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Alignment Overview

Query: NF7321_high_38 (Length: 225)

Name: NF7321_high_38
Description: NF7321
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7321_high_38
NF7321_high_38
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (1-225)||(22081062-22081286)
chr8 (28-225)||(44562932-44563132)
chr8 (28-225)||(9354453-9354653)
chr8 (28-225)||(19659223-19659423)
chr8 (1-194)||(19286266-19286459)
chr8 (1-152)||(31490013-31490164)
chr8 (1-152)||(19674239-19674390)
chr8 (1-152)||(28362218-28362369)
chr8 (73-155)||(19687971-19688053)
chr8 (70-155)||(16277424-16277509)
chr8 (70-155)||(27609165-27609250)
chr8 (67-155)||(18710453-18710541)
chr8 (1-152)||(19208623-19208774)
chr8 (1-152)||(33258524-33258675)
chr8 (70-155)||(2137519-2137604)
chr8 (70-107)||(19518451-19518488)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-225)||(15391563-15391788)
chr4 (1-225)||(14235750-14235980)
chr4 (1-225)||(15285153-15285380)
chr4 (1-225)||(15227689-15227916)
chr4 (1-225)||(1900076-1900303)
chr4 (1-152)||(5005686-5005837)
chr4 (1-152)||(30753558-30753709)
chr4 (1-155)||(21969517-21969671)
chr4 (1-155)||(27163618-27163772)
chr4 (1-152)||(33674114-33674265)
chr4 (1-152)||(39850439-39850590)
chr4 (28-225)||(24460830-24461030)
chr4 (1-194)||(54833206-54833399)
chr4 (1-155)||(24592612-24592766)
chr4 (70-155)||(17013885-17013970)
chr4 (1-107)||(14098357-14098463)
chr4 (1-107)||(31126867-31126973)
chr4 (70-155)||(14664903-14664988)
chr4 (67-155)||(14763605-14763693)
chr4 (7-107)||(18800971-18801071)
chr4 (67-155)||(24112547-24112635)
chr4 (67-155)||(34189258-34189346)
chr4 (1-152)||(40105942-40106093)
chr4 (70-152)||(6569738-6569820)
chr4 (67-107)||(19373143-19373183)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-225)||(21368-21592)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (8-172)||(27392797-27392961)
chr2 (1-225)||(19456635-19456862)
chr2 (28-225)||(31891542-31891742)
chr2 (1-225)||(21703378-21703605)
chr2 (28-224)||(27118515-27118714)
chr2 (1-155)||(32049595-32049749)
chr2 (28-225)||(34156838-34157038)
chr2 (28-225)||(34303517-34303717)
chr2 (1-152)||(11635482-11635633)
chr2 (1-152)||(11641671-11641822)
chr2 (28-225)||(3784481-3784681)
chr2 (28-225)||(16163426-16163626)
chr2 (1-152)||(261058-261209)
chr2 (1-152)||(12586598-12586749)
chr2 (1-152)||(21677475-21677626)
chr2 (1-155)||(34279246-34279400)
chr2 (1-152)||(13936837-13936988)
chr2 (1-107)||(12716943-12717049)
chr2 (1-155)||(27434734-27434888)
chr2 (1-152)||(27803489-27803640)
chr2 (1-152)||(37925290-37925441)
chr2 (1-152)||(40233296-40233447)
chr2 (1-107)||(16829676-16829782)
chr2 (1-107)||(16891699-16891805)
chr2 (1-155)||(28882011-28882165)
chr2 (70-155)||(12655408-12655493)
chr2 (70-155)||(20837784-20837869)
chr2 (70-155)||(23128856-23128941)
chr2 (193-225)||(27392964-27392996)
chr2 (1-152)||(19416792-19416943)
chr2 (1-152)||(27777004-27777155)
chr2 (1-152)||(27816771-27816922)
chr2 (1-152)||(31876078-31876229)
chr2 (1-152)||(34861477-34861628)
chr2 (1-152)||(37686202-37686353)
chr2 (1-152)||(37701467-37701618)
chr2 (1-155)||(34286151-34286305)
chr2 (1-155)||(34291211-34291365)
chr2 (1-107)||(39889859-39889965)
chr2 (67-152)||(39052121-39052206)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-225)||(16208256-16208480)
chr1 (1-172)||(20460908-20461079)
chr1 (28-225)||(20340560-20340760)
chr1 (1-154)||(41793610-41793763)
chr1 (1-152)||(28584781-28584932)
chr1 (1-152)||(10962470-10962621)
chr1 (1-107)||(51638018-51638124)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (1-224)||(20160502-20160728)
chr6 (1-224)||(22172103-22172329)
chr6 (28-225)||(28162485-28162685)
chr6 (1-225)||(22477441-22477671)
chr6 (28-225)||(8892478-8892678)
chr6 (28-225)||(13522241-13522441)
chr6 (28-225)||(33374424-33374624)
chr6 (1-155)||(26918178-26918332)
chr6 (28-225)||(8903713-8903913)
chr6 (1-152)||(3695861-3696012)
chr6 (1-152)||(34463608-34463759)
chr6 (1-155)||(26999871-27000025)
chr6 (1-107)||(30558308-30558414)
chr6 (1-194)||(4525087-4525280)
chr6 (1-152)||(16673925-16674076)
chr6 (1-155)||(26988799-26988953)
chr6 (70-155)||(13299195-13299280)
chr6 (70-155)||(15424561-15424646)
chr6 (70-155)||(16749721-16749806)
chr6 (118-155)||(22935121-22935158)
chr6 (118-155)||(23857566-23857603)
chr6 (67-155)||(29549342-29549430)
chr6 (1-152)||(16944274-16944425)
chr6 (1-152)||(29572811-29572962)
chr6 (1-155)||(24304862-24305016)
chr6 (1-107)||(26777919-26778025)
chr6 (1-107)||(27007510-27007616)
chr6 (70-155)||(24863584-24863669)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-225)||(16626772-16626999)
chr3 (1-225)||(18530159-18530380)
chr3 (1-155)||(7996324-7996478)
chr3 (1-155)||(10642832-10642986)
chr3 (28-225)||(17994050-17994250)
chr3 (1-152)||(28116302-28116453)
chr3 (1-152)||(47023215-47023366)
chr3 (28-225)||(4625736-4625936)
chr3 (1-152)||(11110706-11110857)
chr3 (1-152)||(51781773-51781924)
chr3 (1-152)||(51796862-51797013)
chr3 (1-155)||(4721393-4721547)
chr3 (1-155)||(7072974-7073128)
chr3 (28-225)||(5652179-5652379)
chr3 (1-152)||(20577207-20577358)
chr3 (1-152)||(29665330-29665481)
chr3 (1-152)||(36997434-36997585)
chr3 (1-155)||(4796995-4797149)
chr3 (28-146)||(5713016-5713134)
chr3 (28-146)||(5723926-5724044)
chr3 (28-146)||(5757433-5757551)
chr3 (28-146)||(5768324-5768442)
chr3 (1-155)||(6192078-6192232)
chr3 (1-107)||(17985346-17985452)
chr3 (1-155)||(35880528-35880682)
chr3 (1-194)||(8211503-8211696)
chr3 (67-152)||(48465743-48465828)
chr3 (1-152)||(5013474-5013625)
chr3 (1-152)||(18224953-18225104)
chr3 (1-107)||(5466747-5466853)
chr3 (1-155)||(15741424-15741578)
chr3 (1-107)||(22871264-22871370)
chr3 (1-107)||(22886323-22886429)
chr3 (70-155)||(8295806-8295891)
chr3 (67-155)||(4893041-4893129)
chr3 (67-155)||(18277394-18277482)
chr3 (67-155)||(18292695-18292783)
chr3 (67-155)||(18307996-18308084)
chr3 (67-155)||(32438985-32439073)
chr3 (1-152)||(24327921-24328072)
chr3 (1-107)||(6542864-6542970)
chr3 (70-107)||(29149145-29149182)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-225)||(16450109-16450336)
chr7 (1-225)||(16041128-16041355)
chr7 (28-225)||(31088575-31088775)
chr7 (28-225)||(45733292-45733492)
chr7 (1-152)||(3445096-3445247)
chr7 (1-152)||(5147530-5147681)
chr7 (1-155)||(5127794-5127948)
chr7 (1-155)||(16503567-16503721)
chr7 (1-155)||(16518603-16518757)
chr7 (1-152)||(11441362-11441513)
chr7 (1-152)||(45387145-45387296)
chr7 (67-152)||(26435125-26435210)
chr7 (1-185)||(2154375-2154559)
chr7 (1-155)||(4145310-4145464)
chr7 (67-152)||(26485934-26486019)
chr7 (67-152)||(26538063-26538148)
chr7 (67-155)||(5159390-5159478)
chr7 (1-152)||(9618453-9618604)
chr7 (1-152)||(24592731-24592882)
chr7 (1-152)||(26275284-26275435)
chr7 (1-152)||(26320059-26320210)
chr7 (1-155)||(11424963-11425117)
chr7 (70-155)||(10917052-10917137)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (28-225)||(2883-3083)
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (5-225)||(22888287-22888510)
chr5 (1-225)||(23892016-23892246)
chr5 (28-225)||(13184770-13184970)
chr5 (28-225)||(13440616-13440816)
chr5 (28-225)||(33877087-33877287)
chr5 (1-152)||(8665676-8665827)
chr5 (70-224)||(24969903-24970057)
chr5 (28-225)||(11325634-11325834)
chr5 (1-152)||(18500949-18501100)
chr5 (1-152)||(30168279-30168430)
chr5 (67-225)||(25198908-25199069)
chr5 (7-152)||(43078065-43078210)
chr5 (8-152)||(31431245-31431389)
chr5 (1-107)||(18375658-18375764)
chr5 (1-155)||(22999312-22999466)
chr5 (1-107)||(24681247-24681353)
chr5 (1-107)||(24723774-24723880)
chr5 (1-107)||(33516166-33516272)
chr5 (1-155)||(33777297-33777451)
chr5 (70-155)||(9548741-9548826)
chr5 (1-152)||(30151828-30151979)
chr5 (67-198)||(33292404-33292535)
chr5 (1-152)||(37754778-37754929)
chr5 (1-152)||(40473753-40473904)
chr5 (73-155)||(11549236-11549318)
chr5 (1-155)||(23718186-23718340)
chr5 (1-155)||(23752648-23752802)
chr5 (1-152)||(3789336-3789487)
chr5 (1-152)||(5637720-5637871)
chr5 (1-152)||(9317261-9317412)
chr5 (1-152)||(12131965-12132116)
chr5 (1-152)||(15759058-15759209)
chr5 (1-152)||(26480202-26480353)
chr5 (1-152)||(29967267-29967418)
chr5 (1-152)||(30029225-30029376)
chr5 (1-152)||(31826620-31826771)
chr5 (1-152)||(37771200-37771351)
chr5 (1-155)||(15658958-15659112)
chr5 (70-107)||(28649105-28649142)
chr5 (70-155)||(30934515-30934600)
chr5 (71-152)||(41674589-41674670)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-172)||(20213-20384)
scaffold0124 (70-155)||(30323-30408)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-155)||(431-585)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-107)||(15279-15385)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (70-155)||(27162-27247)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-152)||(37-188)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-152)||(26506-26657)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (70-155)||(47286-47371)
scaffold0089 (118-155)||(40370-40407)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (7-146)||(5796-5936)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-152)||(7543-7694)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (8-155)||(8040-8187)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (187-225)||(253-291)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22081286 - 22081062
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22081286 caatccatggctactgttgcccccatcaatgctgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 22081187  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22081186 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagcaacaaac 22081087  T
Q  201 cagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22081086 cagacctacctttcctccgatacca 22081062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 44562932 - 44563132
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  44562932 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 44563028  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||   | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  44563029 aacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 44563128  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  44563129 acca 44563132  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 9354453 - 9354653
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  9354453 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 9354549  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  9354550 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 9354649  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  9354650 acca 9354653  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19659423 - 19659223
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  19659423 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 19659327  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || ||||| || |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  19659326 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 19659227  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  19659226 acca 19659223  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 19286266 - 19286459
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19286266 caatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 19286365  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 194  Q
    | ||||| ||   | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  19286366 atcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 19286459  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31490164 - 31490013
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31490164 caatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 31490065  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  31490064 atcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 31490013  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 19674239 - 19674390
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19674239 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 19674338  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | || || || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19674339 atcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19674390  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28362369 - 28362218
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28362369 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 28362270  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  28362269 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 28362218  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 19687971 - 19688053
Alignment:
Q  73 cagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19687971 cagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 19688053  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 16277424 - 16277509
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16277424 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 16277509  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27609250 - 27609165
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27609250 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 27609165  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 18710453 - 18710541
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18710453 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctca 18710541  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19208774 - 19208623
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19208774 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 19208675  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19208674 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19208623  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 33258524 - 33258675
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33258524 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 33258623  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  33258624 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33258675  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2137604 - 2137519
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2137604 tctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 2137519  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19518488 - 19518451
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19518488 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 19518451  T

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Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15391788 - 15391563
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgtt-gcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15391788 caatccatggctactgtttgcccccatcaatgttgctcagctacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttat 15391689  T
Q  100 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15391688 caccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggctcaacaacagcagcaacaaa 15391589  T
Q  200 ccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15391588 ccagacctacctttcctccgatacca 15391563  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14235980 - 14235750
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14235980 caatccatggccactgttacccctattaatgctgctcagttacctctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 14235881  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct------caacagcagcagca 194  Q
    | ||||| || | | |  ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||      ||||||||||| ||    
T  14235880 atcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaaca 14235781  T
Q  195 acaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  14235780 acaagctagacctacctttcctctgatacca 14235750  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15285380 - 15285153
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    || |  ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15285380 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatc 15285281  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | |||||||| | | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |   ||   ||||| |||||||||||    
T  15285280 atcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaaca 15285181  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  15285180 agctagacctacctttcctccgatacca 15285153  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 15227689 - 15227916
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  15227689 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatc 15227788  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagca 194  Q
    | || |||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||||||    
T  15227789 atcaatatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagca 15227885  T
Q  195 acaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15227886 acaagctagacctacctttcctccgatacca 15227916  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 1900076 - 1900303
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  1900076 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatc 1900175  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacag---cagcagca 194  Q
    | ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  | |||||||   || || ||    
T  1900176 atcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatca 1900272  T
Q  195 acaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1900273 acaagctagacctacctttcctccgatacca 1900303  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 5005686 - 5005837
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5005686 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 5005785  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5005786 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 5005837  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 30753558 - 30753709
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30753558 caatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 30753657  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  30753658 atcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30753709  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 21969517 - 21969671
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  21969517 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccgttttatc 21969616  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  21969617 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 21969671  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27163772 - 27163618
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27163772 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 27163673  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27163672 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 27163618  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33674265 - 33674114
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33674265 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccattttacc 33674166  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33674165 atcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 33674114  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 39850439 - 39850590
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  39850439 caatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 39850538  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  39850539 atcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 39850590  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24461030 - 24460830
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  24461030 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 24460934  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  24460933 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 24460834  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  24460833 acca 24460830  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 54833206 - 54833399
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54833206 caatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 54833305  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 194  Q
    | ||||| ||   | | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  54833306 atcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 54833399  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24592766 - 24592612
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24592766 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 24592667  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  24592666 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 24592612  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 17013885 - 17013970
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17013885 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 17013970  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 14098357 - 14098463
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14098357 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 14098456  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  14098457 atcagta 14098463  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31126973 - 31126867
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31126973 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 31126874  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  31126873 atcagta 31126867  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 14664903 - 14664988
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  14664903 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 14664988  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14763693 - 14763605
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14763693 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 14763605  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18801071 - 18800971
Alignment:
Q  7 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagt 106  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18801071 atggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagt 18800972  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  18800971 a 18800971  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 24112547 - 24112635
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24112547 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 24112635  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34189346 - 34189258
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34189346 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 34189258  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40106093 - 40105942
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40106093 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 40105994  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  40105993 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 40105942  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 152
Target Start/End: Original strand, 6569738 - 6569820
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6569738 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgc 6569820  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 19373143 - 19373183
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19373143 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 19373183  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21368 - 21592
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21368 caatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacctccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 21467  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaac 200  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21468 accagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaacagcagcaacaacaaac 21567  T
Q  201 cagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21568 cagacctacctttcctccgatacca 21592  T

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Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 27392797 - 27392961
Alignment:
Q  8 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27392797 tggctactgttgcccccatcgatgctgctcagctacctccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 27392896  T
Q  108 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27392897 tccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19456862 - 19456635
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19456862 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatc 19456763  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | |||||||| | | |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||||| || |||||||| |  |||   ||||| |||||||||||    
T  19456762 atcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaaca 19456663  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  19456662 agctagacctacctttcctccgatacca 19456635  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31891742 - 31891542
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  31891742 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 31891646  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  31891645 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 31891546  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  31891545 acca 31891542  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21703605 - 21703378
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  21703605 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatc 21703506  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagca 194  Q
    | ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| ||    
T  21703505 atcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatca 21703409  T
Q  195 acaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  21703408 acaagctagacctaccttccctccgatacca 21703378  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 27118515 - 27118714
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | | |   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  27118515 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 27118611  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  27118612 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgat 27118711  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 32049595 - 32049749
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32049595 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 32049694  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  32049695 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 32049749  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 34156838 - 34157038
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  34156838 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 34156934  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  34156935 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 34157034  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  34157035 acca 34157038  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34303717 - 34303517
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  34303717 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 34303621  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  34303620 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 34303521  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  34303520 acca 34303517  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11635633 - 11635482
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635633 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 11635534  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11635533 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 11635482  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11641822 - 11641671
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641822 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 11641723  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11641722 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 11641671  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 3784481 - 3784681
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  3784481 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 3784577  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    ||| |||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  3784578 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgat 3784677  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  3784678 acca 3784681  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 16163426 - 16163626
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  16163426 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 16163522  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  16163523 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 16163622  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  16163623 acca 16163626  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 261209 - 261058
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  261209 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 261110  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  261109 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 261058  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 12586598 - 12586749
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12586598 caatccatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 12586697  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  12586698 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 12586749  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21677626 - 21677475
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21677626 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 21677527  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21677526 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 21677475  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34279246 - 34279400
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  34279246 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttacc 34279345  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  34279346 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 34279400  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 13936988 - 13936837
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  13936988 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttacc 13936889  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13936888 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 13936837  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12717049 - 12716943
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12717049 caatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 12716950  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  12716949 atcagta 12716943  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27434888 - 27434734
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27434888 caatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatc 27434789  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| ||     | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  27434788 atcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 27434734  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 27803489 - 27803640
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27803489 caatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 27803588  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27803589 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27803640  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 37925290 - 37925441
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37925290 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 37925389  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  37925390 atcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37925441  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 40233296 - 40233447
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  40233296 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 40233395  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  40233396 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 40233447  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16829782 - 16829676
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16829782 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 16829683  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  16829682 atcagta 16829676  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 16891699 - 16891805
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16891699 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 16891798  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  16891799 atcagta 16891805  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 28882011 - 28882165
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28882011 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 28882110  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  28882111 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 28882165  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 12655408 - 12655493
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  12655408 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 12655493  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 20837784 - 20837869
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  20837784 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 20837869  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23128941 - 23128856
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23128941 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23128856  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 225
Target Start/End: Original strand, 27392964 - 27392996
Alignment:
Q  193 caacaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392964 caacaaaccagacctacctttcctccgatacca 27392996  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19416943 - 19416792
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19416943 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 19416844  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19416843 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 19416792  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 27777004 - 27777155
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27777004 caatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 27777103  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27777104 atcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27777155  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 27816771 - 27816922
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27816771 caatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 27816870  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  27816871 atcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 27816922  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 31876078 - 31876229
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31876078 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 31876177  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31876178 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 31876229  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 34861477 - 34861628
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34861477 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 34861576  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  34861577 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 34861628  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37686353 - 37686202
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37686353 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 37686254  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37686253 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37686202  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37701618 - 37701467
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37701618 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 37701519  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37701518 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 37701467  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34286151 - 34286305
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  34286151 caatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttacc 34286250  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34286251 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctca 34286305  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 34291211 - 34291365
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  34291211 caatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttacc 34291310  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34291311 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctca 34291365  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 39889859 - 39889965
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39889859 caatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 39889958  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  39889959 atcagta 39889965  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39052206 - 39052121
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  39052206 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgcaattgc 39052121  T

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Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16208480 - 16208256
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16208480 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 16208381  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaac 200  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| || |||||||| |  | |||||| || || |||||| |    
T  16208380 accagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacatcaacaagc 16208281  T
Q  201 cagacctacctttcctccgatacca 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  16208280 tagacctacctttcctccgatacca 16208256  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 20460908 - 20461079
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20460908 caatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatc 20461007  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 172  Q
    | || ||||| | | |  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  20461008 atcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20340760 - 20340560
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  20340760 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 20340664  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  20340663 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 20340564  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  20340563 acca 20340560  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41793763 - 41793610
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41793763 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatc 41793664  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctc 154  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  41793663 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctc 41793610  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 28584781 - 28584932
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| | ||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28584781 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 28584880  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  28584881 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 28584932  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 10962470 - 10962621
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10962470 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 10962569  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  10962570 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 10962621  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 51638018 - 51638124
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51638018 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 51638117  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  51638118 atcagta 51638124  T

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Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20160502 - 20160728
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||     || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
T  20160502 caatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttacc 20160601  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||   ||||| || ||||||||    
T  20160602 atcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaaca 20160701  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacc 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20160702 aactagacctacctttcctccgatacc 20160728  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22172329 - 22172103
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| ||||| | ||     || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |    
T  22172329 caatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccatacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttacc 22172230  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||   ||||| || ||||||||    
T  22172229 atcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaaca 22172130  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacc 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22172129 aactagacctacctttcctccgatacc 22172103  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 28162485 - 28162685
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||| |    
T  28162485 aatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggac 28162581  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  28162582 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgat 28162681  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  28162682 acca 28162685  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22477671 - 22477441
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| | | || | |||   ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22477671 caatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatc 22477572  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca------gcagca 191  Q
    |  |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | | || ||||||       || ||    
T  22477571 attagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaaca 22477475  T
Q  192 gcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  22477474 gcaacaagctagacctacctttcctctgatacca 22477441  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8892678 - 8892478
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  8892678 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 8892582  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  8892581 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8892482  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  8892481 acca 8892478  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13522441 - 13522241
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13522441 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13522345  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13522344 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13522245  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  13522244 acca 13522241  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33374624 - 33374424
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  33374624 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 33374528  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  33374527 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33374428  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  33374427 acca 33374424  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 26918178 - 26918332
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26918178 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 26918277  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26918278 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 26918332  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8903913 - 8903713
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||| |   |||||||   ||||    
T  8903913 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcg---ggtc 8903817  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  8903816 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 8903717  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  8903716 acca 8903713  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 3695861 - 3696012
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3695861 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 3695960  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3695961 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 3696012  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 34463759 - 34463608
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34463759 caatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 34463660  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34463659 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 34463608  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 26999871 - 27000025
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26999871 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 26999970  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  26999971 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 27000025  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30558414 - 30558308
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30558414 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30558315  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  30558314 atcagta 30558308  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 4525087 - 4525280
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4525087 caatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 4525186  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 194  Q
    | ||||||||     | || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  4525187 atcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 4525280  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 16673925 - 16674076
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  16673925 caatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 16674024  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16674025 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 16674076  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 26988799 - 26988953
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26988799 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 26988898  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  26988899 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 26988953  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13299280 - 13299195
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  13299280 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 13299195  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15424646 - 15424561
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15424646 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15424561  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 16749721 - 16749806
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  16749721 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 16749806  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22935158 - 22935121
Alignment:
Q  118 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22935158 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctca 22935121  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23857603 - 23857566
Alignment:
Q  118 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23857603 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctca 23857566  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 29549342 - 29549430
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  29549342 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 29549430  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16944425 - 16944274
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16944425 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 16944326  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  16944325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 16944274  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 29572811 - 29572962
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29572811 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 29572910  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  29572911 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29572962  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24305016 - 24304862
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24305016 caatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatc 24304917  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  24304916 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 24304862  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26778025 - 26777919
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| | || ||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26778025 caatcaatggctactgttgcacctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 26777926  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  26777925 atcagta 26777919  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 27007510 - 27007616
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27007510 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatc 27007609  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  27007610 atcagta 27007616  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 24863584 - 24863669
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | | | ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  24863584 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgcaattgctca 24863669  T

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Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16626999 - 16626772
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | |||    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  16626999 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatc 16626900  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | |||||||| | | |  |||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| |  |||   ||||| |||||||||||    
T  16626899 atcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaaca 16626800  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  16626799 agctagacctacctttcctccgatacca 16626772  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18530159 - 18530380
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||  | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18530159 caatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatc 18530258  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagcaacaaac 200  Q
    | |||||||| | | |  ||||||||||||| || ||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  ||||||   |||||||||||| |    
T  18530259 atcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaa---cagcagcaacaagc 18530355  T
Q  201 cagacctacctttcctccgatacca 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  18530356 tagacctacctttcctccgatacca 18530380  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 7996324 - 7996478
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7996324 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 7996423  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7996424 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 7996478  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10642832 - 10642986
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10642832 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 10642931  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10642932 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 10642986  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17994250 - 17994050
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  17994250 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 17994154  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  17994153 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 17994054  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  17994053 acca 17994050  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28116453 - 28116302
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28116453 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 28116354  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28116353 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 28116302  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 47023215 - 47023366
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47023215 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 47023314  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47023315 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 47023366  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 4625736 - 4625936
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  4625736 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 4625832  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  4625833 aacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 4625932  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  4625933 acca 4625936  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11110857 - 11110706
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11110857 caatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 11110758  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11110757 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11110706  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 51781773 - 51781924
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  51781773 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 51781872  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  51781873 atcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 51781924  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 51796862 - 51797013
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  51796862 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 51796961  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  51796962 atcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 51797013  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 4721393 - 4721547
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  4721393 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatc 4721492  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4721493 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 4721547  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 7072974 - 7073128
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  7072974 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttacc 7073073  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7073074 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 7073128  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 5652179 - 5652379
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||    || ||||   ||||    
T  5652179 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcg---ggtc 5652275  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  5652276 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 5652375  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  5652376 acca 5652379  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20577358 - 20577207
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20577358 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttacc 20577259  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  20577258 atcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 20577207  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29665481 - 29665330
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29665481 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 29665382  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  29665381 atcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29665330  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 36997585 - 36997434
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36997585 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 36997486  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | || || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36997485 atcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 36997434  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4797149 - 4796995
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4797149 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 4797050  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4797049 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 4796995  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 5713016 - 5713134
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5713016 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5713115  T
Q  128 ctcaggtacccgtcaatgc 146  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5713116 ctcaagtgcccgtcaatgc 5713134  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Original strand, 5723926 - 5724044
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5723926 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5724025  T
Q  128 ctcaggtacccgtcaatgc 146  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5724026 ctcaagtgcccgtcaatgc 5724044  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5757551 - 5757433
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5757551 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5757452  T
Q  128 ctcaggtacccgtcaatgc 146  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5757451 ctcaagtgcccgtcaatgc 5757433  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5768442 - 5768324
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | ||||||||||    
T  5768442 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5768343  T
Q  128 ctcaggtacccgtcaatgc 146  Q
    |||| || |||||||||||    
T  5768342 ctcaagtgcccgtcaatgc 5768324  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 6192078 - 6192232
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  6192078 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccattttatc 6192177  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |  |||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6192178 attagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 6192232  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17985452 - 17985346
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17985452 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 17985353  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  17985352 atcagta 17985346  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 35880528 - 35880682
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35880528 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 35880627  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  35880628 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 35880682  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 8211503 - 8211696
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8211503 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 8211602  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacagcagcagca 194  Q
    | ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  |||| || || ||||  | |||||||||||||||    
T  8211603 atcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagca 8211696  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 48465743 - 48465828
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  48465743 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 48465828  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 5013474 - 5013625
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5013474 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 5013573  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  5013574 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 5013625  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18224953 - 18225104
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18224953 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 18225052  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  18225053 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 18225104  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 5466747 - 5466853
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5466747 caatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatc 5466846  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  5466847 atcagta 5466853  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15741578 - 15741424
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15741578 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 15741479  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15741478 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15741424  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22871370 - 22871264
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22871370 caatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 22871271  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  22871270 atcagta 22871264  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22886429 - 22886323
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22886429 caatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 22886330  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  22886329 atcagta 22886323  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 8295806 - 8295891
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  8295806 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctca 8295891  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 4893041 - 4893129
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4893041 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 4893129  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18277482 - 18277394
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18277482 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18277394  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18292783 - 18292695
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18292783 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18292695  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18308084 - 18307996
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18308084 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 18307996  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 32438985 - 32439073
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  32438985 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 32439073  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 24327921 - 24328072
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24327921 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 24328020  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  24328021 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 24328072  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 6542970 - 6542864
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6542970 caatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 6542871  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  6542870 atcagta 6542864  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 29149182 - 29149145
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29149182 tctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagta 29149145  T

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Target: chr7 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16450336 - 16450109
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16450336 caatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatc 16450237  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaacag---cagcagca 194  Q
    | ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||| | |||||| | | ||||||| | || |||||||| |  |||||||||   ||||||||    
T  16450236 atcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagca 16450140  T
Q  195 acaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16450139 acaagctagacctacctttcctccgatacca 16450109  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16041128 - 16041355
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16041128 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatc 16041227  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaaca 197  Q
    | ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||    
T  16041228 atcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaaca 16041327  T
Q  198 aaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16041328 agctagacctaccttccctccgatacca 16041355  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31088775 - 31088575
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  31088775 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 31088679  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  31088678 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 31088579  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  31088578 acca 31088575  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 45733292 - 45733492
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  45733292 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 45733388  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  45733389 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 45733488  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  45733489 acca 45733492  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 3445096 - 3445247
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  3445096 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 3445195  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3445196 atcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 3445247  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5147681 - 5147530
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||  |||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5147681 caatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 5147582  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5147581 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 5147530  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 5127794 - 5127948
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5127794 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 5127893  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | |||||||| |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5127894 atcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 5127948  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16503721 - 16503567
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16503721 caatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatc 16503622  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16503621 atcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctca 16503567  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16518757 - 16518603
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||   ||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16518757 caatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatc 16518658  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16518657 atcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctca 16518603  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 11441362 - 11441513
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11441362 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 11441461  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  11441462 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11441513  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 45387145 - 45387296
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45387145 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 45387244  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  45387245 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 45387296  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435210
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 26435210  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 2154375 - 2154559
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2154375 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 2154474  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca 185  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  2154475 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggttcaaca 2154559  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4145464 - 4145310
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4145464 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 4145365  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4145364 atcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4145310  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26486019 - 26485934
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26486019 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26485934  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26538148 - 26538063
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  26538148 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26538063  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 5159390 - 5159478
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5159390 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctca 5159478  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 9618453 - 9618604
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9618453 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 9618552  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  9618553 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 9618604  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24592882 - 24592731
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24592882 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 24592783  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  24592782 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 24592731  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26275435 - 26275284
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26275435 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 26275336  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26275335 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26275284  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26320210 - 26320059
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26320210 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 26320111  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26320110 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26320059  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11425117 - 11424963
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  11425117 caatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttacc 11425018  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11425017 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 11424963  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10917052
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |   | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctca 10917052  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2883
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  3083 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 2987  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| || |||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  2986 aacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgat 2887  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  2886 acca 2883  T

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Target: chr5 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888510
Alignment:
Q  5 ccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcacca 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
Q  105 gtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaa 198  Q
    ||||||   |||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||| || |||||||| |  | |   ||||| ||||| ||||||    
T  22888387 gtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaa 22888483  T
Q  199 accagacctacctttcctccgatacca 225  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||    
T  22888484 gctagacctaccttccctccgatacca 22888510  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23892016 - 23892246
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23892016 caatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatc 23892115  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggct------caacagcagca 191  Q
    | ||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | || |      ||||| || ||    
T  23892116 atcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaaca 23892212  T
Q  192 gcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23892213 tcaacaagctagacctacctttcctccgatacca 23892246  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13184970 - 13184770
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13184970 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13184874  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13184873 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13184774  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  13184773 acca 13184770  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13440816 - 13440616
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  13440816 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 13440720  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  13440719 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 13440620  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  13440619 acca 13440616  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 33877087 - 33877287
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   ||||||    
T  33877087 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtc 33877183  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  33877184 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 33877283  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  33877284 acca 33877287  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8665827 - 8665676
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8665827 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 8665728  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8665727 atcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 8665676  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 24969903 - 24970057
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaac 169  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||     | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  | ||||    
T  24969903 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 24970002  T
Q  170 agccgctggctcaacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 224  Q
    ||| || || |||||| || || |||||| | |||||||| || |||||||||||    
T  24970003 agctgccggttcaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgatacc 24970057  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 11325634 - 11325834
Alignment:
Q  28 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtc 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||    ||| |    
T  11325634 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---tgggac 11325730  T
Q  125 aacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagccgctggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||| || |||||||| |  ||||||||    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||    
T  11325731 aacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgat 11325830  T
Q  222 acca 225  Q
    ||||    
T  11325831 acca 11325834  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18501100 - 18500949
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18501100 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatc 18501001  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18501000 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 18500949  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 30168279 - 30168430
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30168279 caatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30168378  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  30168379 atcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30168430  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 25198908 - 25199069
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatac 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||||||||||||||||| ||| || ||| | | ||||||||| |    
T  25198908 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtactcgttaacgccgtcgttcagcaaatgc 25199004  T
Q  164 agcaacagccgctggct---caacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    | |||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  25199005 aacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgatacca 25199069  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 43078065 - 43078210
Alignment:
Q  7 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagt 106  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | || |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43078065 atggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagt 43078164  T
Q  107 atccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  43078165 accctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 43078210  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Original strand, 31431245 - 31431389
Alignment:
Q  8 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31431245 tggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 31431344  T
Q  108 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
     || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  31431345 ccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 31431389  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18375764 - 18375658
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18375764 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 18375665  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  18375664 atcagta 18375658  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22999466 - 22999312
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22999466 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 22999367  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  22999366 atcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 22999312  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24681247 - 24681353
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24681247 caatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 24681346  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  24681347 atcagta 24681353  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 24723774 - 24723880
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24723774 caatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatc 24723873  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  24723874 atcagta 24723880  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 33516166 - 33516272
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33516166 caatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 33516265  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  33516266 atcagta 33516272  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 33777297 - 33777451
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33777297 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 33777396  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  33777397 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 33777451  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548741
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 9548741  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 30151828 - 30151979
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30151828 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30151927  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  30151928 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 30151979  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Original strand, 33292404 - 33292535
Alignment:
Q  67 tactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagc 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||     | ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  | || |    
T  33292404 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 33292503  T
Q  167 aacagccgctggctcaacagcagcagcaacaa 198  Q
    | || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  33292504 atcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaa 33292535  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 37754778 - 37754929
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37754778 caatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 37754877  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37754878 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37754929  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40473904 - 40473753
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  40473904 caatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttacc 40473805  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| || |   ||||||| || ||||| || |||||||| || |||||    
T  40473804 atcagtaccccctgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgc 40473753  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Original strand, 11549236 - 11549318
Alignment:
Q  73 cagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11549236 cagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 11549318  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23718340 - 23718186
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23718340 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 23718241  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23718240 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23718186  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23752802 - 23752648
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23752802 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 23752703  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23752702 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 23752648  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 3789336 - 3789487
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3789336 caatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 3789435  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     | ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  3789436 atcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 3789487  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 5637720 - 5637871
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5637720 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 5637819  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  5637820 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 5637871  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 9317261 - 9317412
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9317261 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 9317360  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  9317361 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 9317412  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 12131965 - 12132116
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12131965 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 12132064  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12132065 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 12132116  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15759209 - 15759058
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15759209 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 15759110  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  15759109 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 15759058  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 26480202 - 26480353
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26480202 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 26480301  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26480302 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26480353  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29967418 - 29967267
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29967418 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 29967319  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  29967318 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29967267  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 30029225 - 30029376
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30029225 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30029324  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  30029325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 30029376  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31826771 - 31826620
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31826771 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 31826672  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31826671 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 31826620  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37771351 - 37771200
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | ||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  37771351 caatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 37771252  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37771251 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37771200  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15659112 - 15658958
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  ||  |||  || ||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  15659112 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccgttttacc 15659013  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  15659012 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 15658958  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Original strand, 28649105 - 28649142
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28649105 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 28649142  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 30934515 - 30934600
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  30934515 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 30934600  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 71 - 152
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674670
Alignment:
Q  71 ctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |   | ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 41674670  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 20213 - 20384
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  20213 caatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatc 20312  T
Q  101 accagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatacagcaacagc 172  Q
    | ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| || |||||||    
T  20313 atcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 20384  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 30323 - 30408
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  30323 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 30408  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 585 - 431
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  585 caatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatc 486  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    | ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  485 atcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctca 431  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15385 - 15279
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15385 caatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 15286  T
Q  101 accagta 107  Q
    | |||||    
T  15285 atcagta 15279  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Original strand, 27162 - 27247
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | | | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  27162 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 27247  T

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Target: scaffold0496 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 37
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  188 caatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 89  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  88 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 37  T

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Target: scaffold0144 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26657 - 26506
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26657 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 26558  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| |||    ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26557 atcagtacccgttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26506  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 47286
Alignment:
Q  70 tctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |   | |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 47286  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40407 - 40370
Alignment:
Q  118 ccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40407 ccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaattgctca 40370  T

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Target: scaffold0415 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 5796 - 5936
Alignment:
Q  7 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccacc-attttatcaccag 105  Q
    |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  5796 atggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtttttatcatcag 5895  T
Q  106 tatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 146  Q
    || || |   | |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5896 taccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5936  T

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Target: scaffold0350 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7694 - 7543
Alignment:
Q  1 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7694 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 7595  T
Q  101 accagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 152  Q
    | ||||| ||     ||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  7594 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 7543  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 8040 - 8187
Alignment:
Q  8 tggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagta 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8040 tggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 8139  T
Q  108 tccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 155  Q
    |||     | || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8140 tcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8187  T

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Target: scaffold0558 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 291 - 253
Alignment:
Q  187 cagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacca 225  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  291 cagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacca 253  T

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