View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7370_low_10 (Length: 343)

Name: NF7370_low_10
Description: NF7370
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7370_low_10
NF7370_low_10
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-342)||(26484826-26485167)
chr7 (1-342)||(2775491-2775832)
chr7 (1-342)||(39210693-39211034)
chr7 (1-339)||(4200682-4201020)
chr7 (1-342)||(2108675-2109016)
chr7 (1-343)||(16449668-16450010)
chr7 (1-339)||(26682670-26683008)
chr7 (1-343)||(16041454-16041796)
chr7 (1-339)||(45733595-45733933)
chr7 (1-339)||(31088134-31088472)
chr7 (2-342)||(5128124-5128464)
chr7 (24-336)||(10916561-10916873)
chr7 (24-336)||(11424469-11424781)
chr7 (2-336)||(2154711-2155045)
chr7 (24-336)||(16518109-16518421)
chr7 (24-336)||(16503073-16503385)
chr7 (59-342)||(26274822-26275105)
chr7 (59-342)||(31564118-31564401)
chr7 (61-342)||(26435389-26435670)
chr7 (2-342)||(3445438-3445778)
chr7 (59-342)||(5147068-5147351)
chr7 (59-342)||(11441704-11441987)
chr7 (59-342)||(24592269-24592552)
chr7 (59-342)||(26319597-26319880)
chr7 (59-342)||(26537598-26537881)
chr7 (59-342)||(26669642-26669925)
chr7 (26-342)||(4144818-4145134)
chr7 (59-342)||(31125052-31125335)
chr7 (2-342)||(16736131-16736471)
chr7 (2-342)||(16751185-16751525)
chr7 (2-342)||(17523664-17524004)
chr7 (2-342)||(17529211-17529551)
chr7 (59-342)||(9618783-9619066)
chr7 (59-342)||(45387475-45387758)
chr7 (45-342)||(18540931-18541228)
chr7 (45-342)||(5159651-5159948)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-342)||(31033942-31034283)
chr3 (1-342)||(32292844-32293185)
chr3 (1-343)||(16626331-16626673)
chr3 (1-343)||(18530479-18530821)
chr3 (1-339)||(5652482-5652820)
chr3 (1-339)||(4626039-4626377)
chr3 (1-342)||(5713319-5713660)
chr3 (1-342)||(5724229-5724570)
chr3 (1-342)||(5767798-5768139)
chr3 (24-336)||(18051360-18051672)
chr3 (47-342)||(5756954-5757248)
chr3 (1-339)||(17993609-17993947)
chr3 (24-336)||(15740942-15741254)
chr3 (2-336)||(8296070-8296404)
chr3 (2-339)||(6192411-6192748)
chr3 (24-336)||(15892554-15892866)
chr3 (54-336)||(18330767-18331049)
chr3 (2-342)||(7073304-7073644)
chr3 (2-336)||(8301093-8301427)
chr3 (2-342)||(29148581-29148921)
chr3 (59-342)||(4417011-4417294)
chr3 (54-336)||(4796531-4796813)
chr3 (2-336)||(35880864-35881198)
chr3 (59-342)||(22387461-22387744)
chr3 (59-342)||(28115837-28116120)
chr3 (25-342)||(48466019-48466336)
chr3 (2-342)||(18292179-18292519)
chr3 (59-342)||(10396225-10396508)
chr3 (59-330)||(29664853-29665124)
chr3 (2-339)||(4721726-4722063)
chr3 (2-342)||(11110175-11110515)
chr3 (2-342)||(18276878-18277218)
chr3 (2-342)||(18307480-18307820)
chr3 (59-342)||(28021367-28021650)
chr3 (2-342)||(6542288-6542628)
chr3 (2-342)||(8211830-8212170)
chr3 (2-330)||(20576673-20577001)
chr3 (2-342)||(51782115-51782455)
chr3 (59-342)||(21674785-21675068)
chr3 (59-342)||(22870739-22871022)
chr3 (59-342)||(22885798-22886081)
chr3 (59-342)||(24328251-24328534)
chr3 (2-342)||(36996903-36997243)
chr3 (59-342)||(4346570-4346853)
chr3 (59-342)||(5013804-5014087)
chr3 (59-342)||(5467077-5467360)
chr3 (59-342)||(5609205-5609488)
chr3 (2-342)||(18242831-18243171)
chr3 (59-342)||(28339394-28339677)
chr3 (97-342)||(51797205-51797450)
chr3 (26-342)||(5596207-5596523)
chr3 (59-342)||(7996654-7996937)
chr3 (59-342)||(10643162-10643445)
chr3 (59-342)||(47023545-47023828)
chr3 (25-342)||(20066135-20066452)
chr3 (59-330)||(17984839-17985110)
chr3 (25-342)||(32439246-32439563)
chr3 (59-342)||(18225283-18225566)
chr3 (59-342)||(31964356-31964639)
chr3 (97-342)||(50133992-50134237)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-343)||(2442-2784)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-343)||(20340119-20340461)
chr1 (1-342)||(28151992-28152333)
chr1 (2-343)||(16207816-16208157)
chr1 (1-343)||(20461210-20461552)
chr1 (26-342)||(51638348-51638664)
chr1 (59-342)||(10962800-10963083)
chr1 (59-342)||(28585111-28585394)
chr1 (2-342)||(41793093-41793433)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (1-342)||(14143012-14143353)
chr6 (1-342)||(26788072-26788413)
chr6 (1-342)||(27196445-27196786)
chr6 (1-342)||(27252454-27252795)
chr6 (1-339)||(13521800-13522138)
chr6 (1-343)||(22456670-22457003)
chr6 (1-339)||(33373983-33374321)
chr6 (2-343)||(27290098-27290439)
chr6 (1-339)||(8892038-8892375)
chr6 (1-339)||(8903273-8903610)
chr6 (1-339)||(28162788-28163126)
chr6 (24-339)||(22934630-22934945)
chr6 (24-339)||(23857075-23857390)
chr6 (2-342)||(29549603-29549943)
chr6 (2-336)||(24304346-24304680)
chr6 (2-336)||(26989135-26989469)
chr6 (1-339)||(27272307-27272645)
chr6 (2-342)||(16749982-16750322)
chr6 (24-336)||(24863851-24864163)
chr6 (54-336)||(13298731-13299013)
chr6 (24-342)||(26918508-26918826)
chr6 (1-264)||(17092167-17092430)
chr6 (2-342)||(27007855-27008195)
chr6 (2-342)||(27359720-27360060)
chr6 (2-342)||(27450063-27450403)
chr6 (2-336)||(15424045-15424379)
chr6 (2-342)||(4545503-4545843)
chr6 (2-342)||(4773134-4773474)
chr6 (2-342)||(4757892-4758232)
chr6 (59-342)||(29573141-29573424)
chr6 (59-330)||(30557801-30558072)
chr6 (2-342)||(34463074-34463414)
chr6 (59-330)||(4525426-4525697)
chr6 (59-342)||(16674267-16674550)
chr6 (2-342)||(26116138-26116478)
chr6 (59-342)||(4723919-4724202)
chr6 (63-342)||(28207582-28207861)
chr6 (2-342)||(29501543-29501883)
chr6 (59-342)||(3696209-3696492)
chr6 (59-342)||(16943812-16944095)
chr6 (97-330)||(17025417-17025650)
chr6 (59-342)||(27044515-27044799)
chr6 (2-342)||(27485257-27485597)
chr6 (149-336)||(27000207-27000394)
chr6 (47-336)||(20160835-20161124)
chr6 (47-336)||(22171707-22171996)
chr6 (241-343)||(22477240-22477342)
chr6 (113-342)||(26777454-26777683)
chr6 (113-285)||(27629539-27629711)
chr6 (54-145)||(27019461-27019552)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-339)||(33877390-33877728)
chr5 (1-343)||(22888609-22888951)
chr5 (1-342)||(29888763-29889104)
chr5 (1-339)||(11325937-11326275)
chr5 (1-343)||(25199168-25199510)
chr5 (2-339)||(23892349-23892686)
chr5 (1-339)||(13184329-13184667)
chr5 (1-339)||(13440175-13440513)
chr5 (1-342)||(9548224-9548565)
chr5 (24-336)||(30934779-30935091)
chr5 (54-339)||(23752184-23752469)
chr5 (60-336)||(24687897-24688173)
chr5 (24-336)||(22998818-22999130)
chr5 (24-336)||(24970164-24970476)
chr5 (24-336)||(23717692-23718004)
chr5 (59-336)||(11549500-11549777)
chr5 (2-339)||(33777630-33777967)
chr5 (59-342)||(15658499-15658782)
chr5 (2-342)||(31431580-31431920)
chr5 (2-342)||(37671165-37671505)
chr5 (2-342)||(43078392-43078732)
chr5 (59-342)||(28649375-28649658)
chr5 (26-342)||(12132295-12132611)
chr5 (2-342)||(13324511-13324851)
chr5 (62-342)||(30168609-30168889)
chr5 (59-342)||(9317591-9317874)
chr5 (59-342)||(18500469-18500752)
chr5 (59-330)||(33516508-33516779)
chr5 (25-330)||(40473254-40473559)
chr5 (2-342)||(31826089-31826429)
chr5 (59-342)||(30152158-30152441)
chr5 (5-342)||(30029555-30029892)
chr5 (2-342)||(2511191-2511531)
chr5 (2-330)||(24681592-24681920)
chr5 (2-330)||(24724119-24724447)
chr5 (2-342)||(32599154-32599494)
chr5 (59-342)||(29966805-29967088)
chr5 (59-342)||(37755120-37755403)
chr5 (59-342)||(37770726-37771009)
chr5 (2-342)||(37358325-37358665)
chr5 (59-342)||(18375151-18375434)
chr5 (2-342)||(6874445-6874785)
chr5 (59-342)||(5638050-5638333)
chr5 (59-342)||(15758596-15758879)
chr5 (59-342)||(26480532-26480814)
chr5 (2-342)||(3789681-3790021)
chr5 (59-342)||(34616658-34616941)
chr5 (59-342)||(8665214-8665497)
chr5 (45-342)||(33292665-33292962)
chr5 (2-342)||(41674849-41675189)
chr5 (59-342)||(28959525-28959808)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-343)||(21702937-21703279)
chr2 (1-343)||(19456194-19456536)
chr2 (1-342)||(22925801-22926142)
chr2 (1-339)||(27118818-27119156)
chr2 (1-339)||(16163729-16164070)
chr2 (1-339)||(3784784-3785122)
chr2 (1-339)||(34157141-34157478)
chr2 (1-339)||(34303076-34303414)
chr2 (1-336)||(31891101-31891436)
chr2 (59-330)||(9349813-9350084)
chr2 (24-339)||(27434240-27434555)
chr2 (24-339)||(20838048-20838363)
chr2 (24-336)||(28882347-28882659)
chr2 (59-342)||(40233638-40233921)
chr2 (170-343)||(27393095-27393268)
chr2 (24-336)||(23128362-23128674)
chr2 (54-336)||(12655675-12655957)
chr2 (2-342)||(32049925-32050265)
chr2 (59-330)||(12586949-12587220)
chr2 (59-330)||(13936375-13936646)
chr2 (2-330)||(27777361-27777689)
chr2 (2-330)||(27817119-27817447)
chr2 (59-330)||(16829169-16829440)
chr2 (59-330)||(16892041-16892312)
chr2 (25-342)||(34286481-34286798)
chr2 (25-342)||(34291541-34291858)
chr2 (59-342)||(19416330-19416613)
chr2 (59-342)||(37925620-37925903)
chr2 (59-330)||(39051653-39051924)
chr2 (2-341)||(39890202-39890541)
chr2 (2-330)||(12716376-12716704)
chr2 (2-330)||(27803846-27804174)
chr2 (2-342)||(37375288-37375628)
chr2 (59-342)||(260584-260867)
chr2 (59-342)||(34861807-34862090)
chr2 (59-342)||(37685740-37686023)
chr2 (59-342)||(37701005-37701288)
chr2 (59-342)||(11635017-11635300)
chr2 (59-342)||(11641206-11641489)
chr2 (59-342)||(31876408-31876691)
chr2 (59-342)||(21677013-21677296)
chr2 (220-342)||(34279576-34279698)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-342)||(18710717-18711058)
chr8 (1-339)||(44563235-44563571)
chr8 (1-339)||(19658783-19659120)
chr8 (1-343)||(22080621-22080963)
chr8 (1-339)||(33244799-33245137)
chr8 (24-339)||(16283583-16283898)
chr8 (2-336)||(27608649-27608983)
chr8 (24-336)||(19688235-19688547)
chr8 (54-336)||(16277691-16277973)
chr8 (2-336)||(14557761-14558095)
chr8 (59-342)||(3329308-3329591)
chr8 (2-336)||(2137003-2137337)
chr8 (63-342)||(12092529-12092808)
chr8 (59-330)||(29829465-29829736)
chr8 (59-339)||(9354756-9355037)
chr8 (59-342)||(31489551-31489834)
chr8 (54-311)||(189256-189513)
chr8 (2-342)||(19674572-19674912)
chr8 (59-342)||(19286593-19286876)
chr8 (59-342)||(19208161-19208444)
chr8 (59-342)||(28361756-28362039)
chr8 (59-342)||(33258854-33259137)
chr8 (59-342)||(31354655-31354938)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-343)||(1900402-1900744)
chr4 (1-343)||(15228015-15228357)
chr4 (4-342)||(15284715-15285053)
chr4 (1-343)||(15391122-15391464)
chr4 (1-339)||(24460389-24460727)
chr4 (1-339)||(14235309-14235647)
chr4 (2-339)||(17014149-17014486)
chr4 (54-336)||(24592151-24592433)
chr4 (24-336)||(14665170-14665482)
chr4 (2-342)||(36344300-36344640)
chr4 (59-342)||(27163159-27163442)
chr4 (2-330)||(21969859-21970187)
chr4 (59-342)||(5006019-5006302)
chr4 (25-342)||(6569999-6570316)
chr4 (2-342)||(14763089-14763429)
chr4 (59-342)||(31126360-31126643)
chr4 (59-330)||(39850796-39851067)
chr4 (59-342)||(40105480-40105763)
chr4 (2-342)||(18800398-18800738)
chr4 (2-342)||(33673583-33673923)
chr4 (59-341)||(14098688-14098970)
chr4 (59-342)||(54833533-54833816)
chr4 (2-342)||(30753900-30754240)
chr4 (45-342)||(24112808-24113105)
chr4 (45-342)||(34188788-34189085)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-343)||(21691-22033)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-327)||(402-728)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (131-343)||(1832-2043)
scaffold0415 (59-342)||(6143-6428)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (131-343)||(20518-20729)
scaffold0124 (24-330)||(30595-30901)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (2-336)||(46770-47104)
scaffold0089 (24-336)||(39876-40188)
scaffold0089 (54-336)||(29900-30182)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (24-336)||(27429-27741)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (59-342)||(9697-9980)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (190-343)||(1-154)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (97-336)||(9-248)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (59-342)||(7081-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (26-342)||(26010-26326)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (63-342)||(8080-8359)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (59-342)||(14772-15055)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (59-342)||(8908-9191)
scaffold0159 (59-342)||(20146-20429)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (77-336)||(46659-46927)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (113-285)||(277-449)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26485167 - 26484826
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26485167 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 26485068  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26485067 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 26484968  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484967 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 26484868  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26484867 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 26484826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2775832 - 2775491
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775832 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattatagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 2775733  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2775732 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 2775633  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2775632 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatc 2775533  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2775532 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2775491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 39210693 - 39211034
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210693 ctggatgtcattttgaacaacacagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 39210792  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39210793 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 39210892  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39210893 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 39210992  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39210993 atgacccaaagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 39211034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4201020 - 4200682
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201020 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 4200921  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200920 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 4200821  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4200820 ggttatcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatc 4200721  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4200720 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 4200682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 2108675 - 2109016
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2108675 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataatttg 2108774  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2108775 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtccagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 2108874  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108875 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 2108974  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2108975 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 2109016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16449668 - 16450010
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16449668 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcatagcttg 16449767  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449768 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacgtccagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 16449867  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16449868 gattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatc 16449967  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449968 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 16450010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 26682670 - 26683008
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682670 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 26682769  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682770 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 26682869  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26682870 ggttgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttaaaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatc 26682969  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26682970 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 26683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16041796 - 16041454
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  16041796 ctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaagattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtgattaaacagagaggcttgacatagcttg 16041697  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041696 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcgtatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 16041597  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16041596 gattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagctttttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttctacatc 16041497  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16041496 atgacccagagcaccttgatggaaatcacactttaggtcagaa 16041454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45733933 - 45733595
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45733933 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 45733834  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45733833 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 45733734  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  45733733 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 45733634  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733633 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 45733595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 31088134 - 31088472
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||  | |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31088134 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccgaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 31088233  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31088234 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 31088333  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  31088334 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 31088433  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088434 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 31088472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5128464 - 5128124
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  5128464 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttga 5128365  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |  ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  5128364 tgtgtagaggcaccagaggagttacgacgttatggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagagg 5128265  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  5128264 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatca 5128165  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5128164 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 5128124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 10916561 - 10916873
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||  || | |||||||||||| || |||||||||||    
T  10916561 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttacacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 10916660  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  10916661 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 10916760  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  10916761 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 10916860  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  10916861 aatcacatttgag 10916873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 11424469 - 11424781
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  11424469 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 11424568  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11424569 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 11424668  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  11424669 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 11424768  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  11424769 aatcacatttgag 11424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2155045 - 2154711
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  2155045 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 2154946  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  2154945 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 2154846  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  2154845 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcatccctcgacatca 2154746  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    ||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  2154745 tgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 2154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 16518109 - 16518421
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  16518109 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 16518208  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16518209 tgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 16518308  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16518309 ttattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 16518408  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  16518409 aatcacatttgag 16518421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 16503073 - 16503385
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  16503073 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 16503172  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16503173 tgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 16503272  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16503273 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaaacatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 16503372  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  16503373 aatcacatttgag 16503385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 26274822 - 26275105
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  26274822 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26274921  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  26274922 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26275021  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  26275022 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 26275105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 31564118 - 31564401
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  31564118 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 31564217  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  31564218 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 31564317  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31564318 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31564401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26435670 - 26435389
Alignment:
Q  61 ggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctca 160  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  26435670 ggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctca 26435571  T
Q  161 tatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagct 260  Q
     | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||    
T  26435570 cacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagct 26435471  T
Q  261 tcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26435470 tcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 26435389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3445778 - 3445438
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  3445778 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 3445679  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||    
T  3445678 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggtagcgg 3445579  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||    
T  3445578 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 3445479  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  3445478 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 3445438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 5147068 - 5147351
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  5147068 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5147167  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  5147168 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 5147267  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5147268 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 5147351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11441987 - 11441704
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  11441987 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 11441888  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  11441887 cacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 11441788  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11441787 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 11441704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 24592269 - 24592552
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  24592269 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 24592368  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  24592369 cacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 24592468  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24592469 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 24592552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 26319597 - 26319880
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  26319597 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26319696  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  26319697 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26319796  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  26319797 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 26319880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 26537598 - 26537881
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  26537598 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 26537697  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  26537698 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 26537797  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  26537798 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcaga 26537881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 26669642 - 26669925
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  26669642 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26669741  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  26669742 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26669841  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  26669842 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 26669925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 4144818 - 4145134
Alignment:
Q  26 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||    
T  4144818 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttg 4144917  T
Q  126 caatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacatt 225  Q
    | |  || |||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  4144918 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 4145017  T
Q  226 gttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 325  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  4145018 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 4145117  T
Q  326 tcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  4145118 tcacatttgagatcaga 4145134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31125335 - 31125052
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  31125335 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaatattgcggacatcaagtctaggagcttcct 31125236  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  31125235 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31125136  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31125135 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31125052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 16736131 - 16736471
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  16736131 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 16736230  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||    
T  16736231 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcgg 16736330  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  16736331 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 16736430  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16736431 tgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 16736471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 16751185 - 16751525
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  16751185 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 16751284  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||    
T  16751285 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcgg 16751384  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  16751385 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 16751484  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16751485 tgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 16751525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17524004 - 17523664
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  17524004 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 17523905  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||    
T  17523904 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcgg 17523805  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  17523804 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 17523705  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17523704 tgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 17523664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 17529211 - 17529551
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  17529211 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 17529310  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| ||||| || || |||||||| || ||    
T  17529311 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacggcggcatgattcggtagcgg 17529410  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  17529411 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 17529510  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  17529511 tgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 17529551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9619066 - 9618783
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  9619066 ttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 9618967  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  9618966 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 9618867  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  9618866 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 9618783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45387758 - 45387475
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||| |    
T  45387758 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 45387659  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  45387658 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 45387559  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  45387558 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 45387475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18541228 - 18540931
Alignment:
Q  45 aacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaag 144  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  18541228 aacattcttggcattcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccag 18541129  T
Q  145 tccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaacttt 244  Q
       |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  18541128 catgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttc 18541029  T
Q  245 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  18541028 ccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 18540931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5159948 - 5159651
Alignment:
Q  45 aacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaag 144  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  5159948 aacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagcggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccag 5159849  T
Q  145 tccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaacttt 244  Q
       |||| | || ||| ||| |||||| || ||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  5159848 catgggaacctcttcacatatctcaattatattcacggcagcatcatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttc 5159749  T
Q  245 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || |  |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  5159748 ccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcaccccttaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 5159651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 31033942 - 31034283
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31033942 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 31034041  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31034042 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 31034141  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034142 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 31034241  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31034242 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 31034283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32293185 - 32292844
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32293185 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 32293086  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32293085 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 32292986  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292985 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 32292886  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32292885 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 32292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 16626331 - 16626673
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16626331 ctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattatggaagcattccgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttg 16626430  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16626431 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagtgtgattcggaagag 16626530  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  16626531 gattgtcaaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatc 16626630  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626631 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 16626673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18530821 - 18530479
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  18530821 ctggatgtcattttgaacaacatagcaacccaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttg 18530722  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530721 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacgaacattaagtctgggagctccctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 18530622  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18530621 gattgtcgaggacacgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatc 18530522  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530521 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 18530479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5652820 - 5652482
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652820 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 5652721  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5652720 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcagcatgattcggaagag 5652621  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  5652620 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 5652521  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652520 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 5652482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4626377 - 4626039
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4626377 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggctcggcataactcg 4626278  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4626277 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 4626178  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  4626177 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 4626078  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4626077 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 4626039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5713660 - 5713319
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5713660 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 5713561  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5713560 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 5713461  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||    
T  5713460 gattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatc 5713361  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5713360 atgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5713319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5724570 - 5724229
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5724570 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 5724471  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5724470 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 5724371  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||    
T  5724370 gattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatc 5724271  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5724270 atgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5724229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 5767798 - 5768139
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5767798 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 5767897  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5767898 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 5767997  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||    
T  5767998 gattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatc 5768097  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5768098 atgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5768139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18051672 - 18051360
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  18051672 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaattgacatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 18051573  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18051572 tgcgatattacggacatcaagtctaggagctttctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 18051473  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  18051472 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgataga 18051373  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  18051372 aatcacatttgag 18051360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 342
Target Start/End: Original strand, 5756954 - 5757248
Alignment:
Q  47 cattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtc 146  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   ||    
T  5756954 cattctggcaaactggcatgatcatg-tcaaacagagaggcttggcataactcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatc 5757052  T
Q  147 cgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcc 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  5757053 tgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgacgacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttccc 5757152  T
Q  247 ttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5757153 ttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5757248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 17993609 - 17993947
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||    
T  17993609 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttg 17993708  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17993709 atgtgtagaggtaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 17993808  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  17993809 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 17993908  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17993909 atgacccatagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 17993947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 15740942 - 15741254
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  15740942 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagt 15741041  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15741042 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 15741141  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15741142 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatcatgacccagagcgccttgatgaa 15741241  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  15741242 aatcacatttgag 15741254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8296404 - 8296070
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  8296404 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 8296305  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8296304 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 8296205  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  8296204 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 8296105  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8296104 tgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgag 8296070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6192748 - 6192411
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  6192748 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 6192649  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  6192648 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 6192549  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  6192548 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 6192449  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6192448 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtc 6192411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 15892554 - 15892866
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  15892554 agcaacccaaaggattacaaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 15892653  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15892654 tgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 15892753  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15892754 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 15892853  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  15892854 aatcacatttgag 15892866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18331049 - 18330767
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  18331049 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 18330950  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  18330949 ttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 18330850  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  18330849 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 18330767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7073644 - 7073304
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| | ||||  |  |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  7073644 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaagggttacgaaggcattctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 7073545  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  7073544 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagagg 7073445  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  7073444 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 7073345  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7073344 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 7073304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 8301093 - 8301427
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  8301093 tggatgtcattttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 8301192  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  8301193 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 8301292  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||    
T  8301293 attgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctctacatca 8301392  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  8301393 tgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 8301427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 29148581 - 29148921
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  29148581 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 29148680  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  29148681 tgtgtagaggcaccagaggagttgtgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 29148780  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  29148781 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 29148880  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29148881 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 29148921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4417294 - 4417011
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  4417294 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 4417195  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  4417194 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 4417095  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4417094 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 4417011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Original strand, 4796531 - 4796813
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  4796531 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 4796630  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  4796631 ttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 4796730  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  4796731 atgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 4796813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35881198 - 35880864
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  35881198 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 35881099  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  35881098 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 35880999  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  35880998 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 35880899  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    ||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  35880898 tgacctagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 35880864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 22387461 - 22387744
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||| ||||||   | |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  22387461 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgttgtgtataagcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 22387560  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  22387561 cacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 22387660  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22387661 cttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 22387744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 28115837 - 28116120
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  28115837 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 28115936  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||| | ||||||    
T  28115937 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaatgtcagctttccttgatcaatgag 28116036  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28116037 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 28116120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48466336 - 48466019
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48466336 gcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagtt 48466237  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    || |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  48466236 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 48466137  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    | ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  48466136 tattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 48466037  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  48466036 atcacatttgagatcaga 48466019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 18292179 - 18292519
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  18292179 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttga 18292278  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  18292279 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcgg 18292378  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  18292379 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 18292478  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18292479 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18292519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10396508 - 10396225
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |  |||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||    
T  10396508 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgatgtgtagagacaccagaggagttgcgatgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 10396409  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| ||||| | ||||||    
T  10396408 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcaatgag 10396309  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10396308 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 10396225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 29664853 - 29665124
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  29664853 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 29664952  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  29664953 cacacacttcgatcatattcacagcggcgtgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 29665052  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  29665053 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 29665124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4722063 - 4721726
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  4722063 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 4721964  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  4721963 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcgagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagagg 4721864  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||| | |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| || |||||||||    
T  4721863 attgtcgaggacatgtgggacattattctaaaaagtcagctttccttgatcaatgagatttttcacgatatacttcaaagtgtagcacccctcgacatca 4721764  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4721763 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtc 4721726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 11110175 - 11110515
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  11110175 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 11110274  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  11110275 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtcttggagcttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttgggagagg 11110374  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  11110375 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 11110474  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11110475 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 11110515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 18276878 - 18277218
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  18276878 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 18276977  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  18276978 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcgg 18277077  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  18277078 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 18277177  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18277178 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18277218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 18307480 - 18307820
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  18307480 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 18307579  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  18307580 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcgg 18307679  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  18307680 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 18307779  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18307780 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18307820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28021650 - 28021367
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  28021650 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 28021551  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  28021550 cacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgggggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 28021451  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28021450 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcataacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 28021367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 6542288 - 6542628
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  6542288 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 6542387  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  6542388 tgtgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtgg 6542487  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  6542488 attgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 6542587  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  6542588 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 6542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8212170 - 8211830
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |  ||||    
T  8212170 tggatgtcgtcttgaacatcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttga 8212071  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  8212070 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 8211971  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  8211970 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 8211871  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8211870 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 8211830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 20576673 - 20577001
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  20576673 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 20576772  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  20576773 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 20576872  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  20576873 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 20576972  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  20576973 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 20577001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51782455 - 51782115
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||    
T  51782455 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttga 51782356  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  51782355 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 51782256  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  51782255 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 51782156  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  51782155 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 51782115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21675068 - 21674785
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  21675068 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 21674969  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  21674968 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggagcattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 21674869  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21674868 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 21674785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 22870739 - 22871022
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22870739 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 22870838  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  22870839 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 22870938  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22870939 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 22871022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 22885798 - 22886081
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  22885798 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 22885897  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  22885898 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 22885997  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22885998 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 22886081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24328534 - 24328251
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  24328534 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 24328435  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  24328434 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 24328335  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  24328334 cttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 24328251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 36996903 - 36997243
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  36996903 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 36997002  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  36997003 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtgg 36997102  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||    
T  36997103 attgtcgaggacatatgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 36997202  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  36997203 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 36997243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 4346570 - 4346853
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  4346570 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 4346669  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  4346670 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4346769  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4346770 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 4346853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5014087 - 5013804
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  5014087 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 5013988  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  5013987 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 5013888  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  5013887 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 5013804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5467360 - 5467077
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  5467360 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5467261  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||| | ||||||    
T  5467260 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagtttcccttgatcaatgag 5467161  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5467160 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5467077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 5609205 - 5609488
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |  ||||||||||    
T  5609205 ttggcatgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcct 5609304  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  5609305 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 5609404  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5609405 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccttcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 5609488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18243171 - 18242831
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  18243171 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 18243072  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  18243071 tgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 18242972  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  18242971 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 18242872  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18242871 tgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 18242831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28339677 - 28339394
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  28339677 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 28339578  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  28339577 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 28339478  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28339477 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 28339394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51797450 - 51797205
Alignment:
Q  97 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 196  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  51797450 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 51797351  T
Q  197 agagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcga 296  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||    
T  51797350 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 51797251  T
Q  297 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  51797250 catcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 51797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 5596207 - 5596523
Alignment:
Q  26 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||| ||| || || ||||||||||| |    
T  5596207 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtgg 5596306  T
Q  126 caatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacatt 225  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || |||||    
T  5596307 caacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacatt 5596406  T
Q  226 gttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 325  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||     
T  5596407 attctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaag 5596506  T
Q  326 tcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  5596507 tcacatttgagatcaga 5596523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7996937 - 7996654
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||| |    
T  7996937 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 7996838  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  7996837 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 7996738  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  7996737 cttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 7996654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10643445 - 10643162
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||| |    
T  10643445 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctcggagcttctt 10643346  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  10643345 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 10643246  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  10643245 cttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 10643162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47023828 - 47023545
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  47023828 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcgcagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 47023729  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  47023728 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 47023629  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  47023628 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 47023545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20066452 - 20066135
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||| |   |||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20066452 gcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcattcaacatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggtaccagaggagtt 20066353  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    |||| ||| |||||||| ||  ||||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || | ||    
T  20066352 gcaacattgcggacatccagcacgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcatat 20066253  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| |||||||||||    
T  20066252 tgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaa 20066153  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || |||||    
T  20066152 gtcacacttaagatcaga 20066135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 17984839 - 17985110
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||||||    |||||||| ||||  || | |||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  17984839 ttggcatgatcatgactgaacagagaagctttacacagcttgatatgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttctt 17984938  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  17984939 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 17985038  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  17985039 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 17985110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32439563 - 32439246
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  32439563 gcaacccaaaggattgcgggaacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcctggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagtt 32439464  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    |||| ||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||    
T  32439463 gcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacat 32439364  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| |||||||||||    
T  32439363 tgttctcaaaagttaacttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaa 32439264  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || |||||    
T  32439263 gtcacacttaagatcaga 32439246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18225566 - 18225283
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |  |||||||| |    
T  18225566 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttctt 18225467  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  18225466 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 18225367  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18225366 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 18225283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 31964356 - 31964639
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  31964356 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 31964455  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  31964456 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31964555  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31964556 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 31964639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 342
Target Start/End: Original strand, 50133992 - 50134237
Alignment:
Q  97 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 196  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||     
T  50133992 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggt 50134091  T
Q  197 agagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcga 296  Q
    || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||    
T  50134092 agcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 50134191  T
Q  297 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    | |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  50134192 cgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 50134237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 2442 - 2784
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2442 ctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 2541  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2542 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 2641  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2642 gattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatc 2741  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2742 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 20340119 - 20340461
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340119 ctggatgtcgttttgaacaacgcagtaacccaaaggattacagaaacattctggacaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 20340218  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340219 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 20340318  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20340319 gattgtcgaggacatgagggatattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatc 20340418  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340419 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 20340461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28152333 - 28151992
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152333 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 28152234  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28152233 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatatctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 28152134  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28152133 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 28152034  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28152033 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 28151992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 16207816 - 16208157
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16207816 tggatgtcattttgaacgacatagcaccccaaaggattacggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttga 16207915  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16207916 tgtgtagaggcaccaaaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggagctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagagg 16208015  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16208016 attgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatca 16208115  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208116 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 16208157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20461552 - 20461210
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  20461552 ctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacgaaagcattctggacaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttg 20461453  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20461452 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcaagtctgcgagcttgctcatatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagag 20461353  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | || || ||||||||||||||  | || ||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20461352 gattatcgaggacatgagggacgatattttcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatc 20461253  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20461252 atgacctagagcaccttgatgaaaatcacacttgaggtcagaa 20461210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51638664 - 51638348
Alignment:
Q  26 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  51638664 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttg 51638565  T
Q  126 caatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacatt 225  Q
    | | ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  51638564 cgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacatt 51638465  T
Q  226 gttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 325  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||    
T  51638464 attctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaa 51638365  T
Q  326 tcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  51638364 tcacatttgagatcaga 51638348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10963083 - 10962800
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  10963083 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 10962984  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  10962983 cacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 10962884  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  10962883 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 10962800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28585394 - 28585111
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  28585394 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 28585295  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  28585294 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 28585195  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  28585194 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 28585111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 41793093 - 41793433
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||    
T  41793093 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttga 41793192  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  41793193 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 41793292  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  | |||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||    
T  41793293 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtca 41793392  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  41793393 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 41793433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 14143012 - 14143353
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143012 ctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 14143111  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14143112 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 14143211  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143212 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 14143311  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14143312 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 14143353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26788413 - 26788072
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788413 ctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 26788314  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26788313 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 26788214  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26788213 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 26788114  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26788113 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 26788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27196786 - 27196445
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196786 ctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 27196687  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27196686 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 27196587  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196586 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 27196487  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27196486 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 27196445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 27252454 - 27252795
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252454 ctggatgtcattttaaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 27252553  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27252554 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 27252653  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252654 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 27252753  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27252754 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 27252795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13521800 - 13522138
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13521800 ctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 13521899  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13521900 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 13521999  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13522000 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatc 13522099  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522100 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13522138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22456670 - 22457003
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  22456670 ctggatgtcgttttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaagaagctttgcatagcttg 22456769  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22456770 atgtg---------cagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcgtgattcggaagag 22456860  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  22456861 gattgtcgaggacatgagggaaattattctcaaaagttaactttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatc 22456960  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22456961 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtaagaa 22457003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33373983 - 33374321
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33373983 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcgtggtcaaacagagaggcttggcataacccg 33374082  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33374083 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 33374182  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  33374183 ggttgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaagtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 33374282  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374283 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33374321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 27290098 - 27290439
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27290098 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27290197  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||| |    
T  27290198 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatatttacagtagcatgattcggaagaag 27290297  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  27290298 attgttgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaacgcgtagcatccttcgacatca 27290397  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27290398 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 27290439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 8892038 - 8892375
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8892038 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 8892137  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8892138 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 8892237  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  8892238 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 8892336  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892337 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 8892375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 8903273 - 8903610
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8903273 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 8903372  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8903373 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 8903472  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  8903473 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 8903571  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903572 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 8903610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28163126 - 28162788
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28163126 ctggatgtcattctgaacaccgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacccg 28163027  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28163026 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 28162927  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||||||| |||||||    
T  28162926 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatcctccgacatc 28162827  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162826 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 28162788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 22934630 - 22934945
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||    
T  22934630 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagt 22934729  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22934730 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 22934829  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22934830 ttattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 22934929  T
Q  324 aatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22934930 aatcacatttgaggtc 22934945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 23857075 - 23857390
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||    
T  23857075 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaaaggagt 23857174  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23857175 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 23857274  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23857275 ttattctcaaaagttagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 23857374  T
Q  324 aatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||| ||||||||    
T  23857375 aatcacatttgaggtc 23857390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29549943 - 29549603
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  29549943 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 29549844  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29549843 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtccaggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacagcggcatgatttggaagagg 29549744  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  29549743 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 29549644  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  29549643 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 29549603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 24304346 - 24304680
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  24304346 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 24304445  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  24304446 tgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 24304545  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || |||||||||    
T  24304546 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaatcatagcacccctcgacatca 24304645  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24304646 tgacccagggcaccttgatgaaaatcacatttgag 24304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26989469 - 26989135
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||    
T  26989469 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttga 26989370  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  26989369 tgtgtagagacaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 26989270  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  26989269 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttctttacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 26989170  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  26989169 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 26989135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 27272307 - 27272645
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| | ||||||||   ||||||||||| |||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| ||||||    
T  27272307 ctggatgtcatcttgaacaataaagcaacccaaaggattacggaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttg 27272406  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    || ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27272407 atatgtagaggcaccagaggagttacaacgttacggacatcaagtctaggagctacctcacatacttcgatcatattcacagcagcatgatttggaagag 27272506  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || | ||| ||||| |  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  27272507 gattatcgaggacatgcggaacattattctcaaaggtcagcttcccttgatcgatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatc 27272606  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27272607 atgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgaggtc 27272645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16750322 - 16749982
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| |||   |||||    
T  16750322 tggatgtcgtcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcaccgcttga 16750223  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  16750222 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcgggcatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 16750123  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  16750122 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 16750023  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16750022 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 16749982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24864163 - 24863851
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||||| || ||| | ||||||||| || || |||||||||||    
T  24864163 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaggatttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagt 24864064  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24864063 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 24863964  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  24863963 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 24863864  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  24863863 aatcacatttgag 24863851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Original strand, 13298731 - 13299013
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  13298731 ggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 13298830  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  13298831 ttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 13298930  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  13298931 atgagcttcttcacgatatacttcaaagtgtagcatccctcgacgtcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 13299013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26918826 - 26918508
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  26918826 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 26918727  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  26918726 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggaca 26918627  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  26918626 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 26918527  T
Q  324 aatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  26918526 aatcacatttgagatcaga 26918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 17092167 - 17092430
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| || |||  ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  17092167 ctggatgtcattttgaacaatgtagcaacccaaaggatcacggaagtattatgggcaactgctatgatcatggtcaaacaaagaggcttgacatagcttg 17092266  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  17092267 atgtttagaggcaccagaggagttgcaacactgcggacatcaagtttggtagcttcctcacatacctcagtcatgttcacagcagcgtggtttggaaggg 17092366  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttctt 264  Q
    | || || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  17092367 gattatcgaggacatgaggggtattattctcaaaagtcaactttccctggtcaatgagcttctt 17092430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27008195 - 27007855
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27008195 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27008096  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||| | | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27008095 tgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttccttacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27007996  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  27007995 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctggtcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 27007896  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27007895 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 27007855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 27359720 - 27360060
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  27359720 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttga 27359819  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    | || || || ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27359820 tatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27359919  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27359920 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatca 27360019  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27360020 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 27360060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 27450063 - 27450403
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  27450063 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcatagcttga 27450162  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    | || || || ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27450163 tatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27450262  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27450263 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatca 27450362  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27450363 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 27450403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 15424045 - 15424379
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| | |||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  15424045 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcactcggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 15424144  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  15424145 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatactttgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 15424244  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  15424245 attgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 15424344  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||| |||||    
T  15424345 tgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgag 15424379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 4545503 - 4545843
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  4545503 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 4545602  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  4545603 tgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtgg 4545702  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  4545703 attgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 4545802  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  4545803 tgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 4545843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4773474 - 4773134
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||    
T  4773474 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttga 4773375  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
     ||| || || |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4773374 cgtgcagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 4773275  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  4773274 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 4773175  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  4773174 tgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 4773134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4758232 - 4757892
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  4758232 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 4758133  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  4758132 tgtgcagaggcaccagaggggtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 4758033  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4758032 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatca 4757933  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  4757932 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 4757892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29573424 - 29573141
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  29573424 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29573325  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  29573324 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 29573225  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29573224 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 29573141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 30557801 - 30558072
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  30557801 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 30557900  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  30557901 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 30558000  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  30558001 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 30558072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 34463074 - 34463414
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  34463074 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 34463173  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  34463174 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 34463273  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  34463274 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 34463373  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34463374 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 34463414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4525697 - 4525426
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4525697 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 4525598  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  4525597 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4525498  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  4525497 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 4525426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16674550 - 16674267
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   || ||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  16674550 ttggcatgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 16674451  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  16674450 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 16674351  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16674350 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 16674267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 26116138 - 26116478
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  26116138 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 26116237  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    | ||||| || |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  26116238 tatgtagaggcaccagaggagtgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 26116337  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  26116338 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 26116437  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  26116438 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 26116478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 4723919 - 4724202
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  4723919 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 4724018  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  4724019 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 4724118  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  4724119 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 4724202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28207861 - 28207582
Alignment:
Q  63 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcata 162  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  28207861 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 28207762  T
Q  163 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttc 262  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||    
T  28207761 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 28207662  T
Q  263 ttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  28207661 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 28207582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29501883 - 29501543
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  29501883 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 29501784  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  29501783 tgtgcagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 29501684  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  29501683 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 29501584  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29501583 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 29501543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3696492 - 3696209
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  3696492 ttggcatgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcat 3696393  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  3696392 cacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 3696293  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  3696292 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcaga 3696209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 16943812 - 16944095
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  16943812 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 16943911  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  16943912 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 16944011  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  16944012 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 16944095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17025650 - 17025417
Alignment:
Q  97 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 196  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  17025650 cttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgga 17025551  T
Q  197 agagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcga 296  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||    
T  17025550 agaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcga 17025451  T
Q  297 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  17025450 catcatgtcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 17025417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27044799 - 27044515
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  27044799 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 27044700  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  27044699 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 27044600  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcat-agcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || |||||||||| | || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27044599 tttcttcacgatatacttcaaagcataaccacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 27044515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27485597 - 27485257
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27485597 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27485498  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  27485497 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 27485398  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  27485397 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 27485298  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27485297 tgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 27485257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27000394 - 27000207
Alignment:
Q  149 ggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcctt 248  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  27000394 ggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttcctt 27000295  T
Q  249 ggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    | | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27000294 gatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 27000207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20161124 - 20160835
Alignment:
Q  47 cattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtc 146  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||  ||||||||| | | |||||  ||||| ||||||| | ||||  | || || || || |||||||    
T  20161124 cattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggcttggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtc 20161025  T
Q  147 cgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcc 246  Q
      |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |     
T  20161024 taggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttcca 20160925  T
Q  247 ttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  20160924 ttggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 20160835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 336
Target Start/End: Original strand, 22171707 - 22171996
Alignment:
Q  47 cattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtc 146  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||||  |||||  ||||||||| | | |||||  ||||| ||||||| | ||||  | || || || || |||||||    
T  22171707 cattccgggcaactgacatggtcatggctaaacaacgaggcttggtagagcttgacatgtagcggtaccaaatgagtcacgatgttgcgaacgtcaagtc 22171806  T
Q  147 cgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttcc 246  Q
      |||||||||||| | || || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||| |     
T  22171807 taggagcttcctcacacacttcgatcatgttcacaacagcatgattcagaagaggattgtcaagaacatgagggacgttattctcgaaagtcagcttcca 22171906  T
Q  247 ttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22171907 ttggtctatgagctttttcacaatatacttcaaagcatagcacccttccacatcatgacctaaggcaccttggtggaaatcacacttgag 22171996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 343
Target Start/End: Original strand, 22477240 - 22477342
Alignment:
Q  241 ctttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtca 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22477240 ctttccttggtctatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtta 22477339  T
Q  341 gaa 343  Q
    |||    
T  22477340 gaa 22477342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 26777454 - 26777683
Alignment:
Q  113 accagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaagga 212  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  |||  ||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||||    
T  26777454 accagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggattttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgagga 26777553  T
Q  213 catgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagc 312  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||    
T  26777554 catgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggc 26777653  T
Q  313 accttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  26777654 accttgatgaaagtcacatttgagatcaga 26777683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Original strand, 27629539 - 27629711
Alignment:
Q  113 accagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaagga 212  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  27629539 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggcgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaagga 27629638  T
Q  213 catgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcata 285  Q
    |||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||  ||||| || || ||||||||    
T  27629639 catgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctggacaatatactttaaagcata 27629711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27019552 - 27019461
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagt 145  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  27019552 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccaggggagttgcgacgttacggacatcaagt 27019461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33877728 - 33877390
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877728 ctggatgtcattttgaacaacgcaacaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatggtcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 33877629  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33877628 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggatgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 33877529  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33877528 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtgtttcaaagcatagcatccttcgacatc 33877429  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877428 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33877390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22888951 - 22888609
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22888951 ctggatgtcattttgaacaacgtaacaacccaaaggattacggaagcattctgggcaactagcatgatcatggtcaaacaaagaggtttggcatagcttg 22888852  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22888851 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctaggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 22888752  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22888751 gattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatc 22888652  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888651 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 22888609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 29888763 - 29889104
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  29888763 ctggatgtcattttgaacagcatagcaacccaaaggattacgaaagcaatctgggcaattggcatgatcacggttaaacagagaagctttgcatagcttg 29888862  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888863 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatacacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 29888962  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29888963 gattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcaaagcatagcatccttcgacatc 29889062  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29889063 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatatgaggtcaga 29889104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11326275 - 11325937
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11326275 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 11326176  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11326175 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcaacgtgattcggaagag 11326076  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326075 ggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 11325976  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11325975 atgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 11325937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25199510 - 25199168
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25199510 ctggatgtcatcttgaacgacgtagcaccccgaaggattacagaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaaaaggcttggcatagcttg 25199411  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25199410 atgtgtaaaggcaccagaggagttgcaacattacgaacatcaagtctgggggctttctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 25199311  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  25199310 gattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtactttaaagcgtagcatccttcgacatc 25199211  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25199210 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgagatcagaa 25199168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23892686 - 23892349
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| |||||||| | | |||| |||||| ||||||  |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  23892686 tggatgtcattttgaacgaagtagcaccccaaaggattacgaaggcatcctgggcagttggcatgatcatggttaaacagagaagctttgcatagcttga 23892587  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23892586 tgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcacgttcacagcagcatgattcggaagagg 23892487  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23892486 attgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacgatgtacttcagagcatagcatctttcgacatca 23892387  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23892386 tgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 23892349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13184329 - 13184667
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184329 ctggatgtcattctgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 13184428  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13184429 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 13184528  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  13184529 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 13184628  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184629 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13184667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 13440175 - 13440513
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13440175 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagaaaggcttggcataactcg 13440274  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13440275 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcagaagag 13440374  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  13440375 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 13440474  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440475 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 13440513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 9548224 - 9548565
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9548224 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcataatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 9548323  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  9548324 atgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagag 9548423  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||    
T  9548424 gattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatc 9548523  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9548524 atgacctagggcaccttgatgaaaatcacacttgagatcaga 9548565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30935091 - 30934779
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  30935091 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagt 30934992  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30934991 tgcgatattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatatacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 30934892  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  30934891 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 30934792  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  30934791 aatcacatttgag 30934779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 339
Target Start/End: Original strand, 23752184 - 23752469
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  23752184 ggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 23752283  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  23752284 ttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 23752383  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23752384 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgaggtc 23752469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 336
Target Start/End: Original strand, 24687897 - 24688173
Alignment:
Q  60 tggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctc 159  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24687897 tggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctc 24687996  T
Q  160 atatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagc 259  Q
    | |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||    
T  24687997 acatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagc 24688096  T
Q  260 ttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    || ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24688097 tttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagagcgccttgatggaaatcacatttgag 24688173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 22998818 - 22999130
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  22998818 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 22998917  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22998918 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatggtttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 22999017  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  22999018 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaa 22999117  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||    
T  22999118 aatcacacttgag 22999130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24970476 - 24970164
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  24970476 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagt 24970377  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||  || ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24970376 tgtgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacgtactttgatcatatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 24970277  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || |||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24970276 ttattctcaaaagtccgctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 24970177  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  24970176 aatcacatttgag 24970164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 23717692 - 23718004
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  23717692 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 23717791  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  23717792 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggaca 23717891  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  23717892 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 23717991  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  23717992 aatcacatttgag 23718004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11549777 - 11549500
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11549777 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcct 11549678  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  11549677 cgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 11549578  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  11549577 cttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 11549500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33777967 - 33777630
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   || ||||| |||| ||| | |||||    
T  33777967 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaatagagaagctttgcacagcttga 33777868  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||  || ||||| ||||||||    
T  33777867 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagagg 33777768  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  33777767 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatca 33777668  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  33777667 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtc 33777630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 15658499 - 15658782
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15658499 ttggcatgatcatggctgaacagagaagcttcgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 15658598  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||    
T  15658599 cacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgag 15658698  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15658699 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 15658782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31431920 - 31431580
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||    
T  31431920 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttga 31431821  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    | || || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  31431820 tatgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 31431721  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31431720 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatca 31431621  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31431620 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31431580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 37671165 - 37671505
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  37671165 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 37671264  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||| |   ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  37671265 tgtgcagaggcaccagaggggcgacaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 37671364  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  37671365 attgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 37671464  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  37671465 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 37671505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43078732 - 43078392
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  43078732 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 43078633  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  43078632 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 43078533  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  43078532 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 43078433  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  43078432 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 43078392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28649658 - 28649375
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  28649658 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 28649559  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  28649558 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 28649459  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28649458 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 28649375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12132611 - 12132295
Alignment:
Q  26 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 125  Q
    ||||||||| ||| || || |||| || | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12132611 caacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttg 12132512  T
Q  126 caatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacatt 225  Q
    | |  || |||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  12132511 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 12132412  T
Q  226 gttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 325  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  12132411 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 12132312  T
Q  326 tcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  12132311 tcacatttgagatcaga 12132295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 13324511 - 13324851
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  13324511 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 13324610  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||| ||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  13324611 tgtgcagaggcaccagaggggttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 13324710  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  13324711 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 13324810  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  13324811 tgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 13324851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30168889 - 30168609
Alignment:
Q  62 gcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcat 161  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| ||| |||     
T  30168889 gcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcttcac 30168790  T
Q  162 atacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagctt 261  Q
    |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||    
T  30168789 atacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtgggacattattctcaaaagtgagcttcccttgatcaatgagctt 30168690  T
Q  262 cttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  30168689 cttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcaga 30168609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9317874 - 9317591
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  9317874 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 9317775  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  9317774 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 9317675  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  9317674 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 9317591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 18500469 - 18500752
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  18500469 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcct 18500568  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  18500569 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 18500668  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18500669 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 18500752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33516779 - 33516508
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  33516779 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 33516680  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  33516679 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 33516580  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  33516579 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 33516508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 330
Target Start/End: Original strand, 40473254 - 40473559
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| ||| || || |||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40473254 gcaacccaaaggatcacggagacatcctagacacttggcatggtcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagtt 40473353  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    || |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  40473354 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacat 40473453  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    | ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  40473454 tattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaa 40473553  T
Q  325 atcaca 330  Q
    ||||||    
T  40473554 atcaca 40473559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 31826089 - 31826429
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  31826089 tggatgtcgtcttgaacagcttggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 31826188  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  31826189 tgtgcagaggcaccaaaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagtttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 31826288  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||    
T  31826289 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 31826388  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31826389 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31826429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30152441 - 30152158
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  30152441 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 30152342  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  30152341 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 30152242  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  30152241 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 30152158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30029892 - 30029555
Alignment:
Q  5 atgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | ||||||||    
T  30029892 atgtcgtcttgaacagcgtggcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgt 30029793  T
Q  105 gtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggtt 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| ||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||    
T  30029792 gtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggatt 30029693  T
Q  205 gtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatga 304  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  30029692 gtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatga 30029593  T
Q  305 cccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  30029592 cccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 30029555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2511531 - 2511191
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  2511531 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 2511432  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  2511431 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagcctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 2511332  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  2511331 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 2511232  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  2511231 tgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 2511191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24681920 - 24681592
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  24681920 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 24681821  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  24681820 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 24681721  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  24681720 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 24681621  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  24681620 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24681592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24724447 - 24724119
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  24724447 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 24724348  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  24724347 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 24724248  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  24724247 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 24724148  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  24724147 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 24724119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 32599154 - 32599494
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    |||| |||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | |||||    
T  32599154 tggatgtcgtcttgaacagtatagcagcccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttga 32599253  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
     ||| || || ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  || ||||||||| | || || ||||| |||||||| || |||||||| || ||    
T  32599254 cgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggggcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcggtagcgg 32599353  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||    
T  32599354 attgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtca 32599453  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  32599454 tgacctaatgcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 32599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 29966805 - 29967088
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  29966805 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 29966904  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  29966905 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 29967004  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29967005 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 29967088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37755403 - 37755120
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  37755403 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 37755304  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  37755303 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 37755204  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  37755203 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 37755120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 37770726 - 37771009
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||    
T  37770726 ttggcatgatcatggctgaacaaagaagctttgcacagcttgatatgtagaggcaccagaggagtagcaacattgcggacatcaagtctagaagcttcct 37770825  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  37770826 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 37770925  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||  || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  37770926 cttcttcatgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 37771009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 37358325 - 37358665
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  37358325 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 37358424  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  37358425 tgtgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 37358524  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||    
T  37358525 attgtcgaggacatgtggaatattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 37358624  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    || || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  37358625 tgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 37358665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 18375151 - 18375434
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  18375151 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 18375250  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || |||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  18375251 cacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 18375350  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18375351 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 18375434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6874785 - 6874445
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| | |||||    
T  6874785 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggttgaacagagaagctttgcacagcttga 6874686  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  6874685 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 6874586  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||    
T  6874585 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgataagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtca 6874486  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6874485 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 6874445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5638333 - 5638050
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  5638333 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 5638234  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  5638233 cacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattttcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 5638134  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  5638133 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 5638050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 15758596 - 15758879
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  15758596 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 15758695  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  15758696 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 15758795  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  15758796 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 15758879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26480814 - 26480532
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  26480814 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagag-agttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 26480716  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  26480715 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 26480616  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  26480615 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 26480532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3790021 - 3789681
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  3790021 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 3789922  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || || ||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  3789921 tgtgcagaggcactagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 3789822  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  3789821 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 3789722  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  3789721 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 3789681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34616941 - 34616658
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  34616941 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 34616842  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  34616841 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 34616742  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  34616741 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 34616658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 8665214 - 8665497
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  8665214 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 8665313  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  8665314 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagtggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 8665413  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  8665414 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 8665497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33292962 - 33292665
Alignment:
Q  45 aacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaag 144  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  33292962 aacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccag 33292863  T
Q  145 tccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaacttt 244  Q
       |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| || || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  33292862 catgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcatcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttc 33292763  T
Q  245 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33292762 ccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 33292665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41675189 - 41674849
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |  ||||    
T  41675189 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttga 41675090  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||    
T  41675089 tgtgtagaggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcgg 41674990  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     || || |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || ||||||    
T  41674989 attatcgaggacatgtggcacattattctcaaaagtcagcttcccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatca 41674890  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  41674889 tggcctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 41674849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 28959525 - 28959808
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||| ||| || || ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||  ||||  ||||    
T  28959525 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttgacgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgtggacatcaagtctaggagtctcct 28959624  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| || ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  28959625 cacacacttcgatcatatttacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 28959724  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  28959725 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 28959808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 21702937 - 21703279
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21702937 ctggatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcattctgggcaattggtatgatcgtggttaaacagagaggcttggcatagcttg 21703036  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21703037 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttacgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 21703136  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  21703137 gattgtcgaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatcctttgacatc 21703236  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703237 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 21703279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 19456194 - 19456536
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19456194 ctggatatcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacagaagcattccgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttg 19456293  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19456294 atgtgtagtggcactagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacaacagcgtgattcggaagag 19456393  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  19456394 gattgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcattcttcaacatc 19456493  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456494 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 19456536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22925801 - 22926142
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22925801 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaagaattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 22925900  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  22925901 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggtagcg 22926000  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||    
T  22926001 gattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtc 22926100  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22926101 atgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 22926142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27119156 - 27118818
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119156 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 27119057  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27119056 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacaaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacaacagcgtgattcggaagag 27118957  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  27118956 gattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 27118857  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118856 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 27118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16164070 - 16163729
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagagg---cttggcataac 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  16164070 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacataatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggaggcttggcataac 16163971  T
Q  98 ttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaa 197  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16163970 tcgatgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaa 16163871  T
Q  198 gagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgac 297  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||| |    
T  16163870 gaggattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgcc 16163771  T
Q  298 atcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163770 atcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 16163729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3785122 - 3784784
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3785122 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 3785023  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3785022 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 3784923  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  3784922 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 3784823  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784822 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 3784784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34157478 - 34157141
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34157478 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 34157379  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34157378 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 34157279  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  34157278 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 34157180  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157179 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 34157141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 34303076 - 34303414
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34303076 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattttgggcaattggcatgatcattgtcaaacaaggaggcttggcatagcttg 34303175  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  34303176 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacattacggacatcaagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttatagcagcatgtttcggaagag 34303275  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  34303276 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 34303375  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303376 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 34303414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 31891101 - 31891436
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31891101 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 31891200  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31891201 atgtgtggtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 31891300  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | ||| |||||||| || |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || ||||| || ||||||||    
T  31891301 gattgtcgacgacgtgagggacgttattcttaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcacccctcgacatc 31891400  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  31891401 atgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 31891436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 9349813 - 9350084
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9349813 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggggttgtaacattacggacgtcaagaccgggagcttcct 9349912  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  9349913 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagagggttgtcgaggacatgagggacgttgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 9350012  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  9350013 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 9350084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Original strand, 27434240 - 27434555
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  27434240 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 27434339  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27434340 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 27434439  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  27434440 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 27434539  T
Q  324 aatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27434540 aatcacatttgaggtc 27434555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20838363 - 20838048
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  20838363 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 20838264  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20838263 tgcgatgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcaaatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 20838164  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20838163 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 20838064  T
Q  324 aatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||| || |||||    
T  20838063 aatcacatttaaggtc 20838048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28882659 - 28882347
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  28882659 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 28882560  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  28882559 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 28882460  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  28882459 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 28882360  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  28882359 aatcacatttgag 28882347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40233921 - 40233638
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| | |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  40233921 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagtttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 40233822  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  40233821 cacacacttcgatcattttcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 40233722  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40233721 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtcaga 40233638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27393268 - 27393095
Alignment:
Q  170 atcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaa 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  27393268 atcatgttcacaacagcgtgattcggaagaggattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaa 27393169  T
Q  270 tgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27393168 tgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatcatggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaa 27393095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 23128362 - 23128674
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||||||  | |||| ||||||    
T  23128362 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaagcaccaaaggagt 23128461  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  23128462 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 23128561  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23128562 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaa 23128661  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  23128662 aatcacatttgag 23128674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12655957 - 12655675
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  12655957 ggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 12655858  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  12655857 ttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 12655758  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  12655757 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 12655675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32050265 - 32049925
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||    
T  32050265 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttga 32050166  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| |||||||| | || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  32050165 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 32050066  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  32050065 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 32049966  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  32049965 tgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 32049925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12587220 - 12586949
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  12587220 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 12587121  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  12587120 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 12587021  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  12587020 cttcttcacgatatacttcaaagcataacatccttcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12586949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 13936375 - 13936646
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  13936375 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 13936474  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  13936475 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 13936574  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  13936575 cttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 13936646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27777689 - 27777361
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27777689 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27777590  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27777589 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27777490  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  27777489 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 27777390  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27777389 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27777361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27817447 - 27817119
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27817447 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27817348  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27817347 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27817248  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  27817247 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 27817148  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  27817147 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27817119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 16829169 - 16829440
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  16829169 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 16829268  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  16829269 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 16829368  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  16829369 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16829440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16892312 - 16892041
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  16892312 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 16892213  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  16892212 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 16892113  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||    
T  16892112 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcaca 16892041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34286798 - 34286481
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  34286798 gcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtt 34286699  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    |||| ||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  34286698 gcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacat 34286599  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  34286598 tattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaa 34286499  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  34286498 atcacatttgagatcaga 34286481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34291858 - 34291541
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  34291858 gcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtt 34291759  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    |||| ||| |||||||| ||   |||| | || ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  34291758 gcaacattgcggacatccagcatgggaacctcttcacatatctcgatcatattcacggcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtggaacat 34291659  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  34291658 tattctcgaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcgtgacctagggcaccttgatgaaa 34291559  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  34291558 atcacatttgagatcaga 34291541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 19416330 - 19416613
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  19416330 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 19416429  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  19416430 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 19416529  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  19416530 tttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 19416613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37925903 - 37925620
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  37925903 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37925804  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  37925803 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37925704  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  37925703 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatggaagtcgcatttgagatcaga 37925620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Original strand, 39051653 - 39051924
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   | |||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  39051653 ttggcatgatcatggctgatcagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 39051752  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  39051753 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 39051852  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||    
T  39051853 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 39051924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39890541 - 39890202
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  39890541 tggatgtcgtcttgaacaacatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 39890442  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  39890441 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 39890342  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||| |||||| || || |||||||||    
T  39890341 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcagagcataacacccctcgacatca 39890242  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 341  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  39890241 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcag 39890202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Original strand, 12716376 - 12716704
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  12716376 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgctcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 12716475  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  12716476 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 12716575  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  12716576 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 12716675  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  12716676 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 12716704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27804174 - 27803846
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  27804174 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 27804075  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27804074 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggtcatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27803975  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  27803974 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 27803875  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    || || |  ||||||||||| ||||||||    
T  27803874 tggcctaaggcaccttgatgaaaatcaca 27803846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37375628 - 37375288
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| |  ||||    
T  37375628 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgttcatggctgaacagagaagctttgcacagtttga 37375529  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||| || | || || ||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  37375528 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttccccacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagagg 37375429  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  37375428 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 37375329  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  37375328 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 37375288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 260584 - 260867
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| | |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  260584 ttggcatgatcgtggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttacgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 260683  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  260684 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgttgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 260783  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  260784 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 260867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34862090 - 34861807
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||  |||||||| |    
T  34862090 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatctagtctcggagcttctt 34861991  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  34861990 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 34861891  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  34861890 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 34861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 37685740 - 37686023
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  37685740 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37685839  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  37685840 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37685939  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37685940 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 37686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 37701005 - 37701288
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  37701005 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 37701104  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  37701105 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaaaaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 37701204  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  37701205 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 37701288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 11635017 - 11635300
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  11635017 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 11635116  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||  ||    
T  11635117 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaag 11635216  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11635217 cttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 11635300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 11641206 - 11641489
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  11641206 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 11641305  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    |  | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||  ||    
T  11641306 cgcacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattatcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaacaag 11641405  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  11641406 cttcttcacgatgtacttcaaagcataacacccctcaacatcatgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 11641489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31876691 - 31876408
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||  ||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  31876691 ttggcatgatcatgattgaacagagaaactttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 31876592  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  31876591 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31876492  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31876491 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31876408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 21677013 - 21677296
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  21677013 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 21677112  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  21677113 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 21677212  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21677213 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 21677296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34279698 - 34279576
Alignment:
Q  220 gacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttga 319  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  34279698 gacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttga 34279599  T
Q  320 tggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  34279598 tgaaaatcacatttgagatcaga 34279576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18711058 - 18710717
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711058 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 18710959  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18710958 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacattacggacgtcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgatttggaagag 18710859  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18710858 ggttgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacatccctcgacatc 18710759  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18710758 atgacctagggcaccctgatgaaaatcacacttgagatcaga 18710717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44563571 - 44563235
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563571 ctggatgtcattttgaacaacgcagcaacccaaaggattacagaatcattcttggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 44563472  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44563471 atgtgtagtggcaccagaggagttgtaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtt-acagcagcgtgattcggaagag 44563373  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  44563372 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaagtcaactttccttggtctatgagtttttt-acaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 44563274  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563273 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 44563235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19658783 - 19659120
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19658783 ctggatgtcattttgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 19658882  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19658883 atgggtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacgtccggtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 19658982  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  19658983 gattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag-ttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 19659081  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659082 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 19659120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 22080621 - 22080963
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22080621 ctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttg 22080720  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||| |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080721 atgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacgaacgtcaagactgggaacttcttcatgagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 22080820  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22080821 gattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatc 22080920  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22080921 atggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaa 22080963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33245137 - 33244799
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33245137 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataatttg 33245038  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||  || ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33245037 atgtgtagtggcaccataggagttgcaacgttacaaacgtccggtctgagagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtggttcggaagag 33244938  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  33244937 gattgtcgaggacatgcgggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 33244838  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244837 atgacccagcgcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 33244799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16283898 - 16283583
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  16283898 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcaaatggtatgatcatggctaaacagagaagctttgcatagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 16283799  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||  | |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16283798 tgtgacattacggacaacaagtctaggagcttcctcacatacttcaatcatgttcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 16283699  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16283698 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccttcgacatcatgacccagggtgccttgatgga 16283599  T
Q  324 aatcacacttgaggtc 339  Q
    ||||||| ||||||||    
T  16283598 aatcacatttgaggtc 16283583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 27608649 - 27608983
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   || || || |||| ||| | |||||    
T  27608649 tggatgtcgtcttgaacagtaaagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaatagggaagctttgcacagcttga 27608748  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27608749 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 27608848  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27608849 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcatccctcgacatca 27608948  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  27608949 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 27608983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19688547 - 19688235
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  19688547 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 19688448  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19688447 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcgcatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggaca 19688348  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19688347 ttattctcaaaagtcaactttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcaccttgatgaa 19688248  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  19688247 aatcacatttgag 19688235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16277973 - 16277691
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  16277973 ggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 16277874  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  16277873 ttcctcacatacttcgatcatatttacggcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 16277774  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  16277773 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 16277691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14558095 - 14557761
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| ||||||||||||||    |||||||| |||| ||| | |||||    
T  14558095 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatgactgaacagagaagctttgcacagcttga 14557996  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||    
T  14557995 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcacatttacagcggcatgatttggaagagg 14557896  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14557895 attgtcgaggacgtgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 14557796  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  14557795 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 14557761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 3329308 - 3329591
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  3329308 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 3329407  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||| | || |||    
T  3329408 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattgttctcaaaagtcagcttcccttgatcaacgag 3329507  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  3329508 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 3329591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 2137003 - 2137337
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  2137003 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 2137102  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| |||| || | || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  2137103 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagctttctcacatgcttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 2137202  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  2137203 attgtcgaggacatgcgagacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctttttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatca 2137302  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||  || |||||||| |||||||| |||||    
T  2137303 tgacccaaggcgccttgatgaaaatcacatttgag 2137337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Original strand, 12092529 - 12092808
Alignment:
Q  63 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcata 162  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| || || || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  12092529 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccagaggagtgacaatattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 12092628  T
Q  163 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttc 262  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||    
T  12092629 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttc 12092728  T
Q  263 ttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  12092729 ttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 12092808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29829736 - 29829465
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  29829736 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 29829637  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  29829636 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 29829537  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  29829536 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 29829465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9355037 - 9354756
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  9355037 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaaaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcct 9354938  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||  |||||    
T  9354937 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaggtcaattttccttggtctatgag 9354838  T
Q  259 -cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
      || || ||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354837 ttttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacgtcatgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 9354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 31489551 - 31489834
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  31489551 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 31489650  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  31489651 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 31489750  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  31489751 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcaga 31489834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 189513 - 189256
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  189513 ggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 189414  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  189413 ttcctcacatacttcgatcatattaacagaggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 189314  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagag 311  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  189313 ataagctttttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagag 189256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19674912 - 19674572
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  19674912 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 19674813  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  19674812 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 19674713  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  |||||||||    
T  19674712 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacaatatacttcaaagcataacacctctcgacatca 19674613  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19674612 tgacctaaggcaccctgatgaaaatcacatttgagatcaga 19674572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19286876 - 19286593
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  19286876 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 19286777  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  19286776 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 19286677  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19286676 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 19286593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 19208161 - 19208444
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  19208161 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 19208260  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  19208261 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 19208360  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  19208361 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 19208444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 28361756 - 28362039
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  28361756 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 28361855  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  28361856 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 28361955  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  28361956 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 28362039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33259137 - 33258854
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  33259137 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 33259038  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||| | || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  33259037 cacacacttcgatcatattcacaacggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 33258938  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  33258937 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacccaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 33258854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31354938 - 31354655
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||| ||||||   ||||| || |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  31354938 ttggcatgctcatggctgaacagggaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctgggagcttcct 31354839  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  31354838 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 31354739  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31354738 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 31354655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1900744 - 1900402
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1900744 ctggatttcattttgaacaacgtagcaacccaaagtattatggaatcattctgggcaactggcatggtcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttg 1900645  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1900644 atgtgtagaggcaccagaggagttgcaatgttatgaacatcgagtctgggagcttcctcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 1900545  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  1900544 gattgtcaaggacataagggacattattctcaaaagttaactttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagtgtagcatccttcaacatc 1900445  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900444 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 1900402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15228357 - 15228015
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15228357 ctggatgtcatttcgaacaacgtggcaacctaaaggattacggaagcattctggacaattggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttg 15228258  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228257 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacgaacatcaagtctgggagctatctcatataccccaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 15228158  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15228157 gattgtcgaggacatgacggacgttattctcaaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatc 15228058  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228057 gtgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 15228015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 15284715 - 15285053
Alignment:
Q  4 gatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatg 103  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15284715 gatgtcattttgaacaacgtagcaacccaaaggattacggaagcatttcgggcaactggcatgatcatggtcaaacaaagaggcttggcatagcttgatg 15284814  T
Q  104 tgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggt 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15284815 tgtagtggcaccagaggagttgcaatgttacgaacgtcaagtctgggagcttcctcacatacctcaatcatgttcacagcaacgtgattcggaagaggat 15284914  T
Q  204 tgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatg 303  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15284915 tgtcgaggacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagcttttttacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcaacatcatg 15285014  T
Q  304 acccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285015 acccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 15285053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 15391122 - 15391464
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    |||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  15391122 ctggatatcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgattatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttg 15391221  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||| |||| ||||    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15391222 atgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggatgtcaagactgggaacttcttcatgactctcgatcatgttcacagcagcgtgattcagaagag 15391321  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  15391322 gattgtcaagaacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccctagtcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatc 15391421  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15391422 atggcccagagcaccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaa 15391464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 24460389 - 24460727
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24460389 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggaagcattctgggcaactggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataactcg 24460488  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  || ||   || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24460489 atgtgtagtggcaccagaggagttgcaacgttacaaacgtccgatctgggagcttcctcatatacttcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagag 24460588  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  24460589 gattgtcgacgacatgagggacgttattctcaaaggtcaattttccttggtctatgagtttttttacaatgtacctcaacgcgtagcatccttcgacatc 24460688  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460689 atgacccatagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 24460727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 14235309 - 14235647
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| || ||| |||||  ||  ||||| || |||  |||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  14235309 ctggatgtcattctgaacaacgtagcagcctaaaggattatggaggcattccggacaaacggcatggtcatggtcaaacaaggaagcttggcatagcttg 14235408  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| | ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14235409 atgtgtagtggtaccagaggagtcgcaacgttacgaacgtcaagactgggagcttcttcataggtctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 14235508  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || |||||    
T  14235509 gattgtcgaggacgtgagggacattgttctcaaaagttaactttccctggtctatgagcttctttacaatgaacttcaaagcgtaacatccctcaacatc 14235608  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14235609 atggcccagagcaccttgatggaaatcacatttgaggtc 14235647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17014486 - 17014149
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  17014486 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 17014387  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  17014386 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 17014287  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  17014286 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatca 17014187  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtc 339  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17014186 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgaggtc 17014149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Original strand, 24592151 - 24592433
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  24592151 ggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagc 24592250  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  24592251 ttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgattgggaagaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 24592350  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  24592351 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 24592433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14665482 - 14665170
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  14665482 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 14665383  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |    
T  14665382 tgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggata 14665283  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  14665282 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 14665183  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  14665182 aatcacatttgag 14665170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 36344300 - 36344640
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  36344300 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttga 36344399  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  36344400 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 36344499  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  36344500 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 36344599  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  36344600 tgacctagggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 36344640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 27163159 - 27163442
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  27163159 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggtaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 27163258  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  27163259 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 27163358  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  27163359 tttcttcacgatatatttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 27163442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21970187 - 21969859
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| |||||||    ||||||||||| ||| || || |||| |  | || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||    
T  21970187 tggatgtcgtcttgaacagtatagcaacccaaaggatcacggagacatcccagacacttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttga 21970088  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| |||||||| | |  |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21970087 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacatttcaatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 21969988  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  21969987 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 21969888  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  21969887 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcaca 21969859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5006302 - 5006019
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  5006302 ttggcatgatcatggctgaacagagaggctttgcacagcttaatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 5006203  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||    
T  5006202 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgattcagaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcaacttcccttgatcgatgag 5006103  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  5006102 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 5006019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6570316 - 6569999
Alignment:
Q  25 gcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagtt 124  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||| || | || ||||||| |||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6570316 gcaacccaaaggattacggaggcatcctagacacttggcataatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagtt 6570217  T
Q  125 gcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacat 224  Q
    || |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  6570216 gcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagaggattgtcgaggacgtgtgggacat 6570117  T
Q  225 tgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaa 324  Q
    | ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6570116 tattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaa 6570017  T
Q  325 atcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  6570016 atcacatttgagatcaga 6569999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 14763089 - 14763429
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||||||  |  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  14763089 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaagattacgaaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 14763188  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  14763189 tgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttgggagcgg 14763288  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  14763289 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 14763388  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14763389 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 14763429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 31126360 - 31126643
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  31126360 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 31126459  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  31126460 cacacacctcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 31126559  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31126560 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 31126643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39851067 - 39850796
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  39851067 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 39850968  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | || |||    
T  39850967 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagggggttgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaacgag 39850868  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  39850867 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaagcaccttgatgaaaatcaca 39850796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 40105480 - 40105763
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  40105480 ttggcatgatcatgattaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 40105579  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  40105580 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 40105679  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  40105680 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 40105763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 18800398 - 18800738
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  18800398 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 18800497  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  18800498 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 18800597  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  18800598 attgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 18800697  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  18800698 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcgcatttgagatcaga 18800738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Original strand, 33673583 - 33673923
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  33673583 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 33673682  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||| |||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  33673683 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggaacttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagagg 33673782  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  33673783 attgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 33673882  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  33673883 tgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 33673923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14098970 - 14098688
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  14098970 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 14098871  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  14098870 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 14098771  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcag 341  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  14098770 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcag 14098688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54833816 - 54833533
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  54833816 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 54833717  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  54833716 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcggattgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 54833617  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
     |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  54833616 tttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 54833533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30754240 - 30753900
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||||| ||||||| |   |||||||||| ||| || ||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||    
T  30754240 tggatgtcgtcttgaacagcatggcaacccaaaggatcacggaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttga 30754141  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    |||| || || |||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || || ||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  30754140 tgtgcagaggcaccagaggagttgcgacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagcgg 30754041  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||    
T  30754040 attgtcgaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatca 30753941  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  30753940 tgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 30753900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24113105 - 24112808
Alignment:
Q  45 aacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaag 144  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  24113105 aacattcttggcacttagcatgatcatgttcaaacaataaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccag 24113006  T
Q  145 tccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaacttt 244  Q
       |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  24113005 catgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttc 24112906  T
Q  245 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24112905 ccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcgccttgatggaagtcacacttaagatcaga 24112808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 342
Target Start/End: Original strand, 34188788 - 34189085
Alignment:
Q  45 aacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaag 144  Q
    |||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||   | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  34188788 aacattcttggcactcagcatgatcatgttcaaacaacaaagcttggcacaacttgatatggagtggcaccagaggagttgcaacattgcggacatccag 34188887  T
Q  145 tccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaacttt 244  Q
       |||| | || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  34188888 catgggaacctcttcacatatctcaatcatattcacggcagcatgatttgggagcggattatcgaggacatgtggcacattgttctcaaaagttaacttc 34188987  T
Q  245 ccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| |  || |||||||| || ||||| || | ||||||||| || || |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  34188988 ccttgatctataagcttcttgacgatgtactttagagcatagcacccctcaacatcatgccctaaagcaccttgatggaagtcacacttaagatcaga 34189085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22033 - 21691
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22033 ctggatgtcattctgaacaacgtagcaaccccaaggattatggcggcattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggaggcttggcatagcttg 21934  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21933 atgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacatcaagaccgggaactttttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 21834  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  21833 gattgtcaagaacatgagggacattgttcttaaaagttaactttccctggtcaatgagcttctttacaatctacttcaaagcgtaacatccttcaacatc 21734  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21733 ttggcccagagccccttgatggaaatcgcacttgaggtcagaa 21691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 402 - 728
Alignment:
Q  1 ctggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttg 100  Q
    ||||||||| || ||||||||| | |||||| || |||||  |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  402 ctggatgtcattctgaacaacgtaacaaccccaaggattatggcggcattatgggcaattggcatgatcatggtcaaacaaggagacttggcatagcttg 501  T
Q  101 atgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  502 atgtgtagcggtaccagaggagttgcaacattacggacgtcaagactgggaacttcttcataagtctcgatcatgttcacagcagcgtgattcggaagag 601  T
Q  201 ggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatc 300  Q
    | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  602 gattgtcaagaacatgagggacattattctcaaaagttaactttccctgatcaatgagcttctttacaatgtacttcaaagcgtaacatccttcaacatc 701  T
Q  301 atgacccagagcaccttgatggaaatc 327  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  702 atggcccagagcatcttgatggaaatc 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 343
Target Start/End: Original strand, 1832 - 2043
Alignment:
Q  131 ttacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttct 230  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1832 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 1931  T
Q  231 caaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1932 caaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 2030  T
Q  331 cttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  2031 cttgaggtcagaa 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6428 - 6143
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  6428 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacattcagtctaggagcttcct 6329  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||| || | ||||||    
T  6328 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgag 6229  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttc-aaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatg-gaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||| || || |||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  6228 cttcttcacgatatacttcaaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaaatcacatttgagatcaga 6143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 131 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20729 - 20518
Alignment:
Q  131 ttacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttct 230  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20729 ttacgaacatcgagtctgggagcttcttcatatacctcaatcatgtttacagcagcgtgattcggaagaggattgtcgaggacatgagggacattgttct 20630  T
Q  231 caaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 330  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629 caaaagttaa-tttccttgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcaca 20531  T
Q  331 cttgaggtcagaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  20530 cttgaggtcagaa 20518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30901 - 30595
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  30901 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 30802  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    | | |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  30801 tacgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggaca 30702  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  30701 ttattctcaaaagtcagctttccctgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaa 30602  T
Q  324 aatcaca 330  Q
    | |||||    
T  30601 agtcaca 30595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 336
Target Start/End: Original strand, 46770 - 47104
Alignment:
Q  2 tggatgtcgttttgaacaacgcagcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttga 101  Q
    |||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||    
T  46770 tggatgtcatcttgaacagtgtagcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaacagagaagctttgcacagcttga 46869  T
Q  102 tgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagg 201  Q
    ||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  46870 tgtgtagaggcaccagaggagttgcgacattacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagagg 46969  T
Q  202 gttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatca 301  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||    
T  46970 attgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcgacatca 47069  T
Q  302 tgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  47070 tgacccagggcgccttgatgaaaatcacatttgag 47104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Original strand, 39876 - 40188
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||    
T  39876 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagt 39975  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  39976 tgcaacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 40075  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  40076 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagctccttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgga 40175  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  40176 aatcacatttgag 40188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30182 - 29900
Alignment:
Q  54 ggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagc 153  Q
    |||| ||||| |||||||||   |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||   ||||    
T  30182 ggcacttggcgtgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtaggggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaagagc 30083  T
Q  154 ttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggtta 253  Q
    ||||||| |||| || ||||| || ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |    
T  30082 ttcctcacatacttcgatcatatttacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatca 29983  T
Q  254 atgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  29982 atgagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcgtgacccagggcgccttggtggaaatcacatttgag 29900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27741 - 27429
Alignment:
Q  24 agcaacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagt 123  Q
    ||||||||||| ||||||  |  ||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  27741 agcaacccaaaggattacgaaggcatcctaggcacttggcatgatcatggctaaatagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagt 27642  T
Q  124 tgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggaca 223  Q
    ||| |  |||| |||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  27641 tgcgacgttacagacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgtgggaca 27542  T
Q  224 ttgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatgga 323  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  27541 ttattctcaaaagtcagctttccttgatcaataagcttcttcacgatatacttcaaagcatagcacccctcgacatcatgacccagggcgccttgatgaa 27442  T
Q  324 aatcacacttgag 336  Q
    ||||||| |||||    
T  27441 aatcacatttgag 27429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9980 - 9697
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  9980 ttggcatgatcatggctgaacagaaaggctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcct 9881  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||    
T  9880 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgag 9781  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9780 cttcttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctaaggcaccttgatgaaaatcacatttgagatcaga 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 343
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  190 attcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcat 289  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1 attcggaagaggattgtcgaggacatgagggacgttgttctcgaaggttaactttccctgatcaatgagcttcttcacaatgtacttcaaagcgtagcat 100  T
Q  290 ccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 ccttcaacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcagaa 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 336
Target Start/End: Original strand, 9 - 248
Alignment:
Q  97 cttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcgga 196  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||| || ||||| || ||||| |||    
T  9 cttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttacggacatcaagtctaggagcttcctcacatacttcgatcatatttacagcggcatgatttgga 108  T
Q  197 agagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcga 296  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||    
T  109 agaggattgtcgaggacatgtgggacattattctcaaaagtcagctttccttgatcaatgagcttcttcacgatatacttcaaagcgtagcacccctcga 208  T
Q  297 catcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    ||||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||    
T  209 catcatgacccaacgcgccttgatgaaaatcacatttgag 248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 7081 - 7364
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||  |||||||| |    
T  7081 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggtaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctcggagcttctt 7180  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  7181 cacacacttcgatcatattcacagtggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 7280  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  7281 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 26010 - 26326
Alignment:
Q  26 caacccaaacgattacagaaacattctgggcaattggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttg 125  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||| || | || |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  26010 caacccaaaggatcacagaggcatcctagacacttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacaacttgatatgtagaggcaccagaggagttg 26109  T
Q  126 caatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacatt 225  Q
    | |  || |||||||||||||  |||||||| ||| | |  || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  26110 cgacgttgcggacatcaagtctcggagcttcttcacacatttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacatt 26209  T
Q  226 gttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaa 325  Q
     ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  26210 attctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgagcttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaag 26309  T
Q  326 tcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  26310 tcacatttgagatcaga 26326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8359 - 8080
Alignment:
Q  63 catgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcata 162  Q
    |||||||||||   |||||||| |||| ||||| |||||| || || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |    
T  8359 catgatcatggctgaacagagaagctttgcatagcttgatatgcagaggcaccaggggagtggcaacattgcggacatcaagtctaggagcttcctcaca 8260  T
Q  163 tacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttc 262  Q
     || || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||| ||||| | |||||| |||    
T  8259 cacttcgatcatattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcaaggacatgtggaacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcaatgagtttc 8160  T
Q  263 ttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  8159 ttcacaatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgtcctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 8080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 14772 - 15055
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||||||||  ||||||||||    
T  14772 ttggcatgatcatgattgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgtagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagtctaggagcttcct 14871  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  14872 cacacacttcgatcacattcacagcggcatgatttggaagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 14971  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  14972 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacgtcatgacctaaggcaccttgatgaaagtcacatttgagatcaga 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Original strand, 8908 - 9191
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |  ||||||||||    
T  8908 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcct 9007  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  9008 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 9107  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  9108 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 9191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20429 - 20146
Alignment:
Q  59 ttggcatgatcatggtcaaacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcct 158  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||| | ||||||||| || || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |  ||||||||||    
T  20429 ttggcatgatcatggctgaacagagaagctttgcacagcttgatgtgcagaggcaccagaggagttgcgacgttgcggacatcaagcctaggagcttcct 20330  T
Q  159 catatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgag 258  Q
    || | || || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |  |||||    
T  20329 cacacacttcgatcatattcacagcggcatgatttggtagaggattgtcgaggacgtgtgggacattattctcaaaagtcagcttcccttgatcgatgag 20230  T
Q  259 cttcttcacaatgtatttcaaagcatagcatccttcgacatcatgacccagagcaccttgatggaaatcacacttgaggtcaga 342  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  20229 cttcttcacgatatacttcaaagcataacacccctcgacatcatgacctagggcaccttgatgaaagtcgcatttgagatcaga 20146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 336
Target Start/End: Original strand, 46659 - 46927
Alignment:
Q  77 aacagagaggcttggcataacttgatgtgtagtggtaccagaggagttgcaatattacggacatcaagtc-cgggagctt-cctcatatac-ctcaatca 173  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||| |||||  |||  | | |||    
T  46659 aacagagaagctttgcacaacttgatgtgtagaggcaccagaggagttgtgatgttacggacatcaagtcttaggagcttccctcacgtactttgattca 46758  T
Q  174 tgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaaggacatgagggacattgttctc-aaaagttaac-tttccttggttaatgagcttcttcacaatg 271  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||   | |||||||| | ||||||||||||||| ||     
T  46759 tatttacagcagcatgatttggaagaggattgtcgaggacatgcgggacattattctcaaaaagtccgcttttccttgatcaatgagcttcttcacgata 46858  T
Q  272 tatttcaaagcata-gcatccttcgacat-cat--gacccagagcaccttgatggaaatcacacttgag 336  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  46859 tacttcaaagcatacgcacccctcgacatccattcgacccagggcgccttgatggaaatcacatttgag 46927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 449 - 277
Alignment:
Q  113 accagaggagttgcaatattacggacatcaagtccgggagcttcctcatatacctcaatcatgttcacagcagcgtgattcggaagagggttgtcaagga 212  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  449 accaaaggagtcgcaacattacggacatctagtttgggtgcttcttcatacgcttcaatcatgtttactgcagcatggtctggaagagggttatcaagga 350  T
Q  213 catgagggacattgttctcaaaagttaactttccttggttaatgagcttcttcacaatgtatttcaaagcata 285  Q
    |||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||  ||||| || || ||||||||    
T  349 catgaggagtactgttctcaaaagtcagctttccttggtcaataagcctctggacaatatactttaaagcata 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University