View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7393_low_1 (Length: 523)

Name: NF7393_low_1
Description: NF7393
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7393_low_1
NF7393_low_1
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (20-513)||(5891120-5891613)
chr6 (63-514)||(5851572-5852020)
chr6 (22-495)||(5763064-5763534)
chr6 (22-495)||(5766599-5767069)
chr6 (22-495)||(5770134-5770604)
chr6 (22-495)||(5773669-5774139)
chr6 (22-495)||(5777204-5777674)
chr6 (22-495)||(5780739-5781209)
chr6 (22-495)||(5784274-5784744)
chr6 (22-495)||(5787809-5788279)
chr6 (22-495)||(5791344-5791814)
chr6 (22-495)||(5794879-5795349)
chr6 (22-495)||(5798414-5798884)
chr6 (22-495)||(5801949-5802419)
chr6 (22-495)||(5805484-5805954)
chr6 (22-495)||(5809019-5809489)
chr6 (22-495)||(5812554-5813024)
chr6 (22-495)||(5816089-5816559)
chr6 (22-495)||(5819624-5820094)
chr6 (63-502)||(5828643-5829079)
chr6 (62-434)||(5878866-5879238)
chr6 (62-292)||(5826155-5826385)
chr6 (312-495)||(5754376-5754559)
chr6 (73-272)||(5754581-5754780)
chr6 (166-445)||(5825862-5826138)
chr6 (368-512)||(5825723-5825867)
chr6 (368-516)||(5878712-5878860)
chr6 (396-457)||(2715723-2715784)
chr6 (302-401)||(5751966-5752062)
chr6 (143-216)||(3777891-3777964)
[»] scaffold0087 (7 HSPs)
scaffold0087 (72-513)||(3920-4364)
scaffold0087 (72-513)||(28766-29207)
scaffold0087 (161-516)||(32764-33116)
scaffold0087 (63-495)||(11402-11834)
scaffold0087 (72-495)||(54042-54465)
scaffold0087 (108-270)||(39061-39223)
scaffold0087 (368-494)||(38868-38994)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (302-401)||(17780-17876)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 513
Target Start/End: Original strand, 5891120 - 5891613
Alignment:
Q  20 aatcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtg 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5891120 aatcacccatggaagaatggaagagtttaaactatttcccccaagattgagggattttagaaaaattgaagtatttaagtggggaatagatttaggagtg 5891219  T
Q  120 acttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5891220 acttgatggagcccacaaccatataaatgaagttcagacaaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattgacatatg 5891319  T
Q  220 ataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattgga 319  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||||    
T  5891320 atagatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgaaaacataaaataattataggaaatatcaagagtttgcaaactgga 5891419  T
Q  320 caggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatcttt 419  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||| || || |||||| || ||||| | ||| ||||||    
T  5891420 aaggttccttagactagaaggaatgacactaacaaatttgttaccactaagtttcaactctttcagctgaccaagtgagcccatgcagtgtgggatcttt 5891519  T
Q  420 ccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataat 513  Q
    ||||||| || || || || ||| | || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5891520 ccttctaggtaatgataactaagttctagaaaaattagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatgctttagtataat 5891613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 63 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5852020 - 5851572
Alignment:
Q  63 agatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaag 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |     
T  5852020 agatcgagagattttagaaaaattgaagtattcaggaggggaatggatttaggattgacttgatggagcccacaaccatataaattaagttgagatagat 5851921  T
Q  163 aatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattc 262  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5851920 aacgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagcttgagtaagattaacatatgatagatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccattc 5851821  T
Q  263 aaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgtta 362  Q
    |||||||||| |  | |      |||||||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||    
T  5851820 aaggtcatttgttgtta---aggaattatatccaaggtcaagtgtttgcaaattggaaaggttccctagactaggaggaatgacactaacaagattgtta 5851724  T
Q  363 tcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgtt 462  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  5851723 tcatgaagattcagttctatcaacttatcaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttcaaattgattaccatggagatttaaagaagttagatgtt 5851624  T
Q  463 gaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataatc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5851623 gaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatgctttagtataatc 5851572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5763534 - 5763064
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5763534 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5763435  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5763434 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5763335  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5763334 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5763238  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5763237 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5763139  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5763138 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5763064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5767069 - 5766599
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5767069 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5766970  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5766969 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5766870  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5766869 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5766773  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5766772 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5766674  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5766673 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5766599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5770604 - 5770134
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5770604 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5770505  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5770504 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5770405  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5770404 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5770308  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5770307 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5770209  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5770208 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5770134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5774139 - 5773669
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5774139 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5774040  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5774039 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5773940  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5773939 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5773843  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5773842 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5773744  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5773743 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5773669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5777674 - 5777204
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5777674 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5777575  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5777574 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5777475  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5777474 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5777378  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5777377 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5777279  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5777278 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5777204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5781209 - 5780739
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5781209 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5781110  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5781109 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5781010  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5781009 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5780913  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5780912 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5780814  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5780813 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5780739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5784744 - 5784274
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5784744 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5784645  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5784644 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5784545  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5784544 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5784448  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5784447 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5784349  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5784348 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5784274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5788279 - 5787809
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5788279 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5788180  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5788179 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5788080  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5788079 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5787983  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5787982 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5787884  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5787883 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5791814 - 5791344
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5791814 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5791715  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5791714 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5791615  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5791614 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5791518  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5791517 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5791419  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5791418 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5791344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5795349 - 5794879
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5795349 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5795250  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5795249 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5795150  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5795149 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5795053  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5795052 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5794954  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5794953 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5794879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5798884 - 5798414
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5798884 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5798785  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5798784 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5798685  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5798684 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5798588  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5798587 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5798489  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5798488 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5798414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5802419 - 5801949
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5802419 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5802320  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5802319 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5802220  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5802219 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5802123  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5802122 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5802024  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5802023 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5801949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5805954 - 5805484
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5805954 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5805855  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5805854 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5805755  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5805754 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5805658  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5805657 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5805559  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5805558 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5805484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5809489 - 5809019
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5809489 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5809390  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5809389 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5809290  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5809289 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5809193  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5809192 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5809094  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5809093 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5809019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5813024 - 5812554
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5813024 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5812925  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5812924 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5812825  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5812824 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5812728  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5812727 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5812629  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5812628 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5812554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5816559 - 5816089
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5816559 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5816460  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5816459 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5816360  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5816359 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5816263  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5816262 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5816164  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5816163 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5816089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5820094 - 5819624
Alignment:
Q  22 tcacccatggaagaatagaagagtttaaactatttcccccaagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgac 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | || || ||||||||||||||||||    
T  5820094 tcacccatggaagaatggaagagtttaaactattttctccaagatcaagggatttcagagaaattgaagtgttcatgtaggaaatagatttaggagtgac 5819995  T
Q  122 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||    
T  5819994 ttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagacaaagtatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaatagccagtgtgagattgacctctgat 5819895  T
Q  222 aaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggaca 321  Q
    | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |    
T  5819894 agatcaaggtatctcaaatcagagagatgagaaagccattcaaggtcatttgcagtta---aataattatgtgaaaggtcaagagtttgcaaattggaaa 5819798  T
Q  322 ggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttat-catgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttc 420  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| ||| || ||| || || | ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5819797 ggttccccaaactaggaggaatgacaccaaaaaaattattgtacat-aagctttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggtatctttc 5819699  T
Q  421 cttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5819698 cttctaagccaatattatcaagatttaaagaaataagatgttgaagttcacatattgaataatctaacttacctc 5819624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 63 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5829079 - 5828643
Alignment:
Q  63 agatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaag 162  Q
    ||||||||  |||| ||| |||| |||||||| ||  | |||||||||| | || |||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  5829079 agatcgagatatttcagagaaatggaagtattcagaagtggaatagattcaagattgacttgatgcagtccacaaccatagaaatcaagttcagataaag 5828980  T
Q  163 aatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattc 262  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || | ||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  5828979 aaggaattttgcttattgatgataaccaatcaacaactagagagagattgacctttgatagaccaaggtgtctcaaattagagaggtgagaaatccattc 5828880  T
Q  263 aaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgtta 362  Q
    ||||||||||  | |||  ||||   || || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  5828879 aaggtcatttgcagtcaagtcat---taaatccaaggtcaagagtttgcaaattggaaaggttccctaaactaggaggaatgacactaacaagtttgtta 5828783  T
Q  363 tcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgtt 462  Q
     ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  5828782 ccaataagatttaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggtatcttactttctaatttattataagcaagatttaaagaagtaagatgtt 5828683  T
Q  463 gaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatct 502  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5828682 tcagttcacatattgaagaatctaacttaccgctcaatct 5828643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5879238 - 5878866
Alignment:
Q  62 aagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttagga-gtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataa 160  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |     
T  5879238 aagatcgagatatttaagagaaatggaagaattcaggtggggaatagatttaggaagtg-cttgatggagcccacaaccgagtaaacgaagttcagacag 5879140  T
Q  161 agaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccat 260  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5879139 agatggagttttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacaaatgatatatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccat 5879040  T
Q  261 tcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgt 360  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||||||||| ||| |    
T  5879039 tcaaggtcatttgaaatcatatcataattaaatccaaggtcaagagttcgcaaattggaaaggttccccaaactaggaggaatgacactaacaagtttat 5878940  T
Q  361 tatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttatta 434  Q
    || ||  |||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5878939 taccactaagatctaactctatcaagttaccaagtgacccaatgctttttggtatctttccttctaagtaatta 5878866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 62 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5826385 - 5826155
Alignment:
Q  62 aagatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttagga-gtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataa 160  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |     
T  5826385 aagatcgagatatttaagagaaatggaagaattcaggtggggaatagatttaggaagtg-cttgatggagcccacaaccgagtaaatgaagttcagacag 5826287  T
Q  161 agaatgaa-ttttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagcca 259  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  5826286 aga-tgaagttttgcttattgatgacaaccgatcaacagctagagtgagattaacaaatgatagatcaaggcatctcaaattggagagatgagaaagcca 5826188  T
Q  260 ttcaaggtcatttatattcatatcataattata 292  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5826187 ttcaaggtcatttgaaatcatatcataattata 5826155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 312 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5754559 - 5754376
Alignment:
Q  312 aaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttg 411  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |  |||| |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5754559 aaattggaaaggttccctagactaggaggaatgacaccaacaaaataattataaccaagattcaactctatcaacttatcaagtgaaccaatgcactttg 5754460  T
Q  412 gaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5754459 gaatctttccttctaagtaattatgaccaagatttaaagaagtaggatgtttcagttcacatattgaagaatctaacttacctc 5754376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5754780 - 5754581
Alignment:
Q  73 attttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaatttt 172  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||  | |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5754780 atttcagagaaatggaagtattcagaagaggaatagattcaagattgacttgatggagtccacaaccattgaaatgaagttcagataaagaaggaatttt 5754681  T
Q  173 gcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcattt 272  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5754680 gcttattgatgagaaccaatcaatagccagagtgagattcacatatgaaagatcaatgtatctcaaattagatagatgagaaagccattcaaggtcattt 5754581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5826138 - 5825862
Alignment:
Q  166 gaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaag 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || | ||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  5826138 gaattttgcttattgatgataaccaatcaacaactagagagagattgacctttgatagaccaaggtgtctcaaattagagaggtgagaaatccattcaag 5826039  T
Q  266 gtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatca 365  Q
    |||||||  | |||  ||   |||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  5826038 gtcatttgcagtcaagtc---attaaatccaaggtcaagagtttgcaaattggaaaggttccctaaaccaggaggaatgacactaacaagtttattacca 5825942  T
Q  366 tgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatt 445  Q
      |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||  |  ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  5825941 ctaagatttaactctatcaagttaccaagtgacccaacactttttggtatctttccttctaagccattaaaaccaagatt 5825862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 368 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5825867 - 5825723
Alignment:
Q  368 aagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagt 467  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| | || ||||||| ||   ||||||| |||||| |||| ||| |||    
T  5825867 aagattcaactctatcagttgaccaagtgtaccaatgcactttgggatttttccatgtaggttattactattgagatttatagaagtaagatattgcagt 5825768  T
Q  468 tcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataa 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5825767 tcacatattgaagaatctaacttaccttgcaatcctttagtataa 5825723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 368 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 5878860 - 5878712
Alignment:
Q  368 aagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagt 467  Q
    |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||  ||   ||||||| |||| | |||| ||| |||    
T  5878860 aagattcaactctatcagttgaccaagtgaaccaatgcactttgggatttttccatgtaggttatttctattgagatttatagaactaagatattgcagt 5878761  T
Q  468 tcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataatcta 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5878760 tcacatattgaagaatctaacttaccttgcaatcctttagtataatcta 5878712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 457
Target Start/End: Original strand, 2715723 - 2715784
Alignment:
Q  396 gaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttag 457  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2715723 gaaccaatacactttggtatctctccttctaagtaatgattaccaagatttaaagaagttag 2715784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 401
Target Start/End: Original strand, 5751966 - 5752062
Alignment:
Q  302 aagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaacca 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||   |||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5751966 aagagtttgcaaattggaaaggttctccagactagaaggaa---cactaacaaaattattaccctcaagattcaactctatcaactgaccaagtgaacca 5752062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3777964 - 3777891
Alignment:
Q  143 taaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacat 216  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  3777964 taaatgaagttcagacagagaaggaatttcgcttattgatgacaaacaatcaactacaagagtgagattcacat 3777891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 7)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 72 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4364 - 3920
Alignment:
Q  72 gattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattt 171  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4364 gatttcagagaaatggaagtattcaggaggggaatggatttaggattgacttgatggagcccacaaacatataaatgaagttcagataaagaaggaattt 4265  T
Q  172 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4264 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattgacatatgataaatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccattcaaggtcatt 4165  T
Q  272 tatattcata---tcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatga 368  Q
    |  | |||||   | |||||| | ||  || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | |||| | ||||| |  |    
T  4164 tgcactcataccgtaataattttctgataggtcaagagtttgtaaattggaaaggttccctagactaggaggaatgacaccatcaaaatagttataacca 4065  T
Q  369 agattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagtt 468  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  4064 agattcaactctatcaacttatcaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttgttacgataaagatttaaagaagtaagatgtttcagtt 3965  T
Q  469 cacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataat 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3964 cacatattgaagaatctaacttacctcgcaattctttagtataat 3920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 72 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 29207 - 28766
Alignment:
Q  72 gattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattt 171  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  29207 gatttcagagaaatggaagtattcaggaggggaatggatttaggattgacttgatggagcccacaaccatataaataaagttcagatagataaggaattt 29108  T
Q  172 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29107 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattgacatttgatagatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccattcaaggtcatt 29008  T
Q  272 tatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaaga 371  Q
    |  | |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| |  |||  |  ||||    
T  29007 tgaaatcatatcataattagatgaaaggtcaagagtttgtaaattggaaaggttccccaaactaggaggaatgacaccaacaaaatgattaaaaccaaga 28908  T
Q  372 ttcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttcac 471  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |   |||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  28907 ttcaactctatcaacttatcaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttcaaattgattaccattgagatttaaagaagtaagatgttgcaattcac 28808  T
Q  472 atattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataat 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28807 atattgaagaatctaacttacctcgcaattctttagtataat 28766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 161 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 33116 - 32764
Alignment:
Q  161 agaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccat 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  33116 agaaggaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattgacatttgatagaccaaggtatctcaaattagagaggtgagaaatccat 33017  T
Q  261 tcaaggtcatttatattcatatcataattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgt 360  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||   || || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  33016 tcaaggtcatttgcagtcaagtcat---taaatccaaggtcaagagtttgcaaattggaaaggttccctagactaggaggaatgacactaacaagtttgt 32920  T
Q  361 tatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatg 460  Q
    || ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32919 taccaataagatttaactctatcaacttaccaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttcaatgcgattattatcaagatttaaagaagtaagatg 32820  T
Q  461 ttgaagttcacatattgaagaatctaacttacctcgcaatcttttagtataatcta 516  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32819 ttgcagttcacatattgaagaatctaacttaccttgcaatcctttagtataatcta 32764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 63 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11834 - 11402
Alignment:
Q  63 agatcgagggattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaag 162  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||| ||| |     
T  11834 agatcgagagatttcagagaaatggaagtattcaggaggggaattgatttaggattgacttgatggagcccacaaatatttaaattaagttcatatagat 11735  T
Q  163 aatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattc 262  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11734 aacgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtaagattaacatatgatagatcaaggcatctcaaattagagagatgagaaagccattc 11635  T
Q  263 aaggtcatttatattcatatca-taattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgtt 361  Q
    ||||||||||    |||  | | ||| || || |||| | || |||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| |  ||    
T  11634 aaggtcatttgcggtcaagtaattaaata-atccaaggtcaaaagtttgtaaattggaaaggttccccaaactaggaggaatgacaccaacaaaataatt 11536  T
Q  362 atcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgt 461  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |   |||||||||||||| ||||||    
T  11535 aaaaccaagattcaactctatcaacttatcaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttcaaattgattaccaaagagatttaaagaagtaagatgt 11436  T
Q  462 tgaagttcacatattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435 tgcaattcacatattgaagaatctaacttacctc 11402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 54465 - 54042
Alignment:
Q  72 gattttagaaaaattgaagtatttaggtggggaatagatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattt 171  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  54465 gatttcagagaaatggaagtattcagaagaggaatagattcaagattgacttgatggagcccacaaccatataaataaagttcagatagataaggaattt 54366  T
Q  172 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcatt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54365 tgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtgagattaacatatgaaagatcaaggtatctcaaattagagagatgagaaagccattcaaggtcatt 54266  T
Q  272 tatattcatatca-taattatatgcaagtttaagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaag 370  Q
    |  | |||  | | ||| ||  | |||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||| |||||| |  ||| ||  |||    
T  54265 tgcagtcaagtaattaaata-ctccaaggtcaagagtttgtaaattggaaaggttccccaaactaggaggaatgacaccaacaaaataattaccaccaag 54167  T
Q  371 attcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagttca 470  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |   ||||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  54166 atctaactcaatcaagttaccaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttcaaattgattatcattgagatttaaataagtaagatgtttcagttca 54067  T
Q  471 catattgaagaatctaacttacctc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  54066 catattgaagaatctaacttacctc 54042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 39223 - 39061
Alignment:
Q  108 gatttaggagtgacttgatggagcccacaaccaaataaatgaagttcagataaagaatgaattttgcttattgatgacaaccaatcaacagctagagtga 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |    
T  39223 gatttaggagtgacttgatggagaccacaagttgataaatgaagttcagacagagaaggaattttgcttattgacgacaaccaaccaacagctagactaa 39124  T
Q  208 gattaacatatgataaatcaaggtatctcaaattagaaagatgagaaagccattcaaggtcat 270  Q
    | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  39123 ggtttacacatgacatatcaaggtatctcaaattagagaggcgagaaagccattgaaggtcat 39061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 368 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38994 - 38868
Alignment:
Q  368 aagattcaactctatcaacttactaagtgaaccaatgcactttggaatctttccttctaagttattattaccaagatttaaagaagttagatgttgaagt 467  Q
    ||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||| | |    
T  38994 aagattcaattctatcaattgaccaagtgagccaatgcactttggtatctttccttctaagagattataaccaagatttaaagaagtaaggtgttgcaat 38895  T
Q  468 tcacatattgaagaatctaacttacct 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38894 tcacatattgaagaatctaacttacct 38868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17876 - 17780
Alignment:
Q  302 aagagtttgcaaattggacaggttccctagactcgaaggaatggcactaacaaatttgttatcatgaagattcaactctatcaacttactaagtgaacca 401  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||   |||||||||| || ||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17876 aagagtttggaaattggaaaggttccccaaactagaaggaa---cactaacaaaattattaccctcaagattcaactctatcaactgaccaagtgaacca 17780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University