View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7349_low_10 (Length: 336)

Name: NF7349_low_10
Description: NF7349
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7349_low_10
NF7349_low_10
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (21-310)||(4344454-4344743)
chr4 (21-310)||(4360885-4361174)
chr4 (18-310)||(4123923-4124215)
chr4 (18-310)||(4335150-4335442)
chr4 (18-310)||(4320603-4320895)
chr4 (18-310)||(4133409-4133699)
chr4 (18-310)||(6728211-6728503)
chr4 (102-308)||(7885377-7885583)
chr4 (18-310)||(6621491-6621783)
chr4 (18-310)||(6498510-6498802)
chr4 (18-310)||(6650872-6651164)
chr4 (18-310)||(6796592-6796884)
chr4 (18-262)||(6815275-6815519)
chr4 (18-259)||(6675508-6675749)
chr4 (24-310)||(6752771-6753057)
chr4 (18-310)||(6545432-6545724)
chr4 (24-260)||(6837085-6837321)
chr4 (25-135)||(6532391-6532501)
chr4 (24-73)||(6758535-6758584)
chr4 (118-259)||(6758629-6758770)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (18-310)||(5690143-5690435)
chr6 (24-310)||(5447398-5447684)
chr6 (24-310)||(5181911-5182197)
chr6 (17-310)||(5128401-5128694)
chr6 (18-307)||(5354601-5354890)
chr6 (17-278)||(5425714-5425975)
chr6 (27-310)||(5073892-5074175)
chr6 (17-310)||(5096512-5096805)
chr6 (17-310)||(5102598-5102891)
chr6 (18-307)||(5176544-5176833)
chr6 (18-309)||(5344666-5344957)
chr6 (18-307)||(5278371-5278660)
chr6 (18-310)||(5383131-5383423)
chr6 (24-288)||(5433846-5434110)
chr6 (20-310)||(5284373-5284663)
chr6 (17-278)||(5066710-5066971)
chr6 (20-304)||(5257324-5257608)
chr6 (17-310)||(5157612-5157905)
chr6 (24-278)||(5350205-5350459)
chr6 (20-287)||(5446964-5447231)
chr6 (17-288)||(5370375-5370646)
chr6 (193-308)||(5281280-5281395)
chr6 (17-251)||(5243910-5244144)
chr6 (193-288)||(5179521-5179616)
chr6 (158-310)||(5396895-5397047)
chr6 (79-144)||(5147046-5147111)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (18-310)||(8884-9176)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (27-310)||(36213813-36214096)
chr7 (106-254)||(34724626-34724774)
chr7 (25-308)||(18935198-18935481)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (24-288)||(8877420-8877684)
chr5 (99-235)||(15802797-15802933)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (126-310)||(22584198-22584382)
chr2 (99-238)||(14767123-14767262)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (23-304)||(47986842-47987123)
chr3 (23-304)||(47996129-47996410)
chr3 (23-304)||(48005416-48005697)
chr3 (23-304)||(48014701-48014982)
chr3 (107-229)||(6905991-6906113)
[»] scaffold0813 (1 HSPs)
scaffold0813 (18-310)||(4810-5102)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (18-262)||(8317-8561)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (18-310)||(6464-6756)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (24-260)||(9501-9737)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (181-281)||(3286648-3286748)
chr8 (180-280)||(3262760-3262860)
chr8 (99-238)||(7164828-7164968)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 4344454 - 4344743
Alignment:
Q  21 cctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4344454 cctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaacaaaattc 4344553  T
Q  121 ttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaa 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4344554 ttttgataaatttgaaaaattgtattagcctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaat 4344653  T
Q  221 gattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4344654 gattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaataacactgctataacaaaagtacccttttc 4344743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 4360885 - 4361174
Alignment:
Q  21 cctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4360885 cctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtacttaaagattgtccaaggctgtctgagatttcccaaagtattggacatctcaagaaaattc 4360984  T
Q  121 ttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4360985 ttttgataaatttgaaagattgcattagcctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttcaat 4361084  T
Q  221 gattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4361085 gattgacacgttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaataacactggtataacaaaagtacccttttc 4361174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4124215 - 4123923
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||     
T  4124215 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaag 4124116  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4124115 ttcttttgataaatttgaaagattgtactagcctttctaaccttccaagaaacatttattcgttgaaatctctgaaaactctcattctatcgggatgttt 4124016  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  4124015 aatgattgacaagttggaagaggagttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaataatactgctataacaaaagtgcccttttc 4123923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 4335150 - 4335442
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||     
T  4335150 acccctgatttttcatacttgcctaatcttgaaaacctagtactcaaagattgtccgaggctgtctgaggtatcccatacaattggacatcttaagaaag 4335249  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4335250 ttcttttgataaatttgaaagattgcattagcctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaagtctctgaaaactctcattctatcaggatgttt 4335349  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4335350 aaagattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctcatggcagataacactggtataacaaaagtgcccttttc 4335442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4320895 - 4320603
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  4320895 acccctgacttttcatacttgcctaatcttgaaaagctagtgctcgaagattgcccaaggctgtctcaggtttcccatagcattggacatctcaaaaaag 4320796  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4320795 ttgttttgataaatttgaaagattgtattagcctttgtagccttccaagaaacatctatacgttgaaaactctgaatactctcattctatcgggatgttt 4320696  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4320695 aatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccaccctgattgcaaataatactggtataacaaaagttcccttttc 4320603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4133699 - 4133409
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| || |||||| || ||||||| || ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | |||     
T  4133699 accccagatttttcacacatgcctaatctagaaaaactaatactcaaagattgtccaaggctgtctgaggtttcccataccattggtcatctccataaag 4133600  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||  | |||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4133599 ttctcattataaatttgaaagactgtactagccttcgtaaccttccaagaaccatctattcgttgaaatctctgaaaactcttattctttctggctgttt 4133500  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||  |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4133499 aattattgacaaattgga--aggacttggaacaaatggagtctttaaccactctgattgtggataacactgcaataacaaaagtgcccttttc 4133409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 6728211 - 6728503
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||  ||| |||||||| ||||||  |||  | ||||    
T  6728211 accccagacttttcctacttacctaatcttgaaaagctcgtgctcaaaaactgtccaagtttgtctacggtctcccaaagcattggatctctacaaaaaa 6728310  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||     ||||| | || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||     
T  6728311 ttcttctgataaatttgagagactgcgcaggtcttcggaaacttccaagaaacatctacaagttaaaatctctagaaactttgattctttcaggatgttc 6728410  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     | ||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  6728411 catgattgacaaattggaggaggacgtggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccattttc 6728503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7885583 - 7885377
Alignment:
Q  102 ggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctca 201  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||   | ||| |  | |||||||| | ||| |||| |||  | || |||||||| ||||    
T  7885583 ggacatctcaaaaagattcttttaataaatttgaaagattgtacaggccttcgagaacttccaaggagcatatataagttagactcgctgaaaacactca 7885484  T
Q  202 ttctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagt 301  Q
    |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||  || ||||  ||||||||| ||| |||| |||    
T  7885483 ttctgtctggatgtacaaaaattgacaagttagaagaggatatagaacaaatgaaatctttaaccaccttggttgcggatgacactgctatcacaagagt 7885384  T
Q  302 gcccttt 308  Q
    |||||||    
T  7885383 gcccttt 7885377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6621783 - 6621491
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||   || ||||| || ||||||  |||| | |||     
T  6621783 accccagatttttcatacatgcctaatctcgaaaagctagtgctcaaagactgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctccataaac 6621684  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||  | |||||||||| ||| || ||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||     
T  6621683 ttctccttataaatttgacagactgcatacgtcttcgtaaacttccaagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttaattctttcaggatgttc 6621584  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     | ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6621583 catgattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttc 6621491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6498802 - 6498510
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||  ||| ||||| || ||||||  ||||   |||     
T  6498802 accccagactttacgtacttgcctaatattgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctctgtaaac 6498703  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||  |||| |||||||  || || |   |||||   |||||||| |||| ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  6498702 ttctaatgattaatttgacggactgcactggtcttcaaaaccttccgagaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6498603  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     ||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| || || ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6498602 caagattgacaaattggaggaggacgtggaacagatggaatcattgacaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttc 6498510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 6650872 - 6651164
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |  ||| ||| ||||  || ||||||  |||  | |||     
T  6650872 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 6650971  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  6650972 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6651071  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  6651072 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttc 6651164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 6796592 - 6796884
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| || || ||| | ||||| ||  |||||  ||| ||||| || ||||||  |||  | ||||    
T  6796592 accccagactttacatacttaccaaatcttgaaaagctagtactaaaaaattgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctacataaaa 6796691  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || ||  ||||| | || |||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| | ||||| |||||||||      
T  6796692 ttcttctcataaatttgacagactgcataggtcttcggaaacttccaagaagcatctatacattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgtac 6796791  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     | |||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||| |||||||| || | |||  ||| ||||||||||| |||||    
T  6796792 catgattgaaaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgattactttgattgcagataagacttctatcacaaaagtgccattttc 6796884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 6815275 - 6815519
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| ||  |||||   || ||||| |||||||||  |||  | ||||    
T  6815275 accccagactttacatacttgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaa 6815374  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |   ||||| | || |||||||||| || |||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  6815375 ttcttctcataaatttgacagactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6815474  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatcttt 262  Q
     | |||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  6815475 catgattgaaaaattggaggaggacttggaacagatggaatcttt 6815519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 259
Target Start/End: Original strand, 6675508 - 6675749
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||| ||||| || ||||||  |||| | ||      
T  6675508 accccagacttttcatacttgcccaatattgaaaagctggtgctcaaagactgtccaagtttgtctacggtctcccatagcattggatctctccataagc 6675607  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| ||||||||||||  || || |   |||||   || ||||| |||| ||| |  |  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  6675608 ttcttatgataaatttgacggactgcactggtcttcaaaaacttccgagaagcatttgcaaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6675707  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatc 259  Q
     ||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||    
T  6675708 caagattgacaaattggaggaggacgtggaacagatggaatc 6675749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 6752771 - 6753057
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||   || ||||| || ||||||  |||  | ||  |||||     
T  6752771 gacttttcatatatgcctaatcttgaaaagcttgtactcaaagactgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctacataatcttcttc 6752870  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    ||||| |||||| ||| || |  ||||||   || ||||| |||  ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | |||    
T  6752871 tgatagatttgacagactgcacgagtcttcagaaacttcctagatgcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttccatgat 6752970  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6752971 tgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgattaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgcccttttc 6753057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6545724 - 6545432
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||| ||  |||||   || ||||| || ||||||  |||  | |||     
T  6545724 accccagacttttcatatatgcctaatcttgaaaagatagtactcaaaggctgtccaagtttgtctacagtctcccatagcattggatctctacataaac 6545625  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |   ||||| | || ||||| | || ||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||||     
T  6545624 ttcttctaataaatttgacagactgcacaggtcttcgaaaacttccgaaaagcatctataaattaaaatctctagaaactttgattctttcgggatgttc 6545525  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     |||||| |||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| |||||||||||||||||||||    
T  6545524 caagattaacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcgttgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgcccttttc 6545432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 6837085 - 6837321
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||| || ||||||  |||| | ||| |||||     
T  6837085 gacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtttgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttc 6837184  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    |||||||||| |   | || |   ||||| | || ||||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | |||    
T  6837185 tgataaatttaacgaactgcacaggtcttcggaaacttccgagaagcatctatacattaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgat 6837284  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatct 260  Q
    |||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||    
T  6837285 tgacaaattggaggaggatttggtacagatggaatct 6837321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6532501 - 6532391
Alignment:
Q  25 acttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctttt 124  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||| || ||||||  |||| | ||| ||||| |    
T  6532501 acttttcatatatgcctaatcttgaaaagttagtactcaaagactgtccaagtttgtctgcggtctcccatagcattggatctctccaaaaacttcttct 6532402  T
Q  125 gataaatttga 135  Q
    |||||||||||    
T  6532401 gataaatttga 6532391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Original strand, 6758535 - 6758584
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtcc 73  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6758535 gacttttcctactttcctaatcttgaaaagctggtgctcaaaaactgtcc 6758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Original strand, 6758629 - 6758770
Alignment:
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || ||  ||||| | || ||||| |||| |||||| || || ||||||||  ||||| | ||||| || |||||  |    
T  6758629 ttcttctgataaatttgacagactgcataggtcttaggaaacttccgagaagcatctaaacattaaaatctctagaaactttgattctctcaggatgcat 6758728  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatc 259  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  6758729 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatc 6758770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5690435 - 5690143
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||||    
T  5690435 accccagacttttcaatcatgcctaatcttgaaaagctaatactcaaagattgtccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgacaaaa 5690336  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||     
T  5690335 ttcttctgataaatttggaagattgtattagcctttctaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttccgggtgttc 5690236  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  5690235 aatgattaacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgacactggaataacaagtgtgcccttttc 5690143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Original strand, 5447398 - 5447684
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||     
T  5447398 gacttttcatgcttgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggacatctcaataaaattcttc 5447497  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5447498 tgataaatttggaagattgtattggcctaggtaacctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtttaaagat 5447597  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||   ||||||| ||||||||||||    
T  5447598 tgacaagctggaagaggacttggaacagatggaatctttaaccactctgcttgcaaataatacttcaataacaacagtgcccttttc 5447684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5182197 - 5181911
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || | || |||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  5182197 gacttttcaaacttgcctaaccttgaacagttagtactcacagattgtccgaagttgtctgaagtttcccaaagtattggagatctcaataaaatacttt 5182098  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||   | ||||||||||| ||||||||  ||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  5182097 tgataaatttggaagattgcattagccttcaaagccttccaagaagcatctataatttgaaatcattaaacactctcattctttctgggtgtttaatgat 5181998  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  5181997 tgacaagttggaagaggatttggaacaaatgaaatctttaaccacattgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccgttttc 5181911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5128694 - 5128401
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | | | |||||||||||||    || || ||||||||||| |||    
T  5128694 caccccagacttttcatatttacctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgttcaatgttgtctgaggtttctactagcatcggacatctcaataaa 5128595  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || || || |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  5128594 attcttctgataaatttggaagattgcattagcctatgtagcctcccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgta 5128495  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||  |||| || ||| ||||||||    
T  5128494 taatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatcattaacaactctgcttgcaaataacactgcaataaaaagagtacccttttc 5128401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5354890 - 5354601
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | | | ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  5354890 acccctgacttttcttacatgcctaatcttgaaaagcttgtactcaaagattgtccaatgttatctgaagtttctccaagcattggacatctcaataaaa 5354791  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| |||||||||| ||||| || || |  |||| || ||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||      
T  5354790 ttcttctgataaatttcaaagactgcattaacctttctagcctcccaagaagcatctacaagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggttgtaa 5354691  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgccctt 307  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  5354690 aaagttagacaagttggaagaggacttggaacaattggaatctttaaccaccctgcttgcaaatgacactgcaataacaagagtaccctt 5354601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 5425714 - 5425975
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||| |  || |||||| ||||||   ||    
T  5425714 cacccctgactttacattcatgcctaatcttgaaaagctggtgctcaaagattgtccaatgttgtctgagatttctcctagcattggaaatctcagagaa 5425813  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||| |  | |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  5425814 attcttctaataaatttagaagattgtgttcgccttcaaagccttccaagaaacatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtg 5425913  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 278  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425914 taatgattgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 5425975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5074175 - 5073892
Alignment:
Q  27 ttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttttga 126  Q
    |||||| |||||||||| |||||| | || || |||| ||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  5074175 ttttcaaacttgcctaatcttgaacaactagtactcacagattgtccaaggttgtcagaggtttctcatagtattgaacatctcaataaaattcttctga 5074076  T
Q  127 taaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattga 226  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||   | |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || |||| || ||||||    
T  5074075 taaatttggaagattgtattggtcttcagagccttccaagaagtatctataagttgaaatctctaaaaactctcattctttccgggtgttcaatgattga 5073976  T
Q  227 caagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  5073975 caagttggaagaggacttagaacagatgacatctttaaccactctgatagcaaataacaccgcaataacaagagtgcccttttc 5073892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Original strand, 5096512 - 5096805
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| | | ||||||||||||| |  || |||||| ||||||   ||    
T  5096512 caccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaagctggtacttaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaa 5096611  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  5096612 attcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgtagccttccaggaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgta 5096711  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  5096712 taatgattgacgagttggaagaggacatagaacaaatggaatcattaaccattctgcttgcaaataacactggaataaaaagagtacccttttc 5096805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5102891 - 5102598
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||  |  |  |||||| ||||||   ||    
T  5102891 cacccctgacttttcatacttgcctaatcttgagaagctggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttgtcctaccattggagatctcactgaa 5102792  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    || ||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  5102791 atacttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgtagccttccaagaagcatctataagttgaaatctttgaaaatactcattctttctgggtgtt 5102692  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5102691 taatgattgacaagttggaagacgacttggaacaaatggaatcattaaccactcttctagcaaacaacactgcaataacaacagtgcccttttc 5102598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 5176544 - 5176833
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  | |||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||||    
T  5176544 accccagacttttcaaacatgcctaatcttgaaaagcttatactcatagattgcccaaggttgcgtgaggtttcccatagcattggacatctcgataaaa 5176643  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||   |  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  5176644 ttcttctgataaacttggaagattgtattagccttcagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttc 5176743  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgccctt 307  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  5176744 gatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgccctt 5176833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Original strand, 5344666 - 5344957
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | || |||   || ||||| ||  ||| |||| |||| || || |||||| ||||||||||||    
T  5344666 accccggacttttcttacttacctaatcttgaaaagttagtactcgtggattgtccaagtttgtgtgagatttctcatagcattggagatctcaagaaaa 5344765  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | || |||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||    
T  5344766 ttcttctcattaatttggaagactgtattagcctatgtagcctgccaagaagcatctataagttgaattctctaaaaactctcattctttcgggttgttt 5344865  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgccctttt 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  5344866 aaagattgacaagttggaagaggacttagaacaaatgaaatctttaaccattctgatcgcaaataacactgcaataacaaaagttccctttt 5344957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 5278371 - 5278660
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  | |||| ||| || || ||| ||| ||||||||| || || |||||| ||||| | ||||    
T  5278371 accccagacttttcaaacatgcctaatcttgaaaagcttatactcatagattgcccaaggttgtgtgaggtttctcatagcattggatatctcgataaaa 5278470  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| || |||   |  ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  5278471 ttcttctgataaacttggaagattgtattagccttcagagtcttccaagaagtatctataagttgaaatctttgaaaacactcattctttctgggtgttc 5278570  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgccctt 307  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  5278571 gatgattgacaagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaactactctgcttgcaaataacactgcaataacaagagtgccctt 5278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 5383131 - 5383423
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||  ||| ||||||||| |||| |||||||| |  || |||||| ||||||||||||    
T  5383131 accccagacttctcaaatttgcctaatcttgaaaagctagtactcgcagattgtccgaggttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcaagaaaa 5383230  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||| | || || |||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5383231 ttcttctgattaatttggaagactgtgttagcctatgtagcctcccaagaagcatttataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctggttgttt 5383330  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||  ||||||| ||| ||| ||||    
T  5383331 aaagattaccaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaactactttgcttgcagataacactgcaataacaagagttcccctttc 5383423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Original strand, 5433846 - 5434110
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||| ||| ||||| || || |||||| |||| |  || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  5433846 gacttttcaaatttgcctaatcttgaaaagttagtactcacagattgtccaagtctttctgagatttctcctagcattggccatctcaatgaaattcttc 5433945  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||  | || |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  5433946 tgataaatttggaagattgtattggcctatgtaacctcccaagaagcatatataagttgaaatctttgaaaactctcatccttactggctgtttaaagat 5434045  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactg 288  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5434046 tgacaatttggaagatgacttggaacatatggaatctttaaccactctgcttgcaaataacactg 5434110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5284663 - 5284373
Alignment:
Q  20 ccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaatt 119  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || |||||| ||||||| ||||||    
T  5284663 ccctgacttttcgaacatgcctaatcttgaaaagctagtgctcaaagattgtccaaggctatctgaggtttcacctagcattggaaatctcaataaaatt 5284564  T
Q  120 cttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaa 219  Q
      ||||||||||||  ||| |||||| ||  | |||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||| ||    
T  5284563 gctttgataaattttgaaggttgtattagcttatgtagcctcccacgaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttttgggtgttcaa 5284464  T
Q  220 agattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| || ||| |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  5284463 tgattgacaagttggaagaggacttagaacagatgacatctttaaccactctgatagctaataacaccgcaataacaagagtgcccttttc 5284373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5066971 - 5066710
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |   |||| |||||||| |  |  || ||| | ||||   ||    
T  5066971 cacccctgacttttcatatatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatattgtccgaggtttctcctacaataggaaaactcagtgaa 5066872  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||     
T  5066871 attcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgtaaccttccaagaagcatctataagttgaaatctcttaaaactctcattctttctgggtgta 5066772  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5066771 taatgattgacaagttagaagaggacatagaacaaatggaatctttaaccactctgcttgca 5066710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5257608 - 5257324
Alignment:
Q  20 ccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaatt 119  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | ||| |||  ||||||   ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5257608 ccctgacttttccaacatgcctaatcttgaaaagttagtactcaaagattgtccaatgctatctagggtttcttcaagcattggaaatctcaagaaaatt 5257509  T
Q  120 cttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaa 219  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||  | ||  | || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  5257508 gttttgataaatttggaagattgtattagcttatgcgaactcccaagaagcatctataagttgaaatctctaaaaactttcattctttctgggtgttcaa 5257409  T
Q  220 agattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 304  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  5257408 tgattgacaagttggaagaggacttagaacagatgacatctttaaccactctaattgcaaataacactgcaataacaagagtgcc 5257324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5157905 - 5157612
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |  || |||||| ||||||   ||    
T  5157905 caccccagacttttcatacatgcctaatcttgagaagctggtactcaaagattgtccaatgttgtctgaggtttctcctagcattggaaatctcagtgaa 5157806  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| || || |||     
T  5157805 attcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgaagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaattttaattctttcagggtgta 5157706  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||| || ||| ||||||||    
T  5157705 taatgattgacaagttggaagaggacatagaacagatggaatctttaaccactctgcttgcacacgacactgcaataaaaagagtacccttttc 5157612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Original strand, 5350205 - 5350459
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | | |||| |||||||| |  || |||||| ||||||   ||||||||     
T  5350205 gacttttcatacatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatgttgtccgaggtttctcctagcattggagatctcagtgaaattcttc 5350304  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    | ||| ||||| | |||||| | || |||   | ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||| |||    
T  5350305 taatagatttggaggattgtgttagccttcaaagccttccaagaagcatctttaagttgaaatctctcaaaactctcattctttcagggtgtataatgat 5350404  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgca 278  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5350405 tgacaagttggaagaggacatagaacaaatggaatctttaaccactctgcttgca 5350459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 287
Target Start/End: Original strand, 5446964 - 5447231
Alignment:
Q  20 ccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaatt 119  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| || || |||||||| || ||   | ||||||||||||| |  || ||  |||||||||| ||||||    
T  5446964 ccctgacttttcaaacacgcctaatcttcaaaaactagtactcaaagattgcccactgttgtctgaggtttcacctagcatcagacatctcaataaaatt 5447063  T
Q  120 cttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| |||| || || || || |||| ||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  5447064 cttctgataaacttggaagactgcattagcctatgtagcctcccaaaaagcatctataagttgaaatctttgaaaactctcgttctttctggttgtttaa 5447163  T
Q  220 agattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacact 287  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5447164 agattgacaaggtggaagaggacttcgagaaaatggaatctttaaccactcttcttgcaaataacact 5447231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 288
Target Start/End: Original strand, 5370375 - 5370646
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| | | ||||||||||||||| |  || |||||  |||||    ||    
T  5370375 caccccagacttttcatacttgcctaagcttgaaaagttagtactcaaagattgttcaatgctgtctgaggtttctcctagcattgggaatctcggcgaa 5370474  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||| ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| || || |||     
T  5370475 attcttctaatagattttgaagattgtgttagccttcgtaaccttccaagaagcatttataagttgaaatctctaaagactcttattctttcagggtgtg 5370574  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactg 288  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5370575 taatgattgagaagttggaagaggatatagaacagatggaatcattaaccactctgcttgcaaataacactg 5370646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 308
Target Start/End: Original strand, 5281280 - 5281395
Alignment:
Q  193 aaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtat 292  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  ||    
T  5281280 aaactctgattctttctgggtgttcaatgattaacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactgcaat 5281379  T
Q  293 aacaaaagtgcccttt 308  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  5281380 aacaagagttcccttt 5281395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5244144 - 5243910
Alignment:
Q  17 cacccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaa 116  Q
    |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||| || |||||||| ||| |   | |||| ||| |||| |  || |||||  ||||||   ||    
T  5244144 caccccagacttttcatacatgtcaaatcttgaaaagctagtactcaaagattgttcagtgttgtccgagatttctcctagcattgggaatctcagtgaa 5244045  T
Q  117 attcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtt 216  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||     
T  5244044 attcttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgaagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactttcattctctcagggtgta 5243945  T
Q  217 taaagattgacaagttagaagaggacttggaacaa 251  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5243944 taatgattgagaagttggaagaggacttggaacaa 5243910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 5179521 - 5179616
Alignment:
Q  193 aaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactg 288  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  5179521 aaactctgattctttctgggtgttcaaagattaacaagttggaagaggacttggaagaaatggaatccttaacgaccctgattgctaatgacactg 5179616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 5396895 - 5397047
Alignment:
Q  158 ccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaa 257  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||| ||  |||||||  |||| ||||| ||||||  ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||    
T  5396895 ccttccaagaagtatttataagttgaaatcactacaaactcttcttctttctgggtgtttactgattgacaaattggaagaagatttggaacagatggaa 5396994  T
Q  258 tctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||||||  |||| || |||||| |||||    
T  5396995 tctttaaccaccttggttgcaaataacactgcaataaaaagagtgccgttttc 5397047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5147111 - 5147046
Alignment:
Q  79 tgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgta 144  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5147111 tgtctgaagtttctcatagtattggatatctcaataaaattcttctgataaatttggaagattgta 5147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9176 - 8884
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| | | || | |||||||| || |  |||||| |||||    |||    
T  9176 accccagacttttcatatttgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccaatgttgaccgaggtttctcataccattggagatctcggtgaaa 9077  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    | ||| | ||| ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9076 tacttctaatagatttggaagattgtgttagccttcgtagccttccaagaagcatctataagttgaaatctctgaaaactctcattctttctgggtgtat 8977  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    || |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  8976 aatgattgacaagttggaagaggacatagaacagatggaatctttaaccactctgcttgcagataacactgcattaacaagagtgcccttttc 8884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36214096 - 36213813
Alignment:
Q  27 ttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttttga 126  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || || |||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | |    
T  36214096 ttttcaaacatgcctaaccttgaaaaactagtactcacagattgtccaagattgtctgaggtttcccacagtattggacatctcaataaagttcttctaa 36213997  T
Q  127 taaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattga 226  Q
    |||||||| |||||||||| || |||   | |||||| | |   ||||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36213996 taaatttggaagattgtattagccttcaaagccttcctaaaggtatctataagttaaaattacttaaaactctcattctttctggatgttcaaagattga 36213897  T
Q  227 caagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||    
T  36213896 caaattggaagaggacatggaacagatggaatctttaaccaccttgattgcaaataacactgcaataacaagagtgccattttc 36213813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34724774 - 34724626
Alignment:
Q  106 atctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattct 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||| | |||||||||| ||||||||  ||||| ||  | |||||||||||| |    
T  34724774 atctcaagaaaattctattgataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgagcttccaagaagcatctataaattgaagtcagtaaaaactctcattgt 34724675  T
Q  206 atctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatg 254  Q
     |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  34724674 gtctggatgtacaaaaattgacaagttggaagaggacatagaacaaatg 34724626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 308
Target Start/End: Original strand, 18935198 - 18935481
Alignment:
Q  25 acttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctttt 124  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||| |  | |||||||| || || ||  ||||   |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18935198 acttttcaaacttgccgaatcttgaaaagttaatactcaaagattgcccaagtttgtcctcggtttctcatagtataggacttctcaagaaaattctttt 18935297  T
Q  125 gataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagatt 224  Q
     |||||||||||||| ||||   | |||||| | |||||||||| ||||||||  ||  | ||  | ||| |||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  18935298 aataaatttgaaagactgtacaggcctttgtgaacttccaagaagcatctataaattagagtcggtcaaagctctcattttatctggatgtacaaaaatt 18935397  T
Q  225 gacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttt 308  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||| ||| ||||  || | |||| | |||||| ||||||||||    
T  18935398 gacaagttggaagaggacatagaacagatgacatctttgaccaccctggttgcggataagactgctgtaacaagagtgcccttt 18935481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 288
Target Start/End: Original strand, 8877420 - 8877684
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||   ||| |||| || | ||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  8877420 gactttttaaacttgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagattgtccgaggttgatagagatttcgcatactataggacttctgaataaagttcttt 8877519  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| | | |||||||||||  || || | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || |||    
T  8877520 tgataaatttggaagattgtattagccttcggagccttccaagaagtatatacaagttgaaatctctaaaatctctcattctttctgggtgttcaatgat 8877619  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactg 288  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8877620 tgacaagttggaggaggacttagaacagatgaaatctttaaccactctgcttgcaaataacactg 8877684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Original strand, 15802797 - 15802933
Alignment:
Q  99 attggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactc 198  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||| || ||||  |||||| | || || |||||| | ||||||   |||| | |  |||||||||    
T  15802797 attggagatctcaacaatcttcttctgataaatttgaaggactgtacgagtcttagcaatctcccaagagagatctatcaattgagaacagtgaaaactc 15802896  T
Q  199 tcattctatctggatgtttaaagattgacaagttaga 235  Q
    |||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  15802897 tcatcctttctggttgttcaaagattgacaaattaga 15802933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 126 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22584382 - 22584198
Alignment:
Q  126 ataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattg 225  Q
    ||||||||| |||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||     
T  22584382 ataaatttgcaagactgtttaagcctttgtagcctcccaagaaacatctacaagttgaaatctttgaaaactctcattctttctggctgttaaaaacttt 22584283  T
Q  226 acaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  22584282 ataagttggaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgcttgcaaatgaaactgcaataaaaaaagtgccattttc 22584198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14767262 - 14767123
Alignment:
Q  99 attggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactc 198  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||| || ||||  ||||||   || || |||||| | ||||||   ||||||||| |||||||||    
T  14767262 attggagatctcaagaatgttcttctcataaatttgaaggactgtacaagtcttgaaaatctcccaagagagatctatcaattgaaatctttgaaaactc 14767163  T
Q  199 tcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaaga 238  Q
    |||| || || || |||| |||||||||||| || |||||    
T  14767162 tcatcctttccggctgttcaaagattgacaaattggaaga 14767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47987123 - 47986842
Alignment:
Q  23 tgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctt 122  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||| || || | | | |||||| |||| |  || |||||||||||| | |||||||||    
T  47987123 tgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattctt 47987024  T
Q  123 ttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaaga 222  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| ||  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47987023 ctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaaga 47986924  T
Q  223 ttgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 304  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  47986923 ttaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 47986842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47996410 - 47996129
Alignment:
Q  23 tgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctt 122  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||| || || | | | |||||| |||| |  || |||||||||||| | |||||||||    
T  47996410 tgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattctt 47996311  T
Q  123 ttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaaga 222  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| ||  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47996310 ctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaaga 47996211  T
Q  223 ttgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 304  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  47996210 ttaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 47996129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48005697 - 48005416
Alignment:
Q  23 tgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctt 122  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||| || || | | | |||||| |||| |  || |||||||||||| | |||||||||    
T  48005697 tgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattctt 48005598  T
Q  123 ttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaaga 222  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| ||  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48005597 ctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaaga 48005498  T
Q  223 ttgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 304  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  48005497 ttaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 48005416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48014982 - 48014701
Alignment:
Q  23 tgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattctt 122  Q
    |||||||||| || ||||||| || |||||||| || |||||||| || || | | | |||||| |||| |  || |||||||||||| | |||||||||    
T  48014982 tgacttttcaaacatgcctaatctcgaaaagctagtactcaaagattgcccaatgttatctgagatttctcctagcattggacatctcgacaaaattctt 48014883  T
Q  123 ttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaaga 222  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || || |||| ||| ||||||| ||  || |  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48014882 ctgataaatttggaagactgtattagcctatgtagcctcccaagaagcacatacaaattaaaatctctaaaaactctcattctttctggctgtttaaaga 48014783  T
Q  223 ttgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcc 304  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  48014782 ttaacaagttggaagaggacatggaataaatgaaatctttaactactttggttgcaaataacactgcgataacaagagtgcc 48014701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6906113 - 6905991
Alignment:
Q  107 tctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattcta 206  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||  |||||| | || || |||||  | ||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||     
T  6906113 tctcaagaagcttcttctgataaatttgaaggactgtacaagtcttggcaatctaccaagggagatctatcagctgatatctgtgaaaactctcattctt 6906014  T
Q  207 tctggatgtttaaagattgacaa 229  Q
    | ||| |||| ||||||||||||    
T  6906013 tttggttgttcaaagattgacaa 6905991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0813 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0813
Description:

Target: scaffold0813; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4810
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |  ||| ||| ||||  || ||||||  |||  | |||     
T  5102 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 5003  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  5002 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 4903  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4902 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagtgccgttttc 4810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8561 - 8317
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| | ||||| ||  |||||   || ||||| |||||||||  |||  | ||||    
T  8561 accccagactttacatacttgccaaatcttgaaaagctagtactcaaaaattgtccaagtttgtctacagtctcccatagtattggatctctacataaaa 8462  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |   ||||| | || |||||||||| || |||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  8461 ttcttctcataaatttgacagactgcacaggtcttcggaaacttccaagaagcaactataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 8362  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatcttt 262  Q
     | |||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  8361 catgattgaaaaattggaggaggacttggaacagatggaatcttt 8317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 6464 - 6756
Alignment:
Q  18 acccctgacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |  ||| ||| ||||  || ||||||  |||  | |||     
T  6464 accccagacttttcattcatgcctaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagattaactgcggtctcccgtagcattggatctctgcataaac 6563  T
Q  118 ttcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgttt 217  Q
    ||||| | |||||||||| ||| || |  ||||||   || ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||     
T  6564 ttcttctaataaatttgacagactgcacaagtcttcagaaacttcctagaagcatatataaattaaaatctctagaaactttgattctttctggatgttc 6663  T
Q  218 aaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaatgacactggtataacaaaagtgcccttttc 310  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |  ||  |||||||  || | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6664 caagattgacaaattggaggaggacttggaacagatggaatcattgaaaaccttgattgcggataagactgctataacaaaagttcccttttc 6756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 9501 - 9737
Alignment:
Q  24 gacttttcatacttgcctaaccttgaaaagctggtgctcaaagactgtccgaggctgtctgaggtttcccaaagtattggacatctcaagaaaattcttt 123  Q
    ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||| || ||||||  |||| | ||| |||||     
T  9501 gacttctcatatatgccgaatcttgaaaagctagtactcaaagactgtccaagtttgtctgcggtctcccatagcattggatctctccataaacttcttc 9600  T
Q  124 tgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctatacgttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagat 223  Q
    |||||||||| |   | || |   ||||| | || ||||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||  | |||    
T  9601 tgataaatttaacgaactgcacaggtcttcggaaacttccgagaagcatctatacattaaaatctctacaaactttgattctttctggatgttccatgat 9700  T
Q  224 tgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatct 260  Q
    |||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||    
T  9701 tgacaaattggaggaggatttggtacagatggaatct 9737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3286748 - 3286648
Alignment:
Q  181 tgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaaa 280  Q
    |||||||| |||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |  || |||||||| || || || |||||||||||    
T  3286748 tgaaatctttgaacactctcatcctttctggttgttcaaagattgacaagttggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaaa 3286649  T
Q  281 t 281  Q
    |    
T  3286648 t 3286648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3262860 - 3262760
Alignment:
Q  180 ttgaaatctctgaaaactctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaagaggacttggaacaaatggaatctttaaccactctgattgcaa 279  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || ||||| ||| | |  || |||||||| || || || ||||||||||    
T  3262860 ttgaaatctttgaaaactctcatactttctggttgctcaaagattgacaaattggaagaagacatagtgcagatggaatccttgacaacactgattgcaa 3262761  T
Q  280 a 280  Q
    |    
T  3262760 a 3262760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7164968 - 7164828
Alignment:
Q  99 attggacatctcaagaaaattcttttgataaatttgaaagattgtatcagtctttgtaaccttccaagaaacatctat-acgttgaaatctctgaaaact 197  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||| || ||||  |||||| | || || ||||| || |||||| | |||||||||  ||||||||    
T  7164968 attggagatctcaagaatgttctactaataaatttgaaggactgtacaagtcttagcaatctcccaaggaatatctatcaagttgaaatcattgaaaact 7164869  T
Q  198 ctcattctatctggatgtttaaagattgacaagttagaaga 238  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||||| | |||| |||||    
T  7164868 ctcatcctttctggttgttcaaagattgcctagttggaaga 7164828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University