View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7356_low_7 (Length: 327)

Name: NF7356_low_7
Description: NF7356
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7356_low_7
NF7356_low_7
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-255)||(66455-66718)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (1-255)||(15344243-15344504)
chr4 (1-255)||(26445251-26445513)
chr4 (1-233)||(19566342-19566582)
chr4 (1-255)||(25513109-25513371)
chr4 (2-240)||(14630207-14630454)
chr4 (2-234)||(45314761-45315001)
chr4 (1-233)||(2425044-2425284)
chr4 (1-234)||(16026352-16026592)
chr4 (1-218)||(10237921-10238146)
chr4 (1-240)||(16997911-16998154)
chr4 (2-203)||(44024028-44024237)
chr4 (1-203)||(40229721-40229932)
chr4 (1-202)||(46740618-46740827)
chr4 (1-240)||(53630896-53631144)
chr4 (1-243)||(55582582-55582820)
chr4 (1-234)||(35660233-35660475)
chr4 (1-248)||(19435120-19435377)
chr4 (2-254)||(15114590-15114850)
chr4 (1-240)||(42875180-42875428)
chr4 (1-240)||(10356859-10357107)
chr4 (1-236)||(25091038-25091282)
chr4 (1-248)||(37019042-37019298)
chr4 (1-231)||(3337489-3337728)
chr4 (1-158)||(9923668-9923825)
chr4 (71-233)||(14508150-14508320)
chr4 (1-240)||(19609705-19609953)
chr4 (1-195)||(11479034-11479237)
chr4 (1-197)||(15008390-15008595)
chr4 (1-239)||(14549008-14549255)
chr4 (1-197)||(9638431-9638636)
chr4 (13-237)||(33243731-33243964)
chr4 (1-197)||(10056896-10057101)
chr4 (1-197)||(10694670-10694875)
chr4 (1-197)||(10908436-10908641)
chr4 (1-158)||(15011936-15012093)
chr4 (1-134)||(40620026-40620159)
chr4 (1-197)||(15990463-15990668)
chr4 (71-203)||(12622790-12622930)
chr4 (1-240)||(11425336-11425574)
chr4 (9-197)||(15447847-15448044)
chr4 (1-134)||(18213062-18213195)
chr4 (9-195)||(20595862-20596056)
chr4 (1-197)||(24046957-24047162)
chr4 (1-134)||(56115259-56115392)
chr4 (2-117)||(18108302-18108417)
chr4 (1-197)||(630326-630531)
chr4 (1-197)||(10704922-10705127)
chr4 (1-197)||(10918692-10918897)
chr4 (1-197)||(33186325-33186530)
chr4 (1-134)||(33849238-33849371)
chr4 (1-134)||(53387360-53387493)
chr4 (1-134)||(12611347-12611480)
chr4 (1-134)||(16277750-16277883)
chr4 (1-191)||(28385673-28385872)
chr4 (17-240)||(3485292-3485521)
chr4 (123-234)||(26922217-26922336)
chr4 (1-134)||(13046068-13046201)
chr4 (1-98)||(22725508-22725605)
chr4 (1-197)||(23802887-23803092)
chr4 (1-208)||(15214468-15214684)
chr4 (1-133)||(51463490-51463622)
chr4 (17-156)||(54364129-54364268)
chr4 (1-86)||(14185426-14185511)
chr4 (1-93)||(15534658-15534750)
chr4 (1-218)||(19081764-19081989)
chr4 (1-93)||(12033367-12033459)
chr4 (1-93)||(14049054-14049146)
chr4 (1-93)||(44615765-44615857)
chr4 (1-93)||(50221933-50222025)
chr4 (1-134)||(17376089-17376222)
chr4 (1-93)||(30147392-30147484)
chr4 (154-240)||(13036362-13036448)
chr4 (3-153)||(32461342-32461491)
chr4 (1-93)||(36038347-36038439)
chr4 (1-93)||(49547367-49547459)
chr4 (4-153)||(8044402-8044549)
chr4 (1-93)||(15117946-15118038)
chr4 (1-93)||(19243177-19243269)
chr4 (17-156)||(19622955-19623094)
chr4 (27-93)||(29267830-29267896)
chr4 (1-93)||(7640780-7640872)
chr4 (1-93)||(44772677-44772769)
chr4 (154-197)||(9871151-9871194)
chr4 (154-197)||(15884000-15884043)
chr4 (211-254)||(10272928-10272971)
chr4 (1-51)||(1837113-1837163)
chr4 (156-218)||(12134446-12134508)
chr4 (159-197)||(12611275-12611313)
[»] chr3 (150 HSPs)
chr3 (1-255)||(50755805-50756067)
chr3 (1-255)||(24546203-24546469)
chr3 (1-237)||(6156090-6156334)
chr3 (1-255)||(15565880-15566142)
chr3 (1-240)||(9511589-9511836)
chr3 (1-240)||(9519564-9519811)
chr3 (1-255)||(17207708-17207969)
chr3 (1-248)||(14152822-14153078)
chr3 (1-234)||(54330729-54330970)
chr3 (1-203)||(14519681-14519891)
chr3 (2-215)||(12952448-12952669)
chr3 (1-218)||(25104626-25104850)
chr3 (1-234)||(50351423-50351665)
chr3 (1-240)||(40807377-40807625)
chr3 (1-248)||(50348449-50348705)
chr3 (1-240)||(54875906-54876154)
chr3 (1-240)||(11192462-11192709)
chr3 (1-218)||(17937931-17938155)
chr3 (1-255)||(40812199-40812462)
chr3 (1-218)||(18739300-18739524)
chr3 (2-240)||(5206078-5206325)
chr3 (2-224)||(14441565-14441796)
chr3 (1-237)||(43889222-43889467)
chr3 (2-237)||(12511232-12511476)
chr3 (1-240)||(17685266-17685514)
chr3 (2-240)||(17693449-17693696)
chr3 (18-240)||(44273855-44274086)
chr3 (1-245)||(2841886-2842138)
chr3 (12-240)||(17538488-17538725)
chr3 (9-240)||(14508229-14508468)
chr3 (1-240)||(17519296-17519544)
chr3 (1-240)||(17534158-17534406)
chr3 (1-240)||(35065004-35065251)
chr3 (2-195)||(17044392-17044594)
chr3 (1-237)||(10541881-10542126)
chr3 (1-197)||(14641973-14642178)
chr3 (1-240)||(35353980-35354231)
chr3 (2-237)||(18699897-18700141)
chr3 (1-197)||(6158821-6159026)
chr3 (1-237)||(12470186-12470431)
chr3 (1-237)||(14671208-14671453)
chr3 (1-240)||(15931930-15932178)
chr3 (1-195)||(33564555-33564758)
chr3 (1-197)||(35961310-35961515)
chr3 (1-240)||(41172793-41173042)
chr3 (12-238)||(13519666-13519901)
chr3 (2-193)||(20248408-20248608)
chr3 (1-240)||(22307006-22307254)
chr3 (52-197)||(22652256-22652409)
chr3 (13-195)||(53646495-53646686)
chr3 (1-197)||(6805384-6805589)
chr3 (1-197)||(16979334-16979539)
chr3 (1-134)||(18893120-18893253)
chr3 (1-134)||(179130-179263)
chr3 (1-197)||(2248393-2248598)
chr3 (1-134)||(3394425-3394558)
chr3 (1-197)||(10833762-10833967)
chr3 (1-134)||(12276045-12276178)
chr3 (1-134)||(18889860-18889993)
chr3 (1-134)||(55292064-55292197)
chr3 (2-134)||(8928089-8928221)
chr3 (14-197)||(14966426-14966618)
chr3 (1-254)||(49900095-49900365)
chr3 (11-197)||(13029709-13029904)
chr3 (2-117)||(17046639-17046754)
chr3 (1-231)||(43928741-43928980)
chr3 (1-135)||(8631237-8631371)
chr3 (1-202)||(11913140-11913350)
chr3 (1-193)||(38311426-38311628)
chr3 (1-134)||(1988655-1988788)
chr3 (1-197)||(10563133-10563338)
chr3 (1-134)||(24152867-24153000)
chr3 (11-197)||(13026117-13026312)
chr3 (9-201)||(37038238-37038440)
chr3 (1-134)||(9533625-9533758)
chr3 (1-134)||(10554763-10554896)
chr3 (9-134)||(19444007-19444132)
chr3 (2-197)||(43550101-43550305)
chr3 (2-197)||(50243157-50243361)
chr3 (1-127)||(13522833-13522959)
chr3 (1-135)||(16643500-16643634)
chr3 (14-132)||(17513078-17513196)
chr3 (1-194)||(17670132-17670334)
chr3 (1-98)||(14763384-14763481)
chr3 (1-98)||(23371130-23371227)
chr3 (1-98)||(46723049-46723146)
chr3 (1-98)||(51603023-51603120)
chr3 (1-117)||(5215160-5215276)
chr3 (1-93)||(15465631-15465723)
chr3 (1-193)||(41955-42156)
chr3 (25-197)||(3803259-3803440)
chr3 (1-130)||(6819609-6819738)
chr3 (1-98)||(19568834-19568931)
chr3 (1-134)||(31224376-31224509)
chr3 (1-197)||(42324644-42324849)
chr3 (1-93)||(5223860-5223952)
chr3 (1-93)||(22764053-22764145)
chr3 (1-93)||(26054858-26054950)
chr3 (9-156)||(8023696-8023843)
chr3 (1-132)||(16324964-16325095)
chr3 (1-134)||(10989227-10989359)
chr3 (1-197)||(18367181-18367386)
chr3 (1-98)||(51300927-51301024)
chr3 (160-240)||(17046543-17046623)
chr3 (3-153)||(14284500-14284650)
chr3 (1-134)||(6002443-6002576)
chr3 (17-158)||(14567651-14567792)
chr3 (1-93)||(12305599-12305691)
chr3 (1-96)||(14647526-14647621)
chr3 (13-155)||(40039779-40039921)
chr3 (1-86)||(36528061-36528146)
chr3 (1-93)||(13436776-13436867)
chr3 (154-237)||(19568953-19569037)
chr3 (1-93)||(29544435-29544527)
chr3 (9-84)||(11986837-11986912)
chr3 (154-240)||(11258848-11258934)
chr3 (155-233)||(14568645-14568723)
chr3 (1-91)||(54521301-54521391)
chr3 (1-93)||(28848215-28848307)
chr3 (1-76)||(11258984-11259059)
chr3 (1-88)||(16453873-16453960)
chr3 (1-93)||(15978009-15978101)
chr3 (1-93)||(34159802-34159894)
chr3 (3-153)||(11479846-11479996)
chr3 (156-240)||(42353260-42353344)
chr3 (1-93)||(7780940-7781032)
chr3 (1-93)||(10247317-10247409)
chr3 (1-93)||(17463654-17463746)
chr3 (1-93)||(55476967-55477059)
chr3 (154-237)||(14682707-14682790)
chr3 (154-197)||(52989543-52989586)
chr3 (44-134)||(5223626-5223716)
chr3 (5-86)||(3264737-3264818)
chr3 (12-129)||(4656152-4656269)
chr3 (191-240)||(17691427-17691476)
chr3 (14-134)||(12902680-12902799)
chr3 (44-134)||(15465397-15465487)
chr3 (44-134)||(26055094-26055184)
chr3 (1-53)||(15412947-15412999)
chr3 (13-69)||(17759093-17759149)
chr3 (13-69)||(19060413-19060469)
chr3 (159-197)||(6819533-6819571)
chr3 (159-197)||(8928255-8928293)
chr3 (1-51)||(13151384-13151434)
chr3 (1-51)||(13153849-13153899)
chr3 (159-197)||(13523001-13523039)
chr3 (159-197)||(18889788-18889826)
chr3 (159-197)||(18893014-18893052)
chr3 (156-218)||(37917171-37917233)
chr3 (1-51)||(45606500-45606550)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (2-255)||(32259214-32259474)
chr6 (1-234)||(25921117-25921358)
chr6 (1-248)||(13285082-13285337)
chr6 (1-233)||(18455495-18455734)
chr6 (1-234)||(18585007-18585247)
chr6 (2-248)||(22556622-22556877)
chr6 (13-215)||(18398325-18398535)
chr6 (3-203)||(20411097-20411305)
chr6 (1-153)||(29044787-29044939)
chr6 (1-240)||(7827353-7827601)
chr6 (1-240)||(19655652-19655900)
chr6 (1-240)||(28947725-28947973)
chr6 (1-240)||(17318545-17318793)
chr6 (2-155)||(17857116-17857269)
chr6 (1-240)||(18702945-18703193)
chr6 (1-240)||(18708880-18709128)
chr6 (2-237)||(19773133-19773377)
chr6 (9-240)||(23150698-23150937)
chr6 (1-195)||(18928149-18928352)
chr6 (1-237)||(15705034-15705279)
chr6 (1-237)||(23491594-23491839)
chr6 (1-237)||(23497192-23497437)
chr6 (1-133)||(34141048-34141180)
chr6 (1-133)||(34153664-34153796)
chr6 (2-218)||(15938650-15938874)
chr6 (1-207)||(25601700-25601915)
chr6 (2-240)||(31734089-31734334)
chr6 (1-203)||(20182982-20183192)
chr6 (1-203)||(22152799-22153009)
chr6 (1-203)||(5834158-5834368)
chr6 (1-131)||(23655838-23655968)
chr6 (1-197)||(20733870-20734074)
chr6 (1-197)||(27851427-27851632)
chr6 (1-203)||(20177164-20177374)
chr6 (1-131)||(15817181-15817311)
chr6 (1-233)||(15891134-15891369)
chr6 (1-134)||(611236-611369)
chr6 (1-134)||(15173878-15174011)
chr6 (1-197)||(18658630-18658835)
chr6 (1-240)||(27125899-27126148)
chr6 (1-203)||(22158617-22158827)
chr6 (1-135)||(1254252-1254386)
chr6 (1-134)||(8767686-8767819)
chr6 (1-98)||(22806281-22806378)
chr6 (1-197)||(25619380-25619585)
chr6 (4-240)||(27317981-27318226)
chr6 (1-134)||(19443703-19443836)
chr6 (1-134)||(35057000-35057133)
chr6 (1-197)||(13764777-13764975)
chr6 (13-132)||(19825924-19826043)
chr6 (1-191)||(25347556-25347755)
chr6 (1-135)||(783-917)
chr6 (1-98)||(4477190-4477287)
chr6 (1-134)||(20556516-20556649)
chr6 (1-134)||(25807628-25807761)
chr6 (3-156)||(31161884-31162037)
chr6 (2-94)||(27330396-27330488)
chr6 (2-94)||(27391136-27391228)
chr6 (10-134)||(34296701-34296825)
chr6 (1-134)||(8759940-8760072)
chr6 (1-197)||(14979045-14979250)
chr6 (25-158)||(23956334-23956467)
chr6 (1-93)||(23415441-23415533)
chr6 (13-134)||(29847938-29848061)
chr6 (1-134)||(16133093-16133226)
chr6 (1-134)||(23838495-23838628)
chr6 (1-93)||(12942666-12942758)
chr6 (13-218)||(23221269-23221482)
chr6 (1-96)||(7430057-7430152)
chr6 (3-153)||(32277427-32277577)
chr6 (9-218)||(22523400-22523617)
chr6 (1-93)||(28288930-28289022)
chr6 (159-234)||(19234584-19234659)
chr6 (159-233)||(29044650-29044724)
chr6 (1-98)||(31022120-31022217)
chr6 (1-93)||(27557199-27557291)
chr6 (2-134)||(31163462-31163594)
chr6 (27-93)||(15892028-15892094)
chr6 (9-134)||(3007543-3007668)
chr6 (1-93)||(17883091-17883183)
chr6 (1-93)||(19858516-19858608)
chr6 (1-93)||(33862270-33862362)
chr6 (9-96)||(14594056-14594143)
chr6 (1-93)||(1540505-1540597)
chr6 (1-93)||(18334186-18334278)
chr6 (9-57)||(19234658-19234706)
chr6 (1-93)||(24423023-24423115)
chr6 (31-93)||(12742794-12742856)
chr6 (1-93)||(26924041-26924133)
chr6 (1-93)||(33864754-33864846)
chr6 (3-153)||(16300644-16300794)
chr6 (44-134)||(27556965-27557055)
chr6 (1-51)||(8055548-8055598)
chr6 (1-93)||(2290774-2290866)
chr6 (17-93)||(22782703-22782779)
chr6 (79-134)||(23415207-23415262)
chr6 (159-197)||(611164-611202)
chr6 (159-197)||(16133260-16133298)
chr6 (159-197)||(19443870-19443908)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (1-256)||(22823830-22824093)
chr1 (1-255)||(1642962-1643222)
chr1 (7-255)||(39060462-39060718)
chr1 (3-233)||(24720119-24720357)
chr1 (8-234)||(50544239-50544473)
chr1 (2-240)||(51323656-51323903)
chr1 (1-233)||(18120993-18121233)
chr1 (1-203)||(14792985-14793195)
chr1 (1-251)||(12710258-12710517)
chr1 (8-234)||(6833602-6833836)
chr1 (1-203)||(17902185-17902395)
chr1 (1-240)||(21239718-21239966)
chr1 (1-240)||(7052478-7052726)
chr1 (1-240)||(4596268-4596516)
chr1 (2-203)||(44891867-44892075)
chr1 (1-240)||(20588060-20588308)
chr1 (1-240)||(20592598-20592846)
chr1 (1-240)||(51082597-51082845)
chr1 (1-240)||(20634057-20634306)
chr1 (1-240)||(19676092-19676340)
chr1 (1-240)||(41227127-41227375)
chr1 (1-240)||(42912431-42912679)
chr1 (1-240)||(14238035-14238283)
chr1 (1-203)||(9784766-9784976)
chr1 (9-240)||(38887518-38887758)
chr1 (1-240)||(16058737-16058985)
chr1 (2-236)||(21046473-21046716)
chr1 (1-234)||(41225874-41226116)
chr1 (12-242)||(45496324-45496564)
chr1 (1-134)||(28312844-28312977)
chr1 (1-197)||(44822545-44822750)
chr1 (1-194)||(46198148-46198350)
chr1 (1-197)||(50000897-50001103)
chr1 (1-134)||(21180748-21180881)
chr1 (1-197)||(2332633-2332838)
chr1 (1-197)||(8276415-8276620)
chr1 (1-134)||(16372247-16372380)
chr1 (1-134)||(24815275-24815408)
chr1 (1-134)||(29764057-29764190)
chr1 (2-134)||(7792276-7792408)
chr1 (1-135)||(22350083-22350217)
chr1 (13-134)||(20031325-20031446)
chr1 (1-134)||(20437650-20437783)
chr1 (1-134)||(296851-296984)
chr1 (1-197)||(38057074-38057279)
chr1 (1-197)||(13881039-13881244)
chr1 (1-201)||(16401088-16401297)
chr1 (1-197)||(22130488-22130693)
chr1 (1-134)||(23194974-23195107)
chr1 (1-86)||(45574475-45574560)
chr1 (1-93)||(29535528-29535620)
chr1 (1-86)||(10812792-10812877)
chr1 (1-93)||(13227340-13227432)
chr1 (1-93)||(16362395-16362487)
chr1 (1-85)||(21659689-21659773)
chr1 (1-93)||(21841243-21841335)
chr1 (1-93)||(21922885-21922977)
chr1 (2-93)||(41372948-41373039)
chr1 (165-255)||(48301298-48301388)
chr1 (1-93)||(13989342-13989434)
chr1 (1-89)||(20708746-20708834)
chr1 (185-255)||(11809199-11809269)
chr1 (1-83)||(23593327-23593409)
chr1 (51-134)||(294541-294624)
chr1 (185-255)||(23073252-23073322)
chr1 (12-154)||(16655844-16655985)
chr1 (3-93)||(21474682-21474772)
chr1 (159-197)||(29764228-29764266)
chr1 (176-221)||(28477375-28477420)
chr1 (216-255)||(10813123-10813162)
chr1 (159-197)||(21180915-21180953)
chr1 (159-197)||(24815442-24815480)
chr1 (159-197)||(28312772-28312810)
[»] chr8 (107 HSPs)
chr8 (1-255)||(22344408-22344670)
chr8 (1-255)||(22356068-22356330)
chr8 (2-250)||(20517542-20517798)
chr8 (1-248)||(22483120-22483375)
chr8 (1-255)||(36305025-36305287)
chr8 (1-234)||(4381216-4381457)
chr8 (3-233)||(17978842-17979080)
chr8 (4-234)||(18816886-18817126)
chr8 (1-203)||(22258727-22258937)
chr8 (9-234)||(22474139-22474372)
chr8 (1-203)||(23670067-23670277)
chr8 (1-234)||(36732947-36733178)
chr8 (1-203)||(38988884-38989094)
chr8 (1-203)||(39019981-39020191)
chr8 (34-234)||(18815279-18815487)
chr8 (7-233)||(21513709-21513942)
chr8 (1-240)||(5760914-5761162)
chr8 (1-255)||(18833837-18834100)
chr8 (1-203)||(36405483-36405693)
chr8 (1-237)||(20084061-20084305)
chr8 (1-240)||(6102176-6102423)
chr8 (1-240)||(20178944-20179192)
chr8 (1-240)||(19140146-19140394)
chr8 (1-218)||(24907180-24907403)
chr8 (1-254)||(5082635-5082897)
chr8 (1-197)||(26454135-26454340)
chr8 (1-240)||(39936434-39936681)
chr8 (2-153)||(21399187-21399338)
chr8 (2-153)||(21793680-21793831)
chr8 (1-197)||(19882392-19882597)
chr8 (1-158)||(6573480-6573636)
chr8 (1-197)||(15635603-15635808)
chr8 (1-197)||(41680557-41680762)
chr8 (1-251)||(17437741-17437999)
chr8 (1-195)||(22207693-22207896)
chr8 (2-240)||(42818331-42818578)
chr8 (1-134)||(38185509-38185642)
chr8 (1-197)||(39694951-39695156)
chr8 (14-197)||(19808033-19808225)
chr8 (1-134)||(364284-364417)
chr8 (9-197)||(17460718-17460915)
chr8 (1-134)||(21326361-21326494)
chr8 (1-134)||(23478576-23478709)
chr8 (1-237)||(23914308-23914552)
chr8 (1-133)||(20455493-20455625)
chr8 (1-133)||(20460471-20460603)
chr8 (10-197)||(21861052-21861248)
chr8 (41-231)||(361675-361874)
chr8 (17-218)||(18118603-18118813)
chr8 (1-134)||(44432357-44432491)
chr8 (1-131)||(44476923-44477053)
chr8 (1-131)||(44480185-44480315)
chr8 (1-134)||(17795728-17795861)
chr8 (1-197)||(18024118-18024323)
chr8 (1-134)||(20454735-20454868)
chr8 (1-158)||(22237677-22237834)
chr8 (1-134)||(44522849-44522982)
chr8 (13-218)||(25757556-25757769)
chr8 (9-132)||(42559959-42560082)
chr8 (1-135)||(39364019-39364153)
chr8 (9-197)||(19880252-19880449)
chr8 (1-134)||(25483897-25484030)
chr8 (1-93)||(16198371-16198463)
chr8 (2-197)||(21579631-21579835)
chr8 (1-157)||(23660688-23660844)
chr8 (13-218)||(25295536-25295749)
chr8 (44-231)||(32949991-32950187)
chr8 (1-85)||(42266018-42266102)
chr8 (13-127)||(24624171-24624285)
chr8 (1-126)||(8728360-8728485)
chr8 (25-158)||(11775194-11775327)
chr8 (1-134)||(21321763-21321896)
chr8 (3-152)||(21495115-21495264)
chr8 (1-134)||(27941312-27941445)
chr8 (16-218)||(22313234-22313445)
chr8 (17-218)||(19332016-19332223)
chr8 (1-218)||(24238819-24239044)
chr8 (1-93)||(18677658-18677750)
chr8 (1-97)||(29763292-29763388)
chr8 (1-93)||(14397334-14397426)
chr8 (1-203)||(17501343-17501554)
chr8 (3-121)||(20176519-20176637)
chr8 (3-121)||(20221246-20221364)
chr8 (1-93)||(4541967-4542059)
chr8 (1-93)||(24485637-24485729)
chr8 (159-234)||(5080396-5080471)
chr8 (157-218)||(18122327-18122388)
chr8 (1-93)||(1484878-1484970)
chr8 (2-98)||(18827755-18827851)
chr8 (1-93)||(20045789-20045881)
chr8 (1-93)||(22002229-22002321)
chr8 (53-218)||(45559644-45559817)
chr8 (154-237)||(21345984-21346067)
chr8 (1-93)||(5852886-5852978)
chr8 (1-93)||(14409038-14409130)
chr8 (1-93)||(45290141-45290233)
chr8 (3-153)||(22885755-22885905)
chr8 (14-134)||(14397540-14397660)
chr8 (25-70)||(8414196-8414241)
chr8 (1-53)||(14824291-14824343)
chr8 (154-193)||(8414295-8414334)
chr8 (154-197)||(21321925-21321968)
chr8 (159-193)||(8728527-8728561)
chr8 (159-197)||(20454663-20454701)
chr8 (156-218)||(24624072-24624134)
chr8 (159-197)||(25484064-25484102)
chr8 (1-93)||(4483756-4483848)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (1-255)||(25587110-25587372)
chr2 (1-243)||(22686218-22686468)
chr2 (1-242)||(28345499-28345748)
chr2 (1-233)||(21335876-21336116)
chr2 (1-234)||(1384109-1384350)
chr2 (1-233)||(21316085-21316325)
chr2 (1-203)||(22690099-22690309)
chr2 (1-203)||(22694695-22694905)
chr2 (12-219)||(29113764-29113979)
chr2 (1-218)||(22332121-22332345)
chr2 (1-233)||(23609865-23610105)
chr2 (1-255)||(43707708-43707970)
chr2 (1-240)||(27484893-27485141)
chr2 (2-240)||(9975310-9975557)
chr2 (2-237)||(23068874-23069118)
chr2 (2-240)||(36839552-36839799)
chr2 (1-240)||(5031553-5031801)
chr2 (1-240)||(23969046-23969294)
chr2 (1-240)||(24781263-24781511)
chr2 (1-231)||(24273682-24273921)
chr2 (1-197)||(25183611-25183816)
chr2 (1-237)||(9784966-9785211)
chr2 (1-197)||(18358392-18358597)
chr2 (1-240)||(17306868-17307116)
chr2 (1-255)||(19201623-19201887)
chr2 (1-153)||(23778718-23778871)
chr2 (1-197)||(27472677-27472882)
chr2 (1-240)||(24515567-24515815)
chr2 (1-197)||(21081394-21081599)
chr2 (1-196)||(24883811-24884015)
chr2 (1-194)||(26903585-26903787)
chr2 (1-248)||(21368480-21368736)
chr2 (6-240)||(28652930-28653173)
chr2 (1-132)||(31520615-31520746)
chr2 (2-197)||(21915046-21915250)
chr2 (1-133)||(41301396-41301528)
chr2 (1-134)||(21073150-21073283)
chr2 (1-134)||(23338823-23338956)
chr2 (1-197)||(34858808-34859013)
chr2 (1-197)||(34873870-34874075)
chr2 (1-131)||(6483018-6483148)
chr2 (1-131)||(6486485-6486615)
chr2 (1-131)||(20590745-20590875)
chr2 (2-156)||(36734909-36735063)
chr2 (1-98)||(6260801-6260898)
chr2 (1-134)||(10039557-10039690)
chr2 (9-134)||(28349413-28349538)
chr2 (1-187)||(18388720-18388915)
chr2 (1-135)||(22173451-22173585)
chr2 (1-98)||(19662078-19662175)
chr2 (2-195)||(20915531-20915733)
chr2 (9-134)||(9242256-9242381)
chr2 (1-93)||(20261696-20261788)
chr2 (1-93)||(31345656-31345748)
chr2 (1-93)||(38967956-38968048)
chr2 (42-218)||(24841356-24841540)
chr2 (3-153)||(28031906-28032056)
chr2 (1-93)||(10684356-10684448)
chr2 (1-93)||(24897789-24897881)
chr2 (1-93)||(24900272-24900364)
chr2 (1-93)||(24902749-24902841)
chr2 (1-93)||(24905226-24905318)
chr2 (1-93)||(24907701-24907793)
chr2 (2-69)||(2524171-2524238)
chr2 (1-74)||(22255768-22255841)
chr2 (1-93)||(23136056-23136148)
chr2 (27-218)||(20272760-20272959)
chr2 (9-130)||(15632718-15632839)
chr2 (1-90)||(40911863-40911952)
chr2 (1-93)||(18809419-18809511)
chr2 (3-134)||(17203787-17203917)
chr2 (1-55)||(22501375-22501429)
chr2 (1-55)||(22509309-22509363)
chr2 (1-93)||(23711607-23711699)
chr2 (1-93)||(26505855-26505947)
chr2 (1-93)||(26508333-26508425)
chr2 (1-93)||(27920358-27920450)
chr2 (1-53)||(28577615-28577667)
chr2 (1-93)||(32039092-32039184)
chr2 (1-54)||(7186942-7186995)
chr2 (1-93)||(571874-571966)
chr2 (50-130)||(24302220-24302300)
chr2 (1-93)||(39682790-39682882)
chr2 (27-127)||(24281174-24281274)
chr2 (44-132)||(31345441-31345529)
chr2 (159-197)||(22173618-22173656)
chr2 (154-196)||(22501293-22501335)
chr2 (154-196)||(22509227-22509269)
chr2 (159-197)||(41301563-41301601)
chr2 (1-93)||(23131338-23131430)
chr2 (1-93)||(23133805-23133897)
chr2 (1-93)||(34402116-34402208)
[»] chr7 (145 HSPs)
chr7 (2-255)||(14161279-14161540)
chr7 (1-248)||(3287370-3287619)
chr7 (1-255)||(25941804-25942066)
chr7 (2-234)||(48213369-48213609)
chr7 (2-234)||(4691320-4691560)
chr7 (1-255)||(13745199-13745462)
chr7 (1-248)||(18875269-18875525)
chr7 (14-234)||(24270418-24270646)
chr7 (1-248)||(43277166-43277423)
chr7 (1-234)||(15576254-15576495)
chr7 (1-234)||(20252765-20253006)
chr7 (1-218)||(39292160-39292385)
chr7 (2-218)||(21538613-21538836)
chr7 (1-240)||(12465683-12465931)
chr7 (1-195)||(9743504-9743706)
chr7 (2-203)||(8514170-8514379)
chr7 (9-202)||(14153403-14153604)
chr7 (1-149)||(18080141-18080289)
chr7 (1-240)||(33001295-33001543)
chr7 (1-240)||(46386510-46386758)
chr7 (2-255)||(8851583-8851845)
chr7 (7-240)||(19282473-19282715)
chr7 (6-218)||(3192721-3192942)
chr7 (1-197)||(32160625-32160830)
chr7 (1-240)||(12371656-12371904)
chr7 (1-240)||(44374327-44374575)
chr7 (1-240)||(44383192-44383440)
chr7 (49-254)||(13745671-13745885)
chr7 (1-197)||(708978-709183)
chr7 (1-240)||(11066849-11067097)
chr7 (1-218)||(15978479-15978704)
chr7 (1-237)||(14258736-14258981)
chr7 (1-197)||(16462460-16462665)
chr7 (1-240)||(13147895-13148143)
chr7 (1-197)||(58841-59046)
chr7 (1-197)||(48812262-48812467)
chr7 (2-237)||(32301566-32301810)
chr7 (1-197)||(14415907-14416112)
chr7 (1-134)||(29052578-29052711)
chr7 (1-197)||(47094504-47094709)
chr7 (1-197)||(47975334-47975539)
chr7 (1-255)||(20619652-20619915)
chr7 (1-134)||(13408268-13408401)
chr7 (9-193)||(15167403-15167596)
chr7 (1-197)||(16550427-16550632)
chr7 (1-197)||(16615030-16615235)
chr7 (1-197)||(18456071-18456276)
chr7 (1-134)||(36685672-36685805)
chr7 (9-224)||(48743700-48743924)
chr7 (1-197)||(14191511-14191714)
chr7 (1-197)||(8756819-8757024)
chr7 (1-134)||(15213995-15214128)
chr7 (1-133)||(4325553-4325685)
chr7 (1-133)||(38828558-38828690)
chr7 (3-240)||(32434014-32434261)
chr7 (8-240)||(12127593-12127835)
chr7 (1-197)||(14188717-14188920)
chr7 (1-134)||(11661601-11661734)
chr7 (1-134)||(13647738-13647871)
chr7 (1-237)||(16580044-16580289)
chr7 (1-134)||(32771824-32771957)
chr7 (1-134)||(40555166-40555299)
chr7 (17-240)||(14928771-14929003)
chr7 (17-240)||(15352237-15352469)
chr7 (1-134)||(832446-832579)
chr7 (1-134)||(1197626-1197759)
chr7 (1-193)||(10896417-10896618)
chr7 (1-197)||(13699312-13699517)
chr7 (1-134)||(14422281-14422414)
chr7 (17-237)||(16585390-16585619)
chr7 (1-197)||(17070716-17070921)
chr7 (1-134)||(17505427-17505560)
chr7 (1-134)||(17547654-17547787)
chr7 (1-134)||(18607783-18607916)
chr7 (9-134)||(34957667-34957792)
chr7 (1-197)||(37727350-37727555)
chr7 (1-129)||(15720250-15720378)
chr7 (1-240)||(20585737-20585981)
chr7 (1-98)||(14566534-14566631)
chr7 (1-98)||(16008910-16009007)
chr7 (1-98)||(18872692-18872789)
chr7 (1-197)||(30820679-30820884)
chr7 (1-93)||(1856823-1856915)
chr7 (25-218)||(8564038-8564239)
chr7 (2-134)||(12755130-12755262)
chr7 (1-132)||(16998930-16999061)
chr7 (9-134)||(147914-148039)
chr7 (1-157)||(12323353-12323509)
chr7 (1-93)||(13917996-13918088)
chr7 (1-133)||(37538905-37539037)
chr7 (2-98)||(46580348-46580444)
chr7 (48-237)||(16460402-16460600)
chr7 (1-93)||(25926723-25926815)
chr7 (73-231)||(13894485-13894652)
chr7 (1-194)||(12191756-12191954)
chr7 (10-111)||(16065966-16066067)
chr7 (1-134)||(29004318-29004451)
chr7 (44-195)||(15119761-15119921)
chr7 (13-93)||(16108294-16108374)
chr7 (1-93)||(18431188-18431280)
chr7 (9-93)||(23664554-23664638)
chr7 (1-134)||(13864818-13864951)
chr7 (1-156)||(3136768-3136920)
chr7 (1-93)||(11303724-11303816)
chr7 (1-89)||(21660558-21660646)
chr7 (1-93)||(29800906-29800998)
chr7 (154-240)||(15720157-15720243)
chr7 (3-121)||(44305758-44305876)
chr7 (1-69)||(11309870-11309938)
chr7 (1-69)||(13897807-13897875)
chr7 (154-218)||(21675493-21675557)
chr7 (1-93)||(24702705-24702797)
chr7 (1-93)||(24705152-24705244)
chr7 (1-93)||(29797087-29797179)
chr7 (1-93)||(32125967-32126059)
chr7 (1-93)||(41523394-41523486)
chr7 (1-93)||(41525856-41525948)
chr7 (9-58)||(44190680-44190729)
chr7 (1-93)||(15376307-15376399)
chr7 (1-93)||(20384717-20384809)
chr7 (27-93)||(14948742-14948808)
chr7 (156-218)||(46473490-46473552)
chr7 (13-126)||(46473562-46473675)
chr7 (1-93)||(27217337-27217429)
chr7 (49-156)||(16383026-16383133)
chr7 (154-197)||(46580495-46580538)
chr7 (44-134)||(13918233-13918323)
chr7 (3-93)||(26355577-26355667)
chr7 (3-93)||(26358029-26358119)
chr7 (1-93)||(16410535-16410627)
chr7 (44-134)||(1857058-1857148)
chr7 (1-51)||(16233039-16233089)
chr7 (44-134)||(25926959-25927049)
chr7 (85-162)||(28719928-28720005)
chr7 (9-153)||(48623348-48623493)
chr7 (154-237)||(20487827-20487910)
chr7 (1-51)||(11392893-11392943)
chr7 (159-197)||(16998850-16998888)
chr7 (159-197)||(29004246-29004284)
chr7 (159-197)||(34957595-34957633)
chr7 (16-53)||(13869864-13869901)
chr7 (1-38)||(14105890-14105927)
chr7 (1-58)||(39431651-39431707)
chr7 (215-255)||(30237101-30237141)
chr7 (159-191)||(38828491-38828523)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (2-255)||(11771-12032)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (13-255)||(62405-62656)
scaffold0032 (1-218)||(116828-117054)
scaffold0032 (9-131)||(67593-67715)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (1-233)||(18744038-18744278)
chr5 (2-233)||(14026232-14026471)
chr5 (9-255)||(23199823-23200075)
chr5 (1-233)||(16605027-16605267)
chr5 (1-203)||(8504292-8504502)
chr5 (1-230)||(1627804-1628041)
chr5 (1-203)||(16062904-16063114)
chr5 (1-255)||(20198009-20198274)
chr5 (44-234)||(22110987-22111185)
chr5 (6-240)||(20565935-20566178)
chr5 (1-255)||(33895305-33895568)
chr5 (74-255)||(30611919-30612108)
chr5 (74-255)||(30613879-30614068)
chr5 (1-254)||(21399427-21399688)
chr5 (1-240)||(32607748-32607995)
chr5 (1-197)||(17011150-17011355)
chr5 (1-240)||(19921015-19921262)
chr5 (1-195)||(26761827-26762030)
chr5 (1-197)||(22412430-22412635)
chr5 (1-197)||(24277029-24277234)
chr5 (1-134)||(24385051-24385184)
chr5 (12-197)||(263281-263475)
chr5 (1-197)||(29448262-29448467)
chr5 (1-131)||(17812895-17813025)
chr5 (1-240)||(36509207-36509447)
chr5 (1-129)||(40917396-40917524)
chr5 (1-197)||(27868998-27869203)
chr5 (1-134)||(36460466-36460599)
chr5 (66-203)||(26749532-26749677)
chr5 (1-191)||(17875429-17875628)
chr5 (1-135)||(31456293-31456427)
chr5 (1-197)||(6766085-6766290)
chr5 (1-134)||(18418908-18419041)
chr5 (1-134)||(21554802-21554934)
chr5 (1-134)||(22336816-22336949)
chr5 (1-98)||(24617346-24617443)
chr5 (1-98)||(24713577-24713674)
chr5 (1-98)||(24746605-24746702)
chr5 (1-98)||(28370679-28370776)
chr5 (1-158)||(8833630-8833779)
chr5 (1-132)||(22340356-22340487)
chr5 (1-131)||(19511686-19511816)
chr5 (1-134)||(17908963-17909096)
chr5 (1-98)||(38145161-38145258)
chr5 (2-98)||(37598541-37598637)
chr5 (2-197)||(41876017-41876221)
chr5 (19-193)||(22750372-22750555)
chr5 (1-134)||(21557467-21557600)
chr5 (1-197)||(30138587-30138791)
chr5 (25-158)||(33473011-33473144)
chr5 (1-98)||(42960909-42961006)
chr5 (1-93)||(37804496-37804588)
chr5 (1-134)||(22758313-22758447)
chr5 (1-98)||(24668620-24668717)
chr5 (1-98)||(24738389-24738486)
chr5 (1-98)||(24751158-24751255)
chr5 (1-93)||(42244959-42245051)
chr5 (13-96)||(43243093-43243176)
chr5 (3-153)||(7528341-7528489)
chr5 (1-93)||(10732534-10732626)
chr5 (1-93)||(29346456-29346548)
chr5 (1-93)||(29348929-29349021)
chr5 (1-93)||(29351402-29351494)
chr5 (12-127)||(31478874-31478988)
chr5 (1-93)||(20909488-20909580)
chr5 (16-93)||(264377-264454)
chr5 (1-53)||(23065030-23065082)
chr5 (1-93)||(39245612-39245704)
chr5 (12-154)||(28901397-28901538)
chr5 (12-154)||(28937792-28937933)
chr5 (154-197)||(12122107-12122150)
chr5 (6-53)||(38619952-38619999)
chr5 (159-197)||(24384979-24385017)
chr5 (159-197)||(42960801-42960839)
chr5 (215-255)||(20312527-20312567)
chr5 (1-93)||(39363860-39363952)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (2-240)||(1092-1339)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (2-240)||(186929-187176)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-255)||(18549-18812)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-234)||(7278-7518)
scaffold0230 (27-93)||(14424-14490)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-240)||(25897-26144)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (17-251)||(35956-36198)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (1-234)||(7206-7446)
scaffold0108 (1-197)||(5841-6046)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (2-203)||(62137-62346)
scaffold0063 (1-41)||(39332-39372)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (2-203)||(65405-65614)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-234)||(34652-34889)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-203)||(18077-18287)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-203)||(8238-8449)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (8-203)||(32872-33075)
scaffold0011 (1-217)||(126152-126377)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (1-203)||(104-314)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-203)||(56395-56605)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-234)||(18552-18793)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (43-234)||(16325-16524)
scaffold0123 (1-134)||(6521-6654)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (1-240)||(15009-15257)
scaffold0061 (1-240)||(24067-24315)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (1-255)||(1273-1536)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (2-153)||(8044-8195)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-255)||(142979-143242)
scaffold0020 (1-131)||(169420-169550)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (1-254)||(27667-27929)
scaffold0125 (1-135)||(1532-1667)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (1-203)||(738-947)
scaffold0462 (1-203)||(6244-6453)
scaffold0462 (1-197)||(10644-10850)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (1-240)||(5136-5384)
scaffold0737 (1-135)||(6100-6234)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (1-240)||(7808-8056)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (2-240)||(891-1138)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (1-237)||(13088-13333)
scaffold0452 (13-158)||(8085-8230)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (1-240)||(78446-78693)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (4-237)||(6897-7139)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-237)||(5749-5994)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-255)||(7011-7275)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (2-237)||(21452-21696)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-237)||(21036-21280)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (1-195)||(5090-5293)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-231)||(28791-29030)
scaffold0180 (13-72)||(9993-10052)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-197)||(11121-11326)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-237)||(120294-120539)
scaffold0034 (2-134)||(29621-29753)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (2-248)||(10084-10328)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-240)||(39480-39728)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (2-240)||(12960-13207)
scaffold0111 (154-240)||(19388-19474)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (1-239)||(7602-7848)
scaffold0104 (1-239)||(14233-14479)
scaffold0104 (1-134)||(26422-26555)
scaffold0104 (1-134)||(27804-27937)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (1-157)||(13195-13355)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (8-240)||(546-787)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (2-194)||(64493-64694)
scaffold0051 (2-93)||(31680-31771)
scaffold0051 (44-134)||(31446-31536)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-240)||(10352-10600)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (1-197)||(21505-21710)
scaffold0026 (1-240)||(146114-146361)
scaffold0026 (1-98)||(111019-111116)
scaffold0026 (3-134)||(123985-124116)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-231)||(9445-9684)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-240)||(400-648)
scaffold0109 (6-240)||(5708-5951)
scaffold0109 (1-117)||(2851-2967)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (1-240)||(405-653)
scaffold0083 (1-240)||(5709-5957)
scaffold0083 (1-85)||(1480-1564)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-240)||(58129-58377)
scaffold0064 (1-93)||(68438-68530)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (6-240)||(7356-7599)
scaffold0546 (1-84)||(10340-10423)
scaffold0546 (154-240)||(11176-11262)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (1-195)||(10870-11073)
scaffold0371 (71-131)||(17258-17318)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (9-231)||(1475-1706)
scaffold0334 (1-134)||(12-145)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (1-214)||(11641-11862)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (2-195)||(1130-1332)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (16-237)||(3654-3884)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (1-240)||(3800-4049)
scaffold0439 (1-234)||(11547-11788)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (2-197)||(5882-6086)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-231)||(21123-21362)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-134)||(7979-8112)
[»] scaffold0515 (2 HSPs)
scaffold0515 (1-134)||(4530-4663)
scaffold0515 (159-197)||(4454-4492)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (1-134)||(4530-4663)
scaffold0306 (159-197)||(4454-4492)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (1-158)||(4569-4726)
scaffold0153 (1-68)||(11679-11746)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-240)||(168818-169067)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-197)||(11930-12135)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-231)||(7523-7762)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (1-197)||(3365-3570)
scaffold0338 (1-48)||(1-48)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (9-197)||(19075-19272)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (1-197)||(8488-8693)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-134)||(21751-21884)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (9-130)||(6299-6420)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (1-197)||(70251-70456)
scaffold0057 (1-98)||(71943-72040)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-197)||(22192-22397)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-197)||(105336-105541)
scaffold0023 (1-134)||(162780-162913)
scaffold0023 (1-93)||(94887-94979)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (1-117)||(1057-1173)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (1-240)||(29993-30241)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-133)||(51455-51587)
scaffold0042 (1-98)||(67200-67297)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (24-234)||(7904-8123)
scaffold0529 (64-164)||(8152-8252)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-202)||(416-626)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (1-234)||(1951-2193)
scaffold0241 (1-126)||(5413-5538)
scaffold0241 (154-234)||(5104-5184)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-135)||(35994-36128)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-210)||(22214-22432)
scaffold0080 (9-134)||(29228-29353)
scaffold0080 (9-134)||(34693-34818)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (1-134)||(16069-16202)
scaffold0156 (160-197)||(15997-16034)
[»] scaffold0117 (3 HSPs)
scaffold0117 (1-98)||(21293-21390)
scaffold0117 (4-48)||(42275-42319)
scaffold0117 (50-93)||(39809-39852)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-134)||(8553-8686)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-134)||(159373-159506)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (1-197)||(77111-77316)
scaffold0001 (1-134)||(152633-152766)
scaffold0001 (1-193)||(176220-176421)
scaffold0001 (1-158)||(168911-169068)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (1-240)||(586-834)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (17-218)||(857-1066)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-133)||(3203-3335)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (3-218)||(20499-20723)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (1-112)||(7800-7911)
scaffold0013 (154-218)||(7931-7995)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (27-236)||(8752-8970)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (55-240)||(22439-22633)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (27-240)||(29539-29761)
scaffold0019 (9-134)||(133246-133371)
scaffold0019 (1-134)||(133587-133720)
scaffold0019 (2-65)||(33803-33866)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-98)||(768-865)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (1-134)||(7380-7513)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-134)||(9379-9512)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-158)||(106626-106783)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (1-117)||(2476-2592)
scaffold0256 (159-229)||(3111-3181)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (12-134)||(745-867)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (1-131)||(1117-1247)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-134)||(512-645)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (2-115)||(2403-2516)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-98)||(2150-2247)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-134)||(12465-12598)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (2-83)||(16412-16493)
scaffold0369 (154-248)||(16555-16649)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (13-134)||(489-610)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (1-197)||(13370-13575)
scaffold0220 (1-134)||(16260-16393)
scaffold0220 (1-133)||(8733-8865)
scaffold0220 (159-197)||(16188-16226)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (1-94)||(24486-24579)
scaffold0162 (154-203)||(24588-24637)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-134)||(23627-23760)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (1-134)||(23065-23198)
scaffold0077 (1-134)||(17680-17813)
scaffold0077 (3-134)||(22604-22736)
scaffold0077 (3-157)||(33812-33966)
scaffold0077 (199-240)||(33731-33772)
scaffold0077 (71-134)||(23383-23446)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (18-134)||(11141-11257)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (7-135)||(12829-12957)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-133)||(138272-138404)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (62-240)||(9711-9897)
scaffold0134 (1-93)||(38298-38390)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (1-131)||(1-131)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (3-152)||(17142-17291)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (71-156)||(40906-40991)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (13-134)||(82482-82603)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (1-208)||(773-989)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-93)||(8495-8587)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (1-93)||(19682-19774)
scaffold0293 (69-134)||(19943-20008)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (1-93)||(18130-18222)
scaffold0200 (78-134)||(17896-17952)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-93)||(33648-33740)
scaffold0138 (154-197)||(33342-33385)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-158)||(7978-8135)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-93)||(3500-3592)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-93)||(21225-21317)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (159-240)||(11-92)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (154-255)||(2419-2520)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (1-96)||(106-201)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (3-153)||(35055-35205)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-93)||(53-146)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-93)||(6423-6515)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (2-158)||(2204-2360)
scaffold0409 (2-158)||(10459-10615)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (14-153)||(4662-4801)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (3-58)||(174573-174628)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (1-58)||(2346-2403)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-158)||(11630-11787)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (176-240)||(4-68)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-93)||(9718-9810)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-93)||(11766-11858)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (14-153)||(6892-7031)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-72)||(9598-9669)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (80-153)||(2971-3044)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-158)||(32716-32872)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (9-153)||(2857-3001)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-93)||(40876-40968)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-53)||(13909-13961)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (70-158)||(21113-21201)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (166-240)||(7104-7178)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (156-218)||(35524-35586)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (46-93)||(134687-134734)
scaffold0028 (46-93)||(137156-137203)
scaffold0028 (46-93)||(139625-139672)
scaffold0028 (46-93)||(142094-142141)
scaffold0028 (46-93)||(144563-144610)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (193-234)||(49243-49284)


Alignment Details
Target: scaffold0004 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 66455 - 66718
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66455 ctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 66554  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66555 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 66654  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66655 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatataatatctata 66718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15344504 - 15344243
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15344504 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 15344405  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15344404 cataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagcttatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 15344306  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15344305 atgttatgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 15344243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26445513 - 26445251
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26445513 ctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcg 26445414  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26445413 gataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 26445314  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26445313 atgttgtgatggatatatcttggtttgacgtgaatatctttattggatgatttaatatctata 26445251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19566342 - 19566582
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  19566342 ctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctg 19566441  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19566442 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 19566541  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19566542 atgttgtgataaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 19566582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25513371 - 25513109
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25513371 ctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagttccg 25513272  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||        |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25513271 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttgtgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatatttaacct 25513172  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25513171 atgttgtgatagatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 25513109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14630454 - 14630207
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14630454 tttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgc 14630355  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14630354 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacct 14630255  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14630254 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 14630207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 45314761 - 45315001
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45314761 tttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 45314860  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||        | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45314861 ataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttgtgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 45314960  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45314961 tgttaagatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 45315001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 2425044 - 2425284
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2425044 ctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccg 2425143  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2425144 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttgtgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 2425243  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  2425244 atgttgtgatgaatcaatcttggtttgatgtgaatatcttt 2425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16026352 - 16026592
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16026352 ctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 16026451  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  16026452 cataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaacttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta-ttaaccc 16026550  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16026551 atgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 16026592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10237921 - 10238146
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10237921 ctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 10238020  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10238021 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtatttaagct 10238120  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    | ||| || || || |||||||||||    
T  10238121 acgttgtggtgaatttaacttggttt 10238146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16998154 - 16997911
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16998154 ctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 16998055  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa----actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||    |||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
T  16998054 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaaagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtatttaacctatgt 16997955  T
Q  197 tttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16997954 tgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 16997911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 44024028 - 44024237
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024028 tttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 44024127  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44024128 ataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44024227  T
Q  194 tgttttgatg 203  Q
    |||| |||||    
T  44024228 tgttatgatg 44024237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40229932 - 40229721
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtctt-agtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  40229932 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattct 40229833  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40229832 gcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacc 40229733  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    |||||| |||||    
T  40229732 tatgttatgatg 40229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 46740827 - 46740618
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  46740827 ctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccg 46740728  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46740727 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacct 46740628  T
Q  193 atgttttgat 202  Q
    ||||| ||||    
T  46740627 atgttatgat 46740618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 53630896 - 53631144
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  53630896 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcgg 53630995  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53630996 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 53631095  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53631096 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 53631144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55582820 - 55582582
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  55582820 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccg 55582721  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||            || |||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  55582720 cataactatttctaag------------ttgtggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatct 55582633  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgat 243  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  55582632 atgttgtgatggatctaacttgatttgatgtgaatatctttgttggatgat 55582582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35660475 - 35660233
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35660475 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 35660376  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggact-gtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||| |||||         |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  35660375 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatct-caaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaac 35660277  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35660276 ctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 35660233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 19435120 - 19435377
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19435120 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcag 19435219  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||||||||  | |||| ||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  19435220 cataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaac 19435319  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19435320 ctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 19435377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15114850 - 15114590
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15114850 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaa-tttatgaaaattcagc 15114752  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| | |||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  15114751 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatttaacct 15114652  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15114651 atgtgctgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttcttggatgatttaatatctat 15114590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42875428 - 42875180
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42875428 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 42875329  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  42875328 cgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatttaacc 42875229  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  42875228 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggat 42875180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10356859 - 10357107
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10356859 ctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10356958  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  10356959 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 10357058  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10357059 tatgttgtgatggatcttatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 10357107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25091282 - 25091038
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25091282 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 25091183  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| || |||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  25091182 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 25091083  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgtt 236  Q
     ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25091082 aatgttgtgatggatctaatttgctttgacgtgaatatctttgtt 25091038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37019298 - 37019042
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37019298 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 37019199  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||| ||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37019198 cataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatttaacc 37019099  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  37019098 tatgctgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatttttgttgaatgatttaat 37019042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3337728 - 3337489
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3337728 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 3337629  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3337628 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 3337529  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3337528 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 3337489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9923825 - 9923668
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9923825 ctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 9923726  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  9923725 cctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactag 9923668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14508320 - 14508150
Alignment:
Q  71 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||        |||| ||||    
T  14508320 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgtgtactatgagt 14508221  T
Q  163 tcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14508220 tcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14508150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19609953 - 19609705
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19609953 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19609854  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||| ||  |   ||||||| ||||||||||          ||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  19609853 cataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 19609754  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  19609753 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgcgaatatttttgttggat 19609705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 11479034 - 11479237
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11479034 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 11479133  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    ||||||  |||| |||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11479134 cctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 11479233  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  11479234 tatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15008595 - 15008390
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15008595 ctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15008496  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008495 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 15008396  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  15008395 tatgtt 15008390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14549255 - 14549008
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14549255 ctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 14549156  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||| |||||         |||||||| || |||| ||||||||||||| ||    
T  14549155 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttagcc 14549056  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttgga 239  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14549055 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttgga 14549008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9638636 - 9638431
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  9638636 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 9638537  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  9638536 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatc 9638437  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  9638436 tatgtt 9638431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 33243731 - 33243964
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  33243731 tttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 33243830  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||  ||||||| |||||         |||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  33243831 taagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgtgatg 33243930  T
Q  204 gatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  33243931 gatctaatttgatttgacgtgaatatttttgttg 33243964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10057101 - 10056896
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10057101 ctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 10057002  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         || |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  10057001 cataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaca 10056902  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  10056901 tatgtt 10056896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 10694670 - 10694875
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10694670 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10694769  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| |  |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10694770 cataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 10694869  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  10694870 tatgtt 10694875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 10908436 - 10908641
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10908436 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10908535  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| |  |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10908536 cataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 10908635  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  10908636 tatgtt 10908641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 15011936 - 15012093
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15011936 ctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15012035  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  15012036 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactag 15012093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 40620159 - 40620026
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40620159 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 40620060  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  40620059 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 40620026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15990668 - 15990463
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15990668 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15990569  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||| |||||||||| || | |||||||||||  |   ||||||  |||||         ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15990568 cacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 15990469  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  15990468 tatgtt 15990463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12622930 - 12622790
Alignment:
Q  71 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||    
T  12622930 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagt 12622831  T
Q  163 tcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  12622830 tcaattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatgatg 12622790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11425574 - 11425336
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||          |||| |    
T  11425574 ctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------attcag 11425485  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactaggagt---------tcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||||||| |||         ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11425484 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 11425385  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11425384 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 11425336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Original strand, 15447847 - 15448044
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  15447847 tggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 15447946  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | |||||||| |         |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15447947 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 15448044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18213195 - 18213062
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  18213195 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 18213096  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  18213095 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 18213062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 20595862 - 20596056
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| ||    
T  20595862 tggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataatta 20595961  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac--------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatg 195  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||  ||   |||||| |||||||        |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  20595962 tttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttgagttataggagttcaattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24046957 - 24047162
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  24046957 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 24047056  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||   ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24047057 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 24047156  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  24047157 catgtt 24047162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 56115259 - 56115392
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  56115259 ctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 56115358  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  56115359 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 56115392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Original strand, 18108302 - 18108417
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18108302 tttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 18108401  T
Q  102 ctaactatttctaagt 117  Q
     ||||| |||||||||    
T  18108402 ataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 630326 - 630531
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  630326 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 630425  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||||||  |    |||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  630426 cataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 630525  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  630526 catgtt 630531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10705127 - 10704922
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  10705127 ctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 10705028  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10705027 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 10704928  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  10704927 catgtt 10704922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10918897 - 10918692
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  10918897 ctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 10918798  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10918797 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 10918698  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  10918697 catgtt 10918692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33186530 - 33186325
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||  |    
T  33186530 ctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttag 33186431  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| |  |||||||||||||| |  |||||| | |||||         |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33186430 tataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacc 33186331  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  33186330 tatgtt 33186325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33849371 - 33849238
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33849371 ctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 33849272  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  33849271 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 33849238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 53387360 - 53387493
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  53387360 ctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 53387459  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  53387460 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgg 53387493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12611480 - 12611347
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  12611480 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 12611381  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  12611380 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 12611347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16277750 - 16277883
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||| |    
T  16277750 ctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcag 16277849  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  16277850 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgg 16277883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 28385872 - 28385673
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28385872 ctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcag 28385773  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28385772 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 28385673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3485521 - 3485292
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | |||  ||||||| || ||||  ||||||||    
T  3485521 gtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaag 3485424  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaa-------acttcaa-aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatct 208  Q
    | || |||||||||| ||| |   |||||       |||  ||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| ||||    
T  3485423 ttaatccaaaacttagggaataattccaaccccaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctagcatatgttgtgatgaatct 3485324  T
Q  209 aacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3485323 aatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 3485292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 26922217 - 26922336
Alignment:
Q  123 caaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttg 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26922217 caaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttg 26922316  T
Q  215 gtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  26922317 gtttgacgtgaatatctttg 26922336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13046068 - 13046201
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||      
T  13046068 ctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaattcaa 13046167  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13046168 cataaccatttctaaatcaacccaaaagttatgg 13046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 22725508 - 22725605
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22725508 ctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaattc 22725605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 23802887 - 23803092
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  23802887 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttag 23802986  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||  |    |||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23802987 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 23803086  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  23803087 catgtt 23803092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 15214468 - 15214684
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||| |    
T  15214468 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcag 15214567  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| || ||         |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  15214568 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacc 15214667  T
Q  192 tatgttttgatggatct 208  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  15214668 tatgtcttgatgaatct 15214684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 51463490 - 51463622
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  51463490 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 51463589  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||| |||||    
T  51463590 cataaccgtttctaagttaatccaaaatttatg 51463622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 54364129 - 54364268
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | ||| |  || |||||||||| |||    
T  54364129 gtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagtaaacttagcataactatttccaag 54364228  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    |||||||||||||||  |   || ||||||||||||||||    
T  54364229 tcaacccaaaacttagagttcgtttccaaacttcaaaact 54364268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14185511 - 14185426
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatt 86  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  14185511 ctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaatt 14185426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15534750 - 15534658
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15534750 ctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19081764 - 19081989
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||| |||||||| |    
T  19081764 ctttccactggattttgtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcag 19081863  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac--------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||| | |||||||||||||        |||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||||    
T  19081864 cataaccgtttccaagtcaacccaaaactcaaggcttgtttacaaacttcaaaacatgagtattaggagtttaattaagatgtttaaaattatttgacct 19081963  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19081964 atgatatgatgaatctaacttggttt 19081989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 12033367 - 12033459
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12033367 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14049146 - 14049054
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14049146 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 44615857 - 44615765
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  44615857 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 50221933 - 50222025
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50221933 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 17376089 - 17376222
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||| | || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| | ||| |  |    
T  17376089 ctttccaatggatttaggtttacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaacttag 17376188  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17376189 cataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 17376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 30147484 - 30147392
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30147484 ctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Original strand, 13036362 - 13036448
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  13036362 actatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggat 13036448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 32461342 - 32461491
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgat-ttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||||||    
T  32461342 ttccattggccttggtttgatttgaaaataatgtttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgc 32461441  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
      || | |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  32461442 --aattgtttctatgtcaacccaaaccttatggattgtttcctaacttcaaa 32461491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 36038439 - 36038347
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36038439 ctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 49547367 - 49547459
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  49547367 ctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8044549 - 8044402
Alignment:
Q  4 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcct 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||| ||| | |||||| | |||||||||||      
T  8044549 tccattggccttggtttgacttgagaataatgttttgtttttgagttatgaagaaat-actctaaggaggttttaataaaattt-acgaaaattccgcac 8044452  T
Q  104 aactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  8044451 aattgtttctaagtcaacccaaaccttatggatagtttccaaacttcaaa 8044402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15117946 - 15118038
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  15117946 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 15118038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 19243269 - 19243177
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||   | || ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19243269 ctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 156
Target Start/End: Original strand, 19622955 - 19623094
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||| | ||| |  || |||||| ||| |||    
T  19622955 gtttgatttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaggtgggtcttgggaaaattttaaggaaacttagcataactaattccaag 19623054  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    |||||| ||| |||| ||  ||| ||||| ||||||||||    
T  19623055 tcaacctaaatcttagggtttgtttccaagcttcaaaact 19623094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29267896 - 29267830
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  29267896 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatgaa 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 7640780 - 7640872
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  7640780 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 7640872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 44772677 - 44772769
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  44772677 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatcagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 44772769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 9871151 - 9871194
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9871151 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9871194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 15884000 - 15884043
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15884000 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15884043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10272971 - 10272928
Alignment:
Q  211 cttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10272971 cttggtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaatatctat 10272928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 1837113 - 1837163
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1837113 ctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagtta 1837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 12134446 - 12134508
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  12134446 taggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgtcttgttaaatctaacttggttt 12134508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12611313 - 12611275
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12611313 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 12611275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 150)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 50755805 - 50756067
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50755805 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 50755904  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50755905 cataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 50756004  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50756005 atgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 50756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24546469 - 24546203
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatga----aaat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    ||||    
T  24546469 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaattaaat 24546370  T
Q  97 tccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtattta 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24546369 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 24546270  T
Q  189 acctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24546269 acctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 24546203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6156334 - 6156090
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6156334 ctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcg 6156235  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6156234 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 6156135  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6156134 atgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttg 6156090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15566142 - 15565880
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15566142 ctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcg 15566043  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15566042 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 15565943  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15565942 atgttgtgttggatctaacttggtttgacgtaaatatctttgttggatgatttaatatctata 15565880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9511589 - 9511836
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511589 ctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 9511688  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511689 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacct 9511788  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9511789 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 9511836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 9519564 - 9519811
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9519564 ctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 9519663  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9519664 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacct 9519763  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9519764 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 9519811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17207969 - 17207708
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17207969 ctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccg 17207871  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||        |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17207870 cataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacct 17207771  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17207770 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 17207708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 14152822 - 14153078
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14152822 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaattccg 14152921  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  14152922 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 14153021  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14153022 tatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 14153078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 54330729 - 54330970
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54330729 ctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 54330828  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54330829 cataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 54330928  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54330929 atgttgtgatgaatctaacttgatttgacgtgaatatctttg 54330970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14519891 - 14519681
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14519891 ctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 14519792  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14519791 cataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 14519692  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  14519691 atgttgtgatg 14519681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12952669 - 12952448
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12952669 tttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgc 12952570  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||         ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12952569 ataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttgtgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 12952470  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttgg 215  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  12952469 tgttgtgatagatctaacttgg 12952448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25104626 - 25104850
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25104626 ctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccg 25104724  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25104725 cataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttgtgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactt 25104824  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  25104825 atgttgtggtggatctaacttggttt 25104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 50351423 - 50351665
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50351423 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 50351522  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  50351523 cataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaaca 50351622  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50351623 tatgttgttatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 50351665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40807625 - 40807377
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40807625 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 40807526  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  40807525 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 40807426  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40807425 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 40807377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 50348449 - 50348705
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  50348449 ctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcag 50348548  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   ||||||| |||||         |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  50348549 tataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 50348648  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50348649 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 50348705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 54875906 - 54876154
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  54875906 ctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcag 54876005  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54876006 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 54876105  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54876106 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 54876154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11192709 - 11192462
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  11192709 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcag 11192611  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11192610 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 11192511  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11192510 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 11192462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17938155 - 17937931
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17938155 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccg 17938056  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||        | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17938055 cataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttgtttattatgagttcaattaagg-gtttaagagtatttaacct 17937957  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    | ||| || ||||||||| |||||||    
T  17937956 aggttgtgttggatctaatttggttt 17937931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40812462 - 40812199
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40812462 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 40812363  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  40812362 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 40812263  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40812262 tatgtggtgatgtatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctata 40812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18739524 - 18739300
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18739524 ctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccg 18739425  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||        | || |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18739424 cataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttgtttattatgagttcaattaagg-gtttaagagtatttaacct 18739326  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |  || || |||||||||||||||||    
T  18739325 agattgtgttggatctaacttggttt 18739300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 5206078 - 5206325
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5206078 tttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 5206177  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  5206178 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacct 5206277  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5206278 atgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 5206325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14441796 - 14441565
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14441796 tttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 14441697  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14441696 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacct 14441597  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtg 224  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14441596 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtg 14441565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 43889222 - 43889467
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43889222 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 43889321  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||     
T  43889322 cataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtatttaaca 43889421  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  43889422 tgtgttgtcatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 43889467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12511476 - 12511232
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12511476 tttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 12511377  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |   ||||||| | |||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  12511376 ataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 12511277  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||    
T  12511276 gtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaagatctttgttg 12511232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17685266 - 17685514
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17685266 ctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17685365  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         || |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  17685366 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatttaatc 17685465  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17685466 tatcttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17685514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17693696 - 17693449
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17693696 tttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 17693597  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  17693596 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacct 17693497  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17693496 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17693449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273855
Alignment:
Q  18 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  118 caacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatct 208  Q
     || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtgatggatct 44273887  T
Q  209 aacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44273886 aatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 44273855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 2841886 - 2842138
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2841886 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 2841985  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||   ||| |||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  2841986 cataac-cgttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 2842084  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatat 245  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2842085 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggataatat 2842138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17538725 - 17538488
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||    
T  17538725 ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacctttt 17538626  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgat 202  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17538625 ctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgat 17538526  T
Q  203 ggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17538525 ggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17538488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14508468 - 14508229
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  14508468 tggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 14508369  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    ||| ||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14508368 ttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 14508270  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14508269 gatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 14508229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17519296 - 17519544
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17519296 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17519395  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  || |||||  || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  17519396 cataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaaca 17519495  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17519496 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17519544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17534158 - 17534406
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17534158 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17534257  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  || |||||  || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  17534258 cataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaaca 17534357  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17534358 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17534406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35065004 - 35065251
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  35065004 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 35065103  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  35065104 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaat-aattcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 35065202  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35065203 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 35065251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17044594 - 17044392
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17044594 tttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaac 17044495  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17044494 ataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 17044395  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  17044394 atg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 10541881 - 10542126
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10541881 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 10541980  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||     
T  10541981 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 10542080  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10542081 tgtgttgtgatggatctaacttggttggacgtgaatatctttgttg 10542126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 14641973 - 14642178
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14641973 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 14642072  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14642073 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14642172  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  14642173 tatgtt 14642178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35354231 - 35353980
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgat---ttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||||||    
T  35354231 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaaaatt 35354132  T
Q  98 ccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaacta---------ggagttcaattaaggtgcttaagagtattta 188  Q
    | || ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||||||         |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  35354131 cagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagtattta 35354032  T
Q  189 acctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  35354031 acctatgttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggat 35353980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 18699897 - 18700141
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18699897 tttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 18699996  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa---------ctaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || ||||||||| |||| |   ||||||| ||||||         ||||||||| | ||||||   ||||||||||||||| |    
T  18699997 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatttaacat 18700096  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18700097 gtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 18700141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6159026 - 6158821
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      
T  6159026 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaa 6158927  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6158926 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 6158827  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  6158826 tatgtt 6158821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12470431 - 12470186
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12470431 ctttctagtggctttgatttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 12470332  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         ||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  12470331 cataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 12470232  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  12470231 tgtgttgtgattgatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 12470186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14671453 - 14671208
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14671453 ctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 14671354  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||     
T  14671353 cataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 14671254  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  14671253 tgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 14671208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 15931930 - 15932178
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15931930 ctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15932029  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| | | |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||| | |    
T  15932030 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttcatc 15932129  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15932130 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 15932178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33564758 - 33564555
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33564758 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 33564659  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    ||||||  |||||| || || |||||||||||||| |   ||||| | |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33564658 cctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 33564559  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  33564558 tatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 35961310 - 35961515
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  35961310 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattag 35961409  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35961410 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 35961509  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  35961510 tatgtt 35961515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41172793 - 41173042
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41172793 ctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 41172892  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||  || |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  41172893 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaac 41172992  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41172993 ctatgttgtgatggatgtaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 41173042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13519901 - 13519666
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||    
T  13519901 ctttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt 13519802  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaacctatgttttga 201  Q
    |||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||         ||||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||    
T  13519801 ctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 13519702  T
Q  202 tggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttgg 238  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13519701 tggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttgg 13519666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 20248408 - 20248608
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20248408 tttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 20248507  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| | | ||||||| || |||||||         |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20248508 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacct 20248607  T
Q  193 a 193  Q
    |    
T  20248608 a 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 22307006 - 22307254
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  22307006 ctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcag 22307105  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||     
T  22307106 cataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaact 22307205  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22307206 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 22307254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652256
Alignment:
Q  52 tgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttca 151  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  152 aa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22652309 aagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22652256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 53646495 - 53646686
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  53646495 tttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttc 53646594  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatg 195  Q
    ||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53646595 taagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6805384 - 6805589
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  6805384 ctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcag 6805483  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || | |||||||||||| |   ||||||| |||||         |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6805484 cataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacc 6805583  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  6805584 tatgtt 6805589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16979539 - 16979334
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  16979539 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattcag 16979440  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | | || |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16979439 catgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 16979340  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  16979339 tatgtt 16979334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18893253 - 18893120
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18893253 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 18893154  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  18893153 cagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 18893120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 179130 - 179263
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  179130 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 179229  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  179230 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 179263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2248393 - 2248598
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2248393 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 2248492  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | | ||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2248493 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 2248592  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  2248593 catgtt 2248598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 3394425 - 3394558
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3394425 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 3394524  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  3394525 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 3394558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 10833762 - 10833967
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10833762 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10833861  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||   ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10833862 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 10833961  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  10833962 catgtt 10833967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12276178 - 12276045
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12276178 ctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 12276079  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  12276078 cataaccatttctaagttaagccaaaacttatgg 12276045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18889993 - 18889860
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18889993 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattccg 18889894  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  18889893 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 18889860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 55292064 - 55292197
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  55292064 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 55292163  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55292164 cataaccctttttaagttaacccaaaacttatgg 55292197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 8928089 - 8928221
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8928089 tttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 8928188  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
     |||| |||||||||  || |||||||||||||    
T  8928189 ataaccatttctaagataatccaaaacttatgg 8928221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14966618 - 14966426
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||    
T  14966618 ttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 14966519  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| | |||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14966518 aagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14966426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 49900365 - 49900095
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  49900365 cttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 49900266  T
Q  101 cctaa------cta--tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagt 183  Q
    | |||      |||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         ||||| |||| ||||||||   ||||||||    
T  49900265 cataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggattttaagagt 49900166  T
Q  184 atttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49900165 atttaacctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgcgaatatccttgttggatgatttaatatctat 49900095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 13029709 - 13029904
Alignment:
Q  11 gctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||    
T  13029709 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13029808  T
Q  111 tctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13029809 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13029904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 17046754 - 17046639
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17046754 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 17046655  T
Q  102 ctaactatttctaagt 117  Q
     ||||  |||||||||    
T  17046654 ataaccgtttctaagt 17046639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43928980 - 43928741
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43928980 ctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 43928881  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||  ||||||||||  | |||||||||||||| |   ||||||  |||||         |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43928880 cataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaca 43928781  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43928780 tatgttctgatgaatcttatttggtttgacgtgaatatct 43928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 8631371 - 8631237
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8631371 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatcttattgaaattttacgaaaattccg 8631272  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      |||||| |||||| ||| |||||| || |||||    
T  8631271 tataactaattctaaatcatcccaaacctcatgga 8631237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11913350 - 11913140
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11913350 ctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 11913251  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  11913250 tataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaact 11913151  T
Q  192 tatgttttgat 202  Q
    |||||||||||    
T  11913150 tatgttttgat 11913140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 38311426 - 38311628
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  38311426 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 38311525  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaa-cttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||| ||| |   |||||| | || |||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38311526 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 38311625  T
Q  191 cta 193  Q
    |||    
T  38311626 cta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1988655 - 1988788
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1988655 ctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcag 1988754  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  1988755 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 1988788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10563338 - 10563133
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10563338 ctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10563239  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||  |||||||||| || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10563238 tataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 10563139  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  10563138 tatgtt 10563133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 24152867 - 24153000
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  24152867 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 24152966  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||||||    
T  24152967 cataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgg 24153000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 197
Target Start/End: Original strand, 13026117 - 13026312
Alignment:
Q  11 gctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||    
T  13026117 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13026216  T
Q  111 tctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13026217 tctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13026312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37038440 - 37038238
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaac-actccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaact 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||     
T  37038440 tggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 37038341  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| ||||||||||         ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37038340 atttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttt 37038241  T
Q  199 tga 201  Q
    |||    
T  37038240 tga 37038238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9533758 - 9533625
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9533758 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcag 9533659  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  9533658 caaaacattttccaagttaatccaaaacttatgg 9533625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10554896 - 10554763
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10554896 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10554797  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  10554796 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgg 10554763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19444132 - 19444007
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||| |    
T  19444132 tggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataacca 19444033  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  19444032 tttctaagtgaatccaaaacttatgg 19444007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 43550101 - 43550305
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  43550101 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 43550200  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||| | || |||||||||||||  |    |||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  43550201 ataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 43550300  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  43550301 atgtt 43550305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50243361 - 50243157
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  50243361 tttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 50243262  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || ||||||||||||   |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  50243261 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 50243162  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  50243161 atgtt 50243157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 13522833 - 13522959
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13522833 ctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 13522932  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaa 127  Q
    | |||  |||||||||| || ||||||    
T  13522933 cataatcatttctaagttaatccaaaa 13522959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16643634 - 16643500
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  16643634 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 16643535  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  16643534 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatgga 16643500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17513196 - 17513078
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| || |||| ||||||    
T  17513196 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttct 17513097  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttat 132  Q
    |||| || |||||||||||    
T  17513096 aagttaatccaaaacttat 17513078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 17670132 - 17670334
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17670132 cttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17670231  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  17670232 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaatc 17670331  T
Q  192 tat 194  Q
    |||    
T  17670332 tat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 14763384 - 14763481
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14763384 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 14763481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 23371130 - 23371227
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23371130 ctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 23371227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 46723049 - 46723146
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  46723049 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaattc 46723146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 51603023 - 51603120
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51603023 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 51603120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5215276 - 5215160
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  5215276 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcag 5215177  T
Q  101 cctaactatttctaagt 117  Q
    | ||||  |||||||||    
T  5215176 cataaccgtttctaagt 5215160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15465723 - 15465631
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15465723 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42156 - 41955
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || || ||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42156 ctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 42057  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42056 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 41957  T
Q  192 ta 193  Q
    ||    
T  41956 ta 41955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3803440 - 3803259
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccca 124  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| || | |    
T  3803440 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaa 3803341  T
Q  125 aaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    || |||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3803340 aatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6819738 - 6819609
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  6819738 ctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaag 6819639  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactt 130  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||    
T  6819638 gataaccgtttctaagttaatccaaaactt 6819609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 19568834 - 19568931
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19568834 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaaattc 19568931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 31224376 - 31224509
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  31224376 ctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcag 31224475  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  31224476 tataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 31224509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42324644 - 42324849
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  42324644 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcag 42324743  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| |  | ||||||||  || |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42324744 tataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 42324843  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  42324844 catgtt 42324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5223952 - 5223860
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5223952 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 22764053 - 22764145
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22764053 cttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 26054858 - 26054950
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26054858 ctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8023843 - 8023696
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||| | |||||||  || ||||||    
T  8023843 tggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataacta 8023744  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||    
T  8023743 tttttaagtcaacccaaaacttatggtttggtcccaaacttcaaaact 8023696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 16324964 - 16325095
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16324964 ctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttag 16325063  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||||    
T  16325064 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttat 16325095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 10989227 - 10989359
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10989227 ctttccaatggctttggtctgacatgaaaataatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10989325  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  10989326 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 10989359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18367181 - 18367386
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  18367181 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 18367280  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||   |||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | |||||         |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18367281 tataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18367380  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  18367381 catgtt 18367386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 51301024 - 51300927
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51301024 ctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 51300927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17046623 - 17046543
Alignment:
Q  160 agttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17046623 agttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17046543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14284650 - 14284500
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  |||| |||| | | |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  14284650 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaataaaatactctacggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 14284551  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     || | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  14284550 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaacttcaaa 14284500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6002576 - 6002443
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||   |||||  |    
T  6002576 ctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaattttaaagaaatttag 6002477  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  6002476 cataactatttccaagtcattccaatacttatgg 6002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567792
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | || |||||||||||| | |   ||||||| ||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactag 14567792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12305691 - 12305599
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12305691 ctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 14647526 - 14647621
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14647526 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14647621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 40039779 - 40039921
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||| | ||| |  || ||||||||||    
T  40039779 tttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaacacttcaagagggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttc 40039878  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac 155  Q
     |||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||    
T  40039879 caagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaagtttcaaaac 40039921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36528146 - 36528061
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  36528146 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 36528061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13436867 - 13436776
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  13436867 ctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaag-agatctcagtgaatttttatgaa 13436776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 19568953 - 19569037
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatc-taacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19568953 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggaccttaatttggtttgacgtgaatatctttgttg 19569037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 29544435 - 29544527
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  29544435 ctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 11986837 - 11986912
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaa 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  11986837 tggctttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11258934 - 11258848
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11258934 actatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatagatataatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 11258848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 233
Target Start/End: Original strand, 14568645 - 14568723
Alignment:
Q  155 ctaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14568645 ctaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 54521391 - 54521301
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatg 91  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  54521391 ctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg 54521301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 28848215 - 28848307
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28848215 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 11259059 - 11258984
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtct 76  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11259059 ctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 16453873 - 16453960
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatttt 88  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16453873 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaattttt 16453960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15978101 - 15978009
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||  | | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15978101 ctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 34159894 - 34159802
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  34159894 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 34159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 11479846 - 11479996
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| | | ||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| ||||||  | |     
T  11479846 ttccattggctttggtttgacttggaaataatgttttgatcttgagttataaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaatatcaca 11479945  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    ||| | || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  11479946 taattgttcctaagtcaacccaaaccttatggagtgtttccaaacttcaaa 11479996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 42353260 - 42353344
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggt-gcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42353260 taggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgtgatggatctaa-tgggtttgacgtgaatatctttgttggat 42353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 7780940 - 7781032
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7780940 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10247317 - 10247409
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||  ||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  10247317 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17463746 - 17463654
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  17463746 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 17463654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 55477059 - 55476967
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  55477059 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 55476967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14682790 - 14682707
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  14682790 actaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 14682707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 52989543 - 52989586
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52989543 actaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 52989586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5223716 - 5223626
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  5223716 ttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgg 5223626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 3264737 - 3264818
Alignment:
Q  5 ccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatt 86  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  3264737 ccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaatt 3264818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4656269 - 4656152
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |   ||||| |||||||||| || |||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||  | ||| |||||    
T  4656269 ctttggtttggcttgaaaatgatgtctatattttgggttatgatgacaatactccaagtatgtcttgataaaattttacgaaaattcaacttaagtattt 4656170  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaact 129  Q
     | |||||||||||||||    
T  4656169 ttcagtcaacccaaaact 4656152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 240
Target Start/End: Original strand, 17691427 - 17691476
Alignment:
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17691427 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17691476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 12902680 - 12902799
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||| | ||| |||| ||||||||||| ||| |  |||     
T  12902680 ttggtttgacttggaaataatgttttgttcttgagttatgaagaaaacaatctaaggaggttttactaaaactttacgaaaattccgcataa-ttgttcc 12902778  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  12902779 aagtcaacccaaaccttatgg 12902799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15465487 - 15465397
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  15465487 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 15465397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 26055094 - 26055184
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  26055094 ttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 26055184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15412999 - 15412947
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15412999 ctttccagtggcgtcgatttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 15412947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 17759093 - 17759149
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaag 69  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17759093 tttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 17759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Original strand, 19060413 - 19060469
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaag 69  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19060413 tttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 19060469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6819571 - 6819533
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6819571 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 6819533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 8928255 - 8928293
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8928255 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 8928293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13151384 - 13151434
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  13151384 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagtta 13151434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13153849 - 13153899
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  13153849 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgaattttggtttatgagtta 13153899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 13523001 - 13523039
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13523001 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 13523039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18889826 - 18889788
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18889826 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 18889788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18893052 - 18893014
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18893052 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 18893014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 37917171 - 37917233
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  37917171 taggagtttaattaagaggtttaagagcatttaacctatgtcttgttgaatctaacttggttt 37917233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 45606500 - 45606550
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45606500 ctttccagtggcgtcgttttgacttgaaaatgaattttggtttatgagtta 45606550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32259474 - 32259214
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32259474 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 32259375  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa-------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32259374 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 32259275  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  32259274 gttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctctgttagatgatttaatatctata 32259214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25921358 - 25921117
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921358 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 25921259  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25921258 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 25921159  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25921158 atgttgtgatgaaactaacttggtttgacgtgaatatctttg 25921117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13285337 - 13285082
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13285337 ctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccg 13285238  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13285237 cataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacct 13285138  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13285137 atattgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgtttgatgatttaat 13285082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 18455495 - 18455734
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18455495 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattccg 18455594  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18455595 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtatactatgagttcaattaaggtctttaagagtatttaacct 18455694  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  18455695 atgttgtgatgaatataacttgg-ttgacgtgaatatcttt 18455734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18585247 - 18585007
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18585247 ctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 18585148  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||        |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18585147 cataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtct-caaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacct 18585049  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18585048 aagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 18585007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22556877 - 22556622
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22556877 tttctagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgc 22556778  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||    
T  22556777 ataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacct 22556678  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22556677 attttgtgatggatctaacttggtttaacgtgaatatctttgttggatgatttaat 22556622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18398535 - 18398325
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18398535 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttc 18398436  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa--------ctaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||        ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18398435 taagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttgtgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatgg 18398336  T
Q  205 atctaacttgg 215  Q
    |||||||||||    
T  18398335 atctaacttgg 18398325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 20411097 - 20411305
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20411097 ttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgca 20411196  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        | || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20411197 taactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttgtgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctat 20411296  T
Q  195 gttttgatg 203  Q
    ||| |||||    
T  20411297 gttatgatg 20411305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29044939 - 29044787
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29044939 ctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccg 29044840  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29044839 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaa 29044787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7827601 - 7827353
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7827601 ctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 7827502  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  7827501 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 7827402  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7827401 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 7827353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 19655652 - 19655900
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19655652 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19655751  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19655752 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 19655851  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19655852 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 19655900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28947973 - 28947725
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28947973 ctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 28947874  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28947873 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 28947774  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28947773 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggat 28947725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17318545 - 17318793
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17318545 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17318644  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||  || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17318645 cataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 17318744  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17318745 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17318793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 17857116 - 17857269
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17857116 tttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgg 17857215  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac 155  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17857216 ataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaac 17857269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18703193 - 18702945
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |    
T  18703193 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcag 18703094  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  18703093 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacc 18702994  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  18702993 tatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggat 18702945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18709128 - 18708880
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| |    
T  18709128 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcag 18709029  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  18709028 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 18708929  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  18708928 tatgttgtgatggatctaatttagtttgacatgaatatctttgttggat 18708880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 19773133 - 19773377
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19773133 tttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagc 19773232  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  19773233 ataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 19773332  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||    
T  19773333 gtgttgtgatggatctaatttgattggacgtgaatatctttgttg 19773377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 23150698 - 23150937
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  23150698 tggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 23150797  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23150798 tttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 23150896  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23150897 gatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 23150937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18928352 - 18928149
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18928352 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 18928253  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||  || |||  |||||         |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18928252 cctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacc 18928153  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  18928152 tatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 15705034 - 15705279
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15705034 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15705133  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  15705134 cataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 15705233  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  15705234 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatttttgttg 15705279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23491594 - 23491839
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23491594 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23491693  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| || |||||| || |||||||||| | | |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  23491694 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23491793  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23491794 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttg 23491839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 23497192 - 23497437
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23497192 ctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23497291  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| || |||||| || |||||||||| | | |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  23497292 cataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaaca 23497391  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23497392 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttg 23497437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34141048 - 34141180
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34141048 ctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccg 34141147  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34141148 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 34153664 - 34153796
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34153664 ctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccg 34153763  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34153764 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 15938650 - 15938874
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  15938650 tttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagc 15938749  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa--------ctaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||         ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15938750 ataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattgagtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaaccta 15938849  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    || | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15938850 tgatatgatgaatcaaacttagttt 15938874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 25601700 - 25601915
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25601700 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcag 25601799  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  25601800 cacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 25601899  T
Q  192 tatgttttgatggatc 207  Q
    |||||  |||||||||    
T  25601900 tatgtggtgatggatc 25601915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31734334 - 31734089
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31734334 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 31734235  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag-------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
     |||   ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||       |||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  31734234 ataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctat 31734135  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31734134 gttgtgatagatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggat 31734089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20183192 - 20182982
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  20183192 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttag 20183093  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa--------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||| ||||         |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20183092 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacct 20182993  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
     |||| |||||    
T  20182992 ttgttatgatg 20182982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22152799 - 22153009
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  22152799 ctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttag 22152898  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa--------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||| ||||         |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22152899 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacct 22152998  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
     |||| |||||    
T  22152999 ttgttatgatg 22153009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 5834158 - 5834368
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5834158 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcag 5834257  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||  |||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5834258 cataaccgtttctaagt-aatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacc 5834356  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    |||||| |||||    
T  5834357 tatgttatgatg 5834368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23655968 - 23655838
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23655968 ctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcag 23655869  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  23655868 cataaccgtttctaagtcaatccaaaactta 23655838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 20733870 - 20734074
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  20733870 ctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa-tctatgaaaattcag 20733968  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20733969 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 20734068  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  20734069 tatgtt 20734074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27851632 - 27851427
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27851632 ctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 27851533  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27851532 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 27851433  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  27851432 tatgtt 27851427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20177374 - 20177164
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20177374 ctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcag 20177275  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||| ||| ||||||| || ||| |   || |||| |||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20177274 cataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacc 20177176  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    |||||| |||||    
T  20177175 tatgttatgatg 20177164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 15817181 - 15817311
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15817181 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15817280  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  15817281 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 15817311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 15891134 - 15891369
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15891134 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15891233  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| | ||||||||         || |||||||| |||| |||||||||      |    
T  15891234 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta------c 15891327  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15891328 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatcttt 15891369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 611369 - 611236
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  611369 ctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 611270  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  611269 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 611236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 15173878 - 15174011
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  15173878 ctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 15173977  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  15173978 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 15174011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18658835 - 18658630
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18658835 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 18658736  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || | |||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18658735 cataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18658636  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  18658635 catgtt 18658630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27125899 - 27126148
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27125899 ctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 27125998  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    || ||||  ||||||||| || ||||||||||  || |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27125999 gcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 27126098  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27126099 ctatgttgtgatggatttaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 27126148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22158617 - 22158827
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22158617 ctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcag 22158716  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||  || ||||||| || ||| |   || |||| |||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22158717 cataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacc 22158815  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    |||||| |||||    
T  22158816 tatgttatgatg 22158827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1254386 - 1254252
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1254386 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1254287  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1254286 tataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 1254252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 8767686 - 8767819
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8767686 ctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 8767785  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  8767786 cataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgg 8767819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22806378 - 22806281
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22806378 ctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 22806281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 25619380 - 25619585
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25619380 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 25619479  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25619480 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 25619579  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  25619580 catgtt 25619585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 27317981 - 27318226
Alignment:
Q  4 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcct 103  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| || |    
T  27317981 tccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 27318080  T
Q  104 aactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    |||  ||||||||| ||  |||||||   ||| |   || |||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||||     
T  27318081 aaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctac 27318180  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  27318181 gttgtgatggatctaatttagtttgacgtgaatatctttgttggat 27318226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 19443703 - 19443836
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19443703 ctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19443802  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  19443803 cataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgg 19443836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35057133 - 35057000
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |  |    
T  35057133 ctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttgg 35057034  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35057033 cataactatttccaagtcaaccaaaaacttatgg 35057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13764975 - 13764777
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  13764975 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttg-------agttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcag 13764883  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13764882 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacc 13764783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 19825924 - 19826043
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  19825924 tttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 19826023  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttat 132  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  19826024 taagttaatccaaaacttat 19826043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25347755 - 25347556
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |    
T  25347755 ctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcag 25347656  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| || |||||||         |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25347655 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 783
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  917 ctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 818  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||| | ||||||||| || | |||| |||||||    
T  817 tataattgtttctaagttaatctaaaatttatgga 783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4477287 - 4477190
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4477287 ctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 4477190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20556516 - 20556649
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  20556516 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 20556615  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  20556616 cataaccgtttataagttaatccaaaacttatgg 20556649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25807761 - 25807628
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || || ||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25807761 ctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 25807662  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  25807661 caaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 25807628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 156
Target Start/End: Original strand, 31161884 - 31162037
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||  ||     
T  31161884 ttccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaatttagca 31161983  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  31161984 tgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaatttcaaaact 31162037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 27330396 - 27330488
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27330396 tttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 27391136 - 27391228
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27391136 tttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 34296701 - 34296825
Alignment:
Q  10 ggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactat 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  |    
T  34296701 ggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgt 34296800  T
Q  110 ttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  34296801 ttctaagttaatccaaaacttatgg 34296825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 8759940 - 8760072
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8759940 ctttccaatggctgtggattgacatgaaaataatttt-ggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 8760038  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  8760039 cataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgg 8760072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 14979045 - 14979250
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  14979045 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcag 14979144  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||| | || ||||||||||| || |   | ||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14979145 tataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14979244  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  14979245 catgtt 14979250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23956467 - 23956334
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccca 124  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| || |||    
T  23956467 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcca 23956368  T
Q  125 aaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  23956367 aaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 23956334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23415533 - 23415441
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23415533 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 29847938 - 29848061
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatg--aaaattccgcctaactatt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||  ||| |||    
T  29847938 tttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatt 29848037  T
Q  111 tctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  29848038 tctaagttaatccaaaacttatgg 29848061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 16133093 - 16133226
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| |    
T  16133093 ctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaattcag 16133192  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| ||||| |||| || |  ||||||||||    
T  16133193 cataaccatttccaagttaatcggaaacttatgg 16133226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23838628 - 23838495
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  23838628 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattcag 23838529  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||| | |||| || |||||||||||||    
T  23838528 cacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgg 23838495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12942758 - 12942666
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12942758 ctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23221482 - 23221269
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| | || |    
T  23221482 tttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataatttttcc 23221383  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatgg 204  Q
    ||||| ||  |||| |||||||  ||| |||||||||||||        | |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| | |||     
T  23221382 taagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttgagtattaggagtttaattaagatgtttaagagtattaaacctaggttataatgc 23221283  T
Q  205 atctaacttggttt 218  Q
    ||||||||| ||||    
T  23221282 atctaacttcgttt 23221269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7430152 - 7430057
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7430152 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 7430057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 32277427 - 32277577
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  32277427 ttccattggccttagtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 32277526  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     || | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  32277527 caattgtttctaagtcaacctaaaccttatggattgtttccaaacttcaaa 32277577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 22523400 - 22523617
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22523400 tggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataacta 22523499  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactg--------tctccaaacttcaaaactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttg 200  Q
    ||| ||||| |||||| || ||||||  ||         ||| |||||| |  |||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||   ||    
T  22523500 tttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttgagtactaggagtttaataaggatgtttaagagtatttaacctatggcatg 22523599  T
Q  201 atggatctaacttggttt 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22523600 atggatctaacttggttt 22523617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 28288930 - 28289022
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28288930 ctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19234659 - 19234584
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19234659 gagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 19234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29044724 - 29044650
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29044724 gagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 29044650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 31022120 - 31022217
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31022120 ctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattc 31022217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27557291 - 27557199
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  27557291 ctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31163594 - 31163462
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| |  ||    
T  31163594 tttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgaggaaattttaaagaaacttagc 31163495  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
     |||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  31163494 ataactatttccaagtcattccaatacttatgg 31163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 15892028 - 15892094
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15892028 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 3007543 - 3007668
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||   ||| |  || ||||||    
T  3007543 tggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgggaaaattttaaagaaacttagcataacta 3007642  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||    
T  3007643 tttccaagtcattccaatacttatgg 3007668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 17883091 - 17883183
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17883091 ctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 19858516 - 19858608
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||    
T  19858516 ctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33862362 - 33862270
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33862362 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 14594056 - 14594143
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14594056 tggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 14594143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1540505 - 1540597
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1540505 ctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18334186 - 18334278
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  18334186 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 18334278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19234706 - 19234658
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatga 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19234706 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24423115 - 24423023
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  24423115 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 24423023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12742856 - 12742794
Alignment:
Q  31 tgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  12742856 tgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 26924041 - 26924133
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  26924041 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26924133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33864846 - 33864754
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  33864846 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 33864754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 16300644 - 16300794
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||| | | ||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| ||||||  |||     
T  16300644 ttccattggccttggtttgacttggaaataatgttttgatcttgagttataaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaatatcgca 16300743  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    ||| | || |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16300744 taattgttcctaagtcaacccaaactttatggattgtttccaaacttcaaa 16300794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27557055 - 27556965
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  27557055 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 27556965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 8055598 - 8055548
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  8055598 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagtta 8055548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 2290774 - 2290866
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  2290774 cttttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 2290866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22782779 - 22782703
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  22782779 gtttgacttgaaaatgatatttggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 22782703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415207
Alignment:
Q  79 gtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 23415207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 611202 - 611164
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  611202 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 611164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 16133260 - 16133298
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16133260 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 16133298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 19443870 - 19443908
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19443870 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 19443908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22823830 - 22824093
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22823830 ctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccg 22823929  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22823930 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacct 22824029  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctatac 256  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22824030 atgttgtgatggatctaacttagtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctatac 22824093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1643222 - 1642962
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643222 ctttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 1643125  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1643124 cataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 1643025  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1643024 atgttttgatggatctaacttgatttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 1642962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39060718 - 39060462
Alignment:
Q  7 agtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  39060718 agtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataac 39060619  T
Q  107 tatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||        |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  39060618 tatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttgtgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttg 39060519  T
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39060518 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 39060462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 24720119 - 24720357
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24720119 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgca 24720218  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24720219 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctat 24720318  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24720319 gttgcgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 24720357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50544473 - 50544239
Alignment:
Q  8 gtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50544473 gtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcggcataact 50544374  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  50544373 atttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 50544274  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  50544273 gatggatctaacttggtttgacgtgaatatatttg 50544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51323903 - 51323656
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51323903 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 51323804  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  51323803 ataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacat 51323704  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  51323703 atgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggat 51323656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18121233 - 18120993
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18121233 ctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcg 18121134  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18121133 cataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctgtgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18121034  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18121033 atgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18120993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14792985 - 14793195
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14792985 ctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcg 14793084  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14793085 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 14793184  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  14793185 atgttatgatg 14793195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12710517 - 12710258
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  12710517 ctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcag 12710418  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12710417 cataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 12710318  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatc 251  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  12710317 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctaggttggatgatttaatatc 12710258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6833836 - 6833602
Alignment:
Q  8 gtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaact 107  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  6833836 gtggatttggttttaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataact 6833737  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  6833736 atttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttgtttactgtgagttcaattaaggagcttaagagtatataacctatgttgt 6833637  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  6833636 gatgaatctaacttggtttgatgtgaatatatttg 6833602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 17902185 - 17902395
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  17902185 ctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctg 17902284  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17902285 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcatgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 17902384  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  17902385 atgttgtgatg 17902395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 21239718 - 21239966
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21239718 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 21239817  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  21239818 cataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatttttaacc 21239917  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21239918 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatttttgttggat 21239966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 7052478 - 7052726
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7052478 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctg 7052577  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||||||||  |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  7052578 cataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaac 7052677  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7052678 ctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggat 7052726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 4596268 - 4596516
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  4596268 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 4596367  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactagga---------gttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||||||| |         |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4596368 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatttaacc 4596467  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4596468 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 4596516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44892075 - 44891867
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44892075 tttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgc 44891976  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44891975 ataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgtatactatgagtacaattaaggtgtttaagagta-ttaaccta 44891877  T
Q  194 tgttttgatg 203  Q
    |||| |||||    
T  44891876 tgttatgatg 44891867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20588308 - 20588060
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20588308 ctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 20588209  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20588208 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 20588109  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20588108 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 20588060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20592846 - 20592598
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20592846 ctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 20592747  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20592746 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 20592647  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20592646 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 20592598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 51082845 - 51082597
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  51082845 ctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcag 51082746  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa---------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||          |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  51082745 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 51082646  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51082645 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 51082597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 20634057 - 20634306
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20634057 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 20634156  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaag-gtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||| ||||| |||||||||   || |   | ||||| |||||         |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  20634157 cataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtatttaac 20634256  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20634257 ctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 20634306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19676340 - 19676092
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19676340 ctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19676241  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||      
T  19676240 cataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaata 19676141  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19676140 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 19676092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 41227127 - 41227375
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41227127 ctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41227226  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  41227227 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41227326  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41227327 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgatggat 41227375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42912679 - 42912431
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  42912679 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 42912580  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||          |||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  42912579 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaata 42912480  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42912479 tatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 42912431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 14238035 - 14238283
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14238035 cttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 14238134  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa---------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||| ||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||          |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  14238135 cataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 14238234  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  14238235 tatgttgtgatgaatctaattttgtttgacgtgaatatctttgttggat 14238283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 9784766 - 9784976
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||| ||||||||     
T  9784766 ctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaattcca 9784865  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||        | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  9784866 cataactatctccaagtcaacccaaaacttatgaattgtttccaaactttaaagtttgtttattatgagttcaattaagaggcttgagagtatttaacct 9784965  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    |||||||||||    
T  9784966 atgttttgatg 9784976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 38887518 - 38887758
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  38887518 tggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 38887617  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |   | ||||  |||||         |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||     
T  38887618 tttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgttg 38887717  T
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887718 tgatggatctaa-ttggtttgacgtggatatctttgttggat 38887758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 16058737 - 16058985
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  16058737 ctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcag 16058836  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||| ||||||| |    
T  16058837 cataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatttaagc 16058936  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16058937 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 16058985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 21046473 - 21046716
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21046473 tttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 21046572  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  21046573 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaacct 21046672  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgtt 236  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21046673 atgttgtgatggatataatttggtttgatgtgaatatctttgtt 21046716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 41225874 - 41226116
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41225874 ctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41225973  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  41225974 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 41226073  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41226074 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttg 41226116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45496564 - 45496324
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  |||    
T  45496564 ctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgttt 45496465  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtg-cttaagagtatttaacctatgttttga 201  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |   | ||||| || |||||||         ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  45496464 ctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatttaacctatgttgtga 45496365  T
Q  202 tggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatga 242  Q
    |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45496364 ttaatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatga 45496324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28312977 - 28312844
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28312977 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 28312878  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  28312877 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 28312844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44822545 - 44822750
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44822545 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 44822644  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||| |||| || |||||||||| ||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44822645 cataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacc 44822744  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  44822745 tatgtt 44822750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 46198148 - 46198350
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  46198148 ctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcag 46198247  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46198248 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 46198347  T
Q  192 tat 194  Q
    |||    
T  46198348 tat 46198350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50001103 - 50000897
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50001103 ctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 50001004  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaa-cccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | |||| |||||||||| || || ||||||||||   |   || |||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50001003 cataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 50000904  T
Q  191 ctatgtt 197  Q
    |||||||    
T  50000903 ctatgtt 50000897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21180748 - 21180881
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21180748 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcag 21180847  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  21180848 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 21180881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 2332633 - 2332838
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  2332633 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 2332732  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2332733 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 2332832  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  2332833 catgtt 2332838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8276415 - 8276620
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  8276415 ctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcag 8276514  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactagga---------gttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||||||||   |   ||||||| |||||||||| |         |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8276515 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacc 8276614  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  8276615 tatgtt 8276620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16372380 - 16372247
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  16372380 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 16372281  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  16372280 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 16372247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 24815275 - 24815408
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24815275 ctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 24815374  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  24815375 caaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgg 24815408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 29764057 - 29764190
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29764057 ctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 29764156  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29764157 cataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 29764190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 7792276 - 7792408
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7792276 tttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 7792375  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  7792376 aaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgg 7792408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22350217 - 22350083
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  22350217 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 22350118  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22350117 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatgga 22350083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 20031325 - 20031446
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||    
T  20031325 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 20031424  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  20031425 taagttaatccaaaacttatgg 20031446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20437650 - 20437783
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  20437650 ctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 20437749  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  20437750 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 20437783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 296984 - 296851
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  296984 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcag 296885  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  296884 cacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgg 296851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 38057074 - 38057279
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  38057074 ctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcag 38057173  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38057174 tataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacc 38057273  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  38057274 tatgtt 38057279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 13881039 - 13881244
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  13881039 ctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 13881138  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | |||||||         || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13881139 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 13881238  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  13881239 catgtt 13881244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16401297 - 16401088
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16401297 ctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 16401198  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||   ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16401197 caaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 16401098  T
Q  192 tatgttttga 201  Q
     |||||||||    
T  16401097 catgttttga 16401088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22130488 - 22130693
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  22130488 ctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 22130587  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||| | || |||||||||||||  |    |||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22130588 cataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22130687  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  22130688 catgtt 22130693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23194974 - 23195107
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23194974 ctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 23195073  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  23195074 cataaccctttctaagttaatccaaaacttatgg 23195107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 45574475 - 45574560
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatt 86  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  45574475 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatt 45574560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29535620 - 29535528
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29535620 ctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 10812792 - 10812877
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatt 86  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  10812792 ctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatt 10812877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13227432 - 13227340
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13227432 ctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16362487 - 16362395
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16362487 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21659773 - 21659689
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaat 85  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21659773 ctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 21659689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21841335 - 21841243
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21841335 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 21922885 - 21922977
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21922885 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41373039 - 41372948
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41373039 tttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48301388 - 48301298
Alignment:
Q  165 aattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  48301388 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtgatagatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttgggtgatttaatatctata 48301298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13989434 - 13989342
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  13989434 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 13989342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 20708746 - 20708834
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatttta 89  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||    
T  20708746 ctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactttaagtagatcttggggaaatttta 20708834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 255
Target Start/End: Original strand, 11809199 - 11809269
Alignment:
Q  185 tttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  11809199 tttaacctatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgatttaatatttata 11809269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 23593327 - 23593409
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaa 83  Q
    ||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  23593327 ctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294541
Alignment:
Q  51 atgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 294541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23073322 - 23073252
Alignment:
Q  185 tttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  23073322 tttaacttatgttgtgatgaatctaacttgggttgacgtgaatatcattgttggatgatttaatatttata 23073252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16655985 - 16655844
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||  || |||| ||||    
T  16655985 ctttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccattt 16655887  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa 154  Q
     ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  16655886 ataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaa 16655844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 21474682 - 21474772
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  21474682 ttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 21474772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 29764228 - 29764266
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29764228 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29764266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 221
Target Start/End: Original strand, 28477375 - 28477420
Alignment:
Q  176 ttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgac 221  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28477375 ttaagaatattttacctatgttgtgatggatctaacttggtttgac 28477420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 255
Target Start/End: Original strand, 10813123 - 10813162
Alignment:
Q  216 tttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10813123 tttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 10813162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 21180915 - 21180953
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21180915 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21180953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 24815442 - 24815480
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24815442 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 24815480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28312810 - 28312772
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28312810 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 28312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 107)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22344670 - 22344408
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344670 ctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22344571  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||        |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22344570 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 22344471  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22344470 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 22344408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22356330 - 22356068
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356330 ctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22356231  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||        |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22356230 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 22356131  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22356130 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 22356068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 250
Target Start/End: Original strand, 20517542 - 20517798
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20517542 tttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgc 20517641  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20517642 ataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 20517741  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatat 250  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20517742 tgttgcgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatat 20517798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22483375 - 22483120
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22483375 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22483276  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22483275 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactt 22483176  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22483175 atgttgtgatggatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaat 22483120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36305287 - 36305025
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36305287 ctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcg 36305188  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||        |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  36305187 cataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacct 36305088  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  36305087 atgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatacctttgttggatgatttaatatctata 36305025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 4381216 - 4381457
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4381216 ctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 4381315  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4381316 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 4381415  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4381416 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 4381457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 17978842 - 17979080
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17978842 ttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgga 17978941  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17978942 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctat 17979041  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17979042 gttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 17979080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817126
Alignment:
Q  4 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttg--gtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18817085  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18817086 tgttgtgatgaatgtaacttggtttgacgtgaatatctttg 18817126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22258727 - 22258937
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258727 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22258826  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22258827 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaact 22258926  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  22258927 atgttatgatg 22258937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22474372 - 22474139
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  22474372 tggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaactccacataatta 22474273  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttg 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22474272 tttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttgtg 22474173  T
Q  201 atggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22474172 atgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 22474139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23670277 - 23670067
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23670277 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccg 23670178  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23670177 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 23670078  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  23670077 atgttatgatg 23670067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 36732947 - 36733178
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36732947 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccg 36733046  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||          |||||||||||    
T  36733047 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgcactatgagttcaattaag----------gtatttaacct 36733136  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36733137 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgttaatatctttg 36733178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38989094 - 38988884
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38989094 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 38988995  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38988994 cataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 38988895  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  38988894 atgttatgatg 38988884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39020191 - 39019981
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39020191 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 39020092  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39020091 cataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 39019992  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  39019991 atgttatgatg 39019981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815487
Alignment:
Q  34 tttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  134 gactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtgg 225  Q
    || |||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttcacgtga 18815478  T
Q  226 atatctttg 234  Q
    |||| ||||    
T  18815479 atatatttg 18815487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21513942 - 21513709
Alignment:
Q  7 agtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaac 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21513942 agtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaag-aggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataac 21513844  T
Q  107 tatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||     
T  21513843 tatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttttgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatattttg 21513744  T
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  21513743 tgatgaatttatcttggtttgacgtgaatatcttt 21513709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5761162 - 5760914
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5761162 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 5761063  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| |||||| || || | |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5761062 cataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 5760963  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5760962 tatgttgtgatggatctaaattggtttgacgtgaatatctttgttggat 5760914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18834100 - 18833837
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18834100 cttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 18834001  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| || | |||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  18834000 cataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 18833901  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18833900 tatatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctata 18833837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 36405483 - 36405693
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36405483 ctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 36405582  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  36405583 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtatttaacct 36405682  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    | ||| |||||    
T  36405683 aagttatgatg 36405693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 20084061 - 20084305
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20084061 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 20084160  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||||||  ||||||||||  || |   ||||||| |||||        |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  20084161 cataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaactagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagattatttaacc 20084260  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20084261 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttg 20084305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 6102176 - 6102423
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6102176 ctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 6102275  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  6102276 cataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatttaacc 6102375  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6102376 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggat 6102423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 20178944 - 20179192
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  20178944 ctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 20179043  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||| || ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  20179044 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacc 20179143  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20179144 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 20179192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19140394 - 19140146
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19140394 ctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19140295  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  19140294 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatttaacc 19140195  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19140194 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 19140146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24907403 - 24907180
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24907403 ctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccg 24907304  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  24907303 cataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttcc-aacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatatttaacct 24907205  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    || || | | ||||||||||||||||    
T  24907204 atattgt-aaggatctaacttggttt 24907180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 5082635 - 5082897
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5082635 ctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcag 5082734  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  5082735 cataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaact 5082834  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5082835 tatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctat 5082897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26454340 - 26454135
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26454340 ctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 26454241  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26454240 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 26454141  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  26454140 tatgtt 26454135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39936434 - 39936681
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  39936434 ctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 39936533  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| | | |   ||||||  || |||||||         |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  39936534 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacc 39936632  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39936633 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 39936681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21399338 - 21399187
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21399338 tttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgc 21399239  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21399238 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaa 21399187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21793831 - 21793680
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21793831 tttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgc 21793732  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21793731 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaa 21793680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19882597 - 19882392
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19882597 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 19882498  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || || ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19882497 cataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacc 19882398  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  19882397 tatgtt 19882392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 6573480 - 6573636
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6573480 ctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttt-gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 6573578  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  6573579 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactag 6573636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15635603 - 15635808
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15635603 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 15635702  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15635703 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 15635802  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  15635803 catgtt 15635808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 41680557 - 41680762
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  41680557 ctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 41680656  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41680657 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 41680756  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  41680757 tatgtt 41680762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 17437741 - 17437999
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17437741 ctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 17437840  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||| | || |||||||||||||| |   ||||||  |||||||         ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  17437841 cacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatttaacc 17437940  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatc 251  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||    
T  17437941 tatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaat-tccttgttggatgatttaatatc 17437999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22207896 - 22207693
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22207896 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 22207797  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact---------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||| | || |||||||||||||| |   ||||||| | ||||||         ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22207796 cataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22207697  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  22207696 tatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 42818331 - 42818578
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  42818331 tttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagc 42818430  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||| ||    
T  42818431 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatct 42818530  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| | |||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  42818531 atggtgtgatggatctaatttgatttgacgtgaatttatttgttggat 42818578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 38185509 - 38185642
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  38185509 ctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 38185608  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  38185609 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 38185642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 39694951 - 39695156
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  39694951 ctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 39695050  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39695051 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacc 39695150  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  39695151 tatgtt 39695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 19808033 - 19808225
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||    
T  19808033 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttct 19808132  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||         |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19808133 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19808225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 364417 - 364284
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  364417 ctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 364318  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  364317 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 364284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Original strand, 17460718 - 17460915
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | ||||      
T  17460718 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccg 17460817  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |   | ||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17460818 tttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17460915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21326361 - 21326494
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21326361 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 21326460  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  21326461 cataaccagttctaagttaatccaaaacttatgg 21326494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23478709 - 23478576
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  23478709 ctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgcag 23478610  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  23478609 cataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 23478576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23914552 - 23914308
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  23914552 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaattcag 23914453  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||         ||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||     
T  23914452 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaaggggtttaacagtatttaaca 23914354  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23914353 tgtgttatgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 23914308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20455625 - 20455493
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20455625 ctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcag 20455526  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  20455525 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 20455493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20460603 - 20460471
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20460603 ctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcag 20460504  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  20460503 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 20460471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 21861052 - 21861248
Alignment:
Q  10 ggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  21861052 ggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgt 21861151  T
Q  110 ttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21861152 ttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361874
Alignment:
Q  41 tttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtc 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |       
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  141 tccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    ||||||  ||||||||||         ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgatgtgaatatct 361874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118813
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||| || |||| ||  || ||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact---------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatc 207  Q
    |||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||          ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttgagtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgatggatt 18118802  T
Q  208 taacttggttt 218  Q
    |||||||||||    
T  18118803 taacttggttt 18118813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 44432491 - 44432357
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  44432491 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattca 44432392  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  44432391 gcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 44432357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44477053 - 44476923
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44477053 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 44476954  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  44476953 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 44476923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44480315 - 44480185
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44480315 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 44480216  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  44480215 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 44480185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17795861 - 17795728
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17795861 ctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17795762  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  17795761 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 17795728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18024118 - 18024323
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18024118 ctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 18024217  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||  |   |||||   ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18024218 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18024317  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  18024318 tatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20454868 - 20454735
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20454868 ctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcag 20454769  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  20454768 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 20454735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22237677 - 22237834
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  22237677 ctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcag 22237776  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  22237777 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 22237834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 44522849 - 44522982
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  44522849 ctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcag 44522948  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  44522949 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 44522982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25757769 - 25757556
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| || ||| |||| |    
T  25757769 tttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcc 25757670  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatgg 204  Q
    ||||| || |||||  ||||||  ||| |||||||||||||        | |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25757669 taagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttgagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatgg 25757570  T
Q  205 atctaacttggttt 218  Q
    || |||||||||||    
T  25757569 atttaacttggttt 25757556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 42559959 - 42560082
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||      
T  42559959 tggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccg 42560058  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  42560059 tttctaagttaatccaaaacttat 42560082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39364153 - 39364019
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||  || |||||||| |    
T  39364153 ctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcag 39364054  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  39364053 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgga 39364019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19880449 - 19880252
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  19880449 tggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 19880350  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  |   ||||||  || |||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19880349 tttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19880252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25483897 - 25484030
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25483897 ctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 25483996  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||   ||||||||| || |||||||||||||    
T  25483997 cataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgg 25484030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16198463 - 16198371
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16198463 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 21579631 - 21579835
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |     
T  21579631 tttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagt 21579730  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | |||||         |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21579731 ataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacct 21579830  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  21579831 atgtt 21579835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23660844 - 23660688
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  23660844 ctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 23660745  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaacta 157  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | |||||||||    
T  23660744 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25295749 - 25295536
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| || |||||||||| || ||| |||| |    
T  25295749 tttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataattattcc 25295650  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatgg 204  Q
    ||||| || |||||  ||||||  ||| |||||||||||||        | |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25295649 taagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttgagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatgg 25295550  T
Q  205 atctaacttggttt 218  Q
    || |||||||||||    
T  25295549 atttaacttggttt 25295536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32949991
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctcc 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||    
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  144 aaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||  ||||||||||         ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgttgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 32949991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 42266018 - 42266102
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaat 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42266018 ctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 42266102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24624285 - 24624171
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  24624285 tttggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttc 24624186  T
Q  113 taagtcaacccaaaa 127  Q
    ||||| |||||||||    
T  24624185 taagtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 8728360 - 8728485
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8728360 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 8728459  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||    
T  8728460 cataaccgtttctaagttaatccaaa 8728485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11775327 - 11775194
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccca 124  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| || |||    
T  11775327 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcca 11775228  T
Q  125 aaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  11775227 aaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 11775194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21321763 - 21321896
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  21321763 ctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcag 21321862  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  21321863 cataaccagttctaagttaatccaaaacttatgg 21321896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Original strand, 21495115 - 21495264
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  21495115 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 21495214  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa 152  Q
     || | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21495215 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaacttcaa 21495264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 27941312 - 27941445
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  27941312 ctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 27941411  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  27941412 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 27941445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22313445 - 22313234
Alignment:
Q  16 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaa 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | ||| |  || |||||||||  ||    
T  22313445 ggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaacactgcaagtgggtcttggagaaattttaaggaaacttagcataactattttcaa 22313346  T
Q  116 gtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggat 206  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||         | ||||| || |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  22313345 gtcaacccaaaacctatggtttgtttccaaacatcaaaatctttagtattaggatttaaattaaggtgtttaatggtatttgacctatgttgtgatggat 22313246  T
Q  207 ctaacttggttt 218  Q
    ||||||||||||    
T  22313245 ctaacttggttt 22313234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 19332016 - 19332223
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||  || ||| |||| |||||    
T  19332016 gtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagtaaaactt--tgaaaatttagcataaatattcctaag 19332113  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatct 208  Q
    | || ||||| |||||||  ||| |||||||||||||        | | ||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19332114 ttaaaccaaatcttatggtttgtttccaaacttcaaaatttaagtattcggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatct 19332213  T
Q  209 aacttggttt 218  Q
    ||||||||||    
T  19332214 aacttggttt 19332223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24239044 - 24238819
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||   ||||||||| | ||| |  |    
T  24239044 ctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaagagggtcttgaagaaattttaaggaaacttag 24238945  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||        |||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  24238944 cataattatttccaagtcaacccaaaacttatcgtttgtttccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaatgtgtttaagattaattaacct 24238845  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    || | ||| || ||||||||||||||    
T  24238844 atatcttgttgaatctaacttggttt 24238819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 18677658 - 18677750
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18677658 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 29763292 - 29763388
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 97  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29763292 ctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatt 29763388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14397334 - 14397426
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14397334 ctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17501554 - 17501343
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  || ||||| | ||||| || || ||||||||||| |  |    
T  17501554 ctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaattag 17501455  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||         |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17501454 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacc 17501355  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    ||||| ||||||    
T  17501354 tatgtcttgatg 17501343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 20176519 - 20176637
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| | |||||  ||     
T  20176519 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 20176618  T
Q  103 taactatttctaagtcaac 121  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20176619 taactatttccaagtcaac 20176637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 20221246 - 20221364
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| | |||||  ||     
T  20221246 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 20221345  T
Q  103 taactatttctaagtcaac 121  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  20221346 taactatttccaagtcaac 20221364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 4541967 - 4542059
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4541967 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24485637 - 24485729
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24485637 ctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5080471 - 5080396
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  5080471 gagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtgatgaatcttacttggtttgacgtgaatatatttg 5080396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122388
Alignment:
Q  157 aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctagattgtgatggatctaacttggttt 18122388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 1484970 - 1484878
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  1484970 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 1484878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18827851 - 18827755
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  18827851 tttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaaattc 18827755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 20045789 - 20045881
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  20045789 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20045881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22002321 - 22002229
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  22002321 ctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaatttgtatgaa 22002229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 45559644 - 45559817
Alignment:
Q  53 gatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa 152  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||  | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  45559644 gatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaa 45559743  T
Q  153 aact--------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    || |        |||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45559744 aatttgagtattaggattttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatctaacttggttt 45559817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Original strand, 21345984 - 21346067
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21345984 actaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 21346067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 5852886 - 5852978
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  5852886 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 5852978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14409038 - 14409130
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  14409038 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 14409130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 45290141 - 45290233
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||| | |||||||  ||| || |||||||||    
T  45290141 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatactcaacgtaggtcacagttaatttttatgaa 45290233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22885905 - 22885755
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | | ||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| ||||||  |||     
T  22885905 ttccattggccttgatttgacttggaaatgatgttttgatcttgagttataaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaatatcgca 22885806  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    ||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22885805 taattgttcctaagttaacccaaaccttatggattgtttccaaacttcaaa 22885755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 134
Target Start/End: Original strand, 14397540 - 14397660
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |   |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||  ||||||    
T  14397540 ttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttct 14397639  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  14397640 aagttaatccaaaacttatgg 14397660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Original strand, 8414196 - 8414241
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagt 70  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  8414196 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagt 8414241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14824343 - 14824291
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14824343 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaattatttttggtttatgagttatg 14824291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 193
Target Start/End: Original strand, 8414295 - 8414334
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8414295 actaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8414334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 21321925 - 21321968
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21321925 actatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 193
Target Start/End: Original strand, 8728527 - 8728561
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8728527 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20454701 - 20454663
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20454701 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 20454663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24624134 - 24624072
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  24624134 taggagtttaattaggatgtttaagagtatttaacctatggaatgatagatctaacttggttt 24624072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 25484064 - 25484102
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25484064 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 25484102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4483848 - 4483756
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  4483848 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaatttttatgaa 4483756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 25587110 - 25587372
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25587110 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcca 25587209  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||  ||||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  25587210 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaagatgtttaagaaaatttaacct 25587309  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25587310 atgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 25587372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22686468 - 22686218
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686468 ctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 22686369  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22686368 cacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 22686269  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgat 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22686268 atgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaataactttgttggatgat 22686218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 28345499 - 28345748
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28345499 ctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaattccg 28345598  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||    
T  28345599 cataactatttctaagccaaccaaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcatttaaggtgtttaatagtacttaatct 28345698  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatga 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28345699 atgttgtgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatga 28345748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21335876 - 21336116
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21335876 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaattccg 21335975  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21335976 cataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacct 21336075  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21336076 atgttgggatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 21336116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1384109 - 1384350
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1384109 ctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcca 1384208  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||        || | |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1384209 cataactatttctaagtcaactcaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttgtgtaccatgagttctattaaggtgtttacgagtatttaacct 1384308  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1384309 atgctgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 1384350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21316085 - 21316325
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21316085 ctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 21316184  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21316185 cttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 21316284  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  21316285 atgttgtgatgaatctatcttgatttgacgtgaatatcttt 21316325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22690309 - 22690099
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22690309 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcca 22690210  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22690209 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcagtgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacct 22690110  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  22690109 atgttatgatg 22690099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22694905 - 22694695
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22694905 ctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcca 22694806  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22694805 cataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcagtgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacct 22694706  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  22694705 atgttatgatg 22694695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29113979 - 29113764
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  29113979 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattc 29113880  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  29113879 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttgtgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatt 29113780  T
Q  204 gatctaacttggtttg 219  Q
    | |||||||| |||||    
T  29113779 ggtctaactttgtttg 29113764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22332345 - 22332121
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22332345 ctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtgaa-ttttatgaaaattccg 22332247  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||        |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22332246 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattgtgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacct 22332147  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22332146 atgttgtgatgaatctaacttggttt 22332121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23610105 - 23609865
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23610105 ctttccagtgtatttagtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctg 23610006  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23610005 cataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 23609906  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609905 atgttgtggtaaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 23609865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 43707708 - 43707970
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43707708 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 43707807  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||   |||||||| || | |||||||||||| |   || |||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43707808 cataac-cgttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 43707906  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43707907 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 43707970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 27484893 - 27485141
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27484893 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcag 27484992  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||     
T  27484993 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaca 27485092  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27485093 tatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggat 27485141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9975557 - 9975310
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9975557 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 9975458  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  9975457 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacct 9975358  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9975357 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 9975310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Original strand, 23068874 - 23069118
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23068874 tttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 23068973  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  23068974 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 23069073  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  23069074 gtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 23069118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36839799 - 36839552
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36839799 tttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 36839700  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||   ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  36839699 ataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacct 36839600  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36839599 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 36839552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5031553 - 5031801
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5031553 ctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 5031652  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||| || | || |||||||||||||||     
T  5031653 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatttaaca 5031752  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5031753 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 5031801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 23969046 - 23969294
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |  | | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23969046 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 23969145  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  23969146 cataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 23969245  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23969246 tatgttgtgattgatctaatttggtttgacgtaaatatctttgttggat 23969294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24781263 - 24781511
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  24781263 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 24781362  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  24781363 cataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatttaacc 24781462  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24781463 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 24781511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24273682 - 24273921
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24273682 ctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 24273781  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24273782 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacc 24273881  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24273882 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 24273921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25183816 - 25183611
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25183816 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 25183717  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||||         || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25183716 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 25183617  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  25183616 tatgtt 25183611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9785211 - 9784966
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9785211 ctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 9785112  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa---------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||| | ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||         ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||     
T  9785111 cataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 9785012  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| ||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  9785011 tgtgttgtgatgaatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 9784966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18358392 - 18358597
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  18358392 cttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 18358491  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18358492 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18358591  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  18358592 tatgtt 18358597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17307116 - 17306868
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17307116 ctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17307017  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||| ||| || |||||||||| ||| |   ||||||  ||||||||||         |||||||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  17307016 cataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatttaaca 17306917  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17306916 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 17306868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 19201623 - 19201887
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaac-actccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19201623 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattca 19201722  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    || ||||  ||||||||| || |||||||||||  | |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  19201723 gcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 19201822  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  19201823 ctatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatgtata 19201887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 23778718 - 23778871
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatg-aaaattcc 99  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23778718 ctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaaattcc 23778817  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||    
T  23778818 gcataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttcgaaacttcaaa 23778871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27472882 - 27472677
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27472882 ctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 27472783  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27472782 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaact 27472683  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  27472682 tatgtt 27472677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24515815 - 24515567
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24515815 ctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 24515716  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||   |||||| || || |||||||||| ||| |   | ||||  ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24515715 tataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatc 24515616  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  24515615 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacatgaatatctttgttggat 24515567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 21081394 - 21081599
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  21081394 ctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttag 21081493  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21081494 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacc 21081593  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  21081594 tatgtt 21081599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24884015 - 24883811
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24884015 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 24883916  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24883915 tataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 24883816  T
Q  192 tatgt 196  Q
     ||||    
T  24883815 catgt 24883811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26903787 - 26903585
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26903787 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 26903688  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26903687 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 26903588  T
Q  192 tat 194  Q
    |||    
T  26903587 tat 26903585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21368736 - 21368480
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  21368736 ctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaa 21368637  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||| ||||||| |   || |||| |||||         |||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||    
T  21368636 cataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacc 21368537  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    |||||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21368536 tatgtggtaatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaat 21368480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 28652930 - 28653173
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaa 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  28652930 cagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataa 28653029  T
Q  106 ctatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |  ||| || || || || ||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  28653030 ccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatct 28653129  T
Q  197 tttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28653130 tgtgatggatctaatttggtttcacgtgaatatctttgttggat 28653173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31520746 - 31520615
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31520746 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcag 31520647  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||    
T  31520646 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttat 31520615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21915250 - 21915046
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21915250 tttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 21915151  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21915150 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 21915051  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  21915050 atgtt 21915046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 41301396 - 41301528
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41301396 ctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 41301495  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    |  |||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  41301496 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 41301528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21073150 - 21073283
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21073150 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 21073249  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21073250 cacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgg 21073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23338823 - 23338956
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23338823 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 23338922  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23338923 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 23338956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 34858808 - 34859013
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  34858808 ctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcag 34858907  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34858908 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 34859007  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  34859008 tatgtt 34859013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 34873870 - 34874075
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||| |    
T  34873870 ctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcag 34873969  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34873970 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 34874069  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  34874070 tatgtt 34874075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6483148 - 6483018
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6483148 ctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 6483049  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  6483048 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 6483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 6486615 - 6486485
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6486615 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 6486516  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  6486515 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 6486485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 20590745 - 20590875
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  20590745 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 20590844  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||| ||||| || ||||||||||    
T  20590845 cataaccctttttaagttaatccaaaactta 20590875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 36734909 - 36735063
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |   |    
T  36734909 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttgac 36735008  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
     |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||| |||||||    
T  36735009 ataactatttccaagtcaacctaaaacttatggtttgttcccaaactccaaaact 36735063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 6260801 - 6260898
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6260801 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 6260898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 10039557 - 10039690
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10039557 ctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 10039656  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  10039657 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 10039690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 28349538 - 28349413
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||| |    
T  28349538 tggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaacca 28349439  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  28349438 tttctaagttaatccaaaacttatgg 28349413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 18388720 - 18388915
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  18388720 ctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcag 18388819  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtattt 187  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18388820 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18388915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 22173451 - 22173585
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  22173451 ctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttag 22173550  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22173551 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 22173585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 19662078 - 19662175
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19662078 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 19662175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20915733 - 20915531
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20915733 tttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 20915634  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||| ||||| |||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20915633 ataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacct 20915534  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  20915533 atg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 9242381 - 9242256
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |    
T  9242381 tggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaacca 9242282  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| |||| || |||||||||||||    
T  9242281 tttccaagttaatccaaaacttatgg 9242256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20261788 - 20261696
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20261788 ctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31345748 - 31345656
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  31345748 cttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38968048 - 38967956
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38968048 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24841540 - 24841356
Alignment:
Q  42 ttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtct 141  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||| | ||| |   | |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  24841540 ttttgagttttgatgaaaacactccaagtggatcttgaagaaattttaaggaaacttaacataactatttccaagtcaacccaaaacttatgggttgttt 24841441  T
Q  142 ccaaacttcaaaactag--------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||||| ||||||| |        |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24841440 ccaaactccaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtaagggatctaacttggttt 24841356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 28031906 - 28032056
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  28031906 ttccattggccttggtttggcttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 28032005  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     || | |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||    
T  28032006 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattatttccaaacttcaaa 28032056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10684356 - 10684448
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10684356 ctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24897789 - 24897881
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24897789 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24900272 - 24900364
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24900272 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24902749 - 24902841
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24902749 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24905226 - 24905318
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24905226 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24907701 - 24907793
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24907701 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 2524171 - 2524238
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaag 69  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2524171 tttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaag 2524238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 22255841 - 22255768
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggt 74  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  22255841 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23136148 - 23136056
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23136148 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20272959 - 20272760
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||  ||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||    
T  20272959 aaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaa 20272860  T
Q  127 acttatggactgtctccaaacttcaaaac--------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||| ||| ||| |  ||||||| ||||        |||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||  | |||||  |||||||||||||    
T  20272859 acttaaggattgtttgtaaacttccaaactcgagtattaggagttaaattaaggtgtttaagattgtttaacatattatatgatgtgtctaacttggttt 20272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15632839 - 15632718
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||| |||  ||| | ||||||| ||| ||||||    
T  15632839 tggctttggtttgacttggaaataagttttaatttttgagttatgttacaaaaactccaaggaggtcttattgaggtttcacgaaaatttcgcataacta 15632740  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaactt 130  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  15632739 actctaagtcaacccaaaactt 15632718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40911952 - 40911863
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttat 90  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||    
T  40911952 ctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18809511 - 18809419
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  18809511 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 18809419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17203917 - 17203787
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||  |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  17203917 ttccattggctttggtttgacttggaaataatgttttgttcttgagttatgaagaaaacaatctaaagaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 17203818  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17203817 taa-ttgttctaagtcaacccaaaccttatgg 17203787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 22501429 - 22501375
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22501429 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 22509363 - 22509309
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22509363 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 23711607 - 23711699
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  23711607 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23711699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26505947 - 26505855
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  26505947 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26505855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 26508425 - 26508333
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  26508425 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26508333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 27920358 - 27920450
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  27920358 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 27920450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 28577667 - 28577615
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28577667 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 32039092 - 32039184
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  32039092 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 32039184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 7186995 - 7186942
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatga 54  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7186995 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 571966 - 571874
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  571966 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 571874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24302300 - 24302220
Alignment:
Q  50 tatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaactt 130  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||| || |||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24302300 tatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39682882 - 39682790
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  39682882 ctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39682790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24281274 - 24281174
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24281274 aaaatgaattttagattttcagttatagtgaaaatactacaagtaggtcttgttgcaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtgaacccaaa 24281175  T
Q  127 a 127  Q
    |    
T  24281174 a 24281174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31345529 - 31345441
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||    
T  31345529 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttat 31345441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 22173618 - 22173656
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22173618 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 22173656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22501335 - 22501293
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22501335 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 22501293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22509269 - 22509227
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22509269 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgt 22509227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Original strand, 41301563 - 41301601
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41301563 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 41301601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23131430 - 23131338
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  23131430 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23131338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23133897 - 23133805
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  23133897 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 23133805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 34402116 - 34402208
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  34402116 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 34402208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 145)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Original strand, 14161279 - 14161540
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14161279 tttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 14161378  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14161379 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaaccta 14161478  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14161479 tgttttgatggatcttacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 14161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3287619 - 3287370
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3287619 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 3287520  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  | |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||     
T  3287519 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagaatatttaacgtatgttg 3287420  T
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3287419 tgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 3287370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25942066 - 25941804
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25942066 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 25941967  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | | |  ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25941966 catgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 25941867  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25941866 atgttgtgatggaactaacttggtttgacgtgaatatctttattggatgatttaatatctata 25941804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 48213369 - 48213609
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48213369 tttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 48213468  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48213469 ataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcatgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaaccta 48213568  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48213569 tgttgtgatgaatctaacttggtttgacgcgaatatctttg 48213609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 4691320 - 4691560
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4691320 tttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 4691419  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4691420 ataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttgtgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaaccaa 4691519  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4691520 tgttgtgatgaatctaactaggtttgacgtgaatatctttg 4691560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 13745199 - 13745462
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13745199 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 13745298  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||||||||| | |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13745299 cataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacc 13745398  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13745399 tatgttgtgatgaatctaacttggtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 13745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 18875269 - 18875525
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18875269 ctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccg 18875368  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact---------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||         ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  18875369 cataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 18875468  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18875469 tatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 18875525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 24270418 - 24270646
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24270418 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattttt 24270517  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag--------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatgga 205  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24270518 aagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaa 24270617  T
Q  206 tctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24270618 tttaacttggtttgacgtgaatatctttg 24270646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 43277166 - 43277423
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttat-gaaaattcc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43277166 ctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattcc 43277265  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  43277266 gcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 43277365  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43277366 atatgttgtgatggatctaacttggtttagcgtgaatatctttgttggatgatttaat 43277423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15576254 - 15576495
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15576254 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaaattctg 15576353  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15576354 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtctactatgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaactt 15576453  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15576454 atgttgtgattaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 15576495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20252765 - 20253006
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20252765 ctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccg 20252864  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20252865 cataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacct 20252964  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  20252965 atgttgtgatgaatctatcttggtttgacataaatatctttg 20253006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 39292160 - 39292385
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39292160 ctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccg 39292259  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39292260 cataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 39292359  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39292360 atgttgtgatggatctaacttggttt 39292385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 21538613 - 21538836
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538613 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgc 21538712  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||        ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21538713 ataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttgtgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 21538812  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||    
T  21538813 tgttgtgatagatct-acttggttt 21538836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12465683 - 12465931
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12465683 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 12465782  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         || |||||||| | || |||||||||||||||     
T  12465783 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatttaact 12465882  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12465883 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 12465931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 9743504 - 9743706
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9743504 cttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcgg 9743603  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||        |||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  9743604 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtatttaacct 9743703  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  9743704 atg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 8514170 - 8514379
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8514170 tttcgagttgctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgc 8514269  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8514270 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacata 8514369  T
Q  194 tgttttgatg 203  Q
    |||| |||||    
T  8514370 tgttatgatg 8514379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 202
Target Start/End: Original strand, 14153403 - 14153604
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  14153403 tggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 14153502  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttg 200  Q
    ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14153503 tttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatg 14153602  T
Q  201 at 202  Q
    ||    
T  14153603 at 14153604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 18080141 - 18080289
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18080141 ctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccg 18080240  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaactt 149  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18080241 cataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtttccaaactt 18080289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33001543 - 33001295
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  33001543 ctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 33001444  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      || | |||||| ||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33001443 tatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacc 33001344  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33001343 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 33001295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 46386510 - 46386758
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  46386510 ctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 46386609  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  46386610 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacc 46386709  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46386710 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 46386758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Original strand, 8851583 - 8851845
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8851583 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 8851682  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  8851683 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacct 8851782  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8851783 atgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatcgttgttggatgatttaatatctata 8851845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19282715 - 19282473
Alignment:
Q  7 agtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaac 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19282715 agtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 19282616  T
Q  107 tatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
      ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19282615 cgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T
Q  198 ttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19282515 gtaatggatctaatttgatttgacgtgaatatctttgttggat 19282473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 3192721 - 3192942
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaa 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || |||    
T  3192721 cagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataa 3192820  T
Q  106 ctatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||         ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3192821 ctatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T
Q  197 tttgatggatctaacttggttt 218  Q
     ||| ||  |||||||||||||    
T  3192921 cttgttgattctaacttggttt 3192942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 32160625 - 32160830
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32160625 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 32160724  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32160725 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 32160824  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  32160825 tatgtt 32160830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12371904 - 12371656
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12371904 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 12371805  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || | || ||||||||||||||||    
T  12371804 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacc 12371705  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12371704 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 12371656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44374575 - 44374327
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  44374575 ctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 44374476  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||| || ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  44374475 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacc 44374376  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44374375 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 44374327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44383440 - 44383192
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  44383440 ctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 44383341  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||| || ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  44383340 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacc 44383241  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44383240 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 44383192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Original strand, 13745671 - 13745885
Alignment:
Q  49 ttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaact 148  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||||| ||||||||||| || |   |||||||     
T  13745671 ttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacc 13745770  T
Q  149 tcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttgga 239  Q
    ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13745771 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttcacgtgaatatctttgttgga 13745870  T
Q  240 tgatataatatctat 254  Q
    |||| ||||||||||    
T  13745871 tgatttaatatctat 13745885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 708978 - 709183
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  708978 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 709077  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  709078 cttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 709177  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  709178 tatgtt 709183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11067097 - 11066849
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  11067097 ctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 11066998  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         || ||||| || |||| |||||||||||||||     
T  11066997 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatttaact 11066898  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11066897 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 11066849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15978479 - 15978704
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||| ||    
T  15978479 ctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcg 15978578  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactaggagt--------tcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||        | |||||||  | ||||||| | |||||||    
T  15978579 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggttaattaagaggtttaagagcacttaacct 15978678  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15978679 atgtcttgttggatctaacttggttt 15978704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14258981 - 14258736
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14258981 ctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 14258882  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||| |||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  14258881 cataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 14258782  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  14258781 tttgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 14258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16462665 - 16462460
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16462665 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 16462566  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | || || ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  16462565 catagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacc 16462466  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  16462465 tatgtt 16462460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13147895 - 13148143
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13147895 ctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 13147994  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||         || ||| |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  13147995 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacc 13148094  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13148095 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 13148143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 58841 - 59046
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  58841 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 58940  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  58941 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 59040  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  59041 tatgtt 59046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48812467 - 48812262
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48812467 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 48812368  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||  || |   ||||||| |||||||         |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  48812367 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 48812268  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  48812267 tatgtt 48812262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32301810 - 32301566
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  32301810 tttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaatacagc 32301711  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||| ||||| || |||||||||||||| |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  32301710 ataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 32301611  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  32301610 gtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatatttgttg 32301566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 14415907 - 14416112
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14415907 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 14416006  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14416007 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14416106  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  14416107 tatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 29052578 - 29052711
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29052578 ctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 29052677  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29052678 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 29052711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47094709 - 47094504
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47094709 ctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 47094610  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| ||||| |||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47094609 cataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 47094510  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  47094509 tatgtt 47094504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 47975334 - 47975539
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  47975334 cttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 47975433  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47975434 cataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 47975533  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  47975534 tatgtt 47975539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20619915 - 20619652
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  20619915 ctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaattcag 20619816  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || ||| |||||||||| |   ||||||  |||||         | ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  20619815 cataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatttaacc 20619716  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    || ||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20619715 tacgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctata 20619652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13408401 - 13408268
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13408401 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 13408302  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13408301 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 13408268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15167596 - 15167403
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  15167596 tggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 15167497  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| || |||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15167496 tttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 16550427 - 16550632
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  16550427 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgag 16550526  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16550527 aataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacc 16550626  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  16550627 tatgtt 16550632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16615235 - 16615030
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  16615235 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgag 16615136  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16615135 aataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacc 16615036  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  16615035 tatgtt 16615030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 18456071 - 18456276
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  18456071 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 18456170  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||| | || |||||||||||||  |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18456171 cataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 18456270  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  18456271 catgtt 18456276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 36685672 - 36685805
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36685672 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 36685771  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  36685772 cgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 36685805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48743924 - 48743700
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||| |||| ||||||| || |||| |    
T  48743924 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataacca 48743825  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  48743824 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacatatgttct 48743725  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtg 224  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  48743724 gatgaatctaagttggtttgacgtg 48743700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 14191511 - 14191714
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  14191511 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcag 14191608  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14191609 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14191708  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  14191709 tatgtt 14191714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8756819 - 8757024
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8756819 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 8756918  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||| |||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8756919 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 8757018  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  8757019 catgtt 8757024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15214128 - 15213995
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15214128 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15214029  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  15214028 tataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 15213995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4325685 - 4325553
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4325685 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcag 4325586  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    |  ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  4325585 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatg 4325553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 38828690 - 38828558
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  38828690 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 38828591  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    |  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38828590 cacaactatttctaagttaatccaaaacttatg 38828558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 32434014 - 32434261
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  32434014 ttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 32434113  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    ||||  ||||||| | || ||||||||||  || |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||| |||    
T  32434114 taaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatcta 32434213  T
Q  194 tgttttg-atggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||| || | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32434214 tgttatgaaaggatctaatttggtttgacgtgaatatatttgttggat 32434261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Original strand, 12127593 - 12127835
Alignment:
Q  8 gtggctttggtttgacttgaaaatgattttt-ggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaac 106  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| || | |||| |||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  12127593 gtggcttctgtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 12127692  T
Q  107 tatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
      ||||||||| || |||||| ||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12127693 cgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T
Q  198 ttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12127793 gtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 12127835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 14188717 - 14188920
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  14188717 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactta--gtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcag 14188814  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||         ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14188815 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 14188914  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  14188915 tatgtt 14188920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11661734 - 11661601
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  11661734 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaa 11661635  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  11661634 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 11661601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 13647871 - 13647738
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  13647871 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 13647772  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||| | || |||||||||||||    
T  13647771 cataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgg 13647738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16580289 - 16580044
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16580289 cttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcag 16580190  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||     
T  16580189 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 16580090  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  16580089 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 16580044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32771957 - 32771824
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32771957 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 32771858  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  32771857 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 32771824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 40555166 - 40555299
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40555166 ctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 40555265  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  40555266 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 40555299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 14928771 - 14929003
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  14928771 gtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14928870  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa---------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatc 207  Q
    | || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||          |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14928871 ttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgttgtgatgaatc 14928970  T
Q  208 taacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14928971 taatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 14929003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 240
Target Start/End: Original strand, 15352237 - 15352469
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  15352237 gtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 15352336  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa---------aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatc 207  Q
    | || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||          |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  15352337 ttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgttgtgatgaatc 15352436  T
Q  208 taacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15352437 taatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 15352469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 832446 - 832579
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  832446 ctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 832545  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  832546 caaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 832579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 1197626 - 1197759
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1197626 ctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 1197725  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  1197726 caaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 1197759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 10896417 - 10896618
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  10896417 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 10896516  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| || |||||||         ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10896517 cacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacc 10896616  T
Q  192 ta 193  Q
    ||    
T  10896617 ta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 13699312 - 13699517
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  13699312 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaattcag 13699411  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |  ||||||||||| |   ||||| | ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13699412 tataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacc 13699511  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  13699512 catgtt 13699517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14422414 - 14422281
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  14422414 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 14422315  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  14422314 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 14422281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585619
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatc 207  Q
    | || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| | |||| |||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatc 16585589  T
Q  208 taacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  16585590 taatttggttggacgtgaatatctttgttg 16585619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 17070716 - 17070921
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  17070716 ctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcag 17070815  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   | |||   ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17070816 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 17070915  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  17070916 tatgtt 17070921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 17505427 - 17505560
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  17505427 ctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 17505526  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  17505527 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgg 17505560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17547787 - 17547654
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  17547787 ctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcag 17547688  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||| ||||| || |||||||||||||    
T  17547687 cataaccctttttaagttaatccaaaacttatgg 17547654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18607916 - 18607783
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |    
T  18607916 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcag 18607817  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  18607816 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 18607783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34957792 - 34957667
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  34957792 tggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 34957693  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||||  || |||||||||||||    
T  34957692 tttctaaggtaatccaaaacttatgg 34957667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 37727350 - 37727555
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  37727350 ctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttag 37727449  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||| | ||||||||||         ||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  37727450 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacc 37727549  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  37727550 tatgtt 37727555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15720378 - 15720250
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  15720378 ctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcag 15720279  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaact 129  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  15720278 cataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20585981 - 20585737
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    ||||||| |||||||||||| |    
T  20585981 ctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaattcag 20585886  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||     
T  20585885 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaact 20585786  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  20585785 tatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaacatttttgttggat 20585737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 14566631 - 14566534
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14566631 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 14566534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16009007 - 16008910
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16009007 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 16008910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18872789 - 18872692
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18872789 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 18872692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 30820679 - 30820884
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  30820679 ctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 30820778  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||  || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30820779 cataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 30820878  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  30820879 catgtt 30820884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1856823 - 1856915
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1856823 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 8564038 - 8564239
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccca 124  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  8564038 tgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaaccca 8564137  T
Q  125 aaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggt 216  Q
    || || ||||  ||| |||||||| ||||        |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||    
T  8564138 aagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattgtgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaatggatttaactttgt 8564237  T
Q  217 tt 218  Q
    ||    
T  8564238 tt 8564239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 12755130 - 12755262
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  12755130 tttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagc 12755229  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  12755230 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 12755262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 16999061 - 16998930
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  16999061 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaattcag 16998962  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
      ||||  |||||| || || |||||||||||    
T  16998961 tataaccttttctatgttaatccaaaacttat 16998930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 148039 - 147914
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||      
T  148039 tggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacat 147940  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| |||| || |||||||||||||    
T  147939 tttccaagttaatccaaaacttatgg 147914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 12323353 - 12323509
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12323353 ctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 12323452  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaacta 157  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||||    
T  12323453 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacta 12323509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 13917996 - 13918088
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13917996 ctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37539037 - 37538905
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |  |    
T  37539037 ctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttgg 37538938  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37538937 cataactatttccaagtcaacacaaaacttatg 37538905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 46580348 - 46580444
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  46580348 tttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattc 46580444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 16460402 - 16460600
Alignment:
Q  48 gttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaac 147  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   |||||||    
T  16460402 gttaggatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaac 16460501  T
Q  148 ttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||||         |||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  16460502 ctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 16460600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 25926723 - 25926815
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25926723 ctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894485
Alignment:
Q  73 gtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagtt 163  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||  ||||||||||         |||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  164 caattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaatttggcttgacgtgaatatct 13894485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12191954 - 12191756
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||| |    
T  12191954 ctttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtaggtcttggaagaattttacgaaaattcag 12191855  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa-----actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    | |||| | |||||| | ||| | |||||| |||  ||| |||||||||||||     | |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  12191854 cataaccacttctaaattaactcgaaacttttggtatgtttccaaacttcaaatccttattaggagtttaattaagatgtttaagagtaattaacctat 12191756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16066067 - 16065966
Alignment:
Q  10 ggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactat 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| || |||||||    
T  16066067 ggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggtgcaattttacaaaaattcagcataactat 16065968  T
Q  110 tt 111  Q
    ||    
T  16065967 tt 16065966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29004451 - 29004318
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||  |    
T  29004451 ctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttag 29004352  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  |||| |||| || | |||||||||||    
T  29004351 cataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgg 29004318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctcc 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   |||    
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  144 aaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatg 195  Q
    |||  |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 16108294 - 16108374
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16108294 tttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18431280 - 18431188
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18431280 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 93
Target Start/End: Original strand, 23664554 - 23664638
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23664554 tggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 13864818 - 13864951
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |    
T  13864818 ctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcag 13864917  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
       |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  13864918 tacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgg 13864951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3136920 - 3136768
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| ||||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |    
T  3136920 ctttccaatggctttgctttgacc--aaaatgagttttatattttgagttagg-tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaag 3136824  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  3136823 cataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaact 3136768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11303816 - 11303724
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11303816 ctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21660646 - 21660558
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaatttta 89  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21660646 ctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaatttta 21660558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29800998 - 29800906
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  29800998 ctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15720243 - 15720157
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15720243 actatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggat 15720157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Original strand, 44305758 - 44305876
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| | |||||  ||     
T  44305758 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 44305857  T
Q  103 taactatttctaagtcaac 121  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  44305858 taactatttccaagtcaac 44305876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11309938 - 11309870
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaag 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  11309938 ctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaataccccaag 11309870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13897875 - 13897807
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaag 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13897875 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaag 13897807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 21675493 - 21675557
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21675493 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaactttgttt 21675557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24702797 - 24702705
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24702797 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24705244 - 24705152
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24705244 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29797179 - 29797087
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  29797179 ctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 32126059 - 32125967
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32126059 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41523486 - 41523394
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41523486 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41525948 - 41525856
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41525948 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Original strand, 44190680 - 44190729
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44190680 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15376307 - 15376399
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  15376307 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 15376399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 20384717 - 20384809
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  20384717 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20384809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Original strand, 14948742 - 14948808
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14948742 aaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 46473552 - 46473490
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46473552 taggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgttttaatggatctaacttggttt 46473490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 46473675 - 46473562
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||   ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| |    
T  46473675 tttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcc 46473576  T
Q  113 taagtcaacccaaa 126  Q
    ||||| || |||||    
T  46473575 taagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27217429 - 27217337
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  27217429 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 27217337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16383133 - 16383026
Alignment:
Q  49 ttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaact 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||| | ||| |  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||| ||    
T  16383133 ttatgaagaaaacactccaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaacttagcataactatttccaagtcagcccaaaacttatggtttgtttccaagct 16383034  T
Q  149 tcaaaact 156  Q
    ||||||||    
T  16383033 tcaaaact 16383026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 46580495 - 46580538
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46580495 actaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46580538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 13918233 - 13918323
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13918233 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 13918323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 26355577 - 26355667
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  26355577 ttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26355667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 26358029 - 26358119
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  26358029 ttccagtggcgtctgtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 26358119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16410627 - 16410535
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  16410627 ctttacagtggcgtcggcttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 16410535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 1857058 - 1857148
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  1857058 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 1857148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16233089 - 16233039
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16233089 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagtta 16233039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 25926959 - 25927049
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  25926959 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 25927049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719928
Alignment:
Q  85 ttttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactaggagt 162  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagt 28719928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Original strand, 48623348 - 48623493
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa-ttccgcctaact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||| ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||| ||||| ||||||   | |    
T  48623348 tggctttggtttgacttgaaaatattattttgtttttgaattatgaagaaaatactctaaggatgttttactaaaactttacgaaaacttccgcaccatt 48623447  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
      ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||    
T  48623448 gcttctaagtcaacccaacccttatggatagtttccaaacttcaaa 48623493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20487910 - 20487827
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  20487910 actaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtgatggatctaatttgctcggacgtgaatatctttgttg 20487827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 11392893 - 11392943
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagtta 51  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11392893 ctttccagtgtcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagtta 11392943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16998888 - 16998850
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16998888 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 16998850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29004284 - 29004246
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29004284 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 29004246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34957633 - 34957595
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34957633 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 34957595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13869901 - 13869864
Alignment:
Q  16 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13869901 ggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 13869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 14105890 - 14105927
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttt 38  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14105890 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 39431651 - 39431707
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaa 58  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39431651 cttttcagtgactttggcttgacttggaaatgatttttgg-ttttgagatatgatgaa 39431707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30237141 - 30237101
Alignment:
Q  215 gtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30237141 gtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 30237101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38828523 - 38828491
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38828523 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 38828491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Original strand, 11771 - 12032
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11771 tttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatttcac 11870  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11871 ataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 11970  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11971 tgttttgatggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgatttaatatctata 12032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Original strand, 62405 - 62656
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  62405 tttgttttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttc 62504  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgctta-agagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||        |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  62505 taagtcaaaccaaaacttgtggattgtctccaaacttctaagcctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgtgatg 62604  T
Q  204 gatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  62605 gatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 62656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 116828 - 117054
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||      
T  116828 ctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcta 116927  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||         |||||||| || ||||  | ||||||||||| ||||    
T  116928 tataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacc 117027  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  117028 tatgtcttgttggatctaacttggttt 117054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 67715 - 67593
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  67715 tggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 67616  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  67615 tttctaagttaatccaaaactta 67593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18744278 - 18744038
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18744278 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccg 18744179  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18744178 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18744079  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18744078 atgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 18744038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Original strand, 14026232 - 14026471
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14026232 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgc 14026331  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14026332 ctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttgtgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 14026431  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    |||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14026432 tgttgtaatgaatctatcttggtttgacgtgaatatcttt 14026471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 23199823 - 23200075
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23199823 tggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataacta 23199919  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgctt-aagagtatttaacctatgtttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||        |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23199920 tttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaagtgtttgaagagtatttaacctatgtttt 23200019  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23200020 gatggatctaacttggtttgacgtgaatatcgttgttggatgatttaatatctata 23200075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16605027 - 16605267
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16605027 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccg 16605126  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16605127 cataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacct 16605226  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatcttt 233  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16605227 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatcttt 16605267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 8504292 - 8504502
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8504292 ctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 8504391  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8504392 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttgtgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattatttaacct 8504491  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    |||||||||||    
T  8504492 atgttttgatg 8504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1627804 - 1628041
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1627804 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccg 1627903  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1627904 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacct 1628003  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatc 230  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  1628004 atgttgtgatgaatctaaattggtttgacgtgaatatc 1628041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16063114 - 16062904
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16063114 ctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 16063015  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16063014 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 16062915  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  16062914 atgttgtgatg 16062904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 20198009 - 20198274
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg--agttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20198009 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattc 20198108  T
Q  99 cgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact---------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaa 189  Q
     || ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||         ||||||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  20198109 agcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagtttaattaaggggtataagagtatttaa 20198208  T
Q  190 cctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20198209 cctatgttttgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 20198274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22110987
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctcc 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  144 aaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||||||||        |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttgtgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 22110987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20566178 - 20565935
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaa 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20566178 cagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataa 20566079  T
Q  106 ctatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20566078 ccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgt 20565979  T
Q  197 tttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  20565978 tgtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctatgttggat 20565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 33895305 - 33895568
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  33895305 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaattcag 33895404  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| || ||||||||||| || |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  33895405 cataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 33895504  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||   |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33895505 tatgcggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 33895568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611919
Alignment:
Q  74 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag--------gagttca 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |        ||||| |    
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgtgtactatgagttga 30612009  T
Q  166 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30612008 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 30611919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613879
Alignment:
Q  74 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||        |||| ||||| |    
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttgtgtactatgagttga 30613969  T
Q  166 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30613968 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtgtgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctata 30613879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 21399427 - 21399688
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  21399427 ctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaatttag 21399525  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21399526 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 21399625  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    ||| || ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21399626 tattttgtgatgaatctaatttggttagacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctat 21399688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32607748 - 32607995
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32607748 ctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 32607847  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||  || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||          |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32607848 cataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 32607947  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32607948 tatgttgtgatggatctaa-ttggcttgacgtgaatatctttgttggat 32607995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17011355 - 17011150
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  17011355 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttag 17011256  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||||||||||         |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17011255 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 17011156  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  17011155 tatgtt 17011150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19921262 - 19921015
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |    
T  19921262 ctttccagtgg-tttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 19921164  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| | ||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||||     
T  19921163 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaca 19921064  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19921063 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 19921015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26762030 - 26761827
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||      
T  26762030 ctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaa 26761931  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26761930 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 26761831  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  26761830 tatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22412635 - 22412430
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22412635 ctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcag 22412536  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22412535 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacc 22412436  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  22412435 tatgtt 22412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24277029 - 24277234
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24277029 ctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 24277128  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | |||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24277129 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 24277228  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  24277229 catgtt 24277234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24385184 - 24385051
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24385184 ctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 24385085  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  24385084 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgg 24385051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 263475 - 263281
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  263475 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 263376  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||| || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  263375 ctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 263281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29448467 - 29448262
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  29448467 ctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 29448368  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   | ||||| ||||||||||         ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29448367 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacc 29448268  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  29448267 tatgtt 29448262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17813025 - 17812895
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17813025 ctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 17812926  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  17812925 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 17812895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 36509207 - 36509447
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36509207 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaa--------ggtttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 36509298  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||  || |   | ||||| |||||         |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  36509299 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaac 36509398  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36509399 ctatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatttttgttggat 36509447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 40917396 - 40917524
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40917396 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 40917495  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaact 129  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  40917496 cataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 27868998 - 27869203
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27868998 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 27869097  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||  |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||   ||||||||||         |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27869098 cacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 27869197  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  27869198 tatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36460599 - 36460466
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  36460599 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 36460500  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  36460499 tataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 36460466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26749677 - 26749532
Alignment:
Q  66 caagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------acta 157  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||        ||||    
T  26749677 caaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttttgtacta 26749578  T
Q  158 ggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26749577 tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 26749532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17875628 - 17875429
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17875628 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 17875529  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||| |||| || ||||||||||| || |   ||||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17875528 cataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 17875429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31456427 - 31456293
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||  |    
T  31456427 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaag 31456328  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  31456327 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatgga 31456293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6766290 - 6766085
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  6766290 ctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcag 6766191  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||         |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6766190 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 6766091  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  6766090 tatgtt 6766085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18419041 - 18418908
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  18419041 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 18418942  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||   ||||||| | || |||||||||||||    
T  18418941 cataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgg 18418908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21554802 - 21554934
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  21554802 ctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttt-ggtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 21554900  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
     ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  21554901 tctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 21554934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22336949 - 22336816
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  22336949 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 22336850  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  22336849 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 22336816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24617346 - 24617443
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24617346 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24617443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24713577 - 24713674
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24713577 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24713674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24746605 - 24746702
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24746605 ctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24746702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 28370679 - 28370776
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28370679 ctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 28370776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 8833630 - 8833779
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8833630 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 8833721  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  8833722 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactag 8833779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22340487 - 22340356
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  22340487 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcag 22340388  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttat 132  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||    
T  22340387 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttat 22340356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19511816 - 19511686
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19511816 ctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcag 19511717  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  19511716 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 19511686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17909096 - 17908963
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| ||||||||||    
T  17909096 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccg 17908997  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  || | | |||||||||||||||| |||||||    
T  17908996 cacaattgtctctaagtcaacccaaaccttatgg 17908963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 38145161 - 38145258
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38145161 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 38145258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 98
Target Start/End: Original strand, 37598541 - 37598637
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37598541 tttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 37598637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 41876017 - 41876221
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41876017 tttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 41876116  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
      |||  ||||||||| || ||||| |||| ||| |   ||||||| |||||         |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41876117 aaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacct 41876216  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  41876217 atgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22750555 - 22750372
Alignment:
Q  19 ttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtc 118  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||     
T  22750555 ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 22750456  T
Q  119 aacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    || |||||||||| ||| |   ||||||| || |||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22750455 aatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 21557467 - 21557600
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  21557467 ctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcag 21557566  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  21557567 tataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 21557600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 30138587 - 30138791
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  || |||||||||| |    
T  30138587 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaacctt-atgaaaattcag 30138685  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||  |   | ||| | ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30138686 cataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 30138785  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  30138786 catgtt 30138791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 33473011 - 33473144
Alignment:
Q  25 tgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccca 124  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| || |||    
T  33473011 tgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcca 33473110  T
Q  125 aaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  33473111 aaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 33473144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 42961006 - 42960909
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42961006 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattc 42960909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 37804496 - 37804588
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37804496 ctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22758313 - 22758447
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttg-agttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  22758313 ctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattca 22758412  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  22758413 gcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 22758447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24668620 - 24668717
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24668620 ctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24668717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24738389 - 24738486
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24738389 ctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24738486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24751158 - 24751255
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24751158 ctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattc 24751255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 42244959 - 42245051
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42244959 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 96
Target Start/End: Original strand, 43243093 - 43243176
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  43243093 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaagtttattaaaat 43243176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7528489 - 7528341
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  7528489 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggatgt-ttaat-aaactttacgaaaattccgca 7528392  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     || | |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  7528391 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaatttcaaa 7528341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 10732534 - 10732626
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||| || | | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10732534 ctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29346548 - 29346456
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  29346548 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29349021 - 29348929
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  29349021 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29351494 - 29351402
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || | ||||||||||||| |||||||||    
T  29351494 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31478988 - 31478874
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| | |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  31478988 ctttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactaca-gtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccattt 31478890  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaa 127  Q
     ||||| ||| |||||    
T  31478889 ttaagtgaactcaaaa 31478874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20909580 - 20909488
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  20909580 ctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 20909488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Original strand, 264377 - 264454
Alignment:
Q  16 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  264377 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 264454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23065082 - 23065030
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23065082 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 23065030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39245704 - 39245612
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  39245704 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaattattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39245612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28901538 - 28901397
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||  || |||| ||||    
T  28901538 ctttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccattt 28901440  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa 154  Q
     ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  28901439 ataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaa 28901397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28937933 - 28937792
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||  || |||| ||||    
T  28937933 ctttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccattt 28937835  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa 154  Q
     ||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||    
T  28937834 ataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaa 28937792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 12122107 - 12122150
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12122107 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgtt 12122150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38619999 - 38619952
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38619999 cagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatg 38619952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24385017 - 24384979
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24385017 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 24384979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42960839 - 42960801
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42960839 gagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgtt 42960801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20312567 - 20312527
Alignment:
Q  215 gtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20312567 gtttgatgtgaatatctatgttggatgatataatatctata 20312527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39363952 - 39363860
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  39363952 ctttccagtggtgtcagtttcacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 39363860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1339 - 1092
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1339 tttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgc 1240  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  1239 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacct 1140  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1139 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 186929 - 187176
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  186929 tttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgc 187028  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  187029 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacct 187128  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  187129 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 187176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 18549 - 18812
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18549 ctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcgg 18648  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgctt-aagagtatttaacc 191  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18649 cataactatttctaagtcaaaccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacc 18748  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18749 tatgttgtgatggatctaacttggtttaacgtaaatatctttgttggatgatttaatatctata 18812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7518
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7278 ctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccg 7377  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||        |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7378 cataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtct-caaacttcaaagcttgtgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacct 7476  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7477 aagttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 7518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14490 - 14424
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14490 aaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26144 - 25897
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 26045  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26044 cataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaacttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 25945  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  25944 atgttgtgatggatctaatttggttttatgtaaatatctttgttggat 25897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 35956 - 36198
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35956 gttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaag 36055  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatct 208  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36056 tcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatct 36155  T
Q  209 aacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatc 251  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36156 aactttgtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatc 36198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 7206 - 7446
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7206 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctg 7304  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||        |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7305 cataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttgtgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacct 7404  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7405 atgttgtgatgaatataacttggtttgacgtgaatatctttg 7446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6046 - 5841
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6046 ctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5947  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  |||| ||||||  |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5946 cataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 5847  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  5846 tatgtt 5841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 62346 - 62137
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62346 tttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 62247  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62246 ataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 62147  T
Q  194 tgttttgatg 203  Q
    |||| |||||    
T  62146 tgttatgatg 62137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 39332 - 39372
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggt 41  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39332 ctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggt 39372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 65405 - 65614
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65405 tttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 65504  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  65505 ataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 65604  T
Q  194 tgttttgatg 203  Q
    |||| |||||    
T  65605 tgttatgatg 65614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34889 - 34652
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34889 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccg 34790  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | ||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34789 cataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 34694  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  34693 atgttgtgatgaatctatcttggtttgacgtgagtatctttg 34652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18077 - 18287
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077 ctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 18176  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18177 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18276  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  18277 atgttatgatg 18287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8449 - 8238
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttt-gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8449 ctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattct 8350  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8349 gcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 8250  T
Q  192 tatgttttgatg 203  Q
    |||||| |||||    
T  8249 tatgttatgatg 8238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33075 - 32872
Alignment:
Q  8 gtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaact 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33075 gtggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataact 32976  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  32975 ttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttat 32876  T
Q  200 gatg 203  Q
    ||||    
T  32875 gatg 32872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 126377 - 126152
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  126377 ctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 126278  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  126277 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 126178  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtt 217  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||    
T  126177 tgtgttgtgatggatctaatttggtt 126152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 104
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  314 ctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcg 215  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  214 cataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 115  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  114 atgttatgatg 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 56605 - 56395
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  56605 ctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccg 56506  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56505 cataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 56406  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  56405 atgttatgatg 56395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18793 - 18552
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  18793 ctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctg 18694  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18693 cataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacat 18594  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  18593 atgttgtgatgaatctatctcggtttgacgtgaatatctttg 18552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16325
Alignment:
Q  43 tttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctc 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  143 caaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||||||||        |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16424 caaacttcaaagatcatgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 16325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6654 - 6521
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  6654 ctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 6555  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      |||  |||| ||||| || |||||||||||||    
T  6554 tataatcatttataagttaatccaaaacttatgg 6521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 15009 - 15257
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15009 ctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 15108  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15109 cataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 15208  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15209 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 15257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 24067 - 24315
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24067 ctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 24166  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24167 cataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacc 24266  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24267 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 24315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1536 - 1273
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1536 ctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttag 1437  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1436 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 1337  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1336 tatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctata 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Original strand, 8044 - 8195
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8044 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 8143  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8144 ataactatttcttagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaa 8195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 143242 - 142979
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  143242 ctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 143143  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  143142 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacc 143043  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  143042 tatgtggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatctata 142979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 169420 - 169550
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  169420 ctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 169519  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  169520 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 169550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27929 - 27667
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | | | || |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27929 ctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaaattcag 27830  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  |||||||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27829 caaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaatc 27730  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctat 254  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27729 tatgttgtgatggatccaatttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaatatctat 27667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 1532 - 1667
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  1532 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattca 1631  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
    |  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1632 gtataaccttttctaagttaatccaaaacttatgga 1667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 947 - 738
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  947 ctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatactcaatg-aggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 849  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  848 cagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 749  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  748 atgttatgatg 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6453 - 6244
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6453 ctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatactcaatg-aggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 6355  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6354 cagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 6255  T
Q  193 atgttttgatg 203  Q
    ||||| |||||    
T  6254 atgttatgatg 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10850 - 10644
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  10850 cttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcag 10751  T
Q  101 cctaacta-tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | |||| | ||||||||| || |||||||||| ||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10750 cataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 10651  T
Q  191 ctatgtt 197  Q
    |||||||    
T  10650 ctatgtt 10644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5136 - 5384
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5136 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 5235  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||| |    
T  5236 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaac 5335  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5336 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 5384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 6100 - 6234
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  6100 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaaattcag 6199  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  6200 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgga 6234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 7808 - 8056
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7808 ctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 7907  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  7908 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 8007  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  8008 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaacatctttgttggat 8056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 891 - 1138
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  891 tttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 990  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||| ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  991 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacct 1090  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1091 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 1138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 13088 - 13333
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13088 ctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 13187  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  13188 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 13287  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  13288 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 8085 - 8230
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| ||||||| ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||| || ||||  ||||    
T  8085 tttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttc 8184  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||| |||| |||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  8185 taactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactag 8230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 78693 - 78446
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  78693 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 78594  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  78593 cataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacc 78494  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78493 tatgttgtgatgaatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggat 78446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7139 - 6897
Alignment:
Q  4 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcct 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7139 tccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 7040  T
Q  104 aactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctat 194  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |    
T  7039 aactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgt 6940  T
Q  195 gttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  6939 gttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 6897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 5749 - 5994
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5749 ctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5848  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||     
T  5849 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaaca 5948  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  5949 tgtgttgtgatggatctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 5994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 7011 - 7275
Alignment:
Q  1 ctttccagtggcttt-ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7011 ctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattca 7110  T
Q  100 gcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    || ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  7111 gcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 7210  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatctata 255  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  7211 ctacgtggtgatggatctaatttggtttcatgtgaatatccttgttggatgatttaatatttata 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21452
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21696 tttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagc 21597  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  |||||||         |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  21596 ataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacat 21497  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21496 gtgttgtaatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 21452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21280 - 21036
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21280 tttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagc 21181  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |    
T  21180 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaacat 21081  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
     |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  21080 gtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 21036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 5090 - 5293
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5090 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 5189  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa---------ctaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||         ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5190 cctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 5289  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  5290 tatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28791 - 29030
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  28791 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 28890  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28891 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacc 28990  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28991 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 29030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10052 - 9993
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtag 72  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10052 tttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtag 9993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11326 - 11121
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11326 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 11227  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11226 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 11127  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  11126 tatgtt 11121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 120539 - 120294
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  120539 ctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 120440  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||| | |||||||||||||||     
T  120439 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaaca 120340  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  120339 tgtgttgtgatggatctaatttggttggacgtgaatatctttgttg 120294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 134
Target Start/End: Original strand, 29621 - 29753
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29621 tttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 29720  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
     |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29721 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 29753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10328 - 10084
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10328 tttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtg-aattttatgaaaagtccgc 10230  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
              ||||||||| |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  10229 ----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacct 10140  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10139 atgttgtggtggatctaacttggtttgacatgaatatctttgttggatgatttaat 10084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 39728 - 39480
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  39728 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcag 39629  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||   |||||| || || |||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||         || |||||||| | || ||||||||||||||||    
T  39628 gataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacc 39529  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39528 tatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 39480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 12960 - 13207
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12960 tttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 13059  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
      ||| |||| ||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||         |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  13060 acaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacct 13159  T
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13160 atgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Original strand, 19388 - 19474
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19388 actatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 19474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7848 - 7602
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  7848 ctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcag 7749  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||| | ||| ||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||    
T  7748 cataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacc 7649  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttgga 239  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7648 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgatgtgaatatctttgttgga 7602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14479 - 14233
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  14479 ctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcag 14380  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||| | ||| ||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||    
T  14379 cataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacc 14280  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttgga 239  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14279 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgatgtgaatatctttgttgga 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26555 - 26422
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26555 ctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 26456  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  26455 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 26422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27937 - 27804
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27937 ctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 27838  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  27837 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 27804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 13195 - 13355
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgat-ttttggtttt---tgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13195 ctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaat 13294  T
Q  97 tccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaacta 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13295 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaacta 13355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 787 - 546
Alignment:
Q  8 gtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaact 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  787 gtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataact 688  T
Q  108 atttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttt 198  Q
     ||||||||  |  |||| | ||| ||| |   ||||||| ||||||||||         |||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||     
T  687 gtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttg 588  T
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  587 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Original strand, 64493 - 64694
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  64493 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagc 64592  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactaggagt---------tcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |   | ||||| |||||||||| |||         |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  64593 ataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaacct 64692  T
Q  193 at 194  Q
    ||    
T  64693 at 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 31771 - 31680
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||| |||||||||| || || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31771 tttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31536 - 31446
Alignment:
Q  44 ttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  31536 ttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 31446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10352 - 10600
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  10352 ctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 10451  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | |||   ||||||||| || ||||||||||| || |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||    
T  10452 cataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaac 10551  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10552 ctacgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggat 10600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21710 - 21505
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  21710 ctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccag 21611  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21610 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacc 21511  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  21510 tatgtt 21505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 146361 - 146114
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  146361 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 146262  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||| |||| | |   || |||| ||||||||||         ||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  146261 aataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaatc 146162  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  146161 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtgaatatctttgttggat 146114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 111116 - 111019
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  111116 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 111019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 123985 - 124116
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  123985 ttccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagca 124084  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  124085 taaccatttctaagtgaatccaaaacttatgg 124116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9684 - 9445
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  9684 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaag 9585  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg-gactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaac 190  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||  | |||||   ||||||||||         ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  9584 cataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaat-tccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaac 9486  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9485 ctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 400 - 648
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  400 ctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 499  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  500 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 599  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  600 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggat 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Original strand, 5708 - 5951
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaa 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5708 cagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataa 5807  T
Q  106 ctatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  5808 ccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatgc 5907  T
Q  197 tttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5908 tgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggat 5951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 2967 - 2851
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2967 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 2868  T
Q  101 cctaactatttctaagt 117  Q
    | ||||  |||||||||    
T  2867 cataaccgtttctaagt 2851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 405 - 653
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  405 ctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 504  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      || | |||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    
T  505 tatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatc 604  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  605 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggat 653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5709 - 5957
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5709 ctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 5808  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      || | |||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    
T  5809 tatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatc 5908  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5909 tatgttgtgatggacctaatttggtttgacgtgagtatctttgttggat 5957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1564 - 1480
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaat 85  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1564 ctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 58377 - 58129
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  58377 ctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 58278  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| || ||||||| || ||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  58277 cataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 58178  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  58177 tgtgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 58129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 68530 - 68438
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  68530 ctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatgaa 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7599 - 7356
Alignment:
Q  6 cagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaa 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7599 cagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataa 7500  T
Q  106 ctatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgt 196  Q
    |  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  7499 ccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatgc 7400  T
Q  197 tttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    | ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7399 tgtgatgaatctaatttggtctgacgtgaatatctttgttggat 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 10340 - 10423
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaa 84  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10340 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11262 - 11176
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11262 actaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatagctttgttggat 11176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10870 - 11073
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  10870 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcag 10969  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |   || |||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10970 aataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 11069  T
Q  192 tatg 195  Q
    ||||    
T  11070 tatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17258
Alignment:
Q  71 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaactta 17258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1706 - 1475
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  1706 tggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataacca 1607  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtttt 199  Q
     |||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  |||||         |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1606 attctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 1507  T
Q  200 gatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1506 gatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 12
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  145 ctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcgg 46  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  45 cataaccaattctatgttaatccaaaacttatgg 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11641 - 11862
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||    
T  11641 ctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcg 11740  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||         |||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||    
T  11741 cataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtatttaacc 11839  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttg 214  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  11840 tatgtgttgttgaatctaacttg 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1332 - 1130
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1332 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagc 1233  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
    |||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1232 ctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacct 1133  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  1132 atg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3884 - 3654
Alignment:
Q  16 ggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3884 ggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaa 3785  T
Q  116 gtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggat 206  Q
    || || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| | |||| ||||||||    
T  3784 gttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaacatgtgttgtgatggat 3685  T
Q  207 ctaacttggtttgacgtggatatctttgttg 237  Q
    |||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  3684 ctaatttggtcggacgtgaatatctttgttg 3654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4049 - 3800
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||  |    
T  4049 ctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttag 3950  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
      ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||||||| |||||| || | || ||||||||||||    
T  3949 tttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaac 3850  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  3849 ctatgttgtgatggatctaatttcgtttgacgtgaatatctttgttggat 3800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11788 - 11547
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  11788 ctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcag 11689  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  | |  ||||||||| || ||||||| || ||| |   ||||||| |||||||         |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  11688 cacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatttgacc 11589  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  11588 tatgttgtgatggatctaa-ttggtttgacgtaaatatctttg 11547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6086 - 5882
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6086 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 5987  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacct 192  Q
     |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5986 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacat 5887  T
Q  193 atgtt 197  Q
    |||||    
T  5886 atgtt 5882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21362 - 21123
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  21362 ctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaattcag 21263  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggact--------gtctccaaacttcaa-aactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |         |||| |||||  ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21262 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 21163  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21162 tatgttgtgatgagtctaatttggtttgacgtgaatatct 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 7979 - 8112
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7979 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 8078  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  8079 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 8112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4663 - 4530
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4663 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 4564  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  4563 cataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4492 - 4454
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4492 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4663 - 4530
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4663 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 4564  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  4563 cataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4492 - 4454
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4492 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4726 - 4569
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4726 ctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 4627  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  4626 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 4569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 11746 - 11679
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaa 68  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11746 ctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaa 11679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 169067 - 168818
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  |    
T  169067 ctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttag 168968  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaa-ggtgcttaagagtatttaac 190  Q
      ||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |   ||||||| || ||         |||||||||| |||||| || | || ||||||||||||    
T  168967 tataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaac 168868  T
Q  191 ctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
     |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  168867 ttatgttgtgatggttctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 168818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 11930 - 12135
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  11930 ctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttag 12029  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| |||| |||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12030 cataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacc 12129  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  12130 tatgtt 12135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7762 - 7523
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  7762 ctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcag 7663  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||| |   || |||  |||||         |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  7662 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacc 7563  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatct 231  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7562 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatct 7523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 3365 - 3570
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |    
T  3365 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcag 3464  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||| ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3465 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacc 3564  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  3565 tatgtt 3570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 48 - 1
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 48  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Original strand, 19075 - 19272
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||||||| || |||| |    
T  19075 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 19174  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19175 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 19272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8693 - 8488
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  8693 ctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcag 8594  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| |||||         |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8593 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacc 8494  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  8493 tatgtt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21884 - 21751
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21884 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 21785  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  21784 cacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 21751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6420 - 6299
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |    
T  6420 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaacca 6321  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaactt 130  Q
    ||||||||| || |||||||||    
T  6320 tttctaagttaatccaaaactt 6299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 70251 - 70456
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  70251 ctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 70350  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || | ||||||||||   |   ||||||  ||||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70351 cataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 70450  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  70451 tatgtt 70456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 72040 - 71943
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  72040 ctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattc 71943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22192 - 22397
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  22192 ctttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattcag 22291  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   | ||||| | ||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22292 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 22391  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  22392 tatgtt 22397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 105541 - 105336
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  105541 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcag 105442  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  105441 cataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacc 105342  T
Q  192 tatgtt 197  Q
     |||||    
T  105341 catgtt 105336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 162913 - 162780
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  162913 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 162814  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  162813 cataactgtttctaagttaatccaaaacatatgg 162780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 94979 - 94887
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  94979 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 94887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1173
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1057 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1156  T
Q  101 cctaactatttctaagt 117  Q
    |  ||| ||||||||||    
T  1157 cacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30241 - 29993
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  30241 ctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcag 30142  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaac---------taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| | | |   ||||||| |||| ||         |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  30141 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaact 30042  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30041 tatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 29993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 51587 - 51455
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  51587 ctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 51488  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    |  ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  51487 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatg 51455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 67297 - 67200
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67297 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 67200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7904
Alignment:
Q  24 ttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaaccc 123  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||| || ||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  124 aaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttg 214  Q
    |||||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttg 7924  T
Q  215 gtttgacgtggatatctttg 234  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  7923 gtatgacgtgaatatctttg 7904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8252
Alignment:
Q  64 tccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactaggagtt 163  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | ||||||||| || |||||||||| ||| |   | ||||| |||||||||| ||||    
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  164 c 164  Q
    |    
T  8252 c 8252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 626 - 416
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  626 ctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 527  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
      |||| |||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||| ||||     
T  526 tataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaact 427  T
Q  192 tatgttttgat 202  Q
    |||||||||||    
T  426 tatgttttgat 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 1951
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2193 ctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 2094  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   | || || ||||||||||         |||||| |||| |||  ||||| ||||||||||    
T  2093 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatttaacc 1994  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1993 tatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 1951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5538 - 5413
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  5538 ctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 5439  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||    
T  5438 cataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5104
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5184 actatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtatgacgtgaatatctttg 5104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 35994 - 36128
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  35994 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcag 36093  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  36094 tataaccttttctaagttaatccaaaacttatgga 36128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22214 - 22432
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22214 ctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 22313  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  22314 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacc 22413  T
Q  192 tatgttttgatggatctaa 210  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  22414 tatgttgtgaaggatctaa 22432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29353 - 29228
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  29353 tggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 29254  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| | || || | |||||||||||    
T  29253 tttccatgttaatcaaaaacttatgg 29228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34818 - 34693
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||      
T  34818 tggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccg 34719  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||| | || || | |||||||||||    
T  34718 tttccatgttaatcaaaaacttatgg 34693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16202 - 16069
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  16202 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 16103  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  16102 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 16069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16034 - 15997
Alignment:
Q  160 agttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16034 agttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 15997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21390 - 21293
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 21293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 42319 - 42275
Alignment:
Q  4 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgag 48  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  42319 tccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgag 42275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 39852 - 39809
Alignment:
Q  50 tatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39852 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 8686 - 8553
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8686 ctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcag 8587  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  8586 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 8553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 159373 - 159506
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  159373 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 159472  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  159473 cataaccatttctaaattaatccaaaacttatgg 159506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 77316 - 77111
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  77316 ctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 77217  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||   ||||||||| ||  ||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  77216 cataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacc 77117  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  77116 tatgtt 77111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 152633 - 152766
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  152633 ctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 152732  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  152733 caaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgg 152766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 176421 - 176220
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  176421 ctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 176322  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  176321 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 176222  T
Q  192 ta 193  Q
    ||    
T  176221 ta 176220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 169068 - 168911
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || || ||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  169068 ctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 168969  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    |  |||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  168968 caaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactag 168911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 586
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||      
T  834 cttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaa 735  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| |   ||||||| |||||         |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  734 cataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaacc 635  T
Q  192 tatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  634 tattttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 857
Alignment:
Q  17 gtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||| || |||| |||||| ||    
T  1066 gtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttag 967  T
Q  117 tcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa--------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatct 208  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||        |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  966 tcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaacttatgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatgatggatct 867  T
Q  209 aacttggttt 218  Q
    ||||||||||    
T  866 aacttggttt 857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 3335 - 3203
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3335 ctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcag 3236  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  3235 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatg 3203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20723
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |  ||     
T  20499 ttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttagca 20598  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact---------aggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaaccta 193  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||          || ||| |||||||||  | |||||||||||||| |    
T  20599 taactatttccaagtcaacccgaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaactttagtattacggggttaaattaaggttttaaagagtatttaaccaa 20698  T
Q  194 tgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  20699 tgttgtgatggatctgacttggttt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 7800 - 7911
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7800 ctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccg 7899  T
Q  101 cctaactatttc 112  Q
    | ||||||||||    
T  7900 cataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 7931 - 7995
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  7931 actatgagtttaattaaggtgcttaagagtatttaacctctgttgtggtggatctaacttggttt 7995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8970
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  127 acttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtt 217  Q
    ||||| ||| |   | ||||| ||||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactataatgtgatggatctaatttggtt 8951  T
Q  218 tgacgtggatatctttgtt 236  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  8952 tgacgtgaatatctttgtt 8970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22439
Alignment:
Q  55 tgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaa 154  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  155 ctag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||         ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 22439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29539
Alignment:
Q  27 aaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaa 126  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||| |   |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  127 acttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtt 217  Q
    ||||| ||| |   ||||||| |||| |||||         ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtgatgaatctaatttggtt 29562  T
Q  218 tgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  29561 tgacgtgaatatctttgttggat 29539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 133371 - 133246
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |    
T  133371 tggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaacca 133272  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||  |||| || |||||||||||||    
T  133271 ttttcaagttaatccaaaacttatgg 133246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 133587 - 133720
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  133587 ctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcag 133686  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  133687 cacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgg 133720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 33866 - 33803
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactc 65  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  33866 tttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactc 33803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 865 - 768
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  865 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattc 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7513 - 7380
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  7513 ctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 7414  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  7413 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 7380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 9379 - 9512
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  9379 ctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattcag 9478  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  |||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  9479 cacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgg 9512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 106626 - 106783
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  106626 ctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 106725  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||    
T  106726 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactag 106783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2592
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  2476 ctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcag 2575  T
Q  101 cctaactatttctaagt 117  Q
    | ||| | |||||||||    
T  2576 cataattgtttctaagt 2592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 229
Target Start/End: Original strand, 3111 - 3181
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatat 229  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3111 gagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatat 3181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 867 - 745
Alignment:
Q  12 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactattt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||    
T  867 ctttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 768  T
Q  112 ctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  767 ctaagttaatccaaaacttatgg 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1247
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  1117 ctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1216  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
    | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  1217 cataaccgtttctaagttaatccaaaactta 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 645 - 512
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  645 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 546  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  545 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2403
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2516 tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagc 2417  T
Q  102 ctaactatttctaa 115  Q
     ||||  |||||||    
T  2416 ataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 2150 - 2247
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2150 ctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattc 2247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12598 - 12465
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  12598 ctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 12499  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | ||||  ||||||||| || |||||||||||||    
T  12498 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 16412 - 16493
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaa 83  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16412 tttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 248
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16649
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataat 248  Q
    ||||||| || ||||||||   |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16555 actaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgtgatggatctaacttggtttgacgtgaatatctttgttggatgatttaat 16649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 610 - 489
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| || ||||  ||||    
T  610 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttc 511  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  510 taagttaatccaaaacttatgg 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13370
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13575 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 13476  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag---------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||| ||||   |   ||| ||| ||||||||||         ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13475 cataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacc 13376  T
Q  192 tatgtt 197  Q
    ||||||    
T  13375 tatgtt 13370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16393 - 16260
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  16393 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatattcag 16294  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  16293 cataatcatttctaagttaatccaaaacttatgg 16260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 8865 - 8733
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  8865 ctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcag 8766  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  8765 cataaccatttctaagttaatccaaaacatatg 8733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16226 - 16188
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16226 gagttcaatgaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24486 - 24579
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24486 ctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 24588 - 24637
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatg 203  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24588 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgatg 24637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 23627 - 23760
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  23627 ctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 23726  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    | |||   ||||||| | || |||||||||||||    
T  23727 cataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgg 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23198 - 23065
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  23198 ctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 23099  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  | | |||||||||| || |||||||||||||    
T  23098 cacatccatttctaagttaatccaaaacttatgg 23065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 17680 - 17813
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | | | ||||||||||||  |||||||||||| |    
T  17680 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaattcag 17779  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |  | | |||||||||| || |||||||||||||    
T  17780 cacagccatttctaagttaatccaaaacttatgg 17813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 22604 - 22736
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactcca-agtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  22604 ttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 22703  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
      ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  22704 acaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 22736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 33966 - 33812
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  33966 ttccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagca 33867  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaacta 157  Q
    ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| |||||||||    
T  33866 taaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacta 33812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 33772 - 33731
Alignment:
Q  199 tgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33772 tgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 33731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 134
Target Start/End: Original strand, 23383 - 23446
Alignment:
Q  71 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23383 aggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 23446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11141
Alignment:
Q  18 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  118 caacccaaaacttatgg 134  Q
     || | |||||||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgg 11141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12957 - 12829
Alignment:
Q  7 agtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaac 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||    
T  12957 agtggctttggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataac 12858  T
Q  107 tatttctaagtcaacccaaaacttatgga 135  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12857 cttttctaagttaatccaaaacttatgga 12829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 138404 - 138272
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  138404 ctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaattcag 138305  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatg 133  Q
    |  ||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  138304 cacaaccatttctaagttaatccaaaacttatg 138272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 240
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9897
Alignment:
Q  62 actccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag--- 158  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||| || |||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||       
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  159 ------gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
          |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaacta-ggtgtttaagagtatttaacctatattgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgttggat 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38390 - 38298
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  38390 ctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 38298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 1
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  131 ctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcag 32  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaactta 131  Q
      ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  31 tataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17291 - 17142
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  17291 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 17192  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaa 152  Q
     || | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  17191 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaacttcaa 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 156
Target Start/End: Original strand, 40906 - 40991
Alignment:
Q  71 aggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaact 156  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40906 aggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatatcaaaccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaact 40991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 82603 - 82482
Alignment:
Q  13 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||  ||||    
T  82603 tttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttc 82504  T
Q  113 taagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||| ||  ||||||||||||    
T  82503 taagttaattcaaaacttatgg 82482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 773 - 989
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||| |    
T  773 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcag 872  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa---------actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacc 191  Q
    | ||||  ||||||||||||  |||||||||| || | | ||||||| || ||         |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  873 cataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacc 972  T
Q  192 tatgttttgatggatct 208  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  973 tatgtcttgatgaatct 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8587 - 8495
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8587 ctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 19682 - 19774
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19682 ctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 134
Target Start/End: Original strand, 19943 - 20008
Alignment:
Q  69 gtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  19943 gtaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 20008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18222 - 18130
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18222 ctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17896
Alignment:
Q  78 agtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 134  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgg 17896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33740 - 33648
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  33740 ctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33385 - 33342
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 197  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33385 actatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 33342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8135 - 7978
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| ||||||| ||  || ||||| | ||||| || || |||||||||||||| |    
T  8135 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaaattcag 8036  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  8035 cataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactag 7978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3592 - 3500
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  3592 ctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21317 - 21225
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21317 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 11 - 92
Alignment:
Q  159 gagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11 gagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgttaatatctttgttggat 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Original strand, 2419 - 2520
Alignment:
Q  154 actaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggatgatataatatcta 253  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2419 actaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctaaatggtgatggatctaatttggtttgatgtgaatatccttgttggatgatttaatatcta 2518  T
Q  254 ta 255  Q
    ||    
T  2519 ta 2520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 106 - 201
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 96  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  106 ctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagaacttaatgaaaatttattaaaat 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 35055 - 35205
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcc 102  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||| |||||||||||     
T  35055 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggatgttttaataaaactttaggaaaattccgca 35154  T
Q  103 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
     || | |||||||||||||| ||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35155 caattgtttctaagtcaacctaaacctcatgaattgtttccaaacttcaaa 35205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 146 - 53
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaa-tgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  146 ctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6515 - 6423
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6515 ctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 2204 - 2360
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  || ||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||    
T  2204 tttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagc 2303  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
     ||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  2304 ataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactag 2360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 158
Target Start/End: Original strand, 10459 - 10615
Alignment:
Q  2 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgc 101  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  || ||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||    
T  10459 tttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagc 10558  T
Q  102 ctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
     ||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  10559 ataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactag 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4662
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||  | ||| |||| |||||||||||  || | |||||    
T  4801 ttggtttgacttgaaaataatgtgttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttgataaaactttacgaaaattccgcacaattgtttct 4702  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||    
T  4701 aagtcaacccaaaccttatggatggcttccaaacttcaaa 4662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 174573 - 174628
Alignment:
Q  3 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaa 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  174573 ttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 2346 - 2403
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaa 58  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2346 ctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 11630 - 11787
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||| || ||  |  ||||| ||||||| || || ||||||| |||||| |    
T  11630 ctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaattcag 11729  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | ||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  11730 cataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactag 11787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 4 - 68
Alignment:
Q  176 ttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4 ttaagggtatttaacctatgttgtgatggatctaatttggtttgacgtgaatatctttgtaggat 68  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 9810 - 9718
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||   | ||||| || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9810 ctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11858 - 11766
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    ||||||| ||||||||||||    | || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11858 ctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 6892 - 7031
Alignment:
Q  14 ttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttct 113  Q
    |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||| |||  || | | |||    
T  6892 ttggtttgacttgaaaataatgttttgtgtttgagttataaagaaaatactctaaggaggttttaataaaattttacgaaaatttcgcacaattgtctct 6991  T
Q  114 aagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    |||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||    
T  6992 aagtcatcccaaaccttatggatggtttccaaacttcaaa 7031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9669 - 9598
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtag 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9669 ctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtag 9598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3044 - 2971
Alignment:
Q  80 tgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | ||  |||||||||||||    
T  3044 tgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccatatgaattgcttccaaacttcaaa 2971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32872 - 32716
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||| || ||||||| ||  || ||||| | |||||  | || |||||||||||||  |    
T  32872 ctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaagtcttgataaatttttatgaaaatta-g 32774  T
Q  101 cctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    | |||   ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32773 cataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactag 32716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3001 - 2857
Alignment:
Q  9 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaacta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| | || ||| | ||| |||| |||| ||||||   | |     
T  3001 tggctttggtttgacttgaaaatactattttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggatgttttattaaaactttacgaaacttccgcaccattg 2902  T
Q  109 tttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaa 153  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||  || |||||||||||||    
T  2901 tttctaagttaacccaacccttatggatagtttccaaacttcaaa 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40968 - 40876
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| || |||||||  |||||| |||||||||    
T  40968 ctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatttttatgaa 40876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13961 - 13909
Alignment:
Q  1 ctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatg 53  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13961 ctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21201 - 21113
Alignment:
Q  70 taggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacttcaaaactag 158  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  21201 taggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactag 21113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 240
Target Start/End: Original strand, 7104 - 7178
Alignment:
Q  166 attaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttgttggat 240  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  7104 attaaggtgtctaagagtatttaacctatgttgtgataaatctcatttggattgacatgaatatctttgttggat 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Original strand, 35524 - 35586
Alignment:
Q  156 taggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgttttgatggatctaacttggttt 218  Q
    |||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35524 taggagtttaattaagaggtttaacagtatttaacctatgttttgttgaatctaacttggttt 35586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 134734 - 134687
Alignment:
Q  46 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  134734 gagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 134687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 137203 - 137156
Alignment:
Q  46 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  137203 gagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 137156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 139672 - 139625
Alignment:
Q  46 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  139672 gagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 139625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 142141 - 142094
Alignment:
Q  46 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  142141 gagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 142094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 144610 - 144563
Alignment:
Q  46 gagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaa 93  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  144610 gagttatgatgacaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 144563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49284 - 49243
Alignment:
Q  193 atgttttgatggatctaacttggtttgacgtggatatctttg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49284 atgttgtgatgaatctaacttggtttgacgtgaatatctttg 49243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University