatttcttcatgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgtatagcacggcttgcgggatt 36379591  T
Q  418 acc 420  Q
    |||    
T  36379592 acc 36379594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 159 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 22801997 - 22801737
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22801997 atcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttga 22801898  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22801897 ggtagaatacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 22801799  T
Q  359 ttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22801798 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 22801737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 99 - 420
Target Start/End: Original strand, 36770499 - 36770820
Alignment:
Q  99 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatcta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36770499 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcagaggcaacaatactcatgatcta 36770598  T
Q  199 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 298  Q
      ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  36770599 tttgttgagttggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtgcgcatttgctagttgaggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccg 36770698  T
Q  299 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
     ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  36770699 ataatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 36770798  T
Q  399 cagcacggcttgcgggattacc 420  Q
     | || |||||| |||||||||    
T  36770799 taacatggcttgtgggattacc 36770820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 420
Target Start/End: Original strand, 24879622 - 24879880
Alignment:
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24879622 cagtctggagaggtggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaagg 24879721  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttctt 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24879722 tagagtacgctcagcgagaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttctt 24879820  T
Q  361 catgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24879821 catgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 24879880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12399852 - 12399578
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  12399852 gtgcactgatggtgtggtgttttttgctggatgaagaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagacgtta 12399753  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  12399752 aacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagggaacaatactcatgatctacatgttaaggtggag 12399653  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12399652 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagtt 12399578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 159 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36920758 - 36920498
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36920758 atcagtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 36920659  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  36920658 ggtagagtacgttcagcgtgaggtgcatttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgcaatgctcta-tggtgagcaagggatttc 36920560  T
Q  359 ttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36920559 ttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgggattacc 36920498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 417
Target Start/End: Original strand, 10113857 - 10114207
Alignment:
Q  65 accttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagt 164  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  10113857 accttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgggaagaatacttatggtcagt 10113956  T
Q  165 cttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 264  Q
    ||  ||||||||  | ||  |||||  ||||| |||| ||||||||  |||| |  ||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10113957 ctgaagaggcgggagtaagaatacttgtgatcaacct-ttgaggtggtgttttagggtgaaagacaaagtgtgatgtacgcattttctagttgaggttga 10114055  T
Q  265 gtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatg 364  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  10114056 caacgctcagcttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatgga-gaccttgggtgttattctttagttgtgagcaatggaattcttcatg 10114154  T
Q  365 aagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggatt 417  Q
    |||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  10114155 aagacataagacattccggagtttgaagaatgtatggcatggcttgtgggatt 10114207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22045638 - 22045431
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22045638 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 22045539  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22045538 gatagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 22045440  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  22045439 ttcatgaag 22045431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22781661 - 22781455
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22781661 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttga 22781562  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22781561 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 22781464  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  22781463 ttcatgaag 22781455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11007483 - 11007286
Alignment:
Q  168 gagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 267  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11007483 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagta 11007384  T
Q  268 cgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11007383 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 11007286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9175397 - 9175190
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9175397 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttga 9175298  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||     
T  9175297 ggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtactatgctcta-tggtgagcaagggattta 9175199  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  9175198 ttcatgaag 9175190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16933063 - 16932866
Alignment:
Q  168 gagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 267  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933063 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggctgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 16932964  T
Q  268 cgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16932963 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactat-gaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 16932866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22781771 - 22781624
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22781771 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 22781672  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22781671 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22781624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16933182 - 16933035
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16933182 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 16933083  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16933082 aacactcaacattagcttggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16933035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9175504 - 9175360
Alignment:
Q  17 ctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaac 116  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9175504 ctctaatggtgtggtgttgcttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaac 9175405  T
Q  117 actcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9175404 actcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 9175360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22045749 - 22045601
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggt-gttcatctggagagacgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  22045749 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtctggagacacgtt 22045650  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22045649 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 22045601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 124 - 420
Target Start/End: Original strand, 47565681 - 47565976
Alignment:
Q  124 atcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagtt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  47565681 atcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatggtcagtttggaaaggcgaaggtaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggtg 47565780  T
Q  224 gaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggacct 323  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    || | ||| ||  ||||||| |||| ||| |||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  47565781 gaagacataatgggatgtacatatttgctagttgagaggtagaaagcttagtttgaggtgaagttgaactcaccgggaatggtatgactatggagaacct 47565880  T
Q  324 tgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  47565881 tgagtgatatgctcta-ttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaaggatgtatagcatggcttgtgggattacc 47565976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11007602 - 11007455
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  11007602 gtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctagagagacgtta 11007503  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11007502 aacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11007455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18536066 - 18535806
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18536066 atcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatctacct-ttgaggtggagttttaaggttgaagacatagtgcgatgtacgcattttctagttga 18535968  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |    |  | ||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18535967 gaggtaaaaagctcagcttgaggtggagtttaacacaccaggaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttc 18535868  T
Q  359 ttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||| |||||| |  | |||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  18535867 ttcataaagacgaacaacattctggaggttaaagaatgtatatcacgacttgcgggattacc 18535806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22802107 - 22801960
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  22802107 gtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgtta 22802008  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  22802007 aacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatc 22801960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36920868 - 36920721
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36920868 gtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgtta 36920769  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| || || |||| ||||||||    
T  36920768 aacactcaacatcagtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatc 36920721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 12396888 - 12396780
Alignment:
Q  311 ctatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttg 410  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12396888 ctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttg 12396790  T
Q  411 cgggattacc 420  Q
    ||||||||||    
T  12396789 cgggattacc 12396780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34571536 - 34571229
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactca-tga 159  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||     
T  34571536 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtgtgaagaatactcattgg 34571437  T
Q  160 tcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 259  Q
    | ||||| |||||| || |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  34571436 ttagtctggagaggtggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaagacatagt-gtatgtacgcatttggaagttgag 34571340  T
Q  260 gtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttct 359  Q
    |||   || ||||| | ||||||||||||    ||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| | || ||||    
T  34571339 gta---taagctcaacttgaggtggagttggtgacaccgagaatgatacaactatgaagg-ccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgtgaattct 34571244  T
Q  360 tcatgaagacggaag 374  Q
    |||||| ||||||||    
T  34571243 tcatgaggacggaag 34571229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12740679 - 12740336
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||    
T  12740679 ggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggataggcggtgagaagaat 12740580  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || ||||||||| |  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||  || || |||| ||||||| | ||||| ||||||     
T  12740579 actcatggttagcctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtggaag-catagtgtg-tgtactcatttgg 12740483  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaa 350  Q
     ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |  | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| || ||||     
T  12740482 aagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtaagcac 12740384  T
Q  351 gggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  12740383 gtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12740336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12748885 - 12748542
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| ||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||    
T  12748885 ggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaacatcatcctggataggcggtgagaagaat 12748786  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || ||||||||| |  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||  || || |||| ||||||| | ||||| ||||||     
T  12748785 actcatggttagcctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggtggaag-catagtgtg-tgtactcatttgg 12748689  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaa 350  Q
     ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |  | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| || ||||     
T  12748688 aagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtaagcac 12748590  T
Q  351 gggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  12748589 gtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12748542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 319
Target Start/End: Original strand, 8394683 - 8394905
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |||||||||    
T  8394683 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatgatcagtctggagaggcggtgtgaataatactcatg 8394782  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||| | | ||||| | ||||||||||||    |    
T  8394783 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagcgaaagctcaacttgaggtggagttggtga 8394879  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggagg 319  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||    
T  8394880 ctccgggaatggtacgactatggagg 8394905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 5137357 - 5137548
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  5137357 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcatg 5137456  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  5137457 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 5137548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 7123973 - 7124164
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  7123973 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatagttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtg 7124072  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  7124073 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 7124164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18536091 - 18536029
Alignment:
Q  99 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18536091 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatattcatgatc 18536029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Original strand, 47565620 - 47565698
Alignment:
Q  98 atctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcgg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47565620 atctggagagacgttaaacactcaacatcaacctgaagaggcagtggtaagaatactcatgatcagcctggagaggcgg 47565698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3578046 - 3577934
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||      |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3578046 gaagaaggtgatgtttctcaccttgggaataatgccttacaacgcggtgatcgtctgaagagacgttaaacactcaacatcagcatggagaggcggtagt 3577947  T
Q  146 aagaatactcatg 158  Q
    |||||||||||||    
T  3577946 aagaatactcatg 3577934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 26558905 - 26559034
Alignment:
Q  33 ttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctg 132  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  | |||||| | || | || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26558905 ttgttggggtgatgaagaaggtgatgtctctcacctttggactgatgccttatagagcggcggtcgtttgtacagacattaaacactcaacatcagcctg 26559004  T
Q  133 gagatgcggtggtaagaatactcatgatca 162  Q
     |||   |  ||||||||||||||||||||    
T  26559005 aagagttgacggtaagaatactcatgatca 26559034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 362
Target Start/End: Original strand, 54881989 - 54882111
Alignment:
Q  239 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 338  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  54881989 tgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccgagaatggtacgactatggagg-ccttgggtgttatgctct 54882087  T
Q  339 agtggtgagcaagggatttcttca 362  Q
    ||| ||||||| | || |||||||    
T  54882088 agttgtgagcatgtgaattcttca 54882111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18536859 - 18536807
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 82  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18536859 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgagtgatgcct 18536807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 18098202 - 18097797
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  18098202 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtctagagagacgtta 18098103  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18098102 aacactcaacatcagcctggagaggcggtagtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggag 18098003  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  18098002 tttgaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcatgaggtggaatttaacacaccggtaatggtacgacta 18097903  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18097902 tggaggaccttgggtgccatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 18097804  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  18097803 gattacc 18097797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 14 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 53917044 - 53916641
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53917044 gtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 53916945  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53916944 aacactctacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggag 53916845  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||    
T  53916844 tttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgagttagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggcta 53916745  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53916744 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagatggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgg 53916646  T
Q  414 gatta 418  Q
    |||||    
T  53916645 gatta 53916641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 3315570 - 3315975
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  3315570 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctggagagacgtta 3315669  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3315670 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaagaatactcatgatcttcctgttgaggtggag 3315769  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  3315770 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccggtaatggtatgacta 3315869  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3315870 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatatatagcacgacttgcgg 3315968  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  3315969 gattacc 3315975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 891277 - 890871
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  891277 gtgctctggtggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgtta 891178  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  891177 aacactcgacatcatcttggagaggcggtggtaagaatactcatgattagtctggagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 891078  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  891077 tttcaaggttgaagacataatgggatgtacacattttctcgttgatgtagagcactctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgacta 890978  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  890977 tggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacagcttgcgg 890878  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  890877 gattacc 890871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28101375 - 28100973
Alignment:
Q  17 ctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  28101375 ctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatctagagggaagttaaac 28101276  T
Q  117 actcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagttt 216  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28101275 actcaacatcatcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggatgcaataatattcatgatctacctgttgaggtggagttt 28101176  T
Q  217 gaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatgg 316  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  28101175 caaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttaaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatga 28101076  T
Q  317 aggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggat 416  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28101075 aggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggat 28100977  T
Q  417 tacc 420  Q
    ||||    
T  28100976 tacc 28100973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 42991187 - 42991535
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42991187 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatctagagagacgtta 42991286  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42991287 aacactcaacatcagcctggagaggcagtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggag 42991386  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  42991387 tttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaacta 42991486  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcat 363  Q
    || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42991487 tgaaggaccttaggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat 42991535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 43422840 - 43422436
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||    
T  43422840 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatctgtctcaccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatggagagacgata 43422741  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43422740 aacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagatgcggaggtaacaatactcattatctacctgttgaggtggag 43422641  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||| || |||||    
T  43422640 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgtatttgctaattgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacactagtaatggtaagacta 43422541  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43422540 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagggattt-ttcattaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgg 43422443  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  43422442 gattacc 43422436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 420
Target Start/End: Original strand, 23634667 - 23635057
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 129  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23634667 gtgttttttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagc 23634766  T
Q  130 ctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagac 229  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||    
T  23634767 atggagaagaggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgagggggagttttaaggttgaagac 23634866  T
Q  230 atagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg 329  Q
    |||||| | ||||| ||||| |||||||||     | | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  23634867 atagtgaggtgtacacattttctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttcggtg 23634966  T
Q  330 ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23634967 ttatgctctactggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgaaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 23635057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28138440 - 28138206
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28138440 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtgg 28138341  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcgga 384  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  28138340 agttgaacacaccggtaatggtacgactatggatgaccttgggtgctatgctcta-tggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccgga 28138242  T
Q  385 ggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  28138241 ggttgaagaatgtatagcgcaacttgcgggattacc 28138206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Original strand, 5898746 - 5898951
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898746 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 5898845  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5898846 ggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgtgtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 5898944  T
Q  359 ttcatga 365  Q
    |||||||    
T  5898945 ttcatga 5898951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4309431 - 4309226
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309431 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 4309332  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4309331 ggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 4309233  T
Q  359 ttcatga 365  Q
    |||||||    
T  4309232 ttcatga 4309226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 354
Target Start/End: Original strand, 25634738 - 25635058
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 129  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||   ||||| || ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  25634738 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagtg---cggtggtcgtctagagagttgttaaatactcaacatcagc 25634834  T
Q  130 ctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagac 229  Q
    || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||    
T  25634835 ctagagaggcggtgctaagaatactcatggtcagtctggagagacggaggtaacaatactcatgatctacct-ttgacgtggagtttcaaggtggaagac 25634933  T
Q  230 atagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    || | | ||||  |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25634934 atagtgggatgtacgcatttgctagttgagaggtagaaagttcagtttgaggtggagttgaacacagcggaaatggtacgactatggaggaccttgggtg 25635033  T
Q  330 ctattctctagtggtgagcaaggga 354  Q
    |||| |||||||||  |||||||||    
T  25635034 ctatgctctagtgggaagcaaggga 25635058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 457241 - 457447
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  457241 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttga 457340  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  457341 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 457438  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  457439 ttcatgaag 457447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6064717 - 6064513
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6064717 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactc-tgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 6064619  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  6064618 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tgatgagcaagggatttc 6064520  T
Q  359 ttcatga 365  Q
    |||||||    
T  6064519 ttcatga 6064513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 365
Target Start/End: Original strand, 43227414 - 43227619
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43227414 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtatgcatttgctagttga 43227513  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43227514 ggtagagtacgctcagcgtgaggtagagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 43227612  T
Q  359 ttcatga 365  Q
    |||||||    
T  43227613 ttcatga 43227619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 457131 - 457278
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  457131 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 457230  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  457231 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10957357 - 10957210
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  10957357 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctggagagacgtta 10957258  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10957257 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 10957210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 43227304 - 43227451
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  43227304 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagggacgtta 43227403  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43227404 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43227451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6064827 - 6064686
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6064827 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgtta 6064728  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6064727 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactc 6064686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 11169435 - 11169642
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11169435 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgcggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttga 11169534  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11169535 ggtagagtacactcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggagcttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 11169633  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  11169634 ttcatgaag 11169642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 5898636 - 5898783
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  5898636 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctggagagacgtta 5898735  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5898736 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 5898783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Original strand, 11169327 - 11169472
Alignment:
Q  16 gctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11169327 gctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaa 11169426  T
Q  116 cactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11169427 cactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 11169472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4309541 - 4309394
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  4309541 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaagagacgtta 4309442  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4309441 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 4309394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23199076 - 23198742
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  23199076 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggt 23198977  T
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
     ||||| |||||| || || ||| |||||||||||| |||| |||||||| |||   || || |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23198976 tagtctggagaggtggtggtaacaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtggtaaggtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgagg 23198880  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttct 359  Q
    ||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||| ||| |||| || ||||||||||| | ||| |||  ||| ||||||| ||||||| | || ||||    
T  23198879 tagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacatcgggaatggtatgactatggagg-ctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattct 23198781  T
Q  360 tcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  23198780 tcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 23198742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10957247 - 10957090
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10957247 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctaccagttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttga 10957148  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatgg 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10957147 ggtagagtacactcagcgtgaggtgaaaatgaacacaccggtaatggtacgactatgg 10957090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5259256 - 5258926
Alignment:
Q  65 accttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagt 164  Q
    ||||||| | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  5259256 accttggtattgatgccttgtagaatggtgttcatctggagagacattaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggttagc 5259157  T
Q  165 cttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 264  Q
    || ||||||||| |  ||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||||  || || |||| |||||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||    
T  5259156 ctagagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacc-cttgaggtggagttacaaggtggaag-catagt-ggaaatactcatttggaagttgaggtaga 5259060  T
Q  265 gtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcat 363  Q
    | | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||  ||| ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  5259059 gaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 5258961  T
Q  364 gaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    || ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  5258960 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 5258926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 398
Target Start/End: Original strand, 7763500 - 7763833
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  7763500 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagccaggagaggcggtggtaacaatactcatggt 7763599  T
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
     ||||| ||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||  |||||||| ||  || ||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  7763600 tagtctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacc--ttgaggtggag-ctgcaaggtgaaggcatagt-ggaagtactcatttggaagttgagg 7763695  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttct 359  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||||||    ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||  |||||||   || ||||    
T  7763696 tagagaaagctcaacttgaggtggagtttgtgacaccgagaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctctaggtgtgagcatatgaattct 7763794  T
Q  360 tcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||    
T  7763795 tcatgaggacggaagacattctggggtttgaagaatgta 7763833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 29812091 - 29812409
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| ||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||    
T  29812091 ggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagtttggagaggcggtcggaagaat 29812190  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || ||||||||| |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||     
T  29812191 actcatggttagcctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaggcatagtgtg-tgtacgcatttgg 29812287  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaag 351  Q
     ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||  |    
T  29812288 aagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggatg-ccttgagtgctatgctctagttgtgagcttg 29812386  T
Q  352 ggatttcttcatgaagacggaag 374  Q
     || ||||||||||  |||||||    
T  29812387 tgaattcttcatgagaacggaag 29812409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 398
Target Start/End: Original strand, 32892289 - 32892652
Alignment:
Q  31 tgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcc 130  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32892289 tgttgttgagatgatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctggagagacgttaaacactcaacatcagtc 32892388  T
Q  131 tggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagaca 230  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  | ||||||||| |  ||  |||||  ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||  ||    
T  32892389 aggagaagcggtgggaagaatactcaaggtcagcatggagaggcggtgtgaataatacttgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaagca 32892486  T
Q  231 tagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgc 330  Q
    | ||| | ||||||||||||  |||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||  |||| ||| |||||||| || |||| |||     
T  32892487 tggtgtg-tgtacgcatttgaaagttgaggcagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccgaaaatggtacaactatgga-gatcttgggtgt 32892584  T
Q  331 tattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    ||  |||||||  ||||||| | | ||||||| || ||||||||   ||||| || ||||||||||||    
T  32892585 taggctctagttttgagcaaagaaattcttcaagaggacggaaggcctttcgaagtttgaagaatgta 32892652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4599622 - 4599321
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  4599622 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgataatactcatggtcagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 4599523  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    |    
T  4599522 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttggtga 4599426  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    | |||| |||| |||| ||||||||| | ||| | |  ||| ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |  ||| ||| | ||||||    
T  4599425 ctccgggaatggtacggctatggagg-ctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggatggtattccggggtttgaag 4599327  T
Q  393 aatgta 398  Q
    ||||||    
T  4599326 aatgta 4599321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 6717774 - 6717965
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  6717774 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcagtggtgagaatacttatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 6717873  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  6717874 atcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagttcaacttgaggtggagtt 6717965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10210463 - 10210654
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10210463 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10210562  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10210563 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtacccatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10210654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10057510 - 10057701
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10057510 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10057609  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10057610 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10057701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10059732 - 10059923
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10059732 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10059831  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10059832 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10059923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10061954 - 10062145
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10061954 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10062053  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10062054 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10062145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10064176 - 10064367
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10064176 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10064275  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10064276 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10064367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 10066398 - 10066589
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  10066398 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 10066497  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  10066498 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 10066589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1619844 - 1619605
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||| ||  || |||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||    
T  1619844 gaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgattccttgtaaagtggtagttttctagagagacgttaaacactcaacatcagcccagagaggcagttgt 1619745  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgc 245  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||||||||| ||  |||||  |||||  ||| || ||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||||||||    
T  1619744 aagaatactcgtggttagtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtgatcagcct-tttaggtggagtttcaaggtgaaagacatggtgggatgtacgc 1619646  T
Q  246 atttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggag 286  Q
    |||||  ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  1619645 atttggaagttgaggtagagaaagttcagcttgaggtggag 1619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Original strand, 7769766 - 7769982
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  | ||||     
T  7769766 gaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaagatcatcctagagagtctgtggg 7769865  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaaga-catagtgggatgtacg 244  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| ||| | || | ||||| ||| | | || |||||||| || ||| ||| |||| | |||||| |||||||||    
T  7769866 aagaatactcatggtcagtctgaagaggaggatgtaaggttactcgtgaacaaact-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaaatcatagt-ggatgtacg 7769962  T
Q  245 catttgctagttgaggtaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  7769963 catttcctagttgaggtaga 7769982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 344 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 35918939 - 35918864
Alignment:
Q  344 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35918939 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattac 35918864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Original strand, 27421892 - 27422028
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| || |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||      
T  27421892 gaagaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaacatcagcatgaaaaggcggtgag 27421991  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaa 182  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||    
T  27421992 aagaatactcatggttagtctgaagaggcagaggcaa 27422028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1619603 - 1619491
Alignment:
Q  306 tacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacg 405  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||   | | |||| ||||||| |||| |    
T  1619603 tacgactatggag-accttgggtgctatgctctagtggtgaccaagggaattcttcatgaagacagaaggcattctagtgtttgaggaatgtatagcatg 1619505  T
Q  406 gcttgcgggattac 419  Q
    ||||| ||||||||    
T  1619504 gcttgtgggattac 1619491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15824808 - 15824698
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| || ||| | |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||| |||     
T  15824808 gaagaaggtgatatttctcacctttggagtgatgccttgtagagagatagtcgtctagagagacattaaacactcaacatcatcttggaggggcgatggg 15824709  T
Q  146 aagaatactca 156  Q
    |||||||||||    
T  15824708 aagaatactca 15824698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 27900211 - 27900276
Alignment:
Q  91 ggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactca 156  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  27900211 ggtgttcattttaagagacgttaaacacccaacatcagtctggagaggcggtgcaaagaatactca 27900276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 420
Target Start/End: Original strand, 43227618 - 43227655
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43227618 gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 43227655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4309227 - 4309191
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4309227 gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattac 4309191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27882695 - 27882632
Alignment:
Q  93 tgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactca 156  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  |||||||||||    
T  27882695 tgttcatcttaagagacgttaaacactcagcatcagtttggagaggcggtgcaaagaatactca 27882632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 384 - 419
Target Start/End: Original strand, 42991537 - 42991572
Alignment:
Q  384 aggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42991537 aggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattac 42991572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 127
Target Start/End: Original strand, 31116511 - 31116539
Alignment:
Q  99 tctggagagacgttaaacactcaacatca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116511 tctggagagacgttaaacactcaacatca 31116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3631312 - 3630908
Alignment:
Q  15 tgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  3631312 tgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaa 3631213  T
Q  115 acactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagt 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3631212 acactcaacatcaacctggagaggcggtggtaagaatagtcatgatcagtctcaagaggtggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggact 3631113  T
Q  215 ttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactat 314  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |    
T  3631112 ttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtatgacttt 3631013  T
Q  315 ggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcggg 414  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3631012 ggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcggg 3630914  T
Q  415 attacc 420  Q
    ||||||    
T  3630913 attacc 3630908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 53 - 420
Target Start/End: Original strand, 3395260 - 3395626
Alignment:
Q  53 gtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaata 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3395260 gtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaata 3395359  T
Q  153 ctcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgct 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3395360 ctcatgatcagtctggagaggcggagacaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgtagacatagtgggatgtacgcatttgct 3395459  T
Q  253 agttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagg 352  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  3395460 agttgagctagagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggttagcaagg 3395558  T
Q  353 gatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||| ||| | ||||||||    
T  3395559 gatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatttatatcacgtctttctggattacc 3395626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 159 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 15533862 - 15533601
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15533862 atcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttaaggtagagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacattttctagttga 15533763  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15533762 ggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcacgggatttc 15533663  T
Q  359 ttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  15533662 ttcatgaagacggaaggcattccaaaggttgaagaatgtatagcacaacttgcgggattacc 15533601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 33310244 - 33310450
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310244 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 33310343  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  33310344 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctaggctcta-tggtgagcaagggatttc 33310441  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  33310442 ttcatgaag 33310450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26067319 - 26067115
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26067319 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagaca--gtgggatgtacgcatttgctagttga 26067222  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26067221 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 26067124  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  26067123 ttcatgaag 26067115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 26067429 - 26067282
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26067429 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctggagagacgtta 26067330  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26067329 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 26067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 33310134 - 33310281
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  33310134 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgtta 33310233  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33310234 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 33310281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15533972 - 15533825
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15533972 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 15533873  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||    
T  15533872 tacactcaacatcagcctagagaggcggaggcaacaatactcatgatc 15533825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 373
Target Start/End: Original strand, 11137349 - 11137673
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||     
T  11137349 gaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaacactcaacatcattctggaaaggcggtggg 11137448  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgc 245  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||| | ||  ||||||||| || |||| |||||||| ||||| || ||  ||| |||||| ||||||||||    
T  11137449 aagaatactcatggttagtctgaagaggcggatgtaagaatactcatgttcaacct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagt-ggatgtacgc 11137546  T
Q  246 atttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtg 345  Q
     |||||||||| |||||||| |  |||||| || ||||||||| |  ||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  11137547 gtttgctagttcaggtagagaaaactcagcttgtggtggagttgatgacatcgggaatggtacgacgatgga-gaccttgggtgctaggctctagttgtg 11137645  T
Q  346 agcaagggatttcttcatgaagacggaa 373  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||    
T  11137646 agcaagagaattcttcaagaagaaggaa 11137673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Original strand, 16652203 - 16652504
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  16652203 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtg 16652302  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |    
T  16652303 atcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatga 16652399  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | ||| | |  |||  |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  16652400 caccgggaatggtacgactatggagg-ctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaag 16652498  T
Q  393 aatgta 398  Q
    ||||||    
T  16652499 aatgta 16652504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 349
Target Start/End: Original strand, 16568196 - 16568480
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  16568196 tctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaacaatactcatggt 16568295  T
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
     ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||  || || |||| ||||||| | |||||  |||||  ||||||||    
T  16568296 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttacaaggtggaag-catagtgtg-tgtactaatttggaagttgagg 16568392  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagca 349  Q
    ||||| |  |||| | ||||||||||||    ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | | ||| ||||||| |||||||    
T  16568393 tagagaaatctcaacttgaggtggagttggtgacaccgggaatggtacaactatgga-gaccttgggagttatgctctagttgtgagca 16568480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 420
Target Start/End: Original strand, 30444585 - 30444936
Alignment:
Q  66 ccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtc 165  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  30444585 ccttgggagtgatgctttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcatggagaggcggtgggaagaatattcatggtcagtc 30444684  T
Q  166 ttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagag 265  Q
    |  ||||||||||| ||  |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||  ||| |||||| |||| |||  |||||  | |||||||||||    
T  30444685 tgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaatct-ttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagt-ggatatacatatttggaacttgaggtagag 30444782  T
Q  266 tacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
     | | ||||| |||||||||||| |  || | | || || |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||    
T  30444783 aaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatgga-gacattgggtgctagtctctagttgtgagcaagagaattcttcaaga 30444881  T
Q  366 agacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
     ||| ||||  |||  || | ||||||||||||  ||| | |||| |||||||||    
T  30444882 ggacagaaggcattcaggggtttgaagaatgtatggcatgacttgtgggattacc 30444936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Original strand, 16553941 - 16554242
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  16553941 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtg 16554040  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |    
T  16554041 atcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatga 16554137  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| | ||| | |  |||  |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  16554138 caccgggaatggtatgactatggagg-ctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaag 16554236  T
Q  393 aatgta 398  Q
    ||||||    
T  16554237 aatgta 16554242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 398
Target Start/End: Original strand, 16630497 - 16630798
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||    
T  16630497 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcatggttagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtg 16630596  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaaca 293  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |    
T  16630597 atcaacct-ttgaggtggagttgcaaagtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatga 16630693  T
Q  294 caccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaag 392  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| | ||| | |  |||  |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  16630694 caccgggaatggtatgactatggagg-ctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaag 16630792  T
Q  393 aatgta 398  Q
    ||||||    
T  16630793 aatgta 16630798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5408014 - 5407899
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5408014 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggt 5407915  T
Q  161 cagtcttgagaggcgg 176  Q
     ||||| | |||||||    
T  5407914 tagtctggggaggcgg 5407899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5412339 - 5412224
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5412339 tctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatggt 5412240  T
Q  161 cagtcttgagaggcgg 176  Q
     ||||| | |||||||    
T  5412239 tagtctggggaggcgg 5412224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 26944465 - 26944562
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtg 143  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26944465 gaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcggtg 26944562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 301 - 398
Target Start/End: Original strand, 26944599 - 26944696
Alignment:
Q  301 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  26944599 aatggtacgactgtggaggaccttgggggctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgta 26944696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 288
Target Start/End: Original strand, 34166149 - 34166340
Alignment:
Q  94 gttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatg 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  34166149 gttcgtctggagagacgttaaacactcaacgtcagcctggagaggcggtggtgagaatactcgtggttagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtg 34166248  T
Q  194 atctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 288  Q
    ||| |||| |||||||| |||   || |  |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  34166249 atcaacct-ttgaggtggagtggcaaggcggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 34166340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28038724 - 28038631
Alignment:
Q  327 gtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  28038724 gtgctatggtctagtggtgaggaaggggattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgtgggattacc 28038631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10456559 - 10456494
Alignment:
Q  91 ggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactca 156  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||  |||||||||||    
T  10456559 ggtgttcgtctggagagacattaaacactcaacatcatcctagagaagtggtgcgaagaatactca 10456494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11722673 - 11722602
Alignment:
Q  91 ggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatca 162  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  11722673 ggtgatcatctggagaaacattaaacattcaacatcagtctggagagacggtgctaataatactcataatca 11722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 17012969 - 17013004
Alignment:
Q  224 gaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17012969 gaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgag 17013004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 15 - 420
Target Start/End: Original strand, 41383618 - 41384021
Alignment:
Q  15 tgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41383618 tgctctgatggtgtggt-ttgtttggaggatgatgaaggtgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaa 41383716  T
Q  115 acactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41383717 acactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtttggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagt 41383816  T
Q  215 ttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactat 314  Q
    || || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  41383817 ttcaaggttgaagacatagtgagatgtgcacatttgctagttgaggtagagtacgctcatcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctat 41383916  T
Q  315 ggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcggg 414  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41383917 ggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcggg 41384015  T
Q  415 attacc 420  Q
    ||||||    
T  41384016 attacc 41384021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 111 - 420
Target Start/End: Original strand, 15071820 - 15072126
Alignment:
Q  111 ttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15071820 ttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtg 15071919  T
Q  211 aagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacga 310  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  15071920 gagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacga 15072019  T
Q  311 ctatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttg 410  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||| ||||||||  |    
T  15072020 caatggaagaccttgagtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccg--ggttgaagaatgtatagcacggcaag 15072116  T
Q  411 cgggattacc 420  Q
    | ||||||||    
T  15072117 caggattacc 15072126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 21481478 - 21481818
Alignment:
Q  32 gttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcct 131  Q
    ||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21481478 gttgtatggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagagcggtggtcgtcaagagagacgttaaacactcaacatcagcct 21481577  T
Q  132 ggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacat 231  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  21481578 ggagaggcgatggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacat 21481677  T
Q  232 agtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgct 331  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||     | | ||||| | ||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||    
T  21481678 agtgggatttacacatttgctagttgagaggttggaagctcaacttgaggtggatttgaacacatcggaaatggtacgactatggaagaccttgggagct 21481777  T
Q  332 attctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacgga 372  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21481778 atgctctagtggtgagcaatggatttcttcatgaagacgga 21481818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Original strand, 18812144 - 18812324
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812144 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 18812243  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18812244 agttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 18812324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 43081012 - 43081218
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43081012 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttga 43081111  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43081112 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 43081209  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  43081210 ttcatgaag 43081218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 367
Target Start/End: Original strand, 27828421 - 27828602
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828421 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 27828520  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27828521 agttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagtaagggatttcttcatgaag 27828602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 43080902 - 43081049
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43080902 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 43081001  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43081002 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 43081049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 18812008 - 18812155
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  18812008 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctggagagacgtta 18812107  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18812108 aacactcaacatcagcctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatc 18812155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 27828285 - 27828432
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27828285 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 27828384  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  27828385 aacactcaacatcaacctggagaggtggtagtaagaatactcatgatc 27828432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34255443 - 34255109
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgat 160  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  34255443 tctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggtggtggtaagaatactcatggt 34255344  T
Q  161 cagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 260  Q
     ||||  |||||||||    ||  |||||| ||||| |||| |||||||| ||||  || || |||| |||||| ||| |||| ||||||  ||||||||    
T  34255343 tagtccggagaggcggtatgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttacaaggtggaag-catagt-ggaagtactcatttggaagttgagg 34255247  T
Q  261 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaagggatttct 359  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||| | || ||||    
T  34255246 tagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattct 34255148  T
Q  360 tcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  34255147 tcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 34255109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31577297 - 31577171
Alignment:
Q  53 gtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaata 152  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31577297 gtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaacctcagcctggagaggcggttgtaagaata 31577198  T
Q  153 ctcatgatcagtcttgagaggcggagg 179  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31577197 ctcatggtcagtctggagaggcggagg 31577171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31574714 - 31574531
Alignment:
Q  236 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  31574714 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtttatgacatcgggaatgatacgactatgga-gaccttgggtgctatgc 31574616  T
Q  336 tctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||| || || |||||||||||| | || ||| || |||||||||    
T  31574615 tctagttatgagaaagggaattcttcatgaagacagaaggcattccgaagtttgaagaatgtataacatggcatgtgggattacc 31574531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 41365965 - 41365619
Alignment:
Q  46 gaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggt 145  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||| || ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41365965 gaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcggtggg 41365866  T
Q  146 aagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgc 245  Q
    ||||||||||||| | || || ||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||| |||||||| ||||  || |   ||| ||||||| | |||| ||    
T  41365865 aagaatactcatggttagcctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacct-ttgaggtggagttgcaaggcaaaaggcatagtgtg-tgtatgc 41365768  T
Q  246 atttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtg 345  Q
    |||||      || || ||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||    
T  41365767 atttg------gaagttgagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagg-ccttgggtgctatgctctagttgtg 41365675  T
Q  346 agcaagggatttcttcat---gaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  41365674 agcatgggaattcttcatgaagaagacggaagacattccagagtttgaagaatgta 41365619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 215
Target Start/End: Original strand, 17848865 - 17849026
Alignment:
Q  53 gtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaata 152  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  17848865 gtgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaacatcaccctggagaggcggtcgaaagaata 17848964  T
Q  153 ctcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtt 215  Q
     ||||| |||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  17848965 gtcatggtcagtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaacct-ttgaggtggagtt 17849026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 15069870 - 15069971
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15069870 gtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctgaagagacgtta 15069969  T
Q  114 aa 115  Q
    ||    
T  15069970 aa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Original strand, 4732851 - 4733116
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4732851 ggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaacactcatcatcagcctggagaggcggtgggaagaat 4732950  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||||||| | || || ||||||| | |  ||   ||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |  |||  ||||||| | ||||||||||||     
T  4732951 actcatggttagcctggagaggcagtgtgaagagtactcatgatcaacct-ttgaggtggagttgcaagggagaaagcatagtgtg-tgtacgcatttgg 4733048  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 319  Q
     | ||||||||||| |  |||| | |||||||||||| |  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  4733049 aaattgaggtagagaaatctcaacttgaggtggagttgatgacaccgaaaatggtacgactatggagg 4733116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Original strand, 17849079 - 17849233
Alignment:
Q  243 cgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |||  ||  |   || ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  17849079 cgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaccttgaggtggagttgatgacattggacaaagtatgactatgga-gaccttgggtgctaggctctagtt 17849177  T
Q  343 gtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    || |||||| || |||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  17849178 gttagcaagagaattcttcaaaaagacggaaggcatttcggattttgaagaatgta 17849233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 394
Target Start/End: Original strand, 6996493 - 6996872
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6996493 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacatttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 6996592  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| ||    
T  6996593 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctagagaggcggaggcaacagtactcatgatctacattttgaggtggag 6996692  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||    
T  6996693 tttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggcta 6996792  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaa 394  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  6996793 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaa 6996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28202731 - 28202326
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  28202731 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaataagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctggagagacgtta 28202632  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  28202631 aacactcgacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggag 28202532  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  28202531 tttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggcacgacta 28202432  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||   |||    
T  28202431 tggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggttttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatatcacggcgctcgg 28202333  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  28202332 gattacc 28202326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 50078164 - 50077759
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||  || |||||||||||||||    
T  50078164 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggagagacgtta 50078065  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50078064 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 50077965  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
     || || |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  50077964 cttcaaggttgaagacataataggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgacta 50077865  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  50077864 tggagaaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattttggaggttaaagaatgtatagcacgacttgcgg 50077766  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  50077765 gattacc 50077759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 31424404 - 31424000
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31424404 gtgctctgatggtgtggtattgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcatcttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 31424305  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  31424304 aacacttaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtagag 31424205  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     | | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  31424204 tttcaaggttgaacacataatgggatgtacgcatttgctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatagtacgacta 31424105  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31424104 tgggggaccttgggtgctatgctcta--ggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtattgcacggcttgcgg 31424007  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  31424006 gattacc 31424000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 420
Target Start/End: Original strand, 16429856 - 16430261
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  16429856 gtgctctggtggtgtggtgttgtttggaggatgaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctggagagaagtta 16429955  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16429956 aacactcaacatcagcttggagaggcggtggtaagaatactcatggtcagtctggagaggcggatgtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggag 16430055  T
Q  214 tttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgacta 313  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||     | | ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||    
T  16430056 tttcaaggttgaagacatagtggtatgtacgc-ttttctagttgagaggatggaagctcagcttaaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggcta 16430154  T
Q  314 tggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgg 413  Q
    ||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16430155 tggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgaaggttggagaatgtatagcacggcttgcgg 16430254  T
Q  414 gattacc 420  Q
    |||||||    
T  16430255 gattacc 16430261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 120 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14099189 - 14098890
Alignment:
Q  120 caacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaa 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  14099189 caacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatcagtctgaagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaa 14099090  T
Q  220 agttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 319  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  14099089 ggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtatgtctatggagg 14098990  T
Q  320 accttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14098989 accttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcatggcttgcgggattac 14098891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 101 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 25249935 - 25249616
Alignment:
Q  101 tggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacc 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25249935 tggagagacgttaaatactaaacatcattctggagaggtggtggtaagaatactaatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacc 25249836  T
Q  201 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 300  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||     
T  25249835 tgttgagttggagttttaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtagagtacactctacttgaggtggagttgaacacaccgga 25249736  T
Q  301 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtaca 400  Q
    |||  || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||| |||||| |    
T  25249735 aatcgtatgactatggaggaccttgggtgctatgatctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggcattctggaggttgaataatgtata 25249636  T
Q  401 gcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  25249635 gcatgacttgcgggattacc 25249616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28997626 - 28997423
Alignment:
Q  13 tgtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28997626 tgtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgtt 28997527  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28997526 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtgga 28997427  T
Q  213 gttt 216  Q
    ||||    
T  28997426 gttt 28997423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29003341 - 29003139
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  29003341 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgtta 29003242  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29003241 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaaaaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatacgcatgatctacctgttgaggtggag 29003142  T
Q  214 ttt 216  Q
    |||    
T  29003141 ttt 29003139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 51751392 - 51751599
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751392 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 51751491  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51751492 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 51751590  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  51751591 ttcatgaag 51751599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Original strand, 47178726 - 47178924
Alignment:
Q  168 gagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 267  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47178726 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 47178825  T
Q  268 cgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 367  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47178826 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 47178924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27338054 - 27337847
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338054 atcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 27337955  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  27337954 ggtagagtacgctcagcgcgaggtggagttgaacacaccggtaatgtttcgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaatggatttc 27337856  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  27337855 ttcatgaag 27337847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31736710 - 31736531
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736710 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 31736611  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31736610 agttgaacacaccggtaatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 31736531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13126755 - 13126369
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagc 129  Q
    |||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  13126755 gtgttgttgggaggatgaagaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagatgataaacactcaacatcaac 13126656  T
Q  130 ctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagac 229  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||| ||  |||||  | |||||||| || ||||| ||||| || || ||||||    
T  13126655 ttggagaggcggtggtaagaatacttatggttagtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtaatctacct-ttaaggtggagtttcaaggtggaagac 13126557  T
Q  230 atagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg 329  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||  |||    
T  13126556 atagtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagctagaggtggagttgaacacactgaaaatggtacgactatagaggacctt--gtg 13126459  T
Q  330 ctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
     ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||  ||| || || |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  13126458 ttatgctctagttgtgagcaaggaaattcttcatgaagacaaaaggcattccgaagtttgaagaaagtatagcatggcttgtgggattac 13126369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 16227523 - 16227729
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227523 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagatatagtgggatgtacgcatttgctagttga 16227622  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16227623 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 16227720  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  16227721 ttcatgaag 16227729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 20301486 - 20301693
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20301486 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgtcgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttga 20301585  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  20301586 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatgaaggaccttgagtgctatgctcta-tcgtgagcaaaggatttc 20301684  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  20301685 ttcatgaag 20301693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 20301376 - 20301523
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20301376 gtgctctgatgatgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 20301475  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20301476 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 20301523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 51751282 - 51751429
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  51751282 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 51751381  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51751382 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 51751429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 16227413 - 16227560
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16227413 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 16227512  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16227513 aacacttaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 16227560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27338164 - 27338017
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27338164 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 27338065  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27338064 aacactcaacatcagcctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 27338017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 47178607 - 47178754
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47178607 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 47178706  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47178707 aacactcaacatcaacctagagaggcggtggtaagaatactcatgatc 47178754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31736846 - 31736699
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  31736846 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttggagagacgtta 31736747  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31736746 aacactcaacattagcctggagaggcggttgtaagaatactcatgatc 31736699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 365
Target Start/End: Original strand, 28841760 - 28841917
Alignment:
Q  207 ggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgat 306  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28841760 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 28841859  T
Q  307 acgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28841860 acgactatgaaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttcttcatga 28841917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 28841634 - 28841764
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  28841634 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatggtcgtctggcgagacgtta 28841733  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtgg 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28841734 aacacccaacatcagcctggagaggcggtgg 28841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50168302 - 50167982
Alignment:
Q  47 aagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggta 146  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |    
T  50168302 aagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaacatcagcctggaaaggcggtagga 50168203  T
Q  147 agaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgca 246  Q
    |||||||||| |   || || ||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| | ||||| ||    
T  50168202 agaatactcaaggatagcctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaggcatagtgtg-tgtacaca 50168106  T
Q  247 tttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtg 345  Q
    ||||  ||||||||||||| |  |||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| |||    
T  50168105 tttggaagttgaggtagagaaaactcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtg 50168007  T
Q  346 agcaagggatttcttcatgaagacg 370  Q
    |||| | || |||||||||| ||||    
T  50168006 agcatgtgaattcttcatgaggacg 50167982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 157
Target Start/End: Original strand, 31658362 - 31658467
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  31658362 ggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcattctggagatgcagtggaaagaat 31658461  T
Q  152 actcat 157  Q
    ||||||    
T  31658462 actcat 31658467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 374
Target Start/End: Original strand, 776294 - 776613
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||  | |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  776294 ggtgaggtttctcaccttgatattgatgccttgtagagtggtgttcgtcttgagagacattaaacactcaacatcagcttggggaggcggtgggaagaat 776393  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgc 251  Q
    ||| | |   || || ||||||||| |  ||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| | | ||||||||||     
T  776394 actgaaggatagcctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaggcatagtgtg-tatacgcatttgg 776490  T
Q  252 tagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctctagtggtgagcaa 350  Q
     ||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| |||||||     
T  776491 aagttgaggtagataaagctcaacttgaggtggagttgataacaccggaaatggtaccactatggagg-ccttgggtgtttatgctctagttgtgagcat 776589  T
Q  351 gggatttcttcatgaagacggaag 374  Q
    | || |||||||||| ||||||||    
T  776590 gtgaattcttcatgaggacggaag 776613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13548556 - 13548287
Alignment:
Q  125 tcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttg 224  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  || ||||| ||| |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||| ||    
T  13548556 tcagcctggagaggcggtgggaagaatactcatggttatcctggagagacggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtt-gcaaggtg 13548459  T
Q  225 aagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggacctt 324  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  13548458 aaggcatagtgtg-tgtacgcatttggaagttaaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggagg-cctt 13548361  T
Q  325 gagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  13548360 gagtgctatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 13548287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 25250651 - 25250566
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  25250651 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggtgaagaatgtgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcat 25250566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28222371 - 28222106
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| || ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||    
T  28222371 ggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaacatcagcctagagaggcagtgtgaagaat 28222272  T
Q  152 actca-tgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttg 250  Q
    ||||| || | || || || |||||| |  ||   ||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  28222271 actcattggttagcctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggag-ttgcaaggtgaaggcatagtgtg-tgtacgcatttg 28222175  T
Q  251 ctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 319  Q
      ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  28222174 gaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggagg 28222106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 31928975 - 31928880
Alignment:
Q  301 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgt 397  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  31928975 aatggtacgactatggag-accttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaagacatttcgggggttgaagaatgt 31928880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8348088 - 8348039
Alignment:
Q  30 gtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatg 79  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8348088 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggagtgatg 8348039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 398
Target Start/End: Original strand, 19753440 - 19753532
Alignment:
Q  306 tacgactatggaggaccttgagtgct-attctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 398  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  19753440 tacgactatggagg-ccttgggtgcttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatttcggggtttgaagaatgta 19753532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31736532 - 31736496
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31736532 gaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattac 31736496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 420
Target Start/End: Original strand, 25127081 - 25127120
Alignment:
Q  381 cggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25127081 cggaggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattacc 25127120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27337847 - 27337813
Alignment:
Q  386 gttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337847 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattacc 27337813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 420
Target Start/End: Original strand, 28242990 - 28243170
Alignment:
Q  239 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 338  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||    
T  28242990 tgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaactagaggtggagttagtgacaccgggaatggtacgactatggagg-tattgggtgttatgctct 28243088  T
Q  339 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    | | ||||||| | || |||| ||||| |||||||   ||| ||  | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  28243089 atttgtgagcatgtgaattctccatgaggacggaaagcattccgtggtttgaagaatgtttagcatggcttgtgggattacc 28243170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 319
Target Start/End: Original strand, 31658561 - 31658626
Alignment:
Q  254 gttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 319  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31658561 gttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg 31658626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 419
Target Start/End: Original strand, 28841916 - 28841952
Alignment:
Q  383 gaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattac 419  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28841916 gaggttgaagaatgtaaagcacagcttgcgggattac 28841952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 979 - 1186
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  979 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctaattga 1078  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1079 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 1177  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  1178 ttcatgaag 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 869 - 1016
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  869 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtta 968  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  969 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 159 - 367
Target Start/End: Original strand, 23482 - 23689
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23482 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 23581  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23582 ggtagagcacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 23680  T
Q  359 ttcatgaag 367  Q
    |||||||||    
T  23681 ttcatgaag 23689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Original strand, 23371 - 23519
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggt-gttcatctggagagacgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23371 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtctggagagacgtt 23470  T
Q  113 aaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23471 aaacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcaggatc 23519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 511
Alignment:
Q  159 atcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 258  Q
    ||||| || ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  712 atcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttga 613  T
Q  259 ggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttc 358  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  612 ggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttc 514  T
Q  359 ttc 361  Q
    |||    
T  513 ttc 511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 822 - 675
Alignment:
Q  14 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgtta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  822 gtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgtta 723  T
Q  114 aacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  722 aacactcaacatcagcctggagaggcggtggtaagaatactcatgatc 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 70426 - 70247
Alignment:
Q  185 atactcatgatctacctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgg 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  70426 atactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtgg 70327  T
Q  285 agttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatga 365  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  70326 agttgaacacactggtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgaggaagggatttcttcatga 70247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 72549 - 72468
Alignment:
Q  13 tgtgctctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtg 94  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  72549 tgtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtg 72468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 70477 - 70415
Alignment:
Q  99 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  70477 tctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagttgcggtggtaataatactcatgatc 70415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 190
Target Start/End: Original strand, 80779 - 80951
Alignment:
Q  18 tctgatggtgtggtgttgtttggatgacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaaca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  80779 tctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaaca 80878  T
Q  118 ctcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaatactcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactc 190  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  80879 ctcaacatcagcctagagaggcgagggtaagaatactcatgatcagtctggagaggcggaggcaacaatactc 80951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 290 - 420
Target Start/End: Original strand, 3969 - 4099
Alignment:
Q  290 aacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttg 389  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  || |||    
T  3969 aacacaccagaaatggtacgactatggaggaccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagtttg 4068  T
Q  390 aagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 420  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4069 aagaatgtatagcacgacttgcgggattacc 4099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26263 - 26228
Alignment:
Q  224 gaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgag 259  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26263 gaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgag 26228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 196
Target Start/End: Original strand, 584 - 728
Alignment:
Q  52 ggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  584 ggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacattaaacactcaacatcagcttggagaggcggtgggaagaat 683  T
Q  152 actcatgatcagtcttgagaggcggaggcaacgatactcatgatc 196  Q
    ||||||| | ||  | ||||||||| || ||| |||||| |||||    
T  684 actcatggttagcttggagaggcggtggtaacaatactcgtgatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 151
Target Start/End: Original strand, 115830 - 115920
Alignment:
Q  61 tctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagatgcggtggtaagaat 151  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||  || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  115830 tctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaacatcagcctggagaggcagtgggaagaat 115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University