View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7343_low_4 (Length: 367)

Name: NF7343_low_4
Description: NF7343
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7343_low_4
NF7343_low_4
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (23-347)||(43849018-43849342)
chr8 (23-347)||(8436335-8436659)
chr8 (7-163)||(31581689-31581845)
chr8 (8-163)||(45141450-45141605)
chr8 (6-163)||(39702300-39702457)
chr8 (7-163)||(8270901-8271057)
chr8 (7-163)||(25023301-25023457)
chr8 (7-163)||(28716659-28716815)
chr8 (7-163)||(31478071-31478227)
chr8 (7-163)||(32541218-32541374)
chr8 (7-163)||(36681442-36681598)
chr8 (7-163)||(44827312-44827468)
chr8 (7-156)||(17081649-17081798)
chr8 (7-163)||(6338313-6338469)
chr8 (7-163)||(10618801-10618957)
chr8 (7-163)||(17115533-17115689)
chr8 (12-163)||(27781102-27781253)
chr8 (23-161)||(7378859-7378997)
chr8 (7-156)||(28709302-28709451)
chr8 (24-159)||(39746938-39747073)
chr8 (7-163)||(39871260-39871415)
chr8 (12-228)||(29189656-29189872)
chr8 (7-163)||(38171422-38171578)
chr8 (12-179)||(41693885-41694055)
chr8 (7-163)||(42142730-42142886)
chr8 (23-156)||(31688052-31688185)
chr8 (7-156)||(43276773-43276922)
chr8 (7-163)||(16422824-16422980)
chr8 (12-156)||(41313375-41313519)
chr8 (12-163)||(39320061-39320212)
chr8 (70-163)||(11741098-11741191)
chr8 (81-173)||(2642403-2642495)
chr8 (7-163)||(23676866-23677023)
chr8 (7-163)||(37560524-37560680)
chr8 (17-164)||(38780666-38780813)
chr8 (7-156)||(1893843-1893993)
chr8 (11-248)||(11297950-11298188)
chr8 (23-160)||(22877923-22878060)
chr8 (23-247)||(24652279-24652503)
chr8 (81-165)||(44157266-44157350)
chr8 (23-221)||(13969986-13970177)
chr8 (57-156)||(36112843-36112942)
chr8 (57-163)||(36590182-36590287)
chr8 (101-191)||(39677445-39677535)
chr8 (79-163)||(35243347-35243431)
chr8 (12-156)||(3427623-3427767)
chr8 (81-163)||(3511287-3511369)
chr8 (81-163)||(40223079-40223160)
chr8 (57-158)||(2855127-2855228)
chr8 (11-156)||(32099535-32099681)
chr8 (8-156)||(37587720-37587869)
chr8 (79-173)||(9370301-9370396)
chr8 (81-163)||(40045469-40045551)
chr8 (7-156)||(34395348-34395499)
chr8 (70-146)||(26293825-26293901)
chr8 (70-146)||(26307082-26307158)
chr8 (101-161)||(44263396-44263456)
chr8 (81-156)||(9211055-9211130)
chr8 (56-163)||(22957353-22957460)
chr8 (70-159)||(26036979-26037068)
chr8 (57-157)||(1363793-1363893)
chr8 (59-159)||(40551856-40551955)
chr8 (101-156)||(42203405-42203460)
chr8 (101-159)||(13888330-13888388)
chr8 (154-232)||(18410959-18411037)
chr8 (102-163)||(10651115-10651176)
chr8 (57-94)||(44263068-44263105)
chr8 (101-153)||(44318319-44318371)
chr8 (140-210)||(5320485-5320555)
chr8 (7-45)||(11741206-11741244)
chr8 (100-152)||(16831614-16831666)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (12-347)||(193398-193726)
chr3 (86-347)||(5506704-5506961)
chr3 (7-163)||(16127139-16127295)
chr3 (7-163)||(29081281-29081437)
chr3 (7-163)||(40563363-40563519)
chr3 (8-163)||(44845621-44845776)
chr3 (12-221)||(44947143-44947352)
chr3 (7-191)||(2579899-2580083)
chr3 (7-163)||(19948318-19948474)
chr3 (7-163)||(26540956-26541112)
chr3 (7-163)||(28676890-28677046)
chr3 (7-163)||(35499597-35499753)
chr3 (7-163)||(37088280-37088436)
chr3 (7-163)||(37528723-37528879)
chr3 (7-163)||(38185766-38185922)
chr3 (8-163)||(45345008-45345163)
chr3 (12-179)||(52794896-52795063)
chr3 (12-163)||(55305109-55305260)
chr3 (7-156)||(40480028-40480177)
chr3 (7-163)||(24536554-24536710)
chr3 (7-163)||(25570375-25570531)
chr3 (11-233)||(20450458-20450680)
chr3 (7-156)||(8872869-8873018)
chr3 (57-165)||(29203025-29203133)
chr3 (7-159)||(38891990-38892142)
chr3 (11-159)||(45368610-45368758)
chr3 (7-206)||(46972029-46972228)
chr3 (7-206)||(52166047-52166246)
chr3 (7-173)||(52857892-52858058)
chr3 (7-156)||(44748793-44748942)
chr3 (7-156)||(46247971-46248120)
chr3 (7-163)||(29718201-29718356)
chr3 (12-156)||(43525744-43525888)
chr3 (23-163)||(49853043-49853183)
chr3 (7-163)||(50499758-50499914)
chr3 (57-163)||(2851863-2851969)
chr3 (12-159)||(4240279-4240426)
chr3 (17-163)||(24628199-24628345)
chr3 (81-248)||(2121897-2122065)
chr3 (57-161)||(7041107-7041211)
chr3 (53-161)||(41518403-41518511)
chr3 (12-156)||(48942992-48943134)
chr3 (57-228)||(51709057-51709229)
chr3 (12-156)||(37713972-37714116)
chr3 (7-163)||(47897606-47897762)
chr3 (12-152)||(54541946-54542086)
chr3 (7-163)||(54672180-54672335)
chr3 (24-163)||(52225298-52225437)
chr3 (12-159)||(53779032-53779179)
chr3 (57-173)||(12063718-12063834)
chr3 (11-156)||(37489931-37490076)
chr3 (17-165)||(32026407-32026555)
chr3 (81-248)||(42497064-42497231)
chr3 (12-163)||(50317029-50317180)
chr3 (10-156)||(42217662-42217808)
chr3 (59-163)||(21603846-21603950)
chr3 (7-156)||(21707147-21707296)
chr3 (57-157)||(30548790-30548890)
chr3 (57-160)||(33391949-33392052)
chr3 (57-159)||(30864472-30864574)
chr3 (59-156)||(41246297-41246394)
chr3 (7-156)||(46318766-46318916)
chr3 (63-228)||(37713074-37713240)
chr3 (23-156)||(39876626-39876759)
chr3 (79-163)||(45693386-45693470)
chr3 (7-156)||(48378222-48378371)
chr3 (79-159)||(51003315-51003395)
chr3 (81-163)||(46627497-46627579)
chr3 (58-159)||(612099-612200)
chr3 (10-152)||(30814261-30814403)
chr3 (18-156)||(39719361-39719498)
chr3 (26-158)||(33897898-33898030)
chr3 (57-158)||(2598641-2598742)
chr3 (54-223)||(9338700-9338876)
chr3 (81-158)||(52868184-52868261)
chr3 (75-159)||(22257717-22257801)
chr3 (81-161)||(42465029-42465109)
chr3 (7-116)||(44545226-44545335)
chr3 (12-116)||(39469914-39470018)
chr3 (7-117)||(41785805-41785915)
chr3 (12-85)||(5505852-5505925)
chr3 (23-152)||(52595345-52595474)
chr3 (11-123)||(47173568-47173680)
chr3 (79-227)||(25146381-25146529)
chr3 (132-182)||(44895985-44896035)
chr3 (102-156)||(52931152-52931206)
chr3 (89-154)||(32982921-32982986)
chr3 (114-158)||(35100284-35100328)
chr3 (126-190)||(42527967-42528031)
chr3 (126-182)||(43968271-43968327)
chr3 (7-45)||(24536807-24536845)
chr3 (85-159)||(27446501-27446575)
chr3 (7-45)||(52363038-52363076)
chr3 (12-45)||(52788677-52788710)
chr3 (56-116)||(43740325-43740385)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (23-347)||(791148-791476)
chr7 (12-191)||(1342777-1342956)
chr7 (7-163)||(36246379-36246535)
chr7 (7-163)||(42587386-42587542)
chr7 (7-163)||(43254099-43254255)
chr7 (7-163)||(45686919-45687075)
chr7 (7-206)||(482942-483141)
chr7 (7-163)||(9487403-9487559)
chr7 (7-163)||(10312032-10312188)
chr7 (57-191)||(36612086-36612220)
chr7 (7-159)||(21254704-21254856)
chr7 (7-163)||(40637163-40637319)
chr7 (12-163)||(27089659-27089810)
chr7 (12-163)||(27188491-27188642)
chr7 (12-163)||(31511301-31511452)
chr7 (7-206)||(44596606-44596805)
chr7 (7-206)||(43134401-43134599)
chr7 (11-228)||(27655611-27655828)
chr7 (7-163)||(21374629-21374785)
chr7 (7-163)||(40258853-40259009)
chr7 (12-163)||(35587580-35587731)
chr7 (61-163)||(46879527-46879629)
chr7 (57-182)||(19757500-19757625)
chr7 (57-158)||(46757756-46757857)
chr7 (9-191)||(47470937-47471119)
chr7 (7-156)||(42375793-42375941)
chr7 (12-163)||(48832056-48832207)
chr7 (23-180)||(40893383-40893541)
chr7 (7-248)||(44743713-44743955)
chr7 (57-163)||(33026922-33027028)
chr7 (8-163)||(33203671-33203826)
chr7 (7-206)||(36407224-36407423)
chr7 (12-163)||(45222076-45222227)
chr7 (23-228)||(17844556-17844761)
chr7 (7-163)||(21741967-21742124)
chr7 (12-228)||(23029790-23030007)
chr7 (10-163)||(28425614-28425767)
chr7 (7-152)||(36436150-36436294)
chr7 (7-248)||(49148328-49148571)
chr7 (57-163)||(12345070-12345176)
chr7 (12-163)||(34709234-34709385)
chr7 (12-163)||(40106008-40106159)
chr7 (8-156)||(47587115-47587262)
chr7 (25-156)||(19832000-19832131)
chr7 (7-163)||(48313427-48313582)
chr7 (57-247)||(38531100-38531291)
chr7 (6-156)||(21313799-21313951)
chr7 (8-156)||(17192452-17192599)
chr7 (57-163)||(48590760-48590866)
chr7 (25-158)||(11466047-11466180)
chr7 (58-158)||(45672341-45672441)
chr7 (57-160)||(21740152-21740254)
chr7 (81-179)||(9485786-9485884)
chr7 (57-158)||(22642259-22642360)
chr7 (132-237)||(33609058-33609163)
chr7 (81-158)||(35000782-35000859)
chr7 (7-116)||(32168829-32168938)
chr7 (23-139)||(21316611-21316727)
chr7 (71-165)||(22621459-22621553)
chr7 (99-221)||(24170864-24170985)
chr7 (17-152)||(38481286-38481421)
chr7 (80-221)||(30699522-30699663)
chr7 (83-158)||(27869570-27869645)
chr7 (85-152)||(48620531-48620598)
chr7 (55-123)||(24170788-24170856)
chr7 (102-156)||(39698930-39698984)
chr7 (81-155)||(39229953-39230027)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (57-347)||(5519876-5520166)
chr2 (6-165)||(38578998-38579157)
chr2 (7-163)||(2546316-2546472)
chr2 (7-163)||(3377385-3377541)
chr2 (7-163)||(16486875-16487031)
chr2 (7-163)||(28382672-28382828)
chr2 (7-163)||(36712528-36712684)
chr2 (7-163)||(4453515-4453671)
chr2 (7-163)||(8688954-8689110)
chr2 (9-165)||(8815208-8815364)
chr2 (7-163)||(9886985-9887141)
chr2 (7-163)||(41322749-41322905)
chr2 (80-222)||(25071436-25071578)
chr2 (12-163)||(43507554-43507705)
chr2 (6-163)||(2266144-2266301)
chr2 (7-163)||(13111734-13111891)
chr2 (7-163)||(650772-650927)
chr2 (7-159)||(15521472-15521624)
chr2 (7-163)||(36999482-36999638)
chr2 (8-163)||(37356162-37356318)
chr2 (12-163)||(24402044-24402195)
chr2 (10-160)||(10393030-10393180)
chr2 (7-156)||(5039768-5039917)
chr2 (7-163)||(21865239-21865396)
chr2 (79-210)||(4055955-4056086)
chr2 (23-163)||(39167760-39167900)
chr2 (7-163)||(40024934-40025090)
chr2 (12-163)||(17263745-17263896)
chr2 (23-158)||(24019895-24020030)
chr2 (13-156)||(31616385-31616528)
chr2 (23-165)||(7400381-7400523)
chr2 (12-163)||(29514832-29514982)
chr2 (7-156)||(4385524-4385673)
chr2 (6-163)||(10839572-10839729)
chr2 (79-219)||(15250170-15250310)
chr2 (7-156)||(6760603-6760752)
chr2 (27-206)||(23356933-23357112)
chr2 (7-241)||(26911505-26911739)
chr2 (57-206)||(38880731-38880880)
chr2 (10-156)||(40869358-40869504)
chr2 (7-156)||(4038339-4038488)
chr2 (7-156)||(43135610-43135759)
chr2 (53-152)||(2758870-2758969)
chr2 (75-158)||(16669113-16669196)
chr2 (7-206)||(44275656-44275854)
chr2 (7-160)||(6232275-6232428)
chr2 (7-156)||(41796741-41796890)
chr2 (85-228)||(38842906-38843049)
chr2 (60-161)||(598937-599038)
chr2 (54-163)||(8070612-8070721)
chr2 (71-227)||(7823475-7823631)
chr2 (57-156)||(43285661-43285760)
chr2 (82-163)||(10727898-10727979)
chr2 (85-248)||(2047227-2047391)
chr2 (81-156)||(42132734-42132809)
chr2 (7-117)||(18212113-18212223)
chr2 (81-152)||(7213664-7213735)
chr2 (7-163)||(8339972-8340128)
chr2 (7-159)||(13527900-13528052)
chr2 (55-221)||(2221430-2221596)
chr2 (99-156)||(18710255-18710312)
chr2 (86-158)||(6222636-6222708)
chr2 (87-163)||(9053122-9053198)
chr2 (101-158)||(41877826-41877883)
chr2 (70-161)||(39675075-39675166)
chr2 (102-156)||(6153461-6153515)
chr2 (152-217)||(3337198-3337263)
chr2 (113-158)||(6807492-6807537)
chr2 (99-156)||(7569851-7569908)
chr2 (7-89)||(18710183-18710265)
chr2 (79-156)||(34884875-34884952)
chr2 (112-156)||(13351603-13351647)
chr2 (136-187)||(10818420-10818471)
chr2 (132-163)||(18212224-18212255)
chr2 (7-45)||(6153558-6153596)
chr2 (152-185)||(24020017-24020050)
chr2 (97-182)||(43496258-43496342)
chr2 (126-163)||(44525925-44525962)
chr2 (152-228)||(13761887-13761963)
[»] chr4 (113 HSPs)
chr4 (23-346)||(30562669-30562984)
chr4 (23-347)||(52707812-52708134)
chr4 (12-191)||(35190584-35190763)
chr4 (11-228)||(21633747-21633964)
chr4 (7-163)||(42116888-42117044)
chr4 (7-163)||(53407181-53407337)
chr4 (7-163)||(7706364-7706520)
chr4 (7-163)||(8829811-8829967)
chr4 (7-163)||(8941896-8942052)
chr4 (7-163)||(11600675-11600831)
chr4 (7-163)||(12233963-12234119)
chr4 (7-163)||(18582836-18582992)
chr4 (7-163)||(45906131-45906287)
chr4 (7-163)||(46895275-46895431)
chr4 (7-163)||(56372427-56372583)
chr4 (24-163)||(4391704-4391843)
chr4 (12-163)||(11151935-11152086)
chr4 (7-206)||(22892520-22892719)
chr4 (7-206)||(22944184-22944383)
chr4 (7-156)||(55495883-55496032)
chr4 (7-163)||(4517187-4517343)
chr4 (7-163)||(19513878-19514034)
chr4 (7-163)||(28307247-28307403)
chr4 (7-163)||(52669986-52670142)
chr4 (12-163)||(3009708-3009859)
chr4 (12-163)||(27397762-27397913)
chr4 (12-179)||(29413528-29413695)
chr4 (57-161)||(25235187-25235291)
chr4 (7-152)||(35777393-35777538)
chr4 (24-161)||(55684704-55684841)
chr4 (7-163)||(22038353-22038509)
chr4 (12-163)||(4939382-4939532)
chr4 (12-163)||(23867865-23868016)
chr4 (7-206)||(37970287-37970485)
chr4 (7-206)||(55764552-55764750)
chr4 (101-221)||(24954159-24954279)
chr4 (70-165)||(22430690-22430785)
chr4 (8-156)||(37115286-37115434)
chr4 (7-159)||(39087558-39087710)
chr4 (12-163)||(25440480-25440631)
chr4 (57-158)||(20511451-20511552)
chr4 (25-163)||(21369890-21370028)
chr4 (25-163)||(33114985-33115123)
chr4 (57-158)||(37047071-37047172)
chr4 (57-165)||(5465404-5465512)
chr4 (7-163)||(9043606-9043763)
chr4 (15-156)||(31678969-31679110)
chr4 (7-163)||(4392722-4392877)
chr4 (12-156)||(29663926-29664070)
chr4 (7-163)||(55856523-55856676)
chr4 (57-191)||(26826563-26826697)
chr4 (81-167)||(27185624-27185710)
chr4 (7-152)||(47417482-47417627)
chr4 (7-156)||(55828996-55829145)
chr4 (57-176)||(9031978-9032097)
chr4 (81-228)||(23113407-23113554)
chr4 (7-159)||(35822299-35822451)
chr4 (12-163)||(4355588-4355739)
chr4 (23-206)||(56270044-56270227)
chr4 (57-241)||(43078113-43078298)
chr4 (57-158)||(48056607-48056708)
chr4 (7-156)||(35580948-35581097)
chr4 (59-151)||(50502284-50502376)
chr4 (17-153)||(37831924-37832060)
chr4 (81-163)||(31338496-31338578)
chr4 (12-163)||(35468012-35468163)
chr4 (81-163)||(55358334-55358416)
chr4 (57-158)||(4465472-4465573)
chr4 (7-156)||(43225680-43225830)
chr4 (82-163)||(51011061-51011142)
chr4 (57-156)||(11050359-11050458)
chr4 (7-163)||(15635934-15636090)
chr4 (85-156)||(44525707-44525778)
chr4 (81-158)||(20148803-20148880)
chr4 (70-158)||(42085723-42085811)
chr4 (57-163)||(30366142-30366248)
chr4 (79-156)||(33005111-33005188)
chr4 (57-160)||(23162643-23162747)
chr4 (74-158)||(36196933-36197017)
chr4 (59-158)||(32101736-32101835)
chr4 (80-191)||(52713559-52713670)
chr4 (72-158)||(31435063-31435149)
chr4 (82-156)||(40497399-40497473)
chr4 (99-156)||(45780760-45780817)
chr4 (12-109)||(33005178-33005275)
chr4 (54-180)||(48977846-48977974)
chr4 (101-192)||(40119906-40119997)
chr4 (57-156)||(41864083-41864182)
chr4 (7-123)||(53273110-53273226)
chr4 (85-191)||(36486353-36486459)
chr4 (101-163)||(42124675-42124737)
chr4 (57-159)||(44442124-44442225)
chr4 (101-158)||(17715650-17715707)
chr4 (102-163)||(36008014-36008075)
chr4 (126-248)||(35842519-35842642)
chr4 (57-160)||(37337681-37337784)
chr4 (102-228)||(3932180-3932306)
chr4 (84-156)||(31953224-31953296)
chr4 (85-165)||(32948177-32948257)
chr4 (105-156)||(53224317-53224368)
chr4 (7-45)||(45780851-45780889)
chr4 (7-97)||(29656600-29656690)
chr4 (134-173)||(1768544-1768583)
chr4 (55-158)||(38048878-38048981)
chr4 (132-163)||(53274813-53274844)
chr4 (10-89)||(17715579-17715658)
chr4 (7-45)||(25199410-25199448)
chr4 (72-158)||(39068883-39068969)
chr4 (9-123)||(29656729-29656843)
chr4 (12-45)||(36008119-36008152)
chr4 (102-159)||(49239219-49239276)
chr4 (127-163)||(20530799-20530835)
chr4 (57-89)||(26443367-26443399)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (7-167)||(2442420-2442580)
chr6 (7-179)||(34232894-34233066)
chr6 (7-163)||(12297360-12297516)
chr6 (7-163)||(14227531-14227686)
chr6 (7-163)||(32731754-32731910)
chr6 (7-156)||(31100017-31100166)
chr6 (8-163)||(30811144-30811299)
chr6 (12-163)||(558360-558512)
chr6 (12-156)||(10856133-10856277)
chr6 (7-159)||(20804985-20805137)
chr6 (79-210)||(21894319-21894450)
chr6 (7-206)||(7317563-7317762)
chr6 (54-228)||(12140809-12140983)
chr6 (57-227)||(15591082-15591252)
chr6 (12-159)||(34685015-34685161)
chr6 (28-158)||(6104671-6104801)
chr6 (23-228)||(5301532-5301737)
chr6 (12-165)||(28076423-28076576)
chr6 (23-163)||(12432616-12432756)
chr6 (7-150)||(31451962-31452105)
chr6 (23-248)||(33540635-33540861)
chr6 (12-228)||(34439683-34439899)
chr6 (12-165)||(3107999-3108153)
chr6 (10-156)||(33453734-33453880)
chr6 (59-163)||(2970722-2970826)
chr6 (81-163)||(5681589-5681671)
chr6 (81-163)||(5943061-5943143)
chr6 (57-227)||(7292480-7292650)
chr6 (57-173)||(6709681-6709797)
chr6 (23-156)||(23648205-23648338)
chr6 (18-163)||(29823031-29823176)
chr6 (74-221)||(20563456-20563603)
chr6 (54-165)||(31049376-31049487)
chr6 (7-182)||(34903955-34904117)
chr6 (12-165)||(11015590-11015743)
chr6 (7-123)||(1806350-1806466)
chr6 (79-173)||(9896773-9896867)
chr6 (101-191)||(11443035-11443125)
chr6 (57-156)||(3636643-3636742)
chr6 (102-163)||(29414919-29414980)
chr6 (57-191)||(32563210-32563346)
chr6 (71-149)||(26561409-26561487)
chr6 (82-158)||(5893894-5893970)
chr6 (113-165)||(19415382-19415434)
chr6 (105-153)||(1225525-1225573)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (7-163)||(29586157-29586313)
chr1 (7-163)||(1918024-1918180)
chr1 (7-163)||(42064297-42064453)
chr1 (12-221)||(7781086-7781295)
chr1 (7-156)||(17046728-17046877)
chr1 (7-163)||(31150405-31150561)
chr1 (7-163)||(44909839-44909995)
chr1 (7-158)||(13121569-13121720)
chr1 (7-156)||(39826599-39826748)
chr1 (7-163)||(2497921-2498077)
chr1 (11-191)||(8221187-8221367)
chr1 (7-163)||(19898888-19899044)
chr1 (7-159)||(26204273-26204425)
chr1 (17-165)||(34318415-34318563)
chr1 (7-163)||(36838675-36838831)
chr1 (7-163)||(36301085-36301240)
chr1 (7-158)||(47134516-47134667)
chr1 (12-163)||(50351036-50351187)
chr1 (7-163)||(30721603-30721760)
chr1 (7-159)||(17499869-17500021)
chr1 (7-163)||(33524527-33524683)
chr1 (7-163)||(38676488-38676644)
chr1 (12-163)||(322869-323020)
chr1 (11-228)||(29374333-29374550)
chr1 (6-163)||(49220453-49220610)
chr1 (15-163)||(29704064-29704212)
chr1 (7-163)||(32368319-32368475)
chr1 (12-163)||(3270663-3270813)
chr1 (7-206)||(34319388-34319587)
chr1 (12-156)||(38967451-38967594)
chr1 (18-221)||(52703033-52703236)
chr1 (59-168)||(5697528-5697637)
chr1 (7-156)||(7710941-7711090)
chr1 (6-163)||(15313242-15313398)
chr1 (7-156)||(25601985-25602134)
chr1 (7-167)||(3660944-3661104)
chr1 (57-228)||(16085526-16085697)
chr1 (7-159)||(26843750-26843902)
chr1 (7-191)||(30774084-30774264)
chr1 (57-158)||(25134897-25134998)
chr1 (82-163)||(40887949-40888030)
chr1 (10-227)||(3391122-3391339)
chr1 (57-248)||(36043194-36043386)
chr1 (8-163)||(1507723-1507879)
chr1 (7-163)||(15348823-15348979)
chr1 (57-163)||(22098967-22099073)
chr1 (57-163)||(37703719-37703825)
chr1 (85-191)||(41004945-41005051)
chr1 (57-163)||(50171277-50171383)
chr1 (57-248)||(37672244-37672436)
chr1 (23-156)||(49240268-49240401)
chr1 (57-156)||(18347403-18347502)
chr1 (12-163)||(46369809-46369959)
chr1 (81-228)||(49822082-49822229)
chr1 (79-165)||(13570771-13570857)
chr1 (81-163)||(43727094-43727176)
chr1 (12-158)||(34086970-34087116)
chr1 (18-152)||(44718962-44719096)
chr1 (57-173)||(28868981-28869097)
chr1 (7-116)||(33561922-33562031)
chr1 (57-161)||(42614117-42614221)
chr1 (58-158)||(44956328-44956428)
chr1 (57-248)||(49185079-49185271)
chr1 (84-156)||(50540848-50540920)
chr1 (84-163)||(46928964-46929043)
chr1 (89-191)||(33151975-33152077)
chr1 (57-163)||(39583145-39583251)
chr1 (7-116)||(2479159-2479268)
chr1 (71-182)||(912716-912827)
chr1 (11-179)||(46087964-46088132)
chr1 (99-156)||(7024914-7024971)
chr1 (70-159)||(36379130-36379219)
chr1 (81-165)||(9769951-9770035)
chr1 (102-173)||(9894931-9895002)
chr1 (79-158)||(10628814-10628893)
chr1 (81-156)||(30495182-30495257)
chr1 (84-159)||(51422968-51423043)
chr1 (104-241)||(6814123-6814261)
chr1 (99-157)||(40935893-40935951)
chr1 (81-158)||(42963901-42963978)
chr1 (104-156)||(9169151-9169203)
chr1 (70-158)||(46056411-46056499)
chr1 (57-123)||(28429078-28429144)
chr1 (99-163)||(33632329-33632393)
chr1 (88-156)||(40719554-40719622)
chr1 (115-179)||(50940120-50940184)
chr1 (132-163)||(2479270-2479301)
chr1 (132-163)||(33561889-33561920)
chr1 (132-241)||(12891648-12891758)
chr1 (82-158)||(2028961-2029037)
chr1 (126-190)||(2459557-2459621)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (53-182)||(119215-119344)
scaffold0002 (25-163)||(431271-431409)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (7-165)||(24793967-24794125)
chr5 (7-163)||(14647343-14647499)
chr5 (7-163)||(13228459-13228614)
chr5 (8-163)||(30299694-30299849)
chr5 (12-228)||(11100690-11100899)
chr5 (7-163)||(2236502-2236658)
chr5 (7-163)||(8023970-8024126)
chr5 (7-159)||(12774571-12774723)
chr5 (7-163)||(36685811-36685967)
chr5 (7-163)||(39744528-39744684)
chr5 (12-222)||(16474771-16474981)
chr5 (10-163)||(26699092-26699245)
chr5 (10-163)||(26968825-26968978)
chr5 (10-163)||(5381930-5382082)
chr5 (7-163)||(5591583-5591739)
chr5 (7-159)||(12713307-12713459)
chr5 (7-159)||(30412602-30412754)
chr5 (7-163)||(32381660-32381816)
chr5 (7-163)||(32382844-32383000)
chr5 (7-163)||(39275418-39275574)
chr5 (7-206)||(1174779-1174978)
chr5 (12-163)||(5997880-5998031)
chr5 (8-163)||(6603896-6604051)
chr5 (6-156)||(2671408-2671558)
chr5 (57-158)||(13936237-13936338)
chr5 (7-165)||(19956292-19956449)
chr5 (7-156)||(4221466-4221615)
chr5 (7-163)||(1711189-1711345)
chr5 (12-163)||(9160678-9160829)
chr5 (7-206)||(10697264-10697463)
chr5 (12-163)||(27130333-27130484)
chr5 (12-163)||(35235713-35235864)
chr5 (7-173)||(30774168-30774334)
chr5 (7-227)||(3670273-3670493)
chr5 (57-228)||(19347751-19347922)
chr5 (12-156)||(39246830-39246973)
chr5 (23-163)||(43402455-43402595)
chr5 (10-188)||(11062868-11063047)
chr5 (7-163)||(12363598-12363755)
chr5 (7-163)||(3037411-3037567)
chr5 (23-163)||(15530446-15530586)
chr5 (7-163)||(19525744-19525900)
chr5 (23-163)||(36027977-36028117)
chr5 (23-158)||(648542-648677)
chr5 (8-163)||(31168973-31169128)
chr5 (7-173)||(35236643-35236810)
chr5 (7-156)||(29392100-29392248)
chr5 (57-163)||(2178805-2178911)
chr5 (8-163)||(15443452-15443607)
chr5 (7-156)||(9587179-9587329)
chr5 (57-160)||(4379303-4379406)
chr5 (23-179)||(5521309-5521465)
chr5 (7-159)||(11663881-11664033)
chr5 (57-163)||(7651685-7651791)
chr5 (57-163)||(22977191-22977297)
chr5 (85-163)||(35640013-35640091)
chr5 (7-156)||(3669536-3669685)
chr5 (10-156)||(6893372-6893517)
chr5 (56-163)||(4875688-4875795)
chr5 (57-160)||(9627143-9627246)
chr5 (7-156)||(13156879-13157028)
chr5 (101-168)||(4657582-4657649)
chr5 (57-165)||(23920502-23920610)
chr5 (70-158)||(13921783-13921871)
chr5 (101-167)||(6349429-6349495)
chr5 (84-165)||(42323591-42323672)
chr5 (78-159)||(32321652-32321733)
chr5 (79-159)||(27005844-27005924)
chr5 (59-158)||(2497610-2497709)
chr5 (70-165)||(33694734-33694829)
chr5 (99-156)||(25872221-25872278)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (7-163)||(22590-22746)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (7-163)||(126755-126911)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (7-173)||(22-188)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (7-163)||(12712-12868)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (23-180)||(72743-72901)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (57-248)||(63889-64081)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (7-163)||(7052-7208)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (12-165)||(192013-192166)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (81-163)||(93381-93463)
scaffold0016 (79-158)||(84323-84402)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (12-156)||(30179-30323)
scaffold0197 (7-163)||(28071-28236)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (57-156)||(53023-53122)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (70-167)||(10821-10918)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (7-123)||(27169-27286)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (99-163)||(41760-41824)
scaffold0027 (7-45)||(41858-41896)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (57-156)||(5454-5552)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (12-158)||(9230-9376)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (82-156)||(4562-4636)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (102-228)||(1175-1301)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (7-45)||(36350-36388)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (57-165)||(8956-9063)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (152-210)||(11855-11913)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43849342 - 43849018
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849342 tataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 43849243  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43849242 atgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaaccaaaacccatgtttaccctta 43849143  T
Q  223 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849142 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 43849043  T
Q  323 attgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  43849042 attgttcaatataagatacatacaa 43849018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8436659 - 8436335
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||         || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8436659 tatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagttatttttcag 8436560  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8436559 atgctattacaaatatcgtttgaacttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 8436460  T
Q  223 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8436459 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaagcc 8436360  T
Q  323 attgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8436359 attgttcagtataagatacatacaa 8436335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 31581689 - 31581845
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31581689 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 31581788  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581789 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31581845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45141605 - 45141450
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  45141605 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 45141506  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45141505 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 45141450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 39702300 - 39702457
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  39702300 acttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacataaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 39702399  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39702400 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 39702457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 8270901 - 8271057
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8270901 cttttagtttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 8271000  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271001 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8271057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 25023301 - 25023457
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  25023301 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 25023400  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25023401 ataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 25023457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 28716659 - 28716815
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  28716659 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 28716758  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28716759 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28716815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 31478071 - 31478227
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31478071 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 31478170  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31478171 ataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31478227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 32541218 - 32541374
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32541218 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 32541317  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32541318 ataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 32541374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36681598 - 36681442
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36681598 cttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36681499  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36681498 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36681442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44827468 - 44827312
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44827468 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 44827369  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44827368 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 44827312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 17081649 - 17081798
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17081649 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 17081748  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17081749 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17081798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 6338313 - 6338469
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||         || |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  6338313 cttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 6338412  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6338413 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 6338469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 10618801 - 10618957
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  10618801 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 10618900  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618901 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 10618957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 17115533 - 17115689
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17115533 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 17115632  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17115633 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 17115689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 27781102 - 27781253
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27781102 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27781201  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27781202 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 27781253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 7378859 - 7378997
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||| |||| ||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7378859 tatagcttataagttcgtctgacaaaagaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcag 7378958  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 161  Q
    |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7378959 aagctacttcaagtagtgtttgagcttatagcttatagc 7378997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 28709302 - 28709451
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  28709302 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 28709401  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28709402 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28709451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39747073 - 39746938
Alignment:
Q  24 atagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39747073 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcaga 39746974  T
Q  124 tactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39746973 tgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 39746938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 39871260 - 39871415
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| | |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39871260 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 39871358  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39871359 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagctt 39871415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29189872 - 29189656
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||        ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  29189872 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgataagaaaagctctgtttagtaacggttttttactacgagcttatagcttatttcacgagcttatatg 29189773  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
     ||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||  | |||| |||||| |||     
T  29189772 ttatttttaagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctcatcttttcttccatttttacccttattattttatctaaaatccaa 29189673  T
Q  212 gtttacccttaataatt 228  Q
     ||||||| | ||||||    
T  29189672 ttttacccattataatt 29189656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38171578 - 38171422
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  || || || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  38171578 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttgttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 38171479  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38171478 ataagttgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38171422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41694055 - 41693885
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn---gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttat 108  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||          ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41694055 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaatttttagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 41693956  T
Q  109 aagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  41693955 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcacgttttcttcca 41693885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42142886 - 42142730
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42142886 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 42142787  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42142786 ataagctatttttcagaagctattccaaatagtgtttgagcttatagcttatagctt 42142730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31688185 - 31688052
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31688185 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 31688086  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31688085 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31688052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43276922 - 43276773
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  43276922 cttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 43276823  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43276822 ataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 43276773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16422824 - 16422980
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||        ||| ||||| |||||  ||||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16422824 cttttagcttttagcttatagcctataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttagtaacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagctt 16422923  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422924 ataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 16422980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 41313375 - 41313519
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41313375 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 41313474  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41313475 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 41313519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39320212 - 39320061
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39320212 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39320113  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39320112 ctatttttcagaagctattccaagtagcgttcgagcttataacttatagctt 39320061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11741191 - 11741098
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741191 ttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaatctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 11741098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2642495 - 2642403
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2642495 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcatttttt 2642403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 23676866 - 23677023
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          || | |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | || ||    
T  23676866 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaact 23676965  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23676966 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 23677023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37560680 - 37560524
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||       | | |||||||||||  ||||| |  | || |||||||||||||| | ||||||    
T  37560680 cttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgatcatgaacttatagcttatttcacgagctt 37560581  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37560580 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 37560524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 164
Target Start/End: Original strand, 38780666 - 38780813
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||        | | ||||||  || ||||||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  38780666 ttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgacaatgatttttcaccacgaacttataacttattttacgagcttataaactatt 38780765  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctta 164  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38780766 tttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctta 38780813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1893993 - 1893843
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  1893993 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 1893894  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1893893 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 1893843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11298188 - 11297950
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| |  |  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11298188 tagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttcatcatcagcttatagcttatttcacgagcttataa 11298089  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    | |||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  |||    
T  11298088 gatatttttcagaagctattccaaataacgtttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattcca 11297989  T
Q  211 -tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
     | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  11297988 ttttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 11297950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22878060 - 22877923
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22878060 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 22877961  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatag 160  Q
    |  |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  22877960 aagctattctcagtagcgtttgagcttatagcttatag 22877923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 24652279 - 24652503
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       | | ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  24652279 tatagcttataagctcgtttgacaaagaaagttctgtttggtaac-acttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagccattttttag 24652377  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttaccctt 221  Q
    |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  ||| | |||||||||    
T  24652378 aagctatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattccattttttaccctt 24652477  T
Q  222 aataattaattttattataatttaaa 247  Q
    ||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  24652478 aatcatttattatattataaattaaa 24652503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Original strand, 44157266 - 44157350
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44157266 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 44157350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 221
Target Start/End: Original strand, 13969986 - 13970177
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13969986 tatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 13970085  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctt 221  Q
    |  |||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
T  13970086 acgctattcgaagtagcgtttg-------agcttatagcttatcatattttcttccatttttacccttatcattttaattaaaacccacttttaccctt 13970177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36112942 - 36112843
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36112942 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 36112843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 36590182 - 36590287
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36590182 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagctt-tagctt 36590280  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  36590281 atagctt 36590287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 39677445 - 39677535
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  39677445 gagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttataccctta 39677535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35243431 - 35243347
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35243431 acgagcttatatcttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35243347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3427767 - 3427623
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||       ||| |||||||||| | ||||| || | || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3427767 agcttatagcttataggttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataag 3427668  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3427667 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 3427623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 3511287 - 3511369
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3511287 gagcttgtagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 3511369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40223160 - 40223079
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223160 gagcttatagcttatttcacgagcttataa-ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40223079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 2855127 - 2855228
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2855127 tgtttggcaatgatctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 2855226  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  2855227 at 2855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 32099535 - 32099681
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnng-ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||         || |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32099535 tagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 32099634  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32099635 agctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 32099681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37587869 - 37587720
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||          || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37587869 ttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 37587770  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37587769 ataagttatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttttagctt 37587720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9370396 - 9370301
Alignment:
Q  79 acgagcttatagctt-attttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9370396 acgagcttataactttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataacttatcatctttt 9370301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 40045469 - 40045551
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagct-atttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40045469 gagcttatagctt-ttttactagcttataagcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40045551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34395499 - 34395348
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnng-ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||         || |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  34395499 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagct 34395400  T
Q  106 tataagctat-ttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  34395399 tataagctattttttcagaagctattcaaagtagcgtttgaacttatagctt 34395348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 26293825 - 26293901
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgag 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26293825 ttttttacaacaagcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26293901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 146
Target Start/End: Original strand, 26307082 - 26307158
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgag 146  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26307082 ttttttacaacaagcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26307158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 161
Target Start/End: Original strand, 44263396 - 44263456
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44263396 gagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 44263456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 9211055 - 9211130
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9211055 gagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatcccaagtagcgtttgagcttatagctt 9211130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Original strand, 22957353 - 22957460
Alignment:
Q  56 ttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagct 155  Q
    |||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||  |||||  |||||| ||||||| |||||| |    
T  22957353 ttgtttcgtaacatttttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagtttatagtt 22957452  T
Q  156 tatagctt 163  Q
    ||||||||    
T  22957453 tatagctt 22957460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26037068 - 26036979
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26037068 ttttttaccacgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcagatgttattccaagttgcgtttgagtttatagcctata 26036979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1363893 - 1363793
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||   |||||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1363893 tgtttggtaatatttttttaccatgagcttataacttatttcacgagtttataagctattattcagacgctattctaagtagcgtttgaacttatagctt 1363794  T
Q  157 a 157  Q
    |    
T  1363793 a 1363793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Original strand, 40551856 - 40551955
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  40551856 tttggtaacattttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttata-gctatttttcagaagctatttcagatagcgtttgagcttatagtttat 40551954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42203460 - 42203405
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42203460 gagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 42203405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Original strand, 13888330 - 13888388
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13888330 gagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcgtttaagcttatagcttata 13888388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 18410959 - 18411037
Alignment:
Q  154 cttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataattaatt 232  Q
    |||||| ||||| || |||||||  | || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18410959 cttataacttataattttttattttacttctacccttaccattttaactaaaactcatgtttaccctttataattaatt 18411037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Original strand, 10651115 - 10651176
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10651115 agcttataagctattttttagaagcaattttaagtagcgtttgagtttatagcttatagctt 10651176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 44263068 - 44263105
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagctta 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44263068 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagctta 44263105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 44318319 - 44318371
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||||||||    
T  44318319 gagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcatttgagcttatag 44318371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5320555 - 5320485
Alignment:
Q  140 gtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||| || |||||  | |||||||||||||||    
T  5320555 gtttgagcttatagcttataacatatcacttttaattccatttttacccttattattttaactaaaaccca 5320485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 11741244 - 11741206
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11741244 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgac 11741206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 16831614 - 16831666
Alignment:
Q  100 tgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  16831614 tgagtttataagctatttttcataagctattttaagtagcgtttgagcttata 16831666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 347
Target Start/End: Original strand, 193398 - 193726
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193398 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 193497  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  193498 ctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgagct-------tatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaacccat 193590  T
Q  212 gtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193591 gtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctct 193690  T
Q  312 accacgaaaccattgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193691 accacgaaaccattgttcagtataagatacatacaa 193726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 86 - 347
Target Start/End: Original strand, 5506704 - 5506961
Alignment:
Q  86 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506704 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttata 5506803  T
Q  186 tccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacg 285  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5506804 cccttaccactttaactaaaatccatgtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgatacatctacatgtacacacg 5506903  T
Q  286 attaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaaccattgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  5506904 attaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaaccattgt----tataagatacatacaa 5506961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16127295 - 16127139
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16127295 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 16127196  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127195 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 16127139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29081437 - 29081281
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29081437 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 29081338  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081337 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29081281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40563519 - 40563363
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  40563519 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 40563420  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40563419 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40563363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 44845621 - 44845776
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  44845621 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 44845720  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845721 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 44845776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44947352 - 44947143
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44947352 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 44947253  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||     
T  44947252 ctatttttcagaagctattccaagcagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaacccac 44947153  T
Q  212 gtttaccctt 221  Q
     |||||||||    
T  44947152 ttttaccctt 44947143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2580083 - 2579899
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2580083 cttttagcttttagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2579984  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||    
T  2579983 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttatcctta 2579899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19948474 - 19948318
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19948474 cttttagcttctagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 19948375  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19948374 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19948318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 26540956 - 26541112
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26540956 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 26541055  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26541056 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagctt 26541112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28677046 - 28676890
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  28677046 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 28676947  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28676946 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28676890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 35499597 - 35499753
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  35499597 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 35499696  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35499697 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35499753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 37088280 - 37088436
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37088280 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 37088379  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37088380 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 37088436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37528879 - 37528723
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37528879 cttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 37528780  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37528779 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 37528723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 38185766 - 38185922
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  38185766 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 38185865  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38185866 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 38185922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45345163 - 45345008
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  45345163 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 45345064  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45345063 taagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 45345008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 52794896 - 52795063
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52794896 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 52794995  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  52794996 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacgttttcttcca 52795063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 55305260 - 55305109
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  55305260 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 55305161  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55305160 ctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 55305109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40480177 - 40480028
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40480177 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagctt 40480078  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40480077 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40480028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24536710 - 24536554
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24536710 cttttagctcttagcttagagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 24536611  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24536610 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24536554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 25570375 - 25570531
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  25570375 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagctt 25570474  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25570475 ataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 25570531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 20450458 - 20450680
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  20450458 tagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagttttttacaacaagtttataacttatttcacgagcttataa 20450557  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    | |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||  | ||||| ||||||  |    
T  20450558 gttatttttcagacgctattgcaagtagcgtttgtgcttataacttatagtttatcatcttttattccatttctacccttattattttaattaaaactta 20450657  T
Q  211 tgtttacccttaataattaattt 233  Q
    | ||||||||| |||||| ||||    
T  20450658 tatttaccctttataatttattt 20450680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 8872869 - 8873018
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8872869 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 8872968  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8872969 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 8873018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29203133 - 29203025
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29203133 tgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 29203034  T
Q  157 atagcttat 165  Q
    |||||||||    
T  29203033 atagcttat 29203025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38892142 - 38891990
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  38892142 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcct 38892043  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  38892042 ataagctatttttcagaaactattccaagtagcatttgagcttatagcttata 38891990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 45368610 - 45368758
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45368610 tagcttatagctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcaggagcttataa 45368709  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368710 gctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 45368758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 46972029 - 46972228
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||         | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  46972029 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatttatgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 46972128  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  46972129 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 46972228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52166246 - 52166047
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||        || ||||||| |||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  52166246 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatctctgtttggcaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 52166147  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  52166146 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttatagcttctcattttttatctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 52166047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 52857892 - 52858058
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  52857892 cttttagctcttagtttatagcttataagctcgttttacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 52857991  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52857992 ataagctatttttcagaagctattccaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctcatttttt 52858058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44748942 - 44748793
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44748942 cttttagcttttagcttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 44748843  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44748842 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 44748793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46248120 - 46247971
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  46248120 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 46248021  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46248020 ataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 46247971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29718356 - 29718201
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| | |||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29718356 cttttagtttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaac-acttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagctt 29718258  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29718257 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29718201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 43525744 - 43525888
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43525744 agcttttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43525843  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43525844 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43525888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49853183 - 49853043
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||| | |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49853183 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaggctatctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 49853084  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853083 aagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 49853043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 50499758 - 50499914
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||        | |||||||||||||  ||||| || |  ||||||||| |||||| | ||||||    
T  50499758 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccataagcttatagtttatttcacgagctt 50499857  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50499858 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 50499914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 2851863 - 2851969
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2851863 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2851962  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  2851963 atagctt 2851969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 4240279 - 4240426
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4240279 agcttttagcttataacttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4240378  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4240379 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 4240426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24628345 - 24628199
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24628345 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatt 24628246  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||  ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  24628245 tttcagaagctattccaagtaacatttgaacttatagcttatagctt 24628199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Original strand, 2121897 - 2122065
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||     
T  2121897 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccag 2121996  T
Q  181 ttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    || || |||||  | | ||||||||  ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  2121997 ttttacccttattattctaactaaattccattttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 2122065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 7041107 - 7041211
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||| ||    
T  7041107 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttaagcttatagttt 7041206  T
Q  157 atagc 161  Q
    |||||    
T  7041207 atagc 7041211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 41518403 - 41518511
Alignment:
Q  53 gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  41518403 gctttctttggtaacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcaagagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttata 41518502  T
Q  153 gcttatagc 161  Q
    |||||||||    
T  41518503 gcttatagc 41518511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 48942992 - 48943134
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||  ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48942992 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatct--gtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48943089  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48943090 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48943134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Original strand, 51709057 - 51709229
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51709057 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 51709156  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataatt 228  Q
    |||| || |||  ||| ||||||||| || |||||  | | ||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  51709157 atagtttctcacttttaattccatttttacccttattattctaactaaattccattttttacccttaataatt 51709229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37714116 - 37713972
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  37714116 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 37714017  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37714016 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37713972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 47897762 - 47897606
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||||       ||| ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  47897762 cttttaccttttagtttatagcttataaactcatttgacaaaaaaagctctgtttagtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 47897663  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47897662 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 47897606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54542086 - 54541946
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54542086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 54541987  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  54541986 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttata 54541946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 54672335 - 54672180
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  54672335 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttga-gaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 54672237  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54672236 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataccttatagctt 54672180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Original strand, 52225298 - 52225437
Alignment:
Q  24 atagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    ||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  52225298 atagcttataagctcgtttgacaacaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcaga 52225397  T
Q  124 tactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52225398 agctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 52225437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 53779032 - 53779179
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  53779032 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 53779131  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53779132 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttata 53779179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12063834 - 12063718
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  12063834 tgtttggtaacactttttgaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatatctt 12063735  T
Q  157 atagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  12063734 atagcttctcatttttt 12063718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37490076 - 37489931
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||       ||| | |||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37490076 tagcttatagctgatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctatttgttaaagattttccaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataa 37489977  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37489976 gctatttttcagacactattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37489931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32026555 - 32026407
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||       ||| |||||| ||| | ||||| || |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||    
T  32026555 ttagcttatagcttataagttcgttcgacaaaaaaagctctgtttgataatggtttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatt 32026456  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32026455 tttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttat 32026407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Original strand, 42497064 - 42497231
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||     
T  42497064 gagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagtttctcacttttaattccag 42497163  T
Q  181 ttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    || || |||||  | | ||||||||  || | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  42497164 ttttacccttattattctaactaaattccttttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 42497231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50317180 - 50317029
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||        | | ||||||| |||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50317180 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50317081  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50317080 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 50317029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Original strand, 42217662 - 42217808
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  42217662 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 42217761  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42217762 agctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 42217808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 21603846 - 21603950
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21603846 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctacttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21603945  T
Q  159 agctt 163  Q
    |||||    
T  21603946 agctt 21603950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 21707147 - 21707296
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||       | | |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  21707147 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagattatagcttatttcacgagctt 21707246  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21707247 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 21707296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Original strand, 30548790 - 30548890
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30548790 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30548889  T
Q  157 a 157  Q
    |    
T  30548890 a 30548890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 33391949 - 33392052
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  33391949 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataactt 33392048  T
Q  157 atag 160  Q
    ||||    
T  33392049 atag 33392052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 30864472 - 30864574
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30864472 tgtttggtaacactttttcaccattagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30864571  T
Q  157 ata 159  Q
    |||    
T  30864572 ata 30864574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 156
Target Start/End: Original strand, 41246297 - 41246394
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41246297 tttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41246394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 46318916 - 46318766
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  46318916 cttttatctcttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 46318817  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46318816 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 46318766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37713240 - 37713074
Alignment:
Q  63 gtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagct--tatagcttatag 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||   ||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  37713240 gtaacggttttttacaacgagcttatagtttattttacgagcttataaactatttttaagaagttattctaagtagcgtttgagcttatataacttatag 37713141  T
Q  161 cttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    ||| |||| |||| |||||||| || |||||  | |||| |||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  37713140 cttctcatcttttcttccatttttacccttattaatttatctaaaatccat-tttacccattataatt 37713074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 39876626 - 39876759
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||| ||||  ||||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39876626 tatagcttataagttcgtttgactaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 39876725  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39876726 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39876759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45693470 - 45693386
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693470 acgaacttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 45693386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 48378222 - 48378371
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||         | |||||||||||  ||||| || |||||  |||||||||||| | ||||||    
T  48378222 cttttacctcttagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacattttttcaccacgagtctatagcttatttcacgagctt 48378321  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48378322 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48378371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 51003315 - 51003395
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51003315 acgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 51003395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46627579 - 46627497
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46627579 gagcttatagcttatttcacgaggttataagctaattttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 46627497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 612099 - 612200
Alignment:
Q  58 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||  |||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  612099 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagtttcttttagaagcttataacttattttccatacgccatttcaagtagcgtttgagcttatagctta 612198  T
Q  158 ta 159  Q
    ||    
T  612199 ta 612200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30814403 - 30814261
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||       | |||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  30814403 ttagcttatagcttatagcttttaagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttata 30814304  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    || |||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30814303 agatatttttcggaaactattccaagtagcgtttgaacttata 30814261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 39719361 - 39719498
Alignment:
Q  18 tagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctattt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||     
T  39719361 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacg-ttttttacaacaagcttatagcttatttcacgagcttataagttatta 39719459  T
Q  118 ttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |  |||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  39719460 tgaagaagctattccaaatagcgtttgagtttatagctt 39719498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33898030 - 33897898
Alignment:
Q  26 agcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagata 125  Q
    |||||||||||||||||||        ||| |||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||      
T  33898030 agcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacg 33897931  T
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  33897930 ctattccaaatagcgtttgaacttataacttat 33897898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 2598641 - 2598742
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| | ||||| || || | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  2598641 tgtttggtaatgttttttcaccacaaacttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttataactt 2598740  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  2598741 at 2598742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9338876 - 9338700
Alignment:
Q  54 ctttgtttggtaacgat-tttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagta------gcgtttgag 146  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| | || ||||| ||||||      || ||||||    
T  9338876 ctttgtttgataacgatctttttacaacgagcttatagcttatttcataagcttataacttattttttaaatgctatttcaagtagtgtttgcatttgag 9338777  T
Q  147 cttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaa 223  Q
    |||||| ||| || ||||||||  ||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  9338776 cttataacttttaacttatcatcctttgtctcatttttacccttatcactttaactaaaattcatttttacctttaa 9338700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52868261 - 52868184
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52868261 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctatttcaagtagtgtttgagcttataacttat 52868184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 159
Target Start/End: Original strand, 22257717 - 22257801
Alignment:
Q  75 tacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257717 tacaacgaccttatagcttatttcataagcttattgcttatttttcaaatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 22257801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42465109 - 42465029
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 161  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42465109 gagcttatagcttatttcacaagtttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagattatagcttatagc 42465029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 44545226 - 44545335
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||    
T  44545226 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagctt 44545325  T
Q  107 ataagctatt 116  Q
    ||||||||||    
T  44545326 ataagctatt 44545335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Original strand, 39469914 - 39470018
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  39469914 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 39470013  T
Q  112 ctatt 116  Q
    |||||    
T  39470014 ctatt 39470018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 41785805 - 41785915
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| |||   ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41785805 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagctt 41785904  T
Q  107 ataagctattt 117  Q
    ||| |||||||    
T  41785905 ataggctattt 41785915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5505852 - 5505925
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagct 85  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5505852 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacgattttttacaacgagct 5505925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52595474 - 52595345
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||       | | |||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  52595474 tatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttatgtttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcacaagattataagctatttttcag 52595375  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52595374 aagctattccaagtagcgttggagcttata 52595345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 47173568 - 47173680
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||        | | |||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  47173568 tagctcttagcttataggttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgataacgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 47173667  T
Q  111 gctatttttcaga 123  Q
    |||||||||||||    
T  47173668 gctatttttcaga 47173680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 25146381 - 25146529
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcc 178  Q
    ||||||||||| ||||||| |  | |||||||  |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  || |||  ||| |||||    
T  25146381 acgagcttataacttatttcaccaacttataacttatttttctgacgctatttcaagtaacgtttgaacttataacttataatttttcacttttaattcc 25146480  T
Q  179 atttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataat 227  Q
    |||| || |||||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  25146481 atttttacccttactattttaattaaaatccacttttacccttaataat 25146529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44896035 - 44895985
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  44896035 caagtagcttttgagcttatagcttgtagcttttcatattttattccattt 44895985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52931206 - 52931152
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  52931206 agcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagctt 52931152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32982986 - 32982921
Alignment:
Q  89 agcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagc 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  32982986 agcttattttacgagcttataagctatttttcggaagctatttcaagtaatgcttgagcttatagc 32982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 158
Target Start/End: Original strand, 35100284 - 35100328
Alignment:
Q  114 atttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35100284 atttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35100328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42528031 - 42527967
Alignment:
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctt 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  42528031 ctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagcttttcacattttcttccatttatatcctt 42527967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43968327 - 43968271
Alignment:
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  43968327 ctatttcaagtagcttttgagcttgtagcttatagcttttcatattttcttccattt 43968271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 24536845 - 24536807
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24536845 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgac 24536807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Original strand, 27446501 - 27446575
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||    
T  27446501 ttatagcttatttcacgagtttatatgctatttttcagaagctatttcaaatagcgtctgagtttataacttata 27446575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Original strand, 52363038 - 52363076
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52363038 cttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgac 52363076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 45
Target Start/End: Original strand, 52788677 - 52788710
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52788677 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgac 52788710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 43740385 - 43740325
Alignment:
Q  56 ttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43740385 ttgtttggtaacagtttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 43740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 791476 - 791148
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||        ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791476 tatagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 791377  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgt----ttacc 218  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  791376 atgctattacaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttatcatgttttattccatttataaccttaccactttaactaaaacccatgtttacttacc 791277  T
Q  219 cttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacga 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  791276 cttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatgtctaccacga 791177  T
Q  319 aaccattgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  791176 aaccattgttcagtataagatacatacaa 791148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 1342777 - 1342956
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1342777 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcagaagcttataag 1342876  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1342877 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttcttccatttttatcctta 1342956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36246535 - 36246379
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36246535 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36246436  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36246435 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36246379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42587542 - 42587386
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42587542 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 42587443  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42587442 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 42587386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 43254099 - 43254255
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  43254099 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 43254198  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254199 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 43254255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45687075 - 45686919
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  45687075 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 45686976  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45686975 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 45686919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 483141 - 482942
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  483141 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 483042  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  483041 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 482942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 9487403 - 9487559
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||       | | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  9487403 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttactatgagcttatagcttatttcacgagctt 9487502  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487503 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 9487559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10312188 - 10312032
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  10312188 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 10312089  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10312088 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatatcttatagctt 10312032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36612220 - 36612086
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36612220 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttttagcttatttcaggagtttataagctattttttagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 36612121  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  36612120 atagcttatcatattttcttccatttttatcctta 36612086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21254856 - 21254704
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21254856 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcacgagctt 21254757  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21254756 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttata 21254704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40637319 - 40637163
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || ||||||| |||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  40637319 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 40637220  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637219 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40637163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27089810 - 27089659
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27089810 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27089711  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27089710 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 27089659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 27188491 - 27188642
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27188491 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27188590  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27188591 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 27188642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 31511301 - 31511452
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31511301 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 31511400  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31511401 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31511452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 44596606 - 44596805
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||         | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44596606 cttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttcacaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 44596705  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  44596706 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtttcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 44596805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 43134401 - 43134599
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  43134401 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaa-gctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 43134499  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  43134500 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 43134599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27655828 - 27655611
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27655828 tagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagcttataa 27655729  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| || || |||||| | |||  |||||| ||     
T  27655728 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttattgttttttcttccacttttacccttactattttttctaaaatcct 27655629  T
Q  211 tgtttacccttaataatt 228  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  27655628 tttttaccctttataatt 27655611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 21374629 - 21374785
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||         | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21374629 cttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 21374728  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21374729 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21374785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 40258853 - 40259009
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40258853 cttttagctcttagcttatagcttataagcttgtttgacagaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagctt 40258952  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40258953 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40259009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 35587580 - 35587731
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35587580 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35587679  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35587680 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35587731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46879629 - 46879527
Alignment:
Q  61 tggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatag 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46879629 tggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatag 46879530  T
Q  161 ctt 163  Q
    |||    
T  46879529 ctt 46879527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19757625 - 19757500
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19757625 tgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttaattcaggagcttataagctatttttcaaaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 19757526  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||    
T  19757525 atagcttataatattttcttccattt 19757500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 46757756 - 46757857
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  46757756 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 46757855  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  46757856 at 46757857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47471119 - 47470937
Alignment:
Q  9 tttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttat 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47471119 tttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 47471020  T
Q  109 aagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||    
T  47471019 aaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttatcctta 47470937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42375941 - 42375793
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42375941 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 42375843  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42375842 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 42375793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48832207 - 48832056
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48832207 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 48832108  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48832107 ctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 48832056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Original strand, 40893383 - 40893541
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattt-tttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||       | | |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  40893383 tatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatgatctctttaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttta 40893482  T
Q  122 gatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40893483 gaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcattttttcttccat 40893541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Original strand, 44743713 - 44743955
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44743713 cttttagctcttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 44743812  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||  ||| |||||| || || | |||  | | ||||||||     
T  44743813 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagtttatagcttataacttctcacttttaattccagttttacctttattattctaactaaat 44743912  T
Q  207 ccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
     ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  44743913 tccattttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 44743955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 33026922 - 33027028
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33026922 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 33027021  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  33027022 atagctt 33027028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33203826 - 33203671
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  33203826 ttttagcttttagtttatagtttataagttcctttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 33203727  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33203726 taagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 33203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 36407224 - 36407423
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| ||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36407224 cttttaactcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttataacttatttcacgagctt 36407323  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  36407324 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 36407423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45222227 - 45222076
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||       | | |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45222227 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 45222128  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45222127 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttatagctt 45222076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Original strand, 17844556 - 17844761
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||| |||||||||||| ||||       ||| |||||||||| | | ||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17844556 tatagtttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctatttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 17844655  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| || |||||  | |||| |||||| |||| |||| ||||     
T  17844656 aagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcaaaatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatccttt 17844755  T
Q  223 ataatt 228  Q
    ||||||    
T  17844756 ataatt 17844761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 21741967 - 21742124
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         || |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  21741967 cttttagattttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 21742066  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21742067 taaaagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21742124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 23029790 - 23030007
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23029790 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacgaaaattagctttgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 23029889  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
     ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||| || || |||||  | |||| |||||| |||    
T  23029890 actattattcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcaatatttcttccaattttacccttaatattttatctaaaatcca 23029989  T
Q  211 tgtttacccttaataatt 228  Q
    | |||| |||| ||||||    
T  23029990 tttttatcctttataatt 23030007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28425767 - 28425614
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||       | |||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28425767 ttagcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaatgttttgtttggtaactttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 28425668  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    || ||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28425667 agttatttttcataagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 28425614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 36436150 - 36436294
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36436150 cttttagcttttagcttatatcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36436248  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36436249 ataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttata 36436294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Original strand, 49148328 - 49148571
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||       ||| ||||| |||||  ||||  || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  49148328 cttttagctcttagctaatagcttataagcttttttgacaaaaaaagctctgtttagtaacacttttccaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 49148427  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | ||||||||||     
T  49148428 atgagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagtttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattttaactaaat 49148527  T
Q  207 ccca--tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
     |||  | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  49148528 tccatttttttacccttaataatttattatattataaattaaaa 49148571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12345176 - 12345070
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12345176 tgtttggtaacactttttcacgaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 12345077  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  12345076 atagctt 12345070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 34709234 - 34709385
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | |||||||       ||| ||| |||||||  ||||| || | |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  34709234 agcttttagcttttagcttataagtttgtttgactaaaaaagctctgtctggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataag 34709333  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34709334 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 34709385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40106159 - 40106008
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  40106159 agcttttagctcttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 40106060  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40106059 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagtttatagctt 40106008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47587262 - 47587115
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||         || ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  47587262 ttttagcttttagcttatagcttataaactcgtctgataaaaaaaactctgtttggtaac-acttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 47587164  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47587163 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 47587115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19832131 - 19832000
Alignment:
Q  25 tagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagat 124  Q
    ||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |     
T  19832131 tagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaa 19832032  T
Q  125 actattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19832031 gctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19832000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 48313582 - 48313427
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||       ||| || ||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  48313582 cttttagcttttaggttatagtttataagttcgtttgacaaaaaa-gctctgattggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagctt 48313484  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48313483 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 48313427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38531291 - 38531100
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38531291 tgtttggtaacactttttcaccatgatctaatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagttatt-caagtagcgtttgagcttatagctt 38531193  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca--tgtttacccttaataattaattttattataatttaaa 247  Q
    ||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  |||  | |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  38531192 atagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattccatttttttacccttaatcatttattatattataaattaaa 38531100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21313951 - 21313799
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn--gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgag 103  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  ||    
T  21313951 acttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaag 21313852  T
Q  104 cttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21313851 cttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 21313799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17192599 - 17192452
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||       ||| ||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  17192599 ttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaac-acttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagctta 17192501  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17192500 taagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 17192452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 48590760 - 48590866
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48590760 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 48590859  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  48590860 atagctt 48590866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11466180 - 11466047
Alignment:
Q  25 tagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagat 124  Q
    ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||     
T  11466180 tagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctattttttagaa 11466081  T
Q  125 actattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11466080 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11466047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 45672341 - 45672441
Alignment:
Q  58 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctta 157  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  45672341 gtttcgtaacaattttttacaacgaacttataatttattttacgaacttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagttta 45672440  T
Q  158 t 158  Q
    |    
T  45672441 t 45672441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21740254 - 21740152
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||| ||||||||||    
T  21740254 tgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcagaagtttataagctatttttcagaaactacttgaaatagcgtttga-cttatagctt 21740156  T
Q  157 atag 160  Q
    ||||    
T  21740155 atag 21740152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Original strand, 9485786 - 9485884
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  9485786 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctatttcaagtatcatttgagcttatagcttataggttctcatttttaattcca 9485884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22642360 - 22642259
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22642360 tgtttggtaacggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttaaacgctattctaagtagcatttgagcttatagctt 22642261  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  22642260 at 22642259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33609163 - 33609058
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataattaat 231  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  33609163 caagtagcatttaagcttatagcttatagcttatcatcttttgtcccatttttacccttattattttaattaaaacccatgtttaccctttataatttat 33609064  T
Q  232 tttatt 237  Q
    | ||||    
T  33609063 tatatt 33609058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 35000782 - 35000859
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35000782 gagcttatagcttatttcacaagtttataaactatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35000859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 32168829 - 32168938
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32168829 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 32168928  T
Q  107 ataagctatt 116  Q
    ||||||||||    
T  32168929 ataagctatt 32168938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21316727 - 21316611
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21316727 tatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaactctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcataagcttataagctatttttcag 21316628  T
Q  123 atactattacaagtagc 139  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  21316627 aagctattccaagtagc 21316611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22621553 - 22621459
Alignment:
Q  71 tttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||  ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22621553 tttttacaacgagattatagtttatttcaggagctcataacttatttttcagacattatttcaagcagcgtttgagcttataacttatagcttat 22621459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 221
Target Start/End: Original strand, 24170864 - 24170985
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccacttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |  || |||||  |||||    
T  24170864 atgagcttataagctatttttcagacattattccaagtagtgcttgagcttataacttatagcttatcactttttcttccaatactacccttattacttt 24170963  T
Q  199 aactaaaacccatgtttaccctt 221  Q
    | |||||| ||| ||||||||||    
T  24170964 atctaaaa-ccaagtttaccctt 24170985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Original strand, 38481286 - 38481421
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  38481286 ttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaacagctctgtttggtaacactttttcaccatgaatttatagcttatttcacgagtctataagctatt 38481385  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38481386 tttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttata 38481421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 30699522 - 30699663
Alignment:
Q  80 cgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||   ||||||||| | | ||||  ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||| | |    
T  30699522 cgagcttataacttattctattagcttatagcttatttttcaaacattattttaagtatcgtttgaacttataattcatagcttatcatattttatccta 30699621  T
Q  180 tttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctt 221  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  30699622 tttataccctcaccattttaagtaaaacccaattttaccctt 30699663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27869645 - 27869570
Alignment:
Q  83 gcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27869645 gcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcggacgttattccaagtagcgtttgagtttatagcttat 27869570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 48620531 - 48620598
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48620531 ttatagtttatttcacgagcttataaactatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcatata 48620598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Original strand, 24170788 - 24170856
Alignment:
Q  55 tttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    |||| ||||||| | ||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24170788 tttgcttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcaga 24170856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Original strand, 39698930 - 39698984
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39698930 agcttacaagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 39698984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 155
Target Start/End: Original strand, 39229953 - 39230027
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagct 155  Q
    ||||||||| | ||||| | || |||||||  ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||    
T  39229953 gagcttataacctatttcacgaacttataacttatttttcagatactattttaaatagtgtttgagcttatagct 39230027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 57 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5520166 - 5519876
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5520166 tgtttagtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagtttataagctatttttcagatgctattacaaatagcgtttgagcttatagcat 5520067  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaa 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520066 atagcttatcatattttattccatttatacccttaccactttaagtaaaacccacgtttacccttaataattaattttattataatttaaaacaaaacaa 5519967  T
Q  257 aaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaaccattgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5519966 aaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctatcacgaaaccattgttcagtataagatacatacaa 5519876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38579157 - 38578998
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  38579157 acttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 38579058  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38579057 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 38578998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2546472 - 2546316
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2546472 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaaattttaaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2546373  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2546372 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2546316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 3377385 - 3377541
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3377385 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 3377484  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3377485 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 3377541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 16486875 - 16487031
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16486875 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 16486974  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16486975 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 16487031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28382828 - 28382672
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  28382828 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 28382729  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382728 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28382672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36712684 - 36712528
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36712684 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36712585  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36712584 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36712528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4453671 - 4453515
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4453671 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 4453572  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4453571 ataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 4453515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8689110 - 8688954
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8689110 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 8689011  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8689010 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8688954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 165
Target Start/End: Original strand, 8815208 - 8815364
Alignment:
Q  9 tttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttat 108  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8815208 tttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat 8815307  T
Q  109 aagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815308 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 8815364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 9886985 - 9887141
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  9886985 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 9887084  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9887085 ataagctatttttcataagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 9887141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 41322749 - 41322905
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  41322749 cttttagcttttatcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 41322848  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41322849 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 41322905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Original strand, 25071436 - 25071578
Alignment:
Q  80 cgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25071436 cgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttcca 25071535  T
Q  180 tttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    |||||| |||||  | |||| |||||| |||| | ||||||||    
T  25071536 tttatacccttattattttatctaaaaaccatttataccctta 25071578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43507705 - 43507554
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43507705 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 43507606  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43507605 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 43507554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2266301 - 2266144
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  2266301 acttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 2266202  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2266201 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2266144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13111891 - 13111734
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgttt-ggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||| ||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  13111891 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 13111792  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13111791 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 13111734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 650927 - 650772
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  650927 cttttagcttt-agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 650829  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650828 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 650772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 15521472 - 15521624
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15521472 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaaactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 15521571  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15521572 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 15521624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 36999482 - 36999638
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36999482 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36999581  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36999582 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 36999638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 37356162 - 37356318
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37356162 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 37356261  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356262 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 37356318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24402195 - 24402044
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24402195 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 24402096  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24402095 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 24402044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10393180 - 10393030
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10393180 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 10393081  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatag 160  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10393080 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatag 10393030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 5039768 - 5039917
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||    
T  5039768 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagctt 5039867  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5039868 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5039917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 21865239 - 21865396
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  21865239 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 21865338  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21865339 tataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21865396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Original strand, 4055955 - 4056086
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcc 178  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4055955 acgagcttatagcttatttcacgagcttattagctatttttcagacactattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagcttatcatgttttatttc 4056054  T
Q  179 atttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||| || | ||| || ||||| |||||||||    
T  4056055 atttttacctttatcattttaattaaaaccca 4056086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 39167760 - 39167900
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39167760 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 39167859  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39167860 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 39167900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40025090 - 40024934
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  40025090 cttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 40024991  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40024990 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgagcttatagcttatagctt 40024934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17263896 - 17263745
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17263896 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatgttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 17263797  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17263796 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 17263745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Original strand, 24019895 - 24020030
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24019895 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaatgatctctaaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 24019994  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24019995 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24020030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31616528 - 31616385
Alignment:
Q  13 gcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31616528 gcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagc 31616429  T
Q  113 tatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31616428 tatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 31616385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7400523 - 7400381
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7400523 tatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 7400424  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7400423 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 7400381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 29514832 - 29514982
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29514832 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacactttttcaccaagagcttatagcttatttcacgagcttataag 29514930  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29514931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29514982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4385673 - 4385524
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4385673 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagctt 4385574  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4385573 ataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 4385524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10839729 - 10839572
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| |  ||||    
T  10839729 acttttagcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatcttatttcactagct 10839630  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10839629 tataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 10839572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Original strand, 15250170 - 15250310
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcc 178  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  15250170 acgagcttatagcttatttctcgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttgtcatgttttgttcc 15250269  T
Q  179 atttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccc 219  Q
    |||| || ||||| || ||||| |||||||||  |||||||    
T  15250270 atttctacccttatcattttaattaaaacccacatttaccc 15250310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6760752 - 6760603
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  6760752 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacaagctt 6760653  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6760652 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6760603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23357112 - 23356933
Alignment:
Q  27 gcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatac 126  Q
    |||||||||||||||||||       ||| |||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||  |    
T  23357112 gcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttatatgctatttttcagaagc 23357013  T
Q  127 tattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  23357012 tatttcaagtagcgtctgagcttatagcttttagctttttatcttttgttccatttttacccttattattttaactaaaa 23356933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 26911505 - 26911739
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||        || | |||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26911505 cttttagctcttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-ctctctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 26911603  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||     
T  26911604 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaat 26911703  T
Q  207 ccca-tgtttacccttaataattaattttattataa 241  Q
     ||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  26911704 tccattttttacccttaatcatttattatattataa 26911739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38880880 - 38880731
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38880880 tgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38880781  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    ||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  38880780 atagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 38880731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40869504 - 40869358
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40869504 ttagcttatagcttatagtttataagctcatttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 40869405  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40869404 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40869358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4038488 - 4038339
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||        | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4038488 cttttagcttttagcttatagcttacaagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 4038389  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4038388 ataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4038339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 43135610 - 43135759
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        ||| |||||| ||||  ||||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  43135610 cttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagctt 43135709  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43135710 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 43135759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 152
Target Start/End: Original strand, 2758870 - 2758969
Alignment:
Q  53 gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2758870 gctttgtttggtgacagttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctattttttagacgctattccaagtagcgtttgagcttata 2758969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Original strand, 16669113 - 16669196
Alignment:
Q  75 tacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16669113 tacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16669196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 44275656 - 44275854
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||         | |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44275656 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaat-tatgtttggtaacactttttgaccacgagcttatagcttatttcacgagctt 44275754  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  44275755 ataatctatttttcagaagttattccaattagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 44275854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6232428 - 6232275
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||         | |||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||| | ||||||    
T  6232428 cttttagctcttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaatattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagctt 6232329  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatag 160  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232328 ataagctatttttcagaagatatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatag 6232275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41796890 - 41796741
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |        ||| ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  41796890 cttttagctcttagcttatagtttataagctcgttttataaaaaaagctctgtttcgtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 41796791  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41796790 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 41796741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 228
Target Start/End: Original strand, 38842906 - 38843049
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttat 184  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |    
T  38842906 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttataacttctcatattttatcccattttt 38843005  T
Q  185 atccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    | || ||  | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  38843006 acccatattattttaattaaaattcatgtttaccctttataatt 38843049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Original strand, 598937 - 599038
Alignment:
Q  60 ttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  598937 ttggtaacgcttttttacaacgagtttatagtttatttcaaaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagtttata 599036  T
Q  160 gc 161  Q
    ||    
T  599037 gc 599038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8070721 - 8070612
Alignment:
Q  54 ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    ||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  8070721 ctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatag 8070622  T
Q  154 cttatagctt 163  Q
     |||||||||    
T  8070621 tttatagctt 8070612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7823631 - 7823475
Alignment:
Q  71 tttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |    
T  7823631 tttttacaacgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctattttttataagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcatctcactt 7823532  T
Q  171 tttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataat 227  Q
    || |||| | || || |||||  | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  7823531 ttaattctagttttacccttattattttaattaaaatccacttttacccttaataat 7823475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Original strand, 43285661 - 43285760
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43285661 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 43285760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 10727898 - 10727979
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10727898 agcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcaaaaactattccaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 10727979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2047391 - 2047227
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttat 184  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || |    
T  2047391 ttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagttattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccagtttt 2047292  T
Q  185 atccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    | |||||  | | ||||||||  ||| | ||||| |||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  2047291 acccttattattctaactaaattccattttttactcttaattatttattatattataaattaaaa 2047227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Original strand, 42132734 - 42132809
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42132734 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 42132809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 117
Target Start/End: Original strand, 18212113 - 18212223
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18212113 cttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 18212212  T
Q  107 ataagctattt 117  Q
    |||||||||||    
T  18212213 ataagctattt 18212223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7213735 - 7213664
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7213735 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgtgcttata 7213664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 8339972 - 8340128
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||       | | |||||||||||  ||||| |  | |||||||||| |||||||| ||  ||    
T  8339972 cttttagctcttaacttatagtttataagttcgtttgacgaaaaaagttctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagtttattttacgaattt 8340071  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8340072 ataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttaaagcttatagctt 8340128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13528052 - 13527900
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||| ||||||   |||| || | ||| ||||| ||||||| |  || ||    
T  13528052 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttcggtaacaccttttcaccatgagtttataacttatttcacaagttt 13527953  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13527952 ataagctatttttcagaagctatttcaagtaacgtttgaacttatagcttata 13527900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 221
Target Start/End: Original strand, 2221430 - 2221596
Alignment:
Q  55 tttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagc 154  Q
    |||||||||||| |  |||| || | ||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  2221430 tttgtttggtaatgtcttttcaccatgagtttatagtttatttcacgagcttctaagctatttttcagacgctattccaagtaacgtttgaacttataac 2221529  T
Q  155 ttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctt 221  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||  || || |||||  | |||| |||||| |||| |||||||||    
T  2221530 ttataacttatcattttttcttcctattttacccttattattttatctaaaatccatttttaccctt 2221596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 18710255 - 18710312
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18710255 atgagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 18710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6222708 - 6222636
Alignment:
Q  86 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  6222708 tatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagcagcatttgaacttatagcttat 6222636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9053198 - 9053122
Alignment:
Q  87 atagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9053198 atagtttatttcacgagcttataaactattcttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttacagctt 9053122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 158
Target Start/End: Original strand, 41877826 - 41877883
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41877826 gagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 41877883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 161
Target Start/End: Original strand, 39675075 - 39675166
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 161  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |  ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39675075 ttttttacaatgaacttataacttatttcaagagtttataagatatttttcaaaagctgcttcaagtagcgtttgagcttataacttatagc 39675166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6153515 - 6153461
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6153515 agcttataagctatttttcagaagttattccaagtagtgtttgagcttatagctt 6153461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 217
Target Start/End: Original strand, 3337198 - 3337263
Alignment:
Q  152 agcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttac 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  3337198 agcttatagcttatcatcttttatttcattttcacccttatcactttaactaaaatccatttttac 3337263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 158
Target Start/End: Original strand, 6807492 - 6807537
Alignment:
Q  113 tatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6807492 tatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6807537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 7569851 - 7569908
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  7569851 atgagcttataagctatttttcagaagttattttaagtaacgtttgagcttatagctt 7569908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 89
Target Start/End: Original strand, 18710183 - 18710265
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttata 89  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  18710183 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttata 18710265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Original strand, 34884875 - 34884952
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||| |||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  34884875 acgagtttatagtttatttcacgagcttatagcctatttttcagactctattccaagtagtgtttcagcttatagctt 34884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13351647 - 13351603
Alignment:
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13351647 ctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 13351603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 10818420 - 10818471
Alignment:
Q  136 tagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatc 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  10818420 tagcgtttgagcttataacttatagtttatcatcttttattctatttttatc 10818471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 163
Target Start/End: Original strand, 18212224 - 18212255
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212224 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 18212255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 6153596 - 6153558
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6153596 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgac 6153558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 185
Target Start/End: Original strand, 24020017 - 24020050
Alignment:
Q  152 agcttatagcttatcatgttttattccatttata 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24020017 agcttatagcttatcatcttttattccatttata 24020050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 182
Target Start/End: Original strand, 43496258 - 43496342
Alignment:
Q  97 ttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    ||||||||||||| ||| ||| | |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||    
T  43496258 ttatgagcttata-gctttttgtaagaagctatttcaagtagcttttgagcttatagcttgtagctttttatattttcttccattt 43496342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44525962 - 44525925
Alignment:
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44525962 ctatttcaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 44525925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 13761887 - 13761963
Alignment:
Q  152 agcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  13761887 agcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattttatctaaaaaccaattttacccattataatt 13761963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 113)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30562984 - 30562669
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30562984 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacgattttttacaacgaacttataacttattttatgagca-ataagctatttttcag 30562886  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30562885 atgctattacaagtagcgtttaagcttatagcttat-------catgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaactcatgtttaccctta 30562793  T
Q  223 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30562792 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 30562693  T
Q  323 attgttcagtataagatacataca 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30562692 attgttcagtataagatacataca 30562669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52708134 - 52707812
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||||||||||||         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  52708134 tatagcttataagctcgtttgatagaaaaaactctgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 52708035  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52708034 atgttattacaagtaacgtt-gagcttatagcttatatcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 52707936  T
Q  223 ataattaattttattataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctacatgtacacacgattaagcttacaatggttgaatctctaccacgaaacc 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  52707935 ataattaattt-attataatttaaaacaaaacaaaaacgatgctacatctgcatgtacacacgattaagcttacaatggctgaatctctatcacaaaacc 52707837  T
Q  323 attgttcagtataagatacatacaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  52707836 attgttcagtataagacacatacaa 52707812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 35190763 - 35190584
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||        || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||    
T  35190763 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacgcttttttacaacgagtttgtagcttatttcaggagcttataag 35190664  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  35190663 ctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatattttcttccatttttatcctta 35190584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21633964 - 21633747
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||       | |||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21633964 tagcttatagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaatgttctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataa 21633865  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||| |||    
T  21633864 gctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattttatctaaaaacca 21633765  T
Q  211 tgtttacccttaataatt 228  Q
      ||||||| | ||||||    
T  21633764 attttacccattataatt 21633747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 42116888 - 42117044
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42116888 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 42116987  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42116988 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 42117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 53407181 - 53407337
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  53407181 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 53407280  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53407281 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 53407337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 7706364 - 7706520
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  7706364 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagctt 7706463  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7706464 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 7706520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8829967 - 8829811
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8829967 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 8829868  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829867 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8829811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 8941896 - 8942052
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8941896 cttttaacttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagctt 8941995  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8941996 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8942052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 11600675 - 11600831
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  |||||    
T  11600675 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagctt 11600774  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11600775 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 11600831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12234119 - 12233963
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12234119 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 12234020  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12234019 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 12233963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 18582836 - 18582992
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  18582836 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagctt 18582935  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18582936 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 18582992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 45906131 - 45906287
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  45906131 cttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 45906230  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45906231 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 45906287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 46895275 - 46895431
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  46895275 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 46895374  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46895375 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 46895431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 56372427 - 56372583
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  56372427 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 56372526  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56372527 ataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagctt 56372583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4391843 - 4391704
Alignment:
Q  24 atagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4391843 atagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcaga 4391744  T
Q  124 tactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4391743 agctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 4391704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 11152086 - 11151935
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11152086 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11151987  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11151986 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 11151935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 22892520 - 22892719
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22892520 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 22892619  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  22892620 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 22892719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 22944184 - 22944383
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22944184 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 22944283  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  22944284 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 22944383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 55496032 - 55495883
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  55496032 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 55495933  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55495932 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55495883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4517343 - 4517187
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4517343 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 4517244  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4517243 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 4517187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19514034 - 19513878
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19514034 cttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 19513935  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19513934 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgttttagcttatagcttatagctt 19513878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 28307247 - 28307403
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||  ||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  28307247 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctcggtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 28307346  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28307347 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28307403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 52669986 - 52670142
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  52669986 cttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 52670085  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52670086 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 52670142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 3009708 - 3009859
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3009708 agcttttagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatttttttaccttgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3009807  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3009808 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 3009859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27397913 - 27397762
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27397913 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27397814  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397813 ctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 27397762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 29413528 - 29413695
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  29413528 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataag 29413627  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  29413628 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacgttttcttcca 29413695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Original strand, 25235187 - 25235291
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25235187 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagctt 25235286  T
Q  157 atagc 161  Q
    |||||    
T  25235287 atagc 25235291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35777538 - 35777393
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  35777538 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 35777439  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35777438 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttata 35777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 55684704 - 55684841
Alignment:
Q  24 atagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  55684704 atagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctttgtttggtaatgcttttttacaacgagcttctagcttatttcaggagcttataagctatttttcaga 55684803  T
Q  124 tactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 161  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55684804 agctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagc 55684841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22038509 - 22038353
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||   ||||||    
T  22038509 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttctcgagctt 22038410  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22038409 ataggctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttatagctt 22038353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4939532 - 4939382
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||       | | ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4939532 agcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaac-actttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4939434  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4939433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 4939382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23868016 - 23867865
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23868016 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 23867917  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23867916 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 23867865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 37970287 - 37970485
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37970287 cttttagctcttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaa-ctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcatgagctt 37970385  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  37970386 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 37970485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 55764552 - 55764750
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  55764552 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttca-aaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 55764650  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  55764651 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 55764750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24954279 - 24954159
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  24954279 gagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttgttccatttttacccttatcattttaa 24954180  T
Q  201 ctaaaacccatgtttaccctt 221  Q
     |||||||||  |||||||||    
T  24954179 ttaaaacccacttttaccctt 24954159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 22430690 - 22430785
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430690 tttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 22430785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37115434 - 37115286
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  37115434 ttttagcttttagcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 37115335  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37115334 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 37115286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39087710 - 39087558
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||    
T  39087710 cttttagcttctagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagttt 39087611  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39087610 ataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 39087558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25440631 - 25440480
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||        | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25440631 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 25440532  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25440531 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 25440480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 20511451 - 20511552
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20511451 tgtttgataacagttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttataactt 20511550  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  20511551 at 20511552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 21369890 - 21370028
Alignment:
Q  25 tagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  21369890 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 21369989  T
Q  125 actattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369990 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 21370028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 33114985 - 33115123
Alignment:
Q  25 tagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  33114985 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 33115084  T
Q  125 actattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33115085 gctatttcaagtatcgtttgagcttatagcttatagctt 33115123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 37047071 - 37047172
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  37047071 tgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttattttaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaaatagcgtttgagcttatagctt 37047170  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  37047171 at 37047172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5465512 - 5465404
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5465512 tgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5465413  T
Q  157 atagcttat 165  Q
    |||||||||    
T  5465412 atagcttat 5465404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9043763 - 9043606
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgatttttt-acaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  |||||  || | ||||||||| ||||||| | |||||    
T  9043763 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacactttttccaccatgagcttataacttatttcacgagct 9043664  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043663 tataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 9043606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Original strand, 31678969 - 31679110
Alignment:
Q  15 ttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagcta 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31678969 ttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta 31679068  T
Q  115 tttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31679069 tttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4392877 - 4392722
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4392877 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 4392778  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392777 ataagctatttt-cataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 4392722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 29663926 - 29664070
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  29663926 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataag 29664025  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29664026 ctatttttcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagctt 29664070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 55856676 - 55856523
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||        ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  55856676 cttttaacttttagcttatagcttataagtttgtttga---taaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 55856580  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55856579 ataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 55856523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Original strand, 26826563 - 26826697
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26826563 tgtttggtaacactttttcacgatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 26826662  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||    
T  26826663 atagcttctcactttttcttccaattttatcctta 26826697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27185710 - 27185624
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 167  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185710 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 27185624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47417627 - 47417482
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  47417627 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 47417528  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47417527 ataagctatctttcataagctattccaagcagcgtttgagcttata 47417482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 55828996 - 55829145
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  55828996 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttataacttatttcacgagctt 55829095  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55829096 ataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 55829145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9032097 - 9031978
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9032097 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagctt 9031998  T
Q  157 atagcttatcatgttttatt 176  Q
    ||||||| |||  |||||||    
T  9031997 atagcttctcactttttatt 9031978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23113554 - 23113407
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  23113554 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagtttataacttataacttctcatattttatcccat 23113455  T
Q  181 ttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    || || |||||  | ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  23113454 ttttacccttattattttaattaaaatccatatttaccctttataatt 23113407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35822451 - 35822299
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||| | ||||||| | ||| ||    
T  35822451 cttttagcttttagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttacaacttatttcacgagatt 35822352  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35822351 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 35822299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4355739 - 4355588
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||       | | ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  4355739 agcttttagcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 4355640  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4355639 ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 4355588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 56270227 - 56270044
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  56270227 tatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 56270128  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  56270127 aagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 56270044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43078298 - 43078113
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| | |||||  | ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43078298 tgtttggtaatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 43078199  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgttt-acccttaataattaattttattataa 241  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||| || || |||||  | ||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  43078198 ataacttctcatttttaattccagttttacccttattagtttaactaaattccatttttcacccttaatcatttattatattataa 43078113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 48056708 - 48056607
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48056708 tgtttggtaacaattttttacaacgaacttatagtttatttcacgaacttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48056609  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  48056608 at 48056607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35581097 - 35580948
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||| | ||||||    
T  35581097 cttttaacttttagcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagtttatttcacgagctt 35580998  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35580997 ataaactatttttcagaggctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 35580948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 151
Target Start/End: Original strand, 50502284 - 50502376
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttat 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50502284 tttggtaacggttttttacaacgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgagcttat 50502376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 37831924 - 37832060
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37831924 ttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 37832023  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37832024 tttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatag 37832060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31338578 - 31338496
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31338578 gagcttatagcttatttcacgggcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31338496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 35468012 - 35468163
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||         | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35468012 agcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35468111  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35468112 ctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttataacatatagctt 35468163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 55358416 - 55358334
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55358416 gagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 55358334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4465573 - 4465472
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  4465573 tgtttggtaacgtctttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctgttccaagtagcgtttgagcttgtagctt 4465474  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  4465473 at 4465472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 43225830 - 43225680
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  43225830 cttttagtttttagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 43225731  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43225730 tataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 43225680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 51011142 - 51011061
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51011142 agcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 51011061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Original strand, 11050359 - 11050458
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| | ||||| || | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11050359 tgtttggtaatgctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 11050458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 15635934 - 15636090
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||        |||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15635934 cttttacctcttagcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaagctttgtttggtaacactttttcactatgagtttatagcttatttcacgagctt 15636033  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15636034 ataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgattttatagcttatagctt 15636090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 156
Target Start/End: Original strand, 44525707 - 44525778
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44525707 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44525778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20148880 - 20148803
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20148880 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 20148803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 42085811 - 42085723
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42085811 tttttcaccacgaacttatagcttatttcacgagcttataagctttttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 42085723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30366248 - 30366142
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| |  | ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30366248 tgtttggtaacactttttcatcatgagcttatatcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 30366149  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  30366148 atagctt 30366142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 33005188 - 33005111
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33005188 acgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 33005111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 23162643 - 23162747
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttg-agcttatagct 155  Q
    |||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  23162643 tgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgaagcttatagct 23162742  T
Q  156 tatag 160  Q
    |||||    
T  23162743 tatag 23162747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 36196933 - 36197017
Alignment:
Q  74 ttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  36196933 ttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagcttatagcttat 36197017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32101835 - 32101736
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32101835 tttggtaacggtcttttaccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttctaagacgttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32101736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 191
Target Start/End: Original strand, 52713559 - 52713670
Alignment:
Q  80 cgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  52713559 cgagcttataacttatttcacaaacttataagttatttttaagacactattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcatcttttcttcca 52713658  T
Q  180 tttatatcctta 191  Q
    ||| || |||||    
T  52713659 tttttaccctta 52713670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 158
Target Start/End: Original strand, 31435063 - 31435149
Alignment:
Q  72 ttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31435063 ttttacaacgagcttatagcttatttcacgagtttataagttatttttcatacgctattccaagtagcgtttgaggttataacttat 31435149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497399
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40497473 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 40497399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45780817 - 45780760
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45780817 atgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 45780760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33005275 - 33005178
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33005275 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33005178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 48977846 - 48977974
Alignment:
Q  54 ctttgtttggtaacgatttttt-acaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctattttt-cagatactattacaagtagcgtttgagcttat 151  Q
    ||||||||||||||| | |||| || | || ||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||| | |||||    
T  48977846 ctttgtttggtaacgttcttttcaccatgaacttatagtttattttattaacttataacttattttttcagacactttttcaagtagcgtttaaccttat 48977945  T
Q  152 agcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  48977946 agcttataacttatcatcttttattccat 48977974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 40119906 - 40119997
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttac 192  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||    
T  40119906 gagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcatttgagcttgtagcctatagcttatcatattttcttccacttttacccttac 40119997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41864182 - 41864083
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  41864182 tgtttgataacggttttttacaacggacctatagcttattttacgaacttataagctatttttaagaagctattccaaatagcgtttaagtttatagctt 41864083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 53273110 - 53273226
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | | |||||||||  ||||| || | || |||||| ||||||| | ||||||    
T  53273110 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccatgaacttataacttatttcacgagctt 53273209  T
Q  107 ataagctatttttcaga 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  53273210 ataagctatttttcaga 53273226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36486459 - 36486353
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| || |    
T  36486459 ttatagtttattttatgagcttataaactatttttcataagctattttaagtaacgtttgaacttatagcttataacttctcacttttaattccagtttt 36486360  T
Q  185 atcctta 191  Q
    |||||||    
T  36486359 atcctta 36486353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42124737 - 42124675
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42124737 gagcttataaactatctttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 42124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 44442124 - 44442225
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | |||||||| |||||| | | ||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44442124 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttattgcttatctcacgagcttaaaa-ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 44442222  T
Q  157 ata 159  Q
    |||    
T  44442223 ata 44442225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 158
Target Start/End: Original strand, 17715650 - 17715707
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17715650 gagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagattatagcttat 17715707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36008075 - 36008014
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36008075 agcttataagctgtttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttatagctt 36008014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35842642 - 35842519
Alignment:
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaat 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  35842642 ctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattccattttttacccttaat 35842543  T
Q  225 aattaattttattataatttaaaa 248  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||    
T  35842542 catttattatattataaattaaaa 35842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 37337681 - 37337784
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  37337681 tgtttggtaacggttttttataataagcatatagcttatttcaggtacttataagctatttttcataagctacttcaagtagcgtttgaacttatagttt 37337780  T
Q  157 atag 160  Q
    ||||    
T  37337781 atag 37337784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3932306 - 3932180
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaac 201  Q
    ||||||| ||| |||||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||  | |||| |    
T  3932306 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttatcatattttctttcatttttacccttattattttatc 3932207  T
Q  202 taaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    ||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  3932206 taaaatccaattttacccattataatt 3932180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 31953224 - 31953296
Alignment:
Q  84 cttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31953224 cttatagcttatttcacgactttataaactattttttagacattatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 31953296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32948257 - 32948177
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32948257 ttatatcttattttatgatattataaagtatttttcagacgctattctaaatagcgtttgagcttatagtttatagcttat 32948177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 156
Target Start/End: Original strand, 53224317 - 53224368
Alignment:
Q  105 ttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53224317 ttataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 53224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 45780889 - 45780851
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45780889 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgac 45780851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29656690 - 29656600
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattt 97  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  29656690 cttttagctcttaccttatagcttttaagctcgtttgacaagaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttatagcttattt 29656600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 173
Target Start/End: Original strand, 1768544 - 1768583
Alignment:
Q  134 agtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1768544 agtagggtttgagcttatagcttatagcttatcatctttt 1768583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38048981 - 38048878
Alignment:
Q  55 tttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagc 154  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||||  |||||| | ||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  38048981 tttgtttgttaacgttttttcatcacgaacttataatttatttcacgagtttataaactatttttcagacgctattccaaatagcatttgagtttatagc 38048882  T
Q  155 ttat 158  Q
    ||||    
T  38048881 ttat 38048878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 163
Target Start/End: Original strand, 53274813 - 53274844
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53274813 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 53274844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 17715579 - 17715658
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttata 89  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  17715579 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttata 17715658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 25199448 - 25199410
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25199448 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgac 25199410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 158
Target Start/End: Original strand, 39068883 - 39068969
Alignment:
Q  72 ttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||  |||||||||||   |||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  39068883 ttttacaatgagcttataacttatttcaggagtttataacttatttttcagacgatatttcaagtaacgtttgatcttataacttat 39068969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29656843 - 29656729
Alignment:
Q  9 tttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttat 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||| ||||  |||||  | | ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  29656843 tttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacagaaaaagttctgtttgttaacactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagctaat 29656744  T
Q  109 aagctatttttcaga 123  Q
    ||  |||||||||||    
T  29656743 aatttatttttcaga 29656729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 36008152 - 36008119
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36008152 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgac 36008119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49239276 - 49239219
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  49239276 agcttataaactatttttcagacgctattataagtaacgtttgaacttatagtttata 49239219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20530835 - 20530799
Alignment:
Q  127 tattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20530835 tattccaagtagcttttgagcttatagcttatagctt 20530799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 89
Target Start/End: Original strand, 26443367 - 26443399
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttata 89  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26443367 tgtttggtaacgcttttttacaacgagcttata 26443399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 2442420 - 2442580
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2442420 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2442519  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 167  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2442520 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 2442580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34233066 - 34232894
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  34233066 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 34232967  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  34232966 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttcttcca 34232894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 12297360 - 12297516
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12297360 cttttaccttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 12297459  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297460 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 12297516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14227686 - 14227531
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  14227686 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttga-taaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 14227588  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14227587 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 14227531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 32731754 - 32731910
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32731754 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 32731853  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32731854 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 32731910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31100166 - 31100017
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31100166 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 31100067  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31100066 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 31100017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30811299 - 30811144
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  30811299 ttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 30811200  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30811199 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 30811144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 558360 - 558512
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  558360 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataa 558459  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558460 gctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 558512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 10856133 - 10856277
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10856133 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 10856232  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10856233 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 10856277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 20804985 - 20805137
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20804985 cttttagtttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 20805084  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805085 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 20805137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Original strand, 21894319 - 21894450
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcc 178  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21894319 acgagattatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttcc 21894418  T
Q  179 atttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||| ||  |||| || ||||| |||||||||    
T  21894419 atttttacgcttatcattttaattaaaaccca 21894450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7317762 - 7317563
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  7317762 cttttagctcttaacttatagcttataagttcgtttcacagaaaaagctctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 7317663  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  7317662 ataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 7317563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12140983 - 12140809
Alignment:
Q  54 ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    |||||||| |||| | ||||| || | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12140983 ctttgtttagtaatgctttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatag 12140884  T
Q  154 cttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||| || |||||  | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  12140883 cttatagcttattatcttttgttccttttttacccttattattttaactaaaattcatatttaccctttataatt 12140809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15591252 - 15591082
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  15591252 tgtttgataacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataactt 15591153  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataat 227  Q
    ||||| | |||  ||| |||||| || || |||||  | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  15591152 atagcgtgtcacttttaattccaattttacccttattattttaattaaaatccacttttacccttaataat 15591082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34685161 - 34685015
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34685161 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacattttcacat-gagcttatagcttatttcacgagcttataag 34685063  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685062 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 34685015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6104801 - 6104671
Alignment:
Q  28 cttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatact 127  Q
    ||||||||||||||||||       ||| |||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  6104801 cttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatggtctttcaccacgagcttatagcttatttcgcgagcttataagctatttttcagatact 6104702  T
Q  128 attacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6104701 atttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6104671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5301737 - 5301532
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||       | | |||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5301737 tatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagttctgtttggtaatgttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 5301638  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctta 222  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||| || |||||  | |||| |||||| |||| |||| ||||     
T  5301637 aagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttatagcttctcaaaatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatccttt 5301538  T
Q  223 ataatt 228  Q
    ||||||    
T  5301537 ataatt 5301532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 28076423 - 28076576
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||       ||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28076423 agcttatagcttatagcttataaactcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 28076522  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28076523 ctatttttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 28076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12432756 - 12432616
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12432756 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 12432657  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12432656 aagccattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 12432616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31452105 - 31451962
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31452105 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 31452006  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagctta 150  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  31452005 ataagctgtttttcagaagctattccaagtagtgtttgagctta 31451962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33540861 - 33540635
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  33540861 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcag 33540762  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttaccctt 221  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||   || | |||||||||    
T  33540761 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaatttcattttttaccctt 33540662  T
Q  222 aataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    ||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  33540661 aattatttattatattataaattaaaa 33540635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 34439683 - 34439899
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||        || ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34439683 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 34439782  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||   ||| |||||||| || |||||  | |||| |||||| ||||    
T  34439783 ctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttacagcttctcaaaatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccat 34439882  T
Q  212 gtttacccttaataatt 228  Q
     |||| |||| ||||||    
T  34439883 ttttatcctttataatt 34439899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3108153 - 3107999
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttatttt-atgagcttataa 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| | |||||||||  ||||| || | ||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  3108153 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttataacttaatttcacgagcttataa 3108054  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3108053 gctatttttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttat 3107999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Original strand, 33453734 - 33453880
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33453734 ttagcttatagcttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33453833  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33453834 agctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 33453880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 163
Target Start/End: Original strand, 2970722 - 2970826
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2970722 tttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2970821  T
Q  159 agctt 163  Q
    |||||    
T  2970822 agctt 2970826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 5681589 - 5681671
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5681589 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 5681671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 5943061 - 5943143
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5943061 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 5943143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7292650 - 7292480
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  7292650 tgtttgataacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcataagctacttcaagtaacgtttgagcttatagctt 7292551  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataat 227  Q
    ||||| | |||  ||| |||||| || ||  ||||  | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||    
T  7292550 atagcgtctcacttttaattccagttttactcttattattttaattaaaatccacttttacccttaataat 7292480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6709797 - 6709681
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6709797 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaaattataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6709698  T
Q  157 atagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  6709697 atagcttctcatttttt 6709681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 23648205 - 23648338
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||       ||| |||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23648205 tatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 23648304  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |  ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  23648305 aagctatttcaagtagcttctgagcttatagctt 23648338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29823176 - 29823031
Alignment:
Q  18 tagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctattt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||  ||||| || | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  29823176 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacattttttcaccatgagctaatagcttattttgcgagcttataagttattt 29823077  T
Q  118 ttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29823076 ttcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29823031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 221
Target Start/End: Original strand, 20563456 - 20563603
Alignment:
Q  74 ttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| || | || ||||    
T  20563456 ttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcatctgagcttatagcttttagttttttatctttt 20563555  T
Q  174 attccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctt 221  Q
     |||||||| || |||||  | |||||||||||  ||| |||||||||    
T  20563556 gttccatttttacccttattattttaactaaaagtcatatttaccctt 20563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 31049376 - 31049487
Alignment:
Q  54 ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    |||||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  31049376 ctttgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctattccaaatagtgtttgagcttatag 31049475  T
Q  154 cttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||    
T  31049476 cttatagcttat 31049487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Original strand, 34903955 - 34904117
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||             |    
T  34903955 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagct-------------t 34904041  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  34904042 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccattt 34904117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 11015590 - 11015743
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||        || ||||||||||   ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  11015590 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttacaag 11015689  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015690 ctatttttgagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 11015743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1806466 - 1806350
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  1806466 cttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgactaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 1806367  T
Q  107 ataagctatttttcaga 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  1806366 ataagctatttttcaga 1806350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 173
Target Start/End: Original strand, 9896773 - 9896867
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9896773 acgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagttaatagcttatagcttatcatttttt 9896867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Original strand, 11443035 - 11443125
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11443035 gagcttataacctattttccagactctatttcaagtagcgtttgagcttatatcttttaacttatcatcttttcttccatttatatcctta 11443125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3636742 - 3636643
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  3636742 tgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcctttgaacttatagctt 3636643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29414980 - 29414919
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29414980 agcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 29414919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 32563346 - 32563210
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgatttttt-acaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagct 155  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||  |||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  32563346 tgtttggtaacgatctttccacaacgagcttataacttatttcagaagcttataatttatttttcagacgctatttcaaatagtgtttgagattataact 32563247  T
Q  156 tatagcttatcatgtt-ttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  32563246 tatagtttatcattttcttattccatttttaccctta 32563210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 149
Target Start/End: Original strand, 26561409 - 26561487
Alignment:
Q  71 tttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagctt 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  26561409 tttttacaacgagcttatagtttatttcaggagcttataacttatttttcaaacgctatttcaagtagcgtttgagctt 26561487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5893970 - 5893894
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5893970 agcttttagcttattttactagcttataacttattttccagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 5893894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 165
Target Start/End: Original strand, 19415382 - 19415434
Alignment:
Q  113 tatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19415382 tatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttacagcttat 19415434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Original strand, 1225525 - 1225573
Alignment:
Q  105 ttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatag 153  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1225525 ttataagctattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatag 1225573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 29586157 - 29586313
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29586157 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 29586256  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29586257 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29586313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 1918024 - 1918180
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  1918024 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 1918123  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1918124 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 1918180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42064453 - 42064297
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42064453 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 42064354  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064353 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 42064297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7781295 - 7781086
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||  |  |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7781295 agcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 7781196  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||||     
T  7781195 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttctttcatttttacccttatcattttaattaaaacccac 7781096  T
Q  212 gtttaccctt 221  Q
     |||||||||    
T  7781095 ttttaccctt 7781086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 17046728 - 17046877
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17046728 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 17046827  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17046828 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17046877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31150561 - 31150405
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||| ||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31150561 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttgggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 31150462  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150461 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31150405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 44909839 - 44909995
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44909839 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 44909938  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44909939 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 44909995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13121720 - 13121569
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  13121720 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 13121621  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13121620 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13121569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 39826599 - 39826748
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39826599 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 39826698  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39826699 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39826748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 2497921 - 2498077
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2497921 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2498020  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2498021 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2498077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8221367 - 8221187
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8221367 tagcttatagcggatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataa 8221268  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||| |||||||| || |||||    
T  8221267 gctatttttcaaaaactattccaaatagcgtttgaatttatagcttatagcttctcactttttcttccatttttaccctta 8221187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19899044 - 19898888
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19899044 cttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 19898945  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19898944 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 19898888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 26204273 - 26204425
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26204273 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 26204372  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204373 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 26204425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 34318415 - 34318563
Alignment:
Q  17 ttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatt 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||       ||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34318415 ttagcttatagcttataagcttgttcgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataagctatt 34318514  T
Q  117 tttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34318515 tttcagatgctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttat 34318563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36838831 - 36838675
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36838831 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttctccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36838732  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36838731 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36838675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36301240 - 36301085
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36301240 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36301142  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36301141 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36301085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 47134667 - 47134516
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47134667 cttttagcttttaccttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagctt 47134568  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47134567 ataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 47134516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 50351036 - 50351187
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50351036 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 50351135  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50351136 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagctt 50351187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30721760 - 30721603
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | |||||    
T  30721760 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagct 30721661  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30721660 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 30721603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17500021 - 17499869
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  17500021 cttttagcttttagtttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 17499922  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17499921 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttata 17499869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 33524527 - 33524683
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  33524527 cttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 33524626  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33524627 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 33524683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 38676488 - 38676644
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | || |||    
T  38676488 cttttagcttttaacttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaactt 38676587  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38676588 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 38676644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 322869 - 323020
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||       | | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  322869 agcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaa 322968  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322969 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 323020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 29374333 - 29374550
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  29374333 tagcttatagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagcttataa 29374432  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| || || |||||| | |||  |||||| ||     
T  29374433 gctatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttatagcttattgttttttcttccacttttacccttactattttttctaaaatcct 29374532  T
Q  211 tgtttacccttaataatt 228  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  29374533 tttttaccctttataatt 29374550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49220610 - 49220453
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||    
T  49220610 acttatagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttacagcttatttcacgagct 49220511  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49220510 tataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 49220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29704212 - 29704064
Alignment:
Q  15 ttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagcta 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  29704212 ttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagcta 29704113  T
Q  115 tttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29704112 tttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 29704064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32368475 - 32368319
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  32368475 cttttaacttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagctt 32368376  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32368375 atatgctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 32368319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 3270663 - 3270813
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||         | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3270663 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaa-tctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 3270761  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270762 ctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 3270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 34319388 - 34319587
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       | | |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||||| | ||||||    
T  34319388 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgaccttatagcttatttcacgagctt 34319487  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  34319488 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 34319587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38967594 - 38967451
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  38967594 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 38967496  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38967495 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 38967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 52703236 - 52703033
Alignment:
Q  18 tagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctattt 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||         | |||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  52703236 tagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaatgctctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagttattt 52703137  T
Q  118 ttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttac 217  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| ||||| || |||||  | |||||||||||  ||| |||||    
T  52703136 ttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttttagctttttatcttttatttcatttttacccttattattttaactaaaagtcatatttac 52703037  T
Q  218 cctt 221  Q
    ||||    
T  52703036 cctt 52703033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 168
Target Start/End: Original strand, 5697528 - 5697637
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5697528 tttggtaacagttttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttataccttat 5697627  T
Q  159 agcttatcat 168  Q
    | ||||||||    
T  5697628 aacttatcat 5697637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7711090 - 7710941
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        || |||||||||||  ||||| |  | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  7711090 cttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagctt 7710991  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7710990 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7710941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 163
Target Start/End: Original strand, 15313242 - 15313398
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  15313242 acttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaac-acttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagct 15313340  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15313341 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 15313398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 25601985 - 25602134
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| ||||||||| |  |||||||| | || |||||||||||||| | ||||||    
T  25601985 cttttagctcttagcttataggttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtatcacttttttaccatgaccttatagcttatttcacgagctt 25602084  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25602085 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 25602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Original strand, 3660944 - 3661104
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3660944 cttttagttcttagcttatagcttataagctcatttgacaacaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatcttatttcacgagctt 3661043  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 167  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661044 ataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 3661104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16085697 - 16085526
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||| | ||||| || |||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16085697 tgtttgataatgttttttcaccacgatcttatagtctattttacgagcttataagctatttttcagatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagctt 16085598  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    ||| ||||| || |||||||||| || || |||||  | |||| |||||     ||||||||||||||||||    
T  16085597 ataacttattattttttattccaattttacccttattattttatctaaattttttgtttacccttaataatt 16085526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 26843750 - 26843902
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| | |||| |||   ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  26843750 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttgataatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 26843849  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26843850 ataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttata 26843902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 191
Target Start/End: Original strand, 30774084 - 30774264
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || |  || ||||||||||||| | ||||||    
T  30774084 cttttagcttttaacttatagcttataagttcgtttga----taaagctctgtttggtaacactttttcaccataagtttatagcttatttcacgagctt 30774179  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctta 191  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||    
T  30774180 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttatcctta 30774264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 25134897 - 25134998
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  25134897 tgtttggtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattttaagtagtgtttgagcttatagctt 25134996  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  25134997 at 25134998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 40887949 - 40888030
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40887949 agcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 40888030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 3391122 - 3391339
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||        ||| ||||||||||   ||||| || | || ||||||| |||||| | |||||||||    
T  3391122 ttagcttatagtctatagcttataagtttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgaacttatagtttatttcacgagcttata 3391221  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccc 209  Q
    | ||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||  | ||||| ||||| ||    
T  3391222 aactatttttcagaagctattccaagtaacgtttaagcttatagcttatagcttctcatattttatcccatttttacccttattattttaattaaaatcc 3391321  T
Q  210 atgtttacccttaataat 227  Q
    |||||||||||| |||||    
T  3391322 atgtttaccctttataat 3391339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36043386 - 36043194
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36043386 tgtttggtaacagtttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagatgctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 36043287  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    ||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  ||| | ||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  36043286 atagcttctcacttttaattccaattttacccttattattctaactaaattccattttttacccgtaatcatttattatattataaattaaaa 36043194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1507879 - 1507723
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || |  || ||||||||||||| | ||||||    
T  1507879 ttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaagaagctctgtttggtaacactttttcaccattagtttatagcttatttcacgagctt 1507780  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507779 ataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 1507723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 15348823 - 15348979
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||         || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15348823 cttttagctctttgcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 15348922  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15348923 ataaattatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagctt 15348979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 22098967 - 22099073
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22098967 tgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22099066  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  22099067 atagctt 22099073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 37703719 - 37703825
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  37703719 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataactt 37703818  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  37703819 atagctt 37703825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41005051 - 41004945
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttat 184  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |    
T  41005051 ttatagcttatttcatgagcttataagttatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctcatcttttcttccattttt 41004952  T
Q  185 atcctta 191  Q
    | |||||    
T  41004951 accctta 41004945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 50171383 - 50171277
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  50171383 tgtttggtaacacctttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagctt 50171284  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  50171283 atagctt 50171277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37672436 - 37672244
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  37672436 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataactt 37672337  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    ||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  ||| | |||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  37672336 atagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattccattttttacctttaatcatttattatattataaattaaaa 37672244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 49240401 - 49240268
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||| |||| ||||       ||| |||||||||| | ||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49240401 tatagcttataagttcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcactatgaacttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcag 49240302  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  49240301 aagctatttcaaatagcgtttgagcttatagctt 49240268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18347502 - 18347403
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18347502 tgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacactattccaagtagtgtttgagcttatagctt 18347403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 46369809 - 46369959
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnng--ctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||          || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||   |    
T  46369809 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct---a 46369905  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46369906 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 46369959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49822229 - 49822082
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||     
T  49822229 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttattgttttttcttccac 49822130  T
Q  181 ttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    || || |||||| | |||  |||||| || | ||||||||| ||||||    
T  49822129 ttttacccttactattttttctaaaatccttttttaccctttataatt 49822082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13570857 - 13570771
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13570857 acgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagcttat 13570771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Original strand, 43727094 - 43727176
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43727094 gagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgaacttatagcttatagctt 43727176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 34086970 - 34087116
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||| ||||||||||   ||||| || | |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  34086970 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagctaatttcacgagcttataag 34087069  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34087070 ctatttttgagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttat 34087116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44719096 - 44718962
Alignment:
Q  18 tagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctattt 117  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |       ||| |||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44719096 tagcttatagcttataagcttgtttggcaaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataaactattt 44718997  T
Q  118 ttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44718996 ttcagacgctatttcaagtagcgtttaagcttata 44718962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28869097 - 28868981
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||  ||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28869097 tgtttggtaaaggttttttacaacgagtttatagtttatttcacgagcttataaattatttttaagaaattatttcaagtaacgtttgagcttatagctt 28868998  T
Q  157 atagcttatcatgtttt 173  Q
    |||| || |||| ||||    
T  28868997 atagtttctcatctttt 28868981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33562031 - 33561922
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  33562031 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 33561932  T
Q  107 ataagctatt 116  Q
    ||||||||||    
T  33561931 ataagctatt 33561922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42614221 - 42614117
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42614221 tgtttggtaacattttttcaccatgagcttctagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagctt 42614122  T
Q  157 atagc 161  Q
    |||||    
T  42614121 atagc 42614117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 44956328 - 44956428
Alignment:
Q  58 gtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctta 157  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44956328 gtttggtaatggttttttaccatgagcttatagcttatttaacgagattataagttatttttcagatgctattccaagtagagtttgagcttataactta 44956427  T
Q  158 t 158  Q
    |    
T  44956428 t 44956428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49185271 - 49185079
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49185271 tgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataaactatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctt 49185172  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    ||||||| |||  ||| ||| || || || |||||  | | ||||||||  ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  49185171 atagcttctcacttttaatttcaattttacccttattattctaactaaattccattttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 49185079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 156
Target Start/End: Original strand, 50540848 - 50540920
Alignment:
Q  84 cttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50540848 cttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattacaagtagcgtttgagcttatagctt 50540920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 46929043 - 46928964
Alignment:
Q  84 cttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46929043 cttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattctaattagcgtttgtgcttatagcttatagctt 46928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 33151975 - 33152077
Alignment:
Q  89 agcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcc 188  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||| || ||    
T  33151975 agcttatttcacgagcttataagctatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgagcttgtaacttatagcttctcatcttttcttccatttttaccc 33152074  T
Q  189 tta 191  Q
    |||    
T  33152075 tta 33152077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 39583145 - 39583251
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  39583145 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttaacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatacctt 39583244  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  39583245 atagctt 39583251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Original strand, 2479159 - 2479268
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||  | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  2479159 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttatcatgagtttatagcttatttcacgagctt 2479258  T
Q  107 ataagctatt 116  Q
    ||||||||||    
T  2479259 ataagctatt 2479268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 182
Target Start/End: Original strand, 912716 - 912827
Alignment:
Q  71 tttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgt 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||  ||| |||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  912716 tttttacaacgagcttataacttatttcaggagcttatatcctattttctagacactatttcaaataacatttgagcttataacttatagcttatcattt 912815  T
Q  171 tttattccattt 182  Q
    ||| || |||||    
T  912816 tttctttcattt 912827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46088132 - 46087964
Alignment:
Q  11 tagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataa 110  Q
    |||||| ||||  |||| |||||||||||||||||       ||| |||||| ||| | |||||  | ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  46088132 tagcttatagcagatagtttataagctcgtttgactagaaaagctctgtttgataatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagtttataa 46088033  T
Q  111 gctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46088032 gctatttttcagacgttattccaagtaatatttgagcttgtagcttatagcttatcattttttcttcca 46087964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 7024914 - 7024971
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7024914 atgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 7024971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36379219 - 36379130
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36379219 ttttttacgatgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 36379130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9770035 - 9769951
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9770035 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaaataacgtttgagcttataacttctagcttat 9769951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Original strand, 9894931 - 9895002
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  9894931 agcttataagctatttttcagacgctattcaaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttgtcatttttt 9895002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10628893 - 10628814
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10628893 acgagcttatagtttattttactagcttataacttatttttcagacattatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 10628814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30495257 - 30495182
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30495257 gagcttatagcttatttctagagtttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttcagcttatagctt 30495182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 51423043 - 51422968
Alignment:
Q  84 cttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51423043 cttatagcttatttcacgagtttataaactattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 51422968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 6814123 - 6814261
Alignment:
Q  104 cttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaacta 203  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||    
T  6814123 cttataagttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagcttttcacttttaattccaattttacccttattagtctaacta 6814222  T
Q  204 aaacccatgttt-acccttaataattaattttattataa 241  Q
    ||  |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  6814223 aattccatttttaacccttaatcatttattgtattataa 6814261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40935951 - 40935893
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctta 157  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40935951 atgagtttataaactatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctta 40935893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 42963901 - 42963978
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42963901 gagcttataatttattttacgagtttataagctatttttgagaagctatttcaagtagcgtttgagcttacagcttat 42963978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Original strand, 9169151 - 9169203
Alignment:
Q  104 cttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9169151 cttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9169203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 46056499 - 46056411
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  46056499 tttttcaccacgaacttatagtttatttcacgagcttataagatatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcttatagcttat 46056411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 123
Target Start/End: Original strand, 28429078 - 28429144
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcaga 123  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28429078 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 28429144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Original strand, 33632329 - 33632393
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33632329 atgagcttataagctatttttcagaagctattccaaacagcgtttgagcttattgctgatagctt 33632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 156
Target Start/End: Original strand, 40719554 - 40719622
Alignment:
Q  88 tagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40719554 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttatttcaagtagcgtttgagtttatagctt 40719622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50940184 - 50940120
Alignment:
Q  115 tttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||    
T  50940184 tttttgagaaactatttcaagtagcttttgagcttataacttatagctttttatgttttcttcca 50940120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 163
Target Start/End: Original strand, 2479270 - 2479301
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479270 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2479301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33561920 - 33561889
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561920 caagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 33561889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 241
Target Start/End: Original strand, 12891648 - 12891758
Alignment:
Q  132 caagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaa 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||||||| ||  ||||  | | ||||||||  ||| | |||||||||||||||| |    
T  12891648 caagtagcgtttgagtttatagcttatagcttctcacttttatttccatttttacgcttattagtctaactaaattccattttttacccttaataattta 12891747  T
Q  231 ttttattataa 241  Q
    || ||||||||    
T  12891748 ttatattataa 12891758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2029037 - 2028961
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2029037 agcttatagtttatttaacgagtttataaactatttttcagacgctatttcaagtaccgtttaagattataacttat 2028961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2459621 - 2459557
Alignment:
Q  126 ctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcctt 190  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||    
T  2459621 ctatttcaagtagctttttagcttatagctgatagcttttcacattttcttccatttataccctt 2459557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 119344 - 119215
Alignment:
Q  53 gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttata 152  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  119344 gctttgtttagtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatcctattccaagtagagtttgagcttata 119245  T
Q  153 gcttatagcttatcatgttttattccattt 182  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  119244 gcttataacttatcatcttttattccattt 119215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 163
Target Start/End: Original strand, 431271 - 431409
Alignment:
Q  25 tagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagat 124  Q
    ||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  431271 tagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 431370  T
Q  125 actattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
     ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  431371 gctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 431409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Original strand, 24793967 - 24794125
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  24793967 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 24794066  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794067 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 24794125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14647499 - 14647343
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  14647499 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 14647400  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14647399 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 14647343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 13228614 - 13228459
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  13228614 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 13228516  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13228515 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 13228459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 30299694 - 30299849
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  30299694 ttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 30299793  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30299794 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 30299849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11100899 - 11100690
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11100899 agcttatagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgtctttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataag 11100800  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||| |||| |||||| | || |||||  | ||||||||||||||||    
T  11100799 ctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagc-------ttatcattttttcttccatctttacccttattattttaactaaaacccat 11100707  T
Q  212 gtttacccttaataatt 228  Q
     ||||||||| ||||||    
T  11100706 atttaccctttataatt 11100690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2236658 - 2236502
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  2236658 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 2236559  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2236558 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 2236502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 8024126 - 8023970
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8024126 cttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 8024027  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8024026 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 8023970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 12774571 - 12774723
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12774571 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 12774670  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774671 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 12774723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 36685811 - 36685967
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36685811 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 36685910  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685911 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 36685967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39744684 - 39744528
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||| |||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39744684 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttgtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 39744585  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39744584 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 39744528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 16474771 - 16474981
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||       ||| |||||||||| | | | |||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||    
T  16474771 agcttatagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaatggtctcttaccacgagcttatagtttatttcacgagattataag 16474870  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccat 211  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  | |||| |||||| ||||    
T  16474871 ctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattttatctaaaaaccat 16474970  T
Q  212 gtttaccctta 222  Q
     | ||||||||    
T  16474971 ttataccctta 16474981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26699245 - 26699092
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26699245 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26699146  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699145 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 26699092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26968978 - 26968825
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26968978 ttagcttatagcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 26968879  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26968878 agctatttttcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 26968825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5382082 - 5381930
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5382082 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttataacttatttcatgagcttata 5381984  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5381983 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 5381930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 5591583 - 5591739
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | || |||    
T  5591583 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaactt 5591682  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5591683 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 5591739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 12713307 - 12713459
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12713307 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 12713406  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12713407 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttata 12713459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30412754 - 30412602
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30412754 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagctt 30412655  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30412654 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttata 30412602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32381816 - 32381660
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32381816 cttttagcttttagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 32381717  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32381716 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 32381660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 32382844 - 32383000
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  32382844 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 32382943  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32382944 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 32383000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 39275418 - 39275574
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39275418 cttttagcttttaacttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 39275517  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39275518 ataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 39275574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 1174779 - 1174978
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  1174779 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 1174878  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  1174879 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 1174978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5998031 - 5997880
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  5998031 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataag 5997932  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5997931 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 5997880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 6604051 - 6603896
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||       ||| |||||||||||  ||||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||    
T  6604051 ttttagcttttagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagctta 6603952  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603951 taagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 6603896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 156
Target Start/End: Original strand, 2671408 - 2671558
Alignment:
Q  6 acttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| |  ||||    
T  2671408 acttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagct 2671507  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2671508 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2671558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 158
Target Start/End: Original strand, 13936237 - 13936338
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13936237 tgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagctt 13936336  T
Q  157 at 158  Q
    ||    
T  13936337 at 13936338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19956449 - 19956292
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19956449 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 19956350  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19956349 ataagctatttt-cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 19956292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4221615 - 4221466
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       | | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  4221615 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 4221516  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4221515 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4221466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1711345 - 1711189
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| |  |||||    
T  1711345 cttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacaagctt 1711246  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711245 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 1711189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9160829 - 9160678
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9160829 agcttttagcttttaacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 9160730  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9160729 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 9160678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 10697264 - 10697463
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  10697264 cttttagctcttagcttatagcttataagctcatttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 10697363  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  10697364 ataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 10697463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Original strand, 27130333 - 27130484
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27130333 agcttttagcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 27130432  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130433 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 27130484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 35235864 - 35235713
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35235864 agcttttagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 35235765  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35235764 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35235713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30774334 - 30774168
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||    
T  30774334 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagcttatagcttatttcacgagctt 30774235  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  30774234 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttttagcttctcatttttt 30774168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Original strand, 3670273 - 3670493
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||        || |||||||||||  ||||| || | | ||||||||||||||| | ||||||    
T  3670273 cttttagctcttagcttatagcttatgagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgcgcttatagcttatttcacgagctt 3670372  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaa 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  3670373 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaacaaaaa 3670472  T
Q  207 cccatgtttacccttaataat 227  Q
      ||| | ||||||| |||||    
T  3670473 ttcatatctaccctttataat 3670493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 228
Target Start/End: Original strand, 19347751 - 19347922
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19347751 tgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 19347850  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    |||||||||  | |||| ||||| || || |||||| | |||  |||||| || | ||||||||| ||||||    
T  19347851 atagcttattgttttttcttccacttttacccttactattttttctaaaatccttttttaccctttataatt 19347922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39246973 - 39246830
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| | |||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39246973 agcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaac-acttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 39246875  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39246874 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 39246830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 43402455 - 43402595
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  43402455 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaa 43402554  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43402555 aagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 43402595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11063047 - 11062868
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttat 108  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11063047 ttagcttatagcttatagcttataagctcgtttggcaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcatgagcttat 11062948  T
Q  109 aagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatcc 188  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||| |||||    
T  11062947 aagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttctcactttttcttccatttttatcc 11062868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12363755 - 12363598
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||         || |||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| | |||||    
T  12363755 cttttaacttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagct 12363656  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12363655 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 12363598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3037567 - 3037411
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||        | | |||||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  3037567 cttttagcttttaacttatagcttataagcttgtttgataaaaaaaggtatgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagctt 3037468  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3037467 ataagctatttttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 3037411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Original strand, 15530446 - 15530586
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  15530446 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 15530545  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530546 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 15530586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 19525744 - 19525900
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||       ||| |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19525744 cttttagcttttaccttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 19525843  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19525844 ataagctatttttcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttatagctt 19525900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36028117 - 36027977
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    ||||||||||||||| |||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36028117 tatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcag 36028018  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36028017 aagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatagctt 36027977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 158
Target Start/End: Original strand, 648542 - 648677
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  648542 tatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 648641  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  648642 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 648677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 31169128 - 31168973
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||        || |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  31169128 ttttagcttttagtttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 31169029  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31169028 taagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 31168973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35236810 - 35236643
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |         ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  35236810 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcataaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagct 35236711  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  35236710 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcatttttt 35236643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29392248 - 29392100
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  29392248 cttttagcttttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 29392150  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||| | |  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  29392149 ataagctattttttaaaagctattccaaatagcgtttgagcttatagctt 29392100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 2178805 - 2178911
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2178805 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 2178904  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  2178905 atagctt 2178911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 163
Target Start/End: Original strand, 15443452 - 15443607
Alignment:
Q  8 ttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctta 107  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||       | |||| ||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  15443452 ttttaacttttagtttatagcttataagttcgtttgacaagtttagttttggttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctta 15443551  T
Q  108 taagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15443552 taaactatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagctt 15443607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9587329 - 9587179
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctt-tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||         || |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  9587329 cttttagcttatagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 9587230  T
Q  106 tataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9587229 tataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 9587179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 4379303 - 4379406
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4379303 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataactt 4379402  T
Q  157 atag 160  Q
    ||||    
T  4379403 atag 4379406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 5521309 - 5521465
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcag 122  Q
    |||||||||||||||||||||||         | |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5521309 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 5521408  T
Q  123 atactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattcca 179  Q
    |  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||| |||||    
T  5521409 aagctattctaagtagcgtttgagtttatagcttatagctcattatcttttcttcca 5521465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11664033 - 11663881
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || |  || ||||||||||||| | ||||||    
T  11664033 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagtttatagcttatttcacgagctt 11663934  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    ||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11663933 ataagttatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttata 11663881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 7651685 - 7651791
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7651685 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagctt 7651784  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  7651785 atagctt 7651791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22977297 - 22977191
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22977297 tgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 22977198  T
Q  157 atagctt 163  Q
    |||||||    
T  22977197 atagctt 22977191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 163
Target Start/End: Original strand, 35640013 - 35640091
Alignment:
Q  85 ttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35640013 ttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 35640091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 3669536 - 3669685
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||        ||| |||||||||||  |||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||||    
T  3669536 cttttagctcttagcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccataaacttgtagcttatttcatgagctt 3669635  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3669636 ataagctatttttcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagctt 3669685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6893517 - 6893372
Alignment:
Q  10 ttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttata 109  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6893517 ttagctcttagcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaa-gctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 6893419  T
Q  110 agctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    | ||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6893418 aactagttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 6893372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Original strand, 4875688 - 4875795
Alignment:
Q  56 ttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagct 155  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4875688 ttgtttggtaacatttttttactacgagtttatagtttattttaggagtttataagctattttttaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagct 4875787  T
Q  156 tatagctt 163  Q
    ||||||||    
T  4875788 tatagctt 4875795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9627246 - 9627143
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  9627246 tgtttgataacacttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataactt 9627147  T
Q  157 atag 160  Q
    ||||    
T  9627146 atag 9627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13157028 - 13156879
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||       ||| |||||||||||  ||||| || |  | |||||||||||||| | ||| ||    
T  13157028 cttttagcttttaccttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccattaacttatagcttatttcacgagttt 13156929  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13156928 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgagcttatagctt 13156879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4657649 - 4657582
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcat 168  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4657649 gagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagagtttgagcttatagcttataacttatcat 4657582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Original strand, 23920502 - 23920610
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||| || ||| || | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| || ||    
T  23920502 tgtttggtaactatctttcaccaggagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgaacttagagttt 23920601  T
Q  157 atagcttat 165  Q
    |||||||||    
T  23920602 atagcttat 23920610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 158
Target Start/End: Original strand, 13921783 - 13921871
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  13921783 ttttttaccacgaacttataacttatttcacgagcttaaaagctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgaacttataacttat 13921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 167
Target Start/End: Original strand, 6349429 - 6349495
Alignment:
Q  101 gagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6349429 gagcttataaactatttttcagacgctattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttatca 6349495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42323672 - 42323591
Alignment:
Q  84 cttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42323672 cttataacatattttacgagtttataagctatttttcagacgctattctaagtagtgtttgagcttatagcttatagtttat 42323591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32321733 - 32321652
Alignment:
Q  78 aacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| ||  |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  32321733 aacgagcttatagcttatttcacgaacttacaacttatttttcagactctatttcaaataacgtttgagcttatagcttata 32321652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27005924 - 27005844
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttata 159  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||  |||||| || |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  27005924 acgaacttatagcttatttcaagagcttataacttattttccaaacgctatttcaagtaacgtttgagcttatagcttata 27005844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 158
Target Start/End: Original strand, 2497610 - 2497709
Alignment:
Q  59 tttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    |||||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| |  |||||  || ||||||||||||||||| |||||    
T  2497610 tttggtaatgctttttcaccatgagattataacttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagctattctaaatagcgtttgagcttataacttat 2497709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 165
Target Start/End: Original strand, 33694734 - 33694829
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||| |||||||||||   ||||  ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  33694734 ttttttaccacgagcttataatttattttacaagtttataagttatttttcagacgttattcgaagtagcgtttgagtctgtagcttataacttat 33694829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25872278 - 25872221
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||| |||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25872278 atgaacttataatttatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagctt 25872221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 22590 - 22746
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22590 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 22689  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22690 ataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 22746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 126911 - 126755
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  126911 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 126812  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  126811 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgcttgagcttatagcttatagctt 126755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 22
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||       ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  188 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 89  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgtttt 173  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  88 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcatttttt 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 12868 - 12712
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12868 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttgacgagctt 12769  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12768 ataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttatagctt 12712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 72901 - 72743
Alignment:
Q  23 tatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattt-tttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttca 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||       | | |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |    
T  72901 tatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatgatctctttaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttta 72802  T
Q  122 gatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccat 180  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  72801 gaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcattttttcttccat 72743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Original strand, 63889 - 64081
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  63889 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagctt 63988  T
Q  157 atagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca-tgtttacccttaataattaattttattataatttaaaa 248  Q
    ||||||| |||  ||| |||||| || || |||||  | | ||||||||  ||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  63989 atagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaattccattttttacccttaatcatttattatattataaattaaaa 64081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 7052 - 7208
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagctt 106  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||       | | |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  7052 cttttagtttttagcttatagcttttaagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagctt 7151  T
Q  107 ataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7152 ataagctattttttagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagctt 7208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 192013 - 192166
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||| ||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  192013 agcttatagcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataag 192112  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttat 165  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  192113 ctatttttgagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttatagcttat 192166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 93463 - 93381
Alignment:
Q  81 gagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93463 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 93381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 84323 - 84402
Alignment:
Q  79 acgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  84323 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 84402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 30323 - 30179
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||        || |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  30323 agcttttagtttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataag 30224  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30223 ctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28236 - 28071
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttat---------tt 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||  ||||| || | |||||||||||||||         ||    
T  28236 cttttagctcttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttataagctattttt 28137  T
Q  98 tatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
     |  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28136 cacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 28071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 53122 - 53023
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  ||||| || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53122 tgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcctatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 53023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 167
Target Start/End: Original strand, 10821 - 10918
Alignment:
Q  70 ttttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatca 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  10821 ttttttacaacaagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgagcttacggtttatagcttatca 10918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27286 - 27169
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnn-gctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagct 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||||| | |||||    
T  27286 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgacaaaataaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagct 27187  T
Q  106 tataagctatttttcaga 123  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27186 tataagctatttttcaga 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41824 - 41760
Alignment:
Q  99 atgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824 atgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagctt 41760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41858
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41896 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgac 41858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Original strand, 5454 - 5552
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5454 tgtttggtaacacttttttaccatgagcttata-cttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Original strand, 9230 - 9376
Alignment:
Q  12 agcttttagcctatagcttataagctcgtttgacnnnnnnngctttgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataag 111  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||        || |||||| ||| | | | |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  9230 agcttatagcttataccttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgttaatggtctcttaccacgagctcatagcttatttcacgagcttataaa 9329  T
Q  112 ctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 158  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9330 ctatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 9376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 82 - 156
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4636
Alignment:
Q  82 agcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4562 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagctt 4636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 1175
Alignment:
Q  102 agcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaac 201  Q
    ||||||| ||| |||||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||  | |||| |    
T  1301 agcttatgagccatttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttatcatattttctttcatttttacccttattattttatc 1202  T
Q  202 taaaacccatgtttacccttaataatt 228  Q
    ||||| |||  ||||||| | ||||||    
T  1201 taaaatccaattttacccattataatt 1175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 45
Target Start/End: Original strand, 36350 - 36388
Alignment:
Q  7 cttttagcttttagcctatagcttataagctcgtttgac 45  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36350 cttttagcttttagcttatagcttataagctcgtttgac 36388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9063 - 8956
Alignment:
Q  57 tgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagctt 156  Q
    |||||||||| |  |||| || |||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||| | |    
T  9063 tgtttggtaatgggttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagtttataagctatttttcagacact-tttcaagtagcatttaagcttatatcgt 8965  T
Q  157 atagcttat 165  Q
    ||| |||||    
T  8964 ataacttat 8956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 210
Target Start/End: Original strand, 11855 - 11913
Alignment:
Q  152 agcttatagcttatcatgttttattccatttatatccttaccactttaactaaaaccca 210  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||    
T  11855 agcttataacttatcattttttattccatttttatccttatcatttttattaaaaccca 11913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University