View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7337_high_3 (Length: 800)

Name: NF7337_high_3
Description: NF7337
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7337_high_3
NF7337_high_3
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (15-784)||(26707724-26708496)
chr1 (97-784)||(33494727-33495417)
chr1 (15-784)||(15714280-15715049)
chr1 (17-627)||(40275960-40276573)
chr1 (15-634)||(26026497-26027115)
chr1 (15-617)||(22577907-22578512)
chr1 (17-718)||(27421341-27422027)
chr1 (54-533)||(29543231-29543705)
chr1 (15-459)||(18536752-18537179)
chr1 (32-410)||(3618495-3618871)
chr1 (17-459)||(37360733-37361164)
chr1 (17-444)||(31094723-31095139)
chr1 (17-459)||(11658180-11658611)
chr1 (510-733)||(11657942-11658165)
chr1 (510-733)||(37361179-37361405)
chr1 (510-733)||(31095169-31095388)
chr1 (539-719)||(29533014-29533188)
chr1 (578-730)||(18537250-18537404)
chr1 (15-69)||(33494657-33494713)
chr1 (367-410)||(3618874-3618917)
chr1 (510-557)||(18537199-18537246)
chr1 (721-752)||(27422052-27422083)
chr1 (681-719)||(26026441-26026479)
chr1 (171-264)||(27172888-27172982)
chr1 (251-293)||(27315604-27315646)
chr1 (678-724)||(40276606-40276651)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (15-784)||(13982349-13983119)
chr3 (15-784)||(23342034-23342803)
chr3 (15-784)||(2170383-2171152)
chr3 (15-784)||(13988490-13989259)
chr3 (41-784)||(9726424-9727164)
chr3 (17-759)||(13924130-13924863)
chr3 (17-724)||(7870861-7871567)
chr3 (17-719)||(44123595-44124283)
chr3 (18-459)||(21881368-21881798)
chr3 (17-459)||(49488508-49488940)
chr3 (17-459)||(15754280-15754711)
chr3 (15-226)||(10935316-10935529)
chr3 (510-733)||(49488960-49489182)
chr3 (65-458)||(20452640-20453033)
chr3 (516-733)||(21881131-21881347)
chr3 (15-214)||(17031307-17031509)
chr3 (510-733)||(15754726-15754955)
chr3 (510-640)||(20451987-20452116)
chr3 (194-276)||(4771696-4771778)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (15-784)||(22433597-22434368)
chr2 (15-784)||(7911695-7912471)
chr2 (15-784)||(633940-634709)
chr2 (15-784)||(14896441-14897210)
chr2 (15-784)||(22428004-22428773)
chr2 (15-784)||(1523386-1524157)
chr2 (15-784)||(14888375-14889144)
chr2 (15-784)||(43774654-43775418)
chr2 (17-716)||(7386556-7387244)
chr2 (392-784)||(26696875-26697269)
chr2 (17-745)||(16445101-16445809)
chr2 (15-704)||(19087174-19087860)
chr2 (17-759)||(21291328-21292037)
chr2 (19-286)||(26697265-26697533)
chr2 (17-459)||(25446843-25447274)
chr2 (17-459)||(43289173-43289604)
chr2 (17-373)||(25451223-25451566)
chr2 (17-459)||(19439319-19439748)
chr2 (510-733)||(43289619-43289842)
chr2 (17-280)||(25450345-25450596)
chr2 (510-733)||(19439763-19439988)
chr2 (461-719)||(25228694-25228942)
chr2 (17-296)||(25228963-25229225)
chr2 (516-733)||(25447295-25447511)
chr2 (549-733)||(25451660-25451843)
chr2 (54-126)||(11310311-11310383)
chr2 (680-732)||(19910901-19910953)
chr2 (542-590)||(14190627-14190675)
chr2 (732-784)||(19087125-19087177)
chr2 (251-290)||(9923771-9923810)
chr2 (724-759)||(19910865-19910900)
chr2 (700-750)||(14190575-14190625)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (15-784)||(42206566-42207344)
chr7 (15-784)||(16646081-16646850)
chr7 (15-784)||(32146143-32146905)
chr7 (15-784)||(17620442-17621211)
chr7 (15-461)||(44658708-44659156)
chr7 (255-784)||(572623-573147)
chr7 (17-634)||(26458341-26458961)
chr7 (392-784)||(42164264-42164658)
chr7 (33-635)||(34324147-34324735)
chr7 (477-784)||(25497082-25497389)
chr7 (17-562)||(20119014-20119563)
chr7 (15-286)||(42163996-42164268)
chr7 (15-214)||(572418-572622)
chr7 (18-459)||(342078-342508)
chr7 (17-459)||(8246053-8246484)
chr7 (510-784)||(44658102-44658370)
chr7 (516-733)||(342529-342745)
chr7 (526-733)||(8245815-8246022)
chr7 (19-100)||(25497393-25497474)
chr7 (750-782)||(22478182-22478214)
chr7 (592-640)||(25674802-25674850)
chr7 (149-214)||(3067269-3067335)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (15-784)||(30959256-30960016)
chr5 (15-784)||(1533400-1534166)
chr5 (15-784)||(28368714-28369483)
chr5 (79-759)||(31105718-31106389)
chr5 (20-784)||(17935854-17936616)
chr5 (55-724)||(18084974-18085629)
chr5 (17-459)||(21172970-21173401)
chr5 (17-459)||(35266325-35266756)
chr5 (17-444)||(16671466-16671882)
chr5 (17-459)||(23055160-23055589)
chr5 (510-733)||(21173416-21173640)
chr5 (155-459)||(26461094-26461401)
chr5 (510-733)||(23055604-23055827)
chr5 (17-214)||(25108317-25108516)
chr5 (17-214)||(25167409-25167608)
chr5 (510-733)||(35266771-35266994)
chr5 (17-214)||(25111311-25111507)
chr5 (17-214)||(25170402-25170598)
chr5 (510-632)||(26461421-26461543)
chr5 (255-353)||(18786545-18786643)
chr5 (738-784)||(16630399-16630445)
chr5 (691-733)||(26461566-26461608)
chr5 (54-95)||(26461046-26461087)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (15-784)||(14850305-14851070)
chr6 (15-613)||(6930884-6931486)
chr6 (54-634)||(17271888-17272469)
chr6 (17-582)||(14462458-14463022)
chr6 (60-471)||(19558722-19559122)
chr6 (605-784)||(6928664-6928843)
chr6 (431-692)||(11305753-11306009)
chr6 (184-304)||(11306238-11306358)
chr6 (658-719)||(25394587-25394648)
chr6 (313-400)||(11306014-11306100)
chr6 (743-784)||(14463033-14463074)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-784)||(347405-348174)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (15-784)||(20194325-20195094)
chr4 (55-724)||(2925940-2926596)
chr4 (55-724)||(12750625-12751282)
chr4 (392-784)||(53979856-53980250)
chr4 (17-722)||(13997674-13998357)
chr4 (55-781)||(53527306-53528031)
chr4 (15-286)||(53980246-53980518)
chr4 (63-460)||(19568434-19568833)
chr4 (276-736)||(26994907-26995346)
chr4 (17-459)||(23192037-23192462)
chr4 (17-459)||(25692956-25693381)
chr4 (17-459)||(12660970-12661401)
chr4 (17-459)||(16330416-16330847)
chr4 (17-454)||(1892334-1892761)
chr4 (17-280)||(22747146-22747401)
chr4 (17-444)||(30675484-30675901)
chr4 (510-733)||(30675931-30676154)
chr4 (510-733)||(12661416-12661639)
chr4 (511-733)||(1892783-1893004)
chr4 (510-733)||(23191794-23192017)
chr4 (510-733)||(25693401-25693623)
chr4 (510-730)||(16330862-16331085)
chr4 (512-735)||(19568200-19568422)
chr4 (92-429)||(25148985-25149326)
chr4 (54-238)||(26995353-26995535)
chr4 (247-357)||(47592147-47592257)
chr4 (523-615)||(25148827-25148920)
chr4 (740-781)||(19568143-19568184)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (250-784)||(16335-16871)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (21-784)||(8507816-8508572)
chr8 (74-634)||(10737358-10737917)
chr8 (17-459)||(30716000-30716431)
chr8 (620-784)||(24048006-24048170)
chr8 (420-720)||(28349623-28349920)
chr8 (510-733)||(30716446-30716669)
chr8 (66-370)||(29541405-29541694)
chr8 (510-733)||(30724169-30724388)
chr8 (204-386)||(30723898-30724080)
chr8 (510-635)||(29541178-29541302)
chr8 (663-759)||(10737221-10737317)
chr8 (17-113)||(30723778-30723877)
chr8 (70-118)||(11686116-11686164)
chr8 (312-373)||(2316656-2316717)
[»] scaffold0062 (3 HSPs)
scaffold0062 (17-714)||(27793-28484)
scaffold0062 (17-714)||(17625-18316)
scaffold0062 (17-714)||(37959-38649)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (17-565)||(110835-111384)
scaffold0020 (727-784)||(110688-110745)
scaffold0020 (597-691)||(110743-110837)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (18-444)||(9972-10390)
scaffold0102 (534-635)||(9861-9962)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (17-459)||(109819-110250)
scaffold0014 (510-733)||(109581-109804)
[»] scaffold0248 (1 HSPs)
scaffold0248 (577-739)||(17265-17426)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 681; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 681; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 26707724 - 26708496
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707724 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 26707823  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaa-ccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26707824 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaaccaaaccatcaattgataattagcct 26707923  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26707924 actaggcagtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaatgcat 26708023  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattca-tttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26708024 tatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcactttagatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgatatattaagaggag 26708123  T
Q  413 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaa-ttgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26708124 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaaattgagcttataaggcatgatctcataacc 26708223  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26708224 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgatcatatg 26708323  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26708324 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 26708423  T
Q  712 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26708424 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 26708496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 784
Target Start/End: Original strand, 33494727 - 33495417
Alignment:
Q  97 aagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattg-gaaaaccaaacca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33494727 aagagacaataatatttcctttcaaataatttatttaaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgtgaaaatcaaacca 33494826  T
Q  196 tcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttca 295  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33494827 tcaattgataatcatcctactaggctataaacaagctggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttca 33494926  T
Q  296 atatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaa 395  Q
    | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33494927 agatttatcaaaatgcattatattgaagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaa 33495026  T
Q  396 tgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagcttata 493  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  33495027 tgatagattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtctata 33495126  T
Q  494 aggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatc 593  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33495127 aggcattatctcataaccaaaatagagtttataagatatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatc 33495226  T
Q  594 catttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactctta 693  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33495227 catttttatgatcatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttg 33495326  T
Q  694 gtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33495327 gtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 33495417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 15715049 - 15714280
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15715049 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 15714950  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15714949 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 15714850  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15714849 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 15714750  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714749 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 15714650  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  15714649 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 15714550  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  15714549 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 15714451  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714450 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 15714357  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15714356 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 15714280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 627
Target Start/End: Original strand, 40275960 - 40276573
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40275960 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatttc 40276059  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaa--ccaaaccatcaattgataatcagcc 212  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  40276060 ctttttaataatttatttaaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttatcatctccccctaatattggaaaaaactaatccatcaattgataatcagcc 40276158  T
Q  213 tattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgca 312  Q
    || | ||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  | ||||    
T  40276159 tactgggctgtaaataagatggcttagcacaattaatgatagatggagattcatttcaaatatattgtcccaatattctttcaagatttatcttagtgca 40276258  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 412  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |    
T  40276259 ttatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaaatccacttagatgagaaatgccaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaaaggggg 40276357  T
Q  413 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataac 510  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | || | || | ||||    
T  40276358 gacatatatatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagtgtttatatgacaagctctc-taac 40276456  T
Q  511 caaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatat 610  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  40276457 caaactagagtttataaggtatggtctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatat 40276556  T
Q  611 gctaccagctgttcaat 627  Q
    |||| ||||||||||||    
T  40276557 gctatcagctgttcaat 40276573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 15 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 26027115 - 26026497
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||    
T  26027115 atggacatctatttcgtttggagcattaacaattgatatttgatttgtttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaatatgagac--taatatt 26027018  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctc--cccctaatattg-gaaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||    
T  26027017 ttctttcacataatttatttgaacttcaggttcaca-tttttagctgcttattatctctccccctaatattgagaaaattaatccatcaattgataatca 26026919  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
     |||| | | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |    
T  26026918 acctactggactataaataagttggctcaatacaattaatgatagatggagattcatatcaaatatatttttctaatattctttcaatatttttcttagt 26026819  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26026818 gcattatattggagtaattgtgatatacacaacacatccaaaa-tccacttggatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaaggg 26026720  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataa 509  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||    
T  26026719 gatgacttatatatagtaatttgttggcctgatgcaaatcaatatctgaa--caagattattgatttccaaactagagtttataagacatggtctcataa 26026622  T
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26026621 ccaaactagagtttataaggtatgatatgataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcata 26026522  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatt 634  Q
    |||||| || |||||||||||||||    
T  26026521 tgctactaggtgttcaatatcaatt 26026497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 617
Target Start/End: Original strand, 22577907 - 22578512
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  22577907 atggacatatatttcgtttggagcattagcagctgatatttgatttgtttacatttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgaggcaatactatt 22578006  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |    
T  22578007 tcctttcaaataatttatttgaactttatgttcaca-tttttagctgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccattaattgataatcatc 22578105  T
Q  212 ctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgc 311  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||  | |||    
T  22578106 ctactgggttgtaaacaagttggctcagtacaattaatgatagagggagattcgtatcaaatatatcttctcattattctttcaaaatttatcttagtgc 22578205  T
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggga 411  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || | || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  22578206 attatattggagcaactgtgatatacacaacacatccacaa-tccacttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaaggaga 22578304  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa--tacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataa 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||    
T  22578305 ggacttatatatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagagtttataagacatggtctcataa 22578404  T
Q  510 ccaaaa-tagagtttataaggtatggtctcataagtat----caatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatga 604  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||     || |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22578405 ccaaaactagagtttataaggtatggtctcataagtatatatcaatcatacaatt-----taaacgtctaaagaacggatctccaagcccatttttatga 22578499  T
Q  605 acatatgctacca 617  Q
      |||||||||||    
T  22578500 gtatatgctacca 22578512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 718
Target Start/End: Original strand, 27421341 - 27422027
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27421341 ggacatatatttcatttggagcattagcagctgatatttgatgtatttaactttgcaaatgag--atattttgaggatcaagatgagacaataatatttc 27421438  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttact---atctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  |||| | |||| || |||||  |   ||||||||       | ||| || || ||  |||||||||||||      
T  27421439 ctttcaaataatttatttgaaccacatattcata-ttttcagttgcttgttgatatctcccc-------tagaatactaatcccccaattgataatcact 27421530  T
Q  212 ctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgc 311  Q
    ||| | |||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||    
T  27421531 ctact-ggctataaataagttaactcaacacaattaatgatagatggagattcatatcaaatatatttttccaatattctttcaaaatttatcttagtgc 27421629  T
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggga 411  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27421630 attatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaaatccacttggataagaaatattaggttgttaacctaaaatcaatgataaattaagggga 27421728  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |       || |||||||||| ||| |||| ||  ||| || |||||||    
T  27421729 tgacttatatatagtaatgtgttggcttgatgtaaatcaatatctcaacata-------tgattcccaaaatagagtttatcagatatggtctcataacc 27421821  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  27421822 aaactggagtttataaggtatgttcttataattatcaatcatacaattaactttagatgtctaaagaatgaattttcaagtccatttttatgagcatatg 27421921  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||   ||||||||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27421922 ttaccaactgttcaatgtcaatttcaattgacgaatgatacttattaaatgctttctgaaaaattcagaaaataaactcttagtcaaa-ttgttgacata 27422020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 54 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 29543705 - 29543231
Alignment:
Q  54 gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttt 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  29543705 gatttatttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaagttcaca-ttct 29543607  T
Q  154 tagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgat 252  Q
     | ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |  ||||||||||||    
T  29543606 caactgcttattatctcccccaaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcctactaggatgtaaataaattggcttagcacaattaatgat 29543507  T
Q  253 agatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaa 352  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| |||    
T  29543506 agatggagattcatataaaatatattttcccaatattctttcaatatttatcttagtgcattatattggagcaattgttatatacacaacaaatcc-aaa 29543408  T
Q  353 attcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaat 452  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |  |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29543407 attcacttggatgagaaatattaggttgttaacctaaaatcaatgttagattaagggggg--cttatatataataatttgttggcttgatgcagatcaat 29543310  T
Q  453 atctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatg 533  Q
    ||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29543309 atctca--acaagattattgatttccaaaatagagtttataagacatggtctaataaccaaactagagtttataaggtatg 29543231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 459
Target Start/End: Original strand, 18536752 - 18537179
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18536752 atggacatctatttcgattggagcattagcagctacttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatat 18536851  T
Q  112 ttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||    
T  18536852 tttctttcaaataattcatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagc 18536936  T
Q  212 ctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgc 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||    
T  18536937 ctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagatttttccaatattctttcaagatctatctaagtgc 18537036  T
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggga 411  Q
    |||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||| | ||||||||||| |||  ||| |     ||||||||    
T  18537037 attatattggagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagacaagaaatattaagttgttaacctaaaataaatta-----taagggga 18537131  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
      |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  18537132 cgacttacatatggtaacttgttggcttgatgcggatcaatatatcaa 18537179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 410
Target Start/End: Original strand, 3618495 - 3618871
Alignment:
Q  32 ttggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataattta 129  Q
    ||||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3618495 ttggagcattagcagctgatattcaatttgtttaactttgcaaatcagttatattttgaggatcaagatgagacgataatatttcctttcaaataattta 3618594  T
Q  130 tttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccc-taatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaac 227  Q
    ||| | |  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||| || || |||||     
T  3618595 tttaaccaacaagttcacaatttttagctgcttattatctcccccctaataatggaaaaactaatccatcaattgataattagcctactaagccgtaaaa 3618694  T
Q  228 aagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaat 327  Q
    |  |||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||| ||||||     
T  3618695 a--ttggctcaata----taatgatagatgaagattcatatcaaatatattttctcaatattctttcaggatttatcttagtgcattatattggagcaaa 3618788  T
Q  328 tgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggg 410  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  3618789 tgtgacatacagaacacatctaaaaatttatttaaatgagaaatatcagattgttaacctaaaaactatgataaattaagggg 3618871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 37360733 - 37361164
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37360733 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 37360832  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  37360833 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-atttttagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 37360917  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |  |||||  ||| || ||||    
T  37360918 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttctcaatattctat-tatattcaatctaagtgca 37361016  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  37361017 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 37361116  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  37361117 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 37361164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 31094723 - 31095139
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31094723 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 31094822  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |              ||||||||||    
T  31094823 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttctca-ttttcagctgcttattctctcccccaaatattgggaaaac--------------taatcagcct 31094907  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  31094908 actaggctgtaaacaagttggctcaatataatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttaacaatattctatc-atattcaatctaagtgca 31095006  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||| ||    
T  31095007 ttatattggagcaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttagatgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataaggtga 31095106  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgc 444  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  31095107 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgc 31095139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11658611 - 11658180
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11658611 ggacatctattttgtttggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacagtaatattt 11658512  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  11658511 tctttcaaataattcatttgaacttcatgttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 11658427  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||  ||| || ||||    
T  11658426 actaggctgtaaacaagttggctcaatacattttataatagatgaagattcatatcatatagattttcccaatattttatc-atattcaatctaagtgca 11658328  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  11658327 ttatattggagtaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagttgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 11658228  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  11658227 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 11658180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 11658165 - 11657942
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  11658165 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 11658067  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11658066 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 11657967  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  11657966 aagataatcgcacaaacttctggtt 11657942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 37361179 - 37361405
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  37361179 ccaaagtagagttttgaaggtatgatctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 37361277  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-----ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgt 704  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||      ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37361278 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttttttgaaaagttcagaaaataaactctt-gtcaaatttgt 37361376  T
Q  705 tgacataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  37361377 tgacaagataatcgcacacacttctggtt 37361405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 31095169 - 31095388
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  31095169 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacttctaaggaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 31095267  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||  || |||| ||||||||||| ||||     || |||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31095268 tgctaaaagttgtttaatatcaatttcaatt----gataatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 31095363  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  31095364 aagataatcgcacaaacttctggtt 31095388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 539 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 29533188 - 29533014
Alignment:
Q  539 ataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaa 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||   |    
T  29533188 ataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcgagtccatttttatgagcatatgctactagttgttcaatatcaattgaca 29533089  T
Q  639 ttagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 719  Q
          |||||||| | | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  29533088 ------aatgatacttatcaaatgatttctaaaaagtttagaaaataaactctttgttaaatctgttgacataataatctc 29533014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 730
Target Start/End: Original strand, 18537250 - 18537404
Alignment:
Q  578 aatggatctccaaatccatttttatgaa--catatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagt 675  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    |||||||| | | ||||||||| |||||| |    
T  18537250 aatggatcttcaagtccattttttttaaagcatatgctagcagctattcaatatcagtttcaattgacaaatgatacttatcaaatgctttctgaaaaat 18537349  T
Q  676 ttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctg 730  Q
    | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537350 tcagaaaataaattctttgtcaaattcgttgacataataatctcacaaacttctg 18537404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 33494657 - 33494713
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaata--agatttgtttacctttg 69  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33494657 atggacatctatttcgtttggagcattagcagctaatatttgatttgtttacctttg 33494713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 410
Target Start/End: Original strand, 3618874 - 3618917
Alignment:
Q  367 gaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggg 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  3618874 gaaatatcaggttgttaacctaaaaactatgataaattaagggg 3618917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 557
Target Start/End: Original strand, 18537199 - 18537246
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaa 557  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18537199 ccaaagtagagtttattatgtatggtttcataagtatcaatcatacaa 18537246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 752
Target Start/End: Original strand, 27422052 - 27422083
Alignment:
Q  721 caaacttctggttgtgaatatacatgtgatca 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27422052 caaacttctggttgtgaatatacatgtgatca 27422083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 26026479 - 26026441
Alignment:
Q  681 aaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 719  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26026479 aaataaactcttagtgaaatttgctgacataataatctc 26026441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Original strand, 27172888 - 27172982
Alignment:
Q  171 cccctaatattg-gaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagattt 264  Q
    |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| | || | | ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27172888 cccctaatattgagaaaactaatctatcaattgataatcaacttactcgactgtaaaaaagttgattcaatacaatttatgatatatggaaattt 27172982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27315646 - 27315604
Alignment:
Q  251 atagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattcttt 293  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27315646 atagatagagattcatatcaaatatattttcccaatattcttt 27315604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 678 - 724
Target Start/End: Original strand, 40276606 - 40276651
Alignment:
Q  678 agaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaa 724  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  40276606 agaaaataaactcttagtcaaa-ttgttgacctaatactctcacaaa 40276651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 644; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 644; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 13982349 - 13983119
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13982349 atggacatctatttcggttggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttt 13982448  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13982449 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttaactgcttactatctctccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 13982548  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||    
T  13982549 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatgaagatttatatcaaatatatttttccaatattcttttaagatttatcaaaatgaat 13982648  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13982649 tatattggagcaattgtgacatacgcaacacatccaaaa-ttcacttagatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 13982747  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13982748 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatctcataaccaa 13982847  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatcca-tttttatgaacatatgc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  13982848 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtgtaaagaatggatctccaaattcattttttatgatcatctgc 13982947  T
Q  613 taccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataa 712  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13982948 taacagttgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataa 13983047  T
Q  713 taatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13983048 taatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgtatcgattcaaatcatataat 13983119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 23342803 - 23342034
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23342803 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 23342704  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23342703 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 23342604  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  23342603 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 23342504  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23342503 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 23342404  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  23342403 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 23342304  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  23342303 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 23342205  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23342204 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 23342111  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23342110 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 23342034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 2170383 - 2171152
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2170383 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 2170482  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2170483 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 2170582  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  2170583 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatccaaat 2170682  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2170683 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 2170782  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  2170783 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 2170882  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  2170883 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 2170981  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2170982 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 2171075  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171076 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 2171152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 13989259 - 13988490
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989259 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 13989160  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13989159 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccgtaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 13989060  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13989059 gcctactaggatgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 13988960  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988959 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 13988860  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  13988859 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 13988760  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  13988759 aaccaaaatagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 13988661  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988660 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 13988567  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13988566 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 13988490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 784
Target Start/End: Original strand, 9726424 - 9727164
Alignment:
Q  41 tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9726424 tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttaaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttca 9726523  T
Q  141 ggttcacaattttt-agctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctca 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9726524 ggttcacaattttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctactaggctgtaaacaagttggctca 9726623  T
Q  239 atacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacataca 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9726624 atacaattaaagatagatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaatgcattatattggagcaattgtgacataca 9726723  T
Q  339 caacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggct 438  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9726724 taacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggtgagaaattacatatagtaatgtgttggct 9726823  T
Q  439 tgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtc 536  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9726824 tgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtctataaggcatgatctcataaccaaaacagagtatataaggtatgttc 9726923  T
Q  537 tcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttg 636  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||||||      ||||||||||||||||     
T  9726924 tgataagtatcaatcatacaattaactttaggcgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagcatatgct------tgttcaatatcaatttc 9727016  T
Q  637 aattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtg 736  Q
    ||||    |||||||  | | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9727017 aattgaaaaatgatagttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaaaataatctcacaaacttctggttgtg 9727116  T
Q  737 aatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9727117 aatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 9727164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 13924863 - 13924130
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||   ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13924863 ggacatatatttcatttggagcattagcagttgatatttgatgtatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttc 13924764  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13924763 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctcccc-taatatcgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 13924666  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||  | |||||    
T  13924665 actaggttgtaaataagttagctcagtacagttaatgatggatgaatattcatatcaaatattttttctcaatattctttcgagatttatcgtagtgcat 13924566  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13924565 tatattggagcaattgtgatatacacaacacatccaaacatccactaagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgataaattaaggggaga 13924466  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  || ||| ||||||||||| || ||| ||| |||| || |||||||||    
T  13924465 acttatgtatagtattgtgttggcttgatgcgaatcaatatctca--acaa-cttgttgattcccaaaatttagtttaaaagacatggtctcataaccaa 13924369  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13924368 gatagagtttataaggcatggtctgataattatcaattatacaattaactttagacgtctaaaaaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgct 13924269  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    ||  | | |||||||||||||   |      |||||| | | | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13924268 acgggttattcaatatcaattgaca------aatgatgcttatcaaatgctttctgaaaagttcttaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 13924175  T
Q  714 aatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13924174 aatctcacaaacttctggttgtg-atatacatgtgatcatttagtt 13924130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 724
Target Start/End: Original strand, 7870861 - 7871567
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7870861 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaggagacaataatatttc 7870960  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7870961 ctttctaataatttatttgaatttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctacccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 7871059  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    ||| | || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  7871060 attggactataaataagttggctcaacataattaatgatagatggagattcatatccaatatattttcccaatattctttcaagatttatcttagtgcat 7871159  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    ||||||  ||||||||| | | ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7871160 tatattgaagcaattgtaataaacacaacacatcc-aaaatccaatttgatgagaaatattaggttgttagcctaaaaccaatgatagattaaggggaga 7871258  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| ||| |||||||||  ||  |||||||  |||  | |||||||    
T  7871259 actt--atatagtgatgtgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacatgcaatattgttgattcccaaaa--gattttataagatatggcctcataacc 7871354  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  7871355 aaattcgagtttattaggtatggtctcataactatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatg 7871454  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactc-ttagtcaaatttgttgacat 710  Q
    ||| || ||||||||| | ||||| || |   ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  7871455 ctatcaactgttcaatgttaatttcaactgacgaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaactctttagtcaaa-atgttgatct 7871553  T
Q  711 aataatctcacaaa 724  Q
    ||||||||||||||    
T  7871554 aataatctcacaaa 7871567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 719
Target Start/End: Original strand, 44123595 - 44124283
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44123595 ggacatctatttcatttggagcattaacagctgatattcgatttatttaactttgcaaatgagttatatcgtgaggatcaagatgagacaataatatttc 44123694  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||| |||||      ||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  44123695 ctttcaaataatttatttgaacttcaagttcaca-ttctcagctgcttattatatcccc------ttggaaaaaataatccatcaattgataatcagcct 44123787  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | | | ||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  44123788 actggactgtaaataagttgaatcagcacaattaatgatagatggagattcatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcttagtgcat 44123887  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |     
T  44123888 tatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaatttcacttggatgagaaatattaggttgttaacctgaaaccaatgatagattaagggg-gg 44123985  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  44123986 acttatatatagtaatttgttggcttgatgcagatcaatatctca--acaagattattgattttcaaaatagagtttataagacatggtctcataaccaa 44124083  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
    | |||||||||||||  ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44124084 actagagtttataagacatgatatgataagtatcaattatacaattaacattagacgtctaaataatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgct 44124183  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    || || |||||||||||||||   |      |||||||  | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44124184 actagttgttcaatatcaattgaca------aatgatatttatcaaatgatttctgaaaagtttagaaaataaactcttggtcaaatttgttgacataat 44124277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21881798 - 21881368
Alignment:
Q  18 gacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  21881798 gacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatatttt 21881699  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagccta 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              |||||||||||    
T  21881698 ctttcaaataattcatttgaacttcagattcaca-ttttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagccta 21881614  T
Q  215 ttaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcatt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||    
T  21881613 ctaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagattttcccaatattctttcaagatctatctaagtgcgtt 21881514  T
Q  315 atattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaacc-ttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| |||||||||     
T  21881513 atattggagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagacaagaaatattaagttcttaaccaatatataaattataaaataaggggagg 21881414  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21881413 acttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 21881368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 49488508 - 49488940
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49488508 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 49488607  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  49488608 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 49488692  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  49488693 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttttcaatattctatc-atattcaatctaagtgca 49488791  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatcc-aaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggg 410  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| |||||||    
T  49488792 ttatattggagcaattgtgatagacacaacacatccaaaaaatttacttagatgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggg 49488891  T
Q  411 agaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    |  |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  49488892 atgacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 49488940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 15754280 - 15754711
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |      ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15754280 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttgttttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 15754379  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |              ||||||||||    
T  15754380 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctgatattgggaaaac--------------taatcagcct 15754464  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  15754465 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcgcaatattctatc-atattcaatctaagtgca 15754563  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  15754564 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 15754663  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  15754664 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 15754711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10935529 - 10935316
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935529 atggacatatatttcgtttggagcattagaagttgatatttgatgtgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatt 10935430  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  10935429 tcttttcaaataatttatttgaactacaggttcac-attttcagctgcttattatctccccttaatattaggaaaattaatccatcaattgataatcaac 10935331  T
Q  212 ctattaggctgtaaa 226  Q
    ||| |||||| ||||    
T  10935330 ctactaggctctaaa 10935316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 49488960 - 49489182
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  49488960 ccaaagtagagttttgaaggtatggtcttataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 49489058  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaca 709  Q
    |||||| || |||| ||||||| |||  |||  | |||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49489059 tgctacaagttgtttaatatcagtttcgattgataaatgatacttatcaaatgctttttgaaaagttcataaaataaactctttgtcaaatttgttaaca 49489158  T
Q  710 taataatctcacaaacttctggtt 733  Q
      |||||| |||||||||||||||    
T  49489159 agataatcgcacaaacttctggtt 49489182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20453033 - 20452640
Alignment:
Q  65 ctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttac 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| ||||||| | |||  ||| |||||     
T  20453033 ctttgcaaatgagttagatcttgaggatcaagatgagacaatattatttcctttcaaatgcttcaattgaacttgaggttcata-tttgcagccgcttat 20452935  T
Q  165 tatctccccctaatat-tggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatt 263  Q
      |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  20452934 cttctccccctaatatctggaaaaccaattaatcaattgataatcagcctgctgggttgtaaacaagttgactcaatacaatttgtaatagatggatatt 20452835  T
Q  264 tatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattca-tttgg 362  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||  | || ||||||||  |||||||   | ||||||| ||||| |||||||||| || |     
T  20452834 catatcaaatatattttctcaatatttttccaatatttatcctagtgtattatattgaagcaattaaaatatacacaccacattcaaaaattcacttaga 20452735  T
Q  363 atgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca 458  Q
    |||| |||||| || |||| |||||  ||  | | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||   |||||| |||||||  || |||||||||    
T  20452734 atga-aaatattagattgtcaacctataataatttataaattgaggggaggacttacatatactatcttgttggtttgatgcgaataaatatctca 20452640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 516 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 21881347 - 21881131
Alignment:
Q  516 tagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctac 615  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  21881347 tagagttttgaaggtatggtctcataagtatatatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcatatgctac 21881249  T
Q  616 cagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataata 714  Q
     || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  21881248 aagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgacaagata 21881149  T
Q  715 atctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  21881148 at-gcacaaacttctggtt 21881131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17031509 - 17031307
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata-t 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17031509 atggacatctatttcgtttggagcattaccagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttacatcttgaggatcaagacgagacaataatatt 17031410  T
Q  112 ttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcag 210  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  17031409 ttgctttaaaataatttatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattatctccccataatattgggaaaactaattcatcaattgataataag 17031311  T
Q  211 ccta 214  Q
    ||||    
T  17031310 ccta 17031307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 15754726 - 15754955
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  15754726 ccaaagtagagttttgaaggtatggcctcattagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 15754824  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-------ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaattt 702  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||    |||||||| | | |||||        ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15754825 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgacaaatgatacttatcaaatgtttttttttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaattt 15754924  T
Q  703 gttgacataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  15754925 gttgacaagataatcgcacacacttctggtt 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 510 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 20452116 - 20451987
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||  |||    
T  20452116 ccaaagtagagttttgaaggtacggtgtcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtccaaagaacggatcttcaagtcca-ttttatgagtata 20452018  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaatt 640  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  20452017 tgctacaagttgttcaatataaatttcaatt 20451987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 276
Target Start/End: Original strand, 4771696 - 4771778
Alignment:
Q  194 catcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatata 276  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4771696 catcaattgataatcagcctacatggatgtaatcaagttggctcagtataattagtgatagatgaagattcatatcaaatata 4771778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 644; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 644; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 22434368 - 22433597
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22434368 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttaaggatcaagaagagacaataatatttc 22434269  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22434268 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagccgctttctatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcaacct 22434169  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22434168 agtaggctgtaaacatgttggctcaatacaattaaagatagatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaatgcat 22434069  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattca-tttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 412  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22434068 tatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcactttagatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagaggag 22433969  T
Q  413 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacca 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22433968 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatctcataacca 22433869  T
Q  513 aaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgc 612  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22433868 aaataaattttataaggtatggtctcataaatatcaatcatacaattaactttagacgtttaaagaatggatctccaaatccatttttatgatcatatgc 22433769  T
Q  613 taccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataa 712  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433768 taccatctattcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttggaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataa 22433669  T
Q  713 taatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22433668 taatctcacaaacttctggttatgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 22433597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 7911695 - 7912471
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7911695 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 7911794  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7911795 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 7911894  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  7911895 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 7911994  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7911995 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 7912094  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  7912095 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 7912194  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7912195 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgagca 7912294  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7912295 tatgctaccagctgttcaatatgattttgaattggtgaatgatacttatgaaatgctttctgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 7912394  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7912395 cataataatctcacaaacttctggttgtaaatatacatgtgattatttagtttatgcatcgattcaaatcatataat 7912471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 634709 - 633940
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634709 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 634610  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  634609 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 634510  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  634509 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 634410  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634409 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 634310  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  634309 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 634210  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  634209 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 634111  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634110 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 634017  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  634016 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 633940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 14897210 - 14896441
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcatt----agcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14897210 atggacatctatttcgattggagcattcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 14897111  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14897110 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 14897011  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14897010 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 14896911  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14896910 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 14896811  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  14896810 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 14896711  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  14896710 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 14896612  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14896611 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 14896518  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14896517 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 14896441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 22428773 - 22428004
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428773 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 22428674  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22428673 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 22428574  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22428573 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 22428474  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428473 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 22428374  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  22428373 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 22428274  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  22428273 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 22428175  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428174 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 22428081  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22428080 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 22428004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 1524157 - 1523386
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1524157 atggacatctatttcgattggagcattagcaactaataagatttgtttatctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 1524058  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1524057 ctttcaaataatttatttgaactt-aggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 1523959  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  1523958 actagactgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatatatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcaaaaggcat 1523859  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1523858 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttagatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 1523759  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  1523758 acttacatatagtaatgtgttggctttatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtttataaggcattatctcataacc 1523659  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||    
T  1523658 aaaatagagtttataaggtatagtctgataagtattaattatacaattaattttagacgtctaaagaatggaccttcaagtcca-ttttatgagcatatg 1523560  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagttt-agaaaataaactcttagtcaaatttgttgacat 710  Q
    ||         ||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1523559 cttgttcaatatcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaa 1523460  T
Q  711 aataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1523459 aataatctcataaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttaatgcatctattcaaatcatataat 1523386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 14889144 - 14888375
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889144 atggacatctatttcgattggagcatacattaacagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 14889045  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14889044 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 14888945  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14888944 gcctactatgctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacatttttccaatattctttcaagatttatcaaaat 14888845  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888844 gcattatattggagcaattctgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 14888745  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  14888744 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 14888645  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  14888644 aaccaagacagagtatataaggtatgttcttataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 14888546  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14888545 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 14888452  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14888451 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 14888375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 43775418 - 43774654
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  43775418 atggacatctatttcgtttggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttaaggatcaagaagagacaataatatttt 43775319  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43775318 ctttcgaataatttatttgaacttcaggttcataatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 43775219  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43775218 actagggtgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatagatggagatttatatcaaatacatttttccaatattctttcaagatttatcaaaatgcat 43775119  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43775118 tatattggagcaattgtgacatacataacacatcc-aaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 43775020  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  43775019 acttacatatagtaatgtgctggcttgatgcatatcaatatcttaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtctataaggcatgatctcataacc 43774920  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||| | ||||||    
T  43774919 aaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccaggcca-ttttattagcatatg 43774821  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
    ||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  43774820 ct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaaa 43774727  T
Q  712 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43774726 acaatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 43774654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 716
Target Start/End: Original strand, 7386556 - 7387244
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcct 116  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7386556 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatatttacctttgcaaatgagttatagcttgaggatcaagacgggacaataatatttcct 7386655  T
Q  117 ttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcagcctat 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||| |||     
T  7386656 ttcaaataatttatt-gaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctccccctaatattggaaaaattgatccatcaattgataatcagactac 7386753  T
Q  216 taggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcatta 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||| | | |||||||  | |||||||    
T  7386754 taggctgtaaataagttggctcaatacaattaatgatagatggagattcatatcaaatatttttctc-aatattcttccgagatttatcgtagtgcatta 7386852  T
Q  316 tattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaac 415  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7386853 tattggagcaattgtgatattcacaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattaggttgtgaacctaaaatcaatgataaattaaggggagaac 7386952  T
Q  416 ttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaa 515  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  || ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7386953 ttatataaagtattgtgttggcttgatgcaaatcaatatctca--acaa-cttgtttattcccaaaattgagtttataagacatgatctcataaccaaaa 7387049  T
Q  516 tagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctac 615  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7387050 tagagtttataaggcatactctcataagtatcaactatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaaatccatttttatgagcatatgctac 7387149  T
Q  616 cagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataa 715  Q
    | | | |||||||||||||   |      |||||||| | | ||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7387150 cggttattcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgctttctgaaaagatcttaaaataaactcttagttaaatttgttgacacaataa 7387243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 392 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 26697269 - 26696875
Alignment:
Q  392 ccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  26697269 ccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcattatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtt 26697170  T
Q  490 tataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctcca 589  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26697169 tataaggcattatctcataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaaaaatggatctcca 26697070  T
Q  590 aatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaact 689  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26697069 aatccatttttatgagcatatgctaccagctgttcaatatgaatttgaattggtgaatgatacttatgaaatgctttctgaaaagtttagaaaataaact 26696970  T
Q  690 cttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26696969 cttagtcaaatttgttaaaataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgattatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 26696875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 745
Target Start/End: Original strand, 16445101 - 16445809
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16445101 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaaaacgagacaataatatttc 16445200  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16445201 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgata-tcagcct 16445298  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||  | | |||    
T  16445299 actaggctgtaaataagttggctcaatacagttaaggatagatggagattcatatcaaatattttttttcaatattctttcgagatttatcgtagttcat 16445398  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| || || || |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16445399 tatattggagcaattgtgatacacagaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattagattgttaacctaaaaccaatgataaattaaggggata 16445498  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    | ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||  || ||| ||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||    
T  16445499 atttatatatagtattgtgttggcttgatgcgaatcaatagctca--acaa-cttgttgattcccaaaatttagtttataagacatggtctcataaccaa 16445595  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||    
T  16445596 aatagagtttataaggcatgacctgataagtatcaattatacaattaactttagacgtgtaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagtatatgct 16445695  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    |     | |||||||||||||   |      |||||||| | | ||||||        ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445696 a----ttattcaatatcaattgaca------aatgatacttttcaaatgc--------aagttcataaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 16445777  T
Q  714 aatctcacaaacttctggttgtgaatatacat 745  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  16445778 aatctcacgaacttccggttgtagatatacat 16445809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 19087860 - 19087174
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19087860 atggaaatctgtttcgtttagagcattagcagctgatatttgatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatt 19087761  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccc-taatattggaa-aaccaaaccatcaattgataatcag 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||| ||||     
T  19087760 tccttttaaataatttatttgaacttcaggtccatatttttcagctgcttattatctcccccctaatattgggagaattaatccatcaattgatgatcaa 19087661  T
Q  211 cctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattg 310  Q
    |||| | |||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||  | ||    
T  19087660 cctactgggctataaataagttggctcatcacaattaataatagattgagattcatatcaaatatattttctcaatattcttttaaggtttatcttagtg 19087561  T
Q  311 cattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggg 410  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19087560 tattatattggagcaattgtgatatacacaacagatccaaaa-tccacttggatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaagggg 19087462  T
Q  411 agaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa--tacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccata 508  Q
       | ||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||| |||| || ||||    
T  19087461 g--atttatatatagtaatcagttgacttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattgttgattcgtaaaatagagtttataagacatggtctcata 19087364  T
Q  509 accaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacat 608  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  19087363 accaaactagagtttataaggtatggtgtgataaatatcaattatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcctcaagtccatttttatgagcat 19087264  T
Q  609 atgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgt 704  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   |      |||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19087263 atgctaccagttgttcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaactcttagtcaaatttgt 19087174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 17 - 759
Target Start/End: Original strand, 21291328 - 21292037
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     |||||  |||||    
T  21291328 ggacatctatttcatttggagcactagcagctgatatttgatttatttacctttccaaatgagttataccttgaggatcaaga-----caatacaatttc 21291422  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  21291423 ctttgaaataatttatttgaacttcaggttcata-ttttcagctgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcagttgataatcagcct 21291521  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||  | |||||    
T  21291522 actaggctgtaaataagttggctcaataca-------atagatggagattcatatcaaatattttttcccaatattcttttgagatttatcgtagtgcat 21291614  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    || ||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21291615 tacattggagcagttgtgatatacacaacacatttaaacatccaattagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgataaattaaggggaga 21291714  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||  || ||  ||||||||||| || ||||||| ||||                 
T  21291715 acttatatatagtattgtgttagcttgatgcgaatcaatatctca--acaa-cttgttcattcccaaaattcagtttataagacatg------------- 21291798  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  21291799 -atagagtttataaggcatggtctgataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtccatttttatgagcatatgct 21291897  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    ||  | | |||||||||||||   |      |||||||| | | ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21291898 actggttattcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcttaaaataaactcttagtcaaatttgttgacaaaat 21291991  T
Q  714 aatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21291992 aatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 21292037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26697533 - 26697265
Alignment:
Q  19 acatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttccttt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26697533 acatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttccttt 26697434  T
Q  119 caaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctatta 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26697433 caaataatttatttgaacatcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctacta 26697334  T
Q  218 ggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26697333 ggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatattttcccaat 26697265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 25446843 - 25447274
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25446843 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 25446942  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  25446943 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 25447027  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  25447028 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 25447126  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  25447127 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 25447226  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25447227 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 25447274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 43289173 - 43289604
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43289173 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 43289272  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |              ||||||||||    
T  43289273 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattggaaaaac--------------taatcagcct 43289357  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| | || |||||  ||| || ||||    
T  43289358 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattttatc-atattcaatctaagtgca 43289456  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||   |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  43289457 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttatgtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 43289556  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  43289557 ggacttacatatggtgacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 43289604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 25451223 - 25451566
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25451223 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 25451322  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  25451323 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 25451407  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  25451408 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaataga-ttttccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 25451505  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatat 373  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  25451506 ttatattggagcaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttagatgagaaatat 25451566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 19439319 - 19439748
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  19439319 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgaattatattttgaggatcaagatgagac--taatattt 19439416  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  19439417 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 19439501  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  19439502 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 19439600  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | ||| |||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  19439601 ttatattagagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgataaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 19439700  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  19439701 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 19439748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 43289619 - 43289842
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  43289619 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtatagatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 43289717  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43289718 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 43289817  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  43289818 aagataatcgcacaaacttctggtt 43289842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 25450345 - 25450596
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25450345 ggacatcaatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 25450444  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  25450445 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 25450529  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttt 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  25450530 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagatttt 25450596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 19439763 - 19439988
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  19439763 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcaaaagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 19439861  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg---ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttg 706  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19439862 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttttgaaaagttgagaaaataaactctttgtcaaatttgttg 19439961  T
Q  707 acataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||    
T  19439962 acaagataatcgcacaaacttctggtt 19439988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 461 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25228942 - 25228694
Alignment:
Q  461 acaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaatta 560  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||||    
T  25228942 acaagattattgatttccaaaatagagtttataagacatggtctcataaccaaactagagtttataaggtacgatatgataagtatcaattatacaatta 25228843  T
Q  561 actttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaa 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||   |      |||||||| | | |||    
T  25228842 actttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcaatttttatgagcatatgctactagttgttcaatatcaattgaga------aatgatacttatcaaa 25228749  T
Q  661 tgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 719  Q
    || ||| ||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25228748 tgatttctgaaaagt----aaaataaactcttagtcaaacttgttgacataataatctc 25228694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25229225 - 25228963
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||  ||   ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25229225 ggacatctatttcatttggagcattaacagctggtatttgatttatttaactttgaaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagacaataatatttc 25229126  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagccta 214  Q
    ||||          |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||| || |    
T  25229125 cttt----------atttgaacttcaggttcata-ttttcagctgcttattatctccccctaatattggtaaa--------tcaattgataatcaaccaa 25229045  T
Q  215 ttaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaa 296  Q
     | | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25229044 ctggactgaaaataagttggctcaacacaattaatgatagatggagattcatatcaaatatattttcccaatattctttcaa 25228963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 516 - 733
Target Start/End: Original strand, 25447295 - 25447511
Alignment:
Q  516 tagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctac 615  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  25447295 tagagttttgaaggtatggtctcataagtatatatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcatatgctac 25447393  T
Q  616 cagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataata 714  Q
     || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  25447394 aagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgacaagata 25447493  T
Q  715 atctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  25447494 at-gcacaaacttctggtt 25447511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 549 - 733
Target Start/End: Original strand, 25451660 - 25451843
Alignment:
Q  549 atcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatg 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||  | |||| | |||||||||  |||  | ||||    
T  25451660 atcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttt-atgagcatatgctacaggttgtttactatcaatttcgattgataaatg 25451758  T
Q  649 atacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25451759 atacttatcaaatgctttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgtggacaagataatcgcacaaacttctggtt 25451843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11310383 - 11310311
Alignment:
Q  54 gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataat 126  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11310383 gatttatttacctttacaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatattctctttcaaataat 11310311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 680 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 19910953 - 19910901
Alignment:
Q  680 aaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19910953 aaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcagaaacttctggt 19910901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 542 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 14190675 - 14190627
Alignment:
Q  542 agtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaa 590  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14190675 agtattaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatgaatctccaa 14190627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 732 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 19087177 - 19087125
Alignment:
Q  732 ttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19087177 ttgtggatatacatgtgatcatttagttgatgcattgattcaaatcatataat 19087125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9923810 - 9923771
Alignment:
Q  251 atagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattc 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9923810 atagatggagattcatatcaaatatatttttccaatattc 9923771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 724 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 19910900 - 19910865
Alignment:
Q  724 acttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 759  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19910900 acttctggttgtggatatacatgtgatcatttagtt 19910865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 700 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 14190625 - 14190575
Alignment:
Q  700 tttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgat 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||    
T  14190625 tttgttgacataataatctcacaaacttctagctgtgagtatccaagtgat 14190575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 42207344 - 42206566
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42207344 atggacatttattttgtttggagcattagcagctaatatttgatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaataagagacaataatatt 42207245  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattg-gaaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  42207244 tcctttcaaataatttatttaaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgtgaaaatcaaaccatcaattgataatcaac 42207145  T
Q  212 ctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagat----ggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaa 307  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  42207144 ctactaggctataaacaagttggctcaatacaattaatgatagatagatggagatttatatcaaatatatttttccaattatctttcaagatttatcaaa 42207045  T
Q  308 ttgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaag 407  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42207044 atgcattatattgaagcaattgtgacatacacaacacatctaaaaattcacttggatgaaaaatgtcaggttgttaaccttcaaccaatgataaattaag 42206945  T
Q  408 gggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatccc 505  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||| |    
T  42206944 cggagaacttacatatagtaatgtgttgacttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattccttaaattgagtctataaggcattatctc 42206845  T
Q  506 ataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaa 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42206844 ataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgat 42206745  T
Q  606 catatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgtt 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42206744 catatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgtt 42206645  T
Q  706 gacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42206644 gacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 42206566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 16646850 - 16646081
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646850 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 16646751  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16646750 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 16646651  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16646650 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 16646551  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646550 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 16646451  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  16646450 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 16646351  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  16646350 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 16646252  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646251 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 16646158  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16646157 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 16646081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 32146905 - 32146143
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggag----cattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32146905 atggacatctatttcgattggagaatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatattttgaggatcaagaagagacaataata 32146806  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaa-ccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32146805 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattggaaaaaccaaaccatcaattgataatca 32146706  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32146705 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatagatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 32146606  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32146605 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccgaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgattaattaaggg 32146506  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  32146505 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatct-----caagattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcataa 32146411  T
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||    
T  32146410 ccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaactaaatttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagcata 32146312  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaca 709  Q
    ||||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32146311 tgct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaga 32146218  T
Q  710 taataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32146217 aaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 32146143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 17621211 - 17620442
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17621211 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 17621112  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17621111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccctctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 17621012  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17621011 gtctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 17620912  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17620911 gcattatattgaagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 17620812  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||| |||    
T  17620811 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataatgcatgatctcat 17620712  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  17620711 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 17620613  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17620612 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 17620519  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17620518 gaaaataatctcacaaacttctggttctgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 17620442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 44659156 - 44658708
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataa-tattt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44659156 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacagtaaatattt 44659057  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44659056 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagttgcttactatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcc 44658957  T
Q  213 tattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgca 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44658956 tactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcaaaatgca 44658857  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658856 ttatattggagcaattgtgacatacacaacacttccaaaatttcacttagatgagaaatattaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 44658757  T
Q  413 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658756 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata 44658708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 784
Target Start/End: Original strand, 572623 - 573147
Alignment:
Q  255 atggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaat 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  572623 atggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaatgcattatattggagcaattgtgacatacataacacatccaaaaat 572722  T
Q  355 tcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatat 454  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  572723 tcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatat 572822  T
Q  455 ctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatca 552  Q
    ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  572823 ctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtctataaggcatgatctcataaccaaaatagagtatataatgtatgttctgataagtatcaatca 572922  T
Q  553 tacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatac 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | |||||||       |||||||||||||||| ||||    ||||||||    
T  572923 tacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagcatatgc------atgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatac 573015  T
Q  653 gtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatca 752  Q
     | | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  573016 ttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatca 573115  T
Q  753 tttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  573116 tttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 573147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 634
Target Start/End: Original strand, 26458341 - 26458961
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||  ||    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||     
T  26458341 ggacatctattttgtttagagcattagcagctgctattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttaaggatcaagatgtgacaataatatttt 26458440  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |    
T  26458441 ctttcaaataattcttttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattacctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataattagctt 26458539  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  26458540 actaggccgtaaacaaattggctcaatatgatatatgatagatgaagattcatatcaaatatattttctcaatattctttcaagatttatcttagtgcat 26458639  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  26458640 tatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaaggggagg 26458739  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26458740 acttatatataataatgtgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacatataagattattgattccc-aaattgagtttataaggcatgatctcataacc 26458838  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||     
T  26458839 aaaatagagtttataaggtatggtctcatacgtatcaatcatacaattatctttagacgtctaaagaatggaccttcaagtccatttttatgagcatata 26458938  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatt 634  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  26458939 ctaccggttgttcaatatcaatt 26458961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 392 - 784
Target Start/End: Original strand, 42164264 - 42164658
Alignment:
Q  392 ccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  42164264 ccaatgataaattaaggggagaacttacatataataatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtt 42164363  T
Q  490 tataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctcca 589  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42164364 tataaggcattatctcataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatgcaattaactttagacgtctaaagaatggatctcca 42164463  T
Q  590 aatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaact 689  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42164464 aatccatttttatgagcatatgctaccagctgttcaatatgattttgaattggtgaatgatacttatgaaatgctttctgaaaagtttagaaaataaact 42164563  T
Q  690 cttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42164564 cttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgattatttagtttatgcatcgattcaaatcatataat 42164658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 33 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 34324735 - 34324147
Alignment:
Q  33 tggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttat 130  Q
    |||||||||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||               ||    
T  34324735 tggagcattagcagctgatatttaatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgatgatcaagatgagacaataatattt---------------at 34324651  T
Q  131 ttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaa 229  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34324650 ttgaacttcaggttcaca-tttccagctgcttattatctccccctaatattgggaaaaataatccatcaattgataatcagcctactaggctgtaaataa 34324552  T
Q  230 gttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattg 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||    
T  34324551 gttggctcaacacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatg----caatattctttcaagatttatcttagtgcaatatattggagcaattg 34324456  T
Q  330 tgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaat 429  Q
    ||| |||||||| |||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34324455 tgatatacacaagacatccaaaa-tccacttagatgagaaatattaggttgttaacctaataccaatgatagattaaggggagaacttatatatagtaat 34324357  T
Q  430 gtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa--tacaagattattg-tttcccaaaattgagcttataaggcat-gatcccataaccaaaatagagtttat 525  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  34324356 ttgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacataaaagattattgatttcctaaaatagagtatataagccattggtctcataaccaaactagagtttat 34324257  T
Q  526 aaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttca 625  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34324256 aaggtatggtttgataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaagagtagatcttcaagtccatttttatgagcatatgcaaccagctgttca 34324157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 477 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 25497389 - 25497082
Alignment:
Q  477 ccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaa 576  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25497389 ccaaaatagagcttataaggcatgatctcataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaa 25497290  T
Q  577 gaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtt 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25497289 gaatggatctccaaatccatttttatgatcatatgttacctgctgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtt 25497190  T
Q  677 tagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaat 776  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  25497189 tagaaaatgaactcttagttaaatttgttgacataataatctcacaaacttttggttatgaatatacatgtgatgatttagttgttgcatcgattcaaat 25497090  T
Q  777 catataat 784  Q
    ||||||||    
T  25497089 catataat 25497082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20119563 - 20119014
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20119563 ggacatatatttcatttggagcattagcaactgatatttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttc 20119464  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20119463 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctccccttaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 20119365  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||||  | |||||    
T  20119364 actaagctataaataagttggctcaatacaaataatgatagatggagattcatatcaaatattttttcccgatattctttccagatttatcgtagtgcat 20119265  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||  ||| |     
T  20119264 tatattggagcaattgtgatatacacaa-acatcc-aaatttcactttgatgagaaatattaggttattaacctaaaaccaataatagatta--gggggg 20119169  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||   || ||||||| |||| || |||||||    
T  20119168 acttatatatagtaatgtcttggcttgatgaagatcaatatctcaacataaaagattattgattcccaaaacaaagtttataagacatggtctcataacc 20119069  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctc----ataagtatcaatcatacaattaac 562  Q
    ||  || ||||||| ||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  20119068 aagctatagtttattaggcatggtctcgtaattaagtatcaatcatacaattaac 20119014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Original strand, 42163996 - 42164268
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42163996 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttatttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttt 42164095  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42164096 ctttcaaataatttatttgaacttcagattcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcaacct 42164195  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaat 286  Q
    |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42164196 accgggctgtaagcaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaat 42164268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 572418 - 572622
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  572418 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttaaggatcaagaagagacaataata 572517  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  572518 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 572617  T
Q  210 gccta 214  Q
    |||||    
T  572618 gccta 572622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 459
Target Start/End: Original strand, 342078 - 342508
Alignment:
Q  18 gacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  342078 gacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatatttt 342177  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagccta 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              |||||||||||    
T  342178 ctttcaaataattcatttgaacttcagattcaca-ttttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagccta 342262  T
Q  215 ttaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcatt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| ||    
T  342263 ctaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagattttcccaatattctttcaagatctatctaagtgcgtt 342362  T
Q  315 atattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaacc-ttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| |||||||||     
T  342363 atattggagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagacaagaaatattaagttcttaaccaatatataaattataaaataaggggagg 342462  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  342463 acttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 342508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8246484 - 8246053
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8246484 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttatttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 8246385  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  8246384 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 8246300  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  8246299 actaggctgtaaacaagctggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttctcaatattctatc-atattcaatctaagtgca 8246201  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  8246200 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 8246101  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  8246100 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 8246053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 510 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 44658370 - 44658102
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| || | | |||||||| |||| ||||    
T  44658370 ccaaaattgagtttataaggtatagtctgataagtatcaattatacaattaattttggacgtctaaagaatggaccttccagtccatttt-atgagcata 44658272  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaag-tttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    ||||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44658271 tgct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaaaatttagaaaataaactctcagtcaaatttgttgag 44658178  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    | |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44658177 aaaataatctcataaacttctggctatgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 44658102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 516 - 733
Target Start/End: Original strand, 342529 - 342745
Alignment:
Q  516 tagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctac 615  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  342529 tagagttttgaaggtatggtctcataagtatatatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcatatgctac 342627  T
Q  616 cagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataata 714  Q
     || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  342628 aagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgacaagata 342727  T
Q  715 atctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  342728 at-gcacaaacttctggtt 342745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 526 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 8246022 - 8245815
Alignment:
Q  526 aaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttca 625  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| || |||| |    
T  8246022 aaggtatggtctcataagtataaatcatataattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcatatgctacaagttgttta 8245924  T
Q  626 atatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaa-----tgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctca 720  Q
    |||||||||| ||||     || |||| | | |||     |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  8245923 atatcaatttcaatt----gataatacttatcaaatatttttttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgacaagataatcgca 8245828  T
Q  721 caaacttctggtt 733  Q
    |||||||||||||    
T  8245827 caaacttctggtt 8245815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25497474 - 25497393
Alignment:
Q  19 acatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25497474 acatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttaccattgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaaga 25497393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 750 - 782
Target Start/End: Original strand, 22478182 - 22478214
Alignment:
Q  750 tcatttagttgatgcatcaattcaaatcatata 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22478182 tcatttagttgatgcatcaattcaaatcatata 22478214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 592 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 25674850 - 25674802
Alignment:
Q  592 tccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaatt 640  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  25674850 tccatttttatgtacatatgctacaagatgttcaatatcaatttcaatt 25674802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Original strand, 3067269 - 3067335
Alignment:
Q  149 atttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagccta 214  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  3067269 attttcagctgcttattatctccctctaatattgggaaaactaattcaccaattgataatcagccta 3067335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 571; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 30959256 - 30960016
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30959256 atggacatctatttcgattggagcatttgcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 30959355  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30959356 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 30959455  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30959456 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcaaaatgcat 30959555  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30959556 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattca-----ctgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 30959650  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  30959651 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtctataaggcatgatctcataacc 30959750  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||||    
T  30959751 aaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagcatatg 30959849  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
    ||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30959850 ct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 30959943  T
Q  712 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30959944 ataatctcacaaacttatggttgtgaatatacatgtgatcattcagttgatgcatcaattcaaatcatataat 30960016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 1533400 - 1534166
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533400 atggacatctattttgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 1533499  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1533500 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgggaaaactaaaccatcaattgataatcagcct 1533599  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  1533600 actagactgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcaaaaggcat 1533699  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1533700 tatattggagcaattgtgacatacacaacacatctaaaaattgacttagatgagaaatatcaggttgttaaccttaaatcaatgataaattaaggggaga 1533799  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  1533800 acttacatatagtaatgtgttggctttatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtttataaggcattatctcataacc 1533899  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||| ||||||    
T  1533900 aaaatagagtttataaggtataatctgataagtatcaattatacaattaattttagacgtctaaagaatggaccttccagtcca-ttttatgagcatatg 1533998  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagttt-agaaaataaactcttagtcaaatttgttgacat 710  Q
    ||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1533999 ct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaa 1534092  T
Q  711 aataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1534093 aataatctcataaacttctgatagtgaatatacatgtgatcatttagttaatgcatcaattcaaatcatataat 1534166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 28368714 - 28369483
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28368714 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatattgaggatcaagaagagacaataata 28368813  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28368814 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 28368913  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28368914 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 28369013  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28369014 acattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 28369113  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  28369114 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatttcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 28369213  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  28369214 aaccaaaacagagtatataagctatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 28369312  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28369313 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 28369406  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28369407 gaaaataatttcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 28369483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 759
Target Start/End: Original strand, 31105718 - 31106389
Alignment:
Q  79 tatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaat 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  31105718 tataccttgaggatcaagacgaggcaatcatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-tttccagctgcttattatctccccctaat 31105816  T
Q  179 attgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatat 277  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  31105817 attgggaaaactaatccatcaattgataatcagcctactaggttgtaaataagttggctcaatacagttaatgatatatggggattcatatcaaatattt 31105916  T
Q  278 ttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcagg 377  Q
    ||| |||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||| |||    
T  31105917 tttcccaatattatttcgagatttatcgtagtgcattatattggagcaatcgtgatatacacaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattagg 31106016  T
Q  378 ttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcc 477  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||   ||||  || ||| ||||    
T  31106017 ttgtttacctaaaaccaatgataaattaaggggagaacttatatatagtattgtgttggcttaatgcgaatcaatacctc--gacaa-cttgttgattcc 31106113  T
Q  478 caaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaag 577  Q
    ||||||| || ||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31106114 caaaatttagtttataagacatggtctcataacgaaaatagaatttataaggcatggtctgataagtatcaattatacaattaactttagacgtctaaag 31106213  T
Q  578 aatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagttt 677  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||   |      |||||||| | | ||||| | | |||||||||     
T  31106214 aatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgctaccggttattcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgttgtctgaaaagttc 31106307  T
Q  678 agaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 759  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31106308 ttaaaataaactcttagttaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtggatatacatgcgatcatttagtt 31106389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 17936616 - 17935854
Alignment:
Q  20 catctatttcgattggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctt 117  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | |||    
T  17936616 catctgtttcgtttggagcattaacagctgatatttaatttatttacctttgcaaatgagttatatcttaaggatcaagacgagacaataatgtattctt 17936517  T
Q  118 tcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctatt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  17936516 tcaaataatttatttgaacttcaggttcac-attttcaactacttatcgtcttcccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataaacagcctact 17936418  T
Q  217 aggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatt----tatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgca 312  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||  | ||||    
T  17936417 gggctgtaaataagttggctcaacacaattaatgatagatggagattcatatatatcaaatatattttcccaata----ttcaagatttatctcagtgca 17936322  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggag 412  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||   ||||||||||||| ||   ||||||| |||||  || |    
T  17936321 ttatattggagcaattgcgatatacacaacacatcc-aaaatctacttagatgagaaatgctaggttgttaacctaaatttaatgatagattaaacgggg 17936223  T
Q  413 aacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagct--tataaggcatgatcccata 508  Q
     || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | | |  |||| | |||| || | ||    
T  17936222 gacataaatatagtaatgtgttgacttgatacatatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagggtttatatatgacatggtctc-ta 17936124  T
Q  509 accaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacat 608  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  17936123 actaaactagagtttataaggtatggtgtgataagtatcaattatacaattaactttagatgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcat 17936024  T
Q  609 atgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||||||  |||||||||||||||   |      |||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17936023 atgctaccaattgttcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 17935930  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17935929 ataataatctcacaaacttttggttgtggatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 17935854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 55 - 724
Target Start/End: Original strand, 18084974 - 18085629
Alignment:
Q  55 atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaattttt 154  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||               |||||||||| ||||||||| |||      
T  18084974 atttgtttaactttgcaaatga-ttatatcttgaggatcaagatgagacaataatattt---------------atttgaactttaggttcaca-tttcc 18085056  T
Q  155 agctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgata 253  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  18085057 agttgcttattatctccccctaatattgggaaaaataatccatcaattgataatcagcctactaggctgtaaataagttggcttaacacaattaatgata 18085156  T
Q  254 gatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18085157 gatggagatttatatcaaatatattttcccaatattctttcaagatttatcttagtgcaatatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaaa 18085255  T
Q  354 ttcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaata 453  Q
    | || || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18085256 tccacttagattagaaatattaggttgttaacctaaaaccaacgatagattaaggggagaatttacatatagtaatgttttggcttgatgcaaatcaata 18085355  T
Q  454 tctca--atacaagattattgtttccc-aaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaat 550  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18085356 tctcaacatacaagattattgattccctaaaatagagtatataagtcatggtctcataaccaaactagagtttataaggtatggtctgataagtatcaac 18085455  T
Q  551 catacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgat 650  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| | ||   ||| |||    
T  18085456 tatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccattttcatgagcatattctaccagttgttcaatgtcaatttcatttgacgaacgat 18085555  T
Q  651 acgtgt-aaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaa 724  Q
    || | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  18085556 acttatcaaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaacacttagtcaaa-ttattgacctaataatctcacaaa 18085629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 21172970 - 21173401
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21172970 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgattaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 21173069  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  21173070 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 21173154  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  21173155 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 21173253  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| | ||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  21173254 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttctcaaccaaaatataaattataaaataagggga 21173353  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  21173354 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 21173401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 35266325 - 35266756
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35266325 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 35266424  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  35266425 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 35266509  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  35266510 actaggctgtaaacaagtaggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 35266608  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | | | ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  35266609 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagctcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 35266708  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  | ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  35266709 ggacttacatatggtaacttattggcttgatgcgaatcaatatttcaa 35266756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16671882 - 16671466
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16671882 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacaagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 16671783  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              |||||| |||    
T  16671782 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcaacct 16671698  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  16671697 actaggttgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 16671599  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  16671598 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 16671499  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgc 444  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  16671498 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgc 16671466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 23055160 - 23055589
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  23055160 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgaattatattttgaggatcaagatgagac--taatattt 23055257  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  23055258 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 23055342  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  23055343 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 23055441  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | ||| |||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  23055442 ttatattagagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgataaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 23055541  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  23055542 ggacttacatatggtaaattgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 23055589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 21173416 - 21173640
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  21173416 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 21173514  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg--ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21173515 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgttttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttga 21173614  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||    
T  21173615 caagataatcgcacaaacttctggtt 21173640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 459
Target Start/End: Original strand, 26461094 - 26461401
Alignment:
Q  155 agctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaac-catcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgata 253  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||||||||| | ||  ||| |||| ||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26461094 agctgtttattatctccatctaatattggaaaaactaattcattaatttataatcaacctactgtgttgtaaacaagttggctcaatacaatttatgata 26461193  T
Q  254 gatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaa 353  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||  | |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26461194 gatgaagattcatatcaaatgtattttcttaatattctttcaagatttatcttagtgcattattttggagcaattgtgatatacacaacacatccaaaat 26461293  T
Q  354 ttcatttggatgagaaatatca---ggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatca 450  Q
    || | || ||||| |||||| |   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  26461294 tt-acttagatgaaaaatataattaggttgttaatctaaaaccaatgataaattaaggggaggacttatatattgtaatgtgatggcttgatgcgtttca 26461392  T
Q  451 atatctcaa 459  Q
    |||||||||    
T  26461393 atatctcaa 26461401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 23055604 - 23055827
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  23055604 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcaaaagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 23055702  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23055703 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttgagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 23055802  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  23055803 aagataatcgcacaaacttctggtt 23055827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 25108317 - 25108516
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108317 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatttc 25108416  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  25108417 ctttcaaatgatttatttgaacttcaggttca-tattttcagctgcttattatctccaactaatattgggaaaactaatccatcaactgataatcagcct 25108515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 25167409 - 25167608
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25167409 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatttc 25167508  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  25167509 ctttcaaatgatttatttgaacttcaggttca-tattttcagctgcttattatctccaactaatattgggaaaactaatccatcaactgataatcagcct 25167607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 35266771 - 35266994
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  35266771 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 35266869  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgt-aaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||| ||||  | |||||||| | | ||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35266870 tgctacaagttgtttaatgtcaatttcaattgataaatgatacttatcaatgttttttttgaaaagttcagaaaataagctctttgtcaaatttgttgac 35266969  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  35266970 aagataatcgcacaaacttctggtt 35266994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25111507 - 25111311
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  25111507 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagac---aatatttc 25111411  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||| |||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  25111410 ctttcaaatgatttatttgaacttcaggttca-tattttcaactgtttattatctccaactaatattgggaaaactaatccatcaactgataatcagcct 25111312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25170598 - 25170402
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    
T  25170598 ggacatctatttcatttggagcattagcagctgatatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagac---aatatttc 25170502  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||| |||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  25170501 ctttcaaatgatttatttgaacttcaggttca-tattttcaactgtttattatctccaactaatattgggaaaactaatccatcaactgataatcagcct 25170403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 510 - 632
Target Start/End: Original strand, 26461421 - 26461543
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||    
T  26461421 ccaaaatagagtttagaaggtattgtctcataagtatcaatcatacaattaactttagatggctaaagaattgatattcaagtccatttttatgagcata 26461520  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaa 632  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  26461521 tgctacaagctattcaatatcaa 26461543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 353
Target Start/End: Original strand, 18786545 - 18786643
Alignment:
Q  255 atggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaa 353  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||  || ||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  18786545 atggagattcatttcaaatatatttttccaatattcttttagaattgctctaattgcattgtattggagcaattgaatcatatacaacacatccaaaaa 18786643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 738 - 784
Target Start/End: Original strand, 16630399 - 16630445
Alignment:
Q  738 atatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16630399 atatacatgtgatcatttagttgatgcatcgaatcaaatcatataat 16630445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 733
Target Start/End: Original strand, 26461566 - 26461608
Alignment:
Q  691 ttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26461566 ttagtcaaatttgttgacagaataatcacacaaacttctggtt 26461608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 26461046 - 26461087
Alignment:
Q  54 gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaa 95  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26461046 gatttctttaactttgcaaatgagttatatctcgaggatcaa 26461087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 551; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 14851070 - 14850305
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851070 atggacatctatttcgtttggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 14850971  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14850970 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 14850871  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14850870 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaatgcat 14850771  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14850770 tatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 14850671  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  14850670 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcataacc 14850571  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||||||    
T  14850570 aaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagcatatg 14850472  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
    ||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14850471 ct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttgagaaa 14850378  T
Q  712 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14850377 ataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 14850305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 6931486 - 6930884
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatt 112  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6931486 atggaaatctatttcgtttggagcattagtagctgatatttgatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatt 6931387  T
Q  113 tcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagc 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||     
T  6931386 tcctttcaaatcatttatttgaatttcaggttcaca-tttgtagctgcttattatctccccctaatattgggaaaattaatccatcaattgataatcagt 6931288  T
Q  212 ctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgc 311  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  | |||    
T  6931287 ctactagtctgtaaataagttggctcaatataatttataatagatggagattcatatcaaatatgtttttccaatattctttcaagatttatcttagtgc 6931188  T
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaagggga 411  Q
    | |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6931187 aatatattggagcaactgtgatatacacaacacatctaaaaattcacttagatgagaaatatcatgtggttaacctaaaatcaatgatagatcaagggga 6931088  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataa 509  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||    
T  6931087 ggacttatatatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagagtttataagacatggtctcataa 6930988  T
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  6930987 ccagaatagggtttataaggtatggtctgataagtatcaatcatacgattaactttagacgtctaaataatggatcttcgagtccatttttatgagcata 6930888  T
Q  610 tgct 613  Q
    ||||    
T  6930887 tgct 6930884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 54 - 634
Target Start/End: Original strand, 17271888 - 17272469
Alignment:
Q  54 gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  17271888 gatttgtttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcagatttaca-tttt 17271986  T
Q  154 tagctgcttactatctccccctaatattg-gaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgat 252  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||    
T  17271987 cagctgcttattatctccccttaatattgagaaaatcaatcaatcaattgataatcagcctactgagctgtaaataagtttgctcagcataattaatgat 17272086  T
Q  253 agatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaa 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17272087 agatggagattcatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcttagtgcattatattggagcaattgtgatatacacaacacattcaaaa 17272186  T
Q  353 attcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaat 452  Q
     |  | || ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17272187 -tcaacttagatgaaaaaaattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaagaggaagacttatatatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaat 17272285  T
Q  453 atctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaat 550  Q
    ||||||| |  ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17272286 atctcaacatgcaagattatttattcccaaaatagagtttataagacatggtctcgtaaccaaactagagtttataaggtgtggtctcataagtatcaat 17272385  T
Q  551 catacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatt 634  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||    
T  17272386 tatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttacgagcatatgctactagttgttcaatatcaatt 17272469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 582
Target Start/End: Original strand, 14462458 - 14463022
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14462458 ggacatctatttcatttggagcagtagcagctgatatttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacaagacaataatatttc 14462557  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaacc-atcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  14462558 ctttcaaataatttatttgaacttcacgttcaca-ttttcagctgcttattatctccccctgatattggaaaaactaatctatcaattgataatcagcct 14462656  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  | |||||||  | |||||    
T  14462657 actaggctgtaaataagttggctcaataaagttaatgatagatggagattcatatcaaatattttttcttaatattcttttgagatttatcgtagtgcat 14462756  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||| | | || ||||||||||||||| || || || |||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  14462757 tatattggagcaattcttatatgcacaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattagatttttaacctaaaatcaatgataaattaatgggaga 14462856  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  || ||  |||||||||   || |||||||  ||| || |||||||||    
T  14462857 acttatatatagtattgtgttggcttgatgcgaatcaatatctca--acaa-cttgttaattcccaaaacatagtttataagatatggtctcataaccaa 14462953  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatgg 582  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14462954 aatagggtttataaggcatggtctgataagtatcaattatacaattaactttagacatctaaagaatgg 14463022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 471
Target Start/End: Original strand, 19558722 - 19559122
Alignment:
Q  60 tttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctg 159  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||            |||||||||| |||| ||||     
T  19558722 tttaactttgtaaatgagttatatcttgaggatcaataagagacagtcatattttctttcaaataat------------caggttcaca-ttttcagcta 19558808  T
Q  160 cttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatgg 258  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558809 cttattatatccccctaatattagggaaactaatccattaattgataatcaacctactggattgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatgg 19558908  T
Q  259 agatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcat 358  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||  |||||||| || ||||| || |||||| ||||| ||     
T  19558909 agattcatatcaaatatattttcccaatattctttcatgatttatcttaatgcattatattgaagcaattgagatatacataatacatcc-aaaatccac 19559007  T
Q  359 ttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca 458  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19559008 ttagatgagaaatattaggttgttaacctaaatccaatgatagattaaggggaggacttatatatagtgatatgttaacttgatgcaaatcaatatctca 19559107  T
Q  459 --atacaagattatt 471  Q
      |||||||||||||    
T  19559108 acatacaagattatt 19559122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 605 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 6928843 - 6928664
Alignment:
Q  605 acatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgt 704  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    |||||||| | | |||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6928843 acatatgctacccgctgttccatatcaatttcaattgacaaatgatacttatcaaattctttctggagtgtttagaaaataaactcttagtcaaatttgt 6928744  T
Q  705 tgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6928743 tgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 6928664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 431 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 11306009 - 11305753
Alignment:
Q  431 tgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataag 528  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||  |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  11306009 tgttggcttgatgtaaatcaatatctcaatatacaagattatttattcccaaaataaagtatataagacatggtctcataaccaaactagagtttataag 11305910  T
Q  529 gtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaata 628  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||    
T  11305909 gtatggtctgataagtattaattatacaattaactttagatgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttacaagcatatgctaccggttgttcaata 11305810  T
Q  629 tcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactctt 692  Q
    ||||||       |  |||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11305809 tcaatt-------gacaatgatacttatcaaacgctttctgaaaagtttagaaaataaactctt 11305753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11306358 - 11306238
Alignment:
Q  184 aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttcc 283  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11306358 aaaacgaatccatcaattgataatcagtctaatgggctttaaataagttgactcatcacaattaatgataaatggagattcatatcaaatatatttttcc 11306259  T
Q  284 aatattctttcaatatttatc 304  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  11306258 aatattctttcacgatttatc 11306238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 658 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 25394648 - 25394587
Alignment:
Q  658 aaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 719  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25394648 aaatgctttctgaaaagttcagaatataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 25394587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11306100 - 11306014
Alignment:
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgata 400  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11306100 ttatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaaatcaacttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgata 11306014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 743 - 784
Target Start/End: Original strand, 14463033 - 14463074
Alignment:
Q  743 catgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14463033 catgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 14463074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 347405 - 348174
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  347405 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 347504  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  347505 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatca 347604  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  347605 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatatatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 347704  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  347705 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggatgaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 347804  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  347805 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 347904  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  347905 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 348003  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      | |||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  348004 tatgct------tattcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 348097  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  348098 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 348174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 526; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 784
Target Start/End: Original strand, 20194325 - 20195094
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcat----tagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20194325 atggacatctatttcgattggagcatacattagcagttaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatattttgaggatcaagaagagacaataata 20194424  T
Q  111 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaa-ccaaaccatcaattgataatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20194425 tttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattggaaaaaccaaaccatcaattgataatca 20194524  T
Q  210 gcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaatt 309  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20194525 gcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaaagatagatggagatttatatcaaatacattttcccaatattctttcaagatttatcaaaat 20194624  T
Q  310 gcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20194625 gcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcacttggataaaaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggg 20194724  T
Q  410 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  20194725 gagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaagatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcat 20194824  T
Q  508 aaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaaca 607  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||| | ||    
T  20194825 aaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatcaatcatataactaactttagacgtcaaaagaatggatcttccagtcca-ttttattagca 20194923  T
Q  608 tatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 707  Q
    ||||||      |||||||||||||||| ||||    |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20194924 tatgct------tgttcaatatcaatttcaattgaaaaatgatacttatcaaatgatttctgaaaatttcagaaaataaactcttagtcaaatttgttga 20195017  T
Q  708 cataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20195018 gaaaataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 20195094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 55 - 724
Target Start/End: Original strand, 2925940 - 2926596
Alignment:
Q  55 atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaattttt 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||               |||||||||| | ||||||| |||      
T  2925940 atttgtttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagacaataatattt---------------atttgaacttaaagttcaca-tttca 2926023  T
Q  155 agctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgata 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2926024 agctgcttattatctccccctaatattgaaaaaaataatccatcaattgataatcagcctactgggctgtaaataagttggctcaacacaattaatgata 2926123  T
Q  254 gatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2926124 gatggagatttatatcaaatattttttcacaatattctttcaagatttatcttagtgcaatatattggagtaattgtgatatacacaacacatcc-aaaa 2926222  T
Q  354 ttcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaata 453  Q
    | |  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2926223 tccgcttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgatagattaaggggagaacttatatatagtaatgtgttggcttcatgcaaatcaata 2926322  T
Q  454 tctca--atacaagattattgtttccc-aaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaat 550  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||| ||| | |||  |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2926323 tctcaacatacaagattattgattccctaaagtagagtatataagtcatggtctcataaccaaactagagtttataaggtatggtctgataagtatcaat 2926422  T
Q  551 catacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgat 650  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||   ||| |||    
T  2926423 tatataattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgctaccaactgttcaatgtcaatttcatttgacgaacgat 2926522  T
Q  651 acgtgt-aaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaa 724  Q
    || | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2926523 acttatcaaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaactcttagtcaaa-ttgttgacctaataatctcacaaa 2926596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 55 - 724
Target Start/End: Original strand, 12750625 - 12751282
Alignment:
Q  55 atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaattttt 154  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||| |||      
T  12750625 atttgtttgactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagacaataatattt---------------atttgaacttcaggttcaca-tttcc 12750708  T
Q  155 agctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa--ccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgat 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  || |||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12750709 agctgcttattatctccccctaatattggaaaaaaataatccttcaattgataatcagcgtactgagctgtaaataagttggctcaacacaattaatgat 12750808  T
Q  253 agatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12750809 agatggagatttatatcaaatatattttcccaatattctttcaagatttatcttagtgcaatatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-aaa 12750907  T
Q  353 attcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaat 452  Q
    || || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12750908 atccacttagatgagaaatattaggttcttaacctaaaaccaatgatagattaaggggagaacttatatatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaat 12751007  T
Q  453 atctca--atacaagattattgtttccc-aaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaa 549  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||  || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12751008 atctcaacatataagattattgattccctaaaatagagtatataagtcatagtctcataatcaaactagagtttataagatatggtcttataagtatcaa 12751107  T
Q  550 tcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatga 649  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||   ||| ||    
T  12751108 ttatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttaaagtccatttttatgagcatatgctacaagctgttcaatgtcaattgcatttgacgaacga 12751207  T
Q  650 tacgtgt-aaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaa 724  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  12751208 tacttataaaaatgctttctgaaaagttcaaaaaataaactcttagtcaaa-ttattgacctaataatctcacaaa 12751282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 392 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 53980250 - 53979856
Alignment:
Q  392 ccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagct 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  53980250 ccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgctggcttgatgcatatcaatatctcaatatacaaaattattgattcccaaaattgagtt 53980151  T
Q  490 tataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctcca 589  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53980150 tataaggcattatctcataaccaaaataaagtttataaggtatggtttcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatgaatctcca 53980051  T
Q  590 aatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaact 689  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53980050 aatccaattttatgagcatatgctaccaactgttcaatatgaatttgaattggtgaatgatacttatgaaatgctttctgaaaagtttagaaaataaact 53979951  T
Q  690 cttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53979950 cttagtcaaatttgtttatataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgattatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 53979856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 13998357 - 13997674
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  | |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13998357 ggacatctatttcatttggagcattagcaattgatatttaatttgtttaactttgcaaatgagttatat-ttgaggatcaagatgacacaataatatttc 13998259  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcag---gttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcag 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |    ||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  13998258 ctttcaaataatttatttgaacttaaaaaagttcaca-tttccagttgcttattatctccccctaatattggaaaaactaatccatcaattgataatcag 13998160  T
Q  211 cctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatat----caaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaa 306  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  13998159 cctattgggctgtaaataagttggctcaacacaattaatgatagatgaagattcatatataccaaatatatttttccaatattctttcaagatttatctt 13998060  T
Q  307 attgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaa 406  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| ||||     
T  13998059 agtgcattatattggagcaattgtgatatacacaacacatccaaaaatccactt--atgagaaatattaggttattaacctaaaaccaattatagattag 13997962  T
Q  407 ggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcc 504  Q
    ||||    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| ||   || |||| |      
T  13997961 gggg---gcttatatatagtaatgtgttggcttgatgcagatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagagttt---agacatggttt 13997868  T
Q  505 cataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatga 604  Q
    ||||||||                  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13997867 cataacca------------------atggtctcgtaagtaccaattatacaattaactttagacggctaaagaatggatcttcaagtccatttttatga 13997786  T
Q  605 acatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgt 704  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||   |      |||||||  | | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13997785 gcatatgctaccagttattcaatatcaattgaca------aatgataattatcaaatgctttctgaaatgttcagaaaataaactcttagtcaaatttgt 13997692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 55 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 53528031 - 53527306
Alignment:
Q  55 atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaattttt 154  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  53528031 atttatttaactttgcaaatgagttatattttaaggatcaaaatgagacaataatatttcattttaaataatttatttgaactccaagttcatatttttt 53527932  T
Q  155 agctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaacc-atcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgata 253  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| |||| | ||   |||||| ||||| ||| ||| ||||| || || || ||  ||||||| |     |||||    
T  53527931 agctgcttattatctccccctggtattgaaaaaactaatttatcaatagataaccagtctactaggccgtgaataaattaactcaatata-----tgata 53527837  T
Q  254 gatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaa 353  Q
    || ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  | |||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  53527836 gaaggagactcgtattaaatatatttttccgatattctttcaagttttatcttagtgcattgtattggagcaattgtgctatacgcaacacatccaaaa- 53527738  T
Q  354 ttcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaactt--acatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaa 451  Q
    | || || ||||||||  || |||||||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53527737 tccacttagatgagaataat-aggttgttaagctaaaaaaaatgatagattaaagggaggacttgtatatatagtaatgtgtttgcttgatgcagatcaa 53527639  T
Q  452 tatctcaa--tacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaa 549  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || | |  |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  53527638 tatctcaacatacgagattattgattcctaaaatagagtttataagacacggtgtcataaccaaactagagtttataaggtatgatttgataagtatcaa 53527539  T
Q  550 tca-tacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatg 648  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||    |||||    
T  53527538 ttaatacaattacctttagacgtctaaataatggatatttaagtccatttttatgagcatatgctactagttgttcaatatcaatttcaatcgacgaatg 53527439  T
Q  649 atacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtg 748  Q
    |||| | | |||||| || | |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53527438 atacttatcaaatgccttctaaaatttttagaaaataaactgtcagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtg 53527339  T
Q  749 atcatttagttgatgcatcaattcaaatcatat 781  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53527338 atcatttagttgatgcatcgattcaaatcatat 53527306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 53980518 - 53980246
Alignment:
Q  15 atggacatctatttcgattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  53980518 atggacatctatttcaattggagcattagcagctaataagatttgtttacctttgcaaatgatttatatttttaggatcaagaatagacaataatatttt 53980419  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53980418 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttaccatctccccctaatattgggaaaaccaaaccatcaattgataatcaacct 53980319  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaat 286  Q
    | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53980318 actgggctgtaagcaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaat 53980246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 63 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19568833 - 19568434
Alignment:
Q  63 acctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataat--atttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgc 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | || |||| |    
T  19568833 acctttgcaaataagttatatcttgcagatcaagatgagacaataattaatttcctttcaaagaatttatttgaacttcaagtccaca-tattcagctac 19568735  T
Q  161 ttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatgga 259  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19568734 ttattatctcaccctaatattaggaaaactaatccattaattgataatcaacctattgagttgtaaacaagttggctcaatacaattaatgagagatgga 19568635  T
Q  260 gatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatt 359  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19568634 gattcatatcaaatatatttttctaatattatttcaagatttatcttagtgcgttatattggagcaattgtgatatacacaacacatccaaaaattcact 19568535  T
Q  360 tggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||| ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19568534 tagatgggaaatattagattcttaacctaaaaccattgataaattaaggggaagacttacatataataatgtgttagcttgatgcaaatcaatatctcaa 19568435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 276 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 26995346 - 26994907
Alignment:
Q  276 atttttccaatattctttcaatatttatcaa-attgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatc 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  26995346 attttcccaatattctttcaatatttatctttagtgcattatattggagcaattgtgatatacacaacacatccaaaa-tccacttggatgagaaatatt 26995248  T
Q  375 aggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtt 474  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  26995247 aggttgttaacctaaaaccaacgatagattaagggggga-cttatatatagtaatttgctggcttgatgcagatcaatatctcaa--caagattattgat 26995151  T
Q  475 tcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtcta 574  Q
    | | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26995150 ttctaaaatagagtttataagacatgatctcataaccaaactagagcttataaggtatgatatgataagtatcaattatacaattaactttagacgtcta 26995051  T
Q  575 aagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaag 674  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||   |      |||||||| | | ||||        | |||    
T  26995050 aagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgcta----ttgttcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaat--------acaag 26994969  T
Q  675 tttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtg 736  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26994968 ttcagaaaataaactcttggtcaaatttgttgacatagtaatctcacaaacttctggttgtg 26994907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23192462 - 23192037
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23192462 ggacatctattttgattggagaattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 23192363  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  23192362 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattctcttcccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 23192278  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  23192277 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagattttaccaatattctttcaagatctatctaagtgcat 23192178  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||| | ||||||||||| |||  ||| |     |||||||| |    
T  23192177 tatatttgagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagacaagaaatattaagttgttaacctaaaataaatta-----taaggggaca 23192083  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  23192082 acttacatatggtaatttgttggcttgatgcggatcaatatatcaa 23192037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 25692956 - 25693381
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25692956 ggacatctattttgattggagaattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 25693055  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  25693056 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattctcttcccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 25693140  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||    
T  25693141 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagattttaccaatattctttcaagatctatctaagtgcat 25693240  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||  |||||||| | ||||||||||| |||  ||| |     |||||||| |    
T  25693241 tatattagagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagacaagaaatattaagttgttaacctaaaataaatta-----taaggggaca 25693335  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  25693336 acttacatatggtaaattgttggcttgatgcggatcaatatatcaa 25693381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 12660970 - 12661401
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12660970 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 12661069  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  12661070 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 12661154  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  12661155 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 12661253  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  12661254 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 12661353  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12661354 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 12661401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 16330416 - 16330847
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16330416 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 16330515  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  16330516 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 16330600  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |  |||||  ||| || ||||    
T  16330601 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttctcaatattctat-tatattcaatctaagtgca 16330699  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| |||| |  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  16330700 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaatcaaaatataaattataaaataagggga 16330799  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16330800 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 16330847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Original strand, 1892334 - 1892761
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1892334 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 1892433  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |||  |||| |              ||||||||||    
T  1892434 tctttcaaatatttcatttgaacttcaggttcacatttttcagctgcttattctctccccctaacatttaaaaaac--------------taatcagcct 1892519  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  1892520 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 1892618  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||| ||    
T  1892619 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataaggaga 1892718  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatat 454  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  1892719 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatat 1892761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22747401 - 22747146
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22747401 ggacatctatttcatttggagcattagcagctggtatttgatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagacaataatatttc 22747302  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    ||||          |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22747301 cttt----------atttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcaacct 22747213  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttt 280  Q
    | | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22747212 actgggctgaaaataagttggctcaacacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttt 22747146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 30675484 - 30675901
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30675484 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 30675583  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  30675584 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttca-tattttcagctgtttattttctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 30675668  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaat-atatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgc 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||  ||| || |||    
T  30675669 aataggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataacagatgaagattcatatcaaataaaattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgc 30675767  T
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggg 410  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| |||||||    
T  30675768 attatattggagcaattgtgatagacagaacacatccaaaaatttacttagatgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggg 30675867  T
Q  411 agaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgc 444  Q
    || |||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  30675868 aggacttacatatggaaacttgttggcttgatgc 30675901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 30675931 - 30676154
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  30675931 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataaatataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 30676029  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30676030 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 30676129  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  30676130 aagataatcgcacaaacttctggtt 30676154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 12661416 - 12661639
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  12661416 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 12661514  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12661515 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttttaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 12661614  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  12661615 aagataatcgcacaaacttctggtt 12661639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 511 - 733
Target Start/End: Original strand, 1892783 - 1893004
Alignment:
Q  511 caaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatat 610  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  1892783 caaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcatat 1892881  T
Q  611 gctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaca 709  Q
    ||||| || |||| ||||| ||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1892882 gctacaagttgtttaatat-aatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgaca 1892980  T
Q  710 taataatctcacaaacttctggtt 733  Q
      |||||| |||||||||||||||    
T  1892981 agataatcgcacaaacttctggtt 1893004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 23192017 - 23191794
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | | ||||    
T  23192017 ccaaagtagagtttattatgtatggtttcataagtatcaatcatacaatatactttagacgtctaaagaatgaatcttcaagtccatttttttaagcata 23191918  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaca 709  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    |||||||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  23191917 tgctagcagctattcaatatcagtttcaattgacaaatgatacttatcaaatgctttctgaaaaattcagaaaataaattctttgtcaaattcgttgaca 23191818  T
Q  710 taataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23191817 taataatctcacaaacttctggtt 23191794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 25693401 - 25693623
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| | | ||||    
T  25693401 ccaaagtagagtttattatgtatggtttcataagtatcaatcatacaatatactttagacgtctaaagaatgaatattcaagtccattttt-taagcata 25693499  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgaca 709  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    |||||||| | | ||||||||| |||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  25693500 tgctagcagctattcaatatcagtttcaattgacaaatgatacttatcaaatgctttatgaaaaattcagaaaataaattctttgtcaaattcgttgaca 25693599  T
Q  710 taataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25693600 taataatctcacaaacttctggtt 25693623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 510 - 730
Target Start/End: Original strand, 16330862 - 16331085
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  16330862 ccaaagtagagttttgaaggtatgatctcataagcataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 16330960  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg----ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgtt 705  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16330961 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgttttttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgtt 16331060  T
Q  706 gacataataatctcacaaacttctg 730  Q
    ||||  |||||| |||| |||||||    
T  16331061 gacaagataatcgcacacacttctg 16331085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 512 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 19568422 - 19568200
Alignment:
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatg 611  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  19568422 aaaatagagtttaaaaagtatggtctcatgagtatcaatcatacaattaaatttagacgtctaaagaatggatctttaagtccatttttatgagcatatg 19568323  T
Q  612 ctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacata 711  Q
    |||| || |||||||||| ||||| ||||    |||||| | | | ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||| |||| |    
T  19568322 ctactagttgttcaatattaatttcaattgacaaatgatgcttatcaaatgctttatgaaacgtttagtaaataaactctt-gataaatttgtagacaga 19568224  T
Q  712 ataatctcacaaacttctggttgt 735  Q
    |||||||  ||||||| |||||||    
T  19568223 ataatctttcaaacttatggttgt 19568200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25149326 - 25148985
Alignment:
Q  92 tcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattg-gaaaacca 190  Q
    |||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||| | |||| | ||||||||  | |||| |    
T  25149326 tcaagatgagaaaataatattctatttcaaataatttatttgaactccaggttcaca-tttttaaccacttattctctcactctaatatttaggaaacta 25149228  T
Q  191 aaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatt----tatatcaaatatatttttccaat 286  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||| |||   | |    
T  25149227 attcatcaattgataatcagtctacttagctgtaaacaagttcgctccatacaatttataatagatggagattcatatatatcaaatataatttctgact 25149128  T
Q  287 attctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaacc 386  Q
    ||  |||||| |||||||  | ||| ||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| || |||   |||||| ||||||||||||    
T  25149127 atcttttcaagatttatcttagtgcgttatattggagcaattttaatatacagaacacatccaaaaattcacttagatcgaaaatattaggttgttaacc 25149028  T
Q  387 ttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaat 429  Q
    | |||  | |   |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25149027 taaaaaaactataaaatcaaggggaggacttacatatagtaat 25148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26995535 - 26995353
Alignment:
Q  54 gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttt 153  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  26995535 gatttatttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaacatgagacaataatatt--ctttcaaataatttatttgaacttcaagttcaca--tct 26995440  T
Q  154 tagctgc-ttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctca 238  Q
     |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||  ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  26995439 cagctactttattatctccccctaatattgggaaaactaatccattaattgataatcaatctactggactgtaaataagttggctca 26995353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 47592257 - 47592147
Alignment:
Q  247 aatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacat 346  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47592257 aatgatagttggagattcatatcaaatatatttttccattattccttcaagatttatcttagtatattatattggagtaattgtgacatacacaacacat 47592158  T
Q  347 ccaaaaattca 357  Q
    |||||||||||    
T  47592157 ccaaaaattca 47592147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 523 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 25148920 - 25148827
Alignment:
Q  523 tataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatcca-tttttatgaacatatgctac 615  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||    
T  25148920 tataaggtatggtctcataagtttcaatcatacaatgaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagttcattttttatgaatatatgctac 25148827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 740 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 19568184 - 19568143
Alignment:
Q  740 atacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatat 781  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19568184 atacatgtggtcatttagttgatgaatcaatttaaatcatat 19568143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 250 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 16871 - 16335
Alignment:
Q  250 gatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatcca 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16871 gatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaagatttatcaaaatgcattatattggagcaattgtgacatacacaacacatcta 16772  T
Q  350 aaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatc 449  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16771 aaaattcaattagatgagaaatatgaggtttttaaccttaaaccaatgatatattaagaggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatc 16672  T
Q  450 aatatctcaata--caagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatc 547  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  16671 aatatctcaatatacaaaattattgatttccaaaattgagtctataaggcatgatctcataaccaaaacagagtatataaggtatgttctgataagtatc 16572  T
Q  548 aatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaat 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16571 aatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgatcatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattggtgaat 16472  T
Q  648 gatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgt 747  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16471 gatacttataaaatgctttttgaaaagtttataaaataaactctttgtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgt 16372  T
Q  748 gatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16371 gatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 16335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 8508572 - 8507816
Alignment:
Q  21 atctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttccttt 118  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  8508572 atctatttcttttggagcattagcaactgatatttgatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagacgagacaataatatttctttt 8508473  T
Q  119 caaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatatt-ggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctatta 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |     
T  8508472 caaataatttatttgaacttcaagttctca-ttttcagctgcttattatctccccctaatattaggaaaactaatccatcaattgataatcaacctactg 8508374  T
Q  218 ggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattata 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||        ||| |    
T  8508373 ggctgtaaacaagttggttcagtacaattaatgatagatggaggttcatatcaaatatattttcccaatattctttcaagacttatc--------ttaga 8508282  T
Q  318 ttagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaactt 417  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||      
T  8508281 ttggagcaattgtgatatacacaacacatccaaaa-tccacttagatgaaaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgctaaattaaggggaagacgc 8508183  T
Q  418 acatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa--tacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaa 515  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||| || | |||||||      
T  8508182 atatatagtaatgtgctggcttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaatagagtttataagacatggtctcctaaccaatc 8508083  T
Q  516 tagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctac 615  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| | ||||||||||    
T  8508082 tgaagtttataaagtatggtctcataagtatcaattatacaattaa-tttagacgtctaaagaatgaatcttcaagcccatttttataagcatatgctac 8507984  T
Q  616 cagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataa 715  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |   ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8507983 cagctattcaatgtcaatttcaactgacgaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcataaaataaactcttagtcaaatt-gttgacataataa 8507885  T
Q  716 tctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8507884 tctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcattgattcaaatcatataat 8507816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 74 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 10737917 - 10737358
Alignment:
Q  74 tgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttg-aacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccc 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||| ||||| ||    
T  10737917 tgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttcctttcaaataatttatttggaacttcaggttcaca-tgttcagcttcttattatcttcc 10737819  T
Q  173 cctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaa 271  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10737818 cctaatattgggaaaactaacccatcaattgataatcagcctactaggttgtaaataagttggctcaatacagttaatgatagatggagattcatatcaa 10737719  T
Q  272 atatatttttcc-aatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaa 370  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  | |||||||  | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || || || |||||||||    
T  10737718 atatttttttcccaatattcttttgagatttatcgtagtgcattatattggagcaattgtgatatacgcaacacatccaaacatccacttagatgagaaa 10737619  T
Q  371 tatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattat 470  Q
    ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||  || |    
T  10737618 tattaggtttttaaccaaaaaccaatgataaattaaggggagaacttatatatagtattgtgttggcttgatgcgaatcaatatctca--acaa-cttgt 10737522  T
Q  471 tgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacg 570  Q
    || || |||||||| || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10737521 tgattaccaaaatttagtttataagatatggtcccataaccaaaatagagtttataaggcatggtctaataagtatcaattatacaattaactttagacg 10737422  T
Q  571 tctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatt 634  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||    
T  10737421 tctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgctcccggttattcaatatcaatt 10737358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Original strand, 30716000 - 30716431
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30716000 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 30716099  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  30716100 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 30716184  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  30716185 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 30716283  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  30716284 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 30716383  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  30716384 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 30716431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 620 - 784
Target Start/End: Original strand, 24048006 - 24048170
Alignment:
Q  620 tgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 719  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048006 tgttcaatatcaatttgaattggtgaatgatacttataaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctc 24048105  T
Q  720 acaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24048106 acaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcgattcaaatcatataat 24048170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 420 - 720
Target Start/End: Original strand, 28349623 - 28349920
Alignment:
Q  420 atatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa--tacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaaaata 517  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  28349623 atatagtaatgtgttggtttgatgcaaatcaatatctcaacatacaagattattgattcccaaaa--gagtttataaggtatgatctcataaccaaacta 28349720  T
Q  518 gagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctacca 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28349721 gagtttataaggtatggtttcataagtatcaatcttacaattaacttcagacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgaacatatgctacca 28349820  T
Q  618 gctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaact---cttagtcaaatttgttgacataata 714  Q
    | | |||||||||||||   |      |||||||| | | ||||| ||| ||||||||| |||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  28349821 gttattcaatatcaattgaca------aatgatacttatcaaatgttttctgaaaagttcagatgataaactctgcttagtcaaatttgttgacataata 28349914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 30716446 - 30716669
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  30716446 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 30716544  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30716545 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttgaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 30716644  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  30716645 aagataatcgcacaaacttctggtt 30716669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29541694 - 29541405
Alignment:
Q  66 tttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttact 165  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  29541694 tttgcaaacgagtaatattttgaagatcaagatgagacaataatatttcctttcaaattattcatttgaacttcaggtttaca-ttttcagctgcttatt 29541596  T
Q  166 atctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagattta 265  Q
     ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||      
T  29541595 ctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcctactggactgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcc 29541510  T
Q  266 tatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatg 365  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | || ||||    
T  29541509 tatcaaatagatttccccaatattctttcaagttctatctaagtgcattatattggagcaactgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttagatg 29541410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Original strand, 30724169 - 30724388
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  30724169 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 30724267  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||     || ||||   | |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30724268 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaatt----gataatactcatcaaatgtttttttaaaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 30724363  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  30724364 aagataatcacacaaacttctggtt 30724388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 386
Target Start/End: Original strand, 30723898 - 30724080
Alignment:
Q  204 taatcagcctattaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-ta 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |    
T  30723898 taatcagcctactaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagatttttccaatattctatc-atattcaa 30723996  T
Q  303 tcaaattgcattatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaacc 386  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||||||    
T  30723997 tctaagtgcattatattggagcaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttagatgagaaatattaagttcttaacc 30724080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 510 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 29541302 - 29541178
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||    
T  29541302 ccaaagtagagtttagaaggtatggtcgcataagtattaatcatacaattaactttagatgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttataagcata 29541204  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaattt 635  Q
    |||||| || |||| |||||||||||    
T  29541203 tgctacaagttgtttaatatcaattt 29541178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 663 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 10737317 - 10737221
Alignment:
Q  663 ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaatatacatgtgatcatttagtt 759  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  10737317 ctttctgaaaagttcttaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttatggatatacatgtgataatttagtt 10737221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Original strand, 30723778 - 30723877
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30723778 ggacatctatttcgtttggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 118
Target Start/End: Original strand, 11686116 - 11686164
Alignment:
Q  70 caaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttccttt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  11686116 caaatgtgttatatcttgaggatcacgatgaaacaataatatttccttt 11686164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2316717 - 2316656
Alignment:
Q  312 attatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatat 373  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  2316717 attatattggagcgattgtaatatacacaacacatttaaaaatttatttagatgagaaatat 2316656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28484 - 27793
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28484 ggacatctatttcatttggatcattagcagctgatgtttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttc 28385  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28384 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagatgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 28286  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||| | |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  | |||||    
T  28285 actaggttataaataagttgacttaatacagttaatgatagatggagattcatatcaaatattttttcccaatattctttcgagatttatcgtagtgcat 28186  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28185 tatattggagcaactgtgatatacacaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaaccaatgataaattaaggggaga 28086  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| | |||||| |||||| |  |||||   ||||||||||||  ||||  || ||| ||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||    
T  28085 acttatacatagtattgtgtttgtctgatgtgaatcaatatctca--acaa-cttgttgattcccaaaattcagtttataagacatggtctcataaccaa 27989  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27988 aatagagtttataaggtatggtctgataagtatcaattatacaattaacttttgacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgct 27889  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    ||| | | ||||||||||||||||       |||||||| | | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27888 accggttattcaatatcaatttga-----caaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcttaaaataaactcttggtcaaatttgttgatataat 27794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 18316 - 17625
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18316 ggacatctatttcatttggatcattagcagctgatgtttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttc 18217  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18216 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagatgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 18118  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||| | |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  | |||||    
T  18117 actaggttataaataagttgacttaatacagttaatgatagatggagattcatatcaaatattttttcccaatattctttcgagatttatcgtagtgcat 18018  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18017 tatattggagcaactgtgatatacacaacacatccaaacatccacttagatgagaaatattaggttgttaacctaaaatcaatgataaattaaggggaga 17918  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| | |||||| |||||| |  |||||   ||||||||||||  ||||  || ||| ||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||    
T  17917 acttatacatagtattgtgtttgtctgatgtgaatcaatatctca--acaa-cttgttgattcccaaaattcagtttataagacatggtctcataaccaa 17821  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17820 aatagagtttataaggtatggtctgataagtatcaattatacaattaacttttgacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgct 17721  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    ||| | | ||||||||||||||||       |||||||| | | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17720 accggttattcaatatcaatttga-----caaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcttaaaataaactcttggtcaaatttgttgatataat 17626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38649 - 37959
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38649 ggacatctatttcatttggatcattagcagctgatgtttgatttatttacctttgcaaatgagttataccttgaggatcaagacgagacaataatatttc 38550  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38549 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagatgcttattatctccccctaatattgggaaaactaatccatcaattgataatcagcct 38451  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | |||| | |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  | |||||    
T  38450 actaggttataaataagttgacttaatacagttaatgatagatggagattcatatcaaatattttttcccaatattctttcgagatttatcgtagtgcat 38351  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38350 tatattggagcaactgtgatatacacaacacattcaaacatcca-atagatgagaaatattaggttgttaacctaaaatcaatgataaattaaggggaga 38252  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaatacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataaccaa 513  Q
    ||||| | |||||| |||||| |  |||||   ||||||||||||  ||||  || ||| ||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||    
T  38251 acttatacatagtattgtgtttgtctgatgtgaatcaatatctca--acaa-cttgttgattcccaaaattcagtttataagacatggtctcataaccaa 38155  T
Q  514 aatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgct 613  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38154 aatagagtttataaggtatggtctgataagtatcaattatacaattaacttttgacgtctaaagaatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgct 38055  T
Q  614 accagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataat 713  Q
    ||| | | ||||||||||||||||       |||||||| | | ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38054 accggttattcaatatcaatttga-----caaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcttaaaataaactcttggtcaaatttgttgacataat 37960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 111384 - 110835
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataa--gatttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttc 114  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  111384 ggacatctatttcatttggagcattagcggctgatatttgatttgtttaactttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagatgagataataatatttc 111285  T
Q  115 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaa-ccatcaattgataatcagcct 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||    
T  111284 ctttcaaataatttatttgaacttcaggttcaca-ttttcagctgcttattatctccccctaatattggaaaaactaatccatcaattcataatcagtct 111186  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcat 313  Q
    | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  111185 actaggctgtaaataagttggctcagcacaattaatgatagatggagattcatatcaaatcgattttcctaatattctttcaagatttatcttagtgcat 111086  T
Q  314 tatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggaga 413  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  111085 tatattggagcaattgtgatatacacaacacatcc-taaatccacttggatgaaaaatattaggttgttaacctaaaaccagtgatagattaaagggaga 110987  T
Q  414 acttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctca--atacaagattattgtttcccaaaattgagcttataaggcatgatcccataacc 511  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||  ||| || |||| ||    
T  110986 actt--atatagtaatgtgttggcttgatgcaaatcaatacctcaacatacaagtatattgattcccaaaatagagtttataagatatggtctcatagcc 110889  T
Q  512 aaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaacttt 565  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110888 aaaccagattttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaacttt 110835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 727 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 110745 - 110688
Alignment:
Q  727 tctggttgtgaatatacatgtgatcatttagttgatgcatcaattcaaatcatataat 784  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  110745 tctggttatgaatatacatgtgatcatttagttgatgcattgattcaaatcatataat 110688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 597 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 110837 - 110743
Alignment:
Q  597 ttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtttagaaaataaactct 691  Q
    ||||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||| || |   ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  110837 ttttatgagtatatgatatcagctgttcaatgttaatttcaactgacgaatgatacttatcaaatgctttctgaaaagttcagaaaataaactct 110743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10390 - 9972
Alignment:
Q  18 gacatctatttcgattggagcattagcagctaataag--atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatatttcc 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10390 gacatctatttcaattggagcattagcagctgctattttatttgcttaactttgcaaatgagttatatctcgaggatcaagatgggacaataatatttcc 10291  T
Q  116 tttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattgg-aaaaccaaaccatcaattgataatcagccta 214  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||     
T  10290 tttcaaataattcatttgaactttaggttcaca--tttcagctgcctattatctccccctaatattgggaaaactaattcatcaattgataatcagcct- 10194  T
Q  215 ttaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatttatcaaattgcatt 314  Q
           ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||| || ||||||    
T  10193 -------gtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagatttatatcaaatagattttcccaatattctttccagatctatctaagtgcatt 10101  T
Q  315 atattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaaaccaatgataaattaaggggagaa 414  Q
    ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| | || ||| | |||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||||  |    
T  10100 atattggagcaattgtaatagacacaacacatccaaaaatttacttagat-aaaaatattaagttgttaacctaaaataaattataaaataaggggatga 10002  T
Q  415 cttacatatagtaatgtgttggcttgatgc 444  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10001 cttacatatggtaacttgttggcttgatgc 9972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 534 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9962 - 9861
Alignment:
Q  534 gtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaat 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||| |||    
T  9962 gtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaataatggatcttcaagtccatttttatgagcatatgatacaagttgttcaatataaat 9863  T
Q  634 tt 635  Q
    ||    
T  9862 tt 9861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 110250 - 109819
Alignment:
Q  17 ggacatctatttcgattggagcattagcagctaataag---atttgtttacctttgcaaatgagttatatcttgaggatcaagaagagacaataatattt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  110250 ggacatctatttcgattggagcattagcagctgcttattttatttgtttaactttgcaaacgagttatattttgaggatcaagatgagacaataatattt 110151  T
Q  114 cctttcaaataatttatttgaacttcaggttcacaatttttagctgcttactatctccccctaatattggaaaaccaaaccatcaattgataatcagcct 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |              ||||||||||    
T  110150 tctttcaaataattcatttgaacttcaggttcac-attttcagctgcttattctctccccctaatattgggaaaac--------------taatcagcct 110066  T
Q  214 attaggctgtaaacaagttggctcaatacaattaatgatagatggagatttatatcaaatatatttttccaatattctttcaatatt-tatcaaattgca 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  ||| || ||||    
T  110065 actaggctgtaaacaagttggctcaatacaatttataatagatgaagattcatatcaaatagattttcccaatattctatc-atattcaatctaagtgca 109967  T
Q  313 ttatattagagcaattgtgacatacacaacacatccaaaaattcatttggatgagaaatatcaggttgttaaccttaa-accaatgataaattaagggga 411  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | || | |||||||||| | ||| ||||||  || |  ||| ||||| ||||||||    
T  109966 ttatattggagtaattgtgatagacacaacacatccaaaaatttacttaggtgagaaatattaagttcttaaccaaaatataaattataaaataagggga 109867  T
Q  412 gaacttacatatagtaatgtgttggcttgatgcatatcaatatctcaa 459  Q
    | |||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  109866 ggacttacatatggtaacttgttggcttgatgcgaatcaatatttcaa 109819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 510 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 109804 - 109581
Alignment:
Q  510 ccaaaatagagtttataaggtatggtctcataagtatcaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatctccaaatccatttttatgaacata 609  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  109804 ccaaagtagagttttgaaggtatggtctcataagtataaatcatacaattaactttagacgtctaaagaatggatcttcaagtcca-ttttatgagcata 109706  T
Q  610 tgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatg-ctttttgaaaagtttagaaaataaactcttagtcaaatttgttgac 708  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||  | |||||||| | | |||||  |||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  109705 tgctacaagttgtttaatatcaatttcaattgataaatgatacttatcaaatgtttttttttaaagttcagaaaataaactctttgtcaaatttgttgac 109606  T
Q  709 ataataatctcacaaacttctggtt 733  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  109605 aagataatcgcacaaacttctggtt 109581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0248 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0248
Description:

Target: scaffold0248; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 17426 - 17265
Alignment:
Q  577 gaatggatctccaaatccatttttatgaacatatgctaccagctgttcaatatcaatttgaattagtgaatgatacgtgtaaaatgctttttgaaaagtt 676  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||  ||||||||| | | ||||||||| | |||||||    
T  17426 gaatgaatcttctaatccatttttatgagtatatgctaccagctgttcaatgttaatttcaactaacgaatgatacttatcaaatgctttctaaaaagtt 17327  T
Q  677 tagaaaataaactcttagtcaaatttgttgacataataatctcacaaacttctggttgtgaat 739  Q
     | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  17326 caaaaaataaaatcttaatcaaa-ttgttgacataataatctaacaaacttcgggttatgaat 17265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University