View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7380_low_16 (Length: 412)

Name: NF7380_low_16
Description: NF7380
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7380_low_16
NF7380_low_16
[»] chr4 (126 HSPs)
chr4 (98-282)||(29777255-29777440)
chr4 (96-278)||(41702461-41702644)
chr4 (100-279)||(6019929-6020109)
chr4 (99-282)||(34276547-34276731)
chr4 (98-281)||(43471694-43471878)
chr4 (96-280)||(21366609-21366794)
chr4 (97-281)||(39077543-39077728)
chr4 (96-280)||(44984758-44984943)
chr4 (97-280)||(23437590-23437774)
chr4 (98-280)||(9798464-9798647)
chr4 (98-280)||(53854430-53854612)
chr4 (97-282)||(237475-237661)
chr4 (96-281)||(2826681-2826866)
chr4 (96-281)||(42085204-42085390)
chr4 (98-278)||(397401-397582)
chr4 (96-280)||(51363004-51363188)
chr4 (98-280)||(27373075-27373257)
chr4 (97-279)||(32366661-32366844)
chr4 (96-282)||(53461814-53462001)
chr4 (96-280)||(29478357-29478542)
chr4 (96-280)||(31532135-31532320)
chr4 (96-280)||(54574940-54575125)
chr4 (99-277)||(6285307-6285486)
chr4 (102-280)||(31972336-31972515)
chr4 (96-281)||(3170623-3170809)
chr4 (99-280)||(18462013-18462195)
chr4 (97-282)||(19387686-19387872)
chr4 (96-285)||(26091253-26091443)
chr4 (95-280)||(42033171-42033357)
chr4 (97-282)||(45797477-45797663)
chr4 (98-282)||(42765840-42766024)
chr4 (96-280)||(47344653-47344838)
chr4 (99-282)||(146427-146611)
chr4 (98-281)||(55056258-55056442)
chr4 (100-282)||(22618512-22618693)
chr4 (97-280)||(49881059-49881247)
chr4 (96-282)||(50233997-50234184)
chr4 (98-280)||(54607961-54608144)
chr4 (98-280)||(41949381-41949566)
chr4 (98-282)||(3692208-3692393)
chr4 (100-280)||(42222292-42222473)
chr4 (100-279)||(53834055-53834235)
chr4 (97-282)||(55776043-55776228)
chr4 (97-282)||(55840221-55840406)
chr4 (97-281)||(31914196-31914380)
chr4 (100-268)||(50534632-50534801)
chr4 (98-280)||(407753-407934)
chr4 (98-280)||(23609086-23609269)
chr4 (98-280)||(41560327-41560510)
chr4 (98-280)||(55519826-55520009)
chr4 (98-282)||(1932762-1932947)
chr4 (98-282)||(2243457-2243642)
chr4 (98-282)||(31070072-31070256)
chr4 (99-276)||(35446506-35446683)
chr4 (98-278)||(50457812-50457993)
chr4 (98-282)||(38591667-38591848)
chr4 (97-282)||(14017374-14017558)
chr4 (98-280)||(39587781-39587962)
chr4 (96-282)||(47662100-47662287)
chr4 (98-280)||(48313556-48313737)
chr4 (98-280)||(56022998-56023181)
chr4 (101-282)||(48657826-48658002)
chr4 (96-280)||(54086407-54086590)
chr4 (97-280)||(54424980-54425163)
chr4 (96-274)||(33897501-33897679)
chr4 (96-280)||(41632007-41632191)
chr4 (96-280)||(54805614-54805803)
chr4 (100-262)||(22468788-22468951)
chr4 (96-276)||(50536628-50536809)
chr4 (100-278)||(51951683-51951861)
chr4 (100-282)||(48654815-48655004)
chr4 (100-282)||(48259510-48259691)
chr4 (98-282)||(36532828-36533003)
chr4 (143-280)||(52728307-52728443)
chr4 (99-282)||(47811906-47812079)
chr4 (98-280)||(9997931-9998103)
chr4 (100-282)||(43890929-43891101)
chr4 (96-280)||(45633779-45633953)
chr4 (97-285)||(54216731-54216909)
chr4 (98-280)||(15060289-15060461)
chr4 (99-280)||(5117438-5117609)
chr4 (99-283)||(54715035-54715209)
chr4 (100-282)||(20351840-20352012)
chr4 (95-257)||(22620589-22620741)
chr4 (96-282)||(34835174-34835350)
chr4 (96-282)||(37239088-37239264)
chr4 (153-280)||(42509351-42509478)
chr4 (98-281)||(38547600-38547773)
chr4 (98-281)||(46708740-46708913)
chr4 (183-280)||(35595772-35595869)
chr4 (98-282)||(4486579-4486753)
chr4 (98-257)||(27873571-27873720)
chr4 (98-280)||(34552318-34552490)
chr4 (98-208)||(27398664-27398775)
chr4 (98-282)||(31881312-31881486)
chr4 (98-282)||(46720024-46720201)
chr4 (146-236)||(52396774-52396865)
chr4 (100-205)||(14335165-14335271)
chr4 (100-205)||(27580120-27580226)
chr4 (96-278)||(54216310-54216482)
chr4 (98-205)||(1662323-1662431)
chr4 (98-281)||(52461365-52461535)
chr4 (98-280)||(33289702-33289873)
chr4 (98-280)||(52688348-52688520)
chr4 (98-197)||(43231502-43231601)
chr4 (96-190)||(3293102-3293197)
chr4 (96-190)||(11972208-11972303)
chr4 (96-280)||(49014095-49014269)
chr4 (99-282)||(6371247-6371420)
chr4 (178-279)||(35344868-35344968)
chr4 (98-280)||(573802-573974)
chr4 (100-278)||(33557944-33558112)
chr4 (100-204)||(49057933-49058038)
chr4 (207-279)||(33048990-33049062)
chr4 (100-182)||(42557583-42557666)
chr4 (203-282)||(48259702-48259780)
chr4 (212-282)||(3291803-3291873)
chr4 (127-280)||(27872607-27872750)
chr4 (143-257)||(51981502-51981605)
chr4 (97-143)||(17555624-17555670)
chr4 (110-204)||(18206583-18206682)
chr4 (178-282)||(42558273-42558369)
chr4 (228-282)||(1662259-1662313)
chr4 (216-280)||(47105023-47105087)
chr4 (148-188)||(47105108-47105148)
chr4 (196-252)||(49304602-49304657)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (98-282)||(2324887-2325072)
chr2 (95-282)||(6594456-6594644)
chr2 (99-280)||(38997100-38997282)
chr2 (98-282)||(4034590-4034775)
chr2 (96-282)||(17600832-17601019)
chr2 (98-280)||(746464-746647)
chr2 (96-280)||(23901775-23901960)
chr2 (98-280)||(10244582-10244765)
chr2 (98-280)||(45370988-45371171)
chr2 (96-280)||(26710341-26710526)
chr2 (97-280)||(13815218-13815402)
chr2 (98-281)||(27651033-27651217)
chr2 (99-282)||(34518366-34518550)
chr2 (98-281)||(40635216-40635400)
chr2 (98-280)||(11184970-11185153)
chr2 (99-281)||(14660445-14660628)
chr2 (98-271)||(6430471-6430645)
chr2 (97-277)||(10424592-10424773)
chr2 (98-282)||(27024413-27024598)
chr2 (96-280)||(27400399-27400584)
chr2 (99-280)||(5726128-5726310)
chr2 (99-282)||(7892686-7892870)
chr2 (98-282)||(1091949-1092134)
chr2 (96-280)||(40735460-40735645)
chr2 (100-282)||(33427645-33427828)
chr2 (100-280)||(2914138-2914319)
chr2 (100-280)||(32327361-32327542)
chr2 (97-280)||(37620867-37621054)
chr2 (100-280)||(4609626-4609807)
chr2 (97-281)||(37255336-37255516)
chr2 (97-280)||(14697537-14697721)
chr2 (96-271)||(15925076-15925252)
chr2 (95-254)||(32608375-32608535)
chr2 (99-280)||(32948445-32948626)
chr2 (100-281)||(9444683-9444875)
chr2 (114-282)||(32856434-32856603)
chr2 (98-282)||(40037141-40037325)
chr2 (103-280)||(11159625-11159802)
chr2 (96-263)||(1229631-1229791)
chr2 (96-254)||(8432942-8433101)
chr2 (100-253)||(12842103-12842257)
chr2 (98-223)||(42899913-42900039)
chr2 (97-282)||(21734898-21735073)
chr2 (150-282)||(25294886-25295018)
chr2 (96-279)||(39103043-39103216)
chr2 (96-246)||(41172455-41172605)
chr2 (99-278)||(145281-145450)
chr2 (173-280)||(447633-447740)
chr2 (100-280)||(35158050-35158220)
chr2 (98-271)||(35126778-35126941)
chr2 (96-280)||(12333497-12333669)
chr2 (98-282)||(44481826-44482000)
chr2 (98-280)||(4258488-4258659)
chr2 (100-282)||(27331298-27331474)
chr2 (98-280)||(28641292-28641464)
chr2 (98-280)||(29687039-29687211)
chr2 (100-280)||(39301197-39301367)
chr2 (98-282)||(12730059-12730233)
chr2 (96-284)||(13543620-13543798)
chr2 (98-285)||(43898966-43899142)
chr2 (96-282)||(2688727-2688903)
chr2 (99-280)||(19428426-19428598)
chr2 (173-260)||(12827137-12827223)
chr2 (97-245)||(27764897-27765035)
chr2 (96-176)||(12814610-12814691)
chr2 (96-190)||(40544155-40544250)
chr2 (98-280)||(43356097-43356266)
chr2 (170-242)||(28014856-28014928)
chr2 (100-190)||(3266296-3266387)
chr2 (96-189)||(2000417-2000511)
chr2 (96-263)||(28566715-28566872)
chr2 (100-282)||(34249265-34249437)
chr2 (99-190)||(8056625-8056717)
chr2 (147-282)||(3711681-3711805)
chr2 (96-195)||(30545817-30545917)
chr2 (97-143)||(28019959-28020005)
chr2 (214-283)||(42900772-42900838)
chr2 (99-166)||(10176558-10176626)
chr2 (100-137)||(1897130-1897167)
chr2 (181-230)||(17799296-17799345)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (98-281)||(6365985-6366169)
chr8 (96-282)||(32984075-32984262)
chr8 (98-281)||(43328706-43328890)
chr8 (96-281)||(5946044-5946230)
chr8 (98-282)||(33730639-33730824)
chr8 (98-282)||(37956420-37956605)
chr8 (97-280)||(41862218-41862402)
chr8 (98-280)||(24079901-24080084)
chr8 (97-281)||(45236564-45236749)
chr8 (99-282)||(9303572-9303756)
chr8 (100-282)||(17718720-17718903)
chr8 (98-279)||(37301326-37301508)
chr8 (99-280)||(40435153-40435335)
chr8 (100-280)||(10646124-10646305)
chr8 (97-281)||(25185897-25186082)
chr8 (100-276)||(31830959-31831136)
chr8 (98-282)||(33981661-33981846)
chr8 (98-282)||(41231945-41232130)
chr8 (96-280)||(41653892-41654077)
chr8 (100-263)||(2714550-2714714)
chr8 (99-280)||(9734255-9734435)
chr8 (96-280)||(37419937-37420122)
chr8 (99-282)||(9013684-9013867)
chr8 (96-282)||(13356118-13356305)
chr8 (97-257)||(29048426-29048587)
chr8 (96-279)||(41639911-41640095)
chr8 (96-280)||(25248036-25248215)
chr8 (104-278)||(32114254-32114429)
chr8 (100-277)||(44088446-44088624)
chr8 (99-282)||(2275913-2276096)
chr8 (98-282)||(13760644-13760831)
chr8 (99-282)||(45066590-45066774)
chr8 (97-279)||(22878389-22878572)
chr8 (98-280)||(35628776-35628959)
chr8 (154-285)||(12032986-12033117)
chr8 (99-263)||(45258510-45258675)
chr8 (98-281)||(4447294-4447467)
chr8 (167-280)||(41981537-41981650)
chr8 (147-280)||(3904126-3904258)
chr8 (100-268)||(42701301-42701471)
chr8 (100-282)||(3211207-3211378)
chr8 (96-280)||(10378306-10378480)
chr8 (98-280)||(31940314-31940485)
chr8 (167-282)||(31336163-31336278)
chr8 (99-205)||(39915887-39915994)
chr8 (98-280)||(9713688-9713857)
chr8 (98-263)||(41843252-41843407)
chr8 (100-280)||(117329-117499)
chr8 (97-281)||(31148890-31149063)
chr8 (97-280)||(2379138-2379311)
chr8 (99-280)||(40458772-40458943)
chr8 (96-282)||(33896841-33897016)
chr8 (96-190)||(27243218-27243313)
chr8 (96-190)||(27254793-27254888)
chr8 (99-267)||(38631652-38631810)
chr8 (98-281)||(9509399-9509572)
chr8 (104-271)||(32373736-32373892)
chr8 (96-282)||(26196315-26196490)
chr8 (97-282)||(3490397-3490572)
chr8 (101-263)||(4975424-4975576)
chr8 (120-200)||(41981454-41981535)
chr8 (100-280)||(33622467-33622635)
chr8 (111-263)||(40649848-40649990)
chr8 (98-135)||(12032951-12032988)
chr8 (215-280)||(39901674-39901739)
chr8 (100-143)||(39901574-39901617)
chr8 (105-165)||(164728-164789)
chr8 (205-237)||(41425471-41425503)
[»] chr1 (111 HSPs)
chr1 (97-282)||(31307999-31308185)
chr1 (96-283)||(44661967-44662155)
chr1 (97-280)||(45538151-45538335)
chr1 (96-280)||(3611133-3611318)
chr1 (98-282)||(17994949-17995134)
chr1 (96-280)||(26277174-26277359)
chr1 (98-282)||(49253973-49254158)
chr1 (96-282)||(23984752-23984939)
chr1 (99-280)||(21139412-21139594)
chr1 (100-281)||(38790196-38790378)
chr1 (98-282)||(5981169-5981354)
chr1 (96-280)||(25058685-25058870)
chr1 (96-280)||(26085398-26085582)
chr1 (98-282)||(31040708-31040893)
chr1 (96-271)||(4068692-4068868)
chr1 (96-282)||(6327546-6327732)
chr1 (98-280)||(25678259-25678442)
chr1 (101-278)||(43251713-43251891)
chr1 (96-280)||(24245025-24245210)
chr1 (97-280)||(33112818-33113001)
chr1 (99-281)||(33884088-33884271)
chr1 (99-281)||(33959981-33960164)
chr1 (96-282)||(38331857-38332044)
chr1 (98-282)||(23932507-23932692)
chr1 (98-282)||(24885500-24885685)
chr1 (97-281)||(41999813-41999998)
chr1 (96-280)||(47671583-47671768)
chr1 (99-282)||(26524887-26525071)
chr1 (97-282)||(35692661-35692848)
chr1 (98-281)||(39646567-39646751)
chr1 (98-280)||(37620192-37620375)
chr1 (98-280)||(46967041-46967224)
chr1 (99-280)||(47383732-47383914)
chr1 (100-281)||(50774218-50774400)
chr1 (97-279)||(3285400-3285582)
chr1 (98-280)||(36566329-36566512)
chr1 (96-282)||(48373501-48373679)
chr1 (99-280)||(46784423-46784605)
chr1 (98-276)||(23220939-23221112)
chr1 (97-276)||(26794302-26794482)
chr1 (100-282)||(36003131-36003317)
chr1 (98-280)||(5980067-5980250)
chr1 (98-280)||(35273595-35273778)
chr1 (98-280)||(49398988-49399171)
chr1 (96-281)||(46616546-46616732)
chr1 (96-280)||(51057068-51057253)
chr1 (97-252)||(31844374-31844530)
chr1 (100-277)||(28888582-28888760)
chr1 (101-262)||(42863867-42864029)
chr1 (100-280)||(47317316-47317497)
chr1 (96-282)||(47187102-47187289)
chr1 (98-282)||(42313359-42313548)
chr1 (100-236)||(25518815-25518952)
chr1 (96-282)||(33073208-33073384)
chr1 (96-285)||(10928064-10928243)
chr1 (99-265)||(51403032-51403189)
chr1 (152-282)||(4808699-4808829)
chr1 (96-280)||(27983603-27983772)
chr1 (101-257)||(45475866-45476014)
chr1 (101-217)||(31979998-31980115)
chr1 (98-280)||(41467632-41467804)
chr1 (96-280)||(2657300-2657474)
chr1 (143-280)||(2450539-2450676)
chr1 (100-282)||(4953053-4953225)
chr1 (143-280)||(51045596-51045733)
chr1 (98-282)||(2954854-2955028)
chr1 (99-279)||(6626025-6626195)
chr1 (98-282)||(26685855-26686029)
chr1 (96-217)||(2556909-2557031)
chr1 (96-263)||(26472196-26472353)
chr1 (96-282)||(29770667-29770843)
chr1 (96-282)||(42234837-42235012)
chr1 (187-280)||(13312531-13312624)
chr1 (99-263)||(34752331-34752485)
chr1 (97-280)||(10920198-10920371)
chr1 (148-282)||(47772170-47772304)
chr1 (98-280)||(38716247-38716419)
chr1 (97-280)||(4243490-4243663)
chr1 (96-194)||(13313249-13313350)
chr1 (97-280)||(30289910-30290083)
chr1 (101-190)||(32448650-32448740)
chr1 (102-280)||(1388476-1388644)
chr1 (96-280)||(33187337-33187505)
chr1 (96-281)||(5961266-5961441)
chr1 (98-205)||(27924722-27924830)
chr1 (96-280)||(39475783-39475956)
chr1 (96-189)||(24649802-24649896)
chr1 (149-281)||(4156438-4156577)
chr1 (100-280)||(7561528-7561712)
chr1 (96-282)||(44293453-44293629)
chr1 (99-190)||(46428332-46428424)
chr1 (111-280)||(48683330-48683489)
chr1 (98-263)||(51155606-51155761)
chr1 (100-190)||(44544125-44544216)
chr1 (99-254)||(13281588-13281733)
chr1 (98-197)||(39637899-39637996)
chr1 (101-280)||(41895164-41895333)
chr1 (97-280)||(52323936-52324110)
chr1 (98-205)||(52367882-52367990)
chr1 (96-266)||(35991613-35991772)
chr1 (98-157)||(4156188-4156248)
chr1 (205-280)||(38718167-38718242)
chr1 (161-280)||(31286504-31286612)
chr1 (97-143)||(10919321-10919367)
chr1 (96-130)||(23994845-23994879)
chr1 (190-254)||(9779919-9779982)
chr1 (143-257)||(24215808-24215911)
chr1 (243-282)||(31844818-31844857)
chr1 (219-276)||(39359502-39359559)
chr1 (101-137)||(12891401-12891437)
chr1 (100-128)||(47772306-47772334)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (98-282)||(5882505-5882690)
chr6 (96-280)||(8615237-8615422)
chr6 (96-280)||(22551061-22551246)
chr6 (98-282)||(26377202-26377387)
chr6 (97-276)||(14891383-14891563)
chr6 (98-281)||(24168090-24168274)
chr6 (96-282)||(7393584-7393771)
chr6 (100-278)||(2892189-2892368)
chr6 (97-282)||(2593850-2594036)
chr6 (98-282)||(34527860-34528045)
chr6 (102-280)||(18101495-18101674)
chr6 (100-282)||(30743446-30743629)
chr6 (112-281)||(11988973-11989143)
chr6 (97-282)||(19415531-19415717)
chr6 (98-262)||(7345130-7345295)
chr6 (97-280)||(599890-600074)
chr6 (97-280)||(28947085-28947269)
chr6 (96-274)||(16703363-16703542)
chr6 (112-282)||(22341786-22341959)
chr6 (99-280)||(959904-960086)
chr6 (98-281)||(10507907-10508091)
chr6 (96-281)||(1970708-1970894)
chr6 (98-279)||(19281056-19281238)
chr6 (100-284)||(5294797-5294982)
chr6 (100-284)||(5299349-5299534)
chr6 (100-280)||(33452572-33452753)
chr6 (99-280)||(24224070-24224253)
chr6 (98-225)||(30467658-30467786)
chr6 (94-263)||(13329376-13329535)
chr6 (131-282)||(23261927-23262079)
chr6 (95-280)||(28948845-28949020)
chr6 (97-280)||(7167580-7167753)
chr6 (98-281)||(15965432-15965605)
chr6 (100-282)||(3291009-3291181)
chr6 (100-280)||(4487528-4487698)
chr6 (97-176)||(929657-929737)
chr6 (97-280)||(1398551-1398724)
chr6 (99-280)||(3786749-3786920)
chr6 (105-194)||(1939579-1939669)
chr6 (96-196)||(375797-375898)
chr6 (205-280)||(18661830-18661905)
chr6 (221-282)||(34262342-34262403)
chr6 (96-137)||(11743088-11743129)
chr6 (221-278)||(375729-375786)
chr6 (205-262)||(24913114-24913171)
chr6 (110-205)||(13844847-13844943)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (96-280)||(24253379-24253564)
chr5 (99-280)||(12648797-12648979)
chr5 (95-280)||(43326379-43326565)
chr5 (97-281)||(7722047-7722232)
chr5 (96-281)||(739703-739889)
chr5 (97-281)||(3466680-3466865)
chr5 (100-284)||(15398478-15398663)
chr5 (100-280)||(18479668-18479849)
chr5 (98-281)||(35626037-35626221)
chr5 (96-278)||(6901796-6901979)
chr5 (98-281)||(39932578-39932762)
chr5 (98-280)||(5184971-5185154)
chr5 (98-280)||(40886028-40886210)
chr5 (96-280)||(27938894-27939080)
chr5 (96-281)||(43262182-43262368)
chr5 (101-280)||(13504742-13504922)
chr5 (96-281)||(25831518-25831703)
chr5 (98-279)||(27278474-27278660)
chr5 (96-280)||(27501055-27501240)
chr5 (97-282)||(28424793-28424977)
chr5 (110-280)||(31938908-31939079)
chr5 (99-280)||(15683791-15683973)
chr5 (96-280)||(40278858-40279042)
chr5 (143-282)||(29789293-29789432)
chr5 (100-280)||(2484292-2484473)
chr5 (97-281)||(5137713-5137898)
chr5 (143-280)||(34451295-34451432)
chr5 (96-281)||(890903-891088)
chr5 (96-278)||(40110231-40110413)
chr5 (107-282)||(38756485-38756662)
chr5 (99-282)||(763723-763907)
chr5 (96-261)||(4149691-4149847)
chr5 (98-285)||(33617584-33617761)
chr5 (96-280)||(19295727-19295901)
chr5 (98-280)||(2585461-2585633)
chr5 (97-282)||(5497271-5497446)
chr5 (98-279)||(9424593-9424764)
chr5 (95-280)||(27503375-27503550)
chr5 (96-275)||(42658667-42658836)
chr5 (100-280)||(31293989-31294170)
chr5 (100-282)||(38015512-38015684)
chr5 (98-282)||(23195246-23195420)
chr5 (96-209)||(12558090-12558203)
chr5 (97-282)||(13957668-13957843)
chr5 (98-266)||(36365459-36365617)
chr5 (99-282)||(6973063-6973236)
chr5 (98-242)||(40632498-40632634)
chr5 (96-205)||(36472348-36472458)
chr5 (97-282)||(38637908-38638083)
chr5 (100-280)||(9374502-9374672)
chr5 (100-280)||(14971979-14972149)
chr5 (97-186)||(42247865-42247955)
chr5 (98-280)||(24167784-24167956)
chr5 (97-282)||(1402503-1402678)
chr5 (97-268)||(18327185-18327346)
chr5 (98-281)||(27390596-27390769)
chr5 (104-279)||(33623940-33624105)
chr5 (110-206)||(5120036-5120132)
chr5 (100-282)||(40686900-40687071)
chr5 (98-257)||(6206883-6207032)
chr5 (126-280)||(3656568-3656712)
chr5 (125-271)||(36948499-36948633)
chr5 (102-183)||(9171111-9171193)
chr5 (100-168)||(9527121-9527190)
chr5 (147-263)||(38492662-38492767)
chr5 (125-282)||(612755-612900)
chr5 (123-189)||(3940411-3940478)
chr5 (143-197)||(20207088-20207142)
chr5 (110-173)||(15300969-15301033)
chr5 (217-280)||(3940336-3940399)
chr5 (246-281)||(40633525-40633560)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (95-280)||(22979647-22979833)
chr7 (95-280)||(25893917-25894103)
chr7 (96-280)||(33695821-33696006)
chr7 (97-279)||(33423276-33423459)
chr7 (97-282)||(33839713-33839899)
chr7 (96-280)||(47740331-47740516)
chr7 (101-274)||(15877553-15877727)
chr7 (97-282)||(17855427-17855613)
chr7 (98-283)||(31586848-31587034)
chr7 (96-282)||(46913107-46913296)
chr7 (97-281)||(35355887-35356072)
chr7 (98-282)||(40670563-40670748)
chr7 (98-282)||(47066975-47067160)
chr7 (97-280)||(33411259-33411443)
chr7 (100-282)||(49171360-49171543)
chr7 (100-280)||(23393051-23393232)
chr7 (96-280)||(45690097-45690282)
chr7 (96-282)||(2341659-2341847)
chr7 (97-280)||(27018115-27018299)
chr7 (98-281)||(35328068-35328252)
chr7 (98-281)||(37846015-37846199)
chr7 (100-280)||(20165814-20165995)
chr7 (98-282)||(26579715-26579900)
chr7 (98-280)||(10028488-10028673)
chr7 (97-282)||(45482657-45482843)
chr7 (98-282)||(35767481-35767659)
chr7 (96-280)||(48609677-48609862)
chr7 (119-282)||(36389377-36389541)
chr7 (97-280)||(43499484-43499668)
chr7 (96-282)||(33332787-33332973)
chr7 (95-280)||(5712165-5712351)
chr7 (96-280)||(19563445-19563630)
chr7 (100-282)||(41990857-41991039)
chr7 (100-281)||(31625706-31625887)
chr7 (115-285)||(5183820-5183991)
chr7 (98-282)||(35757018-35757203)
chr7 (96-280)||(45063357-45063540)
chr7 (97-256)||(33870244-33870404)
chr7 (98-281)||(10618298-10618475)
chr7 (98-280)||(31429475-31429658)
chr7 (123-280)||(29446863-29447020)
chr7 (97-246)||(33720070-33720220)
chr7 (143-280)||(28233936-28234073)
chr7 (149-281)||(30076526-30076658)
chr7 (98-282)||(35752032-35752206)
chr7 (96-281)||(46817420-46817595)
chr7 (97-282)||(46898014-46898189)
chr7 (98-281)||(48085858-48086031)
chr7 (98-280)||(43489218-43489390)
chr7 (97-281)||(24228540-24228714)
chr7 (98-282)||(24923022-24923196)
chr7 (97-280)||(36816845-36817018)
chr7 (161-282)||(44405412-44405533)
chr7 (116-256)||(44564356-44564497)
chr7 (98-275)||(26941537-26941704)
chr7 (98-279)||(33393328-33393499)
chr7 (100-281)||(37127939-37128110)
chr7 (96-281)||(44003369-44003544)
chr7 (97-282)||(7876326-7876501)
chr7 (98-263)||(29610635-29610790)
chr7 (167-282)||(41904275-41904390)
chr7 (98-280)||(498188-498360)
chr7 (97-205)||(16482847-16482956)
chr7 (99-279)||(45502817-45502987)
chr7 (97-280)||(7257380-7257553)
chr7 (98-249)||(21718117-21718258)
chr7 (100-267)||(41855061-41855218)
chr7 (98-280)||(2332019-2332191)
chr7 (97-246)||(32556640-32556779)
chr7 (98-282)||(47906756-47906931)
chr7 (95-263)||(25037525-25037683)
chr7 (99-189)||(29098752-29098843)
chr7 (96-205)||(15644010-15644120)
chr7 (98-190)||(39323616-39323709)
chr7 (98-186)||(39453558-39453647)
chr7 (100-280)||(26371051-26371221)
chr7 (100-190)||(39866667-39866758)
chr7 (99-198)||(7720574-7720674)
chr7 (100-198)||(29863017-29863116)
chr7 (100-280)||(47460772-47460942)
chr7 (96-278)||(35484634-35484807)
chr7 (97-190)||(44659843-44659936)
chr7 (100-282)||(45237531-45237703)
chr7 (104-263)||(46103127-46103275)
chr7 (100-190)||(33455098-33455189)
chr7 (98-162)||(30077043-30077108)
chr7 (98-166)||(35557730-35557799)
chr7 (143-282)||(37443600-37443728)
chr7 (110-209)||(38448508-38448608)
chr7 (97-205)||(21649442-21649552)
chr7 (145-206)||(26456157-26456218)
chr7 (97-160)||(35823289-35823353)
chr7 (96-135)||(42272149-42272188)
chr7 (212-282)||(39323712-39323781)
chr7 (205-278)||(39453484-39453557)
chr7 (208-276)||(29098847-29098915)
chr7 (215-280)||(42272180-42272244)
chr7 (222-282)||(39866762-39866822)
[»] chr3 (115 HSPs)
chr3 (98-282)||(47257792-47257977)
chr3 (96-283)||(7855111-7855299)
chr3 (99-281)||(27066977-27067160)
chr3 (96-282)||(40130957-40131144)
chr3 (96-281)||(29625826-29626012)
chr3 (97-282)||(49330035-49330221)
chr3 (96-279)||(55453245-55453429)
chr3 (100-282)||(38416722-38416905)
chr3 (98-282)||(47809594-47809780)
chr3 (96-280)||(24100280-24100464)
chr3 (96-280)||(41464349-41464534)
chr3 (97-280)||(22399095-22399278)
chr3 (97-280)||(28048392-28048576)
chr3 (98-281)||(35748310-35748494)
chr3 (96-279)||(51170034-51170218)
chr3 (96-282)||(32234396-32234582)
chr3 (97-282)||(42291840-42292026)
chr3 (96-257)||(43125828-43125990)
chr3 (97-282)||(43612045-43612231)
chr3 (100-280)||(46134357-46134538)
chr3 (97-281)||(48739232-48739417)
chr3 (98-281)||(40419834-40420018)
chr3 (99-282)||(51452749-51452932)
chr3 (98-280)||(52628953-52629135)
chr3 (96-280)||(37324538-37324723)
chr3 (98-281)||(2665999-2666183)
chr3 (99-282)||(39634570-39634753)
chr3 (96-278)||(48609719-48609903)
chr3 (98-280)||(40643799-40643982)
chr3 (100-281)||(40804509-40804691)
chr3 (98-282)||(7755305-7755489)
chr3 (98-282)||(20754391-20754576)
chr3 (96-280)||(37313396-37313581)
chr3 (98-282)||(39053393-39053578)
chr3 (96-280)||(41732525-41732710)
chr3 (96-280)||(51102378-51102563)
chr3 (97-280)||(44222827-44223011)
chr3 (97-282)||(35594119-35594305)
chr3 (101-282)||(41293317-41293498)
chr3 (98-282)||(41216454-41216639)
chr3 (98-282)||(44806683-44806868)
chr3 (98-282)||(53943586-53943770)
chr3 (100-282)||(52215077-52215260)
chr3 (96-282)||(52638839-52639026)
chr3 (100-281)||(18946904-18947086)
chr3 (98-263)||(36368938-36369103)
chr3 (98-280)||(51146215-51146398)
chr3 (98-255)||(24376572-24376730)
chr3 (100-279)||(43021715-43021896)
chr3 (122-282)||(46126010-46126170)
chr3 (104-278)||(43183917-43184092)
chr3 (98-283)||(47894817-47895003)
chr3 (96-280)||(5560025-5560217)
chr3 (99-262)||(53832502-53832666)
chr3 (96-278)||(54159000-54159173)
chr3 (99-247)||(53637841-53637990)
chr3 (103-266)||(46949379-46949541)
chr3 (96-278)||(48546842-48547014)
chr3 (167-282)||(33550465-33550580)
chr3 (96-280)||(34279721-34279895)
chr3 (97-282)||(25641644-25641819)
chr3 (98-283)||(54401186-54401361)
chr3 (98-282)||(42589829-42590003)
chr3 (96-282)||(30251499-30251675)
chr3 (96-282)||(49130575-49130751)
chr3 (96-282)||(51415966-51416142)
chr3 (95-281)||(54707219-54707395)
chr3 (98-280)||(55379984-55380156)
chr3 (96-281)||(25353551-25353726)
chr3 (158-282)||(52864550-52864673)
chr3 (98-282)||(53115446-53115620)
chr3 (98-282)||(55000176-55000350)
chr3 (96-244)||(37758926-37759075)
chr3 (99-280)||(38156632-38156803)
chr3 (98-263)||(39141141-39141298)
chr3 (98-282)||(41635798-41635972)
chr3 (96-257)||(51224061-51224211)
chr3 (97-280)||(47510940-47511113)
chr3 (100-282)||(31286791-31286963)
chr3 (98-263)||(45058882-45059037)
chr3 (96-255)||(17665549-17665698)
chr3 (98-279)||(42998790-42998960)
chr3 (96-280)||(37028720-37028894)
chr3 (96-209)||(2227995-2228109)
chr3 (96-197)||(28576184-28576286)
chr3 (100-197)||(41882063-41882161)
chr3 (100-279)||(51143818-51143987)
chr3 (99-280)||(24688114-24688285)
chr3 (96-197)||(21597220-21597322)
chr3 (100-263)||(40022075-40022228)
chr3 (147-225)||(47182049-47182127)
chr3 (100-280)||(43176738-43176908)
chr3 (320-412)||(21009412-21009504)
chr3 (98-197)||(48726070-48726170)
chr3 (108-209)||(47402810-47402911)
chr3 (98-184)||(44946014-44946101)
chr3 (96-197)||(50731986-50732087)
chr3 (96-197)||(50780769-50780870)
chr3 (98-174)||(52434138-52434216)
chr3 (193-281)||(30429226-30429314)
chr3 (99-174)||(48752085-48752161)
chr3 (143-209)||(41609112-41609178)
chr3 (154-282)||(48534005-48534122)
chr3 (100-281)||(177162-177333)
chr3 (100-280)||(40165653-40165822)
chr3 (98-145)||(51942541-51942588)
chr3 (127-280)||(52756067-52756214)
chr3 (96-209)||(8847718-8847831)
chr3 (97-143)||(37741433-37741479)
chr3 (221-279)||(48752226-48752284)
chr3 (205-282)||(44945933-44946010)
chr3 (229-280)||(50731914-50731965)
chr3 (229-280)||(50780891-50780942)
chr3 (228-282)||(40688431-40688485)
chr3 (98-126)||(33550581-33550609)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (98-282)||(39554-39739)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (98-282)||(13760-13945)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (96-280)||(11133-11317)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (101-280)||(1871-2051)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (98-282)||(278005-278192)
scaffold0007 (111-281)||(176666-176837)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (98-282)||(75242-75427)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (98-280)||(2432-2615)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (98-282)||(18852-19037)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (98-252)||(32560-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (100-280)||(4596-4771)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (100-281)||(3089-3262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (99-280)||(20477-20648)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (98-280)||(7089-7262)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (96-280)||(14741-14915)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (96-205)||(99-209)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (95-205)||(4618-4730)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (95-205)||(3388-3500)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (98-246)||(17905-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (110-204)||(19228-19327)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 126)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29777440 - 29777255
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  29777440 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggatacc 29777341  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29777340 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 29777255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41702644 - 41702461
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41702644 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggata 41702545  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41702544 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 279
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020109
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 34276547 - 34276731
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34276547 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 34276646  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34276647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34276731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43471878 - 43471694
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43471878 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggatacc 43471779  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43471778 acttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21366794 - 21366609
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21366794 aagggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 21366695  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21366694 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 39077543 - 39077728
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077543 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatac 39077642  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39077643 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 44984758 - 44984943
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44984758 aagggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 44984857  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44984858 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 23437590 - 23437774
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23437590 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 23437689  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23437690 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 9798464 - 9798647
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9798464 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 9798563  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9798564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 53854612 - 53854430
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53854612 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 53854513  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53854512 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 237475 - 237661
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  237475 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataa 237574  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  237575 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2826866 - 2826681
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2826866 aaggttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 2826767  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2826766 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 42085204 - 42085390
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42085204 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 42085303  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  42085304 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 278
Target Start/End: Original strand, 397401 - 397582
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  397401 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 397500  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  397501 acttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 51363004 - 51363188
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  51363004 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggata 51363103  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51363104 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 27373075 - 27373257
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27373075 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 27373174  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27373175 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-tactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 32366844 - 32366661
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32366844 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 32366745  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32366744 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53462001 - 53461814
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53462001 aaggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 53461902  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  53461901 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 53461814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 29478357 - 29478542
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29478357 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 29478456  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  29478457 ccacttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31532320 - 31532135
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  31532320 aaggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 31532221  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31532220 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 54575125 - 54574940
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  54575125 aaggttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggata 54575026  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54575025 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 6285307 - 6285486
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6285307 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggatacca 6285406  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6285407 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972336
Alignment:
Q  102 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  201 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 3170623 - 3170809
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3170623 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 3170722  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3170723 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacct 3170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18462195 - 18462013
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18462195 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 18462096  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18462095 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19387872 - 19387686
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19387872 aggttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 19387773  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19387772 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19387686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26091443 - 26091253
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26091443 aaggttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 26091344  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  26091343 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatcat 26091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Original strand, 42033171 - 42033357
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  42033171 gaaggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggat 42033270  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42033271 accacttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 45797477 - 45797663
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45797477 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 45797576  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  45797577 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 45797663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42766024 - 42765840
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42766024 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-atacc 42765926  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  42765925 acttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 42765840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 47344653 - 47344838
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  47344653 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 47344752  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47344753 ccacttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 146611 - 146427
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  146611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 146512  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||    
T  146511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacctt 146427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55056442 - 55056258
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  55056442 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataca 55056343  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||    
T  55056342 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22618693 - 22618512
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22618693 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 22618595  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22618594 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 22618512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49881247 - 49881059
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49881247 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatac 49881148  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt----gggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  49881147 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 50233997 - 50234184
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  50233997 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggata 50234096  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50234097 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctt 50234184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 54607961 - 54608144
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54607961 ggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacc 54608060  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54608061 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacc 54608144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 41949381 - 41949566
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41949381 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41949480  T
Q  197 acttaaaaatgtgct--tatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  41949481 acttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3692393 - 3692208
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3692393 ggttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgatacc 3692294  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3692293 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 3692208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 42222292 - 42222473
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42222292 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccac 42222391  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  42222392 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 53834235 - 53834055
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53834235 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccac 53834136  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53834135 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 55776043 - 55776228
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  55776043 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatac 55776141  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  55776142 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55776228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 55840221 - 55840406
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  55840221 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatac 55840319  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  55840320 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 31914196 - 31914380
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31914196 aggttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 31914295  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31914296 cacttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Original strand, 50534632 - 50534801
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50534632 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 50534731  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacc 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50534732 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 50534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 407753 - 407934
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  407753 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-c 407851  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  407852 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 23609086 - 23609269
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23609086 ggttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggatacc 23609185  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23609186 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 41560327 - 41560510
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41560327 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 41560426  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  41560427 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 55519826 - 55520009
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55519826 ggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggatacc 55519925  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  55519926 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 1932762 - 1932947
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1932762 ggttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagatacc 1932861  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||| || |||||||    
T  1932862 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacctt 1932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 2243457 - 2243642
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2243457 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggatacc 2243556  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  2243557 acttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 2243642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31070256 - 31070072
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  31070256 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-atacc 31070158  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31070157 acttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31070072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 276
Target Start/End: Original strand, 35446506 - 35446683
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  35446506 gttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttaccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcac 35446605  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35446606 ttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50457993 - 50457812
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  50457993 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 50457894  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50457893 acttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 38591667 - 38591848
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38591667 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38591766  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    | |    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38591767 att----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38591848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14017558 - 14017374
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14017558 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14017459  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14017458 cactt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 14017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39587962 - 39587781
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39587962 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39587863  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39587862 acttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg-ta-cctaattgtcacc 39587781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47662287 - 47662100
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| || || |||||| |||||||    
T  47662287 aaggttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggata 47662188  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  47662187 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctt 47662100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 48313556 - 48313737
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  48313556 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacc 48313654  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  48313655 acttaaaa-tatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 56023181 - 56022998
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  56023181 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacc 56023082  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  56023081 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 48657826 - 48658002
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48657826 tttttttagattacctttgaagaatggtgggt-----cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 48657920  T
Q  201 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48657921 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 48658002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 54086407 - 54086590
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  54086407 aaggttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 54086504  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  54086505 ccgcttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 54424980 - 54425163
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccaca-accaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  54424980 aggttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 54425079  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  54425080 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccatgg-tacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33897679 - 33897501
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33897679 aaggtttttt-tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33897581  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaatt 274  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  33897580 ccacttaaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtaccctaatt 33897501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41632191 - 41632007
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  41632191 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggata 41632093  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41632092 tcgcttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 54805803 - 54805614
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54805803 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagata 54805704  T
Q  195 ccacttaaaaatgtg----cttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  54805703 ccacttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatg 262  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50536809 - 50536628
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  50536809 aaggttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggata 50536710  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  50536709 ccacttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 278
Target Start/End: Original strand, 51951683 - 51951861
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||| || |||||||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||||||| ||     
T  51951683 ttttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcag 51951782  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51951783 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgtg-taaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655004
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggcta------atgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||      |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacctt 48655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259510
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  48259591 ttaaaa-tgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctacttatcacctt 48259510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36533003 - 36532828
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |     ||||     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36533003 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttac-----accac----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36532913  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  36532912 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 36532828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52728443 - 52728307
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||||    
T  52728443 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgaggtaaa 52728344  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52728343 ttacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 47811906 - 47812079
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||       
T  47811906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata--- 47812002  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
            |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47812003 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacctt 47812079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9998103 - 9997931
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||      
T  9998103 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata-- 9998006  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
             |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9998005 ---------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891101
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||        
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaata---- 43891024  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43891025 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacctt 43891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45633953 - 45633779
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  45633953 aaggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 45633858  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  45633857 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 54216909 - 54216731
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||         
T  54216909 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg----- 54216815  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
          || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  54216814 ------aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcaccatcat 54216731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15060461 - 15060289
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  15060461 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 15060368  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  15060367 -----aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5117609 - 5117438
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  5117609 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 5117517  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||  ||| ||||||||    
T  5117516 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Original strand, 54715035 - 54715209
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||           
T  54715035 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatg------- 54715127  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
        || ||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  54715128 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcaccttc 54715209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351840
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacctt 20351840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Original strand, 22620589 - 22620741
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       
T  22620589 gaaggttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 22620685  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22620686 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattctt 22620741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 34835174 - 34835350
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  34835174 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 34835273  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||  |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34835274 ccatctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 34835350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37239264 - 37239088
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  37239264 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 37239169  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  37239168 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 280
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509478
Alignment:
Q  153 aaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacca 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  253 ttcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacc 42509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38547773 - 38547600
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38547773 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 38547674  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  38547673 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacct 38547600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 46708913 - 46708740
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  46708913 ggttatttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 46708820  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
         || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  46708819 -----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacct 46708740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 280
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595869
Alignment:
Q  183 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4486753 - 4486579
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||          
T  4486753 ggttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------ 4486660  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||    
T  4486659 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27873720 - 27873571
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||          
T  27873720 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatg------ 27873627  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27873626 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 27873571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 34552318 - 34552490
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||          
T  34552318 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg------ 34552411  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  34552412 -----aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27398775 - 27398664
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27398775 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 27398676  T
Q  197 acttaaaaatgt 208  Q
    ||||||||||||    
T  27398675 acttaaaaatgt 27398664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31881486 - 31881312
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  31881486 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 31881393  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  31881392 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 31881312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 46720024 - 46720201
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  46720024 ggttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacc 46720123  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    || |||||| |||  |||       |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  46720124 acctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgttacctt 46720201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  146 ccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaa-gatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335165
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccac 14335172  T
Q  199 ttaaaaa 205  Q
     ||||||    
T  14335171 ctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580226
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 27580219  T
Q  199 ttaaaaa 205  Q
     ||||||    
T  27580220 ctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Original strand, 54216310 - 54216482
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||        
T  54216310 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg---- 54216405  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
           || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  54216406 -------aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1662431 - 1662323
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1662431 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 1662332  T
Q  197 acttaaaaa 205  Q
    || ||||||    
T  1662331 acctaaaaa 1662323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 52461365 - 52461535
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||      
T  52461365 ggttttttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-- 52461459  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
             |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  52461460 ---------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacct 52461535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 33289702 - 33289873
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||     
T  33289702 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac- 33289800  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
              ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  33289801 ----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcct-attgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 52688348 - 52688520
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||          
T  52688348 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg------ 52688441  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  52688442 -----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 43231502 - 43231601
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43231502 ggttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 43231600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3293197 - 3293102
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3293197 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 3293102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11972303 - 11972208
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11972303 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 11972208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 49014095 - 49014269
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  49014095 aaggttttttttaaatcacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 49014190  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  49014191 -------aatatgtacttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6371420 - 6371247
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||    
T  6371420 gttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttacca 6371321  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||    
T  6371320 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 6371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 279
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  178 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  278 ac 279  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 573802 - 573974
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  573802 ggttgtttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 573901  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||| ||| ||||||||    
T  573902 acctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacc 573974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33558112 - 33557944
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||            
T  33558112 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-------- 33558021  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
       || ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  33558020 ---aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtca 33557944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||     
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  199 ttaaaa 204  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  207 gtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 182
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557666
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagat 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259702
Alignment:
Q  203 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacctt 48259702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291803
Alignment:
Q  212 tatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Original strand, 27872607 - 27872750
Alignment:
Q  127 gtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 225  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| |||           |||||    
T  27872607 gtggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgt 27872695  T
Q  226 atattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  27872696 ttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51981605 - 51981502
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51981605 caaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 51981517  T
Q  243 ttacccaccattctt 257  Q
    |||| || |||||||    
T  51981516 ttactcatcattctt 51981502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17555670 - 17555624
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17555670 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 17555624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206583
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccc-cacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaag----atagttcatggataccacttaaaa 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Original strand, 42558273 - 42558369
Alignment:
Q  178 aagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||    
T  42558273 aagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtc 42558364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662259
Alignment:
Q  228 attggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacctt 1662259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47105087 - 47105023
Alignment:
Q  216 tggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||    
T  47105087 tggctaatgtttaatggttgaggtaaattacccacctttcttttatagataccctaattatcacc 47105023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47105148 - 47105108
Alignment:
Q  148 aatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttca 188  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47105148 aatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttca 47105108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 252
Target Start/End: Original strand, 49304602 - 49304657
Alignment:
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacca 252  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  49304602 cacttaaaaatgtatttatgtggctgatgtttattggtt-gaataaattacccacca 49304657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2325072 - 2324887
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2325072 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2324973  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2324972 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 2324887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 95 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6594644 - 6594456
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6594644 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 6594545  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6594544 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 38997100 - 38997282
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38997100 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38997199  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38997200 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 4034590 - 4034775
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034590 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacc 4034689  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4034690 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 4034775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 17600832 - 17601019
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17600832 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 17600931  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17600932 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 746464 - 746647
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  746464 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 746563  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  746564 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 23901775 - 23901960
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23901775 aagggtttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 23901874  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23901875 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10244765 - 10244582
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10244765 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10244666  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10244665 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 45370988 - 45371171
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45370988 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggatacc 45371087  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45371088 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 26710341 - 26710526
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26710341 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggata 26710440  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  26710441 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13815402 - 13815218
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13815402 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 13815303  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  13815302 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27651217 - 27651033
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaacc-aatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27651217 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 27651118  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27651117 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 34518366 - 34518550
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34518366 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 34518465  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34518466 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34518550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 40635216 - 40635400
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40635216 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40635315  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40635316 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 11184970 - 11185153
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11184970 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 11185069  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11185070 acttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 281
Target Start/End: Original strand, 14660445 - 14660628
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14660445 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14660544  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  14660545 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 271
Target Start/End: Original strand, 6430471 - 6430645
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6430471 ggttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 6430570  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6430571 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 6430645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 10424592 - 10424773
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10424592 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 10424691  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10424692 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 27024413 - 27024598
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaa-ccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27024413 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 27024512  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27024513 acttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 27024598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 27400399 - 27400584
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27400399 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 27400498  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27400499 ccacttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 5726128 - 5726310
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5726128 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttacca 5726227  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5726228 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7892870 - 7892686
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  7892870 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggatacca 7892771  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7892770 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacctt 7892686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1092134 - 1091949
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1092134 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 1092035  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1092034 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 1091949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 40735460 - 40735645
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40735460 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggata 40735559  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40735560 ccacttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427645
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 33427645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2914319 - 2914138
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2914319 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 2914220  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2914219 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327542
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaa-ccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37621054 - 37620867
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtt---aagatagttcatgga 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||    
T  37621054 aggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatgga 37620955  T
Q  193 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  37620954 taccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609807
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37255516 - 37255336
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37255516 aggttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatac 37255422  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  37255421 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14697721 - 14697537
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14697721 aggttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggatac 14697622  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  14697621 cacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Original strand, 15925076 - 15925252
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15925076 aaggttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 15925175  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15925176 ccacttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagatacccta 15925252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 254
Target Start/End: Original strand, 32608375 - 32608535
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  32608375 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtat 32608474  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccatt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32608475 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt 32608535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 32948445 - 32948626
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32948445 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggatacca 32948543  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  32948544 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444875
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca--------caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgg 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |        |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  192 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacc---attcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacct 9444875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856434
Alignment:
Q  114 cctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  213 atgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 32856434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 40037141 - 40037325
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40037141 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacc 40037240  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  40037241 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 280
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  103 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactta 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  202 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Original strand, 1229631 - 1229791
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |       ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1229631 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtaggtaatttgtc-------aatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatac 1229723  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1229724 cacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 1229791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8433101 - 8432942
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8433101 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggata 8433002  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccatt 254  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8433001 ccactttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 253
Target Start/End: Original strand, 12842103 - 12842257
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||     
T  12842103 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaa 12842202  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccat 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12842203 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 223
Target Start/End: Original strand, 42899913 - 42900039
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42899913 ggttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 42900012  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaat 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42900013 acttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21735073 - 21734898
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||         
T  21735073 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatg----- 21734979  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
          || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  21734978 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 21734898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 282
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  150 tgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattaccca 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  250 ccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Original strand, 39103043 - 39103216
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||        
T  39103043 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatg---- 39103138  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39103139 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 41172455 - 41172605
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  | ||    
T  41172455 aaggtttttt-taaattacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggta 41172553  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41172554 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Original strand, 145281 - 145450
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||      
T  145281 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-- 145378  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  145379 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  173 gggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaa 272  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||     
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  273 ttgtcacc 280  Q
    ||||||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35158220 - 35158050
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  35158220 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35158129  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  35158128 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 271
Target Start/End: Original strand, 35126778 - 35126941
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35126778 ggttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 35126877  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    || |||||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35126878 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagatacccta 35126941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12333669 - 12333497
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  12333669 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat- 12333571  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  12333570 ----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgg-tagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 44481826 - 44482000
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  44481826 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 44481925  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    || |||||| |||           || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||    
T  44481926 acctaaaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacctt 44482000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 4258488 - 4258659
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||          
T  4258488 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatg------ 4258580  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| ||||||||    
T  4258581 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 27331298 - 27331474
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |          
T  27331298 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa------ 27331391  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     || | ||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27331392 -tatatatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 27331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28641464 - 28641292
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  28641464 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 28641371  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  28641370 -----aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 29687039 - 29687211
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  29687039 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 29687132  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  29687133 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || |||||||||| || ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 12730059 - 12730233
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||            
T  12730059 ggttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-------- 12730150  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  12730151 ---taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacctt 12730233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13543798 - 13543620
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  13543798 aaggttctttttaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 13543703  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttca 284  Q
           || ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  13543702 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttca 13543620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43899142 - 43898966
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||          
T  43899142 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------ 43899049  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |||| ||||    
T  43899048 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatcat 43898966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2688903 - 2688727
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccaca-accaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||    
T  2688903 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata 2688804  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
               |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2688803 -----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctt 2688727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19428598 - 19428426
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacc-tttgaagaatggtgggtaatttccccaca-accaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||          
T  19428598 gttttttctaaattaccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatg------ 19428505  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  19428504 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 260
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827223
Alignment:
Q  173 gggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttcca 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12827137 gggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttcca 12827223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27765035 - 27764897
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||         
T  27765035 aggttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg----- 27764941  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaatta 245  Q
          || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27764940 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 27764897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 12814610 - 12814691
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12814610 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggt 12814691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40544250 - 40544155
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40544250 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 40544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 43356097 - 43356266
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  43356097 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaa--cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 43356187  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||||||  |||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  43356188 ----aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  170 gtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 3266296 - 3266387
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  3266296 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 3266387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 2000511 - 2000417
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcat 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  2000511 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcat 2000417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28566872 - 28566715
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||        
T  28566872 aaggttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg---- 28566777  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
           || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||| |||||    
T  28566776 -------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgg 28566715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 34249265 - 34249437
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||            
T  34249265 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 34249356  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  34249357 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 34249437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Original strand, 8056625 - 8056717
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8056625 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg 8056717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 282
Target Start/End: Original strand, 3711681 - 3711805
Alignment:
Q  147 caatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3711681 caatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattac 3711769  T
Q  247 ccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  3711770 ccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 3711805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 195
Target Start/End: Original strand, 30545817 - 30545917
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30545817 aaggttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggata 30545916  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  30545917 c 30545917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28020005 - 28019959
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28020005 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 42900772 - 42900838
Alignment:
Q  214 tgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  42900772 tgtggctaatgtat--tggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcaccttc 42900838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 10176558 - 10176626
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaattta 166  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||||||||    
T  10176558 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattta 10176626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 1897130 - 1897167
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattt 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1897130 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataattt 1897167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17799345 - 17799296
Alignment:
Q  181 atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatatt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  17799345 atagttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 6365985 - 6366169
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6365985 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggatacc 6366084  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6366085 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32984262 - 32984075
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32984262 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 32984163  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32984162 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 43328706 - 43328890
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43328706 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 43328805  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43328806 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 5946044 - 5946230
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5946044 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 5946143  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  5946144 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33730824 - 33730639
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33730824 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33730725  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33730724 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 33730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 37956420 - 37956605
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37956420 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37956519  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  37956520 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacctt 37956605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 41862218 - 41862402
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  41862218 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 41862317  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41862318 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24080084 - 24079901
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24080084 ggttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24079985  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  24079984 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45236749 - 45236564
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45236749 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatac 45236650  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||||||||    
T  45236649 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9303756 - 9303572
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9303756 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9303657  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9303656 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17718903 - 17718720
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17718903 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccac 17718804  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  17718803 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacctt 17718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37301508 - 37301326
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  37301508 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggatacc 37301409  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  37301408 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40435335 - 40435153
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40435335 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 40435236  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  40435235 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646305
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 25185897 - 25186082
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25185897 aggtattttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatac 25185996  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  25185997 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacct 25186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33981846 - 33981661
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33981846 ggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 33981747  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33981746 acttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 33981661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 41231945 - 41232130
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41231945 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 41232044  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41232045 acttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacctt 41232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 41653892 - 41654077
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  41653892 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggata 41653991  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  41653992 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714714
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg 2714714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 9734255 - 9734435
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9734255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ca 9734353  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9734354 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 37419937 - 37420122
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37419937 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 37420036  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  37420037 ctacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 9013684 - 9013867
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9013684 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 9013783  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9013784 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagg-taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13356305 - 13356118
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13356305 aaggttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 13356206  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13356205 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29048587 - 29048426
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29048587 aggttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatac 29048488  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29048487 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Original strand, 41639911 - 41640095
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41639911 aaggttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagata 41640010  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41640011 ccgcttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 25248036 - 25248215
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248036 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccac---caa--aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 25248130  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248131 cactttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 104 - 278
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  104 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  203 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088446
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 2275913 - 2276096
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2275913 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2276012  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  2276013 ctt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacctt 2276096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13760831 - 13760644
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13760831 ggttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13760732  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg--ataccctaattgtcacctt 282  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  13760731 atttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacctt 13760644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45066774 - 45066590
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45066774 gttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45066675  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45066674 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacctt 45066590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Original strand, 22878389 - 22878572
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaa-ccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22878389 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggatac 22878488  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  22878489 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 35628776 - 35628959
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  35628776 ggttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaatacc 35628875  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  35628876 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033117
Alignment:
Q  154 aatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccat 253  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  254 tcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcaccttcat 12033117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Original strand, 45258510 - 45258675
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45258510 gttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 45258609  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
     ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45258610 tttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 45258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 4447467 - 4447294
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||      
T  4447467 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata-- 4447370  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4447369 ---------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 41981537 - 41981650
Alignment:
Q  167 ttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981537 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggata 41981636  T
Q  267 ccctaattgtcacc 280  Q
    ||||| ||||||||    
T  41981637 ccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 147 - 280
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  147 caatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  247 ccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  199 tta---aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacc 268  Q
    |||   ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211378
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg-------- 3211297  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  3211298 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacctt 3211378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 10378306 - 10378480
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||        
T  10378306 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatg---- 10378401  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10378402 -------aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 31940314 - 31940485
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  31940314 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 31940407  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  31940408 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 282
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336278
Alignment:
Q  167 ttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  267 ccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| ||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacctt 31336278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39915994 - 39915887
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39915994 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 39915895  T
Q  198 cttaaaaa 205  Q
    ||||||||    
T  39915894 cttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 9713688 - 9713857
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||           
T  9713688 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacc--caaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 9713778  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  9713779 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 41843252 - 41843407
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||          
T  41843252 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg------ 41843345  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41843346 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 41843407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 117499 - 117329
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  117499 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 117408  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  117407 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 31149063 - 31148890
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31149063 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gatac 31148965  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||           || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31148964 cacttaaaaat-----------gcgaatgtttattgattgagataaattatccaccatccttccatagataccctagttgtcacct 31148890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 2379138 - 2379311
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||         
T  2379138 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg----- 2379232  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2379233 ------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40458943 - 40458772
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  40458943 gttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 40458851  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  40458850 ----aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 40458772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33897016 - 33896841
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  33897016 aaggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagata 33896918  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| ||||||  ||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||    
T  33896917 ccacctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacctt 33896841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27243313 - 27243218
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27243313 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27243218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27254888 - 27254793
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27254888 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatg 27254793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Original strand, 38631652 - 38631810
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||           
T  38631652 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg------- 38631744  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatac 267  Q
        || || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38631745 ----aatatatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatggatac 38631810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9509572 - 9509399
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  9509572 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg------ 9509479  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
         || ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| || ||||||    
T  9509478 -----aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacct 9509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373736
Alignment:
Q  104 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 202  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  203 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    | |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataaccta 32373736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26196490 - 26196315
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  26196490 aaggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggata 26196392  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  26196391 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctt 26196315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3490572 - 3490397
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||    
T  3490572 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttac 3490473  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||    
T  3490472 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 3490397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975424
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
      || |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgg 4975424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 120 - 200
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  120 aagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622467
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  | |||| || ||||||||||            
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatg-------- 33622545  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||| ||||||||    
T  33622544 ---aatatgtggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcatgg-tagcctagttgtcacc 33622467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649848
Alignment:
Q  111 ttacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 209  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||           ||||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata-----------tgtg 40649902  T
Q  210 cttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgg 40649848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 135
Target Start/End: Original strand, 12032951 - 12032988
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12032951 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 12032988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901739
Alignment:
Q  215 gtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 143
Target Start/End: Original strand, 39901574 - 39901617
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  39901574 ttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttacccac 39901617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164789
Alignment:
Q  105 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaattt 165  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaattt 164789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425471
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggg 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 41425471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 111)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 31307999 - 31308185
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31307999 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 31308098  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31308099 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31308185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Original strand, 44661967 - 44662155
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44661967 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagata 44662066  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44662067 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttc 44662155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 45538151 - 45538335
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45538151 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 45538250  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45538251 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 3611133 - 3611318
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3611133 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 3611232  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3611233 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17995134 - 17994949
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17995134 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 17995035  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  17995034 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctt 17994949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 26277174 - 26277359
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  26277174 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 26277273  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26277274 ccacttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 49254158 - 49253973
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  49254158 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 49254059  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49254058 acttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacctt 49253973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 23984752 - 23984939
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23984752 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 23984851  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23984852 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23984939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21139594 - 21139412
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21139594 gttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 21139495  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  21139494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790196
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 5981169 - 5981354
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5981169 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5981268  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5981269 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5981354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 25058685 - 25058870
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||    
T  25058685 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggata 25058784  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25058785 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26085582 - 26085398
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26085582 aaggtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 26085484  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26085483 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 31040708 - 31040893
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31040708 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 31040807  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31040808 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctt 31040893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4068868 - 4068692
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4068868 aaggctttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 4068769  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4068768 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 4068692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6327732 - 6327546
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6327732 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 6327633  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6327632 ccacttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 6327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25678442 - 25678259
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25678442 ggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 25678343  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25678342 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 101 - 278
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251891
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24245210 - 24245025
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24245210 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 24245111  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  24245110 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33113001 - 33112818
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33113001 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33112902  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  33112901 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgg-taccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 281
Target Start/End: Original strand, 33884088 - 33884271
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33884088 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33884187  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33884188 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33960164 - 33959981
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33960164 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33960065  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33960064 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38332044 - 38331857
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38332044 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 38331945  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38331944 tcacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23932692 - 23932507
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23932692 ggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacacc 23932593  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23932592 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 24885500 - 24885685
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24885500 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24885599  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24885600 acttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 24885685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 41999813 - 41999998
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41999813 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 41999912  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  41999913 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 47671583 - 47671768
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47671583 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggata 47671682  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47671683 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26525071 - 26524887
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  26525071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagatacca 26524972  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26524971 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacctt 26524887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35692848 - 35692661
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattt--ccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  35692848 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 35692749  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35692748 ccgcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacctt 35692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 39646567 - 39646751
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39646567 ggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggatacc 39646666  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39646667 acttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37620375 - 37620192
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37620375 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 37620276  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  37620275 acttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 46967224 - 46967041
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46967224 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 46967125  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  46967124 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47383914 - 47383732
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47383914 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47383815  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  47383814 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774400
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Original strand, 3285400 - 3285582
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3285400 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 3285499  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3285500 cacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 36566329 - 36566512
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36566329 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36566428  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36566429 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 48373501 - 48373679
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48373501 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggata 48373600  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48373601 ccacttaaaaatgtgcttatgtg---------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 46784423 - 46784605
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  46784423 gttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggatacca 46784522  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46784523 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23221112 - 23220939
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23221112 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 23221013  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      || ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23221012 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Original strand, 26794302 - 26794482
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26794302 aggttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatac 26794401  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26794402 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003317
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttc---catggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||| ||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacctt 36003317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 5980067 - 5980250
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5980067 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacc 5980166  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||    
T  5980167 acttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 35273595 - 35273778
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35273595 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35273694  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35273695 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49399171 - 49398988
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49399171 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggatacc 49399072  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  49399071 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 46616546 - 46616732
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  46616546 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 46616645  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  46616646 tcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 51057068 - 51057253
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  51057068 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggata 51057167  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51057168 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Original strand, 31844374 - 31844530
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31844374 aggttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatac 31844473  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacca 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31844474 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 277
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtc 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 101 - 262
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864029
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 42864029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317497
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 47187102 - 47187289
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  47187102 aaggttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggata 47187201  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  47187202 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacctt 47187289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42313548 - 42313359
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgg----gtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgga 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  42313548 ggttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaa 42313449  T
Q  193 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  42313448 taccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgg 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 33073208 - 33073384
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  33073208 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata 33073307  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
               |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33073308 -----------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 33073384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 285
Target Start/End: Original strand, 10928064 - 10928243
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  10928064 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 10928163  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
               |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10928164 -----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcaccttcat 10928243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51403189 - 51403032
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51403189 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 51403090  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggat 265  Q
    ||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51403089 ctt-aaaatgtgcttatatg---------tattggttgggataaattactcaccattcttccatggat 51403032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808829
Alignment:
Q  152 aaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacc 251  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  252 attcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctt 4808829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27983772 - 27983603
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||                |||    
T  27983772 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ata 27983689  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27983688 ccatttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45476014 - 45475866
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45476014 tttttctagattacctttgaagaatggt-------tacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccactt 45475922  T
Q  201 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45475921 acaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtg 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41467804 - 41467632
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  41467804 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 41467711  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41467710 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 2657300 - 2657474
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  2657300 aaggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 2657395  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  2657396 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 2450539 - 2450676
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2450539 caaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 2450638  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  2450639 ttacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953225
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 4953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51045733 - 51045596
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  51045733 caaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaa 51045634  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||| | || || |||| ||||||||    
T  51045633 ttacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 2954854 - 2955028
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2954854 ggttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggatacc 2954953  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||| |||           | ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2954954 acttaaaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 2955028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6626195 - 6626025
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  6626195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 6626103  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  6626102 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 26685855 - 26686029
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  26685855 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 26685954  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26685955 acctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 26686029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2557031 - 2556909
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2557031 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaata 2556932  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtg 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  2556931 ccacttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26472353 - 26472196
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  26472353 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 26472258  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
           || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  26472257 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgg 26472196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 29770667 - 29770843
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  29770667 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 29770762  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| || |||| ||| ||||||    
T  29770763 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacctt 29770843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 42234837 - 42235012
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  42234837 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 42234932  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  42234933 -------aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggg-taaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 42235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  187 catggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 34752485 - 34752331
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||           
T  34752485 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg------- 34752393  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  34752392 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgg 34752331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 10920198 - 10920371
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10920198 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 10920297  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  10920298 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacc 10920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772170
Alignment:
Q  148 aatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacc 247  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| || |||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  248 caccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacctt 47772170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38716419 - 38716247
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  38716419 ggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacc 38716320  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  38716319 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4243663 - 4243490
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||         
T  4243663 aggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg----- 4243569  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||| ||  ||| ||||||||    
T  4243568 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13313350 - 13313249
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagatta--cctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgga 192  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13313350 aaggttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatgga 13313251  T
Q  193 ta 194  Q
    ||    
T  13313250 ta 13313249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30290083 - 30289910
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||         
T  30290083 aggtgttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatg----- 30289989  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  30289988 ------aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448740
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 32448740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 280
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388644
Alignment:
Q  102 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  201 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||| |||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  1388576 aaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 33187337 - 33187505
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||    
T  33187337 aaggttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagata 33187436  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| ||                 ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33187437 ccacttaaaaatatg-----------------tattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5961441 - 5961266
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  5961441 aaggttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggata 5961342  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||| |||||| |||           ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  5961341 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacct 5961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27924830 - 27924722
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  27924830 ggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacc 27924731  T
Q  197 acttaaaaa 205  Q
    || ||||||    
T  27924730 acctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 39475956 - 39475783
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  39475956 aaggttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggata 39475858  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||| ||||||||||           || || ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  39475857 ccacctaaaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 39475783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24649896 - 24649802
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24649896 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156577
Alignment:
Q  149 atgaaaatgagcaatttattggtggggttaaga-------tagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataa 241  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  242 attacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7561712 - 7561528
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaag-atagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |    | ||  |||       
T  7561712 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagtt 7561613  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtgg--ctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | | || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7561612 catgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44293629 - 44293453
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  44293629 aaggtttttttaaaattacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 44293534  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           || |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  44293533 -------aatatgtacttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacctt 44293453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 46428424 - 46428332
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46428424 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatg 46428332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683330
Alignment:
Q  111 ttacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 209  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  210 cttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
               ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 51155761 - 51155606
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||          
T  51155761 ggttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg------ 51155668  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
         || ||||| ||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  51155667 -----aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgg 51155606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544125
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 44544125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13281733 - 13281588
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||           
T  13281733 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 13281641  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccatt 254  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  13281640 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Original strand, 39637899 - 39637996
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttc-atggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39637899 ggttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc---accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaatggatacc 39637995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895164
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||         
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata----- 41895239  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  41895238 ------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 52323936 - 52324110
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  52323936 aggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaatac 52324035  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| |||||| |||           |||||  |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52324036 cacctaaaaaggtga----------aatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Original strand, 52367882 - 52367990
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  52367882 ggttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacc 52367981  T
Q  197 acttaaaaa 205  Q
    || ||||||    
T  52367982 acctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35991772 - 35991613
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaat-gaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  35991772 aaggtttttt-taaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 35991678  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
           || || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  35991677 -------aatatatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatggata 35991613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4156248 - 4156188
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatg 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4156248 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718167
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttggga-taaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcatgg-tagcctagttgtcacc 38718167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31286612 - 31286504
Alignment:
Q  161 aatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttcca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |    
T  31286612 aatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttcta 31286524  T
Q  261 tggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  31286523 tgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10919367 - 10919321
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10919367 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccac 10919321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 130
Target Start/End: Original strand, 23994845 - 23994879
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994845 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgg 23994879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9779982 - 9779919
Alignment:
Q  190 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccatt 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  9779982 ggataccacttaaaaatgtgtttacgtggctaatatatatttgttggg-ttaattagccaccatt 9779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Original strand, 24215808 - 24215911
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||           || || || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24215808 caaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatg-----------aatatatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 24215896  T
Q  243 ttacccaccattctt 257  Q
    ||||||| |||||||    
T  24215897 ttacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 282
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844857
Alignment:
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 31844857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 276
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359559
Alignment:
Q  219 ctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatagatatcctgattgt 39359559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Original strand, 12891401 - 12891437
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattt 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12891401 tttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaattt 12891437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47772334 - 47772306
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47772334 ttttttctagattacctttgaagaatggt 47772306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 5882505 - 5882690
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5882505 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 5882604  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5882605 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5882690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 8615237 - 8615422
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8615237 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 8615336  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8615337 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22551246 - 22551061
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22551246 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggata 22551147  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22551146 ccacctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26377387 - 26377202
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26377387 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 26377288  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26377287 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 26377202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14891563 - 14891383
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14891563 aggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 14891464  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14891463 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 24168090 - 24168274
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24168090 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 24168189  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24168190 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7393771 - 7393584
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7393771 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 7393672  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7393671 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacctt 7393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 278
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2594036 - 2593850
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2594036 aggttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 2593937  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  2593936 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34528045 - 34527860
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34528045 ggttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 34527946  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34527945 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34527860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 102 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101495
Alignment:
Q  102 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  201 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30743629 - 30743446
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  30743629 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccac 30743530  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30743529 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacctt 30743446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988973
Alignment:
Q  112 tacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  211 ttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19415717 - 19415531
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19415717 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggatac 19415618  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19415617 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 19415531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7345295 - 7345130
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7345295 ggttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacc 7345196  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7345195 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatg 7345130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 599890 - 600074
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  599890 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 599989  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  599990 cacttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 28947085 - 28947269
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  28947085 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatac 28947184  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28947185 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 16703363 - 16703542
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16703363 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggata 16703462  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaatt 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| || |||||||    
T  16703463 ccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatcctaatt 16703542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341786
Alignment:
Q  112 tacctttgaagaatggtgggtaatttcccca---caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  209 gcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 22341786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 960086 - 959904
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  960086 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagatacca 959987  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  959986 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10508091 - 10507907
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10508091 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 10507992  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  10507991 acttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 1970708 - 1970894
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1970708 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 1970807  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  1970808 tcacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19281238 - 19281056
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  19281238 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatc 19281139  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||    
T  19281138 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5294982 - 5294797
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5294982 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5294883  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5294882 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttca 5294797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5299534 - 5299349
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5299534 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5299435  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5299434 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttca 5299349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452572
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24224253 - 24224070
Alignment:
Q  99 gttttttctagatt-acctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24224253 gttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 24224154  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  24224153 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30467786 - 30467658
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30467786 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 30467687  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30467686 acttaaacatgtgcttatgtggctaatgt 30467658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 263
Target Start/End: Original strand, 13329376 - 13329535
Alignment:
Q  94 ggaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgga 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||        
T  13329376 ggaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---- 13329471  T
Q  193 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
           |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  13329472 -------taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgg 13329535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261927
Alignment:
Q  131 gtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatat 229  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  230 tggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacctt 23261927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28949020 - 28948845
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||       
T  28949020 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg--- 28948924  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
            || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  28948923 --------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 7167580 - 7167753
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7167580 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatac 7167679  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  7167680 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 15965432 - 15965605
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||          
T  15965432 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatg------ 15965525  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
         || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  15965526 -----aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291181
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487698
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 4487619  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  4487620 ---aatatgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 176
Target Start/End: Original strand, 929657 - 929737
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  929657 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggt 929737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 1398551 - 1398724
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||         
T  1398551 aggttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg----- 1398645  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||| | || |||| ||||||||    
T  1398646 ------aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 3786749 - 3786920
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||||           
T  3786749 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatg------- 3786841  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  3786842 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939579
Alignment:
Q  105 tctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaa-ccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 375898 - 375797
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  375898 aaggttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 375799  T
Q  195 cc 196  Q
    ||    
T  375798 cc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 280
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661905
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 282
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262403
Alignment:
Q  221 aatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 34262403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11743129 - 11743088
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattt 137  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11743129 aaggttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaattt 11743088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  221 aatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913114
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatg 262  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatg 24913114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 205
Target Start/End: Original strand, 13844847 - 13844943
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 205  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||| ||||||    
T  13844847 attacctttgaaaaatggtggttaacttaaccactaacaaatgaaaatgaacaatttattgatggagtcaaaatagttcataaataccacctaaaaa 13844943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 24253379 - 24253564
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24253379 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 24253478  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24253479 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 12648797 - 12648979
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648797 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 12648896  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12648897 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43326565 - 43326379
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43326565 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 43326466  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  43326465 accacttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 7722047 - 7722232
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7722047 aggttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 7722146  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7722147 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 739889 - 739703
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  739889 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 739790  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  739789 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3466865 - 3466680
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3466865 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 3466766  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  3466765 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398478
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcactttca 15398478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479668
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacc 18479668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 35626037 - 35626221
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35626037 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 35626136  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  35626137 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Original strand, 6901796 - 6901979
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6901796 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 6901895  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6901896 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 39932578 - 39932762
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39932578 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39932677  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  39932678 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 39932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 5184971 - 5185154
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5184971 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 5185070  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5185071 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40886210 - 40886028
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40886210 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40886111  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  40886110 acttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 27938894 - 27939080
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27938894 aaggttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 27938993  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccat-ggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  27938994 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43262368 - 43262182
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  43262368 aaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 43262269  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43262268 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 101 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504742
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 25831518 - 25831703
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  25831518 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggata 25831616  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  25831617 ccaattaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27278660 - 27278474
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatag----ttcatgga 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    ||||||||    
T  27278660 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatgga 27278561  T
Q  193 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  27278560 taccacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27501240 - 27501055
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27501240 aaggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 27501141  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27501140 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28424977 - 28424793
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28424977 aggttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 28424880  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28424879 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctt 28424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 280
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939079
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  209 gcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 15683791 - 15683973
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15683791 gttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 15683890  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  15683891 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 40279042 - 40278858
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  40279042 aaggtttttttta-attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggata 40278944  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40278943 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29789432 - 29789293
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789432 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 29789333  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29789332 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 29789293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484292
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 5137713 - 5137898
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5137713 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 5137812  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  5137813 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacct 5137898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 34451295 - 34451432
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  34451295 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaa 34451394  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34451395 ttacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 890903 - 891088
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  890903 aaggttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggata 891002  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  891003 ccacttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Original strand, 40110231 - 40110413
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  40110231 aaggttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagata 40110329  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  40110330 ccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756485
Alignment:
Q  107 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  206 tgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt-ccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacctt 38756485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 763723 - 763907
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  763723 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatca 763822  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  763823 cttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacctt 763907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Original strand, 4149691 - 4149847
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||          ||||||    
T  4149691 aaggttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtta----------tggata 4149780  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4149781 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 285
Target Start/End: Original strand, 33617584 - 33617761
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||          
T  33617584 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg------ 33617677  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33617678 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccttcat 33617761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 19295727 - 19295901
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  19295727 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat- 19295825  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  19295826 ----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 2585461 - 2585633
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  2585461 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 2585560  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |  ||||||  ||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2585561 atctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 5497271 - 5497446
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||         
T  5497271 aggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg----- 5497365  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
          || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  5497366 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 5497446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9424764 - 9424593
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  9424764 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 9424671  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
         || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  9424670 -----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Original strand, 27503375 - 27503550
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       
T  27503375 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 27503471  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
            || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  27503472 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42658836 - 42658667
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  42658836 aaggttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 42658741  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattg 275  Q
           || || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  42658740 -------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 42658667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293989
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||   | |||| |||| |||||||    
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||| |||||| |||  | |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015512
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 38015593  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  38015592 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 38015512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23195420 - 23195246
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  23195420 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 23195327  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  23195326 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12558203 - 12558090
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  12558203 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gata 12558105  T
Q  195 ccacttaaaaatgtg 209  Q
    |||||||||||||||    
T  12558104 ccacttaaaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 13957668 - 13957843
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  13957668 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 13957762  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
          || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  13957763 ------aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13957843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36365617 - 36365459
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  36365617 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 36365524  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  36365523 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggata 36365459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Original strand, 6973063 - 6973236
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  6973063 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 6973155  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
        || ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  6973156 ----aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Original strand, 40632498 - 40632634
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40632498 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
              ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40632598 ---------ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36472458 - 36472348
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36472458 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 36472359  T
Q  195 ccacttaaaaa 205  Q
    |||||| ||||    
T  36472358 ccactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38638083 - 38637908
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38638083 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatac 38637984  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||  |||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38637983 caactaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 38637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 14971979 - 14972149
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||            
T  14971979 ttttttttaaattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-------- 14972070  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  14972071 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42247955 - 42247865
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagtt 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42247955 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 42247865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24167956 - 24167784
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24167956 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 24167857  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  24167856 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacc 24167784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1402678 - 1402503
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1402678 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatac 1402579  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||  ||||| |||           ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  1402578 cacccaaaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacctt 1402503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18327346 - 18327185
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  18327346 aggttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatac 18327247  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacc 268  Q
    ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18327246 cacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacc 18327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 27390596 - 27390769
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27390596 ggttatttttagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 27390695  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    || |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  27390696 acctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 27390769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  104 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 202  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||| ||            
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggta-------- 33624014  T
Q  203 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
       |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33624013 ---tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687071
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||     
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  40687000 ctaaaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacctt 40687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 257
Target Start/End: Original strand, 6206883 - 6207032
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||          
T  6206883 ggttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg------ 6206976  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6206977 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3656712 - 3656568
Alignment:
Q  126 ggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 224  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||           || ||||||||||||||||||||    
T  3656712 ggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatg 3656624  T
Q  225 tatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  3656623 tgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36948633 - 36948499
Alignment:
Q  125 tggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaat 223  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  36948633 tggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtaggg-taagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaat 36948546  T
Q  224 gtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatacccta 271  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  36948545 gtgtattggtaggg-taaattacccaccattcttgcatgagtacccta 36948499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171111
Alignment:
Q  102 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagata 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527121
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttatt 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9527190 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatt 9527121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Original strand, 38492662 - 38492767
Alignment:
Q  147 caatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38492662 caatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 38492750  T
Q  247 ccaccattcttccatgg 263  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  38492751 ccatcattctttcatgg 38492767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612755
Alignment:
Q  125 tggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatg 224  Q
    |||||||||||||  |||| | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||             |||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaaccatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgata-------------tgcttatgtggctaatg 612814  T
Q  225 tatattggttggga-taaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  612813 tgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 612755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  123 aatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcat 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20207142 - 20207088
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  20207142 caaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggatacca 20207088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300969
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtgg 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtgg 15300969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940336
Alignment:
Q  217 ggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcacc 3940336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 281
Target Start/End: Original strand, 40633525 - 40633560
Alignment:
Q  246 cccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40633525 cccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 40633560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22979833 - 22979647
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22979833 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 22979734  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  22979733 accacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25894103 - 25893917
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25894103 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggat 25894004  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25894003 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 33696006 - 33695821
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33696006 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 33695907  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33695906 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33423459 - 33423276
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33423459 aggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33423360  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33423359 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33839899 - 33839713
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33839899 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33839800  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  33839799 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47740516 - 47740331
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  47740516 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 47740417  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47740416 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 101 - 274
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877727
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaatt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 17855427 - 17855613
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17855427 aggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 17855526  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17855527 tacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 17855613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 31586848 - 31587034
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31586848 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 31586947  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||    
T  31586948 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcaccttc 31587034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 46913107 - 46913296
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46913107 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 46913206  T
Q  195 ccacttaaaaatgtg--cttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46913207 ccacttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 46913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 35355887 - 35356072
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35355887 aggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 35355986  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  35355987 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 40670563 - 40670748
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40670563 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 40670662  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  40670663 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 40670748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47067160 - 47066975
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47067160 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47067061  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  47067060 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 33411259 - 33411443
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33411259 aggttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 33411358  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  33411359 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171360
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 49171360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23393232 - 23393051
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23393232 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23393133  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23393132 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45690282 - 45690097
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45690282 aagggtttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 45690183  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45690182 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2341847 - 2341659
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2341847 aaggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 2341748  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccat-ggataccctaattgtcacctt 282  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  2341747 caacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctt 2341659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 27018115 - 27018299
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27018115 aggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatac 27018214  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  27018215 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35328252 - 35328068
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35328252 ggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35328153  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  35328152 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 37846199 - 37846015
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  37846199 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggatacc 37846100  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37846099 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165814
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26579900 - 26579715
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaac-caatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26579900 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtatacc 26579801  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26579800 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 10028488 - 10028673
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10028488 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacc 10028587  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg--ataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  10028588 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 45482657 - 45482843
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  45482657 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatat 45482756  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  45482757 cacttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 35767481 - 35767659
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35767481 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggta------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35767574  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35767575 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 35767659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48609862 - 48609677
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  48609862 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtata 48609763  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48609762 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 119 - 282
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389541
Alignment:
Q  119 gaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  218 gctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 43499484 - 43499668
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43499484 aggttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 43499583  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43499584 cacttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 33332787 - 33332973
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  33332787 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ata 33332885  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  33332886 ccacttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 33332973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 95 - 280
Target Start/End: Original strand, 5712165 - 5712351
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5712165 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggat 5712264  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  5712265 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 19563445 - 19563630
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  19563445 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 19563544  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19563545 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41991039 - 41990857
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41991039 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 41990940  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  41990939 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta-cctaattatcacctt 41990857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 31625706 - 31625887
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31625706 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 31625805  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  31625806 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183820
Alignment:
Q  115 ctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  214 tgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttcat 285  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcaccttcat 5183820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35757203 - 35757018
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35757203 ggttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-atacc 35757105  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35757104 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 35757018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45063540 - 45063357
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||    
T  45063540 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggata 45063441  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||    
T  45063440 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 33870244 - 33870404
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33870244 aggttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatac 33870343  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattct 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33870344 catttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 10618298 - 10618475
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| |||||    
T  10618298 ggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaatacc 10618390  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  10618391 acttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31429658 - 31429475
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  31429658 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggatacc 31429559  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||   |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  31429558 acttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  123 aatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggcta 221  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  222 atgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29446963 atgtgtattggtt-ggagtaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 33720220 - 33720070
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  33720220 aggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatac 33720121  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  33720120 cacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233936
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076526
Alignment:
Q  149 atgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattaccc 248  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  249 accattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35752206 - 35752032
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  35752206 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 35752113  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  35752112 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 46817595 - 46817420
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  46817595 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 46817500  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  46817499 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46898189 - 46898014
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||     
T  46898189 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata- 46898091  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
              |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46898090 ----------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 46898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 48085858 - 48086031
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||          
T  48085858 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 48085951  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  48085952 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 43489218 - 43489390
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  43489218 ggttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 43489311  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||||    
T  43489312 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Original strand, 24228540 - 24228714
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  24228540 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 24228634  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
          || || |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24228635 ------aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24923196 - 24923022
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||          
T  24923196 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------ 24923103  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  24923102 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacctt 24923022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 36817018 - 36816845
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  36817018 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 36816924  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  36816923 ------aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 282
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405533
Alignment:
Q  161 aatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttcca 260  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  261 tggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacctt 44405533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 256
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  116 tttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  215 gtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattct 256  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26941704 - 26941537
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  26941704 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 26941611  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattg 275  Q
         || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||    
T  26941610 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattg 26941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Original strand, 33393328 - 33393499
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33393328 ggttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 33393427  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    || ||||||           || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33393428 acctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128110
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| |||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 44003544 - 44003369
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  44003544 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggata 44003445  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  44003444 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7876501 - 7876326
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||         
T  7876501 aggttgtttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----- 7876407  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
          || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  7876406 ------aatatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacctt 7876326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 29610635 - 29610790
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||          
T  29610635 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg------ 29610728  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||||||| |||||    
T  29610729 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgg 29610790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 282
Target Start/End: Original strand, 41904275 - 41904390
Alignment:
Q  167 ttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||    
T  41904275 ttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagta 41904374  T
Q  267 ccctaattgtcacctt 282  Q
     |||| ||||||||||    
T  41904375 tcctagttgtcacctt 41904390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 498360 - 498188
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  498360 ggttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 498267  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  498266 -----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacc 498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16482956 - 16482847
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  16482956 aggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatac 16482857  T
Q  196 cacttaaaaa 205  Q
    ||| ||||||    
T  16482856 cacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45502987 - 45502817
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||           |||    
T  45502987 gttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaagata-----------cca 45502899  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  45502898 tttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 7257380 - 7257553
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  7257380 aggttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatac 7257479  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||| |||||| |||           ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  7257480 cacctaaaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Original strand, 21718117 - 21718258
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  21718117 ggttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 21718210  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattaccca 249  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21718211 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 21718258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 267
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855218
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggatac 267  Q
     |||| || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatac 41855218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 2332019 - 2332191
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||          
T  2332019 ggttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg------ 2332112  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
         || |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  2332113 -----aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32556779 - 32556640
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||         
T  32556779 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg----- 32556685  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
          || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32556684 ------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47906931 - 47906756
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||          
T  47906931 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------ 47906838  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||| |||| || |||||||| |||| ||| ||||||    
T  47906837 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacctt 47906756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25037683 - 25037525
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  25037683 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg--- 25037587  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
            || |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  25037586 --------aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgg 25037525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 29098752 - 29098843
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcat 189  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29098752 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15644120 - 15644010
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  15644120 aaggttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggata 15644021  T
Q  195 ccacttaaaaa 205  Q
    |||| ||||||    
T  15644020 ccacctaaaaa 15644010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Original strand, 39323616 - 39323709
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39323616 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39323709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 39453647 - 39453558
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagtt 186  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39453647 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt 39453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 26371051 - 26371221
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||            
T  26371051 ttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-------- 26371142  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
       || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  26371143 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 26371221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 39866667 - 39866758
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39866667 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 39866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7720674 - 7720574
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  7720674 gttttttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggatacca 7720575  T
Q  198 c 198  Q
    |    
T  7720574 c 7720574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863116
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47460942 - 47460772
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47460942 ttttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     ||||||  ||           ||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  47460842 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Original strand, 35484634 - 35484807
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaa-tttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||       
T  35484634 aaggttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg--- 35484730  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
            || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  35484731 --------aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 44659843 - 44659936
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  44659843 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg 44659936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237531
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||| || | || ||||||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctt 45237531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103275
Alignment:
Q  104 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaa 203  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||           ||    
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttaccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aa 46103215  T
Q  204 aatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| || ||||||| |||||    
T  46103216 tatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgg 46103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455189
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatg 190  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 33455189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30077108 - 30077043
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  30077108 ggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 166
Target Start/End: Original strand, 35557730 - 35557799
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaattta 166  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35557730 ggttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattta 35557799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37443728 - 37443600
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaa 242  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||    
T  37443728 caaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaa 37443640  T
Q  243 ttacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  37443639 ttacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacctt 37443600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 208  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  209 g 209  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 21649552 - 21649442
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaa-tggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  21649552 aggttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggata 21649453  T
Q  195 ccacttaaaaa 205  Q
    |||| ||||||    
T  21649452 ccacctaaaaa 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456218
Alignment:
Q  145 accaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaat 26456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Original strand, 35823289 - 35823353
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagc 160  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  35823289 aggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 135
Target Start/End: Original strand, 42272149 - 42272188
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42272149 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtggctaat 42272188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323781
Alignment:
Q  212 tatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 39323781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39453557 - 39453484
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  39453557 atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Original strand, 29098847 - 29098915
Alignment:
Q  208 tgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgt 276  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||||    
T  29098847 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 280
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272244
Alignment:
Q  215 gtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacc 42272244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 282
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866822
Alignment:
Q  222 atgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattgccacctt 39866822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 115)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 47257792 - 47257977
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47257792 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacc 47257891  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47257892 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47257977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 96 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7855299 - 7855111
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7855299 aaggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggata 7855200  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7855199 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttc 7855111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27067160 - 27066977
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  27067160 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 27067061  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27067060 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40131144 - 40130957
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  40131144 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggata 40131045  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  40131044 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 29626012 - 29625826
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29626012 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 29625913  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  29625912 ccacttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 49330035 - 49330221
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49330035 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 49330134  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49330135 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 49330221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 55453429 - 55453245
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55453429 aaggttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 55453330  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  55453329 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38416905 - 38416722
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38416905 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38416806  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38416805 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 38416722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47809780 - 47809594
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47809780 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47809681  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47809680 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47809594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 24100280 - 24100464
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24100280 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ata 24100378  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24100379 ccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 41464349 - 41464534
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  41464349 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggata 41464448  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  41464449 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 22399095 - 22399278
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22399095 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaac 22399194  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22399195 cacttaaaa-tgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28048576 - 28048392
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28048576 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatac 28048477  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28048476 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35748494 - 35748310
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35748494 ggttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35748395  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35748394 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51170218 - 51170034
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51170218 aaggttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 51170119  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  51170118 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32234582 - 32234396
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32234582 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 32234483  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32234482 ccactt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32234396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 42291840 - 42292026
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42291840 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatac 42291939  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  42291940 cacttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 42292026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 257
Target Start/End: Original strand, 43125828 - 43125990
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43125828 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggata 43125927  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43125928 ccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 43125990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43612231 - 43612045
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  43612231 aggttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggatac 43612132  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43612131 cacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 43612045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134538
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 48739417 - 48739232
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48739417 aggttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatac 48739318  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48739317 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 40419834 - 40420018
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40419834 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 40419933  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40419934 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51452932 - 51452749
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51452932 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 51452833  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51452832 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgg-taccctaattgtcacctt 51452749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 52628953 - 52629135
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52628953 ggtttattctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 52629052  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52629053 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 37324538 - 37324723
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37324538 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtata 37324637  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37324638 ccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Original strand, 2665999 - 2666183
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2665999 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2666098  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||    
T  2666099 acttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39634753 - 39634570
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39634753 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggatacca 39634655  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39634654 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39634570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Original strand, 48609719 - 48609903
Alignment:
Q  96 aaggttttttcta-gattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48609719 aaggttttttttaagattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggat 48609818  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  48609819 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 40643799 - 40643982
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  40643799 ggttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatc 40643898  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40643899 atttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40804691 - 40804509
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  40804691 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccac 40804592  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  40804591 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7755489 - 7755305
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7755489 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggatacc 7755390  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7755389 acttaaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacctt 7755305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20754576 - 20754391
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |    
T  20754576 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatc 20754477  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20754476 acttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacctt 20754391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 37313396 - 37313581
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37313396 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaata 37313495  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||    
T  37313496 tcacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 39053393 - 39053578
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39053393 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatacc 39053492  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  39053493 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 41732525 - 41732710
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  41732525 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggata 41732624  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  41732625 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51102563 - 51102378
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51102563 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 51102464  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  51102463 tcacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Original strand, 44222827 - 44223011
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  44222827 aggttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaatac 44222926  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44222927 cacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 35594119 - 35594305
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  35594119 aggttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatat 35594218  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  35594219 cacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293317
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41293398 taaaa-tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacctt 41293317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 41216454 - 41216639
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41216454 ggttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggatacc 41216553  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  41216554 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacctt 41216639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 44806683 - 44806868
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44806683 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggatacc 44806782  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  44806783 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 44806868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 53943770 - 53943586
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  53943770 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 53943671  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  53943670 acttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-tactctagttgtcacctt 53943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215260
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacctt 52215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 52638839 - 52639026
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  52638839 aaggttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggata 52638938  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  52638939 ccacttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacctt 52639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 18946904 - 18947086
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18946904 ttttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccag 18947003  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18947004 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 36368938 - 36369103
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36368938 ggttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 36369037  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36369038 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgg 36369103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51146398 - 51146215
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51146398 ggttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacc 51146299  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  51146298 acttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacc 51146215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 24376572 - 24376730
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24376572 ggttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 24376671  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattc 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24376672 acttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 279
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021896
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtt-aagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126170
Alignment:
Q  122 gaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggct 220  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  221 aatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg-taccctagttgtcacctt 46126170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 104 - 278
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  104 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  203 aaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47895003 - 47894817
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47895003 ggttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47894904  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  47894903 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcagcttc 47894817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5560217 - 5560025
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaat-----gagcaatttattggtggggttaagatagttcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5560217 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcat 5560118  T
Q  190 ggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5560117 ggataccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 53832666 - 53832502
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  53832666 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggatacca 53832567  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatg 262  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  53832566 attaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatg 53832502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 54159173 - 54159000
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  54159173 aaggttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagata 54159074  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54159073 ccacttaaaaatgtgcttatgtg---------tattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 53637841 - 53637990
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  53637841 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggatacca 53637940  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacc 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  53637941 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949541
Alignment:
Q  103 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccaca-accaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccactta 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  202 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatggata 46949541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48547014 - 48546842
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||||||||||    
T  48547014 aaggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg--tcaaatagttcatggata 48546917  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||         ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48546916 ccacttaaaaatgtgcttatgtg---------tattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33550580 - 33550465
Alignment:
Q  167 ttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggata 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  33550580 ttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaata 33550481  T
Q  267 ccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||| ||||||||||    
T  33550480 ccctagttgtcacctt 33550465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34279895 - 34279721
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  34279895 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 34279800  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  34279799 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 34279721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 25641644 - 25641819
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||           
T  25641644 aggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca------- 25641736  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
        |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  25641737 ----taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 25641819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 54401186 - 54401361
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  54401186 ggttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 54401279  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcaccttc 283  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  54401280 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccaccttc 54401361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 42589829 - 42590003
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  42589829 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 42589922  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  42589923 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 42590003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30251675 - 30251499
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30251675 aaggttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 30251576  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30251575 ccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 30251499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 49130575 - 49130751
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||        
T  49130575 aaggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatg---- 49130670  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
           || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  49130671 -------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctt 49130751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Original strand, 51415966 - 51416142
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  51415966 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat- 51416064  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  51416065 ----------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 51416142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 54707395 - 54707219
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||       
T  54707395 gaaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--- 54707299  T
Q  194 accacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
            || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  54707298 --------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 55379984 - 55380156
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  55379984 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 55380083  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    || |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  55380084 acctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 25353551 - 25353726
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25353551 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 25353650  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||| |||||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25353651 ccacctaaaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 282
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864673
Alignment:
Q  158 agcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  258 ccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacctt 52864673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 53115446 - 53115620
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  53115446 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 53115545  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  53115546 acttaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacctt 53115620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 55000350 - 55000176
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||          
T  55000350 ggttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg------ 55000257  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  55000256 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 55000176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 244
Target Start/End: Original strand, 37758926 - 37759075
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||| ||||    
T  37758926 aaggttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagata 37759025  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaatt 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37759026 ccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 38156803 - 38156632
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||           
T  38156803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 38156711  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  38156710 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39141298 - 39141141
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||       
T  39141298 ggttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat--- 39141202  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
          | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  39141201 ------atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 39141141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41635972 - 41635798
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  41635972 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 41635879  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
         || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  41635878 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacctt 41635798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51224211 - 51224061
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  51224211 aaggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaacaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 51224117  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattctt 257  Q
          || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  51224116 ------aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattctt 51224061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47511113 - 47510940
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  47511113 aggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 47511019  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  47511018 ------aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31286963 - 31286791
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  31286963 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31286872  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||    
T  31286871 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 31286791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 263
Target Start/End: Original strand, 45058882 - 45059037
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          
T  45058882 ggttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 45058975  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
         || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  45058976 -----aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgg 45059037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17665698 - 17665549
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        
T  17665698 aaggttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg---- 17665603  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattc 255  Q
           || || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17665602 -------aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42998960 - 42998790
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42998960 ggttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacc 42998862  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    || |||||| |||           ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||    
T  42998861 acctaaaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 37028720 - 37028894
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||        
T  37028720 aaggttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatg---- 37028815  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
           || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| ||||    
T  37028816 -------aatatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2228109 - 2227995
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  2228109 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagata 2228010  T
Q  195 ccacttaaaaatgtg 209  Q
     ||||| ||||||||    
T  2228009 tcacttcaaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28576286 - 28576184
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28576286 aaggttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 28576187  T
Q  195 cca 197  Q
    |||    
T  28576186 cca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882063
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 279
Target Start/End: Original strand, 51143818 - 51143987
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  51143818 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||    
T  51143918 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Original strand, 24688114 - 24688285
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||           
T  24688114 gttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 24688206  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
        || ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  24688207 ----aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21597322 - 21597220
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21597322 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggata 21597223  T
Q  195 cca 197  Q
    |||    
T  21597222 cca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 263
Target Start/End: Original strand, 40022075 - 40022228
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||            
T  40022075 ttttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40022166  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatgg 263  Q
       || ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||| |||||    
T  40022167 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgg 40022228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 225
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182127
Alignment:
Q  147 caatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgt 47182127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||| |||            |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  43176808 ctaaaaaggtg-----------gatgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 21009504 - 21009412
Alignment:
Q  320 aacaaaatagaagaaagactaattaggcatctcaagataaatcaagtgatttatccaccaaccatgcaaatcaaaaaataaattataaaactt 412  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21009504 aacaaaatagaagaaatactaaatagacatctcaagatacaccaagtgatttacccacctagcatgcagatcaaaaaataaattataaaactt 21009412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48726170 - 48726070
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  48726170 ggttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacc 48726071  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  48726070 a 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  108 agattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  207 gtg 209  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44946101 - 44946014
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatag 184  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44946101 ggttttttttaaattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag 44946014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50732087 - 50731986
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  50732087 aaggtttttt-tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50731989  T
Q  195 cca 197  Q
    |||    
T  50731988 cca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Original strand, 50780769 - 50780870
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  50780769 aaggtttttt-tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggata 50780867  T
Q  195 cca 197  Q
    |||    
T  50780868 cca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 174
Target Start/End: Original strand, 52434138 - 52434216
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattt--ccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  52434138 ggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429226
Alignment:
Q  193 taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacct 30429226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Original strand, 48752085 - 48752161
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggg 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  48752085 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 41609112 - 41609178
Alignment:
Q  143 caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41609112 caactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg 41609178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48534122 - 48534005
Alignment:
Q  154 aatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccat 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||           |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  48534122 aatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcat 48534034  T
Q  254 tcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||| ||||| || |||| ||| ||||||    
T  48534033 tctttcatgggtagcctagttgccacctt 48534005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 177162 - 177333
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||||| | || ||| |||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  177162 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaac 177261  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  177262 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacct 177333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165822
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccac 198  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||| || |||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  199 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
     |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 51942588 - 51942541
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51942588 ggttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccacaa 51942541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 52756214 - 52756067
Alignment:
Q  127 gtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggc----ta 221  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||           || |||||||||||||||    ||    
T  52756214 gtgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtgcttatgtggctaatta 52756126  T
Q  222 atgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  52756125 atgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8847831 - 8847718
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||| |  || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| | |||    
T  8847831 aaggtttttt-taaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaata 8847733  T
Q  195 ccacttaaaaatgtg 209  Q
    |||||||||||||||    
T  8847732 ccacttaaaaatgtg 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Original strand, 37741433 - 37741479
Alignment:
Q  97 aggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac 143  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37741433 aggttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccac 37741479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 279
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752284
Alignment:
Q  221 aatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcac 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtcac 48752284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44946010 - 44945933
Alignment:
Q  205 atgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||  || |||| ||||||||||    
T  44946010 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctt 44945933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731914
Alignment:
Q  229 ttggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 280
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780942
Alignment:
Q  229 ttggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 282
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688485
Alignment:
Q  228 attggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 40688485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33550609 - 33550581
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550609 ggttttttctagattacctttgaagaatg 33550581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39739 - 39554
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39739 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 39640  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39639 acttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13945 - 13760
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13945 ggttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 13846  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13845 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 13760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11317 - 11133
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11317 aagggtttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata 11219  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11218 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 101 - 280
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2051
Alignment:
Q  101 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 278005 - 278192
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  278005 ggttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 278104  T
Q  197 --acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  278105 ccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 281
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176837
Alignment:
Q  111 ttacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  210 cttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 75427 - 75242
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  75427 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcatacc 75328  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  75327 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacctt 75242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2615 - 2432
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2615 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 2516  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  2515 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19037 - 18852
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19037 ggttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacc 18938  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18937 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 18852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 252
Target Start/End: Original strand, 32560 - 32715
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32560 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 32659  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccacca 252  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32660 atttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4771 - 4596
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     |  |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4771 ttttttctagattaactttgaataatggtgggtaa-----caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccact 4677  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4676 taaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3262
Alignment:
Q  100 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggataccact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||        |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcacaa--------aatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcact 3180  T
Q  200 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  3181 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20648 - 20477
Alignment:
Q  99 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  20648 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T
Q  198 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    | |||||| |||           ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  20548 cctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 280
Target Start/End: Original strand, 7089 - 7262
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatg-aaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatac 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||         
T  7089 ggttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----- 7183  T
Q  196 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
          || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  7184 ------aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 280
Target Start/End: Original strand, 14741 - 14915
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  14741 aaggttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaata 14840  T
Q  195 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 280  Q
    |||| |||||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  14841 ccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 205
Target Start/End: Original strand, 99 - 209
Alignment:
Q  96 aaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggata 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  99 aaggttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaata 198  T
Q  195 ccacttaaaaa 205  Q
    |||| ||||||    
T  199 ccacctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4730 - 4618
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaa-tgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgga 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4730 gaaggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatgga 4631  T
Q  193 taccacttaaaaa 205  Q
    ||||| |||||||    
T  4630 taccatttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 205
Target Start/End: Original strand, 3388 - 3500
Alignment:
Q  95 gaaggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttccccac-aaccaatgaaaa-tgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgga 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3388 gaaggttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatgga 3487  T
Q  193 taccacttaaaaa 205  Q
    ||||| |||||||    
T  3488 taccatttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Original strand, 17905 - 18043
Alignment:
Q  98 ggttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttcccca-caaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatggatacc 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| || || ||| || ||| ||||     
T  17905 ggttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac- 18003  T
Q  197 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattac 246  Q
              ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18004 ----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  110 attacctttgaagaatggtgggtaatttccc-cacaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggttaag----atagttcatggataccacttaaaa 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University