View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7310_low_1 (Length: 873)

Name: NF7310_low_1
Description: NF7310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7310_low_1
NF7310_low_1
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (4-503)||(15284680-15285179)
chr4 (4-503)||(15227890-15228389)
chr4 (4-503)||(1900277-1900776)
chr4 (5-503)||(24460358-24460856)
chr4 (4-500)||(15391090-15391586)
chr4 (1-503)||(14235274-14235776)
chr4 (543-862)||(15285219-15285538)
chr4 (543-864)||(15227529-15227850)
chr4 (543-864)||(1899916-1900237)
chr4 (1-503)||(17014020-17014522)
chr4 (1-503)||(24592063-24592565)
chr4 (1-503)||(14665038-14665540)
chr4 (543-864)||(14235819-14236140)
chr4 (1-503)||(14763053-14763555)
chr4 (1-502)||(18800362-18800863)
chr4 (1-502)||(36344264-36344765)
chr4 (1-503)||(6569873-6570375)
chr4 (1-503)||(5005893-5006395)
chr4 (1-500)||(33673547-33674046)
chr4 (562-863)||(14664675-14664976)
chr4 (1-503)||(31126267-31126769)
chr4 (1-503)||(40105387-40105889)
chr4 (25-503)||(14098561-14099039)
chr4 (562-863)||(17013657-17013958)
chr4 (1-500)||(30753777-30754276)
chr4 (1-500)||(39850661-39851160)
chr4 (567-864)||(15391650-15391948)
chr4 (1-503)||(24112682-24113184)
chr4 (1-503)||(34188709-34189211)
chr4 (562-863)||(24592624-24592925)
chr4 (25-502)||(54833408-54833885)
chr4 (1-503)||(21969721-21970223)
chr4 (1-503)||(27163066-27163568)
chr4 (562-863)||(6569510-6569811)
chr4 (553-677)||(24460906-24461030)
chr4 (554-863)||(14763609-14763918)
chr4 (554-863)||(36344817-36345126)
chr4 (581-863)||(19372918-19373200)
chr4 (565-863)||(27163633-27163931)
chr4 (571-812)||(54833098-54833339)
chr4 (565-863)||(5005527-5005825)
chr4 (598-863)||(14098198-14098463)
chr4 (565-780)||(30753482-30753697)
chr4 (598-780)||(31126867-31127049)
chr4 (598-803)||(18800971-18801176)
chr4 (565-803)||(33674126-33674364)
chr4 (598-851)||(40105987-40106240)
chr4 (565-780)||(21969441-21969656)
chr4 (673-812)||(39850331-39850470)
chr4 (554-702)||(24112483-24112631)
chr4 (554-702)||(34189262-34189410)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (4-503)||(19456162-19456661)
chr2 (4-503)||(21702905-21703404)
chr2 (5-503)||(27118689-27119187)
chr2 (5-503)||(3784655-3785153)
chr2 (5-503)||(34157012-34157509)
chr2 (5-503)||(34303045-34303543)
chr2 (4-503)||(16163600-16164102)
chr2 (5-503)||(31891070-31891568)
chr2 (543-864)||(19456701-19457022)
chr2 (543-864)||(21703444-21703765)
chr2 (4-503)||(22925769-22926268)
chr2 (173-500)||(27392973-27393300)
chr2 (1-503)||(28882215-28882717)
chr2 (1-503)||(27434182-27434684)
chr2 (1-503)||(12655543-12656045)
chr2 (1-503)||(20837919-20838421)
chr2 (1-503)||(23128304-23128806)
chr2 (562-852)||(27434746-27435036)
chr2 (1-500)||(9349720-9350219)
chr2 (25-500)||(40233515-40233990)
chr2 (1-503)||(34286355-34286857)
chr2 (1-503)||(34291415-34291917)
chr2 (1-500)||(13936282-13936781)
chr2 (543-864)||(27392630-27392951)
chr2 (1-500)||(12586814-12587313)
chr2 (1-500)||(27777226-27777725)
chr2 (1-500)||(27816984-27817483)
chr2 (1-502)||(37375163-37375664)
chr2 (25-503)||(11634948-11635426)
chr2 (25-503)||(21676944-21677422)
chr2 (562-863)||(23128868-23129169)
chr2 (1-500)||(27803711-27804210)
chr2 (25-503)||(11641137-11641615)
chr2 (562-863)||(28881852-28882153)
chr2 (1-503)||(32049799-32050301)
chr2 (1-503)||(34861681-34862183)
chr2 (1-503)||(37685647-37686149)
chr2 (1-503)||(37700912-37701414)
chr2 (1-503)||(37925494-37925996)
chr2 (1-500)||(39051560-39052059)
chr2 (562-863)||(20837556-20837857)
chr2 (1-500)||(12716340-12716839)
chr2 (1-503)||(16829076-16829578)
chr2 (1-503)||(16891903-16892405)
chr2 (562-863)||(12655180-12655481)
chr2 (1-503)||(39890075-39890577)
chr2 (1-494)||(260491-260984)
chr2 (1-503)||(31876282-31876784)
chr2 (1-428)||(19416237-19416664)
chr2 (543-677)||(31891608-31891742)
chr2 (543-677)||(27118515-27118649)
chr2 (553-677)||(3784481-3784605)
chr2 (553-677)||(34156838-34156962)
chr2 (562-677)||(34303602-34303717)
chr2 (553-677)||(16163426-16163550)
chr2 (565-863)||(34279087-34279385)
chr2 (289-503)||(34279450-34279664)
chr2 (565-812)||(13936849-13937096)
chr2 (565-779)||(21677487-21677701)
chr2 (571-863)||(37374799-37375091)
chr2 (565-812)||(261070-261317)
chr2 (565-863)||(11635494-11635792)
chr2 (565-863)||(11641683-11641981)
chr2 (565-812)||(34286043-34286290)
chr2 (565-812)||(34291103-34291350)
chr2 (598-780)||(12716943-12717125)
chr2 (565-812)||(37925182-37925429)
chr2 (565-812)||(40233188-40233435)
chr2 (598-780)||(31876002-31876184)
chr2 (598-780)||(34861401-34861583)
chr2 (598-780)||(37686247-37686429)
chr2 (598-780)||(37701512-37701694)
chr2 (598-780)||(39889783-39889965)
chr2 (565-773)||(32049526-32049734)
chr2 (673-812)||(12586490-12586629)
chr2 (598-780)||(16829676-16829858)
chr2 (598-780)||(16891623-16891805)
chr2 (598-803)||(19416837-19417042)
chr2 (598-779)||(22926366-22926547)
chr2 (673-812)||(9350407-9350546)
chr2 (673-812)||(27776896-27777035)
chr2 (673-812)||(27803381-27803520)
chr2 (673-812)||(27816663-27816802)
chr2 (559-812)||(39052127-39052380)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (4-503)||(16626299-16626798)
chr3 (4-503)||(18530354-18530853)
chr3 (5-503)||(5652353-5652851)
chr3 (4-503)||(31033910-31034409)
chr3 (4-503)||(32292718-32293217)
chr3 (5-503)||(4625910-4626408)
chr3 (5-503)||(17993578-17994076)
chr3 (543-864)||(16626838-16627158)
chr3 (543-864)||(18529999-18530320)
chr3 (5-500)||(5713196-5713691)
chr3 (5-500)||(5724106-5724601)
chr3 (5-500)||(5767767-5768262)
chr3 (1-503)||(18051228-18051730)
chr3 (1-503)||(6192282-6192784)
chr3 (1-503)||(8295938-8296440)
chr3 (1-503)||(15740884-15741386)
chr3 (1-503)||(4721597-4722099)
chr3 (1-503)||(18330635-18331137)
chr3 (1-503)||(29148545-29149047)
chr3 (1-503)||(4796443-4796945)
chr3 (35-500)||(5756907-5757371)
chr3 (1-503)||(8301057-8301559)
chr3 (1-503)||(15892496-15892998)
chr3 (1-503)||(7073178-7073680)
chr3 (1-503)||(22387368-22387870)
chr3 (1-503)||(35880732-35881234)
chr3 (1-503)||(10396099-10396601)
chr3 (562-852)||(15893060-15893350)
chr3 (1-503)||(28115744-28116246)
chr3 (1-503)||(4416885-4417387)
chr3 (1-503)||(18276842-18277344)
chr3 (1-503)||(18307444-18307946)
chr3 (1-500)||(11110139-11110638)
chr3 (1-503)||(18292143-18292645)
chr3 (1-500)||(20576637-20577136)
chr3 (1-500)||(29664760-29665259)
chr3 (1-500)||(48465896-48466395)
chr3 (1-503)||(28021241-28021743)
chr3 (1-494)||(8211713-8212206)
chr3 (562-863)||(8301618-8301919)
chr3 (1-500)||(36996867-36997366)
chr3 (1-440)||(51782052-51782491)
chr3 (1-503)||(5609112-5609614)
chr3 (1-503)||(21674659-21675161)
chr3 (25-502)||(6542276-6542753)
chr3 (1-503)||(28339268-28339770)
chr3 (562-863)||(8295578-8295879)
chr3 (562-863)||(18050865-18051166)
chr3 (562-863)||(4797007-4797308)
chr3 (60-501)||(5466953-5467394)
chr3 (562-863)||(15741436-15741737)
chr3 (27-503)||(31964289-31964765)
chr3 (1-503)||(47023419-47023921)
chr3 (27-503)||(17984772-17985248)
chr3 (60-503)||(4346536-4346979)
chr3 (25-502)||(18242706-18243183)
chr3 (562-863)||(35880369-35880670)
chr3 (1-503)||(32439120-32439622)
chr3 (130-503)||(50133990-50134363)
chr3 (60-503)||(22870705-22871148)
chr3 (60-503)||(22885764-22886207)
chr3 (565-863)||(4721234-4721532)
chr3 (1-494)||(5013687-5014180)
chr3 (1-502)||(5596147-5596648)
chr3 (1-428)||(24328200-24328627)
chr3 (562-863)||(29149109-29149410)
chr3 (1-503)||(7996528-7997030)
chr3 (1-503)||(10643036-10643538)
chr3 (562-863)||(18330277-18330573)
chr3 (27-502)||(20066010-20066485)
chr3 (565-863)||(6191919-6192217)
chr3 (1-503)||(18225157-18225659)
chr3 (121-440)||(51797141-51797461)
chr3 (554-863)||(8211344-8211653)
chr3 (553-677)||(17994126-17994250)
chr3 (565-863)||(28116314-28116612)
chr3 (562-677)||(4625736-4625851)
chr3 (565-863)||(7072815-7073113)
chr3 (554-863)||(18277398-18277707)
chr3 (554-863)||(18292699-18293008)
chr3 (554-863)||(18308000-18308309)
chr3 (553-677)||(5652179-5652303)
chr3 (554-773)||(20065739-20065958)
chr3 (554-852)||(10395750-10396048)
chr3 (565-863)||(47023056-47023354)
chr3 (598-812)||(22871264-22871478)
chr3 (598-812)||(22886323-22886537)
chr3 (598-779)||(5466672-5466853)
chr3 (598-803)||(5596756-5596961)
chr3 (565-677)||(5713016-5713128)
chr3 (565-677)||(5723926-5724038)
chr3 (565-677)||(5757439-5757551)
chr3 (565-677)||(5768330-5768442)
chr3 (565-815)||(7996213-7996463)
chr3 (565-815)||(10642721-10642971)
chr3 (598-780)||(18224877-18225059)
chr3 (574-863)||(21674296-21674585)
chr3 (598-780)||(17985346-17985528)
chr3 (598-780)||(28020964-28021146)
chr3 (565-803)||(36997446-36997684)
chr3 (598-863)||(5013315-5013580)
chr3 (598-851)||(6542864-6543117)
chr3 (565-812)||(11110718-11110965)
chr3 (598-780)||(4347074-4347256)
chr3 (598-812)||(18242381-18242595)
chr3 (304-503)||(4893176-4893375)
chr3 (673-812)||(20577327-20577466)
chr3 (673-803)||(51781674-51781804)
chr3 (598-803)||(24327822-24328027)
chr3 (598-779)||(28338989-28339170)
chr3 (598-779)||(31964863-31965044)
chr3 (598-779)||(50134461-50134642)
chr3 (565-749)||(29665342-29665526)
chr3 (673-779)||(4416603-4416709)
chr3 (554-702)||(22387921-22388069)
chr3 (673-776)||(5609787-5609890)
chr3 (565-812)||(48465569-48465816)
chr3 (673-803)||(51796762-51796893)
chr3 (554-852)||(32438771-32439069)
chr3 (554-702)||(4892977-4893125)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (4-503)||(20461085-20461584)
chr1 (4-503)||(20340087-20340586)
chr1 (4-503)||(16207783-16208282)
chr1 (4-503)||(28151866-28152365)
chr1 (543-864)||(20460748-20461069)
chr1 (543-864)||(16208319-16208640)
chr1 (3-503)||(41793059-41793559)
chr1 (1-503)||(10962674-10963176)
chr1 (1-503)||(28584985-28585487)
chr1 (1-503)||(51638222-51638724)
chr1 (543-677)||(20340626-20340760)
chr1 (565-863)||(41793624-41793922)
chr1 (598-812)||(10962362-10962576)
chr1 (598-812)||(51637910-51638124)
chr1 (598-803)||(28584682-28584887)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (4-503)||(16449636-16450135)
chr7 (4-503)||(16041329-16041828)
chr7 (4-503)||(26484700-26485199)
chr7 (4-503)||(39210661-39211160)
chr7 (5-503)||(31088103-31088601)
chr7 (4-503)||(2775365-2775864)
chr7 (5-503)||(2108644-2109142)
chr7 (5-503)||(45733466-45733964)
chr7 (4-374)||(26682638-26683008)
chr7 (5-374)||(4200682-4201051)
chr7 (543-852)||(16040980-16041289)
chr7 (546-864)||(16450178-16450496)
chr7 (1-503)||(5127998-5128500)
chr7 (1-503)||(10916503-10917005)
chr7 (1-503)||(11424412-11424913)
chr7 (1-503)||(16518051-16518553)
chr7 (1-503)||(2154579-2155081)
chr7 (1-503)||(16503015-16503517)
chr7 (562-863)||(16518615-16518916)
chr7 (562-863)||(16503579-16503880)
chr7 (1-503)||(18540805-18541307)
chr7 (1-503)||(5146975-5147477)
chr7 (1-503)||(26435263-26435765)
chr7 (1-503)||(26274729-26275231)
chr7 (1-500)||(3445315-3445814)
chr7 (1-500)||(26537505-26538004)
chr7 (1-503)||(4144758-4145260)
chr7 (1-503)||(26319504-26320006)
chr7 (1-502)||(31564025-31564526)
chr7 (1-503)||(16736095-16736597)
chr7 (1-503)||(16751149-16751651)
chr7 (1-503)||(17523538-17524040)
chr7 (1-503)||(17529175-17529677)
chr7 (1-503)||(9618657-9619159)
chr7 (25-503)||(26669573-26670051)
chr7 (562-863)||(2154216-2154517)
chr7 (60-494)||(11441587-11442021)
chr7 (1-428)||(24592176-24592603)
chr7 (1-503)||(45387349-45387851)
chr7 (562-863)||(5127635-5127936)
chr7 (562-863)||(10917064-10917365)
chr7 (25-502)||(31124927-31125404)
chr7 (562-863)||(11424975-11425276)
chr7 (1-503)||(5159525-5160027)
chr7 (553-677)||(31088651-31088775)
chr7 (553-677)||(45733292-45733416)
chr7 (565-815)||(45387034-45387284)
chr7 (565-863)||(5147542-5147840)
chr7 (565-863)||(16736662-16736960)
chr7 (565-863)||(16751716-16752014)
chr7 (565-863)||(17523175-17523473)
chr7 (565-863)||(17529742-17530040)
chr7 (598-863)||(31124554-31124819)
chr7 (565-803)||(11441263-11441501)
chr7 (554-779)||(4145314-4145539)
chr7 (598-863)||(24592776-24593041)
chr7 (598-812)||(9618345-9618559)
chr7 (598-780)||(26275329-26275511)
chr7 (565-863)||(26434900-26435198)
chr7 (598-778)||(26320104-26320284)
chr7 (673-780)||(3445020-3445127)
chr7 (565-780)||(26485946-26486161)
chr7 (1-160)||(26513130-26513289)
chr7 (565-812)||(26538075-26538322)
chr7 (598-812)||(26670149-26670363)
chr7 (554-702)||(5159326-5159474)
chr7 (673-780)||(31564709-31564816)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (4-503)||(22888484-22888983)
chr5 (4-503)||(25199043-25199542)
chr5 (5-503)||(13184299-13184796)
chr5 (4-503)||(33877261-33877760)
chr5 (5-503)||(11325808-11326306)
chr5 (5-503)||(13440144-13440642)
chr5 (5-503)||(29888732-29889230)
chr5 (1-503)||(23892220-23892722)
chr5 (543-865)||(23891855-23892177)
chr5 (543-864)||(25198682-25199003)
chr5 (5-503)||(9548193-9548691)
chr5 (1-503)||(24687803-24688305)
chr5 (1-503)||(23717634-23718136)
chr5 (1-503)||(23752096-23752598)
chr5 (1-503)||(33777501-33778003)
chr5 (1-503)||(22998760-22999262)
chr5 (1-503)||(30934647-30935149)
chr5 (8-503)||(11549368-11549863)
chr5 (1-503)||(24970032-24970534)
chr5 (1-503)||(15658406-15658908)
chr5 (1-502)||(18500376-18500877)
chr5 (562-863)||(24688367-24688668)
chr5 (1-502)||(28649250-28649751)
chr5 (1-503)||(6874319-6874821)
chr5 (1-503)||(12132169-12132671)
chr5 (3-503)||(41674723-41675223)
chr5 (1-500)||(31826053-31826552)
chr5 (1-500)||(43078269-43078768)
chr5 (1-503)||(2511065-2511567)
chr5 (1-503)||(9317465-9317967)
chr5 (1-503)||(18375058-18375560)
chr5 (1-503)||(30152032-30152534)
chr5 (1-494)||(31431463-31431956)
chr5 (1-502)||(37671129-37671630)
chr5 (25-503)||(8665145-8665623)
chr5 (1-503)||(15758503-15759005)
chr5 (1-502)||(13324475-13324976)
chr5 (562-863)||(23752660-23752961)
chr5 (562-863)||(30934287-30934588)
chr5 (1-502)||(37358289-37358790)
chr5 (1-503)||(5637924-5638426)
chr5 (1-502)||(3789556-3790057)
chr5 (1-500)||(24681457-24681956)
chr5 (1-500)||(24723984-24724483)
chr5 (562-863)||(23718198-23718500)
chr5 (669-863)||(24951761-24951955)
chr5 (1-503)||(26480406-26480907)
chr5 (1-503)||(33516370-33516872)
chr5 (562-863)||(11549005-11549306)
chr5 (543-700)||(22888287-22888444)
chr5 (25-502)||(37770657-37771134)
chr5 (1-500)||(40473195-40473694)
chr5 (1-503)||(30168483-30168985)
chr5 (1-503)||(32599118-32599620)
chr5 (1-503)||(34616532-34617034)
chr5 (1-428)||(30029504-30029931)
chr5 (562-863)||(33777138-33777439)
chr5 (25-502)||(37754995-37755472)
chr5 (562-862)||(22999324-22999624)
chr5 (1-503)||(33292539-33293041)
chr5 (1-503)||(28959432-28959934)
chr5 (95-428)||(29966806-29967139)
chr5 (553-677)||(13184846-13184970)
chr5 (553-677)||(13440692-13440816)
chr5 (553-677)||(33877087-33877211)
chr5 (565-812)||(9548756-9549003)
chr5 (543-677)||(11325634-11325768)
chr5 (565-863)||(15658973-15659271)
chr5 (565-803)||(41674420-41674658)
chr5 (565-812)||(31431130-31431377)
chr5 (598-812)||(2510753-2510967)
chr5 (565-779)||(8665688-8665902)
chr5 (565-812)||(30168171-30168418)
chr5 (598-812)||(9317153-9317367)
chr5 (598-780)||(24681171-24681353)
chr5 (598-780)||(24723698-24723880)
chr5 (673-851)||(40473873-40474051)
chr5 (565-863)||(43077900-43078198)
chr5 (598-863)||(18375658-18375923)
chr5 (565-812)||(18500961-18501208)
chr5 (565-863)||(3789177-3789475)
chr5 (598-780)||(12131889-12132071)
chr5 (562-660)||(24969878-24969976)
chr5 (598-780)||(37771245-37771427)
chr5 (598-863)||(5637561-5637826)
chr5 (598-815)||(15759103-15759320)
chr5 (598-863)||(30151669-30151934)
chr5 (598-851)||(37358901-37359154)
chr5 (673-812)||(6874004-6874143)
chr5 (598-812)||(26480094-26480308)
chr5 (598-780)||(31826665-31826847)
chr5 (598-780)||(33516090-33516272)
chr5 (598-812)||(34616223-34616437)
chr5 (598-780)||(37671738-37671920)
chr5 (673-812)||(37754670-37754809)
chr5 (598-780)||(32599715-32599897)
chr5 (598-780)||(28960044-28960226)
chr5 (598-803)||(28648937-28649142)
chr5 (598-803)||(29967312-29967517)
chr5 (598-803)||(30029126-30029331)
chr5 (673-812)||(13325165-13325304)
chr5 (554-702)||(33292340-33292488)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (4-503)||(2410-2909)
scaffold0260 (543-677)||(2949-3083)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (5-503)||(19658752-19659249)
chr8 (4-503)||(44563106-44563603)
chr8 (5-503)||(33244670-33245168)
chr8 (4-500)||(22080589-22081085)
chr8 (4-503)||(18710591-18711090)
chr8 (1-503)||(16283454-16283956)
chr8 (1-503)||(9354627-9355130)
chr8 (1-503)||(16277559-16278061)
chr8 (5-503)||(19688103-19688601)
chr8 (1-503)||(27608613-27609115)
chr8 (1-503)||(2136967-2137469)
chr8 (1-503)||(14557629-14558131)
chr8 (562-863)||(16283091-16283392)
chr8 (562-863)||(16277196-16277497)
chr8 (562-863)||(19687740-19688041)
chr8 (1-503)||(19674446-19674948)
chr8 (25-502)||(3329239-3329716)
chr8 (543-864)||(22081125-22081446)
chr8 (1-503)||(19208068-19208570)
chr8 (1-503)||(31489458-31489960)
chr8 (27-503)||(31354529-31355005)
chr8 (1-503)||(28361663-28362165)
chr8 (1-502)||(12092432-12092933)
chr8 (562-863)||(2137531-2137832)
chr8 (1-502)||(29829328-29829829)
chr8 (562-863)||(14557269-14557570)
chr8 (25-502)||(19286468-19286945)
chr8 (562-863)||(27609177-27609478)
chr8 (1-428)||(33258803-33259230)
chr8 (81-346)||(189256-189521)
chr8 (553-677)||(19659299-19659423)
chr8 (562-677)||(44562932-44563047)
chr8 (553-677)||(9354453-9354577)
chr8 (565-863)||(18710228-18710526)
chr8 (565-863)||(19674080-19674378)
chr8 (571-812)||(19286158-19286399)
chr8 (565-803)||(31490025-31490263)
chr8 (554-779)||(31354250-31354475)
chr8 (598-780)||(19208668-19208850)
chr8 (598-812)||(28362263-28362477)
chr8 (598-851)||(3329827-3330080)
chr8 (598-851)||(29828967-29829220)
chr8 (1-108)||(18791107-18791214)
chr8 (598-812)||(19518451-19518665)
chr8 (598-803)||(33258425-33258630)
chr8 (598-863)||(12093041-12093306)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (4-503)||(14142980-14143479)
chr6 (4-503)||(26787946-26788445)
chr6 (4-503)||(27196319-27196818)
chr6 (4-503)||(27252422-27252921)
chr6 (4-503)||(22456638-22457128)
chr6 (4-503)||(13521768-13522267)
chr6 (5-503)||(8892007-8892504)
chr6 (5-503)||(8903242-8903739)
chr6 (5-503)||(33373952-33374450)
chr6 (5-503)||(28162659-28163157)
chr6 (1-503)||(27290062-27290564)
chr6 (1-503)||(13298643-13299145)
chr6 (1-500)||(27272272-27272771)
chr6 (1-503)||(22934572-22935074)
chr6 (1-503)||(23857017-23857519)
chr6 (1-503)||(26918382-26918884)
chr6 (1-503)||(26989003-26989506)
chr6 (1-503)||(16749856-16750358)
chr6 (24-502)||(20160704-20161182)
chr6 (24-502)||(22171649-22172127)
chr6 (1-503)||(24304310-24304812)
chr6 (277-503)||(22477241-22477467)
chr6 (1-503)||(24863719-24864221)
chr6 (1-503)||(15424009-15424511)
chr6 (1-503)||(29549477-29549979)
chr6 (1-296)||(17092132-17092427)
chr6 (1-500)||(34463038-34463537)
chr6 (556-864)||(20160345-20160650)
chr6 (556-864)||(22172181-22172486)
chr6 (562-863)||(13299207-13299508)
chr6 (562-863)||(24863356-24863657)
chr6 (1-503)||(29573015-29573517)
chr6 (1-502)||(4773009-4773510)
chr6 (562-863)||(15424573-15424874)
chr6 (4-500)||(3696086-3696582)
chr6 (1-500)||(16674144-16674643)
chr6 (565-863)||(22935136-22935434)
chr6 (565-863)||(23857581-23857879)
chr6 (1-494)||(4545467-4545960)
chr6 (25-502)||(4757767-4758244)
chr6 (562-863)||(26988640-26988941)
chr6 (562-863)||(26999712-27000013)
chr6 (1-502)||(4525289-4525790)
chr6 (1-494)||(4723826-4724319)
chr6 (184-503)||(27000075-27000394)
chr6 (1-503)||(30557708-30558210)
chr6 (1-502)||(27007730-27008231)
chr6 (1-494)||(28207465-28207958)
chr6 (562-812)||(24304874-24305124)
chr6 (1-502)||(27359684-27360185)
chr6 (1-502)||(27450027-27450528)
chr6 (25-502)||(27485132-27485609)
chr6 (562-863)||(16749493-16749794)
chr6 (1-502)||(26116102-26116603)
chr6 (562-706)||(22477529-22477673)
chr6 (565-812)||(26918070-26918317)
chr6 (1-502)||(27044390-27044892)
chr6 (1-428)||(16943719-16944146)
chr6 (1-502)||(29501418-29501919)
chr6 (130-502)||(17025280-17025652)
chr6 (543-677)||(28162485-28162619)
chr6 (553-677)||(13522317-13522441)
chr6 (553-677)||(33374500-33374624)
chr6 (1-503)||(26777302-26777809)
chr6 (543-677)||(8892544-8892678)
chr6 (543-677)||(8903779-8903913)
chr6 (554-863)||(29549117-29549426)
chr6 (554-863)||(27044029-27044338)
chr6 (565-863)||(3695702-3696000)
chr6 (1-180)||(27019461-27019640)
chr6 (594-780)||(4525011-4525197)
chr6 (598-863)||(17024901-17025166)
chr6 (598-812)||(27484807-27485021)
chr6 (598-812)||(29501096-29501310)
chr6 (598-780)||(29572735-29572917)
chr6 (598-780)||(30558308-30558490)
chr6 (673-780)||(4757483-4757590)
chr6 (673-812)||(4772687-4772826)
chr6 (673-812)||(27007402-27007541)
chr6 (565-812)||(34463620-34463867)
chr6 (598-863)||(4546076-4546341)
chr6 (598-803)||(16944319-16944524)
chr6 (598-779)||(26777919-26778100)
chr6 (598-863)||(28207081-28207346)
chr6 (565-812)||(16673817-16674064)
chr6 (673-780)||(27360377-27360484)
chr6 (673-780)||(27450720-27450827)
chr6 (598-851)||(4724435-4724688)
chr6 (565-851)||(27629968-27630254)
chr6 (679-780)||(26116792-26116893)
chr6 (1-254)||(27629392-27629645)
chr6 (670-851)||(27272947-27273128)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (5-500)||(21569-22064)
scaffold0109 (543-864)||(21208-21529)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (543-864)||(20053-20374)
scaffold0124 (165-503)||(20393-20730)
scaffold0124 (1-428)||(30532-30960)
scaffold0124 (562-863)||(30095-30396)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (225-503)||(1-279)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (165-438)||(1831-2103)
scaffold0415 (1-440)||(6080-6521)
scaffold0415 (565-812)||(5682-5930)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-362)||(370-728)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (1-503)||(46734-47236)
scaffold0089 (5-503)||(39822-40320)
scaffold0089 (1-503)||(29768-30270)
scaffold0089 (562-863)||(29405-29706)
scaffold0089 (565-863)||(40385-40683)
scaffold0089 (562-863)||(47298-47599)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-503)||(27297-27800)
scaffold0143 (562-863)||(26934-27235)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (1-503)||(9571-10073)
scaffold0336 (594-863)||(7874-8143)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (130-503)||(7-381)
scaffold0029 (562-863)||(443-744)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (1-503)||(8815-9317)
scaffold0159 (27-503)||(20020-20496)
scaffold0159 (598-776)||(9415-9593)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (1-503)||(6988-7490)
scaffold0350 (598-780)||(7588-7770)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (1-503)||(25950-26453)
scaffold0144 (598-863)||(26551-26816)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (1-503)||(14679-15181)
scaffold0237 (598-863)||(15279-15544)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (1-494)||(7963-8456)
scaffold0038 (598-863)||(7579-7844)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (669-863)||(48568-48769)
scaffold0099 (59-422)||(46604-46981)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-60)||(119651-119706)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 15284680 - 15285179
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  15284680 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgat 15284779  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15284780 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 15284879  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15284880 aatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 15284979  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  15284980 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcag 15285079  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15285080 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 15228389 - 15227890
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  15228389 ctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 15228290  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15228289 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatatacccc 15228190  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  15228189 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 15228090  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  15228089 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcag 15227990  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15227989 gtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 1900776 - 1900277
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  1900776 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggt 1900677  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900676 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 1900577  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  1900576 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 1900477  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  1900476 atgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcag 1900377  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1900376 gtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24460856
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 24460657  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  24460658 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 24460757  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24460758 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 24460856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391586
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttaca 15391389  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15391390 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 15391489  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15391490 gtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 15391586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 14235274 - 14235776
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | |||  |||||    
T  14235274 tcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcat 14235373  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||       
T  14235374 ggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggt 14235473  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  14235474 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttcttt 14235573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  14235574 acaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggt 14235673  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14235674 taggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 14235773  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  14235774 agc 14235776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 543 - 862
Target Start/End: Original strand, 15285219 - 15285538
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285219 catttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 15285318  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15285319 gcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctt 15285418  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285419 tcttcttatgatgaccgttaccgttcctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 15285518  T
Q  843 agtccccatgatgtccatct 862  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  15285519 agtccccatggtgaccatct 15285538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 15227850 - 15227529
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15227850 catttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 15227751  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227750 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 15227651  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227650 tcttcttatgatgaccgttaccatgcctctttgatgcatttgcggaggattcatctttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 15227551  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  15227550 agtccccatggtgaccatctca 15227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 1900237 - 1899916
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1900237 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 1900138  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900137 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 1900038  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  1900037 tcttcttatgatgatcgttaccgtacctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttccaaacg 1899938  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  1899937 agtccccatggtgaccatctca 1899916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17014522 - 17014020
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  17014522 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 17014423  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17014422 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 17014323  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  17014322 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 17014223  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  17014222 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 17014123  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17014122 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 17014023  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  17014022 agc 17014020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 24592063 - 24592565
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  24592063 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 24592162  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24592163 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24592262  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24592263 ttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24592362  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24592363 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24592462  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24592463 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24592562  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24592563 agc 24592565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14665540 - 14665038
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14665540 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14665441  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14665440 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14665341  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14665340 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14665241  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14665240 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14665141  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14665140 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14665041  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  14665040 agc 14665038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 14235819 - 14236140
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14235819 catttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 14235918  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
      |||| |||||| | ||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235919 atatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 14236018  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  ||    
T  14236019 tcttcttatgatgaccattaccgtacttctttgatgtgcttgcagaggattcccctttctcgaacacaataatgtcttctctgacagcctcttctaagcg 14236118  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  14236119 ggttcccatggtgaccatctca 14236140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 14763053 - 14763555
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  14763053 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 14763152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14763153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14763252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  14763253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 14763352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14763353 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 14763452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14763453 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14763552  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  14763553 agc 14763555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18800362 - 18800863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18800362 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18800461  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18800462 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18800561  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18800562 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 18800661  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18800662 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18800761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18800762 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 18800861  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18800862 ag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 36344264 - 36344765
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  36344264 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 36344363  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  36344364 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 36344463  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  36344464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 36344563  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36344564 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggat 36344663  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  36344664 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 36344763  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  36344764 ag 36344765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6570375 - 6569873
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6570375 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 6570276  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
     |||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6570275 aatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6570176  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  6570175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 6570076  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6570075 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6569976  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6569975 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 6569876  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  6569875 agc 6569873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5006395 - 5005893
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||| ||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  5006395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 5006296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5006295 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5006196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  |||||||| ||     
T  5006195 ttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttc 5006096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5006095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5005996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  5005995 caggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5005896  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5005895 agc 5005893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 33673547 - 33674046
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  33673547 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 33673646  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  33673647 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 33673746  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33673747 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33673846  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  33673847 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 33673946  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33673947 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14664976 - 14664675
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||||     
T  14664976 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggag 14664877  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14664876 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14664777  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  14664776 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctaacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 14664677  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  14664676 tc 14664675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 31126267 - 31126769
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31126267 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 31126366  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31126367 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31126466  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31126467 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31126566  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  31126567 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 31126666  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31126667 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31126766  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  31126767 agc 31126769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 40105387 - 40105889
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  40105387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 40105486  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  40105487 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 40105586  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  40105587 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 40105686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  40105687 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 40105786  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  40105787 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 40105886  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  40105887 agc 40105889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14099039 - 14098561
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  14099039 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 14098940  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  14098939 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 14098840  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14098839 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 14098740  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  14098739 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 14098640  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14098639 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 14098561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17013958 - 17013657
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || |||     
T  17013958 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggag 17013859  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  17013858 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 17013759  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  17013758 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 17013659  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  17013658 tc 17013657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30754276 - 30753777
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  30754276 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 30754177  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30754176 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30754077  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  30754076 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 30753977  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30753976 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30753877  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30753876 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39851160 - 39850661
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39851160 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39851061  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39851060 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39850961  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  39850960 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 39850861  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39850860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39850761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39850760 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 567 - 864
Target Start/End: Original strand, 15391650 - 15391948
Alignment:
Q  567 gggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataac 666  Q
    ||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| | |||| ||||  || |    
T  15391650 gggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagc 15391749  T
Q  667 tgggcagcattaataggggcaa-cagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccg 765  Q
    || ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||     
T  15391750 tgagcaacattgatgggggcaaacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttcttatgatgaccattgcca 15391849  T
Q  766 tacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctca 864  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||||| || ||||||||    
T  15391850 tacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttcccaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcgggttcccatggtgaccatctca 15391948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24113184 - 24112682
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||  | ||||    
T  24113184 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcat 24113085  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  24113084 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 24112985  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24112684 agc 24112682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 34188709 - 34189211
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  34188709 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 34188808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34188809 gatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34188908  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  34189209 agc 34189211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 24592624 - 24592925
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24592624 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24592723  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24592724 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24592823  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  24592824 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 24592923  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  24592924 tc 24592925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 54833885 - 54833408
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  54833885 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 54833786  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  54833785 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 54833686  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  54833685 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 54833586  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  54833585 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 54833486  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  54833485 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21970223 - 21969721
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  21970223 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 21970124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | |     
T  21970123 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacat 21970024  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  21970023 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 21969924  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  21969923 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 21969824  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21969823 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 21969724  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  21969723 agc 21969721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 27163066 - 27163568
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  27163066 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 27163165  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27163166 gatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27163265  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27163266 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27163365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27163366 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27163465  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  27163466 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 27163565  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  27163566 agc 27163568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6569811 - 6569510
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  6569811 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 6569712  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  6569711 gcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 6569612  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  6569611 accatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatc 6569512  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  6569511 tc 6569510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 24460906 - 24461030
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24460906 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 24461005  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  24461006 acgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Original strand, 14763609 - 14763918
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  14763609 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 14763708  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14763709 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 14763808  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  14763809 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 14763908  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  14763909 tgaccatctc 14763918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Original strand, 36344817 - 36345126
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  36344817 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 36344916  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  36344917 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 36345016  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  36345017 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 36345116  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  36345117 tgaccatctc 36345126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 581 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19373200 - 19372918
Alignment:
Q  581 gacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaat 680  Q
    |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||    
T  19373200 gacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19373101  T
Q  681 aggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  19373100 aggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 19373001  T
Q  781 tttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    ||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19373000 ttcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19372918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 27163633 - 27163931
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  27163633 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 27163732  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  27163733 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 27163832  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || |||||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  27163833 gtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 27163931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 54833339 - 54833098
Alignment:
Q  571 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 670  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  671 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 770  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  54833239 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 54833140  T
Q  771 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  54833139 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 54833098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5005825 - 5005527
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  5005825 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 5005726  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5005725 tttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5005626  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| || | | | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5005625 atacctcttcgacgtactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5005527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14098463 - 14098198
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14098463 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 14098364  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  14098363 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 14098264  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  14098263 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 14098198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 30753697 - 30753482
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30753697 acgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 30753598  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30753597 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30753498  T
Q  765 gtacctctttgatgca 780  Q
     |||||||| ||||||    
T  30753497 atacctcttcgatgca 30753482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 31126867 - 31127049
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31126966  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31126967 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31127049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Original strand, 18800971 - 18801176
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800971 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 18801070  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18801071 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18801170  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  18801171 tttctc 18801176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 803
Target Start/End: Original strand, 33674126 - 33674364
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| ||||||  || || || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  33674126 acgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 33674225  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  33674226 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 33674325  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  33674326 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 33674364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Original strand, 40105987 - 40106240
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40105987 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 40106086  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |  ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  40106087 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtctattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 40106186  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| ||||||||    
T  40106187 tttctcaaacacaatgattccatccctgactgcttcctcaagacgggtccccat 40106240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 21969656 - 21969441
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21969656 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21969557  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  21969556 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 21969457  T
Q  765 gtacctctttgatgca 780  Q
     |||||||| ||||||    
T  21969456 atacctcttcgatgca 21969441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 39850470 - 39850331
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  39850470 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 39850371  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || | |||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39850370 tcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39850331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 24112631 - 24112483
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  24112631 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 24112532  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||    
T  24112531 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggat 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Original strand, 34189262 - 34189410
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  34189262 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 34189361  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  34189362 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggat 34189410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 19456162 - 19456661
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  19456162 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgat 19456261  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19456262 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 19456361  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456362 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 19456461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19456462 atgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 19456561  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456562 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 21702905 - 21703404
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  21702905 ctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgat 21703004  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703005 cgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 21703104  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  21703105 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 21703204  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21703205 atgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 21703304  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21703305 gtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118689
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 27118888  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  27118887 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 27118788  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  27118787 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagc 27118689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784655
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 3784854  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  3784853 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 3784754  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3784753 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 3784655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34157012
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 34157211  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  34157210 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 34157111  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34157110 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34157012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303543
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 34303344  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  34303345 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 34303444  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34303445 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 34303543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163600
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  104 catggtcaaacaaagagg---cttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 16163803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||    
T  16163802 acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggat 16163703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16163702 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 16163603  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16163602 agc 16163600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891568
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31891369  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  31891370 tgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 31891469  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31891470 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31891568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 19456701 - 19457022
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19456701 catttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgc 19456800  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456801 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctt 19456900  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19456901 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 19457000  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  19457001 agtccccatggtgaccatctca 19457022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 21703444 - 21703765
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21703444 catttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 21703543  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703544 gcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 21703643  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21703644 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 21703743  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  21703744 agtccccatggtgaccatctca 21703765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22926268
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacg 22926068  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  22926069 atatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 22926168  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22926169 gtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 173 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27393300 - 27392973
Alignment:
Q  173 cgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 272  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27393300 cgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 27393201  T
Q  273 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 372  Q
    ||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393200 taactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgagg 27393101  T
Q  373 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatata 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||| |    
T  27393100 tcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcataca 27393001  T
Q  473 gcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27393000 tcattggtatcggaggaaaggtaggtct 27392973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28882717 - 28882215
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  28882717 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 28882618  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28882617 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28882518  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28882517 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28882418  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  28882417 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 28882318  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28882317 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28882218  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28882217 agc 28882215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 27434182 - 27434684
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27434182 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27434281  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27434282 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27434381  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27434382 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27434481  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  27434482 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggat 27434581  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27434582 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27434681  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  27434682 agc 27434684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12656045 - 12655543
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | | || |||||||  ||||||    
T  12656045 tcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcat 12655946  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12655945 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12655846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  12655845 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 12655746  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  12655745 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 12655646  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12655645 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 12655546  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  12655545 agc 12655543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20838421 - 20837919
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  20838421 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 20838322  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20838321 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 20838222  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  20838221 ttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 20838122  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  20838121 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagat 20838022  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20838021 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 20837922  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  20837921 agc 20837919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 23128304 - 23128806
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23128304 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23128403  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23128404 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23128503  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23128504 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23128603  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23128604 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23128703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23128704 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23128803  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  23128804 agc 23128806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 562 - 852
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27435036
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  27434746 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 27434845  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  27434846 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 27434945  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 852  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27434946 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatg 27435036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 9349720 - 9350219
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  9349720 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcat 9349819  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9349820 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatac 9349919  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9349920 ctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9350019  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  9350020 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 9350119  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9350120 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40233990 - 40233515
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  40233990 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 40233891  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  40233890 tgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatg 40233791  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  40233790 atttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 40233691  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  40233690 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 40233591  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40233590 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34286857 - 34286355
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34286857 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34286758  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34286757 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34286658  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34286657 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34286558  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34286557 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34286458  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34286457 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34286358  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  34286357 agc 34286355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34291917 - 34291415
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34291917 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34291818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34291817 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34291718  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34291717 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34291618  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34291617 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34291518  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  34291517 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34291418  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  34291417 agc 34291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 13936282 - 13936781
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13936282 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcat 13936381  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13936382 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13936481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  13936482 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 13936581  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13936582 acgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13936681  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13936682 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 27392951 - 27392630
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27392951 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 27392852  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
       ||| ||||||  |||  || ||| |||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27392851 atgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatgggggcaacagtagccacagattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 27392752  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  27392751 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataatgccgtctctgacagcctcttctaagcg 27392652  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  27392651 ggttcccatggtgaccatctca 27392630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12587313 - 12586814
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12587313 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12587214  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12587213 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12587114  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12587113 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 12587014  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12587013 acgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12586914  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12586913 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27777725 - 27777226
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27777725 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27777626  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27777625 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27777526  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27777525 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27777426  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27777425 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27777326  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27777325 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27817483 - 27816984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27817483 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27817384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27817383 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27817284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27817283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27817184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27817183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27817084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27817083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37375664 - 37375163
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  37375664 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 37375565  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| || | ||    
T  37375564 gttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacac 37375465  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  37375464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 37375365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37375364 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37375265  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  37375264 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 37375165  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37375164 ag 37375163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Original strand, 11634948 - 11635426
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11634948 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11635047  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11635048 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11635147  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11635148 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11635247  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11635248 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11635347  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635348 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11635426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Original strand, 21676944 - 21677422
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  21676944 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 21677043  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  21677044 tgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 21677143  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21677144 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21677243  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21677244 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 21677343  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  21677344 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 21677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 23128868 - 23129169
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  23128868 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 23128967  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  23128968 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 23129067  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  23129068 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 23129167  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  23129168 tc 23129169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27804210 - 27803711
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27804210 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27804111  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27804110 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacac 27804011  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27804010 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27803911  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27803910 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27803811  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27803810 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Original strand, 11641137 - 11641615
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11641137 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11641236  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11641237 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11641336  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11641337 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11641436  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11641437 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11641536  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  11641537 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagc 11641615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28882153 - 28881852
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  28882153 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 28882054  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  28882053 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 28881954  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  28881953 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacagcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 28881854  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  28881853 tc 28881852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32050301 - 32049799
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  32050301 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 32050202  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  32050201 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 32050102  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32050101 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32050002  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  32050001 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 32049902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  32049901 ccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 32049802  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  32049801 agc 32049799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34862183 - 34861681
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  34862183 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 34862084  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  34862083 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacac 34861984  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  34861983 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 34861884  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34861883 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34861784  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  34861783 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 34861684  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  34861683 agc 34861681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 37685647 - 37686149
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37685647 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37685746  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37685747 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37685846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37685847 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37685946  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37685947 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37686046  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  37686047 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37686146  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  37686147 agc 37686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 37700912 - 37701414
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37700912 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37701011  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37701012 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37701111  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37701112 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37701211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37701212 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37701311  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  37701312 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37701411  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  37701412 agc 37701414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37925996 - 37925494
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37925996 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37925897  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37925896 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37925797  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37925796 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37925697  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  37925696 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 37925597  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  37925596 cgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcct 37925497  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  37925496 agc 37925494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 39051560 - 39052059
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39051560 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39051659  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   | || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39051660 gatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39051759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  39051760 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 39051859  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39051860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39051959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39051960 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20837857 - 20837556
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  20837857 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggat 20837758  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  20837757 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 20837658  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  20837657 accatacctctttgatgcattcacagtggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 20837558  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  20837557 tc 20837556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 12716340 - 12716839
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12716340 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12716439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12716440 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12716539  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12716540 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12716639  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12716640 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12716739  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  12716740 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 16829076 - 16829578
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16829076 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16829175  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16829176 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16829275  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16829276 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16829375  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16829376 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16829475  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16829476 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16829575  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16829576 agc 16829578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16892405 - 16891903
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16892405 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16892306  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16892305 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16892206  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16892205 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16892106  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16892105 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16892006  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16892005 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16891906  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16891905 agc 16891903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12655481 - 12655180
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  12655481 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 12655382  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  12655381 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 12655282  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  12655281 accatacctctttgatgcattcacagagggttcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 12655182  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  12655181 tc 12655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 39890577 - 39890075
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39890577 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39890478  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39890477 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39890378  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  39890377 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 39890278  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| |||||||||||||    
T  39890277 acgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggat 39890178  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39890177 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 39890078  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  39890077 agc 39890075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Original strand, 260491 - 260984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  260491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 260590  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||| |||||||  | ||    
T  260591 gatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacac 260690  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  260691 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 260790  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  260791 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagat 260890  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  260891 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31876784 - 31876282
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||| | |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31876784 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcat 31876685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| |||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31876684 gatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31876585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31876584 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 31876485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31876484 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31876385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31876384 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31876285  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  31876284 agc 31876282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 19416237 - 19416664
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19416237 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19416336  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19416337 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19416436  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  19416437 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttc 19416536  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19416537 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19416636  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416637 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Original strand, 31891608 - 31891742
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891608 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 31891707  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  31891708 gcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27118649 - 27118515
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27118649 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 27118550  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  27118549 gcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3784605 - 3784481
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3784605 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 3784506  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  3784505 acgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34156962 - 34156838
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34156962 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 34156863  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  34156862 acgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 562 - 677
Target Start/End: Original strand, 34303602 - 34303717
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  34303602 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 34303701  T
Q  662 ataactgggcagcatt 677  Q
     || ||| ||||||||    
T  34303702 gtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16163550 - 16163426
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16163550 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 16163451  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  16163450 acgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 34279385 - 34279087
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34279385 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34279286  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34279285 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34279186  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| || | |||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  34279185 atacctcttcgacgtattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 34279087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279450
Alignment:
Q  289 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 388  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  389 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggagg 488  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  489 aaaagtaggtctagc 503  Q
     ||||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagc 34279450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 13936849 - 13937096
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  13936849 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 13936948  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  13936949 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 13937048  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13937049 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13937096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 565 - 779
Target Start/End: Original strand, 21677487 - 21677701
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  21677487 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 21677586  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  21677587 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 21677686  T
Q  765 gtacctctttgatgc 779  Q
     |||||||| |||||    
T  21677687 atacctcttcgatgc 21677701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 571 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37374799
Alignment:
Q  571 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 670  Q
    ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 37374992  T
Q  671 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 770  Q
      || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37374991 ttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 37374892  T
Q  771 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  37374891 cttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 37374799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 261070 - 261317
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  261070 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 261169  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  261170 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 261269  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  261270 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 261317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 11635494 - 11635792
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11635494 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11635593  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11635594 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11635693  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11635694 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 11641683 - 11641981
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  11641683 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 11641782  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||||||||| || || || |||||    
T  11641783 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgcttctttcttcttgtggtgtccattacc 11641882  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     ||||||||  | ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  11641883 atacctcttcaacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 11641981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 34286290 - 34286043
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34286290 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34286191  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34286190 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34286091  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34286090 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34286043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 34291350 - 34291103
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  34291350 acgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggca 34291251  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34291250 tttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34291151  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34291150 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34291103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 12716943 - 12717125
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12716943 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 12717042  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  12717043 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 12717125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 37925429 - 37925182
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  37925429 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 37925330  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  37925329 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 37925230  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  37925229 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 37925182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 40233435 - 40233188
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  40233435 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 40233336  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  40233335 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 40233236  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  40233235 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 40233188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 31876184 - 31876002
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31876184 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31876085  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  31876084 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 31876002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 34861583 - 34861401
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34861583 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 34861484  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  34861483 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 34861401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 37686247 - 37686429
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37686247 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37686346  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37686347 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37686429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 37701512 - 37701694
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37701512 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 37701611  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  37701612 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 37701694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 39889965 - 39889783
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  39889965 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggcca 39889866  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  39889865 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 39889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 32049734 - 32049526
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  32049734 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 32049635  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||    
T  32049634 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttcttttttcttgtggtgtccattacc 32049535  T
Q  765 gtacctctt 773  Q
     ||||||||    
T  32049534 atacctctt 32049526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 12586629 - 12586490
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  12586629 gcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 12586530  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12586529 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 12586490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 16829676 - 16829858
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16829775  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16829776 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16829858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 16891805 - 16891623
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| || || ||||| |||||||    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagcca 16891706  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  16891705 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 16891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Original strand, 19416837 - 19417042
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19416837 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagcca 19416936  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19416937 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19417036  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  19417037 tttctc 19417042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Original strand, 22926366 - 22926547
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  22926366 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 22926465  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  22926466 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 22926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Original strand, 9350407 - 9350546
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  9350407 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 9350506  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9350507 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9350546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27777035 - 27776896
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27777035 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27776936  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27776935 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27776896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27803520 - 27803381
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27803520 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27803421  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27803420 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27803381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27816802 - 27816663
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27816802 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27816703  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27816702 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27816663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 812
Target Start/End: Original strand, 39052127 - 39052380
Alignment:
Q  559 gcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 658  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||    
T  39052127 gcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacg 39052226  T
Q  659 gaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgacc 758  Q
    ||   |  || || |||||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  39052227 gaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtcc 39052326  T
Q  759 gttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  39052327 attaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 39052380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 16626299 - 16626798
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16626299 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgat 16626398  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626399 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 16626498  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16626499 aatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 16626598  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16626599 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16626698  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626699 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18530853 - 18530354
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18530853 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 18530754  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530753 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctc 18530654  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18530653 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 18530554  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18530553 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 18530454  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18530453 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652353
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 5652552  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  5652551 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 5652452  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5652451 tgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 5652353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034409
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 31034209  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  31034210 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcag 31034309  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31034310 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292718
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 32292918  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  32292917 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 32292818  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32292817 gtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4625910
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 4626109  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  4626108 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 4626009  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4626008 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 4625910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17994076
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 17993877  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  17993878 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 17993977  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17993978 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 17994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 16626838 - 16627158
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16626838 catttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgt 16626937  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626938 gcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttc-t 16627036  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16627037 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctaggcg 16627136  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16627137 agtccccatggtgaccatctca 16627158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 18530320 - 18529999
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530320 catttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 18530221  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530220 gcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctt 18530121  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18530120 tcttcttatgatgaccgttaccgtatctctttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 18530021  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  18530020 agtccccatggtgaccatctca 18529999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713196
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5713392  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5713391 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5713292  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5713291 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5713196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5724106
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5724302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5724301 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5724202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5724201 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5724106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5768262
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5768066  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5768067 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5768166  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5768167 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5768262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18051730 - 18051228
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||    
T  18051730 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacat 18051631  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18051630 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatac 18051531  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18051530 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18051431  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| |||||    
T  18051430 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggat 18051331  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18051330 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18051231  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18051230 agc 18051228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6192784 - 6192282
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  6192784 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 6192685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6192684 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 6192585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  6192584 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 6192485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | |||    
T  6192484 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagat 6192385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6192384 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 6192285  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  6192284 agc 6192282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 8296440 - 8295938
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8296440 tcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8296341  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8296340 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 8296241  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  8296240 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 8296141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| |||    
T  8296140 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagat 8296041  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8296040 caggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8295941  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  8295940 agc 8295938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 15740884 - 15741386
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  15740884 tcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 15740983  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15740984 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15741083  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15741084 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15741183  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| ||    
T  15741184 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaat 15741283  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15741284 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15741383  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15741384 agc 15741386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4722099 - 4721597
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4722099 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4722000  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||||| ||||    
T  4721999 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatac 4721900  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| |||||     
T  4721899 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttc 4721800  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| |||||    
T  4721799 acgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggat 4721700  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4721699 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4721600  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  4721599 agc 4721597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330635
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18330838  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  18330837 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 18330738  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18330737 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18330638  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18330637 agc 18330635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 29148545 - 29149047
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  29148545 tcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 29148644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29148645 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 29148744  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29148745 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29148844  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29148845 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29148944  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29148945 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29149044  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  29149045 agc 29149047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 4796443 - 4796945
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4796443 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4796542  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4796543 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 4796642  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  4796643 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 4796742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  4796743 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 4796842  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4796843 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4796942  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  4796943 agc 4796945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 500
Target Start/End: Original strand, 5756907 - 5757371
Alignment:
Q  35 tctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagctt 134  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||     |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5756907 tctggatgtcattctgancacngtagcacnnncaaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactc 5757005  T
Q  135 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757006 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5757105  T
Q  235 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5757106 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5757205  T
Q  335 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 434  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5757206 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5757305  T
Q  435 ccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5757306 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 5757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 8301057 - 8301559
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8301057 tcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8301156  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8301157 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8301256  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  8301257 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 8301356  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  8301357 acgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 8301456  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8301457 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8301556  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  8301557 agc 8301559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 15892496 - 15892998
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||||||    
T  15892496 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcat 15892595  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15892596 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15892695  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15892696 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15892795  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||    
T  15892796 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggat 15892895  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15892896 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 15892995  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15892996 agc 15892998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7073680 - 7073178
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  7073680 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcat 7073581  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  7073580 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 7073481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  7073480 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 7073381  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7073380 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7073281  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7073280 caggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 7073181  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  7073180 agc 7073178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22387870
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22387667  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  22387668 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 22387767  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22387768 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtct 22387867  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  22387868 agc 22387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35880732
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 35880935  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| |||||    
T  35880934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggat 35880835  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35880834 caggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 35880735  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  35880734 agc 35880732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10396601 - 10396099
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10396601 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 10396502  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  10396501 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 10396402  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10396401 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 10396302  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10396301 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10396202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10396201 caggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtct 10396102  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  10396101 agc 10396099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 562 - 852
Target Start/End: Original strand, 15893060 - 15893350
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  15893060 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 15893159  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  15893160 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 15893259  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 852  Q
    ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  15893260 actatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacagcttcttccagacgagttcccatg 15893350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 28115744 - 28116246
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  28115744 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 28115843  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  28115844 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 28115943  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28115944 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28116043  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28116044 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28116143  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28116144 caagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28116243  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28116244 agc 28116246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4417387 - 4416885
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  4417387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggcat 4417288  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4417287 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4417188  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  4417187 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 4417088  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4417087 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4416988  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  4416987 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4416888  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  4416887 agc 4416885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 18276842 - 18277344
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18276842 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18276941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18276942 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18277041  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18277042 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18277141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18277142 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18277241  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18277242 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18277341  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18277342 agc 18277344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 18307444 - 18307946
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18307444 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18307543  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18307544 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18307643  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18307644 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18307743  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18307744 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18307843  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18307844 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18307943  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18307944 agc 18307946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 11110139 - 11110638
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  11110139 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 11110238  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  11110239 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacac 11110338  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  11110339 ttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 11110438  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  11110439 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 11110538  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11110539 caggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 18292143 - 18292645
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18292143 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18292242  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18292243 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18292342  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18292343 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18292442  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18292443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18292542  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18292543 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18292642  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18292643 agc 18292645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 20576637 - 20577136
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  20576637 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 20576736  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  20576737 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 20576836  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  20576837 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 20576936  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  20576937 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 20577036  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20577037 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 29664760 - 29665259
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29664760 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29664859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29664860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29664959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29664960 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29665059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  29665060 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 29665159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29665160 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 48466395 - 48465896
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  48466395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 48466296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  48466295 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 48466196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  48466195 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 48466096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  48466095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 48465996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48465995 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28021743 - 28021241
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  28021743 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 28021644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28021643 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28021544  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28021543 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28021444  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || ||||    
T  28021443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggat 28021344  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28021343 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28021244  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28021243 agc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8212206 - 8211713
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8212206 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8212107  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8212106 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8212007  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  8212006 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 8211907  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8211906 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8211807  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8211806 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 8211713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 8301618 - 8301919
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||     
T  8301618 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggag 8301717  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8301718 gcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8301817  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8301818 accatacctctttgacgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8301917  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  8301918 tc 8301919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 36996867 - 36997366
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  36996867 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 36996966  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36996967 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 36997066  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  36997067 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 36997166  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36997167 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 36997266  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997267 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51782491 - 51782052
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  51782491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 51782392  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51782391 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51782292  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  51782291 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttc 51782192  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  51782191 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 51782092  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782091 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 5609112 - 5609614
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5609112 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5609211  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  5609212 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 5609311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5609312 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5609411  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5609412 acgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5609511  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  5609512 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5609611  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5609612 agc 5609614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21675161 - 21674659
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  21675161 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 21675062  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  21675061 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 21674962  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  21674961 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 21674862  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  21674861 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 21674762  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21674761 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 21674662  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  21674661 agc 21674659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 6542276 - 6542753
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  6542276 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6542375  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6542376 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6542475  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6542476 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6542575  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  6542576 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 6542675  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542676 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28339770 - 28339268
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28339770 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28339671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28339670 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28339571  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28339570 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28339471  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28339470 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28339371  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  28339370 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28339271  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28339270 agc 28339268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 8295879 - 8295578
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  8295879 ttaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 8295780  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  8295779 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 8295680  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  |||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8295679 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccttgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 8295580  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  8295579 tc 8295578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18051166 - 18050865
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  18051166 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 18051067  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18051066 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18050967  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18050966 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18050867  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  18050866 tc 18050865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 4797007 - 4797308
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  4797007 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 4797106  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  4797107 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 4797206  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  4797207 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 4797306  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  4797307 tc 4797308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 5467394 - 5466953
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5467394 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 5467295  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  5467294 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 5467195  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5467194 tattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 5467095  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  5467094 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagg 5466995  T
Q  460 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtcta 501  Q
    |  || ||||| | ||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  5466994 agttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtcta 5466953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 15741436 - 15741737
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  15741436 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 15741535  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15741536 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15741635  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
     || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  15741636 gccatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 15741735  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  15741736 tc 15741737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 503
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964765
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31964588  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31964589 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31964688  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31964689 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 47023921 - 47023419
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  47023921 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 47023822  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  47023821 gatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 47023722  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  47023721 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 47023622  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  47023621 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 47023522  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  47023521 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 47023422  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  47023421 agc 47023419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 503
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985248
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    |||| ||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagc 17985248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 4346536 - 4346979
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4346536 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 4346635  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  4346636 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacat 4346735  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4346736 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 4346835  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  460 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18243183 - 18242706
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  18243183 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18243084  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18243083 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18242984  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  18242983 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18242884  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18242883 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18242784  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18242783 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18242706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 35880670 - 35880369
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  35880670 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 35880571  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  35880570 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 35880471  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  35880470 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 35880371  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  35880370 tc 35880369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 32439622 - 32439120
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  32439622 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 32439523  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  32439522 gatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 32439423  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  32439122 agc 32439120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 503
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134363
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    | || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 50134189  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  50134190 gacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgta 50134289  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  50134290 caatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 50134363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22870705 - 22871148
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22870705 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22870804  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22870805 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22870904  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22870905 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22871004  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  460 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22885764 - 22886207
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22885764 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22885863  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22885864 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22885963  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22885964 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22886063  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  460 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 4721532 - 4721234
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  4721532 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 4721433  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  4721432 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 4721333  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4721332 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 4721234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 5014180 - 5013687
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  5014180 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 5014081  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5014080 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5013981  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5013980 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5013881  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5013880 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5013781  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  5013780 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 5013687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 5596147 - 5596648
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  5596147 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 5596246  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5596247 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5596346  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  5596347 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 5596446  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5596447 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5596546  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||    
T  5596547 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 5596646  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  5596647 ag 5596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24328627 - 24328200
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24328627 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24328528  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  24328527 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 24328428  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24328427 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24328328  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24328327 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24328228  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328227 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 29149109 - 29149410
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  29149109 ttaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 29149208  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  29149209 gcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 29149308  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  29149309 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 29149408  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  29149409 tc 29149410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 7997030 - 7996528
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  7997030 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7996931  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  7996930 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 7996831  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7996830 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7996731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7996730 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7996631  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  7996630 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7996531  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  7996530 agc 7996528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10643538 - 10643036
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  10643538 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 10643439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  10643438 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 10643339  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10643338 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10643239  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10643238 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10643139  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  10643138 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10643039  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  10643038 agc 10643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18330573 - 18330277
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  18330573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 18330479  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  18330478 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 18330379  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||  ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  18330378 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgagcacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 18330279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20066485 - 20066010
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     |||||||||| ||||||||  | ||||||    
T  20066485 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 20066386  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || | |||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || || || ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20066385 cacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 20066286  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20066285 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 20066186  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||| || ||     
T  20066185 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtc 20066086  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20066085 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 20066010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6192217 - 6191919
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  6192217 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 6192118  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  6192117 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatccatacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 6192018  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  6192017 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatctc 6191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18225659 - 18225157
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | ||||||    || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18225659 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18225560  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  18225559 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacac 18225460  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18225459 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18225360  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18225359 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18225260  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  18225259 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcct 18225160  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18225159 agc 18225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51797461 - 51797141
Alignment:
Q  121 gcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcag 220  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |    
T  51797461 gctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcgg 51797362  T
Q  221 cgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta 320  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  51797361 catgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcata 51797262  T
Q  321 gcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 419  Q
     || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51797261 acacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctg 51797162  T
Q  420 tctggttgtgcagtgccctct 440  Q
    ||| ||||| || ||||||||    
T  51797161 tctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 8211653 - 8211344
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8211653 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggta 8211554  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  8211553 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 8211454  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  8211453 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggactcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 8211354  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  8211353 tgaccatctc 8211344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 17994126 - 17994250
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17994126 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 17994225  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  17994226 acgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 28116314 - 28116612
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  28116314 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 28116413  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  28116414 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 28116513  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| |||||| | |  || |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28116514 atacctcttcgatgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28116612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 562 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4625851 - 4625736
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  4625851 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggag 4625752  T
Q  662 ataactgggcagcatt 677  Q
     || ||| ||||||||    
T  4625751 gtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7073113 - 7072815
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  7073113 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 7073014  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7073013 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7072914  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7072913 atacctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7072815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Original strand, 18277398 - 18277707
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18277398 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18277497  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18277498 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18277597  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18277598 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18277697  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  18277698 tgaccatctc 18277707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Original strand, 18292699 - 18293008
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18292699 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18292798  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18292799 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18292898  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18292899 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18292998  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  18292999 tgaccatctc 18293008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Original strand, 18308000 - 18308309
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  18308000 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 18308099  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18308100 tgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 18308199  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  18308200 tgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 18308299  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  18308300 tgaccatctc 18308309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5652303 - 5652179
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5652303 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 5652204  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  5652203 acgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 554 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 20065958 - 20065739
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||    
T  20065958 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggta 20065859  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20065858 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttcttcttgtga 20065759  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctt 773  Q
    || || ||||| ||||||||    
T  20065758 tgtccattaccatacctctt 20065739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 10396048 - 10395750
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||  ||| |||||    
T  10396048 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcatatatgggta 10395949  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  10395948 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 10395849  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 852  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||    
T  10395848 tgtccattaccatatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatg 10395750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 47023354 - 47023056
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  47023354 acgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 47023255  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  47023254 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 47023155  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||  ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  47023154 atacctcttcgatgcattcacagaggattcggctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 47023056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Original strand, 22871264 - 22871478
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22871264 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22871363  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22871364 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22871463  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  22871464 tttctcaaacacaat 22871478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Original strand, 22886323 - 22886537
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22886323 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 22886422  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||| |    
T  22886423 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcagc 22886522  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  22886523 tttctcaaacacaat 22886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 5466853 - 5466672
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5466853 tactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 5466754  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  5466753 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgc 5466672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Original strand, 5596756 - 5596961
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5596756 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 5596855  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||    
T  5596856 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgcagaggattcaac 5596955  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  5596956 tttctc 5596961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5713128 - 5713016
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5713128 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5713029  T
Q  665 actgggcagcatt 677  Q
     ||| ||||||||    
T  5713028 gctgagcagcatt 5713016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5724038 - 5723926
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5724038 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5723939  T
Q  665 actgggcagcatt 677  Q
     ||| ||||||||    
T  5723938 gctgagcagcatt 5723926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 677
Target Start/End: Original strand, 5757439 - 5757551
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5757439 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5757538  T
Q  665 actgggcagcatt 677  Q
     ||| ||||||||    
T  5757539 gctgagcagcatt 5757551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 677
Target Start/End: Original strand, 5768330 - 5768442
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  5768330 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggta 5768429  T
Q  665 actgggcagcatt 677  Q
     ||| ||||||||    
T  5768430 gctgagcagcatt 5768442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 7996463 - 7996213
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  7996463 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 7996364  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  7996363 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 7996264  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 815  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  7996263 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 7996213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 10642971 - 10642721
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  10642971 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 10642872  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  10642871 tttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 10642772  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 815  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  10642771 atacctcttcgaggcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 10642721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 18225059 - 18224877
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 18224960  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  18224959 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 18224877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 574 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 21674585 - 21674296
Alignment:
Q  574 tgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcag 673  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |  || || |    
T  21674585 tgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctg 21674486  T
Q  674 cattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctt 773  Q
    |||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |||||    
T  21674485 cattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctt 21674386  T
Q  774 tgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  21674385 cgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 21674296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 17985346 - 17985528
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  17985346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 17985445  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||    
T  17985446 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctttttgatgca 17985528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 28021146 - 28020964
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  28021146 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagcca 28021047  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  28021046 tggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccgttaccatacctctttgatgca 28020964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 803
Target Start/End: Original strand, 36997446 - 36997684
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| ||||||||| | || | ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  36997446 acgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 36997545  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  36997546 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 36997645  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  36997646 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 36997684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5013580 - 5013315
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  5013580 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 5013481  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  5013480 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 5013381  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5013380 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5013315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Original strand, 6542864 - 6543117
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542864 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 6542963  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  6542964 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 6543063  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  6543064 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 6543117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 11110718 - 11110965
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11110718 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11110817  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||    
T  11110818 tttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattacc 11110917  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  11110918 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 11110965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 4347074 - 4347256
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  | | ||||| ||||||   |  ||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4347074 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatacatgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagcca 4347173  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4347174 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4347256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 18242595 - 18242381
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18242595 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 18242496  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  18242495 ttgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 18242396  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  18242395 tttctcaaacacaat 18242381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4893176
Alignment:
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Original strand, 20577327 - 20577466
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  20577327 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 20577426  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  20577427 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 20577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 51781804 - 51781674
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  51781804 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 51781705  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
    | || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51781704 tcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51781674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 24328027 - 24327822
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24328027 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24327928  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  24327927 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 24327828  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  24327827 tttctc 24327822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 28339170 - 28338989
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  28339170 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 28339071  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  28339070 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 28338989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Original strand, 31964863 - 31965044
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  31964863 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 31964962  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  31964963 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 31965044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Original strand, 50134461 - 50134642
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  50134461 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 50134560  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  50134561 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 50134642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 749
Target Start/End: Original strand, 29665342 - 29665526
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  29665342 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggca 29665441  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 749  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665442 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttctt 29665526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 673 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 4416709 - 4416603
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4416709 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4416610  T
Q  773 ttgatgc 779  Q
    | |||||    
T  4416609 tcgatgc 4416603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Original strand, 22387921 - 22388069
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22387921 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggta 22388020  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22388021 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 22388069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 776
Target Start/End: Original strand, 5609787 - 5609890
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  5609787 gcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 5609886  T
Q  773 ttga 776  Q
    ||||    
T  5609887 ttga 5609890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 48465816 - 48465569
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||  | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  48465816 acgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 48465717  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  48465716 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 48465617  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  48465616 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 48465569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 51796893 - 51796762
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg-accgttaccgtacctc 771  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||| || |||    
T  51796893 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtgccattaccatatctc 51796794  T
Q  772 tttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
    || || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  51796793 ttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 51796762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 554 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 32439069 - 32438771
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  32439069 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 32438970  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     |||||    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||   | ||| || | || ||| || || || || ||||||||||| |||    
T  32438969 ggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtga 32438870  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatg 852  Q
    || || |||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| |||||||| |  | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  32438869 tgtccattaccgtatctcttcgcagcatttgcagatgactcaatcttctcaaacacaatgatgccttcccgaacagcttcttccagacgtgttcccatg 32438771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4893125 - 4892977
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  4893125 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 4893026  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  4893025 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20461584 - 20461085
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  20461584 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgat 20461485  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461484 catggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctc 20461385  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461384 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 20461285  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20461284 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 20461185  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20461184 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 20340087 - 20340586
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  20340087 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 20340186  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340187 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 20340286  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  20340287 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 20340386  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  20340387 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 20340486  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20340487 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 16207783 - 16208282
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16207783 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgat 16207882  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207883 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctc 16207982  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  16207983 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 16208082  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16208083 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16208182  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16208183 gtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28151866
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 28152066  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  28152065 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcag 28151966  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28151965 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 20461069 - 20460748
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461069 catttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 20460970  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460969 gcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctt 20460870  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20460869 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcattggcggaggattcaactttctcgaatataataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20460770  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20460769 agtccccatggtgaccatctca 20460748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 16208319 - 16208640
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16208319 catttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
       ||| | |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208419 atgtactgatacggcggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctt 16208518  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16208519 tcttcttatgatgaccgttaccgtaactctttgatgcatttacagaggattcaactttctcaaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16208618  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  16208619 agtccccatggtgaccatctca 16208640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 503
Target Start/End: Original strand, 41793059 - 41793559
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41793059 actgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatga 41793158  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    |||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || |    
T  41793159 tcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacactt 41793258  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || ||    
T  41793259 cgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcac 41793358  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41793359 gatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatca 41793458  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  41793459 ggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctag 41793558  T
Q  503 c 503  Q
    |    
T  41793559 c 41793559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10963176 - 10962674
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||  ||  ||||||    
T  10963176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcat 10963077  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  10963076 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 10962977  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10962976 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10962877  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10962876 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10962777  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  10962776 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10962677  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  10962676 agc 10962674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28585487 - 28584985
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28585487 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28585388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28585387 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28585288  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28585287 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28585188  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28585187 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28585088  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  28585087 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28584988  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28584987 agc 28584985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 51638724 - 51638222
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  51638724 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 51638625  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51638624 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51638525  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  51638524 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 51638425  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  51638424 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 51638325  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  51638324 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcct 51638225  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  51638224 agc 51638222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Original strand, 20340626 - 20340760
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340626 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 20340725  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  20340726 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 41793624 - 41793922
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  41793624 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 41793723  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41793724 tttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41793823  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     ||||||||||||||| |  | |||| |||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  41793824 atacctctttgatgcactcacagaggtttcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 41793922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 10962576 - 10962362
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  10962576 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 10962477  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |    
T  10962476 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcagc 10962377  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  10962376 tttctcaaacacaat 10962362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 51638124 - 51637910
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  51638124 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 51638025  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  51638024 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 51637925  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  51637924 tttctcaaacacaat 51637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28584887 - 28584682
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 28584788  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28584787 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28584688  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  28584687 tttctc 28584682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 16449636 - 16450135
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16449636 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgat 16449735  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449736 catggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctc 16449835  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  16449836 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 16449935  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  16449936 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcag 16450035  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450036 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16041828 - 16041329
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16041828 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgat 16041729  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16041728 cgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctc 16041629  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| |||    
T  16041628 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcaca 16041529  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16041528 atgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16041429  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16041428 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484700
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26484900  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26484899 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26484800  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26484799 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39211160
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 39210960  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  39210961 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 39211060  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39211061 gtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088601
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31088402  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  31088403 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 31088502  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31088503 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31088601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775365
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 2775665  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2775664 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2775565  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  2775564 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 2775465  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2775464 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2109142
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctca 2108843  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2108943  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  2108944 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2109043  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2109044 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2109142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733466
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 45733665  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  45733664 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 45733565  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45733564 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 45733466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26683008
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaa 26682937  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682938 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200682
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 4200752  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200751 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 543 - 852
Target Start/End: Complemental strand, 16041289 - 16040980
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16041289 catttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 16041190  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041189 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16041090  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16041089 tcttcttatgatgaccgttaccatacctctttgatgcatttacggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacg 16040990  T
Q  843 agtccccatg 852  Q
    ||| ||||||    
T  16040989 agttcccatg 16040980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 546 - 864
Target Start/End: Original strand, 16450178 - 16450496
Alignment:
Q  546 ttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgca 645  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  16450178 ttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcg 16450277  T
Q  646 tacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttct 745  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16450278 tacgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttct 16450377  T
Q  746 tcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagt 845  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16450378 tcttatgatgaccgttaccgtatctttttgatgcatttacagaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgacagcttcttctagacgagt 16450477  T
Q  846 ccccatgatgtccatctca 864  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  16450478 ccccatggtgaccatctca 16450496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5127998
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 5128201  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5128200 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5128101  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5128100 taggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5128001  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5128000 agc 5127998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 10916503 - 10917005
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  10916503 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 10916602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10916603 gatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 10916702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  10916703 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 10916802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  10916803 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 10916902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10916903 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 10917002  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  10917003 agc 10917005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11424913
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 11424710  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  11424711 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 11424810  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11424811 caggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 11424910  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  11424911 agc 11424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 16518051 - 16518553
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16518051 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16518150  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16518151 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16518250  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  16518251 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 16518350  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16518351 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16518450  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16518451 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16518550  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16518551 agc 16518553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2155081 - 2154579
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2155081 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2154982  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  2154981 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 2154882  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  2154881 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 2154782  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2154781 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2154682  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2154681 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtct 2154582  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  2154581 agc 2154579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 16503015 - 16503517
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16503015 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16503114  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16503115 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16503214  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16503215 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16503314  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16503315 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16503414  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16503415 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16503514  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16503515 agc 16503517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 16518615 - 16518916
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16518615 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16518714  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16518715 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16518814  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16518815 accatacctctttgatgcatttacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16518914  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  16518915 tc 16518916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 16503579 - 16503880
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16503579 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggag 16503678  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16503679 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16503778  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16503779 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16503878  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  16503879 tc 16503880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18541307 - 18540805
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  18541307 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagcat 18541208  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  18541207 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 18541108  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18540807 agc 18540805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 5146975 - 5147477
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5146975 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5147074  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  5147075 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 5147174  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  5147175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 5147274  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5147275 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5147374  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5147375 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5147474  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5147475 agc 5147477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26435765 - 26435263
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||    
T  26435765 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcat 26435666  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26435665 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26435566  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26435565 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26435466  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26435465 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26435366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26435365 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 26435266  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  26435265 agc 26435263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 26274729 - 26275231
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26274729 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 26274828  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26274829 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26274928  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26274929 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26275028  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26275029 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26275128  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26275129 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26275228  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  26275229 agc 26275231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3445814 - 3445315
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3445814 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3445715  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3445714 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 3445615  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  3445614 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 3445515  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3445514 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3445415  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3445414 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 26537505 - 26538004
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  26537505 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcat 26537604  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26537605 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26537704  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26537705 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 26537804  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26537805 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26537904  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26537905 caggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 4144758 - 4145260
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4144758 tcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4144857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  4144858 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 4144957  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  4144958 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 4145057  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4145058 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4145157  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  4145158 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4145257  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  4145258 agc 4145260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 26319504 - 26320006
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26319504 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcat 26319603  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26319604 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26319703  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26319704 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26319803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26319804 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26319903  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26319904 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26320003  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  26320004 agc 26320006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 31564025 - 31564526
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31564025 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31564124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31564125 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31564224  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31564225 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31564324  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31564325 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31564424  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31564425 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31564524  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  31564525 ag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 16736095 - 16736597
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16736095 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16736194  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16736195 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16736294  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16736295 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16736394  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16736395 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16736494  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16736495 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16736594  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16736595 agc 16736597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 16751149 - 16751651
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16751149 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16751248  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16751249 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16751348  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16751349 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16751448  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16751449 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16751548  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  16751549 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16751648  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16751649 agc 16751651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 17524040 - 17523538
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17524040 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17523941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17523940 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17523841  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17523840 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17523741  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17523740 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17523641  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  17523640 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17523541  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  17523540 agc 17523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 17529175 - 17529677
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17529175 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17529274  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17529275 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17529374  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17529375 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17529474  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17529475 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17529574  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  17529575 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17529674  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  17529675 agc 17529677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9619159 - 9618657
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9619159 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9619060  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9619059 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9618960  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9618959 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9618860  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9618859 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9618760  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  9618759 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9618660  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  9618659 agc 9618657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Original strand, 26669573 - 26670051
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  26669573 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26669672  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26669673 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26669772  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26669773 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26669872  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26669873 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26669972  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26669973 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 26670051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2154517 - 2154216
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  2154517 ttaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 2154418  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2154417 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2154318  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||  | || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  2154317 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatttcatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 2154218  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  2154217 tc 2154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441587
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || |  || || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacat 11441822  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11441821 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 11441722  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagt 459  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  11441721 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 11441622  T
Q  460 aactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
    |  || || || | ||||||||| |||||||||||    
T  11441621 agttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagt 11441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 24592176 - 24592603
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24592176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24592275  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  24592276 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 24592375  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24592376 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24592475  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24592476 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24592575  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592576 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 45387851 - 45387349
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  45387851 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 45387752  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  45387751 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 45387652  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  45387651 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 45387552  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  45387551 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 45387452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  45387451 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 45387352  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  45387351 agc 45387349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5127936 - 5127635
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  5127936 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 5127837  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  5127836 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 5127737  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  5127736 accatacctcttcgatgcattcacagaggactcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 5127637  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  5127636 tc 5127635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 10917064 - 10917365
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| |||| |     
T  10917064 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgaag 10917163  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  10917164 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 10917263  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| ||  | || || |  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  10917264 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgatttcatccctaacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 10917363  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  10917364 tc 10917365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 31125404 - 31124927
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  31125404 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 31125305  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31125304 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31125205  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  31125204 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31125105  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31125104 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 31125005  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31125004 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31124927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 11424975 - 11425276
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||     
T  11424975 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggag 11425074  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11425075 gcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11425174  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11425175 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11425274  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  11425275 tc 11425276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5160027 - 5159525
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  5160027 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 5159928  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  5159927 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 5159828  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5159527 agc 5159525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 31088651 - 31088775
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31088651 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 31088750  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  31088751 acgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 45733416 - 45733292
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45733416 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 45733317  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  45733316 acgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 45387284 - 45387034
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  45387284 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 45387185  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  45387184 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 45387085  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataat 815  Q
     |||||||| || ||| |||| || |||||| ||||||| || ||||||||    
T  45387084 atacctcttcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaataat 45387034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 5147542 - 5147840
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  5147542 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 5147641  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  5147642 tttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 5147741  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5147742 atacctcttcgatgcattcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgatcccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5147840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 16736662 - 16736960
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16736662 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16736761  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16736762 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16736861  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16736862 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16736960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 16751716 - 16752014
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  16751716 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 16751815  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16751816 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16751915  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  16751916 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 16752014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17523473 - 17523175
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17523473 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17523374  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17523373 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17523274  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17523273 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17523175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 17529742 - 17530040
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| |||||| | |    
T  17529742 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggagaca 17529841  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  17529842 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 17529941  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| || ||| | || || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17529942 atatctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31124819 - 31124554
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31124819 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 31124720  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  31124719 ttgattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcattcgcagaggattcagc 31124620  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  31124619 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 31124554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 11441501 - 11441263
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  11441501 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 11441402  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  11441401 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 11441302  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
     || ||||| || |||||| | ||||||||| |||||||    
T  11441301 atatctcttcgacgcatttacagaggattcagctttctc 11441263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 554 - 779
Target Start/End: Original strand, 4145314 - 4145539
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  4145314 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 4145413  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4145414 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtgg 4145513  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  4145514 tgtccattaccatacctcttcgatgc 4145539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 24592776 - 24593041
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24592776 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 24592875  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  24592876 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 24592975  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  24592976 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 24593041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 9618559 - 9618345
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9618559 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9618460  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  9618459 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 9618360  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  9618359 tttctcaaacacaat 9618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 26275329 - 26275511
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26275329 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26275428  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  26275429 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 26275511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26435198 - 26434900
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26435198 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26435099  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26435098 tttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26434999  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| | |||| | |  || |||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26434998 atatctcttcggtgcactcgtagaagattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26434900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 598 - 778
Target Start/End: Original strand, 26320104 - 26320284
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26320104 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26320203  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 778  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  26320204 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatg 26320284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 3445127 - 3445020
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3445127 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 3445028  T
Q  773 ttgatgca 780  Q
    | ||||||    
T  3445027 tcgatgca 3445020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 780
Target Start/End: Original strand, 26485946 - 26486161
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26485946 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26486045  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26486046 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26486145  T
Q  765 gtacctctttgatgca 780  Q
     |||||||| ||||||    
T  26486146 atacctcttcgatgca 26486161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26513289 - 26513130
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26513289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26513190  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttg 160  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513189 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 26538075 - 26538322
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  26538075 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 26538174  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26538175 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26538274  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  26538275 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 26538322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Original strand, 26670149 - 26670363
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  26670149 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcta 26670248  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26670249 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26670348  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  26670349 tttctcaaacacaat 26670363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 5159474 - 5159326
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  5159474 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 5159375  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5159374 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggat 5159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 780
Target Start/End: Original strand, 31564709 - 31564816
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  31564709 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 31564808  T
Q  773 ttgatgca 780  Q
    | ||||||    
T  31564809 tcgatgca 31564816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22888983 - 22888484
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22888983 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgat 22888884  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22888883 catggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctc 22888784  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  22888783 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 22888684  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22888683 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22888584  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22888583 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 25199542 - 25199043
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25199542 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgat 25199443  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25199442 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctc 25199343  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  25199342 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 25199243  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  25199242 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcag 25199143  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25199142 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184796
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13184497  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13184597  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13184598 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13184697  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13184698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877261
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 33877461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  33877460 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 33877361  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33877360 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11325808
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 11326007  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  11326006 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 11325907  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11325906 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 11325808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440642
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13440443  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13440444 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13440543  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13440544 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13440642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29889230
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctca 29888931  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacga 29889031  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  29889032 tgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcagg 29889131  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29889132 tggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 29889230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23892722 - 23892220
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  ||||||    
T  23892722 tcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcat 23892623  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23892622 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 23892523  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  23892522 ctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 23892423  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  23892422 acgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggat 23892323  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23892322 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtct 23892223  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  23892222 agc 23892220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 543 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 23892177 - 23891855
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23892177 catttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggc 23892078  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892077 gcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 23891978  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  23891977 tcttcttatgatgtccgttaccatacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagacg 23891878  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctcat 865  Q
    |||||||||| || |||||||||    
T  23891877 agtccccatggtgaccatctcat 23891855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 25199003 - 25198682
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25199003 catttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggc 25198904  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25198903 gcatatgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttcct 25198804  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  25198803 tcttcttatgatgtccgttaccgtacctctttgatgcattcacggaggattcaactttctcgaatacaataattccttctctgacagcttcttccagatg 25198704  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  25198703 agtccccatggtgaccatctca 25198682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548691
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 9548492  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  9548493 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 9548592  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9548593 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 9548691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 24687803 - 24688305
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24687803 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcat 24687902  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24687903 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24688002  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  24688003 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 24688102  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  24688103 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 24688202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||    
T  24688203 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtct 24688302  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24688303 agc 24688305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 23717634 - 23718136
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23717634 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23717733  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23717734 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23717833  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23717834 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23717933  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23717934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23718033  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23718034 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23718133  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  23718134 agc 23718136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 23752096 - 23752598
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  23752096 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 23752195  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23752196 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23752295  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23752296 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23752395  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  23752396 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 23752495  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23752496 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23752595  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  23752596 agc 23752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33778003 - 33777501
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  33778003 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 33777904  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33777903 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 33777804  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  33777803 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 33777704  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  33777703 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 33777604  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33777603 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 33777504  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  33777503 agc 33777501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 22998760 - 22999262
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22998760 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22998859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22998860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22998959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22998960 ttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22999059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  22999060 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 22999159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22999160 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22999259  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  22999260 agc 22999262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30935149 - 30934647
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  30935149 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 30935050  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30935049 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 30934950  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30934949 ttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 30934850  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  30934849 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 30934750  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30934749 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 30934650  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  30934649 agc 30934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549368
Alignment:
Q  8 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatg 107  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  108 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 207  Q
    |   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  208 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 307  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 11549564  T
Q  308 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 407  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549563 acttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11549464  T
Q  408 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11549463 gggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 11549368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24970534 - 24970032
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24970534 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24970435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||    
T  24970434 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtac 24970335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  |||||||| ||     
T  24970334 tttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttc 24970235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24970234 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24970135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24970134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24970035  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24970034 agc 24970032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 15658406 - 15658908
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  15658406 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 15658505  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | |     
T  15658506 gatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacat 15658605  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15658606 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15658705  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15658706 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15658805  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15658806 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 15658905  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15658906 agc 15658908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18500376 - 18500877
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18500376 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 18500475  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  18500476 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 18500575  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18500576 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18500675  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18500676 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18500775  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  18500776 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 18500875  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18500876 ag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 24688367 - 24688668
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24688367 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 24688466  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24688467 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24688566  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  24688567 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 24688666  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  24688667 tc 24688668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28649751 - 28649250
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28649751 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28649652  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28649651 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28649552  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28649551 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28649452  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28649451 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28649352  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28649351 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28649252  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  28649251 ag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 6874821 - 6874319
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6874821 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 6874722  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6874721 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6874622  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || ||||| ||     
T  6874621 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttc 6874522  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6874521 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6874422  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  6874421 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 6874322  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  6874321 agc 6874319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 12132671 - 12132169
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  12132671 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 12132572  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  12132571 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 12132472  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12132471 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 12132372  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12132371 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12132272  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  12132271 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 12132172  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  12132171 agc 12132169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 41675223 - 41674723
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41675223 actgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatga 41675124  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| ||| ||    
T  41675123 tcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatct 41675024  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| || ||    
T  41675023 caatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgac 41674924  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41674923 gatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatca 41674824  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || || || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41674823 ggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctag 41674724  T
Q  503 c 503  Q
    |    
T  41674723 c 41674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 31826053 - 31826552
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31826053 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31826152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31826153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 31826252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31826253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31826352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31826353 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31826452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31826453 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31826552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43078768 - 43078269
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  43078768 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 43078669  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  43078668 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 43078569  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  43078568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 43078469  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  43078468 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 43078369  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43078368 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2511567 - 2511065
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  2511567 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 2511468  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  2511467 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 2511368  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  2511367 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 2511268  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  2511267 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 2511168  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  2511167 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 2511068  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  2511067 agc 2511065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9317967 - 9317465
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9317967 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9317868  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9317867 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9317768  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9317767 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9317668  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9317667 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9317568  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  9317567 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9317468  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  9317467 agc 9317465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 18375058 - 18375560
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  18375058 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 18375157  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18375158 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18375257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18375258 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18375357  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18375358 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18375457  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18375458 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 18375557  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  18375558 agc 18375560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30152534 - 30152032
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  30152534 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 30152435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30152434 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30152335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30152334 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30152235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30152234 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30152135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  30152134 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30152035  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  30152034 agc 30152032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 31431956 - 31431463
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  31431956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 31431857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31431856 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31431757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31431756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31431657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31431656 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31431557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  31431556 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 31431463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 37671129 - 37671630
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  37671129 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 37671228  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |   |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37671229 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37671328  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  37671329 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 37671428  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37671429 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37671528  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37671529 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37671628  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37671629 ag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 503
Target Start/End: Original strand, 8665145 - 8665623
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || ||||    
T  8665145 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctt 8665244  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8665245 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8665344  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  8665345 atttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 8665444  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8665445 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 8665544  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8665545 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 8665623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 15758503 - 15759005
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  15758503 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 15758602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  15758603 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 15758702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  15758703 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 15758802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15758803 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15758902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  15758903 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 15759002  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15759003 agc 15759005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 13324475 - 13324976
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13324475 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 13324574  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13324575 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13324674  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  13324675 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 13324774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13324775 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13324874  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13324875 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 13324974  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  13324975 ag 13324976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 23752660 - 23752961
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23752660 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23752759  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23752760 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23752859  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23752860 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 23752959  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  23752960 tc 23752961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30934588 - 30934287
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  30934588 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 30934489  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30934488 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30934389  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30934388 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30934289  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  30934288 tc 30934287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 37358289 - 37358790
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  37358289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 37358388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37358389 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37358488  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  37358489 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 37358588  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37358589 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37358688  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37358689 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37358788  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37358789 ag 37358790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 5638426 - 5637924
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5638426 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5638327  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5638326 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5638227  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5638226 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5638127  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5638126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5638027  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  5638026 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5637927  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  5637926 agc 5637924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 3790057 - 3789556
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3790057 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3789958  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  3789957 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 3789858  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  3789857 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 3789758  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3789757 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3789658  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3789657 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3789558  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  3789557 ag 3789556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24681956 - 24681457
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24681956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24681857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24681856 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24681757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24681756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24681657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24681656 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24681557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24681556 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24724483 - 24723984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24724483 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24724384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24724383 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24724284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24724283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24724184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24724183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24724084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24724083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 23718198 - 23718500
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  23718198 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 23718297  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  23718298 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 23718397  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagctt-cttctagacgagtccccatgatgtccat 860  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||| |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  23718398 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttccttccagacgagttcccatggtgaccat 23718497  T
Q  861 ctc 863  Q
    |||    
T  23718498 ctc 23718500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 669 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24951955 - 24951761
Alignment:
Q  669 ggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtac 768  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24951955 ggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttaccatac 24951856  T
Q  769 ctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  24951855 ctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 24951761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26480907 - 26480406
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||   || | || ||  ||||||    
T  26480907 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcat 26480808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26480807 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26480709  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26480708 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26480609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26480608 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26480509  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26480508 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26480409  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  26480408 agc 26480406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33516872 - 33516370
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33516872 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33516773  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33516772 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33516673  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33516672 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33516573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33516572 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33516473  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33516472 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 33516373  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  33516372 agc 33516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 11549306 - 11549005
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  || |||| ||||| ||||||     
T  11549306 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgtgaatacggcacatatgggtatgacggag 11549207  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  11549206 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 11549107  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  11549106 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 11549007  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  11549006 tc 11549005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 543 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22888444 - 22888287
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22888444 catttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggc 22888345  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 700  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888344 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 37770657 - 37771134
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37770657 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctt 37770756  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37770757 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37770856  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || ||     
T  37770857 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacac 37770956  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37770957 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37771056  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37771057 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 40473195 - 40473694
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  40473195 tcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 40473294  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  40473295 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 40473394  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  40473395 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 40473494  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  40473495 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 40473594  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  40473595 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30168985 - 30168483
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  | ||||    
T  30168985 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcat 30168886  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  30168885 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatac 30168786  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30168785 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttc 30168686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30168685 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30168586  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  30168585 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30168486  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  30168485 agc 30168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 32599118 - 32599620
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  32599118 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 32599217  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| || ||||||||| | ||    
T  32599218 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacac 32599317  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32599318 ttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32599417  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  32599418 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 32599517  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32599518 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32599617  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  32599618 agc 32599620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 34617034 - 34616532
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  34617034 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 34616935  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  34616934 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 34616835  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  34616834 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 34616735  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34616734 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34616635  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34616634 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34616535  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  34616534 agc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30029931 - 30029504
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30029931 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30029832  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30029831 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30029732  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30029731 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30029632  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30029631 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30029532  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029531 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 33777439 - 33777138
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  33777439 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 33777340  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  33777339 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 33777240  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  33777239 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 33777140  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  33777139 tc 33777138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37755472 - 37754995
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  37755472 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37755373  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37755372 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37755273  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37755272 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37755173  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  37755172 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 37755073  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37755072 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 562 - 862
Target Start/End: Original strand, 22999324 - 22999624
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  22999324 ttaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 22999423  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  22999424 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 22999523  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  22999524 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 22999623  T
Q  862 t 862  Q
    |    
T  22999624 t 22999624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33293041 - 33292539
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  33293041 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 33292942  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  33292941 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 33292842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  33292541 agc 33292539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 28959432 - 28959934
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  28959432 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 28959531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||  |||||| | ||    
T  28959532 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacac 28959631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28959632 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28959731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28959732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28959831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28959832 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28959931  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28959932 agc 28959934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 428
Target Start/End: Original strand, 29966806 - 29967139
Alignment:
Q  95 tggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 194  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  29966806 tggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttc 29966905  T
Q  195 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagc 294  Q
    | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||    
T  29966906 acacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagc 29967005  T
Q  295 ttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggca 394  Q
    || || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||    
T  29967006 ttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggca 29967105  T
Q  395 acggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967106 acggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 13184846 - 13184970
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13184846 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13184945  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13184946 acgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 13440692 - 13440816
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13440692 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13440791  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13440792 acgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33877211 - 33877087
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33877211 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33877112  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33877111 acgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 9548756 - 9549003
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  9548756 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 9548855  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  9548856 tttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 9548955  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  9548956 atacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 9549003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11325768 - 11325634
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11325768 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 11325669  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11325668 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 15658973 - 15659271
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||  || |||| || || ||||||   |    
T  15658973 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatggatatgacggaggca 15659072  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  15659073 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 15659172  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15659173 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15659271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 41674658 - 41674420
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  41674658 acgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggca 41674559  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  41674558 tttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 41674459  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
     |||||||| || |||||  | ||||||||  |||||||    
T  41674458 atacctcttcgacgcattcacagaggattcggctttctc 41674420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 31431377 - 31431130
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31431377 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 31431278  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31431277 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31431178  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  31431177 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 31431130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 2510967 - 2510753
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2510967 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagcca 2510868  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  2510867 tggattgaccggctccagctgataccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 2510768  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  2510767 tttctcaaacacaat 2510753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 779
Target Start/End: Original strand, 8665688 - 8665902
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| | ||||   |    
T  8665688 acgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggca 8665787  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  8665788 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 8665887  T
Q  765 gtacctctttgatgc 779  Q
     |||||||| |||||    
T  8665888 atacctcttcgatgc 8665902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168171
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  30168418 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 30168319  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  30168318 tttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 30168219  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  30168218 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 30168171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 9317367 - 9317153
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9317367 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 9317268  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  9317267 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctctttgatgcactcacagaggattcagc 9317168  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  9317167 tttctcaaacacaat 9317153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 24681353 - 24681171
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24681353 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24681254  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24681253 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 24723880 - 24723698
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24723880 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 24723781  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  24723780 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 24723698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 673 - 851
Target Start/End: Original strand, 40473873 - 40474051
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  40473873 gcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctct 40473972  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    | || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||    
T  40473973 tcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcttcaagacgggttcccat 40474051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 43078198 - 43077900
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||||||||||   |    
T  43078198 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggca 43078099  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  43078098 tttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 43077999  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  43077998 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcgagacgggttcccatggtgaccatctc 43077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 18375658 - 18375923
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 18375757  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  18375758 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 18375857  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18375858 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18375923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 18500961 - 18501208
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  18500961 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 18501060  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || |  ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18501061 tttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18501160  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  18501161 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 18501208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3789475 - 3789177
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| ||||||||  | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  3789475 acgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggca 3789376  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3789375 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3789276  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3789275 atatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3789177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 12132071 - 12131889
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12132071 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 12131972  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  12131971 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 12131889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 562 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 24969976 - 24969878
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 660  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  24969976 ttaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacgga 24969878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 37771245 - 37771427
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| || |||||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771245 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagcca 37771344  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37771345 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37771427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5637826 - 5637561
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5637826 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 5637727  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  5637726 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 5637627  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  5637626 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 5637561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 815
Target Start/End: Original strand, 15759103 - 15759320
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15759103 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 15759202  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||| |||| || |||||| |    
T  15759203 ttgattgacctgctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgacgcacttgcagaagattcagc 15759302  T
Q  798 tttctcgaatacaataat 815  Q
    |||||| || ||||||||    
T  15759303 tttctcaaacacaataat 15759320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30151934 - 30151669
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  30151934 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 30151835  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  30151834 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 30151735  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  30151734 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 30151669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Original strand, 37358901 - 37359154
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37358901 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37359000  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  37359001 tagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 37359100  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  37359101 tttctcaaatacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 37359154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 6874143 - 6874004
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6874143 gcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 6874044  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    |||||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6874043 ttgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 6874004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 26480308 - 26480094
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26480308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26480209  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  26480208 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 26480109  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  26480108 tttctcaaacacaat 26480094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 31826665 - 31826847
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826665 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 31826764  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  31826765 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 31826847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 33516272 - 33516090
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagcca 33516173  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  33516172 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 33516090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 34616437 - 34616223
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34616437 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagcca 34616338  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  34616337 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 34616238  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  34616237 tttctcaaacacaat 34616223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 37671738 - 37671920
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  37671738 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 37671837  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  37671838 tagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 37671920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 37754809 - 37754670
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  37754809 gcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 37754710  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | || ||| |||| || |||||| ||||||| || |||||    
T  37754709 tcgacgcacttgcagaagattcagctttctcaaacacaat 37754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 32599715 - 32599897
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  32599715 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtca 32599814  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  32599815 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 32599897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 28960044 - 28960226
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  |||||  |||| ||||| ||||||||||||     
T  28960044 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccg 28960143  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  28960144 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 28960226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 28649142 - 28648937
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  28649142 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagcca 28649043  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | | |||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  28649042 tagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 28648943  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  28648942 tttctc 28648937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Original strand, 29967312 - 29967517
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29967312 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29967411  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29967412 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29967511  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  29967512 tttctc 29967517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 30029331 - 30029126
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30029331 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 30029232  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  30029231 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttctttttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 30029132  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  30029131 tttctc 30029126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Original strand, 13325165 - 13325304
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  13325165 gcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 13325264  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  13325265 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 13325304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 554 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 33292488 - 33292340
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  33292488 cgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggta 33292389  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggat 702  Q
     |||||    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33292388 ggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 33292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2909
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  2410 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 2509  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 2609  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2610 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2709  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  2710 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 2809  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2810 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Original strand, 2949 - 3083
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||| | ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2949 catttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 3048  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    || |||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3049 gcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19659249
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 19659050  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  19659051 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 19659150  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19659151 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 19659249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44563106
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44563403 aatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttaca 44563306  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  44563305 atgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 44563206  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44563205 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244670
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33244869  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | |||    
T  33244868 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcagg 33244769  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33244768 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33244670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22081085
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttaca 22080888  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22080889 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 22080988  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22080989 gtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 22081085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710591
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || ||     
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacg 18710791  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| ||    
T  18710790 atatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcag 18710691  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18710690 gtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16283956 - 16283454
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||    
T  16283956 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtat 16283857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16283856 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatac 16283757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16283756 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16283657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  16283656 acgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 16283557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16283556 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtct 16283457  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16283456 agc 16283454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9355130 - 9354627
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  9355130 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 9355031  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  9355030 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 9354931  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9354930 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 9354831  T
Q  301 -acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||    
T  9354830 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 9354731  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 499  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  9354730 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 9354631  T
Q  500 tagc 503  Q
    ||||    
T  9354630 tagc 9354627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16278061 - 16277559
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16278061 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16277962  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16277961 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16277862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16277861 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16277762  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16277761 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 16277662  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16277661 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16277562  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16277561 agc 16277559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19688601 - 19688103
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  19688601 tgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 19688502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||     
T  19688501 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcg 19688402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || |    
T  19688401 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacga 19688302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  19688301 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 19688202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19688201 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 19688103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 27608613 - 27609115
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27608613 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27608712  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || |  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27608713 gatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27608812  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27608813 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27608912  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  27608913 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 27609012  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27609013 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27609112  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  27609113 agc 27609115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 2136967 - 2137469
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2136967 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2137066  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| |||| || |    
T  2137067 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgc 2137166  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  2137167 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 2137266  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2137267 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2137366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2137367 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 2137466  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  2137467 agc 2137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14558131 - 14557629
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14558131 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14558032  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14558031 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14557932  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14557931 ttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14557832  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14557831 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14557732  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14557731 caggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtct 14557632  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  14557631 agc 14557629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16283392 - 16283091
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16283392 ttaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggag 16283293  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  16283292 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 16283193  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16283192 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaatacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16283093  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  16283092 tc 16283091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16277497 - 16277196
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  16277497 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 16277398  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16277397 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16277298  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  16277297 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 16277198  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  16277197 tc 16277196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19688041 - 19687740
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  19688041 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggag 19687942  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  19687941 gcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 19687842  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  19687841 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 19687742  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  19687741 tc 19687740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 19674948 - 19674446
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  19674948 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 19674849  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  19674848 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 19674749  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19674748 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 19674649  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19674648 acaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19674549  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  19674548 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19674449  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  19674448 agc 19674446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 3329239 - 3329716
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  3329239 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 3329338  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  3329339 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 3329438  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  3329439 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3329538  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  3329539 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 3329638  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3329639 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Original strand, 22081125 - 22081446
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22081125 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 22081224  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
       ||| | |||| ||||  || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22081225 atgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 22081324  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||    
T  22081325 tcttcttatgatgaccattgccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacatttttcaaacacaataatgccatctctgacagcctcttctaagcg 22081424  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  22081425 ggttcccatggtgaccatctca 22081446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 19208068 - 19208570
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19208068 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19208167  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19208168 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19208267  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19208268 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 19208367  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19208368 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19208467  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  19208468 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19208567  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  19208568 agc 19208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 31489458 - 31489960
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||  | || |||| |||| ||  ||||||    
T  31489458 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcat 31489557  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31489558 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31489657  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31489658 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31489757  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31489758 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31489857  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  31489858 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 31489957  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  31489958 agc 31489960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31355005 - 31354529
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||| ||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31355005 catcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31354906  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31354905 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31354806  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31354805 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31354706  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31354705 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 31354606  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31354605 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 31354529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 28361663 - 28362165
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28361663 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28361762  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28361763 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28361862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28361863 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28361962  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28361963 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28362062  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  28362063 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28362162  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  28362163 agc 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 12092432 - 12092933
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  12092432 tcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 12092531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12092532 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12092631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12092632 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12092731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12092732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12092831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12092832 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 12092931  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  12092932 ag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 2137531 - 2137832
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  2137531 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 2137630  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  2137631 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 2137730  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  2137731 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattcattccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 2137830  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  2137831 tc 2137832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29829829 - 29829328
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29829829 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29829730  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29829729 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29829630  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29829629 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29829530  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29829529 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggat 29829430  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||| || || |  || || || | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29829429 caggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29829330  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  29829329 ag 29829328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14557570 - 14557269
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  14557570 ttaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 14557471  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  14557470 gcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 14557371  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  14557370 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 14557271  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  14557270 tc 14557269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19286945 - 19286468
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  19286945 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 19286846  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19286845 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19286746  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  19286745 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 19286646  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  19286645 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 19286546  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19286545 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 27609177 - 27609478
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||| ||||||     
T  27609177 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgacacatatgggtatgacggag 27609276  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27609277 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27609376  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  27609377 accatacctctttgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 27609476  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  27609477 tc 27609478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33259230 - 33258803
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33259230 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33259131  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33259130 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33259031  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  33259030 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 33258931  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33258930 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33258831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258830 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 189521 - 189256
Alignment:
Q  81 gcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  189521 gcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 189422  T
Q  181 ctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttc 280  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||    
T  189421 ctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttc 189322  T
Q  281 cttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 346  Q
    |||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189321 cttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 19659299 - 19659423
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659299 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggt 19659398  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  19659399 acgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 562 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 44563047 - 44562932
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44563047 ttaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 44562948  T
Q  662 ataactgggcagcatt 677  Q
     || ||| ||||||||    
T  44562947 gtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 9354577 - 9354453
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9354577 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 9354478  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  9354477 acgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18710526 - 18710228
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  18710526 acgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggca 18710427  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18710426 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 18710327  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  18710326 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 18710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19674378 - 19674080
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  19674378 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggca 19674279  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19674278 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccccacgtccgtttctttcttcttgtgatgtccattacc 19674179  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||| || ||| | || || |||||| |||||||||| |||||||| || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  19674178 atacctcttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcgaacacaataattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 19674080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 571 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 19286399 - 19286158
Alignment:
Q  571 acctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactggg 670  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| ||||| ||||||   |  || |    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  671 cagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacct 770  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19286299 ctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacct 19286200  T
Q  771 ctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    ||| || ||| | || || |||||| ||||||| || |||||    
T  19286199 cttcgacgcactcgcagaagattcagctttctcaaacacaat 19286158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 803
Target Start/End: Original strand, 31490025 - 31490263
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |    
T  31490025 acgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggca 31490124  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  31490125 tttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattacc 31490224  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctc 803  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| |||||||    
T  31490225 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctc 31490263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 554 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 31354475 - 31354250
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  31354475 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 31354376  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  31354375 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 31354276  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  31354275 tgtccattaccatacctcttcgatgc 31354250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 19208668 - 19208850
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19208668 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 19208767  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| ||||||    
T  19208768 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacttcttcgatgca 19208850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Original strand, 28362263 - 28362477
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  28362263 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 28362362  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  28362363 tggattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 28362462  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  28362463 tttctcaaacacaat 28362477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Original strand, 3329827 - 3330080
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||  ||||||    
T  3329827 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagcca 3329926  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  3329927 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 3330026  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || |||||||| |||||    
T  3330027 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgagttcccat 3330080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Complemental strand, 29829220 - 29828967
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29829220 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29829121  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  29829120 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 29829021  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  29829020 tttctcaaacacaatgattccatctctgacggcttcctcaagacgggttcccat 29828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18791214 - 18791107
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18791214 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggcat 18791115  T
Q  101 gatcatgg 108  Q
    ||||||||    
T  18791114 gatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Original strand, 19518451 - 19518665
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || |  ||||| ||||| |||||||||| ||    
T  19518451 tactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtca 19518550  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  19518551 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 19518650  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  19518651 tttctcaaacacaat 19518665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 33258630 - 33258425
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33258630 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 33258531  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  33258530 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgcccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 33258431  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  33258430 tttctc 33258425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 12093041 - 12093306
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12093041 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagcca 12093140  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  12093141 tagattggccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 12093240  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  12093241 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 12093306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143479
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 14143179  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  14143180 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 14143279  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  14143280 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 14143379  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14143380 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26787946
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26788246  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26788245 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26788146  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26788145 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26788046  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26788045 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196319
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27196619  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27196618 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27196519  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27196518 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27196419  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27196418 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27252921
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27252621  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27252622 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27252721  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27252722 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27252821  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27252822 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22457128
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcaca 22456928  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22456929 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22457028  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22457029 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 503
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13522267
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 13522067  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  13522068 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 13522167  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13522168 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892504
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8892305  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8892306 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8892405  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8892406 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8892504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903739
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8903540  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8903541 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8903640  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8903641 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 8903739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374450
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33374251  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  33374252 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33374351  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33374352 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162659
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 28162858  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | |    
T  28162857 tgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaag 28162758  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28162757 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28162659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 27290062 - 27290564
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27290062 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27290161  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27290162 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatac 27290261  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  27290262 ctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 27290361  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  27290362 acaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggat 27290461  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27290462 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 27290561  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  27290562 agc 27290564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 13298643 - 13299145
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  13298643 tcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 13298742  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13298743 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 13298842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  13298843 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 13298942  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  13298943 acgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 13299042  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13299043 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13299142  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  13299143 agc 13299145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 27272272 - 27272771
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  27272272 tcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcat 27272371  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27272372 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatac 27272471  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||||||     
T  27272472 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttc 27272571  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||    
T  27272572 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggat 27272671  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27272672 caggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 22934572 - 22935074
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22934572 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22934671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22934672 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22934771  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22934772 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 22934871  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  22934872 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 22934971  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22934972 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22935071  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  22935072 agc 22935074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 23857017 - 23857519
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23857017 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23857116  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23857117 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23857216  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23857217 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 23857316  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23857317 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 23857416  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23857417 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23857516  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  23857517 agc 23857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918382
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||||||     
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttc 26918585  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26918584 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26918485  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  26918484 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 26918385  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  26918384 agc 26918382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 26989506 - 26989003
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  26989506 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 26989407  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  26989406 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 26989307  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  26989306 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 26989207  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  26989206 tacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 26989107  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26989106 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 26989007  T
Q  500 tagc 503  Q
    ||||    
T  26989006 tagc 26989003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 16750358 - 16749856
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  16750358 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 16750259  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16750258 gatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatac 16750159  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16750158 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16750059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16750058 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16749959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16749958 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16749859  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  16749858 agc 16749856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20161182 - 20160704
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  20161182 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 20161083  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  20161082 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 20160983  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20160982 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 20160883  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20160882 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 20160783  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20160782 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 20160704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 502
Target Start/End: Original strand, 22171649 - 22172127
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  22171649 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 22171748  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  22171749 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 22171848  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22171849 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 22171948  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22171949 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 22172048  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22172049 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctag 22172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 24304310 - 24304812
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24304310 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24304409  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24304410 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24304509  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24304510 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24304609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24304610 acgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24304709  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24304710 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24304809  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24304810 agc 24304812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 277 - 503
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477467
Alignment:
Q  277 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 376  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  377 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcat 476  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  477 tggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22477467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 24864221 - 24863719
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24864221 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24864122  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24864121 gatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24864022  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24864021 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24863922  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24863921 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24863822  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24863821 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24863722  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  24863721 agc 24863719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 15424009 - 15424511
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||    
T  15424009 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcat 15424108  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15424109 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15424208  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  15424209 tttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 15424308  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  15424309 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 15424408  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15424409 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15424508  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15424509 agc 15424511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29549979 - 29549477
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  29549979 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 29549880  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||| | ||    
T  29549879 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacac 29549780  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29549779 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29549680  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29549679 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29549580  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29549579 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29549480  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  29549479 agc 29549477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 17092132 - 17092427
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||  ||    
T  17092132 tcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctat 17092231  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | || || |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  17092232 gatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatac 17092331  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092332 ctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 34463038 - 34463537
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34463038 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 34463137  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  34463138 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 34463237  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  34463238 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 34463337  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34463338 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34463437  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  34463438 caggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 556 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 20160650 - 20160345
Alignment:
Q  556 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 655  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  20160650 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 20160551  T
Q  656 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 755  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20160550 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 20160454  T
Q  756 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 855  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  20160453 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 20160354  T
Q  856 tccatctca 864  Q
     ||||||||    
T  20160353 accatctca 20160345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 556 - 864
Target Start/End: Original strand, 22172181 - 22172486
Alignment:
Q  556 atggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacg 655  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| || |||| |    
T  22172181 atggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacaggtatg 22172280  T
Q  656 acggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatg 755  Q
      |||  ||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22172281 gtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagccatggattgaccggca---gcaaattccatccctacttctgtttccttcttcttatgatg 22172377  T
Q  756 accgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatg 855  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||| |||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||    
T  22172378 accgttaccgtacctttttggtgcgctcacggaggattcacctttatcaaacacaatgattccttccctgacagcttcttctagacgggttcccatggtg 22172477  T
Q  856 tccatctca 864  Q
     ||||||||    
T  22172478 accatctca 22172486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 13299207 - 13299508
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  13299207 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 13299306  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  13299307 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 13299406  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  13299407 accatatctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 13299506  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  13299507 tc 13299508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24863657 - 24863356
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| || ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  24863657 ttaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggag 24863558  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24863557 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24863458  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| | |||| || |||||    
T  24863457 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttctcatggtgaccatc 24863358  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  24863357 tc 24863356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 29573517 - 29573015
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  29573517 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 29573418  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  29573417 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 29573318  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  29573317 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 29573218  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29573217 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29573118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29573117 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29573018  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  29573017 agc 29573015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4773510 - 4773009
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4773510 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4773411  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4773410 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4773311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4773310 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4773211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4773210 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4773111  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4773110 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4773011  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  4773010 ag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 15424573 - 15424874
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  15424573 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 15424672  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  15424673 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 15424772  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||    
T  15424773 accatacctctttgatgcattcacagaagattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatc 15424872  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  15424873 tc 15424874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3696582 - 3696086
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||||||||    
T  3696582 ctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgat 3696483  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |  ||    
T  3696482 cgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttc 3696383  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  3696382 gatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacg 3696283  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  3696282 atatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 3696183  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3696182 gtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16674643 - 16674144
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16674643 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16674544  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  16674543 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 16674444  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16674443 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16674344  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16674343 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16674244  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16674243 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 22935136 - 22935434
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  22935136 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 22935235  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  22935236 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 22935335  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  22935336 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 22935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 23857581 - 23857879
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||   |    
T  23857581 acgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggca 23857680  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  23857681 tttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 23857780  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||||    
T  23857781 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatctc 23857879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Original strand, 4545467 - 4545960
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4545467 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4545566  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4545567 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4545666  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4545667 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4545766  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4545767 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4545866  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4545867 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4758244 - 4757767
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  4758244 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4758145  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4758144 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4758045  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  4758044 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 4757945  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4757944 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4757845  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4757844 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26988941 - 26988640
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  26988941 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26988842  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26988841 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26988742  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  26988741 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26988642  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  26988641 tc 26988640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27000013 - 26999712
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  27000013 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 26999914  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  26999913 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 26999814  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  26999813 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 26999714  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  26999713 tc 26999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4525790 - 4525289
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4525790 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 4525691  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4525690 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4525591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4525590 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4525491  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4525490 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4525391  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4525390 caggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4525291  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  4525290 ag 4525289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Original strand, 4723826 - 4724319
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4723826 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcat 4723925  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4723926 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4724025  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||| || ||     
T  4724026 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttc 4724125  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4724126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4724225  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  4724226 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000075
Alignment:
Q  184 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 283  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  284 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 383  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  384 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatc 483  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  484 ggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagc 27000075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 30557708 - 30558210
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30557708 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30557807  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30557808 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30557907  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  30557908 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 30558007  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30558008 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30558107  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  30558108 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 30558207  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  30558208 agc 30558210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27008231 - 27007730
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27008231 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27008132  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | ||    
T  27008131 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacac 27008032  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||| ||     
T  27008031 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttc 27007932  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27007931 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27007832  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27007831 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 27007732  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  27007731 ag 27007730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 28207958 - 28207465
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  28207958 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 28207859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28207858 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28207759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28207758 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28207659  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28207658 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28207559  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  28207558 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 562 - 812
Target Start/End: Original strand, 24304874 - 24305124
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  24304874 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 24304973  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  24304974 gcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 24305073  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  24305074 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 24305124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 27359684 - 27360185
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27359684 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27359783  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27359784 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27359883  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27359884 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27359983  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27359984 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27360083  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27360084 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 27360183  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  27360184 ag 27360185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 27450027 - 27450528
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27450027 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27450126  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27450127 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27450226  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27450227 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27450326  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27450327 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27450426  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27450427 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 27450526  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  27450527 ag 27450528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27485609 - 27485132
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  27485609 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27485510  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27485509 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27485410  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  27485409 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27485310  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  27485309 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 27485210  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27485209 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 27485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16749794 - 16749493
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  16749794 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
    | |  || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  16749694 acatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 16749595  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||    
T  16749594 accatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcgaacacaatgatcccatccctgacggcttcctccagacgggttcccatggtgaccatc 16749495  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  16749494 tc 16749493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 26116102 - 26116603
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26116102 tcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26116201  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26116202 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26116301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26116302 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26116401  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26116402 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26116501  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || || |||||  | |||| |||||| || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  26116502 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaagtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtct 26116601  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  26116602 ag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 562 - 706
Target Start/End: Original strand, 22477529 - 22477673
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  22477529 ttaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagag 22477628  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgac 706  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22477629 gtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattgac 22477673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 26918317 - 26918070
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||   |    
T  26918317 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggca 26918218  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  26918217 tttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 26918118  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  26918117 atacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaat 26918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27044892 - 27044390
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  27044892 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcat 27044793  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27044792 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27044693  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27044692 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27044593  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||     
T  27044592 acgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 27044493  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27044492 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 27044393  T
Q  500 tag 502  Q
    |||    
T  27044392 tag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 16943719 - 16944146
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16943719 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16943818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16943819 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16943918  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16943919 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 16944018  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16944019 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16944118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944119 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29501919 - 29501418
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  29501919 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 29501820  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29501819 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29501720  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  29501719 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 29501620  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29501619 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29501520  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||| || || |||||    
T  29501519 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 29501420  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  29501419 ag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17025652 - 17025280
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  17025652 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 17025553  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  17025552 gaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 17025453  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||    
T  17025452 gacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtg 17025353  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctag 502  Q
    ||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17025352 cagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28162619 - 28162485
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162619 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 28162520  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  28162519 gcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 13522317 - 13522441
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13522317 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 13522416  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  13522417 acgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 553 - 677
Target Start/End: Original strand, 33374500 - 33374624
Alignment:
Q  553 acgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33374500 acgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgt 33374599  T
Q  653 acgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||||  || ||| ||||||||    
T  33374600 acgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 26777302 - 26777809
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  26777302 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26777401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtg-----gcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |     ||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||  |||||||    
T  26777402 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctca 26777501  T
Q  196 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 295  Q
     | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| |    
T  26777502 cacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtt 26777601  T
Q  296 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 395  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||    
T  26777602 tcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaa 26777701  T
Q  396 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagta 495  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  |||||||| | ||| ||||| ||||| || ||     
T  26777702 cggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggtt 26777801  T
Q  496 ggtctagc 503  Q
    ||||||||    
T  26777802 ggtctagc 26777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Original strand, 8892544 - 8892678
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8892544 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 8892643  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8892644 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 543 - 677
Target Start/End: Original strand, 8903779 - 8903913
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8903779 cattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgc 8903878  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcatt 677  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  8903879 gcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29549426 - 29549117
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||    
T  29549426 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggta 29549327  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29549326 tgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtga 29549227  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  29549226 tgtccattaccatacctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 29549127  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  29549126 tgaccatctc 29549117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 554 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27044338 - 27044029
Alignment:
Q  554 cgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggta 653  Q
    ||||||| || || || ||||||||| | |||| ||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||    
T  27044338 cgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 27044239  T
Q  654 cgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatga 753  Q
     ||||||   |  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  27044238 tgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 27044139  T
Q  754 tgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatga 853  Q
    || || ||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || ||||||     
T  27044138 tgtccattaccatatctcttcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatgg 27044039  T
Q  854 tgtccatctc 863  Q
    || |||||||    
T  27044038 tgaccatctc 27044029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3696000 - 3695702
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  3696000 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 3695901  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  3695900 tttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 3695801  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  3695800 atatctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 3695702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27019640 - 27019461
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || |||| ||||| |||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27019640 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27019541  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||    
T  27019540 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 594 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 4525197 - 4525011
Alignment:
Q  594 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 693  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  4525197 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagta 4525098  T
Q  694 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  4525097 gccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 4525011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 17025166 - 17024901
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17025166 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca 17025067  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | | |||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||  |    
T  17025066 tagcttgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggattcggc 17024967  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  17024966 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 17024901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27485021 - 27484807
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27485021 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 27484922  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||| |    
T  27484921 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtatctcttcgatgcactcacagaggattcagc 27484822  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  27484821 tttctcaaacacaat 27484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 29501310 - 29501096
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29501310 tactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 29501211  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  |  |||||||| |    
T  29501210 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacaaaggattcagc 29501111  T
Q  798 tttctcgaatacaat 812  Q
    |||||| || |||||    
T  29501110 tttctcaaacacaat 29501096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 29572917 - 29572735
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29572917 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 29572818  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||    
T  29572817 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgca 29572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 30558308 - 30558490
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagcca 30558407  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||    
T  30558408 tggattgaccggctccagctgacaccatccccacttcagtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgca 30558490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 4757590 - 4757483
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4757590 gcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctct 4757491  T
Q  773 ttgatgca 780  Q
    | ||||||    
T  4757490 tcgatgca 4757483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 4772826 - 4772687
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  4772826 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 4772727  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  4772726 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 4772687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 673 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 27007541 - 27007402
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27007541 gcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27007442  T
Q  773 ttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    | |||||| |  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  27007441 tcgatgcactcacagaggattcagctttctcaaacacaat 27007402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Original strand, 34463620 - 34463867
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |    
T  34463620 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggca 34463719  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  34463720 tttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 34463819  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  34463820 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 34463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 4546076 - 4546341
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4546076 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4546175  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  4546176 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 4546275  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  4546276 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 4546341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 803
Target Start/End: Original strand, 16944319 - 16944524
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16944319 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 16944418  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||  | ||||||||| |    
T  16944419 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagc 16944518  T
Q  798 tttctc 803  Q
    ||||||    
T  16944519 tttctc 16944524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 779
Target Start/End: Original strand, 26777919 - 26778100
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||   |  ||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  26777919 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagcca 26778018  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgc 779  Q
    | ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||    
T  26778019 ttgattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgc 26778100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28207346 - 28207081
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28207346 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 28207247  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  28207246 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 28207147  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  28207146 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 28207081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 16674064 - 16673817
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| || || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||  ||| || || ||||||   |    
T  16674064 acgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatggatatgacggaggca 16673965  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      || || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  16673964 tttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattacc 16673865  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
     || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  16673864 atatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 16673817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 780
Target Start/End: Original strand, 27360377 - 27360484
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27360377 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27360476  T
Q  773 ttgatgca 780  Q
    | ||||||    
T  27360477 tcgatgca 27360484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 673 - 780
Target Start/End: Original strand, 27450720 - 27450827
Alignment:
Q  673 gcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctct 772  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||    
T  27450720 gcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctct 27450819  T
Q  773 ttgatgca 780  Q
    | ||||||    
T  27450820 tcgatgca 27450827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 851
Target Start/End: Original strand, 4724435 - 4724688
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4724435 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 4724534  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  4724535 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccataccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 4724634  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||    
T  4724635 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccat 4724688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 851
Target Start/End: Original strand, 27629968 - 27630254
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | | | ||||| |  |||  ||    
T  27629968 acgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggta 27630067  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
     ||| ||| |||||| |||||| ||||||||| | || ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27630068 gctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctgctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgcc 27630167  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
     |||||||| ||  || |||  || || ||| | ||||| |||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  27630168 atacctcttcgacccacttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccctctctgacggcctcctctagacgagtccccat 27630254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 679 - 780
Target Start/End: Original strand, 26116792 - 26116893
Alignment:
Q  679 ataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatg 778  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||    
T  26116792 ataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgatg 26116891  T
Q  779 ca 780  Q
    ||    
T  26116892 ca 26116893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27629392 - 27629645
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||   |||| || |||    
T  27629392 tcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgtcat 27629491  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  || || ||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||| |||| ||||| |||||  |    
T  27629492 gatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgc 27629591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagg 254  Q
     ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||    
T  27629592 ttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 851
Target Start/End: Original strand, 27272947 - 27273128
Alignment:
Q  670 gcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacc 769  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  | |  ||||| ||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||||| || || || || || ||||    
T  27272947 gcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtggtggccattgccatacc 27273046  T
Q  770 tctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccat 851  Q
    ||||  |  ||||||  || || ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  27273047 tcttcaacccatttgtagaagactcacccttctcaaatacaatgataccttccctgacggcttcctctagacgagtccccat 27273128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21569
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||| |||  |||||   |||     
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcg 21865  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtct 21569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 21529 - 21208
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| | | ||||| || ||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21529 catttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 21430  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
       ||| |||||| ||||  || ||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21429 atgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctt 21330  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||  ||    
T  21329 tcttcttatgatgaccattaccatacttccttgatgcatttgcagaggattcacctttctcaaacacaataattccgtctctgacagcctcttctaagcg 21230  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
     || |||||| || ||||||||    
T  21229 ggttcccatggtgaccatctca 21208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 543 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 20374 - 20053
Alignment:
Q  543 catttgctaaacgatggcgttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgc 642  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20374 catttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggc 20275  T
Q  643 gcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 742  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20274 gcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 20175  T
Q  743 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacg 842  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20174 tcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaacacaataatgccttctctgacagcttcttctaggcg 20075  T
Q  843 agtccccatgatgtccatctca 864  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20074 agtccccatggtgaccatctca 20053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 165 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20730 - 20393
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20730 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 20631  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 20532  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 20432  T
Q  465 ggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20431 agcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagc 20393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30960 - 30532
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  30960 tcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 30861  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  30860 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 30761  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||    
T  30760 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 30661  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||    
T  30660 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30561  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  30560 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgt 30532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30396 - 30095
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  30396 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 30297  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  30296 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 30197  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||| | ||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  30196 accatacctcctcgatgcattcacagaggattcggctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 30097  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  30096 tc 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 225 - 503
Target Start/End: Original strand, 1 - 279
Alignment:
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 165 - 438
Target Start/End: Original strand, 1831 - 2103
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1831 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 1930  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 2029  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6080
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  6521 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 6422  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  6421 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 6322  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  6321 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 6222  T
Q  301 acaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgg 398  Q
    || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||    
T  6221 acgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgg 6122  T
Q  399 attaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
    || |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||    
T  6121 atcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctct 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5682
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaat-ggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaat 663  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||| ||  ||   || ||||| ||||||       
T  5930 acgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggc 5831  T
Q  664 aactgggcagcattaataggggcaacagtagccatg-gattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtta 762  Q
    |  || |  ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||    
T  5830 atttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccatccc-acttccgtttctttcttcttgtggtgtccatta 5732  T
Q  763 ccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaat 812  Q
    || || ||||| || |||||  | ||||||||| ||||||| || |||||    
T  5731 ccatatctcttcgacgcattcacagaggattcagctttctcaaacacaat 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Original strand, 370 - 728
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  370 ctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgat 469  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||    
T  470 catggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctc 569  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||    
T  570 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttaca 669  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  670 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 46734 - 47236
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  46734 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 46833  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46834 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 46933  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  46934 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 47033  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  47034 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 47133  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 47233  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  47234 agc 47236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 503
Target Start/End: Original strand, 39822 - 40320
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  39822 tgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 39921  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  39922 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcg 40021  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||  || || |    
T  40022 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacga 40121  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||    
T  40122 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcagg 40221  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40222 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 40320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 30270 - 29768
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||| |    
T  30270 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgt 30171  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30170 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatac 30071  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30070 ttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29971  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  29970 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 29871  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29870 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29771  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  29770 agc 29768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29706 - 29405
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||     
T  29706 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggag 29607  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  29606 gcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgtt 29507  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  29506 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttttcgaacacaatgattccttccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 29407  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  29406 tc 29405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 565 - 863
Target Start/End: Original strand, 40385 - 40683
Alignment:
Q  565 acgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaata 664  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||   |    
T  40385 acgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggca 40484  T
Q  665 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttacc 764  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  40485 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccgttacc 40584  T
Q  765 gtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||| || |||||||| |||||| || |||||||    
T  40585 atacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttccctgacggcttcctccagacgagttcccatggtgaccatctc 40683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 47298 - 47599
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |||     
T  47298 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgatggag 47397  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||| || || || ||    
T  47398 gcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccctatttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 47497  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  47498 accatacctctttgatgcattcacggaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 47597  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  47598 tc 47599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 27800 - 27297
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  27800 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27701  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||| | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| |||    
T  27700 tgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 27601  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||| ||    
T  27600 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttctt 27501  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  27500 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27401  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27400 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27301  T
Q  500 tagc 503  Q
    ||||    
T  27300 tagc 27297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27235 - 26934
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||     
T  27235 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggag 27136  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  27135 gcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 27036  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  27035 accatacctctttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 26936  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  26935 tc 26934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 10073 - 9571
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10073 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 9974  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  9973 gatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 9874  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9873 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9773 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 9674  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9673 caggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 9574  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  9573 agc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 594 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7874
Alignment:
Q  594 aggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagta 693  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||    
T  8143 aggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagta 8044  T
Q  694 gccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggatt 793  Q
    ||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  8043 gccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcattcacagaggatt 7944  T
Q  794 caactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    || ||||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7943 cagctttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 130 - 503
Target Start/End: Original strand, 7 - 381
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  7 agcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttg 106  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||    
T  107 gaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctc 206  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  207 gacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgta 306  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaact-cggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || ||||||||  | |||| |||||| || ||||   ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  307 caatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 562 - 863
Target Start/End: Original strand, 443 - 744
Alignment:
Q  562 ttaacgggtacctgaggtagacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaa 661  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||||     
T  443 ttaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 542  T
Q  662 ataactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgtt 761  Q
      |  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||    
T  543 gcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtccatt 642  T
Q  762 accgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    ||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || || || ||||  |||||||| ||||| || |||||| || |||||    
T  643 accatacctcttcgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccatccctgacggcttcttccagacgggttcccatggtgaccatc 742  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  743 tc 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 8815 - 9317
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8815 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8914  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  8915 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 9014  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9015 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9114  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9115 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9214  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  9215 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9314  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  9315 agc 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20020
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| |    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20197  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20196 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 20097  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtctagc 503  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20096 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 20020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 776
Target Start/End: Original strand, 9415 - 9593
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  9415 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagcca 9514  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttga 776  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||    
T  9515 tggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctctttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7490
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  6988 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7087  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  7088 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 7187  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7188 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7287  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7288 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7387  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  7388 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7487  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  7488 agc 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 780
Target Start/End: Original strand, 7588 - 7770
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7588 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 7687  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgca 780  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||    
T  7688 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtacctcttcgatgca 7770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 25950 - 26453
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  25950 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26049  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  26050 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 26149  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26150 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26249  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | ||||||||||||    
T  26250 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacgga 26349  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtc 499  Q
    | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |    
T  26350 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcc 26449  T
Q  500 tagc 503  Q
    ||||    
T  26450 tagc 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 26551 - 26816
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26551 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagcca 26650  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||| | ||||||||| |    
T  26651 ttgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatatctcttcgacgcatttacagaggattcagc 26750  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  26751 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 26816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 503
Target Start/End: Original strand, 14679 - 15181
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  14679 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 14778  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14779 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14878  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  14879 ttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 14978  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14979 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15078  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15079 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 15178  T
Q  501 agc 503  Q
    |||    
T  15179 agc 15181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15544
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| || || |||||||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagcca 15378  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |  || |||||| |    
T  15379 ttgattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccgtaccttttcgatgcactcgtagaagattcagc 15478  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  15479 tttctcaaacacaatgattccatccctgacggcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 8456 - 7963
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  8456 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 8357  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8356 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  8256 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 8157  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8156 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8057  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaagt 494  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8056 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 598 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7844 - 7579
Alignment:
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaaataactgggcagcattaataggggcaacagtagcca 697  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||   |  || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  7844 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagcca 7745  T
Q  698 tggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttcttatgatgaccgttaccgtacctctttgatgcatttgcggaggattcaac 797  Q
    | |||||||||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| | |  || |||||| |    
T  7744 tagattgaccggctgcagctgacaccattcccacttccgtttctttcttcttgtggtgtccattaccatacctcttcgatgcactcgtagaagattcagc 7645  T
Q  798 tttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatctc 863  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || ||||| || |||||| || |||||||    
T  7644 tttctcaaacacaatgatcccatctctgactgcttcctcaagacgggttcccatggtgaccatctc 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 669 - 863
Target Start/End: Original strand, 48568 - 48769
Alignment:
Q  669 ggcagcattaataggggcaacag-tagccatggattga--ccggctccggca-gataccatccc-tacttctgtttctttcttcttatgatgacc-gtta 762  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| || || || ||||    
T  48568 ggcagcattgataggagcaacaggtagccatggattggacccggctccggcaagacaccatcccctacttccgtttctttcttcttgtggtgtcccgtta 48667  T
Q  763 ccgtacctcttt-gatgcatttgcggaggattcaactttctcgaatacaataatgccttctctgatagcttcttctagacgagtccccatgatgtccatc 861  Q
    || ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  48668 ccatacctcttttgatgcattcacagaggattcagctttctcgaacacaatgattccttctctgacggcttcttccagacgagttcccatggtgaccatc 48767  T
Q  862 tc 863  Q
    ||    
T  48768 tc 48769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 422
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46981
Alignment:
Q  59 agcaacccaaa-ggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat-catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagga 156  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  46604 agcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagagga 46703  T
Q  157 gttgcaatgttacgaacgtcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgag 253  Q
    ||||  |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46704 gttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcg 46803  T
Q  254 ggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagc 347  Q
    |||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| ||    
T  46804 ggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggc 46903  T
Q  348 accttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggc--ttgccctgtct 422  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  46904 gccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119706
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtag 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtag 119706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University