View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7305_high_1 (Length: 303)

Name: NF7305_high_1
Description: NF7305
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7305_high_1
NF7305_high_1
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (1-303)||(21743343-21743645)
chr7 (1-303)||(16006177-16006480)
chr7 (1-303)||(17505826-17506122)
chr7 (1-303)||(17547092-17547388)
chr7 (20-303)||(8776122-8776405)
chr7 (7-303)||(38828008-38828302)
chr7 (61-303)||(13395568-13395801)
chr7 (61-303)||(48785096-48785329)
chr7 (9-303)||(13733586-13733863)
chr7 (110-303)||(124324-124509)
chr7 (7-303)||(4993269-4993555)
chr7 (9-204)||(35366101-35366293)
chr7 (104-201)||(21065304-21065400)
chr7 (216-303)||(35366030-35366116)
chr7 (214-303)||(15725531-15725619)
chr7 (141-303)||(709469-709632)
chr7 (141-303)||(47975824-47975990)
chr7 (141-262)||(41055494-41055613)
chr7 (141-262)||(16462055-16462174)
chr7 (148-253)||(44190789-44190897)
chr7 (141-190)||(14421882-14421931)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (1-303)||(4170785-4171087)
chr4 (1-303)||(14698477-14698779)
chr4 (1-303)||(53387759-53388055)
chr4 (1-302)||(41791432-41791734)
chr4 (1-303)||(16278149-16278443)
chr4 (9-303)||(15280136-15280419)
chr4 (61-303)||(286873-287106)
chr4 (85-303)||(16359287-16359495)
chr4 (61-303)||(28382607-28382840)
chr4 (61-303)||(33848690-33848923)
chr4 (61-303)||(47126929-47127162)
chr4 (110-303)||(10313497-10313683)
chr4 (110-303)||(55502880-55503065)
chr4 (110-303)||(31117185-31117370)
chr4 (9-202)||(56115656-56115848)
chr4 (198-270)||(9388310-9388382)
chr4 (177-303)||(15242314-15242441)
chr4 (214-303)||(14942557-14942647)
chr4 (148-303)||(15990089-15990242)
chr4 (214-253)||(56115839-56115878)
chr4 (141-190)||(24047439-24047488)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-303)||(6608312-6608614)
chr8 (1-303)||(45134964-45135267)
chr8 (20-204)||(7301138-7301322)
chr8 (9-303)||(24707859-24708144)
chr8 (61-303)||(17795180-17795413)
chr8 (113-303)||(17614702-17614884)
chr8 (61-303)||(22145490-22145718)
chr8 (9-202)||(363828-364020)
chr8 (61-303)||(22059494-22059712)
chr8 (216-303)||(7301307-7301394)
chr8 (85-303)||(28853734-28853943)
chr8 (9-202)||(44431901-44432093)
chr8 (9-125)||(10829505-10829619)
chr8 (214-253)||(363798-363837)
chr8 (214-253)||(44431871-44431910)
chr8 (214-261)||(22434531-22434579)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-303)||(8522691-8522994)
chr6 (9-303)||(2287966-2288260)
chr6 (9-303)||(15539046-15539340)
chr6 (1-303)||(15686159-15686450)
chr6 (61-303)||(16829581-16829814)
chr6 (9-303)||(16812561-16812845)
chr6 (61-303)||(16102126-16102359)
chr6 (110-303)||(12595740-12595925)
chr6 (62-303)||(29492538-29492770)
chr6 (214-253)||(1590542-1590581)
chr6 (214-261)||(1639218-1639266)
chr6 (141-193)||(23838104-23838156)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-303)||(29325279-29325582)
chr5 (1-303)||(26495645-26495948)
chr5 (9-299)||(4397496-4397776)
chr5 (85-303)||(23693240-23693450)
chr5 (113-303)||(22589885-22590067)
chr5 (113-303)||(22593440-22593622)
chr5 (113-303)||(22596995-22597177)
chr5 (113-303)||(16256088-16256270)
chr5 (117-303)||(16259725-16259903)
chr5 (10-303)||(26361136-26361418)
chr5 (110-303)||(43120959-43121144)
chr5 (110-303)||(43124492-43124677)
chr5 (9-202)||(22758711-22758903)
chr5 (110-170)||(22880134-22880195)
chr5 (230-303)||(22357860-22357933)
chr5 (214-253)||(22758894-22758933)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (1-303)||(21239164-21239467)
chr2 (1-303)||(21241714-21242017)
chr2 (1-303)||(24504462-24504765)
chr2 (1-299)||(20591144-20591442)
chr2 (1-204)||(31503458-31503661)
chr2 (1-204)||(31506024-31506227)
chr2 (61-303)||(23339271-23339504)
chr2 (63-303)||(41684868-41685099)
chr2 (61-303)||(44620716-44620944)
chr2 (110-303)||(31755720-31755905)
chr2 (9-202)||(28348947-28349139)
chr2 (9-199)||(12627942-12628129)
chr2 (216-303)||(12628119-12628206)
chr2 (216-303)||(31503386-31503473)
chr2 (216-303)||(31505952-31506039)
chr2 (219-303)||(24274176-24274261)
chr2 (214-253)||(28348917-28348956)
chr2 (141-190)||(21073632-21073681)
chr2 (141-193)||(9241856-9241908)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (9-303)||(16799582-16799876)
chr3 (1-299)||(55292463-55292761)
chr3 (1-303)||(10554204-10554497)
chr3 (1-204)||(54973244-54973448)
chr3 (1-204)||(54975854-54976058)
chr3 (1-204)||(54978464-54978668)
chr3 (61-303)||(14041428-14041661)
chr3 (61-303)||(2035087-2035320)
chr3 (61-303)||(2038594-2038827)
chr3 (61-303)||(2042335-2042568)
chr3 (61-303)||(14037960-14038193)
chr3 (61-303)||(18958679-18958912)
chr3 (9-199)||(603698-603885)
chr3 (9-199)||(15010208-15010395)
chr3 (9-187)||(54046607-54046782)
chr3 (9-200)||(10989622-10989812)
chr3 (216-303)||(54973172-54973259)
chr3 (216-303)||(54975782-54975869)
chr3 (216-303)||(54978392-54978479)
chr3 (61-303)||(39230523-39230741)
chr3 (216-303)||(603875-603962)
chr3 (225-303)||(14951722-14951800)
chr3 (216-303)||(15010385-15010472)
chr3 (220-303)||(54046518-54046601)
chr3 (141-303)||(6805875-6806041)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (4-303)||(8930-9230)
scaffold0525 (61-303)||(10978-11211)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (7-303)||(2333021-2333315)
chr1 (1-204)||(20579321-20579525)
chr1 (9-303)||(37358255-37358538)
chr1 (61-303)||(20631099-20631332)
chr1 (61-303)||(36181358-36181591)
chr1 (113-303)||(22900406-22900588)
chr1 (61-303)||(45307073-45307306)
chr1 (61-303)||(296309-296536)
chr1 (110-303)||(14432505-14432685)
chr1 (9-202)||(294075-294267)
chr1 (216-303)||(20579249-20579336)
chr1 (216-303)||(20586942-20587029)
chr1 (217-303)||(24087222-24087308)
chr1 (63-187)||(24087311-24087432)
chr1 (214-253)||(294045-294084)
chr1 (211-262)||(7792752-7792803)
chr1 (141-190)||(20438133-20438182)
chr1 (141-190)||(28312446-28312495)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (61-303)||(1483-1716)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (110-303)||(32949-33134)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (110-303)||(81678-81863)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (9-202)||(8548-8740)
scaffold0395 (214-253)||(8731-8770)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-202)||(2379-2570)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-202)||(137815-138007)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (61-201)||(134072-134209)
scaffold0021 (224-303)||(134211-134285)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (10-166)||(162359-162515)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (225-303)||(6032-6111)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (214-303)||(185-275)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (214-262)||(33782-33831)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (216-303)||(10520-10608)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (189-253)||(1712-1776)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (214-262)||(4922-4970)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (151-253)||(3123-3222)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (215-262)||(7205-7253)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (214-262)||(6004-6052)
scaffold0309 (214-262)||(8156-8204)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21743343 - 21743645
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743343 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 21743442  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21743443 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 21743542  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21743543 gttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctgg 21743642  T
Q  301 aat 303  Q
    |||    
T  21743643 aat 21743645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16006480 - 16006177
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006480 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 16006381  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16006380 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataagttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 16006281  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006280 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 16006181  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  16006180 gaat 16006177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 17505826 - 17506122
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17505826 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 17505925  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17505926 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagagggtgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattctgcacagtcgttgtcgtt 17506025  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17506026 g------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 17506119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17547388 - 17547092
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547388 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 17547289  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17547288 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagagggtgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattctgcacagtcgttgtcgtt 17547189  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547188 g------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 17547095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8776405 - 8776122
Alignment:
Q  20 attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8776405 attgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattgaattatacaagatgttggttcaagtggtaaggttgcaagttgtcgtt 8776306  T
Q  120 ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcg 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  8776305 ctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattattcacagtcgttgtcgttgttgttgcctacgttgtcg 8776206  T
Q  220 ttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776205 ttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 8776122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38828302 - 38828008
Alignment:
Q  7 tatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggtt 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||||||| |||    
T  38828302 tatgttgctattgattgaatatgatttgttgctgactgctggtttgtgcatagctgcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgagttgtaaagtt 38828203  T
Q  107 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | ||||| |||    
T  38828202 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcaccatcgttgtggttgtcgtt 38828104  T
Q  207 acctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38828103 gcccatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcataattagg-aactgttgagggctcatgccctggaat 38828008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 13395568 - 13395801
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13395568 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 13395666  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13395667 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 13395759  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  13395760 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 13395801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48785329 - 48785096
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48785329 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 48785231  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48785230 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 48785138  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  48785137 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 48785096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 13733586 - 13733863
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||| || |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||     
T  13733586 tgttgctgttgattgattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgt 13733682  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||      |    
T  13733683 gagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg------c 13733775  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13733776 ctat------gttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggacactgttgagggctcatgccctggaat 13733863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 124324 - 124509
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||      |||||||| || ||    
T  124324 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcaca------atcgttgtcgtcac 124414  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  124415 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 124509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4993555 - 4993269
Alignment:
Q  7 tatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggtt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |  |||| | |||| ||| | ||  ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| |     
T  4993555 tatgttgctgttgattgattatgatt-gttaatgatcgatggtttatacttaactgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tg 4993458  T
Q  107 gcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgt 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||  ||||| ||||||        
T  4993457 gcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttaatatgcacgatcgttgtcgttg---- 4993365  T
Q  206 tacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
      ||||   ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993364 --cctaagatgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 4993269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35366293 - 35366101
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| ||      
T  35366293 tgttgctgttgattgaatatgatt-gttgatgattgctggtttatgcttaattgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaagttttg 35366195  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttg 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35366194 a-gttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagtcgttgtcgtagttg 35366101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 201
Target Start/End: Original strand, 21065304 - 21065400
Alignment:
Q  104 gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21065304 gttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttg 21065400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35366116 - 35366030
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35366116 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtccttttatgattagg-aactgttgagggctcatgccctggaat 35366030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15725619 - 15725531
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15725619 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcataattagg-aactgttgagggctcatgccctggaat 15725531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 709469 - 709632
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||| |||  |||  |||||||||  || | |||||||||||    
T  709469 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgttgttgttgtcgttgtctacgttgtcgttgatgttgctgagttgtatg 709568  T
Q  241 ttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  709569 ttgatatacacaaatttgagtccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 709632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 47975824 - 47975990
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcaca---gtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||   || ||| ||||||| |||   ||  |||||||||  || | ||||||||    
T  47975824 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgttgttgtcgttgtcgttgtttacgttgtcgttgatgttgctgagttgt 47975923  T
Q  238 atgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47975924 atgttgatatacacaaagttgagtccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 47975990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41055613 - 41055494
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||   ||||| |||  |||  |||||||||  || | |||||||||||    
T  41055613 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgtt---gttgtcgttgtctacgttgtcgttgatgttgatgagttgtatg 41055517  T
Q  241 ttgatgtacac-aagttgagtcc 262  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  41055516 ttgatatacacaaagttgagtcc 41055494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16462174 - 16462055
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatg 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||   ||||| |||  |||  |||||||||  || | |||||||||||    
T  16462174 tgttgatattgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgtt---gttgtcgttgtctacgttgtcgttgatgttgctgagttgtatg 16462078  T
Q  241 ttgatgtacac-aagttgagtcc 262  Q
    ||||| ||||| |||||||||||    
T  16462077 ttgatatacacaaagttgagtcc 16462055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 253
Target Start/End: Original strand, 44190789 - 44190897
Alignment:
Q  148 gttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcaca---gtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttga 244  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||   |||||| ||||||| |||  |||  |||||||||  || | |||||||||||||||    
T  44190789 gttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgtcgttgtcgttgtcgttgtctacgttgtcgttgatgttgctgagttgtatgttga 44190888  T
Q  245 tgtacacaa 253  Q
    | |||||||    
T  44190889 tatacacaa 44190897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14421931 - 14421882
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  14421931 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagt 14421882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 4171087 - 4170785
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4171087 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 4170988  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4170987 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 4170888  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4170887 gttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctgg 4170788  T
Q  301 aat 303  Q
    |||    
T  4170787 aat 4170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14698779 - 14698477
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698779 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 14698680  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14698679 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 14698580  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14698579 gttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaatctgttgagggctcatgccctgg 14698480  T
Q  301 aat 303  Q
    |||    
T  14698479 aat 14698477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 53387759 - 53388055
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387759 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatgcatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 53387858  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  53387859 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcagaggatgttgatgttggccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgatgtcgtt 53387958  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387959 g------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 53388052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41791734 - 41791432
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791734 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 41791635  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41791634 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaggttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 41791535  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41791534 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccttg 41791435  T
Q  300 gaa 302  Q
    |||    
T  41791434 gaa 41791432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 16278149 - 16278443
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278149 ttattatatgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 16278248  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcg-ttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||     |||||    
T  16278249 aaggttgcaagttgtcgtttctaagtaatggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgag---tgagttattatgca-ag-----atcgt 16278339  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278340 tgtcgttgcctatgttgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 16278439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 15280136 - 15280419
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||| || |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||     
T  15280136 tgttgctgttgattgattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgt 15280232  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||      |    
T  15280233 gagttgtcgttataagtaatggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg------c 15280325  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15280326 ctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggacactgttgagggctcatgccctggaat 15280419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 287106 - 286873
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  287106 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 287008  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  287007 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 286915  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  286914 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 286873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16359495 - 16359287
Alignment:
Q  85 tgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatg 184  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16359495 tgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcata-gttattgtg 16359399  T
Q  185 cacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttg 284  Q
    ||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16359398 cacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaactgttg 16359306  T
Q  285 agggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16359305 agggctcatgccctggaat 16359287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28382840 - 28382607
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28382840 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 28382742  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28382741 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 28382649  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28382648 cc-ttcatgattagaaaactgttgagggcttatgccctggaat 28382607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33848923 - 33848690
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagtt 159  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33848923 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagtt 33848825  T
Q  160 ggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgag 259  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| ||||||      ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33848824 ggggagtgagtga---gttattatgcacgatcgttgtcgttg------cctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgag 33848734  T
Q  260 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848733 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 33848690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 47126929 - 47127162
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47126929 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 47127027  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47127028 gagagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 47127120  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47127121 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 47127162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10313683 - 10313497
Alignment:
Q  110 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacc 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |      ||||||||||| ||    
T  10313683 agttgtcgttctaagcaacgaagtcataggttgttgatgttgaccaagttgaggagtgagtcat-agttattatacacgg------tcgttgttgttgcc 10313591  T
Q  210 tatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10313590 tatgttgtcgctgtcgtagttgaattgtatgctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 10313497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 55502880 - 55503065
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||      |||||||| || ||    
T  55502880 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcaca------atcgttgtcgtcac 55502970  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55502971 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 55503065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 31117185 - 31117370
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||| || ||    
T  31117185 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttgtcgtcac 31117275  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31117276 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtggagtcctttcatgattagggaactgttgagggctcatgccctggaat 31117370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 56115656 - 56115848
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  56115656 tgttgctgttgattgagtatgatt-gttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 56115754  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  56115755 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 56115848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Original strand, 9388310 - 9388382
Alignment:
Q  198 gttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatga 270  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9388310 gttgtcgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagttctttcatga 9388382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Original strand, 15242314 - 15242441
Alignment:
Q  177 ttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattag 274  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15242314 ttatgatgcaaagttgttgtcgttgtcgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttatatgctgatatacacaaagttaagtccattttatgattag 15242413  T
Q  275 gaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15242414 g-aactgttgagggctcatgccctggaat 15242441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Original strand, 14942557 - 14942647
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14942557 ttgtcgttgttgtagttgagttgtatgttgatatacacaaagttgagcccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 14942647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15990242 - 15990089
Alignment:
Q  148 gttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgt 247  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||   ||||| |||  |||  |||||||||  || | ||||||||||||| || |    
T  15990242 gttgaccaagttgtggagtaagtcataa-ttattatgcacagttgtt---gttgtcgttgtctacgttgtcgttgatgttgctgagttgtatgttaatat 15990147  T
Q  248 acac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| ||||||||||| || |||  | |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15990146 acacaaagttgagtccattgcatactcataaaaccgttgagggcttatgccctggaat 15990089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Original strand, 56115839 - 56115878
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  56115839 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 56115878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Original strand, 24047439 - 24047488
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  24047439 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagt 24047488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6608312 - 6608614
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608312 ttattatatgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 6608411  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6608412 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 6608511  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6608512 gttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttaagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctgg 6608611  T
Q  301 aat 303  Q
    |||    
T  6608612 aat 6608614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 45134964 - 45135267
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  45134964 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattgaattatacaagatgttggttcaagtgg 45135063  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45135064 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttgggaagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 45135163  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135164 tgttgttgcctacgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 45135263  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  45135264 gaat 45135267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 204
Target Start/End: Original strand, 7301138 - 7301322
Alignment:
Q  20 attgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301138 attgaatatgatttgctgttgattgttggtttatgcataaatgcattcaattagattatacaagatgttagttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt 7301237  T
Q  120 ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttg 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7301238 ctaagtaacggagtcataggttgttgatgttggccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtagttg 7301322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 24707859 - 24708144
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaat-atgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | || ||| || |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||    
T  24707859 tgttgctgttgattgaattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttcgggttgtaag-ttg 24707956  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgtta 207  Q
      ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |      |||||||||||     
T  24707957 tgagttgtcattataagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcacgg------tcgttgttgttg 24708049  T
Q  208 cctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24708050 cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctagaat 24708144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17795413 - 17795180
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagtt 159  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17795413 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagtt 17795315  T
Q  160 ggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgag 259  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| ||||||      ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17795314 ggggagtgagtga---gttattatgcacgatcgttgtcgttg------cctatgttgtcgctgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgag 17795224  T
Q  260 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795223 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 17795180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17614884 - 17614702
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  17614884 tgtcattctaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 17614792  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17614791 gttgtcgttgtcgtagtcgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 17614702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 22145490 - 22145718
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22145490 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 22145588  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||            ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22145589 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg-----------gttgtcgtggtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 22145676  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  22145677 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 22145718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 364020 - 363828
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  364020 tgttgctgttgattgagtatgatt-gttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 363922  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  363921 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 363828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 22059494 - 22059712
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||| ||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22059494 tgcattcaattagattgtacaatgtgttagttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 22059592  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||                     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22059593 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgt---------------------tgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 22059670  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22059671 cc-ttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 22059712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 7301307 - 7301394
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301307 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 7301394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28853943 - 28853734
Alignment:
Q  85 tgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattat 183  Q
    |||||||||| |||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||    
T  28853943 tgttggttcaagttgtaag-tggcgggttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttatgat 28853848  T
Q  184 gcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgtt 283  Q
    ||||  |||||  ||| |      | ||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||    
T  28853847 gcacgatcgttgccgtcg------cgtatgttgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattacgaaattgtt 28853754  T
Q  284 gagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28853753 gagggctcatgccctggaat 28853734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44432093 - 44431901
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||  ||  | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  44432093 tgttgttgttgattgagtatgatt-gttgctgattgatggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 44431995  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  44431994 caagttgtcgttctaaataacggagtcatatgttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacaattgttgtcgttgt 44431901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Original strand, 10829505 - 10829619
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| |||| ||||||||  | ||  ||||| || |||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  10829505 tgttgctgttgattgattatga-ttgttgatgattgctggtttatgcataactacaaacaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaa-gttgc 10829602  T
Q  109 aagttgtcgttctaagt 125  Q
     ||||||||||||||||    
T  10829603 gagttgtcgttctaagt 10829619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 363837 - 363798
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  363837 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 363798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44431910 - 44431871
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44431910 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 44431871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 261
Target Start/End: Original strand, 22434531 - 22434579
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtc 261  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22434531 ttgtcgttgttgtagatgagttgtatgttgatatacacaaagttgagtc 22434579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8522994 - 8522691
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522994 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 8522895  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8522894 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 8522795  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522794 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacgagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 8522695  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  8522694 gaat 8522691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 2287966 - 2288260
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2287966 tgttgctgttgattgaatatgatttgatgctgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttgtaaggttgc 2288065  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2288066 aagttgacgttctaagtaacggagtcataggttgttggtgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 2288165  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2288166 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgaaggcttatgccctggaat 2288260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15539340 - 15539046
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539340 tgttgctgttgattgaatatgatttgatgctgattgttagtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 15539241  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15539240 aagttgtcgttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgacgaagttggggagtaagtgataagttattatgcacagtcgttgtcgttgttgttac 15539141  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15539140 ctatgttgtcgttgtcgtagttgtgttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggcttatgccctggaat 15539046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 15686159 - 15686450
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15686159 ttattatatgttgctgttgattgaat-----ttgctgctgattgttggtttatgcataaacgcattcaattggattatacaagatgttggtgccggttgt 15686253  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      | |||    
T  15686254 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcctaggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacag------ttgtt 15686347  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15686348 gtagttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtccttccatgattaggaaaccgttgagggcttatgccctgg 15686447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16829814 - 16829581
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16829814 tgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttgttagttgtcgttataagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttg 16829716  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||      ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16829715 gggagtgagtgat-agttattgtgcacag------tcgttgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagt 16829623  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16829622 cc-ttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 16829581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16812845 - 16812561
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || ||| ||||||| ||| | ||  || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  16812845 tgttgttgttgattgattatgatt-gttgatgaatgttggtttatacttaactgtattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttgt 16812748  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      |||||||| ||| |    
T  16812747 gagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcaca------atcgttgtcgttgc 16812655  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16812654 ctatgttgtcgttgtcgtagttgagttttatgatgatatacacaagttgagt-ctttcatgattaggaaactattgagggctcatgccctggaat 16812561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16102359 - 16102126
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16102359 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 16102261  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16102260 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 16102168  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16102167 cc-ttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 16102126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12595925 - 12595740
Alignment:
Q  110 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||    
T  12595925 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cc 12595833  T
Q  210 tatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12595832 tatgttgtcgttgtcgtagttgaggtgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 12595740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 62 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29492770 - 29492538
Alignment:
Q  62 gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttgg 161  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  29492770 gcattcaattagaatatacaaggtgtgggttcgggttgtaag-ttgtgagatgtcgttataagtaacggagtcataagttgttgacgttgaccaagttgg 29492672  T
Q  162 ggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtc 261  Q
    |||||||||| || || ||| ||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29492671 ggagtgagtcgta-gtcattgtgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtc 29492579  T
Q  262 ctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29492578 c-ttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 29492538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Original strand, 1590542 - 1590581
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1590542 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaa 1590581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1639266 - 1639218
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtc 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1639266 ttgtcgttgttgtagttgagttgtatgttgatatacacaaagttgagtc 1639218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23838156 - 23838104
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgt 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  23838156 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagttataattatttatgcacagtcgt 23838104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 29325279 - 29325582
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325279 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 29325378  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29325379 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 29325478  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29325479 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgctgagggctcatgccctg 29325578  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  29325579 gaat 29325582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26495948 - 26495645
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495948 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 26495849  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26495848 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 26495749  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26495748 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacgagtcgagtcctttcatgattaggaaatcgttgagggctcatgccctg 26495649  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  26495648 gaat 26495645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4397776 - 4397496
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||| || |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||     
T  4397776 tgttgctgttgattgattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattcgaatatacaaggtgttggttcgggttgtaag-ttgt 4397679  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||      |    
T  4397678 gagttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg------c 4397586  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4397585 ctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctg 4397496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23693450 - 23693240
Alignment:
Q  85 tgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatg 184  Q
    |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23693450 tgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacaaagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcata-gttattatg 23693353  T
Q  185 cacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttg 284  Q
    ||| |||||| ||||||      |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693352 cacggtcgttgtcgttg------cctatattgtcgctgtcgtagttgagttgtatcctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttg 23693259  T
Q  285 agggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23693258 agggctcttgccctggaat 23693240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 22589885 - 22590067
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  22589885 tgtcgttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 22589977  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22589978 gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 22590067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 22593440 - 22593622
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  22593440 tgtcgttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 22593532  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593533 gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 22593622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 22596995 - 22597177
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  22596995 tgtcgttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 22597087  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597088 gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 22597177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 16256088 - 16256270
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  16256088 tgtcgttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 16256180  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16256181 gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaatcgttgagggctcatgccctggaat 16256270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 303
Target Start/End: Original strand, 16259725 - 16259903
Alignment:
Q  117 gttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattg 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||||| |||    
T  16259725 gttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttg 16259817  T
Q  217 tcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259818 tcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 16259903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 26361136 - 26361418
Alignment:
Q  10 gttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgca 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||| || |||| ||| | ||  ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||      
T  26361136 gttgctgttgattgattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtg 26361232  T
Q  110 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacc 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||      ||    
T  26361233 agttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagttat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg------cc 26361325  T
Q  210 tatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||    
T  26361326 tatgttgtcgttgccgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattagggcacggtggagggctcatgccctggaat 26361418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43121144 - 43120959
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||| || ||    
T  43121144 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttgtcgtcac 43121054  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43121053 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattagggaactgttgagggctcatgccctggaat 43120959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43124677 - 43124492
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||| || ||    
T  43124677 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttgtcgtcac 43124587  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43124586 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattagggaactgttgagggctcatgccctggaat 43124492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 22758711 - 22758903
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  22758711 tgttgctattgattgagtatgatt-gttgctgattgctggtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 22758809  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22758810 caagttgtcgttctaagtaatggagtcaaaggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 22758903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22880195 - 22880134
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagt 170  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880195 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagt 22880134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 303
Target Start/End: Original strand, 22357860 - 22357933
Alignment:
Q  230 tgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357860 tgagttgtatgttgatatacacaagttgagtccattgcat-actcataaaccgttgagggctcatgccctggaat 22357933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Original strand, 22758894 - 22758933
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22758894 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 22758933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21239164 - 21239467
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239164 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 21239263  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21239264 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 21239363  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21239364 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacgagtcgagtcctttcatgattaggaaatcgttgagggctcatgccctg 21239463  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  21239464 gaat 21239467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 21241714 - 21242017
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21241714 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 21241813  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21241814 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgatgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 21241913  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21241914 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacgagtcgagtcctttcatgattaggaaatcgttgagggctcatgccctg 21242013  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  21242014 gaat 21242017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24504765 - 24504462
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504765 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 24504666  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24504665 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 24504566  T
Q  200 tgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24504565 tgttgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctg 24504466  T
Q  300 gaat 303  Q
    ||||    
T  24504465 gaat 24504462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 20591144 - 20591442
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20591144 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggtttaggttgt 20591243  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20591244 aaggctgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 20591343  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    |    |    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20591344 gaaaatgaaaaagttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcttttcatgattaggaaaccgttgagggctcataccctg 20591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31503661 - 31503458
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||    
T  31503661 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 31503562  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31503561 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgta 31503462  T
Q  201 gttg 204  Q
    ||||    
T  31503461 gttg 31503458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31506227 - 31506024
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||    
T  31506227 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgt 31506128  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31506127 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcatagattgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgta 31506028  T
Q  201 gttg 204  Q
    ||||    
T  31506027 gttg 31506024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 23339271 - 23339504
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagtt 159  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23339271 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagtt 23339369  T
Q  160 ggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgag 259  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| ||||||      ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23339370 ggggagtgagtga---gttattatgcacgatcgttgtcgttg------cctatgttgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgag 23339460  T
Q  260 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339461 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 23339504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 303
Target Start/End: Original strand, 41684868 - 41685099
Alignment:
Q  63 cattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggg 162  Q
    ||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  41684868 cattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaggtaacggagtcataggttgttgacgttgatcaagttggg 41684966  T
Q  163 gagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41684967 gagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc 41685059  T
Q  263 tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  41685060 ttt-atgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 41685099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44620944 - 44620716
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44620944 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 44620846  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  44620845 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg-----------gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 44620758  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  44620757 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 44620716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31755905 - 31755720
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||      |||||||| || ||    
T  31755905 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcaca------atcgttgtcgtcac 31755815  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31755814 ctatgttgttattgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 31755720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28349139 - 28348947
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgta-aggttg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||| | ||||    
T  28349139 tgttgctgttgattgaatatgatt-gttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtagaagttg 28349041  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28349040 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 28348947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 12627942 - 12628129
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  12627942 tgttgttgttgattgattatgatt-gttgatgattgctggtttatgcttaactgcattcaattagaacatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttgc 12628039  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  12628040 gagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtatgtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgt 12628129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 12628119 - 12628206
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12628119 gtcgttgtcgtagatgagttgtatgctgatatacacacgttgagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 12628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31503473 - 31503386
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31503473 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 31503386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31506039 - 31505952
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31506039 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 31505952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 303
Target Start/End: Original strand, 24274176 - 24274261
Alignment:
Q  219 gttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24274176 gttgttgtagttgagttgtatgttgatatacacaaagttgagtccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 24274261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28348956 - 28348917
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28348956 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 28348917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Original strand, 21073632 - 21073681
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  21073632 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagt 21073681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9241908 - 9241856
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgt 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  9241908 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagttataattatttatgcacagtcgt 9241856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16799876 - 16799582
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16799876 tgttgttgttgattgaatatgatttgatgttgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttgtaaggttgc 16799777  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799776 aagttgacgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttaaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 16799677  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799676 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 16799582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 55292463 - 55292761
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292463 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 55292562  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55292563 aaggttgcaagttgtcgttccaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgtt 55292662  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctg 299  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  55292663 gtcgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcttttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctg 55292761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10554497 - 10554204
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554497 ttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatggataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt 10554398  T
Q  101 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||       ||||||    
T  10554397 aaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgag---tgagttattatgcac------gatcgtt 10554307  T
Q  201 gttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctgg 300  Q
    || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10554306 gtcgttgcctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctgg 10554207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54973448 - 54973244
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973448 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 54973349  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54973348 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 54973249  T
Q  200 tgttg 204  Q
     ||||    
T  54973248 agttg 54973244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54976058 - 54975854
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54976058 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 54975959  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54975958 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 54975859  T
Q  200 tgttg 204  Q
     ||||    
T  54975858 agttg 54975854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54978668 - 54978464
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978668 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 54978569  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54978568 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgt 54978469  T
Q  200 tgttg 204  Q
     ||||    
T  54978468 agttg 54978464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14041661 - 14041428
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14041661 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 14041563  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14041562 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 14041470  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14041469 cc-ttcatgattaggaaactgttgagggcttatgccctggaat 14041428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 2035087 - 2035320
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2035087 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 2035185  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2035186 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 2035278  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2035279 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 2035320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 2038594 - 2038827
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2038594 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 2038692  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2038693 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 2038785  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2038786 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 2038827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 2042335 - 2042568
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2042335 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 2042433  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2042434 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 2042526  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  2042527 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 2042568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14038193 - 14037960
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14038193 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 14038095  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038094 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 14038002  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  14038001 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 14037960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18958912 - 18958679
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | ||||| ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  18958912 tgcattcaattagaatgtacaatatgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacgtagttataggttgttgatgttgatctagttg 18958814  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18958813 gggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 18958721  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18958720 cc-ttcatgattaggaaaccgttgagggcttatgccctggaat 18958679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 603698 - 603885
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||| || |||| ||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  603698 tgttgctgttgattgattatgatt-gttgatgattgcaggtttatgcttaactgcattcaattagaatatataaggtgttggttcgagttgtaag-ttgc 603795  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  603796 gagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtatgtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgt 603885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 15010208 - 15010395
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| |||     
T  15010208 tgttgttgttgattgattatgatt-gttgatgattgatggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttga 15010305  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15010306 gagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtatgtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgt 15010395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 54046782 - 54046607
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||||||| ||||    
T  54046782 tgttgttgttgattgattatgatt-gttgatgattgttggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgagttgtaag-ttgc 54046685  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcac 187  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  54046684 gagttgtcgttctaagtaacggagtcatagtttgttgatgttgaccaagttggggagtatgtcat-agttattatgcac 54046607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Original strand, 10989622 - 10989812
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  10989622 tgttgctgttgattgagtatgatt-gttgctgattgttgatttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 10989720  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  10989721 caagttgtcgttctaagtaaaggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgtt 10989812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54973259 - 54973172
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973259 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 54973172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54975869 - 54975782
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975869 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 54975782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54978479 - 54978392
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978479 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 54978392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39230741 - 39230523
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  39230741 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 39230643  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||                     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39230642 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgt---------------------tgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 39230565  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  39230564 cc-ttcatgattaggagtctgttgagggcttatgccctggaat 39230523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 603875 - 603962
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  603875 gtcgttgtcgtagatgagttgtatgctgatatacacacgttgagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 603962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Original strand, 14951722 - 14951800
Alignment:
Q  225 gtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14951722 gtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgcccttgaat 14951800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Original strand, 15010385 - 15010472
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15010385 gtcgttgtcgtagatgagttgtatgctgatatacacacgttgagtcccttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 15010472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54046601 - 54046518
Alignment:
Q  220 ttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54046601 ttgtcgtagatgagttgtatgctaatatacacacgttgagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 54046518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 6805875 - 6806041
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgt---tacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgt 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||| |||| |||||   |  ||| ||||||||||  || | ||||||||    
T  6805875 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcatagttgttgtcgtcgttgtcgttgtctacattgtcgttgatgttgctgagttgt 6805974  T
Q  238 atgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6805975 atgttgatatacacaaagttgaatccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 6806041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 4 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9230 - 8930
Alignment:
Q  4 ttatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaa 102  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9230 ttatatgttgttgttgaattgaatatgattcgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaa 9131  T
Q  103 ggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9130 ggttgcaagttgtcgttctaagtaactgagtcataggttgttgatgttgaccatgttggggagtaagtcataagttattatgcacagtcgttgtcgttgt 9031  T
Q  203 tgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaa 302  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9030 tgttgcctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaa 8931  T
Q  303 t 303  Q
    |    
T  8930 t 8930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 10978 - 11211
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10978 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 11076  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11077 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgtcg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 11169  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  11170 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 11211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 303
Target Start/End: Original strand, 2333021 - 2333315
Alignment:
Q  7 tatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggtt 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||| | ||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  ||||  ||||||| |||    
T  2333021 tatgttgctattgattgaatatgttttgttgctgactgctggtttgtgcataactgcattcaattagaatatacaaggtgtgagttcgagttgtaaagtt 2333120  T
Q  107 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||    
T  2333121 gcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcaccgtcgttgtggttgtcgtt 2333219  T
Q  207 acctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     |  || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2333220 gcacatgttgtcgttgtcgtagttaagttgtatgctgatatacacaagtggagtcttttcatgattagg-aaccgttgagggctcatgccctggaat 2333315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20579525 - 20579321
Alignment:
Q  1 ttattatatgttgctgttga-ttgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20579525 ttattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcgggttg 20579426  T
Q  100 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20579425 taaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagccataggttgttgatgttggccaagttggggagtaagtcataagttactatgcacagtcgttgtcgt 20579326  T
Q  200 tgttg 204  Q
     ||||    
T  20579325 agttg 20579321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37358538 - 37358255
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | || ||| || |||| ||| | ||  |||||||| || || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||     
T  37358538 tgttgctgttgattgattatgatt-gttgatgaatgctggtttatacttaactgcattcagttagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgt 37358442  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||      |    
T  37358441 gagttgtcgttataagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg------c 37358349  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37358348 ctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggacactgttgagggctcatgccctggaat 37358255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20631332 - 20631099
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20631332 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 20631234  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20631233 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 20631141  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  20631140 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 20631099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36181591 - 36181358
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36181591 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttg 36181493  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36181492 gggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 36181400  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  36181399 cc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 36181358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 303
Target Start/End: Original strand, 22900406 - 22900588
Alignment:
Q  113 tgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctat 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      |||||    
T  22900406 tgtcgttccaagtaacggagtcataggtggttgatgttgatcgagttggggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctat 22900498  T
Q  213 attgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22900499 gttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 22900588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45307306 - 45307073
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagtt 159  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45307306 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttccaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagtt 45307208  T
Q  160 ggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgag 259  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||  ||||| ||||||      ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  45307207 ggggagtgagtga---gttattatgcacgatcgttgtcgttg------cctatgttgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagtcgag 45307117  T
Q  260 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45307116 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 45307073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 296536 - 296309
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagtt 159  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  296536 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgtttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagtt 296438  T
Q  160 ggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgag 259  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||      ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  296437 ggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttg------cctatgttgttgctgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgag 296353  T
Q  260 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296352 tcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 296309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 14432505 - 14432685
Alignment:
Q  110 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||      
T  14432505 agttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgatcaagttggggagtgagtcat-agttattatgcacggtcgttgtcgttg--gtta-- 14432599  T
Q  210 tatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
           |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  14432600 -------tcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcc-ttcatgattaggaatctgttgagggcttatgccctggaat 14432685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 294267 - 294075
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgta-aggttg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||| || || ||||| |||  ||||  |||||| | ||||    
T  294267 tgttgctgttaattgaatatgatt-gttgctgattgctagtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaagttcgagttgtagaagttg 294169  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  294168 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 294075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20579336 - 20579249
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579336 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 20579249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20587029 - 20586942
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587029 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatatacacaagtcgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 20586942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24087308 - 24087222
Alignment:
Q  217 tcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24087308 tcgttgtcgtagatgagttgtatgctgatatacacaagttgagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctagaat 24087222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24087432 - 24087311
Alignment:
Q  63 cattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggg 162  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24087432 cattcaattagaatatacaaggtgttggtcgag-ttgtaag-ttgcgagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggg 24087335  T
Q  163 gagtgagtcataagttattatgcac 187  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||    
T  24087334 gagtatgtcat-agttattatgcac 24087311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 294084 - 294045
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  294084 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 294045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 262
Target Start/End: Original strand, 7792752 - 7792803
Alignment:
Q  211 atattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc 262  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7792752 atattgttgttgttgttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtcc 7792803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Original strand, 20438133 - 20438182
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  20438133 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagt 20438182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28312495 - 28312446
Alignment:
Q  141 tgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  28312495 tgttgatgttgaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagt 28312446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1716 - 1483
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| | ||||     
T  1716 tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttcgagttgtaag-tggcgagttgtcgttctaagtaacggagtcttaggtgggtgatgttgatcgagttt 1618  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagt 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1617 gggagtgagtcata-gttattatgcacggtcgttgtcgttg------cctatgttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaagttgagt 1525  T
Q  261 cctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1524 cc-ttcatgtttaggtaaccgttgagggctcatgccctggaat 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33134 - 32949
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||| || ||    
T  33134 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttgtcgtcac 33044  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33043 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaggtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 32949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 81678 - 81863
Alignment:
Q  110 agttgtcgtt-ctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttac 208  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||       |||||||| || ||    
T  81678 agttgtcgtttctaagtaacagagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtgagtga---gttattatgcacg------atcgttgtcgtcac 81768  T
Q  209 ctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  81769 ctatgttgttgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaggtggagtcctttcatgattaggaaactgttgagggctcatgccctggaat 81863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 8548 - 8740
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  ||||    
T  8548 tgttgttgttgattgaatatgatt-gttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttg 8646  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8647 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 8740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 253
Target Start/End: Original strand, 8731 - 8770
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8731 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgctgatatacacaa 8770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2570 - 2379
Alignment:
Q  10 gttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||  ||  | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||    
T  2570 gttgctgttgattgagtatgatt-gttgctgattgctggtttatgtttaactacattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgc 2472  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2471 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 2379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 138007 - 137815
Alignment:
Q  9 tgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgt-aaggttg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||  | ||||| ||| || || ||||| ||| |||||  ||||| ||  |||    
T  138007 tgttgctgttgattgagtatga-ttgttgctgattgctggtttatgtttaacttcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaatttg 137909  T
Q  108 caagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  137908 caagttgtcgttctaagtaatggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagtaagtcat-agttattatgcacagttgttgtcgttgt 137815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 134072 - 134209
Alignment:
Q  61 tgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaaggttgcaagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttg 160  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  134072 tgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc-ggttgtaag-ttgtgagttgtcgttataagaaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttg 134169  T
Q  161 gggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttg 201  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  134170 gggagtgagtcat-agttattgtgcacggtcgttgtcgttg 134209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 303
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134285
Alignment:
Q  224 cgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  134211 cgtagttgagttgtatgctgatata----agttgagtcctt-catgattaagacacggttgagggctcatgccctggaat 134285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 162515 - 162359
Alignment:
Q  10 gttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatacatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttgtaag-gttgc 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||||  ||  ||||||| ||| || || ||||| ||| |||||  |||||||  |||||    
T  162515 gttgctgttgattgattatgatt-gttgctgattgctagtttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttcgagttgtaaaagttgc 162417  T
Q  109 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggatgttgatgttgaccaagttggggagt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  162416 aagttgtcgttctaagtaacggagtcataggttgttgatgttgaccaagttggggagt 162359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 303
Target Start/End: Original strand, 6032 - 6111
Alignment:
Q  225 gtagttgagttgtatgttgatgtacacaa-gttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6032 gtagttgagttgtatgctgatatacacaaagttgagtccatttcataattaggaa-ctgttgagggctcatgccctggaat 6111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 185
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc-tttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  275 ttgtcgttgttgtagttgagttttatgttgatatacacaaagttgagtccattgcatactta-taaactgttgagggctcatgccctggaat 185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33831 - 33782
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc 262  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33831 ttgtcgttgttgtagttgagttgtatgttgatatacacaaagttgagtcc 33782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10608 - 10520
Alignment:
Q  216 gtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcctttcatgattaggaaaccgttgagggctcatgccctggaat 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    | |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10608 gtcgttgttgtagttgagttgtatgttgatatacacaaagtcgagtccattgtacactcataaaccgttgagggctcatgccctggaat 10520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 253
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1776
Alignment:
Q  189 gtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaa 253  Q
    |||||| ||||||| |||  |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1712 gtcgttgtcgttgtcgttgtctaggttgtcgttgttgtagctgagttgtatgttgatatacacaa 1776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4922
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc 262  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4970 ttgttgttgttgttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtcc 4922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3222 - 3123
Alignment:
Q  151 gaccaagttggggagtgagtcataagttattatgcacagtcgttatcgttgttgttacctatattgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtaca 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||   |||  |||||||||  || | |||||||||||||||| ||||    
T  3222 gaccaagttgtggagtaagtcataattatttatgcacagttgttattgtcgttgt---ctacgttgtcgttgatgttgctgagttgtatgttgatataca 3126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7253 - 7205
Alignment:
Q  215 tgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacac-aagttgagtcc 262  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7253 tgtcgttgttgtagatgagttgtatgttgatatacacaaagttgagtcc 7205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6052 - 6004
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc 262  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6052 ttgttgttgttgttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtcc 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8204 - 8156
Alignment:
Q  214 ttgtcgttgtcgtagttgagttgtatgttgatgtacacaagttgagtcc 262  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8204 ttgttgttgttgttgttgagttgtatgtagatatacacaagttgagtcc 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University