View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7310_low_3 (Length: 697)

Name: NF7310_low_3
Description: NF7310
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7310_low_3
NF7310_low_3
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (4-677)||(16626299-16626972)
chr3 (4-677)||(18530186-18530853)
chr3 (5-686)||(5652170-5652851)
chr3 (5-686)||(4625727-4626408)
chr3 (5-686)||(17993578-17994259)
chr3 (4-524)||(32292697-32293217)
chr3 (4-524)||(31033910-31034430)
chr3 (5-686)||(5713007-5713691)
chr3 (5-686)||(5723917-5724601)
chr3 (5-686)||(5767767-5768451)
chr3 (35-686)||(5756907-5757560)
chr3 (1-680)||(8301057-8301736)
chr3 (1-680)||(15892496-15893178)
chr3 (1-662)||(18051066-18051730)
chr3 (1-662)||(8295779-8296440)
chr3 (1-680)||(6192102-6192784)
chr3 (1-662)||(4796443-4797107)
chr3 (1-620)||(4721477-4722099)
chr3 (1-662)||(29148545-29149209)
chr3 (1-680)||(18330460-18331137)
chr3 (1-680)||(35880552-35881234)
chr3 (1-680)||(22387368-22388047)
chr3 (1-662)||(15740884-15741536)
chr3 (1-620)||(7073058-7073680)
chr3 (1-620)||(10395982-10396601)
chr3 (1-614)||(28115744-28116363)
chr3 (1-662)||(18276842-18277506)
chr3 (1-662)||(18307444-18308108)
chr3 (1-662)||(18292143-18292807)
chr3 (1-680)||(8211527-8212206)
chr3 (1-506)||(4416882-4417387)
chr3 (1-617)||(28021127-28021743)
chr3 (1-440)||(11110139-11110578)
chr3 (1-500)||(20576637-20577136)
chr3 (1-500)||(29664760-29665259)
chr3 (1-679)||(32438944-32439622)
chr3 (1-506)||(5609112-5609617)
chr3 (1-440)||(48465956-48466395)
chr3 (1-440)||(51782052-51782491)
chr3 (60-617)||(5466834-5467394)
chr3 (25-502)||(6542276-6542753)
chr3 (1-506)||(28339265-28339770)
chr3 (1-617)||(47023302-47023921)
chr3 (1-680)||(21674479-21675161)
chr3 (27-506)||(31964289-31964768)
chr3 (1-500)||(36996867-36997366)
chr3 (60-617)||(4346536-4347093)
chr3 (27-681)||(17984772-17985429)
chr3 (1-614)||(7996414-7997030)
chr3 (1-614)||(10642922-10643538)
chr3 (130-506)||(50133990-50134366)
chr3 (27-662)||(20065850-20066485)
chr3 (25-428)||(18242780-18243183)
chr3 (1-680)||(5596147-5596838)
chr3 (1-680)||(18224977-18225659)
chr3 (1-440)||(5013741-5014180)
chr3 (1-428)||(24328200-24328627)
chr3 (60-503)||(22870705-22871148)
chr3 (60-503)||(22885764-22886207)
chr3 (121-440)||(51797141-51797461)
chr3 (304-680)||(4892999-4893375)
chr3 (553-638)||(29665330-29665415)
chr3 (553-617)||(11110706-11110770)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (4-677)||(19456162-19456835)
chr2 (5-686)||(27118506-27119187)
chr2 (5-686)||(3784472-3785153)
chr2 (4-677)||(21702905-21703578)
chr2 (5-686)||(34156829-34157509)
chr2 (5-686)||(34303045-34303726)
chr2 (4-686)||(16163417-16164102)
chr2 (5-685)||(31891070-31891750)
chr2 (1-662)||(27434182-27434846)
chr2 (4-506)||(22925769-22926271)
chr2 (1-662)||(28882053-28882717)
chr2 (173-681)||(27392813-27393300)
chr2 (1-662)||(12655381-12656045)
chr2 (1-660)||(20837759-20838421)
chr2 (1-662)||(23128304-23128968)
chr2 (1-500)||(9349720-9350219)
chr2 (1-620)||(13936282-13936904)
chr2 (1-620)||(34286235-34286857)
chr2 (1-620)||(34291295-34291917)
chr2 (25-614)||(11634948-11635543)
chr2 (25-620)||(21676944-21677542)
chr2 (25-500)||(40233515-40233990)
chr2 (25-614)||(11641137-11641732)
chr2 (1-614)||(32049685-32050301)
chr2 (1-617)||(37925377-37925996)
chr2 (1-500)||(12586814-12587313)
chr2 (1-500)||(27777226-27777725)
chr2 (1-500)||(27816984-27817483)
chr2 (1-662)||(37375000-37375664)
chr2 (1-524)||(27803687-27804210)
chr2 (1-506)||(34861678-34862183)
chr2 (1-506)||(37685647-37686152)
chr2 (1-506)||(37700912-37701417)
chr2 (1-524)||(12716340-12716863)
chr2 (1-500)||(39051560-39052059)
chr2 (1-662)||(16829076-16829740)
chr2 (1-662)||(16891741-16892405)
chr2 (1-440)||(260491-260930)
chr2 (1-428)||(39890150-39890577)
chr2 (1-506)||(31876279-31876784)
chr2 (289-620)||(34279330-34279664)
chr2 (1-428)||(19416237-19416664)
chr2 (553-617)||(261058-261122)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (4-677)||(15284680-15285353)
chr4 (4-677)||(15227716-15228389)
chr4 (5-686)||(24460358-24461039)
chr4 (4-677)||(1900103-1900776)
chr4 (1-677)||(14235274-14235953)
chr4 (4-681)||(15391090-15391764)
chr4 (1-662)||(17013858-17014522)
chr4 (1-680)||(24592063-24592742)
chr4 (1-680)||(14664858-14665540)
chr4 (1-662)||(14763053-14763717)
chr4 (1-662)||(36344264-36344925)
chr4 (1-614)||(5005776-5006395)
chr4 (1-620)||(6569753-6570375)
chr4 (1-502)||(18800362-18800863)
chr4 (1-679)||(24112506-24113184)
chr4 (1-680)||(34188709-34189388)
chr4 (1-500)||(33673547-33674046)
chr4 (1-680)||(31126267-31126949)
chr4 (25-680)||(54833230-54833885)
chr4 (1-506)||(40105387-40105892)
chr4 (25-680)||(14098381-14099039)
chr4 (1-614)||(27163066-27163682)
chr4 (1-500)||(39850661-39851160)
chr4 (1-608)||(21969613-21970223)
chr4 (1-440)||(30753837-30754276)
chr4 (579-680)||(19373101-19373202)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (4-686)||(2410-3092)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (4-686)||(20340087-20340769)
chr1 (4-677)||(16207783-16208453)
chr1 (4-512)||(20461076-20461584)
chr1 (4-524)||(28151845-28152365)
chr1 (3-614)||(41793059-41793673)
chr1 (1-680)||(28584805-28585487)
chr1 (1-506)||(10962671-10963176)
chr1 (1-506)||(51638219-51638724)
chr1 (533-677)||(20460935-20461079)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (5-686)||(19658752-19659432)
chr8 (4-686)||(44562923-44563603)
chr8 (5-524)||(33244649-33245168)
chr8 (1-686)||(9354444-9355130)
chr8 (4-681)||(22080589-22081263)
chr8 (4-680)||(18710411-18711090)
chr8 (1-662)||(16283292-16283956)
chr8 (1-662)||(16277397-16278061)
chr8 (5-680)||(19687923-19688601)
chr8 (1-620)||(27608613-27609235)
chr8 (1-662)||(14557470-14558131)
chr8 (1-662)||(2136967-2137631)
chr8 (1-680)||(31489458-31490140)
chr8 (1-620)||(19674323-19674948)
chr8 (25-502)||(3329239-3329716)
chr8 (1-506)||(19208068-19208573)
chr8 (25-680)||(19286290-19286945)
chr8 (1-506)||(28361663-28362168)
chr8 (27-617)||(31354412-31355005)
chr8 (1-440)||(29829390-29829829)
chr8 (1-502)||(12092432-12092933)
chr8 (1-428)||(33258803-33259230)
chr8 (81-346)||(189256-189521)
chr8 (1-108)||(18791107-18791214)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (4-677)||(16449636-16450309)
chr7 (5-686)||(31088103-31088784)
chr7 (4-677)||(16041155-16041828)
chr7 (5-686)||(45733283-45733964)
chr7 (4-524)||(26484679-26485199)
chr7 (4-524)||(39210661-39211181)
chr7 (5-524)||(2108644-2109163)
chr7 (4-524)||(2775344-2775864)
chr7 (4-374)||(26682638-26683008)
chr7 (5-374)||(4200682-4201051)
chr7 (1-662)||(16518051-16518715)
chr7 (1-662)||(16503015-16503679)
chr7 (1-680)||(5127818-5128500)
chr7 (1-635)||(10916503-10917137)
chr7 (1-620)||(11424412-11425033)
chr7 (1-662)||(2154417-2155081)
chr7 (1-524)||(18540784-18541307)
chr7 (1-638)||(5146975-5147615)
chr7 (1-638)||(26435125-26435765)
chr7 (1-506)||(26274729-26275234)
chr7 (1-617)||(4144758-4145377)
chr7 (1-617)||(26319504-26320123)
chr7 (1-620)||(16736095-16736717)
chr7 (1-620)||(16751149-16751771)
chr7 (1-620)||(17523418-17524040)
chr7 (1-620)||(17529175-17529797)
chr7 (1-500)||(26537505-26538004)
chr7 (1-502)||(31564025-31564526)
chr7 (1-440)||(3445375-3445814)
chr7 (1-680)||(5159348-5160027)
chr7 (1-614)||(45387235-45387851)
chr7 (1-506)||(9618654-9619159)
chr7 (25-506)||(26669573-26670054)
chr7 (60-440)||(11441641-11442021)
chr7 (1-428)||(24592176-24592603)
chr7 (25-428)||(31125001-31125404)
chr7 (1-160)||(26513130-26513289)
chr7 (553-617)||(11441449-11441513)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (4-677)||(22888310-22888983)
chr5 (5-686)||(13184299-13184979)
chr5 (4-686)||(33877078-33877760)
chr5 (5-686)||(13440144-13440825)
chr5 (5-686)||(11325625-11326306)
chr5 (4-662)||(25198884-25199542)
chr5 (1-662)||(23892058-23892722)
chr5 (5-536)||(29888732-29889263)
chr5 (1-662)||(24687803-24688467)
chr5 (1-662)||(24969876-24970534)
chr5 (5-620)||(9548193-9548811)
chr5 (1-662)||(30934488-30935149)
chr5 (1-662)||(23717634-23718298)
chr5 (1-662)||(23752096-23752760)
chr5 (1-680)||(33777321-33778003)
chr5 (8-620)||(11549248-11549863)
chr5 (1-662)||(22998760-22999424)
chr5 (1-605)||(15658406-15659013)
chr5 (1-502)||(18500376-18500877)
chr5 (1-502)||(28649250-28649751)
chr5 (1-617)||(6874199-6874821)
chr5 (3-620)||(41674603-41675223)
chr5 (1-617)||(12132052-12132671)
chr5 (1-506)||(2511062-2511567)
chr5 (1-506)||(9317462-9317967)
chr5 (25-620)||(8665145-8665743)
chr5 (1-681)||(18375058-18375741)
chr5 (1-506)||(30152029-30152534)
chr5 (1-681)||(30168302-30168985)
chr5 (1-680)||(33292362-33293041)
chr5 (1-617)||(43078146-43078768)
chr5 (1-491)||(31431466-31431956)
chr5 (1-506)||(15758503-15759008)
chr5 (1-502)||(37671129-37671630)
chr5 (1-617)||(32599118-32599734)
chr5 (1-617)||(34616418-34617034)
chr5 (1-440)||(31826053-31826492)
chr5 (1-506)||(5637921-5638426)
chr5 (1-506)||(26480403-26480907)
chr5 (1-681)||(33516189-33516872)
chr5 (1-440)||(13324475-13324914)
chr5 (1-500)||(24681457-24681956)
chr5 (1-500)||(24723984-24724483)
chr5 (1-524)||(37358289-37358812)
chr5 (25-502)||(37770657-37771134)
chr5 (1-440)||(3789618-3790057)
chr5 (1-500)||(40473195-40473694)
chr5 (1-428)||(30029504-30029931)
chr5 (25-502)||(37754995-37755472)
chr5 (1-515)||(28959432-28959946)
chr5 (95-428)||(29966806-29967139)
chr5 (553-617)||(31431325-31431389)
chr5 (553-680)||(3789360-3789487)
chr5 (553-617)||(18500949-18501013)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (4-686)||(13521768-13522450)
chr6 (5-686)||(33373952-33374633)
chr6 (5-686)||(8892007-8892687)
chr6 (5-686)||(8903242-8903922)
chr6 (5-685)||(28162477-28163157)
chr6 (4-524)||(14142980-14143500)
chr6 (4-524)||(26787925-26788445)
chr6 (4-524)||(27196298-27196818)
chr6 (4-524)||(27252422-27252942)
chr6 (4-524)||(22456638-22457149)
chr6 (1-536)||(27290062-27290597)
chr6 (277-677)||(22477241-22477644)
chr6 (24-618)||(20160588-20161182)
chr6 (24-618)||(22171649-22172243)
chr6 (1-662)||(22934572-22935233)
chr6 (1-662)||(23857017-23857678)
chr6 (1-662)||(13298643-13299307)
chr6 (1-680)||(26918202-26918884)
chr6 (1-680)||(24304310-24304992)
chr6 (1-662)||(26988841-26989506)
chr6 (1-661)||(16749695-16750358)
chr6 (1-500)||(27272272-27272771)
chr6 (1-662)||(15424009-15424673)
chr6 (1-662)||(24863557-24864221)
chr6 (1-680)||(29549300-29549979)
chr6 (1-296)||(17092132-17092427)
chr6 (184-662)||(26999913-27000394)
chr6 (1-500)||(34463038-34463537)
chr6 (1-617)||(4525174-4525790)
chr6 (1-506)||(29573012-29573517)
chr6 (1-502)||(4773009-4773510)
chr6 (4-500)||(3696086-3696582)
chr6 (1-491)||(4545467-4545957)
chr6 (25-617)||(4757646-4758244)
chr6 (1-491)||(4723826-4724316)
chr6 (1-681)||(30557708-30558391)
chr6 (1-440)||(16674204-16674643)
chr6 (1-491)||(28207468-28207958)
chr6 (1-617)||(27044275-27044892)
chr6 (1-440)||(27007792-27008231)
chr6 (1-428)||(27359684-27360111)
chr6 (1-428)||(27450027-27450454)
chr6 (25-428)||(27485206-27485609)
chr6 (1-422)||(26116102-26116523)
chr6 (1-428)||(16943719-16944146)
chr6 (1-502)||(29501418-29501919)
chr6 (130-502)||(17025280-17025652)
chr6 (1-515)||(26777302-26777821)
chr6 (1-180)||(27019461-27019640)
chr6 (1-254)||(27629392-27629645)
chr6 (547-680)||(29501228-29501361)
chr6 (504-605)||(27629907-27630008)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (5-681)||(21391-22064)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (165-677)||(20240-20730)
scaffold0124 (1-662)||(30296-30960)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (225-536)||(1-312)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (5-662)||(39822-40482)
scaffold0089 (1-620)||(46734-47356)
scaffold0089 (1-662)||(29606-30270)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (165-438)||(1831-2103)
scaffold0415 (1-472)||(6047-6521)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-662)||(27135-27800)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-362)||(370-728)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (130-680)||(7-561)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (1-515)||(9559-10073)
scaffold0336 (550-617)||(8120-8187)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-617)||(6988-7607)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-506)||(8815-9320)
scaffold0159 (27-506)||(20017-20496)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-681)||(14679-15362)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-506)||(25950-26456)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-491)||(7966-8456)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (59-422)||(46604-46981)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-60)||(119651-119706)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 16626299 - 16626972
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  16626299 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgat 16626398  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626399 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 16626498  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16626499 aatcatgttcacagcagtgtgattcggaagaggattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 16626598  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16626599 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16626698  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16626699 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtagagtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16626798  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16626799 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactga 16626898  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16626899 tgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18530853 - 18530186
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18530853 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 18530754  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530753 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctc 18530654  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18530653 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 18530554  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18530553 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 18530454  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18530453 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 18530354  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||      ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  18530353 ttgttgctgc------tgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactga 18530260  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  18530259 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactgggcagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5652851 - 5652170
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5652851 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5652752  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5652751 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctca 5652652  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5652651 atcatgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 5652552  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  5652551 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 5652452  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5652451 tgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 5652352  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5652351 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgat 5652252  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652251 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4626408 - 4625727
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4626408 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 4626309  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  4626308 atggtcaaacagagaggctcggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctca 4626209  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4626208 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 4626109  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  4626108 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 4626009  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4626008 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 4625909  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625908 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 4625809  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625808 gatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 17993578 - 17994259
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||    
T  17993578 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatc 17993677  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17993678 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 17993777  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17993778 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 17993877  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  17993878 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 17993977  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17993978 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 17994077  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994078 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 17994177  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994178 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32293217 - 32292697
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  32293217 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 32293118  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32293117 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 32293018  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  32293017 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 32292918  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  32292917 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 32292818  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292817 gtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 32292718  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32292717 ttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 31033910 - 31034430
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  31033910 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 31034009  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31034010 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 31034109  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  31034110 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 31034209  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  31034210 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcag 31034309  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034310 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 31034409  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  31034410 ctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5713691 - 5713007
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5713691 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5713592  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5713591 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5713492  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5713491 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5713392  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5713391 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5713292  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||    
T  5713291 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5713192  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5713191 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtact 5713092  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713091 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5724601 - 5723917
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5724601 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5724502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5724501 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5724402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5724401 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5724302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5724301 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5724202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||    
T  5724201 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5724102  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5724101 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtact 5724002  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724001 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 5767767 - 5768451
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5767767 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 5767866  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5767867 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 5767966  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || |    
T  5767967 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacga 5768066  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  5768067 tatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 5768166  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| |||    
T  5768167 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggct 5768266  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5768267 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtact 5768366  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768367 gatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 35 - 686
Target Start/End: Original strand, 5756907 - 5757560
Alignment:
Q  35 tctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagctt 134  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||     |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     
T  5756907 tctggatgtcattctgancacngtagcacnnncaaggattatggaagcattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactc 5757005  T
Q  135 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaaga 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5757006 gatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaaga 5757105  T
Q  235 ggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacat 334  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||    
T  5757106 ggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacat 5757205  T
Q  335 catgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtg 434  Q
    ||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5757206 catgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatg 5757305  T
Q  435 ccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctgga 531  Q
    ||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||    || ||| |||||||| | ||     
T  5757306 ccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggc 5757405  T
Q  532 ggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggct 631  Q
      |||||||| | | || || || || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  5757406 aactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgct 5757505  T
Q  632 gagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757506 gagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 8301057 - 8301736
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||| |||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8301057 tcaccgacaatcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8301156  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8301157 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8301256  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  8301257 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 8301356  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  8301357 acgatatacttcaaagcatagcacccctctacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 8301456  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  8301457 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8301556  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8301557 agcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtac 8301656  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| | |||||||||||| |  || |||||||||||    
T  8301657 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 15892496 - 15893178
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||||||    
T  15892496 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcat 15892595  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15892596 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15892695  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15892696 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15892795  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| ||||    
T  15892796 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggat 15892895  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||    
T  15892896 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 15892995  T
Q  501 agcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  15892996 agcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaaggg 15893095  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  15893096 tactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18051730 - 18051066
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||    
T  18051730 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacat 18051631  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18051630 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatac 18051531  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18051530 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18051431  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||   |||||||||||||| |||||    
T  18051430 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggat 18051331  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18051330 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18051231  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  18051230 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 18051131  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  18051130 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 8296440 - 8295779
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  8296440 tcactgacagtcaaaaaatcatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 8296341  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8296340 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 8296241  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  8296240 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 8296141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||||||||||||| |||    
T  8296140 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagat 8296041  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  8296040 caggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 8295941  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| ||||||||  |||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| |||    
T  8295940 agcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtac 8295841  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  8295840 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 6192784 - 6192102
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  6192784 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 6192685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6192684 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 6192585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  6192584 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 6192485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| | |||    
T  6192484 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagat 6192385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  6192384 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 6192285  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  6192284 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 6192185  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||| |||||| ||||| | ||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  6192184 tactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 4796443 - 4797107
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4796443 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4796542  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4796543 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 4796642  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  4796643 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 4796742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  4796743 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 4796842  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  4796843 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4796942  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  4796943 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 4797042  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  4797043 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 4797107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 4722099 - 4721477
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  4722099 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 4722000  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||||||| ||||    
T  4721999 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatac 4721900  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| || |  |||||||| |  ||||| |||||     
T  4721899 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttc 4721800  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| |||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||| |||||    
T  4721799 acgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggat 4721700  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  4721699 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 4721600  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   ||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  4721599 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 4721500  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  4721499 tactgatgataaaatggcggaaa 4721477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 29148545 - 29149209
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  29148545 tcactgacagtcaaagaattgtcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 29148644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  29148645 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 29148744  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29148745 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29148844  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29148845 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29148944  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  29148945 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29149044  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  29149045 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaaggg 29149144  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  29149145 tactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 29149209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18331137 - 18330460
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18331137 tcactaacagtcaaaaaattttcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacctaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 18331038  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18331037 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 18330938  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  18330937 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 18330838  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  18330837 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 18330738  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||  ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18330737 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaggtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18330638  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  18330637 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg- 18330539  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
        ||||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18330538 ----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18330460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 35881234 - 35880552
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| || | || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  35881234 tcactaacagtcaaaaaaatttcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 35881135  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  35881134 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 35881035  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  35881034 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 35880935  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||| |||||    
T  35880934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggat 35880835  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  35880834 caggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 35880735  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  35880734 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 35880635  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  35880634 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 22387368 - 22388047
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  22387368 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaagaattacgaaggcatcctagacacttggcat 22387467  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22387468 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22387567  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22387568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22387667  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  22387668 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 22387767  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  22387768 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtct 22387867  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  22387868 agcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 22387967  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || | ||| || || | | ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  22387968 tgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 15740884 - 15741536
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  15740884 tcactaacagtcaaaaaattatcatccatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 15740983  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15740984 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15741083  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15741084 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15741183  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||| ||    
T  15741184 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaat 15741283  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  15741284 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15741383  T
Q  501 agcttgttgct---gctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| || |   | ||| |||||||| ||||   ||||||            ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  15741384 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttg------------agcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 15741471  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  15741472 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 15741536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 7073680 - 7073058
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  7073680 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcat 7073581  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  7073580 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 7073481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  7073480 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 7073381  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7073380 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7073281  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||| || ||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  7073280 caggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 7073181  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  7073180 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 7073081  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  7073080 tactgatggtaaaatggcggaaa 7073058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 10396601 - 10395982
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10396601 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 10396502  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  10396501 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 10396402  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10396401 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 10396302  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10396301 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10396202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  10396201 caggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtct 10396102  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||  |   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  10396101 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacc---tgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 10396005  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  10396004 tactgatgataaaatggcggaaa 10395982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Original strand, 28115744 - 28116363
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  28115744 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 28115843  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  28115844 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 28115943  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28115944 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28116043  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28116044 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28116143  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  28116144 caagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28116243  T
Q  501 agcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaa 594  Q
    ||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  28116244 agcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcaga 28116343  T
Q  595 ggatactgatgatagaatgg 614  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  28116344 gggtactgatgataaaatgg 28116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 18276842 - 18277506
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18276842 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18276941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18276942 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18277041  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18277042 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18277141  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18277142 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18277241  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18277242 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18277341  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  18277342 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 18277441  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18277442 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18277506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 18307444 - 18308108
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18307444 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18307543  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18307544 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18307643  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18307644 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18307743  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18307744 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18307843  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18307844 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18307943  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  18307944 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 18308043  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18308044 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18308108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 18292143 - 18292807
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18292143 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 18292242  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18292243 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18292342  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18292343 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18292442  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  18292443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgat 18292542  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  18292543 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 18292642  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  18292643 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 18292742  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  18292743 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 18292807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8212206 - 8211527
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8212206 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8212107  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8212106 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8212007  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  8212006 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 8211907  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8211906 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8211807  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||  ||||    
T  8211806 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtct 8211707  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  8211706 agtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 8211607  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8211606 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4417387 - 4416882
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  4417387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagttttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatccgagacacttggcat 4417288  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4417287 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4417188  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  4417187 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 4417088  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4417087 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4416988  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  4416987 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4416888  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  4416887 agcttg 4416882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 28021743 - 28021127
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  28021743 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 28021644  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28021643 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28021544  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28021543 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28021444  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| || ||||    
T  28021443 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggat 28021344  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  28021343 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtatagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28021244  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  28021243 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtac 28021144  T
Q  601 tgatgatagaatggtgg 617  Q
    |||||||| || |||||    
T  28021143 tgatgataaaacggtgg 28021127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 11110139 - 11110578
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||| | |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  11110139 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 11110238  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  11110239 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacac 11110338  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  11110339 ttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 11110438  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  11110439 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 11110538  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11110539 caggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 11110578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 20576637 - 20577136
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  20576637 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 20576736  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  20576737 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 20576836  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  20576837 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 20576936  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  20576937 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 20577036  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  20577037 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 29664760 - 29665259
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29664760 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29664859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29664860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29664959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29664960 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29665059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  29665060 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 29665159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  29665160 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 29665259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 32439622 - 32438944
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  32439622 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 32439523  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  32439522 gatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 32439423  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  32439422 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 32439323  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  32439322 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 32439223  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  32439222 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32439123  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  32439122 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 32439023  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 679  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  32439022 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 5609112 - 5609617
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5609112 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5609211  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  5609212 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 5609311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5609312 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5609411  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5609412 acgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5609511  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  5609512 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5609611  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  5609612 agcttg 5609617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48466395 - 48465956
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  48466395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 48466296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  48466295 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 48466196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  48466195 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 48466096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  48466095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 48465996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  48465995 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 48465956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51782491 - 51782052
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  51782491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 51782392  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51782391 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51782292  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  51782291 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttc 51782192  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  51782191 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 51782092  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51782091 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 51782052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 5467394 - 5466834
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5467394 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 5467295  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  5467294 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 5467195  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || | ||| ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5467194 tattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 5467095  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 459  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  5467094 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagg 5466995  T
Q  460 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaa 556  Q
    |  || ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||| |   ||| ||||||||  | |||||| |||| || ||  ||||    || ||||| |    
T  5466994 agttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacctgttgagcga 5466895  T
Q  557 tggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5466894 tggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgg 5466834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 6542276 - 6542753
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  6542276 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 6542375  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||    
T  6542376 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatg 6542475  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  6542476 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 6542575  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  6542576 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 6542675  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  6542676 ttgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 6542753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 28339770 - 28339265
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28339770 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28339671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28339670 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28339571  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28339570 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28339471  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28339470 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28339371  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  28339370 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28339271  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  28339270 agcttg 28339265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 47023921 - 47023302
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  47023921 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 47023822  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  47023821 gatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 47023722  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  47023721 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 47023622  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  47023621 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 47023522  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  47023521 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 47023422  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  47023421 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagaggg 47023322  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  47023321 tactgatgataaaacggtgg 47023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21675161 - 21674479
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  21675161 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 21675062  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  21675061 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 21674962  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  21674961 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 21674862  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  21674861 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 21674762  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  21674761 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 21674662  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| || || | ||| || ||||||||||||| |||||  ||     
T  21674661 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcaggggg 21674562  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21674561 tactgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 21674479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 506
Target Start/End: Original strand, 31964289 - 31964768
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31964289 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31964388  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31964389 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31964488  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31964489 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31964588  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  31964589 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 31964688  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 506  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  31964689 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 31964768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 36996867 - 36997366
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  36996867 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 36996966  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36996967 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 36997066  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||  ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  36997067 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 36997166  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36997167 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 36997266  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  36997267 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 36997366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 617
Target Start/End: Original strand, 4346536 - 4347093
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4346536 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 4346635  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  |    
T  4346636 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacat 4346735  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  4346736 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 4346835  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||     
T  4346836 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaaga 4346935  T
Q  460 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatgg 559  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| ||||    
T  4346936 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgg 4347035  T
Q  560 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    |||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4347036 cattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 4347093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 681
Target Start/End: Original strand, 17984772 - 17985429
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||||||| ||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    |||| ||| ||||      
T  17984772 catcaagctttggatgtcgtcttgaacaatatggcaacccagaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatgactgaacagagaagcttta 17984871  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  17984872 cacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 17984971  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||||    
T  17984972 ttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatcc 17985071  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  17985072 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 17985171  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgtt 523  Q
    || || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| ||||||    
T  17985172 gtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgtt 17985271  T
Q  524 gagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataa 623  Q
    || | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  17985272 gaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaa 17985371  T
Q  624 ggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
     | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  17985372 cggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 7997030 - 7996414
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  7997030 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7996931  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  7996930 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 7996831  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7996830 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7996731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7996730 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7996631  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  7996630 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7996531  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  7996530 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 7996431  T
Q  598 tactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||||| |||||    
T  7996430 tactgatgataaaatgg 7996414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 10643538 - 10642922
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  10643538 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 10643439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  10643438 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 10643339  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10643338 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10643239  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10643238 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10643139  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  10643138 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10643039  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  10643038 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 10642939  T
Q  598 tactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10642938 tactgatgataaaatgg 10642922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 506
Target Start/End: Original strand, 50133990 - 50134366
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  50133990 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 50134089  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    | || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  50134090 gtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 50134189  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||     
T  50134190 gacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgta 50134289  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 506  Q
    || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  50134290 caatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 50134366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20066485 - 20065850
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||||||||  || ||||| || || | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     |||||||||| ||||||||  | ||||||    
T  20066485 catcaagctctggacatcgttttggacgacatggcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaacaataaagcttgg 20066386  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || | |||||| || ||||| ||||||||||||||||  || || || || ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20066385 cacaacttgatatggagtggtaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgat 20066286  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||    
T  20066285 ttgggagcggattatcgaggacatgtggcatattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccc 20066186  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || ||    ||||||||||||||||| || ||     
T  20066185 ctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggcccggtggaggcttgccctgcctagtc 20066086  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgag 526  Q
    |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | ||||||     
T  20066085 gtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaa 20065986  T
Q  527 ctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataagga 626  Q
    |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |     
T  20065985 ctggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaagg 20065886  T
Q  627 aggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  20065885 atgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 20065850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18243183 - 18242780
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  18243183 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 18243084  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  18243083 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 18242984  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  18242983 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 18242884  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  18242883 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 18242784  T
Q  425 ttgt 428  Q
    ||||    
T  18242783 ttgt 18242780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 5596147 - 5596838
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  5596147 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 5596246  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5596247 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5596346  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  5596347 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 5596446  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5596447 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5596546  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  |||| ||||| |||||    
T  5596547 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 5596646  T
Q  501 ag----------ct--tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgat 588  Q
    ||          ||  ||||| || ||| ||||||||  ||| || || ||||| |  |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || | |    
T  5596647 agtatactgctgctgctgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggt 5596746  T
Q  589 ggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5596747 ggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18225659 - 18224977
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | ||||||    || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18225659 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacggtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18225560  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  18225559 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcttcacacac 18225460  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18225459 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18225360  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18225359 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18225260  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  |||| |||||||| ||    
T  18225259 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcct 18225160  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||||||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||     
T  18225159 agcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaaggg 18225060  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18225059 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5014180 - 5013741
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  5014180 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 5014081  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5014080 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5013981  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5013980 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5013881  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5013880 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5013781  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  5013780 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctct 5013741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24328627 - 24328200
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24328627 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24328528  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  24328527 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 24328428  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24328427 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24328328  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24328327 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24328228  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24328227 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 24328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22870705 - 22871148
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22870705 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22870804  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22870805 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22870904  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22870905 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22871004  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22871005 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22871104  T
Q  460 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22871105 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 503
Target Start/End: Original strand, 22885764 - 22886207
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22885764 gcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagtt 22885863  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |    
T  22885864 gcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacat 22885963  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  22885964 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 22886063  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagc 459  Q
    |||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || ||     
T  22886064 atcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaaga 22886163  T
Q  460 aactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22886164 agttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51797461 - 51797141
Alignment:
Q  121 gcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcag 220  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| |    
T  51797461 gctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcgg 51797362  T
Q  221 cgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta 320  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  51797361 catgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcata 51797262  T
Q  321 gcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctg 419  Q
     || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51797261 acacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctg 51797162  T
Q  420 tctggttgtgcagtgccctct 440  Q
    ||| ||||| || ||||||||    
T  51797161 tctagttgtacaatgccctct 51797141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 304 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 4893375 - 4892999
Alignment:
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| || || |  |    
T  4893375 atgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagtggaaccttggaggtaaagggtccg 4893276  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  4893275 gtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4893176  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
     | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  4893175 atattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactga 4893076  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  4893075 tgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 638
Target Start/End: Original strand, 29665330 - 29665415
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 638  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  29665330 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Original strand, 11110706 - 11110770
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11110706 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 11110770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 19456162 - 19456835
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  19456162 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgat 19456261  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19456262 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 19456361  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456362 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 19456461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19456462 atgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 19456561  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19456562 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 19456661  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19456662 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactga 19456761  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19456762 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27119187 - 27118506
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27119187 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 27119088  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27119087 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 27118988  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27118987 atcatgtttacaacagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 27118888  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  27118887 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 27118788  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  27118787 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagct 27118688  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118687 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 27118588  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118587 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 3785153 - 3784472
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3785153 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 3785054  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  3785053 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 3784954  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3784953 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 3784854  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  3784853 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 3784754  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3784753 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 3784654  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784653 tgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 3784554  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784553 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 21702905 - 21703578
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  21702905 ctgacagtcaaataattgccgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgat 21703004  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703005 cgtggttaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 21703104  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  21703105 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 21703204  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21703205 atgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 21703304  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21703305 gtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 21703404  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703405 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 21703504  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  21703505 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactaggcagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 34157509 - 34156829
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34157509 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 34157410  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34157409 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 34157310  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34157309 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 34157211  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  34157210 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 34157111  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34157110 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 34157011  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157010 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 34156911  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156910 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 34303045 - 34303726
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34303045 tgacagtcagataattgtcgttgatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatc 34303144  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303145 attgtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctca 34303244  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34303245 atcatgtttatagcagcatgtttcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 34303344  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||    
T  34303345 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcagg 34303444  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303445 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 34303544  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303545 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 34303644  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303645 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16164102 - 16163417
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  16164102 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgat 16164003  T
Q  104 catggtcaaacaaagagg---cttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||    
T  16164002 catggtcaaacagagaggaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatac 16163903  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16163902 ctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 16163803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||    
T  16163802 acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgccatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggat 16163703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16163702 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 16163603  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16163602 agcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatac 16163503  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163502 tgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 685
Target Start/End: Original strand, 31891070 - 31891750
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31891070 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31891169  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31891170 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31891269  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31891270 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31891369  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  31891370 tgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 31891469  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891470 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 31891569  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31891570 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgat 31891669  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 685  Q
    |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891670 gatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 27434182 - 27434846
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27434182 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27434281  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27434282 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27434381  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27434382 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27434481  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||||    
T  27434482 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggat 27434581  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| || ||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  27434582 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27434681  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  27434682 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaaggg 27434781  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27434782 tactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 4 - 506
Target Start/End: Original strand, 22925769 - 22926271
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  22925769 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgat 22925868  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22925869 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 22925968  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  22925969 aatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacg 22926068  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  22926069 atatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 22926168  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||    
T  22926169 gtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagc 22926268  T
Q  504 ttg 506  Q
    |||    
T  22926269 ttg 22926271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 28882717 - 28882053
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  28882717 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 28882618  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  28882617 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 28882518  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  28882517 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 28882418  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  28882417 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 28882318  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  28882317 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 28882218  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  28882217 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 28882118  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  28882117 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 28882053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 173 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 27393300 - 27392813
Alignment:
Q  173 cgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggt 272  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  27393300 cgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagt 27393201  T
Q  273 taattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagg 372  Q
    ||| ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27393200 taactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgagg 27393101  T
Q  373 tcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatata 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |    
T  27393100 tcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcataca 27393001  T
Q  473 gcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtac 572  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||                     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27393000 tcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgct---------------------gttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtac 27392922  T
Q  573 ctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagca 672  Q
    ||||||||||||||  ||    |||||||| |||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  27392921 ctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagca 27392822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 12656045 - 12655381
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | | || |||||||  ||||||    
T  12656045 tcactcacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggtatcctaggcacttggcat 12655946  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12655945 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12655846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  12655845 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 12655746  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  12655745 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 12655646  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  12655645 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 12655546  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||     
T  12655545 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaggggg 12655446  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  12655445 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 20838421 - 20837759
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  20838421 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 20838322  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20838321 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 20838222  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  20838221 ttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 20838122  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  20838121 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagat 20838022  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  20838021 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 20837922  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||     
T  20837921 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaggggg 20837822  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacgga 660  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  20837821 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacgga 20837759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 23128304 - 23128968
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||| |   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23128304 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatatcatcttgaatagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23128403  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23128404 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23128503  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23128504 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23128603  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23128604 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23128703  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23128704 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23128803  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  23128804 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 23128903  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23128904 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 9349720 - 9350219
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  9349720 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttggcat 9349819  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9349820 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcctcatatac 9349919  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9349920 ctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9350019  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  9350020 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 9350119  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9350120 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 9350219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 13936282 - 13936904
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13936282 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcgcggaggcatcctagacatttggcat 13936381  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13936382 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13936481  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  13936482 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 13936581  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13936582 acgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13936681  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  13936682 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13936781  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
     ||||| ||    |||||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  13936782 ggcttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 13936881  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  13936882 tactgatggtaaaatggcggaaa 13936904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 34286857 - 34286235
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34286857 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34286758  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34286757 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34286658  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34286657 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34286558  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34286557 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34286458  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||    
T  34286457 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34286358  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||     
T  34286357 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagaggg 34286258  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  34286257 tactgatggtaaaatggcggaaa 34286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 34291917 - 34291295
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34291917 tcactgacagtcagaaaattatcgttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 34291818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34291817 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34291718  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  34291717 ctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 34291618  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34291617 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34291518  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||    
T  34291517 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 34291418  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||     
T  34291417 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagaggg 34291318  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  34291317 tactgatggtaaaatggcggaaa 34291295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 614
Target Start/End: Original strand, 11634948 - 11635543
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11634948 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11635047  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11635048 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11635147  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11635148 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11635247  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11635248 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11635347  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcg 518  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |    
T  11635348 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11635447  T
Q  519 ttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  11635448 ttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 11635543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 620
Target Start/End: Original strand, 21676944 - 21677542
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  21676944 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 21677043  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  21677044 tgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 21677143  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  21677144 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 21677243  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21677244 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 21677343  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttg 521  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| ||||    
T  21677344 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 21677443  T
Q  522 ttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21677444 ttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaa 21677542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 40233990 - 40233515
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  40233990 ttcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 40233891  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| || ||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  40233890 tgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcattttcacagcggcatg 40233791  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  40233790 atttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 40233691  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  40233690 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 40233591  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  40233590 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 614
Target Start/End: Original strand, 11641137 - 11641732
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  11641137 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 11641236  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||  | || || ||||| |||||||| || ||    
T  11641237 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacacttcgatcatattcacagcggcatg 11641336  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |  ||||| || || |||||||||||||| || ||     
T  11641337 atttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaagcttcttcacgatgtacttcaaagcataacac 11641436  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  11641437 ccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctag 11641536  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg------ttgctgctgtcg 518  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||||      ||| || ||| |    
T  11641537 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 11641636  T
Q  519 ttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  11641637 ttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgg 11641732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 32050301 - 32049685
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  32050301 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 32050202  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  32050201 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 32050102  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32050101 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32050002  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  32050001 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 32049902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  32049901 ccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 32049802  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  32049801 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 32049702  T
Q  598 tactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||||| |||||    
T  32049701 tactgatgataaaatgg 32049685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 37925996 - 37925377
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37925996 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37925897  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37925896 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37925797  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37925796 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37925697  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  37925696 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 37925597  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||    
T  37925596 cgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcct 37925497  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  37925496 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaaggg 37925397  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  37925396 tactgatgataaaacggtgg 37925377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12587313 - 12586814
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12587313 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12587214  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12587213 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12587114  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12587113 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 12587014  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12587013 acgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12586914  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || ||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  12586913 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27777725 - 27777226
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27777725 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27777626  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27777625 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27777526  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27777525 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27777426  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27777425 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27777326  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27777325 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 27817483 - 27816984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27817483 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27817384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27817383 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27817284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27817283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27817184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27817183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27817084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27817083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 37375664 - 37375000
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  37375664 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 37375565  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||| || | ||    
T  37375564 gttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacac 37375465  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  37375464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 37375365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37375364 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37375265  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  37375264 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 37375165  T
Q  501 ag---cttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    ||    ||| ||||||||  | |||||| | || || || |||||    || ||||| ||| |||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  37375164 agtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacctgttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 37375065  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || || || || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  37375064 tactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 37375000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27804210 - 27803687
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  27804210 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 27804111  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27804110 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacac 27804011  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27804010 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27803911  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  27803910 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 27803811  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  27803810 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
     |  | |||||||||  |||||||    
T  27803710 ggtatattgctgctgntgttgttg 27803687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34862183 - 34861678
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  34862183 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 34862084  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  34862083 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttcttcacacac 34861984  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  34861983 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 34861884  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34861883 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34861784  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  34861783 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 34861684  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  34861683 agcttg 34861678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 37685647 - 37686152
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37685647 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37685746  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37685747 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37685846  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37685847 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37685946  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37685947 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37686046  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  37686047 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37686146  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  37686147 agcttg 37686152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 37700912 - 37701417
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  37700912 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 37701011  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  37701012 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 37701111  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  37701112 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 37701211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37701212 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37701311  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  37701312 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 37701411  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  37701412 agcttg 37701417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 12716340 - 12716863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  12716340 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 12716439  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  12716440 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 12716539  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12716540 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12716639  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  12716640 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 12716739  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  12716740 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
     |  | |||||||||| |||||||    
T  12716840 ggtatattgctgctgttgttgttg 12716863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 39051560 - 39052059
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||  | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39051560 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgttgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39051659  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   | || ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39051660 gatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39051759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  39051760 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 39051859  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39051860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39051959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39051960 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 16829076 - 16829740
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16829076 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16829175  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16829176 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16829275  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16829276 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16829375  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16829376 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16829475  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  16829476 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16829575  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  16829576 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 16829675  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16829676 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16829740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 16892405 - 16891741
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16892405 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16892306  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16892305 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16892206  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  16892205 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 16892106  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16892105 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16892006  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  16892005 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 16891906  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  16891905 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 16891806  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||    
T  16891805 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggagg 16891741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 260491 - 260930
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  260491 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 260590  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||| |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| ||| |||||||  | ||    
T  260591 gatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcgcacac 260690  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  260691 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 260790  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||    
T  260791 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagat 260890  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  260891 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 260930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39890577 - 39890150
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39890577 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagccttggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39890478  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39890477 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39890378  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  39890377 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 39890278  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||| ||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    |||||| |||||||||||||    
T  39890277 acgatatacttcagagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggat 39890178  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39890177 caggtggtggcttgccctgtctagttgt 39890150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 31876784 - 31876279
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||| | |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31876784 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagggtcacggagacatcccagacacttggcat 31876685  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| |||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31876684 gatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31876585  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31876584 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 31876485  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31876484 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31876385  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || || || | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  31876384 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31876285  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  31876284 agcttg 31876279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 289 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 34279664 - 34279330
Alignment:
Q  289 atgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgg 388  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |    
T  34279664 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttg 34279565  T
Q  389 gaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagagg 488  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  34279564 gaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagg 34279465  T
Q  489 aaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgaccc 585  Q
     || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  34279464 gaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgaccc 34279365  T
Q  586 gatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||    
T  34279364 ggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaa 34279330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 19416237 - 19416664
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19416237 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19416336  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19416337 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19416436  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  19416437 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttc 19416536  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19416537 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19416636  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19416637 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 19416664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Original strand, 261058 - 261122
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  261058 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 261122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 522; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 15284680 - 15285353
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  15284680 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaaactctagatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgat 15284779  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15284780 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctc 15284879  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15284880 aatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 15284979  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  15284980 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcag 15285079  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15285080 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15285179  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15285180 ttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactga 15285279  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  15285280 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcagcatt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15228389 - 15227716
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  15228389 ctgacagtcaaataactgtcgttcatcaagctctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgat 15228290  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15228289 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatatacccc 15228190  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  15228189 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 15228090  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  15228089 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcgtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcag 15227990  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15227989 gtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 15227890  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15227889 ttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 15227790  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15227789 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 24460358 - 24461039
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24460358 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 24460457  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  24460458 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 24460557  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24460558 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 24460657  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  24460658 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 24460757  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24460758 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 24460857  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24460858 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgat 24460957  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460958 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 1900776 - 1900103
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  1900776 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggt 1900677  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900676 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctc 1900577  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  1900576 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 1900477  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  1900476 atgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcag 1900377  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1900376 gtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 1900277  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||| || ||| | |||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900276 ttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 1900177  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1900176 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 677
Target Start/End: Original strand, 14235274 - 14235953
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  | |||  |||||    
T  14235274 tcactaacaatcagatatttgttgtccatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcat 14235373  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||       
T  14235374 ggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggt 14235473  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  14235474 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttcttt 14235573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  14235574 acaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggt 14235673  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14235674 taggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcagagtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtct 14235773  T
Q  501 agc---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||   ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||     
T  14235774 agcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagaggg 14235873  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    |||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  14235874 tactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 681
Target Start/End: Original strand, 15391090 - 15391764
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  15391090 ctgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgat 15391189  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  15391190 tatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctc 15391289  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||    
T  15391290 gatcatgttcacagcagcgtgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttaca 15391389  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15391390 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 15391489  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  15391490 gtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggt 15391589  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccg---atggcaaaggatac 600  Q
    |||||||||||||   ||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||   ||||||    
T  15391590 ttgttgctgctgt---tgttgagccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatac 15391683  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    || ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15391684 tggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcaacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 17014522 - 17013858
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  17014522 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 17014423  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  17014422 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 17014323  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  17014322 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 17014223  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  17014222 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 17014123  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  17014122 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 17014023  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  17014022 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 17013923  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| || |||||    
T  17013922 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggagg 17013858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 24592063 - 24592742
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  24592063 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 24592162  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24592163 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24592262  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24592263 ttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24592362  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24592363 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24592462  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  24592463 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24592562  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  24592563 agcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 24592662  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  24592663 tgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14665540 - 14664858
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14665540 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14665441  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14665440 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14665341  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14665340 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggatattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14665241  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14665240 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14665141  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  14665140 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14665041  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  14665040 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 14664941  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  14664940 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 14763053 - 14763717
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||| ||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  14763053 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcat 14763152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14763153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14763252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  14763253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 14763352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14763353 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 14763452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  14763453 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 14763552  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  14763553 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 14763652  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  14763653 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 14763717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 36344264 - 36344925
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  36344264 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 36344363  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  36344364 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 36344463  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  36344464 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 36344563  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  36344564 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggat 36344663  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  36344664 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 36344763  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||  | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36344764 agtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatac 36344863  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||| || ||| | || || | | ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||    
T  36344864 tgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggagg 36344925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 5006395 - 5005776
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||| ||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  5006395 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaatccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 5006296  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  5006295 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 5006196  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || || || ||||| |  |||||||| ||     
T  5006195 ttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgagcttcttc 5006096  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5006095 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5005996  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  5005995 caggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5005896  T
Q  501 agcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaa 594  Q
    ||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  5005895 agcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcaga 5005796  T
Q  595 ggatactgatgatagaatgg 614  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  5005795 gggtactgatgataaaatgg 5005776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 6570375 - 6569753
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6570375 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcat 6570276  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
     |||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6570275 aatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6570176  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  6570175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 6570076  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6570075 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6569976  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||| |||| || ||||||||    
T  6569975 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtct 6569876  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| | |||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  6569875 agcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 6569776  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  6569775 tactgatggtaaaatggcggaaa 6569753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18800362 - 18800863
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  18800362 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 18800461  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18800462 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18800561  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18800562 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 18800661  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18800662 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18800761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  18800762 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 18800861  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18800862 ag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 24113184 - 24112506
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||  | ||||    
T  24113184 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcacttagcat 24113085  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  24113084 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 24112985  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  24112984 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 24112885  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24112884 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24112785  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  24112784 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 24112685  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  24112684 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 24112585  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattga 679  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  24112584 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 34188709 - 34189388
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  34188709 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 34188808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  34188809 gatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 34188908  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  34188909 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 34189008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  34189009 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 34189108  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  34189109 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34189208  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  34189209 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 34189308  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  34189309 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 33673547 - 33674046
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  33673547 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 33673646  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  33673647 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 33673746  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33673747 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33673846  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  33673847 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 33673946  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  33673947 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 31126267 - 31126949
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  31126267 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 31126366  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31126367 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31126466  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31126467 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31126566  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  31126567 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 31126666  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  31126667 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 31126766  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  31126767 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 31126866  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31126867 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 54833885 - 54833230
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  54833885 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 54833786  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  54833785 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 54833686  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  54833685 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 54833586  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  54833585 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 54833486  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||    
T  54833485 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttg 54833386  T
Q  525 agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataag 624  Q
    | |||| || || |||||    || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||     
T  54833385 aactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 54833286  T
Q  625 gaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  54833285 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 40105387 - 40105892
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  40105387 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 40105486  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  40105487 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 40105586  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  40105587 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 40105686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  40105687 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 40105786  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || || |  |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  40105787 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 40105886  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  40105887 agcttg 40105892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14099039 - 14098381
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  14099039 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 14098940  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  14098939 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 14098840  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  14098839 atttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 14098740  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  14098739 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 14098640  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttg 521  Q
    |||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    || ||| ||||    
T  14098639 ttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14098540  T
Q  522 ttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaat 621  Q
    |||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||     
T  14098539 ttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaag 14098440  T
Q  622 aaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14098439 aacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Original strand, 27163066 - 27163682
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  27163066 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 27163165  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27163166 gatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27163265  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27163266 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27163365  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27163366 acgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27163465  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  27163466 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 27163565  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  27163566 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 27163665  T
Q  598 tactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27163666 tactgatgataaaatgg 27163682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 39851160 - 39850661
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  39851160 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtctcgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 39851061  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  39851060 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 39850961  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  39850960 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 39850861  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  39850860 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 39850761  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  39850760 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21970223 - 21969613
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  21970223 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 21970124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | |     
T  21970123 gatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacat 21970024  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  21970023 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 21969924  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  21969923 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 21969824  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      |||||||||||||| || || || || || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  21969823 ccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 21969724  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  21969723 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 21969624  T
Q  598 tactgatgata 608  Q
    |||||||||||    
T  21969623 tactgatgata 21969613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30754276 - 30753837
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  30754276 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 30754177  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30754176 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30754077  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  30754076 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 30753977  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30753976 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30753877  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30753876 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 30753837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 579 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  579 ttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattg 678  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  679 at 680  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Original strand, 2410 - 3092
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  2410 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 2509  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 2609  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2610 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2709  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  2710 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 2809  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2810 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 2909  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2910 ttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 3009  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3010 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Original strand, 20340087 - 20340769
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  20340087 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgat 20340186  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340187 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 20340286  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||    
T  20340287 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcaca 20340386  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  20340387 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcag 20340486  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20340487 gtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 20340586  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340587 ttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 20340686  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340687 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 16207783 - 16208453
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16207783 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctttggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgat 16207882  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16207883 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctc 16207982  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  16207983 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 16208082  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16208083 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16208182  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16208183 gtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16208282  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||   || ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    ||||||||     
T  16208283 ttgt---tgatgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggtacctgaggctgacccgatggtggtggatactgg 16208379  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    |||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||| ||| ||||||||    
T  16208380 tgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtaactgggcagcatt 16208453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 20461584 - 20461076
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  20461584 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgat 20461485  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461484 catggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctc 20461385  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461384 aatcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttaca 20461285  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20461284 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 20461185  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20461184 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagc 20461085  T
Q  504 ttgttgctg 512  Q
    |||||||||    
T  20461084 ttgttgctg 20461076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28152365 - 28151845
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  28152365 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 28152266  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28152265 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctc 28152166  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  28152165 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 28152066  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  28152065 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcag 28151966  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151965 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 28151866  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28151865 ttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 614
Target Start/End: Original strand, 41793059 - 41793673
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41793059 actgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatga 41793158  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    |||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || |    
T  41793159 tcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacactt 41793258  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || ||    
T  41793259 cgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcac 41793358  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41793359 gatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatca 41793458  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||    
T  41793459 ggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctag 41793558  T
Q  503 cttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 599  Q
    |||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  41793559 cttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggta 41793658  T
Q  600 ctgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||| |||||    
T  41793659 ctgatgataaaatgg 41793673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 28585487 - 28584805
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28585487 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28585388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28585387 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28585288  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28585287 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28585188  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28585187 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28585088  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  28585087 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28584988  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||     
T  28584987 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaaggg 28584888  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  28584887 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 28584805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10963176 - 10962671
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||  ||  ||||||    
T  10963176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctaaacacttggcat 10963077  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  10963076 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 10962977  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  10962976 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 10962877  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  10962876 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 10962777  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | || | ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  10962776 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 10962677  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  10962676 agcttg 10962671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 51638724 - 51638219
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  51638724 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 51638625  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  51638624 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 51638525  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  51638524 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 51638425  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| |    
T  51638424 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggt 51638325  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||||||||||  ||| || ||||| ||    
T  51638324 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcct 51638225  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  51638224 agcttg 51638219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 533 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460935
Alignment:
Q  533 gctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctg 632  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  633 agagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcatt 20460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 19658752 - 19659432
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19658752 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 19658851  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19658852 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctca 19658951  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19658952 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 19659050  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||    
T  19659051 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcagg 19659150  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19659151 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 19659250  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659251 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 19659350  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659351 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 44563603 - 44562923
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  44563603 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 44563504  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  44563503 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctc 44563404  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  44563403 aatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgag-ttttttaca 44563306  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  44563305 atgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 44563206  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563205 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 44563106  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44563105 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactga 44563006  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563005 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 33245168 - 33244649
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33245168 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33245069  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33245068 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctca 33244969  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33244968 atcatgtttacagcagcgtggttcggaagaggattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33244869  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| | |||    
T  33244868 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcagg 33244769  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33244768 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 33244669  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33244668 tgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 9355130 - 9354444
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  9355130 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 9355031  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  9355030 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 9354931  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9354930 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagttttttt 9354831  T
Q  301 -acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||    
T  9354830 tacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatgga 9354731  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9354730 tcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtc 9354631  T
Q  500 tagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 599  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354630 tagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 9354531  T
Q  600 ctgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354530 ctgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 681
Target Start/End: Original strand, 22080589 - 22081263
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| | ||| |||||||||    
T  22080589 ctgatagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgat 22080688  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||    |||    
T  22080689 catggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctc 22080788  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  22080789 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttaca 22080888  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22080889 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttag 22080988  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  22080989 gtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggt 22081088  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacc---cgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||||||||   | ||||||||    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||   ||||||    
T  22081089 ttgttgctgct---gctgttgagccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggc---ggatac 22081182  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    || ||||| |||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22081183 tggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgagcagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 4 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 18711090 - 18710411
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  18711090 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 18710991  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18710990 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 18710891  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || ||     
T  18710890 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacg 18710791  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| ||||| ||    
T  18710790 atatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcag 18710691  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  18710690 gtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 18710591  T
Q  504 ---ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
       ||| ||||||||  |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  18710590 atattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 18710491  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18710490 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 16283956 - 16283292
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||    
T  16283956 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtat 16283857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  16283856 gatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatac 16283757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16283756 ttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16283657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  16283656 acgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 16283557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  16283556 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtct 16283457  T
Q  501 agcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16283456 agcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaagga 16283357  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16283356 tactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 16278061 - 16277397
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16278061 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaactcaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16277962  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16277961 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16277862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16277861 ttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16277762  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  16277761 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 16277662  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  16277661 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16277562  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  16277561 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 16277462  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16277461 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19688601 - 19687923
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  19688601 tgacattcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttggacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 19688502  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||     
T  19688501 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcg 19688402  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  ||||||||||| || |    
T  19688401 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacga 19688302  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  19688301 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcagg 19688202  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  19688201 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 19688102  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| |||||||| | |    |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19688101 tgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtact 19688002  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    | ||||||||||| ||||| || | | |||| || ||  ||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  19688001 ggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 27608613 - 27609235
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27608613 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27608712  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || |  || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  27608713 gatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 27608812  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  27608813 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 27608912  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  27608913 acgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 27609012  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  27609013 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27609112  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  27609113 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 27609212  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  27609213 tactgatgataaaatggcggaaa 27609235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 14558131 - 14557470
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  14558131 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 14558032  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  14558031 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 14557932  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  14557931 ttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 14557832  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  14557831 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 14557732  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||    
T  14557731 caggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtct 14557632  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  14557631 agcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 14557532  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  14557531 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 14557470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 2136967 - 2137631
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2136967 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2137066  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||| |||| || |    
T  2137067 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgc 2137166  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  2137167 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 2137266  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2137267 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2137366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  2137367 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 2137466  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  2137467 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 2137566  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  2137567 tactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 31489458 - 31490140
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| ||||||||||  | || |||| |||| ||  ||||||    
T  31489458 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcccagaggcatcctagacacttggcat 31489557  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31489558 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 31489657  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31489658 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31489757  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31489758 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31489857  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  31489858 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 31489957  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   ||| |||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  31489958 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaaggg 31490057  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  31490058 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19674948 - 19674323
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  19674948 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 19674849  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  19674848 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 19674749  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19674748 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 19674649  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || |  || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19674648 acaatatacttcaaagcataacacctctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19674549  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  19674548 caggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19674449  T
Q  501 agcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaa 594  Q
    ||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |    
T  19674448 agcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaga 19674349  T
Q  595 ggatactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    || || |||||||| ||||| |||||    
T  19674348 gggtattgatgataaaatggcggaaa 19674323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 3329239 - 3329716
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  3329239 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 3329338  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||  || ||    
T  3329339 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagtggcatg 3329438  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  || ||||| |  | |||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  3329439 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 3329538  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  3329539 ccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 3329638  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  3329639 tcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 3329716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 19208068 - 19208573
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  19208068 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 19208167  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  19208168 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 19208267  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  19208268 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 19208367  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  19208368 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 19208467  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  19208468 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 19208567  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  19208568 agcttg 19208573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19286945 - 19286290
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  19286945 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacatttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 19286846  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  19286845 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 19286746  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  19286745 atttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 19286646  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  19286645 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctag 19286546  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||||  | |||||||||  | |||||    
T  19286545 ttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttg 19286446  T
Q  525 agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataag 624  Q
    | |||| || || |||||    || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||     
T  19286445 aactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaac 19286346  T
Q  625 gaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19286345 ggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 28361663 - 28362168
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  28361663 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 28361762  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  28361763 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 28361862  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28361863 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 28361962  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28361963 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28362062  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  28362063 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 28362162  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  28362163 agcttg 28362168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 31355005 - 31354412
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||| ||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || |||| |    
T  31355005 catcaggctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctttg 31354906  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  31354905 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 31354806  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  31354805 ttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 31354706  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31354705 ctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagtt 31354606  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgtt 523  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| ||||||    
T  31354605 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgtt 31354506  T
Q  524 gagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    || | ||  | || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  31354505 gaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 31354412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 29829829 - 29829390
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  29829829 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 29829730  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29829729 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29829630  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  29829629 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 29829530  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29829529 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggat 29829430  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29829429 caggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctct 29829390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 12092432 - 12092933
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    |||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  12092432 tcactgacggtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 12092531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12092532 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 12092631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  12092632 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 12092731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12092732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12092831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  12092832 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 12092931  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  12092932 ag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33259230 - 33258803
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33259230 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33259131  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33259130 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33259031  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  33259030 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 33258931  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33258930 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33258831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  33258830 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 33258803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 189521 - 189256
Alignment:
Q  81 gcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  189521 gcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagt 189422  T
Q  181 ctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttc 280  Q
    || |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||    
T  189421 ctaggagcttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttc 189322  T
Q  281 cttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagag 346  Q
    |||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  189321 cttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18791214 - 18791107
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  18791214 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgagcagtgtagcaacccaaaggattacgaatgcatcctaggcacttggcat 18791115  T
Q  101 gatcatgg 108  Q
    ||||||||    
T  18791114 gatcatgg 18791107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Original strand, 16449636 - 16450309
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16449636 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgat 16449735  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449736 catggtcaaacagagaggcttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctc 16449835  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||    
T  16449836 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcaca 16449935  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  16449936 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcag 16450035  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16450036 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagc 16450135  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450136 ttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 16450235  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16450236 tgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 31088103 - 31088784
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31088103 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 31088202  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  31088203 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 31088302  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  31088303 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 31088402  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  31088403 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 31088502  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31088503 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 31088602  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088603 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 31088702  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088703 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16041828 - 16041155
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  16041828 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgat 16041729  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | || | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16041728 cgtgattaaacagagaggcttgacatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctc 16041629  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||| |||    
T  16041628 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcaca 16041529  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16041528 atgtacttcaaagcgtagcatccttctacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 16041429  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16041428 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 16041329  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16041328 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactga 16041229  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16041228 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 45733964 - 45733283
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  45733964 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 45733865  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  45733864 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 45733765  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45733764 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 45733665  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  45733664 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 45733565  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45733564 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 45733465  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733464 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 45733365  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733364 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26485199 - 26484679
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26485199 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26485100  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26485099 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26485000  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26484999 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26484900  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26484899 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26484800  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484799 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26484700  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26484699 ttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 39210661 - 39211181
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  39210661 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 39210760  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39210761 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 39210860  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  39210861 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 39210960  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  39210961 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 39211060  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211061 gtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 39211160  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  39211161 ttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 524
Target Start/End: Original strand, 2108644 - 2109163
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2108644 tgacagttagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 2108743  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2108744 atggtcaaacagagaggcttggcataatttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctca 2108843  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2108844 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 2108943  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    
T  2108944 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcagg 2109043  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2109044 tggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 2109143  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2109144 tgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 2775864 - 2775344
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2775864 ctgatagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgat 2775765  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2775764 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 2775665  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  2775664 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 2775565  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  2775564 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 2775465  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775464 gtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 2775365  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  2775364 ctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Original strand, 26682638 - 26683008
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26682638 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26682737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26682738 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26682837  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  26682838 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaa 26682937  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682938 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4201051 - 4200682
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  4201051 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 4200952  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200951 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctca 4200852  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4200851 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 4200752  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 374  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200751 tgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 16518051 - 16518715
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16518051 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16518150  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16518151 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16518250  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || || |||||||| |  |||||||| ||     
T  16518251 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttc 16518350  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16518351 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16518450  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  16518451 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16518550  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16518551 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaaggga 16518650  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16518651 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 16503015 - 16503679
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  16503015 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 16503114  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16503115 gatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatac 16503214  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16503215 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16503314  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  16503315 acgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 16503414  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  16503415 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16503514  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16503515 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaaggga 16503614  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  16503615 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5128500 - 5127818
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  5128500 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 5128401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| | || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5128400 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 5128301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  5128300 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 5128201  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5128200 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5128101  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5128100 taggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5128001  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5128000 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagga 5127901  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5127900 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 635
Target Start/End: Original strand, 10916503 - 10917137
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  10916503 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 10916602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10916603 gatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 10916702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  10916703 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 10916802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  10916803 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 10916902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  10916903 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 10917002  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10917003 agcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatac 10917102  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgaga 635  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||    
T  10917103 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 11424412 - 11425033
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  11424412 tcactaacagtcaaa-aattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 11424510  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11424511 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 11424610  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  11424611 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 11424710  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  11424711 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 11424810  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  11424811 caggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 11424910  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  11424911 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 11425010  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||||| || ||||| |||||    
T  11425011 tactgatggtaaaatggcggaaa 11425033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 2155081 - 2154417
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  2155081 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 2154982  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  2154981 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 2154882  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  2154881 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 2154782  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  2154781 acgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatcatgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 2154682  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||| ||||    
T  2154681 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtct 2154582  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| |  |   ||||||||   | || |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  2154581 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccagcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagaggg 2154482  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  2154481 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 2154417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 18541307 - 18540784
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  18541307 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcattcagcat 18541208  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  18541207 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 18541108  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  18541107 ctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 18541008  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  18541007 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 18540908  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18540907 ccggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtct 18540808  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18540807 agcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Original strand, 5146975 - 5147615
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5146975 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5147074  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  5147075 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcgcacac 5147174  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  5147175 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 5147274  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5147275 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5147374  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5147375 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtct 5147474  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||||||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  5147475 agcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 5147574  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 638  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  5147575 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 26435765 - 26435125
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||    
T  26435765 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacggaggcatcctagacactcggcat 26435666  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26435665 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26435566  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26435565 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26435466  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26435465 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26435366  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  26435365 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 26435266  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  26435265 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 26435166  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagta 638  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||    
T  26435165 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 26274729 - 26275234
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26274729 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 26274828  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26274829 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26274928  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26274929 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26275028  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26275029 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26275128  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  26275129 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26275228  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  26275229 agcttg 26275234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 4144758 - 4145377
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4144758 tcactgacagtcagaagattatcattcattaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4144857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  4144858 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 4144957  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  4144958 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 4145057  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4145058 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4145157  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  4145158 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 4145257  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||  | || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||     
T  4145258 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggg 4145357  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  4145358 tactgatgataaaacggtgg 4145377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 26319504 - 26320123
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  26319504 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagtcacttggcat 26319603  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26319604 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26319703  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26319704 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26319803  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26319804 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26319903  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  26319904 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26320003  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||     
T  26320004 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaaggg 26320103  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  26320104 tactgatgataaaacggtgg 26320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 16736095 - 16736717
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16736095 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16736194  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16736195 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16736294  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16736295 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16736394  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16736395 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16736494  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  16736495 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16736594  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  16736595 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 16736694  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  16736695 tattgatgataaaatggcggaaa 16736717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 16751149 - 16751771
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16751149 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16751248  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  16751249 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 16751348  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16751349 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16751448  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  16751449 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 16751548  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  16751549 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 16751648  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  16751649 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 16751748  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  16751749 tattgatgataaaatggcggaaa 16751771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17524040 - 17523418
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17524040 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17523941  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17523940 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17523841  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17523840 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17523741  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17523740 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17523641  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  17523640 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17523541  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  17523540 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 17523441  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  17523440 tattgatgataaaatggcggaaa 17523418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 17529175 - 17529797
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  17529175 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 17529274  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  17529275 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 17529374  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  17529375 ttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 17529474  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||| |||||||    
T  17529475 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggat 17529574  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  17529575 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 17529674  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  17529675 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 17529774  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  17529775 tattgatgataaaatggcggaaa 17529797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 26537505 - 26538004
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  26537505 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcat 26537604  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26537605 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26537704  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26537705 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 26537804  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26537805 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26537904  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  26537905 caggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 26538004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 31564025 - 31564526
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31564025 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccgaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31564124  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31564125 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31564224  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31564225 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31564324  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31564325 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31564424  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  31564425 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 31564524  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  31564525 ag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3445814 - 3445375
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3445814 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3445715  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  3445714 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 3445615  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  3445614 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 3445515  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3445514 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3445415  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  3445414 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 3445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5160027 - 5159348
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||| ||||    ||||    
T  5160027 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcat 5159928  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  5159927 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 5159828  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||| || ||||| ||||| | ||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  5159827 ctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 5159728  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || | ||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  5159727 acgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 5159628  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  5159627 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 5159528  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  5159527 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 5159428  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  5159427 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 45387851 - 45387235
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  45387851 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 45387752  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||    |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||| ||| | ||    
T  45387751 gatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttcttcacacac 45387652  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  45387651 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 45387552  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  45387551 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 45387452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  45387451 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 45387352  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  45387351 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 45387252  T
Q  598 tactgatgatagaatgg 614  Q
    ||||||||||| |||||    
T  45387251 tactgatgataaaatgg 45387235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9619159 - 9618654
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9619159 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9619060  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9619059 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9618960  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9618959 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9618860  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9618859 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9618760  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  9618759 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9618660  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  9618659 agcttg 9618654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 506
Target Start/End: Original strand, 26669573 - 26670054
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||||||||| |  |||| ||| ||||    
T  26669573 ttcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctt 26669672  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  26669673 tgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 26669772  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  26669773 atttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 26669872  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  26669873 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 26669972  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 506  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  26669973 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 26670054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 11442021 - 11441641
Alignment:
Q  60 gcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagtt 159  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11442021 gcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtt 11441922  T
Q  160 gcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagt 259  Q
    || |  || || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  11441921 gcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacat 11441822  T
Q  260 tgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaa 359  Q
    | |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  11441821 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 11441722  T
Q  360 atcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  11441721 gtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 11441641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 24592176 - 24592603
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24592176 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24592275  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  24592276 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 24592375  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  24592376 ttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 24592475  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  24592476 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 24592575  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  24592576 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 24592603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31125404 - 31125001
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  31125404 ttcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 31125305  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  31125304 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 31125205  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  31125204 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 31125105  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31125104 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 31125005  T
Q  425 ttgt 428  Q
    ||||    
T  31125004 ttgt 31125001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26513289 - 26513130
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26513289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccagaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26513190  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttg 160  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26513189 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 26513130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 11441513 - 11441449
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  11441513 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 11441449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22888983 - 22888310
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22888983 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgat 22888884  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22888883 catggtcaaacaaagaggtttggcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctc 22888784  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  22888783 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 22888684  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22888683 atgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22888584  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22888583 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaatagagtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagc 22888484  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888483 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 22888384  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 677  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22888383 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 13184299 - 13184979
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13184299 tgacagtcagataattgtcgttcatcat-ctctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatc 13184397  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13184398 atggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13184497  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13184498 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13184597  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13184598 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13184697  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13184698 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 13184797  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184798 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 13184897  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184898 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 33877760 - 33877078
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  33877760 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 33877661  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33877660 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 33877561  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  33877560 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 33877461  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  33877460 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 33877361  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877360 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 33877261  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877260 ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 33877161  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877160 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 13440144 - 13440825
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13440144 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 13440243  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13440244 atggtcaaacagaaaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 13440343  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13440344 atcatgtttacagcagcgtgattcagaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 13440443  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  13440444 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 13440543  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13440544 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 13440643  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440644 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 13440743  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440744 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 11326306 - 11325625
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11326306 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 11326207  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11326206 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 11326107  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11326106 atcatgtttacagcaacgtgattcggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 11326007  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  11326006 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 11325907  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11325906 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 11325807  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11325806 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgat 11325707  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325706 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25199542 - 25198884
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  25199542 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgat 25199443  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25199442 catggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctc 25199343  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| || |||    
T  25199342 aatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcaca 25199243  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  25199242 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcag 25199143  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25199142 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagc 25199043  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199042 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 25198943  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25198942 tgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 23892722 - 23892058
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| || ||||  ||||||    
T  23892722 tcactaacagttaaataattgtcattcatcaagctttggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcat 23892623  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23892622 gatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatac 23892523  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  23892522 ctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 23892423  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  23892422 acgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggat 23892323  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23892322 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtct 23892223  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    ||||||||| || ||| |||||||   | | || |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892222 agcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 23892123  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23892122 tactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 536
Target Start/End: Original strand, 29888732 - 29889263
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29888732 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatc 29888831  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29888832 acggttaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctca 29888931  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  29888932 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacga 29889031  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  29889032 tgtacttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcagg 29889131  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889132 tggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtagagttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 29889231  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889232 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 24687803 - 24688467
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24687803 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacatggcat 24687902  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24687903 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24688002  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  24688003 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 24688102  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  24688103 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 24688202  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| || ||||||||    
T  24688203 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtct 24688302  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  24688303 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 24688402  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24688403 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 24970534 - 24969876
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24970534 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24970435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||    
T  24970434 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtac 24970335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||    |||||||| |  |||||||| ||     
T  24970334 tttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttc 24970235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24970234 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24970135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  24970134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24970035  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||||   || ||| |||||||| | ||  ||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24970034 agcttgt---tgatgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatac 24969938  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24969937 tgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 620
Target Start/End: Original strand, 9548193 - 9548811
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  9548193 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatc 9548292  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || ||     
T  9548293 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcg 9548392  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || |    
T  9548393 atcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacga 9548492  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||    
T  9548493 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcagg 9548592  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  9548593 tgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 9548692  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| ||||||||   ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9548693 tgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtact 9548792  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  9548793 gatggtaaaatggcggaaa 9548811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 30935149 - 30934488
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  30935149 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 30935050  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30935049 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 30934950  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30934949 ttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 30934850  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||    
T  30934849 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggat 30934750  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  30934749 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 30934650  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  30934649 agcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtac 30934550  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  30934549 tgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 30934488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 23717634 - 23718298
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23717634 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23717733  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23717734 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23717833  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23717834 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23717933  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  23717934 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 23718033  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23718034 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23718133  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  23718134 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 23718233  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  23718234 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 23718298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 23752096 - 23752760
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  23752096 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 23752195  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23752196 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23752295  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23752296 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 23752395  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  23752396 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 23752495  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23752496 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23752595  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  23752596 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 23752695  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  23752696 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 23752760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 33778003 - 33777321
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  33778003 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 33777904  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33777903 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 33777804  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  33777803 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 33777704  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  33777703 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggat 33777604  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  33777603 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 33777504  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  33777503 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 33777404  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  33777403 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 11549863 - 11549248
Alignment:
Q  8 cagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatg 107  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  11549863 cagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatg 11549764  T
Q  108 gtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatc 207  Q
    |   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||  |||| || |||    
T  11549763 gctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatc 11549664  T
Q  208 atgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgt 307  Q
    || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || |    
T  11549663 atatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatat 11549564  T
Q  308 acttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtgg 407  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549563 acttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgg 11549464  T
Q  408 aggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgt 507  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||     
T  11549463 gggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgc 11549364  T
Q  508 tg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  11549363 tgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgat 11549264  T
Q  605 gatagaatggtggaaa 620  Q
    |||| |||||||||||    
T  11549263 gataaaatggtggaaa 11549248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 22998760 - 22999424
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22998760 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22998859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22998860 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22998959  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22998960 ttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 22999059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  22999060 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 22999159  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  22999160 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22999259  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||     
T  22999260 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagaggg 22999359  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  22999360 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 22999424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 605
Target Start/End: Original strand, 15658406 - 15659013
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  15658406 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 15658505  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | |     
T  15658506 gatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacat 15658605  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  15658606 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 15658705  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15658706 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15658805  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||    
T  15658806 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtct 15658905  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||     
T  15658906 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagaggg 15659005  T
Q  598 tactgatg 605  Q
    ||||||||    
T  15659006 tactgatg 15659013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18500376 - 18500877
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  18500376 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 18500475  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  18500476 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 18500575  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  18500576 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 18500675  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18500676 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18500775  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  18500776 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 18500875  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  18500876 ag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28649751 - 28649250
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  28649751 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacggtatagcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 28649652  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28649651 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28649552  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  28649551 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 28649452  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28649451 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28649352  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  28649351 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28649252  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  28649251 ag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 6874821 - 6874199
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  6874821 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 6874722  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6874721 gatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 6874622  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  || ||||| ||     
T  6874621 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttc 6874522  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  6874521 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 6874422  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||| ||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  6874421 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 6874322  T
Q  501 agcttg------ttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaa 594  Q
    ||||||      ||| || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||    
T  6874321 agcttgctgattttgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaa 6874222  T
Q  595 ggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    || ||||||||||| || |||||    
T  6874221 gggtactgatgataaaacggtgg 6874199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 41675223 - 41674603
Alignment:
Q  3 actgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatga 102  Q
    ||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||    
T  41675223 actgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatga 41675124  T
Q  103 tcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacct 202  Q
    ||||||   |||| ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| ||| ||    
T  41675123 tcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatct 41675024  T
Q  203 caatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttac 302  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| | ||| ||||| || ||    
T  41675023 caatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgac 41674924  T
Q  303 aatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggatta 402  Q
     |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |    
T  41674923 gatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatca 41674824  T
Q  403 ggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  41674823 ggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctag 41674724  T
Q  503 cttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 599  Q
    |||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||    
T  41674723 cttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggta 41674624  T
Q  600 ctgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||||| || ||||| |||||    
T  41674623 ctgatggtaaaatggcggaaa 41674603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 12132671 - 12132052
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  12132671 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 12132572  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  12132571 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 12132472  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  12132471 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 12132372  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  12132371 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 12132272  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  12132271 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 12132172  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||     
T  12132171 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaaggg 12132072  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  12132071 tactgatgataaaacggtgg 12132052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 2511567 - 2511062
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  2511567 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 2511468  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  2511467 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 2511368  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  2511367 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 2511268  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  2511267 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 2511168  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  2511167 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 2511068  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  2511067 agcttg 2511062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9317967 - 9317462
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  9317967 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 9317868  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  9317867 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 9317768  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9317767 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9317668  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9317667 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9317568  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  9317567 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9317468  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  9317467 agcttg 9317462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 620
Target Start/End: Original strand, 8665145 - 8665743
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||   ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||| ||||||   ||||  || ||||    
T  8665145 ttcatcaagctttggatatcgccttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagggaagctt 8665244  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  8665245 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 8665344  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  8665345 atttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 8665444  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  8665445 ccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctag 8665544  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttg 521  Q
    |||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||    || ||| ||||    
T  8665545 ttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttg 8665644  T
Q  522 ttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    |||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  8665645 ttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaa 8665743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 18375058 - 18375741
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  18375058 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 18375157  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  18375158 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 18375257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  18375258 ttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 18375357  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  18375358 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 18375457  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18375458 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 18375557  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  18375558 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 18375657  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  18375658 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30152534 - 30152029
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| | || ||  ||||||    
T  30152534 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcccagacacttggcat 30152435  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  30152434 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 30152335  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30152334 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30152235  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30152234 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30152135  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  30152134 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30152035  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  30152034 agcttg 30152029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 30168985 - 30168302
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  | ||||    
T  30168985 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagcataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttagcat 30168886  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  30168885 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcacatac 30168786  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30168785 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagcttcttc 30168686  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30168685 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30168586  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  30168585 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 30168486  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||     
T  30168485 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaaggg 30168386  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30168385 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 33293041 - 33292362
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| || || | ||| |||||||| || ||| | |||||| ||||    ||||    
T  33293041 tcactgacagtaaggtaattgccgtccatcaagctctggacatcgttttggacgacatggcagcccaaagggttgcgggaacattcttggcactcagcat 33292942  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| ||||||||  | |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||  || || || || ||  ||||| | || ||| |||     
T  33292941 gatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatat 33292842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||| ||     
T  33292841 ctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttg 33292742  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  33292741 acgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 33292642  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  33292641 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 33292542  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | ||| |||||  | |||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  33292541 agcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 33292442  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  | ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  33292441 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 43078768 - 43078146
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  43078768 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 43078669  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  43078668 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 43078569  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  | |||||| ||     
T  43078568 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttc 43078469  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  43078468 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 43078369  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  43078368 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 43078269  T
Q  501 agcttgttgctgc------tgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaa 594  Q
     |  | |||||||      ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |    
T  43078268 ggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaga 43078169  T
Q  595 ggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    || ||||||||||| || |||||    
T  43078168 gggtactgatgataaaacggtgg 43078146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 31431956 - 31431466
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  31431956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 31431857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  31431856 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 31431757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  31431756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 31431657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31431656 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31431557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  31431556 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 31431466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 15758503 - 15759008
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  15758503 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 15758602  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   ||||  || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  15758603 gctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 15758702  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  15758703 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 15758802  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  15758803 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15758902  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  15758903 caggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 15759002  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  15759003 agcttg 15759008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 37671129 - 37671630
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  37671129 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 37671228  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |   |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37671229 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37671328  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  37671329 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 37671428  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37671429 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37671528  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  37671529 caggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37671628  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  37671629 ag 37671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 32599118 - 32599734
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  32599118 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 32599217  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| || ||||||||| | ||    
T  32599218 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacac 32599317  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  32599318 ttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 32599417  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  32599418 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 32599517  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  32599518 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 32599617  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  32599618 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtac 32599717  T
Q  601 tgatgatagaatggtgg 617  Q
    |||||||| || |||||    
T  32599718 tgatgataaaacggtgg 32599734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 34617034 - 34616418
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||   | ||||||||| |||||||  | |||| |||| ||  ||||||    
T  34617034 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcctgaacagtatggcaacccaagggattacaaaggcatcctagacacttggcat 34616935  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| |||||||| | ||    
T  34616934 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacac 34616835  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  34616834 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 34616735  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34616734 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34616635  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  34616634 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 34616535  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||  || | ||||||||| |||    
T  34616534 agcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtac 34616435  T
Q  601 tgatgatagaatggtgg 617  Q
    |||||||| || |||||    
T  34616434 tgatgataaaacggtgg 34616418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 31826053 - 31826492
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  31826053 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 31826152  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  31826153 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatac 31826252  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  31826253 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 31826352  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  31826353 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 31826452  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  31826453 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctct 31826492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 5638426 - 5637921
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  5638426 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaggctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 5638327  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  5638326 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 5638227  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || || ||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  5638226 ttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 5638127  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  5638126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 5638027  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  5638026 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 5637927  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  5637926 agcttg 5637921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26480907 - 26480403
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||   || | || ||  ||||||    
T  26480907 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagatatcccagacacttggcat 26480808  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  26480807 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 26480709  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26480708 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26480609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26480608 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26480509  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  26480508 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 26480409  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  26480408 agcttg 26480403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 33516872 - 33516189
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  33516872 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 33516773  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  33516772 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 33516673  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  33516672 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 33516573  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  33516572 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 33516473  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  33516472 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 33516373  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  33516372 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 33516273  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  33516272 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Original strand, 13324475 - 13324914
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  13324475 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 13324574  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13324575 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 13324674  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  13324675 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 13324774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  13324775 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 13324874  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  13324875 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctct 13324914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24681956 - 24681457
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24681956 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24681857  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24681856 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24681757  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24681756 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24681657  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24681656 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24681557  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24681556 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 24724483 - 24723984
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  24724483 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 24724384  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24724383 gctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24724284  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  24724283 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 24724184  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  24724183 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 24724084  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  24724083 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 524
Target Start/End: Original strand, 37358289 - 37358812
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || |||||||| || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  37358289 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaatctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 37358388  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37358389 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 37358488  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  37358489 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 37358588  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  37358589 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 37358688  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  37358689 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 37358788  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||  |  ||||||||| |||||||    
T  37358789 agtatactgctgctgttgttgttg 37358812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Original strand, 37770657 - 37771134
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  37770657 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctt 37770756  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| | |||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37770757 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37770856  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || |  || ||||||||||| || ||     
T  37770857 atttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcatgatatacttcaaagcataacac 37770956  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  37770957 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 37771056  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37771057 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3790057 - 3789618
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  3790057 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 3789958  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  3789957 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 3789858  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  3789857 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 3789758  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  3789757 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 3789658  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  3789657 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 3789618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 40473195 - 40473694
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| |||| ||  ||||||    
T  40473195 tcactgacagtcagaagattatcattcgtcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcat 40473294  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  40473295 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 40473394  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  40473395 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 40473494  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |    
T  40473495 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggt 40473594  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
      ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  40473595 ccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 40473694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30029931 - 30029504
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30029931 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30029832  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30029831 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30029732  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  30029731 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 30029632  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30029631 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30029532  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  30029531 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 30029504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 37755472 - 37754995
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  37755472 ttcatcaagttttggatgtcgtcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggaggcaccctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 37755373  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  37755372 tgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 37755273  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||     
T  37755272 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacac 37755173  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  37755172 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctag 37755073  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    | || || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  37755072 tcgtacaatgacctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 37754995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 28959432 - 28959946
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | ||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  28959432 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 28959531  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| ||||  |||||| | ||    
T  28959532 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcctcacacac 28959631  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28959632 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28959731  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28959732 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28959831  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  28959832 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 28959931  T
Q  501 agcttgttgctgctg 515  Q
    ||| | |||||||||    
T  28959932 agcatattgctgctg 28959946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 428
Target Start/End: Original strand, 29966806 - 29967139
Alignment:
Q  95 tggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctc 194  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  29966806 tggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttc 29966905  T
Q  195 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagc 294  Q
    | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||||    
T  29966906 acacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagc 29967005  T
Q  295 ttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggca 394  Q
    || || || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||    
T  29967006 ttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggca 29967105  T
Q  395 acggattaggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29967106 acggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgt 29967139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 31431389 - 31431325
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  31431389 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 31431325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 553 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 3789487 - 3789360
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggt 652  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  ||  ||| ||||    
T  3789487 gcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcatatatgggt 3789388  T
Q  653 acgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    | |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  3789387 atgacggaggcatttgagctgcattgat 3789360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 617
Target Start/End: Original strand, 18500949 - 18501013
Alignment:
Q  553 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  18500949 gcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgg 18501013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 686
Target Start/End: Original strand, 13521768 - 13522450
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |    
T  13521768 ctgacagtcaaatgattgttgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggt 13521867  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13521868 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 13521967  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  13521968 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 13522067  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  13522068 atgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcag 13522167  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522168 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 13522267  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522268 ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 13522367  T
Q  604 tgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522368 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 33373952 - 33374633
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33373952 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 33374051  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  33374052 gtggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 33374151  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33374152 atcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 33374251  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  33374252 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 33374351  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33374352 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 33374451  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374452 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 33374551  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374552 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 8892007 - 8892687
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8892007 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8892106  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8892107 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8892206  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8892207 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8892305  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8892306 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8892405  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8892406 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 8892505  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8892506 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgat 8892605  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892606 gatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 686
Target Start/End: Original strand, 8903242 - 8903922
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8903242 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtttctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 8903341  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||    
T  8903342 atggtcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttca 8903441  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8903442 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaa 8903540  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| |||    
T  8903541 tgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcagg 8903640  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8903641 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcc 8903740  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8903741 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgat 8903840  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 686  Q
    |||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903841 gatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 28163157 - 28162477
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  28163157 tgacagtcagataattgtcgttcatcagtctctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatc 28163058  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28163057 atggtcaaacagagaggcttggcataacccgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctca 28162958  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28162957 atcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaa 28162858  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | |||| | |    
T  28162857 tgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaag 28162758  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162757 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtagagtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 28162658  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28162657 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgat 28162558  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatgtcca 685  Q
    |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162557 gatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagcagcattgatgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 14142980 - 14143500
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14142980 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 14143079  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14143080 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 14143179  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  14143180 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 14143279  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  14143280 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 14143379  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143380 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 14143479  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14143480 ttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 26788445 - 26787925
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26788445 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 26788346  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26788345 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 26788246  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  26788245 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 26788146  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  26788145 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 26788046  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788045 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 26787946  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26787945 ttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 27196818 - 27196298
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27196818 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27196719  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27196718 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27196619  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27196618 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27196519  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27196518 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27196419  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196418 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27196319  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27196318 ttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 27252422 - 27252942
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  27252422 ctgacagtcaaataattgttgttcatcaagctctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgat 27252521  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27252522 catggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctc 27252621  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  27252622 aatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcaca 27252721  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27252722 atgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcag 27252821  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252822 gtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 27252921  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27252922 ttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 524
Target Start/End: Original strand, 22456638 - 22457149
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  22456638 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaatctctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgat 22456737  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||         ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456738 catggtcaaacaaagaagctttgcatagcttgatgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctc 22456828  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||    
T  22456829 aatcacgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcaca 22456928  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22456929 atgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcag 22457028  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457029 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagc 22457128  T
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  22457129 ttgttgctgttgtcgttgttg 22457149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 536
Target Start/End: Original strand, 27290062 - 27290597
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27290062 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27290161  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  27290162 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatac 27290261  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||     
T  27290262 ctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaagattgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttc 27290361  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  27290362 acaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggat 27290461  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27290462 caggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtct 27290561  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 536  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27290562 agcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 277 - 677
Target Start/End: Original strand, 22477241 - 22477644
Alignment:
Q  277 tttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 376  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22477241 tttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggttag 22477340  T
Q  377 aatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcat 476  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  22477341 aacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtagagtcgggagtaactcggcatacatcat 22477440  T
Q  477 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg---agctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | | || | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22477441 tggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacc 22477540  T
Q  574 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcag 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  22477541 tgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcag 22477640  T
Q  674 catt 677  Q
    ||||    
T  22477641 catt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20161182 - 20160588
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  20161182 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 20161083  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  20161082 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 20160983  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20160982 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 20160883  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20160882 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 20160783  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgtt 523  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  20160782 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgtt 20160683  T
Q  524 gagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgga 618  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  20160682 gagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtgga 20160588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 618
Target Start/End: Original strand, 22171649 - 22172243
Alignment:
Q  24 gttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggct 123  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || |||| | | ||||| | ||||||| ||| ||||||  ||||| || |||| ||||||  |||||| ||||||    
T  22171649 gttcatcaggctctggatatcattctgcacaatgcaacaacctagaggattaaggaggcattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggct 22171748  T
Q  124 tggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgt 223  Q
    ||| | |||||||  ||||| || |||| | ||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |    
T  22171749 tggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcat 22171848  T
Q  224 gattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagca 323  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || || |  || | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22171849 gattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttccattggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagca 22171948  T
Q  324 tccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctg 423  Q
     ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  22171949 cccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctg 22172048  T
Q  424 gttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgtt 523  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  22172049 gttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttgggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgtt 22172148  T
Q  524 gagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgga 618  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||    
T  22172149 gagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtgga 22172243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 22934572 - 22935233
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  22934572 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 22934671  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  22934672 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 22934771  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  22934772 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 22934871  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  22934872 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 22934971  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  22934972 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 22935071  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22935072 agcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatac 22935171  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  22935172 tgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 23857017 - 23857678
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  23857017 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacggtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 23857116  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  23857117 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 23857216  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||| ||     
T  23857217 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttc 23857316  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  23857317 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggat 23857416  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23857417 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 23857516  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    |||||| || |  ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23857517 agcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatac 23857616  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | | ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  23857617 tgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 13298643 - 13299307
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| | | |||| |||||||  ||||||    
T  13298643 tcactgacagtcaaataattgtcattcatcaagctctggatgtcattttgaacagtataccaacccaaaggattatgaaggcatcctaggcacttggcat 13298742  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13298743 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 13298842  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  13298843 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 13298942  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  13298943 acgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 13299042  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  13299043 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 13299142  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  13299143 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 13299242  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13299243 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 26918884 - 26918202
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  26918884 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgttatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 26918785  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26918784 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 26918685  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||||||     
T  26918684 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttc 26918585  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26918584 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26918485  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  26918484 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 26918385  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  26918384 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 26918285  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  26918284 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 24304310 - 24304992
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| |||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24304310 tcactaacagtcaaaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24304409  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    | ||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24304410 ggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24304509  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24304510 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24304609  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24304610 acgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24304709  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  24304710 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24304809  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| |||||  |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  24304810 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 24304909  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  24304910 tactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 26989506 - 26988841
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  26989506 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 26989407  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  26989406 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 26989307  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||    
T  26989306 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctt 26989207  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  26989206 tacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 26989107  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||    
T  26989106 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 26989007  T
Q  500 tagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 596  Q
    ||||||| ||    || ||  |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  26989006 tagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg 26988907  T
Q  597 atactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26988906 gtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26988841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 16750358 - 16749695
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  16750358 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 16750259  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16750258 gatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatac 16750159  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  16750158 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 16750059  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16750058 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16749959  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  16749958 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 16749859  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  16749858 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 16749759  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggag 661  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||    
T  16749758 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggag 16749695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 27272272 - 27272771
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  27272272 tcactaacagtcaaaaacttatcattcatcaagctctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcat 27272371  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27272372 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatac 27272471  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  || ||||||||||| |  || ||||| |  |||||||||||     
T  27272472 ttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagaggattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttc 27272571  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||| ||||||    
T  27272572 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggat 27272671  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  27272672 caggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtagagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtct 27272771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Original strand, 15424009 - 15424673
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||   |||||    
T  15424009 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcat 15424108  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15424109 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 15424208  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     |  ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||||||     
T  15424209 tttgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttc 15424308  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  15424309 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 15424408  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  15424409 caggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 15424508  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||| | ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||     
T  15424509 agcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg 15424608  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  15424609 tactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 24864221 - 24863557
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  24864221 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggacgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 24864122  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24864121 gatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 24864022  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  24864021 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 24863922  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  24863921 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 24863822  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  24863821 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 24863722  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||| | |||     
T  24863721 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagaggg 24863622  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  24863621 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29549979 - 29549300
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  29549979 tcactgacagtcagaaaattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 29549880  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||| | ||    
T  29549879 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacac 29549780  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  29549779 ttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29549680  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29549679 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29549580  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  29549579 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29549480  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||| | |||||||||  |||||||| |||| || || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  29549479 agcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtac 29549380  T
Q  601 tgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    |||||||| || ||||| || || | | ||||||||||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29549379 tgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 17092132 - 17092427
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||  ||    
T  17092132 tcactaacagtcagatagttgtcgttcatcaagccctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctat 17092231  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   | || || |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  17092232 gatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttgatgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatac 17092331  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctt 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||   || |||||||| || || ||||| ||||  ||||||||    
T  17092332 ctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggggattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagctt 17092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 26999913
Alignment:
Q  184 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttcctt 283  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  |||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  284 ggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaa 383  Q
    | |  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaa 27000195  T
Q  384 cctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatc 483  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27000194 ccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacatcggtatc 27000095  T
Q  484 agaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggtt 580  Q
     |||| || |||||||||||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27000094 ggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggtt 26999995  T
Q  581 gacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  || |||| ||||| ||||||||    
T  26999994 gacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagg 26999913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 34463038 - 34463537
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  34463038 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 34463137  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  34463138 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 34463237  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  34463238 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 34463337  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  34463338 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 34463437  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  34463438 caggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 34463537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 4525790 - 4525174
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4525790 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 4525691  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4525690 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4525591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4525590 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4525491  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||| | |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4525490 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4525391  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  4525390 caggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4525291  T
Q  501 agcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatac 600  Q
    ||  |  ||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||||    
T  4525290 agtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatac 4525191  T
Q  601 tgatgatagaatggtgg 617  Q
    |||||||| || |||||    
T  4525190 tgatgataaaacggtgg 4525174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 29573517 - 29573012
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  29573517 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 29573418  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  29573417 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 29573318  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  29573317 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 29573218  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29573217 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29573118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  29573117 caggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 29573018  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  29573017 agcttg 29573012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4773510 - 4773009
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4773510 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4773411  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4773410 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4773311  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4773310 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4773211  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4773210 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4773111  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  4773110 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 4773011  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  4773010 ag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3696582 - 3696086
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||| | |||| |||| ||  |||||||||    
T  3696582 ctgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacgaaggcatcctagacacttggcatgat 3696483  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    | |||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |  ||    
T  3696482 cgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcatcacacatttc 3696383  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || ||     
T  3696382 gatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacg 3696283  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattag 403  Q
    || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||    
T  3696282 atatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcag 3696183  T
Q  404 gtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
    |||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||    
T  3696182 gtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 4545467 - 4545957
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  4545467 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 4545566  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4545567 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4545666  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  4545667 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 4545766  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4545767 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4545866  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaa 491  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  4545867 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4545957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 4758244 - 4757646
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  4758244 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 4758145  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  4758144 tgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 4758045  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || |||    
T  4758044 atttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacat 4757945  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |    
T  4757944 ccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctag 4757845  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag----ct--tgttgctgctgtcg 518  Q
    |||| || || |||||  | |||| ||| || |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    ||  || ||||| ||| |    
T  4757844 ttgtacaatgtcctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttg 4757745  T
Q  519 ttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  4757744 ttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgg 4757646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 4723826 - 4724316
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||||||    
T  4723826 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcagcccaaaggatctcggaggcatcctagacacttggcat 4723925  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4723926 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 4724025  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  ||||| || |  ||||| || ||     
T  4724026 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagtttcttc 4724125  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  4724126 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 4724225  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  4724226 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 4724316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 30557708 - 30558391
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  30557708 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 30557807  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  30557808 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 30557907  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  30557908 ctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 30558007  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||    
T  30558008 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 30558107  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  30558108 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcct 30558207  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  30558208 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 30558307  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  30558308 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16674643 - 16674204
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  16674643 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 16674544  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   || | ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||| | | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  16674543 gatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 16674444  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16674443 ttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 16674344  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16674343 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16674244  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16674243 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 16674204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 28207958 - 28207468
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  28207958 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 28207859  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  28207858 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 28207759  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  28207758 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 28207659  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  28207658 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 28207559  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  28207558 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 28207468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 27044892 - 27044275
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||| |||||||| | |||||||   | ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  27044892 tcactgacagtcagaagattatcattcattaagctttggatgtcgtcttgaacagtatggcaacccaagggattacgaaggcatcctagacacttggcat 27044793  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27044792 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27044693  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  27044692 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 27044593  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgt-agcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| | | || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||     
T  27044592 acgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggg 27044493  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || | ||| ||||| | ||| |||||  ||||||| || ||||    
T  27044492 tcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtc 27044393  T
Q  500 tagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggata 599  Q
    |||  | |||||||||  | |||||| |||| || || |||||    || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  27044392 tagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggta 27044293  T
Q  600 ctgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||| || |||||    
T  27044292 ctgatgataaaacggtgg 27044275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27008231 - 27007792
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27008231 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27008132  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||| | | ||    
T  27008131 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacac 27008032  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| ||||  |||||||| ||     
T  27008031 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttc 27007932  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27007931 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27007832  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctct 440  Q
     |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  27007831 caggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctct 27007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 27359684 - 27360111
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27359684 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27359783  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27359784 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27359883  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27359884 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27359983  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27359984 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27360083  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27360084 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 27360111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 27450027 - 27450454
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  27450027 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 27450126  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  27450127 gatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 27450226  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  27450227 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 27450326  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  27450327 acgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 27450426  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27450427 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 27450454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27485609 - 27485206
Alignment:
Q  25 ttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggctt 124  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| ||||    
T  27485609 ttcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctt 27485510  T
Q  125 ggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtg 224  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||    
T  27485509 tgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatg 27485410  T
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || || || || ||||||||||| || ||     
T  27485409 atttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacac 27485310  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  27485309 ccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctag 27485210  T
Q  425 ttgt 428  Q
    ||||    
T  27485209 ttgt 27485206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 26116102 - 26116523
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||| | || |||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  26116102 tcactgacagtcagaagattatcgttcatcgaactttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 26116201  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  26116202 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 26116301  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  26116302 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 26116401  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  26116402 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 26116501  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtct 422  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  26116502 caggtggtggcttgccctgtct 26116523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 16943719 - 16944146
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  16943719 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttgaatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 16943818  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  16943819 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 16943918  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  16943919 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 16944018  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  16944019 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 16944118  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgt 428  Q
     |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16944119 caggtgggggcttaccctgtctagttgt 16944146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29501919 - 29501418
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||| ||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  29501919 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaggctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 29501820  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29501819 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 29501720  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  29501719 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 29501620  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  29501619 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 29501520  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  |||| ||||| |||||    
T  29501519 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtct 29501420  T
Q  501 ag 502  Q
    ||    
T  29501419 ag 29501418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17025652 - 17025280
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  17025652 agcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttg 17025553  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||    
T  17025552 gaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctc 17025453  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||| || |  ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||| || || |||    
T  17025452 gacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtg 17025353  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctag 502  Q
    ||||| |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  17025352 cagtgtcctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 17025280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Original strand, 26777302 - 26777821
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||   ||||| |||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  26777302 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26777401  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtg-----gcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctca 195  Q
    ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||| ||| || |     ||||||||||||| ||||  ||  | || |||||||| |||  |||||||    
T  26777402 gatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagagcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctca 26777501  T
Q  196 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagct 295  Q
     | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| |    
T  26777502 cacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtt 26777601  T
Q  296 tttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaa 395  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| ||||||||    
T  26777602 tcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaa 26777701  T
Q  396 cggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggta 495  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||||  |||| |||||     
T  26777702 cggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtagagttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggtt 26777801  T
Q  496 ggtctagcttgttgctgctg 515  Q
    |||||||| | |||||||||    
T  26777802 ggtctagcatattgctgctg 26777821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27019640 - 27019461
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   || |||| ||||| |||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  27019640 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtataacaactcaaagcattacgaaggcatcctaggcacttggcat 27019541  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagt 180  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || ||||||    
T  27019540 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 27629392 - 27629645
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||| || ||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||  ||| ||   |||| || |||    
T  27629392 tcactaacagtcagatgattatcattcatcaagctctggatatcctcttgcacaacgcggcaacccaagggattaagggcgcactcggagcaactgtcat 27629491  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| || || |  || || ||||||| |||||| ||||  ||||| || || ||| |||| ||||| |||||  |    
T  27629492 gatcatgtttaaacaaagaagcctggcaaagtttaacatgcaggggcaccaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgc 27629591  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagg 254  Q
     ||||||||||| || ||||| || |  |||||||| || || |||||||||||    
T  27629592 ttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaaggacatgagg 27629645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29501361 - 29501228
Alignment:
Q  547 tgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcat 646  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||  ||  ||    
T  29501361 tgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatat 29501262  T
Q  647 acgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
    | |||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29501261 atgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 504 - 605
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630008
Alignment:
Q  504 ttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactga 603  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||| || |||||| || | || ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  604 tg 605  Q
    ||    
T  27630007 tg 27630008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 22064 - 21391
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  22064 tgacaatcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatc 21965  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||| |||  |||||   |||     
T  21964 atggtcaaacaaggaggcttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcg 21865  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  21864 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaa 21765  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21764 tctacttcaaagcgtaacatccttcaacatcttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttagg 21665  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  21664 tggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgtcctttgagaagcaaagtcgggagcagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtt 21565  T
Q  505 tgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgat 604  Q
    ||||| ||||   | |||| |||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    |||||||| |    
T  21564 tgttgttgct---gctgttaagccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggt 21468  T
Q  605 gatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||||| || || | | ||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21467 gatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 165 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 20730 - 20240
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20730 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 20631  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 20532  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactc 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20531 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactc 20432  T
Q  465 agcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcatta 564  Q
    |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||| |||||||| | | |||||||    
T  20431 agcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgct---------------------gttgttgcatttgctgaacgacggcatta 20353  T
Q  565 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggta 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20352 acgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 20253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 30960 - 30296
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataa-ttgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  30960 tcactgacagtcaaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 30861  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||    
T  30860 tgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacata 30761  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||    
T  30760 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttctt 30661  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||||   |||||| ||||||||||||    
T  30660 cacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacgga 30561  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||  || || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||    
T  30560 tcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaaggttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaa-gtaggtc 30462  T
Q  500 tagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 596  Q
    ||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  30461 tagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagg 30362  T
Q  597 atactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  30361 gtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 225 - 536
Target Start/End: Original strand, 1 - 312
Alignment:
Q  225 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcat 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  325 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctgg 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctgg 200  T
Q  425 ttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 524  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  201 ttgagcagtgccctctgagaagtagagtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 300  T
Q  525 agctggaggctg 536  Q
    |||||| |||||    
T  301 agctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 662
Target Start/End: Original strand, 39822 - 40482
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatc 104  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||    
T  39822 tgacagtcaaaaaattatcattcgtcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatc 39921  T
Q  105 atggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctca 204  Q
    ||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  39922 atggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcg 40021  T
Q  205 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaa 304  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||  || || |    
T  40022 atcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacga 40121  T
Q  305 tgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattagg 404  Q
    | ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||| |||||||||| |||    
T  40122 tatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcagg 40221  T
Q  405 tggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagct 504  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  40222 tgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagct 40321  T
Q  505 tgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatact 601  Q
    || ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40322 tgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtact 40421  T
Q  602 gatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    |||||||||||||  |||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  40422 gatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacggcggagg 40482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 620
Target Start/End: Original strand, 46734 - 47356
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||    
T  46734 tcactgacagtcaaaaaattatcattcatcaagccttggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcat 46833  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  46834 gatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatac 46933  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  46934 ttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 47033  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  47034 acgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 47133  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  47134 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 47233  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||     
T  47234 agcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaggggg 47333  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaa 620  Q
    ||||||||||| ||||| |||||    
T  47334 tactgatgataaaatggcggaaa 47356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 30270 - 29606
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    |||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||| |    
T  30270 tcactaacagtcaaaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtaaagcaacccaaaggattccgaaggcatcctaggcacttggcgt 30171  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||    
T  30170 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagcttcctcacatac 30071  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| || ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| ||     
T  30070 ttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttc 29971  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| |||||||||||||    
T  29970 acgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggat 29871  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||    
T  29870 caggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtct 29771  T
Q  501 agcttgt---tgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||||   || || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  29770 agcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaaggg 29671  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  29670 tactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtacgatggagg 29606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 165 - 438
Target Start/End: Original strand, 1831 - 2103
Alignment:
Q  165 gttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1831 gttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttc 1930  T
Q  265 tcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 364  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1931 tcaaaagttaattt-ccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcac 2029  T
Q  365 acttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 438  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2030 acttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6047
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||  ||||||    
T  6521 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcatcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcat 6422  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |  ||||| |||||||||||| | ||    
T  6421 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcctcacacac 6322  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  ||||| || |  |||||||| ||     
T  6321 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttc 6222  T
Q  301 acaatgtacttc-aaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgg 398  Q
    || || |||||| ||||| || || || || ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||    
T  6221 acgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgg 6122  T
Q  399 attaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagt-agagtcgggagcaactcagcatata 472  Q
    || |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | ||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  6121 atcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttggaagcaactcagcatata 6047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27800 - 27135
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattg-tcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggca 99  Q
    ||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||    
T  27800 tcactaacagtcaaaaaattaatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggca 27701  T
Q  100 tgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatata 199  Q
    |||||||||  ||| | ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  || |||||||| |||||||||||| |||    
T  27700 tgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacata 27601  T
Q  200 cctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttt 299  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  || ||||| ||    
T  27600 cttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttctt 27501  T
Q  300 tacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgga 399  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||||| ||||||||||||    
T  27500 cacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgga 27401  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||||    
T  27400 tcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtc 27301  T
Q  500 tagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagg 596  Q
    ||||||| ||    || ||| |||||||| ||||   |||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||    
T  27300 tagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagg 27201  T
Q  597 atactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggagg 662  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  27200 gtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Original strand, 370 - 728
Alignment:
Q  4 ctgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat 103  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  370 ctgacagtaagataattgtcattcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgat 469  T
Q  104 catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctc 203  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||| |||||   |||    
T  470 catggtcaaacaaggagacttggcatagcttgatgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctc 569  T
Q  204 aatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttaca 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||| ||||| || |  |||||||| ||||||    
T  570 gatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttaca 669  T
Q  304 atgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatc 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  670 atgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 130 - 680
Target Start/End: Original strand, 7 - 561
Alignment:
Q  130 agcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |    
T  7 agcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttg 106  T
Q  230 gaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| || |  |||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||||||||| || ||    
T  107 gaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctc 206  T
Q  330 aacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggttgtg 429  Q
     |||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| || ||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  207 gacatcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgta 306  T
Q  430 cagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaact-cagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttga 525  Q
    || ||||||||  | |||| |||||| |||||||  |||||||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| ||||||||    
T  307 caatgccctctatggagtaaagtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttga 406  T
Q  526 gctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaataagg 625  Q
     | ||   |||||||| | | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  407 accggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaag 506  T
Q  626 aaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgat 680  Q
     | ||||||| ||  || |||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  507 gatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10073 - 9559
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | |||||| ||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  10073 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacctaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 9974  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  9973 gatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 9874  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9873 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttc 9774  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9773 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggat 9674  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || || |  || ||||| | ||| |||||  ||||||| || |||||    
T  9673 caggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtct 9574  T
Q  501 agcttgttgctgctg 515  Q
    ||| | |||||||||    
T  9573 agcatattgctgctg 9559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 8120
Alignment:
Q  550 tgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8187 tgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgg 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 617
Target Start/End: Original strand, 6988 - 7607
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  6988 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcttcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 7087  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | ||    
T  7088 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacac 7187  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  7188 ttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 7287  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  7288 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 7387  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  7388 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 7487  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | || | |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||     
T  7488 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaaggg 7587  T
Q  598 tactgatgatagaatggtgg 617  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  7588 tactgatgataaaacggtgg 7607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 8815 - 9320
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || | ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||    
T  8815 tcactgacagtcagaagattatcatccatcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcat 8914  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | ||    
T  8915 gatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacac 9014  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  9015 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 9114  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  9115 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 9214  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||    
T  9215 caggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcct 9314  T
Q  501 agcttg 506  Q
    ||||||    
T  9315 agcttg 9320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 27 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20496 - 20017
Alignment:
Q  27 catcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgg 126  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||| | | |||||||||||||| ||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||   |||| ||| |||| |    
T  20496 catcaagctttggatgtcgtctcgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttg 20397  T
Q  127 catagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgat 226  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || || ||||| || |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20396 cacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgat 20297  T
Q  227 tcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatcc 326  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || || ||    
T  20296 ttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacaccc 20197  T
Q  327 ttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggattaggtggaggcttgccctgtctggtt 426  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  20196 ctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtt 20097  T
Q  427 gtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 506  Q
    || || ||||||||  | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  20096 gtacaatgccctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttg 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 681
Target Start/End: Original strand, 14679 - 15362
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | | || || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| |||||  ||| | || ||  ||||||    
T  14679 tcactgacagtcagaaagttatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcat 14778  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||| |  |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  14779 gatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 14878  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  14879 ttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 14978  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  14979 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 15078  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtct 500  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||| ||| || || |  || ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  15079 caggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaagttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtct 15178  T
Q  501 agcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcgtttgctgagcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagga 597  Q
    |||||| ||    || ||| |||||||| | ||   |||||||| | | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||     
T  15179 agcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaaggg 15278  T
Q  598 tactgatgatagaatggtggaaataaggaaggctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcagcattgatg 681  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | | ||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||    
T  15279 tactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 506
Target Start/End: Original strand, 25950 - 26456
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||   || ||||||||||||| || || |||| |||| ||  ||||||    
T  25950 tcactgacagtcagaaaattatcattcatcaagctttggatgtcctcttgaacagtataacaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcat 26049  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||| | |     
T  26050 gatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacat 26149  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| || |  || ||||| |  |||||||| ||     
T  26150 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttc 26249  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacc-tgggaggcaacgga 399  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   ||||| | ||||||||||||    
T  26250 acgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacgga 26349  T
Q  400 ttaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtc 499  Q
    | |||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||| || || | ||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||| |    
T  26350 tcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtagagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcc 26449  T
Q  500 tagcttg 506  Q
    |||||||    
T  26450 tagcttg 26456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 8456 - 7966
Alignment:
Q  1 tcactgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctaggcaagtggcat 100  Q
    ||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||||||| || ||||| |||| |||| ||  || |||    
T  8456 tcactgacagtcagaagattatcattcatcaagctttggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaagaatcacggaggcatcctagacacttgtcat 8357  T
Q  101 gatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatac 200  Q
    ||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||| | ||    
T  8356 gatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacac 8257  T
Q  201 ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggaagttgttctcaaaggttaattttccttggtttatgagctttttt 300  Q
     || ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  || |||||||| || |  || ||||| |  ||||| || ||     
T  8256 ttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttc 8157  T
Q  301 acaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacggat 400  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||   |||||| |||||||||||||    
T  8156 acaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggat 8057  T
Q  401 taggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaa 491  Q
     |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  8056 caggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtagagttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaa 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 422
Target Start/End: Original strand, 46604 - 46981
Alignment:
Q  59 agcaacccaaa-ggattacggaagcattctaggcaagtggcatgat-catggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatgtgtagtggcaccagagga 156  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  ||||||||| |||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  46604 agcaacccaaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgattcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagagga 46703  T
Q  157 gttgcaatgttacgaacgtcaagtc-tgggagctt-cctcatatac-ctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgag 253  Q
    ||||  |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||  |||  | | |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  46704 gttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcg 46803  T
Q  254 ggaagttgttctc--aaaggttaattttccttggtttatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgta-gcatccttcaacat-cat--gacccagagc 347  Q
    |||  || |||||  ||||     ||||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||| || || |||| |||  ||||||| ||    
T  46804 ggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggc 46903  T
Q  348 accttgatggaaatcacacttgaggtcaga-atggaacctgggaggcaacggattaggtggaggc--ttgccctgtct 422  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || ||  | |||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  46904 gccttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcgtttgccctgtct 46981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Original strand, 119651 - 119706
Alignment:
Q  5 tgacagtcaaataattgtcgttcatcaagctctggatgtcattttgaacaacgtag 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  119651 tgacagtcagataattgtcgttcatcaggctctggatgtcattctgaacaacgtag 119706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University