View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7317_high_3 (Length: 698)

Name: NF7317_high_3
Description: NF7317
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7317_high_3
NF7317_high_3
[»] chr4 (212 HSPs)
chr4 (74-686)||(16934108-16934719)
chr4 (79-686)||(16931754-16932360)
chr4 (77-686)||(22782701-22783319)
chr4 (79-686)||(22780336-22780952)
chr4 (79-686)||(9176438-9177035)
chr4 (79-686)||(18846923-18847521)
chr4 (136-686)||(11008532-11009075)
chr4 (314-686)||(44599802-44600174)
chr4 (287-686)||(51015216-51015614)
chr4 (287-686)||(9174110-9174509)
chr4 (287-686)||(22044355-22044753)
chr4 (287-686)||(22046650-22047048)
chr4 (287-667)||(9148221-9148603)
chr4 (287-686)||(11434925-11435323)
chr4 (314-686)||(8631383-8631759)
chr4 (287-686)||(37089336-37089737)
chr4 (287-686)||(38409169-38409573)
chr4 (314-686)||(2484837-2485209)
chr4 (355-686)||(18709127-18709458)
chr4 (287-667)||(5198390-5198771)
chr4 (287-686)||(31849563-31849962)
chr4 (287-686)||(7941289-7941692)
chr4 (314-686)||(6764836-6765213)
chr4 (287-662)||(24888766-24889142)
chr4 (287-667)||(11006219-11006604)
chr4 (314-664)||(40637071-40637422)
chr4 (314-688)||(47868398-47868772)
chr4 (287-664)||(22800847-22801225)
chr4 (287-664)||(22802719-22803097)
chr4 (314-667)||(24348211-24348569)
chr4 (287-662)||(48486289-48486665)
chr4 (314-686)||(22132355-22132735)
chr4 (291-664)||(40091400-40091774)
chr4 (287-667)||(47274697-47275076)
chr4 (287-664)||(36919569-36919950)
chr4 (314-686)||(14633317-14633687)
chr4 (287-664)||(36921478-36921858)
chr4 (355-686)||(22134582-22134909)
chr4 (291-652)||(24878963-24879326)
chr4 (287-652)||(24880421-24880788)
chr4 (314-664)||(17662230-17662574)
chr4 (315-664)||(38928162-38928513)
chr4 (314-664)||(36378289-36378641)
chr4 (315-664)||(12395830-12396180)
chr4 (383-686)||(26085941-26086243)
chr4 (315-664)||(12400792-12401142)
chr4 (314-664)||(619433-619783)
chr4 (287-590)||(5637524-5637832)
chr4 (315-664)||(19095880-19096231)
chr4 (316-664)||(33415473-33415821)
chr4 (287-592)||(3824627-3824936)
chr4 (316-652)||(37313062-37313400)
chr4 (314-652)||(14787426-14787769)
chr4 (314-645)||(47210756-47211082)
chr4 (314-664)||(16453306-16453658)
chr4 (321-652)||(19322701-19323031)
chr4 (314-683)||(53405124-53405499)
chr4 (316-645)||(56030443-56030770)
chr4 (319-652)||(41997494-41997828)
chr4 (316-625)||(13543953-13544268)
chr4 (315-652)||(18537470-18537806)
chr4 (287-567)||(52942542-52942810)
chr4 (393-664)||(36380425-36380698)
chr4 (315-652)||(18409344-18409681)
chr4 (315-545)||(3937314-3937543)
chr4 (315-652)||(18534828-18535164)
chr4 (315-535)||(6132871-6133090)
chr4 (314-652)||(8756247-8756586)
chr4 (431-652)||(16455355-16455578)
chr4 (512-686)||(5635440-5635614)
chr4 (511-686)||(11437557-11437731)
chr4 (397-652)||(38890221-38890476)
chr4 (79-272)||(9174491-9174684)
chr4 (315-478)||(38270158-38270321)
chr4 (400-664)||(27499128-27499390)
chr4 (465-664)||(13547302-13547502)
chr4 (79-268)||(11006590-11006781)
chr4 (314-639)||(15032557-15032872)
chr4 (494-664)||(4215483-4215654)
chr4 (315-478)||(24446756-24446914)
chr4 (459-664)||(2891433-2891640)
chr4 (316-652)||(28453686-28454020)
chr4 (81-224)||(51015042-51015185)
chr4 (87-264)||(37089727-37089906)
chr4 (321-652)||(9863712-9864049)
chr4 (315-652)||(12102088-12102425)
chr4 (79-196)||(7941133-7941251)
chr4 (79-264)||(36919940-36920125)
chr4 (79-196)||(11434769-11434887)
chr4 (322-643)||(10112876-10113198)
chr4 (79-264)||(3824926-3825112)
chr4 (314-453)||(5100994-5101133)
chr4 (79-264)||(5637822-5638006)
chr4 (405-664)||(30136640-30136898)
chr4 (314-652)||(16185831-16186173)
chr4 (79-264)||(38408993-38409179)
chr4 (315-427)||(2891314-2891427)
chr4 (468-651)||(11853549-11853732)
chr4 (81-224)||(22803127-22803270)
chr4 (79-264)||(31849952-31850138)
chr4 (77-220)||(36921893-36922035)
chr4 (87-264)||(24888598-24888776)
chr4 (314-652)||(25357634-25357979)
chr4 (316-530)||(40999071-40999281)
chr4 (471-653)||(31300427-31300609)
chr4 (471-652)||(8529270-8529452)
chr4 (471-652)||(18586969-18587151)
chr4 (79-224)||(22044783-22044930)
chr4 (468-625)||(7050282-7050439)
chr4 (518-664)||(5101130-5101276)
chr4 (422-638)||(3982186-3982411)
chr4 (471-652)||(4558314-4558495)
chr4 (468-672)||(4570094-4570296)
chr4 (371-615)||(9022362-9022605)
chr4 (471-652)||(15316961-15317142)
chr4 (471-652)||(16688937-16689119)
chr4 (468-651)||(55822265-55822447)
chr4 (471-651)||(15831144-15831325)
chr4 (452-652)||(31983524-31983727)
chr4 (398-672)||(36769406-36769682)
chr4 (371-567)||(47150977-47151167)
chr4 (471-652)||(4556057-4556238)
chr4 (471-652)||(4884877-4885059)
chr4 (585-649)||(10047383-10047447)
chr4 (585-649)||(39245998-39246062)
chr4 (79-264)||(48486113-48486299)
chr4 (471-653)||(16489352-16489534)
chr4 (471-652)||(15312319-15312501)
chr4 (585-649)||(5269220-5269284)
chr4 (468-672)||(5336757-5336964)
chr4 (585-648)||(36315258-36315321)
chr4 (585-648)||(36329467-36329530)
chr4 (398-672)||(36771323-36771599)
chr4 (585-649)||(5396700-5396764)
chr4 (397-495)||(10114412-10114505)
chr4 (585-649)||(38152468-38152532)
chr4 (585-648)||(6743444-6743507)
chr4 (102-196)||(22801262-22801356)
chr4 (585-649)||(5143263-5143327)
chr4 (165-264)||(5198300-5198400)
chr4 (79-217)||(9148054-9148192)
chr4 (585-649)||(16623322-16623386)
chr4 (585-649)||(31985663-31985726)
chr4 (576-664)||(47563021-47563109)
chr4 (87-217)||(52942869-52942999)
chr4 (585-649)||(54867188-54867251)
chr4 (535-652)||(3578668-3578786)
chr4 (471-615)||(13072016-13072160)
chr4 (471-530)||(25699752-25699810)
chr4 (604-652)||(14789425-14789473)
chr4 (585-649)||(24333813-24333877)
chr4 (585-649)||(25862051-25862115)
chr4 (555-652)||(26557823-26557922)
chr4 (166-224)||(22047078-22047135)
chr4 (586-640)||(39774335-39774389)
chr4 (586-643)||(1983330-1983387)
chr4 (586-639)||(34495853-34495906)
chr4 (585-649)||(3777553-3777617)
chr4 (585-649)||(3796548-3796612)
chr4 (589-649)||(5147681-5147741)
chr4 (584-664)||(6133105-6133185)
chr4 (314-386)||(16455284-16455356)
chr4 (585-649)||(16630709-16630773)
chr4 (79-163)||(22048491-22048575)
chr4 (585-649)||(28468558-28468621)
chr4 (471-530)||(47566496-47566554)
chr4 (468-651)||(16638827-16639011)
chr4 (422-495)||(38208839-38208911)
chr4 (610-664)||(52942473-52942527)
chr4 (607-664)||(3937259-3937316)
chr4 (586-643)||(5112247-5112304)
chr4 (561-652)||(10114561-10114654)
chr4 (172-249)||(47868288-47868365)
chr4 (453-571)||(54906722-54906843)
chr4 (589-649)||(3814029-3814088)
chr4 (589-649)||(5732670-5732729)
chr4 (589-649)||(9224428-9224487)
chr4 (605-649)||(12739550-12739594)
chr4 (589-649)||(18855732-18855791)
chr4 (537-612)||(24446678-24446754)
chr4 (589-649)||(24741945-24742004)
chr4 (605-649)||(26175636-26175680)
chr4 (589-649)||(29760646-29760705)
chr4 (605-649)||(36463389-36463433)
chr4 (605-649)||(48893638-48893682)
chr4 (589-649)||(51520462-51520521)
chr4 (314-344)||(22134936-22134966)
chr4 (576-652)||(22295424-22295502)
chr4 (610-652)||(49088865-49088907)
chr4 (183-224)||(619841-619882)
chr4 (79-124)||(8528918-8528963)
chr4 (172-249)||(16689303-16689380)
chr4 (586-643)||(18377369-18377426)
chr4 (542-649)||(27416965-27417070)
chr4 (176-248)||(4556422-4556494)
chr4 (605-649)||(5429803-5429847)
chr4 (605-649)||(5871944-5871988)
chr4 (589-649)||(9229215-9229274)
chr4 (605-649)||(9927458-9927502)
chr4 (605-649)||(12743925-12743969)
chr4 (605-649)||(12745314-12745358)
chr4 (628-664)||(24446639-24446675)
chr4 (561-652)||(25613953-25614048)
chr4 (512-540)||(38270120-38270148)
chr4 (589-649)||(45347838-45347897)
chr4 (589-649)||(45357317-45357376)
chr4 (605-649)||(46147391-46147435)
chr4 (605-649)||(47038411-47038455)
chr4 (76-124)||(47868192-47868240)
chr4 (315-343)||(52043737-52043765)
chr4 (605-649)||(52467354-52467398)
chr4 (184-224)||(52942841-52942881)
[»] chr7 (183 HSPs)
chr7 (79-686)||(1046888-1047503)
chr7 (287-685)||(1049260-1049658)
chr7 (287-686)||(40836707-40837105)
chr7 (314-686)||(7351615-7351994)
chr7 (314-667)||(31155893-31156247)
chr7 (314-686)||(38393935-38394311)
chr7 (287-686)||(35555-35954)
chr7 (314-686)||(48457602-48457978)
chr7 (314-686)||(7349240-7349615)
chr7 (317-688)||(7471942-7472317)
chr7 (287-686)||(44490-44889)
chr7 (317-688)||(7469984-7470359)
chr7 (287-686)||(3878497-3878902)
chr7 (314-686)||(3035670-3036049)
chr7 (314-686)||(18345490-18345866)
chr7 (314-686)||(20299407-20299785)
chr7 (287-652)||(27306227-27306592)
chr7 (315-664)||(44724533-44724883)
chr7 (289-688)||(25542459-25542855)
chr7 (314-686)||(40946277-40946653)
chr7 (314-686)||(20297311-20297687)
chr7 (355-689)||(1849975-1850309)
chr7 (317-664)||(20625990-20626342)
chr7 (317-664)||(20629881-20630233)
chr7 (317-664)||(20642300-20642652)
chr7 (293-664)||(31435031-31435404)
chr7 (315-664)||(20137094-20137444)
chr7 (314-664)||(13099459-13099812)
chr7 (315-652)||(11355212-11355550)
chr7 (79-357)||(2935070-2935349)
chr7 (314-685)||(28487502-28487877)
chr7 (314-664)||(42330982-42331335)
chr7 (314-664)||(443548-443900)
chr7 (315-664)||(4295919-4296271)
chr7 (316-664)||(37412110-37412462)
chr7 (314-686)||(43253481-43253860)
chr7 (315-652)||(21678020-21678358)
chr7 (315-640)||(21679981-21680307)
chr7 (315-664)||(9680768-9681124)
chr7 (315-664)||(24748548-24748899)
chr7 (314-685)||(28485515-28485889)
chr7 (314-593)||(11757177-11757463)
chr7 (348-664)||(21592128-21592445)
chr7 (316-664)||(21990106-21990454)
chr7 (79-358)||(9027396-9027687)
chr7 (79-358)||(22136878-22137169)
chr7 (79-358)||(40551905-40552196)
chr7 (315-664)||(39145971-39146322)
chr7 (79-358)||(22107867-22108158)
chr7 (79-358)||(40549627-40549918)
chr7 (315-652)||(42223110-42223450)
chr7 (315-625)||(27832656-27832969)
chr7 (315-567)||(25276095-25276347)
chr7 (287-554)||(26804499-26804765)
chr7 (316-662)||(9679009-9679361)
chr7 (430-686)||(7092177-7092432)
chr7 (321-637)||(24258423-24258744)
chr7 (439-686)||(38396713-38396959)
chr7 (467-686)||(2935374-2935593)
chr7 (430-686)||(7094424-7094679)
chr7 (467-688)||(22137184-22137404)
chr7 (467-688)||(40552211-40552431)
chr7 (467-688)||(22108173-22108393)
chr7 (467-688)||(40549933-40550153)
chr7 (314-567)||(22828716-22828969)
chr7 (467-686)||(1606486-1606704)
chr7 (314-559)||(22251641-22251878)
chr7 (317-639)||(24817362-24817682)
chr7 (467-685)||(9027158-9027376)
chr7 (314-652)||(7188496-7188833)
chr7 (390-652)||(24813494-24813755)
chr7 (314-616)||(20091580-20091877)
chr7 (293-479)||(18567545-18567731)
chr7 (287-506)||(22392399-22392606)
chr7 (316-559)||(24465503-24465735)
chr7 (79-196)||(40837144-40837261)
chr7 (79-224)||(3878322-3878467)
chr7 (314-652)||(6332179-6332514)
chr7 (468-652)||(25351353-25351536)
chr7 (452-674)||(2120881-2121104)
chr7 (371-652)||(11081522-11081803)
chr7 (468-651)||(3320049-3320232)
chr7 (468-651)||(3324797-3324980)
chr7 (468-652)||(25357047-25357230)
chr7 (468-651)||(25405393-25405576)
chr7 (468-652)||(25410130-25410315)
chr7 (78-264)||(27306582-27306768)
chr7 (468-665)||(7069780-7069976)
chr7 (515-664)||(22393876-22394027)
chr7 (79-196)||(26804345-26804462)
chr7 (468-651)||(7074787-7074970)
chr7 (468-651)||(8378502-8378686)
chr7 (78-224)||(25542280-25542425)
chr7 (468-651)||(15540994-15541177)
chr7 (471-665)||(30246973-30247166)
chr7 (453-652)||(16297018-16297222)
chr7 (468-652)||(42006663-42006848)
chr7 (471-674)||(44512503-44512704)
chr7 (509-637)||(6046641-6046772)
chr7 (371-652)||(6048885-6049166)
chr7 (512-652)||(26295598-26295740)
chr7 (471-672)||(44010729-44010929)
chr7 (597-686)||(11759364-11759452)
chr7 (79-264)||(35379-35565)
chr7 (317-410)||(7094662-7094759)
chr7 (471-674)||(7464496-7464697)
chr7 (586-649)||(9190038-9190101)
chr7 (586-649)||(20284093-20284156)
chr7 (315-530)||(26210500-26210710)
chr7 (390-530)||(11084409-11084544)
chr7 (317-410)||(7092414-7092512)
chr7 (361-422)||(38396316-38396377)
chr7 (398-652)||(13290470-13290723)
chr7 (585-649)||(21983288-21983352)
chr7 (585-649)||(46516339-46516403)
chr7 (79-224)||(44314-44459)
chr7 (586-649)||(2580394-2580457)
chr7 (314-363)||(1606423-1606472)
chr7 (468-649)||(21369642-21369824)
chr7 (585-649)||(2647725-2647789)
chr7 (491-567)||(6348912-6348988)
chr7 (585-649)||(29159807-29159871)
chr7 (76-193)||(1049699-1049816)
chr7 (586-649)||(9185195-9185258)
chr7 (79-224)||(18567363-18567508)
chr7 (586-649)||(28617255-28617318)
chr7 (79-224)||(31435441-31435586)
chr7 (586-649)||(33332480-33332543)
chr7 (561-674)||(34546857-34546972)
chr7 (456-561)||(40281466-40281572)
chr7 (585-646)||(55955-56015)
chr7 (471-625)||(44143892-44144045)
chr7 (585-649)||(35960820-35960884)
chr7 (585-649)||(44848713-44848777)
chr7 (477-652)||(6067195-6067373)
chr7 (321-446)||(6348778-6348903)
chr7 (471-530)||(34546984-34547042)
chr7 (314-438)||(30906264-30906386)
chr7 (585-649)||(4796696-4796760)
chr7 (398-672)||(44016640-44016916)
chr7 (316-383)||(3677235-3677301)
chr7 (429-506)||(12310160-12310236)
chr7 (584-649)||(21639813-21639877)
chr7 (585-649)||(47263682-47263744)
chr7 (314-358)||(1849918-1849962)
chr7 (561-652)||(2075205-2075300)
chr7 (585-649)||(49091665-49091729)
chr7 (586-649)||(5817300-5817362)
chr7 (586-649)||(23403043-23403106)
chr7 (589-649)||(2057970-2058029)
chr7 (585-649)||(2479341-2479404)
chr7 (589-649)||(4866735-4866794)
chr7 (589-649)||(16880078-16880137)
chr7 (589-649)||(16884934-16884993)
chr7 (589-649)||(18408768-18408827)
chr7 (589-649)||(19992318-19992377)
chr7 (589-649)||(24024347-24024406)
chr7 (589-649)||(24261344-24261403)
chr7 (589-649)||(24266223-24266282)
chr7 (612-664)||(26804762-26804814)
chr7 (605-649)||(27347941-27347985)
chr7 (605-649)||(41317434-41317478)
chr7 (606-649)||(21988912-21988955)
chr7 (314-343)||(38396239-38396268)
chr7 (172-249)||(40946167-40946244)
chr7 (589-649)||(1533477-1533536)
chr7 (605-649)||(8153466-8153510)
chr7 (605-649)||(12097867-12097911)
chr7 (589-649)||(12396916-12396975)
chr7 (605-649)||(14069833-14069877)
chr7 (605-649)||(14379861-14379905)
chr7 (605-649)||(18126768-18126812)
chr7 (585-649)||(18413645-18413707)
chr7 (589-649)||(20357580-20357639)
chr7 (585-649)||(21646011-21646074)
chr7 (589-649)||(21812259-21812318)
chr7 (605-649)||(30814560-30814604)
chr7 (589-649)||(31109604-31109663)
chr7 (605-649)||(31732969-31733013)
chr7 (597-652)||(40281379-40281435)
chr7 (605-649)||(41649011-41649055)
chr7 (605-649)||(43864368-43864412)
chr7 (605-649)||(48489555-48489599)
[»] chr3 (244 HSPs)
chr3 (78-686)||(50493675-50494294)
chr3 (79-686)||(6063407-6064006)
chr3 (79-686)||(38210067-38210666)
chr3 (136-667)||(25388654-25389182)
chr3 (286-686)||(6065757-6066159)
chr3 (287-686)||(5191549-5191946)
chr3 (78-686)||(38889756-38890335)
chr3 (287-667)||(3859424-3859804)
chr3 (314-686)||(458203-458580)
chr3 (314-686)||(455826-456203)
chr3 (314-686)||(746674-747053)
chr3 (314-686)||(4103858-4104233)
chr3 (314-664)||(4308264-4308615)
chr3 (355-686)||(10621491-10621823)
chr3 (287-652)||(11170300-11170666)
chr3 (287-686)||(10955989-10956388)
chr3 (287-686)||(10084351-10084754)
chr3 (287-686)||(5522589-5522976)
chr3 (314-686)||(51726969-51727340)
chr3 (287-686)||(10958285-10958684)
chr3 (287-664)||(18099153-18099531)
chr3 (314-664)||(43228214-43228565)
chr3 (287-686)||(26720444-26720842)
chr3 (287-686)||(22114267-22114666)
chr3 (287-664)||(18096883-18097262)
chr3 (381-686)||(28412992-28413299)
chr3 (314-652)||(43226009-43226347)
chr3 (287-664)||(45882835-45883214)
chr3 (314-664)||(53917647-53917998)
chr3 (314-667)||(25533357-25533719)
chr3 (314-664)||(1313333-1313683)
chr3 (355-664)||(42990268-42990578)
chr3 (291-686)||(10191274-10191670)
chr3 (355-664)||(30005805-30006115)
chr3 (315-664)||(43423446-43423796)
chr3 (395-686)||(1321483-1321774)
chr3 (314-675)||(9604578-9604946)
chr3 (287-556)||(35777317-35777587)
chr3 (316-664)||(43421398-43421747)
chr3 (315-664)||(1626666-1627016)
chr3 (314-664)||(27101164-27101519)
chr3 (287-649)||(32264035-32264404)
chr3 (79-369)||(53896475-53896754)
chr3 (287-664)||(24979603-24979982)
chr3 (314-664)||(53915479-53915830)
chr3 (315-664)||(28101985-28102335)
chr3 (287-664)||(18162560-18162937)
chr3 (315-664)||(880434-880785)
chr3 (315-664)||(3314608-3314959)
chr3 (314-652)||(51943294-51943632)
chr3 (315-664)||(5926748-5927097)
chr3 (287-664)||(48361654-48362031)
chr3 (321-606)||(6561740-6562028)
chr3 (291-664)||(12267958-12268323)
chr3 (413-667)||(7606568-7606822)
chr3 (314-647)||(35917944-35918283)
chr3 (355-611)||(29956650-29956907)
chr3 (287-652)||(15780756-15781141)
chr3 (315-664)||(36011751-36012101)
chr3 (315-664)||(47148878-47149233)
chr3 (315-664)||(53468436-53468788)
chr3 (314-652)||(28761422-28761762)
chr3 (316-664)||(51674749-51675087)
chr3 (315-546)||(28100143-28100374)
chr3 (287-664)||(32218991-32219359)
chr3 (314-567)||(39715393-39715645)
chr3 (314-664)||(42992205-42992544)
chr3 (315-641)||(889779-890104)
chr3 (315-652)||(54691569-54691906)
chr3 (314-664)||(23633383-23633727)
chr3 (315-652)||(31151271-31151607)
chr3 (404-664)||(6484372-6484634)
chr3 (452-664)||(5886261-5886472)
chr3 (452-664)||(5899734-5899945)
chr3 (455-686)||(11168165-11168396)
chr3 (442-664)||(25688143-25688367)
chr3 (91-348)||(5899471-5899717)
chr3 (315-551)||(28180948-28181182)
chr3 (315-649)||(53591119-53591442)
chr3 (314-643)||(53597164-53597491)
chr3 (316-567)||(23636952-23637199)
chr3 (314-643)||(13420189-13420506)
chr3 (79-348)||(5885983-5886242)
chr3 (316-664)||(27635641-27635959)
chr3 (412-664)||(4666535-4666788)
chr3 (321-652)||(36871295-36871624)
chr3 (315-539)||(28137415-28137628)
chr3 (287-459)||(11163046-11163218)
chr3 (439-664)||(6231849-6232074)
chr3 (398-652)||(561769-562024)
chr3 (79-264)||(22114656-22114842)
chr3 (79-264)||(18099521-18099707)
chr3 (356-483)||(41849117-41849244)
chr3 (398-652)||(17795269-17795521)
chr3 (398-652)||(19103709-19103961)
chr3 (315-567)||(54884081-54884330)
chr3 (398-559)||(25635391-25635549)
chr3 (79-196)||(35777163-35777280)
chr3 (314-559)||(1673898-1674140)
chr3 (287-495)||(24177175-24177380)
chr3 (316-444)||(6231374-6231502)
chr3 (80-264)||(5191374-5191559)
chr3 (583-686)||(53894018-53894121)
chr3 (315-445)||(47701798-47701928)
chr3 (471-652)||(29913952-29914132)
chr3 (471-674)||(10897008-10897210)
chr3 (518-652)||(47701666-47701801)
chr3 (270-363)||(6719396-6719489)
chr3 (468-651)||(10094073-10094256)
chr3 (453-650)||(1620457-1620657)
chr3 (79-210)||(18097291-18097422)
chr3 (314-531)||(4560401-4560599)
chr3 (468-651)||(10100090-10100273)
chr3 (468-651)||(10200953-10201136)
chr3 (74-264)||(10956378-10956568)
chr3 (287-387)||(1321337-1321437)
chr3 (471-651)||(54193229-54193410)
chr3 (469-664)||(3306839-3307034)
chr3 (79-164)||(7606878-7606963)
chr3 (468-651)||(10207999-10208182)
chr3 (471-652)||(47878168-47878350)
chr3 (316-427)||(3306724-3306835)
chr3 (468-651)||(22625982-22626166)
chr3 (79-196)||(11162891-11163008)
chr3 (471-651)||(54188512-54188692)
chr3 (468-625)||(6303310-6303466)
chr3 (509-652)||(24181498-24181644)
chr3 (87-208)||(10192401-10192521)
chr3 (471-652)||(10612775-10612957)
chr3 (468-651)||(27544273-27544456)
chr3 (78-264)||(32264394-32264581)
chr3 (583-667)||(35919095-35919179)
chr3 (79-224)||(26720268-26720413)
chr3 (468-641)||(5858546-5858718)
chr3 (202-268)||(6066144-6066210)
chr3 (390-506)||(13419883-13419994)
chr3 (398-495)||(25633930-25634024)
chr3 (471-672)||(27761965-27762165)
chr3 (87-208)||(10085481-10085601)
chr3 (471-652)||(10595031-10595213)
chr3 (79-264)||(1321161-1321347)
chr3 (585-649)||(1736324-1736388)
chr3 (468-625)||(11079517-11079674)
chr3 (79-194)||(11170145-11170260)
chr3 (585-649)||(18552902-18552966)
chr3 (585-649)||(30709809-30709873)
chr3 (576-664)||(41849245-41849333)
chr3 (137-196)||(6066195-6066254)
chr3 (79-196)||(6719532-6719651)
chr3 (476-652)||(4535622-4535800)
chr3 (472-672)||(10949239-10949438)
chr3 (181-264)||(3859350-3859434)
chr3 (79-264)||(5522966-5523152)
chr3 (585-649)||(8370505-8370569)
chr3 (585-649)||(27974971-27975035)
chr3 (585-649)||(27986465-27986529)
chr3 (586-649)||(1417510-1417573)
chr3 (471-672)||(20031296-20031497)
chr3 (423-567)||(14634523-14634665)
chr3 (468-530)||(16462203-16462264)
chr3 (468-530)||(47883003-47883064)
chr3 (172-264)||(10958674-10958767)
chr3 (585-646)||(48438221-48438282)
chr3 (585-649)||(16264354-16264418)
chr3 (585-649)||(21711227-21711291)
chr3 (585-649)||(32143325-32143389)
chr3 (585-649)||(33386685-33386749)
chr3 (586-649)||(37466295-37466358)
chr3 (510-673)||(46966624-46966789)
chr3 (468-672)||(38002869-38003072)
chr3 (585-649)||(26298992-26299056)
chr3 (585-649)||(27452962-27453026)
chr3 (585-649)||(36029097-36029161)
chr3 (586-649)||(25795785-25795848)
chr3 (79-124)||(25388618-25388663)
chr3 (585-649)||(3716021-3716085)
chr3 (76-124)||(3859314-3859362)
chr3 (585-649)||(6794732-6794796)
chr3 (468-668)||(16996875-16997078)
chr3 (585-649)||(40592801-40592865)
chr3 (585-649)||(47923925-47923989)
chr3 (371-493)||(7768554-7768672)
chr3 (453-530)||(11066652-11066731)
chr3 (397-493)||(31021300-31021392)
chr3 (79-124)||(6066246-6066291)
chr3 (314-379)||(6484308-6484373)
chr3 (435-480)||(7606828-7606873)
chr3 (586-643)||(25929463-25929519)
chr3 (79-154)||(32218836-32218912)
chr3 (534-652)||(25634030-25634150)
chr3 (585-649)||(26928620-26928683)
chr3 (585-649)||(39040011-39040075)
chr3 (585-649)||(40844656-40844719)
chr3 (79-146)||(48362119-48362186)
chr3 (586-649)||(3328376-3328439)
chr3 (535-652)||(15823644-15823763)
chr3 (595-652)||(1674169-1674227)
chr3 (172-226)||(45882752-45882806)
chr3 (584-672)||(48390281-48390368)
chr3 (314-387)||(1618916-1618992)
chr3 (172-249)||(4308648-4308725)
chr3 (589-649)||(2671619-2671678)
chr3 (589-649)||(2672952-2673011)
chr3 (589-649)||(2677108-2677167)
chr3 (589-649)||(7167249-7167308)
chr3 (589-649)||(8477367-8477426)
chr3 (589-649)||(8512222-8512281)
chr3 (589-649)||(8517102-8517161)
chr3 (589-649)||(8739096-8739155)
chr3 (589-649)||(9091334-9091393)
chr3 (480-626)||(11007544-11007683)
chr3 (589-649)||(18656440-18656499)
chr3 (589-649)||(22173216-22173275)
chr3 (585-649)||(24695183-24695247)
chr3 (589-649)||(32475490-32475549)
chr3 (589-649)||(32480348-32480407)
chr3 (589-649)||(40372828-40372887)
chr3 (605-649)||(40913417-40913461)
chr3 (605-649)||(44331669-44331713)
chr3 (471-530)||(3329896-3329954)
chr3 (314-353)||(25690651-25690690)
chr3 (586-632)||(3323710-3323756)
chr3 (287-345)||(13893289-13893347)
chr3 (476-625)||(13893470-13893621)
chr3 (585-649)||(9666466-9666531)
chr3 (314-343)||(10621847-10621876)
chr3 (172-249)||(27101627-27101704)
chr3 (393-506)||(27420656-27420765)
chr3 (316-345)||(31021450-31021479)
chr3 (172-249)||(35918316-35918393)
chr3 (314-343)||(42990205-42990234)
chr3 (176-249)||(43228108-43228181)
chr3 (589-625)||(4386950-4386986)
chr3 (605-649)||(16499153-16499197)
chr3 (605-649)||(23391909-23391953)
chr3 (314-350)||(27101558-27101594)
chr3 (605-649)||(29196386-29196430)
chr3 (605-649)||(29813187-29813231)
chr3 (605-649)||(30236249-30236293)
chr3 (609-649)||(32744436-32744476)
chr3 (605-649)||(39153361-39153405)
chr3 (605-649)||(40734622-40734666)
chr3 (605-645)||(40735507-40735547)
chr3 (605-649)||(51398938-51398982)
[»] chr1 (174 HSPs)
chr1 (79-686)||(47179428-47180028)
chr1 (87-686)||(16225895-16226483)
chr1 (79-686)||(47177078-47177677)
chr1 (287-686)||(51749955-51750354)
chr1 (287-686)||(28840594-28840994)
chr1 (287-686)||(51752281-51752678)
chr1 (287-686)||(10399794-10400193)
chr1 (287-686)||(13761753-13762151)
chr1 (314-667)||(20302402-20302755)
chr1 (314-686)||(31735487-31735863)
chr1 (291-686)||(28842413-28842809)
chr1 (315-680)||(2617460-2617825)
chr1 (287-664)||(15823462-15823840)
chr1 (287-662)||(6822931-6823306)
chr1 (314-686)||(20291400-20291771)
chr1 (314-667)||(9463228-9463588)
chr1 (314-667)||(9459401-9459761)
chr1 (317-686)||(15294800-15295183)
chr1 (363-686)||(46431671-46431996)
chr1 (317-686)||(39932017-39932389)
chr1 (314-664)||(27336927-27337280)
chr1 (287-652)||(13214997-13215368)
chr1 (314-688)||(24325599-24325980)
chr1 (314-664)||(27339118-27339472)
chr1 (314-664)||(12302492-12302848)
chr1 (314-664)||(47906207-47906564)
chr1 (314-664)||(17324623-17324974)
chr1 (287-664)||(38925468-38925843)
chr1 (315-652)||(50307545-50307884)
chr1 (287-664)||(39462435-39462813)
chr1 (287-652)||(41646836-41647202)
chr1 (314-664)||(16428596-16428948)
chr1 (317-613)||(21948226-21948526)
chr1 (314-667)||(2510309-2510666)
chr1 (315-664)||(17186114-17186465)
chr1 (315-664)||(11457462-11457812)
chr1 (293-664)||(14097956-14098329)
chr1 (314-664)||(6995687-6996038)
chr1 (287-664)||(28207055-28207431)
chr1 (314-664)||(28998240-28998591)
chr1 (314-664)||(29003956-29004307)
chr1 (315-664)||(50076659-50077009)
chr1 (314-652)||(9241084-9241424)
chr1 (438-686)||(16231630-16231878)
chr1 (291-662)||(3579606-3579979)
chr1 (315-652)||(18839531-18839870)
chr1 (315-664)||(50078807-50079158)
chr1 (316-664)||(18307054-18307403)
chr1 (316-664)||(25251261-25251611)
chr1 (314-664)||(2949219-2949569)
chr1 (314-652)||(6756470-6756810)
chr1 (314-592)||(48665114-48665400)
chr1 (355-664)||(4131362-4131676)
chr1 (336-664)||(31425002-31425335)
chr1 (355-664)||(25127856-25128167)
chr1 (316-664)||(17318838-17319181)
chr1 (287-567)||(6823800-6824088)
chr1 (315-664)||(31489859-31490206)
chr1 (287-647)||(47451564-47451919)
chr1 (79-353)||(23783238-23783533)
chr1 (463-686)||(51757623-51757845)
chr1 (315-664)||(50248557-50248909)
chr1 (315-652)||(17324009-17324346)
chr1 (467-686)||(23785935-23786154)
chr1 (106-411)||(16231368-16231641)
chr1 (314-567)||(31422958-31423212)
chr1 (315-652)||(14183589-14183923)
chr1 (314-652)||(42922177-42922514)
chr1 (364-664)||(40133937-40134239)
chr1 (314-638)||(8347284-8347607)
chr1 (314-626)||(15669418-15669729)
chr1 (362-664)||(16432396-16432690)
chr1 (314-652)||(18800570-18800907)
chr1 (316-652)||(8349049-8349385)
chr1 (79-264)||(51752104-51752291)
chr1 (79-264)||(13761577-13761763)
chr1 (456-664)||(16429042-16429252)
chr1 (438-662)||(25248540-25248766)
chr1 (314-652)||(49495209-49495537)
chr1 (79-264)||(51749778-51749965)
chr1 (512-664)||(23816027-23816180)
chr1 (321-652)||(13125455-13125787)
chr1 (451-664)||(6115089-6115304)
chr1 (99-264)||(6823643-6823810)
chr1 (79-264)||(20302198-20302385)
chr1 (79-196)||(6822775-6822893)
chr1 (314-652)||(27916440-27916780)
chr1 (321-559)||(26520206-26520449)
chr1 (79-264)||(10400183-10400369)
chr1 (471-652)||(21353345-21353525)
chr1 (287-650)||(30790401-30790759)
chr1 (576-686)||(13358779-13358888)
chr1 (471-674)||(2401198-2401400)
chr1 (78-223)||(15823285-15823430)
chr1 (315-652)||(30738625-30738963)
chr1 (468-651)||(2232597-2232774)
chr1 (315-652)||(26613237-26613577)
chr1 (78-184)||(20291279-20291386)
chr1 (453-613)||(155788-155950)
chr1 (450-652)||(16561545-16561751)
chr1 (316-410)||(25248756-25248850)
chr1 (471-651)||(9526469-9526650)
chr1 (87-264)||(28840426-28840604)
chr1 (394-652)||(28279292-28279551)
chr1 (87-219)||(28842241-28842373)
chr1 (468-672)||(4144662-4144865)
chr1 (471-674)||(2393260-2393461)
chr1 (471-672)||(25134074-25134274)
chr1 (471-651)||(9521718-9521899)
chr1 (585-649)||(13598402-13598466)
chr1 (585-649)||(16124545-16124609)
chr1 (585-649)||(47703965-47704029)
chr1 (586-649)||(19072932-19072995)
chr1 (586-649)||(19120822-19120885)
chr1 (586-649)||(47098854-47098917)
chr1 (371-495)||(26332719-26332836)
chr1 (585-646)||(29651818-29651879)
chr1 (585-649)||(9476265-9476329)
chr1 (589-649)||(26644930-26644990)
chr1 (321-495)||(13127790-13127959)
chr1 (586-649)||(47102871-47102934)
chr1 (588-646)||(3281715-3281773)
chr1 (543-652)||(15916562-15916674)
chr1 (585-649)||(27104401-27104465)
chr1 (585-649)||(37069774-37069838)
chr1 (513-673)||(46783189-46783350)
chr1 (586-649)||(775676-775739)
chr1 (453-528)||(26332613-26332688)
chr1 (586-649)||(32889443-32889506)
chr1 (584-649)||(21536597-21536662)
chr1 (585-649)||(13604652-13604716)
chr1 (453-530)||(14353047-14353126)
chr1 (628-686)||(13447239-13447296)
chr1 (81-161)||(38925915-38925996)
chr1 (172-249)||(13449919-13449996)
chr1 (585-649)||(19358872-19358935)
chr1 (585-649)||(19361461-19361524)
chr1 (585-649)||(19380101-19380164)
chr1 (585-649)||(24202798-24202861)
chr1 (596-652)||(31422859-31422915)
chr1 (79-161)||(47451405-47451488)
chr1 (348-387)||(6115344-6115383)
chr1 (186-264)||(28207421-28207500)
chr1 (166-264)||(30790749-30790848)
chr1 (78-223)||(39462257-39462402)
chr1 (112-264)||(13214854-13215007)
chr1 (79-148)||(14098441-14098510)
chr1 (468-530)||(14997040-14997101)
chr1 (457-530)||(43104245-43104318)
chr1 (605-649)||(834167-834211)
chr1 (605-649)||(13137976-13138020)
chr1 (314-366)||(16431044-16431096)
chr1 (589-649)||(25445110-25445169)
chr1 (605-649)||(28220226-28220270)
chr1 (605-649)||(28265554-28265598)
chr1 (589-649)||(39445505-39445564)
chr1 (589-649)||(44023894-44023953)
chr1 (79-161)||(49687301-49687384)
chr1 (453-495)||(49959129-49959172)
chr1 (595-652)||(13127685-13127743)
chr1 (390-450)||(14352978-14353034)
chr1 (607-649)||(45644354-45644396)
chr1 (314-343)||(43104102-43104131)
chr1 (314-343)||(46432037-46432066)
chr1 (589-649)||(1055032-1055091)
chr1 (605-649)||(3156989-3157033)
chr1 (605-649)||(4552637-4552681)
chr1 (605-649)||(13659336-13659380)
chr1 (588-643)||(22819438-22819494)
chr1 (605-649)||(28223421-28223465)
chr1 (605-649)||(31659362-31659406)
chr1 (589-649)||(41390586-41390645)
chr1 (589-649)||(41398241-41398300)
chr1 (589-649)||(43988485-43988544)
[»] chr5 (181 HSPs)
chr5 (79-675)||(31542442-31543039)
chr5 (79-674)||(31544798-31545384)
chr5 (136-686)||(31179337-31179897)
chr5 (287-667)||(38882021-38882402)
chr5 (287-686)||(25921437-25921836)
chr5 (287-667)||(2174835-2175215)
chr5 (355-686)||(15552229-15552561)
chr5 (287-688)||(4236545-4236945)
chr5 (314-686)||(10529062-10529435)
chr5 (316-686)||(18466625-18466999)
chr5 (314-664)||(39854427-39854777)
chr5 (287-664)||(21947943-21948320)
chr5 (289-664)||(16776075-16776451)
chr5 (287-686)||(21684416-21684824)
chr5 (314-686)||(27912473-27912851)
chr5 (287-664)||(2818320-2818699)
chr5 (314-686)||(18468950-18469324)
chr5 (355-686)||(34477017-34477349)
chr5 (314-675)||(6747247-6747608)
chr5 (355-664)||(6745053-6745362)
chr5 (355-686)||(34479382-34479714)
chr5 (355-686)||(25804009-25804339)
chr5 (314-667)||(27910388-27910747)
chr5 (317-664)||(18511197-18511547)
chr5 (314-660)||(40221465-40221813)
chr5 (315-664)||(25904047-25904397)
chr5 (314-664)||(26097676-26098025)
chr5 (315-664)||(24126800-24127150)
chr5 (317-664)||(18509303-18509652)
chr5 (315-652)||(17072827-17073166)
chr5 (438-667)||(4410090-4410319)
chr5 (315-675)||(31472585-31472948)
chr5 (315-664)||(1189592-1189949)
chr5 (318-664)||(10474308-10474655)
chr5 (79-355)||(15354777-15355065)
chr5 (79-355)||(15357053-15357341)
chr5 (79-352)||(10756960-10757245)
chr5 (314-663)||(18596590-18596939)
chr5 (314-652)||(37705777-37706116)
chr5 (355-664)||(16092184-16092495)
chr5 (323-664)||(2954368-2954710)
chr5 (287-664)||(36402313-36402690)
chr5 (314-664)||(6756437-6756786)
chr5 (79-351)||(10749505-10749767)
chr5 (78-358)||(23664833-23665125)
chr5 (78-358)||(23793462-23793754)
chr5 (287-652)||(31465986-31466341)
chr5 (393-664)||(658341-658610)
chr5 (315-567)||(34530749-34531001)
chr5 (314-667)||(10586782-10587129)
chr5 (315-664)||(695833-696172)
chr5 (467-675)||(3373111-3373320)
chr5 (322-664)||(17818477-17818817)
chr5 (288-664)||(12555908-12556285)
chr5 (315-664)||(39397978-39398327)
chr5 (315-533)||(20044954-20045172)
chr5 (79-358)||(23667109-23667400)
chr5 (79-343)||(34477379-34477632)
chr5 (467-686)||(10749796-10750014)
chr5 (315-529)||(20042994-20043208)
chr5 (467-688)||(15354537-15354757)
chr5 (467-688)||(23665140-23665360)
chr5 (467-688)||(23793227-23793447)
chr5 (467-688)||(15356813-15357033)
chr5 (467-686)||(10757273-10757490)
chr5 (322-652)||(21288715-21289043)
chr5 (450-667)||(39798126-39798344)
chr5 (320-652)||(6661181-6661512)
chr5 (474-688)||(23741821-23742034)
chr5 (467-685)||(38960096-38960314)
chr5 (449-664)||(20505828-20506042)
chr5 (438-664)||(41585729-41585956)
chr5 (314-506)||(26098395-26098587)
chr5 (79-358)||(38960334-38960604)
chr5 (433-664)||(2723964-2724187)
chr5 (79-343)||(34479740-34479972)
chr5 (316-664)||(9020167-9020514)
chr5 (79-264)||(38881845-38882031)
chr5 (358-664)||(20053834-20054131)
chr5 (315-652)||(36208524-36208858)
chr5 (314-453)||(20507659-20507798)
chr5 (79-196)||(2174680-2174797)
chr5 (69-196)||(25921874-25922002)
chr5 (467-688)||(23667415-23667635)
chr5 (87-224)||(4236378-4236515)
chr5 (371-638)||(17413176-17413441)
chr5 (71-196)||(39797841-39797966)
chr5 (468-651)||(1170811-1170994)
chr5 (468-651)||(35385450-35385634)
chr5 (314-411)||(4410000-4410101)
chr5 (453-652)||(15143547-15143750)
chr5 (473-652)||(25445501-25445681)
chr5 (471-652)||(22672837-22673019)
chr5 (259-358)||(23742057-23742157)
chr5 (314-539)||(42770717-42770934)
chr5 (471-672)||(17841228-17841428)
chr5 (471-652)||(25452498-25452680)
chr5 (79-224)||(16775897-16776042)
chr5 (468-651)||(2297999-2298183)
chr5 (371-640)||(2144570-2144840)
chr5 (76-161)||(18186504-18186590)
chr5 (471-652)||(28786407-28786589)
chr5 (79-196)||(659713-659829)
chr5 (79-143)||(21684905-21684969)
chr5 (314-410)||(41585946-41586042)
chr5 (468-674)||(1240428-1240633)
chr5 (170-267)||(21684811-21684909)
chr5 (471-652)||(4897828-4898013)
chr5 (371-530)||(4754159-4754312)
chr5 (585-649)||(9353361-9353425)
chr5 (585-649)||(36932379-36932443)
chr5 (586-649)||(28832263-28832326)
chr5 (371-525)||(29748352-29748502)
chr5 (584-649)||(11917000-11917065)
chr5 (585-649)||(10281755-10281819)
chr5 (585-649)||(15464536-15464600)
chr5 (585-649)||(17003989-17004053)
chr5 (79-161)||(20504369-20504452)
chr5 (471-672)||(11962412-11962612)
chr5 (497-567)||(42770936-42771006)
chr5 (314-359)||(3373332-3373377)
chr5 (585-649)||(19588750-19588814)
chr5 (586-649)||(31300626-31300689)
chr5 (79-161)||(36402762-36402845)
chr5 (586-649)||(42127440-42127503)
chr5 (506-672)||(42238298-42238463)
chr5 (422-506)||(34033714-34033797)
chr5 (474-653)||(40222769-40222951)
chr5 (79-124)||(31179888-31179933)
chr5 (585-649)||(12084204-12084268)
chr5 (585-649)||(14520234-14520298)
chr5 (79-161)||(20507918-20508001)
chr5 (79-161)||(21947770-21947853)
chr5 (565-652)||(26098285-26098373)
chr5 (468-672)||(10627364-10627569)
chr5 (79-196)||(31466379-31466496)
chr5 (541-652)||(15445263-15445376)
chr5 (602-664)||(20043222-20043284)
chr5 (422-641)||(31782463-31782690)
chr5 (287-341)||(39798004-39798058)
chr5 (172-249)||(4409890-4409967)
chr5 (468-529)||(16093413-16093473)
chr5 (585-649)||(38192178-38192241)
chr5 (585-649)||(38219403-38219466)
chr5 (422-530)||(15224889-15224997)
chr5 (585-651)||(36263810-36263877)
chr5 (134-214)||(659850-659929)
chr5 (172-249)||(39854317-39854394)
chr5 (589-649)||(1457183-1457242)
chr5 (589-649)||(2785380-2785439)
chr5 (585-649)||(3880303-3880367)
chr5 (79-161)||(12556358-12556441)
chr5 (605-649)||(19806487-19806531)
chr5 (589-649)||(28807593-28807652)
chr5 (589-649)||(31180219-31180278)
chr5 (589-649)||(31397014-31397073)
chr5 (605-649)||(32636948-32636992)
chr5 (371-530)||(35430172-35430338)
chr5 (589-649)||(37556643-37556702)
chr5 (589-649)||(37561465-37561524)
chr5 (589-649)||(43592284-43592343)
chr5 (586-649)||(24553537-24553599)
chr5 (315-365)||(2723911-2723961)
chr5 (89-161)||(2818763-2818836)
chr5 (586-639)||(11181862-11181916)
chr5 (390-442)||(13295760-13295809)
chr5 (586-640)||(33030970-33031024)
chr5 (314-343)||(2144899-2144928)
chr5 (172-249)||(6744894-6744971)
chr5 (172-249)||(6747137-6747214)
chr5 (314-343)||(15552178-15552207)
chr5 (314-343)||(25803959-25803988)
chr5 (605-649)||(533893-533937)
chr5 (589-649)||(15044691-15044750)
chr5 (589-649)||(27449819-27449878)
chr5 (315-343)||(29748285-29748313)
chr5 (589-649)||(30631411-30631470)
chr5 (589-649)||(31401871-31401930)
chr5 (585-649)||(35387667-35387730)
chr5 (172-248)||(42238047-42238123)
chr5 (605-649)||(42428430-42428474)
[»] chr8 (140 HSPs)
chr8 (79-686)||(43081722-43082344)
chr8 (79-686)||(18810483-18811078)
chr8 (79-686)||(18812668-18813252)
chr8 (79-686)||(44720617-44721214)
chr8 (287-686)||(27829269-27829667)
chr8 (287-686)||(27826958-27827356)
chr8 (363-686)||(43079650-43079973)
chr8 (287-664)||(14807723-14808111)
chr8 (287-686)||(4423990-4424389)
chr8 (287-664)||(28251552-28251930)
chr8 (314-686)||(32339304-32339680)
chr8 (324-685)||(608735-609105)
chr8 (314-686)||(15809214-15809589)
chr8 (291-664)||(15072686-15073061)
chr8 (314-652)||(24873178-24873523)
chr8 (314-667)||(3874005-3874363)
chr8 (314-686)||(22684617-22685002)
chr8 (314-686)||(28283185-28283561)
chr8 (287-663)||(15067953-15068330)
chr8 (314-685)||(43530123-43530485)
chr8 (315-662)||(27106884-27107232)
chr8 (315-664)||(30480488-30480838)
chr8 (314-652)||(27911014-27911351)
chr8 (314-652)||(27957433-27957770)
chr8 (314-664)||(14419175-14419527)
chr8 (79-343)||(43079347-43079614)
chr8 (314-664)||(13858470-13858820)
chr8 (314-664)||(1225165-1225517)
chr8 (314-652)||(41384744-41385082)
chr8 (316-652)||(36865538-36865875)
chr8 (315-559)||(14477276-14477520)
chr8 (315-664)||(25952521-25952871)
chr8 (315-665)||(5372160-5372512)
chr8 (314-664)||(41382672-41383012)
chr8 (315-531)||(33541507-33541723)
chr8 (314-652)||(15185711-15186046)
chr8 (315-652)||(21482322-21482649)
chr8 (314-652)||(31162212-31162551)
chr8 (315-506)||(5622882-5623073)
chr8 (405-652)||(15956051-15956296)
chr8 (348-643)||(21480547-21480832)
chr8 (314-492)||(26775200-26775378)
chr8 (348-652)||(3005627-3005929)
chr8 (315-478)||(35872555-35872713)
chr8 (291-415)||(3886153-3886277)
chr8 (450-652)||(31035252-31035459)
chr8 (438-585)||(181622-181772)
chr8 (291-426)||(12517248-12517385)
chr8 (287-495)||(2468261-2468461)
chr8 (79-264)||(27826782-27826968)
chr8 (79-264)||(27829093-27829279)
chr8 (453-652)||(31578273-31578476)
chr8 (348-533)||(37214317-37214512)
chr8 (468-651)||(16757266-16757449)
chr8 (87-224)||(14807556-14807693)
chr8 (468-651)||(28327908-28328091)
chr8 (468-652)||(9021104-9021289)
chr8 (316-487)||(31035068-31035238)
chr8 (468-651)||(28895502-28895686)
chr8 (397-530)||(31573847-31573975)
chr8 (468-651)||(4812486-4812669)
chr8 (468-651)||(16752522-16752704)
chr8 (468-651)||(28332631-28332814)
chr8 (314-410)||(181536-181632)
chr8 (78-224)||(12517420-12517566)
chr8 (471-674)||(23179538-23179740)
chr8 (471-651)||(25684646-25684826)
chr8 (471-672)||(33032657-33032857)
chr8 (100-196)||(3886322-3886419)
chr8 (471-625)||(29554810-29554964)
chr8 (453-642)||(17847661-17847848)
chr8 (471-652)||(590797-590979)
chr8 (468-672)||(17799403-17799606)
chr8 (87-264)||(15067785-15067963)
chr8 (521-652)||(2468126-2468259)
chr8 (585-649)||(4696625-4696689)
chr8 (585-649)||(9765848-9765912)
chr8 (79-264)||(15072506-15072692)
chr8 (585-649)||(26403259-26403323)
chr8 (87-217)||(28251988-28252118)
chr8 (18-68)||(23286084-23286134)
chr8 (78-196)||(4423834-4423952)
chr8 (585-649)||(7412345-7412409)
chr8 (585-649)||(23799606-23799670)
chr8 (585-649)||(31071258-31071322)
chr8 (468-652)||(6376141-6376328)
chr8 (586-649)||(19752424-19752487)
chr8 (471-581)||(3276347-3276454)
chr8 (585-649)||(5702512-5702576)
chr8 (585-649)||(19175783-19175847)
chr8 (468-652)||(21033870-21034054)
chr8 (576-664)||(33541395-33541483)
chr8 (561-651)||(28890855-28890949)
chr8 (599-662)||(37214251-37214314)
chr8 (468-553)||(13985176-13985262)
chr8 (585-645)||(4456036-4456096)
chr8 (585-649)||(6127225-6127289)
chr8 (585-649)||(1261983-1262046)
chr8 (585-649)||(26287906-26287969)
chr8 (585-649)||(26301163-26301226)
chr8 (585-649)||(26313157-26313220)
chr8 (413-530)||(3895920-3896035)
chr8 (468-672)||(30423212-30423418)
chr8 (453-529)||(13985933-13986011)
chr8 (584-649)||(18853196-18853260)
chr8 (584-649)||(18870590-18870654)
chr8 (586-643)||(28307571-28307628)
chr8 (585-648)||(4733809-4733873)
chr8 (589-649)||(6311302-6311361)
chr8 (314-358)||(6375988-6376032)
chr8 (589-649)||(6813687-6813747)
chr8 (589-649)||(7289947-7290006)
chr8 (589-649)||(10684285-10684344)
chr8 (589-649)||(10689176-10689235)
chr8 (605-649)||(10930199-10930243)
chr8 (605-649)||(15212910-15212954)
chr8 (589-649)||(25328299-25328358)
chr8 (605-649)||(27811402-27811446)
chr8 (589-649)||(33037839-33037898)
chr8 (605-649)||(33352274-33352318)
chr8 (589-649)||(35745396-35745455)
chr8 (537-612)||(35872477-35872553)
chr8 (589-649)||(36979382-36979441)
chr8 (589-649)||(39784843-39784902)
chr8 (605-649)||(40321204-40321248)
chr8 (606-652)||(31566554-31566601)
chr8 (453-495)||(33839077-33839120)
chr8 (591-649)||(30655651-30655708)
chr8 (453-505)||(11701102-11701155)
chr8 (314-343)||(17847527-17847556)
chr8 (605-646)||(40221869-40221910)
chr8 (605-649)||(4743214-4743258)
chr8 (589-649)||(4760108-4760167)
chr8 (605-649)||(5689395-5689439)
chr8 (605-649)||(6599096-6599140)
chr8 (605-649)||(6674549-6674593)
chr8 (586-638)||(9054867-9054919)
chr8 (605-649)||(12702634-12702678)
chr8 (628-664)||(35872438-35872474)
chr8 (605-649)||(43036547-43036591)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (79-686)||(5927-6523)
[»] chr6 (147 HSPs)
chr6 (314-686)||(12195478-12195851)
chr6 (136-686)||(4816195-4816749)
chr6 (289-686)||(14507140-14507536)
chr6 (272-686)||(20915321-20915736)
chr6 (287-664)||(11983014-11983392)
chr6 (322-686)||(14458731-14459093)
chr6 (314-683)||(28241288-28241657)
chr6 (314-686)||(1230213-1230585)
chr6 (320-686)||(19704531-19704905)
chr6 (314-686)||(26932527-26932906)
chr6 (314-686)||(2628850-2629226)
chr6 (314-686)||(30967176-30967551)
chr6 (314-686)||(30034567-30034943)
chr6 (287-664)||(9019877-9020255)
chr6 (315-664)||(13057173-13057524)
chr6 (355-664)||(26065005-26065310)
chr6 (355-664)||(26084974-26085279)
chr6 (79-359)||(26068590-26068882)
chr6 (287-662)||(30728811-30729191)
chr6 (287-652)||(32279948-32280314)
chr6 (315-664)||(3629850-3630199)
chr6 (287-664)||(15541125-15541503)
chr6 (317-662)||(3631926-3632271)
chr6 (79-359)||(26066319-26066611)
chr6 (314-652)||(3390357-3390697)
chr6 (315-664)||(13039733-13040084)
chr6 (287-606)||(15530166-15530485)
chr6 (315-652)||(25477253-25477599)
chr6 (79-348)||(33310954-33311235)
chr6 (287-652)||(15532679-15533044)
chr6 (79-363)||(29754983-29755279)
chr6 (435-686)||(5273180-5273431)
chr6 (79-348)||(33308685-33308966)
chr6 (287-544)||(19227514-19227771)
chr6 (315-664)||(3233710-3234065)
chr6 (467-686)||(33308988-33309206)
chr6 (315-651)||(24338446-24338783)
chr6 (467-686)||(29754673-29754892)
chr6 (467-686)||(33311257-33311475)
chr6 (315-664)||(12161543-12161889)
chr6 (314-652)||(3027848-3028186)
chr6 (467-674)||(26066099-26066307)
chr6 (467-686)||(26068359-26068578)
chr6 (315-567)||(22490618-22490871)
chr6 (348-652)||(15719666-15719961)
chr6 (371-652)||(16455421-16455701)
chr6 (315-652)||(14466312-14466641)
chr6 (287-460)||(1072067-1072240)
chr6 (315-463)||(32447502-32447651)
chr6 (456-652)||(1069715-1069913)
chr6 (321-652)||(17012029-17012358)
chr6 (402-652)||(15367101-15367349)
chr6 (79-224)||(14507569-14507716)
chr6 (452-664)||(12186056-12186271)
chr6 (322-464)||(13870608-13870749)
chr6 (315-652)||(19696420-19696759)
chr6 (78-226)||(8995254-8995402)
chr6 (78-226)||(9019701-9019849)
chr6 (287-427)||(8995430-8995570)
chr6 (397-652)||(22857949-22858203)
chr6 (314-444)||(17852520-17852650)
chr6 (79-224)||(19227803-19227948)
chr6 (87-264)||(11983382-11983558)
chr6 (468-651)||(13878727-13878910)
chr6 (468-651)||(16785919-16786102)
chr6 (451-652)||(26945258-26945463)
chr6 (468-651)||(13883475-13883658)
chr6 (314-481)||(15346369-15346524)
chr6 (471-652)||(17694849-17695030)
chr6 (511-652)||(15346522-15346664)
chr6 (468-651)||(26887225-26887406)
chr6 (468-651)||(35201325-35201508)
chr6 (397-610)||(20526871-20527081)
chr6 (471-674)||(22342778-22342980)
chr6 (471-674)||(22351830-22352031)
chr6 (474-669)||(25465881-25466075)
chr6 (468-625)||(31248740-31248896)
chr6 (315-428)||(10584105-10584213)
chr6 (471-652)||(33215830-33216012)
chr6 (531-652)||(25465587-25465710)
chr6 (585-649)||(5757507-5757571)
chr6 (585-649)||(10077194-10077258)
chr6 (454-652)||(28037722-28037927)
chr6 (586-649)||(31979517-31979580)
chr6 (475-652)||(12166143-12166321)
chr6 (471-672)||(13467446-13467642)
chr6 (77-224)||(15530516-15530663)
chr6 (585-649)||(5572270-5572334)
chr6 (585-649)||(21356040-21356104)
chr6 (468-530)||(3577636-3577696)
chr6 (471-530)||(17036058-17036116)
chr6 (561-674)||(25941759-25941874)
chr6 (586-649)||(31936591-31936654)
chr6 (423-652)||(25078554-25078783)
chr6 (476-643)||(5165819-5165989)
chr6 (595-664)||(10584256-10584325)
chr6 (471-581)||(26643179-26643286)
chr6 (471-581)||(26749145-26749252)
chr6 (453-528)||(11138423-11138499)
chr6 (476-652)||(11262596-11262777)
chr6 (468-652)||(12911442-12911629)
chr6 (422-528)||(19701985-19702095)
chr6 (78-161)||(1072312-1072396)
chr6 (474-530)||(25941650-25941704)
chr6 (585-649)||(5017498-5017562)
chr6 (453-571)||(7542461-7542581)
chr6 (585-649)||(22709022-22709086)
chr6 (585-649)||(22963704-22963767)
chr6 (585-649)||(23824626-23824689)
chr6 (561-674)||(3577467-3577581)
chr6 (314-387)||(12186330-12186405)
chr6 (468-652)||(12937190-12937376)
chr6 (555-651)||(22870100-22870196)
chr6 (586-643)||(24436001-24436058)
chr6 (172-249)||(26084818-26084895)
chr6 (512-641)||(30445699-30445832)
chr6 (585-649)||(18232849-18232913)
chr6 (165-264)||(30729181-30729281)
chr6 (585-649)||(31086502-31086566)
chr6 (589-649)||(33335963-33336022)
chr6 (586-649)||(4629958-4630021)
chr6 (78-124)||(4816740-4816787)
chr6 (561-651)||(17038324-17038418)
chr6 (586-641)||(21801374-21801429)
chr6 (389-446)||(4595048-4595102)
chr6 (573-673)||(24501425-24501527)
chr6 (595-652)||(30443548-30443606)
chr6 (390-495)||(6843186-6843287)
chr6 (589-649)||(5674803-5674862)
chr6 (589-649)||(6005422-6005481)
chr6 (562-652)||(7294021-7294113)
chr6 (589-649)||(14742457-14742516)
chr6 (314-358)||(18318004-18318048)
chr6 (589-649)||(22010718-22010777)
chr6 (589-649)||(28155590-28155649)
chr6 (605-649)||(33211185-33211229)
chr6 (589-649)||(33330466-33330525)
chr6 (591-649)||(28184510-28184567)
chr6 (390-446)||(17904566-17904619)
chr6 (422-482)||(30445602-30445661)
chr6 (605-649)||(603088-603132)
chr6 (589-649)||(6438506-6438565)
chr6 (589-649)||(11856979-11857038)
chr6 (592-648)||(14521679-14521735)
chr6 (589-649)||(14737597-14737656)
chr6 (605-649)||(16569146-16569190)
chr6 (589-649)||(16838749-16838808)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (287-686)||(2805-3203)
scaffold0250 (79-264)||(2629-2815)
[»] chr2 (163 HSPs)
chr2 (287-686)||(27104691-27105088)
chr2 (287-668)||(42064407-42064789)
chr2 (287-686)||(13910009-13910407)
chr2 (287-685)||(19504311-19504708)
chr2 (316-685)||(19501976-19502345)
chr2 (314-686)||(23452201-23452577)
chr2 (314-667)||(45279966-45280321)
chr2 (287-686)||(24162187-24162575)
chr2 (314-668)||(35215567-35215932)
chr2 (355-668)||(35217944-35218258)
chr2 (314-667)||(42452702-42453053)
chr2 (291-664)||(22287321-22287695)
chr2 (287-652)||(40032050-40032421)
chr2 (287-664)||(21520678-21521058)
chr2 (287-664)||(43623565-43623931)
chr2 (315-664)||(19007560-19007910)
chr2 (314-664)||(42923494-42923847)
chr2 (315-664)||(28196557-28196905)
chr2 (287-664)||(6264133-6264508)
chr2 (287-664)||(6258802-6259178)
chr2 (79-358)||(36559067-36559358)
chr2 (79-358)||(45332384-45332675)
chr2 (315-664)||(11739544-11739895)
chr2 (315-664)||(17848365-17848710)
chr2 (315-652)||(31732773-31733100)
chr2 (318-664)||(3022086-3022442)
chr2 (316-559)||(15539566-15539809)
chr2 (315-664)||(44289052-44289403)
chr2 (323-664)||(34979562-34979906)
chr2 (467-686)||(36561105-36561324)
chr2 (315-664)||(17849037-17849387)
chr2 (467-686)||(45332144-45332364)
chr2 (355-625)||(45239001-45239271)
chr2 (315-664)||(14837193-14837538)
chr2 (467-667)||(36558846-36559047)
chr2 (315-652)||(11578104-11578439)
chr2 (445-664)||(5375331-5375550)
chr2 (287-664)||(18800298-18800665)
chr2 (316-652)||(20146604-20146941)
chr2 (287-468)||(22407591-22407772)
chr2 (314-652)||(22874061-22874389)
chr2 (315-492)||(22163106-22163282)
chr2 (355-552)||(38020162-38020349)
chr2 (314-652)||(17897242-17897578)
chr2 (182-358)||(36561344-36561532)
chr2 (87-224)||(19502405-19502542)
chr2 (405-664)||(28459175-28459435)
chr2 (79-264)||(24162565-24162752)
chr2 (79-217)||(36561539-36561677)
chr2 (78-224)||(19504739-19504885)
chr2 (87-264)||(27104523-27104701)
chr2 (509-664)||(22407439-22407595)
chr2 (314-450)||(5377629-5377769)
chr2 (287-664)||(35107192-35107566)
chr2 (451-652)||(40699429-40699634)
chr2 (314-652)||(37962938-37963263)
chr2 (521-646)||(7462950-7463077)
chr2 (468-674)||(20054742-20054947)
chr2 (471-652)||(17943540-17943720)
chr2 (468-651)||(2736205-2736388)
chr2 (471-674)||(27517616-27517818)
chr2 (468-651)||(17462436-17462619)
chr2 (468-651)||(39686983-39687166)
chr2 (79-264)||(21521048-21521234)
chr2 (405-567)||(27136208-27136368)
chr2 (371-584)||(43139356-43139564)
chr2 (87-196)||(43623968-43624077)
chr2 (468-651)||(2740941-2741124)
chr2 (468-674)||(20049998-20050204)
chr2 (471-674)||(30478997-30479199)
chr2 (471-665)||(12781207-12781400)
chr2 (438-537)||(38414194-38414291)
chr2 (468-651)||(39680045-39680228)
chr2 (79-224)||(42064231-42064376)
chr2 (82-264)||(6259168-6259351)
chr2 (531-664)||(22707736-22707872)
chr2 (585-649)||(14699036-14699100)
chr2 (468-567)||(20589763-20589863)
chr2 (565-664)||(22163007-22163106)
chr2 (471-593)||(17932637-17932757)
chr2 (316-409)||(38020064-38020157)
chr2 (585-649)||(13569332-13569396)
chr2 (585-649)||(20522224-20522288)
chr2 (468-530)||(22712637-22712698)
chr2 (468-530)||(22717346-22717407)
chr2 (468-530)||(45567409-45567470)
chr2 (584-649)||(34682362-34682427)
chr2 (471-625)||(37170778-37170931)
chr2 (585-649)||(8040064-8040128)
chr2 (585-649)||(10445473-10445537)
chr2 (585-649)||(28259206-28259270)
chr2 (79-161)||(40032503-40032586)
chr2 (453-530)||(17921754-17921833)
chr2 (171-264)||(13910397-13910491)
chr2 (413-506)||(27583483-27583573)
chr2 (314-386)||(12342673-12342746)
chr2 (561-651)||(45679813-45679906)
chr2 (585-649)||(8390179-8390243)
chr2 (585-649)||(17865207-17865271)
chr2 (585-649)||(33118140-33118204)
chr2 (585-649)||(34388862-34388926)
chr2 (585-649)||(39482935-39482999)
chr2 (586-649)||(2838060-2838123)
chr2 (530-652)||(23870951-23871074)
chr2 (587-649)||(1345572-1345634)
chr2 (468-530)||(28458949-28459011)
chr2 (452-528)||(26345661-26345738)
chr2 (585-649)||(10707281-10707345)
chr2 (585-649)||(16940238-16940302)
chr2 (585-649)||(17010903-17010967)
chr2 (585-649)||(21629948-21630011)
chr2 (585-649)||(25398500-25398563)
chr2 (585-649)||(33528650-33528714)
chr2 (468-516)||(38190997-38191045)
chr2 (586-649)||(2869723-2869786)
chr2 (87-196)||(6264546-6264655)
chr2 (586-649)||(31056048-31056111)
chr2 (561-651)||(33670965-33671059)
chr2 (413-528)||(35028595-35028707)
chr2 (452-567)||(15693958-15694076)
chr2 (585-649)||(3491755-3491818)
chr2 (605-649)||(17057369-17057413)
chr2 (605-649)||(17085352-17085396)
chr2 (79-264)||(22407762-22407948)
chr2 (585-649)||(25403638-25403701)
chr2 (585-649)||(42039698-42039762)
chr2 (585-648)||(23078499-23078562)
chr2 (584-639)||(27149322-27149377)
chr2 (453-530)||(34575230-34575308)
chr2 (603-652)||(8173539-8173589)
chr2 (467-528)||(10942634-10942696)
chr2 (467-528)||(10948503-10948565)
chr2 (316-358)||(20147040-20147082)
chr2 (600-664)||(34575123-34575186)
chr2 (453-528)||(7502975-7503052)
chr2 (605-649)||(723744-723788)
chr2 (589-649)||(11098960-11099019)
chr2 (589-649)||(14291493-14291552)
chr2 (453-558)||(30720703-30720811)
chr2 (605-649)||(34139770-34139814)
chr2 (589-649)||(36757795-36757855)
chr2 (605-649)||(39284960-39285004)
chr2 (585-649)||(40738848-40738910)
chr2 (589-649)||(44312645-44312704)
chr2 (606-649)||(11151591-11151634)
chr2 (477-530)||(27248021-27248075)
chr2 (600-672)||(38191144-38191215)
chr2 (604-652)||(20592288-20592337)
chr2 (585-622)||(25407653-25407690)
chr2 (471-504)||(33674551-33674584)
chr2 (314-363)||(40699229-40699278)
chr2 (371-446)||(41304596-41304667)
chr2 (589-649)||(9296434-9296493)
chr2 (605-649)||(11067429-11067473)
chr2 (605-649)||(14633825-14633869)
chr2 (628-664)||(15539514-15539550)
chr2 (589-649)||(19344426-19344485)
chr2 (589-649)||(19349284-19349343)
chr2 (315-343)||(20589581-20589609)
chr2 (287-343)||(28462593-28462649)
chr2 (605-649)||(36773686-36773730)
chr2 (605-649)||(38312364-38312408)
chr2 (589-649)||(39812009-39812068)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (287-686)||(69256-69658)
scaffold0025 (287-466)||(73207-73390)
scaffold0025 (87-224)||(69688-69825)
scaffold0025 (87-196)||(73427-73536)
scaffold0025 (434-477)||(73160-73203)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (314-683)||(41450-41819)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (355-667)||(34-347)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (317-664)||(79140-79488)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (287-667)||(3922-4301)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (287-686)||(29086-29494)
scaffold0068 (79-143)||(28941-29005)
scaffold0068 (170-267)||(29001-29099)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (314-686)||(183605-183975)
scaffold0005 (314-652)||(51961-52304)
scaffold0005 (604-652)||(50257-50305)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (314-664)||(11458-11809)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (327-652)||(14379-14707)
scaffold0131 (287-652)||(14944-15310)
scaffold0131 (80-264)||(14768-14954)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (431-686)||(1417-1671)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (79-358)||(21915-22206)
scaffold0140 (79-358)||(24190-24481)
scaffold0140 (467-688)||(22221-22441)
scaffold0140 (467-688)||(24496-24716)
scaffold0140 (585-649)||(8448-8512)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (315-652)||(79812-80150)
scaffold0004 (468-530)||(188363-188424)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (314-613)||(1988-2293)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (315-664)||(85184-85534)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (79-265)||(12868-13054)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (314-652)||(15817-16154)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (315-542)||(35593-35819)
scaffold0011 (584-664)||(35817-35897)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (324-652)||(1638-1958)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (316-652)||(16646-16981)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (314-483)||(993-1167)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (321-643)||(4773-5095)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (471-651)||(16328-16509)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (471-652)||(16983-17165)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (595-675)||(4653-4733)
[»] scaffold0006 (5 HSPs)
scaffold0006 (468-611)||(224819-224961)
scaffold0006 (585-649)||(5687-5751)
scaffold0006 (585-649)||(2496-2560)
scaffold0006 (585-649)||(133309-133373)
scaffold0006 (605-649)||(149097-149141)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (585-649)||(43990-44054)
scaffold0087 (585-649)||(36861-36925)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (561-651)||(3068-3161)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (586-646)||(10736-10796)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (585-649)||(45257-45321)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (615-686)||(1415-1485)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (588-649)||(85687-85748)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (585-649)||(17981-18044)
scaffold0188 (585-649)||(24074-24137)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (468-639)||(57437-57613)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (589-649)||(368-427)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (589-649)||(9663-9722)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (589-649)||(14330-14389)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (589-649)||(17267-17327)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (605-649)||(20415-20459)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (589-649)||(181985-182044)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (589-649)||(2272-2331)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (589-649)||(35083-35142)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (589-649)||(148977-149036)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 534; Significance: 0; HSPs: 212)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16934719 - 16934108
Alignment:
Q  74 ataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggca 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934719 ataaatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggca 16934620  T
Q  174 ctggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934619 ctggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcctggcacgatggtgcgctgtcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg 16934520  T
Q  274 ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16934519 ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgata 16934420  T
Q  374 caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16934419 caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacac 16934320  T
Q  474 tattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 572  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934319 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 16934220  T
Q  573 gaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16934219 gaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttc 16934121  T
Q  673 tttgtgttcttctc 686  Q
    ||| ||||||||||    
T  16934120 ttt-tgttcttctc 16934108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 16932360 - 16931754
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932360 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16932261  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932260 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 16932161  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16932160 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagg 16932061  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16932060 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatta 16931961  T
Q  479 ggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaac 577  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931960 ggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaac 16931861  T
Q  578 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  16931860 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttcttt-t 16931763  T
Q  678 gttcttctc 686  Q
    |||||||||    
T  16931762 gttcttctc 16931754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22783319 - 22782701
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783319 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 22783220  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783219 gaaaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 22783120  T
Q  277 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        ||||||||||    
T  22783119 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggc 22783020  T
Q  369 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22783019 tgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 22782920  T
Q  469 aacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782919 aacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 22782820  T
Q  568 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  22782819 gtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaatatctttgtgttcttct 22782720  T
Q  668 tcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22782719 tcttctttgtgttcttctc 22782701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22780952 - 22780336
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780952 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22780853  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780852 aaaatcatggcacgatggggtctcattgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 22780753  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        ||||||||||||    
T  22780752 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctg 22780653  T
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780652 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22780553  T
Q  471 cactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780552 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22780453  T
Q  570 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttc 669  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22780452 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttc 22780353  T
Q  670 ttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||    
T  22780352 ttctttgtgttcttctc 22780336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176438
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 9176936  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |              
T  9176935 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttataa--------- 9176845  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
      |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9176844 --atttaaagcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaag 9176747  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176746 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 9176647  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9176646 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggta 9176547  T
Q  577 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttg 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  9176546 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattc-tcttctttg 9176448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 18846923 - 18847521
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggttt--ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||    
T  18846923 tgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtact 18847021  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgt 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||           
T  18847022 ggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacaa------ 18847115  T
Q  275 tacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac 374  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18847116 -----atttaaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaac 18847210  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18847211 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 18847310  T
Q  475 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 573  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847311 attagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 18847410  T
Q  574 aaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttct 673  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  18847411 gtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tgttct 18847508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 11009075 - 11008532
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaa 234  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||    
T  11009075 cgtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaa 11008976  T
Q  235 ata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataga 333  Q
    | | |||| |||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008975 acagaaacatatttttgggtgcagatttgttacag-----------attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataga 11008887  T
Q  334 ccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttg 428  Q
    ||||||||||  || |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11008886 ccttgtatcag-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc 11008788  T
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 527  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008787 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 11008688  T
Q  528 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11008687 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 11008590  T
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11008589 ttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 11008532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599802
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599974 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 44599875  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599874 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttcttt-tgttcttctc 44599802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 51015216 - 51015614
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015216 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51015315  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015316 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51015415  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51015416 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 51015515  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51015516 agtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51015614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 9174509 - 9174110
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174509 gcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9174410  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9174210  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9174209 tagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 9174111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22044753 - 22044355
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044753 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22044654  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044653 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgag 22044554  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22044553 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 22044454  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22044453 agtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 22044355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22047048 - 22046650
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047048 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22046949  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046948 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22046849  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22046848 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 22046749  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22046748 agtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 22046650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 9148221 - 9148603
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  9148221 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttag 9148320  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148321 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9148420  T
Q  485 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9148421 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 9148520  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9148521 atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 9148603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 11434925 - 11435323
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434925 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11435024  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435025 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11435124  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11435125 tctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 11435224  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11435225 agtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttccttgtgttcttctc 11435323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631383
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 8631560  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8631559 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 8631460  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8631459 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 8631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 37089737 - 37089336
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 383  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089737 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 37089638  T
Q  384 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089637 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  484 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca 583  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37089537 gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 37089438  T
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 683  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37089437 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttctt 37089339  T
Q  684 ctc 686  Q
    |||    
T  37089338 ctc 37089336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 38409169 - 38409573
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 380  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  38409169 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggt 38409268  T
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409269 ttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 38409368  T
Q  481 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409369 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactca 38409468  T
Q  581 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgtt 680  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  38409469 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttcttc-tcttctttttgtt 38409567  T
Q  681 cttctc 686  Q
    ||||||    
T  38409568 cttctc 38409573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484837
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 2485010  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2485009 actttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2484910  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2484909 ccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 2484837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709127
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattac 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18709258 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttc 18709159  T
Q  655 tttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18709158 tttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 18709127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 5198390 - 5198771
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198390 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5198489  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5198490 aggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgag 5198589  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5198590 tcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 5198689  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  5198690 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttct 5198771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 31849962 - 31849563
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849962 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31849863  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849862 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31849763  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31849762 gtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 31849663  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31849662 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 31849564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 7941289 - 7941692
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7941289 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttag 7941388  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941389 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7941488  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 581  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7941489 tgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcat 7941588  T
Q  582 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttc 681  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7941589 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctt-ttcttctttgtgttc 7941687  T
Q  682 ttctc 686  Q
    |||||    
T  7941688 ttctc 7941692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765213
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  414 agagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 6765035  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765036 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctct 6765135  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6765136 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttggtgttcttctc 6765213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 287 - 662
Target Start/End: Original strand, 24888766 - 24889142
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888766 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24888865  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888866 aggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 24888965  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||    
T  24888966 tctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcata 24889065  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24889066 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 24889142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 11006604 - 11006219
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11006604 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11006506  T
Q  382 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006505 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11006406  T
Q  482 ttg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca 580  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  11006405 ttggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactca 11006306  T
Q  581 tcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11006305 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttcttct 11006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637422
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgaga 40637270  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  40637271 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 40637370  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40637371 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40637422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 314 - 688
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868772
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 47868597  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  47868598 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 47868697  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47868698 ccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattc-tcttctttgtgttcttctcac 47868772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22801225 - 22800847
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801225 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22801126  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22801125 tgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 22801026  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  22801025 tctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 22800926  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22800925 tagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22800847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22803097 - 22802719
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803097 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22802998  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802997 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22802898  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  22802897 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcata 22802798  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22802797 tagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348569
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 24348410  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24348411 gggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 24348510  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24348511 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 24348569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 287 - 662
Target Start/End: Original strand, 48486289 - 48486665
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486289 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48486388  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486389 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 48486488  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||    
T  48486489 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcata 48486588  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48486589 tagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132355
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 22132537  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132536 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 22132437  T
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattacttt-gtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22132436 tctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttggtcttcttc-tcttctttgtgttcttctc 22132355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 291 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091400
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctc 40091575  T
Q  491 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagt 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  40091574 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagt 40091475  T
Q  590 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |   |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40091474 gaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40091400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 47274697 - 47275076
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274697 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47274796  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47274797 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 47274895  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  47274896 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 47274995  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  47274996 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 47275076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 36919950 - 36919569
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919950 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttag 36919851  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919850 aaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36919751  T
Q  484 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||    
T  36919750 gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatc 36919651  T
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36919650 atatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36919569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633687
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggga 14633514  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14633515 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 14633614  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14633615 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14633687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 36921858 - 36921478
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921858 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttag 36921760  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921759 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36921660  T
Q  484 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  36921659 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatc 36921560  T
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36921559 atatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 36921478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134582
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattac 654  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22134711 ttgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttc 22134613  T
Q  655 tttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22134612 tttgtcttcttc-tcttctttgtgttcttctc 22134582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 291 - 652
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879326
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 24879162  T
Q  491 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatag 588  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  24879163 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatag 24879262  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24879263 tgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24879326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 24880421 - 24880788
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24880421 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaa 24880520  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880521 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgag 24880620  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcat 584  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||||||    
T  24880621 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcat 24880720  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24880721 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 24880788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662230
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    ||           ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 17662386  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662385 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 17662286  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17662285 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928162
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctccc 38928214  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38928213 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38928162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378641
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggga 36378488  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  36378489 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 36378588  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36378589 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttct 36378641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395830
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12395881  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12395880 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12395830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 383 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26085941
Alignment:
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatc 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26086143 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatc 26086044  T
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttct 682  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26086043 atatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttt 26085945  T
Q  683 tctc 686  Q
    ||||    
T  26085944 tctc 26085941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400792
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12400843  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12400842 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttct 12400792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 619783 - 619433
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  619783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcat 619684  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||     
T  619683 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggt 619584  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||    
T  619583 ctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 619484  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  619483 cta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 619433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 287 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 5637832 - 5637524
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5637832 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttt 5637733  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637732 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 5637633  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  5637632 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 5637533  T
Q  582 catatagtg 590  Q
    |||||||||    
T  5637532 catatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096231
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  415 gagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |      
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctccc 19096179  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19096180 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19096231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415473
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || | ||    
T  33415721 agtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctc 33415523  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33415522 aggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 33415473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 287 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 3824936 - 3824627
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 381  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  ||||    
T  3824936 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtt 3824839  T
Q  382 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824838 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 3824739  T
Q  482 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 580  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  3824738 ttgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 3824639  T
Q  581 tcatatagtgga 592  Q
    ||||||||||||    
T  3824638 tcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313062
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||| ||||  ||||||| || ||| ||||||||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaatt 37313062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787426
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 14787570  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctc 608  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||    
T  14787569 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 14787470  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  14787469 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 14787426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210756
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagg 47210895  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47210894 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctc 47210795  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 645  Q
    ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  47210794 tctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453658
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggga 16453505  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || || ||||||||||    
T  16453506 ctttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcc 16453605  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||  ||||||||||    
T  16453606 cccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttct 16453658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 321 - 652
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323031
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  619 taggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaatt 19323031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 683
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405499
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctg 53405322  T
Q  511 ggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg 603  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||    
T  53405323 agactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctg 53405422  T
Q  604 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 683  Q
      ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  53405423 --ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgttctt 53405499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 316 - 645
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||||||  | ||||||||   || |  |||||||||||||||||||    
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccc 56030738  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtca 645  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  56030739 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 319 - 652
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  319 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  || || ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  519 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccag 616  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccag 41997792  T
Q  617 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||    
T  41997793 actaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 316 - 625
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544268
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  411 tatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  609 tcccccagactaggtca 625  Q
    |  ||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtca 13544268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 18537512  T
Q  612 cccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| | |||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  18537511 cccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 287 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 52942810 - 52942542
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942810 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag 52942712  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg 52942612  T
Q  485 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52942611 agtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 393 - 664
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380698
Alignment:
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtg 590  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  591 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 36380698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  || ||||| ||||||| |   ||| | |||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccc 18409384  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     ||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409383 tcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 315 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  || | |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattct 545  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534828
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || ||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgaga 18534970  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    |||||| || ||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  18534969 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccc 18534870  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534869 cccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 535
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  515 tttgggtagaattaggcggga 535  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8756586 - 8756247
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| |||| ||||||    
T  8756586 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgta 8756488  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||     
T  8756487 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattga 8756391  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||| |||| |||||||||  ||| || ||||||||    
T  8756390 gactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctct 8756291  T
Q  610 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  8756290 cctccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 431 - 652
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455578
Alignment:
Q  431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  531 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 628  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  |||| |||| |||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatt 16455554  T
Q  629 tggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16455555 tggaccgaactgggtcaacaaatt 16455578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 512 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635440
Alignment:
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5635440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 511 - 686
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437731
Alignment:
Q  511 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 11437656  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11437657 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttccttgtgttcttctc 11437731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 397 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 594  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||      
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9174684 - 9174491
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9174684 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactgga 9174586  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9174585 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttt 9174491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 400 - 664
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499390
Alignment:
Q  400 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  500 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggag 598  Q
      |||||  || | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  | ||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaag 27499325  T
Q  599 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27499326 ggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27499390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 465 - 664
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547502
Alignment:
Q  465 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  565 -tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttc 13547501  T
Q  664 t 664  Q
    |    
T  13547502 t 13547502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11006781 - 11006590
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttc-tgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11006781 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactgg 11006682  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11006681 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacag 11006590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 314 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032557
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| ||||| ||||||||          ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||  | |||    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttgga 15032686  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  | || ||||||||||||    
T  15032685 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcc 15032586  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaact 639  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15032585 cccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 494 - 664
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  494 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtgga 592  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  593 ttggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 664
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891640
Alignment:
Q  459 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  559 tttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactt 656  Q
    | ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  657 tgtgttct 664  Q
    ||||||||    
T  2891633 tgtgttct 2891640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    | |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  || ||||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015185
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaa 180  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaa 51015141  T
Q  181 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015142 aattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 51015185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37089906 - 37089727
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37089906 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaaaatcg 37089807  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  37089806 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgtt 37089727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 321 - 652
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864049
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaac-aaaactagggtttgtataga 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  517 tgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca----tatagtggattggagggctgctctct-- 609  Q
    ||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||    |||||||||  |||| ||||||||||      
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctcc 9864005  T
Q  610 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9864006 cccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102425
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
     |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||  |||     
T  12102185 gagagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattgga 12102281  T
Q  513 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12102282 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 12102381  T
Q  610 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||    
T  12102382 cccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 7941133 - 7941251
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7941133 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 7941232  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7941233 aaaaatggtggcacgatgg 7941251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36920125 - 36919940
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  || |||| ||||||    
T  36920125 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaattttgagg-caagtcactgg 36920028  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 36919940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 11434769 - 11434887
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  11434769 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactgg 11434868  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11434869 aaaaatcgtggcacgatgg 11434887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 322 - 643
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113198
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||| |||||| | ||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagaggctgggactttg 518  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  519 ggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    |||||||||||    | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  10113070 ggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaa 10113169  T
Q  616 gactaggtcag-attggaccgaactgggt 643  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  10113170 gactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3825112 - 3824926
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||    
T  3825112 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaagcactgg 3825014  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||   || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3825013 aaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 3824926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 453
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637822
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| | |  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgta-ttttgggtgcagatttgtt 5637822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 405 - 664
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136898
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggct 602  Q
    |   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |   || ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  603 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||| | | |||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttct 30136898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16185831
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaactagggtt--ta 16186078  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttg---agggttgattcaccttg--ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
     |||| || |||||  ||   | |||||| |||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16186077 gagagatt-tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 16185979  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 605  Q
     ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  16185978 ttggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgct 16185879  T
Q  606 ctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  16185878 ctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 38408993 - 38409179
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||    
T  38408993 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactgg 38409091  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  38409092 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 38409179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 427
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891427
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  414 agagtttgtctctt 427  Q
    ||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853732
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 11853732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22803127
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||    
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagga-aaggcactggaa 22803172  T
Q  180 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22803171 aaatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 22803127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31850138 - 31849952
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  31850138 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaaggcactg 31850041  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  31850040 gaaaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 31849952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36922035 - 36921893
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| ||||    
T  36922035 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcact 36921938  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36921937 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgc 36921893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 24888598 - 24888776
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||||||    
T  24888598 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaatcg 24888696  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  24888697 tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 24888776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 25357634 - 25357979
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  25357634 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggt 25357731  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    ||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25357732 tt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggttgtga---ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagag 25357825  T
Q  507 gctgggactttgg----gtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagg 599  Q
      |||||||||||     ||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  |||      
T  25357826 attgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggata 25357925  T
Q  600 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  25357926 gctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatt 25357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 316 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40999071
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagacgt-caacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  515 tttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||    
T  40999086 tttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 471 - 653
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300609
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 31300522  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31300523 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatta 31300609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529452
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 8529365  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8529366 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 8529452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587151
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||  ||||||| || ||   || |||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttgt 18587064  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18587065 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 18587151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22044930 - 22044783
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcact 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  22044930 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcact 22044832  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22044831 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 22044783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 468 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7050343 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 518 - 664
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  518 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 616  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  617 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 422 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982186
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  517 tgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||     
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccct 3982212  T
Q  614 cagactaggtca-gattggaccgaac 638  Q
    || |||||||||  ||||||||||||    
T  3982211 catactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558495
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4558409  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4558410 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4558495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570296
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 4570189  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||    
T  4570190 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact-ggtcatcattagaccgaactgtgtaaacaaatt--cttgtgtt 4570286  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    ||||||||||    
T  4570287 cttcttcttc 4570296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 615
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatttctctt 566  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  567 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  9022556 tgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317142
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 15317056  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15317057 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 15317142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688937
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 16689024  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16689023 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16688937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822447
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 55822360  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  55822361 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 55822447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831325
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctctttgt 15831239  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||    
T  15831240 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaat 15831325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 452 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  551 cccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 647  Q
    ||| ||||| || | |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||| |||| |||||||| |||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaac 31983529  T
Q  648 aaatt 652  Q
    |||||    
T  31983528 aaatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 398 - 672
Target Start/End: Original strand, 36769406 - 36769682
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||    
T  36769406 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttctt 36769503  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc--atca-tatag 588  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||  |||| |||||    
T  36769504 ggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatag 36769599  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  36769600 tggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 36769682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 47151167 - 47150977
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  47151167 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47151074 cactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttt 47150977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556057
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4556143  T
Q  570 aacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || | |||||||     |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||    
T  4556142 aaag-aactcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt 4556057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885059
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4884972  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||  ||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4884973 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4885059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 48486113 - 48486299
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||    
T  48486113 tgtgagagttaacttaaaatcaggtc-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactg 48486210  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48486211 gatttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggcacaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 48486299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 653
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489534
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 16489447  T
Q  570 aacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    || |||||||||    ||||||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  16489448 aaagaaactcatatcaatatagtggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatta 16489534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312501
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 15312414  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  15312415 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 15312501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336757
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | || ||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctctt 5336866  T
Q  567 tgt-aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
    ||| || |||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| | | |||||| | ||||||| ||||||  | ||||||||  |||||||||    
T  5336865 tgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttc 5336766  T
Q  664 ttcttcttc 672  Q
    | |||||||    
T  5336765 tccttcttc 5336757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 672
Target Start/End: Original strand, 36771323 - 36771599
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggtt--gattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  36771323 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctctt 36771420  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc--atca-tatag 588  Q
    ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||  |||| |||||    
T  36771421 ggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatag 36771516  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    ||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  36771517 tggaacagagagctgctctctacgccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 36771599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 495
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22801356 - 22801262
Alignment:
Q  102 gtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22801356 gtttctacagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5143327 - 5143263
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5143327 atagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 5198300 - 5198400
Alignment:
Q  165 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgt 263  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||    
T  5198300 ggcaaagctctggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgt 5198399  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  5198400 t 5198400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 9148054 - 9148192
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | || ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  9148054 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-cttcaggaatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 9148151  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9148152 gaaaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggcacgatgg 9148192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623386
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 16623386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 31985663 - 31985726
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31985663 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 576 - 664
Target Start/End: Original strand, 47563021 - 47563109
Alignment:
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  47563021 actcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 47563109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52942999 - 52942869
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  |||||| ||||| | |  ||    
T  52942999 ttaacttaaaatcaggttt-tgcaaaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ctttgaggcaagtcactgaatatttc 52942902  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52942901 gtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgg 52942869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 54867251 - 54867188
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54867251 atagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578668
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attgga 632  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattaga 3578688  T
Q  633 ccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3578687 ccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 13072160 - 13072016
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  13072160 cactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 13072065  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    || |||||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  13072064 aaagaaactcatatcattatagtagaatggagagctgctctctccccca 13072016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 530
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 604 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14789473 - 14789425
Alignment:
Q  604 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14789473 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14789425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24333877 - 24333813
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24333877 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 24333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 25862051 - 25862115
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25862051 atagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 25862115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 652
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22047135 - 22047078
Alignment:
Q  166 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22047135 gcaaggcactggaaaaatc-tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 22047078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 39774335 - 39774389
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 640  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39774335 tagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattggaccgaactg 39774389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Original strand, 1983330 - 1983387
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  1983330 tagtggattggagagctgctatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactgggt 1983387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 639
Target Start/End: Original strand, 34495853 - 34495906
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  34495853 tagtggattggagggctgctctctcccccagagtaagtcatgttggaccgaact 34495906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3777617 - 3777553
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3777617 atagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 3777553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 3796548 - 3796612
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3796548 atagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5147741 - 5147681
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5147741 tggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 664
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133185
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 6133185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630773
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16630773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22048575 - 22048491
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |   |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22048575 tgtgagagttaacttaaaatcaagatccgcaagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttt 22048491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 28468558 - 28468621
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  28468558 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 530
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16639011
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||| ||||||||||| |||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaatgaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctctt 16638924  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||  |||||| |||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16638925 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct--cccagagtaggtcataattagactgaactgggtaaacaaat 16639011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208839
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggt 38208839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942473
Alignment:
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 52942473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937259
Alignment:
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttct 3937259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 5112304 - 5112247
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  5112304 tagtggattggagagctgctctcacccccaaagtagatcatattggaccgaactgggt 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 652
Target Start/End: Original strand, 10114561 - 10114654
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||   |||||||||| ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  10114561 tctctttgtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattaggtaaacaaatt 10114654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 47868288 - 47868365
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| ||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  47868288 cactggaaaaatcgtgccacgattggatctaatcgtgccacgatagtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 47868365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 571
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906843
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 549  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |   |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  550 acccattgatttctctttgtaa 571  Q
    || | ||||| |||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctctttgtaa 54906843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3814088 - 3814029
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3814088 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3814029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5732729 - 5732670
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  5732729 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 9224428 - 9224487
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9224428 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18855791 - 18855732
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18855791 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18855732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  537 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 24742004 - 24741945
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24742004 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24741945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29760705 - 29760646
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29760705 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 29760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 51520521 - 51520462
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  51520521 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-cagaactgggtcaacaa 51520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 652
Target Start/End: Original strand, 22295424 - 22295502
Alignment:
Q  576 actcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22295424 actcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagggcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 22295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 610 - 652
Target Start/End: Original strand, 49088865 - 49088907
Alignment:
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  49088865 cccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 49088907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 619882 - 619841
Alignment:
Q  183 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  619882 tcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctg 619841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 8528918 - 8528963
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8528918 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctggagaatcgtgtcacga 8528963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16689380 - 16689303
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||    
T  16689380 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaataaaaacgtattttt 16689303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 18377426 - 18377369
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | || |||||||||    
T  18377426 tagtggaatggagggctgctctctcctccagagtaggtcatatagaactgaactgggt 18377369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27417070 - 27416965
Alignment:
Q  542 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc-tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 640  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| | |   ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  27417070 ttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa--aaactcattg-atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg 27416974  T
Q  641 ggtcaacaa 649  Q
     ||||||||    
T  27416973 agtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4556494 - 4556422
Alignment:
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttt 248  Q
    |||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  4556494 ggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtatttt 4556422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 5871944 - 5871988
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5871944 tctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 9229215 - 9229274
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  9229215 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 9229274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9927502 - 9927458
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9927502 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12743969 - 12743925
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12743969 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12745358 - 12745314
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12745358 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 24446675 - 24446639
Alignment:
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24446675 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24446639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25614048 - 25613953
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  25614048 tctctttgtaaagaaactcatatcattataatggaaaggagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 25613953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 512 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 38270148 - 38270120
Alignment:
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagactt 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270148 gactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 45347838 - 45347897
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  45347838 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45347897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 45357317 - 45357376
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  45357317 tggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 45357376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 46147435 - 46147391
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46147435 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 47038455 - 47038411
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47038455 tctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 47868192 - 47868240
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  47868192 aaatgtgagagttaacttaaaatcagaattctggagaatcgtgccacga 47868240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043737
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52942881 - 52942841
Alignment:
Q  184 cgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  52942881 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctg 52942841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 183)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1047503 - 1046888
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047503 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 1047404  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047403 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 1047304  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||  ||||        ||||||||||||    
T  1047303 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctg 1047204  T
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1047203 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 1047104  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047103 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 1047004  T
Q  571 acgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttct 670  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||    
T  1047003 acgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctct 1046904  T
Q  671 tctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||    
T  1046903 tctttgtgttcttctc 1046888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 287 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 1049658 - 1049260
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049658 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1049559  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1049558 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 1049459  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1049458 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 1049359  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1049358 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtgttcttct 1049260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 40837105 - 40836707
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837105 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaa 40837006  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837005 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40836906  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40836905 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 40836806  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40836805 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 40836707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351615
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7351695  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351694 tctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 7351615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31156247 - 31155893
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31156247 acttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31156148  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  31156147 agagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattggg 31156048  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156047 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctccc 31155948  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31155947 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 31155893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394311
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38394134  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38394135 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38394234  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38394235 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 38394311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 35555 - 35954
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35555 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 35654  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35655 agacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 35754  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  35755 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 35854  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35855 tagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 35953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457978
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 48457801  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48457802 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctc 48457901  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48457902 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 48457978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349240
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 7349316  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7349315 tctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgcgttcttctc 7349240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 317 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471942
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcc 7472018  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7472017 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctcac 7471942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 44490 - 44889
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||  || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490 gcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44589  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44590 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgag 44689  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  44690 tcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 44789  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44790 tagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 44888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 317 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7469984
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcc 7470060  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7470059 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttctcac 7469984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 3878497 - 3878902
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggt 380  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3878497 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggt 3878596  T
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878597 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagg 3878696  T
Q  481 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactc 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  3878697 attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 3878796  T
Q  580 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgt 679  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  3878797 atcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgt 3878895  T
Q  680 tcttctc 686  Q
    |||||||    
T  3878896 tcttctc 3878902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036049
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg---gaagag 506  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagag 3035869  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 605  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035870 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgct 3035969  T
Q  606 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3035970 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcctc-tcttctttgtgttcttctc 3036049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345866
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggct 18345689  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18345690 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctc 18345789  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18345790 tcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18345866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299785
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 20299606  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20299607 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctc 20299706  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20299707 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctc 20299785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 27306592 - 27306227
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306592 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27306493  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306492 aggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27306394  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  27306393 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 27306294  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  27306293 tagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27306227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724883
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 44724832  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44724833 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44724883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 289 - 688
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542855
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    |||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtc 25542656  T
Q  489 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 588  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25542657 tcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 25542756  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25542757 tggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtttttc-tcttctttgtgttcttctcac 25542855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946653
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggct 40946476  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40946477 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctc 40946576  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40946577 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttcttctc 40946653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297687
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 20297510  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297511 ggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 20297610  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20297611 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcctctttgtgttcttctc 20297687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 355 - 689
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850309
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1850274  T
Q  654 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcact 689  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1850275 ttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttttcact 1850309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626342
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20626189  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20626190 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 20626289  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20626290 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630233
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20630080  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20630081 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 20630180  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20630181 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642652
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20642499  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20642500 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 20642599  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20642600 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 293 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435031
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 31435205  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtg 590  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||    
T  31435204 ggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtg 31435105  T
Q  591 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31435104 gaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31435031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137094
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-cc 20137146  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20137145 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20137094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099459
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 13099613  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13099612 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 13099513  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13099512 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13099459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355550
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccc 11355511  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11355512 tagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 11355550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935349
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 2935169  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag-ttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2935170 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgagagcagatttgttacagtttttgttac 2935269  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 357  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935270 agattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 685
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487877
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 28487701  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||    
T  28487702 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctc 28487801  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28487802 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttcttctt-ttctttgtgttcttct 28487877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330982
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--acgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||     
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattga 42331136  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||    
T  42331135 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctc 42331036  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42331035 ccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42330982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443900
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggga 443747  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-cc 611  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||    
T  443748 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccc 443847  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  443848 ccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 443900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295919
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||| |||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcc 4295972  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  4295971 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttct 4295919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412110
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  416 agtttgtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || ||||| |||||  |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttct 37412110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253481
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaaga 43253662  T
Q  506 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 604  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43253661 ggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 43253562  T
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43253561 tctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 43253481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678358
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |  ||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccc 21678319  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21678320 tagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaatt 21678358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 640
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680307
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactg 640  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||    
T  21680281 cagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681124
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  410 gtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  9681068 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttct 9681124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748899
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||     
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcct 24748847  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  24748848 ccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 24748899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 685
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485889
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 28485714  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||  ||||| |||||||    
T  28485715 ggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctc 28485814  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28485815 t-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattc-tcttctttgtgttcttct 28485889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 593
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757463
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 11757376  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11757377 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 348 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592128
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 547  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttg 21592246  T
Q  548 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    |||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21592245 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 21592146  T
Q  647 caaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  21592145 caaattcttttgtgttct 21592128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990454
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccca 21990404  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21990405 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21990454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027396
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 9027588  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  9027587 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 9027488  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027487 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 22136878 - 22137169
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136878 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22136977  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22136978 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22137077  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137078 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 40551905 - 40552196
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551905 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40552004  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  40552005 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 40552104  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552105 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145971
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| | ||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39145971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 22107867 - 22108158
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107867 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22107966  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22107967 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22108066  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108067 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 40549627 - 40549918
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549627 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40549726  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  40549727 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 40549826  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549827 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223450
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
     |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcc 42223409  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  42223410 cccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaatt 42223450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 315 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832656
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt-tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcc 27832670  T
Q  612 cccagactaggtca 625  Q
    ||||||||||||||    
T  27832669 cccagactaggtca 27832656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 567
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276347
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttt 25276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 287 - 554
Target Start/End: Original strand, 26804499 - 26804765
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804499 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 26804594  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag---ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804595 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 26804694  T
Q  484 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804695 tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 316 - 662
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679361
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  411 tatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 430 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092177
Alignment:
Q  430 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  530 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatt 7092234  T
Q  629 tggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7092233 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 7092177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 321 - 637
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258744
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||     
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca----tatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||   ||    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttca 24258722  T
Q  616 gactaggtcagattggaccgaa 637  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  24258723 gactaggtcaatttggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 439 - 686
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396959
Alignment:
Q  439 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 538  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  539 ttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaac 638  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaac 38396912  T
Q  639 tgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38396913 tgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 38396959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935593
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 2935573  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  2935574 cttcttcttt-tgttcttctc 2935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 430 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094424
Alignment:
Q  430 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  530 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatt 7094481  T
Q  629 tggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7094480 tggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 7094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137404
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22137382  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  22137383 cttcttcttt-tgttcttctcac 22137404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552431
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40552409  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  40552410 cttcttcttt-tgttcttctcac 40552431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108393
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22108371  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  22108372 cttcttcttt-tgttcttctcac 22108393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550153
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 40550131  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  40550132 cttcttcttt-tgttcttctcac 40550153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828716
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaga 22828770  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22828769 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22828716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606704
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 1606684  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  1606685 cttcttcttt-tgttcttctc 1606704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 314 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251641
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||  || |     
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 317 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817362
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  614 cagactaggtcag-attggaccgaact 639  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||    
T  24817388 catactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 467 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027158
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctatgtgttctt 9027178  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttct 685  Q
    ||| ||  || |||||||||    
T  9027177 cttattaattatgttcttct 9027158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 7188496 - 7188833
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||    
T  7188496 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaataaaaatagggtttgtat 7188594  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||    
T  7188595 agggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgaga 7188691  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| |  | |||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  7188692 ctttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttc 7188791  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188792 cccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 390 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813494
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  490 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatca-tata 587  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |  |||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  588 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 314 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091580
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgta 20091780  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || |    
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgag 20091683  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20091682 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcc 20091585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 293 - 479
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567731
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 506
Target Start/End: Original strand, 22392399 - 22392606
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22392399 gcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataa 22392498  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |          ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392499 atc--------aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22392586  T
Q  487 tctcttggttacgggaagag 506  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  22392587 tctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 316 - 559
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465735
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgat 24465735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40837261 - 40837144
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40837261 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 40837162  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40837161 aaaatcgtggcacgatgg 40837144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 3878322 - 3878467
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||    
T  3878322 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 3878420  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3878421 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctg 3878467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332514
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagca-acaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||      
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt-- 6332272  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  ||     
T  6332273 atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattga 6332369  T
Q  512 gactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||    
T  6332370 gactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctc 6332469  T
Q  609 tcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6332470 tcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351536
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  567 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25351536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 452 - 674
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121104
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 548  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  549 aacccattgatttctctttgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtc 644  Q
    ||| ||   || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||     
T  2120980 aactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggta 2121076  T
Q  645 aacaaattactttgtgttcttcttcttctt 674  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  2121077 aacaaatt--cttgtgttcatcttcttctt 2121104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 652
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081803
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatttctctt- 566  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  567 tgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  |||||||  || | ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320049
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324797
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357230
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  567 tgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25357230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410315
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25410315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27306768 - 27306582
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||| || ||    
T  27306768 atgtgagagttaacttaaaataaggttt-tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcattg 27306671  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27306670 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcttcgtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 27306582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 468 - 665
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069976
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tattttgtgttc 7069974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 515 - 664
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394027
Alignment:
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 22394027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 26804345 - 26804462
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||    
T  26804345 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcagtgg 26804443  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26804444 aaaaatcgtggcacgatgg 26804462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074970
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7074882  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| |||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtcatcattagaccgaaccgggtaaacaaat 7074970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378502
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 8378591  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  8378590 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Original strand, 25542280 - 25542425
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||     
T  25542280 atgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaagg-caaggcactt 25542377  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25542378 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 25542425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15540994
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 15541082  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  15541081 tgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 15540994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 665
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247166
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttgt 30247068  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  30247069 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtcatcattagaccaaactgggtaaacaaatta--ttgtgttctt 30247166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297018
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  552 cc-attgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaac 647  Q
    ||  || || |||| |||| || |  |||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaac 16297023  T
Q  648 aaatt 652  Q
    |||||    
T  16297022 aaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006848
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || ||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctctt 42006758  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||    
T  42006759 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatt 42006848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512503
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44512609  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| ||||| |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||    
T  44512608 aaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttatt 44512512  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  44512511 cttcttctt 44512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 509 - 637
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046772
Alignment:
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  607 tctcccccagactaggtcag-attggaccgaa 637  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6046741 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 652
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049166
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 568  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||   || |||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  569 taacgaaactcatc---atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |  |||||||   ||||||||||  |||| | ||||||  |||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||  |||||||    
T  6049079 taaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactaggtagacaaatt 6049166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 512 - 652
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295740
Alignment:
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctct 609  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |   || | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaatt 26295740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010729
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| | ||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggactt-gtgtaaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44010834  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||     
T  44010833 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatta--ttgtgttctc 44010736  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  44010735 cttcttc 44010729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 597 - 686
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759452
Alignment:
Q  597 agggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tctcctttgtgttcttctc 11759452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 35379 - 35565
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  35379 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 35476  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |  || |  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35477 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 35565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 7464697 - 7464496
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||   || || | ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  7464697 cactattaggattgagtctctttgtcacggggagaggctgggactt-gggta-aattaggtttgaagagtgattcttgtaactca---atatctctttgt 7464603  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  7464602 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 7464505  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  7464504 cttcttctt 7464496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 530
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210710
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-g 510  Q
    ||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcg 26210690  T
Q  511 ggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  26210691 ggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 530
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084544
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||   |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt---ctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 11084503  T
Q  490 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||| ||| ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084504 cttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa-actagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  361 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290470
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||     
T  13290723 aaactagggtttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtc 13290629  T
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggatt 594  Q
    || ||||||   | | ||| ||||||||||||||   || || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||| |||      
T  13290628 acaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaac 13290529  T
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     ||| ||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13290528 agagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 44314 - 44459
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||| |  |||   | ||| ||||||    
T  44314 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagtttgacg-caaagcactg 44411  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44412 gaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 44459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 649
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369824
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || ||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctt 21369737  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  21369738 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccgccatagtaggtcatcattggaccgaactgggtaaacaa 21369824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 567
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6348988
Alignment:
Q  491 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttt 6348988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1049816 - 1049699
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggca 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||   |||||| |    
T  1049816 aaatgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaagcaaggta 1049719  T
Q  174 ctggaaaaatcgtggcacga 193  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1049718 ctggaaaaatcgtggcacga 1049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 18567363 - 18567508
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  18567363 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 18567460  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  18567461 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctg 18567508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31435586 - 31435441
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  31435586 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 31435489  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  31435488 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctg 31435441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 561 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 34546972 - 34546857
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactt 656  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |    
T  34546972 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--ct 34546875  T
Q  657 tgtgttcttcttcttctt 674  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34546874 tgtgttcttcttcttctt 34546857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 456 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  555 ttgattt 561  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 585 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143892
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggcagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 44143950  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||  ||||||  |||| |||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  44143949 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagttgctctct-ccccagactaggtca 44143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35960884 - 35960820
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  35960884 atagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848777
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 44848777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067195
Alignment:
Q  477 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac-ga 574  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||  ||||||||||   || |||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||  |     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  575 aactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||| |||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaatt 6067195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 446
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagtaaaa-aagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906264
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaaca 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30906288 tagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 44016916 - 44016640
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttgggaaa--cactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  44016916 aaactagggtttatagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctt 44016819  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca--tcat-atag 588  Q
     || | | ||||||||||||| |||||  |||||||||   || |||  ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||||||||  |||| |||     
T  44016818 agtcatgagaagaggctgggaatttggc-agaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcacatcattataa 44016723  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  44016722 tggaacggcgagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 44016640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 383
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 383  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310160
Alignment:
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21639877 - 21639813
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21639877 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 47263744 - 47263682
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47263744 atagtggattggagagctgctctc--ccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 652
Target Start/End: Original strand, 2075205 - 2075300
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2075205 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 2075300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 49091729 - 49091665
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  49091729 atagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 5817300 - 5817362
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  5817300 tagtggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaa 5817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 23403043 - 23403106
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  23403043 tagtagattggagggctgctcactccctcagattaggtcatattagaccgaattgggtcaacaa 23403106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2058029 - 2057970
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2058029 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 2057970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2479404 - 2479341
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2479404 atagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 2479341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4866794 - 4866735
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4866794 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4866735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16880137 - 16880078
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16880137 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16884993 - 16884934
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16884993 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18408827 - 18408768
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18408827 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19992377 - 19992318
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19992377 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 19992318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 24024347 - 24024406
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24024347 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24024406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 24261344 - 24261403
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24261344 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24261403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 24266223 - 24266282
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24266223 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 24266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 664
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804814
Alignment:
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26804814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21988955 - 21988912
Alignment:
Q  606 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21988955 ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21988912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 40946167 - 40946244
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||    
T  40946167 cactggaaaaatcgtgtcacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacatattttt 40946244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 1533477 - 1533536
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1533477 tggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097867
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12396975 - 12396916
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12396975 tggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 12396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 18126768 - 18126812
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  18126768 tctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18413707 - 18413645
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18413707 atagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18413645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 20357580 - 20357639
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  20357580 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 20357639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21646074 - 21646011
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21646074 atagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 21646011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 21812259 - 21812318
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  21812259 tggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 21812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 30814560 - 30814604
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30814560 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 31109604 - 31109663
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31109604 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 31109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31733013 - 31732969
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31733013 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 40281435 - 40281379
Alignment:
Q  597 agggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  40281435 agggatgctctctcccccagactagttcagtattggacagaactgtgtaaacaaatt 40281379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41649055 - 41649011
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41649055 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 43864368 - 43864412
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43864368 tctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 48489555 - 48489599
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  48489555 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 244)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 686
Target Start/End: Original strand, 50493675 - 50494294
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493675 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 50493774  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg---- 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  50493775 aaaaatcgtggcacgatggagtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 50493874  T
Q  274 -------ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 366  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50493875 aaatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggg 50493974  T
Q  367 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50493975 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 50494074  T
Q  467 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494075 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 50494174  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50494175 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttctt 50494274  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  50494275 cttcttcttt-tgttcttctc 50494294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 6064006 - 6063407
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6064006 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 6063907  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||              
T  6063906 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtggactggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgttacag---------- 6063817  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaa 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6063816 -attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaa 6063718  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063717 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 6063618  T
Q  477 taggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaa 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063617 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaa 6063518  T
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6063517 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttcttctccttcttt 6063418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 38210067 - 38210666
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210067 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38210166  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210167 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatagtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 38210266  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaaca 375  Q
    |||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  ||    |||||||||||||||||||||    
T  38210267 gattt-----------gttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaaca 38210354  T
Q  376 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38210355 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 38210454  T
Q  476 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 574  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38210455 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacga 38210554  T
Q  575 aactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  38210555 aactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcctcttctt 38210654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 667
Target Start/End: Original strand, 25388654 - 25389182
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25388654 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaa 25388753  T
Q  236 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagacc 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25388754 taaaacatatttttgggagcagatttgttacag-----------attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacc 25388842  T
Q  336 ttgtatcaaagcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 426  Q
    ||||||||  || |  ||          |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388843 ttgtatcag-gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 25388941  T
Q  427 tggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaa 525  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25388942 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaa 25389040  T
Q  526 ttaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389041 ttaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtca 25389140  T
Q  626 gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25389141 atttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 25389182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 286 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 6066159 - 6065757
Alignment:
Q  286 agcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6066159 agcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttag 6066060  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066059 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6065960  T
Q  485 -agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca 583  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065959 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca 6065860  T
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 683  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6065859 tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctccttctttgtgttctt 6065760  T
Q  684 ctc 686  Q
    |||    
T  6065759 ctc 6065757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 5191549 - 5191946
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191549 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5191648  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191649 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 5191748  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5191749 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 5191848  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5191849 agtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5191946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 78 - 686
Target Start/End: Original strand, 38889756 - 38890335
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggttt-ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  38889756 atgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattg 38889855  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtt 275  Q
    ||||||||                     ||||||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| |||||           ||||||    
T  38889856 gaaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcaga-----------tttgtt 38889923  T
Q  276 acagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctga 371  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||    
T  38889924 acagattttaagcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctga 38890020  T
Q  372 aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 471  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38890021 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 38890120  T
Q  472 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgta 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38890121 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 38890220  T
Q  571 acgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttct 670  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  38890221 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tct 38890319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 3859424 - 3859804
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859424 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 3859523  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859524 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 3859623  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3859624 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 3859723  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3859724 agtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3859804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458580
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458403 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 458502  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458503 tcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 458580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456203
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456026 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 456125  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456126 tcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 456203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747053
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctc 746973  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746974 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 747053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103858
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 4104034  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4104033 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatct 4103934  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4103933 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 4103858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308264
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 4308416  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4308415 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 4308316  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4308315 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4308264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621491
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  554 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621623 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 10621524  T
Q  654 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621523 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 10621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 11170300 - 11170666
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170300 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11170399  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170400 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11170499  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  11170500 tgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11170599  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11170600 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaatt 11170666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10956388 - 10955989
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956388 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10956289  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10956288 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgag 10956189  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  10956188 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 10956089  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10956088 tagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 10955990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10084754 - 10084351
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  10084754 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttt 10084655  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084654 agaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 10084555  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 581  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||    
T  10084554 cgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcat 10084455  T
Q  582 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttc 681  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10084454 catatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttc 10084356  T
Q  682 ttctc 686  Q
    |||||    
T  10084355 ttctc 10084351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5522976 - 5522589
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522976 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5522877  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||           ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5522876 aggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 5522788  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5522787 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatat 5522688  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5522687 agtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 5522589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51726969
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgaga 51727142  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  51727141 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 51727042  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51727041 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51726969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10958684 - 10958285
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958684 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10958585  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958584 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10958485  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||    
T  10958484 tctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcata 10958385  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10958384 tagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttc-tcttctttgtgttcttct 10958286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18099531 - 18099153
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099531 gcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18099433  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099432 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18099333  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  18099332 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcat 18099233  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18099232 atagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228565
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43228413  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43228414 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 43228513  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  43228514 ccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 43228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 26720444 - 26720842
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720444 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaa 26720543  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26720544 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgag 26720642  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26720643 tttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcata 26720742  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720743 tagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 26720841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22114666 - 22114267
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114666 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 22114567  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114566 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22114467  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  22114466 tctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 22114367  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    || || || |||||| || ||||||||||| || | || |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22114366 taatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttttttgtgttcttct 22114268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18097262 - 18096883
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097262 gcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttaga 18097163  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097162 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18097063  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  18097062 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcat 18096963  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  18096962 atagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttct 18096883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 381 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28412992
Alignment:
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  481 attga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 579  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  580 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattac-tttgtgttcttcttcttctttgtg 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttcttcttcttctttgtg 28413000  T
Q  679 ttcttctc 686  Q
    ||||||||    
T  28412999 ttcttctc 28412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226347
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43226207  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43226208 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 43226307  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43226308 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 43226347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 45882835 - 45883214
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882835 gcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 45882934  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 45883034  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  45883035 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 45883134  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45883135 tagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45883214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917647
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53917799  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53917798 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 53917699  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53917698 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53917647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533719
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaaga 25533556  T
Q  506 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 604  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533557 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 25533656  T
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25533657 tctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 25533719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313683
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggga 1313531  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1313532 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 1313631  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1313632 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990578
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 42990567  T
Q  654 ctttgtgttct 664  Q
     ||||||||||    
T  42990568 ttttgtgttct 42990578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 291 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191274
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgag 10191471  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  10191470 tctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcata 10191372  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10191371 tagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatta--ttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 10191275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006115
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||     
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30006104  T
Q  654 ctttgtgttct 664  Q
     ||||||||||    
T  30006105 ttttgtgttct 30006115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423446
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||     
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccct 43423497  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43423496 gagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43423446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 395 - 686
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321774
Alignment:
Q  395 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 494  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  495 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 593  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  594 tggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 1321774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 314 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604578
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagg 9604748  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9604747 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 9604648  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct-tcttcttcttt 675  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  9604647 tctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttcttt 9604578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 287 - 556
Target Start/End: Original strand, 35777317 - 35777587
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777317 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 35777416  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 556  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421398
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43421398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626666
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcc 1626717  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1626716 cagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1626666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101164
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaat 27101320  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27101319 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctc 27101220  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  27101219 tcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 27101164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 287 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32264404 - 32264035
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264404 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttt 32264305  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264304 agaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32264205  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactca 580  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||    
T  32264204 tgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactca 32264105  T
Q  581 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||    
T  32264104 tcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896475
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactgga 53896655  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  53896654 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgctcttgcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt-----------aca 53896566  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896565 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 24979603 - 24979982
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979603 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24979702  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24979703 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 24979802  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcat 584  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || || | ||||| ||||  |||||||||    
T  24979803 tctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcat 24979902  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24979903 atagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24979982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915479
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53915631  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53915630 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctccc 53915531  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53915530 ccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101985
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 28102036  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  28102035 aaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 28101985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 18162560 - 18162937
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18162560 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttaga 18162657  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162658 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 18162757  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat-ttctctttgt-aacgaaactcatca 583  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||  ||||||||    
T  18162758 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatca 18162857  T
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18162858 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 18162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880434
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctccc 880486  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  880485 ctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 880434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314959
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 3314907  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3314908 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3314959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943632
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggg 51943493  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  51943494 ctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccc 51943592  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51943593 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 51943632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926748
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |  |||||||||||| || |  ||| | ||||||||||||     
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccg 5926798  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5926797 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt-ctttgtgttct 5926748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 48362031 - 48361654
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48362031 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaa 48361933  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48361932 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgag 48361833  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  |||||| |||    
T  48361832 tctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataata 48361733  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48361732 tagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 321 - 606
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 520  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 291 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267958
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  391 aacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtc 12268124  T
Q  489 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 588  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  12268123 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac---------tct-tttgtaacgttactcatcatatag 12268034  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || |   |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12268033 tgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 413 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606568
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctccc 7606623  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7606622 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 7606568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917944
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||| | |||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagaga 35918084  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  35918083 ctgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctc 35917984  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 647  Q
    |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  35917983 tctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 355 - 611
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 15780756 - 15781141
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780756 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15780855  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 475  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780856 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 15780955  T
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg----atttctc-tttgta 570  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||    
T  15780956 ttacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgta 15781055  T
Q  571 acgaaactcatca-tatagtggattggaggg---ctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | |  | | |||| |||||||||  | ||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15781056 aagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15781141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012101
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||| |      
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttctt 36012050  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  36012051 cagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 36012101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148878
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  410 gtatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||| |   |||| |||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctct 47148935  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  47148934 ctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttct 47148878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468436
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||  |||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  613 ccag--actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 53468436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28761762 - 28761422
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28761762 acttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 28761663  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||    
T  28761662 atagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgaga 28761564  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  28761563 ctttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcc 28761464  T
Q  612 cccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||    
T  28761463 cccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaatt 28761422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674749
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
           | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 51674749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 32218991 - 32219359
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218991 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 32219090  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32219091 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 32219179  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgt-aacgaaactcatcat 584  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||  |||||||||    
T  32219180 tctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcat 32219279  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  ||| |||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32219280 atagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 32219359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 314 - 567
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715645
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 39715591  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39715592 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttt 39715645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992544
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt 42992404  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
     |||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  42992405 -ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctc 42992488  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42992489 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttct 42992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889779
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gttgggg 889908  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctccc 889808  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgg 641  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  889807 gcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691569
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||  | || |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||  |  |||||||||||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||| ||||  ||| || ||||| |||| |||||||    
T  54691607 tagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaatt 54691569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633727
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 23633576  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||    
T  23633577 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-cc 23633675  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23633676 ccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttct 23633727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151607
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca-tcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |  ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctc 31151564  T
Q  611 ccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||    
T  31151565 ccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaatt 31151607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 404 - 664
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484634
Alignment:
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  503 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggc 601  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  602 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 664
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886472
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  552 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5886459  T
Q  652 tactttgtgttct 664  Q
    |  ||||||||||    
T  5886460 tcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 452 - 664
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899945
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  552 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 5899932  T
Q  652 tactttgtgttct 664  Q
    |  ||||||||||    
T  5899933 tcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 455 - 686
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168396
Alignment:
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||     
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  654 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttcttc-tcttctttttgttcttctc 11168396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 442 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688143
Alignment:
Q  442 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  542 ttcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 639  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  640 gggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttct 25688143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 348
Target Start/End: Original strand, 5899471 - 5899717
Alignment:
Q  91 cttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggca 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5899471 cttataatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcatggca 5899570  T
Q  191 cgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcag 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5899571 cgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgtatttttggg-----------tacagatttgttacagattttaagcag 5899659  T
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899660 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 315 - 551
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 315 - 649
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||     
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | |||| |||||||| |||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccc 53591406  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  53591407 cagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 314 - 643
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597491
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  || ||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgaga 53597358  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  53597359 ttttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctcc 53597458  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 643  Q
    | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  53597459 cacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 316 - 567
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637199
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   | |||||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggact 23637147  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23637148 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 314 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420189
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 13420321  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||| ||||  |||| |||||||||| |    
T  13420320 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct-c 13420222  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 643  Q
     ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  13420221 accagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 5885983 - 5886242
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaa-cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5885983 tgtgagagttaacttaaaattaggtttttacagaatcgtggcacgattgaagcgcaaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactgg 5886082  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |           ||||||||    
T  5886083 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggtacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgtatttttgggtgcaaa-----------tttgttac 5886171  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886172 agattttaagcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635641
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            ||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ct 27635791  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 27635691  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27635690 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27635641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 412 - 664
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666788
Alignment:
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
       |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 4666788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 321 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871295
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 520  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  521 tagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 618  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |  | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagac 36871330  T
Q  619 taggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871329 taggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagact 539  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 287 - 459
Target Start/End: Original strand, 11163046 - 11163218
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163046 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11163145  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 459  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163146 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 439 - 664
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232074
Alignment:
Q  439 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  539 ttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 636  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||| ||  ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  637 actgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 6232074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  498 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattg 595  Q
    || ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| |  |||||||| |||||||||  |    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  596 gagggctgctctctccc-ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22114842 - 22114656
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22114842 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 22114743  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22114742 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 22114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18099707 - 18099521
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  18099707 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagacactgg 18099609  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18099608 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 18099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 356 - 483
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  356 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795521
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  498 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattg 595  Q
    ||| |||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  |    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  596 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaatt 17795521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 398 - 652
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103961
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  498 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattg 595  Q
    ||| |||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  |    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  596 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaatt 19103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 315 - 567
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884330
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||      
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta-- 54884178  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttt 54884330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 398 - 559
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635549
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  498 cgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 25635549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 35777163 - 35777280
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777163 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 35777262  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35777263 aaaatcgtggcacgatgg 35777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 559
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674140
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  ||||||||||||    ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaagtt-aacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgg 1674092  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674093 gactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 495
Target Start/End: Original strand, 24177175 - 24177380
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24177175 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttaga 24177274  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24177275 tgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 24177370  T
Q  486 gtctcttggt 495  Q
    ||||||||||    
T  24177371 gtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 264
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191559
Alignment:
Q  80 gtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactgga 5191472  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 5191559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 583 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894018
Alignment:
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttctttgtgttct 53894022  T
Q  683 tctc 686  Q
    ||||    
T  53894021 tctc 53894018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 445  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913952
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 29914037  T
Q  570 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 29913952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897210
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10897103  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 10897201  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  10897202 cttcttctt 10897210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 518 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701666
Alignment:
Q  518 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  617 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaatt 47701666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6719489 - 6719396
Alignment:
Q  270 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719489 tttgatacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094073
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10094073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 453 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620457
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  552 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    || ||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  1620557 cctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaa 1620458  T
Q  650 a 650  Q
    |    
T  1620457 a 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18097422 - 18097291
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||  ||    
T  18097422 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcatagg 18097324  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18097323 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggc 18097291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 314 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560401
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||             
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag--------- 4560509  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
      |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||      
T  4560508 --agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggag 4560419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100090
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10100178  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10100090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200953
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10201041  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || || |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10201040 tggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10200953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10956568 - 10956378
Alignment:
Q  74 ataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaagg 171  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  10956568 ataattgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcac-atggctggacatcatggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaagg 10956472  T
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  10956471 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttaggtgcagatttgtt 10956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Original strand, 1321337 - 1321437
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321337 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T
Q  387 a 387  Q
    |    
T  1321437 a 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193410
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54193324  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || ||||| |  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 469 - 664
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307034
Alignment:
Q  469 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  568 gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||| |  |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||||  || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 3307034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7606963 - 7606878
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7606963 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttg 7606878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207999
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10208087  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  10208086 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 10207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878168
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 47878255  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaatt 47878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 427
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  416 agtttgtctctt 427  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22625982
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctctt 22626071  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22626070 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 22625982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 11162891 - 11163008
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  11162891 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 11162989  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11162990 aaaaattgtggcacgatgg 11163008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 54188512 - 54188692
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  54188512 cactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54188607  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  54188608 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54188692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 625
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 6303405  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 509 - 652
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181644
Alignment:
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctc 24181597  T
Q  607 tctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181598 tctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10192521 - 10192401
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10192521 ttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 10192423  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtg 208  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  10192422 ggcacgatgggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612775
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10612862  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10612861 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10612775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544456
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    ||||||    
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 27544368  T
Q  567 tgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  27544369 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 27544456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32264581 - 32264394
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  32264581 atgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcact 32264484  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | |  || || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  32264483 ggatttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 32264394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 583 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919095
Alignment:
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 35919095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 26720268 - 26720413
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  26720268 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 26720365  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26720366 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 26720413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 641
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858718
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 5858639  T
Q  567 tgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgg 641  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  5858640 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgg 5858718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6066210 - 6066144
Alignment:
Q  202 catcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6066210 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaatgtatttttgggagcagatttgttacag 6066144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 506
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419994
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  490 cttggttacgggaagag 506  Q
    |||||| |||| |||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagag 13419994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 495
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27761965
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27762070  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  | ||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  27762069 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 27761972  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  27761971 cttcttc 27761965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10085601 - 10085481
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  10085601 ttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttgagg-caaggcactggaaaaatcgt 10085503  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtg 208  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  10085502 ggcacgatgggatcacatcgtg 10085481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595031
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || |||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10595118  T
Q  570 aacgaaactca--tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10595117 aaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 10595031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 1321161 - 1321347
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  1321161 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 1321258  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  1321259 aaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 1321347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 625
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 11079612  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11079613 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 194
Target Start/End: Original strand, 11170145 - 11170260
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  11170145 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactgg 11170243  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgat 194  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11170244 aaaaatcgtggctcgat 11170260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 576 - 664
Target Start/End: Original strand, 41849245 - 41849333
Alignment:
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41849245 actcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41849333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6066254 - 6066195
Alignment:
Q  137 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066254 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatgg 6066195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719532
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat---ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||    ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcag-tttttaggcaatgcact 6719553  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6719552 ggaaaaatcgtggcacgatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 476 - 652
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535800
Alignment:
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| ||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaaga 4535717  T
Q  575 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcc-cccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4535718 aactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 4535800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949239
Alignment:
Q  472 actattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 570  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgta 10949343  T
Q  571 acgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttc 666  Q
    | |||||||  |||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| | ||||||||   ||||||||| |    
T  10949342 aagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagactgaactggataaacaaatt--cttgtgttctcc 10949245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 3859350 - 3859434
Alignment:
Q  181 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3859350 aatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 3859434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5523152 - 5522966
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  5523152 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctggaggaatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagttttgagg-caaggtactg 5523055  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  5523054 gaaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 5522966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031296
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   | ||||  ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctctttgt 20031402  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatag-tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || |||||||  |||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||   |||||||||    
T  20031401 aaagaaactcatatcattatagttggaacggagagctgctctctccccaagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttct 20031304  T
Q  665 tcttcttc 672  Q
     |||||||    
T  20031303 ccttcttc 20031296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634523
Alignment:
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 522  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  523 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    | ||||||   | ||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttt 14634523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10958767 - 10958674
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  10958767 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgtt 10958674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 585 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 510 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 46966789 - 46966624
Alignment:
Q  510 gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 607  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||    
T  46966789 gggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccct 46966690  T
Q  608 ctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttct 673  Q
    || ||||||| |||||| | ||||||| ||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  46966689 ct-ccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttcttcttcttct 46966624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Original strand, 38002869 - 38003072
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  38002869 aaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 38002964  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| | || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||    
T  38002965 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagatgttctctccctcagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaatt--cttgtgtt 38003062  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    || |||||||    
T  38003063 ctccttcttc 38003072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26299056 - 26298992
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26299056 atagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452962
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 27452962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 36029161 - 36029097
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36029161 atagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25795848 - 25795785
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25795848 tagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 25388618 - 25388663
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388618 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 25388663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 3716021 - 3716085
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3716021 atagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 3859314 - 3859362
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3859314 aaatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacga 3859362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794796
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaa 6794796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 468 - 668
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16997078
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||| ||||||||||||||||   | ||||| |||||| |||  |  | || ||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctctt 16996973  T
Q  567 tgt-aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||||||   ||||||||    
T  16996974 tgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgttc 16997073  T
Q  664 ttctt 668  Q
    |||||    
T  16997074 ttctt 16997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 40592801 - 40592865
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40592801 atagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 47923925 - 47923989
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47923925 atagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 493
Target Start/End: Original strand, 7768554 - 7768672
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaaca--ctagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   ||||||||||||||||  ||| |||| |||  |||||||||||||| |    
T  7768554 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactaaggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacaaactaaggtt-gaga-ttgattcaccttggaa 7768647  T
Q  469 aacactattaggattgagtctcttg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7768648 aacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 530
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31021392 - 31021300
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 493  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | || | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021392 aaaactagggtttgta--gagtttgcc-ctagtcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6066291 - 6066246
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6066291 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaattgtggcacga 6066246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 379  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 435 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Original strand, 25929463 - 25929519
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  25929463 tagtggattggagggctgctctc-cccccagagtaggtcgtattggaccgaactgggt 25929519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 32218836 - 32218912
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttt 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32218836 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatgattgggcaacgtggcacgattggaggttt 32218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 652
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  534 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 631  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  | | ||||||||||||| |||||||||| ||  |||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  632 accgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928683
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26928683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 39040011 - 39040075
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39040011 atagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 40844719 - 40844656
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  40844719 atagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaa 40844656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48362186 - 48362119
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48362186 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgtagaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgat 48362119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 3328376 - 3328439
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  3328376 tagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 535 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823644
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattgga 632  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  | || ||||||||||| || ||| || ||| | ||||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  633 ccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  15823663 ccgaattgggtaaacaaatt 15823644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 652
Target Start/End: Original strand, 1674169 - 1674227
Alignment:
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1674169 ggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 45882752 - 45882806
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  45882752 cactggaaaaatcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctgac 45882806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 584 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390281
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 48390281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4308725 - 4308648
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  4308725 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 4308648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 2671619 - 2671678
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2671619 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 2671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 2672952 - 2673011
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2672952 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2673011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 2677108 - 2677167
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2677108 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2677167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7167308 - 7167249
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7167308 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 7167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 8477426 - 8477367
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8477426 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 8477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 8512281 - 8512222
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8512281 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 8517161 - 8517102
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8517161 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 8517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 8739096 - 8739155
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  8739096 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 8739155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 9091334 - 9091393
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9091334 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9091393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 480 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007544
Alignment:
Q  480 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 578  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||         | |||||||||| | ||||  |||| ||||||| |  |||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  579 catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag 626  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtcag 11007544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18656499 - 18656440
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18656499 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18656440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 22173216 - 22173275
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22173216 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 24695183 - 24695247
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24695183 atagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32475549 - 32475490
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32475549 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32475490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32480407 - 32480348
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  32480407 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 32480348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 40372828 - 40372887
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40372828 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 40372887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 530
Target Start/End: Original strand, 3329896 - 3329954
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3329896 cactattaggattcagttagttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3329954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 632
Target Start/End: Original strand, 3323710 - 3323756
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgga 632  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  3323710 tagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgga 3323756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 345
Target Start/End: Original strand, 13893289 - 13893347
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 345  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893289 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 476 - 625
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893621
Alignment:
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 574  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tcaatatctctttgtaaaga 13893567  T
Q  575 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    |||||  |||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  13893568 aactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagagtaggtca 13893621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9666531 - 9666466
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9666531 atagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27101704 - 27101627
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| || ||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  27101704 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccaagatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 27101627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 27420656 - 27420765
Alignment:
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctct 491  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||  ||| |||| |||||||| | | |||||||    
T  27420656 caacaaaattagggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcacgctggagaaatactattagaactcagtctct 27420750  T
Q  492 tggttacgggaagag 506  Q
    |||| ||||||||||    
T  27420751 tggtcacgggaagag 27420765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35918393 - 35918316
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||  || ||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  35918393 cactggaaaaatcgtagcacgattggatcgaatagtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 35918316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 43228108 - 43228181
Alignment:
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  43228108 ggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 43228181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 625
Target Start/End: Original strand, 4386950 - 4386986
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4386950 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtca 4386986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 23391953 - 23391909
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23391953 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27101594 - 27101558
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101594 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa 27101558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29196430 - 29196386
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29196430 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 29813187 - 29813231
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29813187 tctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaacaa 29813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236293
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32744476 - 32744436
Alignment:
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32744476 tcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 40734622 - 40734666
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40734622 tctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 645
Target Start/End: Original strand, 40735507 - 40735547
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 645  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40735507 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtca 40735547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 174)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 47179428 - 47180028
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47179428 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 47179527  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  47179528 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgcttgcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag---------- 47179617  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaac 374  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  47179618 -attttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaac 47179716  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47179717 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47179816  T
Q  475 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179817 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 47179916  T
Q  574 aaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttct 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47179917 aaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttct 47180015  T
Q  674 ttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||    
T  47180016 ttgtgttcttctc 47180028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 686
Target Start/End: Original strand, 16225895 - 16226483
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225895 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 16225994  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||           |||||||||||||    
T  16225995 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttt-gggtgcagatttg-----------ttacagattttaa 16226082  T
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16226083 gtagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaa 16226182  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16226183 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 16226282  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226283 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 16226382  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226383 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 16226482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 47177078 - 47177677
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47177078 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttt-gggcaagacactgga 47177176  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||              
T  47177177 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacctatttttgggagcagatttgttacag---------- 47177266  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaac 374  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  47177267 -attttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaac 47177365  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47177366 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47177465  T
Q  475 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 573  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177466 attaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 47177565  T
Q  574 aaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttct 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47177566 aaactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttct 47177664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 51749955 - 51750354
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749955 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51750054  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750055 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51750154  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  51750155 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 51750254  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51750255 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 51750353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 28840594 - 28840994
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  28840594 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttag 28840693  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840694 aaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 28840793  T
Q  485 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28840794 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 28840893  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttc 684  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28840894 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttc 28840992  T
Q  685 tc 686  Q
    ||    
T  28840993 tc 28840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 51752281 - 51752678
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51752281 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 51752380  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51752381 aggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgag 51752479  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51752480 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatat 51752579  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51752580 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 51752678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10400193 - 10399794
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400193 gcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10400094  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400093 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10399994  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  10399993 tctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 10399894  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10399893 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 10399795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 13761753 - 13762151
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761753 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaa 13761852  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13761853 aggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgag 13761952  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13761953 tctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 13762052  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13762053 agtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 13762151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302755
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20302501  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  20302502 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactagga 20302601  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  20302602 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccc 20302701  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20302702 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttcttct 20302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735487
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggct 31735664  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31735663 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 31735564  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31735563 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 31735487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 291 - 686
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842809
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtc 28842612  T
Q  489 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 588  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28842613 tattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 28842712  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28842713 tggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 28842809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 315 - 680
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617825
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccct 2617759  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgtt 680  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  2617760 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttc-tcttcattgtgtt 2617825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 15823462 - 15823840
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15823462 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 15823561  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15823562 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgag 15823661  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  15823662 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcata 15823761  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15823762 tagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 287 - 662
Target Start/End: Original strand, 6822931 - 6823306
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822931 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6823030  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6823031 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 6823129  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6823130 tctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 6823229  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6823230 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291771
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcccc 20291699  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20291700 cacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 20291771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463228
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9463289  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9463288 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9463228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459401
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 9459462  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9459461 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttct 9459401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 317 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294800
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  403 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15294984  T
Q  503 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggc 601  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  15294983 agaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggc 15294884  T
Q  602 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15294883 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 15294800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 363 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431671
Alignment:
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  463 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  563 tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc--ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtg 660  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  46431796 tctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 46431697  T
Q  661 ttcttcttcttc-tttgtgttcttctc 686  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46431696 ttcttc-tcttcttttgtgttcttctc 46431671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 317 - 686
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932389
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc-tccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  39932217 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttccc 39932316  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39932317 ccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 39932389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336927
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
     |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggct 27337082  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27337081 gtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 27336982  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27336981 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27336927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 13214997 - 13215368
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214997 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13215096  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13215097 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 13215196  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcat 581  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    ||||||    
T  13215197 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcat 13215296  T
Q  582 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13215297 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaatt 13215368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 314 - 688
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325980
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 24325797  T
Q  506 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 604  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || | | ||||||    
T  24325798 ggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgc 24325897  T
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24325898 tctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctcac 24325980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339118
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggct 27339273  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27339272 gagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctct 27339173  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  27339172 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 27339118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302492
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 12302649  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12302648 tgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 12302549  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12302548 ctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 12302492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906564
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 47906406  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  47906407 ttggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctc 47906506  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47906507 tctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 47906564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324623
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 17324775  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  17324774 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 17324675  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17324674 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17324623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 38925843 - 38925468
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38925843 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaa 38925744  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38925743 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 38925644  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  38925643 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 38925544  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
      ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  38925543 --gtaaaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 38925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307545
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 50307585  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50307584 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 50307545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 39462435 - 39462813
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39462435 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaa 39462534  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462535 atgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 39462634  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  | ||||||||    
T  39462635 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcata 39462734  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39462735 tagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 39462813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 41646836 - 41647202
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 41646935  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646936 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 41647035  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  41647036 tcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 41647135  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41647136 tagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41647202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428948
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 16428795  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| | ||||| |  |||||||||||||||||    
T  16428796 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcc 16428895  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16428896 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 16428948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggg 21948328  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21948327 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 21948228  T
Q  612 cc 613  Q
    ||    
T  21948227 cc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510309
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatt 2510467  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  2510466 tggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctc 2510368  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2510367 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 2510309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186114
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctccc 17186166  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  17186165 ccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttct 17186114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457462
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccc 11457513  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  11457512 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 11457462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 293 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14097956
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 14098130  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt-aacgaaactcatcatatagtg 590  Q
    ||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  14098129 ggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtg 14098030  T
Q  591 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     |  |||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14098029 aaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14097956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995687
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 6995839  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||     
T  6995838 ctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcct 6995739  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6995738 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 6995687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28207431 - 28207055
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207431 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 28207332  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28207331 agacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtg 28207232  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||| |||||||  |||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||  |    
T  28207231 tctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--a 28207134  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28207133 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998240
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||     
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 28998392  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || ||||||||    
T  28998391 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctccc 28998292  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28998291 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28998240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003956
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||     
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 29004108  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||| ||||  ||||||||||| ||| |   ||||| || ||||||||    
T  29004107 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctccc 29004008  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29004007 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 29003956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076659
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-cc 50076711  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50076710 ccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 50076659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241084
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 9241226  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  9241225 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 9241126  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  9241125 ccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaatt 9241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 438 - 686
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231878
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 536  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  537 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 16231829  T
Q  637 actgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231830 act-ggtcaacaaatatctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 16231878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 291 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579606
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtc 3579780  T
Q  489 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatata 587  Q
    ||||| |||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| ||    
T  3579779 tcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-ta 3579681  T
Q  588 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||| |  ||| |  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3579680 gtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839870
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   |||||||||||| ||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 18839870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078807
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  | |||||| |||||||||   || ||||||||||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccc 50078859  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||    
T  50078858 ccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttct 50078807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307403
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| |||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccc 18307352  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||    
T  18307353 cagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttct 18307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251261
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  ||| |||| ||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25251261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949219
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||     
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgggg 2949370  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  2949369 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 2949270  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2949269 cc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2949219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756810
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  414 agagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct- 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| | |||||||||     
T  6756668 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctc 6756767  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6756768 cccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaatt 6756810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 592
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665400
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cgggaagag 506  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagag 48665313  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgga 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  48665314 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131362
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg-actttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccca 4131478  T
Q  555 ttgat----ttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |||||    |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||    
T  4131477 ttgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaaca 4131378  T
Q  649 aattactttgtgttct 664  Q
    ||||  ||||||||||    
T  4131377 aattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 336 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425002
Alignment:
Q  336 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaaca 434  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag---tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  532 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagatt 629  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaattt 31425037  T
Q  630 ggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31425036 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128167
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||| || |  |||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaatt 25128155  T
Q  653 actttgtgttct 664  Q
      ||||||||||    
T  25128156 cttttgtgttct 25128167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319181
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| | |  |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| |||    
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccc 17319130  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17319131 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 287 - 567
Target Start/End: Original strand, 6823800 - 6824088
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823800 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6823899  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6823900 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattga 6823999  T
Q  486 gtctctt-------ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
     ||||||       ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824000 atctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490206
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccc 31490155  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||    
T  31490156 cagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttct 31490206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 287 - 647
Target Start/End: Original strand, 47451564 - 47451919
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47451564 gcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaa 47451663  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||    
T  47451664 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgag 47451757  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||    
T  47451758 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 47451857  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 647  Q
    ||||| |  | | | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47451858 tagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 353
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783533
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 23783337  T
Q  179 aaaatcg---------------------tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcag 257  Q
    |||||||                     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23783338 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcag 23783437  T
Q  258 atttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 353  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783438 atttgttacagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 463 - 686
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757845
Alignment:
Q  463 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  563 tctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgtt 51757822  T
Q  663 cttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  51757823 cttc-tcttctttgtgttcttctc 51757845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248557
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |   || || ||  ||||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcc 50248610  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  50248609 cctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 50248557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324346
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  ||| ||||| ||||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccc 17324306  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  17324307 catgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 17324346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786154
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttccttgtgttctt 23786134  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23786135 cttcttcttt-tgttcttctc 23786154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 106 - 411
Target Start/End: Original strand, 16231368 - 16231641
Alignment:
Q  106 ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                         
T  16231368 ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatc--------------------- 16231446  T
Q  206 gtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattt 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231447 gtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttg-----------ttacagattttaagcagatttgttacagattt 16231535  T
Q  306 taagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16231536 taagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagg 16231635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 314 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422958
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgag 31423013  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31423012 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttt 31422958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183589
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aatgcaaca--caaactagggtttgtata 14183827  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | | |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  613 ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 42922177 - 42922514
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  42922177 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 42922275  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  42922276 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 42922372  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |    
T  42922373 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgc 42922472  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922473 ccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 364 - 664
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134239
Alignment:
Q  364 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 463  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  464 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 563  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  564 c-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgt 661  Q
    | ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||    
T  40134137 cttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgt 40134236  T
Q  662 tct 664  Q
    |||    
T  40134237 tct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 314 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347284
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  || |    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgag 8347413  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| |||||| ||    
T  8347412 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttc 8347313  T
Q  611 ccccagactaggtcag-attggaccgaac 638  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  8347312 ccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 314 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669418
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggag-gcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 15669535  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||    
T  15669534 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctct 15669435  T
Q  610 cccccagactaggtcag 626  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15669434 ccccgagactaggtcag 15669418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 362 - 664
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432690
Alignment:
Q  362 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcac 461  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  462 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 561  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  562 ctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttg 658  Q
    ||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800570
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaagt-caacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | | |    
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaa 18800712  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||  |||||||||||    
T  18800711 ctttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcc 18800612  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800611 cccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349049
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||  | ||||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggac 8349190  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  8349189 tttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccc 8349090  T
Q  613 ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | |||||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  8349089 caagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt 8349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 51752104 - 51752291
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51752104 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51752203  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  51752204 aaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 51752291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 13761577 - 13761763
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13761577 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 13761676  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13761677 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 13761763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 456 - 664
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429252
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 555  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  556 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  654 ctttgtgttct 664  Q
     ||||||||||    
T  16429242 ttttgtgttct 16429252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 438 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  538 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 635  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | ||||||| |  ||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  636 aactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495209
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| |||||  ||||     
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattgggg 49495350  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  | ||||||  |||||||    
T  49495349 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctcc 49495250  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||| ||||  || ||||||||| ||| || |||||    
T  49495249 ccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaatt 49495209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 51749778 - 51749965
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51749778 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51749877  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  51749878 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 51749965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 512 - 664
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816180
Alignment:
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23816180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 321 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125455
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 519  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  520 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccag 616  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |||||      
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  617 actaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125491 actaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 451 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115089
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 550  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  551 cccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    || |||||| ||||||| ||||    ||||||||| |||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  649 aattactttgtgttct 664  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttct 6115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 6823643 - 6823810
Alignment:
Q  99 caggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggg 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6823643 caggtttttgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggg 6823742  T
Q  198 gtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6823743 gtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 6823810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 20302198 - 20302385
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20302198 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 20302297  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20302298 aaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgtt 20302385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 6822775 - 6822893
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6822775 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 6822874  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6822875 aaaaatcgtggcacgatgg 6822893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 27916440 - 27916780
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||    
T  27916440 acttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaagc-cagcaagaaaactagggtttg 27916538  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 510  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||    
T  27916539 ta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattg 27916633  T
Q  511 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatttctctttgtaacgaaactcatc-atatagtggattggagggctgctc 606  Q
     |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  27916634 tgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctc 27916733  T
Q  607 tctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916734 tctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 321 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520206
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || ||||||||||  ||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  513 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10400369 - 10400183
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||    
T  10400369 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 10400271  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10400270 aaatatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 10400183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353345
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 21353430  T
Q  570 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaatt 21353345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 30790759 - 30790401
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  30790759 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 30790660  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30790659 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 30790569  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca 583  Q
    |||| ||||||||| ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    
T  30790568 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatca 30790469  T
Q  584 -tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaa 650  Q
     ||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  30790468 ttatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 686
Target Start/End: Original strand, 13358779 - 13358888
Alignment:
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  13358779 actcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcttt 13358877  T
Q  676 gtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||    
T  13358878 gtgttcttctc 13358888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401198
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2401305  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  2401304 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 2401207  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  2401206 cttcttctt 2401198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 15823285 - 15823430
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||    
T  15823285 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcact 15823382  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 223  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15823383 agaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgct 15823430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738625
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||||||||  ||     
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaacaaaaaaac-aaactagggtt--tag 30738867  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||| || |||||  ||   | ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  30738866 agagatt-tctctaagcgggagacactaggg-ttga-gattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattggga 30738770  T
Q  514 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca---tatagtggattggagggctgctctc 608  Q
     ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||||   ||||||| |  |||||| |||||||    
T  30738769 ttttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctc 30738670  T
Q  609 tcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  30738669 tcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232774
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2232692  T
Q  567 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||||    | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  2232693 tgtaaagaaactcat----tcgtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2232774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 26613577 - 26613237
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaaca-aaactagggtttg 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || || | ||| ||||||||     
T  26613577 cttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaagaaaaaaaaaacaaattagggttt- 26613479  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 510  Q
     | |||| || |||||  ||   | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  ||    
T  26613478 -agagagatt-tctctaagcgggagacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattg 26613383  T
Q  511 ggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctct 607  Q
     | |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || |  ||| ||||| ||||||||   ||| ||| ||||    
T  26613382 aggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctct 26613283  T
Q  608 ctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26613282 ctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaacaaatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Original strand, 20291279 - 20291386
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  20291279 atgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactg 20291378  T
Q  177 gaaaaatc 184  Q
    ||||||||    
T  20291379 gaaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 453 - 613
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  552 ccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |  ||| | ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  155888 cttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 450 - 652
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||  || |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  549 aacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtca 645  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||| | ||||||    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  646 acaaatt 652  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526650
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 9526564  T
Q  570 aacgaaact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || ||||||   |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9526565 aaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 28840426 - 28840604
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||     
T  28840426 ttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtactggaaaaatt 28840523  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  28840524 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 28840604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 394 - 652
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279551
Alignment:
Q  394 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagt 589  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||||| |  |||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T
Q  590 ggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| | ||| | || ||| |||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  28279487 ggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatt 28279551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 28842241 - 28842373
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  28842241 ttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtactggaaaaatc 28842338  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtg 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28842339 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtg 28842373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144662
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || | ||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatatctt 4144770  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  4144769 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgtt 4144672  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    || |||||||    
T  4144671 ctccttcttc 4144662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393260
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2393366  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||||||    
T  2393365 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaatt--cttgtgttctt 2393269  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  2393268 cttcttctt 2393260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134274
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 25134169  T
Q  570 aacgaaactcat---catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||||     |||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||| ||||||||   |||||||||     
T  25134170 aaagaaactcatataattatagtggaacggagagctgttctctcccccatactagatcatcattagaccgaagtgggtaaacaaatt--cttgtgttctc 25134267  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  25134268 cttcttc 25134274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521899
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 9521813  T
Q  570 aacgaaact--catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || ||||||   |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9521814 aaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcgtcattagaccgaactgggtaaacaaat 9521899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13598466 - 13598402
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13598466 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 585 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 26644930 - 26644990
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26644930 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
      || ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 c-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 3281773 - 3281715
Alignment:
Q  588 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3281773 gtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 543 - 652
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  543 tcttgtaacccattgatttctctttg-taacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc-agattggaccgaact 639  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||| |  |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  640 gggtcaacaaatt 652  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 513 - 673
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783350
Alignment:
Q  513 actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    ||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  611 ccccagactaggtc-agattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttct 673  Q
    | ||||| || ||| | |||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaatta--ttgtgttcttcttcttct 46783350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775676
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  775739 tagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 775676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 528  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 32889506 - 32889443
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  32889506 tagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 32889443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604716
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 13604716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 530
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 13447296 - 13447239
Alignment:
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13447296 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttctc 13447239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38925996 - 38925915
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38925996 tgagagttaacttaaaatcaggttcc-gcagaaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 38925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13449996 - 13449919
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  13449996 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggtagataaaaataaaacgtattttt 13449919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 19358872 - 19358935
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19358872 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19358935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 19361461 - 19361524
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19361461 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 19380101 - 19380164
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  19380101 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatatt-gactgaactgggtcaacaa 19380164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 24202798 - 24202861
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24202798 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31422915 - 31422859
Alignment:
Q  596 gagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31422915 gagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaatt 31422859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 47451405 - 47451488
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47451405 tgtgagagttaacttcaaatcagattt-tgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcagtttt 47451488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28207500 - 28207421
Alignment:
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28207500 tggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtttttttgggtgcagatttgtt 28207421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30790848 - 30790749
Alignment:
Q  166 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||  | |||||||||||    
T  30790848 gcaagtcactggaaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgtt 30790749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 39462257 - 39462402
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||| || |    
T  39462257 atgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtgacacaatggttgggcaacgtggcacgattagaggtttcag-ttttgaggcaagtcagt 39462354  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 223  Q
    |||    ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  39462355 ggatttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgct 39462402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13215007
Alignment:
Q  112 aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||||    |||||||| |||||| |  || ||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcatgatgggattgcaacgtggc 13214952  T
Q  211 acgatggtgcgctgac-ggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||| | || | | | | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13214953 acgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 13215007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14098510 - 14098441
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatgg 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  14098510 tgtgagagttaacttaaaatcagatt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaccgtggcacgatgg 14098441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 530
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104318
Alignment:
Q  457 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattagg 43104318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Original strand, 16431044 - 16431096
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431044 acttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 25445110 - 25445169
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  25445110 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25445169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 39445564 - 39445505
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  39445564 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39445505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 44023894 - 44023953
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44023894 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44023953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 49687301 - 49687384
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  49687301 tgtgagagttaacttaaaatcaggtta-tgtagaaatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt 49687384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 495
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959172
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggt 49959172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 595 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 13127743 - 13127685
Alignment:
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127743 ggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 450
Target Start/End: Original strand, 14352978 - 14353034
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 450  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14352978 caacaacaaaactagggtttgtagaga---tttctcttggcaacaaacacta-ggtttgag 14353034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 607 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104131
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 1055032 - 1055091
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1055032 tggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 1055091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 3156989 - 3157033
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3156989 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4552681 - 4552637
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4552681 tctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22819494 - 22819438
Alignment:
Q  588 gtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  22819494 gtggattggagggctactctctccccccagagtaggtcatattggaccaaattgggt 22819438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28223465 - 28223421
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28223465 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 31659362 - 31659406
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31659362 tctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41390645 - 41390586
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||||||    
T  41390645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgatctgggtcaacaa 41390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41398300 - 41398241
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | || ||||||||||||    
T  41398300 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 41398241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 43988485 - 43988544
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  43988485 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtaaacaa 43988544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 181)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 675
Target Start/End: Original strand, 31542442 - 31543039
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542442 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31542541  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31542542 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttgttac 31542641  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542642 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 31542741  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542742 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31542841  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |    
T  31542842 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagta 31542940  T
Q  577 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31542941 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttgttcttcttt 31543039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 674
Target Start/End: Original strand, 31544798 - 31545384
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544798 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31544897  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||               
T  31544898 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttattac----------- 31544986  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31544987 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaag 31545086  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545087 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31545186  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 576  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  31545187 aggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagta 31545286  T
Q  577 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31545287 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttctt 31545384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 31179897 - 31179337
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31179897 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgggtaaaaa 31179798  T
Q  236 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttt------------gttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttacta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31179797 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacaaatttaaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttacta 31179698  T
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 423  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179697 taaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 31179598  T
Q  424 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 522  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31179597 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 31179498  T
Q  523 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179497 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 31179398  T
Q  623 tcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31179397 tcagattggaccgaactgggtcaacaaatt--tctgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 31179337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 38882021 - 38882402
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882021 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 38882120  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882121 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38882220  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38882221 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 38882320  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38882321 tagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 38882402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 25921836 - 25921437
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 25921737  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25921736 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgag 25921637  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  25921636 tctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 25921537  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25921536 tagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 25921438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 2174835 - 2175215
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174835 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2174934  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2174935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 2175034  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  2175035 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatat 2175134  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2175135 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 2175215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552561
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  554 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15552429 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 15552528  T
Q  654 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552529 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 15552561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 287 - 688
Target Start/End: Original strand, 4236545 - 4236945
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4236545 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 4236644  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4236645 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 4236744  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  4236745 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 4236844  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4236845 tagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttcttc-tcttatttgtgttcttct 4236942  T
Q  686 cac 688  Q
    |||    
T  4236943 cac 4236945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529062
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 10529236  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  10529235 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctccc 10529136  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-actttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10529135 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 10529062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 316 - 686
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466999
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctc 18466924  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18466925 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18466999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854777
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaa 39854625  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39854626 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 39854725  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  39854726 ccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 39854777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 21947943 - 21948320
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21947943 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 21948041  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948042 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 21948141  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  21948142 tctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcata 21948241  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21948242 tagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 21948320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 289 - 664
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776451
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  388 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 16776274  T
Q  488 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||    
T  16776275 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatat 16776373  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16776374 agtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 21684824 - 21684416
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  21684824 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 21684725  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  21684724 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 21684625  T
Q  477 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  21684624 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaata 21684525  T
Q  577 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttg 676  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  21684524 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttc-tcttttttg 21684426  T
Q  677 tgttcttctc 686  Q
    ||||||||||    
T  21684425 tgttcttctc 21684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912851
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagg 27912672  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||||||    
T  27912673 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctc 27912772  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912773 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27912851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2818699 - 2818320
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818699 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2818600  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2818599 aggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattga 2818500  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||||    
T  2818499 gtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 2818400  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2818399 atagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 2818320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469324
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18469149  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  | || |||||||||    
T  18469150 gggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctc 18469249  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18469250 t--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 18469324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477017
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  553 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34477149 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34477050  T
Q  653 actttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
       ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34477049 ctcttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 34477017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 314 - 675
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747608
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgg 6747445  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6747446 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctct 6747545  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6747546 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc-tcttcttcttt 6747608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745362
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  6745252 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 6745351  T
Q  654 ctttgtgttct 664  Q
     ||||||||||    
T  6745352 ttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479382
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  553 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34479514 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 34479415  T
Q  653 actttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34479414 cttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 34479382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 355 - 686
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804339
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||     
T  25804209 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattc 25804307  T
Q  654 ctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25804308 ttttgtgttctt-gtcttctttgtgttcttctc 25804339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910747
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagg 27910586  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  27910587 ctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctc 27910686  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27910687 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 27910747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511197
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 18511248  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18511247 tagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18511197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 660
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221813
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggga 40221664  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40221665 cttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 40221764  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtg 660  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40221765 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtg 40221813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904397
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 25904346  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25904347 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttct 25904397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098025
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggga 26097874  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||   || |||||||||||||     
T  26097875 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcct 26097973  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26097974 ccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 26098025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127150
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24127099  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24127100 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24127150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509303
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| |  ||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||     
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccct 18509353  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18509352 agactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18509303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073166
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 17073166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 438 - 667
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410319
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 537  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  538 cttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 637  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 4410289  T
Q  638 ctgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4410290 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4410319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472585
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccc 31472649  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct-tcttcttcttt 675  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  31472648 ccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttcttt 31472585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189592
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 607  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |||||||||  |||||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  608 ctcc-cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474308
Alignment:
Q  318 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 517  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  518 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccag 616  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||     
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccat 10474356  T
Q  617 actaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10474355 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10474308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15355065 - 15354777
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355065 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15354966  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  15354965 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 15354866  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 355  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354865 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15357341 - 15357053
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357341 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15357242  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  15357241 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 15357142  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 355  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357141 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 352
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757245
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756960 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10757059  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  10757060 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 10757159  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 352  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757160 aaatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 314 - 663
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596939
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 18596787  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||    
T  18596788 ctttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 18596887  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  18596888 tccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705777
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||     
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 37705917  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  | | ||||  ||||||||    
T  37705916 ttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctccc 37705817  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37705816 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 37705777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092184
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||  |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||    
T  16092295 ttgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaatt 16092196  T
Q  653 actttgtgttct 664  Q
      ||||||||||    
T  16092195 cttttgtgttct 16092184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 323 - 664
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954710
Alignment:
Q  323 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  423 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 521  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  522 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactag 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactag 2954667  T
Q  622 gtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2954668 gtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2954710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 36402690 - 36402313
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402690 gcagatttgtt-caaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 36402592  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  36402591 tgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaa 36402492  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  36402491 tctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 36402392  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |   || | |||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  36402391 tagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 36402313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 6756437 - 6756786
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756437 acttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 6756536  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  6756537 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgaga 6756636  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| |  || ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||    
T  6756637 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagt-gaaacgagggctgctctctcc 6756733  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||    
T  6756734 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttct 6756786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 351
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749767
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10749604  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          
T  10749605 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttt------ 10749698  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 351  Q
      | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749699 --tgtta--cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 358
Target Start/End: Original strand, 23664833 - 23665125
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23664833 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23664932  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt-------- 269  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            
T  23664933 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23665032  T
Q  270 ----tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
        ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665033 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23793754 - 23793462
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23793754 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23793655  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt-------- 269  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            
T  23793654 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23793555  T
Q  270 ----tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
        ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793554 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31466341 - 31465986
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  31466341 gcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaa 31466242  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31466241 aagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgag 31466142  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||||||||    
T  31466141 tctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcata 31466043  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |          |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  31466042 t----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 31465986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 393 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658341
Alignment:
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  493 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtgg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  592 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |  ||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 658341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 315 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530749
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttt 34530749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587129
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  411 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
         |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |    
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagatt 10586970  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10586971 gagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 10587070  T
Q  610 -cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10587071 ccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttct 10587129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696172
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
              ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  | |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 696172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 467 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373111
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 3373121  T
Q  666 cttcttcttt 675  Q
    ||||||||||    
T  3373120 cttcttcttt 3373111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 322 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818477
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 521  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  522 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 620  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||| ||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaacta 17818521  T
Q  621 ggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17818520 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 288 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12556285 - 12555908
Alignment:
Q  288 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12556285 cagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaat 12556186  T
Q  388 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12556185 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgt 12556086  T
Q  488 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  12556085 ctcttggctacgggaaga-gattggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatctta 12555987  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     || | |  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  12555986 aagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 12555908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397978
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccc 39398030  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  39398029 acagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 315 - 533
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgg 533  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 23667109 - 23667400
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23667109 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23667208  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  23667209 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 23667308  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667309 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34477632 - 34477379
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34477632 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34477533  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||           |||    
T  34477532 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgtt-----------aca 34477444  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477443 gattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10750014
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-ctttgtgttctt 10749994  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10749995 cttcttcttt-tgttcttctc 10750014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 529
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  515 tttgggtagaattag 529  Q
    ||||| |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354537
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15354559  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15354558 cttcttcttt-tgttcttctcac 15354537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665360
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23665338  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  23665339 cttcttcttt-tgttcttctcac 23665360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793227
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 23793249  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  23793248 cttcttcttt-tgttcttctcac 23793227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356813
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 15356835  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  15356834 cttcttcttt-tgttcttctcac 15356813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757490
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaatt-ctttgtgttctt 10757470  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10757471 cttcttcttt-tgttcttctc 10757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 322 - 652
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289043
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  422 tctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||      ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccca 21289006  T
Q  616 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  21289007 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 21289043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 450 - 667
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798344
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  550 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  649 aattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttcttct 39798344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 320 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  320 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 519  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || || |||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  520 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccaga 617  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |   ||||| || ||||||||  ||| | |||||||||||| ||||    
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcaga 6661217  T
Q  618 ctaggtcaga-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  6661216 ctaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 474 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741821
Alignment:
Q  474 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 572  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  573 gaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    |  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttcttcttcttc 23741836  T
Q  673 tttgtgttcttctcac 688  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23741835 ttt-tgttcttctcac 23741821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 467 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960096
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 38960116  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttct 685  Q
    ||| ||  || |||||||||    
T  38960115 cttttttcttttgttcttct 38960096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 449 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505828
Alignment:
Q  449 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  549 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 647  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  648 aaattactttgtgttct 664  Q
    |||||  ||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttct 20505828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 438 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  538 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 636  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  637 actgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 314 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098395
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38960604 - 38960334
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960604 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38960505  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||                     ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  38960504 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgttggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 38960426  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960425 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 433 - 664
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724187
Alignment:
Q  433 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  533 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattgg 631  Q
    || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  632 accgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2724187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34479972 - 34479740
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34479972 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34479873  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||                     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  34479872 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcaga-----------tttgttaca 34479805  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479804 gattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 316 - 664
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020514
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggttt-gggaggcaac-acaaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||      
T  9020265 agagtt--gctcttggcaacaaacactagggttgaa--gttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcc 9020460  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     ||| | |||||| |  |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||    
T  9020461 tccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 38881845 - 38882031
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38881845 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcactgg 38881943  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38881944 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 38882031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 664
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054131
Alignment:
Q  358 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 457  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  458 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  558 atttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattac 654  Q
    || |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||      
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208858
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||  || ||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  514 ctttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  || |||||||||| |     
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-tt 36208816  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36208817 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36208858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20507798 - 20507659
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  20507798 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtat 20507699  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 453  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507698 agagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2174797
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 2174779  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2174780 aaaatcgtggcacgatgg 2174797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25922002 - 25921874
Alignment:
Q  69 ccaacataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggc 167  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25922002 ccaacaaatatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggc 25921903  T
Q  168 aaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921902 aaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 25921874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667635
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||  |||||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattcctgtgcgtcctt 23667613  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    ||||||| || ||||||||||||    
T  23667614 cttcttcgtt-tgttcttctcac 23667635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 4236378 - 4236515
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4236378 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttaaggcaaggcactggaaaaatcg 4236476  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4236477 tggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 4236515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 371 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 568  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  569 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaac 638  Q
    ||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Original strand, 39797841 - 39797966
Alignment:
Q  71 aacataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaag 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  39797841 aacataactgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaag 39797940  T
Q  171 gcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  39797941 gcaccggaaaaatcatggcacgatgg 39797966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385450
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 411
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  410 gt 411  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 453 - 652
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143750
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  552 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  || | |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaaca 15143746  T
Q  649 aatt 652  Q
    ||||    
T  15143747 aatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 473 - 652
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445681
Alignment:
Q  473 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  572 cgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25445681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673019
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 22673019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 259 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23742157 - 23742057
Alignment:
Q  259 tttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaa-gcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 357  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23742157 tttgttacagatttgttacaaattttaggcagatttgttataggttttaaagcaggacttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgag 23742058  T
Q  358 a 358  Q
    |    
T  23742057 a 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 539
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770934
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || |    
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgag 42770907  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagact 539  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770908 actttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841228
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17841333  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||     
T  17841332 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatta--ttgtgttctc 17841235  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  17841234 cttcttc 17841228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452680
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || |||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgt 25452593  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25452594 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25452680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 16775897 - 16776042
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  16775897 tgtgagaattaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 16775994  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16775995 aaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 16776042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2297999
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2298088  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    | ||| |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2298087 tataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2297999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144570
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-ga 468  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  469 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||||||||   || || |||||    
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctct 2144647  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactg 640  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||   ||| ||||||||||||||    
T  2144646 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcaaactaaaccagtattggaccgaactg 2144570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18186590 - 18186504
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18186590 aaatgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 18186504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786589
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||   | ||| | ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctctttgt 28786502  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28786503 aaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 28786589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 659713 - 659829
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    |||||| |||||    
T  659713 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttga--ggcaagtcactg 659809  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  659810 gaaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21684969 - 21684905
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21684969 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 674
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240633
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 1240523  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||  |||||||| ||| || |||||   |||||||    
T  1240524 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtcatcattaaaccgaactaggtaaataaatt--cttgtgtt 1240621  T
Q  663 cttcttcttctt 674  Q
    ||||||||||||    
T  1240622 cttcttcttctt 1240633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21684909 - 21684811
Alignment:
Q  170 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  21684909 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttaca 21684811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898013
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttg 568  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  569 taacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |  |||||||| ||||| |||   | |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt 4898013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 530
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 525
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaa 525  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 17003989 - 17004053
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17003989 atagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20504452 - 20504369
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20504452 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttagtttt 20504369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962412
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 11962517  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||| ||||   ||| |||||||||| || || |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||     
T  11962516 aaagaaactcatatcattataatggaacagagagctgctctcttcctcatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctc 11962419  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  11962418 cttcttc 11962412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 497 - 567
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771006
Alignment:
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttt 42771006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19588814 - 19588750
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19588814 atagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 31300626 - 31300689
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31300626 tagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36402845 - 36402762
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  36402845 tgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaatctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcagtttt 36402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 42127440 - 42127503
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  42127440 tagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 42127503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 672
Target Start/End: Original strand, 42238298 - 42238463
Alignment:
Q  506 ggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggc 601  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||    
T  42238298 ggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagc 42238393  T
Q  602 tgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  42238394 tgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 42238463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033714
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagag 34033714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 474 - 653
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222951
Alignment:
Q  474 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 572  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||||     
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaa 40222864  T
Q  573 gaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctct--cccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||  |||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  40222865 gaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccccatactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatta 40222951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31179933 - 31179888
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179933 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 31179888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 12084204 - 12084268
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12084204 atagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaa 12084268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14520298 - 14520234
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14520298 atagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20508001 - 20507918
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20508001 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagtttt 20507918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 21947770 - 21947853
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21947770 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt 21947853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 565 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098285
Alignment:
Q  565 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaatt 26098285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Original strand, 10627364 - 10627569
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||| | |||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || ||||||    
T  10627364 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc-tgaatatctctt 10627461  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||  ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||   |||||||    
T  10627462 tgtaaataaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtcatcattagactgaactgggtaaacagatt--cttgtgtt 10627559  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    || |||||||    
T  10627560 ctccttcttc 10627569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31466496 - 31466379
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgca-gaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| || |||| || || |  |||||| |||||    
T  31466496 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcag-ttatgaggcaagtcactg 31466399  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31466398 gaaaaatcttggcacgatgg 31466379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445263
Alignment:
Q  541 attcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaa 637  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaa 15445278  T
Q  638 ctgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||| ||||||||    
T  15445277 ctgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 664
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043284
Alignment:
Q  602 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 20043284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 31782690 - 31782463
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |    
T  31782690 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-at 31782592  T
Q  517 tgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactca---tcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| |  || | ||||||||| ||||||||   |  |||||| || ||||| | |||||||||||    
T  31782591 tgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc-tcaatatttctttgtaaagaaactcatattattatagtagaatggagagttgctctctccc 31782493  T
Q  613 ccagactaggtca-gattggaccgaactgg 641  Q
    ||||| ||| |||  ||| |||||||||||    
T  31782492 ccagagtagatcatcattagaccgaactgg 31782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 341
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798058
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat 341  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798004 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 4409890 - 4409967
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||  |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  4409890 cactggaaaaatcgtgccacaattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggcagataaaaataaaacgtattttt 4409967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 16093473 - 16093413
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093473 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 38192241 - 38192178
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38192241 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38192178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 38219466 - 38219403
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38219466 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 38219403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224889
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgg 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||  | | ||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  520 gtagaattagg 530  Q
    ||| |||||||    
T  15224899 gtaaaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 36263877 - 36263810
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagac-taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36263877 atagtggattggagagctgctctctcccctagacataggtcatattgggccggactgggtaaacaaat 36263810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659850
Alignment:
Q  134 aacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacga 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagtttga--ggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgaggtcgcattgtggcacga 659850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 39854317 - 39854394
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  39854317 cactggaaaaatcgtgtcacggttgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 39854394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 1457183 - 1457242
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  1457183 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 1457242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2785439 - 2785380
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2785439 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3880367 - 3880303
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||  |||||||    
T  3880367 atagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaa 3880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12556441 - 12556358
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12556441 tgtgagagttaatttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcataatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt 12556358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 28807593 - 28807652
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28807593 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31180278 - 31180219
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31180278 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 31180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 31397014 - 31397073
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31397014 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 530
Target Start/End: Original strand, 35430172 - 35430338
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttg---------agggttgattcac 461  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||||||||         |   |||||||||    
T  35430172 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtacag---ttttctcttggcaataaacactagggtttggattgaatcaccattgattcac 35430267  T
Q  462 cttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  35430268 cttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 37556643 - 37556702
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37556643 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 37561465 - 37561524
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  37561465 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 37561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 43592343 - 43592284
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43592343 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 43592284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 24553537 - 24553599
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24553537 tagtggagtggagg-ctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2818836 - 2818763
Alignment:
Q  89 aacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  2818836 aacttaaaattaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt 2818763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 639
Target Start/End: Original strand, 11181862 - 11181916
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctccccc-agactaggtcagattggaccgaact 639  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11181862 tagtggattggagggttgctctctccccctagagtaggtcatattagaccgaact 11181916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 442
Target Start/End: Original strand, 13295760 - 13295809
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||    
T  13295760 caacaacaaaactagggtttgtatagaat---tcttttggcaacaaacactag 13295809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 640
Target Start/End: Original strand, 33030970 - 33031024
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactg 640  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  33030970 tagtgaattggagagctgctctctcccccagagtatgtcatatttgaccgaactg 33031024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2144928 - 2144899
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144928 acttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 6744894 - 6744971
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||  ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  6744894 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgctacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6744971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 6747137 - 6747214
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  6747137 cactggaaaagtcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 533893 - 533937
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  533893 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15044750 - 15044691
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15044750 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 15044691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 27449878 - 27449819
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| | |||||||||||||||    
T  27449878 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgg-ctgaactgggtcaacaa 27449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 29748285 - 29748313
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748285 cttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 30631470 - 30631411
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||| ||||||||    
T  30631470 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgagtcaacaa 30631411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 31401871 - 31401930
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31401871 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 31401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35387730 - 35387667
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||| |||||||||||    
T  35387730 atagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaattgggtcaacaa 35387667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 248
Target Start/End: Original strand, 42238047 - 42238123
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||    
T  42238047 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaacaaaaacgtatttt 42238123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 42428474 - 42428430
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42428474 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 43081722 - 43082344
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081722 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43081821  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43081822 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtacgctggcggataaaaataaaacgtatctttgggagcagatttgttatagttttgttaca 43081921  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------------taga 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  || ||||                ||||    
T  43081922 gattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatc-aggctattttggagagagagatagagagagataga 43082020  T
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43082021 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43082120  T
Q  463 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 561  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43082121 ttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgattt 43082220  T
Q  562 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43082221 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43082320  T
Q  662 tcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  43082321 tcttcttcttcttt-tgttcttctc 43082344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 18810483 - 18811078
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18810483 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactgga 18810582  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||              
T  18810583 aaaattgcggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacacatttttgggtgcagatttgttacag---------- 18810672  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18810673 -attttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagg 18810771  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810772 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 18810871  T
Q  479 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaact 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18810872 ggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatact 18810971  T
Q  579 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  18810972 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtg 18811070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 18812668 - 18813252
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18812668 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 18812767  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||              
T  18812768 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgttacag---------- 18812857  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18812858 -attttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagg 18812956  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812957 gtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 18813045  T
Q  479 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaact 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18813046 ggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatact 18813145  T
Q  579 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  18813146 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtg 18813244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 44720617 - 44721214
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggttt-ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  44720617 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 44720715  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||            
T  44720716 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacag-------- 44720807  T
Q  277 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 376  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720808 ---attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 44720904  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa-cacta 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44720905 gggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacacta 44721004  T
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaa 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44721005 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggt 44721104  T
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44721105 actcatcatatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttc-tcttcttt 44721203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 27829269 - 27829667
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829269 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27829368  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829369 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27829468  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27829469 tctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 27829568  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27829569 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27829667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 27826958 - 27827356
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826958 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27827057  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827058 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27827157  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27827158 tctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 27827257  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27827258 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27827356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 363 - 686
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079973
Alignment:
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  463 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  562 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgt 661  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43079850 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgt 43079949  T
Q  662 tcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  43079950 tcttgttcttcttt-tgttcttctc 43079973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 14807723 - 14808111
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807723 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 14807822  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807823 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 14807922  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  14807923 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 14808022  T
Q  586 tagtggattggagggctg----------ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||  |||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14808023 tagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14808111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 4423990 - 4424389
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423990 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaa 4424089  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424090 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgag 4424189  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||    
T  4424190 tctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcata 4424289  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4424290 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 4424388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28251930 - 28251552
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251930 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaa 28251831  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251830 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28251731  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  28251730 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcata 28251631  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28251630 tagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339680
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 32339503  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32339504 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 32339603  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32339604 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 32339680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 324 - 685
Target Start/End: Original strand, 608735 - 609105
Alignment:
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  608935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 609034  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt-actttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  609035 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 609105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809589
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15809314 gtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaact 15809412  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15809413 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 15809512  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15809513 ttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 15809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 291 - 664
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073061
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 15072885  T
Q  491 ttggttacgggaaga-ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatag 588  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  15072886 ttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacag 15072985  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15072986 tggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 15073061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873178
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  507 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 24873224  T
Q  607 tctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24873223 tctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874363
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggct 3874204  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3874205 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 3874304  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3874305 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 3874363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684617
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 503  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22684803  T
Q  504 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagg 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  22684802 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagg 22684703  T
Q  600 gctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22684702 gctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 22684617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283185
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaga 28283362  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
     |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28283361 ttggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28283262  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28283261 ct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 28283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 663
Target Start/End: Original strand, 15067953 - 15068330
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067953 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 15068052  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15068053 aggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgag 15068152  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  15068153 tcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 15068252  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttc 663  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  15068253 taatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 314 - 685
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530485
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggct 43530309  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43530310 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtc 43530409  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43530410 tctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 43530485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 315 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106884
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |  ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctc 27106933  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27106932 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480488
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || | |    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccc 30480539  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30480538 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30480488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911351
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27911212  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||    
T  27911213 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-cc 27911311  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27911312 ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27911351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957770
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27957631  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||    
T  27957632 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-cc 27957730  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27957731 ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaatt 27957770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 14419527 - 14419175
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14419527 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtat 14419428  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14419427 agagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggga 14419328  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |  |||||||| ||||||| |   || |||||||||||||    
T  14419327 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcc 14419228  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14419227 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14419175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Original strand, 43079347 - 43079614
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079347 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43079446  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag---ttttgtt 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| ||    
T  43079447 aaaatcgtggtacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatctttgggagcagatttgttatagtttttttttt 43079546  T
Q  276 acagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079547 acagattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 13858820 - 13858470
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13858820 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13858721  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  13858720 agagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattgggg 13858621  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||    
T  13858620 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcc 13858522  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13858521 cccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaatt-ctttgtgttct 13858470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225517
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg--atttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||||    
T  1225365 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctcc 1225464  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  1225465 ctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 1225517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385082
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||      
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 41384942  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  41384943 ctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 41385042  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41385043 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 41385082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865875
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||  ||| ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  613 cc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36865875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 315 - 559
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952871
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   || |||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 25952871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 315 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372160
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cc 611  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| | |||||| ||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctt 5372160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41383012
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 41382860  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  41382861 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 41382960  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  41382961 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 41383012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 315 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541507
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  515 tttgggtagaattaggc 531  Q
    ||| |||||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185711
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt--ctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||         
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag----- 15185852  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||| |  ||||| ||| |||||    
T  15185851 --atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctct 15185754  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15185753 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15185711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||  | |  ||||||||||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162551
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaa-caacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgg 31162405  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  31162406 gactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctct 31162505  T
Q  610 --cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31162506 cccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 315 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622882
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 405 - 652
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956296
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggct 602  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  603 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     ||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 15956296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 348 - 643
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480832
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 547  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttg 21480734  T
Q  548 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21480735 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 492
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005627
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  447 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 546  Q
     ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005832 gga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 3005736  T
Q  547 gtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggt 643  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  3005735 gtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgggt 3005636  T
Q  644 caacaaatt 652  Q
     ||||||||    
T  3005635 aaacaaatt 3005627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 291 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 450 - 652
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  549 aacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac--taggtcag-attggaccgaactgggtc 644  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||     
T  31035352 aaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggta 31035451  T
Q  645 aacaaatt 652  Q
    ||||||||    
T  31035452 aacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 438 - 585
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 534  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  535 agacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 2468461 - 2468261
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  2468461 gcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga- 2468363  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
           ||  |||||| ||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2468362 -------aatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaat 2468274  T
Q  483 tgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||    
T  2468273 tgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 27826782 - 27826968
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||||    
T  27826782 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactgg 27826880  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa-taaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27826881 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgtt 27826968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 27829093 - 27829279
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||    
T  27829093 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactgg 27829191  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa-taaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27829192 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgtt 27829279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 453 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  552 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  649 aatt 652  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 348 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214317
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttg 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 528  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaatta 37214322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757266
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 14807556 - 14807693
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||||||||||    
T  14807556 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactggaaaaatcg 14807654  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14807655 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctg 14807693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328091
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021104
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 9021194  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9021193 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 9021104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 316 - 487
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035238
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895686
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| || ||   || ||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctt 28895597  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28895598 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 397 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573847
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtc 31573881  T
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31573880 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812486
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 4812574  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  4812573 tgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752522
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16752609  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16752608 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16752522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332814
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28332726  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28332727 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28332814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12517566 - 12517420
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||    
T  12517566 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caatgtact 12517469  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  12517468 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 12517420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179538
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 23179645  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  23179644 aaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 23179547  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  23179546 cttcttctt 23179538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 25684646 - 25684826
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||||    |||||||||    
T  25684646 cactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctttgt 25684741  T
Q  570 aacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25684742 aaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032857
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 33032752  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||  |||||||||||| || |||  | ||||||||||     
T  33032753 aaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaaaaaa--attttgtgttctc 33032850  T
Q  666 cttcttc 672  Q
    |||||||    
T  33032851 cttcttc 33032857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3886419 - 3886322
Alignment:
Q  100 aggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3886419 aggtttctgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtggtacgatgg 3886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgt 29554869  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    || |||||||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29554868 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 453 - 642
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847848
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgta 549  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  550 acccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactggg 642  Q
    |||  ||||| ||||||| ||||    | ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17847761 acct-ttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590979
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | |||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttgt 590892  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || |||||    
T  590893 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactaggacatcattagaccgaactgggtaaataaatt 590979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799403
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| |||| ||   || ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  17799510 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgtt 17799413  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    || |||||||    
T  17799412 ctccttcttc 17799403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 15067785 - 15067963
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||    
T  15067785 ttaacttaaaatcagattt-tgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactggaaaaatc 15067882  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataa-aaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     || ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15067883 atgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 15067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 521 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagac 618  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  619 taggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 15072506 - 15072692
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   | |||| ||||     
T  15072506 tgtgagagttaacttaaaatcagatt-ctgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaag-caagccacta 15072603  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15072604 gaaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgtt 15072692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28252118 - 28251988
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||||||||||    
T  28252118 ttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactggaaaaatc 28252021  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28252020 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatgg 28251988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 23286084 - 23286134
Alignment:
Q  18 acaacaaacaagtttaggctttagaatgtaaatttaaatatggatgcttgc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286084 acaacaaacaagtttaggctttagaatgtaaatttaaatatggatgcttgc 23286134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 196
Target Start/End: Original strand, 4423834 - 4423952
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  || |||||||||    
T  4423834 atgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttaagg-caaggcact 4423931  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4423932 ggaaaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 6376141 - 6376328
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   || |||| |||||||| |||  ||||| ||||||    
T  6376141 aaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctctt 6376240  T
Q  567 tgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  6376241 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 581
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276454
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atgtctctttgt 3276442  T
Q  570 aacgaaactcat 581  Q
    || |||||||||    
T  3276443 aaagaaactcat 3276454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5702512 - 5702576
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5702512 ataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175847
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Original strand, 21033870 - 21034054
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  21033870 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaataggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctt 21033964  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||  ||||  ||||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21033965 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagatctgctcttttccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 21034054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 576 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 33541483 - 33541395
Alignment:
Q  576 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||    
T  33541483 actcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttct 33541395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 651
Target Start/End: Original strand, 28890855 - 28890949
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  28890855 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214251
Alignment:
Q  599 ggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456036
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtca 645  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtca 4456036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6127289 - 6127225
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6127289 atagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 6127225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 1261983 - 1262046
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  1261983 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ttgaactgggtcaacaa 1262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26287969 - 26287906
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26287969 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26301226 - 26301163
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26301226 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26313220 - 26313157
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26313220 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 26313157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 413 - 530
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896035
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||   |||    
T  3895920 tagagtttg-cttttggcaacaaacaatagggttgg--gattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgg 3896016  T
Q  512 gactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  3896017 gactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 468 - 672
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423418
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||  | |  || ||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaattc-tcaatatctctt 30423310  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||    
T  30423311 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctccagagtaggtcatcattagaccgaacagggtaaacaaatt--cttgtgtt 30423408  T
Q  663 cttcttcttc 672  Q
    || |||||||    
T  30423409 ctccttcttc 30423418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattag 529  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Original strand, 18853196 - 18853260
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18853196 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18853260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Original strand, 18870590 - 18870654
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  18870590 tatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgga-tgaactgggtcaacaa 18870654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 28307628 - 28307571
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  28307628 tagtggattggagagctgctctcatccccagagtaggtcattttggaccgaactgggt 28307571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 4733809 - 4733873
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggct-gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4733809 atagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6311361 - 6311302
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  6311361 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 6311302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6813747 - 6813687
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6813747 tggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaa 6813687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 7289947 - 7290006
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7289947 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 7290006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 10684285 - 10684344
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10684285 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 10684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 10689176 - 10689235
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10689176 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 10689235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930199
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 25328299 - 25328358
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  25328299 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25328358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 33037839 - 33037898
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33037839 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 33037898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 35745455 - 35745396
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35745455 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 35745396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  537 acttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 36979441 - 36979382
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36979441 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 36979382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 39784843 - 39784902
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  39784843 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 39784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31566601 - 31566554
Alignment:
Q  606 ctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31566601 ctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 30655708 - 30655651
Alignment:
Q  591 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  30655708 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 30655651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 505  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 17847527 - 17847556
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847527 acttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 646
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4743258 - 4743214
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4743258 tctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 4760108 - 4760167
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4760108 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 4760167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 5689395 - 5689439
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5689395 tctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 6599096 - 6599140
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6599096 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 6674549 - 6674593
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6674549 tctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 638
Target Start/End: Original strand, 9054867 - 9054919
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaac 638  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  9054867 tagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattggactgaac 9054919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 35872474 - 35872438
Alignment:
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35872474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35872438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 43036547 - 43036591
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43036547 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 686
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6523
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5927 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 6026  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||               
T  6027 aaaatcgtggcatgatggggtctcatcatggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgttacaa---------- 6116  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6117 -atttaaagcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 6215  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6216 gtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 6315  T
Q  479 ggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaac 577  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6316 ggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttac 6415  T
Q  578 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgt 677  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  6416 tcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttcttcttcttcttt-t 6514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195478
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195651 actttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 12195552  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195551 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 12195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 136 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816195
Alignment:
Q  136 cgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaa 234  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |  ||||    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagcaaaaa 4816651  T
Q  235 ataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagac 334  Q
       |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816650 cagaaacatattttttggtgcagatttgttacagattt----------ttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagac 4816561  T
Q  335 cttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    |||||||||    |||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816560 cttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 4816461  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 520  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4816460 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 4816361  T
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816360 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 4816261  T
Q  620 aggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4816260 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 4816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 289 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507140
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14507337  T
Q  489 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14507336 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatag 14507237  T
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14507236 tgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14507140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 272 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 20915736 - 20915321
Alignment:
Q  272 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    ||||||||||||||    
T  20915736 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggc 20915638  T
Q  369 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915637 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 20915538  T
Q  469 aacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915537 aacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 20915438  T
Q  568 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  20915437 gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt-ctctgtgttcttc- 20915340  T
Q  668 tcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20915339 tcttctttgtgttcttctc 20915321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11983392 - 11983014
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11983392 gcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaa 11983293  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983292 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11983193  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  11983192 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 11983093  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11983092 tagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11983014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 322 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458731
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  522 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  621 ggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 14458731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 314 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241288
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28241458  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28241457 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccc 28241358  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 683  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28241357 ccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttctt 28241288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230213
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggga 1230386  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  1230385 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 1230286  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1230285 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttcattgtgttcttctc 1230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 320 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704531
Alignment:
Q  320 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 19704606  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19704605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 19704531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932527
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaag 504  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 604  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgc 26932607  T
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  26932606 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttt-tg-tgttcttcttctttgtgttcttctc 26932527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628850
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 2629027  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2629026 tgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 2628927  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2628926 tcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 2628850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967551
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30967374 tgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 30967473  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30967474 ctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 30967551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034567
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggct 30034744  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30034743 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctc 30034644  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30034643 tcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatt-atcttctttgtgttcttctc 30034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 9019877 - 9020255
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019877 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 9019976  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019977 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 9020076  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  9020077 tctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 9020176  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9020177 tagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9020255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057524
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttct 13057524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065310
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattac 654  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  26065202 ttgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattat 26065300  T
Q  655 tttgtgttct 664  Q
    ||||||||||    
T  26065301 tttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 355 - 664
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085279
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattac 654  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  26085171 ttgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattat 26085269  T
Q  655 tttgtgttct 664  Q
    ||||||||||    
T  26085270 tttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26068882 - 26068590
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068882 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 26068783  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttg------------ttac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  26068782 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttaccgtttttgttac 26068683  T
Q  267 agttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068682 agatttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 287 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 30729191 - 30728811
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30729191 gcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaa 30729092  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30729091 agacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgac 30728992  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat----ttctcttt-gtaacgaaactcat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    |||||||| |||| |  ||||||    
T  30728991 tctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat 30728892  T
Q  582 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
      |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  30728891 attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 32279948 - 32280314
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32279948 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaa 32280046  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280047 aggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 32280146  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc-at 584  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||  |    
T  32280147 tctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 32280246  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  32280247 atagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaatt 32280314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629850
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||| || |||||||| |   |||||||||||||| |||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccc 3629901  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3629900 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3629850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15541503 - 15541125
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541503 gcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15541404  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15541403 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 15541304  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  | ||||||||    
T  15541303 tctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcata 15541204  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||| |   ||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15541203 tagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15541125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 317 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631926
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  517 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |  |||    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--ccc 3631974  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26066611 - 26066319
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066611 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactgga 26066512  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  26066511 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacaatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 26066412  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
       ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066411 agatttgttacaaatttaaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390697
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||     
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgggg 3390556  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || |||| |  |||||||||||||||||    
T  3390557 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcc 3390656  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  3390657 cccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaatt 3390697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040084
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13040084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 15530485 - 15530166
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530485 gcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15530286  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  15530285 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 15530187  T
Q  586 tagtggattggagggctgctc 606  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  15530186 tagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477599
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaa-------cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       ||  |||||||| ||||||| |   ||||||||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  606 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaatt 25477599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 33310954 - 33311235
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310954 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33311053  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  33311054 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 33311153  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311154 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 15533044 - 15532679
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533044 gcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15532945  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532944 aggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 15532845  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  15532844 tctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 15532745  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||    
T  15532744 tagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaatt 15532679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29755279 - 29754983
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755279 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 29755180  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag-ttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29755179 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 29755080  T
Q  278 agat----------tttaa-gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||          ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755079 agatttgttacaaatttaaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 435 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273180
Alignment:
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  534 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggac 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 5273232  T
Q  634 cgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273231 cgaactgggtcaacaaatttctcagtgttcttcttcttcttt-tgttcttctc 5273180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 33308685 - 33308966
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308685 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33308784  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcaga------------tttgttac 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||    
T  33308785 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacattttttgttac 33308884  T
Q  267 agttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308885 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 287 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19227771 - 19227514
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227771 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaa 19227672  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227671 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19227572  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227571 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233710
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccc 3233767  T
Q  613 ccagactaggtcagattggacc-----gaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| |||||||||  || ||||     ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3233766 ccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309206
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33309186  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  33309187 cttcttcttt-tgttcttctc 33309206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 315 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338446
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  |  ||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||  ||||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcc 24338486  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  24338485 cccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754673
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 29754693  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  29754692 cttcttcttt-tgttcttctc 29754673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311475
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 33311455  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  33311456 cttcttcttt-tgttcttctc 33311475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161543
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  12161790 gagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||| |||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccc 12161594  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     | ||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12161593 taaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttct 12161543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027848
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgag 3027992  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct- 609  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |     
T  3027991 actttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttc 3027892  T
Q  610 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||||||    
T  3027891 cccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 467 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066099
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26066108  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  26066107 cttcttctt 26066099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068359
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttctt 26068379  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  26068378 cttcttcttt-tgttcttctc 26068359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 315 - 567
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490871
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 22490871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 652
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719961
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 547  Q
      | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 15719853  T
Q  548 taacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtc 644  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||| | |||||| | |||||| |||||||||  |||||||||||| |||     
T  15719854 taacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggta 15719953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 371 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455421
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgt 569  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  570 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466641
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
     |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |  ||| | ||||| | |||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcc 14466600  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  14466601 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaatt 14466641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1072240 - 1072067
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1072240 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaa 1072141  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 460  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072140 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 315 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 456 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069715
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  556 tgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 321 - 652
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012358
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 519  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||   |||| |    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  520 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccaga 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |  ||||||| | |||| |||    || | |  |||||||||||||    
T  17012224 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccaga 17012322  T
Q  618 ctaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17012323 ctaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 17012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 402 - 652
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367349
Alignment:
Q  402 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 501  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  502 aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 600  Q
    |||||  ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  ||| ||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  601 ctgctctctc-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14507716 - 14507569
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||    
T  14507716 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcactg 14507617  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507616 gaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 14507569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 452 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186056
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  551 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  649 aattactttgtgttct 664  Q
    ||||| ||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttct 12186056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 322 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696759
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||  ||     
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattga 19696614  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |  | ||||||| ||||||||   ||  |||||||||    
T  19696615 gactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctc 19696714  T
Q  609 tcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19696715 tctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 8995254 - 8995402
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8995254 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcact 8995351  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8995352 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgac 8995402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 9019701 - 9019849
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9019701 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcact 9019798  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9019799 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgac 9019849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 427
Target Start/End: Original strand, 8995430 - 8995570
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8995430 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 8995529  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995530 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 397 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22857949
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtc 22858109  T
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggat 593  Q
    ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||| |  |||||||| |||||||||     
T  22858108 acaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaa 22858009  T
Q  594 tggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  22858008 cggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 444
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 444  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19227948 - 19227803
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  19227948 tgtgagagttaacttaaaattaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactgg 19227850  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19227849 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19227803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11983558 - 11983382
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |  ||  |  ||||||||||||||||    
T  11983558 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcagttgtgaggtaa--gcactggaaaaatcgt 11983461  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  11983460 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 11983382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 451 - 652
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 549  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  550 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    || ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  | ||||| |||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  647 caaatt 652  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883658
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctctt 13883570  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  13883571 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 481
Target Start/End: Original strand, 15346369 - 15346524
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  15346369 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaattc--------aaactagggtttgtat 15346460  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346461 aaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694849
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17694935  T
Q  570 aacgaaact-catca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17694934 aaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17694849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 511 - 652
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  511 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  610 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887225
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 26887311  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26887310 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 26887225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201325
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35201413  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || || |||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  35201412 tgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 397 - 610
Target Start/End: Original strand, 20526871 - 20527081
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20526871 aaaactaggggttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtc 20526965  T
Q  497 acgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggatt 594  Q
    ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  | |||||| |||||||||      
T  20526966 acaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaac 20527065  T
Q  595 ggagggctgctctctc 610  Q
    |||| |||||||||||    
T  20527066 ggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342778
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22342885  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  22342884 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 22342787  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    | |||||||    
T  22342786 catcttctt 22342778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351830
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||||| ||   || |||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctctttgt 22351936  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  22351935 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtcatcattaga-cgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctt 22351839  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  22351838 cttcttctt 22351830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 474 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 25466075 - 25465881
Alignment:
Q  474 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 572  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || |||||||||||     
T  25466075 tattaggattgagtctcttaatcacggaaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgtaaa 25465980  T
Q  573 gaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttctt 668  Q
    |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25465979 gaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatta--ttgtgttcttctt 25465882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 468 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248740
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 31248801  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  31248800 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtca 31248740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  415 gagtttgtctcttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33216012
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 33215925  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33215926 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 33216012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 531 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  531 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-at 628  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  629 tggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 454 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037722
Alignment:
Q  454 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  553 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat-atagtgga---ttggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 646  Q
    | ||||| |||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||     | | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaa 28037728  T
Q  647 caaatt 652  Q
    ||||||    
T  28037727 caaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 475 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166143
Alignment:
Q  475 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 573  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||||||| |    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattca---atatctctttgtaaag 12166226  T
Q  574 aaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||  |||| ||||||| |   ||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12166225 aaactcatatcattatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 12166143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 471 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467446
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||      | |||||||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca-----atatctttgt 13467550  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||   |||||||||     
T  13467549 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtcatgattagaccgaactaggtaaacaaatt--cttgtgttctc 13467453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15530663 - 15530516
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcac 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |   |||  ||||| ||||    
T  15530663 aatgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttca-agtttgaggcaaagcac 15530566  T
Q  175 tggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    | ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15530565 tcgaaaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgtgctg 15530516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 530
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 561 - 674
Target Start/End: Original strand, 25941759 - 25941874
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactt 656  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |    
T  25941759 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--ct 25941856  T
Q  657 tgtgttcttcttcttctt 674  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25941857 tgtgttcttcttcttctt 25941874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 423 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 25078783 - 25078554
Alignment:
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||||  || || |||  |||    
T  25078783 ctcttggcaacaaacattagggttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagta 25078687  T
Q  523 gaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagact 619  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  |||| |||| | ||||||  ||||| ||||| ||| ||| || ||    
T  25078686 gaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttccc-agtct 25078588  T
Q  620 aggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25078587 aggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 25078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 476 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165819
Alignment:
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacga 574  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||||| |  || ||||||||||| ||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccc-tgaatatctctttgtaaaga 5165892  T
Q  575 aactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggt 643  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  5165891 aactcatatcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggt 5165819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 664
Target Start/End: Original strand, 10584256 - 10584325
Alignment:
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  10584256 ggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttct 10584325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 581
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643286
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 26643274  T
Q  570 aacgaaactcat 581  Q
    || |||||||||    
T  26643275 aaagaaactcat 26643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 581
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749252
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 26749240  T
Q  570 aacgaaactcat 581  Q
    || |||||||||    
T  26749241 aaagaaactcat 26749252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 453 - 528
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 528  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 476 - 652
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262777
Alignment:
Q  476 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccca---ttgatttctctttgtaa 571  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  || || ||| ||||||||||||   || |||| |||||| |||||     ||||| |||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattaggtttgaagactaattcttataacctccttttgatatctctttgtaa 11262694  T
Q  572 cgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||||||||| ||| || |  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  11262695 agaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911442
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||  || ||  || |||||| |||||| |||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12911530  T
Q  567 tgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12911529 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 19702095 - 19701985
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttgggaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  19702095 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-t 19701997  T
Q  517 tgggtagaatta 528  Q
    ||||||||||||    
T  19701996 tgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1072396 - 1072312
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1072396 atgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggtacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttaagtttt 1072312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 474 - 530
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  474 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 5017498 - 5017562
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5017498 atagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542461
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 550  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  551 cccattgatttctctttgtaa 571  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctctttgtaa 7542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22709086 - 22709022
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  22709086 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattgaaccgaactaggtcaacaa 22709022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22963767 - 22963704
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22963767 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 22963704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 23824626 - 23824689
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23824626 atagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaa 23824689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 3577581 - 3577467
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactt 656  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |    
T  3577581 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattc--t 3577485  T
Q  657 tgtgttcttcttcttctt 674  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3577484 tgtgttcttcttcttctt 3577467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12186405 - 12186330
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12186405 acttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937190
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||  ||  ||||| ||||||||||||   || | || ||||||||||||  || || ||||||    
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctctt 12937277  T
Q  567 tgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12937276 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt 12937190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870100
Alignment:
Q  555 ttgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22870196 ttgatatctctttgtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaactgggtgaacaaat 22870100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 643
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 26084818 - 26084895
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  26084818 cactggaaaaatcgtgccacgattgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 26084895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 512 - 641
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445832
Alignment:
Q  512 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  ||||  ||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctc 30445798  T
Q  609 tcccccagactaggtcag-attggaccgaactgg 641  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  30445799 tccaccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 18232913 - 18232849
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  18232913 atagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaa 18232849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30729281 - 30729181
Alignment:
Q  165 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgt 263  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |  || || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30729281 ggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgt 30729182  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  30729181 t 30729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 31086502 - 31086566
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31086502 atagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaa 31086566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 33335963 - 33336022
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  33335963 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33336022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 4630021 - 4629958
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  4630021 tagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaa 4629958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4816787 - 4816740
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcagg-tttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816787 atgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcacga 4816740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 561 - 651
Target Start/End: Original strand, 17038324 - 17038418
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17038324 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17038418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 641
Target Start/End: Original strand, 21801374 - 21801429
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgg 641  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  21801374 tagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 446
Target Start/End: Original strand, 4595048 - 4595102
Alignment:
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595048 gcaacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 573 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 24501527 - 24501425
Alignment:
Q  573 gaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttct 670  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| || |||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||    
T  24501527 gaaactcatcattatagtggaatagagagctgctctcttcccctgaataggtcagtattataccgaactgggtaaacaacttcttttgtgtttttcttct 24501428  T
Q  671 tct 673  Q
    |||    
T  24501427 tct 24501425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 652
Target Start/End: Original strand, 30443548 - 30443606
Alignment:
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30443548 ggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 30443606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 495
Target Start/End: Original strand, 6843186 - 6843287
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  6843186 caacaataaaactatggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtc 6843280  T
Q  489 tcttggt 495  Q
    |||||||    
T  6843281 tcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 5674803 - 5674862
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  5674803 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 5674862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6005481 - 6005422
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  6005481 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 6005422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 652
Target Start/End: Original strand, 7294021 - 7294113
Alignment:
Q  562 ctctttgtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  7294021 ctctttgtatagaaactcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtcagtattggaccaaactggataaacaaatt 7294113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 14742457 - 14742516
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14742457 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 14742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 22010718 - 22010777
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22010718 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 22010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 28155590 - 28155649
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28155590 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 28155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 33330466 - 33330525
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33330466 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 33330525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 591 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 28184567 - 28184510
Alignment:
Q  591 gattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  28184567 gattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 28184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17904619 - 17904566
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17904619 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 482
Target Start/End: Original strand, 30445602 - 30445661
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 482  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445602 tctcttggcaacaaacactacgg-ttga-gattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6438565 - 6438506
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||||    
T  6438565 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggacaacaa 6438506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 11857038 - 11856979
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  11857038 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 11856979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 592 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14521735 - 14521679
Alignment:
Q  592 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    ||||||| | |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14521735 attggagaggtgctctctcctcgagagtaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 14521679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 14737597 - 14737656
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  14737597 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggatcaacaa 14737656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 16569146 - 16569190
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16569146 tctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 16838808 - 16838749
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||| | |||||||||||||||    
T  16838808 tggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 16838749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3203
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2904  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2905 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 3004  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005 tctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 3104  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3105 agtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 2629 - 2815
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  2629 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtgacacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 2726  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2727 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 163)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 27104691 - 27105088
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27104691 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 27104790  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104791 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27104889  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  27104890 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatat 27104989  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27104990 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 27105088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 287 - 668
Target Start/End: Original strand, 42064407 - 42064789
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064407 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 42064506  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064507 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 42064606  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42064607 tctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 42064706  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaga-ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttctt 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42064707 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctt 42064789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 13910407 - 13910009
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910407 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13910308  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13910307 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 13910208  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13910207 tctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatat 13910108  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13910107 agtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 13910009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 287 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 19504708 - 19504311
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504708 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 19504609  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504608 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19504509  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19504508 tctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcata 19504410  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19504409 tagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttct 19504311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 316 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501976
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctccccc 19502046  T
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttct 685  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502045 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttct 19501976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452201
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 23452378  T
Q  510 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctc 608  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452377 gggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctc 23452278  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23452277 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 23452201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279966
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa-gcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 45280122  T
Q  513 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45280121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 45280022  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45280021 cccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 45279966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 24162575 - 24162187
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162575 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24162476  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24162475 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 24162376  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 586  Q
    ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  24162375 tctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatat 24162286  T
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24162285 agtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgtttttctc 24162187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 314 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215567
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  503 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 602  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 35215633  T
Q  603 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttctt 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35215632 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttcttctt 35215567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 355 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217944
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  554 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35218058 gttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatat 35217959  T
Q  654 ctttgtgttcttctt 668  Q
    |||||||||||||||    
T  35217958 ctttgtgttcttctt 35217944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453053
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 42452899  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  42452900 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-cc 42452998  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42452999 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 42453053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 291 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287321
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctc 22287496  T
Q  491 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagt 589  Q
    || |||||||||||||  ||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  22287495 ttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 22287396  T
Q  590 ggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22287395 gaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22287321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 40032421 - 40032050
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032421 gcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40032322  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032321 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40032222  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga----tttctc-tttgtaacgaaactcat 581  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| || |  ||||||    
T  40032221 tctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcat 40032122  T
Q  582 ca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40032121 cattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40032050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 21521058 - 21520678
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21521058 gcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttag 21520959  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21520958 aaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg 21520859  T
Q  485 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  21520858 agtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatca 21520759  T
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  21520758 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttct 21520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 43623931 - 43623565
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623931 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaa 43623832  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43623831 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 43623744  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  43623743 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata 43623644  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43623643 tagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 43623565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007910
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 19007859  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  19007860 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923494
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 42923648  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 610  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  42923647 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctc 42923548  T
Q  611 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42923547 ccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42923494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196905
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 613  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccc 28196856  T
Q  614 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28196857 cagactaggtca-att-gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28196905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6264508 - 6264133
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6264508 gcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaa 6264409  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6264408 aggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaag 6264313  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 584  Q
    |||||||||||||  || ||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |    
T  6264312 tctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 6264213  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6264212 atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6264133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 6259178 - 6258802
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||| ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6259178 gcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaa 6259079  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259078 aggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6258979  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 584  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||| | |    
T  6258978 tctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatt 6258881  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6258880 atagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6258802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36559358 - 36559067
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559358 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36559259  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  36559258 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 36559159  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559158 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45332675 - 45332384
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45332675 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactgga 45332576  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332575 aaaatcgtggaacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 45332476  T
Q  279 g-----------attttaagcagatttgttacaga-ttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |           |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332475 gatttgttacagattttaggcagatttgttatagatttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739544
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11739544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848710
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||    
T  17848563 ctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 17848658  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17848659 ccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17848710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732773
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||            ||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggac 31732913  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| |  ||||| ||||||||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaatt 31732773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 318 - 664
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022442
Alignment:
Q  318 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |  |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  518 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca----------tatagtggattggagggctgctct 607  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |  ||||||||          |||| || |   || |||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctct 3022385  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3022386 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 316 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  516 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289052
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    || ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    |||||||| ||||||| |   || || |||||| ||||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttccc 44289104  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44289103 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44289052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 323 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979562
Alignment:
Q  323 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 522  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  523 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct-ctcccccagact 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||  | |||||| |||| | |||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  620 aggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561105
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36561125  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  36561124 cttcttcttt-tgttcttctc 36561105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849387
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcat-atagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctccc 17849335  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     || |||||||||  ||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17849336 acatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17849387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 467 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332144
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    |||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttctt 45332165  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45332164 cttcttctttgtgttcttctc 45332144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 355 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239001
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccca 45239073  T
Q  555 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    ||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239072 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 45239001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837538
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  || |||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttct 14837538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558846
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 36558848  T
Q  666 ct 667  Q
    ||    
T  36558847 ct 36558846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578104
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttccc 11578145  T
Q  613 ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578144 ccagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 445 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375331
Alignment:
Q  445 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 544  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  545 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 643  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  644 caacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttct 5375331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 18800665 - 18800298
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800665 gcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaa 18800566  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |          || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800565 atc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18800478  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-t 584  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||| ||| |    
T  18800477 tctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatt 18800378  T
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18800377 atagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttct 18800298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146604
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgaga 20146746  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  20146745 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 20146646  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146645 ctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 287 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22407772 - 22407591
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22407772 gcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaa 22407673  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407672 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874389
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |     
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgagg 22874248  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  22874249 ctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctcc 22874348  T
Q  612 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    | || |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  22874349 ctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaatt 22874389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 552
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 552  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |          ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggtattg----------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897242
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||     
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattga 17897385  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct-ctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 609  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||    
T  17897384 gattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctct 17897285  T
Q  610 cccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897284 -ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36561532 - 36561344
Alignment:
Q  182 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt------------ 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                
T  36561532 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttacaga 36561433  T
Q  270 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561432 tttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19502542 - 19502405
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19502542 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgt 19502443  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502442 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19502405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 405 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459175
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggct 602  Q
    ||  |||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  603 gctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
     ||||||  || |||||||||||  ||||| |||||| | | ||||||||  ||||||||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttct 28459175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24162752 - 24162565
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24162752 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 24162653  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  || | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24162652 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 24162565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36561677 - 36561539
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561677 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36561578  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561577 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19504885 - 19504739
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19504885 atgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactgg 19504786  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19504785 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19504739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 27104523 - 27104701
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27104523 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 27104622  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  27104623 ggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgtt 27104701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 509 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407439
Alignment:
Q  509 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 607  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 22407496  T
Q  608 ctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22407495 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 22407439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377629
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 450  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 664
Target Start/End: Original strand, 35107192 - 35107566
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||| |  || |||| ||| |||||||    
T  35107192 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttaga 35107290  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35107291 agt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattga 35107383  T
Q  486 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 582  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| |  |||||||    
T  35107384 gtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatc 35107482  T
Q  583 a-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    | |||||||||  ||| || || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||   ||||||||||    
T  35107483 attatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttct 35107566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 451 - 652
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  550 acccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaa 646  Q
    | || ||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  647 caaatt 652  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37962938
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||  || |     
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 37963076  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |  | |||||| ||||||| |   | || ||| |||||| |    
T  37963075 ctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctctc 37962978  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  37962977 ccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 521 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  521 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagact 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  620 aggtc-agattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 468 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054742
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20054852  T
Q  567 tgtaacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgtt 662  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||    
T  20054851 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgtt 20054754  T
Q  663 cttcttcttctt 674  Q
    ||||||||||||    
T  20054753 cttcttcttctt 20054742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943720
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 17943635  T
Q  570 aacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatt 17943720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517616
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27517723  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||   ||||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaatt--cttgtgttctt 27517625  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  27517624 cttcttctt 27517616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462619
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| | |   | ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687166
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21521234 - 21521048
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||    
T  21521234 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctacaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactg 21521137  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21521136 gaaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 21521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 405 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136208
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  505 aggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 567  Q
    |   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 27136208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 584
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttgt 43139549  T
Q  570 aacgaaactcatcat 584  Q
    || |  |||||||||    
T  43139550 aaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43624077 - 43623968
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43624077 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactgaaaaaatcg 43623979  T
Q  186 tggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||    
T  43623978 tggcacgatgg 43623968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741124
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2741036  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaat 2741124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 468 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20049998
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| || || |||||||   || |||| ||||||||||| ||   || ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt-ggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20050109  T
Q  567 tgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctc-ccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgt 661  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||    
T  20050108 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgt 20050011  T
Q  662 tcttcttcttctt 674  Q
    |||||||||||||    
T  20050010 tcttcttcttctt 20049998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 674
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479199
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 30479092  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   |||| |||||    
T  30479093 aaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtattctt 30479190  T
Q  666 cttcttctt 674  Q
    |||||||||    
T  30479191 cttcttctt 30479199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 471 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781207
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | | ||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctctttgt 12781305  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||    
T  12781304 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaatta--ttgtgttctt 12781207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 438 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 651
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680228
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcat---tatctctt 39680140  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39680141 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 42064231 - 42064376
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  42064231 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 42064328  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42064329 gaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctg 42064376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6259351 - 6259168
Alignment:
Q  82 gagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 179  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||  ||  ||| ||||||||    
T  6259351 gagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagttttgagga-aagtcactggaa 6259254  T
Q  180 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  6259253 aaatcgtggcacgatgggatcgcaacgtgacacgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgtt 6259168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 531 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707736
Alignment:
Q  531 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc--cagactaggtcaga 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||  ||||||||||||      
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 22707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 567
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589863
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  567 t 567  Q
    |    
T  20589863 t 20589863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 565 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163007
Alignment:
Q  565 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22163007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 471 - 593
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932757
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17932732  T
Q  570 aacgaaactcatca-tatagtggat 593  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  17932733 aaagaaactcatcattatagtggat 17932757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 409
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 584 - 649
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 471 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| ||   || |||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctctttgt 37170836  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca 625  Q
    || |||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37170835 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40032586 - 40032503
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40032586 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 40032503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 453 - 530
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13910491 - 13910397
Alignment:
Q  171 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  13910491 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 13910397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 413 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583483
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 506  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12342746 - 12342673
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342746 acttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 651
Target Start/End: Original strand, 45679813 - 45679906
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  45679813 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17865271 - 17865207
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  17865271 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 33118204 - 33118140
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  33118204 atagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaa 33118140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388862
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34388926 atagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 34388862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 39482999 - 39482935
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39482999 atagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 39482935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 2838060 - 2838123
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2838060 tagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 652
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871074
Alignment:
Q  530 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagat 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||  ||| |||||||  |    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  629 tggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||| | |||| ||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaatt 23871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 649
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345634
Alignment:
Q  587 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 528
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 528  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707345
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 16940238 - 16940302
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16940238 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 16940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 17010903 - 17010967
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17010903 atagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaa 17010967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 21630011 - 21629948
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21630011 atagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25398563 - 25398500
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  25398563 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 33528650 - 33528714
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33528650 atagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 468 - 516
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191045
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Original strand, 2869723 - 2869786
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2869723 tagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6264655 - 6264546
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  6264655 ttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaattgttgcacgatggttgggcaacgtggcatgattggatgtttcagttttgagg-caagtcactggaaaaatc 6264558  T
Q  185 gtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||    
T  6264557 gtggcacgatgg 6264546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 31056111 - 31056048
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  31056111 tagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 33671059 - 33670965
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||    
T  33671059 tctctttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgcgtaaacaaat 33670965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 528
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 512  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  ||      
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  513 actttgggtagaatta 528  Q
    ||||||||||||||||    
T  35028692 actttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 567
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694076
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  549 aacccattgatttctcttt 567  Q
    ||||  ||||| |||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttt 15694076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 3491818 - 3491755
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3491818 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 3491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22407948 - 22407762
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |  ||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||  || |||| || ||    
T  22407948 tgtgagagttaatttaaaattaggtt-ctgcaggaatcgtggcacgattgaagggtaacatggcacgattggatgtttcagttttgagg-caagtcagtg 22407851  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407850 aaaaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggcacgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 22407762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 25403701 - 25403638
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  25403701 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgagtcaacaa 25403638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 42039698 - 42039762
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42039698 atagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaa 42039762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078562
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 648  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 23078562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 584 - 639
Target Start/End: Original strand, 27149322 - 27149377
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 639  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  27149322 tatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattggaccaaact 27149377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 453 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-aagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaaagattc-gggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 603 - 652
Target Start/End: Original strand, 8173539 - 8173589
Alignment:
Q  603 gctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8173539 gctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 8173589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaatta 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 600 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 34575186 - 34575123
Alignment:
Q  600 gctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  34575186 gctgctctctcccccagactaggtcagcattggatcgaactaggtaaacaaatt--tttgtgttct 34575123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 528
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaatta 528  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 11098960 - 11099019
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  11098960 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 11099019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14291552 - 14291493
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  14291552 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 14291493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720703
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 549  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||  | | |||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  550 acccattga 558  Q
    |||| ||||    
T  30720711 accctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 36757795 - 36757855
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||| | || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36757795 tggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 36757855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 40738910 - 40738848
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  40738910 atagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaa 40738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 44312645 - 44312704
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44312645 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 44312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  606 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 477 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  477 taggattgagtctcttggttacgggaagag-gctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 600 - 672
Target Start/End: Original strand, 38191144 - 38191215
Alignment:
Q  600 gctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttc 672  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||    
T  38191144 gctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt--cttgtgttctccttcttc 38191215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 652
Target Start/End: Original strand, 20592288 - 20592337
Alignment:
Q  604 ctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  20592288 ctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattggataaacaaatt 20592337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 25407690 - 25407653
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactagg 622  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25407690 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 33674584 - 33674551
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674584 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 40699229 - 40699278
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||    
T  40699229 acttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304596
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtaaag---ttttctattggcaacaaacattagggtt 41304596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 9296434 - 9296493
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9296434 tggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9296493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 11067429 - 11067473
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  11067429 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 14633869 - 14633825
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  14633869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 15539550 - 15539514
Alignment:
Q  628 ttggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15539550 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15539514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19344485 - 19344426
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19344485 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 19349343 - 19349284
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  19349343 tggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 19349284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28462649 - 28462593
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462649 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 39812009 - 39812068
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  39812009 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactggttcaacaa 39812068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 69658 - 69256
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  69658 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 69559  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69558 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 69459  T
Q  483 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatc 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  69458 tgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatc 69359  T
Q  583 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttct 682  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  69358 atatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttct 69260  T
Q  683 tctc 686  Q
    ||||    
T  69259 tctc 69256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 73390 - 73207
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  73390 gcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 73291  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 466  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73290 agaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 69825 - 69688
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||||||    
T  69825 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaatcg 69727  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    | |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  69726 tagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctg 69688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 73536 - 73427
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| ||||||||||||| |    
T  73536 ttaacttaaaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaattg 73438  T
Q  186 tggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||    
T  73437 tggcacgatgg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  434 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 314 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41450
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 41620  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41619 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctccc 41520  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttctt 683  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41519 ccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttctt 41450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 355 - 667
Target Start/End: Original strand, 34 - 347
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  554 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatta 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  234 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattt 333  T
Q  654 ctttgtgttcttct 667  Q
    ||||||||||||||    
T  334 ctttgtgttcttct 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 317 - 664
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79488
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 516  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  517 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccca 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 79439  T
Q  616 gactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  79440 gactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttct 79488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4301
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4021  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4022 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 4120  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  4121 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 4220  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttct 667  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  4221 tagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttcttct 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 287 - 686
Target Start/End: Original strand, 29086 - 29494
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  29086 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 29185  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  29186 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 29285  T
Q  477 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaa 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  29286 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaata 29385  T
Q  577 ctcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttg 676  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  29386 ctcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttc-tcttttttg 29484  T
Q  677 tgttcttctc 686  Q
    ||||||||||    
T  29485 tgttcttctc 29494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29005
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28941 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 267
Target Start/End: Original strand, 29001 - 29099
Alignment:
Q  170 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  29001 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttaca 29099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 314 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183605
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattggga 183778  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  183777 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 183678  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  183677 tcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgttcttctc 183605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52304
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 511  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 52160  T
Q  512 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctg--ctctc 608  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||    
T  52161 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 52260  T
Q  609 tcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  52261 tcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 52304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 652
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50305
Alignment:
Q  604 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaatt 50305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11458
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 11610  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11609 ctttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctccc 11510  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  11509 ccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 327 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14379
Alignment:
Q  327 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 424  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  425 cttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaga 524  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 14508  T
Q  525 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14507 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggt 14408  T
Q  624 cagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14407 caatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 287 - 652
Target Start/End: Original strand, 14944 - 15310
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14944 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaa 15043  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044 aggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15143  T
Q  487 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcata 585  Q
    |||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||    
T  15144 tctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 15243  T
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  15244 tagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaatt 15310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 264
Target Start/End: Original strand, 14768 - 14954
Alignment:
Q  80 gtgagaattaacttaaaatcaggtttctgca-gaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |  |||||| ||||||    
T  14768 gtgagagttaacttaaaatcaggattctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcag-ttatgaggcaagtcactgg 14866  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | |  || || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  14867 aaatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgacacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 431 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1417
Alignment:
Q  431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  531 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattg 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 1472  T
Q  631 gaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1471 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc-tcttctttgtgatcttctc 1417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 21915 - 22206
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22014  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22015 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22114  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22115 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24481
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24190 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 24289  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  24290 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 24389  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24390 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22441
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 22419  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  22420 cttcttcttt-tgttcttctcac 22441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 467 - 688
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24716
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  566 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttctt 665  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttctt 24694  T
Q  666 cttcttctttgtgttcttctcac 688  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  24695 cttcttcttt-tgttcttctcac 24716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 315 - 652
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80150
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  80012 ctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 80110  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  80111 ccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaatt 80150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 613
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 507  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagg 2186  T
Q  508 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  2187 ctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactc 2286  T
Q  607 tctcccc 613  Q
    |||||||    
T  2287 tctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 315 - 664
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85534
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 85482  T
Q  613 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||  ||| ||||||||  ||||||||||    
T  85483 ccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttct 85534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12868
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 12955  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtta 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12954 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtta 12868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15817
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  16154 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 16056  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  16055 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 15959  T
Q  514 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |    
T  15958 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgc 15859  T
Q  612 cccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  15858 ccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 315 - 542
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttat 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 664
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35897
Alignment:
Q  584 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttct 664  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttct 35897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 324 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1638
Alignment:
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggta 522  Q
           |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  523 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagacta 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  621 ggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    ||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 316 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16646
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  515 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccc 612  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||| ||||||||     |||| |  ||||||||    
T  16786 tttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctccc 16687  T
Q  613 ccagactaggtcag-attggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  16686 ccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 314 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 993
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  414 agagtttgtctc-----ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||||||||||||     || | ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1067 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 321 - 643
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5095
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaa--aagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||  |||||||||    |||||||||| ||||| |    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaacaa----actagggtttatatagcg 4868  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 517  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||   ||||    
T  4869 ttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttt 4965  T
Q  518 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctccccc 614  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||| |||||||||    ||  ||||||||| ||||    
T  4966 tggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgcccc 5065  T
Q  615 agactaggtcag-attggaccgaactgggt 643  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5066 agactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 471 - 651
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16509
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| ||   || |||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttgt 16423  T
Q  570 aacgaaactc--atca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    || |||||||  |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16424 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 471 - 652
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 16983
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||   || |||| ||||||| |||  |||    |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaacttatta---tctctttgt 17070  T
Q  570 aacgaaactcat--cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaatt 652  Q
    || |||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17069 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 16983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 61; Significance: 8e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 595 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4653
Alignment:
Q  595 ggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttcttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttgttcttcttcttt 4653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 5)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 611
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||   | ||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 224914  T
Q  567 tgtaacgaaactca-tca-tatagtggattggagggctgctctctcc 611  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  224915 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 5751 - 5687
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5751 atagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133373
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaa 133373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 36861 - 36925
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36861 atagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3161 - 3068
Alignment:
Q  561 tctctttgtaacgaaactcat-cat-atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtca-gattggaccgaactgggtcaacaaat 651  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  3161 tctctttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 10796 - 10736
Alignment:
Q  586 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 646  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10796 tagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45257
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaa 45257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1415
Alignment:
Q  615 agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattactttgtgttcttcttcttctttgtgttcttctc 686  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtcctt-ttcttctttgtgttcttctc 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 85748 - 85687
Alignment:
Q  588 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  85748 gtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 17981 - 18044
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  17981 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 649
Target Start/End: Original strand, 24074 - 24137
Alignment:
Q  585 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24074 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 24137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57437
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatttctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||  | |||||||||||| ||||||||   || ||  |||||||||||||| ||||| ||| |    
T  57613 aaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatctat 57514  T
Q  566 tt-gtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcag-attggaccgaact 639  Q
    || |||| |  |||||| | |||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  57513 tttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacggaact 57437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 427 - 368
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  427 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 9663 - 9722
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9663 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 14330 - 14389
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  14330 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 17267
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17327 tggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 17267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 605 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  605 tctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 181985 - 182044
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  181985 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 182044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 2272 - 2331
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2272 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 35083 - 35142
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  35083 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggttaacaa 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 148977 - 149036
Alignment:
Q  589 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 649  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  148977 tggattggagagctactctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University