View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7284_low_2 (Length: 724)

Name: NF7284_low_2
Description: NF7284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7284_low_2
NF7284_low_2
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (16-425)||(638139-638548)
chr8 (16-425)||(38060336-38060745)
chr8 (16-425)||(277301-277713)
chr8 (16-425)||(823942-824354)
chr8 (16-425)||(15882529-15882938)
chr8 (16-425)||(27912961-27913370)
chr8 (16-425)||(27959380-27959789)
chr8 (16-425)||(44256657-44257068)
chr8 (16-425)||(18956018-18956427)
chr8 (16-424)||(23346259-23346667)
chr8 (26-428)||(40303456-40303866)
chr8 (26-425)||(39858556-39858964)
chr8 (16-425)||(36191987-36192405)
chr8 (16-423)||(43694257-43694673)
chr8 (20-422)||(30555780-30556194)
chr8 (16-424)||(13140404-13140821)
chr8 (18-422)||(30111292-30111708)
chr8 (16-422)||(42645880-42646298)
chr8 (16-422)||(45408323-45408725)
chr8 (173-424)||(26949942-26950193)
chr8 (137-424)||(41545526-41545812)
chr8 (16-425)||(42736160-42736560)
chr8 (26-423)||(3850608-3851000)
chr8 (147-425)||(6095493-6095779)
chr8 (16-186)||(2081610-2081780)
chr8 (18-422)||(18088629-18089024)
chr8 (16-151)||(6093895-6094030)
chr8 (212-422)||(40617258-40617469)
chr8 (20-191)||(40617093-40617264)
chr8 (74-196)||(4622083-4622205)
chr8 (319-424)||(16096540-16096645)
chr8 (18-132)||(28085288-28085402)
chr8 (16-100)||(25583023-25583107)
chr8 (275-392)||(3850139-3850252)
chr8 (16-76)||(16096457-16096517)
chr8 (280-392)||(13141158-13141266)
chr8 (280-392)||(30105852-30105960)
chr8 (275-392)||(4622591-4622704)
chr8 (275-392)||(28085748-28085861)
chr8 (275-392)||(43695015-43695128)
chr8 (280-392)||(3704983-3705091)
chr8 (285-392)||(23347021-23347124)
chr8 (286-392)||(15883280-15883382)
chr8 (280-390)||(18955358-18955464)
chr8 (275-392)||(2082122-2082235)
chr8 (275-392)||(17948341-17948454)
chr8 (275-407)||(30556537-30556664)
chr8 (285-392)||(276844-276947)
chr8 (285-392)||(638902-639005)
chr8 (285-392)||(824708-824811)
chr8 (280-407)||(5586957-5587080)
chr8 (274-392)||(44256205-44256319)
chr8 (275-392)||(16096021-16096134)
chr8 (275-392)||(25583449-25583562)
chr8 (275-392)||(39858122-39858235)
chr8 (275-392)||(41545084-41545197)
chr8 (275-392)||(42735706-42735819)
chr8 (275-392)||(6093436-6093549)
chr8 (82-130)||(26950203-26950251)
chr8 (280-352)||(40304228-40304300)
chr8 (121-196)||(5587319-5587394)
chr8 (212-262)||(4622425-4622475)
chr8 (212-262)||(18955585-18955635)
chr8 (212-262)||(25583283-25583333)
chr8 (20-61)||(4622204-4622245)
chr8 (285-344)||(38576905-38576964)
chr8 (212-262)||(277073-277123)
chr8 (212-262)||(638726-638776)
chr8 (212-262)||(824532-824582)
chr8 (212-262)||(2081956-2082006)
chr8 (212-262)||(3850368-3850418)
chr8 (212-262)||(13140997-13141047)
chr8 (212-262)||(39858317-39858367)
chr8 (212-262)||(40304057-40304107)
chr8 (212-262)||(41545313-41545363)
chr8 (212-262)||(44256434-44256484)
chr8 (370-407)||(17981301-17981338)
chr8 (321-407)||(18089325-18089407)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (16-425)||(52447916-52448325)
chr4 (16-425)||(16665187-16665596)
chr4 (16-425)||(20342451-20342860)
chr4 (16-425)||(23418414-23418823)
chr4 (16-425)||(20353176-20353585)
chr4 (16-425)||(54919926-54920335)
chr4 (16-424)||(17361629-17362037)
chr4 (20-425)||(4653503-4653908)
chr4 (20-405)||(41040676-41041061)
chr4 (16-425)||(3034927-3035334)
chr4 (16-425)||(7487796-7488202)
chr4 (16-425)||(20786203-20786614)
chr4 (16-424)||(46718236-46718653)
chr4 (8-425)||(13533670-13534096)
chr4 (16-424)||(23932658-23933076)
chr4 (16-425)||(35825062-35825481)
chr4 (16-425)||(49874264-49874681)
chr4 (21-428)||(31291793-31292208)
chr4 (16-294)||(30826745-30827023)
chr4 (85-425)||(27958593-27958939)
chr4 (18-420)||(50495374-50495778)
chr4 (16-422)||(34073548-34073947)
chr4 (26-425)||(35045518-35045906)
chr4 (293-424)||(9368002-9368133)
chr4 (294-425)||(30824791-30824922)
chr4 (319-425)||(55450501-55450607)
chr4 (275-392)||(13534426-13534539)
chr4 (275-392)||(17361213-17361326)
chr4 (275-392)||(16664732-16664845)
chr4 (16-83)||(27961896-27961963)
chr4 (280-392)||(49873807-49873915)
chr4 (275-392)||(3035676-3035789)
chr4 (275-392)||(4653044-4653157)
chr4 (275-392)||(35824609-35824722)
chr4 (275-403)||(20353937-20354061)
chr4 (285-405)||(31309702-31309818)
chr4 (275-407)||(34073090-34073217)
chr4 (275-352)||(7487392-7487469)
chr4 (275-392)||(8939488-8939601)
chr4 (275-392)||(20786897-20787010)
chr4 (275-392)||(23419167-23419280)
chr4 (275-392)||(46717781-46717894)
chr4 (275-392)||(52447461-52447574)
chr4 (275-392)||(54919470-54919583)
chr4 (285-392)||(23933427-23933530)
chr4 (285-392)||(49970096-49970199)
chr4 (275-392)||(30827365-30827478)
chr4 (287-392)||(31292476-31292577)
chr4 (212-262)||(20343039-20343089)
chr4 (212-262)||(20353763-20353813)
chr4 (212-262)||(3035510-3035560)
chr4 (212-262)||(16664961-16665011)
chr4 (212-262)||(17361442-17361492)
chr4 (212-262)||(27962140-27962190)
chr4 (212-262)||(34073330-34073380)
chr4 (275-337)||(35045122-35045184)
chr4 (212-262)||(49874037-49874087)
chr4 (212-262)||(49969920-49969970)
chr4 (212-262)||(52447690-52447740)
chr4 (212-262)||(54919699-54919749)
chr4 (370-407)||(14269975-14270012)
chr4 (121-162)||(43939115-43939156)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (16-425)||(7153441-7153850)
chr1 (16-425)||(10773252-10773661)
chr1 (16-425)||(33705121-33705530)
chr1 (20-425)||(44511508-44511908)
chr1 (16-424)||(36308359-36308771)
chr1 (16-424)||(14487902-14488310)
chr1 (16-425)||(36731183-36731600)
chr1 (82-424)||(14536491-14536833)
chr1 (16-425)||(35954936-35955352)
chr1 (16-428)||(51087237-51087658)
chr1 (16-425)||(29521076-29521494)
chr1 (16-422)||(25656359-25656772)
chr1 (16-422)||(30302093-30302507)
chr1 (16-307)||(48128297-48128587)
chr1 (19-422)||(12768687-12769096)
chr1 (18-422)||(33005526-33005942)
chr1 (16-428)||(46118757-46119176)
chr1 (16-233)||(24781582-24781798)
chr1 (16-422)||(52405120-52405517)
chr1 (16-422)||(52406553-52406950)
chr1 (16-262)||(29648917-29649172)
chr1 (16-332)||(5327229-5327554)
chr1 (26-162)||(7556718-7556854)
chr1 (280-422)||(29648645-29648787)
chr1 (267-422)||(46463900-46464059)
chr1 (321-425)||(7556852-7556956)
chr1 (248-422)||(9135142-9135313)
chr1 (275-403)||(44512254-44512378)
chr1 (275-392)||(29521759-29521872)
chr1 (351-425)||(48128586-48128660)
chr1 (275-407)||(12768284-12768415)
chr1 (275-392)||(24781126-24781239)
chr1 (275-392)||(33704662-33704775)
chr1 (275-392)||(36307904-36308017)
chr1 (275-392)||(36730728-36730841)
chr1 (280-392)||(14488661-14488769)
chr1 (275-407)||(29649526-29649654)
chr1 (275-392)||(10772795-10772908)
chr1 (275-392)||(35954479-35954592)
chr1 (275-392)||(48127836-48127949)
chr1 (280-392)||(31030152-31030260)
chr1 (285-392)||(7152986-7153089)
chr1 (275-392)||(33006294-33006407)
chr1 (275-407)||(25655897-25656025)
chr1 (298-390)||(51086838-51086926)
chr1 (294-392)||(7556324-7556416)
chr1 (275-407)||(46118284-46118412)
chr1 (321-392)||(30838589-30838656)
chr1 (280-407)||(5326765-5326889)
chr1 (372-422)||(5327984-5328034)
chr1 (212-262)||(7153215-7153265)
chr1 (155-196)||(24781394-24781435)
[»] chr3 (107 HSPs)
chr3 (16-425)||(27126722-27127131)
chr3 (16-428)||(27331014-27331426)
chr3 (16-424)||(30042586-30042994)
chr3 (16-424)||(41697191-41697599)
chr3 (16-425)||(18410761-18411169)
chr3 (16-425)||(37219296-37219705)
chr3 (16-428)||(50547574-50547986)
chr3 (16-423)||(23020331-23020738)
chr3 (16-425)||(40906682-40907092)
chr3 (16-425)||(45052813-45053222)
chr3 (16-424)||(44842293-44842699)
chr3 (16-425)||(50609984-50610392)
chr3 (16-425)||(11122146-11122555)
chr3 (20-425)||(16009337-16009742)
chr3 (16-425)||(8850878-8851290)
chr3 (24-425)||(16464471-16464872)
chr3 (16-424)||(45170540-45170943)
chr3 (16-425)||(41102217-41102624)
chr3 (20-425)||(2218539-2218940)
chr3 (16-357)||(27324848-27325189)
chr3 (16-425)||(38697388-38697806)
chr3 (16-424)||(22605415-22605812)
chr3 (26-424)||(43338903-43339309)
chr3 (26-421)||(38236064-38236468)
chr3 (16-428)||(42826526-42826944)
chr3 (16-425)||(37785978-37786365)
chr3 (16-292)||(4232305-4232581)
chr3 (16-364)||(47912115-47912445)
chr3 (26-425)||(31312725-31313115)
chr3 (67-422)||(37181091-37181456)
chr3 (18-357)||(55411750-55412098)
chr3 (19-425)||(51721902-51722300)
chr3 (78-422)||(30362700-30363055)
chr3 (16-428)||(22428016-22428438)
chr3 (16-229)||(30439581-30439794)
chr3 (18-422)||(53777465-53777863)
chr3 (16-303)||(3891891-3892187)
chr3 (19-425)||(10826828-10827225)
chr3 (91-425)||(18762542-18762886)
chr3 (238-425)||(52746411-52746598)
chr3 (16-206)||(40424237-40424427)
chr3 (252-424)||(30439417-30439589)
chr3 (280-425)||(4232019-4232164)
chr3 (16-114)||(6175057-6175155)
chr3 (16-134)||(30363067-30363185)
chr3 (16-100)||(13214006-13214090)
chr3 (280-392)||(27321097-27321205)
chr3 (275-392)||(15084408-15084521)
chr3 (275-392)||(16008877-16008990)
chr3 (275-392)||(37219942-37220055)
chr3 (275-392)||(41101760-41101873)
chr3 (275-392)||(43338438-43338551)
chr3 (317-420)||(3891744-3891847)
chr3 (275-403)||(37785515-37785639)
chr3 (275-392)||(4232924-4233037)
chr3 (275-392)||(27126299-27126412)
chr3 (287-392)||(30043344-30043445)
chr3 (275-392)||(45170084-45170197)
chr3 (275-392)||(47912787-47912900)
chr3 (275-392)||(50548328-50548441)
chr3 (275-392)||(53778216-53778329)
chr3 (275-391)||(18410306-18410418)
chr3 (275-391)||(30440136-30440248)
chr3 (280-392)||(44843047-44843155)
chr3 (280-407)||(22428789-22428912)
chr3 (280-407)||(22732472-22732595)
chr3 (275-403)||(22604944-22605070)
chr3 (275-392)||(16464008-16464121)
chr3 (285-402)||(38235587-38235700)
chr3 (275-392)||(40423783-40423896)
chr3 (275-392)||(41697941-41698054)
chr3 (275-392)||(51722645-51722758)
chr3 (280-407)||(37181820-37181943)
chr3 (285-407)||(30363535-30363653)
chr3 (275-352)||(38696970-38697047)
chr3 (285-407)||(42826071-42826189)
chr3 (285-392)||(8851638-8851741)
chr3 (275-390)||(45053564-45053675)
chr3 (275-392)||(11121690-11121803)
chr3 (275-388)||(23019881-23019990)
chr3 (121-196)||(22732158-22732233)
chr3 (275-357)||(6175494-6175576)
chr3 (212-262)||(13213780-13213830)
chr3 (212-262)||(27321326-27321376)
chr3 (212-262)||(51722479-51722529)
chr3 (280-392)||(55411286-55411390)
chr3 (280-407)||(3892534-3892661)
chr3 (147-196)||(27126561-27126610)
chr3 (275-392)||(27325504-27325617)
chr3 (275-392)||(27331741-27331854)
chr3 (369-425)||(55412141-55412197)
chr3 (288-350)||(40495876-40495939)
chr3 (298-357)||(40906283-40906342)
chr3 (212-262)||(2218309-2218359)
chr3 (212-262)||(3892363-3892413)
chr3 (212-262)||(8851466-8851516)
chr3 (212-262)||(22605186-22605236)
chr3 (212-262)||(27126522-27126572)
chr3 (212-262)||(37181649-37181699)
chr3 (212-262)||(38697163-38697213)
chr3 (212-262)||(40424010-40424060)
chr3 (212-262)||(40906457-40906507)
chr3 (212-262)||(41697775-41697825)
chr3 (212-262)||(45170313-45170363)
chr3 (212-281)||(4232758-4232827)
chr3 (121-162)||(42164871-42164912)
chr3 (121-162)||(50937271-50937312)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (16-425)||(20120548-20120957)
chr7 (20-425)||(41336831-41337236)
chr7 (16-425)||(724583-724992)
chr7 (16-425)||(41857703-41858112)
chr7 (16-425)||(48951332-48951741)
chr7 (16-428)||(44458350-44458762)
chr7 (16-424)||(40014738-40015146)
chr7 (16-425)||(46554546-46554956)
chr7 (16-425)||(48683785-48684194)
chr7 (16-425)||(28588664-28589073)
chr7 (20-425)||(33245689-33246094)
chr7 (16-424)||(44883267-44883675)
chr7 (16-425)||(3415205-3415612)
chr7 (24-425)||(21815933-21816334)
chr7 (16-425)||(47908057-47908465)
chr7 (16-425)||(48606672-48607090)
chr7 (16-418)||(5373599-5374010)
chr7 (8-425)||(9662646-9663072)
chr7 (16-307)||(18994134-18994425)
chr7 (19-422)||(17967364-17967777)
chr7 (16-422)||(47504144-47504560)
chr7 (16-358)||(30759203-30759554)
chr7 (16-262)||(16276783-16277029)
chr7 (16-422)||(23593618-23594031)
chr7 (16-428)||(46935333-46935736)
chr7 (16-230)||(4925468-4925682)
chr7 (16-422)||(8392521-8392940)
chr7 (103-422)||(44521148-44521462)
chr7 (18-206)||(21730229-21730417)
chr7 (279-425)||(16274322-16274468)
chr7 (266-425)||(41289207-41289366)
chr7 (234-422)||(21736233-21736421)
chr7 (334-425)||(4658151-4658242)
chr7 (275-392)||(9663402-9663515)
chr7 (275-392)||(18994768-18994881)
chr7 (280-392)||(41336370-41336478)
chr7 (18-101)||(44522312-44522395)
chr7 (275-389)||(40015488-40015598)
chr7 (275-392)||(16277371-16277484)
chr7 (275-392)||(20120094-20120207)
chr7 (275-392)||(33246440-33246553)
chr7 (295-392)||(41289425-41289518)
chr7 (275-392)||(41858350-41858463)
chr7 (275-392)||(44459104-44459217)
chr7 (275-392)||(48607432-48607545)
chr7 (280-392)||(46000779-46000887)
chr7 (275-403)||(48683318-48683442)
chr7 (275-392)||(28589398-28589511)
chr7 (275-392)||(47909188-47909301)
chr7 (275-392)||(48951979-48952092)
chr7 (275-407)||(17968119-17968246)
chr7 (280-403)||(44882811-44882930)
chr7 (275-392)||(725334-725447)
chr7 (275-392)||(3415956-3416069)
chr7 (275-392)||(21815470-21815583)
chr7 (275-392)||(46555296-46555409)
chr7 (275-407)||(46936085-46936214)
chr7 (280-392)||(4925009-4925117)
chr7 (359-428)||(30758307-30758376)
chr7 (275-407)||(30759894-30760025)
chr7 (303-407)||(47503675-47503775)
chr7 (103-148)||(41289365-41289410)
chr7 (275-407)||(23594370-23594499)
chr7 (212-262)||(8393110-8393160)
chr7 (369-407)||(10934607-10934645)
chr7 (212-262)||(44458938-44458988)
chr7 (212-262)||(44883041-44883091)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (16-425)||(15420862-15421271)
chr5 (23-425)||(27019218-27019620)
chr5 (16-425)||(9592319-9592728)
chr5 (16-425)||(12499919-12500328)
chr5 (19-425)||(42611350-42611756)
chr5 (16-425)||(744690-745099)
chr5 (16-425)||(823928-824340)
chr5 (16-425)||(30130042-30130450)
chr5 (25-425)||(37939586-37939987)
chr5 (16-425)||(19665472-19665881)
chr5 (16-425)||(39588970-39589360)
chr5 (8-428)||(13304540-13304969)
chr5 (18-424)||(11985161-11985575)
chr5 (16-428)||(37270927-37271348)
chr5 (19-425)||(20545295-20545682)
chr5 (16-422)||(27551295-27551708)
chr5 (16-422)||(31551246-31551660)
chr5 (16-422)||(9986437-9986853)
chr5 (314-421)||(7180760-7180867)
chr5 (275-407)||(7180928-7181056)
chr5 (285-403)||(27019979-27020093)
chr5 (275-392)||(37270492-37270605)
chr5 (285-392)||(745454-745557)
chr5 (280-407)||(27550828-27550951)
chr5 (275-392)||(9591864-9591977)
chr5 (275-392)||(19665017-19665130)
chr5 (275-392)||(20546026-20546139)
chr5 (275-392)||(30130792-30130905)
chr5 (275-392)||(42612091-42612204)
chr5 (298-407)||(11076967-11077072)
chr5 (275-392)||(12499464-12499577)
chr5 (369-428)||(19503901-19503960)
chr5 (285-357)||(15420473-15420545)
chr5 (285-392)||(39588513-39588617)
chr5 (298-392)||(824707-824797)
chr5 (275-392)||(13305300-13305413)
chr5 (285-403)||(11984694-11984808)
chr5 (212-262)||(745278-745328)
chr5 (212-262)||(824518-824568)
chr5 (212-262)||(12499693-12499743)
chr5 (212-262)||(15420676-15420726)
chr5 (212-262)||(27019803-27019853)
chr5 (212-262)||(30130626-30130676)
chr5 (212-262)||(37270721-37270771)
chr5 (212-262)||(39588743-39588793)
chr5 (208-262)||(42611931-42611985)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (16-425)||(38281362-38281771)
chr2 (20-425)||(3906005-3906410)
chr2 (16-424)||(37724607-37725015)
chr2 (16-425)||(39966260-39966669)
chr2 (16-425)||(76733-77140)
chr2 (26-424)||(15399520-15399927)
chr2 (16-425)||(2291394-2291812)
chr2 (16-425)||(15153085-15153503)
chr2 (16-420)||(1054242-1054655)
chr2 (16-423)||(39068101-39068521)
chr2 (16-351)||(4737406-4737750)
chr2 (18-422)||(3754038-3754448)
chr2 (19-422)||(3850898-3851307)
chr2 (16-347)||(6645185-6645520)
chr2 (16-422)||(27550712-27551110)
chr2 (18-384)||(42080005-42080378)
chr2 (208-425)||(28391048-28391265)
chr2 (18-422)||(39774285-39774677)
chr2 (582-679)||(14194463-14194560)
chr2 (275-392)||(2292153-2292266)
chr2 (275-392)||(3906744-3906857)
chr2 (339-422)||(6645930-6646013)
chr2 (280-403)||(14005921-14006040)
chr2 (615-679)||(6339603-6339667)
chr2 (285-392)||(15399051-15399154)
chr2 (275-392)||(4738091-4738204)
chr2 (275-392)||(37725354-37725467)
chr2 (280-392)||(15152641-15152749)
chr2 (280-392)||(25223542-25223650)
chr2 (280-383)||(77460-77559)
chr2 (280-383)||(6644737-6644836)
chr2 (285-392)||(28391664-28391767)
chr2 (275-357)||(38282113-38282195)
chr2 (280-386)||(42080656-42080758)
chr2 (275-407)||(27551449-27551577)
chr2 (275-357)||(3754735-3754817)
chr2 (275-357)||(3851578-3851660)
chr2 (328-407)||(33853095-33853170)
chr2 (280-342)||(39967016-39967078)
chr2 (280-358)||(40494658-40494736)
chr2 (212-281)||(25223752-25223821)
chr2 (212-281)||(39966845-39966914)
chr2 (275-357)||(39774955-39775035)
chr2 (212-262)||(6644958-6645008)
chr2 (212-262)||(28391488-28391538)
chr2 (155-192)||(28391458-28391495)
chr2 (285-350)||(38552036-38552101)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (16-424)||(23573579-23573987)
chr6 (16-425)||(27782985-27783390)
chr6 (19-425)||(11836742-11837149)
chr6 (47-425)||(27440445-27440827)
chr6 (16-425)||(14104509-14104905)
chr6 (16-425)||(954728-955146)
chr6 (16-425)||(4588991-4589382)
chr6 (16-405)||(11153794-11154192)
chr6 (26-333)||(25118784-25119100)
chr6 (174-425)||(16918835-16919086)
chr6 (8-425)||(28579112-28579517)
chr6 (18-422)||(21860488-21860898)
chr6 (137-428)||(15288203-15288503)
chr6 (216-422)||(1090484-1090690)
chr6 (16-392)||(24083638-24084003)
chr6 (280-425)||(5687408-5687557)
chr6 (325-425)||(25119520-25119620)
chr6 (280-407)||(24083168-24083291)
chr6 (280-392)||(955493-955601)
chr6 (275-392)||(27782528-27782641)
chr6 (280-392)||(11154527-11154635)
chr6 (280-392)||(14104051-14104159)
chr6 (275-392)||(4589724-4589837)
chr6 (275-392)||(16918456-16918569)
chr6 (275-392)||(17550730-17550843)
chr6 (275-386)||(21861168-21861275)
chr6 (298-392)||(25109601-25109691)
chr6 (275-392)||(11837490-11837603)
chr6 (275-392)||(28578668-28578781)
chr6 (16-116)||(15288506-15288606)
chr6 (275-392)||(27438458-27438571)
chr6 (212-262)||(27782757-27782807)
chr6 (298-351)||(23580374-23580427)
chr6 (212-262)||(11154368-11154418)
chr6 (212-262)||(23580566-23580616)
chr6 (212-262)||(27438686-27438736)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (47-425)||(46534-46916)
scaffold0003 (275-392)||(48791-48904)
[»] scaffold0208 (3 HSPs)
scaffold0208 (44-422)||(4916-5303)
scaffold0208 (275-407)||(5622-5750)
scaffold0208 (212-262)||(5456-5506)
[»] scaffold0115 (4 HSPs)
scaffold0115 (137-425)||(22626-22914)
scaffold0115 (16-101)||(21422-21507)
scaffold0115 (275-392)||(20965-21077)
scaffold0115 (212-262)||(21193-21243)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (19-422)||(56765-57179)
scaffold0060 (275-386)||(56387-56494)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (20-422)||(18402-18804)
[»] scaffold0259 (3 HSPs)
scaffold0259 (88-422)||(5073-5406)
scaffold0259 (16-99)||(5497-5580)
scaffold0259 (285-407)||(5929-6047)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 638548 - 638139
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  638548 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 638449  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  638448 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 638349  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  638348 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 638249  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  638248 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 638149  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  638148 tacattatgg 638139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38060745 - 38060336
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38060745 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaaaacctgctagcagccctcaaagtacaatagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 38060646  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38060645 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 38060546  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38060545 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 38060446  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38060445 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttgtaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 38060346  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  38060345 tacattatgg 38060336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 277301 - 277713
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  277301 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 277400  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  277401 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatgcctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 277500  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  277501 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 277600  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaat---ataattaaggcaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||    
T  277601 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataataattaaggcaa 277700  T
Q  413 tattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||    
T  277701 tattacattatgg 277713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 824354 - 823942
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  824354 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 824255  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824254 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatgcctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 824155  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  824154 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 824055  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaat---ataattaaggcaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||    
T  824054 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataataattaaggcaa 823955  T
Q  413 tattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||    
T  823954 tattacattatgg 823942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15882938 - 15882529
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15882938 atgcttgcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaattacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 15882839  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15882838 accaagaaaaataaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttaaaatcatgacgattc 15882739  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15882738 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatttaactgataaatttaaggacat 15882639  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  15882638 tcagatgaatgaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatat 15882539  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  15882538 tacattatgg 15882529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 27912961 - 27913370
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27912961 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactatctcaca 27913060  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27913061 accaataaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtaccggaaataacgacaattctaacgatatttgaaatcatgacgattt 27913160  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27913161 tcacgaaaattgaaaaatgcgatagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggggggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 27913260  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27913261 tcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 27913360  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  27913361 tacattatgg 27913370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 27959380 - 27959789
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27959380 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactatctcaca 27959479  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27959480 accaataaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtaccggaaataacgacaattctaacgatatttgaaatcatgacgattt 27959579  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27959580 tcacgaaaattgaaaaatgcgatagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggggggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 27959679  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27959680 tcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 27959779  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  27959780 tacattatgg 27959789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 44256657 - 44257068
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  44256657 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatatcctcaattgttataattaactacctcaca 44256756  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaa--ataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44256757 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatctaacgttgtactggattcataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgat 44256856  T
Q  214 tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaac 313  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  44256857 tcttacgaaaattgaaaaatgcagcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgagtataactgataaatttaaggac 44256956  T
Q  314 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44256957 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaat 44257056  T
Q  414 attacattatgg 425  Q
    ||||||||||||    
T  44257057 attacattatgg 44257068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 18956018 - 18956427
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18956018 atgctagcaaacccccacaacatcacaacggcaacacctactagcagcgctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 18956117  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaa-taacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgatt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18956118 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaaacaagtcatcatacttgacgttgtactggaaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgatt 18956217  T
Q  215 ctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaaca 314  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18956218 c-cacgaaaattgaaaaatgcagcagttgggaacaacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggaca 18956316  T
Q  315 ttcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  18956317 ttcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtcgtgtaaattaattaagattgaacaccaaaatataattaacgcaata 18956416  T
Q  415 ttacattatgg 425  Q
    |||||||||||    
T  18956417 ttacattatgg 18956427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23346667 - 23346259
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23346667 atgctaggagactcccacaacatcagagcggcaaaacctgctagcagccctcaaagtacaactgatgatttactcaattgttataattaactaactcaca 23346568  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23346567 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatccgacgttgtactggaaataatgacaattctcatgatatttaaaatcatgacgattc 23346468  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23346467 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 23346368  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||     
T  23346367 tcaggtgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacagtaa 23346268  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  23346267 tacattatg 23346259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40303866 - 40303456
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  40303866 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacatcacaaccaagaaat 40303767  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||          |||||||||    
T  40303766 atcaaatcaaaaagaaaaatcatgtcatcatac-taacgtggtactggaaataacgacaattttcacgatatttgaaatcaaacgaacgacgacgattct 40303668  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40303667 cacgaaaattgaaaaatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaaaaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 40303568  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  40303567 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaaattaattaagactgaacacctaaatataattaaggcaagatt 40303468  T
Q  417 acattatggatc 428  Q
    ||||||||||||    
T  40303467 acattatggatc 40303456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Original strand, 39858556 - 39858964
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  39858556 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacatcacaaccaagaaat 39858655  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||          |||||||||    
T  39858656 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacaacaattttcacgatatttggaatcaaacgaacgacgacgattct 39858755  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39858756 cacgaaaattgaataatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 39858855  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  39858856 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatttagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagatt 39858955  T
Q  417 acattatgg 425  Q
    |||||||||    
T  39858956 acattatgg 39858964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 36191987 - 36192405
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36191987 atgctagcaaactcccacaacatcgcaggggctacacctgctagcaaccctcaaagtacaacggataacttacttaattgttataattaactacctcaca 36192086  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  36192087 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtgatactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacga 36192186  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36192187 cgacgattctcacaaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataaccgataaatt 36192286  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36192287 taaggatattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacttaaatataatta 36192386  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36192387 aggcaatattacattatgg 36192405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 43694673 - 43694257
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  43694673 atgctagcagactcccacaaaatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacacatgacttactcaattgctataattaactacctcaca 43694574  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  43694573 accaagaaaaattaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatatctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 43694474  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43694473 cggcgattctcacgaaaaataaaaaatgcggcagttgggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 43694374  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43694373 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 43694274  T
Q  407 aggcaatattacattat 423  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43694273 aggcaagattacattat 43694257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30556194 - 30555780
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  30556194 tagcagactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcacaaaaa 30556095  T
Q  120 agaaaat---tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat--------- 207  Q
    | ||||    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||              
T  30556094 aaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgac 30555995  T
Q  208 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30555994 gacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaattt 30555895  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30555894 aaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacaactaaatataattaa 30555795  T
Q  408 ggcaatattacatta 422  Q
    | ||| |||||||||    
T  30555794 gtcaagattacatta 30555780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13140821 - 13140404
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13140821 atgctagcagacttccacaaaatcaaagcggcaacacctgcaagcagcccttaaagtacaacacatgacttactcaattattataattaactacctcaca 13140722  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  13140721 accaagaaatatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 13140622  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13140621 cgacgattctcacgacaattaaaaaatgcggcagttggaaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataaattttatgaatataactgataaatt 13140522  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13140521 taaggacatccagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaagttaattaagattgaacacctaaatataatta 13140422  T
Q  407 aggcaatattacattatg 424  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13140421 aggcaagattacattatg 13140404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Original strand, 30111292 - 30111708
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30111292 gctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacggatgacttacttaattgttataattaactacttcacaac 30111391  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atg 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||         |||    
T  30111392 caagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcataatacctgacgtggttctgaaaataacgacaattctcacgatatttaaaatcaaacgaacgatg 30111491  T
Q  209 acga---ttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||     
T  30111492 acgatatttctcacaaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacaacaaaattgaacaatcgaaatgggaataagaaattttatgaatataaatgataaac 30111591  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  30111592 ttaaggacattcagatcaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagttagtcatgtagtctaaattaattaagattgaacacctaaatataatc 30111691  T
Q  406 aaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30111692 aaggcaagattacatta 30111708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 42645880 - 42646298
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42645880 atgctaacaaactcccacaacgtcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacaaatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 42645979  T
Q  116 acc--aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc-------- 205  Q
    |||  || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||            
T  42645980 accaaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaac 42646079  T
Q  206 -atgacgattctcacgaaaatt-gaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataa 303  Q
     | ||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  42646080 gacgacgattatcacgaaaattaaaaaaatatggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataa 42646179  T
Q  304 atttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  42646180 atttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataa 42646279  T
Q  404 ttaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||| ||| ||| |||||    
T  42646280 ttaagtcaagattgcatta 42646298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 45408725 - 45408323
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45408725 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacatctgctagcagtgctcaaagtacaacacatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 45408626  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| ||||||||||             ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  45408625 accaagaaaaatcaaatcaaa-------------tcaccatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacga 45408539  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  45408538 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagtttgaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatt 45408439  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45408438 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctatgccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 45408339  T
Q  407 aggcaatattacatta 422  Q
    || ||| |||||||||    
T  45408338 agtcaagattacatta 45408323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 173 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26950193 - 26949942
Alignment:
Q  173 gaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgg 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  26950193 gaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgg 26950094  T
Q  273 gaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgt 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  26950093 gaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgt 26949994  T
Q  373 aaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26949993 aaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatattacattatg 26949942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 137 - 424
Target Start/End: Original strand, 41545526 - 41545812
Alignment:
Q  137 aagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41545526 aagaaaaatcaagtcatcatacctgacgtggtactggaaataacgataattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcg 41545625  T
Q  237 gcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatg 336  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41545626 gcagctggaaacgacaaaattgcacaatcaaaatgggaggaagaatt-ttatgaatataactgattaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatg 41545724  T
Q  337 tgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41545725 tgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatattacattatg 41545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 42736160 - 42736560
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  42736160 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacatatgacttactcaattgttataatttactacttcaca 42736259  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------ga 209  Q
    ||||||||||                  ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||       ||    
T  42736260 accaagaaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtgatactggaaataacgacaattctcatgatatttggaatcaaacgaacga 42736341  T
Q  210 c---gattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42736342 caaggattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttggtaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 42736441  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42736442 taaagacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcaattatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 42736541  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  42736542 aggcaaaattacattatgg 42736560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 423
Target Start/End: Original strand, 3850608 - 3851000
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3850608 actcccacaacattacagtggtaacacctgctaacagcc-tcaaagtacaacatatgacttactcaattgttataattaactacatcacaaccaagaaaa 3850706  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatg---------acgattct 216  Q
     |||||||||             |||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||           ||||||||    
T  3850707 atcaaatcaa-------------gtcaccataccttaagtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgacaacgattct 3850793  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3850794 cacgaaaattgaaaaaagcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacttt 3850893  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  3850894 cagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaaatgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattaaacacctaaatataattaaggcaagatt 3850993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 147 - 425
Target Start/End: Original strand, 6095493 - 6095779
Alignment:
Q  147 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca---------tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcgg 237  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6095493 aagtcatcatacttgacgtggtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacgatgacgattctcacgaaaat-gaaaaatgcgg 6095591  T
Q  238 cagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  6095592 cagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattgtatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatct 6095691  T
Q  338 gaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
     |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095692 aaaattttaattgttttaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 6095779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2081780 - 2081610
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2081780 atgctagcaaactcccacaacatcagagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacgaatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 2081681  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaat 186  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2081680 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgacaat 2081610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18089024 - 18088629
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  18089024 gctaacaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctatcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataaataactgcctcataac 18088925  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------g 208  Q
    ||||||||                  ||||||||| |||| ||||||| ||  |  |||||||  ||||||||| |||||||| |||||          |    
T  18088924 caagaaaa------------------atcaagtcaccatatctgacgtggttatgaaaataactgcaattctcatgatatttggaatcaaattaacgacg 18088843  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| |  || |||| |||||||| ||| |||||||  ||    
T  18088842 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaaaaatcaaaatggaaataagaaattttatgaatgtaaatgataaaccta 18088743  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18088742 aggatattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaag 18088643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 151
Target Start/End: Original strand, 6093895 - 6094030
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6093895 atgctagcaaactcacacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 6093994  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6093995 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtc 6094030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 212 - 422
Target Start/End: Original strand, 40617258 - 40617469
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaa-tgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaag 310  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||   |||| || | ||| | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  40617258 attctcatgaaaattgaaaaaatgcggcaatttggaacgataaaattgaacaatcaaaacggaaagaagacattttatgaatgtaactgataaatttaag 40617357  T
Q  311 aacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggc 410  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |    
T  40617358 gacattcagatgaaagaaatttgatttgaaattttaattgttctaagcgagtcttgtaatgtaaattaattaaggttgaacacctaaatataattaagac 40617457  T
Q  411 aatattacatta 422  Q
    || |||||||||    
T  40617458 aaaattacatta 40617469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Original strand, 40617093 - 40617264
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40617093 tagcaaactcccacaacatcactgcggcaacacttgctagcagttcttaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 40617192  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctca 191  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||    
T  40617193 agaaaaaacaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacgtgacgtggttctgaaaataacggcaattctca 40617264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4622205 - 4622083
Alignment:
Q  74 caacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactag 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  4622205 caacagatgatttactcaattgttataattaattacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatctgacgttgtactga 4622106  T
Q  174 aaataacgacaattctcacgata 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  4622105 aaataacgtcaattctcacgata 4622083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 319 - 424
Target Start/End: Original strand, 16096540 - 16096645
Alignment:
Q  319 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattac 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  16096540 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatattattaaggcaatattac 16096639  T
Q  419 attatg 424  Q
    ||||||    
T  16096640 attatg 16096645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28085402 - 28085288
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  28085402 gctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcacaat 28085303  T
Q  118 caagaaaattcaaat 132  Q
    |||||||| ||||||    
T  28085302 caagaaaaatcaaat 28085288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25583107 - 25583023
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25583107 atgctagcaaactcccacaacatcacagaggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttata 25583023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3850252 - 3850139
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  3850252 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 3850157  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3850156 attaattaagattgaaca 3850139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 16096457 - 16096517
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaa 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16096457 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaa 16096517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 13141158 - 13141266
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  13141158 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaagtacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattaa 13141253  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  13141254 ttaagattgaaca 13141266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30105960 - 30105852
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  30105960 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcatgtagtgtaaattaa 30105865  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  30105864 ttaagattgaaca 30105852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 4622591 - 4622704
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |     |||| ||| ||||||    
T  4622591 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttat----cagtcttgtagtgtaa 4622686  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4622687 attaattaagattgaaca 4622704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 28085748 - 28085861
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||||| | ||||||    
T  28085748 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcatatagtgtaa 28085843  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28085844 attaattaagattgaaca 28085861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 43695015 - 43695128
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  43695015 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 43695110  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43695111 attaattaagattgaaca 43695128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 3704983 - 3705091
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  3704983 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 3705078  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  3705079 ttaagattgaaca 3705091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 23347021 - 23347124
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23347021 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaag 23347116  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  23347117 attgaaca 23347124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 392
Target Start/End: Original strand, 15883280 - 15883382
Alignment:
Q  286 tatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaaga 385  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15883280 tatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaaga 15883375  T
Q  386 ttgaaca 392  Q
    |||||||    
T  15883376 ttgaaca 15883382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 280 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18955464 - 18955358
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  18955464 aaattttatgaatgtaaatgatgaattcaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 18955369  T
Q  380 ttaagattgaa 390  Q
    |||||||||||    
T  18955368 ttaagattgaa 18955358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 2082122 - 2082235
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  ||| ||||||    
T  2082122 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agttttgtagtgtaa 2082217  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2082218 attaattaagattgaaca 2082235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 17948341 - 17948454
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  17948341 ggaagaaattttatgaatgtaaatgacgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 17948436  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17948437 attaattaagattgaaca 17948454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 30556537 - 30556664
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  30556537 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 30556631  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  30556632 attaattaagattgaacttcttaatataattaa 30556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 276947 - 276844
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||||||||||||    
T  276947 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaaattaattaag 276852  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  276851 attgaaca 276844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 638902 - 639005
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||||||||||||    
T  638902 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaaattaattaag 638997  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  638998 attgaaca 639005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 824708 - 824811
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||||||||||||    
T  824708 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaaattaattaag 824803  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  824804 attgaaca 824811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5587080 - 5586957
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    | | | |||||||||||    
T  5587080 aaattttatgaatgtaaccgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaaattgatgtgaaattttaattgttataagc----cctatagtgtaaattaa 5586985  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  5586984 ttaagattgaacacctaaatataattaa 5586957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44256319 - 44256205
Alignment:
Q  274 aggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgta 373  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||    
T  44256319 aggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgta 44256224  T
Q  374 aattaattaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44256223 aattaattaagattgaaca 44256205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16096134 - 16096021
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| ||| ||||||    
T  16096134 ggaagaaattttataaatgtaaatgatgaatttaagcacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtcttgtagtgtaa 16096039  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16096038 attaattaagattgaaca 16096021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 25583449 - 25583562
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  25583449 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaattttatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 25583544  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25583545 attaattaagattgaaca 25583562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39858235 - 39858122
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    |||  ||||||||||    
T  39858235 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgctata----agttttgtggtgtaa 39858140  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39858139 attagttaagattgaaca 39858122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41545197 - 41545084
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    | || | | ||||||    
T  41545197 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----aatcttatagtgtaa 41545102  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41545101 attaattaagattgaaca 41545084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42735819 - 42735706
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||    |||| |||||||||     
T  42735819 ggaagaaattttataaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatctgttata----agtcttgtggtgtag 42735724  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42735723 attaattaagattgaaca 42735706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6093549 - 6093436
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  6093549 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaataaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaa 6093454  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6093453 attaattaagattgaaca 6093436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26950251 - 26950203
Alignment:
Q  82 gatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaa 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26950251 gatttactcaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaa 26950203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 352
Target Start/End: Original strand, 40304228 - 40304300
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgtt 352  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40304228 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtt 40304300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5587394 - 5587319
Alignment:
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgata 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  5587394 gaaaaatcaaatcaagaagaaaaatcaagtcgcgatacctgacgtggttctgaaaagaacgacaattctcacgata 5587319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 4622425 - 4622475
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4622425 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 4622475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18955635 - 18955585
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18955635 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 18955585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 25583283 - 25583333
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25583283 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 25583333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4622245 - 4622204
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagca 61  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4622245 tagcaaacttccacaacatcacagcggcaacacctgctagca 4622204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 344
Target Start/End: Original strand, 38576905 - 38576964
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattt 344  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  38576905 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattt 38576964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 277123 - 277073
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  277123 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 277073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 638726 - 638776
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  638726 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 638776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 824532 - 824582
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  824532 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 824582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 2081956 - 2082006
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2081956 attctcacggtaattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 2082006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3850418 - 3850368
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3850418 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 3850368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 13140997 - 13141047
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13140997 attctcactataattgaaaactgcggcagattggaacgacaaaattgaaca 13141047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39858367 - 39858317
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39858367 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 39858317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 40304057 - 40304107
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40304057 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 40304107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41545363 - 41545313
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41545363 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 41545313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44256484 - 44256434
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44256484 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 44256434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 407
Target Start/End: Original strand, 17981301 - 17981338
Alignment:
Q  370 tgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17981301 tgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaa 17981338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 407
Target Start/End: Original strand, 18089325 - 18089407
Alignment:
Q  321 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||    
T  18089325 tgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattatgattgagcaccttaatataattaa 18089407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 52447916 - 52448325
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52447916 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 52448015  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52448016 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 52448115  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52448116 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 52448215  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52448216 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 52448315  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  52448316 tacattatgg 52448325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 16665187 - 16665596
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16665187 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 16665286  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16665287 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 16665386  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16665387 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 16665486  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16665487 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagcgtaaattaattaagattgaacgcctaaatataattaaggcaatat 16665586  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  16665587 tacattatgg 16665596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20342860 - 20342451
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20342860 atgctagcaaactcccacaacatcacatcttcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 20342761  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20342760 acaaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacccgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 20342661  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20342660 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaattaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 20342561  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20342560 tcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcgatat 20342461  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  20342460 tacattatgg 20342451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23418823 - 23418414
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23418823 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 23418724  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23418723 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctaacgttgtactgaaaataacagcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 23418624  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23418623 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 23418524  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  23418523 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcaagtcatgtactgtaaattaattaagattgaacacctagatataattaaggcaatat 23418424  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    | ||||||||    
T  23418423 tgcattatgg 23418414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20353585 - 20353176
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20353585 atgctagcaaactcccacaacatcacagcaacaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 20353486  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353485 acaaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacccgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 20353386  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20353385 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacgacaaaattgaacaattaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 20353286  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20353285 tcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcgatat 20353186  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  20353185 tacattatgg 20353176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 54919926 - 54920335
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  54919926 atgctagcaaacttccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacatcaca 54920025  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54920026 accaagagaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 54920125  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54920126 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 54920225  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  54920226 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagccggtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 54920325  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    || |||||||    
T  54920326 tatattatgg 54920335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 17361629 - 17362037
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17361629 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagaagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 17361728  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17361729 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacgacaattctaacgatatttaaaatcatgacgattc 17361828  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17361829 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggatgaataaattttatgaatataagtgataaatttaaggacat 17361928  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17361929 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcctatagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 17362028  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  17362029 tacattatg 17362037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 4653503 - 4653908
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4653503 tagcaaactcccacaacatcacagcggaaacacatgctagcagcccttaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 4653602  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4653603 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagatatcatatctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatggcgattctcac 4653702  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4653703 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 4653802  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4653803 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaccaagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 4653902  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  4653903 ttatgg 4653908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 41041061 - 41040676
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41041061 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 41040962  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41040961 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 41040862  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41040861 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 41040762  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  41040761 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaaaattgaacacctaaatataatt 41040676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3035334 - 3034927
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3035334 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagtagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 3035235  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035234 accaataaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgtactggaaacaacgacaattctcatgatatttgaaatcatgacgattc 3035135  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3035134 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 3035035  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3035034 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttct--gtcagtcctgtcgtataaattaattaagattgaacacctaaatataagtaaggcaatat 3034937  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  3034936 tacattatgg 3034927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 7487796 - 7488202
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagta--caacagatgatttactcaattgttataactaactacctca 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7487796 atgctagcaaactctcacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtatacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctca 7487895  T
Q  114 caaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgat 213  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7487896 caatcaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctaacgttg-----gaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgat 7487990  T
Q  214 tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |    
T  7487991 tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacgaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaatgc 7488090  T
Q  314 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7488091 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaat 7488190  T
Q  414 attacattatgg 425  Q
    |||| |||||||    
T  7488191 attatattatgg 7488202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20786614 - 20786203
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20786614 atgctagcaaactcccacaatatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 20786515  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgat-- 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20786514 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgatta 20786415  T
Q  214 tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaac 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20786414 tctcacgaaaattgaaaaatgcagcagttggaaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggac 20786315  T
Q  314 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  20786314 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcttgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaatataattaatgcaat 20786215  T
Q  414 attacattatgg 425  Q
    ||||||||||||    
T  20786214 attacattatgg 20786203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 46718236 - 46718653
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46718236 atgctagcaaactcccacaacatcacaacgacaacacctgctatcagccctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 46718335  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  46718336 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacga 46718435  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46718436 tgacgattctcacgaaaaatgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 46718535  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  46718536 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctgaatataatta 46718635  T
Q  407 aggcaatattacattatg 424  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46718636 aggcaatattacattatg 46718653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13534096 - 13533670
Alignment:
Q  8 ccaagaatatgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaact 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13534096 ccaaaaatatgctagcagactcccacaacaacacagcggtaacacctgctagaagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaact 13533997  T
Q  108 acctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||     
T  13533996 acctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattttcaagatatttggactcaa 13533897  T
Q  208 ---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataact 298  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  13533896 acgaacgacgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataact 13533797  T
Q  299 gataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaa 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13533796 gataaatttaaggacattcagatgaaaaaaaaattatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttatagtgtaaattaattaagattgaacacctaaa 13533697  T
Q  399 tataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13533696 tataattaaggcaaaattacattatgg 13533670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23933076 - 23932658
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23933076 atgctagcagactcccacaaaatcacagcggcaacacctgccagcagccctcaaagtacaacacatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 23932977  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc--atg----a 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||    |    
T  23932976 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgagaattctcacgatatttggaatcaaatgaacaa 23932877  T
Q  210 cg--attctcacgaaaattgaaaaatgcggcag--ttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23932876 cgacattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttttgggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaat 23932777  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23932776 ttaaggacattcagctgaaagaaatttgatgtgaaatttttattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatt 23932677  T
Q  406 aaggcaatattacattatg 424  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23932676 aaggcaagattacattatg 23932658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 35825062 - 35825481
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacaga-tgatttactcaattgttataactaactacctcac 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35825062 atgctagcagactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagcactcaaagtacattataatgacttactcaattgttataattaactacttcac 35825161  T
Q  115 aaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------- 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||            
T  35825162 aaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatatctgacgtggtactggaaataacgataattcttacgatatttggaatcaaacgaacg 35825261  T
Q  208 --gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35825262 acgacgattctcacgaaaattgaaaaatacggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaat 35825361  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35825362 ttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatt 35825461  T
Q  406 aaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  35825462 aaggtaagattacattatgg 35825481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 49874264 - 49874681
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  49874264 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcagcatctgctagcagtcctcaaaatacaactgatgacttactcaattgatataattaactac-tcaca 49874362  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||             
T  49874363 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaataaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcatgatatttgaaatcaaacgaacga 49874462  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  49874463 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacaacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataattt 49874562  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49874563 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattaatctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 49874662  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||||||    
T  49874663 aggcaatattacattatgg 49874681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31292208 - 31291793
Alignment:
Q  21 agcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31292208 agcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctactagcaaccctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcacaaccaa 31292109  T
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacg 211  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||          ||||    
T  31292108 gaaaaatgaaatcaaaa-gaaaaatcaagtcaccatacttgacgtggtactggaaataacgacaattcttacgatatttggaatcaaacgaacgacgacg 31292010  T
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaaga 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  31292009 attctcatgaaaattgaaaaatgcagcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaataggaagaagaaattttatgaatataactgatagatttaagg 31291910  T
Q  312 acattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31291909 acattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctttagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggca 31291810  T
Q  412 atattacattatggatc 428  Q
    ||  ||||||| |||||    
T  31291809 atgatacattaaggatc 31291793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30827023 - 30826745
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30827023 atgctagcaaactcacacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 30826924  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826923 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 30826824  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatat 294  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30826823 tctcaaaaattgaaaaatgcggcagttgagaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatat 30826745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 85 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27958939 - 27958593
Alignment:
Q  85 ttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgaca 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  27958939 ttactcaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactagaaataacggta 27958840  T
Q  185 attctcacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggag 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||     
T  27958839 attctgacgatatttgaaatcaaacgaacgacgacgattctcacaaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgtcaaaattgaacaatcaaaatgggaa 27958740  T
Q  276 gaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaa 375  Q
    |||   || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||||    
T  27958739 gaa---attttatgaatataatttataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctttagtgtaaa 27958643  T
Q  376 ttaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27958642 ttaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagattacattatgg 27958593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 50495778 - 50495374
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50495778 gctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagtccttaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcacaac 50495679  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc-----atgacga 212  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||     | |||||    
T  50495678 gaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtccccatacttgacgtggttctggaaataatggcaattctcacgatatttggaatcaaacgacgacga 50495579  T
Q  213 ttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaa 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||   |||||| ||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |    
T  50495578 ttctcacgaaaattaaaaaaagcggcagtttagaacgacataatttaacaatcaaaatgagaacaagaaattttatgaatgtaaattataaacttaagga 50495479  T
Q  313 cattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaa 412  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50495478 cattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaa 50495382  T
Q  413 tattacat 420  Q
     |||||||    
T  50495381 gattacat 50495374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 34073548 - 34073947
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34073548 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 34073647  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||                  |||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  34073648 accaagaaaaatcaaa------------------tcactatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacga 34073729  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatg--cggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaa 304  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  34073730 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgtgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaa 34073829  T
Q  305 tttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataat 404  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34073830 tttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgtaattttaattgttctaagctagttatgtagtgtaaattaattaagattgaacacataaatataat 34073929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Original strand, 35045518 - 35045906
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35045518 actcccacaacatcacagcagcaacacctgctaacagctctcaaagtacaaaatatgacttactcaattgttataataaactacatcacaaccaagaaaa 35045617  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
                      ||||||||| | ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          || ||||||    
T  35045618 ------------------atcaagtcaccgtaccttacg--gtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgacgaagattct 35045697  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35045698 catgaaaattaaaaaatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 35045797  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  35045798 cagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaactaagattgaacacctaaacataattaaggcaagatt 35045897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 293 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9368133 - 9368002
Alignment:
Q  293 ataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  9368133 ataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcgtacagtgtaaattaattaagattgaaca 9368034  T
Q  393 tttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368033 cctaaatataattaaggcaatattacattatg 9368002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30824922 - 30824791
Alignment:
Q  294 taactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacat 393  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  30824922 taactaataaatttgaggacattcaaatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacgc 30824823  T
Q  394 ttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30824822 ctaaatataattaaggcaatattacattatgg 30824791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 319 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 55450607 - 55450501
Alignment:
Q  319 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattac 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  55450607 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatattattaaggcaatattac 55450508  T
Q  419 attatgg 425  Q
    |||||||    
T  55450507 attatgg 55450501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 13534426 - 13534539
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  13534426 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 13534521  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13534522 attaattaagattgaaca 13534539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17361326 - 17361213
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  17361326 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 17361231  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17361230 attaattaagattgaaca 17361213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16664845 - 16664732
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  16664845 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 16664750  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16664749 attaattaagattgaaca 16664732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27961963 - 27961896
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatga 83  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27961963 atgctagcaaactcccacaacatgacaacggcaacacctggtagcagccctcaaagtacaacggatga 27961896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 49873915 - 49873807
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  49873915 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 49873820  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  49873819 ttaagattgaaca 49873807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 3035676 - 3035789
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  3035676 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttttagtgtaa 3035771  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3035772 attaattaagattgaaca 3035789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4653157 - 4653044
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  4653157 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgacgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 4653062  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4653061 attaattaagattgaaca 4653044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35824722 - 35824609
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  35824722 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatctggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 35824627  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35824626 attaattaagattgaaca 35824609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 20353937 - 20354061
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  20353937 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgttgttaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 20354032  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20354033 attaattaagattgaacatcttaatataa 20354061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 31309818 - 31309702
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31309818 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaag 31309723  T
Q  385 attgaacatttaaatataatt 405  Q
    || |||||  | |||||||||    
T  31309722 atcgaacaccttaatataatt 31309702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34073217 - 34073090
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||||||||||    
T  34073217 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aattttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtggtgtaa 34073123  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  34073122 attaattaagattgaacaccttaatataattaa 34073090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7487469 - 7487392
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgtt 352  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7487469 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtgaaattttatttgtt 7487392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8939601 - 8939488
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  | | ||||||    
T  8939601 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtattatagtgtaa 8939506  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8939505 attaattaagattgaaca 8939488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 20786897 - 20787010
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  20786897 ggaagaaattttatgaatgtaaataatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 20786992  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20786993 attaattaagattgaaca 20787010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 23419167 - 23419280
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  23419167 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattata----agtcttgtagtgtaa 23419262  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23419263 attaattaagattgaaca 23419280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46717894 - 46717781
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  46717894 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaatgacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattata----agtcttgtagtgtaa 46717799  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46717798 attaattaagattgaaca 46717781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52447574 - 52447461
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  52447574 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccatatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 52447479  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52447478 attaattaagattgaaca 52447461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54919583 - 54919470
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||    |||| ||| ||||||    
T  54919583 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatctgttata----agtcttgtagtgtaa 54919488  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54919487 attaattaagattgaaca 54919470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 23933427 - 23933530
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||| |||||||||||||    
T  23933427 ttataaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtataaattaattaag 23933522  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  23933523 attgaaca 23933530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 49970096 - 49970199
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    | || ||| |||||||||| |||||    
T  49970096 ttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttata----aatcttgtagtgtaaattatttaag 49970191  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  49970192 attgaaca 49970199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 30827365 - 30827478
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  30827365 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagataaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 30827460  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    || |||||||||||||||    
T  30827461 atcaattaagattgaaca 30827478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 392
Target Start/End: Original strand, 31292476 - 31292577
Alignment:
Q  287 atgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagat 386  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  31292476 atgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaaatttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaggat 31292571  T
Q  387 tgaaca 392  Q
    ||||||    
T  31292572 tgaaca 31292577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 20343039 - 20343089
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20343039 attctcacgaaaattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 20343089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 20353763 - 20353813
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20353763 attctcacgaaaattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 20353813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 3035510 - 3035560
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3035510 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 3035560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16665011 - 16664961
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16665011 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 16664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17361492 - 17361442
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17361492 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 17361442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 27962140 - 27962190
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27962140 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 27962190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 34073380 - 34073330
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34073380 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 34073330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 35045184 - 35045122
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgt 337  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  35045184 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgt 35045122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 49874087 - 49874037
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49874087 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 49874037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 49969920 - 49969970
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49969920 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 49969970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52447740 - 52447690
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52447740 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 52447690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 54919749 - 54919699
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  54919749 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 54919699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 407
Target Start/End: Original strand, 14269975 - 14270012
Alignment:
Q  370 tgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14269975 tgtaaattaattaagattgtatatttaaatataattaa 14270012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 43939115 - 43939156
Alignment:
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctga 162  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43939115 gaaaaatcaaatcaagaagaaaaatcaagtcatgatacctga 43939156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 7153441 - 7153850
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7153441 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 7153540  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7153541 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 7153640  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7153641 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 7153740  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  7153741 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacataaatataattaagacaatat 7153840  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  7153841 tacattatgg 7153850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 10773252 - 10773661
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10773252 atgctagcaaacacccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagcccccaaagtacaacgaatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 10773351  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10773352 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 10773451  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10773452 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 10773551  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10773552 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 10773651  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  10773652 tacattatgg 10773661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 33705121 - 33705530
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33705121 atgctagcaaacacccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 33705220  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33705221 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagccatcatacctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttaaaatcatgacgattc 33705320  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33705321 tctcaaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 33705420  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33705421 tcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccaatcctgtagtgtaaattaattaagattgaacatctaaatataattaaggcgatat 33705520  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  33705521 tacattatgg 33705530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44511908 - 44511508
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44511908 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 44511809  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44511808 agaaaa-----atcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactaaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 44511714  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44511713 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactggtaaatttaaggacattcag 44511614  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44511613 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 44511514  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  44511513 ttatgg 44511508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 36308359 - 36308771
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagca----gccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36308359 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagctagcggccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacct 36308458  T
Q  112 cacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36308459 cacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatctgacgttatactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatggcg 36308558  T
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaaga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  36308559 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagg 36308658  T
Q  312 acattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36308659 acattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggca 36308758  T
Q  412 atattacattatg 424  Q
    |||||||||||||    
T  36308759 atattacattatg 36308771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14488310 - 14487902
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14488310 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggtaacacctgctattagccctcaaaatacaacggatgattttctcaattgttataattaactacctcaca 14488211  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14488210 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgaagttgtactggaaataacgacaattctcacgatattggaaatcatgacgattc 14488111  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14488110 tcacgaaaattgaaaaatgtggtagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatcggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 14488011  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14488010 tcagattaaagaaatttgatgtgaaaatttaattgttctaagtcagtcctgtcgtgtaaattaattaagattgaacactgaaatataattaaggcaatat 14487911  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  14487910 tacattatg 14487902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 36731183 - 36731600
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36731183 atgctagcagactcccacaacatcacagcggcaacagctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcaca 36731282  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  36731283 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 36731382  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36731383 cgaggattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 36731482  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36731483 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaa-tttaattgttctaagccagtcctgtagtctaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 36731581  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  36731582 aggcaagattacattatgg 36731600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 82 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14536833 - 14536491
Alignment:
Q  82 gatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacg 181  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14536833 gattttctcaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgaagttgtactggaaataacg 14536734  T
Q  182 acaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataa 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  14536733 acaattctcacgatattggaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgtggtagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatcggaggaataa 14536634  T
Q  282 atcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaatt 381  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  14536633 attttatgaatataactgataaatttaaggacattcagattaaagaaatttgatgtgaaaatttaattgttctaagtcagtcctgtcgtgtaaattaatt 14536534  T
Q  382 aagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14536533 aagattgaacactgaaatataattaaggcaatattacattatg 14536491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 35954936 - 35955352
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35954936 atgctagcagactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 35955035  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||         |    
T  35955036 accaagaaaaatcaaataaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 35955135  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35955136 cgatgattctcacgaaaattgaaaaatgtggcagttggggacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 35955235  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||    
T  35955236 taaggacattcagaagaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcctgtagtgtaaattaactaagattgaatacctaaatatgatta 35955335  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  35955336 aggc--tattacattatgg 35955352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Original strand, 51087237 - 51087658
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51087237 atgctagcagactcccacaaaatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacacatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 51087336  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  51087337 accaagaaaaattaaatcaaaaataaaaattaagtcaccatatctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 51087436  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51087437 cgtcgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 51087536  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  51087537 taaggacattcagattaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaacttaattaagattggacacctaaatataatta 51087636  T
Q  407 aggcaatattacattatggatc 428  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  51087637 aggcaaaattacattatggatc 51087658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29521494 - 29521076
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29521494 atgctagcagactcccataacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaatatacaacagatgacttactcaattgttacaattaactacctcaca 29521395  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||             
T  29521394 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaaacaattcaccatacctgacgtggtactagaaataatgacaattctcatgatatttggaatcaaacgaacaa 29521295  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||   | ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  29521294 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgaaaacgacaaaattgaacaatcagaatgggaagaagaaattttatgaatataactaataaatt 29521195  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29521194 taaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattcattaagattaaacacctaaatataatta 29521095  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  29521094 aggcaagattatattatgg 29521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 25656359 - 25656772
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25656359 atgctagcaaactcccacaacatcacagcg-cgacacctgctagcagtcctcaaagtacaatagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 25656457  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |             
T  25656458 accaaaaaaat-caaatcaaaaagaaaaatcaaatcaacatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttagaattaaacaaacga 25656556  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  25656557 tgacgattctcacgaaaattaaaaaatacggtagtttggaacgacaaaatttaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatt 25656656  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25656657 taaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataatta 25656756  T
Q  407 aggcaatattacatta 422  Q
    || ||| |||||||||    
T  25656757 agtcaagattacatta 25656772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30302507 - 30302093
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30302507 atgctagcaaactcccacaacatcgaagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaatagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 30302408  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    |  || ||||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||             
T  30302407 aaaaaaaaaat-caaatcgaaaataaaaatcaagccaccatacctgacgtggttctggaaataacggcaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 30302309  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| || ||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  30302308 tgacgattttcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaagaagaaattttatgaatgtaattgataaatt 30302209  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30302208 taaggacattgaaatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 30302109  T
Q  407 aggcaatattacatta 422  Q
    |||||  |||||||||    
T  30302108 aggcaggattacatta 30302093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Original strand, 48128297 - 48128587
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  48128297 atgctagcaaactcccacaacatcgtagcggcaacacctgctagcaaccctcaaattacaacggatgatttactcaattgttataattaactac-tcaca 48128395  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48128396 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcataactgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 48128495  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48128496 tcacgaaaattgaaaaatacggcagttgggagcgacaaaattgaaaaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaattt 48128587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Original strand, 12768687 - 12769096
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12768687 ctagcaaactcccacaacatcacagctgcaacacctgctaacagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcacaacc 12768786  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atga 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||         | ||    
T  12768787 aagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgatgtggttctggaaataacggcaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgacga 12768886  T
Q  210 cgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  |  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  12768887 cgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgaaaacaagaaattttatgaatgtaaattataaacttaa 12768986  T
Q  310 gaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaagg 409  Q
    | | ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12768987 ggaaattcaaat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtattgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagg 12769083  T
Q  410 caatattacatta 422  Q
    ||| |||||||||    
T  12769084 caagattacatta 12769096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33005942 - 33005526
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  33005942 gctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcatcaaagtataacggatgacttactcaattgatataattaactacttcacaac 33005843  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atg 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||         |||    
T  33005842 caagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacgtgatgtggttctggaaataacgacaattctcaagatatttaaaatcaaacgaacgatg 33005743  T
Q  209 acga---ttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||   | |||| |||||||| ||| |||||||     
T  33005742 acgatatttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcgaaatgggaatgagaaattttatgaatgtaaatgataaac 33005643  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| || |||||||||  ||||||||||     
T  33005642 ttaaggacattcatatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtctaaattaaatatgattgaacacctaaatataatc 33005543  T
Q  406 aaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||| |||||||||    
T  33005542 aaggcaagattacatta 33005526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Original strand, 46118757 - 46119176
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46118757 atgctagcaaactcccacaacatcgaagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 46118856  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||             
T  46118857 a--aaaaaaaatcaaatcgaaaataaaaatcaagtcaccatacctgacgtggttcaggaaataacggtaattctcacgatatttagaatcaaatgaacga 46118954  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  46118955 cgacgattttcacgaaaattgaaaaatgcagtagtttgaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaagaagaaattttatgaatgtaattgataaatt 46119054  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46119055 taaagatattgaaatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcaatcgtgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 46119154  T
Q  407 aggcaatattacattatggatc 428  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  46119155 aggcaagattacattagggatc 46119176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 24781582 - 24781798
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24781582 atgctagcaaactcctacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatt-actcaattgttataattaactacctcaca 24781680  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24781681 accaagataaatcaaatcaaaaagagaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcatgatatttgaaatcatgacgattc 24781780  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaat 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24781781 tcacgaaaattgaaaaat 24781798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 52405120 - 52405517
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  52405120 atgctagcaaactccaaacacatcacagcggcaacacctactagcagtcctcaaagtacaacaaatgacttactcaattattataattaattacctcata 52405219  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    ||||| ||||                  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||             
T  52405220 accaataaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtggttctagaaataacgacaattctcacaatatttggaatcaaacgaacga 52405301  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| | |||    | |||||||  ||| |||||||||    
T  52405302 tgacgattctcacgaaatttgaaaactgcggcagtttagaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaagaaatttttttatgaacgtaattgataaatt 52405401  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52405402 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttgaattgttctaagcctgtcgtgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 52405501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 52406553 - 52406950
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  52406553 atgctagcaaactccaaacacatcacagcggcaacacctactagcagtcctcaaagtacaacaaatgacttactcaattattataattaattacctcata 52406652  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    ||||| ||||                  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||             
T  52406653 accaataaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtggttctagaaataacgacaattctcacaatatttggaatcaaacgaacga 52406734  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||   ||||||| | |||    | |||||||  ||| |||||||||    
T  52406735 tgacgattctcacgaaatttgaaaactgcggcagtttagaacgacaatattgaacaatcaaaatggtaagaaatttttttatgaacgtaattgataaatt 52406834  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52406835 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttgaattgttctaagcctgtcgtgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 52406934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29649172 - 29648917
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29649172 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgtaataattaactacctcaca 29649073  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||         |    
T  29649072 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcactgtacctgacgtggttatggaaataacgacaattatcacgatatttgaaatcaaacgaacga 29648973  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| || ||  |||||| |||||||||||    
T  29648972 cgacgattctcacgaaaattgaaaactgcgacaatttagaacgataaaattgaaca 29648917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 332
Target Start/End: Original strand, 5327229 - 5327554
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5327229 atgctagcaaactcc-acaacatcatagtgacaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 5327327  T
Q  116 accaagaaaattc-aaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc--------- 205  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||             
T  5327328 accaagaaaaatcaaaatcaaaaagaaaaatcaagttaccatacttgatgtggttctggaaataacaacaattctcacaatatttggaatcaaacgaacg 5327427  T
Q  206 atgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  5327428 acgacgattctcatgaaaattgaaaattgtgtcagcttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataatttttttgaatgtaactgataaat 5327527  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaattt 332  Q
     |||| || ||| ||||||||||||||    
T  5327528 gtaaggacgttcggatgaaagaaattt 5327554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 7556718 - 7556854
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7556718 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacatcacaaccaagaaaa 7556817  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctga 162  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7556818 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctga 7556854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29648787 - 29648645
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  29648787 aaattttatgaatgaaattgataaatttaaggacattcaaatgaaagaactttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaa 29648688  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29648687 ttaagattgaacacctaaatataattaaggcaagattacatta 29648645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 46463900 - 46464059
Alignment:
Q  267 aaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttcta----agcgagt 362  Q
    ||||||||  || |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  |||    
T  46463900 aaatgggaataagaaattttatgaatgtaaatgataaaattaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcagt 46463999  T
Q  363 catgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46464000 catgtagtctaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagattacatta 46464059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 321 - 425
Target Start/End: Original strand, 7556852 - 7556956
Alignment:
Q  321 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  7556852 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagattacat 7556951  T
Q  421 tatgg 425  Q
    |||||    
T  7556952 tatgg 7556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 422
Target Start/End: Original strand, 9135142 - 9135313
Alignment:
Q  248 cgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaa 347  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  9135142 cgacaaaattgaacaatcaaaataggaacaagaaattttatgaatgtaaattataaacttaaggacattcaaatt---gaaatttgatgtgaaattttaa 9135238  T
Q  348 ttgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9135239 ttgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacatta 9135313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Original strand, 44512254 - 44512378
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  44512254 ggaataaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 44512349  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    
T  44512350 attaattaagattgaacactttaatataa 44512378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 29521759 - 29521872
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  29521759 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 29521854  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29521855 attaattaagattgaaca 29521872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 425
Target Start/End: Original strand, 48128586 - 48128660
Alignment:
Q  351 ttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48128586 ttctaagccaatcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 48128660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12768415 - 12768284
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  12768415 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 12768320  T
Q  375 attaattaaga---ttgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||   |||||||| | |||||||||||    
T  12768319 attaattaagatatttgaacatcttaatataattaa 12768284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24781239 - 24781126
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  24781239 ggaagaaattttatgaatgtaaatgattaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 24781144  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24781143 attaattaagattgaaca 24781126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33704775 - 33704662
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  33704775 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 33704680  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33704679 attaattaagattgaaca 33704662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36308017 - 36307904
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  36308017 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 36307922  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36307921 attaattaagattgaaca 36307904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36730841 - 36730728
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||||||||||    
T  36730841 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattata----agtcttgtggtgtaa 36730746  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36730745 attaattaagattgaaca 36730728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 14488661 - 14488769
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  14488661 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 14488756  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  14488757 ttaagattgaaca 14488769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 29649526 - 29649654
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| | | |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  29649526 ggaagaaattttatgaatgttagtgatgaatttaaggacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 29649621  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29649622 attaattaagattgaacatcttaatataattaa 29649654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10772908 - 10772795
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  ||| ||||||    
T  10772908 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agttttgtagtgtaa 10772813  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10772812 attaattaagattgaaca 10772795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35954592 - 35954479
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || | ||||||||    
T  35954592 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaagtacatccagatgacagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttatggtgtaa 35954497  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35954496 attaattaagattgaaca 35954479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48127949 - 48127836
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  48127949 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 48127854  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48127853 attaattaagattgaaca 48127836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31030260 - 31030152
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  31030260 aaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatcgagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 31030165  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  31030164 ttaagattgaaca 31030152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7153089 - 7152986
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||||||||||||    
T  7153089 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaaattaattaag 7152994  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  7152993 attgaaca 7152986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 33006294 - 33006407
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    |||||||| ||||||    
T  33006294 ggaagaaattttatgaatgtaagtgaagaatttgaggacatccagatgaaagaaatttgatgcaaaattttatttgttata----agtcatgtagtgtaa 33006389  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33006390 attaattaagattgaaca 33006407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25656025 - 25655897
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  25656025 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 25655930  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  25655929 attaattaagattaaacaccttaatataattaa 25655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 51086926 - 51086838
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaa 390  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51086926 tgatgaatttaaggacatccggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattaattaagattgaa 51086838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7556416 - 7556324
Alignment:
Q  294 taactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7556416 taactgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaattttt--ttgttata----agtcttgtggtgtaaattaatttagattgaaca 7556324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46118412 - 46118284
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || || ||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  46118412 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaattaaataaatttgatttaaaattttatttgttataag----tcctgtagtgtaa 46118317  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  46118316 attaattaagattgaaccccttaatataattaa 46118284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 392
Target Start/End: Original strand, 30838589 - 30838656
Alignment:
Q  321 tgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30838589 tgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcatgtagtgtaaattaattaagattgaaca 30838656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5326889 - 5326765
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtc-atgtggtgtaaatta 378  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    ||||  ||| ||||||||||    
T  5326889 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaagacatctggatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtctttgtagtgtaaatta 5326794  T
Q  379 attaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5326793 attaagattgaacaccttaatataattaa 5326765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 422
Target Start/End: Original strand, 5327984 - 5328034
Alignment:
Q  372 taaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5327984 taaattaattatgattgaacacctaaatataattaaggaaatattacatta 5328034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7153265 - 7153215
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7153265 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 7153215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24781435 - 24781394
Alignment:
Q  155 atacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgata 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24781435 atacctgacgtggttctagaaacaacgacaattctcacgata 24781394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 107)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 27126722 - 27127131
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27126722 atgctagcaaactctcacaacatcacagcggcaacatctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 27126821  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126822 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 27126921  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27126922 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 27127021  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27127022 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 27127121  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  27127122 tacattatgg 27127131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27331426 - 27331014
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27331426 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacaactgccagcagccctcaaagtacaacaaatgatttactcaattgatataattaactacctcaca 27331327  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331326 accaagaaaaatcaaatcaaaatgaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 27331227  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27331226 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacat 27331127  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27331126 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacttaaatataattaaggcaatat 27331027  T
Q  416 tacattatggatc 428  Q
    |||||||||||||    
T  27331026 tacattatggatc 27331014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30042994 - 30042586
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30042994 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagcacaacggatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 30042895  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30042894 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 30042795  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30042794 tcacgaaaattgacaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 30042695  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30042694 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 30042595  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  30042594 tacattatg 30042586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41697599 - 41697191
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41697599 atgctagcaaactcccacaacatcacaacgacaacacctgctagcagccctcaaagtacaacgaatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 41697500  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41697499 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 41697400  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41697399 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgtgaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaatacat 41697300  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41697299 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 41697200  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  41697199 tacattatg 41697191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 18410761 - 18411169
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18410761 atgctagcaaactcccacaacatcgcagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 18410860  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410861 acgaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacatgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 18410960  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18410961 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagtt-ggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 18411059  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18411060 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtttaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 18411159  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  18411160 tacattatgg 18411169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37219705 - 37219296
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37219705 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaattacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 37219606  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37219605 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 37219506  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37219505 tcacgaaaatttaaaaatgcggcagttgggaacgaccaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaatgacat 37219406  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37219405 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtggaaattaattaagactgaacacctaaatataattaaggcaatat 37219306  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  37219305 tacattatgg 37219296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 50547986 - 50547574
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50547986 atgctagcaaacgcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 50547887  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50547886 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatattgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 50547787  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50547786 tcacgaaaattgaaaaatgctgcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttaggaatataacttataaatttaaggacat 50547687  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50547686 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccatacctgtagtgtaaattaattaagattgaacatctaaatataattaaggcaatat 50547587  T
Q  416 tacattatggatc 428  Q
    |||||||||||||    
T  50547586 tacattatggatc 50547574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Original strand, 23020331 - 23020738
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23020331 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 23020430  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23020431 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaacatacctgacgttgtataggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 23020530  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23020531 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaaatttatgaatataactgataaatttaaggacat 23020630  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23020631 tcagatgaatgaaatttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtaatgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 23020730  T
Q  416 tacattat 423  Q
    ||||||||    
T  23020731 tacattat 23020738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 40906682 - 40907092
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40906682 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactatctcaca 40906781  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40906782 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 40906881  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40906882 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaatgacaaaattaaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 40906981  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaa-ttgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  40906982 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaatttgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaata 40907081  T
Q  415 ttacattatgg 425  Q
    |||||||||||    
T  40907082 ttacattatgg 40907092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45053222 - 45052813
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45053222 atgctagcaaactcccacaacatcacagcgacaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 45053123  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45053122 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctaacgatatttgaaatcatgacgattc 45053023  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45053022 tcacgaaaattgaaaaatgcaacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaggaataaattttatgaatataacagataaatttaaggacat 45052923  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45052922 tcagaagaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 45052823  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  45052822 tacattatgg 45052813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44842699 - 44842293
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44842699 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtataacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 44842600  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44842599 accaagaaaaatcaaatcaaaaataaaaatcaagtcatcatacctgacgttg--ctggaaataacggcaattctcgcgatatttgaaatcatgacgattc 44842502  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44842501 tcacgaaaattgaaaaatgcggcggttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 44842402  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44842401 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 44842302  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  44842301 tacattatg 44842293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 50609984 - 50610392
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50609984 atgctggcaaactcccacaacatcacagcggcaacacatgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 50610083  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50610084 accaagaaaaatcaaatcaaaaataaaaatcaagtcatcatacctaatgttgtactagaa-taacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 50610182  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50610183 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataattgataaatttaaggacat 50610282  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  50610283 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 50610382  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  50610383 tacattatgg 50610392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 11122146 - 11122555
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11122146 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaactgatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 11122245  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11122246 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaattaagtcatcatatctgacgttgtaccagaaataacgggaattctaacgatatttgaaatcatgacgattc 11122345  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11122346 tcacaaaaatagaaaaatgcgacagttggcaacgacaaaattgaacaattaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 11122445  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11122446 tcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 11122545  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  11122546 tacattatgg 11122555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 16009337 - 16009742
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16009337 tagcaaacacccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaatggatgttttactcaattgttataattaactacctcacaacca 16009436  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16009437 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacaacaattctcacgatatttaaaatcatgacgattctctc 16009536  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16009537 aaaaattgaaaaatgcggcagttgggaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 16009636  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16009637 atgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacatctaaatataattaaggcgatattaca 16009736  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  16009737 ttatgg 16009742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8851290 - 8850878
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8851290 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 8851191  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8851190 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacattgtaccggaaataacgacaattctaacgatatttgaaatcatgacgattc 8851091  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaa---attgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8851090 tcacgaaaattgaaaaatgcgatagttgggaacgacaaaattattgaacaatcaaaatggggggaataaattttatgaatataactgataaatttaagga 8850991  T
Q  313 cattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaa 412  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8850990 cattcagatgaaaaaattttgatatgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaa 8850891  T
Q  413 tattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||    
T  8850890 tattacattatgg 8850878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 425
Target Start/End: Original strand, 16464471 - 16464872
Alignment:
Q  24 aaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16464471 aaactcccacaacatcacagcggcaacacatgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttacttaattgttataattaactacctcacaaccaagaa 16464570  T
Q  124 aattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16464571 aaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattttcacgaaa 16464670  T
Q  224 attgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatga 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16464671 attgaaaaatgcggcagttaggaacgacaaaattgaacaatcaaaatcataggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatga 16464770  T
Q  324 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16464771 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattat 16464870  T
Q  424 gg 425  Q
    ||    
T  16464871 gg 16464872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 45170540 - 45170943
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45170540 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 45170639  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170640 accaagaaaa-----atcataaagaaaaatcaagtcatcatacctgacattgtactggaaataacggatattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 45170734  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  45170735 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggaaat 45170834  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  45170835 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 45170934  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  45170935 tacattatg 45170943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 41102217 - 41102624
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41102217 atgctatcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcatccctgaaagtacaatagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 41102316  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41102317 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgatgattc 41102416  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41102417 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataaccgataaatttaaggacat 41102516  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41102517 tcagatgaaacaaatttgatgtgaaattttaattgttct--gtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacagctaaatataattaaggcaatat 41102614  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    || |||||||    
T  41102615 taaattatgg 41102624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 2218539 - 2218940
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2218539 tagcaaactcccacaacatcagagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaatgaatgatttactcaattgttataattaactacctcacaatca 2218638  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2218639 agaaaaatcaaatcaaaaacaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgatgattctcac 2218738  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2218739 gaaaattgaaaaatgcggcagtagggaacgacaaaattaaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 2218838  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2218839 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttcta----agtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 2218934  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  2218935 ttatgg 2218940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27325189 - 27324848
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27325189 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacaactgccagcagccctcaaagtacaacaaatgatttactcaattgatataattaactacctcaca 27325090  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325089 accaagaaaaatcaaatcaaaatgaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 27324990  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27324989 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 27324890  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27324889 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 27324848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 38697388 - 38697806
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38697388 atgctagcagactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 38697487  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc------atga 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||      | ||    
T  38697488 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacatggtactggaaataacgacaattctcacgatattcggaatcaaacgaacga 38697587  T
Q  210 c---gattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  38697588 caatgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaagaagaaattttatgaatatgactgataaatt 38697687  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  38697688 taaatacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctgaatataatta 38697787  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  38697788 aggcaagattacattatgg 38697806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 22605415 - 22605812
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22605415 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacatgctagcaaccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 22605514  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||             
T  22605515 accaagaaaaatcaaataaaaaagacaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataactgcaattctcacgatatttgaaatca--------- 22605605  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22605606 tcacaaaaattaaaaaatgcggcagttgtgaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggtggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 22605705  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  22605706 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataa-ccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatt-agggaatat 22605803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 43338903 - 43339309
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43338903 actcccacaacatcacagcggcaacacctactagcaaccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaa 43339002  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||    
T  43339003 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactgataataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgacgacgattct 43339102  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  43339103 cacgaaaatt-aaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaagaataaattttatgaatataactgataaatttaaggatatt 43339201  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  43339202 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaaccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacataaatataattaaggcaagatt 43339301  T
Q  417 acattatg 424  Q
    ||||||||    
T  43339302 acattatg 43339309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 26 - 421
Target Start/End: Original strand, 38236064 - 38236468
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38236064 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagccctcaaagtacaacagatgacttacttaattgttataattaactacatcacaaccaagaaaa 38236163  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||          |||||||||    
T  38236164 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgatgtggtattggaaataatgacaattctcaagatatttggaatcaaacgaacgacgacgattct 38236263  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38236264 cacgaaaattggaaaatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataacagataaatttaaggacatt 38236363  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  38236364 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagatt 38236463  T
Q  417 acatt 421  Q
    |||||    
T  38236464 acatt 38236468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Original strand, 42826526 - 42826944
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42826526 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgcaagcagtcctcgaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 42826625  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||             
T  42826626 accaagaaaaatcaaataaaaaa---aaatcaagtcaccatacctgacatggtactggaaataacagcaattctcacaatatttgaaatcaaacgaacga 42826722  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  42826723 cgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatt 42826822  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42826823 taaggacattcatatgaaggaaatttaatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 42826922  T
Q  407 aggcaatattacattatggatc 428  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  42826923 aggcaatattacattagggatc 42826944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 37785978 - 37786365
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37785978 atgctagcaaactcccacaatatcacagcggcaacatctgctagcagcccttaaagtataacagatgatttactcaattgttatacttaactacctcaca 37786077  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37786078 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacagcaattctcacgatatttaaaatcatgacgattc 37786177  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||                      |||||| ||||    
T  37786178 tcatgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacaacaaaattgaacaatcaaaataggaggaataaa----------------------tttaaggacat 37786255  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37786256 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcttgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 37786355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4232581 - 4232305
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4232581 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgacttactgaattgttataattaactacctcaca 4232482  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4232481 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaattatgacgattc 4232382  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4232381 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaat 4232305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47912445 - 47912115
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47912445 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggtaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataagtaactatctcaca 47912346  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47912345 accaagaaaa------------------atcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgacaattctcacaatatttgaaatcatgacgattc 47912264  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47912263 tcacaaaaattgaaaaatgcggcggttgagaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggagaaataaatcttatgaatataactgataaatttaaggacat 47912164  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtca 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47912163 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagccagtca 47912115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31313115 - 31312725
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  31313115 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcaaccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacattacaaccaagaaaa 31313016  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
                      ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||    
T  31313015 ------------------atcaagtcaccatacctgacgtgatactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgacgacgattct 31312934  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31312933 cacgaaaattgaaaagtgtgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 31312834  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  31312833 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagatt 31312734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37181456 - 37181091
Alignment:
Q  67 caaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgtt 166  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||     
T  37181456 caaagtacaacagatgactcactcaattgttataattaactacctcacaactaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtg 37181357  T
Q  167 gtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaa-tgcggcagttgggaacgacaaaat 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37181356 gtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgacgacgattctcacgaaaattaaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaat 37181257  T
Q  257 tgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaa 356  Q
    ||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37181256 tgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaa 37181157  T
Q  357 gcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37181156 gccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagtcaagattacatta 37181091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 55411750 - 55412098
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55411750 gctagtaaactcccacaatatcacagcggcaacacctggtagcagttctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcacaac 55411849  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atg 208  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
T  55411850 caagaaaaaacaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccgtacctgacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacgatg 55411949  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    ||||||||||||||   ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  55411950 acgattctcacgaattatgacacatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaataagaaattttatgaatgtaaatgataaattta 55412049  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55412050 aggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 55412098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 51722300 - 51721902
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51722300 ctagcagactcccacaacatcaccgcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcacaacc 51722201  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------ga 209  Q
    |||||||                  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||          ||    
T  51722200 aagaaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgacatttggaatcaaacgaacgacga 51722119  T
Q  210 cgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaa 309  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51722118 tgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgtgaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaaaaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaa 51722019  T
Q  310 gaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattg-aacatttaaatataattaag 408  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  51722018 ggacattcagatgaaagaaatttaatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtagattaattaagattgtaacacctaaatataattaag 51721919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 78 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 30363055 - 30362700
Alignment:
Q  78 agatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaat--tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaa 175  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  30363055 agatgacttactcagttgttataattaactacctcacaatcaaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactggaa 30362956  T
Q  176 ataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||   |    
T  30362955 ataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgacgacgattctcacgaaaattaaaaaatacggaagtttggaacgacaaaattgaacaatca 30362856  T
Q  267 aaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatg 366  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30362855 aaatgggaagaataaatgttatgaatgtaactgataaatgtaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagccagtcatg 30362756  T
Q  367 tggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30362755 tagtgtagattaattaagattgaacacctaaatataattaagtcaatattacatta 30362700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22428438 - 22428016
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgat---ttactcaattgttataactaactacctc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22428438 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacaaatgacgacttattcaaatgttataattaactacctc 22428339  T
Q  113 acaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc------- 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||           
T  22428338 acaaccaagaaaaatcaaatcaaaaacaaaaatcaagtcaccatacctgacatggttctcgaaataacgataattctcacgatatttggaatcaaacgaa 22428239  T
Q  206 --atgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataa 303  Q
      | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||| ||| ||| ||   ||||| || |||||||||     
T  22428238 cgacgacaattctcaggaaaattgaaaattgcggcagtttggaacgac-aaattgaacaatcaaaat-ggaagaagaatctttatgcatgtaactgatat 22428141  T
Q  304 atttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22428140 atttaaggacattcatatggaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgcagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataa 22428041  T
Q  404 ttaaggcaatattacattatggatc 428  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||    
T  22428040 ttaaggcaaaattacattagggatc 22428016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 30439794 - 30439581
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30439794 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcaagcctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 30439695  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30439694 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcagacctgacgttgtactggaaataacgacaatttttacgatatttgaaatcatgacgattc 30439595  T
Q  216 tcacgaaaattgaa 229  Q
    ||||||||||||||    
T  30439594 tcacgaaaattgaa 30439581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 53777863 - 53777465
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53777863 gctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcacaac 53777764  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca---------tg 208  Q
    ||||||||                  ||||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||         ||    
T  53777763 caagaaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtggttatggaaataacggcaattctcacgatatttaaaatcaaacgaacgatg 53777682  T
Q  209 acgat---tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
    |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||  || |||| |||||||| ||| |||||||     
T  53777681 acgatatttctcacgaatattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaattgaaatgggaataagaaattttatgaatgtaaatgataaac 53777582  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  53777581 ttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtctaaattaattaagattgaatacctaaatataatt 53777482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3892187 - 3891891
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3892187 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 3892088  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||         |    
T  3892087 acaaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactggaaataacgaaaattcacacgatatttggaatcaaacaaacga 3891988  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataa 303  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  3891987 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaaaaaattttatgaatgtaactgataa 3891891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10827225 - 10826828
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10827225 ctagcaaactctcacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcacaacc 10827126  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------ga 209  Q
    |||||||                  ||||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||    
T  10827125 aagaaaa------------------atcaagtcaccatacttgacgtggttatggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgacga 10827044  T
Q  210 cgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaa 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10827043 cgattctcacgaaaattaaaaaatgtggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaa 10826944  T
Q  310 gaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaagg 409  Q
    | | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  10826943 ggatattcagataaaagaaatttgatgcgaaattataattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaaaatttaacacctaaatataattaagg 10826844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 425
Target Start/End: Original strand, 18762542 - 18762886
Alignment:
Q  91 aattgttataactaactacctcacaaccaagaaaat-tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattct 189  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  |||||||||||| | ||| | || | ||||| ||||||||| |||||||    
T  18762542 aattgttataattaactacctcacaaccaaaaaaaaatcaaattaaaaaataaaatcaagtcaccgtacataacatggtactggaaataacggcaattct 18762641  T
Q  190 cacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaata 280  Q
    |||||||||||||||||          || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |    
T  18762642 cacgatatttgaaatcaaacgaacgacgaggattctgacgaaaattggaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaaga 18762741  T
Q  281 aatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaat 380  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  18762742 aattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgctctaagccggtcttgtagtgtaaattaat 18762841  T
Q  381 taagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18762842 taagattgaacacctaaatataattaatacaatattacattatgg 18762886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 238 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 52746598 - 52746411
Alignment:
Q  238 cagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  52746598 cagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcatatgaaaaaaatttgatgt 52746499  T
Q  338 gaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52746498 gaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtataaattaattaagattgaacatctaaatataattaaggcaatattacattatgg 52746411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 40424237 - 40424427
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40424237 atgctagcagactcccacaacatcacagcgacaacacctgccatcagccctcaaattacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcaca 40424336  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40424337 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctaacgtggtactgaaaataacgacaattctcacgatatttggaatca 40424427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 252 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 30439589 - 30439417
Alignment:
Q  252 aaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgt 351  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30439589 aaaattgaacaatcaaaattggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatatgaaattttaattgt 30439490  T
Q  352 tctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30439489 tctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacgtctaaatataattaaggcaatattacattatg 30439417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 280 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4232164 - 4232019
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  4232164 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaacttttaattgttctaagccagtcatctagtgtaaattaa 4232065  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232064 ttaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 4232019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6175155 - 6175057
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6175155 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcac 6175057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 30363185 - 30363067
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30363185 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacttgctcgcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcagttgttataattaactacctcaca 30363086  T
Q  116 accaagaaaattcaaatca 134  Q
    |||||  ||| ||||||||    
T  30363085 accaaagaaaatcaaatca 30363067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Original strand, 13214006 - 13214090
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13214006 atgctagcaaactcccacaacatcacagaggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttata 13214090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27321205 - 27321097
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  27321205 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 27321110  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  27321109 ttaagattgaaca 27321097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 15084408 - 15084521
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  15084408 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 15084503  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15084504 attaattaagattgaaca 15084521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16008990 - 16008877
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  16008990 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 16008895  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16008894 attaattaagattgaaca 16008877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 37219942 - 37220055
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  37219942 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 37220037  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37220038 attaattaagattgaaca 37220055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41101873 - 41101760
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  41101873 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 41101778  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41101777 attaattaagattgaaca 41101760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43338551 - 43338438
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  43338551 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttatgaacatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 43338456  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43338455 attaattaagattgaaca 43338438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3891847 - 3891744
Alignment:
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||    
T  3891847 cagatgaatgaaatttgatgtgaaatttgaatttttttaagccaatcatgtagcgtaaattaattaagattgaacacctaaatgtaattaagtcaagatt 3891748  T
Q  417 acat 420  Q
    ||||    
T  3891747 acat 3891744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37785639 - 37785515
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| ||| ||||||    
T  37785639 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtt----acaagtcttgtagtgtaa 37785544  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    
T  37785543 attaattaagattgaacactttaatataa 37785515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 4232924 - 4233037
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  4232924 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 4233019  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4233020 attaattaagattgaaca 4233037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27126412 - 27126299
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| || |||    
T  27126412 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtttaa 27126317  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27126316 attaattaagattgaaca 27126299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 392
Target Start/End: Original strand, 30043344 - 30043445
Alignment:
Q  287 atgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagat 386  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30043344 atgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaagat 30043439  T
Q  387 tgaaca 392  Q
    ||||||    
T  30043440 tgaaca 30043445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45170197 - 45170084
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| || |||    
T  45170197 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtataa 45170102  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45170101 attaattaagattgaaca 45170084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 47912787 - 47912900
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  47912787 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 47912882  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47912883 attaattaagattgaaca 47912900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 50548328 - 50548441
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  50548328 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaa 50548423  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50548424 attaattaagattgaaca 50548441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 53778216 - 53778329
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    | |||||| ||||||    
T  53778216 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttata----actcatgtagtgtaa 53778311  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53778312 attaattaagattgaaca 53778329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18410418 - 18410306
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| ||| ||||||    
T  18410418 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtcttgtagtgtaa 18410323  T
Q  375 attaattaagattgaac 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  18410322 attaattaagattgaac 18410306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 391
Target Start/End: Original strand, 30440136 - 30440248
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||  ||||||    
T  30440136 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgaagtgtaa 30440231  T
Q  375 attaattaagattgaac 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  30440232 attaattaagattgaac 30440248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 44843047 - 44843155
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  44843047 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 44843142  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  44843143 ttaagattgaaca 44843155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Original strand, 22428789 - 22428912
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| ||||||||  || |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| ||| |||||||||||    
T  22428789 aaattttatgaatgcaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtt----acaagtcttgtagtgtaaattaa 22428884  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||    
T  22428885 ttaagattgaacaccttaatataattaa 22428912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Original strand, 22732472 - 22732595
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| |||| |||  ||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    | | | |||||||||||    
T  22732472 aaattttatgaatgtaaccgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaaattgatgtgaaattttaattgttataagc----cctatagtgtaaattaa 22732567  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22732568 ttaagattgaacacctaaatataattaa 22732595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22605070 - 22604944
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  22605070 ggaagaaattttatgaaagtaaatgatgaatttaaggacattcggatgaaagaaatttgatgtaaaatttcatttgttata--taagtcttgtagtgtaa 22604973  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22604972 attaattaagattgaacacctaaatataa 22604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16464121 - 16464008
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  16464121 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttata----agtcttgtagtgtaa 16464026  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16464025 attaattaagattgaaca 16464008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38235700 - 38235587
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||    |||| |||||||||||||| |||||    
T  38235700 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaatttcatttgttata----agtcttgtggtgtaaattagttaag 38235605  T
Q  385 attgaacatttaaatata 402  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  38235604 attgaacatcttaatata 38235587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40423896 - 40423783
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||  |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  40423896 ggaagaaattttatgaatgtaagtgaggaatttaaggacatccagatgaaagaaactcgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 40423801  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40423800 attaattaagattgaaca 40423783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 41697941 - 41698054
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  41697941 ggaagaaattttatgaatgtaaacgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 41698036  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    |||||| |||||||||||    
T  41698037 attaatcaagattgaaca 41698054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 51722645 - 51722758
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| ||||||||  || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  51722645 ggaagaaattttatgaatgaaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttata----agtcttgttgtgtaa 51722740  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  51722741 attaattaagattgaaca 51722758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Original strand, 37181820 - 37181943
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  37181820 aaattttatgaatgtaagtgatgaattcaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 37181915  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||    
T  37181916 ttaagattaaacaccttaatataattaa 37181943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 407
Target Start/End: Original strand, 30363535 - 30363653
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||| ||||||||||||    
T  30363535 ttatgaatgtaattgatgaatctaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgcaaattaattaag 30363630  T
Q  385 attgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||| | |||||||||||    
T  30363631 attgaacatcttaatataattaa 30363653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38697047 - 38696970
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgtt 352  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38697047 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtt 38696970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 42826189 - 42826071
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || || |    ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42826189 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaagacattcagatgaaagaaatttaatataaaattttatttattat----gagtcttgtagtgtaaattaattaag 42826094  T
Q  385 attgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||  | |||||||||||    
T  42826093 attgaacaccttaatataattaa 42826071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 8851638 - 8851741
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8851638 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtcttgtagtgtaaattaattaag 8851733  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  8851734 attgaaca 8851741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 390
Target Start/End: Original strand, 45053564 - 45053675
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  45053564 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 45053659  T
Q  375 attaattaagattgaa 390  Q
    |||||||| |||||||    
T  45053660 attaattaggattgaa 45053675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11121803 - 11121690
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||  ||| ||||||    
T  11121803 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtattgtagtgtaa 11121708  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11121707 attaattaagattgaaca 11121690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23019990 - 23019881
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  23019990 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagtacatccatattaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaa 23019895  T
Q  375 attaattaagattg 388  Q
    ||||||||||||||    
T  23019894 attaattaagattg 23019881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 196
Target Start/End: Original strand, 22732158 - 22732233
Alignment:
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgata 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  22732158 gaaaaatcaaatcaagaagaaaaatcaagtcgcgatacctgacgtggttctgaaaagaacgacaattctcacgata 22732233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 6175494 - 6175576
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  6175494 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttataag 6175576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13213830 - 13213780
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13213830 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 13213780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27321376 - 27321326
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27321376 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 27321326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 51722479 - 51722529
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51722479 attctcactataattgaaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 51722529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 55411390 - 55411286
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||  |||||||||||    
T  55411390 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacat----atgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcatgcagtgtaaattaa 55411299  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||| ||||||    
T  55411298 ttaagactgaaca 55411286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Original strand, 3892534 - 3892661
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaa----tttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaa 375  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| | || ||||||||| |||    |||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| |||||||    
T  3892534 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggatatccagatgaaaaaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaaa 3892629  T
Q  376 ttaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3892630 ttaattaagattgaacaccttaatataattaa 3892661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27126610 - 27126561
Alignment:
Q  147 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgata 196  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27126610 aagtcatgatacctgacgtggttctagaaacaacgacaattctcacgata 27126561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 27325504 - 27325617
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||| | || || ||    |||  ||| ||||||    
T  27325504 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgagagaaatttgatttaaaatttgattttttata----agtgttgtagtgtaa 27325599  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27325600 attaattaagattgaaca 27325617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 27331741 - 27331854
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||| | || || ||    |||  ||| ||||||    
T  27331741 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgagagaaatttgatttaaaatttgattttttata----agtgttgtagtgtaa 27331836  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27331837 attaattaagattgaaca 27331854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Original strand, 55412141 - 55412197
Alignment:
Q  369 gtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  55412141 gtgtaaatgaattaagattgaatacctaaatataattaaggcaagatcacattatgg 55412197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 40495876 - 40495939
Alignment:
Q  288 tgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaa-tttgatgtgaaattttaattg 350  Q
    ||||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40495876 tgaatataattgttagatttaaggatattcagatgaaagaaacttttatgtgaaattttaattg 40495939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40906342 - 40906283
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  40906342 tgatgaatttaaggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag 40906283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2218359 - 2218309
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2218359 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 2218309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 3892363 - 3892413
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3892363 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 3892413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 8851466 - 8851516
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8851466 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 8851516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22605236 - 22605186
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  22605236 attctcacgataattgaaaattggggcaatttggaacgacaaaattgaaca 22605186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27126572 - 27126522
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27126572 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 27126522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 37181649 - 37181699
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37181649 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 37181699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38697213 - 38697163
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38697213 attctcactataattgaaaactgcgacagtttggaacgacaaaattgaaca 38697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40424060 - 40424010
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40424060 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 40424010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 40906507 - 40906457
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40906507 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 40906457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 41697775 - 41697825
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41697775 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 41697825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 45170363 - 45170313
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  45170363 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 45170313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Original strand, 4232758 - 4232827
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataa 281  Q
    ||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  4232758 attctcaagataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataa 4232827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 42164871 - 42164912
Alignment:
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctga 162  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42164871 gaaaaatcaaatctagaagaaaaatcaagtcatcatacctga 42164912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Original strand, 50937271 - 50937312
Alignment:
Q  121 gaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctga 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50937271 gaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagacatgatacctga 50937312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 20120548 - 20120957
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20120548 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacctactagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 20120647  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20120648 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacaatatttgaaatcatgacgattc 20120747  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20120748 tcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 20120847  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20120848 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 20120947  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  20120948 tacattatgg 20120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 41336831 - 41337236
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41336831 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagaagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 41336930  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41336931 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataaagacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 41337030  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41337031 gaaaattgaaaaatgcgacagttgtaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 41337130  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41337131 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 41337230  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  41337231 ttatgg 41337236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 724992 - 724583
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  724992 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 724893  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724892 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcatcatacctaacgttgtactggaaataacagcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 724793  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  724792 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 724693  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  724692 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctagatataattaaaacaatat 724593  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  724592 tacattatgg 724583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41858112 - 41857703
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41858112 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacctactagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 41858013  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41858012 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacaatatttgaaatcatgacgattc 41857913  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41857912 tcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaatacattttatgaatataactgataaatttaaggacat 41857813  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41857812 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 41857713  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  41857712 tacattatgg 41857703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48951741 - 48951332
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48951741 atgctagcaaactcccacaacatcacagcagcaacacctactagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 48951642  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48951641 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatattcgaaatcatgacgattc 48951542  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48951541 tcacgaaaatttaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaatgacat 48951442  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48951441 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaggcagtcatgtagtgtaaattaattaagactgaacacctaaatataattaaggcaatat 48951342  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  48951341 tacattatgg 48951332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 44458762 - 44458350
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44458762 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 44458663  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44458662 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 44458563  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   |||    
T  44458562 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataacttttaaatttaatttcat 44458463  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  44458462 tcagttgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaaaacctaaatataattaaggcaatat 44458363  T
Q  416 tacattatggatc 428  Q
    |||||||||||||    
T  44458362 tacattatggatc 44458350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 40015146 - 40014738
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40015146 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacatctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 40015047  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40015046 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcattatactcgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 40014947  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40014946 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagagaaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 40014847  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40014846 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 40014747  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  40014746 tacattatg 40014738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 46554956 - 46554546
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46554956 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 46554857  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46554856 acgaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacatgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 46554757  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46554756 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 46554657  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaa-ttttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46554656 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttttaaatgttctaagccagtcctatagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaata 46554557  T
Q  415 ttacattatgg 425  Q
    |||||||||||    
T  46554556 ttacattatgg 46554546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 48683785 - 48684194
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48683785 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 48683884  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48683885 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacatgacgtagtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 48683984  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48683985 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattaaacaatcaaaatgggaggaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 48684084  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  48684085 tcggatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcttgttgtgtaaattaattaagattgaacacctaagtataattaaggcaatat 48684184  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  48684185 tacattatgg 48684194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28589073 - 28588664
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28589073 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtagaacagatgatttactccattgttataattaactacctcaca 28588974  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28588973 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacttgacgttgtactggaaataaaggcaattcttacaatatttgaaatcatgacgattc 28588874  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28588873 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgagaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggaaat 28588774  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  28588773 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatat 28588674  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  28588673 tacattatgg 28588664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33246094 - 33245689
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33246094 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctgaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacca 33245995  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33245994 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 33245895  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33245894 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcag 33245795  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33245794 atgaaagaaatttgatgggaaattttaattattctaagtcagttctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 33245695  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  33245694 ttatgg 33245689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 44883267 - 44883675
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44883267 atgctagcaaactcccacaacatcatagcggcaacacctgctagcagccctcaaagcacaacggatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 44883366  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44883367 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 44883466  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||    
T  44883467 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactagtaaatttaaatacat 44883566  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  44883567 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatatagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagccaatat 44883666  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  44883667 tacattatg 44883675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3415612 - 3415205
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3415612 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaagtacctcaca 3415513  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  3415512 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgtactgaaaataacggcaattttcacgatatttgaaatcacgacgatta 3415413  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3415412 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacaacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 3415313  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3415312 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttc--agccagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 3415215  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  3415214 tacattatgg 3415205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 24 - 425
Target Start/End: Original strand, 21815933 - 21816334
Alignment:
Q  24 aaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaa 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815933 aaactcccacaacatcacagcggcaacacatgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttacttaattgttataattaactacctcacaaccaagaa 21816032  T
Q  124 aattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaa 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21816033 aaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattttcacgaaa 21816132  T
Q  224 attgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatga 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21816133 attgaaaaatgcggcagttaggaacgacaaaattgaacaatcaaaatcataggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatga 21816232  T
Q  324 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21816233 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattat 21816332  T
Q  424 gg 425  Q
    ||    
T  21816333 gg 21816334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 47908465 - 47908057
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47908465 atgctagcgaactcccacaacatcatagcgacaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaatttttataattaactacctcaca 47908366  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47908365 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataactgcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 47908266  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47908265 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggggggaaatttttttatgaatataactgataaatttaaggacat 47908166  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47908165 tcagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaatcgttctaagccagttct-tagtgtaatttaattaagattgaacacttaaatataattaaggcaatat 47908067  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  47908066 tacattatgg 47908057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48607090 - 48606672
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48607090 atgctagcagactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgtcataattaactacctcaca 48606991  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||         |    
T  48606990 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaactaacga 48606891  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48606890 cgacgattctcacgaaaatttaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 48606791  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48606790 taaggacattcagataaaagaaatttgatgtcaaattttaattgttctaagtcagtcctgtaatgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 48606691  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  48606690 aggcaagattacattatgg 48606672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5374010 - 5373599
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5374010 atgctagcagactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaatagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 5373911  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||             
T  5373910 cccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctaacgtggtactgaaaataacgaaaattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 5373811  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5373810 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 5373711  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  5373710 taaggacattcacatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaattaaaattgaacacctaaatataatta 5373611  T
Q  407 aggcaatattac 418  Q
    ||||||||||||    
T  5373610 aggcaatattac 5373599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9663072 - 9662646
Alignment:
Q  8 ccaagaatatgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaact 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9663072 ccaaaaatatgctagcagactcccacaacaacacagcggtaacacctgctagaagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaact 9662973  T
Q  108 acctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |||     
T  9662972 acctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattttcaagatatttggactcaa 9662873  T
Q  208 ---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataact 298  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  9662872 acgaacgacgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataact 9662773  T
Q  299 gataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaa 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9662772 gataaatttaaggacattcagatgaaaaaaaaattatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttatagtgtaaattaattaagattgaacacctaaa 9662673  T
Q  399 tataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9662672 tataattaaggcaaaattacattatgg 9662646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18994425 - 18994134
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18994425 atgctagcaaacacccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaatggatggtttactcaattgttataattaactacctcaca 18994326  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18994325 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacatgacgttgtactgaaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 18994226  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  18994225 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaacatgggaagaataatttttttgaatataactgataaattt 18994134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17967777 - 17967364
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17967777 ctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagaacaacatatgacttactcaattgttataattaactacctcacaaca 17967678  T
Q  119 aagaaaat-tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------g 208  Q
    || ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||          |    
T  17967677 aaaaaaaaatcaaatgaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttaacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgacg 17967578  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17967577 acgattctcacgaaaattaaaaaatgcagcagtttggaacgaaaaaattgaacaatcgaaatgggaagaataaattttatgaatgtaactgataaattta 17967478  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  17967477 agcacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcctgtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataattaag 17967378  T
Q  409 gcaatattacatta 422  Q
     ||| |||||||||    
T  17967377 tcaagattacatta 17967364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 47504144 - 47504560
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47504144 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctcctagcagtcctcaaagtacaatagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 47504243  T
Q  116 accaagaaaat--tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------ 207  Q
    || || ||||   |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  47504244 acaaaaaaaaaaatcaaatcaaaaataaaaa-caaatcaccatatttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaac 47504342  T
Q  208 ---gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaa 304  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||    
T  47504343 gacgacgattctcacgaaaatttaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaaccgataaa 47504442  T
Q  305 tttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataat 404  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  47504443 tttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcaggtagtgtaaattaattaggattgaacgcctaaatataat 47504542  T
Q  405 taaggcaatattacatta 422  Q
    | || ||| |||||||||    
T  47504543 tgagtcaagattacatta 47504560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30759554 - 30759203
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30759554 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacaaatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 30759455  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    ||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||         |    
T  30759454 accaaaaaaaataaaaccaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactagaaataacgacatttctcatgatatttggaatcaaacaaacaa 30759355  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  30759354 cgaggattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatt 30759255  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagc 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759254 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagc 30759203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16277029 - 16276783
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16277029 atgctagtaaacacccacaacatcacagtggcaacacctgctagcaactctcaaagtacaatggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 16276930  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16276929 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacaacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 16276830  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16276829 tcacgaatattgaaaaatgcggcagttgggaacgataaaattgaaca 16276783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23594031 - 23593618
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23594031 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtactcaaagtacaacagatgacttcttcaattgttataattaactacctcaca 23593932  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||         |    
T  23593931 acaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgatgtggtactagaaataatgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacga 23593832  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||   |||||| || ||| |||| |||||||| ||      |||||    
T  23593831 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggtagtatggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaagaagaaattttatgaatgta------aaatt 23593738  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattt----taattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatata 402  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  23593737 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttatataattgttttaagccagtcatgtggtgtaaattaattagcattgaacacctaaatata 23593638  T
Q  403 attaaggcaatattacatta 422  Q
    | |||| ||| |||||||||    
T  23593637 actaagtcaagattacatta 23593618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46935736 - 46935333
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46935736 atgctaacaaactcccacaacatcacagcggcaacacatgctagcagtcctcaaagtacaatggatgacttactcaattattataattaactacctcaca 46935637  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    ||||||||||                  | || |||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||             
T  46935636 accaagaaaa------------------aacatgtcaccatacccgacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacta 46935555  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  46935554 cgacgattctcacgaaaattgaaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaataggaagaagaaattttatgaatgtaacagataaatt 46935455  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46935454 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 46935355  T
Q  407 aggcaatattacattatggatc 428  Q
    || ||| ||||||||| |||||    
T  46935354 agacaagattacattagggatc 46935333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 230
Target Start/End: Original strand, 4925468 - 4925682
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4925468 atgctatcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatgtactcaattgttataattaattacctcaca 4925567  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4925568 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatatctgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 4925667  T
Q  216 tcacgaaaattgaaa 230  Q
    ||| |||||||||||    
T  4925668 tcatgaaaattgaaa 4925682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8392940 - 8392521
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctg----ctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacct 111  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||    ||||||| ||  || ||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||    
T  8392940 atgctagaaaactcccaaaacatcacagtggcaacacctgttagctagcagtccataacgtacaacagatgccttactcgattgttagaattaactacct 8392841  T
Q  112 cacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatg--- 208  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||  | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||         
T  8392840 cacaaccaagaaaaatcaaataaaaaagaataatcaagtcaccatacctgacgcggtcatggaaataatggaaattctcacgatatttggaatcaaacga 8392741  T
Q  209 ------acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgata 302  Q
          || ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||  |||||||| |||| ||||    
T  8392740 acgacaacaattctcatgaaaattgaaagttgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatagaaatgggaagaagaaagtttatgaatgtaaccgata 8392641  T
Q  303 aatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatata 402  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8392640 aatttaaggacattcagatgaaataaagttgatgtgaaattttaattgttctaagccaatcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaattata 8392541  T
Q  403 attaaggcaatattacatta 422  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  8392540 attaaggcaagattacatta 8392521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 103 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44521462 - 44521148
Alignment:
Q  103 taactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaa 202  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  44521462 taactacctcacaacaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactgaaaataacgacaattctcacgatatttaga 44521363  T
Q  203 atcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaata 293  Q
    ||||          ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||              |||| ||| |||| ||||||||     
T  44521362 atcaaacaaacgacgacgattctcacgaaaattaaaaaatgctgcagtttggaacgacaaaat--------------gggaagaagaaattttatgaatg 44521277  T
Q  294 taactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacat 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44521276 taactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgctctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacac 44521177  T
Q  394 ttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44521176 ctaaatataattaagtcaagattacatta 44521148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 21730229 - 21730417
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21730229 gctagtaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacttcacaac 21730328  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca 206  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21730329 caagaaaaatcaaataaaaaagaaaaattaagtcaccatacctgacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatatttaaaatca 21730417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 279 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16274468 - 16274322
Alignment:
Q  279 taaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaatta 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  16274468 taaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaatta 16274369  T
Q  379 attaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274368 attaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 16274322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 266 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41289366 - 41289207
Alignment:
Q  266 aaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcat 365  Q
    |||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41289366 aaaatgggaataagaaattttatgaatgtaactgataaacttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcat 41289267  T
Q  366 gtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41289266 gtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaaaattacattatgg 41289207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 422
Target Start/End: Original strand, 21736233 - 21736421
Alignment:
Q  234 gcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttg 333  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  21736233 gcggcagtttggaacgacaaaagtgaacaatcaaaatgggaataagaaattttatgaatgtaaatgataaacttaaggacatttagatgacagaaatttg 21736332  T
Q  334 atgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21736333 atgtgaaattttaattgttctaagtcattcatgtagtctaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaaaattacatta 21736421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 334 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4658242 - 4658151
Alignment:
Q  334 atgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4658242 atgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 4658151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 9663402 - 9663515
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  9663402 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 9663497  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9663498 attaattaagattgaaca 9663515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 18994768 - 18994881
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  18994768 ggaataaattttatgaatgtaaatgatgaagttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 18994863  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18994864 attaattaagattgaaca 18994881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41336478 - 41336370
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  41336478 aaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 41336383  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  41336382 ttaagattgaaca 41336370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44522395 - 44522312
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44522395 gctagcaaactcccacaacatcataacggcaacacctggtagcagtctccaaagtacaacagatgacttactcaattgttataa 44522312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 389
Target Start/End: Original strand, 40015488 - 40015598
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  40015488 ggaagaaattttatgaatgtaaatgataaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 40015583  T
Q  375 attaattaagattga 389  Q
    |||||||||||||||    
T  40015584 attaattaagattga 40015598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 16277371 - 16277484
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  16277371 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 16277466  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16277467 attaattaagattgaaca 16277484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20120207 - 20120094
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  20120207 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 20120112  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20120111 attaattaagattgaaca 20120094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 33246440 - 33246553
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  ||| ||||||    
T  33246440 ggaagaaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agttttgtagtgtaa 33246535  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33246536 attaattaagattgaaca 33246553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 392
Target Start/End: Original strand, 41289425 - 41289518
Alignment:
Q  295 aactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41289425 aactgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaattttatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattaattaagattgaaca 41289518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 41858350 - 41858463
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  41858350 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 41858445  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41858446 attaattaagattgaaca 41858463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 44459104 - 44459217
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  44459104 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 44459199  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44459200 attaattaagattgaaca 44459217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 48607432 - 48607545
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||    |||| ||||||||||    
T  48607432 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaatttgatgtgttata----agtcttgtggtgtaa 48607527  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48607528 attaattaagattgaaca 48607545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46000887 - 46000779
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    |||| |||||||||||||||    
T  46000887 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaactttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattaa 46000792  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  46000791 ttaagattgaaca 46000779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48683442 - 48683318
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| ||| ||||||    
T  48683442 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtt----acaagtcttgtagtgtaa 48683347  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    
T  48683346 attaattaagattgaacactttaatataa 48683318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 28589398 - 28589511
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  28589398 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 28589493  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28589494 attaattaagattgaaca 28589511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 47909188 - 47909301
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  47909188 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgttgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 47909283  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47909284 attaattaagattgaaca 47909301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 48951979 - 48952092
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  48951979 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatacagatgaaagaaatttgatttaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 48952074  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48952075 attaattaagattgaaca 48952092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 17968119 - 17968246
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  17968119 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa-aaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 17968213  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17968214 attaattaagattgaacaccttaatataattaa 17968246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44882930 - 44882811
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    || | ||| |||||||||||    
T  44882930 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatttagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agacttgtagtgtaaattaa 44882835  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    |||||||| ||||| | |||||||    
T  44882834 ttaagattcaacatcttaatataa 44882811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 725334 - 725447
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  725334 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattata----agtcttgtagtgtaa 725429  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  725430 attaattaagattgaaca 725447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 3415956 - 3416069
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  3415956 ggaagaaattttatgaaagtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttata----agtcttgtagtgtaa 3416051  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3416052 attaattaagattgaaca 3416069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21815583 - 21815470
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||| ||||||    
T  21815583 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttattttttata----agtcttgtagtgtaa 21815488  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21815487 attaattaagattgaaca 21815470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 46555296 - 46555409
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| |||  |||||    
T  46555296 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtcttgtaatgtaa 46555391  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46555392 attaattaagattgaaca 46555409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 46936085 - 46936214
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaa-tttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgta 373  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| |||||    
T  46936085 ggaagaaattttataaatataagtgatgaatttaagaacatccagataaaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgta 46936180  T
Q  374 aattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  46936181 aattaattaagattgaacaccttaatataattaa 46936214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4925117 - 4925009
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| || ||||||||    
T  4925117 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtctaaattaa 4925022  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  4925021 ttaagattgaaca 4925009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30758376 - 30758307
Alignment:
Q  359 gagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatggatc 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  30758376 gagtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataattaagtcaagattacattagggatc 30758307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 30759894 - 30760025
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaat---ttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtg 371  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||    ||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| |||    
T  30759894 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcaaatgaaaaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtg 30759989  T
Q  372 taaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  30759990 taaattaattaagattgaacaccttaatataattaa 30760025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47503775 - 47503675
Alignment:
Q  303 aatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatata 402  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | |||||||||||||||||||||| |  | ||||||    
T  47503775 aatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttttagtgtaaattaattaagattgaataccttaatata 47503680  T
Q  403 attaa 407  Q
    |||||    
T  47503679 attaa 47503675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41289410 - 41289365
Alignment:
Q  103 taactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaa 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41289410 taactacttcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaacaatcaa 41289365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 23594370 - 23594499
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaat-ttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgta 373  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||| |||  ||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| |||||    
T  23594370 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccacatgaaaaaaaaattgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgta 23594465  T
Q  374 aattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  23594466 aattacttaagattgaacaccttaatataattaa 23594499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 8393110 - 8393160
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8393110 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 8393160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 369 - 407
Target Start/End: Original strand, 10934607 - 10934645
Alignment:
Q  369 gtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10934607 gtgtaaattaattaaaattgaacatataaatataattaa 10934645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 44458938 - 44458988
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44458938 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 44458988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44883091 - 44883041
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44883091 attctgacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 44883041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 15420862 - 15421271
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15420862 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacagctgctagtagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 15420961  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420962 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 15421061  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15421062 ttacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 15421161  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15421162 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 15421261  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  15421262 tacattatgg 15421271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27019620 - 27019218
Alignment:
Q  23 caaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaaga 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27019620 caaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaaccaaga 27019521  T
Q  123 aaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaa 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019520 aaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaa 27019421  T
Q  223 aattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatg 322  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27019420 aattgaaaaatgcggtagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatg 27019321  T
Q  323 aaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27019320 aaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacatta 27019221  T
Q  423 tgg 425  Q
    |||    
T  27019220 tgg 27019218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 9592319 - 9592728
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9592319 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacttgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 9592418  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9592419 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgtcaattctcacgatatttaaaatcatgacgattc 9592518  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9592519 tcacgaaaattgaaaaatgcgacagttggtaacgataaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 9592618  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9592619 tcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttaattgttctaagtcagtcctgtggtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 9592718  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  9592719 tacattatgg 9592728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 12499919 - 12500328
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12499919 atgctagcaaactcccacaacatcactgcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacatatgatttagtcaattgttataattaactacctcaca 12500018  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12500019 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgatgattc 12500118  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12500119 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgagaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 12500218  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12500219 tcggatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatat 12500318  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  12500319 tacattatgg 12500328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42611756 - 42611350
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42611756 ctagcaaacacccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacc 42611657  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctca 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42611656 aagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggtaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctca 42611557  T
Q  219 cgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattca 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42611556 cgaaaattgaaaaatgcggtagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggacattca 42611457  T
Q  319 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattac 418  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  42611456 aatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaaaacctaaatataattaaggcaatattac 42611357  T
Q  419 attatgg 425  Q
    |||||||    
T  42611356 attatgg 42611350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 745099 - 744690
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  745099 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaattacctcaca 745000  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  744999 accaagaaaaatcaaatcaaaaagacaagtcaagtcatcttacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 744900  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  744899 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatgtaactgataaatttaaggacat 744800  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  744799 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttataagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 744700  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  744699 tacattatgg 744690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 824340 - 823928
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  824340 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctagcagccttcaaagtacgacggatgatttactcaattgttataattaactacatcaca 824241  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgt---actagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacga 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824240 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgttgtactagaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacga 824141  T
Q  213 ttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaa 312  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  824140 ttctcgtgaaaattgaaaaatgcggcaattggaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagta 824041  T
Q  313 cattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  824040 cattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacttaaatataattaaggcaa 823941  T
Q  413 tattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||    
T  823940 tattacattatgg 823928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30130450 - 30130042
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30130450 atgctagcaaactcccacagcatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 30130351  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30130350 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacttgacgttgtactggaagtaaaggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 30130251  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30130250 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggatgaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 30130151  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  30130150 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaaca-ctaaatataattaagacaatat 30130052  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    || |||||||    
T  30130051 tatattatgg 30130042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37939987 - 37939586
Alignment:
Q  25 aactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca-agaa 123  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  37939987 aactcccacaacattacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaacaacaaaa 37939888  T
Q  124 aattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37939887 aaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacattgtactgaaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaa 37939788  T
Q  224 attgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatga 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37939787 attgaaaaatgcggcagtttggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacgttcagatga 37939688  T
Q  324 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattat 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37939687 aagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattacattat 37939588  T
Q  424 gg 425  Q
    ||    
T  37939587 gg 37939586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 19665472 - 19665881
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19665472 atgctagcaaactcccacaatatcacagcggcaacacttgctagcagcccttaaagtacaacaaatgatttactcaattgttatacttaactacctcaca 19665571  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19665572 accaagaaaaatcaaatcaaaaacaaaaatcaagtcatcatacctgaagttgtactggaaataacagcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 19665671  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19665672 tcatgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 19665771  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  19665772 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcggtcctgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaatttaattaaggcaatat 19665871  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  19665872 tacattatgg 19665881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 39588970 - 39589360
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39588970 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 39589069  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39589070 accaagaaaa------------------atcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggtaattctcacgatatttgaaatcatgacgat-c 39589150  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39589151 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactaataaatttaaggacat 39589250  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  39589251 ttagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaaaacctaaatataattaaggcaatat 39589350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13304969 - 13304540
Alignment:
Q  8 ccaagaatatgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaact 107  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13304969 ccaaaaatatgctagctgactcccacaacaacaaagcggcaacatctgctagcagccctcaaagtacaatagatgacttactcaattgttataattaact 13304870  T
Q  108 acctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13304869 acctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaa 13304770  T
Q  208 ---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataact 298  Q
             ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  13304769 ccgaacaacgacgattctcaggaaaattgaaaaatgcggcagttaggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttataaatataact 13304670  T
Q  299 gataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaa 398  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  13304669 gataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtaatgtaaattagttaagattgaacacctaaa 13304570  T
Q  399 tataattaaggcaatattacattatggatc 428  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13304569 tataattaaggcaagattacattatggatc 13304540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 424
Target Start/End: Original strand, 11985161 - 11985575
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11985161 gctagtaaactcctacaacatcacagcggcaacacctgctagcagcc-tcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacatcacaac 11985259  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca---------tg 208  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||    
T  11985260 caagaaaaattaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgatgtggtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcaaatgaacgatg 11985359  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11985360 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaattta 11985459  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11985460 aggaaattcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagttctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaag 11985559  T
Q  409 gcaatattacattatg 424  Q
    ||||||||||||||||    
T  11985560 gcaatattacattatg 11985575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 16 - 428
Target Start/End: Original strand, 37270927 - 37271348
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37270927 atgctagcagacacccacaacatcacagcggcaatacctgctagcagccctcaaagtacagcagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 37271026  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||             
T  37271027 accaagaaaaatcaaattaaaaagaaaaatcaagttaccataccttacgtggtattggaaataacgataattctcacgatatttggaatcaaacgaacga 37271126  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37271127 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 37271226  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37271227 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgcgaaattttaattgttctaagtcagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacgtaaatataatta 37271326  T
Q  407 aggcaatattacattatggatc 428  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  37271327 aggcaagtttacattatggatc 37271348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20545682 - 20545295
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20545682 ctagcaaactgccacaacatcatagtggcaacacctgctaacagccctcaaagtacaacggatgattt-ctcaattgttataattaactacctcacaacc 20545584  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctca 218  Q
    |||||||                  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20545583 aagaaaa------------------atcaagtcatcatacctaacgttgtactggaaataacggtaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctca 20545502  T
Q  219 cgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattca 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20545501 cgaaaattgaaaaatgcggcagttgggtacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattca 20545402  T
Q  319 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattac 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  20545401 gatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggtaatattac 20545302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Original strand, 27551295 - 27551708
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27551295 atgctagcaaactcccacaacatcacagtggcaacatctgctagaagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 27551394  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------ga 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||    
T  27551395 accaaaaaaat-caaatcaaaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtattggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacga 27551493  T
Q  210 cg--attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27551494 cgctattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagtttggaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaattt 27551593  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  27551594 aaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataattaa 27551693  T
Q  408 ggcaatattacatta 422  Q
    | ||| |||||||||    
T  27551694 gtcaagattacatta 27551708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31551660 - 31551246
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31551660 atgctagcaaactcccacaacatcacagcgggaacacctgctagcagtcatcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 31551561  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||         |    
T  31551560 accaagaaaaatcaaatc-aaaagaaaaatcaaatcaccatacttgacgtggtactagaaatagcgacaattctcacgatatttagaatcaaacaaaaga 31551462  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |  | |||||||| |||||||||||||    
T  31551461 cgacgattctcacgaaaataaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaaaattttttatgaatgtaactgataaatt 31551362  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31551361 taaggacattcagatgaaaaaaaattgatgtgaaattttaattgttctaagctagttatgtagtgtaaattaattaagattgaacacataaatataatta 31551262  T
Q  407 aggcaatattacatta 422  Q
    || ||| |||||||||    
T  31551261 agtcaagattacatta 31551246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9986853 - 9986437
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  9986853 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctactagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactgcatcaca 9986754  T
Q  116 accaagaaaat-tcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------- 207  Q
    || || ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  9986753 acaaaaaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaaatcactatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcaaacaaacg 9986654  T
Q  208 --gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
      ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  9986653 acgacgattctaacgaaaataaaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaat 9986554  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  9986553 ttaaggacatttagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaatcgttataagccagtcatgtagtgtaaattaattaggattgaacacctaaatataatt 9986454  T
Q  406 aaggcaatattacatta 422  Q
    ||| ||| || ||||||    
T  9986453 aagtcaagatcacatta 9986437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 314 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7180867 - 7180760
Alignment:
Q  314 attcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaat 413  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  7180867 attcagatgaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagtcaag 7180768  T
Q  414 attacatt 421  Q
    ||||||||    
T  7180767 attacatt 7180760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 7180928 - 7181056
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  7180928 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 7181023  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  7181024 attaattaagattgaacaccttaatataattaa 7181056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Original strand, 27019979 - 27020093
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  27019979 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaag 27020074  T
Q  385 attgaacatttaaatataa 403  Q
    |||||||| || |||||||    
T  27020075 attgaacactttaatataa 27020093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37270605 - 37270492
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||    
T  37270605 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatataaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaa 37270510  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37270509 attaattaagattgaaca 37270492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 745454 - 745557
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||    
T  745454 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaag 745549  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  745550 attgaaca 745557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27550951 - 27550828
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  27550951 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 27550856  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||    
T  27550855 ttaagattgaacaccttaatataattaa 27550828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9591977 - 9591864
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  9591977 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaacaacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 9591882  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9591881 attaattaagattgaaca 9591864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19665130 - 19665017
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  19665130 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaagacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 19665035  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19665034 attaattaagattgaaca 19665017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 20546026 - 20546139
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  20546026 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaa 20546121  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20546122 attaattaagattgaaca 20546139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 30130792 - 30130905
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  | | ||||||    
T  30130792 ggaagaaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agttttatagtgtaa 30130887  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30130888 attaattaagattgaaca 30130905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 42612091 - 42612204
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||    
T  42612091 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttatagtgtaa 42612186  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42612187 attaattaagattgaaca 42612204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11077072 - 11076967
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaa 397  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  11077072 tgatgaatttaaggacattcaaatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctta 11076977  T
Q  398 atataattaa 407  Q
    ||||||||||    
T  11076976 atataattaa 11076967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12499577 - 12499464
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  12499577 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcgagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 12499482  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12499481 attaattaagattgaaca 12499464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 428
Target Start/End: Original strand, 19503901 - 19503960
Alignment:
Q  369 gtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatggatc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19503901 gtgtaaattaattaagattgaacaccttaatataattaaggcaatattacattatagatc 19503960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15420545 - 15420473
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15420545 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag 15420473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39588617 - 39588513
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaa-ttttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaa 383  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||    |||| |||  ||||||||||||||    
T  39588617 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaatttttatttgttata----agtcttgtaatgtaaattaattaa 39588522  T
Q  384 gattgaaca 392  Q
    |||||||||    
T  39588521 gattgaaca 39588513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 392
Target Start/End: Original strand, 824707 - 824797
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  824707 tgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttctagtgtaaattaattaagagtgaaca 824797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 13305300 - 13305413
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||    |||  ||||||||||    
T  13305300 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaatttaatttgttata----agtgttgtggtgtaa 13305395  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    || ||||| |||||||||    
T  13305396 atcaattatgattgaaca 13305413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11984808 - 11984694
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||  ||||| ||||||||     
T  11984808 ttatgaatgtaaatgatgaatttaaggagatcaagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtaatgtaatttaattaaa 11984713  T
Q  385 attgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  11984712 attgaacatcttaatataa 11984694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 745278 - 745328
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  745278 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 745328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 824518 - 824568
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  824518 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 824568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12499743 - 12499693
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12499743 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 12499693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15420726 - 15420676
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  15420726 attctcacgacaattgaaaactgtggcaatttggaacgacaaaattgaaca 15420676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 27019803 - 27019853
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  27019803 attctcacgataattgaaaattgtggcaatttggaacgacaaaattgaaca 27019853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 30130626 - 30130676
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30130626 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 30130676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37270771 - 37270721
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37270771 attctcactataattggaaactgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 37270721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39588793 - 39588743
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39588793 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 39588743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 262
Target Start/End: Original strand, 42611931 - 42611985
Alignment:
Q  208 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| | || |||||||||||||||||||    
T  42611931 gacgattctcacgataattgaaaattacggaaatttggaacgacaaaattgaaca 42611985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38281771 - 38281362
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38281771 atgctagcaaactcccacaatatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacatatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 38281672  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38281671 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacaattc 38281572  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38281571 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaattaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 38281472  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38281471 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttttaaaccagtcctgtagtgcaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 38281372  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  38281371 tacattatgg 38281362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3906410 - 3906005
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3906410 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcataacca 3906311  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 219  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3906310 agaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctaacgttgtactgaaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcac 3906211  T
Q  220 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3906210 gaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggtaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacaatcag 3906111  T
Q  320 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattaca 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3906110 atgaaagaaatttgatgtgaaattttaattattctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaaaattgaacacctaaatataattaaggcaatattaca 3906011  T
Q  420 ttatgg 425  Q
    ||||||    
T  3906010 ttatgg 3906005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37725015 - 37724607
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37725015 atgctagcaaactcccacaacatcatagcggcaacacctgctagcaacccttaaagtacaacagatgatttactcaactgttataattaactacctcaca 37724916  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37724915 gccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaattcaagtcatcatacttgacgttgtactggaaataacgacaattctcatgatatttgaaatcatgacgattc 37724816  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37724815 tcacgaatattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattcaacaattaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 37724716  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37724715 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaaggcaatcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 37724616  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  37724615 tacattatg 37724607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39966669 - 39966260
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39966669 atgctggcaaactcccacaacatcacagtggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacgaatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 39966570  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39966569 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagccatcatatctgacattgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 39966470  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39966469 tcacgaaaattgaaaaatgcggcaattgggaacgacaaaattgaacgatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 39966370  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  39966369 tcagatgaaataaatttgatgtgtaattttaattgttctaagcgagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaatacctaaatataattaaggcaatat 39966270  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||| ||||    
T  39966269 tacatcatgg 39966260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 77140 - 76733
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  77140 atgctagcgaactcccacaatatcacagcggcaacaactactagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcgca 77041  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77040 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgatgttgtactcgaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 76941  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  76940 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagctgggaaaaacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 76841  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  76840 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttct--gccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 76743  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||| ||||    
T  76742 tacatcatgg 76733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 15399520 - 15399927
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15399520 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcaaccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaaatacatcacaaccaagaaaa 15399619  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||    
T  15399620 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaatgacgacgattct 15399719  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15399720 cacgaaaattaaaaaatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 15399819  T
Q  317 cagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatt 416  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||    
T  15399820 cagatgaaaaaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaagatt 15399919  T
Q  417 acattatg 424  Q
    ||||||||    
T  15399920 acattatg 15399927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2291812 - 2291394
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2291812 atgctagcagactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacttcaca 2291713  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||             
T  2291712 accaagaaaaatcaaatcgaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcaagatatttggaatcaaacgaacga 2291613  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2291612 cgaggattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 2291513  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2291512 taaggacattcagatgaaaggaatttgatgtgaaattttaattgttataagtcaatcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 2291413  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  2291412 agacaagattacattatgg 2291394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 15153085 - 15153503
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15153085 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacatctgctagcaaccctcaatgtacaacggataacttactcaattgttataattaactacctcata 15153184  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||             
T  15153185 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgacacggtactgaaaataaaggcaattatcacgatatttgaaatcaaacgaacga 15153284  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15153285 cgacgattctcacgaaaattgaaaaatgtggcaattgggaacgacaaaattgaacaattaaaatgggaagaagaaattctatgaatataactgataaatt 15153384  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15153385 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacttaaatataatta 15153484  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15153485 aggcaataatacattatgg 15153503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1054655 - 1054242
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1054655 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacatctgctagcagccctcaaaatacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 1054556  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||             
T  1054555 accaagaaaaataaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccataccttacgtggtactggaaataacggcaattctcatcatatttgaaatcaaacgaacga 1054456  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1054455 cgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcagcagttgggaacgacagaattgaacaatcaaaatggaaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 1054356  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1054355 caaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatttagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 1054256  T
Q  407 aggcaatattacat 420  Q
    | ||||||||||||    
T  1054255 atgcaatattacat 1054242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 39068521 - 39068101
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||| | |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39068521 atgctagaagactcccacgaaatcacaacggcaacacatgctagcagccctcaaagtacaacacatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 39068422  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcata----cctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---- 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||         
T  39068421 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatatatacctgacgtagtactggaaataacgacaattctcacgatattaggaatcaaacga 39068322  T
Q  208 -----gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgata 302  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39068321 acgacgacgattctcacgaaaattaaaaaatgcggcagttgggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatggaaagaagaaattttatgaatataactgata 39068222  T
Q  303 aatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatata 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39068221 aatttaaggacattcaaatgaaagaaatttaatgtgaaattttaattgctctaagtcagtcatgtaatgtaaattaactaagattgaacacctaaatata 39068122  T
Q  403 attaaggcaatattacattat 423  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  39068121 attaaggcaagattacattat 39068101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4737750 - 4737406
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4737750 atgctagcaaactctcacaacatcacagcgacaacatctgctagcagccctcaaaatacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 4737651  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------a 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||         |    
T  4737650 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacatgatactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacga 4737551  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4737550 cgacgattctcacgaaaattgaaaattgcggcagttgggaacgacaaaattgaacactcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 4737451  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgt 351  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737450 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgt 4737406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3754448 - 3754038
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3754448 gctagcaaactcccacaacatcaccacggcaacaccggctaatagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcacaac 3754349  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------g 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||          |    
T  3754348 caagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgacgtggttctggaaataacggcaattctcatgatatttggaatcaaacgaacgacg 3754249  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| |||    
T  3754248 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaacaagaaattttatgaatgtaaattataaactta 3754149  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3754148 aggacattcacat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagatcgaacatctaaatataattaag 3754052  T
Q  409 gcaatattacatta 422  Q
    |||| |||||||||    
T  3754051 gcaagattacatta 3754038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3851307 - 3850898
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3851307 ctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaattacctcacaacc 3851208  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atga 209  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||         | ||    
T  3851207 aagaaaaatcaaatcaaaaataaaaatcaagtcaccatacttgacgtggttctggaaataacggcaattctcacgatttttggaatcaaacgaacgacga 3851108  T
Q  210 cgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaa 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||||    
T  3851107 cgattctcacaaaaattgaaaaatgcggcattttaaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaacaagaaattttatgaatgtaaattataaacttaa 3851008  T
Q  310 gaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaagg 409  Q
    | ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3851007 ggacattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttttaagcgagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagg 3850911  T
Q  410 caatattacatta 422  Q
    ||| |||||||||    
T  3850910 caagattacatta 3850898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 347
Target Start/End: Original strand, 6645185 - 6645520
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6645185 atgctagcaaactcccacaacata----cggcaacaccttctaggagtcctcaaagtacaatggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 6645280  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc--------at 207  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||        |     
T  6645281 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacatggttctggaaataacgataattctcacgatatttggaatcaaagaacgac 6645380  T
Q  208 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  6645381 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaacgtaactcataaattt 6645480  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaa 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6645481 aaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaa 6645520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27551110 - 27550712
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27551110 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctaacagtcttcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacatcaca 27551011  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat-------- 207  Q
    ||                 |||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||             
T  27551010 ac-----------------aaaagaaaaatcaaatcaccatatttgacgtggtactagaaataacgataattctcatgatattttgaatcaaacaaacga 27550928  T
Q  208 -gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  27550927 cgacgattctcacgaaaattaaaaaatacggcagtttggaacgacataattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatt 27550828  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  27550827 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaggaatgaacacctaaatataatta 27550728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42080378 - 42080005
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42080378 gctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctaacagtcctcaaaatacaatgaatgacttactcaattgttataattaactacctcacaac 42080279  T
Q  118 caag-aaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------at 207  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||         |     
T  42080278 caagaaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgatgtggttctcggaataacaacaattctcacgatatttggaatcaaacgaacgac 42080179  T
Q  208 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| ||    
T  42080178 gacgattatcacgaaaattgaaaaatacggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaacaagaaattttatgaatgtaaattataaactt 42080079  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  42080078 aaggacattcagat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaag 42080005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 208 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28391265 - 28391048
Alignment:
Q  208 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28391265 gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcgacagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaataataaattttatgaatataactgataaattt 28391166  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28391165 aaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtataaattaattaagattgaacacctaaatataattaa 28391066  T
Q  408 ggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28391065 ggcaagattacattatgg 28391048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39774677 - 39774285
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39774677 gctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagtcctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactaactcacaac 39774578  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------g 208  Q
    ||||||||                  ||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||          |    
T  39774577 caagaaaa------------------atcaagtcaccatacttgacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatacttggaatcaaacgaacgacg 39774496  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||  || |||| |||||||| ||| | ||||| |||    
T  39774495 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgagcaatcaaaatgggaacaagaaattttatgaatgtaaattataaactta 39774396  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39774395 aggacattaagat---agaaatttgatgtgaaattttatttgttctaagtcagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaag 39774299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 14194560 - 14194463
Alignment:
Q  582 tcatcagtggtcacctcggatgtgtgagatcaattgcagttgatcccactgatacatggttctgtactggttctgcagatcgaactatcaaggtattt 679  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14194560 tcatcagtggtcacttaggatgggtgagatctgttgcagttgatcccagtaatacatggtttgctactggttctgcagatcgaactatcaaggtattt 14194463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 2292153 - 2292266
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||    |||| ||||||||||    
T  2292153 ggaagaaattttatgaatgtaactgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttattata----agtcttgtggtgtaa 2292248  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2292249 attaattaagattgaaca 2292266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 3906744 - 3906857
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  3906744 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 3906839  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3906840 attaattaagattgaaca 3906857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 339 - 422
Target Start/End: Original strand, 6645930 - 6646013
Alignment:
Q  339 aaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6645930 aaattttaattgttctaagccagtcctgttgtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaagattacatta 6646013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 403
Target Start/End: Original strand, 14005921 - 14006040
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  14005921 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 14006016  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataa 403  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  14006017 ttaagattgaacactttaatataa 14006040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 6339667 - 6339603
Alignment:
Q  615 ttgcagttgatcccactgatacatggttctgtactggttctgcagatcgaactatcaaggtattt 679  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6339667 ttgcagttgatcccagtaatacatggttttgtactggttctgcagatcgaactatcaaggtattt 6339603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15399154 - 15399051
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||||||||||||||||||||    
T  15399154 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagttgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattaattaag 15399059  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  15399058 attgaaca 15399051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 4738091 - 4738204
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  4738091 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 4738186  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4738187 attaattaagattgaaca 4738204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 37725354 - 37725467
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  37725354 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttaatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 37725449  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37725450 attaattaagattgaaca 37725467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15152749 - 15152641
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  15152749 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcctgatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 15152654  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  15152653 ttaagattgaaca 15152641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25223650 - 25223542
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| | |||||||||    
T  25223650 aaattttataaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagagtaaattaa 25223555  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  25223554 ttaagattgaaca 25223542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Original strand, 77460 - 77559
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| ||| |||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  77460 aaattttacgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcatgtagtgtaaattaa 77555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6644836 - 6644737
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  6644836 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 6644741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 28391664 - 28391767
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||||||||||| || ||    
T  28391664 ttatgaatgtaagtgatgaatttaaggagatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtgtaaattagtttag 28391759  T
Q  385 attgaaca 392  Q
    ||||||||    
T  28391760 attgaaca 28391767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 38282113 - 38282195
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  38282113 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag 38282195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Original strand, 42080656 - 42080758
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  42080656 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaagtttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 42080751  T
Q  380 ttaagat 386  Q
    |||||||    
T  42080752 ttaagat 42080758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 27551449 - 27551577
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  | || |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  27551449 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaagagatccagatggaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 27551544  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  27551545 attaattaagattgaacaccttaatataattaa 27551577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 3754735 - 3754817
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3754735 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatcgagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttataag 3754817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 3851578 - 3851660
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  3851578 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataag 3851660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33853170 - 33853095
Alignment:
Q  328 aatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |    | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33853170 aatttgatgtgaaattttaattgatataagcta----tatggtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaa 33853095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 342
Target Start/End: Original strand, 39967016 - 39967078
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaat 342  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39967016 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacattcagatgaaataaatttgatgtaaaat 39967078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40494736 - 40494658
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagc 358  Q
    |||| |||| || |||||||||  ||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40494736 aaattttattaacataactgatggatttaaggacatctaaatgaaagaaatttgaagtgaaattttaattgttataagc 40494658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25223821 - 25223752
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataa 281  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  25223821 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataa 25223752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 281
Target Start/End: Original strand, 39966845 - 39966914
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataa 281  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  39966845 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaataa 39966914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 39774955 - 39775035
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaag 357  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  39774955 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaa--aatttgatgtaaaattttatttgttataag 39775035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6645008 - 6644958
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6645008 attctcactataattgaaaactgcggcagtttgaaacgacaaaattgaaca 6644958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 28391488 - 28391538
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28391488 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 28391538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 192
Target Start/End: Original strand, 28391458 - 28391495
Alignment:
Q  155 atacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcac 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28391458 atacctgacgtagttctagaaataacgacaattctcac 28391495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38552101 - 38552036
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattg 350  Q
    |||||||| ||||| ||| ||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38552101 ttatgaatgtaactcatagatccaagaatatttagatgaaagaaatttaatgtaaaattttaattg 38552036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 424
Target Start/End: Original strand, 23573579 - 23573987
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23573579 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgctaacagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 23573678  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573679 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcattatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 23573778  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23573779 tagcgaaaattgaaaaatgtggcaattggaaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagtactt 23573878  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23573879 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 23573978  T
Q  416 tacattatg 424  Q
    |||||||||    
T  23573979 tacattatg 23573987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 27782985 - 27783390
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27782985 atgctagcaaacttccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacgaatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 27783084  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783085 accaagaaaaattaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatc----ctgacgttgtactggaaataacagcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 27783180  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27783181 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacat 27783280  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27783281 tcagttgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 27783380  T
Q  416 tacattatgg 425  Q
    ||||||||||    
T  27783381 tacattatgg 27783390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11837149 - 11836742
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11837149 ctagcaaacacccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcacaaca 11837050  T
Q  119 a-agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctc 217  Q
    | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11837049 acaaaaaaaccaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacaattctc 11836950  T
Q  218 acgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattc 317  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11836949 acgaaaattgaaaaatgcggcaatttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataacttttatgaatataactgataaatttaagaacattc 11836850  T
Q  318 agatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatatta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  11836849 agatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtaatgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatatta 11836750  T
Q  418 cattatgg 425  Q
    ||||||||    
T  11836749 cattatgg 11836742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 47 - 425
Target Start/End: Original strand, 27440445 - 27440827
Alignment:
Q  47 caacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatc 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27440445 caacacctactagcagccctcaaagtacaacggatgatttacccaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatc 27440544  T
Q  147 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttggga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27440545 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacatttctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacaaaaattgaaaaatacggcagttggga 27440644  T
Q  247 acgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttta 346  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27440645 acgacaaaattgaacaatcaaaatggaaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagggcattcagatgaaagaattttgatgtgaaatttta 27440744  T
Q  347 attgttc----taagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27440745 attgttctaattaagccagtcatgtagtgtagattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattatattatgg 27440827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 14104509 - 14104905
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14104509 atgcgagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcaaccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataattaactacctcaca 14104608  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    |||||||||| ||||||             |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14104609 accaagaaaaatcaaat-------------caagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacagcaattctcacgatatttaaaatcatgacgattc 14104695  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14104696 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacggcaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataagttttatgaatataactgataaatttaaggacat 14104795  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14104796 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagacaatat 14104895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 955146 - 954728
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  955146 atgctagcaaactcccacaacatcacaacggcaacacctgttatcagccctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaca 955047  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--------- 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||             
T  955046 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagttaccatacctgacgtggtactataaataacggcaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacga 954947  T
Q  207 tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  954946 tgacgattctcacaaaaattgaaaaatgcggcaattgagaacgacaaaattgaataatcaaaatgagaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 954847  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatta 406  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  954846 taaggacattcagataaaataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataatta 954747  T
Q  407 aggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||||||    
T  954746 aggcaatattacattatgg 954728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4589382 - 4588991
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  4589382 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcgattgttttaattaactacctcaca 4589283  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 215  Q
    ||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589282 accaagaaaa------------------atcaagtcatcatacctgacgttgtactggaaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattc 4589201  T
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4589200 tcacgaaaattgaaaaatgtggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgggaggaataaattttataaatataattgataaatttaagaacat 4589101  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4589100 tcagattaaagaaatttgatgtgaaatttttattgttctaagccaatcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatat 4589001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11154192 - 11153794
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11154192 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttataattaactacctcaga 11154093  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc------atga 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||      ||||    
T  11154092 accaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgatgtggtactggaaataaaggcaattctcacgatatttaaaatcaaacgaatga 11153993  T
Q  210 c---gattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatt 306  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11153992 cgatgattctcacgaaaattgaaaagtgcggcagttgggaacgacaaaattaaacaatcaaaatggtaagaagaaattttatgaatataactgataaatt 11153893  T
Q  307 taagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  11153892 taaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacagtcatgtagtgtaaattaattaaaattgaacacctaaatataatt 11153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 25118784 - 25119100
Alignment:
Q  26 actcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25118784 actcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacatcacaaccaagaaaa 25118883  T
Q  126 ttcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atgacgattct 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||         | |||||||||    
T  25118884 atcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacgaatgacgacgattct 25118983  T
Q  217 cacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacatt 316  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25118984 cacgaaaattgaaaaatgcgacagttgggaacgaaaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgataaatttaaggacatt 25119083  T
Q  317 cagatgaaagaaatttg 333  Q
    |||||||||||||||||    
T  25119084 cagatgaaagaaatttg 25119100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 174 - 425
Target Start/End: Original strand, 16918835 - 16919086
Alignment:
Q  174 aaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatggg 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  16918835 aaataacggcaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaatgga 16918934  T
Q  274 aggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgta 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  16918935 aggaataaattttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagctagtcctgtagtgta 16919034  T
Q  374 aattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16919035 aattaattaagattgaacacataaatataattaagacaatattacattatgg 16919086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 425
Target Start/End: Original strand, 28579112 - 28579517
Alignment:
Q  8 ccaagaatatgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaact 107  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28579112 ccaaaaatatgctagcagactcccacaacaacacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaact 28579211  T
Q  108 acctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgat---atttga--a 202  Q
    ||||||||||||||||||                  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |   ||   |  |    
T  28579212 acctcacaaccaagaaaa------------------atcaagtcaccatacctgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgttggaatcaaacga 28579293  T
Q  203 atcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaa-ttgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgat 301  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28579294 acgacgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgaaaaaaattgaaaaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatataactgat 28579393  T
Q  302 aaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatat 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28579394 aaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcctgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatat 28579493  T
Q  402 aattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    ||||||||||| |||| |||||||    
T  28579494 aattaaggcaagattaaattatgg 28579517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21860898 - 21860488
Alignment:
Q  18 gctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  21860898 gctagcaaactcccacaacatcacagaggcaacacctgctaacagttctcaaagtacaacagatgacttactcaattgttataattaactacctcacaat 21860799  T
Q  118 caagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatc---------atg 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || || ||  |||||||  |||||||||||| ||||| ||||         | |    
T  21860798 caagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgatgtggttctgtaaataacagcaattctcacgagatttggaatcaaacgaacgacg 21860699  T
Q  209 acgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattta 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |  || |||| |||||||| ||| | ||||| |||    
T  21860698 acgattctcacgaaaattgaaaaatgtgacagtttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaacaagaaattttatgaatgtaaattataaactta 21860599  T
Q  309 agaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaag 408  Q
    || ||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21860598 aggacattcaaat---ataaatttgatgtgaaattttaattgttctaagacaataatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaag 21860502  T
Q  409 gcaatattacatta 422  Q
     ||| |||||||||    
T  21860501 acaagattacatta 21860488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 137 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15288503 - 15288203
Alignment:
Q  137 aagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||| ||||||||    
T  15288503 aagaaaaatcaagtcatcatacctgacgtggttctggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcaaacgaacgacgacgattctcatgaaaattg 15288404  T
Q  228 aaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaaga 327  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15288403 aaaaatgcggcagtttggaatgacaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactgataaatttaagaacattcaaatgaaaga 15288304  T
Q  328 aatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatggat 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  15288303 aattttatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtatattaattaagattgaacacctaaatataattaatgcaagattgcattatggat 15288204  T
Q  428 c 428  Q
    |    
T  15288203 c 15288203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 216 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 1090690 - 1090484
Alignment:
Q  216 tcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacat 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1090690 tcacgaaaattgaaaaatacggcagtttggaacgataaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattgtatgaatgtaactgataaatttaaggacat 1090591  T
Q  316 tcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatat 415  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  1090590 tcaaatgaaagaaatttaatgtgaatttttaattgttctaagccagtcttgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaaaat 1090491  T
Q  416 tacatta 422  Q
    |||||||    
T  1090490 tacatta 1090484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 392
Target Start/End: Original strand, 24083638 - 24084003
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| || ||||||||||   | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24083638 atgctagcaaactcccacaacattgaagcggcaacatctgctagtagtcctcaaagtatggcggatgacttactcaattattataattaactacctcaca 24083737  T
Q  116 accaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca--tga-cga 212  Q
    ||||||||||                  ||||||||  ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||    
T  24083738 accaagaaaa------------------atcaagtcgccatacttgacgtggttctggaaataacgacaattctcacaatatttggaatcaaatgaacga 24083819  T
Q  213 t-----tctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaattt 307  Q
          |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24083820 caacgatctcaccaaaattgaaaaatgctgcagtttggaacgataaa-ttgaacaaccaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaattgataaattt 24083918  T
Q  308 aagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24083919 aaggacattcaaatgaaacaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaaca 24084003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 280 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5687557 - 5687408
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttcta----agcgagtcatgtggtgtaaa 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  |||| |||||||||||    
T  5687557 aaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagttagttagtcctgtggtgtaaa 5687458  T
Q  376 ttaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5687457 ttaattaagattgagcacctaaatataattaaggcaatattacattatgg 5687408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 325 - 425
Target Start/End: Original strand, 25119520 - 25119620
Alignment:
Q  325 agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25119520 agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaagattacattatg 25119619  T
Q  425 g 425  Q
    |    
T  25119620 g 25119620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24083291 - 24083168
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  24083291 aaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 24083196  T
Q  380 ttaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||    
T  24083195 ttaagattgaacaccttaatataattaa 24083168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 955493 - 955601
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  955493 aaattttatgaatataaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 955588  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  955589 ttaagattgaaca 955601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27782641 - 27782528
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||  ||| ||||||    
T  27782641 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agttttgtagtgtaa 27782546  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27782545 attaattaagattgaaca 27782528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Original strand, 11154527 - 11154635
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  11154527 aaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 11154622  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  11154623 ttaagattgaaca 11154635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14104159 - 14104051
Alignment:
Q  280 aaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaa 379  Q
    |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| |||||||||||    
T  14104159 aaattttatgaaagtaaatgatgaatttaagaacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaaattaa 14104064  T
Q  380 ttaagattgaaca 392  Q
    |||||||||||||    
T  14104063 ttaagattgaaca 14104051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 4589724 - 4589837
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  4589724 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagaagaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 4589819  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4589820 attaattaagattgaaca 4589837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16918569 - 16918456
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  16918569 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 16918474  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  16918473 attaattaaaattgaaca 16918456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 17550730 - 17550843
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| ||| ||||||    
T  17550730 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgtcata----agtcttgtagtgtaa 17550825  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17550826 attaattaagattgaaca 17550843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 386
Target Start/End: Original strand, 21861168 - 21861275
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  21861168 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtataattttatttgttata----agtcttgttgtgtaa 21861263  T
Q  375 attaattaagat 386  Q
    ||||||||||||    
T  21861264 attaattaagat 21861275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25109691 - 25109601
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaaca 392  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25109691 tgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtggtttaaattaattaagattgaaca 25109601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 11837490 - 11837603
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  11837490 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaatgacatctagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 11837585  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11837586 attaattaagattgaaca 11837603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28578781 - 28578668
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| |||  |||||    
T  28578781 ggaagaaatgttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtattgtaa 28578686  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28578685 attaattaagattgaaca 28578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15288606 - 15288506
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcaca 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |  ||||||| | | |||||| | |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15288606 atgctatcaaactcccacaacatcgaaatggcaacaacagttagcagtcttcaaagtaaaacggacgacttactcaattgttataattaactacctcaca 15288507  T
Q  116 a 116  Q
    |    
T  15288506 a 15288506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27438571 - 27438458
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  27438571 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaacgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 27438476  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
     |||||||||||||||||    
T  27438475 gttaattaagattgaaca 27438458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27782807 - 27782757
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27782807 attctcacgataattgaaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 27782757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23580427 - 23580374
Alignment:
Q  298 tgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgt 351  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23580427 tgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgt 23580374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 11154368 - 11154418
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11154368 attctcactataattggaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 11154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23580616 - 23580566
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23580616 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 23580566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27438736 - 27438686
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27438736 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 27438686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 47 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 46916 - 46534
Alignment:
Q  47 caacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatc 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46916 caacacctactagcagccctcaaagtacaacggatgatttacccaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaaatc 46817  T
Q  147 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttggga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46816 aagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacatttctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacaaaaattgaaaaatacggcagttggga 46717  T
Q  247 acgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaatttta 346  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46716 acgacaaaattgaacaatcaaaatggaaggaataaattttatgaatataactgataaatttaagggcattcagatgaaagaattttgatgtgaaatttta 46617  T
Q  347 attgttc----taagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46616 attgttctaattaagccagtcatgtagtgtagattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattatattatgg 46534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Original strand, 48791 - 48904
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  48791 ggaagaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatccaaacgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 48886  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
     |||||||||||||||||    
T  48887 gttaattaagattgaaca 48904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 44 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5303 - 4916
Alignment:
Q  44 cggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaa 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5303 cggcaacacctgctagcagtcctcaaagtacaacaaatgatttactcaattgttataattaactacctcacaaccaagaaaaatcaaatcaaaaagaaaa 5204  T
Q  144 atcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat---------gacgattctcacgaaaattgaaaaatg 234  Q
    || || ||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  5203 attaaatcgccatacttgacgtggtactggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaacgacgacgattctcatgaaaataaaaaaatg 5104  T
Q  235 cggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttga 334  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||   ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5103 cggcagtttggaacggtaaaattgaacaatcaaaatgggaagaagaaattttatgaatgtaactaataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttga 5004  T
Q  335 tgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5003 tgtgaaatcttaattgttttaagctagtcatgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataattaagtcaagattacatta 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 407
Target Start/End: Original strand, 5622 - 5750
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  5622 ggaagaaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaaaaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 5717  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  5718 attaaataagattgaacaccttaatataattaa 5750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Original strand, 5456 - 5506
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5456 attctcactataattgaaaattgcggcagtttggaacgacaaaattgaaca 5506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 4)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 137 - 425
Target Start/End: Original strand, 22626 - 22914
Alignment:
Q  137 aagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcg 236  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22626 aagaaaaatcaagtcatcattcttgacgttgtattggaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcatgacgattctcacgaaaattgaaaaataca 22725  T
Q  237 gcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22726 gcagttgggaacgacaaaattgaacaatcaaaataggaggaataaattttatgaatataactgataaatttaaggacattcagatgaaagaaatttgatg 22825  T
Q  337 tgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacattatgg 425  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22826 tgaaattttaattgttataagccagtcatgtagtgaaaattaattaagattgaacacctaaatataattaaggcaatattatattatgg 22914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 21422 - 21507
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21422 atgctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacggatgatttactcaattgttataa 21507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20965
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    || ||| ||||||    
T  21077 ggaaaaaattttatgaatgtaaatgatgaatttaaggacatcc-gttgaaataaatttgatgtaaaattttatttgttataag----tcttgtagtgtaa 20983  T
Q  375 attaattaagattgaaca 392  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20982 attaattaagattgaaca 20965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21243 - 21193
Alignment:
Q  212 attctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaaca 262  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21243 attctcacgataattggaaattgcggcaatttggaacgacaaaattgaaca 21193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 422
Target Start/End: Original strand, 56765 - 57179
Alignment:
Q  19 ctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56765 ctagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacctgctaacagtcttcaaagtacaacggatgactcactcaattgttataattaactacctcacaacc 56864  T
Q  119 aagaaaattcaaatcaaaaagaaaa-----atcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatcat------ 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||     ||||||||| ||||| ||| || ||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||           
T  56865 aagaaaaatcaaatcaaaaagaaaagaaaaatcaagtcaccatacttgatgtggttatggaaataacgaaaattctcacgatatttggaatcaaacgaac 56964  T
Q  208 ---gacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaa 304  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||| |  || |||| |||||||| ||| | |||||    
T  56965 gacgacgattctcatgaaaattgaaaaatgcggcaatttggaacgacaaaattgaacaatcaaaatggaaacaagaaattttatgaatgtaaattataaa 57064  T
Q  305 tttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataat 404  Q
     ||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  57065 cttaaggacattcaaat---agaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagccagtattgtagtgtaaattaattaagattgaacacctaaatataat 57161  T
Q  405 taaggcaatattacatta 422  Q
    |||||||| |||||||||    
T  57162 taaggcaagattacatta 57179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 56494 - 56387
Alignment:
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||| ||||||    
T  56494 ggaataaattttatgaatgtaagtgatgaatttaaggacatccagatgaaagaaatatgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgtagtgtaa 56399  T
Q  375 attaattaagat 386  Q
    ||||||||||||    
T  56398 attaattaagat 56387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18804 - 18402
Alignment:
Q  20 tagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttataactaactacctcacaacca 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18804 tagcaaactcccacaacatcacagcggcaacacttgctagcagtcctcaaagtaaaataaatgacatacttaattgttataattaactacctcacaacca 18705  T
Q  120 agaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaattctcacgatatttgaaatca------------- 206  Q
    |             |||||| |||||||| ||| ||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||                 
T  18704 a-------------aaaaagtaaaatcaaatcaccatacttgtcgtggtgctggaaataacgacaattctcacgatatttggaatcaaacaaattaaatg 18618  T
Q  207 -tgacgattctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatgggaggaataaatcttatgaatataactgataaat 305  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| | |||    | |||||||| ||||||||||||    
T  18617 atgacgattctcacgaaaatt-aaaaatacggcagtttggaacgagaaaattgaacaatcaaaatggaaagaaatttttttatgaatgtaactgataaat 18519  T
Q  306 ttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaagattgaacatttaaatataatt 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18518 ttaaggacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagtcagtcatgtagtgtaaattaattaagattaaacacctaaatataatt 18419  T
Q  406 aaggcaatattacatta 422  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18418 aagtcaatattacatta 18402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 90; Significance: 4e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5406 - 5073
Alignment:
Q  88 ctcaattgttataactaactacctc--acaaccaagaaaattcaaatcaaaaagaaaaatcaagtcatcatacctgacgttgtactagaaataacgacaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||  ||    
T  5406 ctcaattgttataattaactacctctcacaaccaaaaaaaatcaaatcaaaacgaaaaatcaagtcaccatacctgacgtggttatggaaataacggaaa 5307  T
Q  186 ttc--tcacgatatttgaaatca------tgacga---ttctcacgaaaattgaaaaatgcggcagttgggaacgacaaaattgaacagaaaaaatggga 274  Q
    |||  | | |||||||| || ||      ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||              ||||    
T  5306 ttccttgatgatatttggaagcaaacgaatgacgacaattctcacgaaaattgaaaaatgcagcagtttggaacgacaaaat--------------ggga 5221  T
Q  275 ggaataaatcttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaa 374  Q
     ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||  |||  ||| ||||||    
T  5220 agaagaaattttatgaatgtaattgataaatttaaggacattcaaatgaaacagttttgatgtgaaattataattgttataagtcagttctgtagtgtaa 5121  T
Q  375 attaattaagattgaacatttaaatataattaaggcaatattacatta 422  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5120 attaattaagattgaacacctaaatattattaaggcaagattacatta 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 5580 - 5497
Alignment:
Q  16 atgctagcaaactcccacaacatcacatcggcaacacctgctagcagccctcaaagtacaacagatgatttactcaattgttat 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5580 atgctagcgaactcccaaaacatcgaagcggcaacacctgctaccagtcctcaaagtacaacggatgacttactcaattgttat 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 285 - 407
Target Start/End: Original strand, 5929 - 6047
Alignment:
Q  285 ttatgaatataactgataaatttaagaacattcagatgaaagaaatttgatgtgaaattttaattgttctaagcgagtcatgtggtgtaaattaattaag 384  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| | | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    |||| ||  ||||||||||||||||    
T  5929 ttatgaatgtaaatgatgaatttagggaaatccagatgaaagaaatttgatgtaaaattttatttgttata----agtcttgcagtgtaaattaattaag 6024  T
Q  385 attgaacatttaaatataattaa 407  Q
    ||| ||||  | |||||||||||    
T  6025 attaaacaccttaatataattaa 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University