View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7296_low_6 (Length: 343)

Name: NF7296_low_6
Description: NF7296
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7296_low_6
NF7296_low_6
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (4-333)||(27126079-27126408)
chr6 (24-326)||(15891327-15891627)
chr6 (4-293)||(31733869-31734158)
chr6 (4-293)||(17318724-17319014)
chr6 (4-211)||(23150868-23151075)
chr6 (4-211)||(18708743-18708949)
chr6 (4-192)||(7827234-7827422)
chr6 (187-333)||(7825767-7825913)
chr6 (1-161)||(27318154-27318314)
chr6 (8-129)||(18702889-18703010)
chr6 (113-262)||(24441112-24441261)
chr6 (4-105)||(28947693-28947794)
chr6 (103-294)||(31735629-31735821)
chr6 (4-105)||(19655831-19655932)
chr6 (4-105)||(23491773-23491874)
chr6 (4-105)||(23497371-23497472)
chr6 (103-294)||(22212214-22212407)
chr6 (156-211)||(27322172-27322227)
chr6 (65-169)||(23655665-23655767)
chr6 (103-262)||(13751060-13751219)
chr6 (7-105)||(15705216-15705314)
chr6 (7-105)||(19773314-19773412)
chr6 (132-207)||(18658448-18658524)
chr6 (38-105)||(22806182-22806249)
chr6 (224-270)||(16245370-16245416)
chr6 (70-132)||(23655740-23655802)
chr6 (132-262)||(610927-611058)
chr6 (132-262)||(29848239-29848370)
chr6 (132-207)||(19444016-19444092)
chr6 (4-78)||(13285085-13285159)
chr6 (168-262)||(5110534-5110628)
chr6 (132-207)||(16133406-16133482)
chr6 (4-67)||(19234584-19234647)
chr6 (7-78)||(22556625-22556696)
chr6 (4-67)||(25921117-25921180)
chr6 (97-186)||(23497614-23497702)
chr6 (4-66)||(29044650-29044712)
chr6 (4-78)||(32259224-32259298)
chr6 (280-333)||(25920781-25920834)
chr6 (168-262)||(5289893-5289987)
chr6 (148-207)||(13764592-13764652)
chr6 (4-67)||(18585007-18585070)
chr6 (97-186)||(23492016-23492104)
chr6 (98-132)||(23655639-23655673)
chr6 (103-262)||(24266952-24267111)
chr6 (299-333)||(30674292-30674326)
chr6 (139-207)||(19829695-19829764)
chr6 (105-169)||(19773372-19773434)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (1-327)||(46386686-46387012)
chr7 (4-333)||(20585477-20585806)
chr7 (4-333)||(44374067-44374396)
chr7 (4-333)||(44382932-44383261)
chr7 (4-333)||(19282213-19282542)
chr7 (6-333)||(12465864-12466191)
chr7 (4-211)||(13148074-13148281)
chr7 (4-211)||(12127766-12127973)
chr7 (4-211)||(11066711-11066918)
chr7 (113-294)||(37785076-37785257)
chr7 (6-211)||(12371521-12371723)
chr7 (4-204)||(32434191-32434392)
chr7 (123-276)||(18875646-18875799)
chr7 (123-276)||(43277546-43277699)
chr7 (123-276)||(3287100-3287247)
chr7 (20-172)||(14928950-14929100)
chr7 (20-172)||(15352416-15352566)
chr7 (103-294)||(11053785-11053976)
chr7 (4-95)||(33001273-33001364)
chr7 (4-93)||(15720137-15720226)
chr7 (38-105)||(1489907-1489974)
chr7 (105-234)||(33001177-33001303)
chr7 (103-207)||(15281505-15281607)
chr7 (7-105)||(14258701-14258799)
chr7 (132-262)||(8757130-8757261)
chr7 (132-262)||(40555477-40555608)
chr7 (17-105)||(16460547-16460635)
chr7 (17-105)||(16580009-16580097)
chr7 (17-105)||(16585566-16585654)
chr7 (123-262)||(3289548-3289687)
chr7 (7-105)||(32301531-32301629)
chr7 (7-78)||(18875451-18875522)
chr7 (4-78)||(13745802-13745876)
chr7 (4-78)||(14161456-14161530)
chr7 (17-105)||(20487792-20487880)
chr7 (133-228)||(21735237-21735331)
chr7 (97-207)||(15096386-15096495)
chr7 (4-78)||(13745378-13745452)
chr7 (4-78)||(25941814-25941888)
chr7 (17-78)||(3287373-3287434)
chr7 (132-195)||(4325310-4325374)
chr7 (132-207)||(13408014-13408090)
chr7 (132-207)||(13865120-13865196)
chr7 (4-64)||(13894485-13894545)
chr7 (97-207)||(19558026-19558135)
chr7 (4-67)||(24270583-24270646)
chr7 (132-258)||(832757-832884)
chr7 (132-258)||(1197937-1198064)
chr7 (17-78)||(8851774-8851835)
chr7 (4-67)||(4691497-4691560)
chr7 (151-218)||(14161683-14161749)
chr7 (4-67)||(15576432-15576495)
chr7 (7-78)||(20619662-20619733)
chr7 (7-78)||(43277349-43277420)
chr7 (4-67)||(48213546-48213609)
chr7 (134-195)||(12755442-12755504)
chr7 (97-186)||(13133258-13133346)
chr7 (97-186)||(14219714-14219802)
chr7 (102-207)||(15139364-15139468)
chr7 (299-333)||(43747595-43747629)
chr7 (56-105)||(13133067-13133116)
chr7 (139-207)||(17071030-17071099)
chr7 (148-195)||(11309537-11309585)
chr7 (148-195)||(14191839-14191887)
chr7 (65-105)||(14219722-14219762)
chr7 (105-169)||(14258679-14258741)
chr7 (65-105)||(15096394-15096434)
chr7 (65-105)||(16077624-16077664)
chr7 (105-169)||(16460595-16460657)
chr7 (105-169)||(16579987-16580049)
chr7 (105-169)||(16585614-16585676)
chr7 (65-105)||(19558034-19558074)
chr7 (105-169)||(32301509-32301571)
chr7 (7-51)||(46473490-46473534)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (4-333)||(35065182-35065511)
chr3 (4-329)||(11258592-11258917)
chr3 (7-333)||(35353720-35354046)
chr3 (4-327)||(17519475-17519799)
chr3 (4-327)||(17534337-17534661)
chr3 (7-293)||(41172976-41173263)
chr3 (4-329)||(2842064-2842379)
chr3 (1-282)||(5206253-5206535)
chr3 (4-293)||(14508012-14508298)
chr3 (4-293)||(15932109-15932398)
chr3 (4-293)||(17693236-17693518)
chr3 (8-223)||(44273705-44273920)
chr3 (105-333)||(19884226-19884454)
chr3 (4-211)||(22307185-22307392)
chr3 (4-211)||(17538350-17538557)
chr3 (4-211)||(40807239-40807446)
chr3 (113-294)||(16728443-16728624)
chr3 (123-276)||(14153191-14153344)
chr3 (102-276)||(50348806-50348977)
chr3 (113-276)||(45531332-45531496)
chr3 (160-293)||(5215026-5215159)
chr3 (7-194)||(42353279-42353463)
chr3 (215-333)||(44269650-44269768)
chr3 (7-190)||(13519549-13519729)
chr3 (139-276)||(10562881-10563019)
chr3 (4-105)||(17046511-17046612)
chr3 (4-105)||(54876085-54876186)
chr3 (4-100)||(9511767-9511863)
chr3 (4-100)||(9519742-9519838)
chr3 (4-105)||(11192430-11192531)
chr3 (4-105)||(17685445-17685546)
chr3 (103-294)||(20417233-20417424)
chr3 (4-105)||(6156055-6156156)
chr3 (4-105)||(14441517-14441618)
chr3 (24-105)||(17691427-17691508)
chr3 (4-105)||(19568970-19569072)
chr3 (254-327)||(40811913-40811986)
chr3 (4-78)||(17207718-17207792)
chr3 (102-276)||(13179314-13179488)
chr3 (132-262)||(13523145-13523276)
chr3 (8-105)||(18700079-18700176)
chr3 (8-105)||(43889405-43889502)
chr3 (38-105)||(12470151-12470218)
chr3 (7-78)||(50348631-50348702)
chr3 (103-262)||(14818211-14818370)
chr3 (4-78)||(24546213-24546287)
chr3 (4-78)||(50755983-50756057)
chr3 (132-262)||(3394736-3394867)
chr3 (17-105)||(14671173-14671261)
chr3 (17-105)||(14682672-14682760)
chr3 (7-78)||(14153004-14153075)
chr3 (123-262)||(23395786-23395925)
chr3 (131-207)||(10550510-10550587)
chr3 (132-262)||(18367492-18367623)
chr3 (7-78)||(40812209-40812280)
chr3 (4-67)||(50351602-50351665)
chr3 (4-78)||(15565890-15565964)
chr3 (280-333)||(1208848-1208901)
chr3 (280-333)||(11258560-11258613)
chr3 (132-262)||(13520515-13520646)
chr3 (168-262)||(3803066-3803160)
chr3 (132-191)||(6819367-6819427)
chr3 (168-262)||(11850414-11850508)
chr3 (132-207)||(17548285-17548361)
chr3 (105-274)||(19569032-19569200)
chr3 (299-338)||(50756254-50756293)
chr3 (4-67)||(54330907-54330970)
chr3 (139-207)||(6158637-6158706)
chr3 (17-86)||(10542073-10542142)
chr3 (139-207)||(14642293-14642362)
chr3 (103-207)||(52338671-52338775)
chr3 (132-207)||(179441-179517)
chr3 (210-261)||(13516530-13516582)
chr3 (139-234)||(14250861-14250952)
chr3 (168-262)||(54520668-54520762)
chr3 (282-333)||(50351983-50352034)
chr3 (97-186)||(6155897-6155985)
chr3 (97-186)||(11192200-11192288)
chr3 (4-66)||(14568661-14568723)
chr3 (8-78)||(49900104-49900174)
chr3 (103-192)||(52213183-52213272)
chr3 (300-333)||(22842513-22842546)
chr3 (139-207)||(37038058-37038127)
chr3 (139-207)||(42324964-42325033)
chr3 (97-196)||(11562678-11562776)
chr3 (168-262)||(12275785-12275879)
chr3 (7-75)||(12511227-12511295)
chr3 (123-183)||(16050114-16050172)
chr3 (123-191)||(16059489-16059555)
chr3 (4-64)||(43928741-43928801)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (4-333)||(23-352)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (4-333)||(20179123-20179452)
chr8 (4-333)||(42818509-42818829)
chr8 (4-211)||(39936612-39936819)
chr8 (4-211)||(19140008-19140215)
chr8 (17-276)||(20084253-20084508)
chr8 (139-276)||(22259106-22259243)
chr8 (165-293)||(24713329-24713457)
chr8 (8-188)||(6102359-6102536)
chr8 (117-274)||(23947374-23947531)
chr8 (116-264)||(17217771-17217920)
chr8 (4-105)||(5760882-5760983)
chr8 (123-294)||(17907695-17907867)
chr8 (103-294)||(23888879-23889070)
chr8 (123-294)||(22244557-22244729)
chr8 (123-264)||(22584461-22584602)
chr8 (17-105)||(21346014-21346102)
chr8 (17-105)||(23914273-23914361)
chr8 (4-78)||(22344418-22344492)
chr8 (4-78)||(22356078-22356152)
chr8 (4-78)||(20517719-20517793)
chr8 (6-78)||(36305035-36305107)
chr8 (4-67)||(4381394-4381457)
chr8 (4-78)||(22483123-22483197)
chr8 (4-64)||(361814-361874)
chr8 (97-196)||(36728026-36728124)
chr8 (4-67)||(18817063-18817126)
chr8 (97-207)||(22318656-22318765)
chr8 (4-67)||(22474139-22474202)
chr8 (148-262)||(20454426-20454541)
chr8 (132-195)||(15635914-15635978)
chr8 (148-207)||(19882207-19882267)
chr8 (148-207)||(20455238-20455298)
chr8 (148-207)||(20460216-20460276)
chr8 (97-196)||(31723310-31723408)
chr8 (4-64)||(32949991-32950051)
chr8 (7-78)||(18833847-18833918)
chr8 (4-66)||(17979018-17979080)
chr8 (5-67)||(18815425-18815487)
chr8 (299-333)||(22344202-22344236)
chr8 (299-333)||(22355862-22355896)
chr8 (299-333)||(36304877-36304911)
chr8 (17-67)||(36733128-36733178)
chr8 (299-333)||(38988466-38988500)
chr8 (299-333)||(39019563-39019597)
chr8 (280-329)||(12577009-12577058)
chr8 (296-333)||(12577033-12577070)
chr8 (139-207)||(39695271-39695340)
chr8 (38-78)||(5082848-5082888)
chr8 (105-169)||(21346062-21346124)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (4-329)||(42874924-42875249)
chr4 (4-332)||(16997649-16997980)
chr4 (4-333)||(11425075-11425405)
chr4 (4-333)||(25090774-25091103)
chr4 (4-307)||(14548773-14549076)
chr4 (4-293)||(10357038-10357328)
chr4 (123-333)||(37018719-37018929)
chr4 (4-211)||(19609567-19609774)
chr4 (4-276)||(3485091-3485361)
chr4 (123-294)||(19435498-19435669)
chr4 (105-276)||(33243959-33244129)
chr4 (53-276)||(19734471-19734687)
chr4 (4-103)||(14630177-14630276)
chr4 (4-105)||(53631075-53631176)
chr4 (6-104)||(13036381-13036479)
chr4 (103-234)||(4615772-4615901)
chr4 (123-262)||(2584937-2585076)
chr4 (132-294)||(21061680-21061844)
chr4 (4-78)||(15344253-15344327)
chr4 (20-92)||(33243914-33243986)
chr4 (7-78)||(19435303-19435374)
chr4 (5-67)||(35660233-35660295)
chr4 (123-261)||(6511762-6511900)
chr4 (132-262)||(27027922-27028053)
chr4 (4-64)||(3337489-3337549)
chr4 (132-207)||(14933175-14933251)
chr4 (4-67)||(26922273-26922336)
chr4 (97-186)||(9638080-9638168)
chr4 (123-262)||(13446642-13446778)
chr4 (132-262)||(14942381-14942512)
chr4 (132-262)||(15448145-15448276)
chr4 (133-207)||(18229899-18229974)
chr4 (4-67)||(45314938-45315001)
chr4 (4-66)||(14508150-14508212)
chr4 (4-66)||(19566520-19566582)
chr4 (103-262)||(20899466-20899625)
chr4 (4-78)||(25513119-25513193)
chr4 (4-78)||(26445261-26445335)
chr4 (4-70)||(37019053-37019119)
chr4 (236-293)||(50160165-50160222)
chr4 (139-207)||(9638247-9638316)
chr4 (97-196)||(16026789-16026887)
chr4 (168-262)||(49547996-49548090)
chr4 (5-73)||(55582585-55582653)
chr4 (7-78)||(15114599-15114670)
chr4 (97-186)||(14629945-14630033)
chr4 (299-333)||(25512660-25512694)
chr4 (299-333)||(26922555-26922589)
chr4 (139-234)||(51992738-51992832)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (4-333)||(21046651-21046980)
chr1 (4-333)||(42912171-42912500)
chr1 (4-333)||(4596447-4596776)
chr1 (4-333)||(16058916-16059245)
chr1 (7-274)||(20634240-20634507)
chr1 (4-293)||(20587838-20588129)
chr1 (4-293)||(20592376-20592667)
chr1 (105-333)||(19675872-19676100)
chr1 (4-276)||(14238214-14238484)
chr1 (6-211)||(41227308-41227513)
chr1 (7-276)||(7052661-7052927)
chr1 (65-276)||(38887790-38887999)
chr1 (4-176)||(51082496-51082666)
chr1 (7-132)||(38887693-38887817)
chr1 (18-105)||(21239911-21239998)
chr1 (4-101)||(51323628-51323725)
chr1 (4-92)||(19676073-19676161)
chr1 (139-234)||(42696937-42697031)
chr1 (103-262)||(52983332-52983491)
chr1 (123-207)||(18275157-18275241)
chr1 (6-78)||(39060472-39060544)
chr1 (103-294)||(51476131-51476322)
chr1 (4-78)||(1642972-1643046)
chr1 (139-234)||(1642657-1642750)
chr1 (4-78)||(12710264-12710338)
chr1 (6-67)||(41226055-41226116)
chr1 (4-78)||(22824008-22824082)
chr1 (132-207)||(7792586-7792662)
chr1 (132-207)||(13528528-13528604)
chr1 (132-195)||(44822855-44822919)
chr1 (4-67)||(50544239-50544302)
chr1 (4-66)||(18120993-18121055)
chr1 (123-192)||(18270518-18270587)
chr1 (103-262)||(18823793-18823952)
chr1 (146-207)||(21181073-21181135)
chr1 (139-207)||(38057394-38057463)
chr1 (8-73)||(45496326-45496391)
chr1 (148-207)||(10813273-10813333)
chr1 (18-78)||(11809199-11809259)
chr1 (100-191)||(13302045-13302135)
chr1 (132-195)||(24815586-24815647)
chr1 (299-333)||(6833382-6833416)
chr1 (4-66)||(24720295-24720357)
chr1 (299-333)||(45496142-45496176)
chr1 (139-207)||(19761968-19762037)
chr1 (18-78)||(23073262-23073322)
chr1 (7-71)||(48301315-48301379)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (4-333)||(28653104-28653433)
chr2 (4-333)||(17306608-17306937)
chr2 (4-333)||(23969225-23969554)
chr2 (4-332)||(24515308-24515636)
chr2 (4-333)||(36839295-36839621)
chr2 (4-293)||(9975089-9975379)
chr2 (4-290)||(27485072-27485359)
chr2 (4-211)||(24781442-24781649)
chr2 (6-194)||(5031734-5031922)
chr2 (113-276)||(19358110-19358272)
chr2 (113-281)||(14693380-14693547)
chr2 (114-276)||(10897503-10897666)
chr2 (139-294)||(5985236-5985396)
chr2 (7-100)||(23069055-23069148)
chr2 (102-264)||(44071676-44071837)
chr2 (4-78)||(43707886-43707960)
chr2 (17-105)||(9784931-9785019)
chr2 (4-64)||(24273861-24273921)
chr2 (4-73)||(22686221-22686290)
chr2 (17-78)||(25587301-25587362)
chr2 (7-78)||(21368483-21368554)
chr2 (97-230)||(3538960-3539090)
chr2 (103-264)||(27860469-27860629)
chr2 (132-195)||(31520371-31520435)
chr2 (113-191)||(18391046-18391124)
chr2 (7-78)||(19201806-19201877)
chr2 (132-207)||(6478034-6478110)
chr2 (104-191)||(27851836-27851922)
chr2 (4-67)||(1384287-1384350)
chr2 (4-66)||(21316263-21316325)
chr2 (4-66)||(23609865-23609927)
chr2 (19-73)||(28345692-28345746)
chr2 (102-186)||(25141349-25141432)
chr2 (65-105)||(3539042-3539082)
chr2 (105-169)||(9784909-9784971)
chr2 (6-66)||(21336056-21336116)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (4-333)||(13138-13465)
scaffold0111 (4-333)||(19405-19732)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (6-333)||(1-327)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (4-293)||(5315-5604)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (4-321)||(19920767-19921084)
chr5 (65-276)||(36509479-36509688)
chr5 (4-132)||(32607927-32608054)
chr5 (157-276)||(21406443-21406562)
chr5 (65-230)||(32608027-32608188)
chr5 (7-132)||(36509382-36509506)
chr5 (4-105)||(20565903-20566004)
chr5 (139-294)||(25250632-25250789)
chr5 (139-294)||(25314417-25314574)
chr5 (17-78)||(20198203-20198264)
chr5 (139-208)||(23200299-23200368)
chr5 (132-207)||(24277340-24277416)
chr5 (132-207)||(24384797-24384873)
chr5 (4-78)||(21399605-21399679)
chr5 (4-78)||(30611929-30612003)
chr5 (4-78)||(30613889-30613963)
chr5 (17-78)||(23200004-23200065)
chr5 (135-262)||(8952787-8952915)
chr5 (4-66)||(14026409-14026471)
chr5 (5-66)||(16605206-16605267)
chr5 (168-262)||(41876320-41876414)
chr5 (4-67)||(22110987-22111050)
chr5 (7-78)||(33895487-33895558)
chr5 (5-63)||(1627983-1628041)
chr5 (4-66)||(18744038-18744100)
chr5 (97-158)||(20565701-20565761)
chr5 (148-207)||(17812638-17812698)
chr5 (103-186)||(22357664-22357747)
chr5 (299-333)||(22110893-22110927)
chr5 (139-207)||(10953214-10953283)
chr5 (299-331)||(8504636-8504668)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (4-293)||(57908-58198)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (4-293)||(327-615)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (4-211)||(7987-8195)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (4-211)||(9828-10035)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (4-276)||(10975-11245)
scaffold0546 (4-276)||(7155-7425)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (4-276)||(579-849)
scaffold0109 (4-276)||(5882-6152)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (38-211)||(9397-9567)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (38-276)||(33530-33766)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (139-333)||(23517-23711)
scaffold0146 (4-192)||(22322-22508)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (4-205)||(8905-9106)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (45-276)||(15152-15381)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (6-293)||(145895-146180)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (113-276)||(47280-47442)
scaffold0042 (139-294)||(28433-28589)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (7-276)||(388-652)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (4-276)||(11340-11609)
scaffold0439 (17-105)||(3768-3856)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (4-172)||(29442-29608)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (17-276)||(10545-10787)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-196)||(78322-78514)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (4-172)||(29894-30062)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (145-276)||(1196-1326)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (185-281)||(1653-1749)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (4-103)||(1062-1161)
scaffold1186 (97-186)||(830-918)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (4-103)||(187107-187206)
scaffold0005 (97-186)||(187350-187438)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (7-132)||(7542-7666)
scaffold0104 (7-132)||(14173-14297)
scaffold0104 (77-132)||(16575-16630)
scaffold0104 (77-132)||(18595-18650)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (6-104)||(39449-39547)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (4-105)||(1069-1170)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (4-105)||(15188-15289)
scaffold0061 (4-105)||(24246-24347)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (105-234)||(645-771)
scaffold0083 (105-234)||(5949-6075)
scaffold0083 (4-95)||(584-675)
scaffold0083 (4-95)||(5888-5979)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (4-105)||(25865-25966)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (103-207)||(34097-34201)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (139-276)||(20821-20958)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (103-262)||(6807-6966)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (17-95)||(168796-168874)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (7-100)||(21422-21515)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (104-260)||(3224-3380)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (7-105)||(6862-6960)
scaffold0292 (105-169)||(6840-6902)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (4-94)||(7109-7199)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (114-264)||(411-562)
scaffold0409 (114-264)||(8666-8817)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (102-276)||(127500-127674)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (17-105)||(21001-21089)
scaffold0018 (105-169)||(20979-21041)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (7-94)||(13270-13357)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (7-94)||(120270-120357)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (103-262)||(297-456)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (103-262)||(10863-11022)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (131-262)||(370-502)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (102-264)||(66196-66357)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (4-73)||(66634-66703)
scaffold0004 (123-207)||(59585-59669)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (17-105)||(5941-6029)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (131-234)||(6123-6225)
scaffold0309 (131-234)||(8275-8377)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (17-105)||(3619-3707)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (4-78)||(11948-12022)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (4-78)||(27676-27750)
scaffold0125 (280-333)||(27435-27488)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (131-262)||(40958-41090)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (4-78)||(36118-36192)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (131-207)||(5066-5143)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (17-78)||(16585-16646)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (132-262)||(8244-8375)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (17-78)||(62585-62646)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (145-262)||(1276-1394)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (4-64)||(1475-1535)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (277-333)||(1970-2026)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (133-207)||(2013-2088)
scaffold0123 (7-67)||(16325-16385)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (151-218)||(764-830)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (123-234)||(127144-127252)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (132-233)||(2724-2824)
[»] scaffold0379 (3 HSPs)
scaffold0379 (224-293)||(4616-4685)
scaffold0379 (224-293)||(14662-14731)
scaffold0379 (17-78)||(10087-10148)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (132-262)||(2893-3024)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (56-100)||(390-434)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (132-195)||(1549-1613)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (168-262)||(143-237)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (4-64)||(28970-29030)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (4-64)||(9445-9505)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (132-195)||(6053-6117)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (4-64)||(21123-21183)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (7-78)||(1283-1354)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (4-67)||(7904-7967)
scaffold0529 (97-217)||(7576-7694)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (17-64)||(7523-7570)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (4-67)||(5104-5167)
scaffold0241 (8-67)||(1951-2010)
scaffold0241 (97-186)||(1654-1742)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (4-67)||(7383-7446)
scaffold0108 (139-207)||(5657-5726)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (139-234)||(53378-53471)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (7-78)||(142989-143060)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (102-196)||(136323-136416)
scaffold0008 (148-262)||(12260-12375)
[»] scaffold1695 (2 HSPs)
scaffold1695 (97-186)||(625-713)
scaffold1695 (65-105)||(665-705)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (4-62)||(3123-3181)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (105-143)||(63835-63873)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (56-105)||(3984-4033)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (139-207)||(8304-8373)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (17-78)||(18741-18802)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (116-191)||(2652-2727)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (281-333)||(18843-18894)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (132-207)||(3120-3196)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (4-67)||(7455-7518)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (145-207)||(16004-16067)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (4-67)||(34652-34715)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (299-333)||(10066-10100)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (139-207)||(19387-19456)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (300-333)||(4210-4243)
scaffold0174 (300-333)||(10332-10365)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (38-78)||(2470-2510)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (168-262)||(159723-159817)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 27126079 - 27126408
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27126079 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatttaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 27126178  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27126179 gttgttgaataatttgagttacataaatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 27126278  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27126279 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 27126378  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27126379 tgtctttaaagttgtaagttgttgtcgatg 27126408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 24 - 326
Target Start/End: Original strand, 15891327 - 15891627
Alignment:
Q  24 ctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagtt 123  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15891327 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatcttt--tggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagtt 15891424  T
Q  124 acatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15891425 acatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgt 15891524  T
Q  224 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagtt 323  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15891525 tgttgtctctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagtt 15891624  T
Q  324 gtt 326  Q
    |||    
T  15891625 gtt 15891627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31734158 - 31733869
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31734158 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggataattagaaatacatatattatgtgaatgtt 31734059  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31734058 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgttat 31733959  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733958 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 31733869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 17318724 - 17319014
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17318724 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatatt 17318823  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318824 gttcttgaattatttgagttatatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 17318923  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17318924 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattatatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17319014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 23150868 - 23151075
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23150868 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 23150967  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23150968 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctat 23151067  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  23151068 gttgtgaa 23151075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18708949 - 18708743
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18708949 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 18708850  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18708849 gttgttgaataatttgagttacatatagttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt-ttattattaatgatgctat 18708751  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  18708750 gttgtgaa 18708743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7827422 - 7827234
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7827422 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattggaaatacatatattatgtgaatgtt 7827323  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827322 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattatt 7827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 7825913 - 7825767
Alignment:
Q  187 attattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 286  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7825913 attattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattactaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaag 7825814  T
Q  287 ttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7825813 ttgtaagttgttgtcaatgttgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 7825767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 27318154 - 27318314
Alignment:
Q  1 tatggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27318154 tatggtgtttaagagtatttaacctacgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaat 27318253  T
Q  101 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaata 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27318254 gttgttgttgaataatttaagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatataaaata 27318314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18703010 - 18702889
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttg 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18703010 tttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttg 18702911  T
Q  108 ttgaataatttgagttacatat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18702910 ttgaataatttgagttacatat 18702889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24441261 - 24441112
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  24441261 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatattgaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caag 24441163  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24441162 ttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 24441112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28947794 - 28947693
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28947794 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 28947695  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  28947694 gt 28947693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Original strand, 31735629 - 31735821
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31735629 tgttgttggttaatttgaaatacatatatt-atgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattattaatgttgct 31735727  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    |||||   |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  31735728 atgtt-acaagttgttttatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 31735821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 19655831 - 19655932
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  19655831 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattcgagatacatatattatgtgaatatt 19655930  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  19655931 gt 19655932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 23491773 - 23491874
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23491773 ggtgtttaagagtatctaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatatt 23491872  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  23491873 gt 23491874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 23497371 - 23497472
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  23497371 ggtgtttaagagtatctaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatatt 23497470  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  23497471 gt 23497472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Original strand, 22212214 - 22212407
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22212214 tgttgttggttaatttgagatacatatatt-atgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgtt 22212312  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg-atgtattgatta-ttaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
     |||||  |||||||| |||||||||| |||||  | | ||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22212313 gtgttg-caagttgttttatgttgctgcctctgcttttgttgattatttatatcataaagttgcaagtgttggtctaagttgtctaagttgtaagt 22212407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 27322172 - 27322227
Alignment:
Q  156 aaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27322172 aaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgctatgttgtgaa 27322227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23655767 - 23655665
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg 164  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  23655767 ttgttgaataatttaaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaatattttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatg 23655670  T
Q  165 ttgtt 169  Q
    |||||    
T  23655669 ttgtt 23655665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Original strand, 13751060 - 13751219
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13751060 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 13751158  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13751159 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 13751219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 15705216 - 15705314
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15705216 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15705314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 19773314 - 19773412
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19773314 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttgattggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19773412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18658524 - 18658448
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18658524 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 18658448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22806249 - 22806182
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  22806249 atctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttaagatacatatattatgtgaatattgt 22806182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16245416 - 16245370
Alignment:
Q  224 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16245416 tgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtt 16245370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23655802 - 23655740
Alignment:
Q  70 ggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23655802 ggataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttaaaatacatatatt 23655740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 611058 - 610927
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  611058 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 610961  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  610960 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 610927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 29848239 - 29848370
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  29848239 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 29848336  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  29848337 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 29848370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 19444016 - 19444092
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  19444016 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 19444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13285159 - 13285085
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13285159 ggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgtttgatgattt 13285085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 5110534 - 5110628
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5110534 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5110628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 16133406 - 16133482
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  16133406 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 16133482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19234647 - 19234584
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19234647 ggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 19234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22556696 - 22556625
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | ||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22556696 gtttaagagtatttaacctattttgtgatggatctaacttggtttaacgtgaatatctttgttggatgattt 22556625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25921180 - 25921117
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921180 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaaactaacttggtttgacgtgaatatctttg 25921117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 23497614 - 23497702
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23497614 gaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23497702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29044712 - 29044650
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29044712 ggtgtttaagagtatataacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 29044650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 32259298 - 32259224
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  32259298 ggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctctgttagatgattt 32259224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25920834 - 25920781
Alignment:
Q  280 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25920834 gttaaagttataagttgtggtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25920781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 5289893 - 5289987
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  5289893 ttatatcattcgagttgttattattaccgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 5289987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13764652 - 13764592
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13764652 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13764592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18585070 - 18585007
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18585070 ggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 18585007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 23492016 - 23492104
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23492016 gaattttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaagagtgttgttcatatcattcaagttgtt 23492104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23655673 - 23655639
Alignment:
Q  98 aatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23655673 aatgttgttgttgaataatttgaggtacatatatt 23655639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24267111 - 24266952
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  24267111 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtgaaaaatgtatgatataaaaaatgtccttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 24267013  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24267012 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 24266952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Original strand, 30674292 - 30674326
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30674292 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 30674326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 19829695 - 19829764
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  19829695 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttg 19829764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 19773372 - 19773434
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19773372 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 19773434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 46386686 - 46387012
Alignment:
Q  1 tatggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386686 tatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 46386785  T
Q  101 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386786 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 46386885  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  46386886 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgt 46386985  T
Q  301 caatgtcgttaaatttgtaagttgttg 327  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  46386986 caatgtcgttaaagttgtaagatgttg 46387012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20585806 - 20585477
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20585806 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaacatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 20585707  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20585706 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 20585607  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20585606 gtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 20585507  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20585506 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 20585477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44374396 - 44374067
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44374396 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 44374297  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44374296 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 44374197  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  44374196 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 44374097  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44374096 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 44374067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44383261 - 44382932
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44383261 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 44383162  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44383161 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 44383062  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  44383061 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 44382962  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44382961 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 44382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19282542 - 19282213
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19282542 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 19282443  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19282442 gttgttgaataatttgagttacatatatttatatggaaaagatataatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaacgatgctat 19282343  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19282342 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgtttgtcaagttgttaaaattgtaagttgttgtcaa 19282243  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19282242 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 19282213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 12465864 - 12466191
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12465864 tgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 12465963  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12465964 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagtaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgt 12466063  T
Q  206 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatg 305  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12466064 tgttaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattaataaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatg 12466163  T
Q  306 tcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12466164 tcgttaaagttgcaagttgttgtcgatg 12466191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 13148074 - 13148281
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13148074 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 13148173  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148174 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgcggaaaaggtatgatatagaaaataatatttttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 13148273  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  13148274 gttgtgaa 13148281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 12127766 - 12127973
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12127766 ggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacacatattatgtgaatgtt 12127865  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12127866 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactat 12127965  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  12127966 gttgtgaa 12127973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11066918 - 11066711
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11066918 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaagtacatatattatgtgaatgtt 11066819  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066818 gtcgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatggaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 11066719  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  11066718 gttgtgaa 11066711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Original strand, 37785076 - 37785257
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37785076 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 37785175  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  37785176 ttgttgtatgttgctgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaagattgtcaagttgtaagt 37785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12371723 - 12371521
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12371723 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 12371624  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 205  Q
    ||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371623 tg---aataatttgagttatatatatttacgtggaaaaagtatgatatagaaaataaagtttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 12371527  T
Q  206 tgtgaa 211  Q
    ||||||    
T  12371526 tgtgaa 12371521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 32434191 - 32434392
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgtttt-aatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgt 102  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  32434191 ggtgtttaagagtatttaatctatgttatgaaaggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatat 32434290  T
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32434291 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttgttattaatgatgtta 32434390  T
Q  203 tg 204  Q
    ||    
T  32434391 tg 32434392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Original strand, 18875646 - 18875799
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875646 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 18875745  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18875746 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 18875799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Original strand, 43277546 - 43277699
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277546 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 43277645  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43277646 ttactgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 43277699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3287247 - 3287100
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3287247 tacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 3287148  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3287147 ttgctgt------tgtattgattattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 3287100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 14928950 - 14929100
Alignment:
Q  20 taacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttg 119  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14928950 taacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttg 14929049  T
Q  120 agttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 172  Q
    || |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14929050 agatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 14929100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 15352416 - 15352566
Alignment:
Q  20 taacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttg 119  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15352416 taacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataacttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttg 15352515  T
Q  120 agttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 172  Q
    || |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15352516 agatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 15352566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11053976 - 11053785
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11053976 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 11053878  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    || |||  ||||| || ||||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11053877 atattg-caagttctt-tatgttgttgtctatgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 11053785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33001364 - 33001273
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatg 95  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33001364 ggtgtttaagagaatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatg 33001273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15720226 - 15720137
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatta 93  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720226 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatta 15720137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Original strand, 1489907 - 1489974
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1489907 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 1489974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33001303 - 33001177
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| || ||||||| | |||||||    
T  33001303 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaatgtatgatatagaaaattatgttgttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatg 33001206  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33001205 ttg-caagttgttttatgttgctgtctctg 33001177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15281607 - 15281505
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    ||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  15281607 tgttgttggttattttgaattacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttatta-taatgttgcta 15281510  T
Q  203 tgttg 207  Q
    |||||    
T  15281509 tgttg 15281505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14258799 - 14258701
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14258799 gtttaagagtatttaacatttgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14258701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 8757130 - 8757261
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8757130 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8757227  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8757228 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 8757261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 40555477 - 40555608
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  40555477 ttatatggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 40555574  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  40555575 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 40555608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 16460547 - 16460635
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  16460547 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16460635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16580097 - 16580009
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  16580097 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16580009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 16585566 - 16585654
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  16585566 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 16585654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Original strand, 3289548 - 3289687
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| |||    
T  3289548 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttg-caagttgtt-tat 3289644  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||    
T  3289645 gttgttgtctctgttgttgttgattattaataccattaagttg 3289687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 32301629 - 32301531
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  32301629 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatatttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 32301531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 18875451 - 18875522
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18875451 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 18875522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 13745802 - 13745876
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13745802 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttcacgtgaatatctttgttggatgattt 13745876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 14161456 - 14161530
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14161456 ggtgtttaagattatttaacctatgttttgatggatcttacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 14161530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20487880 - 20487792
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  20487880 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttgctcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 20487792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 228
Target Start/End: Original strand, 21735237 - 21735331
Alignment:
Q  133 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctg 228  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  21735237 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctg 21735331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 15096386 - 15096495
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  15096386 gaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaat 15096483  T
Q  196 gatgctatgttg 207  Q
    | || |||||||    
T  15096484 gttgttatgttg 15096495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 13745378 - 13745452
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13745378 ggtgtttcagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 13745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25941888 - 25941814
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25941888 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaactaacttggtttgacgtgaatatctttattggatgattt 25941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3287434 - 3287373
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3287434 atttaacgtatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 3287373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4325374 - 4325310
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4325374 ttatgttgaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 4325310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13408090 - 13408014
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13408090 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 13408014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 13865120 - 13865196
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13865120 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttg 13865196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13894545 - 13894485
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13894545 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggcttgacgtgaatatct 13894485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 19558026 - 19558135
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  19558026 gaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatatagttgttcatatcattcaagttgttgttattgat 19558123  T
Q  196 gatgctatgttg 207  Q
    | || |||||||    
T  19558124 gttgttatgttg 19558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 24270583 - 24270646
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24270583 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatttaacttggtttgacgtgaatatctttg 24270646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 258
Target Start/End: Original strand, 832757 - 832884
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  832757 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 832854  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 258  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  832855 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 832884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 258
Target Start/End: Original strand, 1197937 - 1198064
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  1197937 ttatgaggaaaatgtatgataaagaaaatatcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 1198034  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaa 258  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||    
T  1198035 tctgttgttgttgattattaatatcattaa 1198064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 8851774 - 8851835
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  8851774 atttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatcgttgttggatgattt 8851835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 4691497 - 4691560
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4691497 ggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtgatgaatctaactaggtttgacgtgaatatctttg 4691560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 14161683 - 14161749
Alignment:
Q  151 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14161683 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgtcatgttgt-aagttgttg 14161749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 15576432 - 15576495
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15576432 ggtgtttaagggtatttaacttatgttgtgattaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 15576495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20619733 - 20619662
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  20619733 gtttaagagtatttaacctacgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 20619662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 43277349 - 43277420
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  43277349 gtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaacttggtttagcgtgaatatctttgttggatgattt 43277420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 48213546 - 48213609
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  48213546 ggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgcgaatatctttg 48213609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Original strand, 12755442 - 12755504
Alignment:
Q  134 atgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12755442 atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatataattcaagttgttatgattaat 12755504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 13133258 - 13133346
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13133258 gaatattgttgctgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 13133346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 14219714 - 14219802
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14219714 gaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aagtattgttgttcatatcattcaagttgtt 14219802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15139468 - 15139364
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |  |||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| ||     
T  15139468 ttgttgttggataatttgagatacatatatt-atgtgaacattgtatgatatagaaa-tattgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgt 15139371  T
Q  201 tatgttg 207  Q
    |||||||    
T  15139370 tatgttg 15139364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43747629 - 43747595
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43747629 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 43747595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 105
Target Start/End: Original strand, 13133067 - 13133116
Alignment:
Q  56 tgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13133067 tgaatatcgttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 13133116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 17071030 - 17071099
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17071030 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 17071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309537
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaat 11309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Original strand, 14191839 - 14191887
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14191839 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 14191887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 14219722 - 14219762
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14219722 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14219762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14258741 - 14258679
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14258741 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 14258679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 15096394 - 15096434
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  15096394 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 15096434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 16077664 - 16077624
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  16077664 ttgttggataatttgaaatacatgtattatgtgaatattgt 16077624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 16460595 - 16460657
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16460595 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16460657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16580049 - 16579987
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16580049 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16579987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 16585614 - 16585676
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16585614 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 16585676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 19558034 - 19558074
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19558034 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 19558074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 32301571 - 32301509
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  32301571 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 32301509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 46473534 - 46473490
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggttt 51  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  46473534 gtttaagagtatttaacctatgttttaatggatctaacttggttt 46473490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 35065182 - 35065511
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35065182 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 35065281  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35065282 gttgttgaacaatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 35065381  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35065382 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 35065481  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35065482 tgtcgttaaagttataagttgttgtcgatg 35065511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11258917 - 11258592
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11258917 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatataatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 11258818  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11258817 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 11258718  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11258717 gttgtgaagttgtagtatgttgatgtttctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 11258618  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  11258617 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 11258592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 35354046 - 35353720
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35354046 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtt 35353947  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35353946 gttgaataattttagttacatatatttatgtggaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttataccttttaagttgttattattaattatgctatgtt 35353847  T
Q  207 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgt 306  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35353846 gtgaagttgttgtatgttgttgtctctgttgtatttattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgt 35353747  T
Q  307 cgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35353746 cgttaaagttgtaagttgttatcgatg 35353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 327
Target Start/End: Original strand, 17519475 - 17519799
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17519475 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 17519574  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17519575 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttat 17519674  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  17519675 attgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgttttca 17519774  T
Q  303 atgtcgttaaatttgtaagttgttg 327  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17519775 atgtcgttaaagttgtaagatgttg 17519799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 4 - 327
Target Start/End: Original strand, 17534337 - 17534661
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17534337 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 17534436  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17534437 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttat 17534536  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattga-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtca 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  17534537 attgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgatttattaaatcattaagttgcatatgttggtgaagttgttaaagttgtaagttgttttca 17534636  T
Q  303 atgtcgttaaatttgtaagttgttg 327  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17534637 atgtcgttaaagttgtaagatgttg 17534661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 293
Target Start/End: Original strand, 41172976 - 41173263
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41172976 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatgtaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtt 41173075  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173076 gttgaagaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 41173175  T
Q  207 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41173176 gtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 41173263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Original strand, 2842064 - 2842379
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2842064 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatatgaaatacatatattatgtgaatgtt 2842163  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2842164 gttgttgaataatttgtgttacacatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagtttttattattaatgatgctat 2842263  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  2842264 gttgtgaagttgt----------tgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcca 2842353  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  2842354 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtc 2842379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 5206253 - 5206535
Alignment:
Q  1 tatggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5206253 tatggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 5206352  T
Q  101 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206353 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 5206452  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5206453 tatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatattggtctaagttgtt 5206535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14508298 - 14508012
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14508298 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaatgtt 14508199  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508198 gttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtattatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 14508102  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508101 gttgtgaagttgttgtatgtttttgtcttttttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 14508012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 15932109 - 15932398
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15932109 ggtgtttaagagtatttcatctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 15932208  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15932209 gttgttgaataatttgagttacatatgtttatgtggaaattgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 15932308  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15932309 gttgtgaagttgttgtatgctgctgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgtatatgttggtcaagttgtttaaattgtaag 15932398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17693518 - 17693236
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17693518 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 17693419  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693418 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatataccattcaagttgttattattaatgatgctat 17693319  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17693318 gttgtgaagttgttgtatgttgatgtct--------ttgattattaaattattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 17693236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44273920 - 44273705
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttg 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44273920 tttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttg 44273821  T
Q  108 ttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44273820 ttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 44273721  T
Q  208 tgaagttgttgtatgt 223  Q
    || |||||||||||||    
T  44273720 tggagttgttgtatgt 44273705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 105 - 333
Target Start/End: Original strand, 19884226 - 19884454
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19884226 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgttatg 19884325  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaat 304  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19884326 ttatggagttgttgtatgttgatgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaat 19884425  T
Q  305 gtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19884426 gtcgtcaaagttttaagttgttgtcgatg 19884454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 22307185 - 22307392
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22307185 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 22307284  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22307285 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 22307384  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  22307385 gttgtgaa 22307392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17538557 - 17538350
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17538557 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 17538458  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17538457 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttgttattattaatgaagctat 17538358  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  17538357 gttgtgaa 17538350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 40807446 - 40807239
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40807446 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 40807347  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40807346 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttattattattaatgatgctat 40807247  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  40807246 gttgtgaa 40807239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16728624 - 16728443
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16728624 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaag 16728525  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||    
T  16728524 ttgttgtatgttgttgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaggttgtcaagttgtaagt 16728443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Original strand, 14153191 - 14153344
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153191 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 14153290  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14153291 ttactgtctctgatgtattcattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 14153344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Original strand, 50348806 - 50348977
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    |||||||||  |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50348806 ttgttgttggttaatgtgaaatacatgtatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataccattcaagttgttattattaatgatgct 50348905  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50348906 atgttgtgaa---gttgtatgttgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 50348977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Original strand, 45531332 - 45531496
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45531332 taatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatataaaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaag 45531431  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45531432 ttgttgtatgttattgtctctgctgttattgattatttaatcattaagttgcatatgtaggtcaa 45531496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5215159 - 5215026
Alignment:
Q  160 taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5215159 taatgttgttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaag 5215060  T
Q  260 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215059 ttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 5215026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 194
Target Start/End: Original strand, 42353279 - 42353463
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42353279 gtttaagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaatg-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtt 42353377  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42353378 gttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaa 42353463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 44269768 - 44269650
Alignment:
Q  215 gttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaat 314  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  44269768 gttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaag 44269669  T
Q  315 ttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44269668 ttgtaagttgttgtcgatg 44269650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13519729 - 13519549
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13519729 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggcgaatttgaaatacatatattatatgaatgttgtt 13519631  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttatta 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13519630 gttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatatcgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttatta 13519549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10563019 - 10562881
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 237  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  10563019 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttatctctgctg 10562920  T
Q  238 tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10562919 tattgatgattaaatcattaagtttcatatgttagtcaa 10562881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17046612 - 17046511
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  17046612 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 17046513  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  17046512 gt 17046511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 54876085 - 54876186
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  54876085 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 54876184  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  54876185 gt 54876186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 9511767 - 9511863
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9511767 ggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 9511863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Original strand, 9519742 - 9519838
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9519742 ggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaat 9519838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11192531 - 11192430
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  11192531 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatttattatgtgaatatt 11192432  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  11192431 gt 11192430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 17685445 - 17685546
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||| |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  17685445 ggtgtttaagagtatttaatctatcttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattagaaatacatatattatgtgaatatt 17685544  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  17685545 gt 17685546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20417424 - 20417233
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  20417424 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgat 20417326  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20417325 atgttg-caagttgtt-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 20417233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6156156 - 6156055
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||    
T  6156156 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatgttatgtgaatatt 6156057  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  6156056 gt 6156055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14441618 - 14441517
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  14441618 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaattagtttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 14441519  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  14441518 gt 14441517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 105
Target Start/End: Original strand, 17691427 - 17691508
Alignment:
Q  24 ctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  17691427 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgatatacatatattatgtgaatattgt 17691508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 19568970 - 19569072
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatct-aatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgt 102  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  19568970 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaccttaatttggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatat 19569069  T
Q  103 tgt 105  Q
    |||    
T  19569070 tgt 19569072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40811986 - 40811913
Alignment:
Q  254 attaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttg 327  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40811986 attaagttgtatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagatgttg 40811913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17207792 - 17207718
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17207792 ggtgtttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 17207718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13179488 - 13179314
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |      
T  13179488 ttgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg 13179390  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13179389 tatgttg-caagttgttg-atgttgctatctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 13179314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 13523145 - 13523276
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13523145 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtc 13523242  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13523243 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13523276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 18700079 - 18700176
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  18700079 tttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 18700176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 43889405 - 43889502
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  43889405 tttaagagtatttaacatgtgttgtcatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 43889502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12470218 - 12470151
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  12470218 atctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 12470151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 50348631 - 50348702
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50348631 gtttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 50348702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14818370 - 14818211
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14818370 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 14818272  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
     | |||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14818271 gtattg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14818211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24546287 - 24546213
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24546287 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 24546213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 50755983 - 50756057
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50755983 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 50756057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 3394736 - 3394867
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  3394736 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 3394833  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3394834 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 3394867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14671261 - 14671173
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14671261 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14671173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 14682760 - 14682672
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  14682760 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 14682672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 14153004 - 14153075
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14153004 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 14153075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Original strand, 23395786 - 23395925
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||| |||  |||||||| |||    
T  23395786 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattg-caagttgtt-tat 23395882  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23395883 gttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcatgaagttg 23395925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10550587 - 10550510
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10550587 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10550510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 18367492 - 18367623
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  18367492 ttatgtggaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 18367589  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  18367590 tctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 18367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 40812280 - 40812209
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  40812280 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatgtatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 40812209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 50351602 - 50351665
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50351602 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgttatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 50351665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15565964 - 15565890
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15565964 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgttggatctaacttggtttgacgtaaatatctttgttggatgattt 15565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Original strand, 1208848 - 1208901
Alignment:
Q  280 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1208848 gttaaagttgtaagttggtgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11258613 - 11258560
Alignment:
Q  280 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11258613 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgacgatg 11258560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 13520515 - 13520646
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  13520515 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 13520612  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13520613 tctgctgttgttgattagtaatatcattaagttg 13520646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3803160 - 3803066
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  3803160 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 3803066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6819427 - 6819367
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattat 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6819427 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 11850414 - 11850508
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  11850414 ttatatcattctagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 11850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 17548285 - 17548361
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17548285 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 17548361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 19569032 - 19569200
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  | |||||| || |||    
T  19569032 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgctgttaatgttgttat 19569129  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc 274  Q
    | ||  |||||||| | |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  19569130 gatg-caagttgttat-tgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtc 19569200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 338
Target Start/End: Original strand, 50756254 - 50756293
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatgatgtc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50756254 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatgttgtc 50756293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 54330907 - 54330970
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  54330907 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttgatttgacgtgaatatctttg 54330970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6158706 - 6158637
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6158706 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 6158637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Original strand, 10542073 - 10542142
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaataca 86  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10542073 atttaacatgtgttgtgatggatctaacttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagataca 10542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 14642293 - 14642362
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14642293 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 14642362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 52338671 - 52338775
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtt-gttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  52338671 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgct 52338769  T
Q  202 atgttg 207  Q
    ||||||    
T  52338770 atgttg 52338775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 179441 - 179517
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  179441 ttatgtgcaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttg 179517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13516582 - 13516530
Alignment:
Q  210 aagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagtt 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13516582 aagttcttgtatgttgctgtctctgctgttattggttattaaatcattaagtt 13516530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Original strand, 14250861 - 14250952
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  14250861 gaaaatgtatgatatggaaattattattgttata--attcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 14250952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 54520762 - 54520668
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  54520762 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctttgttgttgttgattattaatatcattaagttg 54520668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 333
Target Start/End: Original strand, 50351983 - 50352034
Alignment:
Q  282 taaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351983 taaagttataagttgttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 50352034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 6155985 - 6155897
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6155985 gaatattgttgttgaataatttgagatacatat-gttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 6155897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11192288 - 11192200
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  11192288 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgttcatatcattcaagttgtt 11192200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 14568661 - 14568723
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14568661 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 49900174 - 49900104
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  49900174 tttaagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgcgaatatccttgttggatgattt 49900104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Original strand, 52213183 - 52213272
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattatt 192  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  52213183 tgttgttggttaatttaagttgtatatatt-atgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattatt 52213272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 333
Target Start/End: Original strand, 22842513 - 22842546
Alignment:
Q  300 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22842513 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22842546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37038127 - 37038058
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37038127 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttg 37038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 42324964 - 42325033
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42324964 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttg 42325033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11562776 - 11562678
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  11562776 gaatattgttgttgaataattagagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaat 11562679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12275879 - 12275785
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||| || | || |||||||| ||||||||||||    
T  12275879 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgtt-tcaagttgct-tatgttgctgtttctgctgttgttaattattaatatcattaagttg 12275785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12511295 - 12511227
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataa 75  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  12511295 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaagatctttgttgaataa 12511227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16050172 - 16050114
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt 183  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  16050172 tacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttatatcattcaagtt 16050114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16059555 - 16059489
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattat 191  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16059555 tacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatag-aaatgatgttgttaaatcattcaagttattattat 16059489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 43928801 - 43928741
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||| ||||| | ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43928801 ggtgcttaagagtatttaacatatgttctgatgaatcttatttggtttgacgtgaatatct 43928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 23 - 352
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgttaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 122  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123 gttgttgaataatttgagttacatataattttgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 222  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  223 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 322  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  323 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 20179123 - 20179452
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20179123 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 20179222  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20179223 gttgttgaataatttgagttacgtatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 20179322  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  20179323 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaataattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaggttgttgtcaa 20179422  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20179423 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 20179452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 42818509 - 42818829
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| | | ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42818509 ggtgtttaagagtatttaatctatggtgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatttatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 42818608  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  42818609 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgaggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtttttattattaacgatgatat 42818708  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||||    
T  42818709 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctagtgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt--aagttg-------ttgtcaa 42818799  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42818800 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 42818829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 39936612 - 39936819
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39936612 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 39936711  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936712 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtggttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 39936811  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  39936812 gttgtgaa 39936819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19140215 - 19140008
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19140215 ggtgtttaacagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 19140116  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140115 cttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 19140016  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  19140015 gttgtgaa 19140008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 20084253 - 20084508
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataat 116  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  20084253 atttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttgaataatttgaaatacatatactatatgaatgttcttgttgaataat 20084351  T
Q  117 ttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgt 216  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| | | |||||||    
T  20084352 ttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatata-aaaataatgttgttatacca-tcaagtggttattattaatgttgttatgat-tcaagttgt 20084447  T
Q  217 tgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20084448 tgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaattattaagttgcatatgttggtcaa 20084508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 276
Target Start/End: Original strand, 22259106 - 22259243
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22259106 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgt 22259205  T
Q  239 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22259206 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 22259243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 165 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24713457 - 24713329
Alignment:
Q  165 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgca 264  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713457 ttgttatatcattcaaattgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgca 24713358  T
Q  265 tatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24713357 tatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 24713329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Original strand, 6102359 - 6102536
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttg 107  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  6102359 tttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtta 6102457  T
Q  108 ttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttat 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  6102458 ttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttat 6102536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23947531 - 23947374
Alignment:
Q  117 ttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 215  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  23947531 ttgagctacatatatt-atgtggaaatg-tatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 23947435  T
Q  216 ttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc 274  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  23947434 ttttatgttgctgtctctgctgttattgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtc 23947374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17217920 - 17217771
Alignment:
Q  116 tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttg 215  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  17217920 tttgaattacatatatt-atgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttg-caagttg 17217823  T
Q  216 ttgtatgttgctgtctctgatg-tattg-attattaa-atcattaagttgca 264  Q
    || |||||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17217822 ttttatgttgctgtctctgctgttgttgaattattaatatcattaagttgca 17217771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5760983 - 5760882
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  5760983 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaaattggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 5760884  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  5760883 gt 5760882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 294
Target Start/End: Original strand, 17907695 - 17907867
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  17907695 tacatatatt-atgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattattaatgttgctatgttg-caagttgttttat 17907792  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattatt-aaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  17907793 gttgttgtctctgctgttgttgattattgatatcattaagttgcaaatgttagtctaagttg-caaagttgtaagt 17907867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23889070 - 23888879
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||    
T  23889070 tgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaatgtagct 23888972  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  23888971 gtgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctattgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 23888879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22244729 - 22244557
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||    
T  22244729 tacatatatt-atgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattattaatgtttctatgttg-caagttgttttat 22244632  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  22244631 gttgatgtctctgctgttattgattattaatatcattaaattgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 22244557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 264
Target Start/End: Original strand, 22584461 - 22584602
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  22584461 tacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatgttg-caagttgtt-tat 22584557  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22584558 gttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 22584602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 21346014 - 21346102
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  21346014 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21346102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23914361 - 23914273
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23914361 atttaacatgtgttatgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatgttgt 23914273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22344492 - 22344418
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22344492 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22344418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22356152 - 22356078
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22356152 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22356078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 20517719 - 20517793
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20517719 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgcgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 20517793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36305107 - 36305035
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36305107 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatacctttgttggatgattt 36305035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 4381394 - 4381457
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381394 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 4381457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22483197 - 22483123
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22483197 ggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 22483123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 361814 - 361874
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  361814 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgatgtgaatatct 361874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Original strand, 36728026 - 36728124
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  36728026 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaat 36728123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 18817063 - 18817126
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18817063 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatgtaacttggtttgacgtgaatatctttg 18817126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Original strand, 22318656 - 22318765
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  22318656 gaatattgttgttggataatttgagatacatatatt-acgtggatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaat 22318753  T
Q  196 gatgctatgttg 207  Q
    | || |||||||    
T  22318754 gttgttatgttg 22318765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22474202 - 22474139
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22474202 ggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 22474139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20454541 - 20454426
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 245  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  20454541 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 20454444  T
Q  246 attaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  20454443 attaatatcattaagttg 20454426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 15635914 - 15635978
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15635914 ttatgaggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 15635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19882267 - 19882207
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19882267 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 19882207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20455298 - 20455238
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20455298 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20455238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20460276 - 20460216
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20460276 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 20460216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Original strand, 31723310 - 31723408
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  31723310 gaatattgttgttaaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaat 31723407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32950051 - 32949991
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32950051 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgttgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 32949991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18833918 - 18833847
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  18833918 gtttaagagtatttaacctatatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 18833847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 17979018 - 17979080
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17979018 ggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 17979080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 18815425 - 18815487
Alignment:
Q  5 gtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18815425 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttcacgtgaatatatttg 18815487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22344236 - 22344202
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22344236 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22344202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22355896 - 22355862
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22355896 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22355862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36304911 - 36304877
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36304911 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 36304877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 36733128 - 36733178
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36733128 atttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgttaatatctttg 36733178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38988500 - 38988466
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38988500 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 38988466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 39019597 - 39019563
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39019597 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 39019563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12577058 - 12577009
Alignment:
Q  280 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 329  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12577058 gttaaagttgtaagttgttgtcgatgtcgataaagttgtaagttgttgtc 12577009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12577070 - 12577033
Alignment:
Q  296 tttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12577070 tttgtccatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 12577033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 39695271 - 39695340
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39695271 gaaaatgtatgatataaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 39695340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 5082848 - 5082888
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  5082848 atctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 5082888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 21346062 - 21346124
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21346062 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 21346124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42875249 - 42874924
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42875249 ggtgtttaggagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 42875150  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875149 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 42875050  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42875049 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 42874950  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtc 329  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||    
T  42874949 tgtcgttaaagttgtaagttggtgtc 42874924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16997980 - 16997649
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16997980 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 16997881  T
Q  104 gttgttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16997880 gttgttgttgaataatttgagttacttatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgc 16997781  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16997780 tatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcacatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgt 16997681  T
Q  301 caatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgat 332  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16997680 caatgtcattaaagttgtaagttgttgtcgat 16997649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11425405 - 11425075
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11425405 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgtatgtt 11425306  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-taatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11425305 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaataggtatgatatagaaaaataatattgttatatcattcatgttgttattattaatgatgcta 11425206  T
Q  203 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtca 302  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11425205 tgttgtgaagttgatgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtca 11425106  T
Q  303 atgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11425105 atgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 11425075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25091103 - 25090774
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25091103 ggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtgatggatctaatttgctttgacgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 25091004  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25091003 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgttat 25090904  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  25090903 gttgtgaagttgttgtgtgttgttttctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcat 25090804  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25090803 tgtcattaaagttgtaagttgttgtcgatg 25090774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14549076 - 14548773
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14549076 ggtgtttaagagtatttagcctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14548977  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14548976 gttgttgaataatttgagttacatatatgtatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 14548877  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||  ||||| |    
T  14548876 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatttgttgtttatgttgttaaagttgtaagttgttgtcga 14548777  T
Q  304 tgtc 307  Q
    ||||    
T  14548776 tgtc 14548773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 10357038 - 10357328
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10357038 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatcttatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 10357137  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10357138 gttgatgaataatttgagttacatatatttacgtagaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttat 10357237  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10357238 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 10357328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 123 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37018929 - 37018719
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37018929 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 37018830  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagt 322  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37018829 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtccagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttgtaagt 37018730  T
Q  323 tgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||    
T  37018729 tgttgtcgatg 37018719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19609774 - 19609567
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19609774 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgcgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 19609675  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609674 gttgttgaataatttgagtgacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaaaccattcaagttgttattattaatgatgctat 19609575  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  19609574 gttgtgaa 19609567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3485361 - 3485091
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || || | |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3485361 ggtgtttaagagtatctagcatatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 3485262  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3485261 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 3485164  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485163 gat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 3485091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 123 - 294
Target Start/End: Original strand, 19435498 - 19435669
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19435498 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 19435597  T
Q  223 ttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||    
T  19435598 ttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaatttgtcaagttgtaagt 19435669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 33243959 - 33244129
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33243959 ttgttgaataatttgagatacatatattg-tgtgaataaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 33244057  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33244058 ttgtgaagttattgtatgttgatgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaa 33244129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19734687 - 19734471
Alignment:
Q  53 acgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgata 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||||     
T  19734687 acgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgat- 19734590  T
Q  153 tagaaaataatgttgttataccattc-aagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa 250  Q
          |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19734589 ------ataatgttgttataccatccaaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgttgtctctgttgttattgattattaa 19734497  T
Q  251 atcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  19734496 atcattaagttgcatatgatggtcaa 19734471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14630276 - 14630177
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14630276 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14630177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 53631075 - 53631176
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  53631075 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 53631174  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  53631175 gt 53631176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Original strand, 13036381 - 13036479
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttg 104  Q
    |||||||| | ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13036381 tgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggataatttaaaatacatatattatgtgaatgttg 13036479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 234
Target Start/End: Original strand, 4615772 - 4615901
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4615772 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 4615870  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  4615871 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctg 4615901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Original strand, 2584937 - 2585076
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||  |||||||| |||    
T  2584937 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg-caagttgtt-tat 2585033  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2585034 gttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 2585076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21061844 - 21061680
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21061844 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtc 21061746  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    |||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  21061745 tctactgttattgattattaatatcgttaagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 21061680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15344327 - 15344253
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15344327 ggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 15344253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 92
Target Start/End: Original strand, 33243914 - 33243986
Alignment:
Q  20 taacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 92  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33243914 taacctatgttgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatatttttgttgaataatttgagatacatatatt 33243986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 19435303 - 19435374
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19435303 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 19435374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 35660295 - 35660233
Alignment:
Q  5 gtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35660295 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 35660233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6511900 - 6511762
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| || | |||||||| |||    
T  6511900 tacatatatt-atgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatt-tcaagttgtt-tat 6511804  T
Q  222 gttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagtt 261  Q
    |||| || ||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  6511803 gttgttgcctctgttgttgttgattattaatatcattaagtt 6511762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27028053 - 27027922
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  27028053 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 27027956  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27027955 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 27027922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3337549 - 3337489
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3337549 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 3337489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 14933175 - 14933251
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14933175 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 14933251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 26922273 - 26922336
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922273 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 26922336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9638168 - 9638080
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9638168 gaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 9638080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13446778 - 13446642
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtat 221  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | |||    
T  13446778 tacatatatt-atgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgct-tat 13446682  T
Q  222 gttgctgtctctgatgtattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  13446681 gttgttgtctctgttg--ttgattattaatatcattaagttg 13446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 14942381 - 14942512
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||     
T  14942381 ttatgtggaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtt 14942478  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  14942479 tctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 14942512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Original strand, 15448145 - 15448276
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  15448145 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 15448242  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||| || |  |||||||||| ||||||||||||    
T  15448243 tctgctgttgctgattattaatatcattaagttg 15448276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18229974 - 18229899
Alignment:
Q  133 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  18229974 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgctatgttg 18229899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 45314938 - 45315001
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45314938 ggtgtttaagagtatttaacctatgttaagatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 45315001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 14508212 - 14508150
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14508212 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14508150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 19566520 - 19566582
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19566520 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgataaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 19566582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Original strand, 20899466 - 20899625
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  20899466 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 20899564  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  20899565 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctactgttgttgattattaatatcattaagttg 20899625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25513193 - 25513119
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25513193 ggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatagatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 25513119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 26445335 - 26445261
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26445335 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatatatcttggtttgacgtgaatatctttattggatgattt 26445261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 37019119 - 37019053
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttg 70  Q
    |||||||||| | |||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37019119 ggtgtttaagagtatttaacctatgctgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatttttgttg 37019053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 50160222 - 50160165
Alignment:
Q  236 tgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  50160222 tgtattgattattaaatcattaaattgcatatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 50160165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9638316 - 9638247
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9638316 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 9638247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 196
Target Start/End: Original strand, 16026789 - 16026887
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16026789 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtgtgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgctattgttaat 16026886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 49547996 - 49548090
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  49547996 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatattattaagttg 49548090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 55582653 - 55582585
Alignment:
Q  5 gtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 73  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  55582653 gtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaacttgatttgatgtgaatatctttgttggat 55582585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 15114670 - 15114599
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||    
T  15114670 gtttaagagtatttaacctatgtgctgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttcttggatgattt 15114599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14630033 - 14629945
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  14630033 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 14629945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25512694 - 25512660
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25512694 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 25512660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Original strand, 26922555 - 26922589
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26922555 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 26922589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51992832 - 51992738
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  51992832 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 51992738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 21046651 - 21046980
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21046651 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatataatttggtttgatgtgaatatctttgttagataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 21046750  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046751 gttgttgaataatttgagttacatatatctatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 21046850  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21046851 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctcttctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 21046950  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21046951 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 21046980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42912500 - 42912171
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42912500 ggtgtttaagagtatttaatatatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 42912401  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42912400 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 42912301  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42912300 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctttgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 42912201  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42912200 tgtcattaaagttgtaagttgttgtcgatg 42912171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 4596447 - 4596776
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4596447 ggtgcttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatatt 4596546  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596547 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaactaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 4596646  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  4596647 gttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttgatcgagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 4596746  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4596747 tttcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 4596776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 16058916 - 16059245
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16058916 ggtgtttaagattatttaagctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 16059015  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16059016 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 16059115  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16059116 gttgtgaagttggtgtatgtgtttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 16059215  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  16059216 tgtagttaaagttgtaagttgttatcgatg 16059245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 274
Target Start/End: Original strand, 20634240 - 20634507
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20634240 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattatgtgaatgttgtt 20634339  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634340 gttaaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggcatgatataaaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 20634439  T
Q  207 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20634440 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc 20634507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20588129 - 20587838
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20588129 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgtt 20588030  T
Q  104 gttgttgaataa-tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20588029 gttgttgaataaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatacta 20587930  T
Q  203 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20587929 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20587838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20592667 - 20592376
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20592667 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaagacatatattatgtgaatgtt 20592568  T
Q  104 gttgttgaataa-tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20592567 gttgttgaataaatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatacta 20592468  T
Q  203 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  20592467 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgctatattgattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttgtttaagctgtaag 20592376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 105 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19676100 - 19675872
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676100 ttgttggataatttgaaatacatatatttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 19676001  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaat 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19676000 ttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaat 19675901  T
Q  305 gtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19675900 gtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 19675872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Original strand, 14238214 - 14238484
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14238214 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaattttgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 14238313  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||    
T  14238314 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgttat 14238411  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238412 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 14238484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 41227308 - 41227513
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41227308 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgatggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 41227407  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41227408 tgttgaataatttgagttacatacaattatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgt 41227507  T
Q  206 tgtgaa 211  Q
    ||||||    
T  41227508 tgtgaa 41227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Original strand, 7052661 - 7052927
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7052661 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtt 7052759  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  7052760 gttgaataatttgagatacatatatt-aggtgaatattgtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat 7052857  T
Q  207 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
     | |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7052858 -tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 7052927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 38887790 - 38887999
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  38887790 ttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatg 38887887  T
Q  165 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgc 263  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38887888 ttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtttctgctgttattgattattaaatcattaagttgc 38887986  T
Q  264 atatgttggtcaa 276  Q
    |||||||||||||    
T  38887987 atatgttggtcaa 38887999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51082666 - 51082496
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51082666 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 51082567  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccat 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51082566 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccat 51082496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 38887693 - 38887817
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38887693 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtggatatctttgttggataagttgaaatacatatattatatgaatgttgtt 38887791  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  38887792 gttgaataatttgaaatacatatatt 38887817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 21239911 - 21239998
Alignment:
Q  18 tttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21239911 tttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 21239998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 51323725 - 51323628
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatg 101  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51323725 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatg 51323628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19676161 - 19676073
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 92  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676161 ggtgtttaagagtatttaatatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatatt 19676073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42697031 - 42696937
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42697031 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttg-caagttgttttatgttgttgtctctg 42696937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 52983491 - 52983332
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  52983491 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgtt 52983393  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg-atgtattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  52983392 atgttg-caagttgct-tatgttgatgtctctgcagttgttgattattaatatcattaagttg 52983332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18275241 - 18275157
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18275241 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttg 18275157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 39060544 - 39060472
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39060544 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 39060472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51476322 - 51476131
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51476322 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattattaatgttgct 51476224  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| | |||||  || | ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  51476223 atgttg-caagttgtt-tatgttgttctctctactgttgttgattattaatatcattaagctgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 51476131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1643046 - 1642972
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1643046 ggtgtttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttgatttgacgtgaatatctttgttggatgattt 1642972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1642750 - 1642657
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  1642750 gaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 1642657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12710338 - 12710264
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  12710338 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctaggttggatgattt 12710264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Original strand, 41226055 - 41226116
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41226055 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 41226116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 22824008 - 22824082
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22824008 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaacttagtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 22824082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 7792586 - 7792662
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7792586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 7792662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 13528528 - 13528604
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  13528528 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 13528604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 44822855 - 44822919
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44822855 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaat 44822919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 50544302 - 50544239
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50544302 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatatttg 50544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18121055 - 18120993
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18121055 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18120993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18270587 - 18270518
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattatt 192  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18270587 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatt 18270518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18823952 - 18823793
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  || |    
T  18823952 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgtt 18823854  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  18823853 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcagtaagttg 18823793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 207
Target Start/End: Original strand, 21181073 - 21181135
Alignment:
Q  146 tatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21181073 tatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 21181135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 38057394 - 38057463
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38057394 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 38057463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 45496391 - 45496326
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 73  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45496391 tttaagagtatttaacctatgttgtgattaatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggat 45496326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813333
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 10813333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 11809199 - 11809259
Alignment:
Q  18 tttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11809199 tttaacctatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgattt 11809259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13302135 - 13302045
Alignment:
Q  100 tgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 191  Q
    |||||||||||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13302135 tgttgttgttgtttaatttgagatctatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13302045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 24815586 - 24815647
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24815586 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgtt--tatatcattcaagttgttattattaat 24815647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6833416 - 6833382
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6833416 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 6833382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 24720295 - 24720357
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24720295 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgcgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 24720357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45496176 - 45496142
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45496176 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 45496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 19761968 - 19762037
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19761968 gaaaatgtatgatatggaaattattattgattatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 19762037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23073322 - 23073262
Alignment:
Q  18 tttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23073322 tttaacttatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgattt 23073262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 48301379 - 48301315
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgg 71  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | ||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48301379 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatagatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgg 48301315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 28653104 - 28653433
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  28653104 ggtgtttaagagtatttaacatatcttgtgatggatctaatttggtttcacgtgaatatctttgttggataatttgaaatgcatatattacgtgaatgtt 28653203  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653204 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagataataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 28653303  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28653304 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 28653403  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28653404 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 28653433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17306937 - 17306608
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17306937 ggtgtttaagatcatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaatgtt 17306838  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17306837 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataaaattcaagttgttattattaatgatgctat 17306738  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17306737 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattaattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtatgttgttgtcaa 17306638  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17306637 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 17306608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 23969225 - 23969554
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23969225 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 23969324  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23969325 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatat 23969424  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23969425 gttgtgaagttgtagtatgttgatgtatctgctatattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtaaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 23969524  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969525 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 23969554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24515636 - 24515308
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24515636 ggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 24515537  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24515536 gttgttgaataatttcagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattgaagttgttatgattaatgatgctat 24515437  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24515436 gttgcgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 24515337  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgat 332  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24515336 tgtcgttaaagttgcaagttgttgtcgat 24515308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36839621 - 36839295
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36839621 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatttattatgtgaatgtt 36839522  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839521 gttg---aataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 36839425  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36839424 gttgtgaagttgtcgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 36839325  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36839324 tgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 36839295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9975379 - 9975089
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaat-acatatattatgcgaatgt 102  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  9975379 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaattacatatgttatgtgaatgt 9975280  T
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975279 tgttgttgaataatttgagttacatatatatatgtggaaaatgtatggtatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 9975180  T
Q  203 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9975179 tgttgtaaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttacatatgttggtcaaattgttaaagttgtaag 9975089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 4 - 290
Target Start/End: Original strand, 27485072 - 27485359
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27485072 ggtgtttaagagtatttaacatatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 27485171  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27485172 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 27485271  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattg-attattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgt 290  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27485272 gttgtgaagttgtgatatgttgatgtctctgttgtattgaattattaaatcattaagttacatatgttggtctaagttg-taaagttgt 27485359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 24781442 - 24781649
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24781442 ggtgtttaagaatatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 24781541  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24781542 attgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 24781641  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  24781642 gttgtgaa 24781649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 5031734 - 5031922
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5031734 tgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 5031833  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5031834 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaa 5031922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19358272 - 19358110
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19358272 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaag 19358173  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358172 ttgttgtatgttgatgtctctactgtattg-ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 19358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 14693547 - 14693380
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||    
T  14693547 taatttgagctatatacaattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgatgttatatcattcaagttgttatgattaatgttgctatgat-tcaag 14693449  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 281  Q
    |||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14693448 ttgttgtatg-tgatgtctctgccgttattgattatttaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 14693380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 276
Target Start/End: Original strand, 10897503 - 10897666
Alignment:
Q  114 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  10897503 aatttgagctacatatatttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaag 10897601  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10897602 ttgttgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatattggtcaa 10897666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5985396 - 5985236
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatg---ctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||   |||||| |  |||||||| | ||||||||||||||     
T  5985396 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttgttattattgatgttgctatgtggc-aagttgttttctgttgctgtctctgt 5985298  T
Q  236 tg-tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    || | ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5985297 tgttgttgaattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 5985236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 23069055 - 23069148
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23069055 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 23069148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44071837 - 44071676
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||     
T  44071837 ttgttgttggataatttgagatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgt 44071740  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44071739 tatgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 44071676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 43707886 - 43707960
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43707886 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 43707960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 9785019 - 9784931
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  9785019 atttaacatgtgttgtgatgaatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 9784931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 24273861 - 24273921
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24273861 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 24273921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22686290 - 22686221
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 73  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22686290 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaataactttgttggat 22686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 25587301 - 25587362
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25587301 atttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 25587362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21368554 - 21368483
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  21368554 gtttaagagtatttaacctatgtggtaatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 21368483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3539090 - 3538960
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||    
T  3539090 gaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgat 3538993  T
Q  196 gatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    | || |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  3538992 gttgttatgttg-caagttgttgt-tgttgctgtc 3538960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27860629 - 27860469
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  ||| ||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | || || |    
T  27860629 tgttgttggttaaattgagatagatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgtt 27860532  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27860531 atgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 27860469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31520435 - 31520371
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31520435 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgttattatcattcaagttgttattattaat 31520371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 191
Target Start/End: Original strand, 18391046 - 18391124
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 191  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18391046 taatttgagctacatatatt-atgtggaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 19201806 - 19201877
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19201806 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 19201877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 6478034 - 6478110
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  6478034 ttatgtggaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 6478110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27851922 - 27851836
Alignment:
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 191  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27851922 gttgttggttaatttgaaatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 27851836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 1384287 - 1384350
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||| | | |||||||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1384287 ggtgtttacgagtatttaacctatgctgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 1384350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 21316263 - 21316325
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  21316263 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttgatttgacgtgaatatcttt 21316325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23609927 - 23609865
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23609927 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtggtaaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 23609865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 28345692 - 28345746
Alignment:
Q  19 ttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 73  Q
    |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28345692 ttaatctatgttgtgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggat 28345746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25141432 - 25141349
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |   |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  25141432 ttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattttatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 25141349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3539082 - 3539042
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  3539082 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3539042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9784971 - 9784909
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  9784971 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 9784909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 21336056 - 21336116
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||| | ||||||||||||||   ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21336056 tgtttaagagtatttaacctatgttgggatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 21336116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 13138 - 13465
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  13138 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaa--catatattatgtgaatgtt 13235  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13236 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 13335  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13336 gttgtgaagttgttgtatgttattgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 13435  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  13436 tgtcattaaagctgtaagttgttgtcgatg 13465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 333
Target Start/End: Original strand, 19405 - 19732
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  19405 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaa--catatattatgtgaatgtt 19502  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 19602  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19603 gttgtgaagttgttgtatgttcttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 19702  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  19703 tgtcattaaagctgtaagttgttgtcgatg 19732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 6 - 333
Target Start/End: Original strand, 1 - 327
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1 tgtttaagggtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggatcatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 100  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgctatgt 200  T
Q  206 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatg 305  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  201 tgtgaaattgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcatgtt-ttaaagttgtaagttgttgtcaatg 299  T
Q  306 tcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||    
T  300 tagttaaagttttaagttgttgtcgatg 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 5315 - 5604
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5315 ggtgtttaagagtatttaaactatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 5414  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5415 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgttgctat 5514  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5515 gttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtttaagttgtaag 5604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19921084 - 19920767
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19921084 ggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 19920985  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19920984 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaactatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttattattattaatgatgatat 19920885  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaa 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19920884 gttgtgaagttgttgtgtgttgctgtctctgctgtattgtttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaa 19920785  T
Q  304 tgtcgttaaatttgtaag 321  Q
    | | ||| || |||||||    
T  19920784 tattgtttaagttgtaag 19920767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 276
Target Start/End: Original strand, 36509479 - 36509688
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||| |    
T  36509479 ttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatatcgtatgatatag-aaataacg 36509576  T
Q  165 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgc 263  Q
    || ||||||||| |||||  |||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36509577 ttattataccatccaagtgattattattaatgttgccatgat-tcaagttgttgtacgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgc 36509675  T
Q  264 atatgttggtcaa 276  Q
    ||||||| |||||    
T  36509676 atatgttagtcaa 36509688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 32607927 - 32608054
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32607927 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggcttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgtt 32608025  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32608026 gttgttgaataatttgaaatacatatatt 32608054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 276
Target Start/End: Original strand, 21406443 - 21406562
Alignment:
Q  157 aaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcat 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21406443 aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgctgttattgattattaaatcat 21406541  T
Q  256 taagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  21406542 ttagttgcatatgttggtcaa 21406562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 32608027 - 32608188
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  32608027 ttgttgaataatttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataattttagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatg 32608124  T
Q  165 ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  32608125 ttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgta-gttgctgtc 32608188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Original strand, 36509382 - 36509506
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36509382 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatttttgttggataatttgaagtacatatattatatgaatgttgtt 36509480  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  36509481 gttgaataatttgaaatacatatatt 36509506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20566004 - 20565903
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20566004 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctatgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 20565905  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  20565904 gt 20565903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 25250632 - 25250789
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25250632 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25250730  T
Q  238 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25250731 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25250789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 25314417 - 25314574
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgat-g 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  |      
T  25314417 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttg-caagttgttttatgttgttgtctctactat 25314515  T
Q  238 tattg-attattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25314516 tgttgaattattaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttg-taaagttgtaagt 25314574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 20198203 - 20198264
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20198203 atttaacctatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 20198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 208
Target Start/End: Original strand, 23200299 - 23200368
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  23200299 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgt 23200368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Original strand, 24277340 - 24277416
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24277340 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24277416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24384873 - 24384797
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24384873 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttg 24384797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 21399605 - 21399679
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21399605 ggtgtttaagagtatttaacctattttgtgatgaatctaatttggttagacgtgaatatctttgttggatgattt 21399679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30612003 - 30611929
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30612003 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgattt 30611929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30613963 - 30613889
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30613963 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgattt 30613889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23200004 - 23200065
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23200004 atttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatcgttgttggatgattt 23200065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 262
Target Start/End: Original strand, 8952787 - 8952915
Alignment:
Q  135 tgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctct 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||    
T  8952787 tgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtctct 8952884  T
Q  234 gatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    | || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8952885 gttgttgttgattattaatatcattaagttg 8952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 14026409 - 14026471
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14026409 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14026471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 66
Target Start/End: Original strand, 16605206 - 16605267
Alignment:
Q  5 gtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16605206 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 16605267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 41876320 - 41876414
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41876320 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 41876414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22111050 - 22110987
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111050 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 22110987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 33895487 - 33895558
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33895487 gtttaagagtatttaacctatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggatgattt 33895558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 1627983 - 1628041
Alignment:
Q  5 gtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatc 63  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1627983 gtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaaattggtttgacgtgaatatc 1628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18744100 - 18744038
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18744100 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20565761 - 20565701
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaa 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||    
T  20565761 gaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatagaaa 20565701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17812698 - 17812638
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17812698 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 17812638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 22357664 - 22357747
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 186  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22357664 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22110927 - 22110893
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22110927 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 22110893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10953283 - 10953214
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  10953283 gaaaatgtatgatatggaaattattattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttg 10953214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 331
Target Start/End: Original strand, 8504636 - 8504668
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcga 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8504636 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcga 8504668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 58198 - 57908
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  58198 ggtgtttaagagtatttaacctgtgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 58099  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58098 gttgttgaagaatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 57999  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  57998 gtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 57908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 615 - 327
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  615 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 516  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  515 gttgttgaataatttgagttacatatatttatatggaaaaggtatgatatagaaaataacgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgatat 416  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  415 gttgtgaagttgttgtacgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgtt-aagttgtaag 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 7987 - 8195
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7987 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaacatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 8086  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8087 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 8186  T
Q  203 tgttgtgaa 211  Q
    |||||||||    
T  8187 tgttgtgaa 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 9828 - 10035
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9828 ggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 9927  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9928 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttattattaattatgctat 10027  T
Q  204 gttgtgaa 211  Q
    ||||||||    
T  10028 gttgtgaa 10035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11245 - 10975
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11245 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 11146  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11145 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctat 11048  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11047 gat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7425 - 7155
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||  |||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7425 ggtgtttaagagtatcaaacctatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 7326  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7325 gttgttgaataatttgagatacata-aattatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 7228  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7227 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 7155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Original strand, 579 - 849
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  579 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 678  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  679 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgacatag-aaataatgttgttataccatcgaagtggttattattaatgttgctat 776  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  777 gat-tcaagttgttgtatgttgctttctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Original strand, 5882 - 6152
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | ||  |||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5882 ggtgtttaagagtatcaaacctatgctgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 5981  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5982 gttgttgaataatttgagatacata-aattatgtgaatattgtatgatat-ggaaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctat 6079  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6080 gat-tcaagttgttgtatgttgctgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 6152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 211
Target Start/End: Original strand, 9397 - 9567
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9397 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt---gttgaataatttgagttacatatatttatgt 9493  T
Q  138 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaa 9567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33766 - 33530
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33766 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatacattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgt 33668  T
Q  138 ggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 237  Q
    | | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  33667 gaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctgttg 33570  T
Q  238 -tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33569 ttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 33530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 139 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23711 - 23517
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||    
T  23711 gaaaaggtatgatgtagaaaataatgttgttataccatttaagttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctcaattgt 23612  T
Q  239 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23611 attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgttaaagttgtaagttgttgtcaatgtcgttaaagttttaagttgttgtcgatg 23517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22508 - 22322
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22508 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 22409  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattatt 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22408 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattatt 22322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 8905 - 9106
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8905 ggtgtttaagagtatttaaactataatgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttagatagtttgaaatacatatattatgtgaatgtt 9004  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9005 gttgttgaataaattgagttacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctat 9104  T
Q  204 gt 205  Q
    ||    
T  9105 gt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 276
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15381
Alignment:
Q  45 ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaag 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |      
T  15152 ttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatatt 15250  T
Q  145 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattga 243  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  15251 gtatgatatag-aaataatgtttttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgatgtctctgttgttattga 15348  T
Q  244 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15349 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 15381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 146180 - 145895
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  146180 tgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgt 146082  T
Q  106 tgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 205  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |     
T  146081 tgttgattaatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctacgg 145984  T
Q  206 tgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    | | |||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  145983 t-tcaagttgttgtatgttgttgtcattgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaag 145895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 276
Target Start/End: Original strand, 47280 - 47442
Alignment:
Q  113 taatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47280 taatttgggttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaa-aatgttgttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttgtgaag 47378  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47379 ttgttgtatgttgttgtctctactgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 47442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28589 - 28433
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg- 237  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| ||     
T  28589 gaaaatgtatgatacagaaactaatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgtgactatgctg-caagttgttttatgttgctatctctgctgt 28491  T
Q  238 tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagt 294  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  28490 tattgattattaacatcatttagttgcaagtgttggtctaagttg-caaagttgtaagt 28433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 652 - 388
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||       
T  652 gtttaagagtatttaacctattttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattttgtgaatgtt--- 556  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtt 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |    
T  555 gttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatattgttataccatccaagtggttattattaatgtttctatgat 458  T
Q  207 gtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
     | |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  457 -tcaagttgttgtatattggtgtctctgttgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11609 - 11340
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11609 ggtgtttaagagtatttgacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtaaatatctttgctagataatttgaaatacatatattatatgaatgtt 11511  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  11510 gttgttgaataatttgaggtacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttataccatccaaatggttattattaatgttgctat 11413  T
Q  204 gttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | | | |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11412 ggt-tcaagttgttgtatgttgttgtctgtgctgttattgattgttaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 11340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3856 - 3768
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3856 atttaacctatgttgtgatggatctaatttcgtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29608 - 29442
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29608 ggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 29509  T
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 172  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29508 gttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 10545 - 10787
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataat 116  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10545 atttaacctacgttgtgatggatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgttgttattgaataat 10643  T
Q  117 ttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgt 216  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||              | |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  10644 ttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatg--------------atgcggttattattaatgttgctatgat-tgaagttgt 10726  T
Q  217 tgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10727 tgtatgttgttgtctctgctgttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 78514 - 78322
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  78514 ggtgttaaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatt-ggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 78416  T
Q  104 gtt---gttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatg 196  Q
    |||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  78415 gttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatggtatag-aaataatgttgttataccatccaagtggttattattaatg 78322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 30062 - 29894
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaa---t 100  Q
    |||||||||| | || |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |    
T  30062 ggtgtttaagagtatctaacttatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataa-ttgaaatacatatattatgtgaatgtt 29964  T
Q  101 gttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttata 172  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29963 gttgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgttata 29894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 145 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1196
Alignment:
Q  145 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgt-attga 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  1326 gtatgatatagaaa-taatgttgttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgat-tcaagttgttgtatgttgctgtctgtgctgttattga 1229  T
Q  244 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1228 ttattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1749 - 1653
Alignment:
Q  185 ttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1749 ttattattaatgatgctatgttgttaagttgttgtattttgctatctctgttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaagttgt 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1062
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1161 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 918 - 830
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  918 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 187107 - 187206
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  187107 ggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 187206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Original strand, 187350 - 187438
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgtt 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  187350 gaatattgttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 187438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7666 - 7542
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7666 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgtt 7568  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7567 gttgaataatttgaggtacgtatatt 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14297 - 14173
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgtt 106  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14297 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatt-ggtttgatgtgaatatctttgttggagaatttgaaatacatatattatatgaatgttgtt 14199  T
Q  107 gttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14198 gttgaataatttgaggtacgtatatt 14173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16630 - 16575
Alignment:
Q  77 ttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16630 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgtggtacgtatatt 16575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18650 - 18595
Alignment:
Q  77 ttgaaatacatatattatgcgaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatt 132  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  18650 ttgaaatacatatattatatgaatgttgttgttgaataatttgtggtacgtatatt 18595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 39547 - 39449
Alignment:
Q  6 tgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttg 104  Q
    |||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39547 tgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatatgaatgttg 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 1069 - 1170
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  1069 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 1168  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  1169 gt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 15188 - 15289
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  15188 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 15287  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  15288 gt 15289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Original strand, 24246 - 24347
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  24246 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatatt 24345  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  24346 gt 24347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 645 - 771
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  645 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 742  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  743 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6075
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatg 204  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| | |||||||    
T  5949 ttgttggataatttgagatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 6046  T
Q  205 ttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6047 ttg-gaagttgttttatgttgctctctctg 6075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 584 - 675
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatg 95  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  584 ggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggataatttgagatacatatattatg 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Original strand, 5888 - 5979
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatg 95  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5888 ggtgtttaagagaatttaatctatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggataatttgagatacatatattatg 5979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25966 - 25865
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgtt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25966 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggttttatgtaaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatgtt 25867  T
Q  104 gt 105  Q
    ||    
T  25866 gt 25865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Original strand, 34097 - 34201
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34097 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 34195  T
Q  202 atgttg 207  Q
    ||||||    
T  34196 atgttg 34201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20958 - 20821
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||| ||| |||| ||    
T  20958 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgc-aagatgtt-tatgttgttgtttctgctg 20861  T
Q  238 t-attgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20860 ttattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtcaa 20821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6966 - 6807
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6966 tgttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgct 6868  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  6867 atgttg-caagttgct-tatgttgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 168874 - 168796
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatg 95  Q
    ||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168874 atttaacttatgttgtgatggttctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatg 168796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21515 - 21422
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21515 gtttaagagtatttaacatgtgttgtaatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaat 21422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3380 - 3224
Alignment:
Q  104 gttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgcta 202  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3380 gttgttggttaatttaagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgcta 3282  T
Q  203 tgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagt 260  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  3281 tgttg-caagttgtt-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagt 3224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6960 - 6862
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  6960 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6840
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6902 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 6840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 7109 - 7199
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattat 94  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| | ||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7109 ggtgtctaagagtatttaacctatgttgtgataaatctcatttggattgacatgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattat 7199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 562 - 411
Alignment:
Q  114 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  562 aatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 465  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  464 ttgttttatgttgttgtctctactgttactgattattaatatcactaagttgca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8817 - 8666
Alignment:
Q  114 aatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgt-tataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 212  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||    
T  8817 aatttgagctacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattcatgttgctacgttgt-aag 8720  T
Q  213 ttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    ||||| ||||||| |||||||  || || |||||||||| |||| |||||||||    
T  8719 ttgttttatgttgttgtctctactgttactgattattaatatcactaagttgca 8666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 276
Target Start/End: Original strand, 127500 - 127674
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | |  |      
T  127500 ttgttgttggttaatttgagctacatatatt-atgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagttgttg 127598  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgcatatgttggtcaa 276  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  127599 tatgttg-caagttgttg-atgttgctatctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaa 127674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21089 - 21001
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  21089 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 21001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21041 - 20979
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21041 ttgttgaataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttgtt 20979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 13270 - 13357
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattat 94  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13270 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 120357 - 120270
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattat 94  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  120357 gtttaagagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattat 120270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 297
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  456 tgttgttggttaatttaagctatatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgct 358  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  357 atgttg-caagttgct-tatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11022 - 10863
Alignment:
Q  103 tgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgct 201  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11022 tgttgttggttaatttgagttacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttct 10924  T
Q  202 atgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  10923 atgttg-caagttg-tctatgttgttgtctctgctgttgttgattattaatatcattgagttg 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 370 - 502
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 229  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  370 tttatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgt 467  T
Q  230 ctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  468 ctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 66357 - 66196
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgc 200  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  66357 ttgttgttggttaatttgagatacatatatg-atgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgt 66260  T
Q  201 tatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttgca 264  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  66259 tatgttg-caagttgttg-atgttgttgtctttgctgttgttgattattaatatcattaagttgca 66196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 66634 - 66703
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 73  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  66634 ggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggat 66703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 59669 - 59585
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatg-ttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||    
T  59669 tacatatatt-atgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttg 59585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6029
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  5941 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 6029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6225 - 6123
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  6225 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgt 6128  T
Q  230 ctctg 234  Q
    |||||    
T  6127 ctctg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8377 - 8275
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  8377 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg-caagttgtt-tatgttgttgt 8280  T
Q  230 ctctg 234  Q
    |||||    
T  8279 ctctg 8275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3619
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    ||||||| | |||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  3707 atttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttgaataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 3619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 11948 - 12022
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11948 ggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgattt 12022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27750 - 27676
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27750 ggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgatggatccaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 27676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 280 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27488 - 27435
Alignment:
Q  280 gttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27488 gttaaagttgtaagttgttgtcaatgtagttaaagttgtaagttgttatcgatg 27435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 262
Target Start/End: Original strand, 40958 - 41090
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | |||||||||||    
T  40958 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctgt 41055  T
Q  230 ctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    | ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41056 cactgctgttgttgattattaatatcattaagttg 41090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 36118 - 36192
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36118 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaactttgtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 36192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 5066
Alignment:
Q  131 tttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5143 tttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttg 5066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 16585 - 16646
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16585 atttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8375 - 8244
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  8375 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 8278  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
     ||| || | ||||||||||| |||| |||||||    
T  8277 cctgctgttgttgattattaatatcaataagttg 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 62585 - 62646
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62585 atttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgattt 62646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 262
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1394
Alignment:
Q  145 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattg 242  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || | |||    
T  1276 gtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgt-aagttgct-tatgttgctgtctctactgttgttg 1373  T
Q  243 attattaa-atcattaagttg 262  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  1374 attattaatatcattaagttg 1394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1475
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1535 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 2026 - 1970
Alignment:
Q  277 gttgttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2026 gttgttaaagttgtaagttgtcgtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 207
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2088
Alignment:
Q  133 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat-accattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2013 tatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttg 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16385 - 16325
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16385 gtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 16325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 830 - 764
Alignment:
Q  151 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  830 tatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgctgctatgttgt-aagttgttg 764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 127144 - 127252
Alignment:
Q  123 tacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatg 222  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| |||| ||||    
T  127144 tacatatatt-atgtggaaa-ggtatgatagggaaaataatgttattatatcatccaagttgttgttattaaagttgctatgttg-caagctgttttatg 127240  T
Q  223 ttgctgtctctg 234  Q
    ||| ||||||||    
T  127241 ttgttgtctctg 127252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 2724 - 2824
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  2724 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgctgtc 2821  T
Q  231 tct 233  Q
    |||    
T  2822 tct 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 293
Target Start/End: Original strand, 4616 - 4685
Alignment:
Q  224 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  4616 tgctgtctctgctgtattgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 4685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 293
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14731
Alignment:
Q  224 tgctgtctctgatgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaag 293  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14662 tgctgtctctgctgtactgattaataaatcattaagttgcttatgttagtcaaagttgtt-aagttgtaag 14731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10148 - 10087
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10148 atttaacctatgttgtggtggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgattt 10087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3024 - 2893
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtc 230  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  3024 ttatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttg-caagttgct-tatgttgttgtc 2927  T
Q  231 tctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
     ||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  2926 cctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 434 - 390
Alignment:
Q  56 tgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  434 tgaatatctttgttggataatttgaaatacttatattatgtgaat 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1613
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1549 ttatgtggaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 1613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 143 - 237
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  143 ttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttg-caagttgtt-tatgttgctgtctctgttgttgttgattattaatatcattaagttg 237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Original strand, 28970 - 29030
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28970 ggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9505 - 9445
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9505 ggtgtttaagattatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 6053
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtta-taccattcaagttgttattattaat 195  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6117 ttatgtggaaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaat 6053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21183 - 21123
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21183 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgagtctaatttggtttgacgtgaatatct 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1283
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  1354 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 1283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7967 - 7904
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7967 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 7904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7694 - 7576
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||    
T  7694 gaatgttgttgttgaataattcgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaat 7597  T
Q  196 gatgctatgttgtgaagttgtt 217  Q
    | || |||| || |||||||||    
T  7596 gttgttatgatg-gaagttgtt 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7570 - 7523
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatct 64  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7570 atttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 5167 - 5104
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5167 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 5104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2010 - 1951
Alignment:
Q  8 tttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2010 tttaagggtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 1951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1742 - 1654
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  1742 gaatgttgttgttgaataatttgagatacatata-ctatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgtt 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 7383 - 7446
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7383 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5726 - 5657
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5726 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Original strand, 53378 - 53471
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 234  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  53378 gaaaatgtatgatatggaaattattatttttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgttgctgtctctg 53471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 143060 - 142989
Alignment:
Q  7 gtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  143060 gtttaagagtatttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 142989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 136323 - 136416
Alignment:
Q  102 ttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatg 196  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  136323 ttgtagttggataatttgagatacatatatt-atgtgaaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttattaatg 136416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 12260 - 12375
Alignment:
Q  148 tgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgatt 245  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||| |||| ||| || | ||||||    
T  12260 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttg-caagttgct-tatgttgttgtccctgctgttgttgatt 12357  T
Q  246 attaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  12358 attaatatcattaagttg 12375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 625
Alignment:
Q  97 gaatgttgttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgtt 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  713 gaatgttgttgttggataatttgagatacatata-ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 665
Alignment:
Q  65 ttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  705 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgt 665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Original strand, 3123 - 3181
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatat 62  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3123 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatat 3181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 63835 - 63873
Alignment:
Q  105 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtggaaaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  63835 ttgttgaataatttgagttacatatatttatgtgaaaaa 63873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4033 - 3984
Alignment:
Q  56 tgaatatctttgttggataatttgaaatacatatattatgcgaatgttgt 105  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4033 tgaatattgttgttggataatttgaaatacatatattatgtgaatattgt 3984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8373 - 8304
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8373 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 18741 - 18802
Alignment:
Q  17 atttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18741 atttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttaacgtaaatatctttgttggatgattt 18802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Original strand, 2652 - 2727
Alignment:
Q  116 tttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattat 191  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  2652 tttgagatacatatatt-atgtggaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18894 - 18843
Alignment:
Q  281 ttaaagttgtaagtgtttgtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18894 ttaaagttgtaagttgttatcaatgtcgttaaa-ttgtaagttgttgtcgatg 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3196 - 3120
Alignment:
Q  132 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3196 ttatggggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttg 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 7455 - 7518
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7455 ggtgtttaaaagtatttaacctaagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 7518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16067 - 16004
Alignment:
Q  145 gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16067 gtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttg 16004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 34715 - 34652
Alignment:
Q  4 ggtgtttaagtgcatttaacctatgttttaatgtatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 67  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  34715 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgagtatctttg 34652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 333
Target Start/End: Original strand, 10066 - 10100
Alignment:
Q  299 gtcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10066 gtcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 207
Target Start/End: Original strand, 19387 - 19456
Alignment:
Q  139 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  19387 gaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttg 19456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4243 - 4210
Alignment:
Q  300 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4243 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 10365 - 10332
Alignment:
Q  300 tcaatgtcgttaaatttgtaagttgttgtcgatg 333  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10365 tcaatgtcgttaaagttgtaagttgttgtcgatg 10332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Original strand, 2470 - 2510
Alignment:
Q  38 atctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataattt 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  2470 atctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgattt 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 159723 - 159817
Alignment:
Q  168 ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgatg-tattgattattaa-atcattaagttg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  159723 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttg-caagatgtt-tatgctgctgtctctgctgttgttgattattaatatcattaagttg 159817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University