View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7337_low_51 (Length: 363)

Name: NF7337_low_51
Description: NF7337
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7337_low_51
NF7337_low_51
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (8-361)||(15229269-15229622)
chr4 (8-361)||(1901657-1902010)
chr4 (8-361)||(15283446-15283799)
chr4 (8-361)||(15389896-15390249)
chr4 (7-361)||(6571252-6571606)
chr4 (7-360)||(34187479-34187832)
chr4 (7-361)||(5007272-5007626)
chr4 (7-361)||(31125036-31125390)
chr4 (8-360)||(24590874-24591226)
chr4 (7-360)||(36343034-36343387)
chr4 (23-360)||(14666433-14666770)
chr4 (7-361)||(39852037-39852391)
chr4 (7-322)||(18799170-18799485)
chr4 (7-361)||(30755153-30755507)
chr4 (7-361)||(33672316-33672670)
chr4 (7-361)||(54834786-54835140)
chr4 (7-361)||(14099940-14100294)
chr4 (7-360)||(14761823-14762176)
chr4 (7-361)||(21971100-21971454)
chr4 (7-361)||(27161834-27162188)
chr4 (7-322)||(40104195-40104510)
chr4 (8-360)||(24114062-24114414)
chr4 (116-360)||(17014551-17014795)
chr4 (293-361)||(24460281-24460349)
chr4 (44-107)||(14731187-14731250)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (8-361)||(19454929-19455281)
chr2 (8-361)||(21701671-21702024)
chr2 (7-361)||(27805087-27805441)
chr2 (7-361)||(27778602-27778956)
chr2 (7-361)||(9348489-9348843)
chr2 (7-361)||(12588190-12588544)
chr2 (7-360)||(37376541-37376894)
chr2 (7-322)||(27818360-27818675)
chr2 (7-361)||(13935051-13935405)
chr2 (7-361)||(34287734-34288088)
chr2 (7-361)||(34292794-34293148)
chr2 (7-361)||(16827845-16828199)
chr2 (7-361)||(16893282-16893636)
chr2 (7-361)||(32051178-32051532)
chr2 (7-361)||(39050329-39050683)
chr2 (7-361)||(40234891-40235245)
chr2 (7-361)||(259260-259614)
chr2 (38-361)||(19415006-19415329)
chr2 (7-361)||(11633692-11634046)
chr2 (7-361)||(12715109-12715463)
chr2 (23-360)||(28883610-28883947)
chr2 (8-360)||(23127074-23127426)
chr2 (7-361)||(21675689-21676043)
chr2 (7-361)||(31877661-31878015)
chr2 (8-360)||(27432952-27433304)
chr2 (8-360)||(12656923-12657275)
chr2 (116-360)||(20839390-20839634)
chr2 (7-361)||(39891454-39891808)
chr2 (39-361)||(34863092-34863414)
chr2 (7-361)||(37949829-37950183)
chr2 (293-361)||(34302968-34303036)
chr2 (39-361)||(37684416-37684738)
chr2 (39-361)||(37699681-37700003)
chr2 (293-361)||(3785162-3785230)
chr2 (293-361)||(27119196-27119264)
chr2 (293-361)||(31890993-31891061)
chr2 (293-361)||(34157518-34157586)
chr2 (7-126)||(11640117-11640236)
chr2 (249-361)||(37926992-37927104)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (8-361)||(16625160-16625513)
chr3 (8-361)||(18531734-18532087)
chr3 (7-361)||(20575406-20575760)
chr3 (7-361)||(29663529-29663883)
chr3 (8-360)||(8297318-8297670)
chr3 (7-361)||(18226536-18226890)
chr3 (7-361)||(28114513-28114867)
chr3 (7-360)||(7074557-7074910)
chr3 (23-360)||(18052623-18052960)
chr3 (7-360)||(20067388-20067741)
chr3 (8-360)||(15891266-15891618)
chr3 (7-361)||(10397478-10397832)
chr3 (8-360)||(22386138-22386490)
chr3 (7-361)||(5607881-5608235)
chr3 (8-330)||(6193661-6193983)
chr3 (7-361)||(11108908-11109262)
chr3 (7-361)||(5594916-5595270)
chr3 (7-361)||(4345246-4345600)
chr3 (7-361)||(5015057-5015411)
chr3 (7-360)||(18290913-18291266)
chr3 (7-360)||(18306214-18306567)
chr3 (8-360)||(4722977-4723329)
chr3 (8-360)||(15739654-15740006)
chr3 (8-360)||(29147315-29147667)
chr3 (8-360)||(35882112-35882464)
chr3 (7-322)||(18244084-18244399)
chr3 (7-361)||(31963032-31963386)
chr3 (7-361)||(4418264-4418618)
chr3 (39-361)||(5468362-5468684)
chr3 (8-361)||(22869415-22869768)
chr3 (8-361)||(22884474-22884827)
chr3 (7-360)||(18275612-18275965)
chr3 (7-360)||(32440499-32440852)
chr3 (8-360)||(8288031-8288383)
chr3 (7-270)||(48467272-48467535)
chr3 (23-270)||(4795303-4795550)
chr3 (7-361)||(10644415-10644769)
chr3 (7-361)||(17983515-17983869)
chr3 (7-361)||(24329504-24329858)
chr3 (7-361)||(51783368-51783722)
chr3 (7-361)||(8213083-8213437)
chr3 (7-361)||(21676038-21676392)
chr3 (31-360)||(18331997-18332326)
chr3 (7-361)||(6541021-6541375)
chr3 (38-361)||(7997938-7998261)
chr3 (7-361)||(47024798-47025152)
chr3 (8-321)||(28022621-28022934)
chr3 (293-361)||(5652860-5652928)
chr3 (293-361)||(4626417-4626485)
chr3 (293-361)||(5713700-5713768)
chr3 (293-361)||(5724610-5724678)
chr3 (293-361)||(5767690-5767758)
chr3 (293-361)||(17993501-17993569)
chr3 (7-120)||(20441462-20441575)
chr3 (7-120)||(41438588-41438701)
chr3 (249-361)||(28340766-28340878)
chr3 (249-361)||(36995759-36995871)
chr3 (44-107)||(7090873-7090936)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (8-361)||(22889863-22890216)
chr5 (12-361)||(25200427-25200776)
chr5 (116-361)||(25264686-25264931)
chr5 (8-360)||(23893600-23893952)
chr5 (7-360)||(15657176-15657529)
chr5 (7-361)||(9318844-9319198)
chr5 (7-361)||(40471964-40472318)
chr5 (7-360)||(41676102-41676455)
chr5 (7-361)||(12133548-12133902)
chr5 (7-361)||(26481784-26482138)
chr5 (8-360)||(11550748-11551100)
chr5 (8-360)||(30936027-30936379)
chr5 (7-359)||(33517749-33518101)
chr5 (7-361)||(3790934-3791288)
chr5 (7-361)||(28650628-28650982)
chr5 (7-361)||(43079645-43079999)
chr5 (7-360)||(33293918-33294271)
chr5 (8-360)||(24686573-24686925)
chr5 (8-360)||(24971412-24971764)
chr5 (8-360)||(33778881-33779233)
chr5 (7-361)||(24682833-24683187)
chr5 (7-361)||(24725360-24725714)
chr5 (8-360)||(23750866-23751218)
chr5 (7-361)||(15757272-15757626)
chr5 (7-361)||(18499145-18499499)
chr5 (8-360)||(22997530-22997882)
chr5 (8-360)||(23716404-23716756)
chr5 (7-361)||(8663890-8664244)
chr5 (7-361)||(13323244-13323598)
chr5 (7-322)||(37669937-37670252)
chr5 (7-361)||(28958201-28958555)
chr5 (7-361)||(30169862-30170216)
chr5 (7-361)||(37357058-37357412)
chr5 (7-361)||(30030808-30031162)
chr5 (7-361)||(30153411-30153765)
chr5 (7-361)||(37756373-37756727)
chr5 (7-360)||(18125811-18126164)
chr5 (7-361)||(6875698-6876052)
chr5 (7-361)||(31824822-31825176)
chr5 (7-361)||(34617911-34618265)
chr5 (8-361)||(31432834-31433187)
chr5 (38-322)||(37769441-37769725)
chr5 (7-361)||(2512444-2512798)
chr5 (293-361)||(13440067-13440135)
chr5 (293-361)||(9548116-9548184)
chr5 (293-361)||(11326315-11326383)
chr5 (293-361)||(13184222-13184290)
chr5 (249-361)||(18373950-18374062)
chr5 (249-361)||(5639422-5639534)
chr5 (249-361)||(32594689-32594801)
chr5 (45-120)||(34467047-34467122)
chr5 (291-360)||(20390438-20390507)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (8-361)||(16042709-16043062)
chr7 (8-361)||(16448402-16448755)
chr7 (7-361)||(5145744-5146098)
chr7 (8-360)||(5129378-5129730)
chr7 (7-361)||(26318273-26318627)
chr7 (7-361)||(26536274-26536628)
chr7 (8-360)||(5160905-5161257)
chr7 (7-322)||(26436642-26436957)
chr7 (8-320)||(10915313-10915625)
chr7 (7-361)||(26514166-26514520)
chr7 (7-361)||(31126305-31126659)
chr7 (23-360)||(16501806-16502143)
chr7 (8-360)||(11423182-11423534)
chr7 (7-361)||(31562794-31563148)
chr7 (8-360)||(2155959-2156311)
chr7 (7-361)||(3446691-3447045)
chr7 (7-361)||(9620036-9620390)
chr7 (23-360)||(16516842-16517179)
chr7 (7-361)||(11442264-11442618)
chr7 (7-361)||(26273498-26273852)
chr7 (7-361)||(16734864-16735218)
chr7 (7-361)||(16749918-16750272)
chr7 (7-361)||(17524917-17525271)
chr7 (7-361)||(17527944-17528298)
chr7 (7-361)||(24590945-24591299)
chr7 (39-361)||(26668318-26668640)
chr7 (293-361)||(2108567-2108635)
chr7 (191-361)||(45388789-45388959)
chr7 (293-361)||(45733973-45734041)
chr7 (7-114)||(18542184-18542291)
chr7 (293-354)||(31088033-31088094)
chr7 (293-361)||(4201060-4201128)
chr7 (45-120)||(800159-800234)
chr7 (249-361)||(4143650-4143762)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (8-361)||(16206549-16206902)
chr1 (8-194)||(20462469-20462655)
chr1 (7-361)||(10964053-10964407)
chr1 (7-361)||(51639601-51639955)
chr1 (7-361)||(28586364-28586718)
chr1 (7-361)||(41791826-41792180)
chr1 (7-361)||(10946462-10946816)
chr1 (299-361)||(20462656-20462718)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (8-361)||(22079379-22079732)
chr8 (8-360)||(16284834-16285186)
chr8 (8-360)||(27607383-27607735)
chr8 (8-360)||(18792092-18792444)
chr8 (7-361)||(19675825-19676179)
chr8 (8-361)||(19206837-19207190)
chr8 (23-360)||(19689498-19689835)
chr8 (7-361)||(9356007-9356361)
chr8 (7-361)||(3327984-3328338)
chr8 (8-360)||(14559009-14559361)
chr8 (8-360)||(16278939-16279290)
chr8 (8-360)||(2135737-2136089)
chr8 (8-361)||(29830707-29831060)
chr8 (7-322)||(12091240-12091555)
chr8 (7-361)||(31355909-31356263)
chr8 (7-361)||(33260107-33260461)
chr8 (7-322)||(28360471-28360786)
chr8 (293-361)||(33245177-33245245)
chr8 (191-361)||(31488350-31488520)
chr8 (293-361)||(19658675-19658743)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (8-361)||(17090907-17091260)
chr6 (8-322)||(27628206-27628520)
chr6 (7-361)||(16675520-16675874)
chr6 (7-360)||(29550856-29551209)
chr6 (7-361)||(3697462-3697816)
chr6 (7-361)||(26776071-26776425)
chr6 (8-360)||(22933342-22933694)
chr6 (8-360)||(23855787-23856139)
chr6 (8-360)||(24303080-24303432)
chr6 (8-360)||(15422779-15423131)
chr6 (8-324)||(27271078-27271394)
chr6 (7-361)||(29502796-29503150)
chr6 (8-114)||(20162073-20162179)
chr6 (8-114)||(22170652-22170758)
chr6 (7-361)||(27045769-27046123)
chr6 (8-360)||(27020520-27020873)
chr6 (8-360)||(13297413-13297765)
chr6 (8-360)||(24865099-24865451)
chr6 (8-360)||(26919762-26920114)
chr6 (8-361)||(27288831-27289184)
chr6 (8-360)||(16751236-16751588)
chr6 (7-322)||(26114910-26115225)
chr6 (186-361)||(20162176-20162351)
chr6 (186-361)||(22170480-22170655)
chr6 (7-361)||(27009111-27009465)
chr6 (7-322)||(27486510-27486825)
chr6 (7-322)||(28208835-28209150)
chr6 (7-361)||(30556477-30556831)
chr6 (7-361)||(4759145-4759499)
chr6 (7-361)||(4544236-4544590)
chr6 (7-361)||(4526667-4527021)
chr6 (7-361)||(16942488-16942842)
chr6 (8-201)||(26990271-26990464)
chr6 (7-322)||(4722634-4722949)
chr6 (7-361)||(29574394-29574748)
chr6 (116-348)||(34913563-34913795)
chr6 (249-361)||(4774506-4774618)
chr6 (293-361)||(8891930-8891998)
chr6 (293-361)||(8903165-8903233)
chr6 (293-361)||(28163166-28163234)
chr6 (293-361)||(33373875-33373943)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (7-361)||(958-1312)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (8-361)||(5755-6108)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (263-361)||(46134-46232)
scaffold0124 (8-360)||(31838-32190)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (8-360)||(31142-31494)
scaffold0089 (23-360)||(45504-45841)
scaffold0089 (8-348)||(38600-38940)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (7-322)||(10950-11265)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (23-360)||(28693-29030)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (7-361)||(7399-7753)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (7-322)||(9333-9648)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (7-361)||(13448-13802)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (7-361)||(24719-25073)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (293-361)||(22073-22141)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (293-361)||(119574-119642)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (249-361)||(7707-7819)
scaffold0159 (249-361)||(21260-21372)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (129-322)||(27711-27904)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 15229269 - 15229622
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15229269 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 15229368  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15229369 agaatggaaaacttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15229468  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15229469 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 15229568  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15229569 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 15229622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 1901657 - 1902010
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1901657 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcataagaaattgaagtttgtaa 1901756  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  1901757 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgccgaaggaactgc 1901856  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1901857 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 1901956  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1901957 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 1902010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15283799 - 15283446
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15283799 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggacacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 15283700  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15283699 agaatgggaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 15283600  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15283599 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 15283500  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15283499 gtcggctagggcaagttaatacaactccgcgggaataagcacaaagaaggtctc 15283446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15390249 - 15389896
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15390249 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcctagaaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgtaa 15390150  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  15390149 agaatggaaagctcgttacaatccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 15390050  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||||| ||  ||    
T  15390049 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtccaagaaggtcaagct 15389950  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  15389949 accggctggggcaagttaatacaactccttaagaataagcacagagagggtctc 15389896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 6571252 - 6571606
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  6571252 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 6571351  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  6571352 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 6571451  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  6571452 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 6571551  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6571552 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6571606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34187832 - 34187479
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  34187832 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 34187733  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| ||||| ||||    
T  34187732 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagaggggactg 34187633  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  34187632 cttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 34187533  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34187532 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 34187479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 5007272 - 5007626
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5007272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5007371  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  5007372 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggggaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 5007471  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||    
T  5007472 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggaaggtcagac 5007571  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5007572 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5007626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31125390 - 31125036
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  31125390 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 31125291  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31125290 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31125191  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  31125190 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 31125091  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31125090 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31125036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24591226 - 24590874
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24591226 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24591127  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24591126 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24591027  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24591026 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24590927  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  24590926 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 24590874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36343387 - 36343034
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  36343387 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 36343288  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  36343287 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 36343188  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  36343187 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 36343088  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  36343087 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 36343034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 14666433 - 14666770
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  14666433 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtaacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 14666532  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  14666533 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 14666632  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaa 321  Q
    | | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||| |||||||     
T  14666633 tgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggatggggcag 14666731  T
Q  322 gttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  14666732 gttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 14666770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 39852037 - 39852391
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39852037 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39852136  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || || || |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39852137 aggaatggaaagcttgttaccgttcacggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39852236  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39852237 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39852336  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39852337 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39852391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18799485 - 18799170
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18799485 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18799386  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||  || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18799385 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgttgtccttttcttgtattgaagcggggtctgctgaagggactg 18799286  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  18799285 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 18799186  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  18799185 tgccggctggggcaag 18799170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 30755153 - 30755507
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30755153 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30755252  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30755253 aagaatggaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30755352  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  30755353 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 30755452  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30755453 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30755507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33672670 - 33672316
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33672670 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33672571  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33672570 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33672471  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  33672470 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 33672371  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  33672370 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 33672316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 54834786 - 54835140
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  54834786 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 54834885  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  54834886 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 54834985  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||  ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  54834986 ctttccaaggtttgatcattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 54835085  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  54835086 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 54835140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 14099940 - 14100294
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  14099940 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 14100039  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  14100040 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 14100139  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  14100140 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 14100238  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  14100239 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 14100294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14762176 - 14761823
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  14762176 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 14762077  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | ||||||||  |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  14762076 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagagaaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 14761977  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  14761976 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 14761877  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  14761876 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 14761823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 21971100 - 21971454
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21971100 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21971199  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21971200 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21971299  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  21971300 cgttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 21971398  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  21971399 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21971454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27162188 - 27161834
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27162188 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27162089  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27162088 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27161989  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  27161988 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 27161890  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27161889 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27161834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40104510 - 40104195
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  40104510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 40104411  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40104410 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40104311  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40104310 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40104211  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    |||||| |||||||||    
T  40104210 tgccggttggggcaag 40104195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 24114062 - 24114414
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24114062 atggatattaatgcctcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24114161  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  24114162 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 24114261  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24114262 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24114361  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24114362 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24114414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 360
Target Start/End: Original strand, 17014551 - 17014795
Alignment:
Q  116 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 215  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| ||    
T  17014551 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaag 17014650  T
Q  216 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 315  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  17014651 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 17014750  T
Q  316 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17014751 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 17014795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24460349 - 24460281
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460349 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 24460281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 14731250 - 14731187
Alignment:
Q  44 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  14731250 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 14731187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19455281 - 19454929
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455281 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgttggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 19455182  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19455181 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatcttt-tcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 19455083  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  19455082 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaaggctggggctgctatggcttctttaaaagacgcttagaaggctgtccaagaaggacaggct 19454983  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19454982 gccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 19454929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21702024 - 21701671
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21702024 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaattttaagtttgtaa 21701925  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21701924 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagttgtcgtctttctcttgtattgaagctggatctgctgaaggaactgc 21701825  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21701824 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 21701725  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21701724 gccggccggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 21701671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 27805087 - 27805441
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||    
T  27805087 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccctacatcagaagttgaagttcata 27805186  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27805187 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27805286  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27805287 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27805386  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27805387 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27805441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 27778602 - 27778956
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27778602 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27778701  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27778702 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27778801  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27778802 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27778901  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27778902 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27778956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9348843 - 9348489
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  9348843 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 9348744  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9348743 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9348644  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9348643 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9348544  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9348543 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 12588190 - 12588544
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  12588190 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 12588289  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12588290 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagtcagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12588389  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12588390 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12588489  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12588490 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 12588544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 37376541 - 37376894
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  37376541 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 37376640  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    || | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  37376641 aaaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 37376740  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  37376741 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 37376840  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  37376841 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 37376894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 27818360 - 27818675
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  27818360 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 27818459  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||  | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27818460 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctcacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27818559  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| |||| |||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  27818560 ctttccaaggtttgaccattggaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 27818659  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    |||||| |||||||||    
T  27818660 tgccggttggggcaag 27818675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13935405 - 13935051
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  13935405 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 13935306  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13935305 aggaatggaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13935206  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  13935205 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 13935106  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13935105 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13935051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 34287734 - 34288088
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34287734 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34287833  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34287834 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34287933  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34287934 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34288033  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34288034 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34288088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 34292794 - 34293148
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  34292794 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 34292893  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||     
T  34292894 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggacta 34292993  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  34292994 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 34293093  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34293094 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34293148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16828199 - 16827845
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16828199 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16828100  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16828099 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16828000  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16827999 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16827900  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16827899 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16827845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 16893282 - 16893636
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  16893282 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 16893381  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16893382 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16893481  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  16893482 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 16893581  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16893582 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16893636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 32051178 - 32051532
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  32051178 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 32051277  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  32051278 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 32051377  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  32051378 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 32051477  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  32051478 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 32051532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39050683 - 39050329
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  39050683 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 39050584  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  39050583 aggaatgaaaagcttgttacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 39050484  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||||||||||||| | || |  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  39050483 ctttccaaggtttgactattgaaggtgcagaacctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 39050384  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39050383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39050329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 40234891 - 40235245
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  40234891 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 40234990  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| || | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40234991 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40235090  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40235091 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40235190  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  40235191 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 40235245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 259614 - 259260
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  259614 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 259515  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  259514 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 259415  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  259414 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 259315  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  259314 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 259260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19415329 - 19415006
Alignment:
Q  38 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  19415329 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 19415230  T
Q  138 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 237  Q
    ||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  19415229 aagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 19415130  T
Q  238 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 336  Q
    | || | |||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  19415129 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttctttgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtaatacagctctg 19415031  T
Q  337 cgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19415030 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 19415006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11634046 - 11633692
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11634046 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11633947  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11633946 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11633847  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  || ||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  11633846 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaaaaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 11633747  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11633746 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11633692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12715463 - 12715109
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12715463 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12715364  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12715363 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12715264  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12715263 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12715164  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12715163 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 12715109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 28883610 - 28883947
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28883610 tcttacagctgtctcttgggtagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28883709  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||||||| |||  | ||    
T  28883710 ttaccattcatggagaggaagcatacctggctagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcctttcaaggattaac 28883809  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28883810 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28883909  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28883910 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 28883947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23127426 - 23127074
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23127426 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23127327  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||||| ||||| || ||    
T  23127326 aaagtggaaagcttgttaccatacatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcataggggcaggatctgcagaggggaccgc 23127227  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23127226 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23127127  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||    
T  23127126 gccggctggggcaggttaatacagctttgtgagaacaagcataaggaaggtct 23127074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21676043 - 21675689
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  21676043 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 21675944  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21675943 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21675844  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  21675843 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 21675745  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    | ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  21675744 ccgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21675689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 31877661 - 31878015
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31877661 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31877760  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  31877761 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 31877860  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  31877861 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 31877960  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    || ||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31877961 tgtcggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31878015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27433304 - 27432952
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||| |||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27433304 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcggtgacctttactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27433205  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27433204 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27433105  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27433104 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27433005  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27433004 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27432952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 12656923 - 12657275
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  12656923 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 12657022  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||| | ||||| || ||    
T  12657023 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctacagaggggaccgc 12657122  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  12657123 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 12657222  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  12657223 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 12657275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 360
Target Start/End: Original strand, 20839390 - 20839634
Alignment:
Q  116 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 215  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  20839390 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 20839489  T
Q  216 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 315  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||    
T  20839490 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctg 20839589  T
Q  316 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  20839590 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 20839634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 39891454 - 39891808
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  39891454 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 39891553  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  39891554 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 39891653  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||  |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  39891654 ctttccaaggtttgatcattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 39891752  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  39891753 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 39891808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Original strand, 34863092 - 34863414
Alignment:
Q  39 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  34863092 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 34863191  T
Q  139 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 238  Q
    |||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||    
T  34863192 agaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagag 34863291  T
Q  239 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 338  Q
       ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  34863292 tcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtg 34863391  T
Q  339 agaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  34863392 agaacaagcgtaaagaaggtctc 34863414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37950183 - 37949829
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  37950183 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 37950084  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37950083 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37949984  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  | ||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  ||  | || || || |||||    
T  37949983 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagccggggctgctgtggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaggagggtcagac 37949884  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37949883 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 37949829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34303036 - 34302968
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34303036 caagaaggacaggctgccggctggggtaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagagggtctc 34302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37684738 - 37684416
Alignment:
Q  39 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37684738 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37684639  T
Q  139 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 238  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37684638 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37684539  T
Q  239 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 337  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37684538 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37684440  T
Q  338 gagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37684439 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37684416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37700003 - 37699681
Alignment:
Q  39 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  37700003 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 37699904  T
Q  139 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 238  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  37699903 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 37699804  T
Q  239 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 337  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  37699803 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 37699705  T
Q  338 gagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37699704 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 37699681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 3785162 - 3785230
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3785162 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 3785230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 27119196 - 27119264
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  27119196 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 27119264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31891061 - 31890993
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891061 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 31890993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 34157518 - 34157586
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34157518 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 34157586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11640236 - 11640117
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||  ||    
T  11640236 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccactttacatcagaagttgaagttcata 11640137  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttac 126  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  11640136 aggaatggaaagcttgttac 11640117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 37926992 - 37927104
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||||| | | || ||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  37926992 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagaaggttatccaggaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 37927091  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  37927092 taaagaaggtctc 37927104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16625513 - 16625160
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625513 atggacatcaatgcttcttatagctgtatcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 16625414  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16625413 agaatgggaagcttgttatagtccatggataagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16625314  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16625313 ctttcaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaggctggggctgctgtggcttctttaaaagacgctcagaaggctgtccaagaaggacaggct 16625214  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16625213 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16625160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 18531734 - 18532087
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18531734 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 18531833  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  18531834 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagagacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctaccgaaggaactgc 18531933  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18531934 ctttcaaggtttgactattgaaggtatggagcctaagaagactggggctgccatggcatctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 18532033  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532034 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 18532087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20575760 - 20575406
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20575760 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20575661  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  20575660 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 20575561  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  20575560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 20575461  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20575460 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 20575406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29663883 - 29663529
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29663883 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29663784  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||  ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29663783 aggaatgaaaagcttgttaccgttcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29663684  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  29663683 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 29663584  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29663583 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29663529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 8297318 - 8297670
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  8297318 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 8297417  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  8297418 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 8297517  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  8297518 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 8297616  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8297617 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 8297670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 18226536 - 18226890
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  18226536 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 18226635  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18226636 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18226735  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  18226736 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 18226835  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  18226836 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 18226890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28114867 - 28114513
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||      
T  28114867 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgag 28114768  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||    
T  28114767 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaggcagggtctgctgaagggactg 28114668  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  28114667 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 28114568  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28114567 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28114513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 7074557 - 7074910
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  7074557 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 7074656  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  7074657 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctgtcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 7074756  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  7074757 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 7074856  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  7074857 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 7074910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 18052623 - 18052960
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  18052623 tcttacagctgtctcctggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 18052722  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  18052723 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 18052822  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  18052823 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 18052922  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18052923 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18052960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 20067388 - 20067741
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  20067388 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 20067487  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  20067488 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 20067587  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  20067588 cttttcaaggtttaactctcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 20067687  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20067688 tgccggccggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 20067741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15891618 - 15891266
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15891618 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15891519  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15891518 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15891419  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || |||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  15891418 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 15891319  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15891318 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 10397478 - 10397832
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||     
T  10397478 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 10397577  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10397578 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10397677  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  10397678 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 10397777  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10397778 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10397832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22386490 - 22386138
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22386490 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgatgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22386391  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  22386390 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 22386291  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22386290 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcgatggcttctttaaaggatacacagagagccgtccaagagggtcaagct 22386191  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22386190 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22386138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5608235 - 5607881
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5608235 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5608136  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5608135 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5608036  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | ||| ||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  5608035 ctttccaaggtctgaccattgaaggtgcagagtctaaagaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 5607937  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5607936 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5607881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 330
Target Start/End: Original strand, 6193661 - 6193983
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  6193661 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttgggaagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 6193760  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  6193761 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 6193860  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  ||    
T  6193861 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagct 6193960  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtaca 330  Q
    ||||||||||||| |||| ||||    
T  6193961 gccggctggggcaggttaataca 6193983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11109262 - 11108908
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11109262 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11109163  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11109162 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11109063  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  11109062 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 11108963  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11108962 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5595270 - 5594916
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5595270 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5595171  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5595170 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5595071  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  5595070 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 5594972  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5594971 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5594916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4345600 - 4345246
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    |||||||||||| || || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4345600 gatggacatcaacgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4345501  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    ||| |||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4345500 aagcatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4345401  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4345400 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagacgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4345301  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4345300 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4345246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 5015057 - 5015411
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  5015057 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 5015156  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  5015157 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 5015256  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  5015257 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 5015356  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5015357 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5015411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18291266 - 18290913
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18291266 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18291167  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18291166 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18291067  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18291066 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18290967  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18290966 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18290913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18306567 - 18306214
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18306567 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18306468  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18306467 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18306368  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18306367 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18306268  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18306267 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18306214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 4722977 - 4723329
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  4722977 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacatgatgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 4723076  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||  ||||| || ||    
T  4723077 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgtagaggggaccgc 4723176  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  4723177 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 4723276  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4723277 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 4723329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15740006 - 15739654
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  15740006 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttagggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 15739907  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  15739906 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 15739807  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15739806 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15739707  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15739706 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15739654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29147667 - 29147315
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  29147667 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 29147568  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  29147567 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccaactatcatctttctcttgcatagaggcggggtctgcagaggggaccgc 29147468  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||   |    
T  29147467 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagtccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagtt 29147368  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29147367 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29147315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 35882112 - 35882464
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  35882112 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 35882211  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  35882212 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 35882311  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || || || |  || || | ||| || ||  ||    
T  35882312 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacatagagccgtccgagagggtcaagct 35882411  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  35882412 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 35882464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 18244084 - 18244399
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  18244084 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 18244183  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  ||||||||||| || ||||    
T  18244184 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgctgaagggactg 18244283  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  18244284 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 18244383  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  18244384 tgccggctggggcaag 18244399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31963386 - 31963032
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31963386 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31963287  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  31963286 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 31963187  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  31963186 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 31963088  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31963087 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31963032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 4418264 - 4418618
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  4418264 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 4418363  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4418364 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4418463  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  4418464 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 4418563  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4418564 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Original strand, 5468362 - 5468684
Alignment:
Q  39 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  5468362 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtaaagaatggaaaactcgttacaatccatggtga 5468461  T
Q  139 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 238  Q
    |||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  ||||  |||||||| | |||    
T  5468462 agaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagag 5468561  T
Q  239 ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcg 338  Q
    |  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |    
T  5468562 cctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtg 5468661  T
Q  339 agaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  5468662 agaacaagcgtaaagaaggtctc 5468684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22869768 - 22869415
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22869768 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22869669  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22869668 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22869569  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22869568 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22869470  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22869469 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 22869415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22884827 - 22884474
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  22884827 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 22884728  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22884727 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 22884628  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  22884627 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 22884529  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  22884528 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 22884474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18275965 - 18275612
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18275965 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18275866  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  18275865 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 18275766  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| ||||||| ||||| |  ||||||  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18275765 cttttcaaggattaactgttgaaggaacggaacctaagaaggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18275666  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18275665 tgccggctggagcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18275612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 32440499 - 32440852
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  32440499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgtggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 32440598  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  32440599 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaagaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 32440698  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  32440699 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 32440798  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  32440799 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 32440852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8288383 - 8288031
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  8288383 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 8288284  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  8288283 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtcggcggaggggaccgc 8288184  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  8288183 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 8288084  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8288083 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 8288031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 48467272 - 48467535
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  48467272 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 48467371  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  48467372 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 48467471  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 270  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48467472 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctgggactgctatggcttcttt 48467535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4795550 - 4795303
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  4795550 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 4795451  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  4795450 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 4795351  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttcttt 270  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| |||||||||||    
T  4795350 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttcttt 4795303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 10644415 - 10644769
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10644415 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagatcgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10644514  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10644515 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10644614  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  10644615 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 10644713  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10644714 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10644769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17983869 - 17983515
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17983869 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17983770  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17983769 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17983670  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  17983669 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 17983571  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17983570 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 17983515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 24329504 - 24329858
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24329504 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24329603  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24329604 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24329703  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  24329704 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 24329802  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24329803 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24329858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 51783368 - 51783722
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  51783368 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 51783467  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51783468 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51783567  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51783568 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51783666  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  51783667 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 51783722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 8213083 - 8213437
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8213083 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8213182  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8213183 acgaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8213282  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||||  |||||  ||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  8213283 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagcctaagaaagctggagctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 8213382  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  8213383 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 21676038 - 21676392
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  21676038 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 21676137  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| ||  | || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  21676138 aagaatggaaaaatcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 21676237  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  21676238 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 21676337  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  21676338 tgccggttggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 21676392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 360
Target Start/End: Original strand, 18331997 - 18332326
Alignment:
Q  31 ctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtc 130  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||  |     
T  18331997 ctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggaacagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttgttaccatt 18332096  T
Q  131 catggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaag 230  Q
    | |||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||| | ||||    
T  18332097 cgtggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaactgtcgaag 18332196  T
Q  231 gtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtaca 330  Q
    ||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18332197 gtacggagcccaagagggatggaactgcaatgacttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcaggttaataca 18332296  T
Q  331 actccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
     || |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  18332297 gcttcttgagaacaagcataaggaaggtct 18332326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6541375 - 6541021
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6541375 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6541276  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  6541275 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 6541176  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||  ||  | |||||||| ||||    
T  6541175 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgttcagagagccatccaagaaggtcaga 6541077  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6541076 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6541021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Original strand, 7997938 - 7998261
Alignment:
Q  38 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  7997938 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 7998037  T
Q  138 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 237  Q
    ||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  7998038 aagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgcgttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 7998137  T
Q  238 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccg 336  Q
    | || | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |    
T  7998138 gtctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctg 7998236  T
Q  337 cgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7998237 tgagaacaagcgtaaagaaggtctc 7998261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 47024798 - 47025152
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || || || ||||| |||||     
T  47024798 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcaaaagttgaaatttgtg 47024897  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| |||||||    
T  47024898 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaaggaactg 47024997  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| |||||| || | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  47024998 ctttccaaggtttgaccattgaaagtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 47025096  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  47025097 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 47025152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 321
Target Start/End: Original strand, 28022621 - 28022934
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  28022621 atggacattaatgcgtcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 28022720  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||| ||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || |||||    
T  28022721 agaatggaaaactcgttacaatccgtggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactgc 28022820  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     || | |||  |||| ||||||| | | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  28022821 tttccaaggtttgaccattgaagatgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 28022919  T
Q  307 tgccggctggggcaa 321  Q
     ||||||||||||||    
T  28022920 cgccggctggggcaa 28022934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 5652860 - 5652928
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5652860 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 5652928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 4626417 - 4626485
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  4626417 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 4626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 5713700 - 5713768
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5713700 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5713768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 5724610 - 5724678
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5724610 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5724678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5767758 - 5767690
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5767758 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 5767690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17993569 - 17993501
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17993569 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 17993501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 20441462 - 20441575
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  20441462 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 20441561  T
Q  107 aagaatgggaagct 120  Q
    ||||||||||||||    
T  20441562 aagaatgggaagct 20441575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Original strand, 41438588 - 41438701
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    |||||||||| | || || || |||||||| || ||  |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||     
T  41438588 gatggacatccaagcatcctacagctgtctactaggccgaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 41438687  T
Q  107 aagaatgggaagct 120  Q
    ||||||||||||||    
T  41438688 aagaatgggaagct 41438701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 28340766 - 28340878
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  28340766 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctgggggaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 28340865  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  28340866 taaagaaggtctc 28340878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36995871 - 36995759
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  36995871 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 36995772  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  36995771 taaagaaggtctc 36995759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 7090936 - 7090873
Alignment:
Q  44 agaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7090936 agaccatggattcatgacgctggggcagtgacatctactctccatcagaaattgaagtttgtaa 7090873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 22889863 - 22890216
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22889863 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggtgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 22889962  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  22889963 agaatggaaagcttgttacaatccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagcaggatctgctgaaggaactac 22890062  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22890063 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaagct 22890162  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890163 gtcggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 22890216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 361
Target Start/End: Original strand, 25200427 - 25200776
Alignment:
Q  12 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25200427 acatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaaagaa 25200526  T
Q  112 tgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgccttt 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25200527 tggaaagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgccttt 25200626  T
Q  212 cgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccg 311  Q
    | |||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25200627 caaggtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccg 25200726  T
Q  312 gctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25200727 gctggggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25200776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Original strand, 25264686 - 25264931
Alignment:
Q  116 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25264686 aagcttgttacagtccatggagaagaagcatatttggttagccagctatcgtctttctcctgcattgaagctggatctgctgaaggaactgcctttcaag 25264785  T
Q  216 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 315  Q
    |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  25264786 gtttgactattgaaggtacggaacctaagaagactgggactgctatggcttcttttaaagacgctcagaaggctattcaggaaggacaggctgccggctg 25264885  T
Q  316 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25264886 gggcaagttaatccaactccgtgagaataagcacaaggaaggtctc 25264931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 23893600 - 23893952
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  23893600 atggacatcaatgcctcttatagctgtctcttaggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccctgcaccagaagttaaagtttgcaa 23893699  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| || ||||| ||    
T  23893700 agagtggaaagctcgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaaggaaccgc 23893799  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  | |  |||||||||||||||| || || || || | ||| || |||||||| ||  |     
T  23893800 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggattgagctgctatggcttctttgaaggatgcacatagggccgtccaagaaggtcaagcc 23893899  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23893900 gccggctggggcagattaatacaactccgtgagaacaagcataaggaaggtct 23893952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15657529 - 15657176
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  15657529 gatggacattaatgcatcttacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 15657430  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |  | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  15657429 agaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 15657330  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  15657329 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 15657230  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15657229 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaataagcataaggaaggtct 15657176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 9318844 - 9319198
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  9318844 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 9318943  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9318944 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9319043  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  9319044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 9319143  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9319144 tgccggttggggcaaggtggtacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9319198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40472318 - 40471964
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  40472318 gatggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 40472219  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  40472218 aggaacggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 40472119  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| | ||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  40472118 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggccgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 40472019  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  40472018 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 40471964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 41676102 - 41676455
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  41676102 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 41676201  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  41676202 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatacttggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 41676301  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| ||||| ||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  41676302 cttttcaaggattaactgttgaatgtacggagtccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 41676401  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  41676402 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 41676455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 12133548 - 12133902
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  12133548 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 12133647  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  12133648 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 12133747  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  12133748 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 12133847  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12133848 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 12133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 26481784 - 26482138
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  26481784 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 26481883  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26481884 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26481983  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26481984 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26482083  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26482084 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26482138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 11550748 - 11551100
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| ||    
T  11550748 atggatattaatgcctcttacagctgtctcgtggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaagtttgcaa 11550847  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11550848 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11550947  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  11550948 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 11551047  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11551048 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11551100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 30936027 - 30936379
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  30936027 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 30936126  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  30936127 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 30936226  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  30936227 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 30936326  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  30936327 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 30936379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 359
Target Start/End: Original strand, 33517749 - 33518101
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||    
T  33517749 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcata 33517848  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  33517849 aggaatggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagttagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 33517948  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | |||| || || |||||    
T  33517949 ctttccaaggattgaccattgaaggtgcggagcctaagaaagctgggactgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttattcaggacggtcagac 33518048  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtc 359  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||    
T  33518049 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtc 33518101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 3790934 - 3791288
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  3790934 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 3791033  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3791034 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3791133  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||| ||| | ||||  |||||  |||||  ||||||| |||| || ||||| |||| ||||| | | || ||||| |||||    
T  3791134 ctttccaaggtttgaccattgagggtgcagagcctaagaaagctggggttgctatgacttcattgaaagatgctcggaaggttatccaggaaggtcagac 3791233  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3791234 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3791288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 28650628 - 28650982
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28650628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28650727  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  28650728 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 28650827  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28650828 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28650927  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28650928 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28650982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 43079645 - 43079999
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  43079645 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtcacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 43079744  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  43079745 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagttagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 43079844  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  43079845 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagccaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 43079944  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  43079945 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 43079999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 33293918 - 33294271
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||| | ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  33293918 gatggacgttaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 33294017  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  33294018 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 33294117  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33294118 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33294217  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33294218 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33294271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24686925 - 24686573
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24686925 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacataacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24686826  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || ||||| ||||| || ||    
T  24686825 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatataagcagggtctgcagaggggaccgc 24686726  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24686725 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaagatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24686626  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    | |||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24686625 gtcggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24686573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 24971412 - 24971764
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24971412 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24971511  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24971512 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttttcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24971611  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24971612 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24971711  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24971712 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24971764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 33778881 - 33779233
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  33778881 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 33778980  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  33778981 aaagtggaaagcttgttactattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcgtctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 33779080  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  33779081 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 33779180  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33779181 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 33779233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 24682833 - 24683187
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24682833 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24682932  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24682933 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24683032  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24683033 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24683132  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24683133 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24683187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 24725360 - 24725714
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24725360 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24725459  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24725460 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24725559  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24725560 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24725659  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24725660 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24725714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23751218 - 23750866
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  23751218 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 23751119  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23751118 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23751019  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23751018 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23750919  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23750918 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23750866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15757626 - 15757272
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  15757626 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 15757527  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||    
T  15757526 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaaggaactg 15757427  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  15757426 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 15757328  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  15757327 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 15757272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18499499 - 18499145
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18499499 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagttcata 18499400  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  18499399 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 18499300  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||  |    
T  18499299 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaagatgcacagaaagccgtccaagagggtcaagc 18499200  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  18499199 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 18499145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22997882 - 22997530
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  22997882 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 22997783  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  22997782 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 22997683  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | |||   ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22997682 ttttcaaggattaactgccgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcctctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22997583  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22997582 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22997530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23716756 - 23716404
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  23716756 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 23716657  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  23716656 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 23716557  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  |  || | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23716556 ttttcaaggattagctgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23716457  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23716456 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23716404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8664244 - 8663890
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  8664244 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 8664145  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  8664144 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 8664045  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  8664044 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ttggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 8663946  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  8663945 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgcgagaacaagcgtaaagaaggtctc 8663890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13323598 - 13323244
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  13323598 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 13323499  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13323498 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13323399  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  13323398 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 13323300  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13323299 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13323244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37670252 - 37669937
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37670252 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37670153  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  37670152 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 37670053  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37670052 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37669953  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  37669952 tgccggctggggcaag 37669937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28958555 - 28958201
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28958555 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28958456  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || ||||||||  |||| |  || |||||||| || ||||    
T  28958455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtgttgaggcagggtctgctgaagggactg 28958356  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  28958355 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 28958256  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28958255 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28958201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 30169862 - 30170216
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30169862 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30169961  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30169962 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30170061  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  30170062 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 30170161  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  30170162 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgcaaagaaggtctc 30170216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37357412 - 37357058
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37357412 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37357313  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37357312 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37357213  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37357212 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37357113  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37357112 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 37357058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 30030808 - 30031162
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30030808 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30030907  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30030908 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30031007  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  30031008 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 30031106  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30031107 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30031162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 30153411 - 30153765
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30153411 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30153510  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  30153511 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 30153610  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30153611 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30153709  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30153710 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30153765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 37756373 - 37756727
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  37756373 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 37756472  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  37756473 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 37756572  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  37756573 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 37756672  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  37756673 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 37756727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18126164 - 18125811
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18126164 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18126065  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||| ||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  || || || ||||| || |    
T  18126064 aggaatggaaagcttgttaccattcatggaaaagaggcatacctggtcagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtcggcagaggggaccg 18125965  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | ||||  ||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| || || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  18125964 cttttcagggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaaccgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 18125865  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18125864 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18125811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 6875698 - 6876052
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  6875698 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 6875797  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  6875798 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 6875897  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  6875898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 6875996  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  6875997 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 6876052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31825176 - 31824822
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31825176 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31825077  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31825076 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31824977  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31824976 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31824878  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31824877 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31824822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 34617911 - 34618265
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  34617911 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 34618010  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  34618011 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 34618110  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  34618111 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 34618209  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  34618210 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 34618265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 31432834 - 31433187
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  31432834 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 31432933  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| | || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  31432934 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttatcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 31433033  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31433034 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31433132  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31433133 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31433187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37769725 - 37769441
Alignment:
Q  38 ctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggag 137  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||| ||||||| |    
T  37769725 ctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaagaatggaaaactcgttacaatccatggtg 37769626  T
Q  138 aagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacgga 237  Q
    ||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||| || | |||  |||| ||||||||| | ||    
T  37769625 aagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcaga 37769526  T
Q  238 g-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37769525 gtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 37769441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 2512444 - 2512798
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  2512444 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 2512543  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| || | || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  2512544 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcacacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 2512643  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  2512644 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 2512742  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  2512743 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 2512798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13440135 - 13440067
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13440135 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13440067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9548184 - 9548116
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  9548184 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 9548116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 11326315 - 11326383
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  11326315 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 11326383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13184290 - 13184222
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184290 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 13184222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18374062 - 18373950
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  18374062 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 18373963  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  18373962 taaagaaggtctc 18373950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 5639422 - 5639534
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  5639422 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 5639521  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  5639522 taaagaaggtctc 5639534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32594801 - 32594689
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  32594801 ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 32594702  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  32594701 taaagaaggtctc 32594689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Original strand, 34467047 - 34467122
Alignment:
Q  45 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 120  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  34467047 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 34467122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20390507 - 20390438
Alignment:
Q  291 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||| |  |||  |||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  20390507 ttcaagaaggaaaagctgaaggctgggggaagttagtacagctgcccgagaacaagcacaaagaaggtct 20390438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 16042709 - 16043062
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16042709 atggacatcaacgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacacgatgctggcgcaataacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16042808  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16042809 agaatggaaagctcgttacggtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctgctgaaggaactgc 16042908  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16042909 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagcctaagaagactggggctactatggcttcttttaaagatgctcagaaggttgttcaagaaggacaggct 16043008  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043009 gccggctggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 16043062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16448755 - 16448402
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16448755 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtaa 16448656  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |    
T  16448655 agaatggaaagcttgttacggtccatggagaagaagcatatttggttagccagctgtcatctttctctagcattgaatctggatctgctgaagaaactac 16448556  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||| | |||  |||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16448555 cttccaaggtttgactattgaaggtacagagcctaagaaagctggggctgctatggtttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggct 16448456  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448455 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 16448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5146098 - 5145744
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  5146098 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 5145999  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  5145998 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatacttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 5145899  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  5145898 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctttggcttcgttgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 5145799  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5145798 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5145744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 5129378 - 5129730
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  5129378 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 5129477  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  5129478 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 5129577  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  5129578 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 5129677  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5129678 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5129730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26318627 - 26318273
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26318627 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26318528  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | ||| || |||||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26318527 aggaagggaaagcttgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26318428  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26318427 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26318328  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26318327 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26318273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26536628 - 26536274
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26536628 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggcgcggttacctccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26536529  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26536528 aagaatggaaaactcgttacaatccatggcgaagaagcatacttagtcagccagctgtcgtccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26536429  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||    
T  26536428 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagagggtcagac 26536329  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26536328 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26536274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 5160905 - 5161257
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  5160905 atggatattaatgcctcttacagctgtctcctggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 5161004  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||| ||||| || ||    
T  5161005 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagtagcagggtctgcagaggggaccgc 5161104  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  ||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||  | ||||| || ||  ||    
T  5161105 ttttcaaggattgactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccatccaagagggccaagct 5161204  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5161205 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 5161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 26436642 - 26436957
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| |||||||||||     
T  26436642 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaagtttgtg 26436741  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26436742 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26436841  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26436842 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26436941  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    |||||| |||||||||    
T  26436942 tgccggttggggcaag 26436957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10915625 - 10915313
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||| ||    
T  10915625 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcaa 10915526  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  10915525 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggttctgcagaggggaccgc 10915426  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  10915425 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 10915326  T
Q  308 gccggctggggca 320  Q
    |||||||||||||    
T  10915325 gccggctggggca 10915313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 26514166 - 26514520
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26514166 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26514265  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26514266 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26514365  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  26514366 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 26514465  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26514466 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26514520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 31126305 - 31126659
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  31126305 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 31126404  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31126405 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31126504  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31126505 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31126604  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31126605 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31126659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16502143 - 16501806
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16502143 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16502044  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16502043 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16501944  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  16501943 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 16501844  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16501843 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16501806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11423534 - 11423182
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  11423534 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 11423435  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  11423434 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 11423335  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||| ||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |     
T  11423334 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacgaagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagcc 11423235  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    || |||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  11423234 gctggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 11423182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31563148 - 31562794
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31563148 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31563049  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  31563048 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 31562949  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  31562948 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 31562849  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31562848 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31562794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 2155959 - 2156311
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2155959 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2156058  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  2156059 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggtagggtctgcagaggggaccgc 2156158  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||  ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  2156159 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgacatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 2156258  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| || || || ||||||||    
T  2156259 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaaacataaggaaggtct 2156311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 3446691 - 3447045
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3446691 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3446790  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3446791 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3446890  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  3446891 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 3446989  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3446990 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3447045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 9620036 - 9620390
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9620036 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9620135  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9620136 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9620235  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  9620236 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 9620334  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9620335 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9620390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16517179 - 16516842
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  16517179 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggtggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 16517080  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  16517079 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 16516980  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||| ||||||||| |    
T  16516979 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccagctggggcagg 16516880  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16516879 ttaataaagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16516842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 11442264 - 11442618
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  11442264 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11442363  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11442364 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11442463  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  11442464 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ccggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 11442562  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  11442563 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 11442618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26273852 - 26273498
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26273852 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26273753  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26273752 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26273653  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26273652 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26273554  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26273553 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26273498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16735218 - 16734864
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16735218 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16735119  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16735118 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16735019  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16735018 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16734919  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16734918 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16734864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16750272 - 16749918
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16750272 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16750173  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16750172 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16750073  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16750072 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16749973  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16749972 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16749918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 17524917 - 17525271
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17524917 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17525016  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17525017 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17525116  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17525117 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17525216  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17525217 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 17525271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17528298 - 17527944
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  17528298 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 17528199  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||  ||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  17528198 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacctagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 17528099  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  17528098 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 17527999  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  17527998 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 17527944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24591299 - 24590945
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  24591299 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24591200  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  24591199 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 24591100  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24591099 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24591000  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
     ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24590999 cgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24590945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26668640 - 26668318
Alignment:
Q  39 tgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttgttacagtccatggaga 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||| ||||||| ||    
T  26668640 tgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtgaaaaatggaaaactcgttacaatccatggtga 26668541  T
Q  139 agaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggag 238  Q
    |||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||| || |  ||  |||| ||||||||| | |||    
T  26668540 agaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgctttccagggtttgaccattgaaggtgcagag 26668441  T
Q  239 -ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgc 337  Q
     || | |||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |     
T  26668440 tctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattaaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgt 26668342  T
Q  338 gagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26668341 gagaacaagcgtaaagaaggtctc 26668318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2108635 - 2108567
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2108635 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 2108567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 361
Target Start/End: Original strand, 45388789 - 45388959
Alignment:
Q  191 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 290  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  45388789 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 45388888  T
Q  291 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  45388889 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 45388959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 45733973 - 45734041
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733973 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 45734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 114
Target Start/End: Original strand, 18542184 - 18542291
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  18542184 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 18542283  T
Q  107 aagaatgg 114  Q
    ||||||||    
T  18542284 aagaatgg 18542291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 31088094 - 31088033
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaaga 354  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31088094 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaaga 31088033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 4201060 - 4201128
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4201060 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4201128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 800234 - 800159
Alignment:
Q  45 gaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagct 120  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  800234 gaccctggattcatgaagcgggggcagtaacgtctaccttgcatcagaagttaaagtttgtgaagaatgggaagct 800159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4143762 - 4143650
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  4143762 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 4143663  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  4143662 taaagaaggtctc 4143650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16206902 - 16206549
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16206902 atggacatcaatgcctattatagctgtctcttgggaagaccatggatacacgatgctggcgcagtaacctctaccctgcatcagaaattgaagtttgtga 16206803  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  16206802 agaatggaaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagccggatctgctgaaggaactgc 16206703  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16206702 ctttcaaggtttgactattgaaggtacggagctcaaaaagactggggctactatggcttcttttaaagacgctcagaaggctgttcaggaaggacaggct 16206603  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16206602 gccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcataaggaaggtctc 16206549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Original strand, 20462469 - 20462655
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20462469 atggatatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccaacaattgaagtttgtaa 20462568  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20462569 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaggcatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagctggatctg 20462655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 10964053 - 10964407
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10964053 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10964152  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10964153 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10964252  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  10964253 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 10964351  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10964352 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10964407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 51639601 - 51639955
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  51639601 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcagttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 51639700  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  51639701 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 51639800  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  51639801 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 51639899  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  51639900 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 51639955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 28586364 - 28586718
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28586364 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28586463  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  28586464 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 28586563  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| |||||    
T  28586564 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagac 28586663  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  28586664 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 28586718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41792180 - 41791826
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  41792180 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 41792081  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||| |||| || ||||    
T  41792080 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctactgaagggactg 41791981  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  41791980 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 41791882  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  41791881 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 41791826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 10946462 - 10946816
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10946462 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 10946561  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  10946562 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 10946661  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  | |||||||| ||||    
T  10946662 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccatccaagaaggtcaga 10946760  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10946761 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 10946816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 361
Target Start/End: Original strand, 20462656 - 20462718
Alignment:
Q  299 ggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462656 ggacaggctgccggatggggcaagttaatacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 20462718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22079732 - 22079379
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  22079732 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctaggaagaccgtggatacatgacgctggggcagtgacctctaccctgcaccaaaagttaaagtttgtaa 22079633  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||    
T  22079632 agaatggaaagctcgttacagtccatggagaggaggcatatttggttagccagctatcatctttctcttgcattgaagcagggtctgcagaaggaaccgc 22079533  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     ||||  ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| | |||||| ||  ||    
T  22079532 ttttcagggtttgactatcgaaggtacggagcccaagagggctggagctgctatggcctctttgaaggatgctcagagggctgtcctagaaggtcaagct 22079433  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22079432 accggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacagagagggtctc 22079379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 16284834 - 16285186
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  16284834 atggatatcaatgcctcttatatctgtctcttgggaagaccgtggatacatgacgctggggcggtgacctctaccttgcaccagaagttgaagtttgcaa 16284933  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  16284934 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 16285033  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||||||||||||| || || || ||||  || ||  ||||||| ||  ||    
T  16285034 ttttcaaggtttaactgtcgaaggtacggagcccaaaagggatggaactgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtctaagaaggtcaagct 16285133  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16285134 gccggctggggcaggttaatacaacttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16285186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27607735 - 27607383
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  27607735 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 27607636  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  27607635 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 27607536  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  27607535 ttttcaaggactaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 27607436  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27607435 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27607383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 18792092 - 18792444
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  18792092 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 18792191  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  18792192 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 18792291  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  18792292 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 18792391  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18792392 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 18792444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 19675825 - 19676179
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  19675825 gatggacattaatgcctcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgctggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 19675924  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  19675925 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagtagggtctgctgaagggactg 19676024  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  19676025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 19676124  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19676125 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 19676179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19207190 - 19206837
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  19207190 atggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 19207091  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||  |||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  19207090 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaggcatacttagtcagccagctatcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 19206991  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| ||||||    
T  19206990 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagact 19206891  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  19206890 gccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 19206837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 19689498 - 19689835
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  19689498 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 19689597  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  19689598 ttaccattcatggagaggaagcatatctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 19689697  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  19689698 tgtcgaaggtacggaacctaagagggatggaactgcgatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 19689797  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19689798 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 19689835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 9356007 - 9356361
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||||    
T  9356007 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgta 9356106  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  9356107 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 9356206  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  9356207 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 9356305  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  9356306 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 9356361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3328338 - 3327984
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  3328338 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 3328239  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  3328238 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 3328139  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  3328138 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 3328039  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3328038 tgccggctggggcaagatgatacaactctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3327984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 14559009 - 14559361
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  14559009 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctaccttgcatcagaagttgaaatttgcca 14559108  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | |  || |||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  14559109 aaagcggaaagcttgttacaattcatggagaggaagcatacctggttaaccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 14559208  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  14559209 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggagggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 14559308  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| | || ||||||||    
T  14559309 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagtataaggaaggtct 14559361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 16278939 - 16279290
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16278939 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16279038  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |     
T  16279039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg- 16279137  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaaga-agactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    ||||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  16279138 ctttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagaga-tggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 16279236  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16279237 tgccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16279290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2136089 - 2135737
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  2136089 atggatattaatgcctcttacagttgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 2135990  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  2135989 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacccggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 2135890  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  2135889 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 2135790  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  2135789 gccggttggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 2135737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Original strand, 29830707 - 29831060
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |    
T  29830707 atggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtga 29830806  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||  ||||||| || |||||    
T  29830807 agaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggcctgctgaagggactgc 29830906  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  29830907 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 29831005  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29831006 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29831060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12091555 - 12091240
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  12091555 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 12091456  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  12091455 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 12091356  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  12091355 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 12091256  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    | ||||||||||||||    
T  12091255 taccggctggggcaag 12091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 31355909 - 31356263
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  31355909 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 31356008  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  31356009 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 31356108  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  31356109 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 31356207  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31356208 ctgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31356263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 33260107 - 33260461
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  33260107 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 33260206  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| | || || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  33260207 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcgtacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgagggaactg 33260306  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  | || ||||||||| | ||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  33260307 ctttccaaggtttaaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 33260406  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  33260407 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 33260461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28360786 - 28360471
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28360786 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28360687  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  28360686 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 28360587  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacgga-gctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | || ||| | |||| ||||| | ||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  28360586 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagaggctaaggaag-ctggggccgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 28360488  T
Q  306 ctgccggctggggcaag 322  Q
    |||||||||||||||||    
T  28360487 ctgccggctggggcaag 28360471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 33245177 - 33245245
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33245177 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 33245245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31488520 - 31488350
Alignment:
Q  191 tctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctg 290  Q
    ||||||||||||||||| || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||      
T  31488520 tctgctgagggaactgctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagcca 31488421  T
Q  291 ttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  31488420 ttcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 31488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19658743 - 19658675
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19658743 caagaaggacaagctgctggctggggcaagataatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 19658675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17091260 - 17090907
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  17091260 atggatatcaacgcttcttatagctgtcttctgggaaggccgtggatacatgacgcgggcgcagtaacctccaccctgcaccagaagttaaagtttgtga 17091161  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
     |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| || |||||    
T  17091160 ggaatggaaagctcgtcacagtccatggtgaagaagcatacttagttagccaactgtcatccttctcctgtattgaagcaggatctgctgaagggactgc 17091061  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  |||| |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  17091060 ttttcaaggattgaccattgaaggtacggagcccaagaaggttagggctgctatggcttctttgaaggacgctcagaaggctattcaagaaggacaggct 17090961  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  17090960 gccggttggggtaagttgatacaactctatgagaataaacacaaagaaggtctc 17090907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27628520 - 27628206
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||| |    
T  27628520 atggatattaatgcttcatacagctgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtga 27628421  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27628420 agaatggaaaactcgttacagtccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27628321  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     || | |||  |||| ||||||||  ||||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  27628320 tttccaaggtttgaccattgaaggcgcggagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttattcaagaaggtcagact 27628221  T
Q  308 gccggctggggcaag 322  Q
    |||||||||||||||    
T  27628220 gccggctggggcaag 27628206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 16675520 - 16675874
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  16675520 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 16675619  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16675620 aggaatggaaagcttgttaccgttcatggagaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16675719  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  16675720 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 16675819  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16675820 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16675874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Original strand, 29550856 - 29551209
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  ||    
T  29550856 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcata 29550955  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || |    
T  29550956 aggaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacttggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccg 29551055  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  29551056 cttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 29551155  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  29551156 tgccggctggggcaagttagtacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29551209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 3697462 - 3697816
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||| |||||     
T  3697462 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacaccagaagttgaaatttgtg 3697561  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  3697562 aagaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 3697661  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  3697662 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 3697761  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3697762 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 3697816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26776425 - 26776071
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||| || |||    
T  26776425 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggtaacctctaccttacatcagaagttgaaattcgta 26776326  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    | |||||  ||||| |||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  26776325 aggaatgaaaagctcgttaccattcatggtgaagaggcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 26776226  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | || ||||| |||||    
T  26776225 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcggagcttaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaggaaggtcagac 26776126  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  26776125 tgccggatggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 26776071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22933694 - 22933342
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  22933694 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 22933595  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  22933594 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 22933495  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  22933494 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 22933395  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  22933394 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 22933342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23856139 - 23855787
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||| ||    
T  23856139 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttacaccaaaagttgaaatttgcaa 23856040  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||| || ||    
T  23856039 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgttgaggggaccgc 23855940  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  23855939 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 23855840  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  23855839 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 23855787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24303432 - 24303080
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24303432 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24303333  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24303332 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 24303233  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  24303232 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 24303133  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24303132 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24303080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15423131 - 15422779
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  15423131 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcaggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 15423032  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  15423031 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 15422932  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| || || ||  |||  || || ||||| || ||  ||    
T  15422931 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcatagagagccgtccaagagggtcaagct 15422832  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15422831 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 15422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27271394 - 27271078
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |    
T  27271394 atggatattaatgcttcatacagttgcctcttgggaaggccttggatacatgacgcgggcgcggtaacctccaccttgcatcagaaattaaagtttgtga 27271295  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    ||||||| || || || ||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  27271294 agaatggaaaactcgtcacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 27271195  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     || |  ||  |||| |||||||||   ||||  |||| |  |||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||    
T  27271194 tttccagggtttgaccattgaaggtgtagagcctaagagggatggagctgccatggcttcattaaaagatgctcagagggttattcaggaaggtcagact 27271095  T
Q  308 gccggctggggcaagtt 324  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27271094 gccggttggggcaagtt 27271078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 29502796 - 29503150
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29502796 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccatggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29502895  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29502896 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29502995  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29502996 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29503094  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29503095 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29503150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 20162073 - 20162179
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  20162073 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 20162172  T
Q  108 agaatgg 114  Q
    |||||||    
T  20162173 agaatgg 20162179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 22170758 - 22170652
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  22170758 atggatatcaatgcttcgtatagctgtctcctgggaagaccttggatacatgacgctggcgcggtaacctctaccctacaccagaagttgaaatttgtga 22170659  T
Q  108 agaatgg 114  Q
    |||||||    
T  22170658 agaatgg 22170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 27045769 - 27046123
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27045769 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27045868  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27045869 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagctgtcttccttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27045968  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||| | | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| || | | || ||||| |||||    
T  27045969 ctttccaaggtttgaccattgaagatgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagggttatccaggaaggtcagac 27046068  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27046069 tgccggttggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27046123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 27020520 - 27020873
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27020520 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27020619  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  27020620 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 27020719  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||| || | || |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  |    
T  27020720 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaggagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagc 27020819  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  27020820 tgccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 27020873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 13297765 - 13297413
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  13297765 atggacattaacgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgagagcgatgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 13297666  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || ||    
T  13297665 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgc 13297566  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || |||||||| || ||  ||    
T  13297565 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgttcaagagggtcaagct 13297466  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  13297465 gccggctggggcaggttaatacagcttcgcgagaacaagcataaggaaggtct 13297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 24865099 - 24865451
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  24865099 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 24865198  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  24865199 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagccgggtctgcagaggggaccgc 24865298  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||| |||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  24865299 ttttcaaggattaactgtcgaaggaacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 24865398  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    | ||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24865399 gtcggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 24865451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 26919762 - 26920114
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| | |||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26919762 atggatattaatgcctcttacagttgcctcttggggaaaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26919861  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | ||||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  26919862 aaaatggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagtcagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 26919961  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  26919962 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 26920061  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  26920062 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 26920114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27289184 - 27288831
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  27289184 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 27289085  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||| ||    
T  27289084 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccaactatcatctttctcctgcatagaagcagggtctgcagagggaaccgc 27288985  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||| ||||  || | |  |||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||  || || ||||| || ||||||    
T  27288984 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacagagcctaaaagggatggagctgccatggcttctttgaaagatgcgcagagagccgtccaagagggtcagact 27288885  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    || || ||||||||| |  |||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27288884 gctgggtggggcaaggtgatacagctccgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27288831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 16751236 - 16751588
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  16751236 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccgtggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 16751335  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  16751336 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 16751435  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | ||||||| ||| |  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| || ||  ||    
T  16751436 ttttcaaggattaactgtcgaaggtatggaacctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagctgtccaagagggtcaagct 16751535  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16751536 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 16751588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26115225 - 26114910
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  26115225 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 26115126  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||    
T  26115125 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcaggatctgctgaagggactg 26115026  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  26115025 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 26114927  T
Q  306 ctgccggctggggcaag 322  Q
    |||||||||||||||||    
T  26114926 ctgccggctggggcaag 26114910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 361
Target Start/End: Original strand, 20162176 - 20162351
Alignment:
Q  186 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  20162176 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 20162275  T
Q  286 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  20162276 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctc 20162351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22170655 - 22170480
Alignment:
Q  186 atggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||| |||||| | |||| |||||||  |||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22170655 atggatctgctgagggaactgcttttcaagggttgtctatggaaggtgcagagcccaagaaggttggagctgcaatggcttctttgaaggacgcccagaa 22170556  T
Q  286 ggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  22170555 ggctgttcaggagggacaggctgccgactggggcaagttaatccaactctgtgagaataagcgaaaggaaggtctc 22170480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 27009111 - 27009465
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| ||| |     
T  27009111 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttatg 27009210  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  27009211 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 27009310  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  27009311 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 27009409  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  27009410 ctgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 27009465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 27486510 - 27486825
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  27486510 gatggacattaatgcatcctacagttgcctactgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 27486609  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  |||||||| || || ||||    
T  27486610 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcaggatctgccgaagggactg 27486709  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  27486710 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 27486809  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  27486810 tgccggctggggcaag 27486825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 28208835 - 28209150
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  28208835 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 28208934  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  28208935 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 28209034  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  28209035 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 28209134  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  28209135 tgccggctggggcaag 28209150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30556831 - 30556477
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  30556831 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 30556732  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  30556731 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 30556632  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  30556631 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 30556533  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  30556532 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 30556477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 4759145 - 4759499
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4759145 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4759244  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  4759245 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 4759344  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4759345 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4759444  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4759445 tgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4759499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4544590 - 4544236
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4544590 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4544491  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4544490 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4544391  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4544390 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4544292  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4544291 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4544236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 4526667 - 4527021
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||  | || ||||| ||||| |||||     
T  4526667 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccactttacatcagaagttgaaatttgtg 4526766  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4526767 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4526866  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||  | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  4526867 ctttccaaggtttgaccattgaaggcgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 4526966  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4526967 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 4527021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16942842 - 16942488
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  16942842 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 16942743  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  16942742 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 16942643  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  ||||  |||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  16942642 ctttccaaggtttgaccgttgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 16942543  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16942542 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 16942488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 26990271 - 26990464
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  26990271 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 26990370  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgaggg 201  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||    
T  26990371 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaggcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcaggatctgcagaggg 26990464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4722949 - 4722634
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  4722949 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctggggagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 4722850  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  4722849 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 4722750  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| || |||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  4722749 ctttccaaggtttgaccatcgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 4722651  T
Q  306 ctgccggctggggcaag 322  Q
    |||||||||||||||||    
T  4722650 ctgccggctggggcaag 4722634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 29574394 - 29574748
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  29574394 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 29574493  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| | || || |||||  |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  29574494 aagaatggaaaactcgttacaattcacggtgaagaggcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 29574593  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||    
T  29574594 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcaga 29574692  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  29574693 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 29574748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34913795 - 34913563
Alignment:
Q  116 aagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgag 215  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| ||    
T  34913795 aagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctgattagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaag 34913696  T
Q  216 gcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctg 315  Q
    |  | ||| | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||  | ||  ||||||||||    
T  34913695 gattaactgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagagtcaagctgccggctg 34913596  T
Q  316 gggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  34913595 gggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 34913563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Original strand, 4774506 - 4774618
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| |||||    
T  4774506 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaagatgatacagctctgtgagaacaagca 4774605  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  4774606 taaagaaggtctc 4774618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8891998 - 8891930
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8891998 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8891930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8903233 - 8903165
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903233 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 8903165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 28163166 - 28163234
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  28163166 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 28163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33373943 - 33373875
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33373943 caagaaggacaagctgctggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcataaagagggtctc 33373875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1312 - 958
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||     
T  1312 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgacgcgggtgcggtaacctccaccttgcatcagaagttaaagtttgtg 1213  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  1212 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatatttggtcagccagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 1113  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  ||||  |||| ||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| | | |||| ||||| |||||    
T  1112 ctttccaaggtttgacctttgagggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaagttattcaggaaggtcagac 1013  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||| ||||||||| |  |||| || || ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1012 tgccggttggggcaaggtgatacagcttcgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6108 - 5755
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||  |||    
T  6108 atggacattaatgcatcctacagttgtttgctgggaagaccatggatacacgatgcgggtgcggtaacctccaccttacatcagaagttgaagttcataa 6009  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
     |||||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  6008 ggaatggaaaacttgttaccattcatggtgaagaagcatatttagtcagccagctgacttctttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactgc 5909  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     || | |||  |||| ||||||||| | ||||  |||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | | ||||| || ||||||    
T  5908 tttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaagaaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagaaggttatccaagagggtcagact 5809  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  5808 gccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 5755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46232 - 46134
Alignment:
Q  263 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46232 gcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaggctgccggctggggcaagttaatacaactccgtgagaataagcacaaagaaggtctc 46134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 31838 - 32190
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  31838 atggacattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacacgacgcgggagcagtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 31937  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || ||    
T  31938 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaggcagggtctgcagaggggaccgc 32037  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || |||||||| ||  ||    
T  32038 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagaaggtcaagct 32137  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    |||||||||||||||||| |||| || || ||||  ||||| || ||||||||    
T  32138 gccggctggggcaagttaatacagcttcgtgagagcaagcataaggaaggtct 32190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 360
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31494
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||    
T  31142 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggggcggtgacctctactttgcaccagaagttgaaatttgcaa 31241  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  31242 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 31341  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  31342 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaaaagggatggaactgccatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 31441  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31442 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 31494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45841 - 45504
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  45841 tcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtgggaagcttg 45742  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || || || ||||| || || |||| |||  | ||    
T  45741 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtccgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 45642  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | |||||||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  45641 tgtcgaaggtacggagcctaaaagggatgggactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 45542  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45541 ttaatacagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 45504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 38940 - 38600
Alignment:
Q  8 atggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaa 107  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||||| || ||||| |||| ||    
T  38940 atggatattaatgcctcttacagctgtctcttggggagaccatggatacatgacgcgggagcggtgacctctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaa 38841  T
Q  108 agaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgc 207  Q
    | | ||| |||||||||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || ||    
T  38840 aaagtggaaagcttgttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgc 38741  T
Q  208 ctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagact 307  Q
     |||| |||  | ||| | |||||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||    
T  38740 ttttcaaggattaactgtcgaaggtacggagcctaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagct 38641  T
Q  308 gccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||    
T  38640 gccggctggggcaggttaatacagcttcgtgagaacaagca 38600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 10950 - 11265
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  10950 gatggacattaatgcatcctacagttgtctgctgggaagaccgtggatacacgatgtgggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 11049  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || ||| ||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  11050 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagctagctgtcttccttctcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 11149  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  11150 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 11249  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  11250 tgccggctggggcaag 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 360
Target Start/End: Original strand, 28693 - 29030
Alignment:
Q  23 tcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgtaaagaatgggaagcttg 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||  ||||||| || ||||| |||| ||| | ||| |||||||    
T  28693 tcttacagctgtctcttggggagaccttggatacatgacgcgggggcggtgacccctactttgcaccaaaagttgaaatttgcaaaaagtggaaagcttg 28792  T
Q  123 ttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgac 222  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| || || |||| |||  | ||    
T  28793 ttaccattcatggagaggaagcatacctggttagccagctatcatctttctcttgcatagaagcagggtctgcagaggggaccgcttttcaaggattaac 28892  T
Q  223 tattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||  || || ||||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28893 tgtcgaaggtacggagcccaagagggatggaactgcaatggcttctttgaaggatgcacagagagccgtccaagagggtcaagctgccggctggggcagg 28992  T
Q  323 ttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtct 360  Q
    ||| || | || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28993 ttaatatagcttcgtgagaacaagcataaggaaggtct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Original strand, 7399 - 7753
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  7399 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 7498  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  7499 aagaatggaaagctcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 7598  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||| ||  ||  |||||||||| ||||    
T  7599 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcggagagccattcaagaaggtcaga 7697  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7698 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 7753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 9333 - 9648
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  9333 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 9432  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| |||||  ||||||  || |||||||| || ||||    
T  9433 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtgttgaagcagggtctgctgaagggactg 9532  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  9533 ctttccaagggttgaccattgaaggtgcagagcctaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaagatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 9632  T
Q  307 tgccggctggggcaag 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  9633 tgccggctggggcaag 9648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13802 - 13448
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  13802 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 13703  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || ||||    
T  13702 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccaattgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggactg 13603  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacaga 305  Q
    | || |  ||  |||| ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||    
T  13602 ctttccagggtttgaccattgaaggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcaga 13504  T
Q  306 ctgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  13503 ctgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 13448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25073 - 24719
Alignment:
Q  7 gatggacatcaatgcttcttatagctgtctcctgggaagaccatggatacatgatgctggcgcagtaacctctaccctgcaccagaaattgaagtttgta 106  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||| | || ||||| ||||| |||||     
T  25073 gatggacattaatgcatcctacagttgcctgctgggaagaccgtggatacacgatgcaggtgcggttacttccaccttacatcagaagttgaaatttgtg 24974  T
Q  107 aagaatgggaagcttgttacagtccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactg 206  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||| || || |    
T  24973 aagaatggaaaactcgttacaatccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcagggtctgctgaagggaccg 24874  T
Q  207 cctttcgaggcctgactattgaaggtacggagctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagac 306  Q
    | || | |||  |||| ||||||||| | |||   ||| |  ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||    
T  24873 ctttccaaggtttgaccattgaaggtgcagagtcaaaggaagctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagac 24774  T
Q  307 tgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  24773 tgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcgtaaagaaggtctc 24719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Original strand, 22073 - 22141
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  22073 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 22141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 119642 - 119574
Alignment:
Q  293 caagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagcacaaagaaggtctc 361  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  119642 caagaaggacaagctgccggctggggcaagttaatacaactccttgagaataagcacaaagagggtctc 119574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7819 - 7707
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  7819 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 7720  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  7719 taaagaaggtctc 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21372 - 21260
Alignment:
Q  249 ctgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaagttagtacaactccgcgagaataagca 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | ||||| ||||     
T  21372 ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccattcaagaaggtcagactgccggctggggcaaggtgatacagctctgtgagaacaagcg 21273  T
Q  349 caaagaaggtctc 361  Q
     ||||||||||||    
T  21272 taaagaaggtctc 21260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 322
Target Start/End: Original strand, 27711 - 27904
Alignment:
Q  129 tccatggagaagaaacatatttggttagccagctgtcatctttctcttgcattgaagatggatctgctgagggaactgcctttcgaggcctgactattga 228  Q
    ||||||| |||||| |||| || || |||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||| |||||| || ||||| || | |||  ||||  ||||    
T  27711 tccatggtgaagaagcatacttagtcagccagttgtcttctttttcttgtattgaagcaggatttgctgaagggactgctttccaaggtttgaccgttga 27810  T
Q  229 aggtacggag-ctcaagaagactgggactgctatggcttctttaaaagacgctcagaaggctgttcaagaaggacagactgccggctggggcaag 322  Q
    |||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27811 aggtgcagagtctaaggaag-ctggggctgctatggcttcattgaaggatgctcagagagccatccaagaaggtcagactgccggctggggcaag 27904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University