View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7317_low_4 (Length: 686)

Name: NF7317_low_4
Description: NF7317
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7317_low_4
NF7317_low_4
[»] chr4 (168 HSPs)
chr4 (74-651)||(16934144-16934719)
chr4 (79-651)||(16931790-16932360)
chr4 (77-651)||(22782739-22783319)
chr4 (79-651)||(22780374-22780952)
chr4 (79-641)||(9176485-9177035)
chr4 (79-667)||(18846923-18847500)
chr4 (136-667)||(11008553-11009075)
chr4 (287-673)||(22802713-22803097)
chr4 (287-673)||(22800841-22801225)
chr4 (287-673)||(24888766-24889150)
chr4 (314-673)||(40637071-40637428)
chr4 (291-673)||(40091394-40091774)
chr4 (287-667)||(22044376-22044753)
chr4 (287-667)||(22046671-22047048)
chr4 (314-667)||(8631404-8631759)
chr4 (287-667)||(47274697-47275073)
chr4 (314-673)||(36378289-36378647)
chr4 (287-673)||(48486289-48486673)
chr4 (287-667)||(11434925-11435302)
chr4 (287-667)||(9148221-9148600)
chr4 (287-673)||(24880421-24880806)
chr4 (287-673)||(36921472-36921858)
chr4 (287-667)||(37089357-37089737)
chr4 (287-667)||(51015216-51015593)
chr4 (291-673)||(24878963-24879344)
chr4 (314-665)||(47868398-47868747)
chr4 (287-651)||(9174147-9174509)
chr4 (287-673)||(36919563-36919950)
chr4 (316-670)||(37313047-37313400)
chr4 (287-667)||(11006222-11006604)
chr4 (315-673)||(38928156-38928513)
chr4 (314-667)||(6764836-6765192)
chr4 (287-667)||(5198390-5198768)
chr4 (314-667)||(24348211-24348566)
chr4 (314-667)||(2484858-2485209)
chr4 (315-673)||(12395824-12396180)
chr4 (287-667)||(31849584-31849962)
chr4 (287-667)||(38409169-38409552)
chr4 (314-651)||(44599839-44600174)
chr4 (315-673)||(12400786-12401142)
chr4 (316-673)||(33415467-33415821)
chr4 (314-667)||(14633317-14633666)
chr4 (287-667)||(7941289-7941671)
chr4 (321-672)||(19322701-19323048)
chr4 (314-673)||(16453306-16453664)
chr4 (314-673)||(17662224-17662574)
chr4 (314-651)||(14787430-14787769)
chr4 (315-672)||(19095880-19096236)
chr4 (314-672)||(619428-619783)
chr4 (319-651)||(41997494-41997824)
chr4 (287-586)||(5637530-5637832)
chr4 (393-673)||(36380425-36380704)
chr4 (314-651)||(22132393-22132735)
chr4 (315-635)||(18409364-18409681)
chr4 (287-595)||(3824627-3824936)
chr4 (316-642)||(56030443-56030764)
chr4 (315-628)||(18537498-18537806)
chr4 (355-651)||(22134619-22134909)
chr4 (314-627)||(8756276-8756586)
chr4 (316-632)||(13543953-13544272)
chr4 (355-651)||(18709165-18709458)
chr4 (314-642)||(47210762-47211082)
chr4 (314-667)||(53405124-53405481)
chr4 (383-667)||(26085962-26086243)
chr4 (315-626)||(18534858-18535164)
chr4 (287-568)||(52942541-52942810)
chr4 (431-651)||(16455355-16455574)
chr4 (315-545)||(3937314-3937543)
chr4 (315-535)||(6132871-6133090)
chr4 (400-673)||(27499128-27499396)
chr4 (397-642)||(38890234-38890476)
chr4 (79-272)||(9174491-9174684)
chr4 (465-673)||(13547302-13547508)
chr4 (315-478)||(38270158-38270321)
chr4 (459-673)||(2891433-2891646)
chr4 (314-644)||(15032555-15032872)
chr4 (405-672)||(30136640-30136903)
chr4 (79-268)||(11006590-11006781)
chr4 (315-478)||(24446756-24446914)
chr4 (315-644)||(12102088-12102414)
chr4 (81-224)||(51015042-51015185)
chr4 (494-669)||(4215483-4215656)
chr4 (87-264)||(37089727-37089906)
chr4 (316-642)||(28453686-28454007)
chr4 (79-196)||(7941133-7941251)
chr4 (515-667)||(5635461-5635611)
chr4 (79-264)||(36919940-36920125)
chr4 (79-196)||(11434769-11434887)
chr4 (79-264)||(3824926-3825112)
chr4 (314-453)||(5100994-5101133)
chr4 (321-642)||(9863712-9864036)
chr4 (79-264)||(5637822-5638006)
chr4 (314-673)||(25357634-25357997)
chr4 (515-667)||(11437561-11437710)
chr4 (452-615)||(31983564-31983727)
chr4 (316-611)||(40998990-40999281)
chr4 (79-264)||(38408993-38409179)
chr4 (315-427)||(2891314-2891427)
chr4 (81-224)||(22803127-22803270)
chr4 (79-264)||(31849952-31850138)
chr4 (77-220)||(36921893-36922035)
chr4 (422-641)||(3982186-3982411)
chr4 (371-640)||(47150904-47151167)
chr4 (87-264)||(24888598-24888776)
chr4 (533-671)||(5101145-5101280)
chr4 (314-642)||(16185844-16186173)
chr4 (79-224)||(22044783-22044930)
chr4 (322-642)||(10112876-10113194)
chr4 (371-618)||(9022362-9022605)
chr4 (565-673)||(47563008-47563115)
chr4 (79-264)||(48486113-48486299)
chr4 (580-673)||(6133098-6133191)
chr4 (468-628)||(7050282-7050439)
chr4 (555-644)||(26557823-26557911)
chr4 (398-628)||(36769406-36769636)
chr4 (468-628)||(11853549-11853705)
chr4 (471-628)||(4556085-4556238)
chr4 (471-628)||(8529270-8529424)
chr4 (397-495)||(10114412-10114505)
chr4 (471-628)||(31300427-31300580)
chr4 (102-196)||(22801262-22801356)
chr4 (398-628)||(36771323-36771553)
chr4 (471-628)||(4884877-4885031)
chr4 (165-264)||(5198300-5198400)
chr4 (79-217)||(9148054-9148192)
chr4 (471-628)||(15831144-15831298)
chr4 (87-217)||(52942869-52942999)
chr4 (535-625)||(3578699-3578786)
chr4 (566-625)||(22295412-22295471)
chr4 (471-622)||(4558314-4558462)
chr4 (468-622)||(4570094-4570245)
chr4 (539-651)||(49088791-49088903)
chr4 (468-616)||(55822265-55822409)
chr4 (586-651)||(14789429-14789496)
chr4 (471-628)||(15312319-15312473)
chr4 (471-628)||(15316961-15317114)
chr4 (471-628)||(16688965-16689119)
chr4 (471-628)||(18586969-18587123)
chr4 (613-673)||(52942467-52942527)
chr4 (166-224)||(22047078-22047135)
chr4 (583-651)||(5269215-5269283)
chr4 (558-640)||(10114558-10114639)
chr4 (314-386)||(16455284-16455356)
chr4 (79-163)||(22048491-22048575)
chr4 (610-672)||(3937254-3937316)
chr4 (537-615)||(24446678-24446754)
chr4 (422-495)||(38208839-38208911)
chr4 (535-601)||(54928699-54928764)
chr4 (580-668)||(5336764-5336853)
chr4 (172-249)||(47868288-47868365)
chr4 (453-617)||(54906722-54906888)
chr4 (583-651)||(10047384-10047452)
chr4 (583-651)||(39245999-39246067)
chr4 (605-651)||(5143264-5143310)
chr4 (582-628)||(16631294-16631340)
chr4 (314-344)||(22134936-22134966)
chr4 (183-224)||(619841-619882)
chr4 (79-124)||(8528918-8528963)
chr4 (172-249)||(16689303-16689380)
chr4 (471-528)||(25699752-25699808)
chr4 (583-652)||(36315253-36315322)
chr4 (583-652)||(36329462-36329531)
chr4 (176-248)||(4556422-4556494)
chr4 (566-606)||(23001449-23001489)
chr4 (629-673)||(24446633-24446677)
chr4 (76-124)||(47868192-47868240)
chr4 (315-343)||(52043737-52043765)
chr4 (184-224)||(52942841-52942881)
[»] chr7 (141 HSPs)
chr7 (79-665)||(1046912-1047503)
chr7 (293-673)||(31435025-31435404)
chr7 (314-673)||(13099453-13099812)
chr7 (315-675)||(44724533-44724891)
chr7 (315-673)||(20137088-20137444)
chr7 (316-673)||(37412104-37412462)
chr7 (287-667)||(40836728-40837105)
chr7 (287-667)||(35555-35933)
chr7 (287-665)||(1049283-1049658)
chr7 (287-673)||(27306211-27306592)
chr7 (287-667)||(44490-44868)
chr7 (314-667)||(38393935-38394290)
chr7 (315-672)||(11355212-11355567)
chr7 (314-667)||(48457602-48457957)
chr7 (317-667)||(7470007-7470359)
chr7 (287-667)||(3878497-3878881)
chr7 (314-667)||(20299407-20299764)
chr7 (317-667)||(7471965-7472317)
chr7 (314-672)||(42330977-42331335)
chr7 (79-357)||(2935070-2935349)
chr7 (317-670)||(20625990-20626345)
chr7 (317-670)||(20629881-20630236)
chr7 (317-670)||(20642300-20642655)
chr7 (315-673)||(4295913-4296271)
chr7 (314-667)||(18345490-18345845)
chr7 (315-673)||(9680768-9681130)
chr7 (321-673)||(24258423-24258778)
chr7 (315-672)||(24748548-24748904)
chr7 (315-673)||(39145965-39146322)
chr7 (316-673)||(21990106-21990460)
chr7 (289-665)||(25542459-25542830)
chr7 (314-673)||(443548-443906)
chr7 (314-667)||(40946277-40946632)
chr7 (355-667)||(1849975-1850285)
chr7 (314-666)||(3035670-3036027)
chr7 (315-599)||(25276095-25276378)
chr7 (315-642)||(21679981-21680306)
chr7 (79-358)||(9027396-9027687)
chr7 (79-358)||(22136878-22137169)
chr7 (79-358)||(40551905-40552196)
chr7 (348-673)||(21592122-21592445)
chr7 (315-642)||(21678020-21678345)
chr7 (315-633)||(27832651-27832969)
chr7 (314-651)||(31155912-31156247)
chr7 (79-358)||(22107867-22108158)
chr7 (79-358)||(40549627-40549918)
chr7 (314-667)||(20297311-20297666)
chr7 (314-667)||(28487502-28487857)
chr7 (314-667)||(43253502-43253860)
chr7 (315-673)||(42223110-42223468)
chr7 (316-673)||(9679009-9679369)
chr7 (314-640)||(7349285-7349615)
chr7 (287-551)||(26804499-26804762)
chr7 (314-595)||(11757177-11757462)
chr7 (314-612)||(22828672-22828969)
chr7 (314-651)||(7351653-7351994)
chr7 (314-665)||(28485515-28485867)
chr7 (317-642)||(24817362-24817682)
chr7 (314-644)||(7188496-7188822)
chr7 (314-595)||(22251602-22251878)
chr7 (314-619)||(20091580-20091877)
chr7 (430-667)||(7092198-7092432)
chr7 (390-642)||(24813507-24813755)
chr7 (293-479)||(18567545-18567731)
chr7 (316-642)||(24465503-24465816)
chr7 (430-667)||(7094445-7094679)
chr7 (439-667)||(38396713-38396938)
chr7 (287-506)||(22392399-22392606)
chr7 (514-672)||(22393875-22394032)
chr7 (467-651)||(2935374-2935556)
chr7 (371-642)||(11081522-11081790)
chr7 (79-196)||(40837144-40837261)
chr7 (79-224)||(3878322-3878467)
chr7 (314-642)||(6332179-6332501)
chr7 (467-667)||(22108173-22108370)
chr7 (467-667)||(40549933-40550130)
chr7 (467-651)||(9027195-9027376)
chr7 (467-667)||(22137184-22137381)
chr7 (467-667)||(40552211-40552408)
chr7 (467-651)||(1606486-1606667)
chr7 (515-651)||(26295601-26295736)
chr7 (78-264)||(27306582-27306768)
chr7 (371-644)||(6048885-6049155)
chr7 (79-196)||(26804345-26804462)
chr7 (78-224)||(25542280-25542425)
chr7 (453-642)||(16297031-16297222)
chr7 (79-264)||(35379-35565)
chr7 (317-410)||(7094662-7094759)
chr7 (468-628)||(25351353-25351508)
chr7 (535-640)||(6046668-6046772)
chr7 (509-600)||(6348930-6349020)
chr7 (468-628)||(25410130-25410287)
chr7 (452-628)||(2120881-2121056)
chr7 (317-410)||(7092414-7092512)
chr7 (361-422)||(38396316-38396377)
chr7 (468-628)||(25357047-25357202)
chr7 (79-224)||(44314-44459)
chr7 (600-667)||(11759364-11759431)
chr7 (314-363)||(1606423-1606472)
chr7 (468-628)||(3320076-3320232)
chr7 (468-628)||(3324824-3324980)
chr7 (468-628)||(25405393-25405549)
chr7 (76-193)||(1049699-1049816)
chr7 (468-628)||(8378529-8378686)
chr7 (390-495)||(11084409-11084509)
chr7 (79-224)||(18567363-18567508)
chr7 (315-495)||(26210500-26210674)
chr7 (79-224)||(31435441-31435586)
chr7 (468-628)||(7069780-7069936)
chr7 (468-628)||(7074787-7074943)
chr7 (471-628)||(30246973-30247127)
chr7 (456-624)||(40281411-40281572)
chr7 (471-628)||(44010775-44010929)
chr7 (471-628)||(44143892-44144045)
chr7 (321-446)||(6348778-6348903)
chr7 (468-628)||(42006663-42006820)
chr7 (314-438)||(30906264-30906386)
chr7 (316-383)||(3677235-3677301)
chr7 (615-673)||(26804762-26804820)
chr7 (582-628)||(34546905-34546951)
chr7 (398-628)||(44016686-44016916)
chr7 (468-628)||(15541021-15541177)
chr7 (314-358)||(1849918-1849962)
chr7 (471-628)||(44512551-44512704)
chr7 (429-506)||(12310160-12310236)
chr7 (541-642)||(13290483-13290583)
chr7 (582-628)||(2075226-2075272)
chr7 (582-628)||(7464544-7464590)
chr7 (477-628)||(6067223-6067373)
chr7 (608-651)||(12097868-12097911)
chr7 (471-510)||(34547003-34547042)
chr7 (605-651)||(9190054-9190100)
chr7 (589-651)||(20284094-20284156)
chr7 (468-506)||(21369642-21369680)
chr7 (614-672)||(25276381-25276439)
chr7 (314-343)||(38396239-38396268)
chr7 (172-249)||(40946167-40946244)
chr7 (608-644)||(4253536-4253572)
chr7 (583-651)||(21983289-21983357)
chr7 (611-651)||(30024733-30024773)
chr7 (583-651)||(46516334-46516402)
[»] chr3 (205 HSPs)
chr3 (78-651)||(50493675-50494257)
chr3 (79-651)||(38210067-38210628)
chr3 (79-642)||(6063454-6064006)
chr3 (136-651)||(25388654-25389163)
chr3 (287-673)||(32264015-32264404)
chr3 (314-673)||(4308258-4308615)
chr3 (287-673)||(45882835-45883220)
chr3 (287-667)||(3859424-3859801)
chr3 (287-667)||(10956010-10956388)
chr3 (287-667)||(10958306-10958684)
chr3 (287-667)||(11170300-11170678)
chr3 (78-667)||(38889756-38890314)
chr3 (314-667)||(51726990-51727340)
chr3 (314-673)||(43228214-43228571)
chr3 (287-673)||(18096877-18097262)
chr3 (287-669)||(18099151-18099531)
chr3 (314-673)||(53917641-53917998)
chr3 (314-673)||(1313333-1313689)
chr3 (287-667)||(5191549-5191925)
chr3 (315-673)||(1626660-1627016)
chr3 (315-673)||(43423440-43423796)
chr3 (287-667)||(22114288-22114666)
chr3 (287-673)||(24979603-24979988)
chr3 (315-673)||(3314608-3314965)
chr3 (314-673)||(43226009-43226363)
chr3 (314-673)||(27101158-27101519)
chr3 (315-673)||(28101979-28102335)
chr3 (355-673)||(30005805-30006121)
chr3 (314-667)||(4103879-4104233)
chr3 (316-673)||(43421392-43421747)
chr3 (286-651)||(6065795-6066159)
chr3 (314-667)||(25533357-25533716)
chr3 (355-671)||(42990268-42990582)
chr3 (79-369)||(53896475-53896754)
chr3 (287-667)||(10084372-10084754)
chr3 (287-667)||(26720444-26720821)
chr3 (314-673)||(53915473-53915830)
chr3 (314-673)||(9604584-9604946)
chr3 (287-556)||(35777317-35777587)
chr3 (287-673)||(15780756-15781159)
chr3 (321-609)||(6561740-6562028)
chr3 (287-667)||(5522610-5522976)
chr3 (287-673)||(48361648-48362031)
chr3 (287-673)||(18162560-18162943)
chr3 (315-673)||(880428-880785)
chr3 (314-673)||(51943294-51943650)
chr3 (314-670)||(28761407-28761762)
chr3 (291-673)||(12267952-12268323)
chr3 (314-651)||(746674-747015)
chr3 (315-673)||(53468430-53468788)
chr3 (291-651)||(10191309-10191670)
chr3 (315-669)||(5926746-5927097)
chr3 (315-673)||(36011751-36012107)
chr3 (314-650)||(35917944-35918283)
chr3 (314-672)||(39715393-39715744)
chr3 (395-667)||(1321483-1321753)
chr3 (316-673)||(51674743-51675087)
chr3 (314-651)||(458203-458542)
chr3 (314-651)||(455826-456165)
chr3 (355-614)||(29956650-29956907)
chr3 (315-673)||(47148872-47149233)
chr3 (355-651)||(10621529-10621823)
chr3 (315-673)||(54691551-54691906)
chr3 (287-673)||(32218991-32219365)
chr3 (315-642)||(889781-890104)
chr3 (404-672)||(6484372-6484639)
chr3 (314-672)||(23633383-23633732)
chr3 (314-640)||(53597164-53597485)
chr3 (314-671)||(42992205-42992548)
chr3 (315-628)||(31151271-31151579)
chr3 (413-667)||(7606571-7606822)
chr3 (381-667)||(28413014-28413299)
chr3 (315-546)||(28100143-28100374)
chr3 (314-640)||(13420195-13420506)
chr3 (412-673)||(4666535-4666794)
chr3 (91-348)||(5899471-5899717)
chr3 (442-673)||(25688137-25688367)
chr3 (315-651)||(53591119-53591441)
chr3 (315-554)||(28180948-28181185)
chr3 (398-641)||(561783-562024)
chr3 (439-673)||(6231849-6232080)
chr3 (79-348)||(5885983-5886242)
chr3 (398-672)||(17795269-17795538)
chr3 (398-672)||(19103709-19103978)
chr3 (316-673)||(27635635-27635959)
chr3 (315-600)||(54884081-54884362)
chr3 (316-568)||(23636952-23637200)
chr3 (398-642)||(25635391-25635631)
chr3 (287-459)||(11163046-11163218)
chr3 (455-667)||(11168165-11168375)
chr3 (79-264)||(22114656-22114842)
chr3 (321-642)||(36871308-36871624)
chr3 (79-264)||(18099521-18099707)
chr3 (356-483)||(41849117-41849244)
chr3 (452-669)||(5886261-5886474)
chr3 (452-669)||(5899734-5899947)
chr3 (315-539)||(28137415-28137628)
chr3 (469-673)||(3306839-3307040)
chr3 (79-196)||(35777163-35777280)
chr3 (287-495)||(24177175-24177380)
chr3 (316-444)||(6231374-6231502)
chr3 (80-264)||(5191374-5191559)
chr3 (521-669)||(47701652-47701798)
chr3 (315-445)||(47701798-47701928)
chr3 (314-580)||(1673898-1674160)
chr3 (270-363)||(6719396-6719489)
chr3 (79-210)||(18097291-18097422)
chr3 (74-264)||(10956378-10956568)
chr3 (287-387)||(1321337-1321437)
chr3 (79-164)||(7606878-7606963)
chr3 (316-427)||(3306724-3306835)
chr3 (453-644)||(1620466-1620657)
chr3 (79-196)||(11162891-11163008)
chr3 (515-640)||(24181504-24181629)
chr3 (534-644)||(25634030-25634139)
chr3 (390-622)||(13419883-13420110)
chr3 (314-506)||(4560426-4560599)
chr3 (87-208)||(10192401-10192521)
chr3 (78-264)||(32264394-32264581)
chr3 (576-673)||(41849243-41849339)
chr3 (587-667)||(35919098-35919178)
chr3 (423-600)||(14634491-14634665)
chr3 (79-224)||(26720268-26720413)
chr3 (202-268)||(6066144-6066210)
chr3 (398-495)||(25633930-25634024)
chr3 (87-208)||(10085481-10085601)
chr3 (79-264)||(1321161-1321347)
chr3 (79-194)||(11170145-11170260)
chr3 (137-196)||(6066195-6066254)
chr3 (79-196)||(6719532-6719651)
chr3 (471-628)||(29913980-29914132)
chr3 (181-264)||(3859350-3859434)
chr3 (79-264)||(5522966-5523152)
chr3 (542-628)||(11007545-11007630)
chr3 (468-628)||(10094100-10094256)
chr3 (172-264)||(10958674-10958767)
chr3 (471-628)||(47878196-47878350)
chr3 (468-628)||(11079517-11079674)
chr3 (468-628)||(10100117-10100273)
chr3 (468-628)||(10200980-10201136)
chr3 (598-667)||(53894040-53894109)
chr3 (471-628)||(10595059-10595213)
chr3 (471-628)||(10897008-10897162)
chr3 (471-628)||(54193229-54193383)
chr3 (472-628)||(10949285-10949438)
chr3 (566-644)||(27420824-27420903)
chr3 (468-628)||(6303310-6303466)
chr3 (567-628)||(7768745-7768806)
chr3 (468-628)||(10208026-10208182)
chr3 (79-124)||(25388618-25388663)
chr3 (76-124)||(3859314-3859362)
chr3 (471-628)||(10612803-10612957)
chr3 (371-493)||(7768554-7768672)
chr3 (468-628)||(22626009-22626166)
chr3 (397-493)||(31021300-31021392)
chr3 (582-628)||(48390327-48390373)
chr3 (79-124)||(6066246-6066291)
chr3 (314-379)||(6484308-6484373)
chr3 (435-480)||(7606828-7606873)
chr3 (468-628)||(27544273-27544429)
chr3 (79-154)||(32218836-32218912)
chr3 (476-628)||(4535622-4535772)
chr3 (468-628)||(5858546-5858701)
chr3 (79-146)||(48362119-48362186)
chr3 (608-651)||(46173481-46173524)
chr3 (468-510)||(16462203-16462245)
chr3 (172-226)||(45882752-45882806)
chr3 (468-510)||(47883022-47883064)
chr3 (583-649)||(48438221-48438287)
chr3 (314-387)||(1618916-1618992)
chr3 (172-249)||(4308648-4308725)
chr3 (471-628)||(20031342-20031497)
chr3 (567-628)||(31021185-31021244)
chr3 (583-651)||(1736319-1736387)
chr3 (583-651)||(16264355-16264423)
chr3 (583-651)||(18552897-18552965)
chr3 (545-643)||(27703177-27703274)
chr3 (471-628)||(27762011-27762165)
chr3 (583-651)||(30709804-30709872)
chr3 (583-651)||(32143326-32143394)
chr3 (583-651)||(33386680-33386748)
chr3 (535-590)||(42297721-42297777)
chr3 (535-640)||(15823659-15823763)
chr3 (314-353)||(25690651-25690690)
chr3 (608-651)||(30236249-30236292)
chr3 (589-651)||(1417510-1417572)
chr3 (287-345)||(13893289-13893347)
chr3 (605-651)||(25795786-25795832)
chr3 (314-343)||(10621847-10621876)
chr3 (581-626)||(16996987-16997032)
chr3 (172-249)||(27101627-27101704)
chr3 (316-345)||(31021450-31021479)
chr3 (172-249)||(35918316-35918393)
chr3 (314-343)||(42990205-42990234)
chr3 (614-671)||(42992607-42992664)
chr3 (176-249)||(43228108-43228181)
chr3 (583-651)||(8370500-8370568)
chr3 (599-651)||(24695194-24695246)
chr3 (314-350)||(27101558-27101594)
chr3 (583-651)||(27452963-27453031)
chr3 (583-651)||(27974966-27975034)
chr3 (583-651)||(27986460-27986528)
chr3 (583-651)||(39040006-39040074)
chr3 (555-630)||(46966671-46966743)
chr3 (565-601)||(53973728-53973764)
[»] chr5 (147 HSPs)
chr5 (79-651)||(31542442-31543012)
chr5 (79-651)||(31544798-31545358)
chr5 (136-651)||(31179372-31179897)
chr5 (287-673)||(21947943-21948326)
chr5 (287-667)||(25921458-25921836)
chr5 (287-667)||(38882021-38882399)
chr5 (287-673)||(2818314-2818699)
chr5 (317-673)||(18511191-18511547)
chr5 (314-673)||(39854427-39854783)
chr5 (287-667)||(2174835-2175212)
chr5 (287-667)||(4236545-4236922)
chr5 (315-672)||(17072827-17073183)
chr5 (317-673)||(18509297-18509652)
chr5 (289-668)||(16776075-16776452)
chr5 (314-673)||(40221465-40221823)
chr5 (315-673)||(31472591-31472948)
chr5 (355-673)||(16092178-16092495)
chr5 (315-673)||(1189586-1189949)
chr5 (314-660)||(10529091-10529435)
chr5 (314-673)||(26097676-26098031)
chr5 (316-667)||(18466625-18466978)
chr5 (314-666)||(18596590-18596939)
chr5 (315-672)||(24126800-24127155)
chr5 (314-673)||(6756437-6756792)
chr5 (315-673)||(25904047-25904403)
chr5 (314-667)||(27912473-27912830)
chr5 (314-669)||(6747247-6747600)
chr5 (355-669)||(6745053-6745364)
chr5 (314-667)||(18468950-18469303)
chr5 (314-651)||(37705781-37706116)
chr5 (355-667)||(25804009-25804318)
chr5 (314-667)||(27910388-27910744)
chr5 (318-673)||(10474302-10474655)
chr5 (79-355)||(15354777-15355065)
chr5 (79-355)||(15357053-15357341)
chr5 (288-673)||(12555902-12556285)
chr5 (79-352)||(10756960-10757245)
chr5 (287-667)||(21684437-21684824)
chr5 (315-672)||(695833-696177)
chr5 (315-596)||(34530721-34531001)
chr5 (79-351)||(10749505-10749767)
chr5 (322-669)||(17818475-17818817)
chr5 (78-358)||(23664833-23665125)
chr5 (78-358)||(23793462-23793754)
chr5 (355-667)||(34479403-34479714)
chr5 (287-673)||(36402307-36402690)
chr5 (323-673)||(2954368-2954716)
chr5 (287-673)||(31465968-31466341)
chr5 (355-667)||(34477038-34477349)
chr5 (79-358)||(23667109-23667400)
chr5 (79-343)||(34477379-34477632)
chr5 (315-671)||(39397974-39398327)
chr5 (393-673)||(658335-658610)
chr5 (315-528)||(20042994-20043207)
chr5 (355-651)||(15552229-15552523)
chr5 (320-651)||(6661185-6661512)
chr5 (315-533)||(20044954-20045172)
chr5 (322-672)||(21288715-21289060)
chr5 (314-667)||(10586782-10587126)
chr5 (449-672)||(20505823-20506042)
chr5 (438-671)||(41585725-41585956)
chr5 (79-358)||(38960334-38960604)
chr5 (314-506)||(26098395-26098587)
chr5 (438-667)||(4410090-4410316)
chr5 (433-673)||(2723964-2724193)
chr5 (79-343)||(34479740-34479972)
chr5 (450-667)||(39798126-39798341)
chr5 (316-671)||(9020167-9020518)
chr5 (358-672)||(20053834-20054136)
chr5 (315-672)||(36208524-36208874)
chr5 (79-264)||(38881845-38882031)
chr5 (371-641)||(17413176-17413441)
chr5 (314-453)||(20507659-20507798)
chr5 (79-196)||(2174680-2174797)
chr5 (69-196)||(25921874-25922002)
chr5 (467-651)||(10749796-10749978)
chr5 (87-224)||(4236378-4236515)
chr5 (71-196)||(39797841-39797966)
chr5 (467-651)||(3373138-3373320)
chr5 (467-667)||(15354560-15354757)
chr5 (467-667)||(23665140-23665337)
chr5 (467-667)||(23793250-23793447)
chr5 (467-651)||(38960133-38960314)
chr5 (453-628)||(15143547-15143722)
chr5 (467-651)||(10757273-10757454)
chr5 (467-667)||(15356836-15357033)
chr5 (314-411)||(4410000-4410101)
chr5 (259-358)||(23742057-23742157)
chr5 (79-224)||(16775897-16776042)
chr5 (474-667)||(23741844-23742034)
chr5 (371-615)||(2144599-2144840)
chr5 (76-161)||(18186504-18186590)
chr5 (314-528)||(42770717-42770923)
chr5 (79-196)||(659713-659829)
chr5 (79-143)||(21684905-21684969)
chr5 (314-410)||(41585946-41586042)
chr5 (170-267)||(21684811-21684909)
chr5 (541-628)||(15445291-15445376)
chr5 (468-628)||(35385477-35385634)
chr5 (371-595)||(4754159-4754377)
chr5 (471-628)||(4897828-4897985)
chr5 (468-628)||(1170811-1170967)
chr5 (79-161)||(20504369-20504452)
chr5 (471-628)||(22672837-22672991)
chr5 (566-673)||(26098267-26098374)
chr5 (589-672)||(20043206-20043289)
chr5 (499-586)||(42770938-42771024)
chr5 (314-359)||(3373332-3373377)
chr5 (471-628)||(17841274-17841428)
chr5 (371-495)||(29748352-29748471)
chr5 (468-628)||(1240428-1240585)
chr5 (468-628)||(2298026-2298183)
chr5 (79-161)||(36402762-36402845)
chr5 (473-628)||(25445501-25445653)
chr5 (79-124)||(31179888-31179933)
chr5 (79-161)||(20507918-20508001)
chr5 (79-161)||(21947770-21947853)
chr5 (422-597)||(34033621-34033797)
chr5 (79-196)||(31466379-31466496)
chr5 (535-628)||(42238327-42238417)
chr5 (422-506)||(15224914-15224997)
chr5 (287-341)||(39798004-39798058)
chr5 (474-617)||(40222769-40222909)
chr5 (172-249)||(4409890-4409967)
chr5 (371-600)||(35430172-35430408)
chr5 (471-628)||(25452498-25452652)
chr5 (471-628)||(28786407-28786561)
chr5 (541-604)||(20045210-20045272)
chr5 (134-214)||(659850-659929)
chr5 (172-249)||(39854317-39854394)
chr5 (471-628)||(11962458-11962612)
chr5 (79-161)||(12556358-12556441)
chr5 (315-365)||(2723911-2723961)
chr5 (89-161)||(2818763-2818836)
chr5 (582-628)||(10627477-10627523)
chr5 (390-442)||(13295760-13295809)
chr5 (314-343)||(2144899-2144928)
chr5 (172-249)||(6744894-6744971)
chr5 (172-249)||(6747137-6747214)
chr5 (314-343)||(15552178-15552207)
chr5 (314-343)||(25803959-25803988)
chr5 (583-651)||(9353356-9353424)
chr5 (583-651)||(11916996-11917064)
chr5 (589-641)||(28832274-28832326)
chr5 (315-343)||(29748285-29748313)
chr5 (583-651)||(36932374-36932442)
chr5 (172-248)||(42238047-42238123)
[»] chr1 (141 HSPs)
chr1 (79-651)||(47179428-47179990)
chr1 (87-651)||(16225895-16226445)
chr1 (79-651)||(47177078-47177639)
chr1 (287-667)||(51749955-51750333)
chr1 (287-673)||(15823462-15823846)
chr1 (287-642)||(13214997-13215355)
chr1 (287-667)||(28840594-28840973)
chr1 (287-667)||(10399815-10400193)
chr1 (287-665)||(6822931-6823306)
chr1 (291-667)||(28842413-28842788)
chr1 (314-667)||(20302402-20302752)
chr1 (287-667)||(13761753-13762130)
chr1 (287-673)||(38925462-38925843)
chr1 (314-673)||(12302486-12302848)
chr1 (287-673)||(41646836-41647220)
chr1 (315-642)||(2617460-2617785)
chr1 (314-673)||(16428596-16428954)
chr1 (314-673)||(17324617-17324974)
chr1 (287-673)||(39462435-39462819)
chr1 (315-672)||(17186109-17186465)
chr1 (287-667)||(51752281-51752657)
chr1 (314-672)||(9241067-9241424)
chr1 (315-672)||(50307527-50307884)
chr1 (315-673)||(50076653-50077009)
chr1 (287-673)||(28207049-28207431)
chr1 (315-673)||(11457456-11457812)
chr1 (315-673)||(18839531-18839888)
chr1 (315-673)||(50078801-50079158)
chr1 (316-673)||(18307054-18307409)
chr1 (314-667)||(31735508-31735863)
chr1 (314-673)||(6995681-6996038)
chr1 (314-673)||(27336921-27337280)
chr1 (314-673)||(27339112-27339472)
chr1 (316-673)||(25251255-25251611)
chr1 (355-669)||(4131360-4131676)
chr1 (291-673)||(3579598-3579979)
chr1 (355-673)||(25127856-25128173)
chr1 (314-672)||(28998235-28998591)
chr1 (314-672)||(29003951-29004307)
chr1 (315-672)||(31489859-31490211)
chr1 (317-667)||(39932017-39932368)
chr1 (293-673)||(14097950-14098329)
chr1 (314-667)||(20291400-20291750)
chr1 (314-673)||(47906207-47906570)
chr1 (317-667)||(15294821-15295183)
chr1 (314-664)||(24325599-24325954)
chr1 (336-673)||(31424996-31425335)
chr1 (314-673)||(6756470-6756828)
chr1 (316-673)||(17318838-17319187)
chr1 (317-616)||(21948226-21948526)
chr1 (364-669)||(40133937-40134241)
chr1 (314-667)||(2510312-2510666)
chr1 (363-667)||(46431693-46431996)
chr1 (314-673)||(2949213-2949569)
chr1 (315-673)||(17324009-17324362)
chr1 (314-651)||(9463247-9463588)
chr1 (315-673)||(50248551-50248909)
chr1 (314-651)||(9459420-9459761)
chr1 (79-353)||(23783238-23783533)
chr1 (314-673)||(31422841-31423212)
chr1 (314-599)||(48665114-48665404)
chr1 (106-411)||(16231368-16231641)
chr1 (315-642)||(14183602-14183923)
chr1 (362-673)||(16432396-16432696)
chr1 (287-642)||(47451564-47451911)
chr1 (314-641)||(8347284-8347607)
chr1 (314-642)||(42922177-42922501)
chr1 (287-568)||(6823800-6824089)
chr1 (314-628)||(15669419-15669729)
chr1 (316-628)||(8349077-8349385)
chr1 (314-626)||(18800600-18800907)
chr1 (314-644)||(49495220-49495537)
chr1 (456-673)||(16429042-16429258)
chr1 (438-665)||(25248540-25248766)
chr1 (79-264)||(51752104-51752291)
chr1 (79-264)||(13761577-13761763)
chr1 (463-667)||(51757623-51757824)
chr1 (79-264)||(51749778-51749965)
chr1 (451-673)||(6115083-6115304)
chr1 (321-644)||(13125466-13125787)
chr1 (438-642)||(16231630-16231832)
chr1 (99-264)||(6823643-6823810)
chr1 (79-264)||(20302198-20302385)
chr1 (79-196)||(6822775-6822893)
chr1 (467-651)||(23785935-23786117)
chr1 (314-640)||(27916440-27916765)
chr1 (515-672)||(23816030-23816185)
chr1 (79-264)||(10400183-10400369)
chr1 (321-628)||(26520146-26520449)
chr1 (287-651)||(30790403-30790759)
chr1 (315-628)||(30738653-30738963)
chr1 (450-642)||(16561545-16561738)
chr1 (453-630)||(155788-155963)
chr1 (78-223)||(15823285-15823430)
chr1 (315-628)||(26613265-26613577)
chr1 (543-642)||(15916562-15916661)
chr1 (78-184)||(20291279-20291386)
chr1 (394-628)||(28279292-28279523)
chr1 (316-410)||(25248756-25248850)
chr1 (87-264)||(28840426-28840604)
chr1 (87-219)||(28842241-28842373)
chr1 (471-628)||(21353373-21353525)
chr1 (587-667)||(13358787-13358867)
chr1 (371-495)||(26332719-26332836)
chr1 (542-626)||(43104332-43104414)
chr1 (321-495)||(13127790-13127959)
chr1 (471-628)||(2401246-2401400)
chr1 (471-628)||(9526469-9526623)
chr1 (566-626)||(13127715-13127775)
chr1 (390-598)||(14352978-14353190)
chr1 (81-161)||(38925915-38925996)
chr1 (172-249)||(13449919-13449996)
chr1 (471-624)||(25134074-25134224)
chr1 (567-627)||(32261337-32261397)
chr1 (79-161)||(47451405-47451488)
chr1 (468-628)||(4144708-4144865)
chr1 (348-387)||(6115344-6115383)
chr1 (471-627)||(9521718-9521871)
chr1 (453-528)||(26332613-26332688)
chr1 (186-264)||(28207421-28207500)
chr1 (166-264)||(30790749-30790848)
chr1 (78-223)||(39462257-39462402)
chr1 (468-510)||(2232597-2232639)
chr1 (566-600)||(8213579-8213613)
chr1 (112-264)||(13214854-13215007)
chr1 (79-148)||(14098441-14098510)
chr1 (605-651)||(32889444-32889490)
chr1 (535-651)||(46783212-46783327)
chr1 (453-506)||(49959129-49959183)
chr1 (471-628)||(2393308-2393461)
chr1 (567-615)||(11693349-11693397)
chr1 (314-366)||(16431044-16431096)
chr1 (583-651)||(37069775-37069843)
chr1 (79-161)||(49687301-49687384)
chr1 (583-642)||(16124540-16124599)
chr1 (314-343)||(43104102-43104131)
chr1 (314-343)||(46432037-46432066)
chr1 (467-503)||(10115880-10115916)
chr1 (583-651)||(13598403-13598471)
chr1 (583-651)||(21536593-21536661)
chr1 (583-651)||(47703960-47704028)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (79-642)||(5927-6477)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (79-667)||(18810483-18811057)
chr8 (79-651)||(43081722-43082307)
chr8 (79-667)||(18812668-18813231)
chr8 (79-651)||(44720617-44721177)
chr8 (287-673)||(14807723-14808117)
chr8 (287-667)||(27829269-27829646)
chr8 (287-673)||(28251546-28251930)
chr8 (287-667)||(27826958-27827335)
chr8 (287-666)||(15067953-15068330)
chr8 (291-673)||(15072686-15073067)
chr8 (314-671)||(27911014-27911367)
chr8 (314-671)||(27957433-27957786)
chr8 (287-667)||(4423990-4424368)
chr8 (314-673)||(14419169-14419527)
chr8 (315-672)||(25952521-25952876)
chr8 (314-673)||(1225165-1225523)
chr8 (314-642)||(13858494-13858820)
chr8 (79-343)||(43079347-43079614)
chr8 (314-667)||(32339304-32339659)
chr8 (324-660)||(608735-609077)
chr8 (315-673)||(30480482-30480838)
chr8 (315-672)||(27106877-27107232)
chr8 (314-667)||(3874005-3874360)
chr8 (315-642)||(5372186-5372512)
chr8 (314-667)||(22684638-22685002)
chr8 (314-667)||(15809214-15809568)
chr8 (316-672)||(36865538-36865892)
chr8 (314-673)||(41384744-41385100)
chr8 (314-667)||(28283206-28283561)
chr8 (315-561)||(14477276-14477522)
chr8 (314-673)||(41382672-41383018)
chr8 (314-667)||(43530123-43530465)
chr8 (363-651)||(43079650-43079936)
chr8 (314-672)||(15185694-15186046)
chr8 (314-640)||(24873193-24873523)
chr8 (315-642)||(21482322-21482636)
chr8 (405-673)||(15956051-15956314)
chr8 (314-642)||(31162212-31162538)
chr8 (348-642)||(21480547-21480828)
chr8 (315-506)||(33541532-33541723)
chr8 (314-492)||(26775200-26775378)
chr8 (348-642)||(3005640-3005929)
chr8 (315-506)||(5622882-5623073)
chr8 (315-478)||(35872555-35872713)
chr8 (291-415)||(3886153-3886277)
chr8 (291-426)||(12517248-12517385)
chr8 (287-495)||(2468261-2468461)
chr8 (79-264)||(27826782-27826968)
chr8 (79-264)||(27829093-27829279)
chr8 (450-623)||(31035252-31035424)
chr8 (453-628)||(31578301-31578476)
chr8 (87-224)||(14807556-14807693)
chr8 (438-586)||(181622-181771)
chr8 (520-644)||(2468137-2468260)
chr8 (316-487)||(31035068-31035238)
chr8 (397-583)||(31573794-31573975)
chr8 (348-472)||(37214369-37214512)
chr8 (314-410)||(181536-181632)
chr8 (78-224)||(12517420-12517566)
chr8 (100-196)||(3886322-3886419)
chr8 (553-673)||(33541389-33541507)
chr8 (87-264)||(15067785-15067963)
chr8 (468-628)||(28327908-28328064)
chr8 (79-264)||(15072506-15072692)
chr8 (87-217)||(28251988-28252118)
chr8 (18-68)||(23286084-23286134)
chr8 (555-642)||(6376229-6376315)
chr8 (468-628)||(16757293-16757449)
chr8 (453-628)||(17847661-17847830)
chr8 (78-196)||(4423834-4423952)
chr8 (471-628)||(29554810-29554964)
chr8 (468-628)||(28332631-28332787)
chr8 (471-628)||(23179586-23179740)
chr8 (605-673)||(37214243-37214311)
chr8 (468-628)||(9021132-9021289)
chr8 (468-628)||(17799449-17799606)
chr8 (541-618)||(3896047-3896124)
chr8 (535-628)||(16833769-16833861)
chr8 (471-628)||(33032657-33032811)
chr8 (468-628)||(28895502-28895659)
chr8 (468-628)||(4812513-4812669)
chr8 (468-628)||(16752549-16752704)
chr8 (583-651)||(19175778-19175846)
chr8 (471-510)||(3276347-3276386)
chr8 (567-628)||(25684737-25684799)
chr8 (582-628)||(28890876-28890922)
chr8 (537-615)||(35872477-35872553)
chr8 (471-625)||(590797-590948)
chr8 (535-628)||(33020925-33021018)
chr8 (314-358)||(6375988-6376032)
chr8 (587-673)||(14477520-14477607)
chr8 (453-495)||(33839077-33839120)
chr8 (605-651)||(19752440-19752486)
chr8 (314-343)||(17847527-17847556)
chr8 (583-651)||(4696620-4696688)
chr8 (453-492)||(13985971-13986011)
chr8 (583-651)||(26403254-26403322)
chr8 (583-651)||(31071253-31071321)
chr8 (629-673)||(35872432-35872476)
[»] chr6 (120 HSPs)
chr6 (136-667)||(4816216-4816749)
chr6 (287-673)||(11983008-11983392)
chr6 (314-675)||(1230225-1230585)
chr6 (315-672)||(13057173-13057529)
chr6 (287-673)||(9019877-9020261)
chr6 (289-667)||(14507161-14507536)
chr6 (322-667)||(14458752-14459093)
chr6 (314-667)||(28241306-28241657)
chr6 (287-673)||(32279948-32280332)
chr6 (287-673)||(30728803-30729191)
chr6 (272-651)||(20915357-20915736)
chr6 (315-672)||(13039733-13040089)
chr6 (79-359)||(26068590-26068882)
chr6 (314-671)||(3390357-3390713)
chr6 (317-673)||(3631918-3632271)
chr6 (315-673)||(3629844-3630199)
chr6 (314-651)||(12195516-12195851)
chr6 (79-359)||(26066319-26066611)
chr6 (314-667)||(30967176-30967530)
chr6 (287-672)||(15541120-15541503)
chr6 (315-672)||(25477253-25477616)
chr6 (287-660)||(15532674-15533044)
chr6 (79-348)||(33310954-33311235)
chr6 (320-667)||(19704552-19704905)
chr6 (314-665)||(30034590-30034943)
chr6 (79-363)||(29754983-29755279)
chr6 (79-348)||(33308685-33308966)
chr6 (287-609)||(15530166-15530485)
chr6 (315-642)||(3233740-3234065)
chr6 (315-673)||(24338427-24338783)
chr6 (314-667)||(2628871-2629226)
chr6 (355-669)||(26065005-26065312)
chr6 (355-669)||(26084974-26085281)
chr6 (314-667)||(26932546-26932906)
chr6 (287-544)||(19227514-19227771)
chr6 (314-628)||(3027876-3028186)
chr6 (315-673)||(12161537-12161889)
chr6 (348-642)||(15719666-15719948)
chr6 (315-593)||(22490618-22490896)
chr6 (456-673)||(1069697-1069913)
chr6 (315-672)||(14466312-14466658)
chr6 (321-644)||(17012029-17012347)
chr6 (371-642)||(16455434-16455701)
chr6 (435-651)||(5273217-5273431)
chr6 (452-672)||(12186051-12186271)
chr6 (287-460)||(1072067-1072240)
chr6 (315-463)||(32447502-32447651)
chr6 (79-224)||(14507569-14507716)
chr6 (402-642)||(15367101-15367336)
chr6 (315-642)||(19696420-19696746)
chr6 (322-464)||(13870608-13870749)
chr6 (78-226)||(8995254-8995402)
chr6 (78-226)||(9019701-9019849)
chr6 (287-427)||(8995430-8995570)
chr6 (467-651)||(26066125-26066307)
chr6 (314-444)||(17852520-17852650)
chr6 (79-224)||(19227803-19227948)
chr6 (467-667)||(29754694-29754892)
chr6 (467-651)||(33308988-33309169)
chr6 (451-642)||(26945258-26945450)
chr6 (87-264)||(11983382-11983558)
chr6 (397-642)||(22857962-22858203)
chr6 (467-651)||(26068396-26068578)
chr6 (467-651)||(33311257-33311438)
chr6 (314-481)||(15346369-15346524)
chr6 (524-642)||(15346535-15346651)
chr6 (569-673)||(10584227-10584331)
chr6 (397-613)||(20526871-20527081)
chr6 (315-428)||(10584105-10584213)
chr6 (531-642)||(25465600-25465710)
chr6 (567-627)||(12911471-12911531)
chr6 (423-642)||(25078567-25078783)
chr6 (535-628)||(30445723-30445815)
chr6 (471-628)||(22351877-22352031)
chr6 (454-628)||(28037750-28037927)
chr6 (468-628)||(13878727-13878883)
chr6 (77-224)||(15530516-15530663)
chr6 (468-628)||(16785919-16786075)
chr6 (567-627)||(12937219-12937278)
chr6 (471-628)||(17694877-17695030)
chr6 (468-628)||(13883475-13883631)
chr6 (471-628)||(33215830-33215984)
chr6 (78-161)||(1072312-1072396)
chr6 (535-632)||(28078215-28078310)
chr6 (471-628)||(22342826-22342980)
chr6 (314-387)||(12186330-12186405)
chr6 (578-628)||(7294035-7294085)
chr6 (582-628)||(25941780-25941826)
chr6 (468-628)||(26887252-26887406)
chr6 (422-554)||(19701958-19702095)
chr6 (172-249)||(26084818-26084895)
chr6 (468-628)||(31248740-31248896)
chr6 (468-628)||(35201352-35201508)
chr6 (541-600)||(3833481-3833540)
chr6 (555-641)||(11262678-11262763)
chr6 (535-625)||(25465927-25466014)
chr6 (165-264)||(30729181-30729281)
chr6 (78-124)||(4816740-4816787)
chr6 (471-628)||(13467492-13467642)
chr6 (468-510)||(3577654-3577696)
chr6 (389-446)||(4595048-4595102)
chr6 (453-506)||(11138423-11138477)
chr6 (582-628)||(17038345-17038391)
chr6 (390-495)||(6843186-6843287)
chr6 (453-582)||(7542452-7542581)
chr6 (314-358)||(18318004-18318048)
chr6 (535-628)||(3577515-3577604)
chr6 (471-510)||(17036058-17036097)
chr6 (582-628)||(5165838-5165884)
chr6 (555-642)||(22870112-22870196)
chr6 (605-651)||(31936592-31936638)
chr6 (583-640)||(10077189-10077246)
chr6 (390-446)||(17904566-17904619)
chr6 (598-639)||(18232862-18232903)
chr6 (471-628)||(26643179-26643331)
chr6 (471-628)||(26749145-26749297)
chr6 (582-642)||(30443532-30443593)
chr6 (422-482)||(30445602-30445661)
chr6 (583-651)||(5757502-5757570)
chr6 (474-510)||(25941650-25941686)
[»] chr2 (124 HSPs)
chr2 (287-667)||(42064407-42064785)
chr2 (287-673)||(40032032-40032421)
chr2 (287-667)||(27104691-27105067)
chr2 (316-667)||(19501996-19502345)
chr2 (314-667)||(45279969-45280321)
chr2 (287-667)||(19504331-19504708)
chr2 (287-673)||(6264127-6264508)
chr2 (315-675)||(19007560-19007918)
chr2 (314-667)||(42452702-42453050)
chr2 (287-667)||(13910030-13910407)
chr2 (287-673)||(21520672-21521058)
chr2 (287-673)||(43623559-43623931)
chr2 (291-673)||(22287315-22287695)
chr2 (314-673)||(42923488-42923847)
chr2 (314-667)||(23452222-23452577)
chr2 (287-673)||(6258796-6259178)
chr2 (315-673)||(28196557-28196911)
chr2 (315-673)||(11739538-11739895)
chr2 (287-667)||(24162208-24162575)
chr2 (79-358)||(36559067-36559358)
chr2 (315-675)||(44289044-44289403)
chr2 (315-673)||(14837193-14837544)
chr2 (318-673)||(3022086-3022448)
chr2 (79-358)||(45332384-45332675)
chr2 (315-639)||(31732789-31733100)
chr2 (315-673)||(17849037-17849393)
chr2 (315-673)||(17848365-17848716)
chr2 (323-671)||(34979558-34979906)
chr2 (314-651)||(35215587-35215932)
chr2 (355-629)||(45239000-45239271)
chr2 (316-568)||(15539557-15539809)
chr2 (315-644)||(11578115-11578439)
chr2 (355-651)||(35217964-35218258)
chr2 (316-642)||(20146617-20146941)
chr2 (287-673)||(18800292-18800665)
chr2 (445-673)||(5375325-5375550)
chr2 (314-672)||(22874061-22874406)
chr2 (405-672)||(28459170-28459435)
chr2 (314-628)||(17897270-17897578)
chr2 (287-468)||(22407591-22407772)
chr2 (315-492)||(22163106-22163282)
chr2 (355-495)||(38020162-38020302)
chr2 (182-358)||(36561344-36561532)
chr2 (87-224)||(19502405-19502542)
chr2 (79-264)||(24162565-24162752)
chr2 (79-217)||(36561539-36561677)
chr2 (287-672)||(35107192-35107571)
chr2 (78-224)||(19504739-19504885)
chr2 (87-264)||(27104523-27104701)
chr2 (521-673)||(22407433-22407583)
chr2 (467-667)||(36558849-36559047)
chr2 (467-667)||(36561126-36561324)
chr2 (314-450)||(5377629-5377769)
chr2 (451-644)||(40699429-40699623)
chr2 (314-642)||(37962951-37963263)
chr2 (467-651)||(45332182-45332364)
chr2 (531-673)||(22707730-22707872)
chr2 (79-264)||(21521048-21521234)
chr2 (521-642)||(7462957-7463077)
chr2 (530-675)||(23870951-23871094)
chr2 (405-581)||(27136195-27136368)
chr2 (87-196)||(43623968-43624077)
chr2 (566-673)||(22163001-22163107)
chr2 (468-601)||(20589763-20589896)
chr2 (79-224)||(42064231-42064376)
chr2 (371-594)||(43139356-43139572)
chr2 (82-264)||(6259168-6259351)
chr2 (468-628)||(2736205-2736361)
chr2 (471-628)||(17943540-17943692)
chr2 (316-409)||(38020064-38020157)
chr2 (468-628)||(39686983-39687139)
chr2 (471-628)||(27517664-27517818)
chr2 (438-495)||(38414235-38414291)
chr2 (468-628)||(39680045-39680201)
chr2 (413-628)||(35028595-35028807)
chr2 (79-161)||(40032503-40032586)
chr2 (171-264)||(13910397-13910491)
chr2 (314-386)||(12342673-12342746)
chr2 (468-628)||(17462436-17462592)
chr2 (471-628)||(12781246-12781400)
chr2 (471-628)||(37170778-37170931)
chr2 (468-628)||(20054790-20054947)
chr2 (413-506)||(27583483-27583573)
chr2 (468-628)||(2740941-2741097)
chr2 (535-651)||(13828342-13828458)
chr2 (452-601)||(15693958-15694109)
chr2 (87-196)||(6264546-6264655)
chr2 (567-618)||(33604092-33604143)
chr2 (565-628)||(39287261-39287324)
chr2 (571-628)||(17921871-17921927)
chr2 (471-595)||(17932637-17932756)
chr2 (468-628)||(20050046-20050204)
chr2 (583-651)||(20522225-20522293)
chr2 (79-264)||(22407762-22407948)
chr2 (452-495)||(26345661-26345704)
chr2 (453-506)||(17921754-17921808)
chr2 (316-358)||(20147040-20147082)
chr2 (468-510)||(22712656-22712698)
chr2 (468-510)||(22717365-22717407)
chr2 (582-628)||(33670992-33671038)
chr2 (468-510)||(45567409-45567451)
chr2 (567-628)||(45679817-45679879)
chr2 (583-651)||(10445468-10445536)
chr2 (583-651)||(14699031-14699099)
chr2 (471-628)||(30478997-30479151)
chr2 (453-530)||(7502975-7503054)
chr2 (608-651)||(17057370-17057413)
chr2 (608-651)||(17085353-17085396)
chr2 (453-495)||(34575265-34575308)
chr2 (566-597)||(41303088-41303119)
chr2 (468-510)||(38190997-38191039)
chr2 (605-651)||(42039715-42039761)
chr2 (590-651)||(1345572-1345633)
chr2 (628-673)||(15539508-15539553)
chr2 (583-628)||(17865231-17865276)
chr2 (314-363)||(40699229-40699278)
chr2 (371-446)||(41304596-41304667)
chr2 (583-651)||(8390174-8390242)
chr2 (583-651)||(13569333-13569401)
chr2 (315-343)||(20589581-20589609)
chr2 (287-343)||(28462593-28462649)
chr2 (453-492)||(30720771-30720811)
chr2 (583-651)||(34682358-34682426)
chr2 (583-651)||(39482936-39483004)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (287-667)||(3922-4298)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (317-673)||(79140-79494)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (287-667)||(69277-69658)
scaffold0025 (287-466)||(73207-73390)
scaffold0025 (87-224)||(69688-69825)
scaffold0025 (87-196)||(73427-73536)
scaffold0025 (434-477)||(73160-73203)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (314-667)||(41468-41819)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (287-642)||(14944-15297)
scaffold0131 (327-673)||(14363-14707)
scaffold0131 (80-264)||(14768-14954)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (287-642)||(2805-3157)
scaffold0250 (79-264)||(2629-2815)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (314-667)||(183626-183975)
scaffold0005 (314-651)||(51961-52300)
scaffold0005 (586-651)||(50234-50301)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (314-673)||(11452-11809)
[»] scaffold0140 (5 HSPs)
scaffold0140 (79-358)||(21915-22206)
scaffold0140 (79-358)||(24190-24481)
scaffold0140 (467-667)||(22221-22418)
scaffold0140 (467-667)||(24496-24693)
scaffold0140 (583-651)||(8443-8511)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (287-667)||(29086-29473)
scaffold0068 (79-143)||(28941-29005)
scaffold0068 (170-267)||(29001-29099)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (315-673)||(79812-80168)
scaffold0004 (468-510)||(188382-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (315-673)||(85184-85540)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (355-651)||(34-328)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (79-265)||(12868-13054)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (314-616)||(1988-2293)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (314-642)||(15830-16154)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (431-667)||(1438-1671)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (316-642)||(16659-16981)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (315-542)||(35593-35819)
scaffold0011 (586-673)||(35816-35903)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (324-628)||(1666-1958)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (321-640)||(4773-5089)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (314-483)||(993-1167)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (598-665)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (540-644)||(57435-57539)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (471-628)||(16328-16482)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (468-614)||(224819-224961)
scaffold0006 (583-651)||(5688-5756)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (567-628)||(3095-3157)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (582-628)||(17011-17057)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (618-664)||(1439-1485)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 168)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16934719 - 16934144
Alignment:
Q  74 ataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggca 173  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934719 ataaatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggca 16934620  T
Q  174 ctggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934619 ctggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcctggcacgatggtgcgctgtcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg 16934520  T
Q  274 ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16934519 ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgata 16934420  T
Q  374 caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16934419 caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacac 16934320  T
Q  474 tattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgta 572  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  16934319 tattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgta 16934222  T
Q  573 aagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    | |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16934221 acgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 16934144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16932360 - 16931790
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932360 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16932261  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16932260 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 16932161  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16932160 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagg 16932061  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16932060 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatta 16931961  T
Q  479 ggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtt 577  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |      
T  16931960 ggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaa 16931863  T
Q  578 actcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16931862 actcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 16931790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 77 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22783319 - 22782739
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783319 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 22783220  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 276  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783219 gaaaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 22783120  T
Q  277 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact--------ttgagatagagggggc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||          ||||||||||||||    
T  22783119 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggc 22783020  T
Q  369 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22783019 tgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 22782920  T
Q  469 aacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 567  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  22782919 aacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--t 22782822  T
Q  568 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  22782821 ttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaaca 22782739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22780952 - 22780374
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780952 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22780853  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780852 aaaatcatggcacgatggggtctcattgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 22780753  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact--------ttgagatagagggggctg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||          ||||||||||||||||    
T  22780752 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctg 22780653  T
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22780652 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 22780553  T
Q  471 cactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||    
T  22780552 cactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--ttt 22780455  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  22780454 gtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 22780374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176485
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 9176936  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |              
T  9176935 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttataa--------- 9176845  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
      |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9176844 --atttaaagcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaag 9176747  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176746 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 9176647  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagt 576  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |     
T  9176646 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgg 9176549  T
Q  577 tactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 641  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176548 tactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 9176485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 79 - 667
Target Start/End: Original strand, 18846923 - 18847500
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggttt--ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||    
T  18846923 tgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtact 18847021  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgt 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||           
T  18847022 ggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacaa------ 18847115  T
Q  275 tacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac 374  Q
         |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18847116 -----atttaaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaac 18847210  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18847211 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 18847310  T
Q  475 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaa 573  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  18847311 attagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaa 18847408  T
Q  574 agttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
     | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  18847409 cggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 136 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 11009075 - 11008553
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaa 234  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||    
T  11009075 cgtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaa 11008976  T
Q  235 ata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataga 333  Q
    | | |||| |||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11008975 acagaaacatatttttgggtgcagatttgttacag-----------attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataga 11008887  T
Q  334 ccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttg 428  Q
    ||||||||||  || |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11008886 ccttgtatcag-gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc 11008788  T
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaatt 527  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11008787 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 11008688  T
Q  528 atgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc 627  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11008687 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc----tttgtaatggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtc 11008593  T
Q  628 aatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  11008592 aatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22803097 - 22802713
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803097 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22802998  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802997 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22802898  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  22802897 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatca- 22802800  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  22802799 tatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22802713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22801225 - 22800841
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801225 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22801126  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22801125 tgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 22801026  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  22801025 tctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 22800928  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22800927 tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22800841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 24888766 - 24889150
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888766 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24888865  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888866 aggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 24888965  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||     
T  24888966 tctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttacttatca- 24889063  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  24889064 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 24889150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637428
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgaga 40637270  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  40637271 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 40637368  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  40637369 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 40637428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091394
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctc 40091575  T
Q  491 ttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattata 590  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  40091574 ttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatca-tata 40091477  T
Q  591 gtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  40091476 gtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 40091394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22044753 - 22044376
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044753 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22044654  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044653 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgag 22044554  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||     
T  22044553 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca- 22044457  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  22044456 tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22047048 - 22046671
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047048 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22046949  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046948 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22046849  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||     
T  22046848 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca- 22046752  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  22046751 tatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631404
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 8631560  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  8631559 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 8631462  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  8631461 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 47274697 - 47275073
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274697 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47274796  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47274797 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 47274895  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  47274896 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca- 47274993  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||    
T  47274994 tatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378647
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  || ||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggga 36378488  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36378489 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-tcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttc 36378647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 48486289 - 48486673
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486289 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48486388  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486389 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 48486488  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  48486489 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctc-ttttgtaacgttactcatca- 48486586  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  48486587 tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgttttctcttc 48486673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 11434925 - 11435302
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434925 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11435024  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435025 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11435124  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||     
T  11435125 tctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca- 11435221  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  11435222 tatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 9148221 - 9148600
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  9148221 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttag 9148320  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148321 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 9148420  T
Q  485 agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  9148421 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatc 9148518  T
Q  585 attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  9148519 a-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 24880421 - 24880806
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24880421 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaa 24880520  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880521 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgag 24880620  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatca 585  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  24880621 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaacgttacgcatca 24880719  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  24880720 -tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24880806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 36921858 - 36921472
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921858 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttag 36921760  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921759 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36921660  T
Q  484 gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36921659 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttactcat 36921561  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36921560 ca-tatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36921472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 37089737 - 37089357
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 383  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089737 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 37089638  T
Q  384 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089637 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  484 gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  37089537 gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcat 37089440  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  37089439 ca-tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 51015216 - 51015593
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015216 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51015315  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015316 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51015415  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  51015416 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 51015512  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  51015513 tatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879344
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 24879162  T
Q  491 ttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatcattat 589  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||    
T  24879163 ttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaacgatacacatca-tat 24879260  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  24879261 agtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 314 - 665
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868747
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 47868597  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  47868598 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 47868695  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  47868696 ccccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9174509 - 9174147
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174509 gcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9174410  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaacggtactcatca 9174212  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     |||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9174211 -tatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 9174147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 36919950 - 36919563
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919950 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttag 36919851  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919850 aaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36919751  T
Q  484 gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  36919750 gagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttattcat 36919652  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || ||||||||||  || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36919651 ca-tatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 316 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313047
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 37313102  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctc 670  Q
    |||||||| ||||||||||||| || | |||||||| || ||||||| |||||||    
T  37313101 ccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 11006604 - 11006222
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  11006604 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 11006506  T
Q  382 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006505 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga 11006406  T
Q  482 tt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttact 580  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||    
T  11006405 ttggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaatggtact 11006308  T
Q  581 catcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||    
T  11006307 catca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928156
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  415 gagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtaaaacggagggctgctctctc 38928216  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  38928215 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 38928156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765192
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  414 agagtttgtctcttg-----gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||      | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 6765035  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  6765036 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagggctgct 6765133  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  6765134 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 5198390 - 5198768
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198390 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5198489  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5198490 aggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgag 5198589  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||| ||||||| ||||||||  || |  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||     
T  5198590 tcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca- 5198687  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||    
T  5198688 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348566
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 24348410  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24348411 gggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 24348508  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  24348509 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484858
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 2485010  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2485009 actttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 2484913  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||    
T  2484912 cccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395824
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcc 12395883  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12395882 cccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12395824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31849962 - 31849584
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849962 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31849863  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact-agggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849862 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 31849763  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  31849762 gtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca 31849665  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  31849664 -tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 38409169 - 38409552
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 380  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  38409169 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggt 38409268  T
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409269 ttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 38409368  T
Q  481 attgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttact 580  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||    
T  38409369 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatact 38409466  T
Q  581 catcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||    
T  38409467 catca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599839
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  44599974 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 44599878  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  44599877 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 44599839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400786
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggggggctgctctctcc 12400845  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12400844 cccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12400786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415467
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||  |    
T  33415721 agtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 33415525  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||    
T  33415524 tcaggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttc 33415467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633666
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cggaagagattggga 14633514  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14633515 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 14633612  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  14633613 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 7941289 - 7941671
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7941289 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttag 7941388  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaa--cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941389 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7941488  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  7941489 tgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactca 7941587  T
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7941588 tca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 321 - 672
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323048
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgga 520  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||     
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccaga 620  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccaga 19322995  T
Q  621 ctaggtca-atttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  19322996 ctaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctctt 19323048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453664
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggga 16453505  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16453506 ctttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||| | || ||||||||||||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttc 16453664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662224
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    ||           ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagact 17662386  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  17662385 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 17662288  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17662287 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17662224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787430
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 14787570  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg--ctc 609  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||    
T  14787569 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 14787472  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  14787471 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaaca 14787430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096236
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  415 gagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct-gag 512  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
      ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19096080 -ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggagagctgctctct 19096176  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  19096177 cccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 19096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 619783 - 619428
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  619783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcat 619684  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  || |     
T  619683 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggt 619584  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  619583 ctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctc 619486  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  619485 cccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 319 - 651
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997824
Alignment:
Q  319 tactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttg 518  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  519 gatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctc-ttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-cccca 41997791  T
Q  619 gactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  41997792 gactaggttaatttggaccgaactggataaaca 41997824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 287 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5637832 - 5637530
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5637832 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttt 5637733  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637732 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 5637633  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  5637632 tgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactca 5637534  T
Q  583 tcat 586  Q
    ||||    
T  5637533 tcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 393 - 673
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380704
Alignment:
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagt 592  Q
    |||||  |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatc-ttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  593 ggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 36380704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132393
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 22132537  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||     
T  22132536 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggc 22132440  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22132439 tgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 22132393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 315 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409364
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||     
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgt-aagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  615 cccagactaggtcaatttgga 635  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttgga 18409364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 287 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3824936 - 3824627
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 381  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  ||||    
T  3824936 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtt 3824839  T
Q  382 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824838 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 3824739  T
Q  482 ttgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactc 581  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  3824738 ttgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactc 3824640  T
Q  582 atcattatagtgga 595  Q
    |||| |||||||||    
T  3824639 atca-tatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 316 - 642
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030764
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagct 56030642  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||     || ||||||||| |||||||||||    
T  56030643 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttc-ttttgtaacgttattcatcat----atgaaacggagggctgctctctccc 56030737  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  56030738 ctagactaggtcaatttggaccgaact 56030764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 315 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537498
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 18537612  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18537611 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  614 ccccagactaggtca 628  Q
    ||||| | |||||||    
T  18537512 ccccataataggtca 18537498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134619
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22134811 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 22134712  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22134711 ttgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 22134619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 314 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8756586 - 8756276
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| |||| ||||||    
T  8756586 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgta 8756488  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt-ggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||    
T  8756487 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattga 8756391  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8756390 gactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt-gtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctc 8756292  T
Q  612 tcccccagactaggtc 627  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8756291 tcctccagactaggtc 8756276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 316 - 632
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  411 tatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctc 13544249  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaattt 632  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  13544250 tctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709165
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  18709358 gattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccca 18709259  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18709258 ttgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 18709165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210762
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |            |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagg 47210895  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  47210894 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgc 47210797  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47210796 tctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405481
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctg 53405322  T
Q  511 agattttggatagaattatgcgggaga------cttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    ||| ||| | |||||||| ||||||||      |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| |     
T  53405323 agactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgaaacgatactcatca-tatagtggaacagagagc 53405420  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  53405421 tg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 383 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26085962
Alignment:
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||||| | ||||||    
T  26086143 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc--tttgtaacgatactca 26086046  T
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||    
T  26086045 tca-tatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 315 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534858
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgaga 18534970  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18534969 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccc 18534871  T
Q  614 ccccagactaggt 626  Q
    |||||||||||||    
T  18534870 ccccagactaggt 18534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 287 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 52942810 - 52942541
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942810 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag 52942712  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg 52942612  T
Q  485 agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
    ||||||||||||| |||             ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52942611 agtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 52942541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 431 - 651
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455574
Alignment:
Q  431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg 530  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |||||||| |    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  531 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  631 ttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaaca 16455574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 315 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||  ||||      
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattct 545  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 315 - 535
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  515 tttggatagaattatgcggga 535  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 400 - 673
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499396
Alignment:
Q  400 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatg 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  500 ggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 599  Q
      |||||  ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||     
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatattgaaacga 27499323  T
Q  600 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27499324 agggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27499396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 397 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890234
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  497 atgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 596  Q
    | ||||||||  ||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  597 cggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaact 38890234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9174684 - 9174491
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9174684 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactgga 9174586  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9174585 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttt 9174491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 465 - 673
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547508
Alignment:
Q  465 gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  565 tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgt 664  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||  ||||||||    
T  13547402 -ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgt 13547499  T
Q  665 tctctcttc 673  Q
    |||||||||    
T  13547500 tctctcttc 13547508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 459 - 673
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891646
Alignment:
Q  459 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattga 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  559 tatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctt 658  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| || |||    
T  2891533 tatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T
Q  659 ttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||    
T  2891632 ttgtgttctctcttc 2891646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 314 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032555
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| ||||| ||||||||          ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||  |  ||    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttgga 15032686  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  15032685 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctc 15032587  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  15032586 ccccaaactaggtcagtattggaccgaactag 15032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 405 - 672
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136903
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    |   || || ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||     
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctctttt-gtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctt 30136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11006781 - 11006590
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttc-tgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  11006781 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactgg 11006682  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11006681 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacag 11006590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 24446820  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 644
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102414
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
     |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||      
T  12102185 gagagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattgga 12102281  T
Q  513 attttggatagaattatgcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    | ||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12102282 actttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 12102380  T
Q  612 tcccccagactaggtca-atttggaccgaactag 644  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12102381 tcccccatactaggtcagttttggaccgaactag 12102414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015185
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaa 180  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaa 51015141  T
Q  181 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015142 aattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 51015185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 494 - 669
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  494 gttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtg 593  Q
    |||| ||||||||| || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaacgttactcatcat-atagtg 4215580  T
Q  594 gaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  4215581 gaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37089906 - 37089727
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  37089906 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaaaatcg 37089807  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  37089806 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgtt 37089727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 316 - 642
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454007
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |  ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
      |||| |||||||| |  | ||||| ||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctc 28453977  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  28453978 ccccagactaggttagtattggaccgaact 28454007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 7941133 - 7941251
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7941133 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 7941232  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7941233 aaaaatggtggcacgatgg 7941251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 515 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5635611 - 5635461
Alignment:
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5635611 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcc 5635514  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  5635513 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36920125 - 36919940
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  || |||| ||||||    
T  36920125 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaattttgagg-caagtcactgg 36920028  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 36919940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 11434769 - 11434887
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  11434769 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactgg 11434868  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11434869 aaaaatcgtggcacgatgg 11434887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3825112 - 3824926
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||    
T  3825112 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaagcactgg 3825014  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||   || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3825013 aaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 3824926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 453
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 453  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 321 - 642
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9864036
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaac-aaaactagggtttgtataga 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattt 516  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactt 9863905  T
Q  517 tggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttac---tcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    ||| |||||||| |   | ||||| |||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9863906 tgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc--tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctct 9864003  T
Q  613 --cccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
      ||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  9864004 cccccccagactaagtcagtattggaccgaact 9864036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637822
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| | |  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgta-ttttgggtgcagatttgtt 5637822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 25357634 - 25357997
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  25357634 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggt 25357731  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    ||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25357732 tt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggttgtga---ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagag 25357825  T
Q  507 gctgagattttggata----gaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
      || || ||||||||    |||||| |   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25357826 attgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtagaacggat 25357924  T
Q  602 ggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| | | |||| ||  || ||||||||||||||    
T  25357925 agctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctcttc 25357997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 515 - 667
Target Start/End: Original strand, 11437561 - 11437710
Alignment:
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11437561 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt--gtaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 452 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |   || |||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  551 ctcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatct-tttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 316 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40998990
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagacgt-caacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||     
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  515 tttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    ||||| |||||||| |   |||||||   | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  40999086 tttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 38408993 - 38409179
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||    
T  38408993 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactgg 38409091  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  38409092 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 38409179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 427
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891427
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  414 agagtttgtctctt 427  Q
    ||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctt 2891427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22803127
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 179  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||||||    
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagga-aaggcactggaa 22803172  T
Q  180 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22803171 aaatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 22803127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31850138 - 31849952
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  31850138 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaaggcactg 31850041  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  31850040 gaaaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 31849952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 77 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36922035 - 36921893
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  || |||| ||||    
T  36922035 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcact 36921938  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36921937 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgc 36921893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 422 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 3982411 - 3982186
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttg--attcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct-gagattt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  | | || ||    
T  3982411 tctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactt 3982312  T
Q  517 tggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||| |||||||| |   || |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982311 tgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 3982213  T
Q  616 ccagactaggtcaat-ttggaccgaac 641  Q
     || ||||||||| | |||||||||||    
T  3982212 tcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 371 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 47151167 - 47150904
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  || |  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  |   ||||||||||||||||||    
T  47151167 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |   ||||||  ||||| ||||| |||||||| |   || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  47151074 cactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctc-tttt 47150976  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 640  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47150975 ctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaa 47150904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 24888598 - 24888776
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||||||    
T  24888598 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaatcg 24888696  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  24888697 tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 24888776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 533 - 671
Target Start/End: Original strand, 5101145 - 5101280
Alignment:
Q  533 ggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaattt 632  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5101145 ggagacttattcttgtaacccattgatatgtctttt-gtaaatttactcatcat-atagtaaaacggagggctgctatctcccc-agactaggtcaattt 5101241  T
Q  633 ggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  5101242 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 5101280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16185844
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaactagggtt--ta 16186078  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttg---agggttgattcaccttg--ggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
     |||| || |||||  ||   | |||||| |||| |    |  |||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  16186077 gagagatt-tctctaagcgggagacactaaggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 16185979  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
     ||  | ||||| |||||||| |   | ||||||||||||| ||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16185978 ttggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc--tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctg 16185881  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16185880 ctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaact 16185844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22044930 - 22044783
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcact 175  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  22044930 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcact 22044832  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22044831 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 22044783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 642
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113194
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | |||| | |||| |||||| | ||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-tgggaagaggctgagattttg 518  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |  || ||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  519 gatagaatta-tgcgggagacttattcttgtaa-ctcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccc 616  Q
    | ||||||||     | ||||| |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  10113070 ggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc--tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctcccc 10113167  T
Q  617 cagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||    
T  10113168 aagactaggttagtattggaccgaact 10113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 371 - 618
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaac-tc-attgatatctctt 566  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| | ||||||||  ||||| ||||| | |||||| |   || |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  9022556 t--gtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 565 - 673
Target Start/End: Original strand, 47563008 - 47563115
Alignment:
Q  565 tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgt 664  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  47563008 tttttgtaaggttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 47563106  T
Q  665 tctctcttc 673  Q
    |||||||||    
T  47563107 tctctcttc 47563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 48486113 - 48486299
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||    
T  48486113 tgtgagagttaacttaaaatcaggtc-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactg 48486210  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||    |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48486211 gatttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggcacaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 48486299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 580 - 673
Target Start/End: Original strand, 6133098 - 6133191
Alignment:
Q  580 tcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6133098 tcatcattatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6133191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050282
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7050343 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 555 - 644
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557911
Alignment:
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt--gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactag 26557911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 628
Target Start/End: Original strand, 36769406 - 36769636
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||    
T  36769406 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttctt 36769503  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat--cattat 589  Q
    ||| | ||||||||||||||| || || || ||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  ||||||  ||||||    
T  36769504 ggtcacgggaagaggctgagacttggg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaagaaactcatatcattat 36769597  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36769598 agtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 36769636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853705
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 11853642  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11853643 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 11853705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556085
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 4556145  T
Q  570 gtaaagttactcatc--attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4556144 gtaaaga-actcatatgattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4556085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529424
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-- 8529363  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8529364 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 8529424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 397 - 495
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300580
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 31300520  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31300521 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtca 31300580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22801356 - 22801262
Alignment:
Q  102 gtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22801356 gtttctacagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 628
Target Start/End: Original strand, 36771323 - 36771553
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggtt--gattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||  |||  |||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  36771323 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctctt 36771420  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactc--atcattat 589  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||||  ||||  ||||||||    
T  36771421 ggtcatgggaagaggctgtga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--tttgtaaagaaactcatatcattat 36771514  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  36771515 agtggaacagagagctgctctctacgccagactaggtca 36771553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885031
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || || ||| | |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttggg-tataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 4884970  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||   ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4884971 gtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 4885031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 5198300 - 5198400
Alignment:
Q  165 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgt 263  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||    
T  5198300 ggcaaagctctggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgt 5198399  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  5198400 t 5198400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 9148054 - 9148192
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | || ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  9148054 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-cttcaggaatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 9148151  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9148152 gaaaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggcacgatgg 9148192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 15831144 - 15831298
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  15831144 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttgcg-tagaattaggtttgaagactgattcttggaactca---atatctcttt-- 15831237  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15831238 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52942999 - 52942869
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||  |||||| ||||| | |  ||    
T  52942999 ttaacttaaaatcaggttt-tgcaaaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ctttgaggcaagtcactgaatatttc 52942902  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52942901 gtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgg 52942869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 3578786 - 3578699
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactagg 625  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||    
T  3578786 agactaattcttgtaacattttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactagg 3578699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 625
Target Start/End: Original strand, 22295412 - 22295471
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactagg 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  22295412 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagaattgctctctcccccacactagg 22295471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 622
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558462
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 4558407  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagact 622  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4558408 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagact 4558462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 622
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570245
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 4570189  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagact 622  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4570190 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact 4570245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 539 - 651
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088903
Alignment:
Q  539 ttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct-cccccagactaggtcaatttggacc 637  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||   | |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatca-tatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggcc 49088889  T
Q  638 gaactagatcaaca 651  Q
    ||||| | ||||||    
T  49088890 gaactgggtcaaca 49088903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 616
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822409
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 55822358  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccc 616  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  55822359 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccc 55822409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 14789496 - 14789429
Alignment:
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctc--ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14789496 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 14789429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 15312319 - 15312473
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  15312319 cactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 15312412  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  15312413 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctggtctctcccccagactaggtca 15312473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317114
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctc--ttt 15317054  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15317055 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtca 15317114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 16689119 - 16688965
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  16689119 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 16689026  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  16689025 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccacaaactaggtca 16688965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587123
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || ||||  ||||||| |||||   ||||||||||      
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctcttt-- 18587062  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18587063 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 18587123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 613 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942467
Alignment:
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 52942467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22047135 - 22047078
Alignment:
Q  166 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22047135 gcaaggcactggaaaaatc-tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 22047078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 5269215 - 5269283
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  5269215 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 5269283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 640
Target Start/End: Original strand, 10114558 - 10114639
Alignment:
Q  558 atatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 640  Q
    ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10114558 atatctcttt--gtaaattaactcatcattatagttgaacgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 10114639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22048575 - 22048491
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttt 163  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |   |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22048575 tgtgagagttaacttaaaatcaagatccgcaagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttt 22048491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937254
Alignment:
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || | |||||||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctt 3937254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  537 acttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctctttt-gtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208839
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggt 38208839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 54928764 - 54928699
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
    ||||| |||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54928764 agactgattcttgtaacattttaatatctctttt-gtaaagttactcatcactatagtggaacggag 54928699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 580 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5336853 - 5336764
Alignment:
Q  580 tcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctc 668  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||   | |||| || |||||||||||||    
T  5336853 tcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttctc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 47868288 - 47868365
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||| ||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  47868288 cactggaaaaatcgtgccacgattggatctaatcgtgccacgatagtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 47868365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 617
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906888
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga-gattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgta 549  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  | | || ||| | |||||||| |   || |||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  550 actcattgatatctctttttgtaaagttactcatca-ttatagtggaacggagggttgctctctccccc 617  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc--tttgtaaagttactcaaaagttataatggaacggaaagctgctctctccccc 54906888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10047452 - 10047384
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10047452 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 10047384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 39246067 - 39245999
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  39246067 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 39245999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 5143310 - 5143264
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  5143310 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 5143264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 16631294 - 16631340
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  16631294 atcattatagtggaacggagagctactctctcccccagagtaggtca 16631340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134936
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaa 22134936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 619882 - 619841
Alignment:
Q  183 tcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  619882 tcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctg 619841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 8528918 - 8528963
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8528918 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctggagaatcgtgtcacga 8528963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16689380 - 16689303
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |   ||||||||  |||||||||||||    
T  16689380 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaataaaaacgtattttt 16689303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 528
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699808
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaatta 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactttgg-tagaatta 25699808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 652
Target Start/End: Original strand, 36315253 - 36315322
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacat 652  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  36315253 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacat 36315322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 652
Target Start/End: Original strand, 36329462 - 36329531
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacat 652  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  36329462 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacat 36329531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4556494 - 4556422
Alignment:
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttt 248  Q
    |||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  4556494 ggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtatttt 4556422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 23001489 - 23001449
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23001489 ttttgtaaagttattcatcattgtagtggaacggagagttg 23001449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 24446677 - 24446633
Alignment:
Q  629 atttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  24446677 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 24446633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 47868192 - 47868240
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  47868192 aaatgtgagagttaacttaaaatcagaattctggagaatcgtgccacga 47868240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043737
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatca 52043737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 52942881 - 52942841
Alignment:
Q  184 cgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  52942881 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctg 52942841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 1047503 - 1046912
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047503 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 1047404  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047403 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 1047304  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact--------ttgagatagagggggctg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||          ||||||||||||||||    
T  1047303 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatagagggggctg 1047204  T
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1047203 aaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 1047104  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttg 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  1047103 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttg 1047006  T
Q  571 taaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  1047005 taacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 293 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435025
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 31435205  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagt 592  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31435204 ggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagt 31435106  T
Q  593 ggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31435105 ggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31435025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099453
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 13099613  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13099612 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctc 13099513  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  13099512 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 13099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724891
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 44724830  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttcat 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44724831 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcat 44724891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137088
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||     
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-c 20137147  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  20137146 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 20137088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412104
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  416 agtttgtctcttg-gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||     
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggac 37412263  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37412262 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 37412163  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  37412162 cctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctcccttc 37412104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 40837105 - 40836728
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837105 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaa 40837006  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837005 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40836906  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  40836905 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca- 40836809  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  40836808 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 35555 - 35933
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35555 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 35654  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35655 agacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 35754  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  35755 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 35852  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  35853 tatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 1049658 - 1049283
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049658 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1049559  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1049558 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 1049459  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  1049458 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca- 1049362  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  1049361 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27306592 - 27306211
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306592 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27306493  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306492 aggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27306394  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  27306393 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 27306296  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  | |||||||||||||||    
T  27306295 tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaat--tcttgtgttctctcttc 27306211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 44490 - 44868
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||  || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490 gcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44589  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44590 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgag 44689  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  44690 tcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 44787  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  44788 tatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394290
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38394134  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  38394135 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 38394232  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  38394233 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355567
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||     
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct-tttttgtaacgtttctcatca-tatagtggaacagagagctgctctctcc 11355509  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||    
T  11355510 cctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctctt 11355567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457957
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 48457801  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48457802 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 48457899  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  48457900 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470007
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 7470160  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  7470159 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctccct 7470062  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7470061 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 3878497 - 3878881
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggt 380  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3878497 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggt 3878596  T
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878597 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagg 3878696  T
Q  481 attgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttact 580  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  3878697 attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttact 3878795  T
Q  581 catcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  3878796 catca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299764
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 20299606  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20299607 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggttgc 20299704  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 317 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471965
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgga 7472118  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  7472117 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggatggctgctctct 7472020  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7472019 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330977
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt--atgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattga 42331136  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |  ||||    
T  42331135 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatta-tatagtgaaacggagggctattctc 42331038  T
Q  612 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  42331037 tcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 42330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 357
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935349
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 2935169  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag-ttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2935170 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgagagcagatttgttacagtttttgttac 2935269  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 357  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935270 agattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626345
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20626189  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20626190 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 20626287  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctc 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  20626288 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630236
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20630080  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20630081 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 20630178  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctc 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  20630179 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 670
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642655
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 20642499  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20642500 actttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 20642597  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctc 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  20642598 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295913
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctatct 4295974  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  4295973 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttc 4295913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345845
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggct 18345689  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||    
T  18345690 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgttc 18345787  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||    
T  18345788 tctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681130
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  410 gtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaatggagggctgct 9681065  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||    
T  9681066 ctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 9681130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 321 - 673
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258778
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgga 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||| ||||||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgga 24258622  T
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc---attatagtggaacggagggttgctctctccccc 617  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||   |    
T  24258623 tagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttc 24258721  T
Q  618 agactaggtcaatttggaccgaactagatcaac-atatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  24258722 agactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctcttc 24258778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748904
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  || ||     
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 24748747  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24748748 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||    
T  24748847 tccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145965
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||  |     
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttc 39146024  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  39146023 cctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990460
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 21990304  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21990305 ttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctctccc 21990402  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  21990403 caagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21990460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 289 - 665
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542830
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    |||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggattgagtc 25542656  T
Q  489 tcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 588  Q
    |||||||||  ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  25542657 tcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-ta 25542753  T
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  25542754 tagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443906
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggga 443747  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct- 612  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||     
T  443748 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttataacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctc 443845  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  443846 ccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 443906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946632
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggct 40946476  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  40946477 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcgaagggctgctc 40946574  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  40946575 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 355 - 667
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850285
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  1850175 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 1850272  T
Q  655 gcttttgtgttct 667  Q
     ||||||||||||    
T  1850273 tcttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 666
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036027
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgg---gaagag 506  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagag 3035869  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
    |||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  3035870 gctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgcaacgatactcatca-tatagtggattggagggctg 3035967  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  3035968 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 315 - 599
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276378
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 599  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 25276378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680306
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||     
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagagagctgctctctcc 21680278  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680279 cccagactaggtgaatttggaccgaact 21680306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027396
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 9027588  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  9027587 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 9027488  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027487 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 22136878 - 22137169
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136878 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22136977  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22136978 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22137077  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137078 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 40551905 - 40552196
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40551905 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40552004  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  40552005 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 40552104  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552105 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 348 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592122
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttg 547  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  || || ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttg 21592246  T
Q  548 taactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatc 647  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21592245 taactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtc 21592148  T
Q  648 aacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| || ||||||||||||||||||    
T  21592147 aacaaattcttttgtgttctctcttc 21592122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678345
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   || ||     
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatc-ttttgtaaggttacttatca-tatagtgaaacagtgggctgctctctcc 21678317  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||    
T  21678318 cctagactaggttaatttggaccgaact 21678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832651
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctc 27832671  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttg 633  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27832670 ccccagactaggtcaatttg 27832651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 31156247 - 31155912
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31156247 acttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31156148  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  || |    
T  31156147 agagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattggg 31156048  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||    
T  31156047 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatc-ctatagtggattggagggctgctctct 31155951  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31155950 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 31155912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 22107867 - 22108158
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107867 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22107966  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22107967 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22108066  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108067 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 40549627 - 40549918
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549627 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40549726  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  40549727 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 40549826  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549827 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297666
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 20297510  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | |  ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  20297511 ggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctc 20297608  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  20297609 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487857
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatt 28487701  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  28487702 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcagagggttgctc 28487799  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  28487800 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253502
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaaga 43253662  T
Q  506 ggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggtt 605  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  43253661 ggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggct 43253564  T
Q  606 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  43253563 gctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223468
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||      
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
      |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaatggatggctgctctct 42223407  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  42223408 cccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttc 42223468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679369
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  411 tatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagtactgctc 9679305  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  9679306 tctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 9679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 314 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349285
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctg 7349319  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 640  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349318 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 287 - 551
Target Start/End: Original strand, 26804499 - 26804762
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804499 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 26804594  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag---ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804595 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 26804694  T
Q  484 gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaac 551  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804695 tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 314 - 595
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757462
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 11757376  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgga 595  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757377 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 314 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828672
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaga 22828770  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22828769 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351653
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctg 7351698  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  7351697 ctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 7351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 314 - 665
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485867
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 28485714  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | |  ||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| || | | |||||||||||    
T  28485715 ggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tataatgaatcagagggttgctc 28485812  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  28485813 tct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 317 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817362
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 24817390  T
Q  616 ccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24817389 ccatactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 314 - 644
Target Start/End: Original strand, 7188496 - 7188822
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||    
T  7188496 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagt-caacaataaaaatagggtttgtat 7188594  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||    
T  7188595 agggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgaga 7188691  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  7188692 ctttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttc-ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctctt 7188790  T
Q  614 ccccagactaggtca-atttggaccgaactag 644  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||    
T  7188791 ccccagtctatgtcagttttggactgaactag 7188822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 314 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251602
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||     
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 22251687  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct---ttttgtaaagttactcatcattatagtgga 595  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251686 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 314 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091580
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgta 20091780  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||  ||||    
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgag 20091683  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  20091682 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc---atagtggaacggagggctgctctct 20091587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 430 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092198
Alignment:
Q  430 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattat 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||| ||||||||     
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  530 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaa 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaa 7092236  T
Q  630 tttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7092235 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 390 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813507
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  490 cttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattat 589  Q
    |||||| | |||||| |  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctc-ctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaact 24813507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 293 - 479
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567731
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 316 - 642
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465816
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||     
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |||||  |  ||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtc-ttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcc 24465788  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24465789 cccagactagatcaatatgaaccgaact 24465816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 430 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094445
Alignment:
Q  430 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattat 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  || |  ||||| ||||||||     
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  530 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaa 629  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 7094483  T
Q  630 tttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||| ||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  7094482 tttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 439 - 667
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  439 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagac 538  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  539 ttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 638  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc--tttgtaactttactcatca-tatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccg 38396909  T
Q  639 aactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||    
T  38396910 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 287 - 506
Target Start/End: Original strand, 22392399 - 22392606
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22392399 gcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataa 22392498  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |          ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392499 atc--------aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22392586  T
Q  487 tctcttggttatgggaagag 506  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  22392587 tctcttggtcacgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 514 - 672
Target Start/End: Original strand, 22393875 - 22394032
Alignment:
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22393875 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctc 22393973  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| | | |||| || |||||||||||||||||    
T  22393974 ccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 22394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935556
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 2935472  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  2935473 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 2935556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 371 - 642
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081790
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaa--ctcattgatatctcttt 567  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |  |||||||  || ||||| |   | ||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||    
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctc-tt 11081714  T
Q  568 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
     |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaact 11081790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40837261 - 40837144
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40837261 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 40837162  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40837161 aaaatcgtggcacgatgg 40837144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 3878322 - 3878467
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||    
T  3878322 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 3878420  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3878421 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctg 3878467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332501
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagca-acaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||      
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt-- 6332272  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||  |||    
T  6332273 atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattga 6332369  T
Q  512 gattttggatagaattatgc-gggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctct 610  Q
    || ||| | |||||||| ||  | ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||    
T  6332370 gactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttct 6332468  T
Q  611 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  6332469 ctcccctagactaggtcagtattggaccgaact 6332501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108370
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  22108272 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 22108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550130
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  40550032 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 40550128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027195
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9027277 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 9027195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137381
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  22137283 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 22137379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552408
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  40552310 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 40552406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606667
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||    
T  1606585 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaaca 1606667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 515 - 651
Target Start/End: Original strand, 26295601 - 26295736
Alignment:
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  26295601 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcc 26295699  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26295700 tccagactaggtcaatttggactgaactggataaaca 26295736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27306768 - 27306582
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||| || ||    
T  27306768 atgtgagagttaacttaaaataaggttt-tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcattg 27306671  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27306670 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcttcgtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 27306582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 371 - 644
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049155
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||   ||||| |||||||||||||| |   | |||| ||||||| |||| | |||||||| |  ||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccc--tt 6049076  T
Q  569 tgtaaagttactcatcat--tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||| |  |||||||||||||    
T  6049077 tgtaaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctcttccccccatactagctcagtaatggaccgaactag 6049155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 26804345 - 26804462
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||    
T  26804345 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcagtgg 26804443  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26804444 aaaaatcgtggcacgatgg 26804462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Original strand, 25542280 - 25542425
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||     
T  25542280 atgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttaagg-caaggcactt 25542377  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25542378 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 25542425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 453 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297031
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaatta-tgcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| ||||||||     | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  552 tc-attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
     |  || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  16297122 ccttttaatatctc-ttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaact 16297031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 35379 - 35565
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  35379 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 35476  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |  || |  | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  35477 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 35565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351508
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  25351449 t--gtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 535 - 640
Target Start/End: Original strand, 6046668 - 6046772
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttg 633  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6046668 agacttattcttgtaaacctttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattg 6046765  T
Q  634 gaccgaa 640  Q
    |||||||    
T  6046766 gaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 509 - 600
Target Start/End: Original strand, 6348930 - 6349020
Alignment:
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  6348930 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattacagtggaacgga 6349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410287
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25410226 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 452 - 628
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2121056
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttggg--aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgt 548  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgt 2120979  T
Q  549 aactcattgatatctctttttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||   |||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2120980 aactca---atatctc--tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa-actagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 361 - 422
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  361 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357202
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||||||||||    
T  25357143 t--gtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtca 25357202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 44314 - 44459
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||| |  |||   | ||| ||||||    
T  44314 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagtttgacg-caaagcactg 44411  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44412 gaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 44459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 600 - 667
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  600 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320076
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 3320137  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3320136 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3320076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324824
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 3324885  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3324884 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3324824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405549
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 25405486  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25405487 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25405549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1049816 - 1049699
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggca 173  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||   |||||| |    
T  1049816 aaatgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaagcaaggta 1049719  T
Q  174 ctggaaaaatcgtggcacga 193  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1049718 ctggaaaaatcgtggcacga 1049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378529
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 8378591  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8378590 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtca 8378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 495
Target Start/End: Original strand, 11084409 - 11084509
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | ||   |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11084409 caacaagaaaactagggtttgtagaaaatt---ctcttggcaacaaacaatagggtt-gaga-ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtct 11084503  T
Q  490 cttggt 495  Q
    ||||||    
T  11084504 cttggt 11084509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 18567363 - 18567508
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  18567363 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 18567460  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  18567461 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctg 18567508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 495
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210674
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt-tgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggttgtga---ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggt 26210674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31435586 - 31435441
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||    
T  31435586 tgtgagagttgacttaaaatcaggtt-ctacagaaatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caagtcactg 31435489  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  31435488 gatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggcacgatggtgcgctg 31435441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069936
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 7069873  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  7069874 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 7069936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074943
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 7074880  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  7074881 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggtca 7074943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247127
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||  ||||||||||||||   ||||||||||      
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctcttt-- 30247066  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  30247067 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctatctcccccagactaggtca 30247127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 456 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281411
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||  ||||| ||| | | |||||| |   || |||||||||||||||| |     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactag 624  Q
    |||||        ||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40281472 ttgat--------ttgtaaagttactcatcgttgttgtggaacgaagggatgctctctcccccagactag 40281411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 44010929 - 44010775
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||  | || ||||| |   ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  44010929 cactattaggattgagtctcttagtcatgagaagaggctgggacttgtg-taaaattaggtttggagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 44010836  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44010835 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143892
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||  ||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttggc-agaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 44143952  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||   ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  44143951 gtaaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagttgctctct-ccccagactaggtca 44143892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 446
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagtaaaa-aagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006820
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||| ||||||||||   |||||||      
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc-- 42006756  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  42006757 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacgaagagctgctctctctcccagactaggtca 42006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906264
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaaca 438  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30906288 tagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 383
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 383  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 615 - 673
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804820
Alignment:
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 26804820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 34546951 - 34546905
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34546951 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 34546905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 44016916 - 44016686
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttgggaaa--cactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||    
T  44016916 aaactagggtttatagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctt 44016819  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca--tcattat 589  Q
     || ||| |||||||||| || |||||  ||||||| |   || |||  ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  |||||  |||||||    
T  44016818 agtcatgagaagaggctgggaatttggc-agaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaagaaactcacatcattat 44016725  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    | |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  44016724 aatggaacggcgagctgctctctcccccagactaggtca 44016686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541021
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| || ||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtataattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 15541084  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  15541083 tttgtaaagaaactcattcattatagtgtatcgtagagctgctctctcccccagactaggtca 15541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512551
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 44512611  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  44512610 gtaaagaaactcatatcattataggggaacggagagctgctctct-ccctagactaggtca 44512551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 429 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310160
Alignment:
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 541 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 13290583 - 13290483
Alignment:
Q  541 attcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccga 639  Q
    |||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  13290583 attcttgtaaccttttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccga 13290486  T
Q  640 act 642  Q
    |||    
T  13290485 act 13290483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 2075226 - 2075272
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  2075226 atcattatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtca 2075272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 7464590 - 7464544
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7464590 atcattatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtca 7464544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 477 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067223
Alignment:
Q  477 taggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaag 575  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||| |||| ||||||||| |   || |||| ||||||||||  |  |||||||||||| |  ||||    
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg-atagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgta-aaag 6067276  T
Q  576 ttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
      |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  6067275 gaactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtca 6067223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 12097911 - 12097868
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12097911 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 12097868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34547003
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 34547003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Original strand, 9190054 - 9190100
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9190054 tgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 9190100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284094
Alignment:
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 20284094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 506
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369680
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 21369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 614 - 672
Target Start/End: Original strand, 25276381 - 25276439
Alignment:
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||    
T  25276381 ccccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt 25276439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 40946167 - 40946244
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||    
T  40946167 cactggaaaaatcgtgtcacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacatattttt 40946244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 608 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 4253572 - 4253536
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactag 644  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4253572 tctctcccacagagtaggtcaatttggaccgaactag 4253536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 21983357 - 21983289
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  21983357 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 21983289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 611 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 30024773 - 30024733
Alignment:
Q  611 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30024773 ctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactggatcaaca 30024733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 46516334 - 46516402
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  46516334 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 46516402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 205)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 651
Target Start/End: Original strand, 50493675 - 50494257
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493675 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 50493774  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttg---- 273  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  50493775 aaaaatcgtggcacgatggagtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 50493874  T
Q  274 -------ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 366  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50493875 aaatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggg 50493974  T
Q  367 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50493975 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 50494074  T
Q  467 gaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |  || || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  50494075 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc- 50494173  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  50494174 -tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 50494257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 38210067 - 38210628
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210067 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38210166  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38210167 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatagtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta-- 38210264  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt---tgagatagagggggctgaaaca 375  Q
             |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |  ||    |||||||||||||||||||||    
T  38210265 ---------cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatc-aggctattttgagagagatagagggggctgaaaca 38210354  T
Q  376 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38210355 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 38210454  T
Q  476 ttaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa 574  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  38210455 ttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaac 38210552  T
Q  575 gttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |  |||||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  38210553 gaaactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 38210628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 6064006 - 6063454
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6064006 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 6063907  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||              
T  6063906 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtggactggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgttacag---------- 6063817  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaa 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6063816 -attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaa 6063718  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6063717 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 6063618  T
Q  477 taggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaag 575  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |    
T  6063617 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacg 6063520  T
Q  576 ttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
      |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6063519 aaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 6063454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 136 - 651
Target Start/End: Original strand, 25388654 - 25389163
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25388654 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaa 25388753  T
Q  236 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagacc 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25388754 taaaacatatttttgggagcagatttgttacag-----------attttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacc 25388842  T
Q  336 ttgtatcaaagcaaacttt---------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 426  Q
    ||||||||  || |  ||          |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388843 ttgtatcag-gctattttgagagagagagagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 25388941  T
Q  427 tggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaa 525  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||    
T  25388942 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaa 25389040  T
Q  526 ttatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactagg 625  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25389041 ttaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagg 25389137  T
Q  626 tcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  25389138 tcaatttggaccgaactgggtcaaca 25389163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 32264404 - 32264015
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264404 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttt 32264305  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264304 agaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32264205  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264204 tgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactca 32264105  T
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32264104 tcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaaca-attcttttgtgttctctcttc 32264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308258
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga 4308416  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4308415 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctc 4308318  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  4308317 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 4308258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 45882835 - 45883220
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882835 gcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 45882934  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 45883034  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  45883035 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 45883132  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  45883133 tatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 45883220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 3859424 - 3859801
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859424 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 3859523  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859524 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 3859623  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  3859624 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 3859720  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  3859721 tatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10956388 - 10956010
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956388 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10956289  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10956288 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgag 10956189  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  10956188 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 10956091  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  10956090 tatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10958684 - 10958306
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958684 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10958585  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958584 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10958485  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||     
T  10958484 tctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttactcttca- 10958387  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||    
T  10958386 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 11170300 - 11170678
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170300 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11170399  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170400 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11170499  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    | ||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  11170500 tgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 11170597  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||||||| ||||    
T  11170598 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 78 - 667
Target Start/End: Original strand, 38889756 - 38890314
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggttt-ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  38889756 atgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattg 38889855  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtt 275  Q
    ||||||||                     ||||||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| |||||           ||||||    
T  38889856 gaaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcaga-----------tttgtt 38889923  T
Q  276 acagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctga 371  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    |||||||||||||||||    
T  38889924 acagattttaagcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctga 38890020  T
Q  372 aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 471  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38890021 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 38890120  T
Q  472 actattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgt 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  38890121 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgt 38890219  T
Q  572 aaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  38890220 aacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51726990
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgaga 51727142  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  51727141 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 51727044  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  51727043 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228571
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43228413  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43228414 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 43228511  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43228512 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43228571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 18097262 - 18096877
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097262 gcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttaga 18097163  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097162 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18097063  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  18097062 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttc-ccttttgtaacgttactcatca 18096964  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||||    
T  18096963 -tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctcttc 18096877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 18099531 - 18099151
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099531 gcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18099433  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099432 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18099333  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  18099332 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacattactcatca 18099234  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  18099233 -tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917641
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53917799  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53917798 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 53917701  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  53917700 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53917641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313689
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || ||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggga 1313531  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1313532 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 1313629  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1313630 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1313689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 5191549 - 5191925
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191549 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5191648  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191649 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 5191748  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  5191749 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca- 5191845  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  5191846 tatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626660
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  || ||     
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||     
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcg 1626719  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1626718 cccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423440
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |      
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaactgagagctgctctctcc 43423499  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  43423498 ctgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43423440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22114666 - 22114288
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114666 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 22114567  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114566 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 22114467  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  22114466 tctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 22114369  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||| || | ||||||| || ||||||||||| || | || ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  22114368 tataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 24979603 - 24979988
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979603 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24979702  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24979703 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 24979802  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatca 585  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24979803 tctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatct-tttttgtaaacgttactcatca 24979901  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  24979902 -tatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 24979988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314965
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |      
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 3314906  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3314907 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226363
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 43226207  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43226208 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 43226305  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||    
T  43226306 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtgttctctcttc 43226363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101158
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |    
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaat 27101320  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27101319 gggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgcaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctc 27101222  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27101221 tctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27101158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101979
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |      
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttacttatca-tatagtggaacggatggctgctctctcc 28102038  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || |  ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28102037 ccaaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 355 - 673
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006121
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  30006005 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 30006102  T
Q  655 gcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30006103 tcttttgtgttctctcttc 30006121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103879
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 4104034  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  4104033 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgcta 4103937  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  4103936 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421392
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || |  |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||    
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagatggctgctctctccc 43421450  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  43421449 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43421392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 286 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 6066159 - 6065795
Alignment:
Q  286 agcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6066159 agcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttag 6066060  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt- 483  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6066059 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6065960  T
Q  484 gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||||||    
T  6065959 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcat 6065862  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    || |||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| | ||||||    
T  6065861 ca-tatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaaca 6065795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533716
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaaga 25533556  T
Q  506 ggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggtt 605  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  25533557 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggct 25533654  T
Q  606 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  25533655 gctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 355 - 671
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990582
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  42990468 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 42990565  T
Q  655 gcttttgtgttctctct 671  Q
     ||||||||||||||||    
T  42990566 tcttttgtgttctctct 42990582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896475
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactgga 53896655  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  53896654 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgctcttgcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt-----------aca 53896566  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896565 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10084754 - 10084372
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  10084754 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttt 10084655  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084654 agaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 10084555  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10084554 cgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-ttttgtaacgttactca 10084456  T
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||    
T  10084455 tca-tatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 26720444 - 26720821
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720444 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaa 26720543  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  26720544 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgag 26720642  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    | ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||| | |||||||||     
T  26720643 tttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctc-ttttgtaacgatactcatca- 26720740  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||    
T  26720741 tatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915473
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 53915631  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  53915630 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatcatt-tagtgaaacggagggctgctctctc 53915533  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  53915532 ccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53915473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604584
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagg 9604748  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  9604747 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 9604650  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  9604649 tctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 9604584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 287 - 556
Target Start/End: Original strand, 35777317 - 35777587
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777317 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 35777416  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcatt 556  Q
    |||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 15780756 - 15781159
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780756 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15780855  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 475  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780856 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 15780955  T
Q  476 ttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct---ttttgta 572  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |   |||||||    
T  15780956 ttacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgta 15781055  T
Q  573 aagttactcatcattatagtggaacggaggg---ttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||    
T  15781056 aagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctct 15781155  T
Q  670 cttc 673  Q
    ||||    
T  15781156 cttc 15781159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 321 - 609
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6562028
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgga 520  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || |||||     
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 6561939  T
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6561940 tagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 5522976 - 5522610
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522976 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5522877  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||           ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5522876 aggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgag 5522788  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  5522787 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca- 5522691  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  5522690 tatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 48362031 - 48361648
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48362031 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaa 48361933  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48361932 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgag 48361833  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||| |||| ||||||||  || |  ||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |     
T  48361832 tctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcat-aa 48361735  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  48361734 tatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 48361648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 18162560 - 18162943
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18162560 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttaga 18162657  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162658 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattga 18162757  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatc 584  Q
    |||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||||||||||    
T  18162758 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatat-ttattttgtaaacgttactcatc 18162856  T
Q  585 attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18162857 a-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttc 18162943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880428
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  415 gagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  || |     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtaaaatggagggctgctctctc 880488  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  880487 ccctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 880428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943650
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |     
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggg 51943493  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  51943494 ctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctc 51943590  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  51943591 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 51943650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 28761762 - 28761407
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28761762 acttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 28761663  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||    
T  28761662 atagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgaga 28761564  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  28761563 ctttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctc 28761465  T
Q  614 ccccagactaggtcaa-tttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctc 670  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| | | |||| || ||||||| |||||||    
T  28761464 ccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12267952
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  391 aacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtc 12268124  T
Q  489 tcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 588  Q
    ||||||||| ||||||||  || |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||||||||| ||    
T  12268123 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc------------ttttgtaacgttactcatca-ta 12268037  T
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  12268036 tagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 12267952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747015
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggaggactg 746970  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  746971 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 747015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468430
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  || ||     
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccc 53468491  T
Q  615 cccag--actaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  53468490 cccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53468430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 291 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191309
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgag 10191471  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || || |||| |||||||| |||||||||||     
T  10191470 tctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 10191374  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10191373 tatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 10191309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926746
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||| || |||||| |  ||||||||||    
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatc-ttttgtaaggttactcatca-tataatgaaacggatgactgctctctcc 5926800  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||    
T  5926799 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012107
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  || ||     
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacagagggctgctctcttc 36012048  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36012049 ttcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36012107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 314 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917944
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||| | |||||||||      ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||     
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagaga 35918084  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||| || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||    
T  35918083 ctgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatta-tatagtggaacggagagctgc 35917986  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaac 650  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35917985 tctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715744
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 39715591  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||| || |||||  |||||    
T  39715592 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc---atagtgaaacagatggttg--ctctc 39715685  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  39715686 ccccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 39715744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 395 - 667
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  395 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 494  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  495 ttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgg 594  Q
    |||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgg 1321680  T
Q  595 aacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  1321681 atcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674743
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
           | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || ||||    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| |||||||||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaatgttactcatca-tatactgaaatggagggctgctctctccc 51674801  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  51674800 ccataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 51674743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458542
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  458403 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 458499  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  458500 ctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaaca 458542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456165
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  456026 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgct 456122  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  456123 ctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaaca 456165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 355 - 614
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29956850 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148872
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  410 gtatagagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||      
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcacctt-ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtatcgttactcatca-tatagtgaaacagaggactgct 47148937  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||    
T  47148936 ctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctcttc 47148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621529
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10621723 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 10621624  T
Q  554 attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||    
T  10621623 attgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaaca 10621529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691551
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |  |      
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctc-ttttgtaacgttacccatca-tatagttaaacggagggctgctctctcc 54691610  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || |||||| ||||||||| || ||||||| || ||| || ||||| |||| |||||||    
T  54691609 cctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttc 54691551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 32218991 - 32219365
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218991 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 32219090  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32219091 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgag 32219179  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatca 585  Q
    ||||||||||  ||||||||  || || |||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32219180 tctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatct-tttttgtaaacgttactcatca 32219278  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  32219279 -tatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 32219365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889781
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt-tgggg 889908  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctctttt-gtaaagttactcatcat-atagtgaaacggagggctgatttctc 889810  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  889809 ccgcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 404 - 672
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484639
Alignment:
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  503 agaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagg 602  Q
    ||||  || | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatct-tttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagg 6484569  T
Q  603 gttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  6484570 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 6484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633732
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 23633576  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||     
T  23633577 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc--tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct- 23633673  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | | | |||| || |||||||||||||||||    
T  23633674 ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 23633732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 314 - 640
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597485
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggga-tgaaacaagggtttataagt-caacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgaga 53597358  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
    |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53597359 ttttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctc 53597457  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 640  Q
    || || ||||||||| | ||||||||||    
T  53597458 ccacaaactaggtcagtattggaccgaa 53597485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 671
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992548
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt 42992404  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||               ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||| | ||| ||| |||||    
T  42992405 g-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaatcggggggctgctc 42992486  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||    
T  42992487 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctct 42992548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 315 - 628
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151579
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  || |    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctc-ttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  613 cccccagactaggtca 628  Q
    ||||||||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggtca 31151579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 413 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattg--atttctatttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctct 7606626  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  7606625 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 381 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413014
Alignment:
Q  381 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  481 attg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttac 579  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaac 28413102  T
Q  580 tcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacata-tgcttttgtgttct 667  Q
    |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||    
T  28413101 tcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 315 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |      
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattctt 546  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 314 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420195
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 13420321  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||     
T  13420320 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct- 13420223  T
Q  614 ccccagactaggtca-atttggaccgaa 640  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||    
T  13420222 caccagactaggtcagttttggaccgaa 13420195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 412 - 673
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666794
Alignment:
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggaga--cttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctc 4666733  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4666734 t---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 4666794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 348
Target Start/End: Original strand, 5899471 - 5899717
Alignment:
Q  91 cttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggca 190  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  5899471 cttataatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcatggca 5899570  T
Q  191 cgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcag 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||           ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5899571 cgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgtatttttggg-----------tacagatttgttacagattttaagcag 5899659  T
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899660 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 442 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688137
Alignment:
Q  442 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagactta 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  542 ttcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 640  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaacgttacgcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 25688170  T
Q  641 ctagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || | |||| |  | ||||||||||||||||||    
T  25688169 ctgggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttc 25688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 315 - 651
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591441
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
          |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||  |  |||    
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctc-atttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggatgctctct-c 53591404  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53591405 cccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaaca 53591441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 315 - 554
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181185
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||     
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataactca 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 398 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561783
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  498 tgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
     | ||||||  ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatct-tttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 561829  T
Q  598 ggagggttgctctctccc-ccagactaggtca-atttggaccgaac 641  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  561828 gaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaac 561783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 439 - 673
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232080
Alignment:
Q  439 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagac 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  539 ttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 638  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  639 aactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6232080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 5885983 - 5886242
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaa-cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5885983 tgtgagagttaacttaaaattaggtttttacagaatcgtggcacgattgaagcgcaaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactgg 5886082  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |           ||||||||    
T  5886083 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggtacgatggtgcgctggcagataaaaataaaacgtatttttgggtgcaaa-----------tttgttac 5886171  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886172 agattttaagcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 398 - 672
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795538
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  498 tgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
     || |||||  ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||| || || ||||||||||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 17795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 398 - 672
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103978
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  498 tgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
     || |||||  ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||| || || ||||||||||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 19103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635635
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||                   |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||             |    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacgggc------------t 27635791  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27635790 ttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt-gtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27635635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 315 - 600
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884362
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||      
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta-- 54884178  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| |     
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaac 54884278  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54884279 tttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 54884362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 316 - 568
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637200
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |  || |    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggact 23637147  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23637148 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 398 - 642
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635631
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  498 tgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
     ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatct-attttgtaaagttactcatcattatggtgaaac 25635586  T
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
     ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  25635587 agagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaact 25635631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 287 - 459
Target Start/End: Original strand, 11163046 - 11163218
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163046 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11163145  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattc 459  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163146 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 455 - 667
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||    
T  11168265 ttgatttctc-ttttgtaacgttacttatca-tatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaat 11168362  T
Q  655 gcttttgtgttct 667  Q
     ||||||||||||    
T  11168363 tcttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22114842 - 22114656
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22114842 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 22114743  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22114742 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 22114656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 321 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871308
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||| | | |  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgga 520  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||||  || || |||||     
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  521 tagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccag 619  Q
    |||||||| |   | ||||||||||||| ||| | ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc--tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccag 36871332  T
Q  620 actaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  36871331 actaggtcagtattggaccgaact 36871308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18099707 - 18099521
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  18099707 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagacactgg 18099609  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18099608 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 18099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 356 - 483
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  356 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 452 - 669
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| | |||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5886360 ccattgatttgtcttt--gaaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 5886456  T
Q  652 tatgcttttgtgttctct 669  Q
     || ||||||||||||||    
T  5886457 aattcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 452 - 669
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  || |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5899833 ccattgatttctcttt--gcaacgttactcatcat-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 5899929  T
Q  652 tatgcttttgtgttctct 669  Q
     || ||||||||||||||    
T  5899930 aattcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || |      
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagact 539  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 469 - 673
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307040
Alignment:
Q  469 aacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||   ||   |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  569 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctc 668  Q
     |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||    
T  3306939 -gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctctcct--agactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctc 3307035  T
Q  669 tcttc 673  Q
    |||||    
T  3307036 tcttc 3307040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 35777163 - 35777280
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777163 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 35777262  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35777263 aaaatcgtggcacgatgg 35777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 495
Target Start/End: Original strand, 24177175 - 24177380
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24177175 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttaga 24177274  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24177275 tgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 24177370  T
Q  486 gtctcttggt 495  Q
    ||||||||||    
T  24177371 gtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 264
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191559
Alignment:
Q  80 gtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactgga 5191472  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 5191559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 521 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 47701798 - 47701652
Alignment:
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccaga 620  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47701798 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaggttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 47701701  T
Q  621 ctaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  47701700 ttaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggt 445  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674160
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  ||||||||||||    ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaagtt-aacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||     
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattgg 1674092  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttact 580  Q
    || ||||| ||||| ||  |||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  1674093 gactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtc-ttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6719489 - 6719396
Alignment:
Q  270 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719489 tttgatacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18097422 - 18097291
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||  ||    
T  18097422 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcatagg 18097324  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18097323 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggc 18097291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10956568 - 10956378
Alignment:
Q  74 ataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaagg 171  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  10956568 ataattgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcac-atggctggacatcatggcacgattggaggtttcagttttg-gggcaagg 10956472  T
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  10956471 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttaggtgcagatttgtt 10956378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 387
Target Start/End: Original strand, 1321337 - 1321437
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321337 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T
Q  387 a 387  Q
    |    
T  1321437 a 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7606963 - 7606878
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7606963 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttg 7606878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 316 - 427
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306835
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  416 agtttgtctctt 427  Q
    ||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctt 3306835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 453 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620466
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||  || || ||||| |||||||| |   || | ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
     | |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1620557 cctttgatatctcttt--gtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactag 1620466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 11162891 - 11163008
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  11162891 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 11162989  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11162990 aaaaattgtggcacgatgg 11163008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 640
Target Start/End: Original strand, 24181504 - 24181629
Alignment:
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  24181504 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 24181602  T
Q  615 cccagactaggtca-atttggaccgaa 640  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||    
T  24181603 tccaaactaggtcagttttggaccgaa 24181629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 534 - 644
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634139
Alignment:
Q  534 gagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttg 633  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttg 25634128  T
Q  634 gaccgaactag 644  Q
     ||||||||||    
T  25634129 caccgaactag 25634139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 622
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420110
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 489  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtct 13419977  T
Q  490 cttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaac-tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatt 587  Q
    |||||| | || |||||  | | ||||||| |||||||  |  || ||| | ||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13419978 cttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc--tttgtaaagttactcatcatt 13420075  T
Q  588 atagtggaacggagggttgctctctcccccagact 622  Q
    |||||||||  | ||  | ||||||||||||||||    
T  13420076 atagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 314 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560426
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||             
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag--------- 4560509  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
      |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  4560508 --agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagag 4560426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10192521 - 10192401
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10192521 ttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 10192423  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtg 208  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  10192422 ggcacgatgggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32264581 - 32264394
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  32264581 atgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcact 32264484  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | |  || || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  32264483 ggatttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 32264394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 673
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849339
Alignment:
Q  576 ttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 41849339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 587 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 35919178 - 35919098
Alignment:
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  35919178 tatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 423 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 14634665 - 14634491
Alignment:
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggata 522  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||  ||||| ||||| ||    
T  14634665 ctcttggcaacaaacactggg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  523 gaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    | |||| |   | ||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcataatagtggaacgga 14634491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 26720268 - 26720413
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  26720268 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 26720365  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  26720366 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 26720413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6066210 - 6066144
Alignment:
Q  202 catcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6066210 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaatgtatttttgggagcagatttgttacag 6066144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 495
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  398 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10085601 - 10085481
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  10085601 ttaactgaaaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttgagg-caaggcactggaaaaatcgt 10085503  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtg 208  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  10085502 ggcacgatgggatcacatcgtg 10085481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 1321161 - 1321347
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  1321161 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 1321258  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  1321259 aaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 1321347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 194
Target Start/End: Original strand, 11170145 - 11170260
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  11170145 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactgg 11170243  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgat 194  Q
    |||||||||||| ||||    
T  11170244 aaaaatcgtggctcgat 11170260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6066254 - 6066195
Alignment:
Q  137 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066254 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatgg 6066195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719532
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat---ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||    ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcag-tttttaggcaatgcact 6719553  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6719552 ggaaaaatcgtggcacgatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913980
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 29914039  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  29914038 gtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Original strand, 3859350 - 3859434
Alignment:
Q  181 aatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3859350 aatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 3859434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5523152 - 5522966
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | ||| || |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  5523152 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctggaggaatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagttttgagg-caaggtactg 5523055  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  5523054 gaaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 5522966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 542 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 11007630 - 11007545
Alignment:
Q  542 ttcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  11007630 ttcttgtaactctttgacatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094100
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 10094161  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10094160 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10094100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10958767 - 10958674
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  10958767 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgtt 10958674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878196
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 47878257  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  47878256 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 47878196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079674
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttagg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 11079612  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11079613 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100117
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || || ||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-taaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 10100178  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10100177 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10100117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200980
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 10201043  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10201042 tttggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10200980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 598 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894040
Alignment:
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595059
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |   || |||| |||||| |||||||   ||||||||||      
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-- 10595120  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  10595119 gtaaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtca 10595059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897162
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 10897101  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10897102 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 10897162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193383
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 54193322  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  || |||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  54193323 gtaaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 54193383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949285
Alignment:
Q  472 actattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttg 570  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| | |||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg-gaacttgggttgaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt--g 10949345  T
Q  571 taaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||  ||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10949344 taaagaaactcatatcattataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10949285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 644
Target Start/End: Original strand, 27420824 - 27420903
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  27420824 ttttgtaaagttactcatcattataatggaacatagagttgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaactag 27420903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303466
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| || | ||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 6303403  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6303404 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 6303466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 628
Target Start/End: Original strand, 7768745 - 7768806
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  7768745 tttgtaaagttactcattattatagtggaacgaagggttactccctcccccatactaggtca 7768806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10208026
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 10208087  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10208086 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtca 10208026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Original strand, 25388618 - 25388663
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388618 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 25388663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 3859314 - 3859362
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3859314 aaatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacga 3859362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 10612957 - 10612803
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| |||||| |||||||   ||||||||||      
T  10612957 cactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctcttt-- 10612864  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10612863 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 10612803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 493
Target Start/End: Original strand, 7768554 - 7768672
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaaca--ctagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||| ||| ||   ||||||||||||||||  ||| |||| |||  |||||||||||||| |    
T  7768554 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactaaggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacaaactaaggtt-gaga-ttgattcaccttggaa 7768647  T
Q  469 aacactattaggattgagtctcttg 493  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  7768648 aacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626009
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | | ||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaaaactgattcttgaaactcat---tatctc-- 22626073  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22626072 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagaactgctctctcccccagactaggtca 22626009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 31021392 - 31021300
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttg 493  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | || | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31021392 aaaactagggtttgta--gagtttgcc-ctagtcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 48390373 - 48390327
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48390373 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 48390327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6066291 - 6066246
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6066291 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaattgtggcacga 6066246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 379
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 379  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 435 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 480  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 27544273 - 27544429
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  27544273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 27544366  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27544367 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctccctcagactaggtca 27544429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 32218836 - 32218912
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttt 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32218836 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatgattgggcaacgtggcacgattggaggttt 32218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 476 - 628
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535772
Alignment:
Q  476 ttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa 574  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggaattggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaa 4535715  T
Q  575 gttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcc-cccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  4535716 gaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcctcccagactaggtca 4535772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858701
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 5858639  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5858640 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48362186 - 48362119
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat 146  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48362186 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgtagaaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgat 48362119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 608 - 651
Target Start/End: Original strand, 46173481 - 46173524
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46173481 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaaca 46173524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462245
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 16462245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Original strand, 45882752 - 45882806
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  45882752 cactggaaaaatcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctgac 45882806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883022
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 47883022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 583 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 48438287 - 48438221
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaa 649  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48438287 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4308725 - 4308648
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  4308725 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 4308648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20031497 - 20031342
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| || ||||| |   | ||||  ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  20031497 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtaaaattaggtttgaagaccgattcttgtaactca---atatctc--ttt 20031404  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatag-tggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  20031403 gtaaagaaactcatatcattatagttggaacggagagctgctctctccccaagactaggtca 20031342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31021244 - 31021185
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31021244 tttgtaaagttactcatcattata-ttgaacggagggctgctctc-accccagactaggtca 31021185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 1736319 - 1736387
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1736319 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 1736387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 16264423 - 16264355
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  16264423 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 16264355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 18552897 - 18552965
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  18552897 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 18552965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 545 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 27703274 - 27703177
Alignment:
Q  545 ttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaacta 643  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||  |||   |||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  27703274 ttgtaactctttgatatctc--tttgtaaagaaactcataattatagtggaaaagagacatgctctctcccccatagtaggtcagttttggaccgaacta 27703177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762011
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 27762072  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||||    
T  27762071 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaaccgctctatcccccaaactaggtca 27762011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 30709804 - 30709872
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  30709804 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 30709872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 32143394 - 32143326
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32143394 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 32143326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 33386680 - 33386748
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  33386680 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaaca 33386748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 42297777 - 42297721
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctcttt-ttgtaaagttactcatcattata 590  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42297777 agactgattcttgtaaccctttgatatctttttgttgtaaagttactcatcattata 42297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823659
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttg 633  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| || | ||||||||| || ||| || |||||| |||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctcttt--gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattg 15823666  T
Q  634 gaccgaa 640  Q
    |||||||    
T  15823665 gaccgaa 15823659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 25690690 - 25690651
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 353  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690690 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 651
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236292
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 30236292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 651
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417572
Alignment:
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 1417572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 345
Target Start/End: Original strand, 13893289 - 13893347
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 345  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893289 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 25795832 - 25795786
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  25795832 tgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 25795786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621847
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatca 10621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 626
Target Start/End: Original strand, 16996987 - 16997032
Alignment:
Q  581 catcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggt 626  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  16996987 catcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggt 16997032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27101704 - 27101627
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| || ||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  27101704 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccaagatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 27101627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021450
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa 31021450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35918393 - 35918316
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||  || ||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  35918393 cactggaaaaatcgtagcacgattggatcgaatagtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 35918316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 614 - 671
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992664
Alignment:
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||||||| ||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctct 42992664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 43228108 - 43228181
Alignment:
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  43228108 ggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 43228181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 8370500 - 8370568
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8370500 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 8370568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 651
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695246
Alignment:
Q  599 gagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  24695194 gagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 24695246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27101594 - 27101558
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaa 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101594 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaa 27101558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 27453031 - 27452963
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | ||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  27453031 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaaca 27452963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 27974966 - 27975034
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27974966 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 27975034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 27986460 - 27986528
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  27986460 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 27986528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 39040006 - 39040074
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  39040006 tcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 39040074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 46966743 - 46966671
Alignment:
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat 630  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  46966743 ttgatatctcttt--gtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaat 46966671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 565 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 53973764 - 53973728
Alignment:
Q  565 tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  53973764 tttttgtaaagttactcatcaatgtagtggaacggag 53973728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 31542442 - 31543012
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542442 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31542541  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31542542 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttgttac 31542641  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542642 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 31542741  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542742 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31542841  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagt 576  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||  |||||||       
T  31542842 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc--tttgtaacag 31542938  T
Q  577 tactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31542939 tactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 31543012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 31544798 - 31545358
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31544798 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31544897  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||               
T  31544898 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttattac----------- 31544986  T
Q  278 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31544987 agattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaag 31545086  T
Q  378 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545087 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31545186  T
Q  478 aggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagt 576  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||       
T  31545187 aggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacag 31545284  T
Q  577 tactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31545285 tactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 31545358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 31179897 - 31179372
Alignment:
Q  136 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31179897 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcgggtaaaaa 31179798  T
Q  236 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttt------------gttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttacta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31179797 taaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttttgttacagatttgttacaaatttaaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttacta 31179698  T
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 423  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179697 taaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 31179598  T
Q  424 tcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggata 522  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| ||    
T  31179597 tcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggta 31179498  T
Q  523 gaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagact 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  31179497 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagact 31179401  T
Q  623 aggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31179400 aggtcagattggaccgaactgggtcaaca 31179372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 21947943 - 21948326
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21947943 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 21948041  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948042 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 21948141  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  21948142 tctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 21948239  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  21948240 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21948326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 25921836 - 25921458
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 25921737  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25921736 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgag 25921637  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  25921636 tctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 25921539  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  25921538 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 38882021 - 38882399
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882021 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 38882120  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882121 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38882220  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  38882221 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca 38882318  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  38882319 -tatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 2818699 - 2818314
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818699 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2818600  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaggg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2818599 aggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattga 2818500  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2818499 gtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca 2818401  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2818400 -tatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2818314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511191
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18511348  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18511347 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 18511250  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18511249 cctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18511191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854783
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |    
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaa 39854625  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39854626 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctc 39854723  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  39854724 ccccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39854783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 2174835 - 2175212
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174835 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2174934  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2174935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 2175034  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||     
T  2175035 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttacttatca- 2175131  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  2175132 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 4236545 - 4236922
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4236545 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 4236644  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4236645 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 4236744  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  4236745 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 4236842  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  4236843 tatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073183
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |      
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17073125  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||  |||||||||    
T  17073126 cccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctctt 17073183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 317 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509297
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || || |    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggact 18509453  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  18509452 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatct-attttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggtgggctgctctctccc 18509355  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18509354 ctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18509297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 289 - 668
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776452
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  388 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 16776274  T
Q  488 ctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatt 587  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |    
T  16776275 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatttctc-ttttgtaacgttacttatca-t 16776371  T
Q  588 atagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctc 668  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  16776372 atagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221823
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggga 40221664  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40221665 cttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttc 40221823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472591
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||     
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| | |||||||| ||||||  | | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 31472650  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31472649 cccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31472591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 355 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092178
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16092395 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 16092296  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  16092295 ttgagatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaat 16092197  T
Q  655 gcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||||||||||||||    
T  16092196 tcttttgtgttctctcttc 16092178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189586
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  |    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctc 1189651  T
Q  610 tctcc-cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1189650 tctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 314 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529091
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 10529236  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||    
T  10529235 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggaaggctgctctctc 10529138  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctttt 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  10529137 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098031
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggga 26097874  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  26097875 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacaga-ggctgctctctc 26097971  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  26097972 ctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 26098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 316 - 667
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466978
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgg 18466824  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||    
T  18466825 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgctctc 18466922  T
Q  612 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||    
T  18466923 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 314 - 666
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596939
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 18596787  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18596788 ctttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 18596886  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttc 666  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||    
T  18596887 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127155
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 24127097  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  24127098 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24127155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 6756437 - 6756792
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756437 acttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 6756536  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  6756537 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgaga 6756636  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  6756637 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatct-tttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctc 6756732  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6756733 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttc 6756792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904403
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |      
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctc-tattgtaacgttacttatca-tatagtgaaacggatgactgctctctcc 25904344  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25904345 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 25904403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912830
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagg 27912672  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  27912673 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacagagaactgc 27912770  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27912771 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 669
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747600
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgg 6747445  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  6747446 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattg--atttctttttgtaacgttactcgtca-tatagtggatcggagggctgctctc 6747542  T
Q  612 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  6747543 tctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 355 - 669
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745364
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 6745251  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  6745252 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 6745349  T
Q  655 gcttttgtgttctct 669  Q
     ||||||||||||||    
T  6745350 tcttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469303
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 18469149  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||| || | |||||    
T  18469150 gggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tctagtggaacgaagagctgctc 18469247  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||    
T  18469248 tct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705781
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |  |     
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattaggg 37705917  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || |  ||||||    
T  37705916 ttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacgaatggctattctctc 37705819  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37705818 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaca 37705781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 355 - 667
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804318
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 25804208  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||    
T  25804209 ttgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaat 25804305  T
Q  655 gcttttgtgttct 667  Q
     ||||||||||||    
T  25804306 tcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910744
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagg 27910586  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  27910587 ctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tataatggaacggagagctgc 27910684  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27910685 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 318 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474302
Alignment:
Q  318 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatttt 517  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  || || |||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  518 ggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccc 617  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttctaaggttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctctctccccc 10474358  T
Q  618 agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  10474357 atactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 10474302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15355065 - 15354777
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355065 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15354966  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  15354965 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 15354866  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 355  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354865 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15357341 - 15357053
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357341 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15357242  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  15357241 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 15357142  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 355  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357141 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 288 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12556285 - 12555902
Alignment:
Q  288 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12556285 cagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaat 12556186  T
Q  388 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12556185 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgt 12556086  T
Q  488 ctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatt 587  Q
    ||||||| || ||||||||  || || ||| | ||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  12556085 ctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatc-tt 12555988  T
Q  588 atagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | || | ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||| | || ||||||||||||||||||    
T  12555987 aaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttc 12555902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 352
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757245
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756960 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10757059  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  10757060 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 10757159  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 352  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757160 aaatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 21684824 - 21684437
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  21684824 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 21684725  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  21684724 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 21684625  T
Q  477 taggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagt 576  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||       
T  21684624 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaacaa 21684527  T
Q  577 tactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||    
T  21684526 tactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696177
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
              ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  696120 cccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530721
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  ||     
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 596  Q
    ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttgctcatcattatagtggaa 34530721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 79 - 351
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749767
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10749604  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          
T  10749605 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttt------ 10749698  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 351  Q
      | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749699 --tgtta--cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 322 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818475
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggat 521  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| |    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  522 agaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagac 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tacagtggaacagagggct--tctctcccccaaac 17818523  T
Q  622 taggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctct 669  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  17818522 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 358
Target Start/End: Original strand, 23664833 - 23665125
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23664833 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23664932  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt-------- 269  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            
T  23664933 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23665032  T
Q  270 ----tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
        ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665033 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 78 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23793754 - 23793462
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23793754 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23793655  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt-------- 269  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            
T  23793654 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgtta 23793555  T
Q  270 ----tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
        ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793554 cagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 355 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479403
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaact 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||     
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  553 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacat 652  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  34479514 cattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34479418  T
Q  653 atgcttttgtgttct 667  Q
    || ||||||||||||    
T  34479417 attcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 36402690 - 36402307
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402690 gcagatttgtt-caaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 36402592  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  36402591 tgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaa 36402492  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||  | ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  36402491 tctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 36402394  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  36402393 tatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36402307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 323 - 673
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954716
Alignment:
Q  323 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  423 ctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggat 521  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  ||||| ||||| |    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  522 agaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagac 621  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc--tttgtaaagttactcatca-tatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaac 2954664  T
Q  622 taggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2954665 taggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2954716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31466341 - 31465968
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  31466341 gcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaa 31466242  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31466241 aagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgag 31466142  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  |  || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  31466141 tctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatct-attttgtaaagttactcatca- 31466045  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||          |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  31466044 tat----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 31465968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 355 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477038
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaact 552  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||     
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  553 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacat 652  Q
    ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  34477149 cattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34477053  T
Q  653 atgcttttgtgttct 667  Q
    || || |||||||||    
T  34477052 attctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 23667109 - 23667400
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23667109 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23667208  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  23667209 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 23667308  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667309 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34477632 - 34477379
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34477632 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34477533  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||           |||    
T  34477532 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgtt-----------aca 34477444  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477443 gattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 315 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397974
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||  |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||  || || |||||  |||||| || |||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtgacgttaccaattat-atagtaaaacggatggctgctctctc 39398032  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  39398031 ccacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctct 39397974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 393 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658335
Alignment:
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagt 592  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagt 658413  T
Q  593 ggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | |||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  658412 gaaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 658335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 528
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043207
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  515 tttggatagaatta 528  Q
    ||||||||||||||    
T  20043194 tttggatagaatta 20043207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552523
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15552329 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 15552428  T
Q  554 attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  15552429 attgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 15552523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 320 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661185
Alignment:
Q  320 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgg 519  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgg 6661317  T
Q  520 atagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccag 619  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||    
T  6661316 gtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcag 6661218  T
Q  620 actaggtca-atttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  6661217 actaggtcagatttggaccgaactggataaaca 6661185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 315 - 533
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  || ||     
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  515 tttggatagaattatgcgg 533  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 322 - 672
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289060
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  422 tctcttggcaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||| | |||||||||      ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |  || |    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||          |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat---------cttttgtaacgttactcatc-ttatagtgaaacggagggctgctctctccc 21289003  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  21289004 ccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctctt 21289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587126
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  411 tatagagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
         |||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  |    
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagatt 10586970  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  10586971 gagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 10587067  T
Q  610 tct-cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  10587068 tctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 449 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505823
Alignment:
Q  449 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  549 aactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatca 648  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20505942 aacacattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 20505847  T
Q  649 acatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  20505846 acaaattcttttgtgttctctctt 20505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 438 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585725
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggaga 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  || |  ||||| |||||||| || |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  538 cttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 637  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctctttt-gtaatgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggacc 41585759  T
Q  638 gaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    ||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  41585758 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 41585725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38960604 - 38960334
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960604 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38960505  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||                     ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  38960504 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgttggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 38960426  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960425 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 314 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098395
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 438 - 667
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggaga 537  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  538 cttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 637  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc--tttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggacc 4410286  T
Q  638 gaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  4410287 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 433 - 673
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724193
Alignment:
Q  433 caaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcg 532  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||| |||||||| |||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagaga--------ttgg-tagaattaggcg 2724054  T
Q  533 ggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaattt 632  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaagattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 2724152  T
Q  633 ggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2724153 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34479972 - 34479740
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34479972 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34479873  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||                     |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  34479872 aaaatcgtggcacga---------------------tggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcaga-----------tttgttaca 34479805  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479804 gattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 450 - 667
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgta 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  550 actcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaa 649  Q
    || ||||||| |||| |||| ||| | ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||    
T  39798226 acccattgatttctc-ttttataatgatactcatc-gtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaa 39798323  T
Q  650 catatgcttttgtgttct 667  Q
    || || ||||||||||||    
T  39798324 caaattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 316 - 671
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020518
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggag-gcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||  ||       
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctc 9020459  T
Q  614 ccccagactaggtc-aatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    | ||| | ||||||   ||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  9020460 ctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctct 9020518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 358 - 672
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054136
Alignment:
Q  358 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgat 457  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  458 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||  || || |||   |||||||| | |||||||||||||||||||| |   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt-tg----gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  558 atatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactagatcaacatatgc 656  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||   | |||| || |    
T  20054022 atatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T
Q  657 ttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||    
T  20054121 ttttgtgttctctctt 20054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208874
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||| || |||||  ||   | | |||||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  514 ttttggatagaattatgcggg-agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
     ||||| |||||||| |   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |    
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-t 36208815  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||| |||||||||    
T  36208816 tccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt-ttctctctt 36208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 38881845 - 38882031
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38881845 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcactgg 38881943  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38881944 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 38882031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 371 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||| | |||||||| |   | | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctc-tttt 17413249  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaac 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20507798 - 20507659
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  20507798 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtat 20507699  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggt 453  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  20507698 agagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2174797
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 2174779  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2174780 aaaatcgtggcacgatgg 2174797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25922002 - 25921874
Alignment:
Q  69 ccaacataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggc 167  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25922002 ccaacaaatatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggc 25921903  T
Q  168 aaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921902 aaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 25921874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749978
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 10749894  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  10749895 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 10749978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 4236378 - 4236515
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4236378 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttaaggcaaggcactggaaaaatcg 4236476  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4236477 tggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 4236515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Original strand, 39797841 - 39797966
Alignment:
Q  71 aacataaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaag 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  39797841 aacataactgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaag 39797940  T
Q  171 gcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||    
T  39797941 gcaccggaaaaatcatggcacgatgg 39797966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373138
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattga-gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 3373222  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  3373221 -tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 3373138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354560
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  15354658 tt--gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 15354562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665337
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  23665239 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 23665335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793250
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  23793348 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 23793252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960133
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  38960215 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 38960133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 453 - 628
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |  |||||||| |||||||| |   || ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||    
T  15143647 cctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757454
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||||||    
T  10757372 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaaca 10757454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356836
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  15356934 tt--gtaacgttactcattaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 15356838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 411
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  410 gt 411  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 259 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23742157 - 23742057
Alignment:
Q  259 tttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaa-gcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 357  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23742157 tttgttacagatttgttacaaattttaggcagatttgttataggttttaaagcaggacttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgag 23742058  T
Q  358 a 358  Q
    |    
T  23742057 a 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 16775897 - 16776042
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  16775897 tgtgagaattaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 16775994  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16775995 aaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 16776042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 474 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741844
Alignment:
Q  474 tattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgta 572  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt--gta 23741938  T
Q  573 aagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    | |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||||    
T  23741937 acgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 371 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgg-ga 468  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  469 aacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag-attttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||  | || | ||||| | |||||| |   || |||| ||||||||||| | ||  ||| |||     
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaac-cttttttatatctc 2144648  T
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18186590 - 18186504
Alignment:
Q  76 aaatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18186590 aaatgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 18186504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 528
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770923
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgag 42770907  T
Q  513 attttggatagaatta 528  Q
    | ||||| ||||||||    
T  42770908 actttgggtagaatta 42770923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 659713 - 659829
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    |||||| |||||    
T  659713 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttga--ggcaagtcactg 659809  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  659810 gaaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21684969 - 21684905
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21684969 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21684909 - 21684811
Alignment:
Q  170 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  21684909 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttaca 21684811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 541 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15445376 - 15445291
Alignment:
Q  541 attcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  15445376 attcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtca 15445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385477
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 35385541  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35385540 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 35385477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 595
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754377
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||  || || |||||||||||||| |   | || || ||||||||||| | ||  ||| ||| |||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattaggtttgaaggctaattcttgtaac-cttttttatatctcttt 4754351  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtgga 595  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  4754352 gtaaagttactcatcaatatagtgga 4754377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897985
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||  || || ||||| |||||||| ||  || |||| |||||||||||   ||||||||||| ||     
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctatt- 4897926  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  4897927 gtaaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtca 4897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170967
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 1170904  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1170905 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 1170967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20504452 - 20504369
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20504452 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttagtttt 20504369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672991
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 22672930  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22672931 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 22672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 566 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 26098374 - 26098267
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgt 664  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||| |||    
T  26098374 ttttgtaacgttactcatcat-atggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttatgt 26098276  T
Q  665 tctctcttc 673  Q
    |||||||||    
T  26098275 tctctcttc 26098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 672
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043289
Alignment:
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 20043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 499 - 586
Target Start/End: Original strand, 42770938 - 42771024
Alignment:
Q  499 gggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42770938 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17841428 - 17841274
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  17841428 cactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 17841335  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17841334 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 17841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748471
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaa 469  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  470 acactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggt 29748471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 1240428 - 1240585
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  1240428 aaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctgggatttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 1240523  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  1240524 t--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccaaactaggtca 1240585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298026
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 2298090  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||| |||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2298089 tttataaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctcccccccagactaggtca 2298026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36402845 - 36402762
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||    
T  36402845 tgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaatctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcagtttt 36402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 628
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445653
Alignment:
Q  473 ctattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgt 571  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| |||||||| |||||   ||||||||||  ||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctcttt--gt 25445594  T
Q  572 aaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25445595 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25445653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31179933 - 31179888
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179933 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacga 31179888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20508001 - 20507918
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20508001 tgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagtttt 20507918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 21947770 - 21947853
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21947770 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt 21947853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 422 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033621
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga-gattttgg 519  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | | ||||||||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgg 34033700  T
Q  520 atagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcatt-gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
     |||||||| |   | |||||| || | ||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34033699 gtagaattaagtttgaagacttgttatggtaaccccttcgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattactgtggaac 34033621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31466496 - 31466379
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgca-gaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatg-gaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| || |||| || || |  |||||| |||||    
T  31466496 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcag-ttatgaggcaagtcactg 31466399  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  31466398 gaaaaatcttggcacgatgg 31466379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Original strand, 42238327 - 42238417
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42238327 agactgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 42238417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 422 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224914
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagag 15224914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 341
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798058
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat 341  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798004 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 617
Target Start/End: Original strand, 40222769 - 40222909
Alignment:
Q  474 tattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgta 572  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||  |||| ||||||||||   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||    
T  40222769 tattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctg-gaacttgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt--gta 40222862  T
Q  573 aagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctccccc 617  Q
    |||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40222863 aagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 40222909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 4409890 - 4409967
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||  |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  4409890 cactggaaaaatcgtgccacaattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggcagataaaaataaaacgtattttt 4409967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 371 - 600
Target Start/End: Original strand, 35430172 - 35430408
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttg---------agggttgattcac 461  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||||||||||||         |   |||||||||    
T  35430172 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtacag---ttttctcttggcaataaacactagggtttggattgaatcaccattgattcac 35430267  T
Q  462 cttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat-tttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcatt-g 557  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||  |  | | ||||| |||||||| |   || |||| |||||||||| || || |    
T  35430268 cttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaattcttttg 35430367  T
Q  558 atatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35430368 atatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452652
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| |||||||| |||||   |||||||  |||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc--ttt 25452591  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  25452592 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtca 25452652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 28786407 - 28786561
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||  ||||||| |   | ||| | ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  28786407 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggcagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatctc--ttt 28786500  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28786501 gtaaagaaactcatatcattataatggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 28786561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 541 - 604
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045272
Alignment:
Q  541 attcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatct-tttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggagggt 20045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659850
Alignment:
Q  134 aacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacga 214  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagtttga--ggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgaggtcgcattgtggcacga 659850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 39854317 - 39854394
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  39854317 cactggaaaaatcgtgtcacggttgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 39854394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962458
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgaga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 11962519  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||| |||||| ||| | |||||||| || || |||||||||    
T  11962518 gtaaagaaactcatatcattataatggaacagagagctgctctcttcctcatactaggtca 11962458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12556441 - 12556358
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  12556441 tgtgagagttaatttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcataatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt 12556358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 365
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2818836 - 2818763
Alignment:
Q  89 aacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  2818836 aacttaaaattaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt 2818763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 10627477 - 10627523
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||    
T  10627477 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtca 10627523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 442
Target Start/End: Original strand, 13295760 - 13295809
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||    
T  13295760 caacaacaaaactagggtttgtatagaat---tcttttggcaacaaacactag 13295809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2144928 - 2144899
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2144928 acttttactataaatatagaccttgtatca 2144899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 6744894 - 6744971
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||  ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  6744894 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgctacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6744971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 6747137 - 6747214
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  6747137 cactggaaaagtcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 6747214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552207
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatca 15552207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 9353356 - 9353424
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9353356 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 9353424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 11916996 - 11917064
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  11916996 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 11917064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832274
Alignment:
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 641  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaac 28832274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 29748285 - 29748313
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29748285 cttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 36932374 - 36932442
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  36932374 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36932442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 248
Target Start/End: Original strand, 42238047 - 42238123
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||   || || ||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||    
T  42238047 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcgattgaggataaaacaaaaacgtatttt 42238123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 141)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 47179428 - 47179990
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47179428 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 47179527  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  47179528 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgcttgcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag---------- 47179617  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaac 374  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  47179618 -attttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaac 47179716  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47179717 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47179816  T
Q  475 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaa 573  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  47179817 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaa 47179914  T
Q  574 agttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     |  |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  47179915 cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 47179990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 651
Target Start/End: Original strand, 16225895 - 16226445
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16225895 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 16225994  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaa 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||           |||||||||||||    
T  16225995 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttt-gggtgcagatttg-----------ttacagattttaa 16226082  T
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16226083 gtagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaa 16226182  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16226183 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 16226282  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca 585  Q
    |||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||||||||    
T  16226283 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca 16226380  T
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  16226381 -tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 16226445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 47177078 - 47177639
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47177078 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttt-gggcaagacactgga 47177176  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||              
T  47177177 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacctatttttgggagcagatttgttacag---------- 47177266  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaac 374  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  47177267 -attttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaac 47177365  T
Q  375 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47177366 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47177465  T
Q  475 attaggat-tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaa 573  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  47177466 attaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaa 47177563  T
Q  574 agttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     |  |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  47177564 cgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaaca 47177639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 51749955 - 51750333
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749955 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51750054  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750055 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 51750154  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  51750155 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 51750252  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  51750253 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 15823462 - 15823846
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15823462 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 15823561  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15823562 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgag 15823661  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||     
T  15823662 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tattgtaacgttactcatca- 15823759  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  15823760 tatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15823846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 287 - 642
Target Start/End: Original strand, 13214997 - 13215355
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214997 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13215096  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13215097 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgag 13215196  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct---ttttgtaaagttactcat 583  Q
    ||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |   ||||||||| ||||||||    
T  13215197 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcat 13215296  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215297 cattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 13215355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 28840594 - 28840973
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  28840594 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttag 28840693  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840694 aaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 28840793  T
Q  485 agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  28840794 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatc 28840891  T
Q  585 attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  28840892 a-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 10400193 - 10399815
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400193 gcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10400094  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400093 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 10399994  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  10399993 tctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 10399896  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  10399895 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 287 - 665
Target Start/End: Original strand, 6822931 - 6823306
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822931 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6823030  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6823031 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgag 6823129  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||||||||||||  || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||     
T  6823130 tctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca- 6823227  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  6823228 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 291 - 667
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842788
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtc 28842612  T
Q  489 tcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 588  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  28842613 tattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-ta 28842709  T
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||    
T  28842710 tagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302752
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20302501  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  20302502 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactagga 20302601  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||  |||||||| ||||||  | |||||||    
T  20302602 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca-gatagtggatcggaggactactctctc 20302698  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  20302699 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 13761753 - 13762130
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761753 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaa 13761852  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13761853 aggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgag 13761952  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||     
T  13761953 tctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca- 13762049  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  13762050 tatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 38925843 - 38925462
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38925843 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaa 38925744  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38925743 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 38925644  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||      
T  38925643 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc-- 38925547  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     |||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  38925546 -atagtaaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 38925462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302486
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 12302649  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  12302648 tgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgct 12302551  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  12302550 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 12302486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 41646836 - 41647220
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 41646935  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646936 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 41647035  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    || |||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  41647036 tcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 41647133  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  41647134 tatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 41647220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617785
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcc 2617757  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2617758 ctcagactaggtcaatttggaccgaact 2617785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428954
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 16428795  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  16428796 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctc 16428894  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  16428895 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 16428954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324617
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 17324775  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17324774 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 17324677  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17324676 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17324617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 39462435 - 39462819
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39462435 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaa 39462534  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462535 atgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 39462634  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||     
T  39462635 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgaaaagttattcatca- 39462732  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  39462733 tatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39462819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186109
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |   |     
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaac 17186266  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  17186265 tttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||| || |||||||||||||||||    
T  17186166 cccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 17186109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 51752281 - 51752657
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51752281 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 51752380  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51752381 aggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgag 51752479  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||| ||     
T  51752480 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcacca- 51752576  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  51752577 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241067
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 9241226  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
      ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9241225 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||| || ||||| |||||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctt 9241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307527
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 50307587  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgc-ttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||    
T  50307586 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctctt 50307527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076653
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-c 50076712  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  50076711 cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50076653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 28207431 - 28207049
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207431 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 28207332  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28207331 agacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtg 28207232  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||  |||||||  || |  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||      
T  28207231 tctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatc-- 28207135  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28207134 -atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28207049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457456
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  || |      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatgtctgctctctcc 11457515  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11457514 cccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11457456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839888
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||     
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcc 18839829  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||    
T  18839830 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctcttc 18839888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078801
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |  ||     
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcc 50078860  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  50078859 cccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 50078801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307409
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |  |    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-cc 18307351  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18307352 ccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735508
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggct 31735664  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  31735663 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 31735566  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  31735565 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995681
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 6995839  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6995838 ctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttataacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 6995741  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6995740 ctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6995681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336921
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
     |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggct 27337082  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  27337081 gtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 27336985  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27336984 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27336921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339112
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggct 27339273  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||    
T  27339272 gagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgatc 27339176  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27339175 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251255
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || || |    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatc-ttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccc 25251313  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  25251312 caatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 25251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 355 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131360
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccca 4131478  T
Q  555 ttgatatctct---ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  4131477 ttgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaaca 4131378  T
Q  652 tatgcttttgtgttctct 669  Q
     || ||||||||||||||    
T  4131377 aattcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579598
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtc 3579780  T
Q  489 tcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 588  Q
    ||||| ||| || |||||  || |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  3579779 tcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat-- 3579683  T
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  3579682 tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 3579598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 355 - 673
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128173
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  25128056 ttgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  655 gcttttgtgttctctcttc 673  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttc 25128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998235
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |     
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 28998392  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  28998391 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctc 28998294  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  28998293 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 28998235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003951
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |     
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 29004108  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  29004107 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgcaacgttactcatca-tatggtgaaactgagggttgttctctc 29004010  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  29004009 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 29003951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490211
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  |||||     
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttattcatca-tatggtgaaacggagggctgctctc-cc 31490153  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  31490154 cccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 31490211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 317 - 667
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932368
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||     
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagac 39932216  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc-tc 613  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39932217 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggaacggagggctgctctcttc 39932314  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  39932315 ccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 293 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14097950
Alignment:
Q  293 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 392  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  393 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 14098130  T
Q  493 ggttatgggaagaggct-gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaa-gttactcatcattata 590  Q
    ||||| ||||||||  | |||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14098129 ggttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaacgttactcatca-tata 14098033  T
Q  591 gtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14098032 gtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291750
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagga 20291599  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20291600 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgattctcatca-tatagtggatcggagggttgttctctc 20291696  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||    
T  20291697 ccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906570
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 47906406  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
     || |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  47906407 ttggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgc 47906504  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  47906505 tctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 47906570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 317 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15294821
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 15295084  T
Q  403 agggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295083 agggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 15294984  T
Q  503 agaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagg 602  Q
    ||||| || || ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  15294983 agaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagg 15294886  T
Q  603 gttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  15294885 gctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 664
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325954
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 505  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 24325797  T
Q  506 ggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggtt 605  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | || | || |    
T  24325798 ggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca-tatagtgaatcgaatggct 24325895  T
Q  606 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgt 664  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  24325896 gctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 336 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424996
Alignment:
Q  336 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttggcaaca 434  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag---tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||  || || ||||| |||||||| ||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  532 gggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatt 631  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatt 31425038  T
Q  632 tggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  31425037 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 31424996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756828
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  414 agagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||  || |    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  6756668 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctct 6756766  T
Q  613 -cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6756767 ccccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttc 6756828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 316 - 673
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319187
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| ||||| ||  || || |    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggact 17319031  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||    
T  17319032 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctc-ttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-cc 17319129  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17319130 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17319187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 317 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctggg 21948328  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21948327 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctct 21948230  T
Q  613 cccc 616  Q
    ||||    
T  21948229 cccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 364 - 669
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134241
Alignment:
Q  364 ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 463  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  464 tgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatct 563  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40134037 tgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatct 40134136  T
Q  564 ctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtg 663  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||    
T  40134137 c-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtg 40134235  T
Q  664 ttctct 669  Q
    ||||||    
T  40134236 ttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510312
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatt 2510467  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
      || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  2510466 tggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctc-tcttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggatggctgctc 2510370  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  2510369 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 363 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431693
Alignment:
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  463 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatc 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 46431797  T
Q  563 tctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct--cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctttt 660  Q
    ||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  46431796 tc--tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 46431700  T
Q  661 gtgttct 667  Q
    |||||||    
T  46431699 gtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949213
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  || |     
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattgggg 2949370  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  2949369 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 2949272  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2949271 cccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2949213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324362
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||  |     
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaac 17324206  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||    
T  17324207 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcc 17324305  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||    
T  17324306 ccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat--tcttgtgttctctcttc 17324362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463247
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctg 9463292  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9463291 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 9463247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248551
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||     
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg--ctctct 612  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||  ||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtgaaacagatggttgttctctct 50248612  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  50248611 cccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459420
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctg 9459465  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  9459464 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 9459420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 79 - 353
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783533
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 23783337  T
Q  179 aaaatcg---------------------tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcag 257  Q
    |||||||                     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23783338 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcag 23783437  T
Q  258 atttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 353  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783438 atttgttacagatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422841
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  414 agagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgag 31423013  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattata------------gtggaacgga 600  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||            ||| ||| ||    
T  31423012 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacaga 31422914  T
Q  601 gggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | |||| || |||||||| | |||||||    
T  31422913 gggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtgatatctcttc 31422841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 314 - 599
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665404
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-tgggaagag 506  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagag 48665313  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg 599  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  48665314 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 106 - 411
Target Start/End: Original strand, 16231368 - 16231641
Alignment:
Q  106 ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                         
T  16231368 ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatc--------------------- 16231446  T
Q  206 gtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattt 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231447 gtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttg-----------ttacagattttaagcagatttgttacagattt 16231535  T
Q  306 taagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16231536 taagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagg 16231635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183602
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaat-gcaacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |   ||    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 14183631  T
Q  615 cccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14183630 cccagactaggtcagttttggaccgaact 14183602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 362 - 673
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432696
Alignment:
Q  362 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcac 461  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  462 cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatat 561  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  562 ctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccc-agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctttt 660  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  16432585 ctc-ttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctttt 16432683  T
Q  661 gtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||    
T  16432684 gtgttctctcttc 16432696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 287 - 642
Target Start/End: Original strand, 47451564 - 47451911
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47451564 gcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaa 47451663  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |         |||||||||||    
T  47451664 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgag 47451757  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |  ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  47451758 tctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca- 47451855  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    ||||||| |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47451856 tatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaact 47451911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 314 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347284
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgag 8347413  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8347412 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctcttt 8347314  T
Q  613 cccccagactaggtca-atttggaccgaac 641  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  8347313 cccctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Original strand, 42922177 - 42922501
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  42922177 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 42922275  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||    
T  42922276 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 42922372  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  42922373 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctg 42922471  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  42922472 cccccgactaggtcagtgttggaccgaact 42922501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 287 - 568
Target Start/End: Original strand, 6823800 - 6824089
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823800 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6823899  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6823900 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattga 6823999  T
Q  486 gtctctt-------ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
     ||||||       ||||| ||||||||  || |  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6824000 atctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 6824089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 314 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669419
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggag-gcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 15669535  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15669534 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 15669436  T
Q  612 tcccccagactaggtca 628  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15669435 tccccgagactaggtca 15669419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 316 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349077
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||  |  ||     
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggac 8349190  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  8349189 tttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctctttt-gttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  615 cccagactaggtca 628  Q
    || |||||| ||||    
T  8349090 ccaagactatgtca 8349077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 314 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800600
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||  |   |    
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaa 18800712  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||    
T  18800711 ctttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctc 18800613  T
Q  614 ccccagactaggt 626  Q
    ||||| |||||||    
T  18800612 ccccaaactaggt 18800600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 314 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495220
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| | || |||||  || |     
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattgggg 49495350  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||    
T  49495349 ctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctc 49495251  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactag 644  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  49495250 cccaagactatgtcaatttagaccgaactag 49495220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 456 - 673
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429258
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcat 555  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  556 tgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatg 655  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||     
T  16429142 tgatatctctttt-gtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 16429240  T
Q  656 cttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16429241 cttttgtgttctctcttc 16429258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 438 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggaga 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||  ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  538 cttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 637  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  638 gaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 51752104 - 51752291
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51752104 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51752203  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  51752204 aaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 51752291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 13761577 - 13761763
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13761577 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 13761676  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13761677 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 13761763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 463 - 667
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  463 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatc 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  563 tctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgt 662  Q
    ||  ||||||| | |||||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  51757723 tc--tttgtaacgatactcacca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgt 51757819  T
Q  663 gttct 667  Q
    |||||    
T  51757820 gttct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 51749778 - 51749965
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51749778 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51749877  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  51749878 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 51749965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 451 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115083
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaa 550  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  551 ctcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaac 650  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  6115204 ccaattgatatctctttt-gtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaac 6115106  T
Q  651 atatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||  |||||||||||||||||    
T  6115105 aaattattttgtgttctctcttc 6115083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 321 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125466
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgg 519  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||  || || |||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  520 atagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
     |||||||| |   | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccct 13125493  T
Q  619 gactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
     ||||||||| | | ||||||||||||    
T  13125492 tactaggtcagtataggaccgaactag 13125466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 438 - 642
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231832
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggag 536  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  537 acttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggac 636  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggac 16231826  T
Q  637 cgaact 642  Q
    ||||||    
T  16231827 cgaact 16231832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 264
Target Start/End: Original strand, 6823643 - 6823810
Alignment:
Q  99 caggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggg 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6823643 caggtttttgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggg 6823742  T
Q  198 gtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6823743 gtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 6823810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 20302198 - 20302385
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20302198 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 20302297  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20302298 aaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgtt 20302385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 6822775 - 6822893
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6822775 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 6822874  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6822875 aaaaatcgtggcacgatgg 6822893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786117
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 23786033  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  23786034 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 23786117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 314 - 640
Target Start/End: Original strand, 27916440 - 27916765
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||    
T  27916440 acttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaagc-cagcaagaaaactagggtttg 27916538  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  ||    
T  27916539 ta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattg 27916633  T
Q  511 agattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaac--tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
     || ||||| | |||||| |   || |||| |||||| ||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27916634 tgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt--gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgc 27916731  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaa 640  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27916732 tctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 27916765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 515 - 672
Target Start/End: Original strand, 23816030 - 23816185
Alignment:
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  23816030 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt-gtaacgttactcatcat-ataatggatcggagggatgctctctcc 23816127  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  23816128 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 23816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10400369 - 10400183
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||    
T  10400369 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactgg 10400271  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10400270 aaatatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 10400183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 321 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520146
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 418  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  419 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg------gttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      || | ||||||||  || |    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattggg 26520254  T
Q  513 attttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    | ||||| |||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||||         |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||     
T  26520253 actttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata---------gtaaagttgcttataattatagtggaacggagggttgctctt 26520163  T
Q  612 tcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||| | |||||||    
T  26520162 tcccccaaattaggtca 26520146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 30790759 - 30790403
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  30790759 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 30790660  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30790659 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-ga 30790569  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcg-ggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc 584  Q
    |||| ||||||| | ||||||   |||| ||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30790568 gtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatc 30790470  T
Q  585 attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||    
T  30790469 attatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaaca 30790403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738653
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||||||||  ||     
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaacaaaaaaac-aaactagggtt--tag 30738867  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||| || |||||  ||   | ||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||    
T  30738866 agagatt-tctctaagcgggagacactaggg-ttga-gattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattggga 30738770  T
Q  514 ttttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc--attatagtggaacggagggttgctct 610  Q
    |||||| |||||||| |   | ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30738769 ttttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctc-ttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctct 30738671  T
Q  611 ctcccccagactaggtca 628  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  30738670 ctcacccatactaggtca 30738653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 642
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561738
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || || ||  ||||| ||||| ||||| || |   || |||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  549 aactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  16561645 aaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaact 16561738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 453 - 630
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaac 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  || || |||||||||||||| |   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat 630  Q
       ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc--tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctct-ccccaaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 15823285 - 15823430
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||    
T  15823285 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcact 15823382  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 223  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15823383 agaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgct 15823430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 26613577 - 26613265
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaaca-aaactagggtttg 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || || | ||| ||||||||     
T  26613577 cttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaagaaaaaaaaaacaaattagggttt- 26613479  T
Q  411 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
     | |||| || |||||  ||   | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||  ||    
T  26613478 -agagagatt-tctctaagcgggagacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattg 26613383  T
Q  511 agattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    ||  ||||| |||||||| |   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||    
T  26613382 aggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgg-aaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctc 26613284  T
Q  610 tctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26613283 tctcccccagattaggtca 26613265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 543 - 642
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916661
Alignment:
Q  543 tcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaa-tttggaccgaac 641  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctctttta-taaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaac 15916660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 184
Target Start/End: Original strand, 20291279 - 20291386
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactg 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  20291279 atgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactg 20291378  T
Q  177 gaaaaatc 184  Q
    ||||||||    
T  20291379 gaaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 394 - 628
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279523
Alignment:
Q  394 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  493 ggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatag 591  Q
    ||| | ||||||||  || || ||| | |||||||| |   || |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctctttt-gtaaagttactcatcattatag 28279485  T
Q  592 tggaacggagggttgctctctccccc-agactaggtca 628  Q
    |||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  28279486 tggaattgagagttgttctttccccctagactaggtca 28279523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 28840426 - 28840604
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||     
T  28840426 ttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtactggaaaaatt 28840523  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  28840524 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 28840604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 28842241 - 28842373
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  28842241 ttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagtttttagg-caaggtactggaaaaatc 28842338  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtg 219  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28842339 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtg 28842373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353373
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 21353432  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21353431 gtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 21353373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 667
Target Start/End: Original strand, 13358787 - 13358867
Alignment:
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  13358787 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 542 - 626
Target Start/End: Original strand, 43104332 - 43104414
Alignment:
Q  542 ttcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggt 626  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  43104332 ttcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc-ctcccagactaggt 43104414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127790
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
      || ||||||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127861 c-cttttggcaacaaacactagggttgg--gatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401246
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 2401307  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  2401306 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtca 2401246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526623
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-- 9526562  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9526563 gtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 9526623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 566 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 13127775 - 13127715
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggt 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  13127775 ttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggt 13127715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 598
Target Start/End: Original strand, 14352978 - 14353190
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag----------ggttgattcaccttgg-gaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||            |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352978 caacaacaaaactagggtttgtagaga---tttctcttggcaacaaacacta-ggtttgagattgaatcaccattgattcaccttggagaaacactatta 14353073  T
Q  479 ggattgagtctcttggttatgggaagaggct-gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtt 577  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||  | |||| ||||| |||||||| |   || || |||||||||||| | |||| |||   ||||||||||||    
T  14353074 ggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaaccctttgaaatc---ttttgtaaagtt 14353169  T
Q  578 actcatcattatagtggaacg 598  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  14353170 attcatcattatagtggaacg 14353190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38925996 - 38925915
Alignment:
Q  81 tgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38925996 tgagagttaacttaaaatcaggttcc-gcagaaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 38925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13449996 - 13449919
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  13449996 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcgatggtagataaaaataaaacgtattttt 13449919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 624
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134224
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 25134167  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactag 624  Q
    ||||||  ||||  || ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  25134168 gtaaagaaactcatataattatagtggaacggagagctgttctctcccccatactag 25134224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 627
Target Start/End: Original strand, 32261337 - 32261397
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc 627  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||    
T  32261337 tttgtaaagttattcatcattttagtggaacggagagttgttctcccccccagagtaggtc 32261397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 47451405 - 47451488
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  47451405 tgtgagagttaacttcaaatcagattt-tgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcagtttt 47451488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144708
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| || || || |||||||| |   || || | |||||||||||||| | ||||||       
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttggg-tagaattaggtttgaagattgattcttgtaactcaat-atatct--- 4144771  T
Q  567 tttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
     ||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  4144770 -ttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtca 4144708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 348 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 471 - 627
Target Start/End: Original strand, 9521718 - 9521871
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  9521718 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-- 9521811  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc 627  Q
    ||||||  ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  9521812 gtaaagaaacttatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtc 9521871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaatta 528  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  ||||| ||||  ||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28207500 - 28207421
Alignment:
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||  || || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28207500 tggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtttttttgggtgcagatttgtt 28207421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30790848 - 30790749
Alignment:
Q  166 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||  ||||| | ||||||||||||  | |||||||||||    
T  30790848 gcaagtcactggaaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgtt 30790749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 223
Target Start/End: Original strand, 39462257 - 39462402
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||| || |    
T  39462257 atgtgagagttaacttaaaatcagg-ttctgcagaaatcgtgacacaatggttgggcaacgtggcacgattagaggtttcag-ttttgaggcaagtcagt 39462354  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgct 223  Q
    |||    ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||    
T  39462355 ggatttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgct 39462402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232639
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 2232639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 8213613 - 8213579
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213613 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 8213579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13215007
Alignment:
Q  112 aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggc 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||| |||||||    |||||||| |||||| |  || ||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcatgatgggattgcaacgtggc 13214952  T
Q  211 acgatggtgcgctgac-ggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||| | || | | | | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13214953 acgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 13215007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14098510 - 14098441
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatgg 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  14098510 tgtgagagttaacttaaaatcagatt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgagcaccgtggcacgatgg 14098441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 32889490 - 32889444
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32889490 tgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaaca 32889444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 651
Target Start/End: Original strand, 46783212 - 46783327
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttg 633  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | || | ||||| ||||| || |||||| |||    
T  46783212 agactaattcttgtaaccctttgatatct--ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaatattg 46783309  T
Q  634 gaccgaactagatcaaca 651  Q
    || |||||| ||| ||||    
T  46783310 gatcgaactggataaaca 46783327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959183
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagag 49959183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 2393461 - 2393308
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| || || || ||||||||     || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  2393461 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggacttggg-tagaattagatttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 2393368  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2393367 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 2393308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 567 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 11693397 - 11693349
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11693397 tttgaaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccc 11693349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 366
Target Start/End: Original strand, 16431044 - 16431096
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 366  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16431044 acttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 37069843 - 37069775
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  37069843 tcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 37069775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Original strand, 49687301 - 49687384
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  49687301 tgtgagagttaacttaaaatcaggtta-tgtagaaatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttt 49687384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 642
Target Start/End: Original strand, 16124540 - 16124599
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16124540 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaact 16124599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104131
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatca 43104131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432037
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatca 46432037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 467 - 503
Target Start/End: Original strand, 10115880 - 10115916
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaa 503  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10115880 gaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaa 10115916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13598471 - 13598403
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13598471 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 13598403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 21536593 - 21536661
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  21536593 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaaca 21536661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 47703960 - 47704028
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  47703960 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 47704028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 642
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6477
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5927 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 6026  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||               
T  6027 aaaatcgtggcatgatggggtctcatcatggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcagatttgttacaa---------- 6116  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6117 -atttaaagcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 6215  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6216 gtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 6315  T
Q  479 ggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtt 577  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||    
T  6316 ggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgtt 6413  T
Q  578 actcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6414 actcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 6477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 667
Target Start/End: Original strand, 18810483 - 18811057
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18810483 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactgga 18810582  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||              
T  18810583 aaaattgcggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacacatttttgggtgcagatttgttacag---------- 18810672  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18810673 -attttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagg 18810771  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810772 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 18810871  T
Q  479 ggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtta 578  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   ||    
T  18810872 ggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaata 18810969  T
Q  579 ctcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  18810970 ctcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 43081722 - 43082307
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081722 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43081821  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43081822 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtacgctggcggataaaaataaaacgtatctttgggagcagatttgttatagttttgttaca 43081921  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------------taga 362  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  || ||||                ||||    
T  43081922 gattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatc-aggctattttggagagagagatagagagagataga 43082020  T
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43082021 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43082120  T
Q  463 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatat 561  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43082121 ttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgattt 43082220  T
Q  562 ctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43082221 ctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 43082307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 667
Target Start/End: Original strand, 18812668 - 18813231
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18812668 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 18812767  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||           |||||||||    
T  18812768 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggtgcaga-----------tttgttaca 18812856  T
Q  279 gattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagg 378  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18812857 gattttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagg 18812956  T
Q  379 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812957 gtttagaaaggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 18813045  T
Q  479 ggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtta 578  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   ||    
T  18813046 ggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaata 18813143  T
Q  579 ctcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  18813144 ctcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 79 - 651
Target Start/End: Original strand, 44720617 - 44721177
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggttt-ctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  44720617 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 44720715  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgtta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||   |||| |||||||||| |||||||||           |||    
T  44720716 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttg-----------tta 44720804  T
Q  277 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720805 cagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaa 44720904  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacacta 475  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44720905 gggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacacta 44721004  T
Q  476 ttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaag 575  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |    
T  44721005 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacg 44721102  T
Q  576 ttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44721103 gtactcatca-tatagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 44721177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 14807723 - 14808117
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807723 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 14807822  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807823 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 14807922  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  14807923 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 14808020  T
Q  587 tatagtggaacggagggttg----------ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14808021 tatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14808117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 27829269 - 27829646
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829269 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27829368  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829369 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27829468  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  27829469 tctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 27829565  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27829566 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 28251930 - 28251546
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251930 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaa 28251831  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251830 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 28251731  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  28251730 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca- 28251633  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28251632 tatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28251546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 27826958 - 27827335
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826958 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27827057  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827058 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27827157  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  27827158 tctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 27827254  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27827255 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 666
Target Start/End: Original strand, 15067953 - 15068330
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067953 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 15068052  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15068053 aggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgag 15068152  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||| ||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15068153 tcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 15068250  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttc 666  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||    
T  15068251 tataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15073067
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 15072885  T
Q  491 ttggttatgggaaga-ggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattat 589  Q
    ||||||| | ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  15072886 ttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tac 15072983  T
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  15072984 agtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 15073067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 314 - 671
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911367
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27911212  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  27911213 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc-tattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctct- 27911309  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| |||||||    
T  27911310 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27911367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 314 - 671
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957786
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 27957631  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  27957632 ctttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctc-tattgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggttgctctct- 27957728  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| |||||||    
T  27957729 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctct 27957786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 4423990 - 4424368
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423990 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaa 4424089  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4424090 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgag 4424189  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||  ||||||||||     
T  4424190 tctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatc-ttttgtaacattactcatca- 4424287  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  4424288 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 14419527 - 14419169
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14419527 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtat 14419428  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  14419427 agagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggga 14419328  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  14419327 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctc 14419229  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14419228 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14419169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952876
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||     
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
     |||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 25952818  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25952819 cccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 25952876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225523
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 1225364  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  1225365 ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1225523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 13858820 - 13858494
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13858820 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13858721  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || |     
T  13858720 agagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattgggg 13858621  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13858620 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctc 13858523  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13858522 ccccagactaggtcaatttggacagaact 13858494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 79 - 343
Target Start/End: Original strand, 43079347 - 43079614
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079347 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43079446  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag---ttttgtt 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| ||    
T  43079447 aaaatcgtggtacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatctttgggagcagatttgttatagtttttttttt 43079546  T
Q  276 acagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079547 acagattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339659
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 32339503  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  32339504 ggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 32339601  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||    
T  32339602 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 324 - 660
Target Start/End: Original strand, 608735 - 609077
Alignment:
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  608735 taaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatag 608834  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  608835 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  608935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctccc 609032  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctttt 660  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  609033 ccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480482
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||      
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| || ||| || ||||||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttagtcatca-tatagtgaaatggatggctgctctctcc 30480541  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  30480540 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 30480482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106877
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctc-ttttgtagggttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctatctcc 27106935  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  27106934 tccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctctt 27106877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874360
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggct 3874204  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3874205 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctc 3874302  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  3874303 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372186
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct-c 613  Q
    ||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatct-tttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcc 5372215  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372214 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 5372186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684638
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaa 503  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22684803  T
Q  504 gaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactc---attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 600  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22684802 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctc-tattgtaacgttactcatca-tatagtggaacgga 22684705  T
Q  601 gggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  22684704 gggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809568
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  15809314 gtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaact 15809412  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
      || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  15809413 aggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctc 15809510  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  15809511 tcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 316 - 672
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865892
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||  ||  |     
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcc 36865833  T
Q  615 ccc-agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| || || ||||||||| ||||    
T  36865834 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctt 36865892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385100
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct-gag 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 41384942  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
     ||| || |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41384943 ctttagg-tagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 41385039  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  41385040 cccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctcttc 41385100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283206
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaga 28283362  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
     || |  ||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  28283361 ttggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgc 28283265  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  28283264 tctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 315 - 561
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatat 561  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41383018
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |     
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 41382860  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  41382861 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt-gtaacgttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctc 41382958  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  41382959 ccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 41383018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530465
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggct 43530309  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  43530310 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgctactcatca-tatagtggatcggagggctgctg 43530407  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  43530408 tctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 363 - 651
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079936
Alignment:
Q  363 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  463 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatat 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  562 ctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  43079850 ctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 43079936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185694
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt--ctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||         
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag----- 15185852  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
       ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  15185851 --atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttt-taaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctc 15185755  T
Q  612 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||    
T  15185754 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctt 15185694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 314 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873193
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  507 gctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg 606  Q
      || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctg 24873227  T
Q  607 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 640  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  24873226 ctctctcccccatactaggtcagattggaccgaa 24873193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482636
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |      
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcc 21482608  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21482609 cccaaactaggtcaatttggaccgaact 21482636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 405 - 673
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956314
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    ||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 15956314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162538
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaa-caacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||     
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattgg 31162405  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    || ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31162406 gactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 31162504  T
Q  612 t--cccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |  |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31162505 tcccccccagactaggtcagtattggaccgaact 31162538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 348 - 642
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480828
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttg 547  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || | |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttg 21480734  T
Q  548 taactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480735 taacccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaact 21480828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 315 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541532
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagag 33541532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 492
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775378
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 348 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005640
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  447 tgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattctt 546  Q
     ||   ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3005832 gga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 3005736  T
Q  547 gtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3005735 gtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaact 3005640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 315 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622882
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     |||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtata 35872619  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 478  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 291 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 291 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 2468461 - 2468261
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  2468461 gcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga- 2468363  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
           ||  |||||| ||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2468362 -------aatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaat 2468274  T
Q  483 tgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||    
T  2468273 tgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 27826782 - 27826968
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||||    
T  27826782 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactgg 27826880  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa-taaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27826881 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgtt 27826968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 27829093 - 27829279
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||  ||||||    
T  27829093 tgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactgg 27829191  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaa-taaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  27829192 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgtt 27829279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 450 - 623
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035424
Alignment:
Q  450 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||| | |||||||| |   || |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  549 aactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagacta 623  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagacta 31035424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 453 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578301
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaac 551  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| |   || |||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  552 tcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  31578376 cttttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtca 31578301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Original strand, 14807556 - 14807693
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||| |  |||  || ||| |||||||||||||||    
T  14807556 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactggaaaaatcg 14807654  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14807655 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctg 14807693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 438 - 586
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181771
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-aggattgagtctcttggttatg--ggaagaggctgagattttggatagaattatgcggg 534  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |  |||||||  || || ||||| |||||||| ||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc--tttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 520 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 2468260 - 2468137
Alignment:
Q  520 atagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccag 619  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||    
T  2468260 atagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccag 2468162  T
Q  620 actaggtcaatttggaccgaactag 644  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  2468161 attaggtcaatttggacagaactag 2468137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 316 - 487
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035238
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573794
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtc 31573881  T
Q  497 atgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |   | ||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31573880 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctc-ttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 348 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214369
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttg 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  429 gcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 472  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 37214369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12517566 - 12517420
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| | |||    
T  12517566 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caatgtact 12517469  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  12517468 ggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctg 12517420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3886419 - 3886322
Alignment:
Q  100 aggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3886419 aggtttctgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtggtacgatgg 3886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541389
Alignment:
Q  553 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacat 652  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |     
T  33541507 cattgatatctctttt-gtaaggttactcatcat-atagtgaaacggaaggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaa 33541410  T
Q  653 atgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  33541409 tttcttttgtgttctctcttc 33541389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 15067785 - 15067963
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||||||||||    
T  15067785 ttaacttaaaatcagattt-tgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactggaaaaatc 15067882  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataa-aaataaaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     || ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |  || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15067883 atgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 15067963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328064
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 28328003  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28328004 t--gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 15072506 - 15072692
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   | |||| ||||     
T  15072506 tgtgagagttaacttaaaatcagatt-ctgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagttttgaag-caagccacta 15072603  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15072604 gaaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgtt 15072692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28252118 - 28251988
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |  |||  || ||| ||||||||||||||    
T  28252118 ttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagtttgagg-caaagcactggaaaaatc 28252021  T
Q  185 gtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28252020 gtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatgg 28251988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 23286084 - 23286134
Alignment:
Q  18 acaacaaacaagtttaggctttagaatgtaaatttaaatatggatgcttgc 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286084 acaacaaacaagtttaggctttagaatgtaaatttaaatatggatgcttgc 23286134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 555 - 642
Target Start/End: Original strand, 6376229 - 6376315
Alignment:
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  6376229 ttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaact 6376315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757293
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 16757354  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16757353 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16757293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 453 - 628
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg--gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgta 549  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |   || |||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  550 actcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    || | |||||||||||||| |||||       ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17847761 ac-ctttgatatctctttt-gtaaa-------atcattatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 196
Target Start/End: Original strand, 4423834 - 4423952
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  || |||||||||    
T  4423834 atgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagttttaagg-caaggcact 4423931  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4423932 ggaaaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554810
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggag-acttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || ||||||||||   ||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||      
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctcttt-- 29554871  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29554870 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 29554810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332787
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 28332726  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  28332727 t--gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtca 28332787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 23179740 - 23179586
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  23179740 cactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg-taaaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 23179647  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  23179646 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtca 23179586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 605 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 37214311 - 37214243
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  37214311 tgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctcttc 37214243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021132
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||      
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-- 9021196  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  9021195 tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 9021132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799449
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||  || ||||| |   | ||||| |||||| |||||||   |||||||      
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-cttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctc-- 17799513  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17799512 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtca 17799449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 618
Target Start/End: Original strand, 3896047 - 3896124
Alignment:
Q  541 attcttgtaactcat-tgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3896047 attcttgtaactcttatgatatctctttt-gtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctccccca 3896124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833861
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcatt-gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  16833769 agacttactcttgtaa-tcatttgatatctctttt-gtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtca 16833861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032811
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 33032750  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  33032751 gtaaagaaactcatatcattatagtggaatggagagctgctctctctcctagactaggtca 33032811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895659
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| |||||||| |||||   |||||||      
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctc-- 28895595  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||    
T  28895596 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcctctagactaggtca 28895659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812513
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 4812576  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  4812575 tttgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtca 4812513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752549
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 16752611  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  16752610 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctct-ccccagactaggtca 16752549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 19175778 - 19175846
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19175778 tcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 19175846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 471 - 510
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276386
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctg 3276386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 628
Target Start/End: Original strand, 25684737 - 25684799
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25684737 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 25684799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 28890876 - 28890922
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28890876 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 28890922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  537 acttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctctttt-gtaacattactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 471 - 625
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590948
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||  |||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc--ttt 590890  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactagg 625  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||    
T  590891 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactagg 590948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 33021018 - 33020925
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||| |  | ||||||||||| |||| |||||||    
T  33021018 agactgattcttgtaaccctttgatattttttgttgtaaagttactcatcattataagtgaacgaaaagctgctctctcccacagagtaggtca 33020925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 587 - 673
Target Start/End: Original strand, 14477520 - 14477607
Alignment:
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact-agatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| |||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| || |||||||||||| |||||    
T  14477520 tatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttc 14477607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839077
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Original strand, 19752440 - 19752486
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  19752440 tgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 19752486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 343
Target Start/End: Original strand, 17847527 - 17847556
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847527 acttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 4696620 - 4696688
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||| | ||||||    
T  4696620 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 4696688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985971
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactctt 13985971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 26403254 - 26403322
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  26403254 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 26403322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 31071253 - 31071321
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  31071253 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaaca 31071321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 35872476 - 35872432
Alignment:
Q  629 atttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  35872476 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 35872432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 120)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 136 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816216
Alignment:
Q  136 cgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaa 234  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   |  ||||    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagcaaaaa 4816651  T
Q  235 ataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagac 334  Q
       |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816650 cagaaacatattttttggtgcagatttgttacagattt----------ttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagac 4816561  T
Q  335 cttgtatcaaagcaaactttgaga--------------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 420  Q
    |||||||||    |||||||||||              ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816560 cttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 4816461  T
Q  421 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttgga 520  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  4816460 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggg 4816361  T
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccaga 620  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  4816360 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccaga 4816263  T
Q  621 ctaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  4816262 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 11983392 - 11983008
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11983392 gcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaa 11983293  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983292 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 11983193  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  11983192 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca- 11983095  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11983094 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11983008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 314 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230225
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggga 1230386  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  1230385 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggatggctgctctctc 1230288  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttc-tctcttcat 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  1230287 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcat 1230225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057529
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||     
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcc 13057471  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  13057472 cccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13057529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 9019877 - 9020261
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019877 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 9019976  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019977 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 9020076  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||| |||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  9020077 tctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca- 9020174  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  9020175 tatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 9020261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 289 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507161
Alignment:
Q  289 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 388  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 14507337  T
Q  489 tcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcatta 588  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||| |||| ||    
T  14507336 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatacttatca-ta 14507240  T
Q  589 tagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  14507239 tagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 322 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggat 521  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  522 agaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagac 621  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 14458798  T
Q  622 taggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  14458797 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241306
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28241458  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  28241457 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc 28241360  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  28241359 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Original strand, 32279948 - 32280332
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32279948 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaa 32280046  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280047 aggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 32280146  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  || || ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32280147 tctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcgt 32280245  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || || |||||||||||||||    
T  32280246 tatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttc 32280332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 30729191 - 30728803
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30729191 gcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaa 30729092  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30729091 agacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgac 30728992  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct---ttttgtaaagttactcat 583  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||    
T  30728991 tctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcat 30728892  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  30728891 -attatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 30728803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 272 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 20915736 - 20915357
Alignment:
Q  272 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggc 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||    ||||||||||||||    
T  20915736 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggc 20915638  T
Q  369 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20915637 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 20915538  T
Q  469 aacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttt 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  20915537 aacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--t 20915440  T
Q  568 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20915439 ttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 20915357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040089
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||     
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13040031  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  13040032 cctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26068882 - 26068590
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068882 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 26068783  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttg------------ttac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||    
T  26068782 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttaccgtttttgttac 26068683  T
Q  267 agttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068682 agatttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 671
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390713
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || |     
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgggg 3390556  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  3390557 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctc 3390655  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | | |||||| || |||||||| |||||||    
T  3390656 ccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctct 3390713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 317 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631918
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  || || ||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  517 tggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccc 616  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||    
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cc 3631975  T
Q  617 cagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| |||||||    
T  3631974 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttc 3631918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629844
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |      
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactaat-aatatagtgaaactgagggctgctctct-c 3629903  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3629902 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3629844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195516
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  12195651 actttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 12195555  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  12195554 cccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 12195516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 79 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26066611 - 26066319
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066611 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactgga 26066512  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  26066511 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacaatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 26066412  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 359  Q
       ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066411 agatttgttacaaatttaaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967530
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    ||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  30967374 tgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagagctgct 30967471  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  30967472 ctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 287 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15541503 - 15541120
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541503 gcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15541404  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15541403 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgag 15541304  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||| | | ||||||  || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  15541303 tctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttattcatca- 15541206  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  15541205 tatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 15541120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477616
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  || |      
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaa-------agttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 25477551  T
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||| |||||||||    
T  25477552 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctctt 25477616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 287 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 15533044 - 15532674
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533044 gcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15532945  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15532944 aggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 15532845  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || ||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15532844 tctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca- 15532747  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgctttt 660  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||    
T  15532746 tatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 33310954 - 33311235
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33310954 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33311053  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  33311054 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 33311153  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311154 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 320 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704552
Alignment:
Q  320 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatca-tatagtggattggagggctgctctct 19704607  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||    
T  19704606 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 314 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034590
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggct 30034744  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  30034743 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagcggatcggagggctgctc 30034646  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  30034645 tctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29755279 - 29754983
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29755279 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 29755180  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacag-ttttgttac 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29755179 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 29755080  T
Q  278 agat----------tttaa-gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||          ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755079 agatttgttacaaatttaaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 79 - 348
Target Start/End: Original strand, 33308685 - 33308966
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308685 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33308784  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcaga------------tttgttac 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||    
T  33308785 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacattttttgttac 33308884  T
Q  267 agttttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 348  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308885 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 287 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 15530485 - 15530166
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530485 gcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15530286  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15530285 tctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 15530189  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  15530188 tatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233740
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
     |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactca-ccgtatagtgaaacggagggctgctctctc 3233769  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3233768 ccccacactaggtcaattttgaccgaact 3233740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338427
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacacta-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | |||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctc 24338487  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  24338486 ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttc 24338427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628871
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  409 tgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggc 508  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 2629027  T
Q  509 tgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgct 608  Q
    || || ||||| |||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  2629026 tgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacggtactcatca-tatagtggatcggagggctgct 2628930  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  2628929 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 355 - 669
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065312
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26065102 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26065201  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  26065202 ttgacttctc--tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26065297  T
Q  655 gcttttgtgttctct 669  Q
      |||||||||||||    
T  26065298 tattttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 355 - 669
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085281
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttg---gaaacactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26085071 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26085170  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatat 654  Q
    ||||  ||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  26085171 ttgacttctc--tttgtaacgttactcgtta-tatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 26085266  T
Q  655 gcttttgtgttctct 669  Q
      |||||||||||||    
T  26085267 tattttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932546
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  406 gtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaag 504  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggt 26932610  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacata-tgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||    
T  26932609 tgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 287 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19227771 - 19227514
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227771 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaa 19227672  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227671 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19227572  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattc 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19227571 tctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 314 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027876
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgag 3027992  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||  |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3027991 actttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctcttt 3027893  T
Q  613 -cccccagactaggtca 628  Q
     ||||||||||||||||    
T  3027892 ccccccagactaggtca 3027876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161537
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||     
T  12161790 gagtttgtctctgg--aacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||| | || ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||| |    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatca-tatagtaaaatggatggctgttctct-c 12161596  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12161595 cctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttc 12161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 348 - 642
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719948
Alignment:
Q  348 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt 447  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  448 gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttg 547  Q
      | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttg 15719853  T
Q  548 taactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct-cccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15719854 taacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaact 15719948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 593
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490896
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 22490817  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtg 593  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22490818 ctttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaagattactcatcattatagtg 22490896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 456 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069697
Alignment:
Q  456 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  556 tgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatg 655  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  1069813 tgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 1069715  T
Q  656 cttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1069714 cttttatgttctctcttc 1069697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 315 - 672
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466658
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |  |||| | ||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttc 14466599  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||||||    
T  14466600 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctt 14466658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 321 - 644
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012347
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  420 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga-gattttg 518  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| | |||||    
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttg 17012223  T
Q  519 gatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || | |  |||||||||||    
T  17012224 g-tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctccccca 17012320  T
Q  619 gactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    
T  17012321 gactaggtcagtattggaccgaactag 17012347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 371 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455434
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16455701 aaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttg 570  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | | || |||||  || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctc-ttttg 16455507  T
Q  571 taaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  16455506 taaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaact 16455434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 435 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273217
Alignment:
Q  435 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgg 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| ||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  534 gagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttg 633  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatc-ttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 5273235  T
Q  634 gaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| | ||||||    
T  5273234 gaccgaactgggtcaaca 5273217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 452 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186051
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcg-ggagacttattcttgtaa 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  551 ctcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaac 650  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| | | |||    
T  12186171 ctcattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaac 12186073  T
Q  651 atatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    | ||  ||||||||||||||||    
T  12186072 aaattattttgtgttctctctt 12186051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1072240 - 1072067
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1072240 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaa 1072141  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattca 460  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072140 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 315 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14507716 - 14507569
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgg--gcaaggcactg 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||    
T  14507716 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcactg 14507617  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14507616 gaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 14507569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 402 - 642
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367336
Alignment:
Q  402 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatggg 501  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  502 aagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
    |||||  ||| | ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||     
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tattgtaaagttattcatca-tatagtgaaacggaa 15367294  T
Q  602 ggttgctctctc-ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367295 ggctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaact 15367336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 315 - 642
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696746
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||||  |||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattga 19696614  T
Q  512 gattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctct 610  Q
    || ||||| |||||||| |   || |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  19696615 gactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctctttt-gtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T
Q  611 ctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19696714 ctctcccagactaggtcagtattggaccgaact 19696746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 322 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  322 tataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 421  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 464  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 8995254 - 8995402
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8995254 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcact 8995351  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8995352 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgac 8995402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 9019701 - 9019849
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcact 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9019701 atgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgtaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-tgggcaaggcact 9019798  T
Q  176 ggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9019799 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctgac 9019849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 427
Target Start/End: Original strand, 8995430 - 8995570
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8995430 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 8995529  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 427  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995530 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 8995570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066125
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26066207 tt--gtaacgttacttatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 26066125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 444
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 444  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19227948 - 19227803
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  19227948 tgtgagagttaacttaaaattaagat-ctgcaggaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactgg 19227850  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19227849 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19227803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754694
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || || ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  29754792 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 29754696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309169
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33309087 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 33309169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 451 - 642
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945450
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggg-agacttattcttgta 549  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  || || ||||| |||||||| |   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  550 actcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaact 26945450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11983558 - 11983382
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |  ||  |  ||||||||||||||||    
T  11983558 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcagttgtgaggtaa--gcactggaaaaatcgt 11983461  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  11983460 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 11983382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22857962
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtc 22858109  T
Q  497 atgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcatt-gatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgg 594  Q
    |   ||||||  ||||| ||| | |||| ||| |   || |||| ||||||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22858108 acaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatcttt--gtaaagttactcatcattatagtgg 22858011  T
Q  595 aacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22858010 aacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaact 22857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068396
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  || || ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| ||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26068478 tt--gtaacgttgctcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 26068396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311438
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  33311356 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 33311438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 481
Target Start/End: Original strand, 15346369 - 15346524
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||           ||||||||||||||||    
T  15346369 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaattc--------aaactagggtttgtat 15346460  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 481  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15346461 aaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 524 - 642
Target Start/End: Original strand, 15346535 - 15346651
Alignment:
Q  524 aattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagacta 623  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  15346535 aattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctatt-gtaaagttattcatcat-atagtgaaacggaaagctgctctctcccccagacta 15346632  T
Q  624 ggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15346633 ggtcaatttggaccgaact 15346651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 569 - 673
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584331
Alignment:
Q  569 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctc 668  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  669 tcttc 673  Q
    |||||    
T  10584327 tcttc 10584331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 397 - 613
Target Start/End: Original strand, 20526871 - 20527081
Alignment:
Q  397 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 496  Q
    |||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20526871 aaaactaggggttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtc 20526965  T
Q  497 atgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgga 595  Q
    |   ||||||  | ||| ||| | |||||||| |   | ||||| |||||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20526966 acaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc--tttgtaaagttattcatcattatagtgga 20527063  T
Q  596 acggagggttgctctctc 613  Q
    |||||| | |||||||||    
T  20527064 acggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 315 - 428
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584213
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  415 gagtttgtctcttg 428  Q
    ||||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctcttg 10584213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 531 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465600
Alignment:
Q  531 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat 630  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||| |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt--gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagt 25465613  T
Q  631 -ttggaccgaact 642  Q
     ||||||||||||    
T  25465612 attggaccgaact 25465600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 567 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12911531 - 12911471
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12911531 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtc 12911471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 423 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 25078783 - 25078567
Alignment:
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggata 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |   |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| | || |||||  ||||||||  | ||    
T  25078783 ctcttggcaacaaacattagggttgaaa--ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgagatttaag-ta 25078687  T
Q  523 gaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagac 621  Q
    |||||| |   || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| |||  ||||| |    
T  25078686 gaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtc 25078589  T
Q  622 taggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  25078588 taggtcagtattggaccgaact 25078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445815
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtca 30445815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351877
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |   | ||||| |||| |||||||||   |||||||  |||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattaggtttgaagactgattcatgtaactca---atatctc--ttt 22351938  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  22351937 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagaactgctctctcccccagactaggtca 22351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 454 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037750
Alignment:
Q  454 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggaga-cttattcttgtaact 552  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | || || ||  ||||| ||||| |||||||| |    | | ||||||||||||||     
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  553 cattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgga---acggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||| | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  28037827 ctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtca 28037750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878883
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 13878820  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13878821 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15530663 - 15530516
Alignment:
Q  77 aatgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcac 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |   |||  ||||| ||||    
T  15530663 aatgtgagagttaacttaaaatcaggat-ctgcaggaatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttca-agtttgaggcaaagcac 15530566  T
Q  175 tggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    | ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15530565 tcgaaaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgtgctg 15530516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786075
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 16786012  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16786013 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 16786075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 567 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 12937278 - 12937219
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12937278 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtc 12937219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694877
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 17694937  T
Q  570 gtaaagttactc-atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  |||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17694936 gtaaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtca 17694877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883631
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| || ||||   ||||||      
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctc-- 13883568  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13883569 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 13883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 33215830 - 33215984
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  33215830 cactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggactt-ggatagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 33215923  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  33215924 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctatcccccatactaggtca 33215984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1072396 - 1072312
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1072396 atgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggtacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttaagtttt 1072312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaattt 632  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    | |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaac-ctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342826
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||| |||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctgggatttggg-tagtattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 22342887  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  22342886 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtca 22342826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12186405 - 12186330
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 387  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12186405 acttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 578 - 628
Target Start/End: Original strand, 7294035 - 7294085
Alignment:
Q  578 actcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  7294035 actcatcattatagtggaacagagagttgctctctcccccagagtaggtca 7294085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 25941780 - 25941826
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25941780 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25941826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887252
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 26887313  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||    
T  26887312 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctg--ctctcccccagactaggtca 26887252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 19702095 - 19701958
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttga---gggttgattcaccttgggaaa--cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattt 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |    
T  19702095 tctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-ct 19701997  T
Q  517 tggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||||||    
T  19701996 tgggtagaattatgtttgaagactgattcttgtaactca 19701958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 26084818 - 26084895
Alignment:
Q  172 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtattttt 249  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  26084818 cactggaaaaatcgtgccacgattgaatcgcatcgtggcacgatggtgcgattgaagataaaaataaaacgtattttt 26084895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248740
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 31248803  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  31248802 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctactctctcccctatactaggtca 31248740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201352
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 35201415  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||| ||||  ||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  35201414 tttgaaaagaaactaattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtca 35201352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 600
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833540
Alignment:
Q  541 attcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagtta-ctcatcattatagtggaacgga 600  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctctttt-gtaaagttaactcatcattatagtggaacgga 3833540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 641
Target Start/End: Original strand, 11262678 - 11262763
Alignment:
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaac 641  Q
    |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11262678 ttgatatctcttt--gtaaagaaactcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaac 11262763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 25466014 - 25465927
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactagg 625  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25466014 agactgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactagg 25465927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30729281 - 30729181
Alignment:
Q  165 ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgt 263  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |  || || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30729281 ggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgt 30729182  T
Q  264 t 264  Q
    |    
T  30729181 t 30729181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4816787 - 4816740
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcagg-tttctgcagaatcgtggcacga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816787 atgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcacga 4816740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 13467642 - 13467492
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||    |||    
T  13467642 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatc----ttt 13467552  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  13467551 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 13467492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577654
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 3577654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 446
Target Start/End: Original strand, 4595048 - 4595102
Alignment:
Q  389 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4595048 gcaacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138477
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagag 11138477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Original strand, 17038345 - 17038391
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  17038345 atcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagacttggtca 17038391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 495
Target Start/End: Original strand, 6843186 - 6843287
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg-ggaaacactattaggattgagtc 488  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  6843186 caacaataaaactatggtttgtagagaattt---tcttggcaacaaacactagggtt--aggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtc 6843280  T
Q  489 tcttggt 495  Q
    |||||||    
T  6843281 tcttggt 6843287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542452
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag-gctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaa 550  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||   || || |||||||||||||| |   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  551 ctcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    | | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctc--tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 358
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3577604 - 3577515
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  3577604 agactgattcttgtaactca---atatctcttt--gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 3577515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 510
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036097
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 17036097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 5165884 - 5165838
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  5165884 atcattatagtggaatggagagttgctatctcccccagagtaggtca 5165838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 22870196 - 22870112
Alignment:
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  22870196 ttgatatctcttt--gtaaagaaactcatcattatagtggaacggagagcttctctctctcccag--taggtcagtattggaccgaact 22870112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 31936638 - 31936592
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31936638 tgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 31936592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 640
Target Start/End: Original strand, 10077189 - 10077246
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 640  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  10077189 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaa 10077246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17904619 - 17904566
Alignment:
Q  390 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  17904619 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 18232903 - 18232862
Alignment:
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  18232903 ggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccga 18232862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643331
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||  |||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctggga-cttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctc--ttt 26643272  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  26643273 gtaaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtca 26643331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749297
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||  |||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctggga-cttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaactca---atatctc--ttt 26749238  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||    
T  26749239 gtaaagaaactcatatcattatagttgaacggagagctg--ctctcccccagaccaggtca 26749297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 582 - 642
Target Start/End: Original strand, 30443532 - 30443593
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  30443532 atcattatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaact 30443593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 482
Target Start/End: Original strand, 30445602 - 30445661
Alignment:
Q  422 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-gaaacactattaggat 482  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30445602 tctcttggcaacaaacactacgg-ttga-gattgattcaccttggagaaacactattaggat 30445661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 5757502 - 5757570
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5757502 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 5757570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 474 - 510
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941686
Alignment:
Q  474 tattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 25941686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 124)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 42064407 - 42064785
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064407 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 42064506  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064507 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 42064606  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  42064607 tctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 42064703  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtc-aatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  42064704 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 40032421 - 40032032
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032421 gcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40032322  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032321 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 40032222  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct---ttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||||  |||||||| |  || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||    
T  40032221 tctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcat 40032122  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  40032121 cattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 40032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 27104691 - 27105067
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27104691 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 27104790  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104791 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 27104889  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||     
T  27104890 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacattactcatca- 27104986  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  27104987 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 316 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19501996
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19502146  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccc 615  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19502145 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggatcgaagggctgctctctccc 19502048  T
Q  616 ccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  19502047 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279969
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa-gcaacaacaaaactagggtttgta 412  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 45280122  T
Q  513 attttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctct 612  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45280121 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct 45280024  T
Q  613 cccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || ||||||||||||    
T  45280023 cccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 19504708 - 19504331
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504708 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 19504609  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504608 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 19504509  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||     
T  19504508 tctcttggtta-cggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca- 19504412  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  19504411 tatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6264508 - 6264127
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6264508 gcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaa 6264409  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6264408 aggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaag 6264313  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |  || ||  || |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6264312 tctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcat 6264214  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6264213 tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007918
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |      
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgaagggctgctctctcc 19007857  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttcat 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  19007858 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctattcat 19007918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453050
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaga 42452899  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||     
T  42452900 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggatcggagggctgctctct- 42452996  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  42452997 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 13910407 - 13910030
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910407 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13910308  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13910307 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 13910208  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||   |||||||||     
T  13910207 tctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacaatactcatca- 13910111  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  13910110 tatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 21521058 - 21520672
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 384  Q
    ||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21521058 gcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttag 21520959  T
Q  385 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 484  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21520958 aaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg 21520859  T
Q  485 agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatc 584  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21520858 agtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatc 21520760  T
Q  585 attatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  21520759 a-tatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21520672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 43623931 - 43623559
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623931 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaa 43623832  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43623831 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgag 43623744  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  43623743 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca- 43623646  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  43623645 tatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43623559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 291 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287315
Alignment:
Q  291 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 390  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  391 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctc 22287496  T
Q  491 ttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattata 590  Q
    || |||| ||||||||  ||| | || || |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22287495 ttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tata 22287398  T
Q  591 gtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22287397 gtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22287315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923488
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgg 42923648  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    |  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42923647 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctc-ttttgtaaagttactcgtca-tatagtgaaacggagggctgctctc 42923550  T
Q  612 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  42923549 tcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 42923488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452222
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct 509  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 23452378  T
Q  510 gagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctc 609  Q
    | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  23452377 gggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgatactcatca-tatagtggattggagggctgctc 23452280  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  23452279 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 6259178 - 6258796
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||| ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6259178 gcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaa 6259079  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259078 aggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 6258979  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| |||||||   || |  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6258978 tctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcattat 6258882  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6258881 tatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196911
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||      
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacattactcatca-tatagtgaaacgaatggctgctctctcc 28196854  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28196855 cccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28196911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739538
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||     
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctc-ttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 11739597  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11739596 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11739538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 24162575 - 24162208
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162575 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24162476  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24162475 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgag 24162376  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||          |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||||||||     
T  24162375 tctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaatgctactcatca- 24162289  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||    
T  24162288 tatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36559358 - 36559067
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559358 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36559259  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  36559258 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 36559159  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559158 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289044
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||     
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    || || |||||||| | || | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctc-ttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcc 44289105  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttcat 675  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44289104 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcat 44289044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837544
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||  |||||     
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct------tgggaagagattgagac 14837386  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    |||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcc 14837485  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  14837486 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 318 - 673
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022448
Alignment:
Q  318 ttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatttt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  518 ggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatca---------ttatagtggaacggagggttgct 608  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||         ||||| || ||| || || ||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc--tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgct 3022383  T
Q  609 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  3022384 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3022448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45332675 - 45332384
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45332675 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactgga 45332576  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 278  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45332575 aaaatcgtggaacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagttttgttaca 45332476  T
Q  279 g-----------attttaagcagatttgttacaga-ttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    |           |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332475 gatttgttacagattttaggcagatttgttatagatttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 315 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732789
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||     
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tgggac 31732913  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcc 31732814  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccga 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31732813 cccagactaggtcaatttggaccga 31732789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849393
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||     
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctcc 17849334  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    | || |||||||||||||||||   ||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17849335 cacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17849393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848716
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  415 gagtttgtctctt-ggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  17848563 ctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggatgactgctctctc 17848656  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  17848657 ccccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17848716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 323 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979558
Alignment:
Q  323 ataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggata 522  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |  || ||| | ||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  523 gaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctct-ctcccccagac 621  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||||| ||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctc-ttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaac 34979608  T
Q  622 taggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctct 671  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  34979607 taggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctct 34979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215587
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  404 gggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatggga 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  503 agaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagg 602  Q
    ||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagg 35215636  T
Q  603 gttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  35215635 gctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 35215587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 355 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239000
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactca 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccca 45239073  T
Q  555 ttgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaa 629  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45239072 ttgatatctc-ttttgtaaagttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 316 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539557
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  416 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagatt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  516 ttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 568  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatctttt 15539557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 315 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578115
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    || ||| ||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||     
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 11578245  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  11578244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcc 11578146  T
Q  615 cccagactaggtca-atttggaccgaactag 644  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  11578145 cccagactagatcagttttagaccgaactag 11578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217964
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  554 attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
     ||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  35218058 gttgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 35217964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 316 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146617
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgaga 20146746  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20146745 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 20146647  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    || ||||||| |||| | ||||||||||||    
T  20146646 cctcagactaagtcagtattggaccgaact 20146617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 287 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 18800665 - 18800292
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800665 gcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaa 18800566  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    |          || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18800565 atc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18800478  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||| |  |||||||  || |  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18800477 tctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcgtcat 18800379  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca-atttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||    
T  18800378 tatagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 18800292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 445 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375325
Alignment:
Q  445 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattc 544  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  545 ttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactag 644  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctctttt-gtaacattactcatcat-atagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgg 5375354  T
Q  645 atcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||    
T  5375353 gtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 5375325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 314 - 672
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874406
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||  ||||     
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgagg 22874248  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  22874249 ctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctc 22874347  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    || || ||||||||||||||||||||| | | | |||| || || ||||||||||||||    
T  22874348 cctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 22874406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 405 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459170
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 504  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggt 604  Q
    ||  || |  ||  | || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttt-taaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  28459236 ttctctctacct-agactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctt 28459170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 314 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897270
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattga 17897385  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  17897384 gattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatct-attttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctc 17897286  T
Q  612 tcccccagactaggtca 628  Q
    | |||||||||||||||    
T  17897285 t-ccccagactaggtca 17897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 287 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22407772 - 22407591
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22407772 gcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaa 22407673  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 468  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407672 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 315 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 355 - 495
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020302
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 36561532 - 36561344
Alignment:
Q  182 atcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt------------ 269  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                
T  36561532 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttacaga 36561433  T
Q  270 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561432 tttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19502542 - 19502405
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19502542 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgt 19502443  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502442 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19502405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24162752 - 24162565
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttg-ggcaaggcactgg 177  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24162752 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 24162653  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |  || | || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24162652 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 24162565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36561677 - 36561539
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561677 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36561578  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatgg 217  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36561577 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 672
Target Start/End: Original strand, 35107192 - 35107571
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttaga 385  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||||| |  || |||| ||| |||||||    
T  35107192 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttaga 35107290  T
Q  386 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 485  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35107291 agt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattga 35107383  T
Q  486 gtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaatta--tgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcat 583  Q
    |||||||||| | ||||||||  || || ||||| ||||||||  |   | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  35107384 gtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctctttt-gtaatgttactcat 35107481  T
Q  584 cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctctt 672  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||| ||  ||||||||||||||||    
T  35107482 cattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctt 35107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19504885 - 19504739
Alignment:
Q  78 atgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19504885 atgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactgg 19504786  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19504785 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctg 19504739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 27104523 - 27104701
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 186  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27104523 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 27104622  T
Q  187 ggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  27104623 ggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgtt 27104701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 521 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22407583 - 22407433
Alignment:
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccaga 620  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22407583 tagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 22407486  T
Q  621 ctaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22407485 ctaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22407433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558849
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36558949  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  36558948 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 36558851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561126
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 36561226  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
     ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  36561225 -tttgtaacgttactcatca-aatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 36561128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 314 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377629
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  410 gtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgag 450  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 451 - 644
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699623
Alignment:
Q  451 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgta 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  || || ||||| |||||||| |   || |||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  550 actcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccgaactag 644  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactag 40699623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37962951
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    | |||||| |||||| |||||||||| | ||||   | |||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| |   ||||||  ||||     
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgagg 37963076  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| |    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||  || ||||||    
T  37963075 ctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt----ttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctc 37962980  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37962979 tcccacactaggttaatttggaccgaact 37962951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 467 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332182
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |  || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||  |||||| |||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  45332264 tt--gtaaaggtactcatcat-atagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 45332182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 531 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707730
Alignment:
Q  531 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccc--cagactaggtca 628  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt-gtaaggttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtca 22707775  T
Q  629 atttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22707774 atttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22707730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21521234 - 21521048
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||    
T  21521234 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctacaggaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgaag-caagccactg 21521137  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21521136 gaaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 21521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 521 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462957
Alignment:
Q  521 tagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccaga 620  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-ttttgtaacgttacccatta-tatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 7462980  T
Q  621 ctaggtcaa-tttggaccgaact 642  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  7462979 ctaggtcaattttggaccgaact 7462957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 530 - 675
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871094
Alignment:
Q  530 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaa 629  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctcttta-gtaaggttactcatcat-atagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaa 23871048  T
Q  630 tttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttcat 675  Q
    |||||| | |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23871049 tttggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttcat 23871094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 405 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  405 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaag 504  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | || |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  505 aggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactc 581  Q
    |   || || ||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctc-ttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43624077 - 43623968
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43624077 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactgaaaaaatcg 43623979  T
Q  186 tggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||    
T  43623978 tggcacgatgg 43623968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22163107 - 22163001
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||    
T  22163107 ttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 22163009  T
Q  666 ctctcttc 673  Q
    ||||||||    
T  22163008 ctctcttc 22163001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 468 - 601
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589896
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctc-t 20589861  T
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 42064231 - 42064376
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||  || ||| ||||||    
T  42064231 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagtttgagg-caaagcactg 42064328  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42064329 gaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctg 42064376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 371 - 594
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139572
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 470  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||| ||| | |||||||| | |   ||||| ||| |||||||   ||||| ||||  |||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc--ttt 43139547  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtgg 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43139548 gtaaagttactcatcattatagtgg 43139572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6259351 - 6259168
Alignment:
Q  82 gagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaa 179  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||  ||  ||| ||||||||    
T  6259351 gagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagttttgagga-aagtcactggaa 6259254  T
Q  180 aaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||  || || | |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  6259253 aaatcgtggcacgatgggatcgcaacgtgacacgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgtt 6259168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736361
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 2736298  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2736299 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2736361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943692
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctcttt-- 17943633  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17943634 gtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 409
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 409  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687139
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 39687078  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39687079 t--gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517664
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||||||||||   ||||||||||      
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt-- 27517725  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27517724 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 27517664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 438 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414235
Alignment:
Q  438 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 38414235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680201
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || || |||||||| |   || || | ||||||| ||||||||   |||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagacttggg-tagaattaggtttgaagattgattcttgaaactcatt---atctctt 39680140  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39680141 t--gtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 413 - 628
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028807
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgag 512  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||  |||     
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  513 attttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctc 611  Q
    | ||||| ||||||||||   | | ||| |||||||||||   || ||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  35028692 actttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctc-ttttctaaaattactcatcattgcagtggaacggagagctgctctc 35028790  T
Q  612 tcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  |||||||||    
T  35028791 tcccccttactaggtca 35028807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40032586 - 40032503
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagtttt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40032586 tgtgagagttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 40032503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13910491 - 13910397
Alignment:
Q  171 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | |||||||||||    
T  13910491 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtt 13910397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12342746 - 12342673
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 386  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342746 acttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462592
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| ||||| |   ||||||      
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctc-- 17462529  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17462530 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17462592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781246
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggaga-cttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || | || ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaaaactgattcttggaactca---atatctcttt-- 12781307  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12781306 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170778
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||| ||||||||||   |||||||  |||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgatttttgtaactca---atatctc--ttt 37170838  T
Q  570 gtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  37170837 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctct-ccccagactaggtca 37170778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054790
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||      
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-- 20054854  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  20054853 tttgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtca 20054790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 413 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583483
Alignment:
Q  413 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27583573 tagagttt-tctcttggcaacgaacactaaggttgggag--tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741097
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || || || |||||||| |    | |||| ||||||| ||||||||   |||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggacttggg-tagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatt---atctctt 2741036  T
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2741037 t--gtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 2741097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13828458 - 13828342
Alignment:
Q  535 agacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatt-tg 633  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |   | | |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  13828458 agacttattcttgtagccctttgatatctctttt-gtaaaattactcataattatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctg 13828360  T
Q  634 gaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  13828359 gaccgaactggataaaca 13828342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 601
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694109
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggct-gagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgt 548  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||  | | || ||||| |||||||| |   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  549 aactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggag 601  Q
    |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctctttt-gtaaagttactcatcattttagtggaacggag 15694109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6264655 - 6264546
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaa-tcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatc 184  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| || |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||  || |||| |||||||||||||    
T  6264655 ttaacttaaaatcaggtt-ctgcagaaattgttgcacgatggttgggcaacgtggcatgattggatgtttcagttttgagg-caagtcactggaaaaatc 6264558  T
Q  185 gtggcacgatgg 196  Q
    ||||||||||||    
T  6264557 gtggcacgatgg 6264546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 618
Target Start/End: Original strand, 33604092 - 33604143
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctccccca 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  33604092 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 565 - 628
Target Start/End: Original strand, 39287261 - 39287324
Alignment:
Q  565 tttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  39287261 tttttgtaaaattactcatcattatagtggaacgaagagctgctctctccctcatactaggtca 39287324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 628
Target Start/End: Original strand, 17921871 - 17921927
Alignment:
Q  571 taaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  17921871 taaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctctct-acccagactaggtca 17921927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 595
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932756
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||  |||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc--ttt 17932730  T
Q  570 gtaaagttactcatcattatagtgga 595  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||    
T  17932731 gtaaagaaactcatcattatagtgga 17932756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050046
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||   ||||||| ||||| |   | ||||| ||||||||||||||   |||||||      
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggct-aggacttggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc-- 20050111  T
Q  567 tttgtaaagttactc--atcattatagtggaacggagggttgctctct-cccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  20050110 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtca 20050046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 20522293 - 20522225
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20522293 tcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 20522225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22407948 - 22407762
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  |  ||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||||  || |||| || ||    
T  22407948 tgtgagagttaatttaaaattaggtt-ctgcaggaatcgtggcacgattgaagggtaacatggcacgattggatgtttcagttttgagg-caagtcagtg 22407851  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407850 aaaaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggcacgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtt 22407762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 452 - 495
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345704
Alignment:
Q  452 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggt 26345704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 453 - 506
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921808
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag 506  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagag 17921808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712656
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 22712656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717365
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 22717365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 33671038 - 33670992
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33671038 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 33670992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567451
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 45567451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 628
Target Start/End: Original strand, 45679817 - 45679879
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45679817 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 45679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 10445468 - 10445536
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  10445468 tcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaaca 10445536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 14699031 - 14699099
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  14699031 tcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 14699099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479151
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggacttggg-tagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctcttt-- 30479090  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30479091 gtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 30479151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 530
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503054
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagag-gctgagattttggatagaattatg 530  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||   ||||| ||||| ||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaattatg 7503054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057370
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 17057370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085353
Alignment:
Q  608 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 17085353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575265
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctcttggt 495  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggt 34575265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 41303119 - 41303088
Alignment:
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41303119 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 41303088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Original strand, 38190997 - 38191039
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  38190997 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 38191039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 605 - 651
Target Start/End: Original strand, 42039715 - 42039761
Alignment:
Q  605 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42039715 tgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaaca 42039761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 651
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345633
Alignment:
Q  590 agtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 1345633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539508
Alignment:
Q  628 aatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17865276 - 17865231
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17865276 tcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtca 17865231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 363
Target Start/End: Original strand, 40699229 - 40699278
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||    
T  40699229 acttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 371 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304596
Alignment:
Q  371 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtt 446  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtaaag---ttttctattggcaacaaacattagggtt 41304596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 8390174 - 8390242
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  8390174 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaaca 8390242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 13569401 - 13569333
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  13569401 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 13569333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 343
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28462649 - 28462593
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 343  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462649 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720771
Alignment:
Q  453 ttgattcaccttgg-gaaacactattaggattgagtctctt 492  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctt 30720771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 34682358 - 34682426
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  34682358 tcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaaca 34682426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 39483004 - 39482936
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||||  |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  39483004 tcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 39482936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4298
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4021  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4022 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgag 4120  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4121 tctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca- 4218  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||    
T  4219 tatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 317 - 673
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79494
Alignment:
Q  317 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 416  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  417 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattt 516  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatt 79339  T
Q  517 tggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccc 616  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  79340 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccc 79437  T
Q  617 cagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  79438 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 79494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 69658 - 69277
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  69658 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 69559  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69558 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 69459  T
Q  483 tgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactca 582  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  69458 tgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgttactca 69361  T
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  69360 tca-tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 73390 - 73207
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 382  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  73390 gcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 73291  T
Q  383 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 466  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73290 agaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 69825 - 69688
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| |||||||||||||||    
T  69825 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaatcg 69727  T
Q  186 tggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctg 224  Q
    | |||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  69726 tagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctg 69688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 73536 - 73427
Alignment:
Q  87 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacga-tggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcg 185  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |   |||  ||||| ||||||||||||| |    
T  73536 ttaacttaaaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttca-agtttgaggcaaagcactggaaaaattg 73438  T
Q  186 tggcacgatgg 196  Q
    |||||||||||    
T  73437 tggcacgatgg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  434 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41468
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 41620  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  41619 ctttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaatcggagggctgctctctc 41522  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  41521 ccccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 287 - 642
Target Start/End: Original strand, 14944 - 15297
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14944 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaa 15043  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044 aggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 15143  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    ||||||||||| || |||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15144 tctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatca- 15241  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15242 tatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaact 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 327 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14363
Alignment:
Q  327 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 424  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  425 cttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggataga 524  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 14508  T
Q  525 attatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactag 624  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14507 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctctctcccctagactag 14410  T
Q  625 gtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||||    
T  14409 gtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtgttctctcttc 14363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 264
Target Start/End: Original strand, 14768 - 14954
Alignment:
Q  80 gtgagaattaacttaaaatcaggtttctgca-gaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 177  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || || |  |||||| ||||||    
T  14768 gtgagagttaacttaaaatcaggattctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcag-ttatgaggcaagtcactgg 14866  T
Q  178 aaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    |||  ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||| | |  || || | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  14867 aaatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgacacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 287 - 642
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3157
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 386  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2904  T
Q  387 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 486  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2905 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 3004  T
Q  487 tctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcat 586  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| |  ||||||||     
T  3005 tctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgaaactcatca- 3101  T
Q  587 tatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 642  Q
    |||||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3102 tatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaact 3157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 2629 - 2815
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcag-aatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgat-ggaggttttagttttttgggcaaggcactg 176  Q
    ||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||| ||||    
T  2629 tgtgagagttaacttaaaatcaagat-ctgcaggaattgtgacacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgagg-caaggtactg 2726  T
Q  177 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |  || || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2727 gaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtt 2815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 314 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183626
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtta-cggaagagattggga 183778  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  183777 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaatgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 183680  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  183679 cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 314 - 651
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52300
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  412 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga 511  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgt 52160  T
Q  512 gattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttg--ctc 609  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||    
T  52161 gactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 52258  T
Q  610 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  52259 tctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaaca 52300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 651
Target Start/End: Original strand, 50234 - 50301
Alignment:
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctct--ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  50234 ttatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaaca 50301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 314 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11452
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 11610  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| | |||||||||    
T  11609 ctttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtggattggagagctgctctctc 11512  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||    
T  11511 ccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 11452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 21915 - 22206
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22014  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  22015 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 22114  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22115 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 79 - 358
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24481
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24190 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 24289  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgttacagt--------- 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||             
T  24290 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacatatttttgggagcagatttgttacagtttttgttac 24389  T
Q  270 ---tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 358  Q
       ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24390 agatttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22418
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  22320 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 22416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 467 - 667
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24693
Alignment:
Q  467 gaaacactattaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 565  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  566 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  24595 tt--gtaacgttactcatcaa-atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgtt 24691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Original strand, 8443 - 8511
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  8443 tcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 8511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 287 - 667
Target Start/End: Original strand, 29086 - 29473
Alignment:
Q  287 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 376  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  29086 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 29185  T
Q  377 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 476  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  29186 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 29285  T
Q  477 taggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagt 576  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||       
T  29286 taggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc--tttgtaacaa 29383  T
Q  577 tactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||    
T  29384 tactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29005
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcac 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28941 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 267
Target Start/End: Original strand, 29001 - 29099
Alignment:
Q  170 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaata-aaacgtatttttgggagcagatttgttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  29001 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttaca 29099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80168
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  415 gagtttgtctc-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  80012 ctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 80108  T
Q  614 ccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| || |||||||| |||||||||    
T  80109 ccccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttc 80168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188382
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctg 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctg 188382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 315 - 673
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85540
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||  || ||     
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-tttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 85481  T
Q  615 cccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| || | |||| || ||||||||||||||||||    
T  85482 cccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttc 85540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 179; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 355 - 651
Target Start/End: Original strand, 34 - 328
Alignment:
Q  355 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggtt 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  455 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  554 attgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||||| ||||  ||||||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  234 attgatttctc--tttgtaacgaaactcatca-tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaaca 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12868
Alignment:
Q  79 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 178  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 12955  T
Q  179 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctgacggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtta 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12954 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaataaaacgtatttttgggagcagatttgtta 12868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 314 - 616
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  408 ttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagg 507  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagg 2186  T
Q  508 ctgagattttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgc 607  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||||||| | |    
T  2187 ctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctc-ttttgtaacgttcctcatca-tatagtgaatcggagggctac 2284  T
Q  608 tctctcccc 616  Q
    |||||||||    
T  2285 tctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 314 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15830
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  16154 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 16056  T
Q  414 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgaga 513  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||    
T  16055 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 15959  T
Q  514 ttttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctc 613  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  15958 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctg 15860  T
Q  614 ccccagactaggtcaat-ttggaccgaact 642  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  15859 cccccgactaggtcagtgttggaccgaact 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 431 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1438
Alignment:
Q  431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg 530  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  531 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc--tttgtaacgatactcatca-tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  631 ttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttct 667  Q
    |||||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 316 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16659
Alignment:
Q  316 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||     
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagac 16787  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||    
T  16786 tttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcc 16688  T
Q  615 cccagactaggtca-atttggaccgaact 642  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16687 cccagaccaggtcagttttggaccgaact 16659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 315 - 542
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  315 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  415 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagat 514  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  515 tttggatagaattatgcgggagacttat 542  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 673
Target Start/End: Original strand, 35816 - 35903
Alignment:
Q  586 ttatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgttctctcttc 673  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||||||    
T  35816 ttatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 35903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 324 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1666
Alignment:
Q  324 taaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 422  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt-- 1862  T
Q  423 ctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggata 522  Q
           |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||  || || ||||| ||    
T  1861 -------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  523 gaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagact 622  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatact 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 321 - 640
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5089
Alignment:
Q  321 ctataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaa--aagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||  |||||||||    |||||||||| ||||| |    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaacaa----actagggtttatatagcg 4868  T
Q  418 tttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctga-gattt 516  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| | |||    
T  4869 ttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttt 4965  T
Q  517 tggatagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccc 616  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||   |||||||| |||    
T  4966 tgg-tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccc 5064  T
Q  617 cagactaggtcaat-ttggaccgaa 640  Q
    |||||||||||| | ||||||||||    
T  5065 cagactaggtcagtattggaccgaa 5089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 314 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 993
Alignment:
Q  314 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  414 agagtttgtctc-----ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 483  Q
    ||||||||||||     || | ||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  1067 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  598 ggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgtt 665  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 540 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 57539 - 57435
Alignment:
Q  540 tattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaat-ttggaccg 638  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  57539 tattcttgtaaccctttgatatctatttt-gtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggacgg 57441  T
Q  639 aactag 644  Q
    ||||||    
T  57440 aactag 57435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 471 - 628
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16482
Alignment:
Q  471 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatgcggga-gacttattcttgtaactcattgatatctcttttt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||| |   || |||| ||||||| ||||||   ||||||||||      
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttggg-tagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctcttt-- 16421  T
Q  570 gtaaagttactcat--cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16422 gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 16482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 468 - 614
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224961
Alignment:
Q  468 aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgagattttggatagaattatg-cgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||||| |   | ||||| ||||||| |||||||   ||||||      
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggga-cttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctc-- 224912  T
Q  567 tttgtaaagttactca-tcattatagtggaacggagggttgctctctcc 614  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  224913 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcc 224961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 5756 - 5688
Alignment:
Q  583 tcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactagatcaaca 651  Q
    |||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  5756 tcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 5688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3157 - 3095
Alignment:
Q  567 tttgtaaagttactcat-cattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3157 tttgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 582 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 17057 - 17011
Alignment:
Q  582 atcattatagtggaacggagggttgctctctcccccagactaggtca 628  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17057 atcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtca 17011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 618 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1439
Alignment:
Q  618 agactaggtcaatttggaccgaactagatcaacatatgcttttgtgt 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University