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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7322_low_2 (Length: 567)

Name: NF7322_low_2
Description: NF7322
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7322_low_2
NF7322_low_2
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (20-560)||(11755777-11756302)
chr7 (20-555)||(1636913-1637449)
chr7 (20-555)||(44673008-44673544)
chr7 (20-555)||(1633668-1634204)
chr7 (38-555)||(5189695-5190212)
chr7 (146-560)||(21659146-21659561)
chr7 (312-555)||(20436355-20436600)
chr7 (20-188)||(20436630-20436798)
chr7 (96-447)||(7570051-7570402)
chr7 (96-447)||(7576466-7576817)
chr7 (295-447)||(18970843-18970996)
chr7 (96-186)||(18973966-18974056)
chr7 (419-497)||(22721866-22721944)
chr7 (454-488)||(23611526-23611560)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (20-560)||(12489070-12489611)
chr6 (20-560)||(15394133-15394673)
chr6 (38-555)||(964356-964874)
chr6 (97-555)||(27315476-27315939)
chr6 (212-555)||(20110192-20110537)
chr6 (20-286)||(5190401-5190666)
chr6 (96-447)||(11184125-11184470)
chr6 (495-555)||(16567266-16567326)
chr6 (22-157)||(17733473-17733608)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (20-555)||(199845-200380)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (20-555)||(14616997-14617532)
chr4 (25-553)||(12194063-12194592)
chr4 (20-560)||(22755231-22755777)
chr4 (22-555)||(48961699-48962221)
chr4 (146-550)||(54899406-54899811)
chr4 (96-555)||(22884377-22884825)
chr4 (96-555)||(22936041-22936489)
chr4 (171-555)||(12705582-12705967)
chr4 (139-347)||(34855736-34855942)
chr4 (139-387)||(21614410-21614657)
chr4 (428-484)||(5692567-5692623)
chr4 (428-484)||(5693335-5693391)
chr4 (22-72)||(25186135-25186185)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (20-553)||(45532564-45533100)
chr1 (20-555)||(28138825-28139361)
chr1 (20-555)||(28142076-28142612)
chr1 (20-555)||(14159278-14159814)
chr1 (20-389)||(17761627-17761997)
chr1 (38-555)||(25663088-25663604)
chr1 (235-520)||(1941373-1941659)
chr1 (414-553)||(17761484-17761624)
chr1 (166-347)||(8434961-8435142)
chr1 (109-279)||(28957022-28957191)
chr1 (329-447)||(21914206-21914325)
chr1 (139-250)||(26639628-26639737)
chr1 (148-259)||(42590923-42591033)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (20-553)||(7289639-7290174)
chr5 (20-553)||(9420926-9421461)
chr5 (20-555)||(22035456-22035992)
chr5 (20-555)||(22038682-22039218)
chr5 (20-555)||(43103876-43104412)
chr5 (77-555)||(36700061-36700538)
chr5 (139-447)||(20473694-20474002)
chr5 (109-447)||(31375328-31375666)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (20-553)||(33578248-33578783)
chr8 (38-555)||(5951723-5952241)
chr8 (38-555)||(33382957-33383475)
chr8 (38-555)||(2847820-2848338)
chr8 (200-560)||(15928815-15929177)
chr8 (146-421)||(29354012-29354287)
chr8 (139-447)||(27805703-27806011)
chr8 (96-188)||(8855973-8856065)
chr8 (96-188)||(8857446-8857538)
chr8 (452-550)||(8856358-8856456)
chr8 (452-550)||(8857831-8857929)
chr8 (139-387)||(12104588-12104835)
chr8 (441-505)||(29353950-29354014)
chr8 (456-488)||(3296846-3296878)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (24-553)||(27195871-27196403)
chr2 (20-553)||(4696874-4697409)
chr2 (20-553)||(27498863-27499398)
chr2 (20-555)||(35079769-35080305)
chr2 (20-555)||(35076511-35077047)
chr2 (237-553)||(29445619-29445936)
chr2 (146-555)||(6277274-6277677)
chr2 (20-187)||(29445430-29445597)
chr2 (96-447)||(3252029-3252378)
chr2 (280-447)||(16880871-16881039)
chr2 (280-447)||(17038561-17038729)
chr2 (96-279)||(23258661-23258843)
chr2 (493-553)||(29434151-29434211)
chr2 (20-124)||(16881065-16881169)
chr2 (20-124)||(17038755-17038859)
chr2 (275-324)||(16881263-16881312)
chr2 (275-324)||(17038953-17039002)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (20-553)||(9237183-9237721)
chr3 (20-553)||(6765238-6765773)
chr3 (20-553)||(6731471-6732006)
chr3 (20-553)||(53189369-53189904)
chr3 (20-555)||(10558023-10558559)
chr3 (20-555)||(19193337-19193874)
chr3 (106-553)||(3164903-3165351)
chr3 (109-447)||(23048685-23049023)
chr3 (24-242)||(33672078-33672297)
chr3 (109-447)||(50096387-50096725)
chr3 (162-552)||(28716886-28717276)
chr3 (109-347)||(17544878-17545115)
chr3 (96-445)||(43683217-43683564)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (22-488)||(156762-157231)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (25-555)||(35433-35968)
scaffold0146 (493-555)||(29425-29487)
scaffold0146 (38-115)||(37595-37672)
[»] scaffold2047 (2 HSPs)
scaffold2047 (200-388)||(890-1078)
scaffold2047 (41-130)||(770-859)
[»] scaffold1206 (1 HSPs)
scaffold1206 (366-555)||(1764-1955)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (417-549)||(41500-41632)
scaffold0050 (141-188)||(38779-38826)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Original strand, 11755777 - 11756302
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11755777 attcgattcatctgcacttcactcattagcattctgtttcctacgtctacgaatatcacaa-gtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 11755875  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11755876 ttgatcctaagtccgcttatctaatcct--------------ttaggtgaacctataatcaccaaaggtatttaagctcgttaattcaattatcacaacc 11755961  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11755962 taacaacgctctatccctagattgtccgttagattgaacaacataaacatgtctgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 11756061  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagc 419  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756062 atattgggtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaactaaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagc 11756161  T
Q  420 tagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattga 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756162 tagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaatgataaagaagaattcattacatgtaattga 11756261  T
Q  520 taaccggctatgagttttgattgtctcccaccttcttctca 560  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11756262 taaccggctatgagttttgatggtctcccaccttctgctca 11756302  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 1636913 - 1637449
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1636913 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 1637012  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  1637013 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 1637111  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  1637112 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 1637211  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  1637212 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 1637311  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  1637312 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 1637411  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1637412 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 1637449  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 44673008 - 44673544
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  44673008 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctatttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 44673107  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  44673108 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 44673206  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||  ||||||||||  |||| |||||||||    
T  44673207 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcggtagtcatatatactctaaaatcaatt 44673306  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  44673307 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 44673406  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  44673407 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 44673506  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  44673507 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 44673544  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 1633668 - 1634204
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1633668 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacatgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 1633767  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  1633768 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccttaatcccttcggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 1633866  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  1633867 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 1633966  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  1633967 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 1634066  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  1634067 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 1634166  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1634167 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 1634204  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Original strand, 5189695 - 5190212
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||| || |||    
T  5189695 tcactcattagcaacctgtttcttaagtttacgaatgctataaagttaacgacaaattaacaaaatagct-aggtcaatcccttgatcctaagccctctt 5189793  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5189794 ttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacgctccatccct 5189892  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||  ||||||| | |   ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  5189893 agattgtccgttatattgaacagtatagatatgtcagagttacatgttggtgtcagcagtcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcat 5189992  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  5189993 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctc 5190092  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  5190093 ttgacctagtcacaaaagatctaactactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagtt 5190192  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5190193 ttgatggtctcccaccttct 5190212  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 560
Target Start/End: Original strand, 21659146 - 21659561
Alignment:
Q  146 ataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtc 245  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||| || |||  | |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21659146 ataagtccctaatcactt-ggtgaacctataatagtaaaaggt-ttgaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaactctctatccctagattgta 21659243  T
Q  246 cgttagatt-gaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggca 344  Q
     |||||||| |||||  ||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||  ||||| |||| || ||||||||||||||| |||    
T  21659244 tgttagatttgaacaatataaatatgtcagagttacacgttagtgtcaatagtcatatacactctagaatcagttatgttgagtcagaatcataaaagca 21659343  T
Q  345 ttaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacct 442  Q
    ||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || |||| | || ||||| || |||||||     | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  21659344 ttaagaataatttatactgaataaactagaatgacaatcttaaaaattaagagttacaagttacattgtactaagctagaacagaatcatctcttgacct 21659443  T
Q  443 aatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattg 542  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  || |||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |    
T  21659444 aatcacaaaggatttagctactcgtggctaaagcacgaataactaatgtaaaggaaatattcattacatgaatttgacaaccggctatgagttttgatgg 21659543  T
Q  543 tctcccaccttcttctca 560  Q
     |||||||||||||||||    
T  21659544 cctcccaccttcttctca 21659561  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 312 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20436600 - 20436355
Alignment:
Q  312 aatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacata 410  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||     
T  20436600 aatcagttatattgggtcagaatcataaatgcattaagagtaatttatattgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaggttacatt 20436501  T
Q  411 agcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattac 509  Q
        |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||  |||||||||    
T  20436500 gtactgagctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaatagatttagctactcatggctaaagcacaaataactaatatgaaagaaagattcattac 20436401  T
Q  510 atgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||| ||||| |||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  20436400 atgaaattggtaactggataagagttttgatggtctcccaccttct 20436355  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20436798 - 20436630
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||  |||||  || |||||| || ||||||| ||||||    
T  20436798 attcgattcatctgctcatcactcattagcaaactgtttcttaagtctacgaatgctataaagtttacgacatattaacaaaatagcttaggtgaatccc 20436699  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt 188  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20436698 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt 20436630  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7570402 - 7570051
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  7570402 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactcagagccctcttctctgattataattccctaattccttaggtgaatctataaccatcaaaggt-tttaag 7570304  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | ||||||  |  |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | |||| ||||| | |||   ||||| |    
T  7570303 tccgttaattttagaatcacaacctaacaattttctatccctagatcatccgttaagttgaacaatataaataggtctgagttataagctggtgtcaaca 7570204  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcatta-agatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataa-acaata 393  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | || |||||| | |||||||| |  | | |||||||||| |   ||    
T  7570203 gtcctataatctctaagatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattacacat-aatttatactgaataaaatgaaataacattcataataattta 7570105  T
Q  394 gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||||| ||  |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7570104 gagttacatattacatgatcatgagctagaacagaatcatctatgacctaatca 7570051  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7576817 - 7576466
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  7576817 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactcagagccctcttctctgattataattccctaattccttaggtgaatctataaccatcaaaggt-tttaag 7576719  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | ||||||  |  |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||| | |||| ||||| | |||   ||||| |    
T  7576718 tccgttaattttagaatcacaacctaacaattttctatccctagatcatccgttaagttgaacaatataaataggtctgagttataagctggtgtcaaca 7576619  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcatta-agatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataa-acaata 393  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | || |||||| | |||||||| |  | | |||||||||| |   ||    
T  7576618 gtcctataatctctaagatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattacacat-aatttatactgaataaaatgaaataacattcataataattta 7576520  T
Q  394 gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||||| ||  |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7576519 gagttacatattacatgatcatgagctagaacagaatcatctatgacctaatca 7576466  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 447
Target Start/End: Original strand, 18970843 - 18970996
Alignment:
Q  295 agtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-a 393  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||  | | |    
T  18970843 agtcatacaatctctaatatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattacacacaatttatattgaataaactagaataactttcataatgattca 18970942  T
Q  394 gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||| | ||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18970943 gagctacagattacatggtcatgagttagaacagaatcatctatgacctaatca 18970996  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 186
Target Start/End: Original strand, 18973966 - 18974056
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaag 186  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  |  || ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18973966 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactcagaaccctcttttctaattataattccctaattcctcaggtgaacctataatcataaaag 18974056  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22721944 - 22721866
Alignment:
Q  419 ctagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaaga 497  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||    
T  22721944 ctaggacataatcatcttagacctaatcacaaagagtttagctactcatgactaaaacataaataactaatgttaaaga 22721866  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 488
Target Start/End: Original strand, 23611526 - 23611560
Alignment:
Q  454 atttagctactcatggctaaagcacaaataactaa 488  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23611526 atttagctactcatgactaaagcacaaataactaa 23611560  T

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Target: chr6 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Original strand, 12489070 - 12489611
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489070 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacatgtcccctatgtctatgaatatcacaaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 12489169  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtattt-aagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  12489170 ttgatcctaagtccgctcgtctaattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtattttaagctcgttaattcaatgatcacaac 12489269  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12489270 ctaacaacactccattcctagattgtctgttagattgaacagtataaacatgtctgagttatacgctacgatcaatagtcatacaatctcttaaatcaat 12489369  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489370 tagattgggtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 12489469  T
Q  419 ctagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattg 518  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||    
T  12489470 atagtacagaatcatctttgacctaatcacgacgggtttagctactcatggctaaagcacaaataactaatgctagagagaaattcattacatgtaattg 12489569  T
Q  519 ataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttcttctca 560  Q
    |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  12489570 ataactagctatgagtttttatagtctctcaccttctgctca 12489611  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Original strand, 15394133 - 15394673
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15394133 attcgattcatctgtacttcactcattagcaacatgtttcttatgtctacgtatctcacaaagttaacgaagaatcaacaatttaacttaggtcaatccc 15394232  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  15394233 tttatcttaagtccgcttatctaatcataattccctaattgcttaggtgaacctataatcatcaaaggtttttaagtccgttaattcaattatcacaacc 15394332  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15394333 taacaaagctctatccctagattgtttgttaggttgaacaacataaatatgtttgagttacacgttactgtcaatagtcatataatctcttgaatcaatt 15394432  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagc 419  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15394433 atattgggtcagaatcataaaagcattaagatcaatttatattgaataaactagattgatattcatcaacaatagagtttcaggttacataagtatgagc 15394532  T
Q  420 tagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattga 519  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15394533 tagtacaaaatcatctttgacctaatcacaaaggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaatgataaaggagaattcattacatgaaattga 15394632  T
Q  520 taaccggctatgagttttgattgtctcccaccttcttctca 560  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15394633 taactggctatgagttttgatggtctcccaccttctgctca 15394673  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 964874 - 964356
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  964874 tcactcattagcaacctgtttcttaagtttacgaatgctataaagttaacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatcccttgatcctaagccctctt 964775  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
     ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  964774 ttctgattataattccctaattccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacgctccatccct 964676  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |   ||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  964675 agattgtccgttagattgaacagtatagatatgtcagagttacacgttggtgtcagcaatcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcat 964576  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  964575 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatagcattcataaagattaagagttacaggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctc 964476  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  964475 ttgacctaatcacaaaagatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagtt 964376  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  964375 ttgatggtctcccaccttct 964356  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27315939 - 27315476
Alignment:
Q  97 acaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagc 196  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| | || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  27315939 acaaaatagcttaggtcaatcccttgatcctaggccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttgtgc 27315841  T
Q  197 tctttaattcaattatcacaaccta----acaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtca 292  Q
     | ||||||||||||||||||||||    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||   ||||||||||||   |||    
T  27315840 ccgttaattcaattatcacaacctagctaacaacgctccatccctagattttccgttagattgaacagtatagatatgttagagttacacgctagtttca 27315741  T
Q  293 atagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat 392  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | | ||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| | |    
T  27315740 gtagtcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattaaaaacgatttatactgaataaactagaatggtattcataaagatt 27315641  T
Q  393 a-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacg 490  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||  || |||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27315640 aagagttactggttacataaacatgagtgagaacagaagcatctcttcacctaatcacaaaggatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatg 27315541  T
Q  491 ataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
      ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27315540 taaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccagatatgagttttgatggtctcccaccttct 27315476  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 212 - 555
Target Start/End: Original strand, 20110192 - 20110537
Alignment:
Q  212 tcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctctta 311  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |    
T  20110192 tcacaacctaacaacgttccatccctagattgtccgttagattgaatagtataaatatgtcagagttacacgctagtgtcaatagtcatatatactctaa 20110291  T
Q  312 aatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacata 410  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  20110292 aatcatttatattgggttagaatcataaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaggttacata 20110391  T
Q  411 agcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattac 509  Q
    | |||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  20110392 aacatgagatagaacaaaatcatctcttgagctaatcacaaaggatctagctactgatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattac 20110491  T
Q  510 atgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||| ||||| ||||||| || || | ||||| ||||||||||||||    
T  20110492 atgaaattggtaaccggataggactgttgatggtctcccaccttct 20110537  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5190666 - 5190401
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || |||| |||||||||    
T  5190666 attcgattcatctgctcatcgctcataagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaagtcaatccc 5190567  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  5190566 ttgatcctaagccctcttttataattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 5190468  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgcta 286  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||    
T  5190467 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgcta 5190401  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Original strand, 11184125 - 11184470
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11184125 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactcagagccctcttttctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttaag 11184223  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | ||||||  || ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||      ||||||||||||| |  ||| ||||| | |||   ||||  |    
T  11184224 tccgttaattttataatcgcaacctaacaactttccatccctagattgtccg------tgaacagcataaataaatctgagttataagctggtgtcagca 11184317  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-ag 394  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||| |  |||||||||||| | || |||||||  | | ||    
T  11184318 gtcctataatctctaatatcaattatattgagtcagaatcataaaagcattacacacaatttataccgaataaactagaataactttcataataattcag 11184417  T
Q  395 agtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    || | ||| |||| |   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11184418 agctacagattacttggtcatgagctagaacagaatcatctatgacctaatca 11184470  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 495 - 555
Target Start/End: Original strand, 16567266 - 16567326
Alignment:
Q  495 agaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16567266 agaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 16567326  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 17733473 - 17733608
Alignment:
Q  22 tcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccctt 121  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||  | ||||  | ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||    
T  17733473 tcgattcatctgttcatcactcattagcaacctatttcttaagtttacgaatgttgttaagtttaagacaaattaacaaaataacttaggttcatccctt 17733572  T
Q  122 gattctaagtccgcttatctaatcataattccctaa 157  Q
    ||||  |||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  17733573 gattaaaagtcctcttttctgattataattccctaa 17733608  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 199845 - 200380
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  199845 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcttatgtctatgcatgtcacaaagttaacgacgaatcaacaatttaacttaggtcaatccc 199944  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  199945 ttgatcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaagattgttaagtccgttaattcaattatcacaacc 200044  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  200045 taacaacgttctatccctagattgttcgttagattgaacagcataaatatgtctgagtcacacgctactttcaatagtcatataatctcttgaatcaatt 200144  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagc 419  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  200145 atattgggttagaatcataaaagcattaatatcaatttatactgaataaactagattgacattcataaacaatagattttcaggttacataagtatgagc 200244  T
Q  420 tagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattga 519  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  200245 tagtacataatcatctttgacctaatcacaaaggatttagctactcacggctaaagcacaaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaattga 200344  T
Q  520 taaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  200345 taaccggctatgagttttgatggtctcccaccttct 200380  T

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Target: chr4 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 14617532 - 14616997
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14617532 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcttatgtctatgcatgtcacaaagttaacgacgaatcaacaatttaacttaggtcaatccc 14617433  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14617432 ttgatcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaagattgttaagtccgttaattcaattatcacaacc 14617333  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14617332 taacaacgttctatccctagattgttcgttagattgaacagcataaatatgtctgagtcacacgctactttcaatagtcatataatctcttgaatcaatt 14617233  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagc 419  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14617232 atattgggttagaatcataaaagcattaatatcaatttatactgaataaactagattgacattcataaacaatagattttcaggttacataagtatgagc 14617133  T
Q  420 tagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattga 519  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14617132 tagtacataatcatctttgacctaatcacaaaggatttagctactcacggctaaagcacaaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaattga 14617033  T
Q  520 taaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14617032 taaccggctatgagttttgatggtctcccaccttct 14616997  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 25 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12194592 - 12194063
Alignment:
Q  25 attcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgat 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12194592 attcatatgcacttcactcattagcaacctgtttctgatgtctacgaatgtcacaaagtaaacgacgaattaacacattaacttaggtcaatcccttgat 12194493  T
Q  125 tctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaaca 224  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||  | ||||||||||||| |||||||||||    
T  12194492 cctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataatcgtcaaaggatattaagtccgttaattcaattataacaacctaaca 12194393  T
Q  225 acactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatt 324  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12194392 acgctctattcctagattgtctgttagattgaacaacataaatatattcgagttacacactacggttaatagtcatataatctcttgaatcaattatatt 12194293  T
Q  325 tagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagctagta 424  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||   ||||||||||||    
T  12194292 gggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatacactgaataaactatattgacattcataaacgtaagagtatcaggttacatccacatgagctagta 12194193  T
Q  425 cagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataac 523  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12194192 caaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatttagttactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaattgataac 12194093  T
Q  524 cggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12194092 cggctatgagttttgatggtctcccacctt 12194063  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 22755777 - 22755231
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactca-ttagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  22755777 attcgattcatctgcaattcacttaattagcaacctgtttcttatgtctatgaatgtcgcaaagtaaccgacaaattaacaaattaactttggttaatcc 22755678  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtat-ttaagctctttaattcaattatcacaa 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||  | ||||| ||||||||||||    
T  22755677 cttgatcctaagtccgcttatctaattataattccctaattccttaggggaacctataatcatcaaaggaatataaagtccgttaatccaattatcacaa 22755578  T
Q  218 cctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaa 317  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22755577 cttaacaactctatatccctagattgtctgttagattgaacaacataaatatgtccgagttacacgctactgtcaatagtcaggtaatctcttgaatcaa 22755478  T
Q  318 ttatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcat-aaacaat-agagtttcaggttacataagcat 415  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||    |  || | |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||| |||  |    
T  22755477 ttacattgtgtcagaatcataaaggcattaagcatgagatatactgaataaactagattgacgttcataaaacgataagagttccaggttacaaaagttt 22755378  T
Q  416 gagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatg-t 513  Q
     ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  22755377 aagctaatacaaaatcatctcttgacctaatcacaatagatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgataaagaagaattcattacatgag 22755278  T
Q  514 aattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttcttctca 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22755277 aattgataaccggctatgagttttgatggtctcccaccttctgctca 22755231  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 555
Target Start/End: Original strand, 48961699 - 48962221
Alignment:
Q  22 tcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccctt 121  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||  | ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  48961699 tcgattcatctgttcatcattcattagcaacctgtttcttaagtttacgaatggtataaagtttaagacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccctt 48961798  T
Q  122 gattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaaccta 221  Q
    |||   ||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||| ||||||    
T  48961799 gatcaaaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcataaccta 48961897  T
Q  222 acaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattat 321  Q
    ||||| ||| ||||||||||||            ||||| ||| | ||||   ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48961898 acaacgctccatccctagattg------------aacagtatagatatgttagagttacacgctagcgtcagtagtcatataaactcttgaatcaattat 48961985  T
Q  322 atttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagct 420  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||| || |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  48961986 attgggtcagaatcataaaagcattaagaacaatttatacttaataaactagaatggcattcataaagattaagagttacaggttacataaacatgagct 48962085  T
Q  421 agtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattga 519  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||     
T  48962086 agaacaaaatcatctattgacctaatcacaaaagatctagctactgatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattgg 48962185  T
Q  520 taaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48962186 taaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 48962221  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 54899811 - 54899406
Alignment:
Q  146 ataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtc 245  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |  |||  | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  54899811 ataattccctaattcctcaggtgaacctatattcattcaaggt-taaaagtccgttaatttaattatcacaacctaacaacgctccatccctagattgtc 54899713  T
Q  246 cgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcat 345  Q
    ||||||||| ||||| ||| | || ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  54899712 cgttagattaaacagtatagatatttctgagttacacgctagtgtcaagagtcatataaactcctgaatcaattatattgggtcagaatcataaaagcat 54899613  T
Q  346 taagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgaccta 443  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54899612 taagaaccatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaggttacatatacatgagctagaacagaatcatctcttgaccta 54899513  T
Q  444 atcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgt 543  Q
    |||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||    
T  54899512 atcagaaaggatctagctaatcatggttaaagcacaaataactaatatgaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccagatatgagttttgatggt 54899413  T
Q  544 ctcccac 550  Q
    |||||||    
T  54899412 ctcccac 54899406  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 555
Target Start/End: Original strand, 22884377 - 22884825
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22884377 aacaaaatagcttaggtcaatcccttgatccaaagccgtcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaag 22884475  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||            |||||||| ||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||    
T  22884476 tccgttaatttaagtgtcacaacctaacaacgctccatccctaga------------ttgaacagtataaatatttccgagttacaagctagtgtcaata 22884563  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-ag 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||  | | ||    
T  22884564 gtcatatatactcttgaatcagttatattgggtcataatcataaatgcattaagaacaatttatattaaataaactataatgacattcataacgattaag 22884663  T
Q  395 agtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgata 493  Q
    |||| || |||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    |    
T  22884664 agttacatgttatataaacatgagctagaacataatcatctcttgatctaatcacaaaggatctagctactcatggctaaaacacaaataactaatatga 22884763  T
Q  494 aagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22884764 aagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagttttgatggtcttccactttct 22884825  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 555
Target Start/End: Original strand, 22936041 - 22936489
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22936041 aacaaaatagcttaggtcaatcccttgatccaaagccgtcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaag 22936139  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | |||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||||            |||||||| ||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||    
T  22936140 tccgttaatttaagtgtcacaacctaacaacgctccatccctaga------------ttgaacagtataaatatttccgagttacaagctagtgtcaata 22936227  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-ag 394  Q
    ||||||||  ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||  | | ||    
T  22936228 gtcatatatactcttgaatcagttatattgggtcataatcataaatgcattaagaacaatttatattaaataaactataatgacattcataacgattaag 22936327  T
Q  395 agtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgata 493  Q
    |||| || |||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    |    
T  22936328 agttacatgttatataaacatgagctagaacataatcatctcttgatctaatcacaaaggatctagctactcatggctaaaacacaaataactaatatga 22936427  T
Q  494 aagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  22936428 aagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagttttgatggtcttccactttct 22936489  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 171 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12705967 - 12705582
Alignment:
Q  171 cctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatg 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||     
T  12705967 cctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaattatcacaacctaacaacgcttcatccctagattgtccgttagattgaactgtatagatatt 12705869  T
Q  271 tctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaac 370  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  | |||| | |||||||||    
T  12705868 tatgagttacacgctagtgtcaatagtcatatatactattgaattgattatattgggtcagaatcataaaagcattaagaatagtttataatgaataaac 12705769  T
Q  371 tagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatg 468  Q
    |||| || |||||||||| | || ||||| || ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  12705768 tagaatggcattcataaagattaagagttacaagttacataaacatgagttagaacaaaatcatctcttgacctaatcacagaggatctagctactcatg 12705669  T
Q  469 gctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  12705668 gctaaaacacaaataactaatgtaaaagaatgactcattacatgaaattggtgaccgaatatgagttttgatgttctcccaccttct 12705582  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 347
Target Start/End: Original strand, 34855736 - 34855942
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatcccta 238  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |  ||||||||||||||||  || |||||||    
T  34855736 tctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaattttagaatcacaacctaacaactttccatcccta 34855834  T
Q  239 gattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcata 338  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || || | |||   |||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  34855835 gattgtctgttaaattgaacagcataaatatgtctgagatataagctggtgtcattagtcatgtaatctctaagatcaattttattgggtc-gaatcata 34855933  T
Q  339 aaggcatta 347  Q
    || ||||||    
T  34855934 aaagcatta 34855942  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 387
Target Start/End: Original strand, 21614410 - 21614657
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatcccta 238  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||  | ||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||    
T  21614410 tctaattataattctctaatcccttaggtgaacctataatcatagaaggttttaaagtccgttaattc-ataatcacaacctaacacttttctatcccta 21614508  T
Q  239 gattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcata 338  Q
    ||||  ||||||  ||||||| |||||| | ||| |||||| | ||||  |||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||   ||||||||||||    
T  21614509 gattacccgttaagttgaacatcataaataggtcaaagttataagctagtgtcagtagtcatataaactctaagctcaattatatcgggtcagaatcata 21614608  T
Q  339 aaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataa 387  Q
    ||  ||| | |  ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21614609 aaatcatcacgcacaatttatactgaataaactagaataacaatcataa 21614657  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5692623 - 5692567
Alignment:
Q  428 aatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataa 484  Q
    |||||| || ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5692623 aatcatattagacctaatcacgaaaaatttagctactcatggctaaagcacaaataa 5692567  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 5693391 - 5693335
Alignment:
Q  428 aatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataa 484  Q
    |||||| || ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5693391 aatcatattagacctaatcacgaaaaatttagctactcatggctaaagcacaaataa 5693335  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25186185 - 25186135
Alignment:
Q  22 tcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaa 72  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25186185 tcgattcatctgcacatcgctcattagtaacctgtttcttaagtctacgaa 25186135  T

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Target: chr1 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Original strand, 45532564 - 45533100
Alignment:
Q  20 attcgattcat-ctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45532564 attcgattcattctgcacttcactcactagtaacatgtttctgatgtctacgaatgtcacaaagtaaacgacgaattaacacattaacttaggtcaatcc 45532663  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||||  | |||||||||||||||||||    
T  45532664 cttgatcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataatcgtcaaaggatattaagtccgttaattcaattatcacaac 45532763  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45532764 ctaacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagcataaatatatccgagttacaacctacggtcaatagtcatataatctcttgaatcaat 45532863  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatga- 417  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||||     
T  45532864 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 45532963  T
Q  418 gctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaat 516  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  45532964 gttagtacagaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatggctaaagcataaataactaataataaagaagaattcattacatgaaat 45533063  T
Q  517 tgataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45533064 tgataaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 45533100  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 28138825 - 28139361
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  28138825 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 28138924  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  28138925 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 28139023  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  28139024 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 28139123  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  28139124 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 28139223  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28139224 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 28139323  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  28139324 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 28139361  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 28142076 - 28142612
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  28142076 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 28142175  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  28142176 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 28142274  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  28142275 taacaacgccccatccctagattgttcgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 28142374  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  28142375 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 28142474  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28142475 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 28142574  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  28142575 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 28142612  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 14159278 - 14159814
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || |||| |||||||||    
T  14159278 attcgattcatctgctgatcgctcattaacaacctgtttcttaagtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaagtcaatccc 14159377  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctct-ttaattcaattatcacaac 218  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  14159378 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaag-tctgttaatttaagtatcacaac 14159475  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||| |    
T  14159476 ctaacaatgctccatccctagattgtccgttagattgaacaatataaatatgtcagagttatacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcagt 14159575  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatga 417  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| |||||    
T  14159576 tatattgggtcagaatcataaaagcattgagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttacaggttacataaacatga 14159675  T
Q  418 gctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaat 516  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||    
T  14159676 gctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatcgagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaagaatttattacatgaaat 14159775  T
Q  517 tgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14159776 tggtaaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 14159814  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 17761997 - 17761627
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||| |||  |||||||||||||| | ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17761997 attcgaatcatctgcaattcactcaatgggcaacctggttctgatgtctacgaatgttacaaagtaaatgatgaatcaacacattaacttaggtcaatcc 17761898  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | |||  | |||||||||| ||| ||||    
T  17761897 cttgatcctaagtcctcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataattgtcaaaggatatcaagtccgttaattcaatgatctcaac 17761798  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17761797 ctaacaactctccatccctagattgtccgttagattgaacaacataaatagatccgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctattaaatcaat 17761698  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaac 389  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17761697 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaac 17761627  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Original strand, 25663088 - 25663604
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    ||||||||||||||| |||||| || || || |||||  |||||||  | ||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||   ||| || |||    
T  25663088 tcactcattagcaacttgtttcttaagtttatgaatgctataaagtgtaagacaaattaacaaaatagcttaggtcaatcccttgatcaaaagccctctt 25663187  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
      || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||  |||| |   |||||| ||   ||||||| |||||||  || ||||||    
T  25663188 tcctgattataattctctaatcctttaggtgaacctatattcattcaaggt--ttaaacaagttaatttaaaagtcacaac-taacaacgttccatccct 25663284  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||  ||||||| |||    
T  25663285 agattgtccgttagattgaacaatataaacatgtcagagttacacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcatttatattgggtcagaaacat 25663384  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||| |   |||||||| ||| ||||||||     
T  25663385 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacatgttacattatactgagctagaacaaaatcatctc 25663484  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||    
T  25663485 ttgacctaatcagaaaggatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaaaattcattacatgaacttggtaaccggatatgattt 25663584  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  25663585 ttgatggtgtcccaccttct 25663604  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1941659 - 1941373
Alignment:
Q  235 cctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaat 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  1941659 cctagattgtccgttagattgaacagtatagatatgtcagagttacatgctagtgtcagtagtcatataaactcttgaatcaattatattgggtccgaat 1941560  T
Q  335 cataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcat 433  Q
    |||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  1941559 cataaa-gcattaagaataatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaagttacataaacatgagctagaacaaaatcat 1941461  T
Q  434 ct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgat 520  Q
    || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1941460 ctcttgacctaatcacaaaagatctagctactcatggctaaaacacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattgat 1941373  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17761624 - 17761484
Alignment:
Q  414 atgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatg 512  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17761624 atgagctattacagaatcatctcttgacctaatcacaaaggacttagctactcatggctaaagcataaataactaatgatgaagaagaattcattacatg 17761525  T
Q  513 taattgataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17761524 aaattgataactggctatgagttttgatggtctcccacctt 17761484  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8435142 - 8434961
Alignment:
Q  166 gtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataa 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  || ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8435142 gtgaatctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaattttataatcgcaacctaacaactttccatccctagattgtccgttaaattgaacagcataa 8435044  T
Q  266 acatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatt-tagtcagaatcataaaggcatta 347  Q
    | | |||| ||||| | |||   ||||  |||| |||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  8435043 ataagtctgagttataagctggtgtcagcagtcctataatctctaagatcaattatattggggtcagaatcataaaagcatta 8434961  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28957191 - 28957022
Alignment:
Q  109 aggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaa 208  Q
    ||||||||||||||||||  ||  | ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||  |    
T  28957191 aggtcaatcccttgattcataggtctcttctctgattataattctctaattccttaggtgaacctataatcatcaaagg-gtttaagtccgttaatttta 28957093  T
Q  209 ttatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagtta 279  Q
      |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| | |||| |||||    
T  28957092 gaatcacaacctaacaattttctatccctagatcatccgttaagttgaacagtataaataggtctgagtta 28957022  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 447
Target Start/End: Original strand, 21914206 - 21914325
Alignment:
Q  329 cagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacag 427  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||  |  ||||||| |||| || |||||||||| | || ||||| |||||||||||  |||||||||| |||     
T  21914206 cagaatcataaaagcattaagaacgatttctaccgaataaattagaatggcattcataaagattaagagttacaggttacatagtcatgagctagaacaa 21914305  T
Q  428 aatcatctttgacctaatca 447  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  21914306 aatcatctatgacctaatca 21914325  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 250
Target Start/End: Original strand, 26639628 - 26639737
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatcccta 238  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || | |  | ||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  26639628 tctaattataattctctaattctttagctgaacctataatcatcaaaggttttaatgtacgttaatttgaaaatcacaa--taacaactctctatcccta 26639725  T
Q  239 gattgtccgtta 250  Q
    ||||||||||||    
T  26639726 gattgtccgtta 26639737  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 42590923 - 42591033
Alignment:
Q  148 aattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctct-ttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtcc 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||  ||| |||||| ||  |||||||| |||||||  |||||||||| || || |    
T  42590923 aattccctaatccctta-gtgaacctgtaatcatcaaaagt-tttaatgtctgttaatttaaaaatcacaacttaacaactttctatccctaaatcgttc 42591020  T
Q  247 gttagattgaaca 259  Q
    |||| || |||||    
T  42591021 gttaaatcgaaca 42591033  T

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Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7290174 - 7289639
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7290174 attcgattcatctgcacttcactcatttggcaacctgtttctgatgtctacgaatgtcacaaagtaaacgatgaattaacacattaacttaggtcaatcc 7290075  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctct-ttaattcaattatcacaa 217  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  7290074 cttgatcctaagtccgcttttctaatcataattccctaattccttaggtaaacctataattgtcaaaggagattaag-tctgttaattcaatgatcacaa 7289976  T
Q  218 cctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaa 317  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289975 tctaacaacgctccatccctagattgtctgttagattgaacaacataaatatatctgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaa 7289876  T
Q  318 ttatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatga 417  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||   |||||    
T  7289875 ttatattgggtcagaatcataaaagcattaagaccaagatatactgaataaactagattgacattcataaatgtaagagtttcaggttacatccacatga 7289776  T
Q  418 gctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaat 516  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7289775 gctagtacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggacttagctactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaat 7289676  T
Q  517 tgataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  7289675 tgataacaggctatgagttttgatggtttcccacctt 7289639  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Original strand, 9420926 - 9421461
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9420926 attcgattcatctgcacttcactcatttggcaacctggttcttatgtctacgaatatcacaaagtgaatgatcaattaacacattaacttaggtcaatcc 9421025  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  |||  |||    
T  9421026 cttgatcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataattctcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatcttaac 9421125  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9421126 ctaacaacgctccatccctagattgtctgttagattgaacaacataaatagatctgagttacacgcaacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 9421225  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  9421226 tatatttggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 9421325  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9421326 ctagtacagaatcatctcttgacctaatcgcaaaggacttagctactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaatt 9421425  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9421426 gataaccggctatgaattttgatggtctcccacctt 9421461  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22035992 - 22035456
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22035992 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 22035893  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    |||||  |||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  22035892 ttgatcataagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 22035794  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  22035793 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 22035694  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22035693 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 22035594  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22035593 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 22035494  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22035493 ggtaaccggatatgagtttcgatggtctcacaccttct 22035456  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22039218 - 22038682
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  22039218 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 22039119  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    |||||  |||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  22039118 ttgatcataagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 22039020  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  22039019 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 22038920  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22038919 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 22038820  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22038819 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 22038720  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22038719 ggtaaccggatatgagtttcgatggtctcacaccttct 22038682  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 43103876 - 43104412
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43103876 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacttgtttcttaagtctacaaatgttataaagtttacgacaaattaacaaaataacttaggtcaatccc 43103975  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| ||  |||||||||    
T  43103976 ttgatcctaagtcctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagcatcacaacc 43104074  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||  ||||||  |||| | ||||||||  |||| |||||||||    
T  43104075 taacaacgcaccatccctagattgtccgttagattgaacattataaatatgtcagagttttacgctagtgtcagtggtcatatatactctaaaatcaatt 43104174  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  43104175 atattgggtcaaaatcataaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacaggttacataaacatgag 43104274  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  43104275 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatatgaaagaaggattcattacatgaaatt 43104374  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43104375 ggcaaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 43104412  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36700538 - 36700061
Alignment:
Q  77 ataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctata 176  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||| || |||  || || ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36700538 ataaagttaacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatcccttg-tcctaagccctctttcctgattataattccctaattcctcaggtgaacctata 36700440  T
Q  177 atcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaag 276  Q
     ||||  |||||  |||| | | |||||| ||   |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||  ||    
T  36700439 ttcattcaaggt--ttaaacacgttaatttaaaattcacaacctaacaacgttccatccctagattgtccattaagttgaacagtataaatatgtcagag 36700342  T
Q  277 ttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagatt 376  Q
    ||| | | |   ||||  |||||| ||| ||||  |||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |    
T  36700341 ttaaaagttggtgtcagcagtcatctaagctctagaatcgattatattgggtcagaattataaaagcattaagaacgatttatactgaataaactagaat 36700242  T
Q  377 gacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaa 474  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36700241 gacattcataaatattaagagttacaggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaatggatctagctactcatggctaaa 36700142  T
Q  475 gcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36700141 gcacaaataactaatataaaagaaggattcattacatgaaattgttaatcagatatgagttttgatggtctccaaccttct 36700061  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 447
Target Start/End: Original strand, 20473694 - 20474002
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatcccta 238  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||  |  ||||||||||||||||  || |||||||    
T  20473694 tctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggttttaaatc-cgttaattttagaatcacaacctaacaactttccatcccta 20473792  T
Q  239 gattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcata 338  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||   ||||  ||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||    
T  20473793 gattgtctgttaaattgaacagcataaatatgtctgagttataagctggtgtcagcagtcatacaatctctaagaacaattatattgagtcagaatcata 20473892  T
Q  339 aaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatcttt 437  Q
    || ||||||    ||||||| | ||||||||||||| | || |||||||  | | |||| | ||| |||| |   |||||||||| |||||||||||| |    
T  20473893 aaagcattacacacaatttatactgaataaactagaataactttcataataattcagagctacagattacttggtcatgagctagaacagaatcatctat 20473992  T
Q  438 gacctaatca 447  Q
    ||||||||||    
T  20473993 gacctaatca 20474002  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 109 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 31375666 - 31375328
Alignment:
Q  109 aggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaa 208  Q
    |||| |||||||||| ||  || || ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |    
T  31375666 aggtaaatcccttgactcagagccctcttttctaattataattctctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaatttta 31375568  T
Q  209 ttatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctc 308  Q
      |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||   ||||  |||| |||||||||    
T  31375567 gaatcacaacataacaactttccatccctagattgtccgttaaattgaacaggataaataagtctgagttataagctggtgtcagcagtcctataatctc 31375468  T
Q  309 ttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttac 407  Q
    | | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |  ||||||| | | ||||| ||||| | || |||||||  | | |||| | ||| ||||    
T  31375467 taagatcaattataatgggtcagaatcataaaagcattacgcacaatttatactaaataacctagaataactttcataataattcagagctacagattac 31375368  T
Q  408 ataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31375367 atggtcatgagctagaacagaatcatctatgacctaatca 31375328  T

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Target: chr8 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Original strand, 33578248 - 33578783
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  33578248 attcgatttatctgcacttcactcatttggcaacctgtttctcatgtctacgaatgtcacaaagtagacgatgaattaacacattaacttaggtcaatcc 33578347  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||   |||||  | | ||||| || ||||||||    
T  33578348 cttgatcctaagtctgcttacctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataattgtcgaaggatattaagtccgtgaattcgatgatcacaac 33578447  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33578448 ctaactacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagcataaatatatatgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttgaatcaat 33578547  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  33578548 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattaataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 33578647  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  33578648 ctagtacagaatcatctcttgacctaatcacaaaggacttagctactcatggctaaagcataaataactaatggtaaagaagaattcattacatgaaatt 33578747  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33578748 gataaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 33578783  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 5952241 - 5951723
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  5952241 tcactcattagcaacctgtttcttaagtttacgaatgctataaagttaacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatcccttgatcctaagccctctt 5952142  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
     ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5952141 ttctgattataattccctaattccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacgctccatccct 5952043  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |   ||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  5952042 agattgtccgttagattgaacagtatagatatgtcagagttacacgttggtgtcagcaatcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcat 5951943  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  5951942 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaataacattcataaagattaagagttaaaggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctc 5951843  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  5951842 ttgacctaatcacaaaagatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagtt 5951743  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5951742 ttgatggtctcccaccttct 5951723  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 33383475 - 33382957
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||  ||||||| |||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  33383475 tcactcattagcaacctgtttcttaagtttacgaatgctataaagttaacggcaaattaacaaaatagcttaggtcaatcccttgatcctaaaccctctt 33383376  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
     ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33383375 ttctgattataattccctaattccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacgctccatccct 33383277  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |   ||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  33383276 agattgtccgttagattgaacagtatagatatgtcagagttacacgttggtgtcagcaatcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcat 33383177  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  33383176 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttataggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctc 33383077  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  33383076 ttgacctaatcacaaaagatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagtt 33382977  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  33382976 ttgatggtctcccaccttct 33382957  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 38 - 555
Target Start/End: Original strand, 2847820 - 2848338
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgctt 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  2847820 tcactcattagcaacctgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagtttaggtcaatcccttgatcctaagccctctt 2847919  T
Q  138 atctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccct 237  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2847920 ttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacgctccatccct 2848018  T
Q  238 agattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcat 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||| |   ||||  || ||||  | ||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  2848019 agattgtccgttagattgaacagtatagatatgtcagagttacacgttggtgtcagcaggcataataactcttgaatcaattatattgggtcagaatcat 2848118  T
Q  338 aaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    ||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||     
T  2848119 aaaagcattaagaacaatttatactgaataaactagaatttcattcataaagatttagagttataggttacataaacatgagctagaacaaaattatctc 2848218  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2848219 ttgacctaatcacaaaagatctagctactcatggctaaagcacaaataactaatgtagaagaaggattcattatatgaaattggtaaccggatatgagtt 2848318  T
Q  536 ttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  2848319 ttgatggtctcccaccttct 2848338  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 560
Target Start/End: Original strand, 15928815 - 15929177
Alignment:
Q  200 ttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtca 299  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||||||||  |||||||||||    
T  15928815 ttaattcgaatatcacaacctaacaacgctccattcctagattgtctgttagattgaacagtataaagatatccgacttacacgctagtgtcaatagtca 15928914  T
Q  300 tataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaa-gatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaata-gagt 397  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||   ||||||||||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||||||| || ||||||||||   || ||||    
T  15928915 tataaactctagaatcatttatattagctcagaatcataaaagctttaaagat-aatttataatgaataaactagaatggcattcataaagtttaagagt 15929013  T
Q  398 ttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaag 496  Q
    | ||||||||||     |||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||    
T  15929014 tacaggttacattctattgagctagaacaaaatcatatcttgacctaatcacaaaggatttagctactcatggataaggcacaaataactaatgtaaaag 15929113  T
Q  497 aagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttcttctca 560  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15929114 aaggattcactacatgtaattgataaccggctatgagttttgatagtctctcaccttcttctca 15929177  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29354287 - 29354012
Alignment:
Q  146 ataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtc 245  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29354287 ataatttcctactcgcttaggtgaacctataatcatgaaaggt-ttgaagtccgttaatttaagtatcacaacctaacaacggtccatccctagattgtc 29354189  T
Q  246 cgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcat 345  Q
    ||||||||||||||  | ||| || | | ||| ||||  ||  |||||||||||||||  || || ||||| ||| ||   |||||||||||||| ||||    
T  29354188 cgttagattgaacaatacaaatatttatgagtaacacaatagtgtcaatagtcatatatactattgaatcagttacatcgggtcagaatcataaaagcat 29354089  T
Q  346 taagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagcta 421  Q
    ||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  29354088 taacaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttacatgttacataaacatgagcta 29354012  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 447
Target Start/End: Original strand, 27805703 - 27806011
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatcccta 238  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |  || ||||  |  || |||||||||||||  |  |||||||    
T  27805703 tctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaatggttttaaatcagtt-aattttagaattacaacctaacaacttttcatcccta 27805801  T
Q  239 gattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcata 338  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||   ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||    
T  27805802 gattgttcgttaaattgaacagcataaatatgtctgaattatacgctggagtcatcagtcatataatctctaagatcaattatattggatcagaatcata 27805901  T
Q  339 aaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatcttt 437  Q
    || |||||| |  ||||||| | ||||||| ||||| | |||||||| |  | | ||||||  || |||||||| |||||||||| | | |||||| | |    
T  27805902 aaagcattacgcacaatttatactgaataacctagaataacattcatgataattcagagttatagattacataatcatgagctagaataaaatcatgtat 27806001  T
Q  438 gacctaatca 447  Q
    ||||||||||    
T  27806002 gacctaatca 27806011  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 8855973 - 8856065
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt 188  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8855973 aacaaagtatctcaggtcaatcccttgaatcagagccctcttttctaatcataattccataatcccataggtgaacctataatcatcaaaggt 8856065  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 8857446 - 8857538
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt 188  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8857446 aacaaagtatctcaggtcaatcccttgaatcagagccctcttttctaatcataattccataatcccataggtgaacctataatcatcaaaggt 8857538  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 452 - 550
Target Start/End: Original strand, 8856358 - 8856456
Alignment:
Q  452 ggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccac 550  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  8856358 ggatttagttactcatggctaaatcataaacaactaataacaaagaaggattcattacatgaaattgatgattggctatgagttttgatggtctcccac 8856456  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 452 - 550
Target Start/End: Original strand, 8857831 - 8857929
Alignment:
Q  452 ggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccac 550  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  8857831 ggatttagttactcatggctaaatcataaacaactaataacaaagaaggattcattacatgaaattgatgattggctatgagttttgatggtctcccac 8857929  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 387
Target Start/End: Original strand, 12104588 - 12104835
Alignment:
Q  139 tctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaac-actct--atcc 235  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||| |  |||||||||||| ||| ||| |  ||||    
T  12104588 tctaattataatttgctaatcccttacgtgaacctataatcatcaaaggttttaaagtgcgttaattc-agaatcacaacctaataacaacttttcatcc 12104686  T
Q  236 ctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatc 335  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||| | |||  ||||| | |||   ||||   |||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||     
T  12104687 ctagattgtccgttaagttgcacaacataaataagtcggagttataagctggtgtcagctgtcatataatctctt---tcaattatattgggtcagaatt 12104783  T
Q  336 ataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataa 387  Q
    ||||| | |||| |  ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  12104784 ataaaaggattacgcacaatttatattgaataaactagaataacaatcataa 12104835  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 29354014 - 29353950
Alignment:
Q  441 ctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattca 505  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  29354014 ctaatcacaaaggatgtaactactcatggctaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattca 29353950  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 456 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 3296878 - 3296846
Alignment:
Q  456 ttagctactcatggctaaagcacaaataactaa 488  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3296878 ttagatactcatggctaaagcacaaataactaa 3296846  T

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Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 553
Target Start/End: Original strand, 27195871 - 27196403
Alignment:
Q  24 gattcatctgcacttcactcattagc-aacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttg 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| || ||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27195871 gattcatctgcgcttcactcatttggtaacctggttctgatgtctacgaatatcacaaagtgaatgatcaactaacacattaacttaggtcaatcccttg 27195970  T
Q  123 attctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaa 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  ||| ||||||||    
T  27195971 atcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataattctcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatctcaacctaa 27196070  T
Q  223 caacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattata 322  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196071 caacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagcataaatagatccgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattata 27196170  T
Q  323 tttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagctag 422  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27196171 ttgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgagctag 27196270  T
Q  423 tacagaatcatct-ttgacctaatcac-aacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgat 520  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196271 tacagaatcatctcttgacctaagcacaaaaggacttagctactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaattgat 27196370  T
Q  521 aaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27196371 aaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 27196403  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Original strand, 4696874 - 4697409
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4696874 attcgaatcatctgcaattcactcaatgggcaacctggttcttatgtctacgaacgtcacaaagtaaatgatgaatcaacacattaacttaggtcaattc 4696973  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||| ||| ||||    
T  4696974 cttgatcctaagtctgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataattgtcaaaggatattaagtccgttaattcaatgatctcaac 4697073  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697074 ctaacaactctcaatccctagattgtctgttagactgaaaagcataaatagatccgagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 4697173  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    ||||||    
T  4697174 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacaaccacatgag 4697273  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4697274 ctattacataatcatctcttgacctaatcacaaaggacttagctactcatggctaaaacataaataactaatgataaagaagaattcattacatgaaatt 4697373  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4697374 gataactggctatgagttttgatggtctcccacctt 4697409  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27499398 - 27498863
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27499398 attcgaatcatctgcaatttactcattgggcaacctggttcttatatctacgaatgtcacaaagtaaatgataaattaacatattaacttaggtcaatcc 27499299  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  ||| ||||    
T  27499298 cttgatcctaagtccgcttttctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataattgtcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatctcaac 27499199  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27499198 ctaacaacgttccatccctagattgtccgttagattaaccagcataaatagatccgaggtacacgctacagtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 27499099  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  27499098 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 27498999  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  27498998 ttagtacagaatcatctcttgacctaatcacaacagacttagctactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacatgagatt 27498899  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27498898 gataaccggctataagttttgatggtctcccacctt 27498863  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 35080305 - 35079769
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   | |  |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  35080305 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttttcacgcttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 35080206  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  35080205 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 35080107  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  35080106 taacaacgctccatccctagattgtctgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 35080007  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  35080006 atattgggtcagaatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 35079907  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  35079906 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 35079807  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  35079806 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 35079769  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 35077047 - 35076511
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||   | |  |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  35077047 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacctgtttttcacgcttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 35076948  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  35076947 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 35076849  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  35076848 taacaacgctccatccctagattgtctgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 35076749  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  35076748 atattgggtcagaatcataaaagttttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 35076649  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  35076648 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 35076549  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  35076548 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 35076511  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 237 - 553
Target Start/End: Original strand, 29445619 - 29445936
Alignment:
Q  237 tagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatca 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  29445619 tagattgtccgttaaattgaacagcataaatatatccgagttacacactacggtcaatagtcatataatgtcttgaatcaattatattgggtcagaatca 29445718  T
Q  337 taaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct- 435  Q
    |||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||     
T  29445719 taaaagcattaagaacaaaatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgagctagtacaaaatcatctc 29445818  T
Q  436 ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagtt 535  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29445819 ttgacctaatcacaaaggatttagctactcatggctaaagcataaataactaatgataaagaagaattcattacataaaattgataaccggctatgagtt 29445918  T
Q  536 ttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  29445919 ttgatggtctcccacctt 29445936  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 555
Target Start/End: Original strand, 6277274 - 6277677
Alignment:
Q  146 ataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtc 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  | |||||| ||       ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  6277274 ataattctctaatcccttaggtgaacttataatcataaaaggt-tttaagtccgttaatttaa-------aacctaacaacgctccatccctggattgtc 6277365  T
Q  246 cgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcat 345  Q
    ||||||||||||||| ||| | | |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  6277366 cgttagattgaacagtatagataagtcagagttacacgctagtgtcagtagtcatataaactcttgaatcaattatattgggtcagaatcataaaagcat 6277465  T
Q  346 taagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgaccta 443  Q
    |||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  6277466 taagaagaatttatactgaataaactagaatgacattcataaagattaagagttataggttacataaacatgagctagaacaaaatcatctcttgaccta 6277565  T
Q  444 atcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgt 543  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  6277566 atcacaaaagatctagatactcatggctaaaacataaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaattggtaaccggatatgagttttgatggt 6277665  T
Q  544 ctcccaccttct 555  Q
    ||||||||||||    
T  6277666 ctcccaccttct 6277677  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 29445430 - 29445597
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29445430 attcgattcatctgcacttcactcactagcaacctatttctcatgtctacgaatgtcacaaagtaaacgatgaattaacacattaacttaggtcaatccc 29445529  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaagg 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29445530 ttgatcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataatcgtcaaagg 29445597  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3252378 - 3252029
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  3252378 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactc--agccctcttttctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggttttaaat 3252281  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
    |   | ||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| | |||   ||||  |    
T  3252280 cagat-aattttagaatcacaacctaacaactttctatccctagattgtccgttaaattgaacaacataaatatgtctgagttataagctggtgtcagca 3252182  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-ag 394  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |  ||||||| | | ||||| || || | |||||||| |  | | ||    
T  3252181 gtcatataatctctaagatcaattatattggatcagaatcataaaagcattacgcacaatttatacttaataacctggaataacattcatgataattcag 3252082  T
Q  395 agtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    |||| ||| |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  3252081 agttacagattacatagtcatgagctagaacaaaattatctatgacctaatca 3252029  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 16881039 - 16880871
Alignment:
Q  280 cacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgac 379  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16881039 cacgctagtgtcaatagtcatataaaatcttgaatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacgatttatactgaataaactagaatgac 16880940  T
Q  380 attcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  16880939 attcataaagattaagagttacaggttagatagtcatgagctagaacaaaatcatctatgatctaatca 16880871  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 17038729 - 17038561
Alignment:
Q  280 cacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgac 379  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17038729 cacgctagtgtcaatagtcatataaaatcttgaatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacgatttatactgaataaactagaatgac 17038630  T
Q  380 attcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    ||||||||| | | |||||| ||||||| |||  |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||    
T  17038629 attcataaagattaagagttacaggttagatagtcatgagctagaacaaaatcatctatgatctaatca 17038561  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23258843 - 23258661
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| |   || || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23258843 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactgagagcccacttttctaattataattccctaatcccttacgtgaacctataatcatcaaaggttttaaag 23258744  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagtta 279  Q
        ||||||| |  |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| ||||||    
T  23258743 tgtgttaattc-agaatcacaacttaacaaatttttatccctagattgtccgttaagtttaacagcataaataagtcaaagtta 23258661  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 493 - 553
Target Start/End: Original strand, 29434151 - 29434211
Alignment:
Q  493 aaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29434151 aaagaagaattcattacatgaaattgataaccggttataagttttgatggtctcccacctt 29434211  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16881169 - 16881065
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  16881169 attcgattcatctgctcatcgctcattaacaacttgtttcttaattctacgaatgttataaagtttatgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 16881070  T
Q  120 ttgat 124  Q
    |||||    
T  16881069 ttgat 16881065  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 17038859 - 17038755
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||  | ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17038859 attcgattcatctgctcatcgctcattaacaacttgtttcttaattctacgaatgttataaagtttatgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 17038760  T
Q  120 ttgat 124  Q
    |||||    
T  17038759 ttgat 17038755  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16881312 - 16881263
Alignment:
Q  275 agttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatt 324  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  16881312 agttacacgctagtgtcaatagtcatataaaatcttgaatcaattatatt 16881263  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17039002 - 17038953
Alignment:
Q  275 agttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatt 324  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  17039002 agttacacgctagtgtcaatagtcatataaaatcttgaatcaattatatt 17038953  T

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Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9237721 - 9237183
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9237721 attcgattcatctgtacttcactcattagcaacctgtttcttaagtctacgaatgtcacaaagttaacgacgaattaacaaattaacttaggtcaatccc 9237622  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    || || |||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9237621 ttaatcctaagttctcttatctaaccataattccataattccttaggtgaacctataatcatcaaaggttattaagttcgttaattcaattatcacaacc 9237522  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9237521 taacaacgctctatccctagattgtccgttagattgaacaacataaatatgtctgagttacacgctagtgtcaatagtcatataatctcttgaatcaatt 9237422  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcat-aaacaat-agagtttcaggttacataagcatga 417  Q
    |||||  |||||||||||||| || | ||||   | ||  | |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  9237421 atattgggtcagaatcataaaagcgtgaagaatgacttccactgaataaactagattggcattcataaaacagtaagagtttcaggttacataagtatga 9237322  T
Q  418 gc-tagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaa 515  Q
    || || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||||||||| ||    
T  9237321 gcttaatacataatcatctcttgacctaatcacaaaggatttagctactcatggctaaagcataaataactaatgtaaaagaaagcttcattacatg-aa 9237223  T
Q  516 tt--gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  9237222 ttcggataaccggcaatgagttttgatagtcccccacctt 9237183  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Original strand, 6765238 - 6765773
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6765238 attcgaatcatctgcaatttactcattgggcaacctggttcttatgtctacgaatgtcacaaagtaaatgataaattaacatattaacttaggtcaatcc 6765337  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  ||| ||||    
T  6765338 cttgatcctaagtccgcttttctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataattgtcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatctcaac 6765437  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6765438 ctaacaacgttccatccctagattgtccgttagattaaccagcataaatagatccgaggtacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcagt 6765537  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  6765538 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 6765637  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  6765638 ttagtacagaatcatctcttgacctaatcacaacagacttagctactcatggctaaagcataaaccactaatgataaagaagaattcattacatgagatt 6765737  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6765738 gataaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 6765773  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6732006 - 6731471
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6732006 attcgaatcatctgcaatttactcattgggcaacctggttcttatgtctacgaatgtcacaaagtaaatgataaattaacatattaacttaggtcaatcc 6731907  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  ||| ||||    
T  6731906 cttgatcctaagtccgcttttctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataattgtcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatctcaac 6731807  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6731806 ctaacaacgttccatccctagattgtccgttagattaaccagcataaatagatccgaggtacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcagt 6731707  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  6731706 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 6731607  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  6731606 ttagtacaaaatcatctcttgacctaatcacaacagacttagctactcatggctaaagcataaaccactaatgataaagaagaattcattacatgagatt 6731507  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6731506 gataaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 6731471  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 53189904 - 53189369
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattag-caacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcc 118  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  53189904 attcgaatcatctgcaatttactcaatgggcaacctggttcttatatctacgaatgtcacaaagtaaatgatgaattaacacattaacttaggtcaatcc 53189805  T
Q  119 cttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaac 218  Q
    || ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||   |||||  | ||||||||   ||| ||||    
T  53189804 ctcgatcctaagttcgcttttctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctacaattgacaaaggatattaagtccgttaattcataaatctcaac 53189705  T
Q  219 ctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaat 318  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  53189704 ctaacaacgttccatccctagattgtcctttagattgaccagcataaatagatccgagttacacgctactgtcaatagtcatataatctttttaatcaat 53189605  T
Q  319 tatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaatagagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||    
T  53189604 tatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacaagatatactgaataaactagattgacattcataaacgtaagagtttcaggttacatccacatgag 53189505  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53189504 ttaatacagaatcatctcttgacctaatcgcaaaagacttagctactcatggctaaagcataaataactaataataaagaagaattcattacatgaaatt 53189405  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53189404 gataaccggctatgagttttgatggtctcccacctt 53189369  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Original strand, 10558023 - 10558559
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| || || |||||| |  |||||||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  10558023 attcgattcatctgctcatcgctcattagcaacatgtttcttacgtttacgaacgctataaagtttacgacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 10558122  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  10558123 ttgatcctaagccctcttttctgattataattccctaatcccttaggtgaacctatagtcatcaaaggt-tttaagtccgttaattcaagtatcacaacc 10558221  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  10558222 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagagttaaacgctagtgtcagtagtcatatatactctaaaatcaatt 10558321  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||| ||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  10558322 atattgggtcataatcataaaagctttaagaacaatttatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagttgcaggttacataaacatgag 10558421  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  10558422 ctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaaaggatctagctactcatgactaaagcacaaataactaatgtaaaagaaggattcattacatgaaatt 10558521  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    | ||||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  10558522 ggtaaccgaatatgagtttcgatggtctcacaccttct 10558559  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 19193874 - 19193337
Alignment:
Q  20 attcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccc 119  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| || || |||||| |  |||||||  | ||| ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  19193874 attcaattcatctgttcatcactcattagcaacctgtttcttaagtttacgaacgctataaagtttaagacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccc 19193775  T
Q  120 ttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacc 219  Q
    ||||| |||||  | ||| ||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19193774 ttgatcctaagcactcttttctgattataattccataatctcttaggcgaacctataatcatgaaaggt-tttaagtccgttaattcaattatcacaacc 19193676  T
Q  220 taacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||| || ||   ||||  | |||| ||| ||||  ||||| ||    
T  19193675 taacaacgctccatccctagattgtccgttagattgaacagtataaatatgtcagcgttaaacactggtgtcagcattcatctaa-ctctagaatcagtt 19193577  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||| | |||||| | |||| ||||||||||||| | | |||||| || |||||||     ||||    
T  19193576 atattaggtcagaatcataaaagcattaagagtaatttatactgaatagaatagaatgacattcataaagattaagagttacaagttacattgtattgag 19193477  T
Q  419 ct-agtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatt-tagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaa 515  Q
     | ||   | |||||||| |||||||||||||||  | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||    
T  19193476 ttaagattaaaatcatctcttgacctaatcacaatagcttctagctagtcattgctaaagcacaaataactaatatgaaagaaggattcattacatgaaa 19193377  T
Q  516 ttgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
    ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19193376 ttggtaaccagatatgcgttttgatggtctcccaccttct 19193337  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 553
Target Start/End: Original strand, 3164903 - 3165351
Alignment:
Q  106 cttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaatt 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||  || ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  | ||||||    
T  3164903 cttaggtcaatcccttgactcaaaaccctcttttctgattataattccctaattccttaggtgaacctatattcatcaaagct-tttaagtacgttaatt 3165001  T
Q  206 caattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataat 305  Q
      | | |||||||||||||||  || ||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||| |  | | ||||||||||||  |||||||||||||||      
T  3165002 ttagtttcacaacctaacaacgttccatccctatattgtatgttaggttgaacagtataaatacttatgagttacacgctagtgtcaatagtcatatata 3165101  T
Q  306 ctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggt 404  Q
    ||||  ||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||| || |||||||||| | | |||||  || ||    
T  3165102 ctctagaattagttatattgggttagaatcataaatgcattaagaataattaatactgaataaactagaatggcattcataaagattaagagtgacatgt 3165201  T
Q  405 tacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaatt 503  Q
     ||||    | ||| ||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||  || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||    
T  3165202 aacattgtaaagagttagaacaaaatcatctagtgacctagtcacaaaagacttacctattcatggttaaagcacaaataactaatataaaagaaggatt 3165301  T
Q  504 cattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccacctt 553  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3165302 cattacatgaatttgataaccgactatgagtttttatggtctcccacctt 3165351  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 23049023 - 23048685
Alignment:
Q  109 aggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaa 208  Q
    ||||||||||||||| ||  || || ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||||  |    
T  23049023 aggtcaatcccttgactcagagccctcttttctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggttttaaaatccgttaatttta 23048924  T
Q  209 ttatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctc 308  Q
      ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | |||   ||||  ||||||| ||||||    
T  23048923 gaatcacaacctaacaactttccatccctagattgtccgttaaattgaacagcataaatatgtcagagttataagctggtgtcagcagtcatacaatctc 23048824  T
Q  309 ttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttac 407  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |  ||||||| | ||||||| || || | |||||||| |  | | |||||| ||| ||||    
T  23048823 taagatcaattatattgggtcagaatcataaaagcattacgcacaatttatactgaataacct-gaataacattcatgataattcagagttacagattac 23048725  T
Q  408 ataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
    |||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  23048724 atagtcatgagctagaacaaaatcatctatgacctaatca 23048685  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33672297 - 33672078
Alignment:
Q  24 gattcatctgcacttcactcattagc-aacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttg 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| || ||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33672297 gattcatctgcgcttcactcatttggtaacctggttctgatgtctacgaatatcacaaagtgaatgatcaactaacacattaacttaggtcaatcccttg 33672198  T
Q  123 attctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaa 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   |||||  | |||||||||  ||| ||||||||    
T  33672197 atcctaagtccgcttatctaatcataattccctaattccttaggtgaacctataattctcaaaggatattaagtccgttaattcaaagatctcaacctaa 33672098  T
Q  223 caacactctatccctagatt 242  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  33672097 caacgctccatccctagatt 33672078  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 50096725 - 50096387
Alignment:
Q  109 aggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaa 208  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |    
T  50096725 aggtcaatcccttgactcagagccctattttctaattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaatttta 50096627  T
Q  209 ttatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctc 308  Q
    | ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| | |||   ||||  |||| |||||||||    
T  50096626 taatcgcaacctaacaactttccatccctagattgtccgttaaattgaacaacataaataagtctgagttataagctggtgtcagcagtcctataatctc 50096527  T
Q  309 ttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttac 407  Q
    | | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    ||||||| |  |||||||||||| | || |||||||  | | |||| | ||| ||||    
T  50096526 taatattaattatattgagtcagaatcataaaagcattacatgcaatttataccgaataaactagaataactttcataataattaagagctacagattac 50096427  T
Q  408 ataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaatca 447  Q
     |   |||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  50096426 ttggtcatgagctataacagaatcatctatgacctaatca 50096387  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 552
Target Start/End: Original strand, 28716886 - 28717276
Alignment:
Q  162 ttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagc 261  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||  | | ||||||| |   |||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||   |||||||     
T  28716886 ttaggtgaacctaaaaccatcaaaggtttttac-cacattaattctaaagtcacaaccaaacaacgttccatccctagattgtctgttaagatgaacagt 28716984  T
Q  262 ataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaat 361  Q
    ||||  | ||| |||||| | |||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||  |||||| |     
T  28716985 ataataa-gtcaaagttataagctggtgtcaatagtcatataatctctagaatcaattatattgggttagaatcataaaagcattaagagaaatttatac 28717083  T
Q  362 tgaataaactagattgacattcataaaca-atagagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttag 459  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||  ||||||||    ||| |||||| ||||||||||||   |||||||||| || | |  |||    
T  28717084 taaataaactagaataacattcataaagatttagagttataggttacactgtcataagctagaacagaatcatctagggacctaatcataaagaacctag 28717183  T
Q  460 ctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccacct 552  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  28717184 atactcatggataaagcacaaataactaatacaaaagtaggattcattacatgaatttgataaccggctatgagttttgacggtcttccacct 28717276  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 347
Target Start/End: Original strand, 17544878 - 17545115
Alignment:
Q  109 aggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaa 208  Q
    ||||||||||||||| |   || || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  |    
T  17544878 aggtcaatcccttgacttagagccctcttttctaattataattccctaattccttaagtgaacctataatcatcaaaggt-tttaagtccgttaatttta 17544976  T
Q  209 ttatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctc 308  Q
      |||||||| |||||||  || ||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||   ||||| |||| |||||||||    
T  17544977 gaatcacaacataacaactttccatctctagattgtcagttaaattgaacaggataaataagtctgagttataagctggtgtcaacagtcctataatctc 17545076  T
Q  309 ttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcatta 347  Q
    | ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  17545077 taaaatcaattatattgggtcataatcataaaagcatta 17545115  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 43683564 - 43683217
Alignment:
Q  96 aacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaag 195  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| ||  || || ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43683564 aacaaaatagctcaggtcaatcccttgactcagaggcctcttctctgattataattccctaattccttaggtgaacctataatcatcaaaggt-tttaag 43683466  T
Q  196 ctctttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaata 295  Q
      | ||||||  |  |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| | || | ||||| | ||    ||||  |    
T  43683465 tccgttaattttagaatcacaacctaacaattttctatccctagatcatccgttaagttgaacagtataaataggtatgagttataagcgggtgtcagca 43683366  T
Q  296 gtcatataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaaca-atag 394  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||| | || |||||| | ||||||||||  | | ||||||||||| |  |||    
T  43683365 gtcctataatctctaagatcaattatattgggtcaaaattataaaagcatt-acat-aatttatactgaataaactgaaataacattcataaaaatttag 43683268  T
Q  395 agtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatctttgacctaat 445  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  43683267 agttacagattacatgatcatgagctagaacagaatcatctatgacctaat 43683217  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 157231 - 156762
Alignment:
Q  22 tcgattcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatccctt 121  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| || || ||| ||    |||||||  | ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  157231 tcgattcatctgttcatcactcattagcaacttgtttcttaagtttaccaacactataaagtttaagacaaattaacaaaatagcttaggtcaatccctt 157132  T
Q  122 gattctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaaccta 221  Q
    ||| | ||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||  | |||||| || ||||||||||||    
T  157131 gatccaaagccctcttttctgattataattccctaatcccttagctgaacctataatcttaaaaggt-tttaagtccgttaatttaagtatcacaaccta 157033  T
Q  222 acaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtca--atagtcatataatctcttaaatcaatt 319  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||  ||||||| ||||  ||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  157032 acaacactccatccctagattgtccgttagattgaacacaataaatatttccgagttacaagctagtgtcaatatagtcatatatactcttgaatcagtt 156933  T
Q  320 atatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgag 418  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||| |  ||||| ||| ||||||    
T  156932 atattgggtcagaatcataaaagcattaacaacaatttatactgaataaactagaatgacattcataatgattaagagttactagttacgtaaacatgag 156833  T
Q  419 ctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaa 488  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  156832 ctaaaacagaatcatctcttgacctaaccagaaaggatctagctactcatggctaaagcacaaataactaa 156762  T

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Target: scaffold0146 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 35968 - 35433
Alignment:
Q  25 attcatctgcacttcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgat 124  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || || || || ||  ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||| | |||||||||||    
T  35968 attcatctgttcatcactcattagcaacctctttcttaagtttatgagtgctataaagttaacgacaaattaacaaaatagcttagataaatcccttgat 35869  T
Q  125 tctaagtccgcttatctaatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggtatttaagctctttaattcaattatcacaacctaaca 224  Q
     ||||| || |||  || || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||  |||| | | |||||| ||   |||||||||||||    
T  35868 cctaagccctctttcctgattataattctctaattcctcaggtgaacctatattcattcaaggt--ttaaacacattaatttaaaagtcacaacctaaca 35771  T
Q  225 acactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtcatataatctcttaaatcaattatatt 324  Q
    ||  || || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||   ||||| |||||   ||||  |||||| ||  ||||  |||| ||||||||    
T  35770 acgttccattcctagattgtccgttaagttgaacagtataaatatgttagagttaaacgctggtgtcagcagtcatctatgctctagaatcgattatatt 35671  T
Q  325 tagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagt 423  Q
      |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  35670 gggtcagaatcataaaagcattaagagcgatttatactgaataaactagaatgacattcataaatattaagagttacgggttacataaacatgagctaga 35571  T
Q  424 acagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaat-----aactaacgataaagaagaattcattacatgtaatt 517  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  35570 acaaaatcatctcttgacctaatcacaatggatctagctactcatggctaaagcacaaatataaaaactaatataaaagaagaattcattacatgaaatt 35471  T
Q  518 gataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
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T  35470 ggtaaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 35433  T

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Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 493 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 29487 - 29425
Alignment:
Q  493 aaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
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T  29487 aaagaagaattcattacatgaaattggtaaccggatatgagttttgatggtctcccaccttct 29425  T

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Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37672 - 37595
Alignment:
Q  38 tcactcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaa 115  Q
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T  37672 tcactcattagcaacctgtttcttaagtttatgaacgctataaagttaacgacaaatgaacaaaatagcttaggtcaa 37595  T

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Target: scaffold2047 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold2047
Description:

Target: scaffold2047; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1078 - 890
Alignment:
Q  200 ttaattcaattatcacaacctaacaacactctatccctagattgtccgttagattgaacagcataaacatgtctaagttacacgctacggtcaatagtca 299  Q
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T  1078 ttaattcaattatctcaacctaacaacgctccgtccctaaattgtccgttagattgaacaatatagatatttccgagttacacgctagtgtcaatagtca 979  T
Q  300 tataatctcttaaatcaattatatttagtcagaatcataaaggcattaagatcaatttaaattgaataaactagattgacattcataaa 388  Q
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T  978 tataaactcttgaatcagttatattgggtcagaatcataaaagcattaagaacgatttatactgaataaactagaatgacattcataaa 890  T

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Target: scaffold2047; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 130
Target Start/End: Original strand, 770 - 859
Alignment:
Q  41 ctcattagcaacctgtttcctatgtctacgaatgtcataaagtcaacgacgaatcaacaaattaacttaggtcaatcccttgattctaag 130  Q
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T  770 ctcattagcaacctgtttcttaagtttacaaatgttataaagttaacgacaaattaacaaaatatcttaggtcaatctcttgatcctaag 859  T

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Target: scaffold1206 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1206
Description:

Target: scaffold1206; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 1955 - 1764
Alignment:
Q  366 taaactagattgacattcataaacaat-agagtttcaggttacataagcatgagctagtacagaatcatct-ttgacctaatcacaacggatttagctac 463  Q
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T  1955 taaactagaatgacattcataaatatttagagttacatgttacataaacatgagctagaacaaaatcatctcttgacctaatcacaatggatctaactac 1856  T
Q  464 tcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaattgataaccggctatgagttttgattgtctcccaccttct 555  Q
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T  1855 tcatggctaaagcacaaataactaatataaaagaaggattcattacatgaaattggcaaccagatatgagttttgatggtctcccaccttct 1764  T

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Target: scaffold0050 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 549
Target Start/End: Original strand, 41500 - 41632
Alignment:
Q  417 agctagtacagaatcatctttgacctaatcacaacggatttagctactcatggctaaagcacaaataactaacgataaagaagaattcattacatgtaat 516  Q
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T  41500 agctagaacataatcatctatgacctaatcacaatggatttagttactcatgactaaagcataaacaactagtaacaaaggaggattcatttcataaatt 41599  T
Q  517 tgataaccggctatgagttttgattgtctccca 549  Q
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T  41600 ggatgactggctatgagttttgatggtctccca 41632  T

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Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 188
Target Start/End: Original strand, 38779 - 38826
Alignment:
Q  141 taatcataattccctaatcccttaggtgaacctataatcatcaaaggt 188  Q
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T  38779 taattataattctctaatcccttaggtgaacatataatcatcaaaggt 38826  T

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